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lowQualScore                  :     ..  . ..    .  ....  .. . . . .....   . ..... .  ..............  .. .... .      . ..   .. .  .  ....... . .  . ..   .       .............   .  . . .. . . ... .....  ..... .  .... .. . . . . .   .  ...    ...... . .   . ..   .  ... ... ... . .  . . .. .. . . . ..  .  .  . .    . . . .....  . ...   ..  ...  .  ...  . ..  .      ..  . . .....  ....  ..  .   .. ..          
lowQualScore                  :     22  2 77    8  7777  77 2 5 2 00000   2 99999 2  66666666666666  77 4444 1      1 22   66 1  4  0000000 2 4  0 00   0       5555555555555   3  3 1 55 1 1 999 66666  88888 1  3333 55 1 1 1 1 1   1  111    999999 0 1   0 88   0  555 888 666 2 1  1 2 66 99 3 1 1 55  1  2  2 2    5 2 2 11111  5 999   00  222  5  444  2 00  2      00  2 2 11111  9999  77  2   11 11          
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Reference ( gi|65829 )        : ACCA--TG-G--CAACATTC-G-CT--A-T-C-A---T-ACC-T-----T-CA-----T-T------CA--T----T-TATGAT-G-CCAT--A-TC-TT-------G-G-TTCA-ATTTTCAACTTAGA--AA------ACAT-CA-G-A--G-T-G---G-----TA---C-C-AA----A--T-G-A-A-A-GCA-TA-TTGAAT------T-G-TAC-T--TTT-AT-T-T---G--AT-A-CC-A-T--TA-T-A-T-G--TA-AA-TT-A-GCTC-A-T-T-----TG-C---ATA--TT---CA-TG---AA-T--AT-TAATGA--TT-T-TC----GT----AA--AA-ATTT-A--TGTTTTTATT
gi|65832                      : ACCA--TG-G--CAACATTC-G-CT--A-T-C-A---T-ACC-T-----T-CA-----T-A------CA--T----T-TATGAT-G-CTAT--A-TC-CT-------G-A-TTCA-ATTT-CAACTTAGA--AA-------CAT-CA-G-A--G-T-G---G-----TA---C-C-AA----A--T-G-A-A-A-GCA-TA-T-GAAT------T-G-TAC-T--TTT-AT-T-T---T--AT-A-GC-A-T--GA-T-A-T-G--TA-AA-TT-A-GCTC-A-T-T-----TG-C---ATA--TT---CA-TG---AA-T--AT-TAATGA--TT-T-TC----GT----AA--AA-ATTG-A--TGTTTTTATT
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gi|65842                      : ACCA--TA-G--CAAT-TTT-A-CT--T-A-A-A---C-AAC-T-----T-CA-----A-A------CA--T----C-TACGAT-G-TGAT--A-TC-TT-------G-GGTTTA-GTTTT-AACTTATA--TACATTGTACAT-CA-G-A--G-C-G---G-----TA---T-C-AA----A--T-G-A-T-A-GCA-TA-T-GAAT------T-G-TAC-T--TTT-AT-A-T---G--CT-A-CA-G-T--TA-T-A-T-G--TA-AA-TT-A-GCTC-A-T-T-----TG-C---ATG--TT---CA-TG---AA-A--A---AATGA--TT-T-TT----GT----AA--AA-A
gi|65857                      : ACCA--TG-G--CAA-ATTC-A-CT--A-TTC-A---C-AC--T-----T-CA-----A--------CA--T----A-TATTAT-G-C-AT--AATC-TT-------G---TTCA--TTTTCAACTTAGA--AA-------CAT-CA-G-A--G-T-G---------TA---C-C-AA----A--T-G-A-A-A-GCA-CA-TAGACG------T-G-TAA-T--TTT-AC-T-T---ATCAT-A-CC---T--TA-T-A-T-G--T--AA-TT-A-GCTC-A-TCT-----TG-C---ATA--TT---CAGTG---A-----AT-TAATGA--TTAT-GC----GT----AA--AA-ATTG-A--GTTTTTTATT
gi|65854                      : ACCG--TA-G--CAACCTTT-AACT--AAT-C-AACAT-ACT-T-----C-AA-----A-A------CA--T----T-TATGAT-G-CAAT--A-TCCTT-------G-G-TTTA-TTTTTTCACCTAGA--TA------ACAT-CAAG-AAGG-T-G---G-----TA---T-C-AA----A--T-G-A-A-A-ATA-TA-ATGAAT------TAG-TA--T--TTT-AT-AAT---G--CT-A-CC-A-T--T--T-A-T-G--TA-GA-TT-A-GTTTGA-T-T-----TG-C---ATA--TT---CA-TG---AA-T--AT-TAATGA--TT-T-TT----GT----AA--AA-A
gi|65849                      : ACCG--TA-G--CAACCTTT-A-CT--G-T-C-A---C-ACA-T-----T-CA-----A-A------CA--T----T-TTTGAT-G-TCAT--A-TC-TT-------G-G-TTTG-GTTTGGACCTTA----AT------ATAT-CA-G-A--G-T-G---G-----TA---T-C-AA----A--T----------------------------T-G-TAC-T--TTT-AT-A-T---G--AT-A-CC-A-T--TT-T-A-T-G--TA-AA-TT-A-ACTG-A-T-T-----TG-C---ATA--TT---CA-TG---AA-T--AA-CAAAAA--TG-T-TT----GT-----A--AA-ATTT-
