lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 222222222222222222
lowQualScore : 2 1 1 1 1 1 2 22 0 1 66666 1 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 1 33333 1 1 11 1 1 1 1 5555 1 1 222 1 1 0000 1 1 222 1 1 1 33 1 11 222 222 5 22 444444444444444444 555 7777777777777777 4444 333 2222 1 1 1 2 1 1 22 111 2 222 0 0 2 1 2 0 0 1 1 11 1
lowQualScore : . . . . . . . .. . . ..... . . ...................................................... .... . ..... . . .. . . . . .... . . ... . . .... . . ... . . . .. . .. ... ... . .. .................. ... ................ .... ... .... . . . . . . .. ... . ... . . . . . . . . . .. .
lowQualScore : 0 0 9 0 0 9 8 22 9 9 66666 8 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 9 88888 9 0 33 9 9 0 0 2222 0 0 666 0 0 5555 0 9 666 0 0 0 33 0 33 777 777 4 33 222222222222222222 222 4444444444444444 8888 000 1111 0 0 0 0 0 0 55 666 7 444 9 9 7 8 7 9 9 0 0 44 0
consensus : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----C---G-T-A----AT--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---CCA--C-N-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
Reference ( gi|98740 ) : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------T----T---G-T-A----AT--T---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--T-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---CTA--C-A-GTA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98743 : CATGC-A-A-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----T---G-T-C----AT--TATC------C----T-G-----TAG-AA-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---CCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AT----A---T----G-T-CC-TCT-C-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98737 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----C---G-TCATC--AT--T---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C--C-T-G-CC---T-T-C-A--TCA-GT--TCT---T---TCA--C-T-ATA------------C-C-T----------------AC----A---T----G-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98744 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------AACCAC------T----T---C-T-A----AC--C---------C------G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--C-C-A-CC---T-T-A-A--TCA-GA--TCC---T---CCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98742 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GC-----GT-A-T----------T----CCCA---T----T---A-T-C----AT--T---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-A---C-C-C--C-T-G-CC---T-T-T-A--CCA-GT--TCT---T---CCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCT-T-AC-G--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98738 : CATGC-A-G-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------CTC--C------C----C---G-T-CT---AT--C---------C----C-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C--C-C-A-CC---T-T-C-A--TCA-GT--TCT---T---TCA--C-T-ATA------------T-C-T----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98745 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-TAACCA-----T----C------T----C-----T-A--------C---------CA---T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-A----T-A-G---C-C-C--C-C-T-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---TCA--C-C-ATT------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAA-TG-G--T-GTAT
gi|98741 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----C---C-C-ATCT-AT--C---------C----C-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-TT--TCC---T---TCA--C-T-ATA------------T-C-T----------------GC----A---T----G-G-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTA
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAA--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----C---C-C-ATTC-AG--T---------C----T-G-----TAA-AT-T--G-A-C-A-A----C-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---TTCACTA--T-ACGTT------------C-T-CCCTCATATGCAACTATAC----A---TATACG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98749 : CATGC-A-G-C-T-A-G-CAT--T-G-GC-----AT-A-T----------T----C------C----C---G-T-CCCT-AT--C---------C----T-G-----TAT-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-A---T-T-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---CAA--C-T-ATA------------C-T-T----------------GC----A---T----G-T-CC-TCC-C-AT-G--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98746 