lowQualScore : 111111
lowQualScore : 222 2222 11 11 55 1 4 2 0 3 2 4 33 0 2 333333 3 4 0 555 88 55 4 6
lowQualScore : ... .... .. .. .. . . . . . . . .. . . ...... . . . ... .. .. . .
lowQualScore : 000 4444 55 33 11 8 6 7 6 1 3 1 88 9 1 222222 4 0 9 999 44 22 2 3
consensus : CAGCC---CCA----C--AGACG--GACGAATNTGGAAACCCNAT-CCTGGTNCCNAAGACGGACTCG-TATGG-CAAACC----N-ATGACGGACG-AGN-ATGGNAACAC-NATNATGGTNCC
Reference ( gi|22632 ) : CAGCC---CCA----C--AGACA--GACGAACATGGAAATCCCAT-CTTGGTGCCAAAGACGGACTCG-TATGG-CAAGCC----A-ATGACGGATG-AGA-ATGGCCACAC-TATAATGGTTCC
gi|22634 : CAGCC---CCA----C--AGACA--GACGAACATGGAAATCCTAT-CTTGGTACCTAAGACCGATTCA-TATGG-CAAGCC----G-ATGACGGATG-AGA-ATGGCCACAC-TATAATGGTTCC
gi|22633 : CAGCC---CCA----C--AGACA--GACGAACATGGAAACCCCAT-TCTGGTGCCAAAGACAGATTCT-TATGG-CAAGCC----G-ATGACGGATG-AGA-ATGGCCATAC-TATAATGGTTCC
gi|22635 : CAGCC---CCC----A--AAACA--GACGAACATGGAAACCCCAT-CTTGGTGCCAAAGACGGACTCG-TATGG-CAAACC----C-ATGACAGATG-AGA-ATGGCCACAC-GATCATGGTTCC
gi|22636 : CAGCC---CCC----A--AAACA--GACGAACATGGAAACCCCAT-CTTGGTGCCAAAGACGGATTCA-TATGG-CAAACC----C-ATGACAGATG-AGA-ATGGCCACAC-TATCATGGTTCC
gi|22637 : CAGCC---CCA----C--AGACA--GATGAAAATGGAAACCCCAT-CTTGGTGCCAAAAACAGACTCC-TATGG-CAAACC----C-ATGACAGATG-AGA-ATGGCCACAT-CATCATGGTTCC
gi|22638 : CAGCC---CCA----C--AAACA--GACGAACACGGAAACCCAAT-CTTGGTGCCGAAAACAGACTCG-TATGG-GAAACC----G-ATGACTGACG-AGA-ATGGTAAAAC-TATAATGGTTCC
gi|22640 : CAGCG---CCA----C--AGACA--GATGAAAATGGAAATCCAAT-CTTAGTACCAAAGACGGACTCC-TATGG-TAAACC----A-ATAACAGACG-A
gi|22639 : CAGCA---CCA----C--AGACA--GACGAGTTTGGAAATCCCAT-CCTGGTACCAAAGACTGATGAA-TATGG-AAAGCC----GTAT-ACAGATG-AGA-AGGGAAACAC-AGTCATGGTGCC
gi|22641 : CAGTC---CCT----G--AAACA--GACAGGTTCGGGAACCCCAT-TCTTGTGCCGAAGACGGATTCG-TATGG-CAAACC----A-ATGACAGACG-ATC-AAGGCCACAC-TATTCTGGTACC
gi|22643 : CGGCA---CCA----C--TTACT--GATGCCCAGGGAAATCCAAT-CTTAGTTCCAAAAACTGACTCG-TATGG-CAAACC----A-ATGACGGACG-ATC-AAGGACACAC-AATTATGGT
gi|22642 : CGGCG---CCA----G--AAACT--GACAAATTTGGTAACCCTAT-ACTGATCCCAAAGACAGATTCG-TATGG-TCACCC----A-ATGACAGACG-AGC-ATGGCAATAC-CATTATGGTTCC
gi|22644 : CAGTT---CCC----C--AGACT--GATGAGTTTGGAAACCCAAT-CATGATCCCAAAAACTGACTCC-TATGG-CAAGCC----T-ATGACTGACG-ACC-AGGGCAGAAC-CATCATGGTACC
gi|22647 : CAGTC---CCAATACCGAAGACG--GACGACTTCGGCAATCCTAT-CATGATCCCCAAAACGGACTCC-TACGG-CAAACC----C-ATGACGGATG-ACT-TTGGGGAGAC-CATTATGGTGCC
gi|22645 : CATCT---CCA----C--AGACG--GACAAGTACGGAAATCCAAT-TCTGGTTCCCAAAACCGATGAA-TATGG-TAAACC----GTAC-ACGGACG-AGC-ACGGAAACAC-AGTGATGGTACC
gi|22646 : CAGCCGTGCCT----C--AGACA--GACGAACACGGAAACCCAAT-TCTGGTGCCCAGGACGGATGAA-TATGGCCGACCC----T-AC-ACGGACA-AGC-AGGGC
gi|22648 : CAGCC---CCC----A--AAACA--GACAAATATGGCAATCCAAT-CCTGGTGCCCAGGACAGATGAA-TATGG-ACAGCCT---T-AC-ACAGATG-AAC-ATGGTAATAC-AGTCTTAGTTCC
gi|22649 : GCT---CCC----C--AGACG--GACGAACATGGTAATCCCAT-CTTGGTGCCCAAAACAGACTCC-TATGG-AAAGCC----A-ATGACGGACG-ATC-AGGGCCATAC-CATCATGGTACC
gi|22650 : GCA---CCG----C--AAACC--GATGAATTTGGAAACCCTAT-CATGGTTCCAAAAACAGACTCC-TATGG-TAAACC----A-ATGACTGATG-AGA-ATGGTAAAAC-TATAATGGTGCC
gi|22651 : GCC---CCG----C--AAACA--GACGAACATGGAAACCCAATACTT-GTTCCAAAGACTGA-TAGTTATGG-TCATCC----A-ATGACGGACG-ACC-AAGGCAACAC-AATAATGGTACC
gi|22652 : GCT---CCA----T--TGACC--GATGAATTTGGAGTACCCAT-CATGGTGCCAAAGACGGATTCT-TACGG-TCATCC----A-ATGACAGATA-CAA-ATGGCAATAC-CATCATGGTTCC
