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lowQualScore                  :       ...   .  ... .     . .  . .  . .... . . ...... .  .  .. .   .  . . .  . ...   . .      . .   . ..    .    ..  .. ......  .   . ...... .. . ....  . . .. .. ........   ...    ..... ...  .. ......... ... ... . ......... ..  .   . .  ..  .. .   .   . ....  .  ... . ....   . . .     
lowQualScore                  :       999   7  111 2     2 2  2 2  2 7777 2 4 333333 2  1  99 1   1  7 7 8  5 777   1 5      5 5   5 22    5    00  00 444444  5   6 666666 11 5 3333  2 5 11 22 11111111   444    77777 111  00 222222222 666 111 1 555555555 66  2   1 2  99  55 1   1   2 6666  2  999 1 5555   1 1 1     
consensus                     : AAGGAA---CAG-CCG--A-AGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
Reference ( gi|103628 )       : AAGGAA---CAG-TCC--A-AGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---T-A---------C--GG-AGC-G-TAA-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103629                     : AAGGAA---CAG-TCC--A-AGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-TGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGGT--GC--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----C---CG--T-T-------T---A---T-A---------C--GG-AAT-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103630                     : AAGGAA---CAG-CCG--A-AGCAG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-GA-AC--A-AGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AATT-CGAT--GC--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-AT---TTG-C-C-GATTG
gi|103631                     : AAGGAA---CAG-CTG--A-ATCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G--------AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A--T---AT-CCT-T------A--C-A----AC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---T-A---------T--GG-AGC-G-TAG-CA--G-AGT-TAA-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103632                     : AAGGAA---TAG-CCG--G-AGCGG-A-GT-G-GA-A--AAG-A-GCACCGGT-AA-GC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCG-A-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGGT--GC--A--T---AT-CCC-C------A--C-A----CC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------TGTGA---T-A---------T--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AAT-TAG-C----CG-AA---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103633                     : AAGGAA---CAG-CCG--A-AGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-G--------------------C--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GGGTT-T-------T---G---T-A---------T--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----CTG-T-C-GGTTG
gi|103634                     : AAGGAA----AG-TCCGCA-AGCGG-AAGT-G-GACA--T-G-A-G------T-AA-AC--AAGGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGAAAT-GTTAT-C--AAAT-CGAT--GC--A--T---ATCCCC-T------A--C-A----CC-ACT--T--C--------ACA---TCCG-----A---GA--T-G-------T---A---T-A---------CG-GG-AGC-G-TAGCCG--G-AGT-TAG-CA---CG-AG---GAA----TTG-C-C-GACT
gi|103635                     : AAGGAA---CAG-TCC--A-AGCGGCA-GTCG-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--C-AGT-AC-T-T-CC-G---GT--G-AGAAAT-G-TAT-TCAAAAT-CGAT--GC--AT-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--TC-C--------ACA---TCCG-----AC--GG--T-G-------T---A---T-A---------C--GGTAGC-A-TAG-CGAAG-AGT-TAG-C----CGCAG---G-GGCATTTG-C-C-GATTG
gi|103636                     : AAGGAA---CAGGTCC--A-A-CG--A-GT-GTGA-A--T-G-ACG------T-AACAG--A-GGT-AT-T-T-TCAG---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGATTGAC--A--T---AT-CCCGT------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-A-------G---T---T-A---------C--GG-AGC-GCTAC-CG--G-GAG-TAG------CG-AG---A-A----TTGCC-C-GATTG
gi|103637                     : AAGGAA---CAG-TC---A-AGCGG-A---------------------------------------------T-CC-G---GCG-GGAGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGAT--GCAAA--T---AT-CCC-T------A--A-C----CC-A-T--T--CA-------ACA---TCCG-----A---GG--TGG-------T---A---T-AAC-------C--GGAAGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-A----G-A----TTG---C-GATTG
gi|103638                     : AAGGAG---CAG-TCC--ACAGCGG-A-GT-G-GA-AC-T-G-C-ACGC---T-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-TC-G---GCG-G-AGAAAT-G--------------------C--A--T---AT-CCC-T------A--CTA----TT-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---T-A---------C--GG-AGCTG-T-A-CA--A--------------CG-AG---G-A----TTG-C-CAAATTG
gi|103640                     : AAGGAA---TAA-GCC--G-AGCGG-A-GT-G-GA-A--T-GTA-G------T-AA-A---A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCG-G-AGGAA
gi|103639                     : AAGGAAG--TAG-CTG--A-AGCGG-A-GT-G-GA-AA-T-G-AAG------T-AA-ACTCA-CATTAC-TATACC-GTTCGTT-G-AGAAAT-G-TATCC--AAAT-T-AT--GC--A--T----T-CTT-TTTCATAA--C-A----CC-A-C--CAGC--------ACACATTCCG-----A---GG--T-T-------TGC-A---A-A---------CTGGG-AGA-G-TGC-GG--G-AGTATGG-C----CATAA---G-A----TTT-T-C-TATT
gi|103641                     : AAGGAA---GAG-CTG--A-AGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-