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-TAACCA-----T----C------T----C-----T-A-----C--C---------C----T-G-----TAT-AT-T--G-A-T-A-T----T-A-G---C-C-C--C-A-G-CC---T-T-C-A--CAA-GC--TCC---T---TCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-A-CC-ATT-C-GT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98759 : CATGC-A-G-C-T-A-T-C-G--T-G-GTTGTTGAT-A-T----------T----CCCCACAT----T---C-T-AGT--AC--C---------C----C-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--------CC---C-T-T-A--CC--GC--TCC---T---CCA--C-A-CCA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T--C-TCC-C-CT-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98779 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GC-----GT-A-T----------
gi|98755 : tcctgtagattgacatcagcccctgcctttagcaactcctccgccatactaacatgtcctccctcaCATGC-A---C-G-A-T-CAG--T-G--T-----GTTA-T----------T----C------C----C---C-C-AC---AT--TACTAGATACC----T-G-----TAG-AT-T--A-A-C---T----C-A-G---C-C-C--C-C-A-CC---T-T-C-A--CC--GC--TCC---T---CCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-T-T-----C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98750 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--A-A-GT-----GC-A-T----------T----C------C----T---C-T-------T--T---------C----T-ACCCTTTAG-AT-T--C-G-C-A-T----C-A-G---C-C-C--C-C-A-CC---T-T-A-G--CAA-GC--TTC---T---CCA--C-T-ACA------------C-T-C----------------AC----G---T----G-T-CC-CCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAT-TG-G--C-ATAT
gi|98747 : CATGC-A-G-C-T-A-G-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C----C------C----C---A-C-A-----T--T---------CACACT-T-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C--C-C-G-AC---T-T-T-A--TCA-GT--TCC---T---TCA--C-T-ATA------------T-C-T----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-T-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98756 : CATGC-A-GGC-T-AAT-CAG--T-G-GTCT---GT-A-T----------T----CGCCCCGT----C---A-T-A----TT--C---------C----T-G-----TAGTAT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCATGC--TCC---C---CCA--C-A--CA------------C-T-C----------------ACA---A---T----G-T-CC-TCCGC-CC-A--C---A-T---G-C-A--C-G-A-T-CAG-
gi|98778 : CATGC-A-G-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-
gi|98761 : gtacccccatatatcctttagattgacatcagcctccgcattcatcagctcctccactacacgcacatctcctctcttaCATGC-A-G-C-T-G-T-CAG--A-T-GT-----GTCACT----------T----C------C----C---A-TTC----AT--T---------C----C-A-----TA--AT-T--G-A-C-A-T----T-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCCG--T---CTATCC-A---A------------C---C----------------AC----A---T------T-CC-TCC-C-CCAA--C---A-T---G-C-AGGC-TAA-T-CAG-TG-GTCT-GTAT
gi|98751 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TGC--C------A----C---C-C-C----AT--T---------C----TTG-----TAG-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--T-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---TCA--C-A-CCG------------C-A-C----------------ACTAA-A---T----G-A-CC-TCT-C-CT-A--C---A-T---
gi|98760 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG----G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----CACAG-T-AT---AT--C---------C----T-G-----TAG-AT------G-C-A-T----C-A-G---C-C-CA-C-C-G-CC---T-A-C-A--TC------TCC---T---CTC--C-A--CA------------C-TTC----------------AC----A---T----G-T-CC-TCCTC-TC-AACC---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAG-AT-G--T-GT
gi|98758 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A----C------C----C---A-T-C----ATA-C---------C----C-T-----TAG-A--T--G-A-CAA-T----C-A-G---C-CAC--C-C-G-CC---T-T-C-A---CA-G---TCC---TC--CTA--C-T-ACA------------C-T-C----------------A-----A---T----G-T-CC-TCC-C-CT-A--C---ATT---G-C-AGGC-T-A-T-CA--TG-G--G-GTAT
gi|98765 : CATGC-A-A-T-T-G-T-CAG--T-G-GG-----GT-A-T----------T----CACA---TG---T---G-T-A-----C--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T--T-T-G-CC---T-T-T-A--TCA-GC--TCC---T---CCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----
gi|98754 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------C----C---GTT-T----AC--C---------C----T-G------AG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C----C-A-CC---T-T-CGA--CTA-G---TCT---T---TCAC-C-A-TTA------------T-A-C-----------------C----AGGGT----G-T-CC-CTC-C-CG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98775 : CATGCCA-G-C-T-A-TTCAG--T-G-GT-----GT-A-T----------
