lowQualScore : 11 111111111 22 222222222222222 11111
lowQualScore : 2 1 1 1 2 3 5555555555555 11 2222 3333 1 1 44444 1 55555 2 2 11 8888 11 1 1 22 2 2 11 22 1 1 1 555 11 11 3 33 2 2 555 3 11 1 1 22 99 11 22 2 22 11 2 11 1 000000000 99999999999999999999 1 2222 22 22 2 00 1 444444444444444 333333 22 1 222 22 2 1 1 1 1 9999 222222 1 4444444 1 1 1 22 1 222 1 1 333 2 22 3 666666 111 1 1 1 1 2 555 2 4444 2 2 11 22 11 1 1 22 1 33 3 1 2 3 444 2 1 555 11 555 2 2222 3 555 1 4 1 1 1 222 1 4444444 1 1 88888 1 8 1 3
lowQualScore : . . . . . . ............. .. .... .... . . ..... . ..... . . .. .... .. . . .. . . .. .. . . . ... .. .. . .. . . ... . .. . . .. .. .. .. . .. .. . .. . ......... .................... . .... .. .. . .. . ............... ...... .. . ... .. . . . . . .... ...... . ....... . . . .. . ... . . ... . .. . ...... ... . . . . . ... . .... . . .. .. .. . . .. . .. . . . . ... . . ... .. ... . .... . ... . . . . . ... . ....... . . ..... . . . .
lowQualScore : 4 1 1 1 2 2 9999999999999 44 2222 3333 1 1 77777 1 33333 2 2 55 4444 55 1 1 44 2 2 55 66 1 1 2 666 66 66 4 11 3 3 444 4 66 1 2 88 77 66 88 4 88 66 4 66 2 333333333 88888888888888888888 2 6666 99 99 4 99 2 111111111111111 444444 88 2 111 77 1 0 0 0 0 7777 777777 9 0000000 0 0 0 33 0 999 0 0 000 9 44 1 888888 888 0 0 0 0 1 333 1 4444 1 1 44 44 44 0 0 44 0 44 0 0 1 1 666 6 3 333 88 999 6 7777 9 000 3 0 3 3 4 444 4 5555555 4 4 11111 5 1 5 1
consensus : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG-TTTT-T--------------AAAA------AAA-C-GGA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTT-T-ATTTT
Reference ( gi|33377 ) : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-AT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG-ATTT-T----------A---AAAA------AAA-C-GGA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-A-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-T--TTA-TCT-T-ATTTT
gi|33379 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AC---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--AGA--TT-TT--TA-GA--A--A--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG-TTTT-T----------G---AAAA------A---C-GCA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--C--G--T-T-AA--G-GT--AAA-A-T-G-TAT---AG-TC-GGT-A--TG-G-A-G------AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TTA-------G-T-GTACT-A--TTA-TCT-T-ATTTT
gi|33378 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA---------T-TTT-TT-----CCCT-AT-----GA-AT-AC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-GT---GA-----AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT--------------------T-T----TT---A--A-ATTTG-TTTT-T----------A---AAA--------AA-C-GGA---AAA--A-CT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------G---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAG----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-
gi|33381 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-GA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-C-A--A-ACC-TT--C----CTG-T--TTA---T-TT--TA-GG-----A--TTT--------------------T-C----TTT--A--G-ATT---GTTT-T----------T---TAAA------AAA-C-GGA---AAA--A-AT-A-T-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCC-T-T-AC-A---T-A---AC-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G---AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TATA--AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CTA---T-TCA-------GTT-GTACT-T--TTA-TTT-T-CTTT
gi|33380 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AT--GACA----A----T-TTTTTT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-AG-----A--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG-TTTT-T---------------AAA------AAA-C-GG----AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AC-TCT-----T---A-T-T-T-GT-A---T-G----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-
gi|33382 : TTAAGG-TA-GA-ATTGAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT---AT-TATT-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-GACCTA--A-A--ACA-C-A--AT-CC-TT--CAA---TG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A------TT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG-TTTT-T---------------AAA------AAA-C-GGA---AAA--A-AT-A-C-T-TTTTT-G-TCC------T-A-------A---C-T--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AC-TC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----GAA-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-CT---GA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTT-T-ATTTT
gi|33383 : TTAAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AG--GA-A----T----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--TTACC-TG--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--AT-A--TTT--------------------T-T----TTT--A--T-A-TTG-TTTT-T---------------AAA------AAA-C-GGA---AAAAGA-AT-A-C-A-TTTTTGA-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-A--A---T-AC--AC-AC------T---A-T-T-T-GTAA---T-T----G----A--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-GTTAT---AG-TA-G---C--TGAA-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-TT-T-CTAGTTT-CCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTT-T-ATTTT
gi|33385 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----C-TTT-TT-----GCCTAAT-----GA-A--TC--A-G--TC--AT-A-AT----T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA----A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATCCT-TC--CAA--CTGTT--TTA--TT-TT--TA-GGAAA--A--TTT--------------------T-T----TTTA-A--G-ATTTG-TTTT-T----------T---TAAA------AAA-C-GG----AAA--A-AT-ACC-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A---C-C--TT-CCA-T-T-TA-A---T-AC--AC-AC------T---A-T-T-T-GT-ATT-T-T----G-A-AATTG--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---GGATA-G---A--TGCATA-GAC----AA-TG---AA-AAC---A-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTAC--T--TTA-TTT-T-ATTTT
gi|33384 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-TTTATTGGAAACAGTT--GACA----A------TTT-TT-----GCTA-GT-----TG-AT-TC--A-G--TC--AT-ATAT-TA-T-GA--TC-G-A-AAG-AT---GC--A--AA-C--AGG-CCT---A-A--ACA-C----ATACCTTT--CAA--CTG-TA-TTA--TT-TT--TA-GG--A------TT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG--TTT-T----------A---AAAA------AAC-G-GGA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC-----AC------T---C-T-T-T-G------T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC---AA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--T----A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTT-A-ATTTT
gi|33387 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--GAA-AAG-AT---GG--G--CA-C--A-G-CCTA--A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--CAA--CTGTT--TTA--TT-TT--TG-AG--ATTT--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATT---GTTT-T----------T---TAAA------AAA-C-GGA---AAA--A-AT-A-C-ATTTTTT-G-TCC------T-A-------A-A-C-CGTTT-CCA-T-TCACAA---T-AC--AC-TC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----T-G-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-ATT-G-TAT---AG-TA-G---ATTTG-A-A-GAC----ACTTGT--AA-AAC-AAA-TT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GT-CT-TTATTA-T-T-T-ATTTT
gi|33388 : TTAAGG-TG-GA-A--GAAA-CG-T-------------TT-----------------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT--C--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-A-G-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-AG-ATACC-TT--CAAA-CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--T--TTT--------------------T-T----TTA--A--G-ATTTG--TTT-T----------A---AAAA------A-----GGA---AAA--ACATTA-C-A-TTTTT-AGTCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CC--T-T-A--A---T-AC--AC-AC------T---A-T-T---GT-A---T------G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TGAA-A-GAC----AA-TGA--AA-AAC-AAA-AT-T-CAG---T-TCA-------G-TGGTATT-A--TTA-T-T-T-ATTTT
gi|33389 : TTAAGG-TGTGA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GACA----A------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-TA-AC--A-G--TC--AG-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT--------------------T-T----TTG--A--G-A-TTG-TTTT-T---------------AAA------AAA-C-GGA---ATA--G-AC-A------TTTT-G-TCC------T-AG------A-C-T-C--TT-CCATT-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---T-T-T-T-GT-T---T-T----G-A-A-----------T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC-----A-TG---AAGAAC-AAA-AT-T-CT----T-TCA-------G-T-CTA---T--ATA-TC--T-ATTCT
gi|33396 : TTACGG-TG-GA-AT-GAAA------------------------------A----T-TTT--------GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG-----AA-C--C-G-CCT---A-A--ACA-C-A---TACC-----TAA--CGG-T--TTA--TT-TT--TA-AG--A--AA-TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATT---GTTT-T----------A---AAAA------AA-----GG---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TTC------TTA-------A-C-C-C--TTTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AC-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G---AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAAGA-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AACTG---AA-AAC-CAG-AT-T-C-A---T-TCA-------G-T-GTACTAT--TTA-TTC-T-ATTTTtt
gi|33386 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAATCG-T-------------TT--GAC-----A----T-ATT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A---TT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTGTATTT-----------------AAA------AAA-C-GGA---CAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCT------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T----C-A---T-AC--AACATA-----T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-TAAA--G-GC--ATA-T-T-G-TCT---A
gi|33395 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCAT-AC-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-AA--T--A-T-AAG-AT---GG--C--AG-C--A-G-TTT---A-A--ATC-C-A--ATATC-AC--CAG--TTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG-----A--TTT--------------------C-T----TTT-----G-ATTT---TTT-T--------------CCAA------AAA-C--GA---TAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-ATT------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AT-T---T-TC--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---C-T----G-C-AA--A--G--T-T-AG--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TATGTATA--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-ATA---T-TCAGATTCAGG-T-GTACT-A--TTGTTTT-T-ATTT
gi|33397 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GAC-----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-A------A-G--TC--AT-A-AT-TATT-GAACT--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CC------A--ACACC-A--ATATC-TT--CAA--CTG-TTGTTA--TT-TT--TATGG--A--A----T--------------------T-T----TTT--A--GAATTTG-GTTTGT---------------AAA------AAA-C-GGA---AAC--ATAT-A-C-T-ATTTT-G-TCC------T-A-------A-CTT-C--TT-CCA---T-AC-A---T-ACA-AA-AC------T---T-T-T-T-GT-T---T-T----G-A-AA--A--G--T----A--G-GC--AAA-A-T-GATAT---AG-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-TTT---T-TCA-------G-T-CTAC--T--ATA-TCT-TAATTTT
gi|33391 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T----GCA----A----TATTT-TT-----GCCT-AT-----AA----TC--A-G--T---AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AAAC--A-G-CCT---ACA--ACA-------TACC--T--CAA--CTG-T--TTT--TT-TT--TA-GG--A--T--TTT--------------------G-T----TTT--A--G-ATTTT-TTTT-T----------T---AAAA------AA--C-GAA---AAA--A-AT-A-C-A-GTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-----T-CC----T-AC-A---TTAC--AA-TCCTC---T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A---G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-A--T-CTA-----TCA-------G-T-GT-CA-A--TTA-TTT-TAATTTT
gi|33390 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTTGGACA----AA---T-TTT-TT-----GGCT-AT-----GA-TT-TC--ATG--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAT-AT---GT--CCAAA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--CAA--C-G-T--T-A--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT--------------------T-T----TT---A--G-ATTTG-TTTT-T----------T---AAGA------A---C-TGA---AAA--T--T-A-C-A-TTTT--G-TCC------T-A-------AAC-C-C--TT-CCA-T-T-AC-AAATT-AC--AG-AC------T---A-T-T---GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GCCAAAA-A-T----------G-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CTT---A-TCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTTAT-ATTTT
gi|33392 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTT----GCCT-A------GA-AT-TT--A-GC-TC--AT-A-A---A-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A---CA-C-A--ATA-C-GT--TCG--CTG-T--TTA--TT-TT-----GG--A--G--ATT--------------------T-T----TTG--A--T-AATTG-TTTT-T----------A---AAAA----------C-GGA---AAA--A-A--A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-T-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AC-AA------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-AGT----AT-TG----A-AAC--AA-GT-T-CTA-------A-------T-T-GTGCC-TA-TCA-T-T-T-ATT