gi|65852                      : ACCACTTA-G--CAACCTTT-A-CT--G-T-C--------CC---------CA-----T-TTCAAAACA--T----T-TATGAT-G-TAATTTA-TC-TG-------C-G-TTTA-GTTTTCCACCTA-A--AA------ACAT-CA-GAA--G-T-G---G------A---T-C-CG----A--T-G-A-A-A-GCA-TA--TGAAT------T-G-CAC-T--TTT-AA-A-T---G--CT-A-CC-ATT--TT-T-A-T-G--TA-AATTT-A-TCTG-A-T-T-----TG-----ATA--TT---CA-TG---AA-T--AT-TAATGGATTT-T-TT----GT----AA--AA-AATA-A--TGTTTCTg
gi|65838                      : ACCA--TA-G--CAA-ATTT-A-CTTAA-A-A-A---C-ACT-T-----T-CA-----A-A------AAA-T----T-TACGAT-G-TGAT--A-TC-TT-------G-GGTTTA-GTTTT-AACTTAAT--AAT-----ACAT-CA-G-A--G-T-G---G-----TA---T-C-AA----A--T-G---A-A-GCA-TA--TGAAT------T-G-TAC-T--TTT-AT-A-T---G---T-A-C----G--TA-T-A-T-AGTTA-AA-TT-ATGCTC-A-T-T-----TGTC---ATA--TT---CA-TGAAAAA-A--AA-TAATTA--TT-T-TT----GTTAAAAA--AA-A----A--TGTTTTTAT
gi|65848                      : ACCA--TG-G--CAACATTT-T-AC--A-T-C-A---C-GCC-C-----T-CA-----A-A------CA--T----T-TATGAT-G--CAT--G-TC-TT-------G-G-TTT--GTGTTCAACGTA-ATTAA------ACAT-CA-G-A--A---A---G-----TA---T-C-AA----T--G-G-A-A-A-GCA-TA--TGAAT------T-G-TAC-CTGTTT-AT-A-TAAAG--GT-A-CC-A-C--TA-T-T-T-A--TA-AA-TT-T-CTTT-A-T-T-----TG-CACAATA--TT---TA-TG---AA-T--A--TGGTGA--TT-T-TT----G---------AA-AT------TGTTTTTGTT
gi|65856                      : ACCAA-TA-G--CAA---TT-A-CT--A-A-C-A-------C-T-----T-CA-----A-A------CA--T----T-TACGAA-G-TCAT--A-TC-TT-------GAG-TTTA-AGTTTCAACTTATA--TA-------CATTCA-G-A--G-T-G---G-----TA---T-C-AA----AA-T-G-A-A-G-TTA-TT-ATGAAT------T-G-TACTT--TTT-AT-A-T---G--CT---TT-G-T--TG-T-A-T-G--TA-AA-TT-A-ACTC-A-T-T-----TG-A---ATA--TT------TG---AA----AT-TATTGAT-TT-T-TT----GT----AAAGAA-AAAT-A--TGTTT
gi|65839                      : ACCA--TA-GAGCAAC-------CT--A-T-CTA---T-ACC-C-----A-CA-----T-T------CA--AAACAT-TATAAT-G-TAAA--A-TC-TT-------G-A-TTTA-GTTTCTATCCTAAG--AT------ACAT-CA-G-A--A-T-GA--G-----TA---T-C-CA----A--T-G---A-A-GCA-TA--TGAA-------T-G-TAC-T--TTT-AA-A-T---G--CT-A-CC-A-T--T--T-A-T-G--TATAA-TT-A-GCTC-A-T-TTGCTATG-C---ATA--CTTGATA-TC---AA-T--AT-TATTGAT-TT-T-TC----GTAA--AA--AA-AATC-A--TGTTCT
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Reference ( family-423 )      :                                                                                                                             ACCA--T-G-G--CAACN---TTT-G-CT--A-T-CA--C-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------TGA--T-G-TC-AT--A-TC-TT---G-G-TT---T---A-ATTT-TCAACTTAGA--A-A------ACAT-CA---G-A--G-T-G-G-----TA---C-C-AA----A--T-G-A-AA-GCA-TATTGAAT------T-G-TAC-T--TTT-AT-T-T---G--AT-A-CC-A-T--TA-TA-T-G--TA-AA-TT-A-GCTC-A-T-T-----T-G-C---ATA--TT---CA-TG---AA-T-AT--TAATGA--TT-T-TC----G-T----AAAA-ATTG-A--TGTTTTTATT
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gi|65847                      :                                                                                                                             ACCG--T-A-G--CAACC---TTT-A-CT--G-T-CA----AT-A-T-----T-CAAA-C------A-TT-TT------TGA--T-G-TC-TT--A-TC-TT---G-G-TT---T---A--TTT-TCGACCTA-A--A-T------ACAT-CA---GA--A-T-G-G-----TA---T-C-AA----A--T-A-A-AC-TCA-TAT-GAAT------T-G-TAC-T--TTT-A--TAT-T---GA-T-A-CCA-T--T---T-A-T-G--TA-AATT-A-GCT-G-A-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---CA-TG---AA-T-AT--CAATAA--TG-T-TT----G-T----AACA-TTTG-A--TG-TTTTATT
gi|65848                      :                                                                                                                             ACCA--T-G-G--CAACA---TTT-T-AC--A-T-CA--C-GC-C-C-----T-CAAA-C------A-TT-TA------TGA--T-G--C-AT--G-TC-TT---G-G-TT---T-----GTGT-TCAACGTA-ATTA-A------ACAT-CA---GA--A---A-G-----TA---T-C-AA----T--G-G-A-AA-GCA-TA-TGAAT------T-G-TAC-CTGTTT-A--T-A-TAAAGG-T-A-CCA-C--T-A-T-T-T-A--TA-AATT-T-CTT-T-A-T-T-----T-G-CACAAT--A-TT---TA-TG---AA-T-A---TGGTGA--TT-T-TT----G--------AA-AT------TGTTTTTGTT
