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Reference ( gi|54262 ) : AAAA---ATAAA-AA-TA--G----GT-GT--GTT-T-C--C---GCTA---A---------C-A---TA---C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----GT--A--G--G-GAA-T--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C-A----A-A--C---------A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CGT-C--T-T-A----C----AT-C-----------TA----C-T-G--A--T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--G-T--T-TTGTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
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gi|54287 : AAA---ATAAA-AAATA--G----TT-GT--GTTAT-C--C---GCTA---A---------C-A---TA---C------A---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----GT----------GAC-T--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--A-T--------AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-TTA-G------T--A-GCG-------C-G----A-A--C---------ATTC-A---T-A----A-TT---A----A-T-AA--A-----C--CAA--CAAGA-T----A-A-A-G--T----CAT-C--TAC-A----C----CT-C-----------TA----CAT-G--A--T-----T-CATAT-A--TCA----T-----T-A--A-T--C--A-T-T---AACTC---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----G-T--T------A-A-T-T-----TTAATTA-C-TT--T-----G-GA--A-G--T-TTG-T--T-CGAG-TTA-A-C-AAACAT
gi|54288 : AAA---ATAAA----TA--G----TT-GT--GTT-T-T--C---GCTATAAA---------CCA---TA---A----CAG---A--AAA----AA--T-TACTCATTTAAATTGAAGG--GT-GG---T-A-----G----GT--A--G--G-AAA-T--A-CA--TT-TT--A---T--------AA-TT--T-C--A-----AA--T--TTT--------------------------------T--T--C-A--------------------------------------------------------T-T-A-T--A-TT---A----A---------CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-AAG--T----CAT-T--T-T-A----C----AC-C-----------TA----C-T-G--AA-T-----T-CAT-T-AG-TGA--T-T-----T-AT-A-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--T--CT----A-T--TTTG---A-A-T-T-----TTA--TA-CTTT--T-----G-AA--G----T-TTGTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
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gi|54295 : gttatgttatcctacttaactataagtag----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-T-----G----GG--A--A--G-AAA-T--A-AA--TT-T---A---TTT----C-AA-TT--T-T--A-----A--------T-A------------------------------------C-A-ATA-G------T--A-T-G-------C-G----A-A-----------------A-----A-C--A-TT---A----A-C-GA--A-CT--A--TAA--GA--A-G----A-A-A-G--T----AAT-C--T-T-A----C----AT-C-----------TA----C-T-G--A--T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AC--C---T---AC------GA-----A-TG-TT-TT----A-T--T--GA--A-A-T-TCAATGTTA--TA-C-TT--TCAAAAG-AA--A-T--T-TTGCT--T-T-AG-TT--AGC-AA
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Reference ( family-419 ) : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
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gi|54265 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--CTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AA-T--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T----A-----AA--T--TT--A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C--------AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------ATATAC-T-G--A-T-----T-CAT-TTA--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54266 : AAAA---ATAAA-AA-AA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----TT--T-TA---------------GA--GTAGG---T-A-----G----G--TTAA--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTA----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------A------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----T-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-ATT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54267 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--------------------------------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--C----------A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACATta
gi|54268 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-AA--TA-----CATTCCAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-ACCGTAG----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--AT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-T--A-TC---A----A-T-AA--A-CT--C--AAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--A-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TC-CT----C-G--T--G---A-A-T-T-----TTA--AA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-GTT--C-TGAG-TT--A-C-AAACATta
gi|54269 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-A--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C-----AG---A--AAA----AA--T--A---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--AGG-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-A-------------AA--TA--A-T----ATA-A-G--T-----AT-C----T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CTC-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-TG--AG--T---T---AT-----GGA-----A-T--GT-CTG---A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C--AACATca
gi|54270 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--T---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--T--A---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AACT--T-GA--TT-TG--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TA--T--C-A-ATA-G------T--T-G-G-------C------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AC--A-CT--C--AAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----TA-------T-A-----C----AC--A-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-G--TC-CA----A-G--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-GA--GT--T-TT-ATT--T-TGAG-TT--A-C-AAAAAT
gi|54271 : AAAA---ATAAAGAA-TA--GTTC---GT--GTT---C--C---GCT-AC--A---------T-AAATTA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GGCGGTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-TTGTT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-ATATA-G------T--A-G-G-------C------G-AAA-C---A--C-A-T-T-G-C--A-TT---A----A-T-AA--A-AT--C--CAA--CA--AAT----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----A----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-AAA-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AAA-C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-------------------------A--CG-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TTTGTT--T-TGAG-TT--A-A-AGACATta
gi|54272 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GT--GTT-TTC--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G--AAT--A-AA--TT-TT--A----TT----T-AT-TT--T-TTAA-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--CTA-ATA-G------T--A-G-GC------C------G-AA--CA--A--A-A-TAT-A-CG-A-TA---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--ACT----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--ACT-----T-CAT-TAA--TGA--T-T-----T-ATTT-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----ATT--T--G---A-A-C-T-----TT------T-TT--T-----G-A
gi|54273 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAA---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---C-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTC-N----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATT--T--C-A-AT--G------T--A-G-G-------C------G-AACCC---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-TAAA--A-CT--T--CAA--CA--A-T----A-A-G-A--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----C-AAT-T-AT-TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-TAC---AA--C---TGG-AT-----GGGAACATA-T--TTGCT----ATT--T--G---ATA-T-C-----TAA--TACC-TT--T-----GAAA--GTAAT-TT-GTTGCT-TGAG-TT--A-CAAAACAT