gi|103642                     :  AGGAATTACAG-TCC--A-AGCG--A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------TAAA-AA--A-GGT-AC-T-T--C-G---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-CA-AAAT-C-AT--GC--A--TTTAAT-CCC-T------A--C-AAAACCC-T-T--T--CCCCCCAAAACAATTCCCGAAAAAA---GG--G-T-------T---A---T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103643                     :           AG-CCA--A-AGTGA-A-GT-G-GA-A----A-A-G------A-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GTG---AGGAAT-A-TAA-C--AAAT-CGGT--GC--A--T---AT-CAC-T------A--C-A----CC-G-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---G---T--------------GA-AGT-G-TAA-CG--G-ATC-GAA-CCATGCA-AA---G-A----TTG-T-C-CATTG
gi|103644                     :                 --A-AGCGG-A-GT-G-AA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-TGT-AC-G-T-CC-A---GCG-G-AGAAAT-G-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---G-A---------C--GG-AGC-G-TAA-CG--G-AGT-TAG-C----TG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103645                     :                 --A-AGCGG-A-GT-G-GA-A--A-A-A-G------T-AA-AC--A-GAT-AC-T-T-CC-A---GTG-A-AGAAAT-G-TAA-C--AAGT-CCGT--GC--A--T---AC-CCC-T------A--C-A----CC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---CG--T-TTGTGAAGT---A---T-AAC-------C--GA-AGC-A-TGA-CG--G-A
gi|103646                     :                 --A-AGCAG-A-AT-G-AA-AAAT---A-G------C-AA-AC--A-TTT-AC-T-T-CC-G---GTG-A-GGAAAT-G-TAA-T--AAAT-CTGT--AC--A--T---AT-CCC--------A----A----CT-A-TTAT--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-T-------T---G---T-AAAGTGTAGCC--AT-AGC-A-TAT-CG--G-AAT-CAT-A----AG-AT---G-A----TTG-T-C-GGTTG
gi|103647                     :                                                         -AC--A-TGT-GCAT-T-CC-A---CAG-G-AAAAAT-G-CAT-C--AGTT-TGAT--GC--A--T---TT-----T------G--C-A----CCAA-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-C-------T---
gi|103649                     :                                                                     C-T-T-CC-G---TCG-A-A-AAAT-G-CAT-C--GATTTCGAT--GC--A------AT-TT--T------G--C-G----CC-G-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---GG--T-C-------T---ACTTT-C---------C--G------G-TTA-CG--GAAAT-TGA-C----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTG
gi|103648                     :                                                                     C-T-T-CC-G---GTG-G-ATAAAT-G-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A------AT-TTT-T------G--C-A----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---G
gi|103650                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCG-G-ATAAAT-G-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A------AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A----G--T-C-------T---ACTTT-C---------C--G------G-TTA-CG--G-AAA-TTG-A----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTGtctactttccggttacggaaaatggcgagcgtgatccgattgc
gi|103651                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCG-G-ATAAAT-G-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A------AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---G
gi|103650                     :                                                                            C-G---GCGCA-AGAATT-G-CAT-C--AAAT-CGAT--GC--ATTT---AT-CC
gi|103649                     :                                                                     ttccggcC-G---GCG-C-AAAATT-G-CAT-CG-AAAT-CGAT--GC--A--T---atccacgtccgagtctactttccggttacggaaattgacgagcgtgatccgattg
gi|103651                     :                                                               cttccgtcgaaaaC-G---GCGCA-AGAATT-G-CAT-C--AAAT-CGAT--GC--ATTT---AT-CCtccacgtccgaggtctactttccggttacggaaattgaccgagcgtgatccgattg
gi|103648                     :                                                                     ttccggcC-G---GTG-C-AAAAATTG-CAT-C--AAAT-CGAT--GC--ATTT---AT-CCatccacgtccgag
gi|103652                     :                                                                                  cttccggtAAAT-G-TGG-C--GGAT---AC--GC--A--T---AT-C----------AAGT-A----CT-A-T--TA-T--------ACA---TCCG-----A---GG--T-------------A---TGA---------T--GT-AG--G-TCA-CG--G-AAT-CAG-C----CG-AG---G-T----TTG-C-C-GAATGatccacgtccgagtctactttccggttacggaaaatggcgagcgtgatccgattgc
gi|103653                     :                                                                                                         AAT-CGAT--GC--A--T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-G-------T---A---T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103655                     :                                                                                                                                  CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
gi|103654                     :                                                                                                                                  CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
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gi|103657                     :                                                                                                                                                                                    -----A---GT--T-T-------T---G---T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-T-AATTG