gi|98763 : aggtgtcagtgtgtttgtactcccatatttattcccattagtattggacattagtcccccgcctttcaccagtcctctaccacaccactggtcctcccttaCATGC-AAG-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT---T----------C----CA-----T----C---G-T-A-----C--C---------C----T-------CAG-ATAT--G-A-C-A-TT---C-A-G---G-C-C----C-G-CC---T---C-A--CCA-GT--TCC---A---C----C-A-AT-------------C-T-C----------------AT----A---T----G-T-CC-TTC-T-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-C
gi|98757 : CGTGC-A-A-T-C-A-T--AG----G-GT-----GT-A-TCCACCA----T----C------T-----------------AT--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C---T----C-A-G---C-C-C--C-C-GTCC---T-T-C-A--CTA-GTGTCCC---T---CCA--C-C-ATA------------C-C-C----------------AC----A---T----G-TGTC-TTG-C-TT-AATC---A-TT--G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-
gi|98762 : CATGCCA-G-C-T-A-TTCAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C----C------AAA--G---G-T-AT---AT--C---------CA---T-G-----TAG-AT-TTAG-A---A-TA---C-A-G---G-C-C--C-C---CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCCGATT---CCA--C----TA------------C---C----------------ACTATAA---T----GTT-CC-TCC-C-CC-A--CTTGA-T---G-C-A-GC-T-A-T-TAGCTGAG--T-GTAT
gi|98764 : CATGC-A-G-C-T-AAG-CAG--T-G-G------GT-AAT----------T----C------C----C---A-T-ATC--AT--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-G----C-------C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TTA-------CCA--C-A--CA------------T-T-C----------------GC----ATT-T----G-T-CT-TCC-CTTT-A--C---A-TATCG-CAA-GG-T-G-T-CAG-
gi|98752 : CATGC-A-A-TAT-A-T-CAGGCT-G-CT-----GT-C-A----------C----C------C----C---A-T-AT---ATA-C---------C----T-T-----TAG-AT-T--G-A-C-A-TCCACC-A-G---C-C-C--TCC-G-CA---T-T-C-ATCTCA-GC--TCC---T---CCA--CTA-ACA------------CGC-C----------------AC----A---T----C-T-CCATCT-C-TT-C--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-TCCAG-TG-G--TCGTAT
gi|98739 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----CCA----C----C---A-T-AGACTAT--TACC------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C--C-C-G-CC---T-
gi|98766 : CATGC-A-G-A-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------
gi|98753 : CATGC-A-G-T-T-A-TCCAG--T-G-GTC----GT-A-T----------T----C------T----C---G-C-C----AT--T---------T----T-ccccctctaccctgt
gi|98767 : ATGC-A-G-C-TTA-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T----C------CCCAAT---C-T-A-----T--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--C-A-C-A-T----CTA-G---C-C-C--C-CTG-CC---C-T-C-A--CCA-GT--CCT---T---CCA--C-C-TCA------------C---C----------------AC----A---T----T-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-aaatttcgtctttcccctgaacataataggtattcctttaattgcatcgcccagcccaccaccagttcttccactataatgaaaatgaagttaaaatgtcctccctcaatgcagcatgtgaagagtgtat
gi|98768 : ATGC-A-G-C-T-A-T-TAGC-T-GAGT-----GT-A-TA---------T----CCCGGA-T----T---C-T-C----AT--T---------CCTG-T-A-----TAG-AT-C--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C------C-A-CC-----T-C-AC-CCG-GC--TCC---T---CCA--
gi|98770 : TGC-A-G-T-T-G-T-TAG--T-G-GT-----AT-A-T----------T----C------C----C---G-T-C----AT--TATC------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--T-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---CTA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTATtcacac
gi|98772 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C----A------T----C---G-T-C----ATCAT---------C----TTG-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCT---T---CCA--C-C-ATA------------C-G-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCT-A-TA-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-AA-G--T-GCAT
gi|98769 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GC-A-T----------T----C------C----C---G-T--------------------C----------------AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-A--T-A-G-CC---T-T-T-A--CCA-GC--TCC---T---CCA--C-C-ACA------------C-T-C----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-C-AC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98771 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAA--T-G-GT-----GT-T-T----------T----C------CCCCCT---C-T-A-----C--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-T-T----T-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--CCA-GC--TCC---T---CAG--C-T-ATT------------C-T-T----------------AT----A---T----G-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98773 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GTT----GC-A-A----------T----C------C----C---G-T-A----AT--CATGC-----C----T-G-----TAG-AT----G-ATC-A-T----C-A-G---C-C-C--C-C-G-CC---T-T-C-A--ACA-GC--TTC-------CCA--C-GCACA------------C-T-C----------------AC--------T----G-T--C-TCC-G-T--A--C---ATT---G-C-A-AC-T-A-T-CA--TG-G--T-GTAT