gi|54274 : AAAAT--ATAAA-AA-TA--GC-----GT--GTTCT-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAGTGAA--AAA----AG--T-T-----------------G--ATAGT---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--AG--TTT----T-A------T-T--G-----AA-----TTT-A----T------------------------TT--T--A-C-GTA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-ACT-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--G-CT--C--C-A--CA--A-T------A-A-G--T----CAT----T-T-A-----C----AC--CTT-----------AAT--C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T--TTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----G-------A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--T--C-TT--T-----G-AAAGGT--T-TT-GTT--TCTGAG-TT--A-C-AAAC
gi|54275 : AAAA---ATAAG-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA------------------T----CAT-C-----------------------------------------------A-T-----C-CAT-C-A--TCA--T-CGG---T-ATTT-T--G--A-T-T---AA--C---
gi|54276 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--AATA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--ATAG--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----TG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------C------G-AA--C---A--C-A-T--------A-T-------------------------------CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--A-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--CAAA-T-T---AG--C---
gi|54277 : AAAA---ATAAA-AAATA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTA-------A-----G----G--T--A--GTAG-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT-----------------------------------A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C----TT---A----A---AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T------A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----TCCATCT-AAGAGA--T-A-----T-ATTA-T--C--
gi|54278 : AAGA---ATAAA-AA-TGTGGTT----GT--GTT-T-T--C---CCT-A---A---------C-----TATTC--C----CAG---A--AAA----AAAAG-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G-------T--A--G--G-AAAT--A-AAATTT-TT--A---TTT----A-AT-TT--C-T--A-----AAGTT--CTT-A----T------------------------TC--C--C-A-TT--G------T--A-A-G-------T------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-CTAACTT---A----T-T-AAGCA-CT--C--CAAAACAG-A-T----A-ATA-G--T----CATGC--T-T-A----------GC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----TGATTA-T--CT-A-T-TA--AA--C---T---AT------GA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TT---TA-C-TT--T-----G--A--GT--T-
gi|54279 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--T--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----TCAT-TT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-
gi|54280 : AAAATATATAAA-AAGTA--GTT----GTTAGTT-T-C--TCTAGCT-A---AAAA------C-A---TA-----C----CAG---A--AAACAAAAA--A-TA---------------GG---TAGG---TTA-----G----G--T--A--G--G-AA-T--A-CA--TT-TTTAA---TTT----TTAT-CTG-T-T--ATAGAAAA--T--TTT-A----T------------------------TT--TT-C-G-ATAAG------TC-ATG-G-------CT-----G-AA--C---A--CGA-T-T-AAC--A-TTTTTA----ACT-AT--A-CT--C--CAA--CA--A-TTATCA-A-A-G--T----CAT-C--T-T-ATTCT-C----AC--C-T-----------T----C-TTG--T-T-----T-CAT-T-T--T----T-TAAAAAT-ATTA-T--C--AAT-T---AA--T---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-TACT--GT--A-ATT-T-----TTA--TA-C-TT--T-----A-AA--GT--TATT-GTT--
gi|54281 : AAAA---ATAAA-GC-TA--GTT----GTA-GTT-T-T--C---ACT-A---AAGTTGAAACC-A---TT-----C----CTG---G--AAA----AA--A-TA---------------GA---TAG----T-G-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-C--A-----AA--A--TTT-A------------------------------T--T--C-A-ATA-A------T--ATG-G-------C------A-AA--G---A----------A-C--A-TT---A----A-T-GA--A-CG--C--CAA--CA--A------G-A-A-G--T----GAT-G--T-T-------C----AC--C-TATTGATTCAATA----C-T-G--A-T-----T-CAA-T-A--CAA--T-T-----T-A-TA-T--C--A-T-T---AA--C---T----T------GA-----A-TG-TT-CTTCAAA-A--T--G---A-A-----------------------T-----G-AA--GC--T-TT-GTT--T-T
gi|54282 : AACA---ATAAA-AA-TA--GAT----GT--GTT-T-C--C---GCC-A---A---------C-G---TC-----C----CAG---A--AAA----A-----T--------------------GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-GAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TCT-A----A------------------------TT--T--C-A-A-A-C------T------G-------C------A-AA------A----------A-C--A-TG---A----A-T-GA--T-TG--C--CAA--CA--A-G----A-A-A-G--T----AAT-G--T-T-A-----C----AC--
gi|54283 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GG--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG------AAA----AA--T-TA---------------GG--GCAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TT
gi|54284 : AAAA---ATAAA-A--TA--GTT----AT--GTT-T-C--C---ACT-A---A---------C-A---TA-----C----CAA---A--TAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----
gi|54285 : AAAA---ATAGA-AA-AACTGTT----GT--GTT-T-T--C---GCA-A---A---------C-A---TT-----C----CCG---A--AAG----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--G--G--T-AAAT--A-AA--TC-TT--A---CTTTTAAT-AT-TT--C-T--G-----A
gi|54286 : AAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GC--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA--------T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----A-TT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G--A--C---AC-C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--T-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----CA--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--ATT-T---AA--T---T---AT-----GAA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54287 : AAA---ATAAA-AAATA--GTT----GT--GTTAT-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C------A---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T----------GACT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--A-T--------AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-TTA-G------T--A-GCG-------C------G-AA--C---ATTC-A---T-A----A-TT---A----A-T-AA--A-----C--CAA--CAAGA-T----A-A-A-G--T----CAT-C----T-A-----C----ACCTC-T-----------A----CAT-G--A-T-----T-CATAT-A--TCA----T-----T-A--A-T--C--A-T-T---AACTC---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----G-T--T------A-A-T-T-----TTAATTA-C-TT--T-----G-GA--AG--T-TT-G-T--T-CGAG-TTA-A-C-AAACAT
gi|54288 : AAA---ATAAA----TA--GTT----GT--GTT-T-T--C---GCT-ATAAA---------CCA---TA-----A----CAG---A--AAA----AA--T-TACTCATTTAAATTGAAGG--GT-GG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---T--------AA-TT--T-C--A-----AA--T--TTT--------------------------------T--T--C-A---------------------------------------------------T-T-A-T--A-TT---A----A---------CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-AAG--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--AAT-----T-CAT-T-AG-TGA--T-T-----T-AT-A-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--T--CT----A-T--TTTG---A-A-T-T-----TTA--TA-CTTT--T-----G-AA--G---T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54289 : AAT---ATAAA-AA-TA--GTTAAATGT--TTT-T-CGTC---ACT-A---AA--------C-A---TAG----C----CAA---GCTAAA----AA--T-TAAA-------------GG--GTAGG-----A-----GAAGGG--T--AC-G--G-GAAT--GTCA--TTATT--A---TCT----T-AT-TTCTT-T--A-----AA--T--TTTTA----T------------------------TT--TTTC-A-ATA-G------TTCA-G-GTTTGATGC------G-AA--A---A--C-A-T-T-A-C--A--T---A----A-T--G--A-CT--C--CAA--CA--A-T----ACA-A-A--T----CAT-CT-T-T-ATT---C----TT--C-T-----------A----C-T-G--ATT-----T-CAT-T-G--AGT--T-T-----T-ATTAGT--C--A-T-T---AAT-C---TTTCATTGAGAAGA-----A-TAATC-ATAA--A-T--T--GAGAA-A-T-TGA---TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GTA-T-TT-GAT--T-