gi|33393 : TTAAGG-TT-GA-AT-GAAA-CC-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-TTT----GA-AT--C--A-GCGTC--ATCA-AC-TA-A-GA--T----A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-T--ACA-C-A---TATC--T--CAA--CTG-T--TTA--TG-GT--TA-GG--G--AGATTT--------------------TAT----TTT--A--G-ATT---GTTT-T----------ATGAAAAA------AAA-C-GGA---AAA--A-GC-A-T-A--TTTT-G-TCC------TAA-------A-C-A-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-T----T-A---T-T----G-G-AA--A--G--T-T-AA--G-GC---AA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GA-----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-G--TT--TTT-T--TTTT
gi|33394 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCC-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-T--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--CAG--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG-----A--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG--TTT-T----------A---AAAA------AAACC-GGA---AAA--A-AT-A-A-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-C
gi|33399 : TTAAGG-TT-GG-AT-GAAA-CG-T-------------TT--G-CA----T----T-TGT-TT-----GCCT-AT-----GAGAG-TC----G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AG---TG--C--AA-C--A-G-CCT---ATT--TCA-C-A--ATACG-TT--CAA--CTG----TTA--TT-TT--TA-GG-----A--TTT--------------------T-T----TTA--A--G-ATTTG--TT-------------------AA------AAA-C-GG----AAA--A-AT-A-C-A-TTTT----GCC------T-A-------A-C-C-----T-TCA-T-T-AC-----T-AC--ACTTC------T---ATT-T-T-GTAA---T-T----G-A-AA--A--G--T----A--G-GC--AGA-A-T-G-TGTATCAG-TA-G---A--TG---A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTT-T-ATTTT
gi|33398 : TCAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GACA----A------TTT-TT-----GCTT-AT-----TA-ATGTC--A-G--TG--A--A-ATATA-T-GA-----G-A-AGA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTTTAAA-A--ACA-C-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TTGTC--TA-GGC-A--A-------------------------T-G----TTT--A--G-ATTTG--TTT------------------AA------ACA-C-GGA---AAA--A-AT-A-C-A-TGTTT-G-TCCAACATGT-A-------A-C-A-C--CT-CCA---C-AC-A---TCAC--AA-AC------T---A-T-T-T-TG-A---T-T----G-A-AA--AC-A--TGT-AA--G-CC--AAACA-T-G-TAT---AG-T--T---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-ATCT-CTA---T-TCA-------G-T-GTACC-TA-TTA-TTT-T-AATTT
gi|33400 : TTAAGG-TG-GA-AT-AAGA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTTTTTTGCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-T-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TC--TA-GG--A--A----T--------------------T-T----TTT--AC-G-ATTTG-TTTT-T---------------CAA------AAA-C--GA---AAA--C-AT-A-C---TTTT-------------T-G-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AT-A---T-AC--A
gi|33401 : TTATGG-TG-GG-AT-GAAAACA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-AT-----GA-AT-TC--C-G--TC--AT-A-AT--G-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACG-C-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--TTG--TG-TT--TA-GG--A--A--TTT--------------------T-T----TTT--A--A-GTTTGTATTT-C----------------AA------AAG-C-GGA---AAA--G----A-C-C-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TC-CCG-G-C-AC-A---T-
gi|33402 : TTAAAG-TG-GACAT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AT-----GACAT-TC----A--TC--AG-A-AT-TA---GA--T--A-A-TAG-ATG--GG--C--AA-CAAA-G-CCT---A-ACTACA-C-A--ATACC-TT--CCA--GTG-T--TTACGTT-TT--TA-GG--A----------------------------T-TGAGATGT--A--GTATTTG--TTC-T----------T---AAAA------AAA-C-GAACATAAA--T-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------C-A-C-C--TT-CCA-TGT-AC-A---T-AC---C-GC------T---A-T-TCT-GT-AC--T-T----GTATAA--A--G--T-G-AAGCG-GC--TAA-A-----TAT---AG-AA-A---A--T----A-AAC----AACTGCGAAA-AAC-AAA-AT-C-C--------CA-------G-T-GTAC
gi|33403 : TTAACG-TG-GA-AT-GAAA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCGT-AT-----aattcaaattt
gi|33404 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----ATCCTT-CTT-TT-----GTTT-AT-----CA-AC-TG--A-A--T---AT-A-A---A-T-GG--C--G-A-A
gi|33405 : TAAGG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------T---GACA----A----T-TTT-TT-----GCTT-AT-----GA-ATCTC--A-G--T---A--A-ATATA-T-GA-----G-A-GAA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TC--TA-GC--A--A--TGT--------------------T-T---------A--G-ATTTG-TTTT-T----------G---AAA-----------C-CGG---AAA--A-AT-A-C-A-TGTTT-G-TCC------T-ACATGTAAA-C-C-----T-CCA-T-C-AC-A---TCAC--AA-AC------T---A-T-T-TTGT-A---T-T----G-A-AA--A--G----T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TT-G---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G---GTACT-A--TTA-TTT-T-AATTT
gi|33406 : TAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GT-T-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-
gi|33407 : AAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TC--GATA----A----T-TTT-TTT----GCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TT--AT-A-AG-TG-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-C-A--ATGTC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT-T----TTT--------TTTG-A----------------------A------AAG-C-AGA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCT------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AT-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-----G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-A---A--TG-A-A-GACAAAAAA-TG---AA-ACA-AAA-AA-T-CTA---T-TTA-------A-T-GTA------TTA-TTT-T-ATTTT
gi|33408 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GGCA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA--T-TT--G-T--TG--AT-A-AA-TT-T-GA--T--G-A-AAG-AT---G---C--AA-C--A-G-CTT---A-A--CCA-C-A--ATATC-TT--CAT--CTG-T--TTA--TT-TTCTTA-GG--A-----TTT--------------------T-T----TTT--A--G-ATTTG-TTTT-T----------G---AAAA------AA--C-GGA---AAA--A-TT---T-A-TTTGT---TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-TGT-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-TG---AA-AAC-AAA-AT-TCCTA---TATCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTT-T--TTTT
gi|33409 : AAG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GC-T-AG-----GA-AT-TC--A-G---C--AT-A-AT--A-T-TA--T--G-A-AAATAT---GG--C--AAAC--AAG-CCT---A-A--ACA-CCA--GTATC--T--CAA--CTG-T--T-A--TTCTT--TA-GG--A--A--GTT--------------------T-T----TT---A--G-ATTTG---TT-T----------A---AAAA------AAC-CCGGA---AAA--A-AA-A-C-A-TTTT--G-TCC------T-A-------A-C-C-CG-TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-C---GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-CC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G------TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACATAT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-A--TTA-TTG-T-ATTTT
gi|33410 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-GTT-TT-----GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--
gi|33411 : AGG-TG-GA-AT-GAA--CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-
gi|33412 : -GA-AT-GAAA-CG-T-------------T---GACA----A----C-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-CA-TTGA--T--G-ACAAG-ATT--GG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-C-A--ATATC-TG--CAA--CTG-T--TTA---T-TT--TA-GG--A--T--TTT--------------------T-T----TTT--A--G-A-TTG-TTTT-T---------------GAA------AAA-C--GA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTG-T-GCT------T-A-------A-C-C-------TCA-T-T-A--A---T-AC---A-AC------C---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A-----T-T--A--G-GC--AAA-A-T-G-TTA---AGCTA-GA--A--TG-AGA-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AA-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTAA--A--TTA-TTT-T-ATTTTgagtgtagtaagtgacattatgttttttgtccatacaaagagttcagtctcataatatgatgaaagacttaggaccaaccagacctaaaacacaagataccttcccaatgtttatttatag
gi|33413 : AA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AG-TA-T-TA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-T-A--ATATC-TT--CAATGCTG----TTA--TT-TT--TT-GG--A--T--TTT--------------------T-C----TTT--A--G-GATTG-TTGT-T----------G---AAAAACGTGTAGG-A-GGA---AAA--A-AT-A-C-A--TTTT-G-TCC------T-A-----------C-C--TT-CTA---T-AC-A---T-AA--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AAG-G-GC--AAA-A-T-G-TATCG-CG-TA-G---A--TG-A-A-G-C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-GTACT-A--TTG-TTT-T-ATTTT
gi|33414 : A-CA-T-------------TT----CA----A----T-TTT-TT-----GCCT-ATTG---GA-AT-TTCAA-A--TC--AT-A-AT--A-TCGA--TATG-T-AAG-ATA--GG--C--AA-CTCA-G-TCT---ATA--ACA-A-A--ATCTT-CT--TAA--CTA-T--T-A--TC-TT---A-GG--A--T--TTT--------------------T-C----TTT--ATAG-ATTTG-TTTT-TGAAAAAAGAAA---AGAA------AAA-C-GGA---AAAC-A-AT-A-CAA-TTTTT-G-GCC------T-T-------A-C-CTC--GT-CAA-GAT-AC-AAT-C-ACAGAA-AC------T---A-T-T-T-GT-ATTTT-T----G-A-AA--ACTG--T-T-AA----GC--AAA-A-T-GTTAT---A
gi|33411 : T--GACATTATG----T-TTT-TT-----GTCC-ATACAAAGA-GT-TC--A-G--TCTCAT-A-AT--A-T-GA--T--G-A-AAG-ACTTAGGACC--AACC--A-GACCTA--A-A--ACA-C-AAGATACC-TTCCCAA---TG-T--TTA--TT-TA--TA-G
gi|33415 : aggtggaatgaacgtttgacaattttttgcctgagtgtagtaag-C--A-G-CCT---A-A--ATA-C-A--ATACC-TT--CAA--CTG-T--TTA--TC-TT--TA-GT--A--A--TTT--------------------T-T----TTTTTA--G-ATTTG--TTT-T----------A---AAAA------ACA---AGA---AAA--A-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CC
gi|33416 : AA------AAA-C-GGA---AAA--T-AT-A-C-A-TTTTT-G-TCC------A-A-------A-C-C-C--TT-CTC-T-C-GC-A---T-AC--AA-CC------T---A-T-T-C-GT-A---T-T----G-G-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAT-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TA---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------G-T-
gi|33417 : --A-AT-A-C-A-TGTTT-G-TCT------T-A-------A-C-C-C--TT-CCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-ATTACATGT---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-AC--AAA-A-T-G-T
gi|33379 : -AT-A-C-A-TTTT--A-CCT------T-A-------A-C-G-T--TT-C-------A--A---T-AC--AA-AT------A---G-T-T-T-GT-A---TGTAATGG-A-AG--G--G--T-T-AG--G-ACA-AAA-A-T-G-TAT---
gi|33378 : ttaaggtggaatgaaacgtttgacaatttttgcgtatgaattcagtcataattatgatgaaagacggcaacagtctaaacacaatatcttcaactgtagatttttagaaattttttttagatttgtttttgaaaaacgcaaaaa-AT-A-C-A-TTTT--G-CCT------T-A-------A-C-T-T--TT-C-------A--A---T-AC--AA-AT------C---G-T-T-T-GT-A---TGTAATGG-A-AG--G--G--T-T-AG--G-ACA-AAA-A-T-G-TAagtcggtatggagaatgaaaacaaaattctatttagtgtactattatcttatttt
gi|33380 : ttaaggtggaatgaaacgtttgacattttttccctatgaatacagtcataattatgatgaaaggtgaaacagcctaaacacaatatcttcaactgtttatttttaggaatttttttaaatttgtttttaaaaaacggaaaaac-AT-A-C-A-TTTT--G-CCT------T-A-------A-C-T-T--TT-CCA-T---AC-A---A-AT--AAGAG------T---G-T-A-T-GT-AA--T-G----G-A-AG--G--G--T-T-AG--G-AC--AAAAA-T-G-TAT---agtagatgaagagaatgaaaacaaaattctattcag
gi|33382 : ttaaggtggaatgaaacgtatgacaatttttttgcctatgaattcagtcataattatgatgaaagatggcaacagcctaaacacaataccttcaactgtttatttttaagattttttttagatttgtttttaaaaaacggaaaa-AT-A-C-C-ATTTT-G-CCT------T-A-------A-C-T-T--TT-TCA-A-T-AC-A---A-AT--AG-AG------T---G-T-A-T-GT-A---A-T----G-G-AA--A--G--T-T-AG--G-AC--AAA-A-agtagatgaagacaa
gi|33390 : ttaaggtagaattgaaacgtttgacaaatttttgcctatgaattcagtcatattattgatgaaagatggcaacagacctaaaacacaatccttcaatgtttatttttaggatttttttagatttgtttttaaaaaacggaaaaaatacttT-A-C-A-TTTTT-G-GCC------T-T-------A-A-C-T--TT-TCA-A-T-AC-A-----AT--AG-TC------TGTAA-T-T-T-GT-A---A-T----G-G-AA--G--GGTT-T-AG--G-AC--AAA-A-T-G-TAagtagatgaagaccactgaaacaaaattctattcagtgtactattattttatttt
gi|33412 : ttaagggtggaatgaaacgttttggacaaattttttggctatgatttcatgtcataattatgatgaaatatgtccaaacagcctaaacacaataccttcaacgttatttttaggaatttttttagatttgttttttaagaactgaaaat-A-C-A-TTTTG----CC------T-A-------A-T------TT-TCA--------A---T-AC--AA-A-------T---G-G-T-T-GT-A---T-T----A-ATGA--G--G--T-T-AA--GCAC--AAA-A-T-G-TAT---gatgaaggacaatgaaaacaaaaattcttatcagtgtactattatttatatttt
gi|33418 : gaatgaaacgttgacaactttttgcctatgaattcagtcataatcattgatgacaagattggcaacagcccaaacacaatatctgcaactgtttattttaggatttttttttagattgtttttgaaaaacgaaaaa-TCC------T-A-------A-C-C-C--TT-CCG-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-taagctagaatgagagacaatgaaaacaaaaatctattcagtgtaaattattttatttt
gi|33419 : -T-T-AT-A---T-AC--AA-AG------T---A-T-T-T-GT-A---T-T----G-A-AA--A--G--T-T-AA--G-GC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CTA---T-TCA-------A-T-GTACT-A--TAA-TTT-T-ATTTT
gi|33420 : --T-T-AA--G-GC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACA-AT-T-CT----T-TCA-------G-T-GTAC--A--TTA-TTT-T-ATTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111 222222222222
lowQualScore : 2 1 1 1 2 2 5555555555555 22 2222 3333 1 1 44444 1 55555 2 2 11 1 22 11 1 1 2 2 2 11 22 1 1 1 555 11 11 3 33 2 2 555 3 11 1 1 22 1 11 11 22 2 22 11 2 11 1 333333333 88888888888888888 1 2222 1 22 2 1 1 111111111111 33 66666666 222 22 2 1 1 1 1 1 2 1 333333 4444444 1 1 2 33 1 2 1 1 333 3 22 2 777777 2 1 1 2 444 2 1 11 22 1 1 22 11 2 1 2 3 444 2 1 555 11 555 2 2222 3 444 1 3 1 1 1 1 222 1 4444444 1 1 55555 1 222 1 22 1 3
lowQualScore : . . . . . . ............. .. .... .... . . ..... . ..... . . .. . .. .. . . . . . .. .. . . . ... .. .. . .. . . ... . .. . . .. . .. .. .. . .. .. . .. . ......... ................. . .... . .. . . . ............ .. ........ ... .. . . . . . . . . ...... ....... . . . .. . . . . ... . .. . ...... . . . . ... . . .. .. . . .. .. . . . . ... . . ... .. ... . .... . ... . . . . . . ... . ....... . . ..... . ... . .. . .
