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lowQualScore                  :       2  3  7777   5 1 1 33 333   22 2 11  1    444444   1 33 2 2 3 3333 1 3  3    22 111  6666666666 333 4444444444 4444444444 5555555555 333   11 222 11 2 555555555 1 1 11 11 11 666 4 1 1 2 444 4444 22 11 1 1  555 3  1 22 99999   11 11  1 1 2  333 1    2   1 2  1  1   
lowQualScore                  :       .  .  ....   . . . .. ...   .. . ..  .    ......   . .. . . . .... . .  .    .. ...  .......... ... .......... .......... .......... ...   .. ... .. . ......... . . .. .. .. ... . . . . ... .... .. .. . .  ... .  . .. .....   .. ..  . . .  ... .    .   . .  .  .   
lowQualScore                  :       0  3  1111   8 4 4 33 777   77 3 66  1    222222   1 66 1 1 1 9999 0 1  1    55 888  1111111111 333 6666666666 6666666666 5555555555 999   44 888 44 1 555555555 0 0 44 44 44 444 1 0 0 0 111 5555 44 44 0 0  333 1  0 55 11111   55 55  1 1 2  111 1    3   4 4  2  2   
consensus                     :   GAAA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
Reference ( gi|58339 )        :   GAAA-AGATA--A-ATTTC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58338                      :   GAAA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-A-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58340                      :   GAAA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T----AA--A-A--AC-CTTC------AAA----T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G----AA--A---T--G-A---------C-A-G--A--AATA-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-TT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTT--AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58341                      :   GAAA-AAGTA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-TCG--C-G-T-CA-TTTT------TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G-----A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C-----TCG--GACAC-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58342                      :   GGAA-AAACA--T-ATTCC-A-T--T---TAA--A-A--CC-CTTC------AAA-AA-T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTA--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-TGA-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCT--G--GG-A-C-AA---A-TTCC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58345                      :   GAAA-AGATA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-G-T-G--C-G-T-CA-TTT------------------------------------------------------------AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--T--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58343                      :   GAAA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--A-G-C-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------A----------T----------G---AAA--A---T--GAA---------C-A-GGAA--A--A-T---T-A-G-TTG-A----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCA--G--AG-A-A-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58344                      :   GAAA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--TT--CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A----T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--T---AT----------GAT-A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-A-A-G-T--------A--A--A-A-TG---A-CT-A--T--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-ACTAAA
gi|58346                      :   GAAA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT---------------------------------------------------------------------T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG--------A--C--T--TCG--G--AT-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58347                      :   GAAA-AGGTA--G-TTTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC---TC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTA--T---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--A-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-C---GGTGTA--A--A-A-TG---ACCT-A--C-----TCG--G--AG-ACC-GA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58348                      :   GAAA-AGTTA--T-ATTCC-AAT--T---CAA--A-A--AC-CTTCC-----AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CATTTTT--A---TT----------GGGTA----------T----------T----------GA--AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-TCGAA----A--A--A-A-TG---A-CT-AACT--T--TCG--G--AG-A-CAAA---A-TTTC-AAAGC-CT-AC-AAA
gi|58349                      :   GAAATAGGTT--A-ATTCC-A-T--T---CAA--A-T--TC-CTACTGGCGAGAA-A--TGTGT-G--T-G-T-CAGTTTT--AGAATT----------G---A----------T----------TT---------G---AAA--A---T--G-AAA-------C-A-G--A--A--A-TTA-T-A-G-T---G----AC-A--A-A-TACTCA-CT-C--C--C--TCG--G--AG-A-C-CA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AGA
gi|58350                      :   GAAA-AGTTA--T-ATTTT-T-T--T---CAA--ACA--AC-TCTT------AAA-A--T-T-TTG--T-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------TTCACATCATCA---AAA--A---T--G-A---------C-ACA--A--A--A-T-A-T-T-T-TT--A----A--A--A-A-TT---A-CT-A--C--AA-TCGACG--AG-A-C-AT---A-CATC-AAGCC-GT-AT-AAA