gi|54290 : AAA---ATAAG-AA-TA--GTTT---GTT-GTT-T-C--C---GCT-ATTAA---------CCA---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------CG--GTAGGGAAT-A-----T----GAAT--G--T--G-AAGG--A-TA--TC-GT--AAGCTTG----T-AT-TT--TCT--C-----AA---------G----G------------------------CT--C--C-G-ACA-T------T--A-A-C-------C------G-AC--C---A--C-G----------A-TT---A----AGT-AA--A-CTAAC--AAA--CA--A-T----A-A-A-GG-T----CAT-A--TCT-C-----T----GC--C-C-----------A----C-T------T-----T-TAT-T-GC-TGA--T-TCA---T-ATTA-T--T--A-T-T---GA--C---T---AT-----GAA-----AAT--TT-CT----A-T--T--T---G-A-T-T-----TTA--TG-C-TTGCC-----A-AA--AT--T-TT-GTT--A-TGAGTTT--G-C-AAACATatatcagcagaggttacgaaacatta
gi|54291 : AG---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAAG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-TA--TT-TC--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----A---T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-T----A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----GC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--A-TGAta
gi|54292 : A---ATATA-AA-TA--GTT----GC--GTT-C-T--C---GCT-A---A---------C-A---AT-----C----CAG---A--AAA----AT--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---CTT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------G------G-AA--C--------------A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--T--CAA----------------------------------------------------------------------------G--A-T-----T-TAT-T-A--TCA--T-G-----T-ATT--T--C--A-T-TGGCAA--C---T----T-------A-----A-C--TT-CTG---A-T--T--T-------T-T-----TTT--TT-T-TT--T-----G-AA--AT--
gi|54293 : AAATAA-TA--GTTT---GT--GTT---C--C---G-T-A---A---------CCA---TA-----C----CAG---A--AAA----AT--T-TA---------------GG--GTAG----T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----TTAT-TT--T----------AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-A---C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--AACT--C--CAA--CT--A------A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC----T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-TA----T-ATTA-T--C--A-T-T----A--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----G-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGA--TTGAA-T-AAATAT
gi|54294 : --GTT----AT--GTTAT-C--CT--ACTTA---A---------CTA---TAAGTAGC----CAA---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTGGG---TAA-----G----G--T--A--G--G-AAATGAA-CA--TT-TT--A------------AT-TA--T-T--A-----AA--TTCTTT-ACCACT------------------------TT--T--C-A-ATACG------T--A-G-G-------CTCACGAG-AG--CCGAA--C-A-C-T--------TT---A----A-T-AA--T-CT--CTACAAC-CA--ATT----A-A-A-G--TTCTATAT-CTTT-T-A-----C----ACA-C-T-----------A----C-T-G--A-TAAGGAT-CAT-T----TGAATT-T-----T-ATTA-T--ca
gi|54295 : ----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-T-----G----G--G--A--A--G-AAAT--A-AA--TT-T---A---TTT----C-AA-TT--T-T--A-----A--------T-A------------------------------------C-A-ATA-G------T--A-T-G-------C------G-AA-----------A-----A-C--A-TT---A----A-C-GA--A-CT--A--TAA--GA--A-G----A-A-A-G--T----AAT-C--T-T-A-----C----AT--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AC--C---T---AC------GA-----A-TG-TT-TT----A-T--T--GA--A-A-T-TCAATGTTA--TA-C-TT--TCAAAAG-AA--AT--T-TT-GCT--T-T-AG-TT--AGC-AA
gi|54296 : --G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C------------------------------------G-AA--C---A--C-A-T-TTA-C--A-TT---A----A-T-AA--A-TT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----------T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-ATT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54297 : -TT--A---TTT------AT-TT--T-G--A-----AA--T--TTT-A----A------------------------TT--T--C-A-ATA-C------T--T-T-G-------C------A-AA--A---G--C-A-T-T--------------------T-AA--G-AT--CT-CAA--CA--A-T----A-A-T-G--T----AAT-C--T-T-A-----CTCTTAT--A-T-----------A----T-T-G--C-T-----T-CAT-C-A--TTA--T-T-----T-AATA-T--CG-A-T-T---AA--TAAAT---AT------CA-----A-TG-TT-CT----G-T--T--G---A-A-A-T-----TTA--TA-C-TT--ta
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gi|54299 : T----T-AT-TT--C-C--A-----AA--T--TTC-A----T------------------------TT--T--C-A-ATT-G------T--A-T-G-------C------GTAA-----------------A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--TA--A-G----A-A-A-G--T----TAT-C--T-A-A-----C----AC--C-T-----------
gi|54300 : --A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-GGCCTAGT--A-G-G-------T------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--G------------------------------A--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-T-----C----AC--C-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-TTCT--A-T-T---AA--C---T---ATG----GGA-----A-T--TT-CT----ATT--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--TC----C-AA--GT--T-TT-G-T--T-TGAG-TC--A-C-AAA
gi|54301 : A--T--TTT-G----C------------------------TA--T--C-A--TA-T------T--G-G-GAATT---T------G-AA--C---AA-C-A-T-A-C-C--A-TT---A----A-T-AA--AACT--C--CAA--CA--ACT----A-A-A-G--T----AAT-C--T-TTA-----C----AA----T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATT--T--C--A---T---AA--C---T---AT-----GG------A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-TAT-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--G---T-TT-GTT--T-TGAG-GT--T-C-AAACAT
gi|54302 : T---A----A-T-AA--A-CT--C--CGA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--C-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGG--T-T-----C-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-GT----T-T--T--G---A-G-T-T-----
gi|54303 : AA--CA--A-T----T-A-A-A--T----TCT-A--T-T-G-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T--AT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C----T-T---AA--C---A---AT-----CGA-----A-T--TT-CT----A-A--T--T---A-A-T-T-----TTA--TA-C--T--T-----G-AA--GT--T-TT-GT-------A---T--A-C-AAACATacaaacatta
gi|54304 : --T----CAT-C--T-T-AAGTACCG---AC--T-T-----------A----C-T-G--A-T-----TGCAT-TGA--TGA--TAT-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---TA--AT-----GGG-----A-C--T------------------------------------------TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG--T--A-C-AAACAT
Alignments
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lowQualScore : ... . . .. .... .. . . .. ... . ... ......... . ... ..... .... ... .. .... .. . ............... .. ... . ..... .... .. .. .. .. . .. .. .. . .. ... ...... . .. . .. ..... .. .. . .... ........................ .. .. . . . ...... .. . . ....... ...... . ...... .. . . . . . .. . ... .... . . .. . .. .. .. .. ...... . . . .. .... . .. . . ..... .... .. . ........... .... . . .. . ..... . . . .. .. . ..... . . .. .. . . ... .. ... ... ..... ..... . .. . .... . .. .. ... . . . ..... .. . . .. ..... . .. .. . . .. . . .. . .