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gi|103669                     :                                                                                                                                                                                                                      ---------C--GG-GAC-G-TG--CG--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATT
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Alignments
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lowQualScore                  :       ...  . ..  ..      . .  . .  . .. . . . ...... .  .  .. .   .  . . .  . ...    .       .   . ..  . .    ..  .. .....  .   . ...... .. . ....  . . .. .. ........   ...    ..... ...  .. ......... ... ......... . ......... ..  .   . .   . . .. .   .   . ....  .  ... . ....   . . .     
lowQualScore                  :       333  5 44  55      1 1  1 1  1 11 1 1 2 777777 1  0  88 0   0  7 7 7  7 000    7       7   7 11  1 7    33  33 88888  7   5 444444 00 5 1111  9 5 00 00 99999999   222    66666 999  88 666666666 444 333333333 1 111111111 44  1   0 1   0 0 44 0   1   1 3333  1  777 1 3333   1 1 1     
consensus                     : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
Reference ( family-413 )      : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103628                     : AAGGAA---CA-G--TCC-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAA-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103629                     : AAGGAA---CA-G--TCC-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-TGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGGT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----C---CG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AAT-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103630                     : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCAG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-GA-AC--A-AGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AATT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-AT---TTG-C-C-GATTG
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gi|103638                     : AAGGAG---CA-GT-CCA-CAGCGG-A-GT-G-GA-AC-T-G-C-ACGC---T-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-TC-G---GCGG-AGAAATG--------------------C--A-T---AT-CCC-T------A--CTA----TT-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGCTG-TA--C-A--A--------------CG-AG---G-A----TTG-C-CAAATTG
gi|103639                     : AAGGAAG--TA-G--CTG-AAGCGG-A-GT-G-GA-AA-T-G-AAG------T-AA-ACTCA-CATTAC-TATACC-GTTCGTTG-AGAAATG-TATCC--AAAT-T-AT--GC--A-T----T-CTT-TTTCATAA--C-A----CC-A-C--CAGC--------ACACATTCCG-----A---GG--T-T-------TGC-A---------A-A---------CTGGG-AGA-G-T-G-CGG--G-AGTATGG-C----CATAA---G-A----TTT-T-C-TATT
gi|103640                     : AAGGAA---TAAG--CCG-A-GCGG-A-GT-G-GA-A--T-GTA-G------T-AA-A---A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGGAA
gi|103641                     : AAGGAA---GA-G--CTG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-
gi|103642                     :  AGGAATTACA-G--TCC-AAGCG--A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------TAAA-AA--A-GGT-AC-T-T--C-G---GCGG-AGAAATG-TAT-CA-AAAT-C-AT--GC--A-TTTAAT-CCC-T------A--C-AAAACCC-T-T--T--CCCCCCAAAACAATTCCCGAAAAAA---GG--G-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103643                     :           A-G--CCA-AAGTGA-A-GT-G-GA-A----A-A-G------A-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GTG--AGGAATA-TAA-C--AAAT-CGGT--GC--A-T---AT-CAC-T------A--C-A----CC-G-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---G---------T--------------GA-AGT-G-TAA-C-G--G-ATC-GAA-CCATGCA-AA---G-A----TTG-T-C-CATTG
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gi|103647                     :                                                         -AC--A-TGT-GCAT-T-CC-A---CAGG-AAAAATG-CAT-C--AGTT-TGAT--GC--A-T---TT-----T------G--C-A----CCAA-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-C-------T---
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gi|103650                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A----G--T-C-------T---ACTT------T-C---------C--G------G-TTA-C-G--G-AAA-TTG-A----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTG
gi|103651                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---G
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gi|103654                     :                                                                                                                               CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
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Alignments
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lowQualScore                  :       ...  . ..  ..      . .  . .  . .. . . . ...... .  .  .. .   .  . . .  . ...    .       .   . ..  . .    ..  .. .....  .   . ...... .. . ....  . . .. .. ........   ...    ..... ...  .. ......... ... ......... . ......... ..  .   . .   . . .. .   .   . ....  .  ... . ....   . . .     