gi|58351                      :   GAAA-AGGTA-----TTTCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-G-G--C-T-T-CA-TTT
gi|58352                      :    AAA-AGCTA--T-ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-AA-T-T-T-G--A-G-T-CA-TTT---A---TT----------G---G----------T----------T----------G---AAA------T--T-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--T--T--TCA--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAACC-TT-AC-AAA
gi|58354                      :    AAA-AGGTACAA-AATCC-A-TATT---CAATAA-A--AC-CTTC------AAA-A--T-TAT-G--CAG-T-CA-TTTTA-A---TT----------G---A----------T----------T----------GGAAAAA--G---T--GAA---------C-A-G--AATA--A-C-A-TAA-G-T---GAA--A--A--A-A-TG---ACCT-A--C--TGGTCG--C--AGAA-C-AATAGA-TTTT-AAGCCGCT-A
gi|58355                      :    AAA-AGATG--T-ATAAT-A-TA-T---CAAT-A-A--AG-CTTC------AAA-A--T-T-T-GG-C-G-T-CA-TTT---A---TTAT--------G---A----------T----------T----------G---AAC--A---T--G-AATAGTTGAGCGA-G--A--A--G-T-AAT-A-GGT---G----A--AGAA-A-TG---A-CT-A--C--T--T
gi|58357                      :     AA-AGATT--ATAT----A-T--T---CAA--A-A--GC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--T---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-C--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTGC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58356                      :     AA-GGGTA--T-ATT-C-A-T--T---CTA--A-C--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------T---GAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TGA--A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTCAAAGCC-CT-AC-AAA
gi|58358                      :     AA-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T---AAA--A-A--AC-TCT-------AAA-A--T-T-A-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--AT--T--G-A---------T-A-G--T--A--A---A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---ATCT-AT-C--T--TCG--G--AG-A-C-AAG--A-TTTC-AAG---CT-AC-AA
gi|58359                      :      A-AGGTA--T-ATTCC-A-T--T---CTA--A-C--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G----AA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TGA--A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTCAAAGCC-CT-AC-AAA
gi|58361                      :         GATA--T-ATTCT-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-TTG--C-GGT-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--
gi|58353                      :          ATA--A-ATGCC-A-T------CAC--A-A--AC-CTTC------AAATA--T-T-T-G--C-G-TACAATTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------GA--AAA--A---TGGG-A---------C-A-G--A--A--A-C-ATT-A-G-T---G----ATGA--A-A-TGAA-A-CT-G--C--T--TCG--G--AG-A-CTAA---A-
gi|58362                      : aaacggtataTA--T-ATTTT-A-T--CAAACAA--A-AGAACTCTT---------A-A--T-T-T-GG-T-A-T-CA-TTCT--A---TT----------A---A----------T----------TTA--------A---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-AT---A-CTTC-GA
gi|58360                      :                -ATTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CGT-------AAA-A--T-T-T-G--C---T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--AAAAT--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-AAG-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CTGAC-AAA
gi|58365                      :           aaggtttTTCC-A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TATT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------A-A-G--A--A--A-T-A-T-C-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--T--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58363                      :                  TTCC-A-T--T---CAT--A-A-----CTTC------AAA------T-T-GGAT-G-T-CA-TTTTTAA---TT----------G---A----------T---------------------G---AAA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-T-A-A-A-G-T---G----A--A--A-A-AG-----CT-A--C--T--TCG--G---G-A-C-AA---A-TTTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58364                      :               attTTTC-C-C--C---CAA--A-A--TT-CTT-------AAA-A--T-T-T-G------T-CA-TTTT--A---TTAATTTCAGCTG---A----------T----------C----------A---AAA--A---T--G-A---------A-A-A--A--A--A-A-AGT-A-G-T---A----A--A--A-A-TT---A-CT-A--C--A--AGG--G--AG-A-C-AT---A-CTTC-TAGCC-CT-GT-AAA
gi|58366                      :                   atC-A-T--T---TCA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TATT--A---T---------------A----------T----------T----------G---AAA--T---T--G-A---------A-A-G--A--A--ACT-A-T-C-G-T---G----A--A--ACATTG---A-CTAA--T--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-ATTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58367                      :                      -A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--CAG-T-CA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-TTA-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---ATTTTC-AAGCC-CT-AA-AAA
gi|58368                      :                             ---CAA--A-A--CC-CCTT------AGA-A--T-T-T-T--A-G-C-CC-TTTC--A---TT----------A---AATTCACCTCGT----------T----------A---AAA--A---T--G-A---------C-A-------A--A-TGA-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CA-A--CAAT--TAG--G--AG-A-A-AT---A-TTTC-AAGAT-CT-AT-AAA