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Reference ( family-419 ) : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
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gi|54265 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--CTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AA-T--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T----A-----AA--T--TT--A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C--------AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------ATATAC-T-G--A-T-----T-CAT-TTA--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
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gi|54273 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAA---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---C-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTC-N----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATT--T--C-A-AT--G------T--A-G-G-------C------G-AACCC---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-TAAA--A-CT--T--CAA--CA--A-T----A-A-G-A--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----C-AAT-T-AT-TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-TAC---AA--C---TGG-AT-----GGGAACATA-T--TTGCT----ATT--T--G---ATA-T-C-----TAA--TACC-TT--T-----GAAA--GTAAT-TT-GTTGCT-TGAG-TT--A-CAAAACAT
gi|54274 : AAAAT--ATAAA-AA-TA--GC-----GT--GTTCT-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAGTGAA--AAA----AG--T-T-----------------G--ATAGT---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--AG--TTT----T-A------T-T--G-----AA-----TTT-A----T------------------------TT--T--A-C-GTA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-ACT-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--G-CT--C--C-A--CA--A-T------A-A-G--T----CAT----T-T-A-----C----AC--CTT-----------AAT--C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T--TTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----G-------A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--T--C-TT--T-----G-AAAGGT--T-TT-GTT--TCTGAG-TT--A-C-AAAC
gi|54275 : AAAA---ATAAG-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA------------------T----CAT-C-----------------------------------------------A-T-----C-CAT-C-A--TCA--T-CGG---T-ATTT-T--G--A-T-T---AA--C---
gi|54276 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--AATA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--ATAG--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----TG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------C------G-AA--C---A--C-A-T--------A-T-------------------------------CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--A-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--CAAA-T-T---AG--C---
gi|54277 : AAAA---ATAAA-AAATA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTA-------A-----G----G--T--A--GTAG-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT-----------------------------------A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C----TT---A----A---AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T------A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----TCCATCT-AAGAGA--T-A-----T-ATTA-T--C--
gi|54278 : AAGA---ATAAA-AA-TGTGGTT----GT--GTT-T-T--C---CCT-A---A---------C-----TATTC--C----CAG---A--AAA----AAAAG-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G-------T--A--G--G-AAAT--A-AAATTT-TT--A---TTT----A-AT-TT--C-T--A-----AAGTT--CTT-A----T------------------------TC--C--C-A-TT--G------T--A-A-G-------T------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-CTAACTT---A----T-T-AAGCA-CT--C--CAAAACAG-A-T----A-ATA-G--T----CATGC--T-T-A----------GC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----TGATTA-T--CT-A-T-TA--AA--C---T---AT------GA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TT---TA-C-TT--T-----G--A--GT--T-
gi|54279 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--T--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----TCAT-TT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-
gi|54280 : AAAATATATAAA-AAGTA--GTT----GTTAGTT-T-C--TCTAGCT-A---AAAA------C-A---TA-----C----CAG---A--AAACAAAAA--A-TA---------------GG---TAGG---TTA-----G----G--T--A--G--G-AA-T--A-CA--TT-TTTAA---TTT----TTAT-CTG-T-T--ATAGAAAA--T--TTT-A----T------------------------TT--TT-C-G-ATAAG------TC-ATG-G-------CT-----G-AA--C---A--CGA-T-T-AAC--A-TTTTTA----ACT-AT--A-CT--C--CAA--CA--A-TTATCA-A-A-G--T----CAT-C--T-T-ATTCT-C----AC--C-T-----------T----C-TTG--T-T-----T-CAT-T-T--T----T-TAAAAAT-ATTA-T--C--AAT-T---AA--T---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-TACT--GT--A-ATT-T-----TTA--TA-C-TT--T-----A-AA--GT--TATT-GTT--
gi|54281 : AAAA---ATAAA-GC-TA--GTT----GTA-GTT-T-T--C---ACT-A---AAGTTGAAACC-A---TT-----C----CTG---G--AAA----AA--A-TA---------------GA---TAG----T-G-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-C--A-----AA--A--TTT-A------------------------------T--T--C-A-ATA-A------T--ATG-G-------C------A-AA--G---A----------A-C--A-TT---A----A-T-GA--A-CG--C--CAA--CA--A------G-A-A-G--T----GAT-G--T-T-------C----AC--C-TATTGATTCAATA----C-T-G--A-T-----T-CAA-T-A--CAA--T-T-----T-A-TA-T--C--A-T-T---AA--C---T----T------GA-----A-TG-TT-CTTCAAA-A--T--G---A-A-----------------------T-----G-AA--GC--T-TT-GTT--T-T