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gi|65850                      :                                                                                                                             ACCA--T-G-G--CAACA---TTC-GGCT--A-T-CA--T-AC-C-T-----TACACATC------A-TT-TA------TGA--T-G-CC-A---A-TC-TT---G-G-TT---C---A-ATTT--CAATTTAGA--A-A-------CAT-CA---GA--G-T-G-G-----TA---C-C-AA----AATT-GAA-AA-GCA-TA-TAAAT------T-G-TAC-----TT-A--T-T-T---GC-T-A-CCA-T--T-A-T-A-T-G--TA-AATT-A-GCT-C-ACT-T-----T-G-C---AT--ATTT---CA-TG---AA-TAAT--TAATGA--TT-T-TCTGTAG-T----AAAA-AATG-ATTTGTTTTTTTT
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gi|65853                      :                                                                                                                             ACCA--TTA-G--CAATCAATTTT-A-CT--T-A-AA--C-AC-C-T-----T-CAAAAC------A-TT-TA------TGATGT-G-TG-AT--ATTC-TT---G-G-TT---T---A-GTTTATTAACTTA
gi|65853                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ------ACA--CA---GT--G-T-GCG-----TA---TTC-AA----A--T-G-A-AAAGCA-TA-TGAAT------TGG-CAC-T--TTT-A--T-A-T---GCTT-ACCCG-TA-T-A-T-A-T-G--TA-AATT-A-GTTCC-A-T-T-----T-G-C---ATAAA-TT---CA-TGA--AA-A-AA--TAATGA--TT-T-TT----G-T----AAAA-Atattgacgttttaatacattgttacttcgcattttatatttatatacacagtgtgcgtattcaaatgaaaagcatatgaattggcacttttatatgcttacccgtatatatgtaaattagttccatttgcataaattcatgaaaaaataatgatttttgtaaaaa
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gi|65855                      :                                                                                                                             ACAA--T-G-G--CAAAC---TTT-G-TC--T-T-CA--C-AC-C-T-----T-CAAA-T------AATT-TA------TTA--T-G-TC-TT--A-TCATT---G-G-TT---T---A-ATAT--CAAATTAGA--A-A------ACAT-CAA--GA--G-T-G-G-----TA---CGC-AA----A--T-G-A-AA-AGA-TATGAAAT------T-G-TAT-T--TTTTA--T-T-T---GA-T-GGCCA-TAGT-A-T-AAT-G--TA-AATT-A-GCT-T-A-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---CC-TG---AA-T-AT--TAAAGA--TT-TATC----G-T-----AAA-ATTG-A--AATTTTT
gi|65856                      :                                                                                                                             ACCAA-T-A-G--CAA------TT-A-CT--A----A--C-AC---T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------CGA--A-G-TC-AT--A-TC-TT---GAG-TT---T---A-AGTT-TCAACTTATA--T-A-------CATTCA---GA--G-T-G-G-----TA---T-C-AA----AA-T-G-A-AG-TTA-TTATGAAT------T-G-TACTT--TTT-A--T-A-T---GC-T---TTG-T--T-G-T-A-T-G--TA-AATT-A-ACT-C-A-T-T-----T-G-A---AT--A-TT------TG---AA---AT--TATTGAT-TT-T-TT----G-TAAAGAAAA-AT---A--TGTTT
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gi|65860                      :                                                                                                                             ACCA--T-A-G--CAACT---TTT-A-CC--A-T-AA--T-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-CA------TGG--T-G-TC-AT--A-TC-TT---A-G-TT---T---A-ATTT-a
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Reference ( family-423 )      :                                                                                                                             ACCA--T-G-G--CAACN---TTT-G-CT--A-T-CA--C-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------TGA--T-G-TC-AT--A-TC-TT---G-G-TT---T---A-ATTT-TCAACTTAGA--A-A------ACAT-CA---GA--G-T-G-G-----TA---C-C-AA----A--T-G-A-AA-GCA-TATTGAAT------T-G-TAC-T--TTT-A--T-N-T---GA-T-A-CCA-T--T-A-T-A-T-G--TA-AATT-A-GCT-C-A-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---CA-TG---AA-T-AT--TAATGA--TT-T-TC----G-T----AAAA-ATTG-A--TGTTTTTATT