gi|58369                      :                                 AA--A-A--AC-CTTC------AAA-AATTAT-T-G--C-G-TTCA-TTTT--A---TT----------G---C----------A----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-ATT-A-GTT---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTT-AAGCCACT-AC-AAA
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gi|58371                      :                                 AA--A-A--AC-TCGT------GAA-A--T-T-T-G--A-G-T-TA-TTTC--A---TT----------A---A----------T----------TTCACCTCATCA---AAA--A---T--A-A---------C-A-G--G--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TG---A-CT-G--T--A--TGG--G--AA-A-C-AT---G-CTTC-TAGCC-CT-AT-GAA
gi|58372                      :                                  A--A-A--AC-CTCT------TAA-A--T-T-T-A--T-G-T-CA-TTAT--A---TT----------A---A----------TGTCGCCTCATT----------A---AAA--A---T--T-A---------C-A-G--A--A--A-T---T-A-T-T---A----A--A--A-G-TG---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-T-AT---A-CTTT-AAGCC-CT-AG-AAA
gi|58373                      :                                  A--G-A--AC-TATT------AAA-T--T-T-T-G--T-A---CA-TTTT--A---TT----------A---A----------T----------TTCACCCCATCA---AAA--A---T--A-A---------C-A----A--A--A-T-A-T-----T---T----A--A--A-A-TG---G-CC-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-AT---A-TTTC-TAGCC-CT-AT-AA
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gi|58375                      :                                               TC------AAA-A--T-T-T-G--C-T-TTCA-TTTT--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A--T-A--CA-T--TCG--G--AG-A-C-AA------TTC-AAG-C-CT-AC-AAA
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Reference ( family-420 )      : GAAA-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58338                      : GAAA-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-A-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58339                      : GAAA-AGAT-AAA-----T--TTCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
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gi|58354                      :  AAA-AGGT-ACA-----AAATCCA-TATT---CAATAA-A--AC-CTTC------AAA-A--T-TAT-G--CAG-T-CA-TTT--TA-A---TT----------G---A----------T----------T----------GGAAAAA--G---T--GAA---------C-A-G--AATA--A-C-A-TAA-G-T---GAA--A--A--A-A-TG---ACCT-A--C--TGGTCG--C--AGAA-C-AATAGA-TTTT-AAGCCGCT-A
gi|58355                      :  AAA-AGAT-GTA-----T--AATA-TA-T---CAAT-A-A--AG-CTTC------AAA-A--T-T-T-GG-C-G-T-CA-TTTATT--A---T-----------G---A----------T----------T----------G---AAC--A---T--G-AATAGTTGAGCGA-G--A--A--G-T-AAT-A-GGT---G----A--AGAA-A-TG---A-CT-A--C--T--T
gi|58356                      :   AA-GGGT-ATA-----T--TC-A-T--T---CTA--A-C--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------T---GAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TGA--A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTCAAAGCC-CT-AC-AAA
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gi|58358                      :   AA-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---AAA--A-A--AC-TCT-------AAA-A--T-T-A-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--AT--T--G-A---------T-A-G--T--A--A---A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---ATCT-AT-C--T--TCG--G--AG-A-C-AAG--A-TTTC-AAG---CT-AC-AA
gi|58359                      :    A-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---CTA--A-C--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G----AA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TGA--A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTCAAAGCC-CT-AC-AAA
gi|58360                      :    A-AGGT-TTA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CGT-------AAA-A--T-T-T-G--C---T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--AAAAT--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-AAG-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CTGAC-AAA
gi|58361                      :       GAT-ATA-----T--TCTA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-TTG--C-GGT-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--
gi|58362                      :         T-ATA-----T--TTTA-T--CAAACAA--A-AGAACTCTT---------A-A--T-T-T-GG-T-A-T-CA-TTC--T--A---TT----------A---A----------T----------TTA--------A---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-AT---A-CTTC-GA
gi|58363                      :          -ATT-----T--TCCA-T--T---CAT--A-A-----CTTC------AAA------T-T-GGAT-G-T-CA-TTT--TTAA---TT----------G---A----------T---------------------G---AAA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-T-A-A-A-G-T---G----A--A--A-A-AG-----CT-A--C--T--TCG--G---G-A-C-AA---A-TTTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58364                      :          -ATT-----T--TCC--C--C---CAA--A-A--TT-CTT-------AAA-A--T-T-T-G------T-CA-TTT--T--A---TTAATTTCAGCTG---A----------T----------C----------A---AAA--A---T--G-A---------A-A-A--A--A--A-A-AGT-A-G-T---A----A--A--A-A-TT---A-CT-A--C--A--AGG--G--AG-A-C-AT---A-CTTC-TAGCC-CT-GT-AAA