gi|98774 : TGC-A-GGC-T-A-T-CA---T-G-GG-----GT-A-TGATTCC----C----C------C----T---C-T-A-----C--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-AAC-AGT----C-A-G---CGC-C--C-C-G-CCA--T-T-C----CCA-GC--TCC---A---CCA--C-C--TA------------C---C----------------TC----A---A----G-T-CC-TCG-C--C-A--C---AAT---G-C-A-GC-TTA-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98775 : -A-G-G-T-G-T-CAG--T-GTGTTT---GT-A-C----------T----C------C----C---A-T-ATTT-AT--T---------C----C-CAT---TAGTAT-T--GGA-C-A-T----T-A-GT--C-C-C--C-C-G-CC---T-TTC-A--CCA-G---TCC---T---CTA--C-C-ACA------------C---C----------------AC----T---G----G-T-CC-TCC-C-TT-A--C---A-T---GCC-A-GC-T-ATT-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98776 : -G-C-T-A-T-CAG--TTG-GT-----GT-G-TATTGTCAGTGT----CCT----T----T---C-T-A----AC--C---------T----T-C-----TAG-AT-T--GGA-C-A-TGA--C-A-G---C-A-CGGT-G-A-CCCATT-T-C-AT-CCA-GC--TCC---T---CCA--C-T-ACA------------CCT-CT---------------AC----A---T----G-T-CT-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-ATAT-A-T-CAG-
gi|98777 : -T-CAG--T-G-GA-----GA-A-T----------TGCCCC------T----T-----T-A-----C--C---------C----T-G------AG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-GGCCC-C-C--C-C-GCCC---T-T-C-A---CA-AC--TCC---------A--C-A-CCACAT---------C-T-C----------------AC----A---G----G-T-CC-TCC----C-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG--G-G--T-GTAT
gi|98778 : -----GT-A-C----------C----C------C----C---A-T-AT---AT--C---------C----T-T-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T--C-C-G-CA---T-T-C-A--TCA-GC--TCC---T---CCA--C-T-ACA------------C-G-C----------------AC----A---T----C-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTA
gi|98753 : ---G-T-A----TT--C---------C----T-T-----TA--AT-T--G---C-A-T----C---G---C-C-C----A-G-CC---CAC-C-A--CCA-GT--TCT---T---CCA--C-T-ATAATGAAAATGAAGT-T-A----------------AA----A---T----G-T-CC-TCC-C-TC-A------A-T---G-C-A-GCAT-G-T-GAA-GA-G--T-GTAT
gi|98779 : catgcagttatccagtggtcgtattctcgccattttaaatttcgtctttcccctgaacataatagT--C---------C----T-G-----TAG-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--C-T-G-CC---T-T-T-A--GCA-AC--TCC---T---CCG--C-C-ATA------------C-T-A----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--C-GTAT
gi|98780 : AG-AT-T--G-A-C-A------C-ATG---C-C-T--C-T-T-TT---T-T-C-A--GCA-AC--ACC---T---TCA--C-A-ATA------------C-C-C----------------AA----A---T----T-T-CC-ATT-C-TC-A--C---A-A---G-C-G-GC-T-G-T-CAA-AG-G--T-GTAT
gi|98781 : ----------------AC----A---T----G-T-CC-TCC-C-TG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-A--T-GTAT
gi|98751 : ctatatct--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98763 : --C---A-T---G-C-AAGC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTtgccaccccattcttgtagattaacatcagccctcgccttcaccagctccttcacaccgcacactaaatgacctctcctacat
gi|98739 : --C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTATtccatcgtaccctcagatatgacattcaggcccgcctcaccagttccaccaatctcatatgtccttctccacatgcagctatc
gi|98766 : --C---A-T---G-C-A-GA-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTATtccaccatagactattaccctgtagattgacatcagctcccgcct
gi|98767 : ---A-T---G-C-A-GC-TTA-T-CAG-TG-G--T-GTATtcccccctctaccctgt
Alignments
lowQualScore : 55555555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 1 1 2 1 1 1 1 1 22 1 2 66666 1 1 6666666666666666 222 444 00000000000000000000000000000000000000 1 11 1 0 11 1 1 0 0 5555 0 0 222 0 0 44444 0 1 0 0 1 1 33 22 222 222 1 0 66666 0 555555555555 222 1 1 11 1 1 1 2 1 1 22 222 2 111 1 1 2 3 1 1 1 1 1 11 1
lowQualScore : . . . . . . . . .. . . ..... . . ................ ... ... ...................................... . .. . . .. . . . . .... . . ... . . ..... . . . . . . .. .. ... ... . . ..... . ............ ... . . .. . . . . . . .. ... . ... . . . . . . . . . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 9 9 0 33 0 9 77777 9 9 8888888888888888 666 333 33333333333333333333333333333333333333 0 33 9 9 33 9 9 9 9 1111 9 9 666 9 9 22222 9 9 9 9 0 0 22 33 666 666 0 9 77777 9 777777777777 000 0 0 33 0 0 0 0 0 0 77 777 9 777 0 0 0 0 0 0 0 1 2 66 2