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gi|65853                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ------ACA--CA---GT--G-T-GCG-----TA---TTC-AA----A--T-G-A-AAAGCA-TA-TGAAT------TGG-CAC-T--TTT-A--T-A-T---GCTT-ACCCG-TA-T-A-T-A-T-G--TA-AATT-A-GTTCC-A-T-T-----T-G-C---ATAAA-TT---CA-TGA--AA-A-AA--TAATGA--TT-T-TT----G-T----AAAA-Atattgacgttttaatacattgttacttcgcattttatatttatatacacagtgtgcgtattcaaatgaaaagcatatgaattggcacttttatatgcttacccgtatatatgtaaattagttccatttgcataaattcatgaaaaaataatgatttttgtaaaaa
gi|65854                      : accattagcaatcaattttacttaaacaccttcaaaacatttatgatgtgtgatattcttggtttagtttattaacttatattgacgttttaatacattgttacttcgcattttatatttatatACCG--T-A-G--CAACC---TTT-AACT--AAT-CAA-C-ATAC-T-----T-CAAAAC------A-TT-TA------TGA--T-G-CA-AT--A-TCCTT---G-G-TT---T---A-TTTT-TTCACCTAGA--T-A------ACAT-CAA--GAAGG-T-G-G-----TA---T-C-AA----A--T-G-A-AA-ATA-TAATGAAT------TAG-TA--T--TTT-A--T-AAT---GC-T-A-CCA-T--T---T-A-T-G--TA-GATT-A-GTT-TGA-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---CA-TG---AA-T-AT--TAATGA--TT-T-TT----G-T----AAAA-A
gi|65855                      :                                                                                                                             ACAA--T-G-G--CAAAC---TTT-G-TC--T-T-CA--C-AC-C-T-----T-CAAA-T------AATT-TA------TTA--T-G-TC-TT--A-TCATT---G-G-TT---T---A-ATAT--CAAATTAGA--A-A------ACAT-CAA--GA--G-T-G-G-----TA---CGC-AA----A--T-G-A-AA-AGA-TATGAAAT------T-G-TAT-T--TTTTA--T-T-T---GA-T-GGCCA-TAGT-A-T-AAT-G--TA-AATT-A-GCT-T-A-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---CC-TG---AA-T-AT--TAAAGA--TT-TATC----G-T-----AAA-ATTG-A--AATTTTT
gi|65856                      :                                                                                                                             ACCAA-T-A-G--CAA------TT-A-CT--A----A--C-AC---T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------CGA--A-G-TC-AT--A-TC-TT---GAG-TT---T---A-AGTT-TCAACTTATA--T-A-------CATTCA---GA--G-T-G-G-----TA---T-C-AA----AA-T-G-A-AG-TTA-TTATGAAT------T-G-TACTT--TTT-A--T-A-T---GC-T---TTG-T--T-G-T-A-T-G--TA-AATT-A-ACT-C-A-T-T-----T-G-A---AT--A-TT------TG---AA---AT--TATTGAT-TT-T-TT----G-TAAAGAAAA-AT---A--TGTTT
gi|65857                      :                                                                                                                             ACCA--T-G-G--CAA-A---TTC-A-CT--A-TTCA--C-AC---T-----T-CAA--C------A-TA-TA------TTA--T-G--C-AT--AATC-TT---G----T---T---C-ATTT-TCAACTTAGA--A-A-------CAT-CA---GA--G-T-G-------TA---C-C-AA----A--T-G-A-AA-GCA-CATAGACG------T-G-TAA-T--TTT-ACTT-A-T---CA-T-A-CC--T--T-A-T-A-T-G--T--AATT-A-GCT-C-A-TCT-----T-G-C---AT--A-TT---CAGTG---A----AT--TAATGA--TTAT-GC----G-T----AAAA-ATTG-A--GTTTTTTATT
gi|65858                      :                                                                                                                             ACCA--A-A-G--CAACC---TTT----T--ACT-CA--C-AA-A-T-----C---AA-T------A-TT-TA------TGG--T-G-TA-AT--A-TC-TT---G-G-TT---T---A-GTTT-CTAACCTAGC--ATT------ACAT-CA---GA--T-T-G-G-----TATTTC-C--A----A--T-G-G-AA-GCA-TATGAAAT------T-G-TAC-T--TTT-A--A-A-T---GC-T-A--CA-T--T-T-T-A-T----TC-AATT-A-GCT-G-A-T-T-----TGG-C---AT--A-TT---CA-TG---AA-T-AT--TAATGA--TT-T-T-----G-T----AAAA-A
gi|65859                      :                                                                                                                             ACCA--T-A-G--CAA-----TTT-A-CT----T-AA--C-AC---T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------CGA--T-G-TG-AT--A-TC-TA---G-GATT---TTAGA-ATTT-