gi|22653 : GTC---CCA----G--AGACA--GATGAGTTTGGAAACCCTAT-CCTAATTCCAAAAACGGATGAG-TATGG-AAGACC----A-ATGACAGATT-TCT-ATGGCAATAC-TGTAATGGTTCC
gi|22654 : CC---CCA----C--AGACA--GATAAGTTTGGAAATCCAAT-TTTGGTACCAAGAACAGATGAG-TATGG-AAGGCC----A-TTCACAGATG-AAT-TTGGAAGTAC-CCAAATGGTTCC
gi|22655 : CT---CCA----G--CGACA--GACGAGCAAGGTCGCCCGAT-CTTAGTGCCCAAAACTGATTCG-TATGG-CACATT----A-ATTACAGATG-A
gi|22656 : C---CCA----G--AAACG--GACCGATTTGGTAACCCTAT-TTTGGTGCCTAAGACAGATTCT-TATGG-AAAACC----A-ATGACCGATG-CTC-AAGGACACAC-AATCTTGGTGCC
gi|22657 : ---CCA----C--AGACA--GACGAAAATGGAAATCCCAT-CTTGGTACCAAAGACAGACTCC-TACGG-CAAGCC----C-ATGACTGACG-AGA-ATGGAAAAAC-CATCATGGTGCC
gi|22658 : ---CCA----T--TGACG--GACGAGCAAGGAAACCCAAT-AATGGTTCCTAAGACTGATTCT-TATGG-CAAACC----A-ATGACAGATG-AAA-ATGGGCACAC-TATAATGGTACC
gi|22659 : ---CCG----C--AGACG--GATAAAAATGGACTTCCAAT-CTTGGTCCCTAAGACAGACTCC-TATGG-CAAACC----G-ATGACGGACG-TAA-ATGGGAACAC-GATAATGGTGCC
gi|22660 : ---CCA----C--AAACA--GACAAGTTTGGAAACCCCAT-CCTTGTACCCAGGACAGACTCG-TATGG-CAAACC----T-ATGACAGATA-AAT-TTGGAAACAC-GATATTGGTTCC
gi|22661 : ---CCA----C--AAACA--GATGAATTTGGAAATCCTAT-TCTTGTCCCAAGAACTGATGAG-TATGG-CAGGCC----ATAT-ACAGACA-AGA-ATGGACAGAC-TGAGATGGTTCC
gi|22662 : ---CCG----C--AAACG--GACAAGTTTGGAAACCCGAT-CTTGGTTCCCAAGACGGACGAA-TATGG-CAAGCC----A-TTTACGGATG-TCG-AGGGACACAC-
gi|22664 : ---CCA----A--AGACG--GATGAATTCGGAAATCCAATACTTG-TCCCCAAGACGGATGAA-TATGG-CAAGCC----ATAC-ACAGATG-CAA-ATGGAAACAC-AGTGATGGTGCC
gi|22663 : ---CCG----C--AGACG--GACGAATTTGGATTGCCCAT-TCTCGTTCCCAAGACAGACACC-TACGG-CAAACC----G-GTGACGGACG-ATT-TCGGGAACAC-CGTCATGGTACC
gi|22666 : ---CCA----C--AGACA--GACGAGTTTGGTAACCCGAT-CCTCGTACCAAGAACTGATGAA-TATGG-TAAGCC----ATAC-ACAGAT--AGATTTGGAAATAC-TGAAATGGTGCC
gi|22665 : ---CCA----C--AGACA--GACAAGTTTGGAAACCCCAT-CCTTGTACCTAAGACCGATGAA-TACGG-CAGACCGTATA-CTGACAG-TG-----ATCACCATAC-TGTTCTGGTGCC
gi|22667 : ---CCA----C--AAACG--GATAAATTTGGAAACCCGATACTTG-TACCCAAGACGGATGAG-TATGG-AAAACC----GTAC-ACTGATG-AAC-ACGGTAACAC-AGTCATGGTGCC
gi|22668 : ----C--AGCCACTGACGAACATGGAAACCCGAT-CATGGTCCCAAGAACGGATTCC-TATGG-CAAACC----T-ATGACTGATGCAGA-A-GGAAGCAC-TATACTGGTTCC
gi|22669 : GACC--GACGCCCAAGGTCAGCCCAT-CCTGGTGCCCAAAACAGACTCG-TATGG-AAAGCC----G-ATGACTGACG-AGC-ATGGTAGCAC-TATTATGGTACC
gi|22670 : GACG--GATAAATTCGGAAATCCAGT-CCTTATGCCAAAAACTGATTCA-TATGG-ACATCC----A-ATGACAGATG-AAA-ATGGAAATAC-AATAATGGTCCC
gi|22672 : GACA--GACAAATTTGGAAATCCGAT-CTTGGTGCCCAGGACGGACTCA-TATCA-CCATCC----CTAC-ACAGACG-AGA-ATGGCCGCAC-
gi|22671 : GACA--GACAAATTCGGAAGACCCAT-CTTGGTACCAAGGACAGATGAG-TATGG-AAAGCCT---T-AT-ACAGATG-AAT-TTGGACACACACA-AATGGTGCC
gi|22673 : ACA--GACGCTCAAGGTCGTCCAAT-CTTGGTGCCAAAGACAGACTCG-TATGG-CAAACC----C-ATGACAGATG-AAC-TTGGACACAC-CATAATGGTACC
gi|22674 : ACC--GACGAGCACGGTAATCCTAT-TCTGGTACCCAAGACTGATTCG-TATGG-CAAACC----T-ATGACAGATG-ATC-AGGGACACAC-CATATTGGTACC
gi|22675 : GGAGA-CCCAT-CATGGTTCCAAAGACAGACTCG-TACGG-TCGACC----C-ATGACTGACG-AGA-ACGGACACAC-CATCATGGTCCC
gi|22676 : T-CTTAGTGCCAAAGACTGACTCT-TACAA-TAAACC----C-ATGACTGATG-AGA-GTGGCAGTAC-CATAATGGTACC
Alignments
lowQualScore : 222 2222 11 2 1 1 2 0 1 1 3 2 0 0 0 55 4 3 111 0 33 33 1 1 1
lowQualScore : ... .... .. . . . . . . . . . . . . .. . . ... . .. .. . . .