lowQualScore                  :       333  5 44  55      1 1  1 1  1 11 1 1 2 777777 1  0  88 0   0  7 7 7  7 000    7       7   7 11  1 7    33  33 88888  7   5 444444 00 5 1111  9 5 00 00 99999999   222    66666 999  88 666666666 444 333333333 1 111111111 44  1   0 1   0 0 44 0   1   1 3333  1  777 1 3333   1 1 1     
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Reference ( family-413 )      : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103628                     : AAGGAA---CA-G--TCC-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAA-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103629                     : AAGGAA---CA-G--TCC-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-TGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGGT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----C---CG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AAT-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103630                     : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCAG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-GA-AC--A-AGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AATT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-AT---TTG-C-C-GATTG
gi|103631                     : AAGGAA---CA-G--CTG-AATCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G--------AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCT-T------A--C-A----AC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-A--G-AGT-TAA-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103632                     : AAGGAA---TA-G--CCG-GAGCGG-A-GT-G-GA-A--AAG-A-GCACCGGT-AA-GC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGA-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGGT--GC--A-T---AT-CCC-C------A--C-A----CC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------TGTGA---------T-A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AAT-TAG-C----CG-AA---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103633                     : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG--------------------C--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GGGTT-T-------T---G---------T-A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----CTG-T-C-GGTTG
gi|103634                     : AAGGAA----A-GT-CCGCAAGCGG-AAGT-G-GACA--T-G-A-G------T-AA-AC--AAGGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATGTTAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---ATCCCC-T------A--C-A----CC-ACT--T--C--------ACA---TCCG-----A---GA--T-G-------T---A---------T-A---------CG-GG-AGC-G-TAGCC-G--G-AGT-TAG-CA---CG-AG---GAA----TTG-C-C-GACT
gi|103635                     : AAGGAA---CA-G--TCC-AAGCGGCA-GTCG-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--C-AGT-AC-T-T-CC-G---GT-G-AGAAATG-TAT-TCAAAAT-CGAT--GC--ATT---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--TC-C--------ACA---TCCG-----AC--GG--T-G-------T---A---------T-A---------C--GGTAGC-A-TAG-C-GAAG-AGT-TAG-C----CGCAG---G-GGCATTTG-C-C-GATTG
gi|103636                     : AAGGAA---CA-GGTCCA-A--CG--A-GT-GTGA-A--T-G-ACG------T-AACAG--A-GGT-AT-T-T-TCAG---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGATTGAC--A-T---AT-CCCGT------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-A-------G---T---------T-A---------C--GG-AGC-GCTAC-C-G--G-GAG-TAG------CG-AG---A-A----TTGCC-C-GATTG
gi|103637                     : AAGGAA---CA-G--TC--AAGCGG-A---------------------------------------------T-CC-G---GCGGGAGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GCAAA-T---AT-CCC-T------A--A-C----CC-A-T--T--CA-------ACA---TCCG-----A---GG--TGG-------T---A---------T-AAC-------C--GGAAGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-A----G-A----TTG---C-GATTG
gi|103638                     : AAGGAG---CA-GT-CCA-CAGCGG-A-GT-G-GA-AC-T-G-C-ACGC---T-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-TC-G---GCGG-AGAAATG--------------------C--A-T---AT-CCC-T------A--CTA----TT-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGCTG-TA--C-A--A--------------CG-AG---G-A----TTG-C-CAAATTG
gi|103639                     : AAGGAAG--TA-G--CTG-AAGCGG-A-GT-G-GA-AA-T-G-AAG------T-AA-ACTCA-CATTAC-TATACC-GTTCGTTG-AGAAATG-TATCC--AAAT-T-AT--GC--A-T----T-CTT-TTTCATAA--C-A----CC-A-C--CAGC--------ACACATTCCG-----A---GG--T-T-------TGC-A---------A-A---------CTGGG-AGA-G-T-G-CGG--G-AGTATGG-C----CATAA---G-A----TTT-T-C-TATT
gi|103640                     : AAGGAA---TAAG--CCG-A-GCGG-A-GT-G-GA-A--T-GTA-G------T-AA-A---A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGGAA
gi|103641                     : AAGGAA---GA-G--CTG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-
gi|103642                     :  AGGAATTACA-G--TCC-AAGCG--A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------TAAA-AA--A-GGT-AC-T-T--C-G---GCGG-AGAAATG-TAT-CA-AAAT-C-AT--GC--A-TTTAAT-CCC-T------A--C-AAAACCC-T-T--T--CCCCCCAAAACAATTCCCGAAAAAA---GG--G-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103643                     :           A-G--CCA-AAGTGA-A-GT-G-GA-A----A-A-G------A-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GTG--AGGAATA-TAA-C--AAAT-CGGT--GC--A-T---AT-CAC-T------A--C-A----CC-G-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---G---------T--------------GA-AGT-G-TAA-C-G--G-ATC-GAA-CCATGCA-AA---G-A----TTG-T-C-CATTG