gi|54282 : AACA---ATAAA-AA-TA--GAT----GT--GTT-T-C--C---GCC-A---A---------C-G---TC-----C----CAG---A--AAA----A-----T--------------------GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-GAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TCT-A----A------------------------TT--T--C-A-A-A-C------T------G-------C------A-AA------A----------A-C--A-TG---A----A-T-GA--T-TG--C--CAA--CA--A-G----A-A-A-G--T----AAT-G--T-T-A-----C----AC--
gi|54283 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GG--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG------AAA----AA--T-TA---------------GG--GCAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TT
gi|54284 : AAAA---ATAAA-A--TA--GTT----AT--GTT-T-C--C---ACT-A---A---------C-A---TA-----C----CAA---A--TAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----
gi|54285 : AAAA---ATAGA-AA-AACTGTT----GT--GTT-T-T--C---GCA-A---A---------C-A---TT-----C----CCG---A--AAG----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--G--G--T-AAAT--A-AA--TC-TT--A---CTTTTAAT-AT-TT--C-T--G-----A
gi|54286 : AAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GC--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA--------T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----A-TT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G--A--C---AC-C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--T-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----CA--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--ATT-T---AA--T---T---AT-----GAA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54287 : AAA---ATAAA-AAATA--GTT----GT--GTTAT-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C------A---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T----------GACT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--A-T--------AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-TTA-G------T--A-GCG-------C------G-AA--C---ATTC-A---T-A----A-TT---A----A-T-AA--A-----C--CAA--CAAGA-T----A-A-A-G--T----CAT-C----T-A-----C----ACCTC-T-----------A----CAT-G--A-T-----T-CATAT-A--TCA----T-----T-A--A-T--C--A-T-T---AACTC---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----G-T--T------A-A-T-T-----TTAATTA-C-TT--T-----G-GA--AG--T-TT-G-T--T-CGAG-TTA-A-C-AAACAT
gi|54288 : AAA---ATAAA----TA--GTT----GT--GTT-T-T--C---GCT-ATAAA---------CCA---TA-----A----CAG---A--AAA----AA--T-TACTCATTTAAATTGAAGG--GT-GG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---T--------AA-TT--T-C--A-----AA--T--TTT--------------------------------T--T--C-A---------------------------------------------------T-T-A-T--A-TT---A----A---------CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-AAG--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--AAT-----T-CAT-T-AG-TGA--T-T-----T-AT-A-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--T--CT----A-T--TTTG---A-A-T-T-----TTA--TA-CTTT--T-----G-AA--G---T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
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gi|54298 : TT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------G------G-AA--C--------------A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--T--CAA--
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gi|54301 : A--T--TTT-G----C------------------------TA--T--C-A--TA-T------T--G-G-GAATT---T------G-AA--C---AA-C-A-T-A-C-C--A-TT---A----A-T-AA--AACT--C--CAA--CA--ACT----A-A-A-G--T----AAT-C--T-TTA-----C----AA----T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATT--T--C--A---T---AA--C---T---AT-----GG------A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-TAT-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--G---T-TT-GTT--T-TGAG-GT--T-C-AAACAT
gi|54302 : T---A----A-T-AA--A-CT--C--CGA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--C-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGG--T-T-----C-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-GT----T-T--T--G---A-G-T-T-----
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gi|54304 : --T----CAT-C--T-T-AAGTACCG---AC--T-T-----------A----C-T-G--A-T-----TGCAT-TGA--TGA--TAT-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---TA--AT-----GGG-----A-C--T------------------------------------------TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG--T--A-C-AAACAT
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blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . G . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Alignments
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lowQualScore : 333 2 3 33 6666 44 3 1 11 333 1 555 888888888 4 333 66666 2222 222 11 2222 11 2 999999999999999 11 222 2 22222 2222 11 11 22 11 1 11 33 11 1 11 333 333333 1 22 1 11 22222 11 11 1 2222 000000000000000000000000 11 22 1 1 2 333333 22 3 1 7777777 444444 1 333333 33 1 1 1 1 1 22 1 111 2222 2 1 11 2 11 22 22 22 444444 2 1 1 22 2222 1 22 1 2 66666 3333 22 1 55555555555 3333 1 1 11 3 22222 2 2 3 55 11 1 77777 1 1 11 44 2 1 444 44 222 555 44444 33333 1 55 1 7777 3 11 11 444 1 1 1 55555 11 1 1 11 44444 1 22 33 1 1 22 1 1 44 1 1
lowQualScore : ... . . .. .... .. . . .. ... . ... ......... . ... ..... .... ... .. .... .. . ............... .. ... . ..... .... .. .. .. .. . .. .. .. . .. ... ...... . .. . .. ..... .. .. . .... ........................ .. .. . . . ...... .. . . ....... ...... . ...... .. . . . . . .. . ... .... . . .. . .. .. .. .. ...... . . . .. .... . .. . . ..... .... .. . ........... .... . . .. . ..... . . . .. .. . ..... . . .. .. . . ... .. ... ... ..... ..... . .. . .... . .. .. ... . . . ..... .. . . .. ..... . .. .. . . .. . . .. . .