lowQualScore : 000 4444 66 9 0 0 8 4 0 0 5 6 9 9 9 66 7 6 666 9 00 22 0 0 0
consensus : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
Reference ( family-407 ) : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNAACACNATNATGGTNCC
gi|22632 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ATCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-GCC-AATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCACACTATAATGGTTCC
gi|22633 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ACCCCATTCTGGTGCCAAAGACAGATTCTT-ATGG-CAA-GCC-GATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCATACTATAATGGTTCC
gi|22634 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ATCCTATCTTGGTACCTAAGACCGATTCAT-ATGG-CAA-GCC-GATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCACACTATAATGGTTCC
gi|22635 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACACGATCATGGTTCC
gi|22636 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGATTCAT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACACTATCATGGTTCC
gi|22637 : CAGCC---CCA----C--AGACAGATGAAAATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAAACAGACTCCT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACATCATCATGGTTCC
gi|22638 : CAGCC---CCA----C--AAACAGACGAACACGGAA-ACCCAATCTTGGTGCCGAAAACAGACTCGT-ATGG-GAA-ACC-GATG-ACTGA---CG-AGAATGGTAAAACTATAATGGTTCC
gi|22639 : CAGCA---CCA----C--AGACAGACGAGTTTGGAA-ATCCCATCCTGGTACCAAAGACTGATGAAT-ATGG-AAA-GCCGTAT--ACAGA---TG-AGAAGGGAAACACAGTCATGGTGCC
gi|22640 : CAGCG---CCA----C--AGACAGATGAAAATGGAA-ATCCAATCTTAGTACCAAAGACGGACTCCT-ATGG-TAA-ACC-AATA-ACAGA---CG-A
gi|22641 : CAGTC---CCT----G--AAACAGACAGGTTCGGGA-ACCCCATTCTTGTGCCGAAGACGGATTCGT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACAGA---CG-ATCAAGGCCACACTATTCTGGTACC
gi|22642 : CGGCG---CCA----G--AAACTGACAAATTTGGTA-ACCCTATACTGATCCCAAAGACAGATTCGT-ATGG-TCA-CCC-AATG-ACAGA---CG-AGCATGGCAATACCATTATGGTTCC
gi|22643 : GGAA-ATCCAATCTTAGTTCCAAAAACTGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACGGA---CG-ATCAAGGACACACAATTATGGT
gi|22644 : cggcaccacttactgatgcccagCAGTT---CCC----C--AGACTGATGAGTTTGGAA-ACCCAATCATGATCCCAAAAACTGACTCCT-ATGG-CAA-GCC-TATG-ACTGA---CG-ACCAGGGCAGAACCATCATGGTACC
gi|22645 : CATCT---CCA----C--AGACGGACAAGTACGGAA-ATCCAATTCTGGTTCCCAAAACCGATGAAT-ATGG-TAA-ACC-G-TACACGGA---CG-AGCACGGAAACACAGTGATGGTACC
gi|22646 : CAGCCGTGCCT----C--AGACAGACGAACACGGAA-ACCCAATTCTGGTGCCCAGGACGGATGAAT-ATGG-CCG-ACC-C-TACACGGA---CA-AGCAGGG
gi|22647 : CAGTC---CCAATACCGAAGACGGACGACTTCGGCA-ATCCTATCATGATCCCCAAAACGGACTCCT-ACGG-CAA-ACC-CATG-ACGGA---TG-ACTTTGGGGAGACCATTATGGTGCCc
gi|22648 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACAAATATGGCA-ATCCAATCCTGGTGCCCAGGACAGATGAAT-ATGGACAG-CCT-TAC--ACAGA---TG-AACATGGTAATACAGTCTTAGTTCC
gi|22649 : GCT---CCC----C--AGACGGACGAACATGGTA-ATCCCATCTTGGTGCCCAAAACAGACTCCT-ATGG-AAA-GCC-AATG-ACGGA---CG-ATCAGGGCCATACCATCATGGTACC
gi|22650 : GCA---CCG----C--AAACCGATGAATTTGGAA-ACCCTATCATGGTTCCAAAAACAGACTCCT-ATGG-TAA-ACC-AATG-ACTGA---TG-AGAATGGTAAAACTATAATGGTGCC
gi|22651 : GCC---CCG----C--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCAATACTTGTTCCAAAGACTGA-TAGTTATGG-TCA-TCC-AATG-ACGGA---CG-ACCAAGGCAACACAATAATGGTACC
gi|22652 : GCT---CCA----T--TGACCGATGAATTTGGAGTACCC-ATCATGGTGCCAAAGACGGATTCTT-ACGG-TCA-TCC-AATG-ACAGA---TA-CAAATGGCAATACCATCATGGTTCC