gi|103644                     :                   -AAGCGG-A-GT-G-AA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-TGT-AC-G-T-CC-A---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------G-A---------C--GG-AGC-G-TAA-C-G--G-AGT-TAG-C----TG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103645                     :                   -AAGCGG-A-GT-G-GA-A--A-A-A-G------T-AA-AC--A-GAT-AC-T-T-CC-A---GTGA-AGAAATG-TAA-C--AAGT-CCGT--GC--A-T---AC-CCC-T------A--C-A----CC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---CG--T-TTGTGAAGT---A---------T-AAC-------C--GA-AGC-A-TGA-C-G--G-A
gi|103646                     :                   -AAGCAG-A-AT-G-AA-AAAT---A-G------C-AA-AC--A-TTT-AC-T-T-CC-G---GTGA-GGAAATG-TAA-T--AAAT-CTGT--AC--A-T---AT-CCC--------A----A----CT-A-TTAT--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-T-------T---G---------T-AAAGTGTAGCC--AT-AGC-A-TAT-C-G--G-AAT-CAT-A----AG-AT---G-A----TTG-T-C-GGTTG
gi|103647                     :                                                         -AC--A-TGT-GCAT-T-CC-A---CAGG-AAAAATG-CAT-C--AGTT-TGAT--GC--A-T---TT-----T------G--C-A----CCAA-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-C-------T---
gi|103648                     :                                                                     C-T-T-CC-G---GTGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TTT-T------G--C-A----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A----G--T-C-------T---ACTTTCCGGTT-A---------C--GG-AAA-A-TGG-C-GA-G-CGT-GAT-C----C-------G-A----TTG-C-
gi|103649                     :                                                                     C-T-T-CC-G---TCGA-A-AAATG-CAT-C--GATTTCGAT--GC--A-----AT-TT--T------G--C-G----CC-G-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---GG--T-C-------T---ACTT------T-C---------C--G------G-TTA-C-G--GAAAT-TGA-C----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTG
gi|103650                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A----G--T-C-------T---ACTT------T-C---------C--G------G-TTA-C-G--G-AAA-TTG-A----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTG
gi|103651                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---G
gi|103652                     :                                                                                         AAATG-TGG-C--GGAT---AC--GC--A-T---AT-C----------AAGT-A----CT-A-T--TA-T--------ACA---TCCG-----A---GG--T-------------A---------TGA---------T--GT-AG--G-TCA-C-G--G-AAT-CAG-C----CG-AG---G-T----TTG-C-C-GAATG
gi|103653                     :                                                                                                       AAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-G-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103654                     :                                                                                                                               CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
gi|103655                     :                                                                                                                               CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
gi|103656                     :                                                                                                                                          --C-A----CC-T-C--G--C--------ACA----CTG-----ACTCGG--T-G-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103657                     :                                                                                                                                                                                 -----A---GT--T-T-------T---G---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-T-AATTG
gi|103658                     :                                                                                                                                                                                           G--T-G-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103659                     :                                                                                                                                                                                           G--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AAC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---T-A----TTG-C-C-GATT
gi|103660                     :                                                                                                                                                                                            --T-C-------T---A---------T-A---------C--GG-AAC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAGAC----CG-AG---G-A----TTG---C-GAT
gi|103661                     :                                                                                                                                                                                                 -------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103662                     :                                                                                                                                                                                                 -------T---A---------T-A---------C--GG-AGC---TAG-C-G--G-AGT-TAGAC----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