lowQualScore : 555 5 8 33 2222 11 6 2 77 333 2 555 222222222 8 333 44444 5555 111 66 5555 66 4 000000000000000 66 111 4 99999 6666 77 77 99 66 2 66 11 66 1 66 111 333333 1 66 1 55 77777 55 55 1 3333 444444444444444444444444 55 66 1 1 2 111111 66 2 1 1111111 333333 1 111111 88 1 1 1 1 1 66 1 999 3333 2 1 55 2 55 66 55 66 999999 2 1 1 55 2222 1 55 1 1 33333 3333 55 1 11111111111 9999 1 1 55 3 88888 2 3 4 00 66 1 11111 1 1 66 00 4 2 555 11 111 333 55555 22222 3 66 3 1111 9 88 88 888 3 3 3 00000 88 3 3 88 88888 4 00 44 5 5 11 6 8 33 8 8
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Reference ( family-419 ) : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54262 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GGT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-GAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CGT-C--T-T-A-----C----AT--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54263 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--GGAAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----A-CT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TA---A----A-T-AA--A-CT--T--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-GATA-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54264 : AAAA---AAAAA-AA-TA--GGT----GT--GTT-T-C--C---GAT-T---A---------C-A---TA-----T----CAA---A--AAT----AA--TGTA---------------GG--GTCGG-----G-----G----A--T--C--G--G-AAAT-----T--TT-TT--T---TTT----T-GA-TT--T-T--A-----TT--T--TTT-A----T------------------------TCAGT--A-A-ATA-T------T--A------------------A-AG--T---A--A-A-T-T-A-A--A-GC---AAAATA-T-AA--A-TT--A--AAG--CA--A-A----A-A-A-ATTT----CAT-T--T-TGA-----C----A-----------------A----C-T-G--A-T-----T-
gi|54265 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--CTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AA-T--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T----A-----AA--T--TT--A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C--------AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------ATATAC-T-G--A-T-----T-CAT-TTA--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54266 : AAAA---ATAAA-AA-AA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----TT--T-TA---------------GA--GTAGG---T-A-----G----G--TTAA--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTA----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------A------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----T-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-ATT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54267 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--------------------------------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--C----------A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACATta
gi|54268 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-AA--TA-----CATTCCAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-ACCGTAG----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--AT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-T--A-TC---A----A-T-AA--A-CT--C--AAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--A-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TC-CT----C-G--T--G---A-A-T-T-----TTA--AA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-GTT--C-TGAG-TT--A-C-AAACATta
gi|54269 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-A--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C-----AG---A--AAA----AA--T--A---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--AGG-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-A-------------AA--TA--A-T----ATA-A-G--T-----AT-C----T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CTC-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-TG--AG--T---T---AT-----GGA-----A-T--GT-CTG---A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C--AACATca
gi|54270 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--T---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--T--A---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AACT--T-GA--TT-TG--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TA--T--C-A-ATA-G------T--T-G-G-------C------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AC--A-CT--C--AAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----TA-------T-A-----C----AC--A-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-G--TC-CA----A-G--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-GA--GT--T-TT-ATT--T-TGAG-TT--A-C-AAAAAT
gi|54271 : AAAA---ATAAAGAA-TA--GTTC---GT--GTT---C--C---GCT-AC--A---------T-AAATTA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GGCGGTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-TTGTT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-ATATA-G------T--A-G-G-------C------G-AAA-C---A--C-A-T-T-G-C--A-TT---A----A-T-AA--A-AT--C--CAA--CA--AAT----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----A----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-AAA-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AAA-C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-------------------------A--CG-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TTTGTT--T-TGAG-TT--A-A-AGACATta
gi|54272 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GT--GTT-TTC--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G--AAT--A-AA--TT-TT--A----TT----T-AT-TT--T-TTAA-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--CTA-ATA-G------T--A-G-GC------C------G-AA--CA--A--A-A-TAT-A-CG-A-TA---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--ACT----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--ACT-----T-CAT-TAA--TGA--T-T-----T-ATTT-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----ATT--T--G---A-A-C-T-----TT------T-TT--T-----G-A
gi|54273 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAA---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---C-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTC-N----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATT--T--C-A-AT--G------T--A-G-G-------C------G-AACCC---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-TAAA--A-CT--T--CAA--CA--A-T----A-A-G-A--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----C-AAT-T-AT-TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-TAC---AA--C---TGG-AT-----GGGAACATA-T--TTGCT----ATT--T--G---ATA-T-C-----TAA--TACC-TT--T-----GAAA--GTAAT-TT-GTTGCT-TGAG-TT--A-CAAAACAT