gi|22653 : GTC---CCA----G--AGACAGATGAGTTTGGAA-ACCCTATCCTAATTCCAAAAACGGATGAGT-ATGG-AAG-ACC-AATG-ACAGA---TT-TCTATGGCAATACTGTAATGGTTCC
gi|22654 : CC---CCA----C--AGACAGATAAGTTTGGAA-ATCCAATTTTGGTACCAAGAACAGATGAGT-ATGG-AAG-GCC-ATTC-ACAGA---TG-AATTTGGAAGTACCCAAATGGTTCC
gi|22655 : CT---CCA----G--CGACAGACGAGCAAGGTC-GCCCGATCTTAGTGCCCAAAACTGATTCGT-ATGG-CAC-ATT-AATT-ACAGA---TG-A
gi|22656 : C---CCA----G--AAACGGACCGATTTGGTA-ACCCTATTTTGGTGCCTAAGACAGATTCTT-ATGG-AAA-ACC-AATG-ACCGA---TG-CTCAAGGACACACAATCTTGGTGCC
gi|22657 : ---CCA----C--AGACAGACGAAAATGGAA-ATCCCATCTTGGTACCAAAGACAGACTCCT-ACGG-CAA-GCC-CATG-ACTGA---CG-AGAATGGAAAAACCATCATGGTGCC
gi|22658 : ---CCA----T--TGACGGACGAGCAAGGAA-ACCCAATAATGGTTCCTAAGACTGATTCTT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACAGA---TG-AAAATGGGCACACTATAATGGTACC
gi|22659 : ---CCG----C--AGACGGATAAAAATGGAC-TTCCAATCTTGGTCCCTAAGACAGACTCCT-ATGG-CAA-ACC-GATG-ACGGA---CG-TAAATGGGAACACGATAATGGTGCC
gi|22660 : ---CCA----C--AAACAGACAAGTTTGGAA-ACCCCATCCTTGTACCCAGGACAGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACAGA---TA-AATTTGGAAACACGATATTGGTTCC
gi|22661 : ---CCA----C--AAACAGATGAATTTGGAA-ATCCTATTCTTGTCCCAAGAACTGATGAGT-ATGG-CAG-GCCATAT--ACAGA---CA-AGAATGGACAGACTGAGATGGTTCC
gi|22662 : ---CCG----C--AAACGGACAAGTTTGGAA-ACCCGATCTTGGTTCCCAAGACGGACGAAT-ATGG-CAA-GCC-ATTT-ACGGATGTCG-AG---GGACACAC
gi|22663 : ---CCG----C--AGACGGACGAATTTGGAT-TGCCCATTCTCGTTCCCAAGACAGACACCT-ACGG-CAA-ACC-GGTG-ACGGA---CG-ATTTCGGGAACACCGTCATGGTACC
gi|22664 : ---CCA----A--AGACGGATGAATTCGGAA-ATCCAATACTTGTCCCCAAGACGGATGAAT-ATGG-CAA-GCC--ATACACAGA---TG-CAAATGGAAACACAGTGATGGTGCC
gi|22665 : ---CCA----C--AGACAGACAAGTTTGGAA-ACCCCATCCTTGTACCTAAGACCGATGAAT-ACGG-CAG-ACCGTAT--ACTGA---CA-GTGATCACCATACTGTTCTGGTGCC
gi|22666 : ---CCA----C--AGACAGACGAGTTTGGTA-ACCCGATCCTCGTACCAAGAACTGATGAAT-ATGG-TAA-GCC--ATACACAGA---TA-GATTTGGAAATACTGAAATGGTGCC
gi|22667 : ---CCA----C--AAACGGATAAATTTGGAA-ACCCGATACTTGTACCCAAGACGGATGAGT-ATGG-AAA-ACC-G-TACACTGA---TG-AACACGGTAACACAGTCATGGTGCC
gi|22668 : ACTGACGAACATGGAA-ACCCGATCATGGTCCCAAGAACGGATTCCT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACTGA---TGCAGAA-GGAAGCACTATACTGGTTCC
gi|22669 : cagccCCCATCCTGGTGCCCAAAACAGACTCGT-ATGG-AAA-GCC-GATG-ACTGA---CG-AGCATGGTAGCACTATTATGGTACC
gi|22670 : gaccgacgcccaaggtcagGACGGATAAATTCGGAA-ATCCAGTCCTTATGCCAAAAACTGATTCAT-ATGG-ACA-TCC-AATG-ACAGA---TG-AAAATGGAAATACAATAATGGTCCC
gi|22672 : GACAGACAAATTTGGAA-ATCCGATCTTGGTGCCCAGGACGGACTCAT-ATCA-CCATCCC-TAC--ACAGA---CG-AGAATGGCCGCAC
gi|22673 : CCAATCTTGGTGCCAAAGACAGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AACTTGGACACACCATAATGGTACC
gi|22674 : acagacgctcaaggtcgtACCGACGAGCACGGTA-ATCCTATTCTGGTACCCAAGACTGATTCGT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACAGA---TG-ATCAGGGACACACCATATTGGTACC
gi|22675 : GGAG-ACCC-ATCATGGTTCCAAAGACAGACTCGT-ACGG-TCG-ACC-CATG-ACTGA---CG-AGAACGGACACACCATCATGGTCCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22676 ): TCTTAGTGCCAAAGACTGACTCTTACAATAAACCCATGACTGATGAGAGTGGCAGTACCATAATGGTACC
Unaligned ( gi|22671 ): GACAGACAAATTCGGAAGACCCATCTTGGTACCAAGGACAGATGAGTATGGAAAGCCTTATACAGATGAATTTGGACACACACAAATGGTGCC
Alignments
lowQualScore : 222 2222 11 3 1 1 2 0 1 1 3 2 0 0 0 66 55 3 111 0 33 22 1 1 1
lowQualScore : ... .... .. . . . . . . . . . . . . .. .. . ... . .. .. . . .