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gi|103665                     :                                                                                                                                                                                                         ---A---------T-A---------C--GG-AAC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103666                     :                                                                                                                                                                                                         ---A---------C-A---------C--GC-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103667                     :                                                                                                                                                                                                         ---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-CA---CG-A----G-A----TCG-CAC-GATT
gi|103668                     :                                                                                                                                                                                                                       -A---------T--GG-AGC-G-TAG-G-G--A-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTC-C-C-GATTG
gi|103669                     :                                                                                                                                                                                                                         ---------C--GG-GAC-G-T-G-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATT
gi|103670                     :                                                                                                                                                                                                                                   --GG-GGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GAT


blockSeqs                     :       TTA  A GT  GC      C A  C T  C AA A T C CACCGG A  C  TC A   T  A A A  A TTC    G       T   C CA    T    TG  AA TTTA   C   G TTCATA AG T AAAC  A C TA AG CCCCCAAA   CAT    AAAAA CTC  GT TTGTGAAG  GTG CTTTCCGGT G AAGTGTAGC TG  T   T C   C G AA A   A   A CATG  C  CGT A GCAT   C A A
blockSeqs                     :       G    . T   C       . .  . .  . C  . . A CGC    .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . A     .    .   .  TT     .   . .      .  . .     G . .  C  A          ATT    .     C    .  GG        GC  CTT       . AC        G   A   . G   . . A  .   .   A A     T  CGT . T      . . .
blockSeqs                     :       .    . T   G       . .  . .  . A  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     G . .  A  .          .      .     .    .  T         .   CTT       . AC        .   .   . .   . . .  .   .   . A     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   G       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     G . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   G       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   G       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   C       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   A       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  G         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   A       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  G         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   G       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  A         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   G       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   G       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   C       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :       .    . .   A       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :            . .   .       . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                          . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                          . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  C         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                          . .  . .  . .  . . . .      .  .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  C         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                         .  .  .   .  . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  T      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  C         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                                      . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  .      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  C         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                                      . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  .      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  G         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                                      . . .  . .      .       .   . .     .    .   .  .      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  G         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                                      . .                                 .    .   .  .      .   . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                 . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  G         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                 . .      .  . .     . . .  .  .          .      .     .    .  T         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                 .     .    .  .         .   .         . .         .   .   . .   . . .  .   .   . .     .  .   . .      . . .