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gi|58375                      :                                                 TC------AAA-A--T-T-T-G--C-T-TTCA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A--T-A--CA-T--TCG--G--AG-A-C-AA------TTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58376                      :                                                          AA-T--T-T-T-T--C-G-T-CA-TTT--T--A---AT----------G---A----------A----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--T--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-
gi|58377                      :                                                                 -T-T-G----G-T-CA-CCT--T--A---TT----------A---C----------A----------T----------G---TAATCA---T--G-A---------C-A-A--A--A--A---A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CA-A--CAAT--TAG--A--AG-A-C-AT---G-TTTC-AAGAC-CT-AT-
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Reference ( family-420 )      : GAAA-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58338                      : GAAA-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-A-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58339                      : GAAA-AGAT-AAA-----T--TTCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
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gi|58352                      :  AAA-AGCT-ATA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-AA-T-T-T-G--A-G-T-CA-TTT-----A---TT----------G---G----------T----------T----------G---AAA------T--T-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--T--T--TCA--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAACC-TT-AC-AAA
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gi|58354                      :  AAA-AGGT-ACA-----AAATCCA-TATT---CAATAA-A--AC-CTTC------AAA-A--T-TAT-G--CAG-T-CA-TTT--TA-A---TT----------G---A----------T----------T----------GGAAAAA--G---T--GAA---------C-A-G--AATA--A-C-A-TAA-G-T---GAA--A--A--A-A-TG---ACCT-A--C--TGGTCG--C--AGAA-C-AATAGA-TTTT-AAGCCGCT-A
gi|58355                      :  AAA-AGAT-GTA-----T--AATA-TA-T---CAAT-A-A--AG-CTTC------AAA-A--T-T-T-GG-C-G-T-CA-TTTATT--A---T-----------G---A----------T----------T----------G---AAC--A---T--G-AATAGTTGAGCGA-G--A--A--G-T-AAT-A-GGT---G----A--AGAA-A-TG---A-CT-A--C--T--T
gi|58356                      :   AA-GGGT-ATA-----T--TC-A-T--T---CTA--A-C--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------T---GAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TGA--A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTCAAAGCC-CT-AC-AAA
gi|58357                      :   AA-AGATTATA-----T-----A-T--T---CAA--A-A--GC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--T---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-C--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTGC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58358                      :   AA-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---AAA--A-A--AC-TCT-------AAA-A--T-T-A-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--AT--T--G-A---------T-A-G--T--A--A---A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---ATCT-AT-C--T--TCG--G--AG-A-C-AAG--A-TTTC-AAG---CT-AC-AA
gi|58359                      :    A-AGGT-ATA-----T--TCCA-T--T---CTA--A-C--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G----AA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TGA--A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTCAAAGCC-CT-AC-AAA
gi|58360                      :    A-AGGT-TTA-----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CGT-------AAA-A--T-T-T-G--C---T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--AAAAT--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-AAG-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CTGAC-AAA
gi|58361                      :       GAT-ATA-----T--TCTA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-TTG--C-GGT-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--
gi|58362                      :         T-ATA-----T--TTTA-T--CAAACAA--A-AGAACTCTT---------A-A--T-T-T-GG-T-A-T-CA-TTC--T--A---TT----------A---A----------T----------TTA--------A---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-AT---A-CTTC-GA
gi|58363                      :          -ATT-----T--TCCA-T--T---CAT--A-A-----CTTC------AAA------T-T-GGAT-G-T-CA-TTT--TTAA---TT----------G---A----------T---------------------G---AAA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-T-A-A-A-G-T---G----A--A--A-A-AG-----CT-A--C--T--TCG--G---G-A-C-AA---A-TTTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58364                      :          -ATT-----T--TCC--C--C---CAA--A-A--TT-CTT-------AAA-A--T-T-T-G------T-CA-TTT--T--A---TTAATTTCAGCTG---A----------T----------C----------A---AAA--A---T--G-A---------A-A-A--A--A--A-A-AGT-A-G-T---A----A--A--A-A-TT---A-CT-A--C--A--AGG--G--AG-A-C-AT---A-CTTC-TAGCC-CT-GT-AAA