lowQualScore : 000 4444 66 0 0 0 8 5 0 0 6 3 9 9 9 44 22 7 666 9 00 00 0 0 0
consensus : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
Reference ( family-407 ) : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
gi|22632 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ATCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-GCC-AATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCACACTATAATGGTTCC
gi|22633 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ACCCCATTCTGGTGCCAAAGACAGATTCTT-ATGG-CAA-GCC-GATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCATACTATAATGGTTCC
gi|22634 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ATCCTATCTTGGTACCTAAGACCGATTCAT-ATGG-CAA-GCC-GATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCACACTATAATGGTTCC
gi|22635 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACACGATCATGGTTCC
gi|22636 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGATTCAT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACACTATCATGGTTCC
gi|22637 : CAGCC---CCA----C--AGACAGATGAAAATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAAACAGACTCCT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACATCATCATGGTTCC
gi|22638 : CAGCC---CCA----C--AAACAGACGAACACGGAA-ACCCAATCTTGGTGCCGAAAACAGACTCGT-ATGG-GAA-ACC-GATG-ACTGA---CG-AGAATGGTAAAACTATAATGGTTCC
gi|22639 : CAGCA---CCA----C--AGACAGACGAGTTTGGAA-ATCCCATCCTGGTACCAAAGACTGATGAAT-ATGG-AAA-GCCGTAT--ACAGA---TG-AGAAGGGAAACACAGTCATGGTGCC
gi|22640 : CAGCG---CCA----C--AGACAGATGAAAATGGAA-ATCCAATCTTAGTACCAAAGACGGACTCCT-ATGG-TAA-ACC-AATA-ACAGA---CG-A
gi|22641 : CAGTC---CCT----G--AAACAGACAGGTTCGGGA-ACCCCATTCTTGTGCCGAAGACGGATTCGT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACAGA---CG-ATCAAGGCCACACTATTCTGGTACC
gi|22642 : CGGCG---CCA----G--AAACTGACAAATTTGGTA-ACCCTATACTGATCCCAAAGACAGATTCGT-ATGG-TCA-CCC-AATG-ACAGA---CG-AGCATGGCAATACCATTATGGTTCC
gi|22643 : GGAA-ATCCAATCTTAGTTCCAAAAACTGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACGGA---CG-ATCAAGGACACACAATTATGGT
gi|22644 : cggcaccacttactgatgcccagCAGTT---CCC----C--AGACTGATGAGTTTGGAA-ACCCAATCATGATCCCAAAAACTGACTCCT-ATGG-CAA-GCC-TATG-ACTGA---CG-ACCAGGGCAGAACCATCATGGTACC
gi|22645 : CATCT---CCA----C--AGACGGACAAGTACGGAA-ATCCAATTCTGGTTCCCAAAACCGATGAAT-ATGG-TAA-ACC-G-TACACGGA---CG-AGCACGGAAACACAGTGATGGTACC
gi|22646 : CAGCCGTGCCT----C--AGACAGACGAACACGGAA-ACCCAATTCTGGTGCCCAGGACGGATGAAT-ATGG-CCG-ACC-C-TACACGGA---CA-AGCAGGG
gi|22647 : CAGTC---CCAATACCGAAGACGGACGACTTCGGCA-ATCCTATCATGATCCCCAAAACGGACTCCT-ACGG-CAA-ACC-CATG-ACGGA---TG-ACTTTGGGGAGACCATTATGGTGCCc
gi|22648 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACAAATATGGCA-ATCCAATCCTGGTGCCCAGGACAGATGAAT-ATGGACAG-CCT-TAC--ACAGA---TG-AACATGGTAATACAGTCTTAGTTCC
gi|22649 : GCT---CCC----C--AGACGGACGAACATGGTA-ATCCCATCTTGGTGCCCAAAACAGACTCCT-ATGG-AAA-GCC-AATG-ACGGA---CG-ATCAGGGCCATACCATCATGGTACC
gi|22650 : GCA---CCG----C--AAACCGATGAATTTGGAA-ACCCTATCATGGTTCCAAAAACAGACTCCT-ATGG-TAA-ACC-AATG-ACTGA---TG-AGAATGGTAAAACTATAATGGTGCC
gi|22651 : GCC---CCG----C--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCAATACTTGTTCCAAAGACTGA-TAGTTATGG-TCA-TCC-AATG-ACGGA---CG-ACCAAGGCAACACAATAATGGTACC
gi|22652 : GCT---CCA----T--TGACCGATGAATTTGGAGTACCC-ATCATGGTGCCAAAGACGGATTCTT-ACGG-TCA-TCC-AATG-ACAGA---TA-CAAATGGCAATACCATCATGGTTCC
gi|22653 : GTC---CCA----G--AGACAGATGAGTTTGGAA-ACCCTATCCTAATTCCAAAAACGGATGAGT-ATGG-AAG-ACC-AATG-ACAGA---TT-TCTATGGCAATACTGTAATGGTTCC
gi|22654 : CC---CCA----C--AGACAGATAAGTTTGGAA-ATCCAATTTTGGTACCAAGAACAGATGAGT-ATGG-AAG-GCC-ATTC-ACAGA---TG-AATTTGGAAGTACCCAAATGGTTCC
gi|22655 : CT---CCA----G--CGACAGACGAGCAAGGTC-GCCCGATCTTAGTGCCCAAAACTGATTCGT-ATGG-CAC-ATT-AATT-ACAGA---TG-A
gi|22656 : C---CCA----G--AAACGGACCGATTTGGTA-ACCCTATTTTGGTGCCTAAGACAGATTCTT-ATGG-AAA-ACC-AATG-ACCGA---TG-CTCAAGGACACACAATCTTGGTGCC
gi|22657 : ---CCA----C--AGACAGACGAAAATGGAA-ATCCCATCTTGGTACCAAAGACAGACTCCT-ACGG-CAA-GCC-CATG-ACTGA---CG-AGAATGGAAAAACCATCATGGTGCC
gi|22658 : ---CCA----T--TGACGGACGAGCAAGGAA-ACCCAATAATGGTTCCTAAGACTGATTCTT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACAGA---TG-AAAATGGGCACACTATAATGGTACC
gi|22659 : ---CCG----C--AGACGGATAAAAATGGAC-TTCCAATCTTGGTCCCTAAGACAGACTCCT-ATGG-CAA-ACC-GATG-ACGGA---CG-TAAATGGGAACACGATAATGGTGCC