gi|65860                      :                                                                                                                             ACCA--T-A-G--CAACT---TTT-A-CC--A-T-AA--T-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-CA------TGG--T-G-TC-AT--A-TC-TT---A-G-TT---T---A-ATTT-a
gi|65861                      :                                                                                                                             ACCA--T-A-G--CAACT---GTT-A-TT--A-T-AA--C-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------TGA--T-G-TC-AT--A-
gi|65862                      :                                                                                                                                A--T-GCG--CAACT---TTTTG-CT--A-T-CCGCC-AC-C-TCGTTCT-CAAA-C------A-TT-TA------TGG--T-GGCC-AT--A-TC-TT---G-C-TT---T---A-ATTT-CAAACTTAG---A-A------ACATCCA---GA--G-TCG-GCTGCCTA---T-T-AATATTA--T-G-A-AT-TCA-TA-TGAAT------T-G-TAC-T--CTT-A--T-C-T---
gi|65863                      :                                                                                                                                      -G--CAACA---TTC-G-CT--A-T-CA--C-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-T-------TGA--T-G-TCCAT--A-TC-TG---G-C-TT---C---A-ATTT-C--ACCTAAG--A-A------TCAT-CA---GAA-G-T-G-G-----TA---C-C-CA----A--T-G-A-AA--CA-TAT-GAAT------T-G-TAC-T--TT--A--T-T-T---GA-T-A-CCA-G--T-A-T-A-T-G--TA-AATT-A-GCT-C-A-T-T-----T-G-C----T--A-TT---CA-TG---AA-T-AT--TAATGAT-TT-T-TC----G-T----AAAA-ATTG-A--TGTTTTTGTT
gi|65864                      :                                                                                                                                      -G--CAACC---TT--A-CT--G-T-CA--G-AT-A-T-----T---AA-C------A-TT-TT------TGA--TTG-TC-TT--A-CT-GT---G-G-TT---------ATTT--CGACCTA----A-ATTT---ACAT-CA---GA--A-T-G-G------A---T-C-AA----A--T-A-A-AC-TCA-TAT--GAT------T-G-TAC-T--TTT-A--T-A-TT--GA-T-A-CCA-T--T---T-A-TCG--TA-AATT-A-GCT-G-A-T-T-----T-G-CCA-AT--A-TT---CA-TG---AA-T--TCATAATG----T-T-TT----G-T----AACA-TTTG-A--TG-TTTTATT
gi|65865                      :                                                                                                                                                                  --C-AC-C-T-----T-CAAA-C------A-TT-TA------TGA--T-G-CC-AT--A-TC-TTCTGG-G-TTGGTT---G-AATT-TCAACTTAGA--A-A-------CAT-CA---G-----T-G-G-----TA---C-C-AA----A--T-G-A-AA-CCA-TAT-GAAT------T-G-TTC-T--TTA-A--T-T-T---GA-T-A-CCA-T--T-A-T-A-T-G--TA-AATT-A-G
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gi|65868                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-A-T-G--TA-AATT-A-GCT-G-A-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---CA-TG---GA-T-AT--CAATAA--TT-T-TG----G-T----AAAA-CTT--A--TGTTTTTAT
gi|65869                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-A-T-G--TA-GATT-A-ACT-C-A-T-T-----T-G-C---AT--A-TT---AA-TG---AA-T-AT--TAATGA--TT-T-TT----G-T----AAAA-A