gi|58365                      :              -----T--TCCA-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TAT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------A-A-G--A--A--A-T-A-T-C-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--T--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTC-AAGCC-CT-AC-AAA
gi|58366                      :                        CA-T--T---TCA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--C-G-T-CA-TAT--T--A---T---------------A----------T----------T----------G---AAA--T---T--G-A---------A-A-G--A--A--ACT-A-T-C-G-T---G----A--A--ACATTG---A-CTAA--T--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-ATTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58367                      :                         A-T--T---CAA--A-A--AC-CTTC------AAA-A--T-T-T-G--CAG-T-CA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-TTA-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---ATTTTC-AAGCC-CT-AA-AAA
gi|58368                      :                               ---CAA--A-A--CC-CCTT------AGA-A--T-T-T-T--A-G-C-CC-TTT--C--A---TT----------A---AATTCACCTCGT----------T----------A---AAA--A---T--G-A---------C-A-------A--A-TGA-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CA-A--CAAT--TAG--G--AG-A-A-AT---A-TTTC-AAGAT-CT-AT-AAA
gi|58369                      :                                   AA--A-A--AC-CTTC------AAA-AATTAT-T-G--C-G-TTCA-TTT--T--A---TT----------G---C----------A----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-ATT-A-GTT---G----A--A--A-A-TG---A-CT-A--CT-T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTTT-AAGCCACT-AC-AAA
gi|58370                      :                                   AA--ATA--AC-TCTT------AAA-T--T-T-T-G--T-G-T-CA-TTT--T--T---TT----------T---A----------T----------TTCATCTTATAA---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TA---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-A
gi|58371                      :                                   AA--A-A--AC-TCGT------GAA-A--T-T-T-G--A-G-T-TA-TTT--C--A---TT----------A---A----------T----------TTCACCTCATCA---AAA--A---T--A-A---------C-A-G--G--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TG---A-CT-G--T--A--TGG--G--AA-A-C-AT---G-CTTC-TAGCC-CT-AT-GAA
gi|58372                      :                                    A--A-A--AC-CTCT------TAA-A--T-T-T-A--T-G-T-CA-TTA--T--A---TT----------A---A----------TGTCGCCTCATT----------A---AAA--A---T--T-A---------C-A-G--A--A--A-T---T-A-T-T---A----A--A--A-G-TG---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-T-AT---A-CTTT-AAGCC-CT-AG-AAA
gi|58373                      :                                    A--G-A--AC-TATT------AAA-T--T-T-T-G--T-A---CA-TTT--T--A---TT----------A---A----------T----------TTCACCCCATCA---AAA--A---T--A-A---------C-A----A--A--A-T-A-T-----T---T----A--A--A-A-TG---G-CC-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-AT---A-TTTC-TAGCC-CT-AT-AA
gi|58374                      :                                             C-CATT------AAA-T--T-T-T-G--T-G-T-TC-TTT--T--A---TT----------A---A----------T----------TCCACCTCATCA---AAA--A---T--G-A---------C-A-C--A--A--A---A-T-A-T-T---A----A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--A--TGG--G--AG-A-C-AT---A-TTTC-
gi|58375                      :                                                 TC------AAA-A--T-T-T-G--C-T-TTCA-TTT--T--A---TT----------G---A----------T----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--A--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A--T-A--CA-T--TCG--G--AG-A-C-AA------TTC-AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58376                      :                                                          AA-T--T-T-T-T--C-G-T-CA-TTT--T--A---AT----------G---A----------A----------T----------G---AAA--A---T--G-A---------C-A-G--A--T--A-T-A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-
gi|58377                      :                                                                 -T-T-G----G-T-CA-CCT--T--A---TT----------A---C----------A----------T----------G---TAATCA---T--G-A---------C-A-A--A--A--A---A-T-A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CA-A--CAAT--TAG--A--AG-A-C-AT---G-TTTC-AAGAC-CT-AT-
gi|58378                      :                                                                                                                                                    AA--A---T--G-A---------T-A-G--A--A--A-------A-G-T---GC---A--A--A-A-TG---A-CT-A--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTT--AAG-C-CT-AC-AAA
gi|58379                      :                                                                                                                                                                                               -A-G-T---G----A--A--A-A-TG---A-CT-G--C--T--TCG--G--AG-A-C-AA---A-TTAC-AAACC-CT-AC-AAA


blockSeqs                     :     T    T   ATAAA AA    T AT AAA   TA C GA  T    TGGCGA   T AT G G C GAT  G A  T   AT TA GAA  AATTTCAGCT GGT ATTCACCTCG GTCGCCTCAT TCACATCATC GAA   TC AAA GG A ATAGTTGAG G C GA AT AT TG  T     G CGA GTGT TG GA C T  CTC C  A AC TGG     AC AC  A C A  TAG T    A   C G  G  T