gi|22660 : ---CCA----C--AAACAGACAAGTTTGGAA-ACCCCATCCTTGTACCCAGGACAGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACAGA---TA-AATTTGGAAACACGATATTGGTTCC
gi|22661 : ---CCA----C--AAACAGATGAATTTGGAA-ATCCTATTCTTGTCCCAAGAACTGATGAGT-ATGG-CAG-GCCATAT--ACAGA---CA-AGAATGGACAGACTGAGATGGTTCC
gi|22662 : ---CCG----C--AAACGGACAAGTTTGGAA-ACCCGATCTTGGTTCCCAAGACGGACGAAT-ATGG-CAA-GCC-ATTT-ACGGATGTCG-AG---GGACACAC
gi|22663 : ---CCG----C--AGACGGACGAATTTGGAT-TGCCCATTCTCGTTCCCAAGACAGACACCT-ACGG-CAA-ACC-GGTG-ACGGA---CG-ATTTCGGGAACACCGTCATGGTACC
gi|22664 : ---CCA----A--AGACGGATGAATTCGGAA-ATCCAATACTTGTCCCCAAGACGGATGAAT-ATGG-CAA-GCC--ATACACAGA---TG-CAAATGGAAACACAGTGATGGTGCC
gi|22665 : ---CCA----C--AGACAGACAAGTTTGGAA-ACCCCATCCTTGTACCTAAGACCGATGAAT-ACGG-CAG-ACCGTAT--ACTGA---CA-GTGATCACCATACTGTTCTGGTGCC
gi|22666 : ---CCA----C--AGACAGACGAGTTTGGTA-ACCCGATCCTCGTACCAAGAACTGATGAAT-ATGG-TAA-GCC--ATACACAGA---TA-GATTTGGAAATACTGAAATGGTGCC
gi|22667 : ---CCA----C--AAACGGATAAATTTGGAA-ACCCGATACTTGTACCCAAGACGGATGAGT-ATGG-AAA-ACC-G-TACACTGA---TG-AACACGGTAACACAGTCATGGTGCC
gi|22668 : ACTGACGAACATGGAA-ACCCGATCATGGTCCCAAGAACGGATTCCT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACTGA---TGCAGAA-GGAAGCACTATACTGGTTCC
gi|22669 : cagccCCCATCCTGGTGCCCAAAACAGACTCGT-ATGG-AAA-GCC-GATG-ACTGA---CG-AGCATGGTAGCACTATTATGGTACC
gi|22670 : gaccgacgcccaaggtcagGACGGATAAATTCGGAA-ATCCAGTCCTTATGCCAAAAACTGATTCAT-ATGG-ACA-TCC-AATG-ACAGA---TG-AAAATGGAAATACAATAATGGTCCC
gi|22671 : GACAGACAAATTCGGAA-GACCCATCTTGGTACCAAGGACAGATGAGT-ATGG-AAA-GCCTTAT--ACAGA---TG-AATTTGGACACACACAAATGGTGCC
gi|22672 : GACAGACAAATTTGGAA-ATCCGATCTTGGTGCCCAGGACGGACTCAT-ATCA-CCATCCC-TAC--ACAGA---CG-AGAATGGCCGCAC
gi|22673 : CCAATCTTGGTGCCAAAGACAGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AACTTGGACACACCATAATGGTACC
gi|22674 : acagacgctcaaggtcgtACCGACGAGCACGGTA-ATCCTATTCTGGTACCCAAGACTGATTCGT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACAGA---TG-ATCAGGGACACACCATATTGGTACC
gi|22675 : GGAG-ACCC-ATCATGGTTCCAAAGACAGACTCGT-ACGG-TCG-ACC-CATG-ACTGA---CG-AGAACGGACACACCATCATGGTCCC
blockSeqs : GTG ATAC GA A A C G A A T GT AC G TGT GA CC T A T
blockSeqs : . . . A A T A T C A AT AC G . GA CC T A T
blockSeqs : . . . A A C G A G G GT AC A . GA CC G C T
blockSeqs : . . . A A C G A G A TT AC A . GA CC T C T
blockSeqs : . . . A A C G A A C G AC A . GA CC C C T
blockSeqs : . . . A A A G G A G G G T . GA TA T A T
blockSeqs : . . . A T C A A T A C G A . GA AA A C G
blockSeqs : . . . A A A A A G C C G A . TC CC T T A
blockSeqs : . . . A T C G G G G C G A . GC CA C T T
blockSeqs : . . . T T T C A A G G G A . TC AC A T A
blockSeqs : . . . T T A T A T G A G G . CC CA C C A
blockSeqs : . . . G A A C A T C A A T . GC AA A G G
blockSeqs : . . . A A A T C C A A G G . GC GG C T T
blockSeqs : . . . G T A G C G A A G G . CT TA A C A
blockSeqs : . . . A A T C C G C T G G . AC CC C C G
blockSeqs : . . . G A A G C A A G G A . TC TA T A A
blockSeqs : . . . C T C G C A C C G G . GA CA A A T
blockSeqs : . . . A A T T A A C C G T . CC CA C C T
blockSeqs : . . . C T A T A T G T G G . AA CA T A T
blockSeqs : . . . A T T G A G T A G A . CT AA C A G
blockSeqs : . . . A T A T A G G A G A . AT AC A C G
blockSeqs : . . . A A G A A A G A G A . TC AA C C A
blockSeqs : . . . G T T G C T G A C A . GA GC T A G
blockSeqs : . . . A A C G T A T A T C . AA GA G A T
blockSeqs : . . . G A A A A A C A G T . AA AA G A T
blockSeqs : . . . G A A T T T T A G A . AT AC T G A
blockSeqs : . . . A T C C T A C A G G . GA AC C C G
blockSeqs : . . . A T T A C A G C G A . TT GA A G G
blockSeqs : . . . G T G C A T G A G A . AA AA T T G
blockSeqs : . . . G T C T C G A G T G . TG CC T A G
blockSeqs : . . . G T A T C A C T G G . AT AA A C T
blockSeqs : . . . A T C C C G A A G A . AC TA T A A
blockSeqs : . . . A T G A T C A G G T . GA AA T T C
blockSeqs : . . . G T G A A T A G G A . GC TA A A G
blockSeqs : T A G A C G G T G T . AA AA A A A
blockSeqs : G T C C A G C G G T . AT AC C A A
blockSeqs : A T A G C A G A G T . GA CC C A C
blockSeqs : A T C G A T A T . A . AC AC C C
blockSeqs : C A G A A A G C . A . TC AC
blockSeqs : A G C G A T . A . GA AC
blockSeqs : T G A A G C . A . G
blockSeqs : . A C T G . . A .