lowQualScore : 3 1 1 1 1 1 8888888888888 44 2222 2222 0 0 66666 0 11111 2 2 55 1 66 55 1 1 2 2 2 55 66 1 1 1 444 66 66 3 11 2 2 333 3 55 1 1 77 1 66 66 77 3 77 66 3 66 1 777777777 22222222222222222 2 5555 2 88 4 2 2 444444444444 99 44444444 000 66 2 1 1 1 1 1 2 1 111111 6666666 1 1 2 66 1 2 1 1 555 3 77 4 888888 4 2 2 4 999 4 2 66 88 1 1 77 66 3 1 3 4 999 5 2 222 77 444 5 7777 8 888 3 9 3 3 3 3 333 3 3333333 3 4 00000 4 555 4 00 4 1
consensus : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T------------AAAAAA--C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Reference ( family-411 ) : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T-----------AAAAAAA--C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33377 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-AT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-ATTT-T-----------AAAAAAAA-C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-A-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTT-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33378 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA---------T-TTT-TT-----CCCT-AT-----GA-AT-AC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-GT---GA-----AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT-----------------T-T----TT--A--A-ATTTG-TTTT-T-----------AAAA-AA--C--------GGA---AAA--A-C-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------GA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAG----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-
gi|33379 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AC---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--AGA--TT-TT--TA-GA--A--A--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T-----------GAAAAA---C--------GCA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--C--GT-T-AA--GGT--AAA-A-T-G-TAT---AG-TC-GGT-A--TG-G-A-G------AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TTA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33380 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AT--GACA----A----T-TTTTTT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-AG-----A--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T------------AAAAAA--C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC-TCT-----TA-T-T-TGT-A---TGG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-
gi|33381 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-GA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-C-A--A-ACC-TT--C------CTG-T--TTA---T-TT--TA-GG-----A--TTT-----------------T-C----TTT-A--G-A-TTG-TTTT-T-----------TAAAAAA--C--------GGA---AAA--A-A-TA-T-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCC-T-T-AC-A---T-A---AC-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TATA--AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------GTT-GTA-----CTT-TT---A-T--TT-T-CTTT
gi|33382 : TTAAGG-TA-GA-ATTGAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT---AT-TATT-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-GACCTA--A-A--ACA-C-A--AT-CC-TT--C--AA---TG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A------TT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T------------AAAAAA--C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-T-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-T--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC-TC------TA-T-T-TGT-A---TTGAA-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-CT---GA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33383 : TTAAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AG--GA-A----T----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--TTACC-TG--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--AT-A--TTT-----------------T-T----TTT-A--T-A-TTG-TTTT-T------------AAAAAA--C--------GGA---AAAAGA-A-TA-C-A-TTTTT-GAT-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-A--A---T-AC--AC-AC------TA-T-T-TGTAA---TTG----A--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-GTTAT---AG-TA-G---C--TGAA-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-TT-T-CT-AGTTT-CCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33384 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-TTTATTGGAAACAGTT--GACA----A------TTT-TT-----GCTA-GT-----TG-AT-TC--A-G--TC--AT-ATAT-TA-T-GA--TC-G-A-AAG-AT---GC--A--AA-C--AGG-CCT---A-A--ACA-C----ATACCTTT--C--AA--CTG-TA-TTA--TT-TT--TA-GG--A------TT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG--TTT-T-----------AAAAAAA--CG-------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC-----AC------TC-T-T-TG------TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC---AA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--T----A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-A-ATTTT
gi|33385 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----C-TTT-TT-----GCCTAAT-----GA-A--TC--A-G--TC--AT-A-AT----T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA----A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATCCT-TC--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--TA-GGAAA--A--TTT-----------------T-T----TTTAA--G-ATTTGTTTTT-T-----------TAAAAAA--C--------GG----AAA--A-A-TACC-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-C--TTCCA-T-T-TA-A---T-AC--AC-AC------TA-T-T-TGT-ATT-TTG-A-AATTG--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---GGATA-G---A--TGCATA-GAC----AA-TG---AA-AAC---A-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CT--TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33386 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAATCG-T-------------TT--GAC-----A----T-ATT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A---TT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TATT-T------------AAAAAA--C--------GGA---CAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T----C-A---T-AC--AACATA-----TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-TAAA--GGC--ATA-T-T-G-TCT---A
gi|33387 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--GAA-AAG-AT---GG--G--CA-C--A-G-CCTA--A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--TG-AG--ATTT--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-A-TTG-TTTT-T-----------TAAAAAA--C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-ATTTTTT-G-T-CC------T-------A-AA-C-CGTTTCCA-T-TCACAA---T-AC--AC-TC------TA-T-T-TGT-A---TTT-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-ATT-G-TAT---AG-TA-G---ATTTG-A-A-GAC----ACTTGT--AA-AAC-AAA-TT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GT------CT--TT---A-TTATT-T-ATTTT
gi|33388 : TTAAGG-TG-GA-A--GAAA-CG-T-------------TT-----------------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT--C--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-A-G-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-AG-ATACC-TT--C--AAA-CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--T--TTT-----------------T-T----TTA-A--G-ATTTG--TTT-T-----------AAAAAA------------GGA---AAA--ACATTA-C-A-TTTTTAG-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC--T-T-A--A---T-AC--AC-AC------TA---T-TGT-A----TG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TGAA-A-GAC----AA-TGA--AA-AAC-AAA-AT-T-CA-G---T-TCA-------G-TGGTA-----TTA-TT---A----TT-T-ATTTT
gi|33389 : TTAAGG-TGTGA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GACA----A------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-TA-AC--A-G--TC--AG-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTT-----------------T-T----TTG-A--G-A-TTG-TTTT-T------------AAAAAA--C--------GGA---ATA--G-A-CA------TTTT-G-T-CC------T-------AGAC-T-C--TTCCATT-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-A---------T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC-----A-TG---AAGAAC-AAA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-CTATATATCTA-TT---C-T--TT-
gi|33390 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTTGGACA----AA---T-TTT-TT-----GGCT-AT-----GA-TT-TC--ATG--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAT-AT---GT--CCAAA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AA--C-G----TTA--TT-TT--TA-GG--A--A---TT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T-----------TAAGAAC--T--------G-----AAA--A-T-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------TA------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-AAATT-AC--AG-AC------TA---T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGCCAAAA-A-T----------G-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-T---A-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TTAT-ATTTT
gi|33391 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T----GCA----A----TATTT-TT-----GCCT-AT-----AA----TC--A-G--T---AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AAAC--A-G-CCT---ACA--ACA-------TACC-T---C--AA--CTG-T--TTT--TT-TT--TA-GG--A--T--TTT-----------------G-T----TTT-A--G-ATTTT-TTTT-T-----------TAAAAAA--C--------GAA---AAA--A-A-TA-C-A-GTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-----TCC----T-AC-A---TTAC--AA-TCCTC---TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A---G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-A--T-CT-A-----TCA-------G-T-GT------CAA-TT---A-T--TT-TAATTTT
gi|33392 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTT----GCCT-A------GA-AT-TT--A-GC-TC--AT-A-A---A-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A---CA-C-A--ATACG-TT--C--G---CTG-T--TTA--TT-TT-----GG--A--G--ATT-----------------T-T----TTG-A--T-AATTG-TTTT-T-----------AAAAA----C--------GGA---AAA--A-A--A-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-T-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC-AA------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-AGT----AT-TG----A-AAC--AA-GT-T-CTAA---T-T---------G-T-GC------CTA-TC---A----TT-T-ATT
gi|33393 : TTAAGG-TT-GA-AT-GAAA-CC-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-TTT----GA-AT--C--A-GCGTC--ATCA-AC-TA-A-GA--T----A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-T--ACA-C-A---TATC-T---C--AA--CTG-T--TTA--TG-GT--TA-GG--G--AGATTT-----------------TAT----TTT-A--G-ATT-G-TTTTATGA---------AAAAAAA--C--------GGA---AAA--A-G-CA-T-A-TTTT--G-T-CC------T-------A-AA-CAC--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-T---A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GA-----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTG-TT-----T--TT-T--TTTT
gi|33394 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCC-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-T--A-G-CCT---A-A--ACA-C-A--ATACC-TT--C--AG--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG-----A--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-A-----------AAAAAAAC-C--------GGA---AAA--A-A-TA-A-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTC
gi|33395 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCAT-AC-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-AA--T--A-T-AAG-AT---GG--C--AG-C--A-G-TTT---A-A--ATC-C-A--ATATC-AC--C--AG--TTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG-----A--TTT-----------------C-T----TTT----G-ATT---TTTT-T-----------CCAAAAA--C---------GA---TAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-A-TT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-T---T-TC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---CTG-C-AA--A--GT-T-AG--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TATGTATA--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-AT-A---T-TCAGATTCAGG-T-GTA-----CTA-TT---GTT--TT-T-ATTT
gi|33396 : TTACGG-TG-GA-AT-GAAA------------------------------A----T-TTT--------GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG-----AA-C--C-G-CCT---A-A--ACA-C-A---TACC-T------AA--CGG-T--TTA--TT-TT--TA-AG--A--AA-TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATT-G-TTTT-------------AAAAAAA------------GG---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-GTT-CT------T-------A-AC-C-CT-TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AC-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAAGA-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AACTG---AA-AAC-CAG-AT-T-C--A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTATTT---A-T--TC-T-ATTTT
gi|33397 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GAC-----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-A------A-G--TC--AT-A-AT-TATT-GAACT--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CC------A--ACACC-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-TTGTTA--TT-TT--TATGG--A--A----T-----------------T-T----TTT-A--GAATTTG-GTTT-G-----------TAAAAAA--C--------GGA---AAC--ATA-TA-C-T-ATTTT-G-T-CC------T-------A-ACTT-C--TTCCA---T-AC-A---T-ACA-AA-AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AAA-A-T-GATAT---AG-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-TT-T---T-TCA-------G-T-CTA-----CTA--T---A-T--CT-TAATTTT
gi|33398 : TCAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTT-GACA----A----T-TTT-T------GCTT-AT-----TA-ATGTC--A-G--TG--A--A-ATATA-T-GA-----G-A-AGA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTTTAAA-A--ACA-C-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TTGTC--TA-GGC-A--A----------------------T-G----TTT-A--G-ATTTG-TTT----------------AAACA--C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CCAACATGT-------A-AC-A-C--CTCCA---C-AC-A---TCAC--AA-AC------TA-T-T-TTG-A---TTG-A-AA--AC-ATGT-AA--GCC--AAACA-T-G-TAT---AG-T--T---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-ATCT-CT-A---T-TCA-------G-T-GTAC----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33399 : TTAAGG-TT-GG-AT-GAAA-CG-T-------------TT--G-CA----T----T-TGT-TT-----GCCT-AT-----GAGAG-TC----G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AG---TG--C--AA-C--A-G-CCT---ATT--TCA-C-A--ATACG-TT--C--AA--CTG----TTA--TT-TT--TA-GG-----A--TTT-----------------T-T----TTA-A--G-ATTTG-TT-----------------AAAAA--C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G---CC------T-------A-AC-C-----TTCA-T-T-AC-----T-AC--ACTTC------TATT-T-TGTAA---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AGA-A-T-G-TGTATCAG-TA-G---A--TG---A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33400 : TTAAGG-TG-GA-AT-AAGA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTTTTTTGCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-T-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--TA-GG--A--A----T-----------------T-T----TTT-AC-G-ATTTG-TTTT-T------------CAAAAA--C---------GA---AAA--C-A-TA-C---TTTTT-G---------------------AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--A
gi|33401 : TTATGG-TG-GG-AT-GAAAACA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-AT-----GA-AT-TC--C-G--TC--AT-A-AT--G-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACG-C-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTG--TG-TT--TA-GG--A--A--TTT-----------------T-T----TTT-A--A-GTTTG-TATT-T------------CAAAAG--C--------GGA---AAA--G----A-C-C-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TCCCG-G-C-AC-A---T-