consensus : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------G------T-AT--------AT---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
Reference ( family-405 ) : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------G------T-A---------AT---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CC-A-C----NA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98737 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------G------T-C---------AT---CATT-C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CT-G-CC-T-T-C-A--TCA--GTTCT---T---TC-A-C----TA-TA------------C-C-T-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98738 : CATGC-A-G-T-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------CTC---C---C---C---------G------T-CT--------AT---C----C-CGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CC-A-CC-T-T-C-A--TCA--GTTCT---T---TC-A-C----TA-TA------------T-C-T-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98739 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---CAC-C---------A------T-AGACTATT--AC---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-
gi|98740 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---T---T---------G------T-A---------AT---T----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CT-A-C----AG-TA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98741 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------C------C-ATCT------AT---C----C-CGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--TTTCC---T---TC-A-C----TA-TA------------T-C-T-GC-A--TG-G-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTA
gi|98742 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CA-G--T-G-GC-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------A------T-T---------AT---CATT-C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-A---C-C-C-----CT-G-CC-T-T-T-A--CCA--GTTCT---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCT-T-AC-G--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98743 : CATGC-A-A-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---T---------G------TCATT-------AT---C----C-TGTA--G-AA-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AT-A--TG-T-CC-TCT-C-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98744 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C---C---------ACTTC--T-A---------AC---C----C--GTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-T-A-A--TCA--GATCC---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98745 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C---C---------A------T-CTCT------AC---C----A-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-A----T-A-G---C-C-C-----CC-T-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---TC-A-C----CA-TT------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAA-TG-G--T-GTAT
gi|98746 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C---C---------A------T-CTCT------AC---C----C-TGTA--T-AT-T--G-A-T-A-T----T-A-G---C-C-C-----CA-G-CC-T-T-C-A--CAA--GCTCC---T---TC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-A-CC-ATT-C-GT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98747 : CATGC-A-G-C-T-A-G-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----C---C---C---------A------C-A---------TT---CACA-C-TTTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-AC-T-T-T-A--TCA--GTTCC---T---TC-A-C----TA-TA------------T-C-T-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CA-A--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------C------C-A---------TT---CAGT-C-TGTA--A-AT-T--G-A-C-A-A----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---TC-A-C----TA-TA------------C------------G-T-TC-TCC-C-TC-A--T---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------acatatacgtcctctctcacatgcagctatcagtggtgtat