blockSeqs : . T A A G . . T .
blockSeqCons :
originalCons : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
finalCons : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22676 ): TCTTAGTGCCAAAGACTGACTCTTACAATAAACCCATGACTGATGAGAGTGGCAGTACCATAATGGTACC
Alignments
lowQualScore : 222 2222 11 3 1 1 2 0 1 1 3 2 0 0 0 66 55 3 111 0 33 22 1 1 1
lowQualScore : ... .... .. . . . . . . . . . . . . .. .. . ... . .. .. . . .
lowQualScore : 000 4444 66 0 0 0 8 5 0 0 6 3 9 9 9 44 22 7 666 9 00 00 0 0 0
consensus : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
Reference ( family-407 ) : CAGCC---CCA----C--AGACGGACGAATNTGGAA-ACCCNATCCTGGTNCCNAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-NATG-ACGGA---CG-AGNATGGNNACACNATNATGGTNCC
gi|22632 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ATCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-GCC-AATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCACACTATAATGGTTCC
gi|22633 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ACCCCATTCTGGTGCCAAAGACAGATTCTT-ATGG-CAA-GCC-GATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCATACTATAATGGTTCC
gi|22634 : CAGCC---CCA----C--AGACAGACGAACATGGAA-ATCCTATCTTGGTACCTAAGACCGATTCAT-ATGG-CAA-GCC-GATG-ACGGA---TG-AGAATGGCCACACTATAATGGTTCC
gi|22635 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACACGATCATGGTTCC
gi|22636 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAGACGGATTCAT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACACTATCATGGTTCC
gi|22637 : CAGCC---CCA----C--AGACAGATGAAAATGGAA-ACCCCATCTTGGTGCCAAAAACAGACTCCT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AGAATGGCCACATCATCATGGTTCC
gi|22638 : CAGCC---CCA----C--AAACAGACGAACACGGAA-ACCCAATCTTGGTGCCGAAAACAGACTCGT-ATGG-GAA-ACC-GATG-ACTGA---CG-AGAATGGTAAAACTATAATGGTTCC
gi|22639 : CAGCA---CCA----C--AGACAGACGAGTTTGGAA-ATCCCATCCTGGTACCAAAGACTGATGAAT-ATGG-AAA-GCCGTAT--ACAGA---TG-AGAAGGGAAACACAGTCATGGTGCC
gi|22640 : CAGCG---CCA----C--AGACAGATGAAAATGGAA-ATCCAATCTTAGTACCAAAGACGGACTCCT-ATGG-TAA-ACC-AATA-ACAGA---CG-A
gi|22641 : CAGTC---CCT----G--AAACAGACAGGTTCGGGA-ACCCCATTCTTGTGCCGAAGACGGATTCGT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACAGA---CG-ATCAAGGCCACACTATTCTGGTACC
gi|22642 : CGGCG---CCA----G--AAACTGACAAATTTGGTA-ACCCTATACTGATCCCAAAGACAGATTCGT-ATGG-TCA-CCC-AATG-ACAGA---CG-AGCATGGCAATACCATTATGGTTCC
gi|22643 : GGAA-ATCCAATCTTAGTTCCAAAAACTGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACGGA---CG-ATCAAGGACACACAATTATGGT
gi|22644 : cggcaccacttactgatgcccagCAGTT---CCC----C--AGACTGATGAGTTTGGAA-ACCCAATCATGATCCCAAAAACTGACTCCT-ATGG-CAA-GCC-TATG-ACTGA---CG-ACCAGGGCAGAACCATCATGGTACC
gi|22645 : CATCT---CCA----C--AGACGGACAAGTACGGAA-ATCCAATTCTGGTTCCCAAAACCGATGAAT-ATGG-TAA-ACC-G-TACACGGA---CG-AGCACGGAAACACAGTGATGGTACC
gi|22646 : CAGCCGTGCCT----C--AGACAGACGAACACGGAA-ACCCAATTCTGGTGCCCAGGACGGATGAAT-ATGG-CCG-ACC-C-TACACGGA---CA-AGCAGGG
gi|22647 : CAGTC---CCAATACCGAAGACGGACGACTTCGGCA-ATCCTATCATGATCCCCAAAACGGACTCCT-ACGG-CAA-ACC-CATG-ACGGA---TG-ACTTTGGGGAGACCATTATGGTGCCc
gi|22648 : CAGCC---CCC----A--AAACAGACAAATATGGCA-ATCCAATCCTGGTGCCCAGGACAGATGAAT-ATGGACAG-CCT-TAC--ACAGA---TG-AACATGGTAATACAGTCTTAGTTCC
gi|22649 : GCT---CCC----C--AGACGGACGAACATGGTA-ATCCCATCTTGGTGCCCAAAACAGACTCCT-ATGG-AAA-GCC-AATG-ACGGA---CG-ATCAGGGCCATACCATCATGGTACC
gi|22650 : GCA---CCG----C--AAACCGATGAATTTGGAA-ACCCTATCATGGTTCCAAAAACAGACTCCT-ATGG-TAA-ACC-AATG-ACTGA---TG-AGAATGGTAAAACTATAATGGTGCC