gi|33402 : TTAAAG-TG-GACAT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AT-----GACAT-TC--A----TC--AG-A-AT-TA---GA--T--A-A-TAG-ATG--GG--C--AA-CAAA-G-CCT---A-ACTACA-C-A--ATACC-TT--C--CA--GTG-T--TTACGTT-TT--TA-GG--A-------------------------T-TGAGATGT-A--GTATTTG-TTCT-T-----------AAAAAAA--C--------GAACATAAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-CA-C-C--TTCCA-TGT-AC-A---T-AC---C-GC------TA-T-TCTGT-AC--TTGTATAA--A--GT-G-AAGCGGC--TAA-A-----TAT---AG-AA-A---A--T----A-AAC----AACTGCGAAA-AAC-AAA-AT-C-C---------CA-------G-T-GTA-----CAA-TTCAAA-T--TT-
gi|33403 : TTAACG-TG-GA-AT-GAAA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCGT-AT-----
gi|33404 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----ATCCTT-CTT-TT-----GTTT-AT-----CA-AC-TG--A-A--T---AT-A-A---A-T-GG--C--G-A-A
gi|33405 : TAAGG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------T---GACA----A----T-TTT-TT-----GCTT-AT-----GA-ATCTC--A-G--T---A--A-ATATA-T-GA-----G-A-GAA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-C-A--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--TA-GC--A--A----------------------T-G----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T--------------GAAA--C--------CGG---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CC------TACATGTAA-AC-C-----TCCA-T-C-AC-A---TCAC--AA-AC------TATT-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--G--T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TT-G---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G---GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33406 : TAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GT-T-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-
gi|33407 : AAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TC--GATA----A----T-TTT-TTT----GCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TT--AT-A-AG-TG-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-C-A--ATGTC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--TA-GG--A--A--TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA-----------A--A-ATTT--TTTT-T-----------GAAAAG---C--------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-----GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-A---A--TG-A-A-GACAAAAAA-TG---AA-ACA-AAA-AA-T-CT-A---T-TTA-------A-T-G--------TA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33408 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GGCA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA--T-TT--G-T--TG--AT-A-AA-TT-T-GA--T--G-A-AAG-AT---G---C--AA-C--A-G-CTT---A-A--CCA-C-A--ATATC-TT--C--AT--CTG-T--TTA--TT-TTCTTA-GG--A-----TTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT-T-----------GAAAAAA--C--------GGA---AAA--A-T-T--T-A-TTTGT---T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-TGT-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-TG---AA-AAC-AAA-AT-TCCT-A---TATCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T--TTTT
gi|33409 : AAG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GC-T-AG-----GA-AT-TC--A-G---C--AT-A-AT--A-T-TA--T--G-A-AAATAT---GG--C--AAAC--AAG-CCT---A-A--ACA-CCA--GTATC-T---C--AA--CTG-T--T-A--TTCTT--TA-GG--A--A--GTT-----------------T-T-----TT-A--G-ATTTG---TT-T-----------AAAAAAACCC--------GGA---AAA--A-A-AA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-CG-TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA---T-CGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GCC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G------TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACATAT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TG-T-ATTTT
gi|33410 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-GTT-TT-----GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--
gi|33411 : AGG-TG-GA-AT-GAA--CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-
gi|33411 : T--GACATTATG----T-TTT-TT-----GTCC-ATACAAAGA-GT-TC--A-G--TCTCAT-A-AT--A-T-GA--T--G-A-AAG-ACTTAGGACC--AACC--A-GACCTA--A-A--ACA-C-AAGATACC-TTCCC--AA---TG-T--TTA--TT-TA--TA-Ggagtgtagtaagtgacattatgttttttgtccatacaaagagttcagtctcataatatgatgaaagacttaggaccaaccagacctaaaacacaagataccttcccaatgtttatttatag
gi|33412 : aggtggaatgaacgtttgacaattttttgcctgagtgtagtaag-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T---GACA----A----C-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-CA-TTGA--T--G-ACAAG-ATT--GG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-C-A--ATATC-TG--C--AA--CTG-T--TTA---T-TT--TA-GG--A--T--TTT-----------------T-T----TTT-A--G-A-TTG-TTTT-T------------GAAAAA--C---------GA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-TGCT------T-------A-AC-C------TCA-T-T-A--A---T-AC---A-AC------CA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A---T-T--A--GGC--AAA-A-T-G-TTA---AGCTA-GA--A--TG-AGA-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AA-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----A-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33413 : AA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AG-TA-T-TA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-T-A--ATATC-TT--C--AATGCTG----TTA--TT-TT--TT-GG--A--T--TTT-----------------T-C----TTT-A--G-GATTG-TTGT-T------------GAAAAA--CGTGTAGGAGGA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A----C-C--TTCTA---T-AC-A---T-AA--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AAG-GGC--AAA-A-T-G-TATCG-CG-TA-G---A--TG-A-A-G-C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---G-T--TT-T-ATTTT
gi|33414 : A-CA-T-------------TT----CA----A----T-TTT-TT-----GCCT-ATTG---GA-AT-TTCAA-A--TC--AT-A-AT--A-TCGA--TATG-T-AAG-ATA--GG--C--AA-CTCA-G-TCT---ATA--ACA-A-A--AT--C-TT--CTTAA--CTA-T--T-A--TC-TT---A-GG--A--T--TTT-----------------T-C----TTT-ATAG-ATTTG-TTTT-TGAAAAAAGAAAAGAAAAA--C--------GGA---AAAC-A-A-TA-CAA-TTTTT-G-G-CC------T-------T-AC-CTC--GTCAA-GAT-AC-AAT-C-ACAGAA-AC------TA-T-T-TGT-ATTTTTG-A-AA--ACTGT-T-AA---GC--AAA-A-T-GTTAT---A
gi|33415 : -C--A-G-CCT---A-A--ATA-C-A--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TC-TT--TA-GT--A--ATTTTT-----------------T-T----TTT-A--G-ATTTG-TTTT--------------AAAAAA--CA-------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC
gi|33416 : AAAAA--C--------GGA---AAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------A-------A-AC-C-C--TTCTC-T-C-GC-A---T-AC--AA-CC------TA-T-T-CGT-A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAT-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TA---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-
gi|33417 : --A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA-ATTACATGTA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GAC--AAA-A-T-G-T
gi|33418 : -T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCG-T-T-AC-A---T-AC--AA-AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-
gi|33419 : -T-T-AT-A---T-AC--AA-AG------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------A-T-GTA-----CTA-TA---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33420 : T-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-GTA-----C-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 1 1 1 2 2 5555555555555 22 2222 3333 1 1 44444 1 55555 2 2 11 1 22 11 1 1 2 2 2 11 22 1 1 1 555 11 22 2 44 1 2 555 3 11 2 22 1 11 11 22 2 22 11 2 11 1 1 111111111 88888888888888888 22 2222 1 22 2 1 11 2 000000000000 11 333 66666666 222 22 2 1 1 1 1 1 2 1 333333 4444444 1 1 2 33 1 2 1 1 444 2 22 444 555555 2 1 1 2 444 2 1 11 22 1 1 22 11 2 1 2 3 444 2 1 555 11 555 2 2222 3 444 1 3 1 1 1 1 222 1 4444444 1 1 55555 1 222 1 22 1 3
lowQualScore : . . . . . . ............. .. .... .... . . ..... . ..... . . .. . .. .. . . . . . .. .. . . . ... .. .. . .. . . ... . .. . .. . .. .. .. . .. .. . .. . . ......... ................. .. .... . .. . . .. . ............ .. ... ........ ... .. . . . . . . . . ...... ....... . . . .. . . . . ... . .. ... ...... . . . . ... . . .. .. . . .. .. . . . . ... . . ... .. ... . .... . ... . . . . . . ... . ....... . . ..... . ... . .. . .
lowQualScore : 3 1 1 1 1 1 8888888888888 44 2222 2222 0 0 66666 0 11111 2 2 55 1 66 55 1 1 2 2 2 55 66 1 1 1 444 66 77 2 22 1 2 333 3 55 2 77 1 66 66 77 3 77 66 3 66 1 1 666666666 22222222222222222 88 5555 2 88 4 2 66 4 444444444444 66 666 44444444 000 66 2 1 1 1 1 1 2 1 111111 6666666 1 1 2 66 1 2 1 1 666 2 77 444 777777 4 2 2 4 999 4 2 66 88 1 1 77 66 3 1 3 4 999 5 2 222 77 444 5 7777 8 888 3 9 3 3 3 3 333 3 3333333 3 4 00000 4 555 4 00 4 1
consensus : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Reference ( family-411 ) : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33377 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-AT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--ATTT-T------------AAAAAAAA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-A-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTT-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33378 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA---------T-TTT-TT-----CCCT-AT-----GA-AT-AC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-GT---GA-----AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TT--A--A-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-C-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------GA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAG----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-
gi|33379 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AC---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--AGA--TT-TT--T-A-GA--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------GAAA--AA---C--------GCA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--C--GT-T-AA--GGT--AAA-A-T-G-TAT---AG-TC-GGT-A--TG-G-A-G------AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TTA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33380 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AT--GACA----A----T-TTTTTT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-AG-----A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---TCT-----TA-T-T-TGT-A---TGG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-
gi|33381 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-GA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-CA--A-ACC-TT--C------CTG-T--TTA---T-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--C----TTT-A--G-ATTG-T--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-T-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCC-T-T-AC-A---T-A---AC---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TATA--AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------GTT-GTA-----CTT-TT---A-T--TT-T-CTTT
gi|33382 : TTAAGG-TA-GA-ATTGAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT---AT-TATT-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-GACCTA--A-A--ACA-CA--AT-CC-TT--C--AA---TG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A------TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-T-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-T--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---TC------TA-T-T-TGT-A---TTGAA-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-CT---GA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33383 : TTAAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AG--GA-A----T----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--TTACC-TG--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--AT-A--TTT-----------------T--T----TTT-A--T-A-TT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAAAGA-A-TA-C-A-TTTTT-GAT-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-A--A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGTAA---TTG----A--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-GTTAT---AG-TA-G---C--TGAA-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-TT-T-CT-AGTTT-CCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33384 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-TTTATTGGAAACAGTT--GACA----A------TTT-TT-----GCTA-GT-----TG-AT-TC--A-G--TC--AT-ATAT-TA-T-GA--TC-G-A-AAG-AT---GC--A--AA-C--AGG-CCT---A-A--ACA-C---ATACCTTT--C--AA--CTG-TA-TTA--TT-TT--T-A-GG--A------TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-A------------AAAA--AA---CG-------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC-------AC------TC-T-T-TG------TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC---AA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--T----A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-A-ATTTT
gi|33385 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----C-TTT-TT-----GCCTAAT-----GA-A--TC--A-G--TC--AT-A-AT----T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA----A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATCCT-TC--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--T-A-GGAAA--A--TTT-----------------T--T----TTTAA--G-ATTT-GTTTTTT-T------------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TACC-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-C--TTCCA-T-T-TA-A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGT-ATT-TTG-A-AATTG--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---GGATA-G---A--TGCATA-GAC----AA-TG---AA-AAC---A-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CT--TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33386 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAATCG-T-------------TT--GAC-----A----T-ATT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A---TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TATT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---CAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T----C-A---T-AC--AAC--ATA-----TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-TAAA--GGC--ATA-T-T-G-TCT---A
gi|33387 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--GAA-AAG-AT---GG--G--CA-C--A-G-CCTA--A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--T-G-AG--ATTT--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTG-T--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-ATTTTTT-G-T-CC------T-------A-AA-C-CGTTTCCA-T-TCACAA---T-AC--AC---TC------TA-T-T-TGT-A---TTT-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-ATT-G-TAT---AG-TA-G---ATTTG-A-A-GAC----ACTTGT--AA-AAC-AAA-TT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GT------CT--TT---A-TTATT-T-ATTTT
gi|33388 : TTAAGG-TG-GA-A--GAAA-CG-T-------------TT-----------------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT--C--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-A-G-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CAG-ATACC-TT--C--AAA-CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------T--T----TTA-A--G-ATTT-G---TTT-T------------AAAA--AA------------GGA---AAA--ACATTA-C-A-TTTTTAG-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC--T-T-A--A---T-AC--AC---AC------TA---T-TGT-A----TG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TGAA-A-GAC----AA-TGA--AA-AAC-AAA-AT-T-CA-G---T-TCA-------G-TGGTA-----TTA-TT---A----TT-T-ATTTT
gi|33389 : TTAAGG-TGTGA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GACA----A------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-TA-AC--A-G--TC--AG-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTG-A--G-A-TT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---ATA--G-A-CA------TTTT-G-T-CC------T-------AGAC-T-C--TTCCATT-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-A---------T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC-----A-TG---AAGAAC-AAA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-CTATATATCTA-TT---C-T--TT-