gi|54274 : AAAAT--ATAAA-AA-TA--GC-----GT--GTTCT-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAGTGAA--AAA----AG--T-T-----------------G--ATAGT---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--AG--TTT----T-A------T-T--G-----AA-----TTT-A----T------------------------TT--T--A-C-GTA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-ACT-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--G-CT--C--C-A--CA--A-T------A-A-G--T----CAT----T-T-A-----C----AC--CTT-----------AAT--C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T--TTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----G-------A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--T--C-TT--T-----G-AAAGGT--T-TT-GTT--TCTGAG-TT--A-C-AAAC
gi|54275 : AAAA---ATAAG-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA------------------T----CAT-C-----------------------------------------------A-T-----C-CAT-C-A--TCA--T-CGG---T-ATTT-T--G--A-T-T---AA--C---
gi|54276 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--AATA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--ATAG--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--C-T--A-----TG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------C------G-AA--C---A--C-A-T--------A-T-------------------------------CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--A-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--CAAA-T-T---AG--C---
gi|54277 : AAAA---ATAAA-AAATA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTA-------A-----G----G--T--A--GTAG-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT-----------------------------------A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C----TT---A----A---AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T------A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----TCCATCT-AAGAGA--T-A-----T-ATTA-T--C--
gi|54278 : AAGA---ATAAA-AA-TGTGGTT----GT--GTT-T-T--C---CCT-A---A---------C-----TATTC--C----CAG---A--AAA----AAAAG-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G-------T--A--G--G-AAAT--A-AAATTT-TT--A---TTT----A-AT-TT--C-T--A-----AAGTT--CTT-A----T------------------------TC--C--C-A-TT--G------T--A-A-G-------T------A-AA--C---A--C-A-T-T-A-CTAACTT---A----T-T-AAGCA-CT--C--CAAAACAG-A-T----A-ATA-G--T----CATGC--T-T-A----------GC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----TGATTA-T--CT-A-T-TA--AA--C---T---AT------GA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TT---TA-C-TT--T-----G--A--GT--T-
gi|54279 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GA--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--T--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----TCAT-TT--C-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-
gi|54280 : AAAATATATAAA-AAGTA--GTT----GTTAGTT-T-C--TCTAGCT-A---AAAA------C-A---TA-----C----CAG---A--AAACAAAAA--A-TA---------------GG---TAGG---TTA-----G----G--T--A--G--G-AA-T--A-CA--TT-TTTAA---TTT----TTAT-CTG-T-T--ATAGAAAA--T--TTT-A----T------------------------TT--TT-C-G-ATAAG------TC-ATG-G-------CT-----G-AA--C---A--CGA-T-T-AAC--A-TTTTTA----ACT-AT--A-CT--C--CAA--CA--A-TTATCA-A-A-G--T----CAT-C--T-T-ATTCT-C----AC--C-T-----------T----C-TTG--T-T-----T-CAT-T-T--T----T-TAAAAAT-ATTA-T--C--AAT-T---AA--T---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-TACT--GT--A-ATT-T-----TTA--TA-C-TT--T-----A-AA--GT--TATT-GTT--
gi|54281 : AAAA---ATAAA-GC-TA--GTT----GTA-GTT-T-T--C---ACT-A---AAGTTGAAACC-A---TT-----C----CTG---G--AAA----AA--A-TA---------------GA---TAG----T-G-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-C--A-----AA--A--TTT-A------------------------------T--T--C-A-ATA-A------T--ATG-G-------C------A-AA--G---A----------A-C--A-TT---A----A-T-GA--A-CG--C--CAA--CA--A------G-A-A-G--T----GAT-G--T-T-------C----AC--C-TATTGATTCAATA----C-T-G--A-T-----T-CAA-T-A--CAA--T-T-----T-A-TA-T--C--A-T-T---AA--C---T----T------GA-----A-TG-TT-CTTCAAA-A--T--G---A-A-----------------------T-----G-AA--GC--T-TT-GTT--T-T
gi|54282 : AACA---ATAAA-AA-TA--GAT----GT--GTT-T-C--C---GCC-A---A---------C-G---TC-----C----CAG---A--AAA----A-----T--------------------GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-GAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AA--T--TCT-A----A------------------------TT--T--C-A-A-A-C------T------G-------C------A-AA------A----------A-C--A-TG---A----A-T-GA--T-TG--C--CAA--CA--A-G----A-A-A-G--T----AAT-G--T-T-A-----C----AC--
gi|54283 : AAAA---ATAAA-AA-TA--GTT----GG--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG------AAA----AA--T-TA---------------GG--GCAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TT
gi|54284 : AAAA---ATAAA-A--TA--GTT----AT--GTT-T-C--C---ACT-A---A---------C-A---TA-----C----CAA---A--TAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----
gi|54285 : AAAA---ATAGA-AA-AACTGTT----GT--GTT-T-T--C---GCA-A---A---------C-A---TT-----C----CCG---A--AAG----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--G--G--T-AAAT--A-AA--TC-TT--A---CTTTTAAT-AT-TT--C-T--G-----A
gi|54286 : AAA---ATAAA-AA-TA--GCT----GC--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA--------T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----A-TT-TT--T-T--A-----AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G--A--C---AC-C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--T-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----CA--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--ATT-T---AA--T---T---AT-----GAA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54287 : AAA---ATAAA-AAATA--GTT----GT--GTTAT-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C------A---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T----------GACT--A-CA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--A-T--------AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-TTA-G------T--A-GCG-------C------G-AA--C---ATTC-A---T-A----A-TT---A----A-T-AA--A-----C--CAA--CAAGA-T----A-A-A-G--T----CAT-C----T-A-----C----ACCTC-T-----------A----CAT-G--A-T-----T-CATAT-A--TCA----T-----T-A--A-T--C--A-T-T---AACTC---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----G-T--T------A-A-T-T-----TTAATTA-C-TT--T-----G-GA--AG--T-TT-G-T--T-CGAG-TTA-A-C-AAACAT
gi|54288 : AAA---ATAAA----TA--GTT----GT--GTT-T-T--C---GCT-ATAAA---------CCA---TA-----A----CAG---A--AAA----AA--T-TACTCATTTAAATTGAAGG--GT-GG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---T--------AA-TT--T-C--A-----AA--T--TTT--------------------------------T--T--C-A---------------------------------------------------T-T-A-T--A-TT---A----A---------CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-AAG--T----CAT-T--T-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--AAT-----T-CAT-T-AG-TGA--T-T-----T-AT-A-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--T--CT----A-T--TTTG---A-A-T-T-----TTA--TA-CTTT--T-----G-AA--G---T-TT-GTT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54289 : AAT---ATAAA-AA-TA--GTTAAATGT--TTT-T-CGTC---ACT-A---AA--------C-A---TAG----C----CAA---GCTAAA----AA--T-TAAA-------------GG--GTAGG-----A-----GAAGGG--T--AC-G--G-GAAT--GTCA--TTATT--A---TCT----T-AT-TTCTT-T--A-----AA--T--TTTTA----T------------------------TT--TTTC-A-ATA-G------TTCA-G-GTTTGATGC------G-AA--A---A--C-A-T-T-A-C--A--T---A----A-T--G--A-CT--C--CAA--CA--A-T----ACA-A-A--T----CAT-CT-T-T-ATT---C----TT--C-T-----------A----C-T-G--ATT-----T-CAT-T-G--AGT--T-T-----T-ATTAGT--C--A-T-T---AAT-C---TTTCATTGAGAAGA-----A-TAATC-ATAA--A-T--T--GAGAA-A-T-TGA---TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GTA-T-TT-GAT--T-