gi|22651 : GCC---CCG----C--AAACAGACGAACATGGAA-ACCCAATACTTGTTCCAAAGACTGA-TAGTTATGG-TCA-TCC-AATG-ACGGA---CG-ACCAAGGCAACACAATAATGGTACC
gi|22652 : GCT---CCA----T--TGACCGATGAATTTGGAGTACCC-ATCATGGTGCCAAAGACGGATTCTT-ACGG-TCA-TCC-AATG-ACAGA---TA-CAAATGGCAATACCATCATGGTTCC
gi|22653 : GTC---CCA----G--AGACAGATGAGTTTGGAA-ACCCTATCCTAATTCCAAAAACGGATGAGT-ATGG-AAG-ACC-AATG-ACAGA---TT-TCTATGGCAATACTGTAATGGTTCC
gi|22654 : CC---CCA----C--AGACAGATAAGTTTGGAA-ATCCAATTTTGGTACCAAGAACAGATGAGT-ATGG-AAG-GCC-ATTC-ACAGA---TG-AATTTGGAAGTACCCAAATGGTTCC
gi|22655 : CT---CCA----G--CGACAGACGAGCAAGGTC-GCCCGATCTTAGTGCCCAAAACTGATTCGT-ATGG-CAC-ATT-AATT-ACAGA---TG-A
gi|22656 : C---CCA----G--AAACGGACCGATTTGGTA-ACCCTATTTTGGTGCCTAAGACAGATTCTT-ATGG-AAA-ACC-AATG-ACCGA---TG-CTCAAGGACACACAATCTTGGTGCC
gi|22657 : ---CCA----C--AGACAGACGAAAATGGAA-ATCCCATCTTGGTACCAAAGACAGACTCCT-ACGG-CAA-GCC-CATG-ACTGA---CG-AGAATGGAAAAACCATCATGGTGCC
gi|22658 : ---CCA----T--TGACGGACGAGCAAGGAA-ACCCAATAATGGTTCCTAAGACTGATTCTT-ATGG-CAA-ACC-AATG-ACAGA---TG-AAAATGGGCACACTATAATGGTACC
gi|22659 : ---CCG----C--AGACGGATAAAAATGGAC-TTCCAATCTTGGTCCCTAAGACAGACTCCT-ATGG-CAA-ACC-GATG-ACGGA---CG-TAAATGGGAACACGATAATGGTGCC
gi|22660 : ---CCA----C--AAACAGACAAGTTTGGAA-ACCCCATCCTTGTACCCAGGACAGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACAGA---TA-AATTTGGAAACACGATATTGGTTCC
gi|22661 : ---CCA----C--AAACAGATGAATTTGGAA-ATCCTATTCTTGTCCCAAGAACTGATGAGT-ATGG-CAG-GCCATAT--ACAGA---CA-AGAATGGACAGACTGAGATGGTTCC
gi|22662 : ---CCG----C--AAACGGACAAGTTTGGAA-ACCCGATCTTGGTTCCCAAGACGGACGAAT-ATGG-CAA-GCC-ATTT-ACGGATGTCG-AG---GGACACAC
gi|22663 : ---CCG----C--AGACGGACGAATTTGGAT-TGCCCATTCTCGTTCCCAAGACAGACACCT-ACGG-CAA-ACC-GGTG-ACGGA---CG-ATTTCGGGAACACCGTCATGGTACC
gi|22664 : ---CCA----A--AGACGGATGAATTCGGAA-ATCCAATACTTGTCCCCAAGACGGATGAAT-ATGG-CAA-GCC--ATACACAGA---TG-CAAATGGAAACACAGTGATGGTGCC
gi|22665 : ---CCA----C--AGACAGACAAGTTTGGAA-ACCCCATCCTTGTACCTAAGACCGATGAAT-ACGG-CAG-ACCGTAT--ACTGA---CA-GTGATCACCATACTGTTCTGGTGCC
gi|22666 : ---CCA----C--AGACAGACGAGTTTGGTA-ACCCGATCCTCGTACCAAGAACTGATGAAT-ATGG-TAA-GCC--ATACACAGA---TA-GATTTGGAAATACTGAAATGGTGCC
gi|22667 : ---CCA----C--AAACGGATAAATTTGGAA-ACCCGATACTTGTACCCAAGACGGATGAGT-ATGG-AAA-ACC-G-TACACTGA---TG-AACACGGTAACACAGTCATGGTGCC
gi|22668 : ACTGACGAACATGGAA-ACCCGATCATGGTCCCAAGAACGGATTCCT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACTGA---TGCAGAA-GGAAGCACTATACTGGTTCC
gi|22669 : cagccCCCATCCTGGTGCCCAAAACAGACTCGT-ATGG-AAA-GCC-GATG-ACTGA---CG-AGCATGGTAGCACTATTATGGTACC
gi|22670 : gaccgacgcccaaggtcagGACGGATAAATTCGGAA-ATCCAGTCCTTATGCCAAAAACTGATTCAT-ATGG-ACA-TCC-AATG-ACAGA---TG-AAAATGGAAATACAATAATGGTCCC
gi|22671 : GACAGACAAATTCGGAA-GACCCATCTTGGTACCAAGGACAGATGAGT-ATGG-AAA-GCCTTAT--ACAGA---TG-AATTTGGACACACACAAATGGTGCC
gi|22672 : GACAGACAAATTTGGAA-ATCCGATCTTGGTGCCCAGGACGGACTCAT-ATCA-CCATCCC-TAC--ACAGA---CG-AGAATGGCCGCAC
gi|22673 : CCAATCTTGGTGCCAAAGACAGACTCGT-ATGG-CAA-ACC-CATG-ACAGA---TG-AACTTGGACACACCATAATGGTACC
gi|22674 : acagacgctcaaggtcgtACCGACGAGCACGGTA-ATCCTATTCTGGTACCCAAGACTGATTCGT-ATGG-CAA-ACC-TATG-ACAGA---TG-ATCAGGGACACACCATATTGGTACC
gi|22675 : GGAG-ACCC-ATCATGGTTCCAAAGACAGACTCGT-ACGG-TCG-ACC-CATG-ACTGA---CG-AGAACGGACACACCATCATGGTCCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22676 ): TCTTAGTGCCAAAGACTGACTCTTACAATAAACCCATGACTGATGAGAGTGGCAGTACCATAATGGTACC