gi|33390 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTTGGACA----AA---T-TTT-TT-----GGCT-AT-----GA-TT-TC--ATG--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAT-AT---GT--CCAAA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--C-G----TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A---TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------TAAG--AA---C--------TG----AAA--A-T-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------TA------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-AAATT-AC--AG---AC------TA---T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGCCAAAA-A-T----------G-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-T---A-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TTAT-ATTTT
gi|33391 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T----GCA----A----TATTT-TT-----GCCT-AT-----AA----TC--A-G--T---AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AAAC--A-G-CCT---ACA--ACA------TACC-T---C--AA--CTG-T--TTT--TT-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------G--T----TTT-A--G-ATTT-T--TTTTTT------------AAAA--AA---C--------GAA---AAA--A-A-TA-C-A-GTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-----TCC----T-AC-AT--T-AC--AATCCTC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A---G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-A--T-CT-A-----TCA-------G-T-GT------CAA-TT---A-T--TT-TAATTTT
gi|33392 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTT----GCCT-A------GA-AT-TT--A-GC-TC--AT-A-A---A-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A---CA-CA--ATACG-TT--C--G---CTG-T--TTA--TT-TT------GG--A--G--ATT-----------------T--T----TTG-A--T-AATT-G--TTTT-T------------AAAA--A----C--------GGA---AAA--A-A--A-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-T-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---AA------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-AGT----AT-TG----A-AAC--AA-GT-T-CTAA---T-T---------G-T-GC------CTA-TC---A----TT-T-ATT
gi|33393 : TTAAGG-TT-GA-AT-GAAA-CC-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-TTT----GA-AT--C--A-GCGTC--ATCA-AC-TA-A-GA--T----A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-T--ACA-CA---TATC-T---C--AA--CTG-T--TTA--TG-GT--T-A-GG--G--AGATTT-----------------TA-T----TTT-A--G-ATT--G--TTTTATGAA---------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-G-CA-T-A-TTTT--G-T-CC------T-------A-AA-CAC--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-T---A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GA-----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTG-TT-----T--TT-T--TTTT
gi|33394 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCC-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-T--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AG--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-A------------AAAA--AAAC-C--------GGA---AAA--A-A-TA-A-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTC
gi|33395 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCAT-AC-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-AA--T--A-T-AAG-AT---GG--C--AG-C--A-G-TTT---A-A--ATC-CA--ATATC-AC--C--AG--TTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------C--T----TTT----G-ATTT----TTTT-C------------CAAA--AA---C---------GA---TAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-A-TT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-T---T-TC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---CTG-C-AA--A--GT-T-AG--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TATGTATA--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-AT-A---T-TCAGATTCAGG-T-GTA-----CTA-TT---GTT--TT-T-ATTT
gi|33396 : TTACGG-TG-GA-AT-GAAA------------------------------A----T-TTT--------GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG-----AA-C--C-G-CCT---A-A--ACA-CA---TACC-T------AA--CGG-T--TTA--TT-TT--TAA-GA--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-A-TT-G--TTTT-A------------AAAA--AA-------------GG---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-GTT-CT------T-------A-AC-C-CT-TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAAGA-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AACTG---AA-AAC-CAG-AT-T-C--A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTATTT---A-T--TC-T-ATTTT
gi|33397 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GAC-----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-A------A-G--TC--AT-A-AT-TATT-GAACT--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CC------A--ACACCA--ATATC-TT--C--AA--CTG-TTGTTA--TT-TT--T-ATGG--A--A----T-----------------T--T----TTT-A--GAATTTGG--TTTG-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAC--ATA-TA-C-T-ATTTT-G-T-CC------T-------A-ACTT-C--TTCCA---T-AC-A---T-ACA-AA---AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AAA-A-T-GATAT---AG-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-TT-T---T-TCA-------G-T-CTA-----CTA--T---A-T--CT-TAATTTT
gi|33398 : TCAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTT-GACA----A----T-TTT-T------GCTT-AT-----TA-ATGTC--A-G--TG--A--A-ATATA-T-GA-----G-A-AGA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTTTAAA-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TTGTC--T-A-GGC-A--A----------------------T--G----TTT-A--G-ATTT-G--TTT----------------AAA--CA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CCAACATGT-------A-AC-A-C--CTCCA---C-AC-A---TCAC--AA---AC------TA-T-T-TTG-A---TTG-A-AA--AC-ATGT-AA--GCC--AAACA-T-G-TAT---AG-T--T---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-ATCT-CT-A---T-TCA-------G-T-GTAC----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33399 : TTAAGG-TT-GG-AT-GAAA-CG-T-------------TT--G-CA----T----T-TGT-TT-----GCCT-AT-----GAGAG-TC----G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AG---TG--C--AA-C--A-G-CCT---ATT--TCA-CA--ATACG-TT--C--AA--CTG----TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--T----TTA-A--G-ATTT-G--TT-----------------AAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G---CC------T-------A-AC-C-----TTCA-T-T-AC-----T-AC--ACT--TC------TATT-T-TGTAA---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AGA-A-T-G-TGTATCAG-TA-G---A--TG---A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33400 : TTAAGG-TG-GA-AT-AAGA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTTTTTTGCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-TA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--T-A-GG--A--A----T-----------------T--T----TTT-AC-G-ATTT-G--TTTT-T------------CAAA--AA---C---------GA---AAA--C-A-TA-C---TTTTT-G---------------------AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--A
gi|33401 : TTATGG-TG-GG-AT-GAAAACA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-AT-----GA-AT-TC--C-G--TC--AT-A-AT--G-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACG-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTG--TG-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--A-GTTT-G--TATT-T------------CAAA--AG---C--------GGA---AAA--G----A-C-C-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TCCCG-G-C-AC-A---T-
gi|33402 : TTAAAG-TG-GACAT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AT-----GACAT-TC--A----TC--AG-A-AT-TA---GA--T--A-A-TAG-ATG--GG--C--AA-CAAA-G-CCT---A-ACTACA-CA--ATACC-TT--C--CA--GTG-T--TTACGTT-TT--T-A-GG--A-------------------------T--TGAGATGT-A--GTATTT-G--TTCT-TA-----------AAAA--AA---C--------GAACATAAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-CA-C-C--TTCCA-TGT-AC-A---T-AC---C---GC------TA-T-TCTGT-AC--TTGTATAA--A--GT-G-AAGCGGC--TAA-A-----TAT---AG-AA-A---A--T----A-AAC----AACTGCGAAA-AAC-AAA-AT-C-C---------CA-------G-T-GTA-----CAA-TTCAAA-T--TT-
gi|33403 : TTAACG-TG-GA-AT-GAAA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCGT-AT-----
gi|33404 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----ATCCTT-CTT-TT-----GTTT-AT-----CA-AC-TG--A-A--T---AT-A-A---A-T-GG--C--G-A-A
gi|33405 : TAAGG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------T---GACA----A----T-TTT-TT-----GCTT-AT-----GA-ATCTC--A-G--T---A--A-ATATA-T-GA-----G-A-GAA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--T-A-GC--A--A----------------------T--G----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T--------------GA--AA---C--------CGG---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CC------TACATGTAA-AC-C-----TCCA-T-C-AC-A---TCAC--AA---AC------TATT-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--G--T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TT-G---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G---GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33406 : TAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GT-T-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-
gi|33407 : AAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TC--GATA----A----T-TTT-TTT----GCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TT--AT-A-AG-TG-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-CA--ATGTC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA------------A--A-ATTT----TTTT-T------------GAAA--AG---C--------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-----GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-A---A--TG-A-A-GACAAAAAA-TG---AA-ACA-AAA-AA-T-CT-A---T-TTA-------A-T-G--------TA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33408 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GGCA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA--T-TT--G-T--TG--AT-A-AA-TT-T-GA--T--G-A-AAG-AT---G---C--AA-C--A-G-CTT---A-A--CCA-CA--ATATC-TT--C--AT--CTG-T--TTA--TT-TTCTT-A-GG--A-----TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-TG-----------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TT-T-A-TTTGT---T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-TGT-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-TG---AA-AAC-AAA-AT-TCCT-A---TATCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T--TTTT
gi|33409 : AAG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AG-----GA-AT-TC--A-G---C--AT-A-A--TA-T-TA--T--G-A-AAATAT---GG--CA-AA-CA-A-G-CCT---A-A--ACACCA--GTATC--T--C--AA--CTG----TTA--TTCTT--T-A-GG--A--A---GT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G----TT-T------------AAAA--AAACCC--------GGA---AAA--A-A-AA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-CG-TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA---T-CGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GCC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G------TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACATAT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TG-T-ATTTT
gi|33410 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-GTT-TT-----GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--
gi|33411 : AGG-TG-GA-AT-GAA--CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-
gi|33411 : T--GACATTATG----T-TTT-TT-----GTCC-ATACAAAGA-GT-TC--A-G--TCTCAT-A-AT--A-T-GA--T--G-A-AAG-ACTTAGGACC--AACC--A-GACCTA--A-A--ACA-CAAGATACC-TTCCC--AA---TG-T--TTA--TT-TA--T-A-Ggagtgtagtaagtgacattatgttttttgtccatacaaagagttcagtctcataatatgatgaaagacttaggaccaaccagacctaaaacacaagataccttcccaatgtttatttatag
gi|33412 : aggtggaatgaacgtttgacaattttttgcctgagtgtagtaag-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T---GACA----A----C-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-CA-TTGA--T--G-ACAAG-ATT--GG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-CA--ATATC-TG--C--AA--CTG-T--TTA---T-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-A-TT-G--TTTT-T------------GAAA--AA---C---------GA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-TGCT------T-------A-AC-C------TCA-T-T-A--A---T-AC---A---AC------CA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A---T-T--A--GGC--AAA-A-T-G-TTA---AGCTA-GA--A--TG-AGA-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AA-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----A-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33413 : AA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AG-TA-T-TA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-TA--ATATC-TT--C--AATGCTG----TTA--TT-TT--T-T-GG--A--T--TTT-----------------T--C----TTT-A--G-GATT-G--TTGT-T------------GAAA--AA---CGTGTAGGAGGA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A----C-C--TTCTA---T-AC-A---T-AA--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AAG-GGC--AAA-A-T-G-TATCG-CG-TA-G---A--TG-A-A-G-C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---G-T--TT-T-ATTTT
gi|33414 : A-CA-T-------------TT----CA----A----T-TTT-TT-----GCCT-ATTG---GA-AT-TTCAA-A--TC--AT-A-AT--A-TCGA--TATG-T-AAG-ATA--GG--C--AA-CTCA-G-TCT---ATA--ACA-AA--AT--C-TT--CTTAA--CTA-T--T-A--TC-TT----A-GG--A--T--TTT-----------------T--C----TTT-ATAG-ATTT-G--TTTT-TGAAAAAAGAAAAGAAA--AA---C--------GGA---AAAC-A-A-TA-CAA-TTTTT-G-G-CC------T-------T-AC-CTC--GTCAA-GAT-AC-AAT-C-ACAGAA---AC------TA-T-T-TGT-ATTTTTG-A-AA--ACTGT-T-AA---GC--AAA-A-T-GTTAT---A
gi|33415 : -C--A-G-CCT---A-A--ATA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TC-TT--T-A-GT--A--A--TTT-----------------TTTT----TTT-A--G-ATTT-G---TTT-T------------AAAA--AA---CA-------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC
gi|33416 : AAA--AA---C--------GGA---AAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------A-------A-AC-C-C--TTCTC-T-C-GC-A---T-AC--AA---CC------TA-T-T-CGT-A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAT-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TA---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-
gi|33417 : --A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---ATTACATGTA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GAC--AAA-A-T-G-T
gi|33418 : -T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCG-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-
gi|33419 : -T-T-AT-A---T-AC--AA---AG------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------A-T-GTA-----CTA-TA---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33420 : T-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-GTA-----C-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 1 1 1 2 2 5555555555555 22 2222 3333 1 1 44444 1 55555 2 2 11 1 22 11 1 1 2 2 2 11 22 1 1 1 555 11 22 2 44 1 2 555 3 11 2 22 1 11 11 22 2 22 11 2 11 1 1 111111111 88888888888888888 22 2222 1 22 2 1 11 2 000000000000 11 333 66666666 222 22 2 1 1 1 1 1 2 1 333333 4444444 1 1 2 33 1 2 1 1 444 2 22 444 555555 2 1 1 2 444 2 1 11 22 1 1 22 11 2 1 2 3 444 2 1 555 11 555 2 2222 3 444 1 3 1 1 1 1 222 1 4444444 1 1 55555 1 222 1 22 1 3
lowQualScore : . . . . . . ............. .. .... .... . . ..... . ..... . . .. . .. .. . . . . . .. .. . . . ... .. .. . .. . . ... . .. . .. . .. .. .. . .. .. . .. . . ......... ................. .. .... . .. . . .. . ............ .. ... ........ ... .. . . . . . . . . ...... ....... . . . .. . . . . ... . .. ... ...... . . . . ... . . .. .. . . .. .. . . . . ... . . ... .. ... . .... . ... . . . . . . ... . ....... . . ..... . ... . .. . .