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lowQualScore                  :       ...  . ..  ..      . .  . .  . .. . . . ...... .  .  .. .   .  . . .  . ...    .       .   . ..  . .    ..  .. .....  .   . ...... .. . ....  . . .. .. ........   ...    ..... ...  .. ......... ... ......... . ......... ..  .   . .   . . .. .   .   . ....  .  ... . ....   . . .     
lowQualScore                  :       333  5 44  55      1 1  1 1  1 11 1 1 2 777777 1  0  88 0   0  7 7 7  7 000    7       7   7 11  1 7    33  33 88888  7   5 444444 00 5 1111  9 5 00 00 99999999   222    66666 999  88 666666666 444 333333333 1 111111111 44  1   0 1   0 0 44 0   1   1 3333  1  777 1 3333   1 1 1     
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Reference ( family-413 )      : AAGGAA---CA-G--CCG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
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gi|103635                     : AAGGAA---CA-G--TCC-AAGCGGCA-GTCG-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--C-AGT-AC-T-T-CC-G---GT-G-AGAAATG-TAT-TCAAAAT-CGAT--GC--ATT---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--TC-C--------ACA---TCCG-----AC--GG--T-G-------T---A---------T-A---------C--GGTAGC-A-TAG-C-GAAG-AGT-TAG-C----CGCAG---G-GGCATTTG-C-C-GATTG
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gi|103638                     : AAGGAG---CA-GT-CCA-CAGCGG-A-GT-G-GA-AC-T-G-C-ACGC---T-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-TC-G---GCGG-AGAAATG--------------------C--A-T---AT-CCC-T------A--CTA----TT-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGCTG-TA--C-A--A--------------CG-AG---G-A----TTG-C-CAAATTG
gi|103639                     : AAGGAAG--TA-G--CTG-AAGCGG-A-GT-G-GA-AA-T-G-AAG------T-AA-ACTCA-CATTAC-TATACC-GTTCGTTG-AGAAATG-TATCC--AAAT-T-AT--GC--A-T----T-CTT-TTTCATAA--C-A----CC-A-C--CAGC--------ACACATTCCG-----A---GG--T-T-------TGC-A---------A-A---------CTGGG-AGA-G-T-G-CGG--G-AGTATGG-C----CATAA---G-A----TTT-T-C-TATT
gi|103640                     : AAGGAA---TAAG--CCG-A-GCGG-A-GT-G-GA-A--T-GTA-G------T-AA-A---A-GGT-AC-T-T-CC-G---GCGG-AGGAA
gi|103641                     : AAGGAA---GA-G--CTG-AAGCGG-A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-GGT-AC-T-
gi|103642                     :  AGGAATTACA-G--TCC-AAGCG--A-GT-G-GA-A--T-G-A-G------TAAA-AA--A-GGT-AC-T-T--C-G---GCGG-AGAAATG-TAT-CA-AAAT-C-AT--GC--A-TTTAAT-CCC-T------A--C-AAAACCC-T-T--T--CCCCCCAAAACAATTCCCGAAAAAA---GG--G-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103643                     :           A-G--CCA-AAGTGA-A-GT-G-GA-A----A-A-G------A-AT-AC--A-GGT-AC-T-T-CC-G---GTG--AGGAATA-TAA-C--AAAT-CGGT--GC--A-T---AT-CAC-T------A--C-A----CC-G-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---G---------T--------------GA-AGT-G-TAA-C-G--G-ATC-GAA-CCATGCA-AA---G-A----TTG-T-C-CATTG
gi|103644                     :                   -AAGCGG-A-GT-G-AA-A--T-G-A-G------T-AA-AC--A-TGT-AC-G-T-CC-A---GCGG-AGAAATG-TAT-C--AAAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCG-----A---GG--T-T-------T---A---------G-A---------C--GG-AGC-G-TAA-C-G--G-AGT-TAG-C----TG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103645                     :                   -AAGCGG-A-GT-G-GA-A--A-A-A-G------T-AA-AC--A-GAT-AC-T-T-CC-A---GTGA-AGAAATG-TAA-C--AAGT-CCGT--GC--A-T---AC-CCC-T------A--C-A----CC-A-A--T--C--------ACA---TCCG-----A---CG--T-TTGTGAAGT---A---------T-AAC-------C--GA-AGC-A-TGA-C-G--G-A
gi|103646                     :                   -AAGCAG-A-AT-G-AA-AAAT---A-G------C-AA-AC--A-TTT-AC-T-T-CC-G---GTGA-GGAAATG-TAA-T--AAAT-CTGT--AC--A-T---AT-CCC--------A----A----CT-A-TTAT--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-T-------T---G---------T-AAAGTGTAGCC--AT-AGC-A-TAT-C-G--G-AAT-CAT-A----AG-AT---G-A----TTG-T-C-GGTTG
gi|103647                     :                                                         -AC--A-TGT-GCAT-T-CC-A---CAGG-AAAAATG-CAT-C--AGTT-TGAT--GC--A-T---TT-----T------G--C-A----CCAA-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-C-------T---
gi|103648                     :                                                                     C-T-T-CC-G---GTGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TTT-T------G--C-A----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A----G--T-C-------T---ACTTTCCGGTT-A---------C--GG-AAA-A-TGG-C-GA-G-CGT-GAT-C----C-------G-A----TTG-C-
gi|103649                     :                                                                     C-T-T-CC-G---TCGA-A-AAATG-CAT-C--GATTTCGAT--GC--A-----AT-TT--T------G--C-G----CC-G-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---GG--T-C-------T---ACTT------T-C---------C--G------G-TTA-C-G--GAAAT-TGA-C----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTG
gi|103650                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A----G--T-C-------T---ACTT------T-C---------C--G------G-TTA-C-G--G-AAA-TTG-A----CG-AGCGTG-A----T---C-C-GATTG
gi|103651                     :                                                                      -T-T-CC-G---GCGG-ATAAATG-CAT-C--GATT-TGAT--GC--A-----AT-TCT-T------G--C-G----CCGA-T--C--C--------ACG---TCCG-----A---G
gi|103652                     :                                                                                         AAATG-TGG-C--GGAT---AC--GC--A-T---AT-C----------AAGT-A----CT-A-T--TA-T--------ACA---TCCG-----A---GG--T-------------A---------TGA---------T--GT-AG--G-TCA-C-G--G-AAT-CAG-C----CG-AG---G-T----TTG-C-C-GAATG