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blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      G    .  . .  .  .  C   .     .    A .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        AATTTA           .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  AT    .      . .   . .    . .  T   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       T   . . C     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    C        AGAGT            .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  TA    .      . .   . .    . .  T   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       T   . . C     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    C        AGATA            .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  TG    .      . .   . .    . .  T   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  AA  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    T        GATAA            .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  TG    .      . .   . .    . .  T   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TA  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      G    .  . .  .  .  T   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        GAAAA            .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . C     . .       .  TT  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        AGAAT            .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   C  . .   . .  T   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TT  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      G    .  . .  .  .  T   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    T        AAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        GAAA             .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   G  . .   . .  A   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   G  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    G        GAAG             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   G  . .   . .  A   . . . .   .    . .   T   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  T   . . . .   .    . .   T   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TA  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    T        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   T   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TA  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    T        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   G  . .   . .  T   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    T        GATA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    C        TAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  T   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   T   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . C     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    C        TAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  T   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  TG  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      T    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   T    C        AAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  AT  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    T        AATA             .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  T   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  T   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    T        AATA             .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  G   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . C     . .       .  .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      A    .  . .  .  .  T   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   T   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .  .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   G    .        AAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  T   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . C     . .       .  .   . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      G    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        TATA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  C   .   C  . .   . .  A   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . C     . .       .  .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      A    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        GAAA             .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  T   .   A  . .   . .  A   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     T      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  A   .   A  . .   . .  .   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . C     . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     A      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        GAAA             .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  T   .   A  . .   . .  .   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . G     . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     C      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        GAAA             .  .    .  . . . .      T     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  T   .   A  . .   . .  .   . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . T     . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     .      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        ATA              .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  T     .      . .   . .    . .  .   .   .  . .   . .  .   . . . .   .    . .   G   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . .     . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     .      G    .  . .  .  .  A   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   A    .        AAA              .  .    .  . . . .      C     .  .    .  . . .  .   .  .     .      . .   . .    . .  .   .                     . . . .   .    . .   C   . . .     . . .    .  .  .    .  .    . .  .       .   . . .     . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                 .  . . .     .      A    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   .    .                         .  .    .  .                                                 .      . .   . .    . .  .   .                     . . . .   .    . .                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                      . .     .      .    .  . .  .  .  C   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                      . .     .      .    .  . .  .  .  .   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  .  .  .   .     .    . .      .  .  .        .  . .  .  .  .  .  .   . .  .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                           
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Reference ( family-423 )      :                                                                                                              ACCA--T-G-G--CAACN---TTT-G-CT--A-T-CA--C-AC-C-T-----T-CAAA-C-A-TT-T------A------TGA--T-G-TC-AT--A-TC-TT---G-G-TT---T---A-ATTT-TCAACTTA-G--A---A----A-CAT-CA---GA--GT-G-G-----TA---C-C-AA----A--T-G-A-AA-GCA-T-A-T-G-AA-T------T-G-TAC-T--TTT-A--T-N-T---GAT-A-CC-A-T--T-A-TA-T-G--TA-AA-TT-A-GCTC-A-T-T-----T-G-C---ATA--TT---CA-TG---AA-T-AT--TAATGA--TT-T-TC----G-T----AAAA-ATTG-A--TGTTTTTATT
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