lowQualScore : 3 1 1 1 1 1 8888888888888 44 2222 2222 0 0 66666 0 11111 2 2 55 1 66 55 1 1 2 2 2 55 66 1 1 1 444 66 77 2 22 1 2 333 3 55 2 77 1 66 66 77 3 77 66 3 66 1 1 666666666 22222222222222222 88 5555 2 88 4 2 66 4 444444444444 66 666 44444444 000 66 2 1 1 1 1 1 2 1 111111 6666666 1 1 2 66 1 2 1 1 666 2 77 444 777777 4 2 2 4 999 4 2 66 88 1 1 77 66 3 1 3 4 999 5 2 222 77 444 5 7777 8 888 3 9 3 3 3 3 333 3 3333333 3 4 00000 4 555 4 00 4 1
consensus : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Reference ( family-411 ) : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33377 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-AT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--ATTT-T------------AAAAAAAA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-A-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTT-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33378 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA---------T-TTT-TT-----CCCT-AT-----GA-AT-AC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-GT---GA-----AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TT--A--A-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-C-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------GA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAG----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-
gi|33379 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AC---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--AGA--TT-TT--T-A-GA--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------GAAA--AA---C--------GCA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--C--GT-T-AA--GGT--AAA-A-T-G-TAT---AG-TC-GGT-A--TG-G-A-G------AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TTA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33380 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AT--GACA----A----T-TTTTTT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-AG-----A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---TCT-----TA-T-T-TGT-A---TGG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-
gi|33381 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-GA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-CA--A-ACC-TT--C------CTG-T--TTA---T-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--C----TTT-A--G-ATTG-T--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-T-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCC-T-T-AC-A---T-A---AC---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TATA--AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------GTT-GTA-----CTT-TT---A-T--TT-T-CTTT
gi|33382 : TTAAGG-TA-GA-ATTGAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT---AT-TATT-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-GACCTA--A-A--ACA-CA--AT-CC-TT--C--AA---TG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A------TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-T-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-T--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---TC------TA-T-T-TGT-A---TTGAA-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-CT---GA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33383 : TTAAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AG--GA-A----T----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--TTACC-TG--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--AT-A--TTT-----------------T--T----TTT-A--T-A-TT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAAAGA-A-TA-C-A-TTTTT-GAT-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-A--A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGTAA---TTG----A--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-GTTAT---AG-TA-G---C--TGAA-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-TT-T-CT-AGTTT-CCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33384 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-TTTATTGGAAACAGTT--GACA----A------TTT-TT-----GCTA-GT-----TG-AT-TC--A-G--TC--AT-ATAT-TA-T-GA--TC-G-A-AAG-AT---GC--A--AA-C--AGG-CCT---A-A--ACA-C---ATACCTTT--C--AA--CTG-TA-TTA--TT-TT--T-A-GG--A------TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-A------------AAAA--AA---CG-------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC-------AC------TC-T-T-TG------TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC---AA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--T----A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-A-ATTTT
gi|33385 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----C-TTT-TT-----GCCTAAT-----GA-A--TC--A-G--TC--AT-A-AT----T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA----A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATCCT-TC--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--T-A-GGAAA--A--TTT-----------------T--T----TTTAA--G-ATTT-GTTTTTT-T------------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TACC-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-C--TTCCA-T-T-TA-A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGT-ATT-TTG-A-AATTG--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---GGATA-G---A--TGCATA-GAC----AA-TG---AA-AAC---A-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CT--TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33386 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAATCG-T-------------TT--GAC-----A----T-ATT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A---TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TATT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---CAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T----C-A---T-AC--AAC--ATA-----TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-TAAA--GGC--ATA-T-T-G-TCT---A
gi|33387 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--GAA-AAG-AT---GG--G--CA-C--A-G-CCTA--A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--T-G-AG--ATTT--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTG-T--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-ATTTTTT-G-T-CC------T-------A-AA-C-CGTTTCCA-T-TCACAA---T-AC--AC---TC------TA-T-T-TGT-A---TTT-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-ATT-G-TAT---AG-TA-G---ATTTG-A-A-GAC----ACTTGT--AA-AAC-AAA-TT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GT------CT--TT---A-TTATT-T-ATTTT
gi|33388 : TTAAGG-TG-GA-A--GAAA-CG-T-------------TT-----------------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT--C--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-A-G-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CAG-ATACC-TT--C--AAA-CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------T--T----TTA-A--G-ATTT-G---TTT-T------------AAAA--AA------------GGA---AAA--ACATTA-C-A-TTTTTAG-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC--T-T-A--A---T-AC--AC---AC------TA---T-TGT-A----TG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TGAA-A-GAC----AA-TGA--AA-AAC-AAA-AT-T-CA-G---T-TCA-------G-TGGTA-----TTA-TT---A----TT-T-ATTTT
gi|33389 : TTAAGG-TGTGA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GACA----A------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-TA-AC--A-G--TC--AG-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTG-A--G-A-TT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---ATA--G-A-CA------TTTT-G-T-CC------T-------AGAC-T-C--TTCCATT-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-A---------T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC-----A-TG---AAGAAC-AAA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-CTATATATCTA-TT---C-T--TT-
gi|33390 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTTGGACA----AA---T-TTT-TT-----GGCT-AT-----GA-TT-TC--ATG--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAT-AT---GT--CCAAA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--C-G----TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A---TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------TAAG--AA---C--------TG----AAA--A-T-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------TA------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-AAATT-AC--AG---AC------TA---T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGCCAAAA-A-T----------G-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-T---A-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TTAT-ATTTT
gi|33391 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T----GCA----A----TATTT-TT-----GCCT-AT-----AA----TC--A-G--T---AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AAAC--A-G-CCT---ACA--ACA------TACC-T---C--AA--CTG-T--TTT--TT-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------G--T----TTT-A--G-ATTT-T--TTTTTT------------AAAA--AA---C--------GAA---AAA--A-A-TA-C-A-GTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-----TCC----T-AC-AT--T-AC--AATCCTC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A---G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-A--T-CT-A-----TCA-------G-T-GT------CAA-TT---A-T--TT-TAATTTT
gi|33392 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTT----GCCT-A------GA-AT-TT--A-GC-TC--AT-A-A---A-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A---CA-CA--ATACG-TT--C--G---CTG-T--TTA--TT-TT------GG--A--G--ATT-----------------T--T----TTG-A--T-AATT-G--TTTT-T------------AAAA--A----C--------GGA---AAA--A-A--A-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-T-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---AA------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-AGT----AT-TG----A-AAC--AA-GT-T-CTAA---T-T---------G-T-GC------CTA-TC---A----TT-T-ATT
gi|33393 : TTAAGG-TT-GA-AT-GAAA-CC-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-TTT----GA-AT--C--A-GCGTC--ATCA-AC-TA-A-GA--T----A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-T--ACA-CA---TATC-T---C--AA--CTG-T--TTA--TG-GT--T-A-GG--G--AGATTT-----------------TA-T----TTT-A--G-ATT--G--TTTTATGAA---------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-G-CA-T-A-TTTT--G-T-CC------T-------A-AA-CAC--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-T---A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GA-----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTG-TT-----T--TT-T--TTTT
gi|33394 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCC-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-T--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AG--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-A------------AAAA--AAAC-C--------GGA---AAA--A-A-TA-A-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTC
gi|33395 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCAT-AC-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-AA--T--A-T-AAG-AT---GG--C--AG-C--A-G-TTT---A-A--ATC-CA--ATATC-AC--C--AG--TTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------C--T----TTT----G-ATTT----TTTT-C------------CAAA--AA---C---------GA---TAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-A-TT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-T---T-TC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---CTG-C-AA--A--GT-T-AG--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TATGTATA--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-AT-A---T-TCAGATTCAGG-T-GTA-----CTA-TT---GTT--TT-T-ATTT
gi|33396 : TTACGG-TG-GA-AT-GAAA------------------------------A----T-TTT--------GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG-----AA-C--C-G-CCT---A-A--ACA-CA---TACC-T------AA--CGG-T--TTA--TT-TT--TAA-GA--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-A-TT-G--TTTT-A------------AAAA--AA-------------GG---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-GTT-CT------T-------A-AC-C-CT-TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAAGA-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AACTG---AA-AAC-CAG-AT-T-C--A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTATTT---A-T--TC-T-ATTTT
gi|33397 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GAC-----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-A------A-G--TC--AT-A-AT-TATT-GAACT--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CC------A--ACACCA--ATATC-TT--C--AA--CTG-TTGTTA--TT-TT--T-ATGG--A--A----T-----------------T--T----TTT-A--GAATTTGG--TTTG-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAC--ATA-TA-C-T-ATTTT-G-T-CC------T-------A-ACTT-C--TTCCA---T-AC-A---T-ACA-AA---AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AAA-A-T-GATAT---AG-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-TT-T---T-TCA-------G-T-CTA-----CTA--T---A-T--CT-TAATTTT
gi|33398 : TCAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTT-GACA----A----T-TTT-T------GCTT-AT-----TA-ATGTC--A-G--TG--A--A-ATATA-T-GA-----G-A-AGA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTTTAAA-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TTGTC--T-A-GGC-A--A----------------------T--G----TTT-A--G-ATTT-G--TTT----------------AAA--CA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CCAACATGT-------A-AC-A-C--CTCCA---C-AC-A---TCAC--AA---AC------TA-T-T-TTG-A---TTG-A-AA--AC-ATGT-AA--GCC--AAACA-T-G-TAT---AG-T--T---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-ATCT-CT-A---T-TCA-------G-T-GTAC----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33399 : TTAAGG-TT-GG-AT-GAAA-CG-T-------------TT--G-CA----T----T-TGT-TT-----GCCT-AT-----GAGAG-TC----G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AG---TG--C--AA-C--A-G-CCT---ATT--TCA-CA--ATACG-TT--C--AA--CTG----TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--T----TTA-A--G-ATTT-G--TT-----------------AAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G---CC------T-------A-AC-C-----TTCA-T-T-AC-----T-AC--ACT--TC------TATT-T-TGTAA---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AGA-A-T-G-TGTATCAG-TA-G---A--TG---A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33400 : TTAAGG-TG-GA-AT-AAGA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTTTTTTGCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-TA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--T-A-GG--A--A----T-----------------T--T----TTT-AC-G-ATTT-G--TTTT-T------------CAAA--AA---C---------GA---AAA--C-A-TA-C---TTTTT-G---------------------AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--A
gi|33401 : TTATGG-TG-GG-AT-GAAAACA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-AT-----GA-AT-TC--C-G--TC--AT-A-AT--G-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACG-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTG--TG-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--A-GTTT-G--TATT-T------------CAAA--AG---C--------GGA---AAA--G----A-C-C-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TCCCG-G-C-AC-A---T-
gi|33402 : TTAAAG-TG-GACAT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AT-----GACAT-TC--A----TC--AG-A-AT-TA---GA--T--A-A-TAG-ATG--GG--C--AA-CAAA-G-CCT---A-ACTACA-CA--ATACC-TT--C--CA--GTG-T--TTACGTT-TT--T-A-GG--A-------------------------T--TGAGATGT-A--GTATTT-G--TTCT-TA-----------AAAA--AA---C--------GAACATAAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-CA-C-C--TTCCA-TGT-AC-A---T-AC---C---GC------TA-T-TCTGT-AC--TTGTATAA--A--GT-G-AAGCGGC--TAA-A-----TAT---AG-AA-A---A--T----A-AAC----AACTGCGAAA-AAC-AAA-AT-C-C---------CA-------G-T-GTA-----CAA-TTCAAA-T--TT-
gi|33403 : TTAACG-TG-GA-AT-GAAA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCGT-AT-----