blockSeqs                     :     .    .   .     .     A A  .     T  T .   .    C        . A  A A T CA   . T  G   .  A  .    .          AT  .          .          TCATCTTATA A     .  T   .  A AA        . . .  .  .  TT  A     T TG  AA   C  .  . .  AA  C  . T  AAT     .  .   . . T  G   .    A   C A  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . A  . . T GC   . T  A   .  .  .    .          .   .          .          TCACCTCATC A     .  .   .  . .         . . .  .  .  CT  G     . T   C    .  .  . .  A   T  . .  AAT     .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . GT   . .  .   .  .  .    .          .   .          .          TCACCCCATC .     .  .   .  . .         . . .  .  .  TT  T     . .   .    .  .  . .  A   .  . .  AA      .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . CA   . .  .   .  .  .    .          .   .          .          CCACCTCATC .     .  .   .  . .         . . .  .  .  TG  .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  TT      .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          TA         .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  TT      .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          T          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  TT      .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  AT      .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   G .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . A    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . T    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . T    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  C   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  C       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  C   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . A    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   A .  .  .
blockSeqs                     :     .    .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :          .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :          .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :          .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :          .   .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  A   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .   A .  .  .
blockSeqs                     :              .     .     . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   C .  .  .
blockSeqs                     :                          . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   . .  .  .
blockSeqs                     :                          . .  .     .  . .   .    .        . .  . . . A    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .   . .  .  .
blockSeqs                     :                               .     .  . .   .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .   . .  .  .
blockSeqs                     :                                     .  . .   .    .        . .  . . . T    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .   . .  .  .
blockSeqs                     :                                     .  . .   .    .        . .  . . . A    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  T   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .   . .  .  .
blockSeqs                     :                                     .  . .   .    .        . .  . . . T    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .   . .  .   
blockSeqs                     :                                     .  . .   .    .        . .  . . . T    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  A       .  .   . . .  .   .    .            
blockSeqs                     :                                     .  . .   .    .        . .  . . . T    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .    .            
blockSeqs                     :                                              .    .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  T       .  .   . . .  .   .                 
blockSeqs                     :                                                   .        . .  . . . C    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  .       .  .   . . .                        
blockSeqs                     :                                                            . .  . . . .    . .  .   .  .  .    .          .   .          .          .          .     .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  . .  .                                           
blockSeqs                     :                                                                 . . . .    . .  .   .                                                                .  .   .  . .         . . .  .  .  .   .     . .   .    .  .  . .  .   .  .                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                   . .   .    .  .                                                               


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