gi|54290 : AAA---ATAAG-AA-TA--GTTT---GTT-GTT-T-C--C---GCT-ATTAA---------CCA---TT-----C----CAG---A--AAA----AA--A-TA---------------CG--GTAGGGAAT-A-----T----GAAT--G--T--G-AAGG--A-TA--TC-GT--AAGCTTG----T-AT-TT--TCT--C-----AA---------G----G------------------------CT--C--C-G-ACA-T------T--A-A-C-------C------G-AC--C---A--C-G----------A-TT---A----AGT-AA--A-CTAAC--AAA--CA--A-T----A-A-A-GG-T----CAT-A--TCT-C-----T----GC--C-C-----------A----C-T------T-----T-TAT-T-GC-TGA--T-TCA---T-ATTA-T--T--A-T-T---GA--C---T---AT-----GAA-----AAT--TT-CT----A-T--T--T---G-A-T-T-----TTA--TG-C-TTGCC-----A-AA--AT--T-TT-GTT--A-TGAGTTT--G-C-AAACATatatcagcagaggttacgaaacatta
gi|54291 : AG---ATAAA-AA-TA--GTT----GT--GTT-T-C--C---GCT-A---A---------C-A---TA-----C----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAAG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-TA--TT-TC--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----A---T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--A-T----A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----GC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--A-TGAta
gi|54292 : A---ATATA-AA-TA--GTT----GC--GTT-C-T--C---GCT-A---A---------C-A---AT-----C----CAG---A--AAA----AT--T-TA---------------GG--GTAGG---T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---CTT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------G------G-AA--C--------------A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--T--CAA----------------------------------------------------------------------------G--A-T-----T-TAT-T-A--TCA--T-G-----T-ATT--T--C--A-T-TGGCAA--C---T----T-------A-----A-C--TT-CTG---A-T--T--T-------T-T-----TTT--TT-T-TT--T-----G-AA--AT--
gi|54293 : AAATAA-TA--GTTT---GT--GTT---C--C---G-T-A---A---------CCA---TA-----C----CAG---A--AAA----AT--T-TA---------------GG--GTAG----T-A-----G----G--T--A--G--G-AAAT--A-CA--TT-TT--A---TTT----TTAT-TT--T----------AA--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-G-------C------G-A---C---A--C-A-T-T-A-C--A-TT---A----A-T-AA--AACT--C--CAA--CT--A------A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-A-----C----AC----T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-TA----T-ATTA-T--C--A-T-T----A--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-CT----G-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGA--TTGAA-T-AAATAT
gi|54294 : --GTT----AT--GTTAT-C--CT--ACTTA---A---------CTA---TAAGTAGC----CAA---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTGGG---TAA-----G----G--T--A--G--G-AAATGAA-CA--TT-TT--A------------AT-TA--T-T--A-----AA--TTCTTT-ACCACT------------------------TT--T--C-A-ATACG------T--A-G-G-------CTCACGAG-AG--CCGAA--C-A-C-T--------TT---A----A-T-AA--T-CT--CTACAAC-CA--ATT----A-A-A-G--TTCTATAT-CTTT-T-A-----C----ACA-C-T-----------A----C-T-G--A-TAAGGAT-CAT-T----TGAATT-T-----T-ATTA-T--ca
gi|54295 : ----CAG---A--AAA----AA--T-TA---------------GG--GTAGG---T-T-----G----G--G--A--A--G-AAAT--A-AA--TT-T---A---TTT----C-AA-TT--T-T--A-----A--------T-A------------------------------------C-A-ATA-G------T--A-T-G-------C------G-AA-----------A-----A-C--A-TT---A----A-C-GA--A-CT--A--TAA--GA--A-G----A-A-A-G--T----AAT-C--T-T-A-----C----AT--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AC--C---T---AC------GA-----A-TG-TT-TT----A-T--T--GA--A-A-T-TCAATGTTA--TA-C-TT--TCAAAAG-AA--AT--T-TT-GCT--T-T-AG-TT--AGC-AA
gi|54296 : --G-AAAT--A-AA--TT-TT--A---TTT----T-AT-TT--T-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C------------------------------------G-AA--C---A--C-A-T-TTA-C--A-TT---A----A-T-AA--A-TT--C--CAA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-T--T-T-A-----C----------T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AG-----GGA-----A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--T-----C-AA--GT--T-TT-ATT--T-TGAG-TT--A-C-AAACAT
gi|54297 : -TT--A---TTT------AT-TT--T-G--A-----AA--T--TTT-A----A------------------------TT--T--C-A-ATA-C------T--T-T-G-------C------A-AA--A---G--C-A-T-T--------------------T-AA--G-AT--CT-CAA--CA--A-T----A-A-T-G--T----AAT-C--T-T-A-----CTCTTAT--A-T-----------A----T-T-G--C-T-----T-CAT-C-A--TTA--T-T-----T-AATA-T--CG-A-T-T---AA--TAAAT---AT------CA-----A-TG-TT-CT----G-T--T--G---A-A-A-T-----TTA--TA-C-TT--ta
gi|54298 : TT----T-AT-TT--C-T--A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-G------T--A-G-A-------G------G-AA--C--------------A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--T--CAA--
gi|54299 : T----T-AT-TT--C-C--A-----AA--T--TTC-A----T------------------------TT--T--C-A-ATT-G------T--A-T-G-------C------GTAA-----------------A-C--A-TT---A----A-T-AA--A-CT--C--CAA--TA--A-G----A-A-A-G--T----TAT-C--T-A-A-----C----AC--C-T-----------
gi|54300 : --A-----AG--T--TTT-A----T------------------------TT--T--C-A-ATA-GGCCTAGT--A-G-G-------T------G-AA--C---A--C-A-T-T-A-C--G------------------------------A--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--T-T-T-----C----AC--C-A-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-TTCT--A-T-T---AA--C---T---ATG----GGA-----A-T--TT-CT----ATT--T--G---A-A-T-T-----TTA--TA-C-TT--TC----C-AA--GT--T-TT-G-T--T-TGAG-TC--A-C-AAA
gi|54301 : A--T--TTT-G----C------------------------TA--T--C-A--TA-T------T--G-G-GAATT---T------G-AA--C---AA-C-A-T-A-C-C--A-TT---A----A-T-AA--AACT--C--CAA--CA--ACT----A-A-A-G--T----AAT-C--T-TTA-----C----AA----T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGA--T-T-----T-ATT--T--C--A---T---AA--C---T---AT-----GG------A-T--TT-CT----A-T--T--G---A-A-TAT-----TTA--TA-C-TT--T-----G-AA--G---T-TT-GTT--T-TGAG-GT--T-C-AAACAT
gi|54302 : T---A----A-T-AA--A-CT--C--CGA--CA--A-T----A-A-A-G--T----CAT-C--C-T-A-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T-CAT-T-A--TGG--T-T-----C-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---T---AT-----GGA-----A-T--TT-GT----T-T--T--G---A-G-T-T-----
gi|54303 : AA--CA--A-T----T-A-A-A--T----TCT-A--T-T-G-----C----AC--C-T-----------A----C-T-G--A-T-----T--AT-T-A--TGA--T-T-----T-ATTA-T--C----T-T---AA--C---A---AT-----CGA-----A-T--TT-CT----A-A--T--T---A-A-T-T-----TTA--TA-C--T--T-----G-AA--GT--T-TT-GT-------A---T--A-C-AAACATacaaacatta
gi|54304 : --T----CAT-C--T-T-AAGTACCG---AC--T-T-----------A----C-T-G--A-T-----TGCAT-TGA--TGA--TAT-----T-ATTA-T--C--A-T-T---AA--C---TA--AT-----GGG-----A-C--T------------------------------------------TT--T-----G-AA--GT--T-TT-GTT--T-TGAG--T--A-C-AAACAT