gi|33404 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----ATCCTT-CTT-TT-----GTTT-AT-----CA-AC-TG--A-A--T---AT-A-A---A-T-GG--C--G-A-A
gi|33405 : TAAGG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------T---GACA----A----T-TTT-TT-----GCTT-AT-----GA-ATCTC--A-G--T---A--A-ATATA-T-GA-----G-A-GAA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--T-A-GC--A--A----------------------T--G----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T--------------GA--AA---C--------CGG---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CC------TACATGTAA-AC-C-----TCCA-T-C-AC-A---TCAC--AA---AC------TATT-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--G--T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TT-G---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G---GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33406 : TAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GT-T-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-
gi|33407 : AAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TC--GATA----A----T-TTT-TTT----GCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TT--AT-A-AG-TG-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-CA--ATGTC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA------------A--A-ATTT----TTTT-T------------GAAA--AG---C--------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-----GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-A---A--TG-A-A-GACAAAAAA-TG---AA-ACA-AAA-AA-T-CT-A---T-TTA-------A-T-G--------TA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33408 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GGCA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA--T-TT--G-T--TG--AT-A-AA-TT-T-GA--T--G-A-AAG-AT---G---C--AA-C--A-G-CTT---A-A--CCA-CA--ATATC-TT--C--AT--CTG-T--TTA--TT-TTCTT-A-GG--A-----TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-TG-----------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TT-T-A-TTTGT---T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-TGT-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-TG---AA-AAC-AAA-AT-TCCT-A---TATCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T--TTTT
gi|33409 : AAG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AG-----GA-AT-TC--A-G---C--AT-A-A--TA-T-TA--T--G-A-AAATAT---GG--CA-AA-CA-A-G-CCT---A-A--ACACCA--GTATC--T--C--AA--CTG----TTA--TTCTT--T-A-GG--A--A---GT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G----TT-T------------AAAA--AAACCC--------GGA---AAA--A-A-AA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-CG-TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA---T-CGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GCC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G------TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACATAT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TG-T-ATTTT
gi|33410 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-GTT-TT-----GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--
gi|33411 : AGG-TG-GA-AT-GAA--CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-
gi|33411 : T--GACATTATG----T-TTT-TT-----GTCC-ATACAAAGA-GT-TC--A-G--TCTCAT-A-AT--A-T-GA--T--G-A-AAG-ACTTAGGACC--AACC--A-GACCTA--A-A--ACA-CAAGATACC-TTCCC--AA---TG-T--TTA--TT-TA--T-A-Ggagtgtagtaagtgacattatgttttttgtccatacaaagagttcagtctcataatatgatgaaagacttaggaccaaccagacctaaaacacaagataccttcccaatgtttatttatag
gi|33412 : aggtggaatgaacgtttgacaattttttgcctgagtgtagtaag-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T---GACA----A----C-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-CA-TTGA--T--G-ACAAG-ATT--GG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-CA--ATATC-TG--C--AA--CTG-T--TTA---T-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-A-TT-G--TTTT-T------------GAAA--AA---C---------GA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-TGCT------T-------A-AC-C------TCA-T-T-A--A---T-AC---A---AC------CA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A---T-T--A--GGC--AAA-A-T-G-TTA---AGCTA-GA--A--TG-AGA-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AA-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----A-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33413 : AA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AG-TA-T-TA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-TA--ATATC-TT--C--AATGCTG----TTA--TT-TT--T-T-GG--A--T--TTT-----------------T--C----TTT-A--G-GATT-G--TTGT-T------------GAAA--AA---CGTGTAGGAGGA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A----C-C--TTCTA---T-AC-A---T-AA--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AAG-GGC--AAA-A-T-G-TATCG-CG-TA-G---A--TG-A-A-G-C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---G-T--TT-T-ATTTT
gi|33414 : A-CA-T-------------TT----CA----A----T-TTT-TT-----GCCT-ATTG---GA-AT-TTCAA-A--TC--AT-A-AT--A-TCGA--TATG-T-AAG-ATA--GG--C--AA-CTCA-G-TCT---ATA--ACA-AA--AT--C-TT--CTTAA--CTA-T--T-A--TC-TT----A-GG--A--T--TTT-----------------T--C----TTT-ATAG-ATTT-G--TTTT-TGAAAAAAGAAAAGAAA--AA---C--------GGA---AAAC-A-A-TA-CAA-TTTTT-G-G-CC------T-------T-AC-CTC--GTCAA-GAT-AC-AAT-C-ACAGAA---AC------TA-T-T-TGT-ATTTTTG-A-AA--ACTGT-T-AA---GC--AAA-A-T-GTTAT---A
gi|33415 : -C--A-G-CCT---A-A--ATA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TC-TT--T-A-GT--A--A--TTT-----------------TTTT----TTT-A--G-ATTT-G---TTT-T------------AAAA--AA---CA-------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC
gi|33416 : AAA--AA---C--------GGA---AAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------A-------A-AC-C-C--TTCTC-T-C-GC-A---T-AC--AA---CC------TA-T-T-CGT-A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAT-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TA---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-
gi|33417 : --A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---ATTACATGTA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GAC--AAA-A-T-G-T
gi|33418 : -T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCG-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-
gi|33419 : -T-T-AT-A---T-AC--AA---AG------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------A-T-GTA-----CTA-TA---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33420 : T-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-GTA-----C-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
blockSeqs : G T C T T T TTATTGGAAACAG TG TTAT TCCT A T TTTTT A ACAAA G G CA T CG TC C T A T T AC AT A C T TTA AC CA A AA G A TAA C CT C AG T CC TT TG T TG CG G CT A T AAAAT AAAAAAAAAAAAAAAAA TT GAGA A TA A G TT T GAAAAAAGAAAA . ACC GTGTAGGA CAT AG C T C A T A A G AACATG ACATGTA G T A GT T G C A AAT C AG TCC TACATG T G C A TTT A T TT CT G A GC CA G T G T ATC A T TAT TT CAT G AAAA T CGA G A T C C A GTT A GATTCAG T G TATAT T CAA T TA A A
blockSeqs : G . . . A T . T . A . . T . TG C C . . C . . . A T C . C . . . G . A C TC . A A T . C G . . . A T A . C . . . ATTTT . A . . C T . . A GAA . AC G . C T . . . . . T . . A . . T T . A . . AT C A C T T . . A TT T . . C . . G . C . G A CG C . GT . AA G . C T . A . . . . . . . . . C . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . A T . . . . . . . . . . . . . . GAGAT . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . T A . . . . C . . . . . . . . . . . T A . . A . AA . . C A . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . ATAT . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
finalCons : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111
lowQualScore : 2 1 1 1 2 2 5555555555555 22 2222 3333 1 1 44444 1 55555 2 2 11 1 22 11 1 1 2 2 2 11 22 1 1 1 555 11 22 2 44 1 2 555 3 11 2 22 1 11 11 22 2 22 11 2 11 1 1 111111111 88888888888888888 22 2222 1 22 2 1 11 2 000000000000 11 333 66666666 222 22 2 1 1 1 1 1 2 1 333333 4444444 1 1 2 33 1 2 1 1 444 2 22 444 555555 2 1 1 2 444 2 1 11 22 1 1 22 11 2 1 2 3 444 2 1 555 11 555 2 2222 3 444 1 3 1 1 1 1 222 1 4444444 1 1 55555 1 222 1 22 1 3
lowQualScore : . . . . . . ............. .. .... .... . . ..... . ..... . . .. . .. .. . . . . . .. .. . . . ... .. .. . .. . . ... . .. . .. . .. .. .. . .. .. . .. . . ......... ................. .. .... . .. . . .. . ............ .. ... ........ ... .. . . . . . . . . ...... ....... . . . .. . . . . ... . .. ... ...... . . . . ... . . .. .. . . .. .. . . . . ... . . ... .. ... . .... . ... . . . . . . ... . ....... . . ..... . ... . .. . .
lowQualScore : 3 1 1 1 1 1 8888888888888 44 2222 2222 0 0 66666 0 11111 2 2 55 1 66 55 1 1 2 2 2 55 66 1 1 1 444 66 77 2 22 1 2 333 3 55 2 77 1 66 66 77 3 77 66 3 66 1 1 666666666 22222222222222222 88 5555 2 88 4 2 66 4 444444444444 66 666 44444444 000 66 2 1 1 1 1 1 2 1 111111 6666666 1 1 2 66 1 2 1 1 666 2 77 444 777777 4 2 2 4 999 4 2 66 88 1 1 77 66 3 1 3 4 999 5 2 222 77 444 5 7777 8 888 3 9 3 3 3 3 333 3 3333333 3 4 00000 4 555 4 00 4 1
consensus : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
Reference ( family-411 ) : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33377 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-AT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--ATTT-T------------AAAAAAAA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-A-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTT-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33378 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA---------T-TTT-TT-----CCCT-AT-----GA-AT-AC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-GT---GA-----AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TT--A--A-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-C-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------GA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAG----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-
gi|33379 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AC---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--AGA--TT-TT--T-A-GA--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------GAAA--AA---C--------GCA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--C--GT-T-AA--GGT--AAA-A-T-G-TAT---AG-TC-GGT-A--TG-G-A-G------AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TTA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--CT-T-ATTTT
gi|33380 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AT--GACA----A----T-TTTTTT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-AG-----A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---TCT-----TA-T-T-TGT-A---TGG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-
gi|33381 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-GA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-CA--A-ACC-TT--C------CTG-T--TTA---T-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--C----TTT-A--G-ATTG-T--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-T-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCC-T-T-AC-A---T-A---AC---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TATA--AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------GTT-GTA-----CTT-TT---A-T--TT-T-CTTT
gi|33382 : TTAAGG-TA-GA-ATTGAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT---AT-TATT-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-GACCTA--A-A--ACA-CA--AT-CC-TT--C--AA---TG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A------TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-T-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-T--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---TC------TA-T-T-TGT-A---TTGAA-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-CT---GA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33383 : TTAAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------AG--GA-A----T----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--TTACC-TG--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--AT-A--TTT-----------------T--T----TTT-A--T-A-TT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAAAGA-A-TA-C-A-TTTTT-GAT-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-A--A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGTAA---TTG----A--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-GTTAT---AG-TA-G---C--TGAA-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-TT-T-CT-AGTTT-CCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33384 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-TTTATTGGAAACAGTT--GACA----A------TTT-TT-----GCTA-GT-----TG-AT-TC--A-G--TC--AT-ATAT-TA-T-GA--TC-G-A-AAG-AT---GC--A--AA-C--AGG-CCT---A-A--ACA-C---ATACCTTT--C--AA--CTG-TA-TTA--TT-TT--T-A-GG--A------TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-A------------AAAA--AA---CG-------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC-------AC------TC-T-T-TG------TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC---AA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--T----A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-A-ATTTT
gi|33385 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----C-TTT-TT-----GCCTAAT-----GA-A--TC--A-G--TC--AT-A-AT----T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA----A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATCCT-TC--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--T-A-GGAAA--A--TTT-----------------T--T----TTTAA--G-ATTT-GTTTTTT-T------------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TACC-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-A--C-C--TTCCA-T-T-TA-A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGT-ATT-TTG-A-AATTG--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---GGATA-G---A--TGCATA-GAC----AA-TG---AA-AAC---A-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CT--TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33386 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAATCG-T-------------TT--GAC-----A----T-ATT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A---TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TATT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---CAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T----C-A---T-AC--AAC--ATA-----TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-TAAA--GGC--ATA-T-T-G-TCT---A
gi|33387 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--GAA-AAG-AT---GG--G--CA-C--A-G-CCTA--A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTGTT--TTA--TT-TT--T-G-AG--ATTT--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTG-T--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-ATTTTTT-G-T-CC------T-------A-AA-C-CGTTTCCA-T-TCACAA---T-AC--AC---TC------TA-T-T-TGT-A---TTT-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-ATT-G-TAT---AG-TA-G---ATTTG-A-A-GAC----ACTTGT--AA-AAC-AAA-TT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GT------CT--TT---A-TTATT-T-ATTTT
gi|33388 : TTAAGG-TG-GA-A--GAAA-CG-T-------------TT-----------------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT--C--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-A-G-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CAG-ATACC-TT--C--AAA-CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------T--T----TTA-A--G-ATTT-G---TTT-T------------AAAA--AA------------GGA---AAA--ACATTA-C-A-TTTTTAG-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC--T-T-A--A---T-AC--AC---AC------TA---T-TGT-A----TG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TGAA-A-GAC----AA-TGA--AA-AAC-AAA-AT-T-CA-G---T-TCA-------G-TGGTA-----TTA-TT---A----TT-T-ATTTT