gi|103653                     :                                                                                                       AAT-CGAT--GC--A-T---AT-CCC-T------A--C-A----CC-A-T--T--C--------ACA---TCCA-----A---GG--T-G-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103654                     :                                                                                                                               CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
gi|103655                     :                                                                                                                               CT-T------G--T-A----CC-T-T--T--C--------ACA----CTG-----T---GG----------------------------A---------T--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----AG-AA---A-A----TTG-C-C-TATTG
gi|103656                     :                                                                                                                                          --C-A----CC-T-C--G--C--------ACA----CTG-----ACTCGG--T-G-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103657                     :                                                                                                                                                                                 -----A---GT--T-T-------T---G---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-T-AATTG
gi|103658                     :                                                                                                                                                                                           G--T-G-------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103659                     :                                                                                                                                                                                           G--T-T-------T---A---------T-A---------C--GG-AAC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---T-A----TTG-C-C-GATT
gi|103660                     :                                                                                                                                                                                            --T-C-------T---A---------T-A---------C--GG-AAC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAGAC----CG-AG---G-A----TTG---C-GAT
gi|103661                     :                                                                                                                                                                                                 -------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103662                     :                                                                                                                                                                                                 -------T---A---------T-A---------C--GG-AGC---TAG-C-G--G-AGT-TAGAC----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103663                     :                                                                                                                                                                                                 -------T---A---------T-A---------C--GG-AGC-GGTAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-G-TTG
gi|103664                     :                                                                                                                                                                                                 -------T---A---------C-A---------C--GG-AGC-G-T-G-C-A--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103665                     :                                                                                                                                                                                                         ---A---------T-A---------C--GG-AAC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103666                     :                                                                                                                                                                                                         ---A---------C-A---------C--GC-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATTG
gi|103667                     :                                                                                                                                                                                                         ---A---------T-A---------C--GG-AGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-CA---CG-A----G-A----TCG-CAC-GATT
gi|103668                     :                                                                                                                                                                                                                       -A---------T--GG-AGC-G-TAG-G-G--A-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTC-C-C-GATTG
gi|103669                     :                                                                                                                                                                                                                         ---------C--GG-GAC-G-T-G-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GATT
gi|103670                     :                                                                                                                                                                                                                                   --GG-GGC-G-TAG-C-G--G-AGT-TAG-C----CG-AG---G-A----TTG-C-C-GAT