gi|33389 : TTAAGG-TGTGA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GACA----A------TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-TA-AC--A-G--TC--AG-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTG-A--G-A-TT-G--TTTT-T------------AAAA--AA---C--------GGA---ATA--G-A-CA------TTTT-G-T-CC------T-------AGAC-T-C--TTCCATT-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-A---------T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC-----A-TG---AAGAAC-AAA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-CTATATATCTA-TT---C-T--TT-
gi|33390 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTTGGACA----AA---T-TTT-TT-----GGCT-AT-----GA-TT-TC--ATG--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAT-AT---GT--CCAAA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AA--C-G----TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A---TT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T------------TAAG--AA---C--------TG----AAA--A-T-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------TA------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-AAATT-AC--AG---AC------TA---T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGCCAAAA-A-T----------G-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-T---A-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TTAT-ATTTT
gi|33391 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T----GCA----A----TATTT-TT-----GCCT-AT-----AA----TC--A-G--T---AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AAAC--A-G-CCT---ACA--ACA------TACC-T---C--AA--CTG-T--TTT--TT-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------G--T----TTT-A--G-ATTT-T--TTTTTT------------AAAA--AA---C--------GAA---AAA--A-A-TA-C-A-GTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-----TCC----T-AC-AT--T-AC--AATCCTC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A---G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-A--T-CT-A-----TCA-------G-T-GT------CAA-TT---A-T--TT-TAATTTT
gi|33392 : TTAAGGGTG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTT----GCCT-A------GA-AT-TT--A-GC-TC--AT-A-A---A-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A---CA-CA--ATACG-TT--C--G---CTG-T--TTA--TT-TT------GG--A--G--ATT-----------------T--T----TTG-A--T-AATT-G--TTTT-T------------AAAA--A----C--------GGA---AAA--A-A--A-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-T-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AC---AA------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-AGT----AT-TG----A-AAC--AA-GT-T-CTAA---T-T---------G-T-GC------CTA-TC---A----TT-T-ATT
gi|33393 : TTAAGG-TT-GA-AT-GAAA-CC-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-TTT----GA-AT--C--A-GCGTC--ATCA-AC-TA-A-GA--T----A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-T--ACA-CA---TATC-T---C--AA--CTG-T--TTA--TG-GT--T-A-GG--G--AGATTT-----------------TA-T----TTT-A--G-ATT--G--TTTTATGAA---------AAAA--AA---C--------GGA---AAA--A-G-CA-T-A-TTTT--G-T-CC------T-------A-AA-CAC--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-T---A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GA-----AA-TG---AA-AACAAAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTG-TT-----T--TT-T--TTTT
gi|33394 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCC-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-T--A-G-CCT---A-A--ACA-CA--ATACC-TT--C--AG--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-A------------AAAA--AAAC-C--------GGA---AAA--A-A-TA-A-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTC
gi|33395 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----A-TTT-TT-----GCAT-AC-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-AA--T--A-T-AAG-AT---GG--C--AG-C--A-G-TTT---A-A--ATC-CA--ATATC-AC--C--AG--TTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------C--T----TTT----G-ATTT----TTTT-C------------CAAA--AA---C---------GA---TAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-A-TT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-T---T-TC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---CTG-C-AA--A--GT-T-AG--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TATGTATA--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-AT-A---T-TCAGATTCAGG-T-GTA-----CTA-TT---GTT--TT-T-ATTT
gi|33396 : TTACGG-TG-GA-AT-GAAA------------------------------A----T-TTT--------GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG-----AA-C--C-G-CCT---A-A--ACA-CA---TACC-T------AA--CGG-T--TTA--TT-TT--TAA-GA--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-A-TT-G--TTTT-A------------AAAA--AA-------------GG---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-GTT-CT------T-------A-AC-C-CT-TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AC---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG---AA--A--GT-T-AA--GGC--AAAGA-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AACTG---AA-AAC-CAG-AT-T-C--A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTATTT---A-T--TC-T-ATTTT
gi|33397 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CGTT-------------TT--GAC-----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-A------A-G--TC--AT-A-AT-TATT-GAACT--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CC------A--ACACCA--ATATC-TT--C--AA--CTG-TTGTTA--TT-TT--T-ATGG--A--A----T-----------------T--T----TTT-A--GAATTTGG--TTTG-T------------AAAA--AA---C--------GGA---AAC--ATA-TA-C-T-ATTTT-G-T-CC------T-------A-ACTT-C--TTCCA---T-AC-A---T-ACA-AA---AC------TT-T-T-TGT-T---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AAA-A-T-GATAT---AG-TA-G---A--TG-A-AGGAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-TT-T---T-TCA-------G-T-CTA-----CTA--T---A-T--CT-TAATTTT
gi|33398 : TCAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TTT-GACA----A----T-TTT-T------GCTT-AT-----TA-ATGTC--A-G--TG--A--A-ATATA-T-GA-----G-A-AGA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTTTAAA-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TTGTC--T-A-GGC-A--A----------------------T--G----TTT-A--G-ATTT-G--TTT----------------AAA--CA---C--------GGA---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CCAACATGT-------A-AC-A-C--CTCCA---C-AC-A---TCAC--AA---AC------TA-T-T-TTG-A---TTG-A-AA--AC-ATGT-AA--GCC--AAACA-T-G-TAT---AG-T--T---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-ATCT-CT-A---T-TCA-------G-T-GTAC----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33399 : TTAAGG-TT-GG-AT-GAAA-CG-T-------------TT--G-CA----T----T-TGT-TT-----GCCT-AT-----GAGAG-TC----G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AG---TG--C--AA-C--A-G-CCT---ATT--TCA-CA--ATACG-TT--C--AA--CTG----TTA--TT-TT--T-A-GG-----A--TTT-----------------T--T----TTA-A--G-ATTT-G--TT-----------------AAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G---CC------T-------A-AC-C-----TTCA-T-T-AC-----T-AC--ACT--TC------TATT-T-TGTAA---TTG-A-AA--A--GT----A--GGC--AGA-A-T-G-TGTATCAG-TA-G---A--TG---A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33400 : TTAAGG-TG-GA-AT-AAGA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TTTTTTTGCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-CCT---A-A--ACA-TA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--T-A-GG--A--A----T-----------------T--T----TTT-AC-G-ATTT-G--TTTT-T------------CAAA--AA---C---------GA---AAA--C-A-TA-C---TTTTT-G---------------------AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--A
gi|33401 : TTATGG-TG-GG-AT-GAAAACA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-T------GCCT-AT-----GA-AT-TC--C-G--TC--AT-A-AT--G-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACG-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTG--TG-TT--T-A-GG--A--A--TTT-----------------T--T----TTT-A--A-GTTT-G--TATT-T------------CAAA--AG---C--------GGA---AAA--G----A-C-C-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TCCCG-G-C-AC-A---T-
gi|33402 : TTAAAG-TG-GACAT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AT-----GACAT-TC--A----TC--AG-A-AT-TA---GA--T--A-A-TAG-ATG--GG--C--AA-CAAA-G-CCT---A-ACTACA-CA--ATACC-TT--C--CA--GTG-T--TTACGTT-TT--T-A-GG--A-------------------------T--TGAGATGT-A--GTATTT-G--TTCT-TA-----------AAAA--AA---C--------GAACATAAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-CA-C-C--TTCCA-TGT-AC-A---T-AC---C---GC------TA-T-TCTGT-AC--TTGTATAA--A--GT-G-AAGCGGC--TAA-A-----TAT---AG-AA-A---A--T----A-AAC----AACTGCGAAA-AAC-AAA-AT-C-C---------CA-------G-T-GTA-----CAA-TTCAAA-T--TT-
gi|33403 : TTAACG-TG-GA-AT-GAAA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCGT-AT-----
gi|33404 : TTAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----ATCCTT-CTT-TT-----GTTT-AT-----CA-AC-TG--A-A--T---AT-A-A---A-T-GG--C--G-A-A
gi|33405 : TAAGG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------T---GACA----A----T-TTT-TT-----GCTT-AT-----GA-ATCTC--A-G--T---A--A-ATATA-T-GA-----G-A-GAA-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-CA--ATATC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TC--T-A-GC--A--A----------------------T--G----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-T--------------GA--AA---C--------CGG---AAA--A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CC------TACATGTAA-AC-C-----TCCA-T-C-AC-A---TCAC--AA---AC------TATT-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--G--T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TT-G---A--TG-------C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G---GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T-AATTT
gi|33406 : TAAGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GT-T-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AA-TA-T-GA--T--G-A-AAG-AT---TG--C--AA-C--A-G-CTT---A-A--ACA-
gi|33407 : AAAG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TC--GATA----A----T-TTT-TTT----GCAT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TT--AT-A-AG-TG-T-GA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-CA--ATGTC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TT-TT--T-A-GG--A--A--TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA------------A--A-ATTT----TTTT-T------------GAAA--AG---C--------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AT-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-----GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-A---A--TG-A-A-GACAAAAAA-TG---AA-ACA-AAA-AA-T-CT-A---T-TTA-------A-T-G--------TA-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33408 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GGCA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA--T-TT--G-T--TG--AT-A-AA-TT-T-GA--T--G-A-AAG-AT---G---C--AA-C--A-G-CTT---A-A--CCA-CA--ATATC-TT--C--AT--CTG-T--TTA--TT-TTCTT-A-GG--A-----TTT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G--TTTT-TG-----------AAAA--AA---C--------GG----AAA--A-A-TT-T-A-TTTGT---T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-TGT-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----CA-TG---AA-AAC-AAA-AT-TCCT-A---TATCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TT-T--TTTT
gi|33409 : AAG-TG-GA-AT--AAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----G-CT-AG-----GA-AT-TC--A-G---C--AT-A-A--TA-T-TA--T--G-A-AAATAT---GG--CA-AA-CA-A-G-CCT---A-A--ACACCA--GTATC--T--C--AA--CTG----TTA--TTCTT--T-A-GG--A--A---GT-----------------T--T----TTT-A--G-ATTT-G----TT-T------------AAAA--AAACCC--------GGA---AAA--A-A-AA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-CG-TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA---T-CGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GCC--AAA-A-TGG-TAT---AG-TA-G------TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACATAT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---A-T--TG-T-ATTTT
gi|33410 : AGG-TG-GA-AT-GAAA-CG-T-------------TT--GACA----A----T-GTT-TT-----GCGT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-TA-T-GA--T--
gi|33411 : AGG-TG-GA-AT-GAA--CG-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-
gi|33411 : T--GACATTATG----T-TTT-TT-----GTCC-ATACAAAGA-GT-TC--A-G--TCTCAT-A-AT--A-T-GA--T--G-A-AAG-ACTTAGGACC--AACC--A-GACCTA--A-A--ACA-CAAGATACC-TTCCC--AA---TG-T--TTA--TT-TA--T-A-Ggagtgtagtaagtgacattatgttttttgtccatacaaagagttcagtctcataatatgatgaaagacttaggaccaaccagacctaaaacacaagataccttcccaatgtttatttatag
gi|33412 : aggtggaatgaacgtttgacaattttttgcctgagtgtagtaag-GA-AT-GAAA-CG-T-------------T---GACA----A----C-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-G--TC--AT-A-AT-CA-TTGA--T--G-ACAAG-ATT--GG--C--AA-C--A-G-CCC---A-A--ACA-CA--ATATC-TG--C--AA--CTG-T--TTA---T-TT--T-A-GG--A--T--TTT-----------------T--T----TTT-A--G-A-TT-G--TTTT-T------------GAAA--AA---C---------GA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-TGCT------T-------A-AC-C------TCA-T-T-A--A---T-AC---A---AC------CA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A---T-T--A--GGC--AAA-A-T-G-TTA---AGCTA-GA--A--TG-AGA-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AA-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----A-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33413 : AA-CA-T-------------TT--GACA----A----T-TTT-TT-----GCCT-AT-----GA-AT-TC--A-A--TC--AT-A-AG-TA-T-TA--T--G-A-AAG-AT---GG--C--AA-C--A-G-TCT---A-A--ACA-TA--ATATC-TT--C--AATGCTG----TTA--TT-TT--T-T-GG--A--T--TTT-----------------T--C----TTT-A--G-GATT-G--TTGT-T------------GAAA--AA---CGTGTAGGAGGA---AAA--A-A-TA-C-A--TTTT-G-T-CC------T-------A----C-C--TTCTA---T-AC-A---T-AA--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AAG-GGC--AAA-A-T-G-TATCG-CG-TA-G---A--TG-A-A-G-C----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-GTA-----CTA-TT---G-T--TT-T-ATTTT
gi|33414 : A-CA-T-------------TT----CA----A----T-TTT-TT-----GCCT-ATTG---GA-AT-TTCAA-A--TC--AT-A-AT--A-TCGA--TATG-T-AAG-ATA--GG--C--AA-CTCA-G-TCT---ATA--ACA-AA--AT--C-TT--CTTAA--CTA-T--T-A--TC-TT----A-GG--A--T--TTT-----------------T--C----TTT-ATAG-ATTT-G--TTTT-TGAAAAAAGAAAAGAAA--AA---C--------GGA---AAAC-A-A-TA-CAA-TTTTT-G-G-CC------T-------T-AC-CTC--GTCAA-GAT-AC-AAT-C-ACAGAA---AC------TA-T-T-TGT-ATTTTTG-A-AA--ACTGT-T-AA---GC--AAA-A-T-GTTAT---A
gi|33415 : -C--A-G-CCT---A-A--ATA-CA--ATACC-TT--C--AA--CTG-T--TTA--TC-TT--T-A-GT--A--A--TTT-----------------TTTT----TTT-A--G-ATTT-G---TTT-T------------AAAA--AA---CA-------AGA---AAA--A-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCC
gi|33416 : AAA--AA---C--------GGA---AAA--T-A-TA-C-A-TTTTT-G-T-CC------A-------A-AC-C-C--TTCTC-T-C-GC-A---T-AC--AA---CC------TA-T-T-CGT-A---TTG-G-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAT-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TA---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------G-T-
gi|33417 : --A-A-TA-C-A-TGTTT-G-T-CT------T-------A-AC-C-C--TTCCA-T-T-AC-A---T-AC--AA---ATTACATGTA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GAC--AAA-A-T-G-T
gi|33418 : -T-CC------T-------A-AC-C-C--TTCCG-T-T-AC-A---T-AC--AA---AC------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-T-G-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-
gi|33419 : -T-T-AT-A---T-AC--AA---AG------TA-T-T-TGT-A---TTG-A-AA--A--GT-T-AA--GGC--AAA-A-T-G-TAT---AG-TA-G---A--TA-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-AAA-AT-T-CT-A---T-TCA-------A-T-GTA-----CTA-TA---A-T--TT-T-ATTTT
gi|33420 : T-T-AA--GGC--AAA---T-G-TAT---AG-TA-G---A--TG-A-A-GAC----AA-TG---AA-AAC-ACA-AT-T-CT-----T-TCA-------G-T-GTA-----C-A-TT---A-T--TT-T-ATTTT