gi|98749 : catgcagctgtcaatggtgtattcccccattcagtctgtaaattgacaacagcccccgccttcaccagctccttcactatacgttctccctcatatgcaactatacatatacgtcctctctcaCATGC-A-G-C-T-A-G-CA-T--T-G-GC-----AT-A-T----------T-----C---C---C---------G------T-CCCT------AT---C----C-TGTA--T-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-A---T-T-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CA-A-C----TA-TA------------C-T-T-GC-A--TG-T-CC-TCC-C-AT-G--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98750 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--A-A-GT-----GC-A-T----------T-----C---C---T---------C------T-TTCT------AC---C----C-TTTA--G-AT-T--C-G-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-T-A-G--CAA--GCTTC---T---CC-A-C----TA-CA------------C-T-C-AC-G--TG-T-CC-CCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAT-TG-G--C-ATAT
gi|98751 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------TGCCACC---C---C---------A------T------------T---C----T-TGTA--G-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---TC-A-CACCGCA-CA------------C-T---AA-A--TG-A-CC-TCT-C-CT-A--C---A-T---
gi|98752 : CATGC-A-A-TAT-A-T-CA-GGCT-G-CT-----GT-C-A----------C-----C---C---C---------A------T-AT--------ATA--C----C-TTTA--G-AT-T--G-A-C-A-TCCACC-A-G---C-C-CT----CC-G-CA-T-T-C-ATCTCA--GCTCC---T---CC-A-CT---AA-CA------------CGC-C-AC-A--TC-T-CCATCT-C-TT-C--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-TCCAG-TG-G--TCGTAT
gi|98753 : CATGC-A-G-T-T-A-TCCA-G--T-G-GTC----GT-A-T----------T-----C---T---C---------G------
gi|98753 : ---------G------T-A---------TT---C----C-TTTA----AT-T--G---C-A-T----C-G-------C-C-----CA-G-CC-CAC-C-A--CCA--GTTCT---T---CC-A-C----TA-TAATGAAAATGAAGT-T-A-AA-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A------A-T---G-C-A-GCAT-G-T-GAA-GA-G--T-GTATccattttaaatttcgtctttcccctgaacataataggtattcctttaattgcatcgcccagcccaccaccagttcttccactataatgaaaatgaagttaaaatgtcctccctcaatgcagcatgtgaagagtgtat
gi|98754 : catgcagttatccagtggtcgtattctcgccattttaaatttcgtctttcccctgaacataatagCATGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------GT-----T-T---------AC---C----C-TG-A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G-----C-C-----CC-A-CC-T-T-CGA--CTA--G-TCT---TTCACC-A-T----TA-TA------------C-C-A-GG-G--TG-T-CC-CTC-C-CG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98755 : CATGC-A---C-G-A-T-CA-G--T-GTGT------T-A-T----------T-----C---C---C---------C------C-ACATTACTAGATA--C----C-TGTA--G-AT-T--A-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-T-C-A--CC---GCTCC---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-T-----C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98756 : CATGC-A-GGC-T-AAT-CA-G--T-G-GTCT---GT-A-T----------T-----CGCCC---C---------G------T-C---------ATATTC----C-TGTA--GTAT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCAT-GCTCC---C---CC-A-C-----A-CA------------C-T-C-ACAA--TG-T-CC-TCCGC-CC-A--C---A-T---G-C-A--C-G-A-T-CAG-
gi|98757 : CGTGC-A-A-T-C-A-T--A-G----G-GT-----GT-A-T----------C-----CA--C---C---------A------T-CT--------AT---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-GTCC-T-T-C-A--CTAGTGTCCC---T---CC-A-C----CA-TA------------C-C-C-AC-A--TG-TGTC-TTG-C-TT-AATC---ATT---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-
gi|98758 : CATGC-A---C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----C---C---C---------A------T-C---------ATA--C----C-CTTA--G-A--T--G-A-CAA-T----C-A-G---C-CAC-----CC-G-CC-T-T-C-A---CA--G-TCC---T---CCTA-C----TA-CA------------C-T-C-A--A--TG-T-CC-TCC-C-CT-A--C---ATT---G-C-AGGC-T-A-T-CA--TG-G--G-GTAT
gi|98759 : CATGC-A-G-C-T-A-T-C--G--T-G-GTTGTTGAT-A-T----------T-----C---C---CCACATTCTAG------T-A----------C---C----C-CGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC----C-T-T---A--CC---GCTCC---T---CC-A-C----AC-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T--C-TCC-C-CT-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98760 : CATGC-A---C-T-A-T-CA-G----G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---CACA------G------T-AT--------AT---C----C-TGTA--G-AT------G-C-A-T----C-A-G---C-C-CA----CC-G-CC-T-A-C-A--TC-----TCC---T---CT---C----CA-CA------------C-TTC-AC-A--TG-T-CC-TCCTC-TC-AACC---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAG-AT-G--T-GT
gi|98761 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CA-G--A-T-GT-----GTCACT----------T-----C---C---C---------A------TTC---------AT---T----C-CATA----AT-T--G-A-C-A-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCCG--T---CT-A-T----C--CA------------A-C-C-AC-A--T--T-CC-TCC-C-CCAA--C---A-T---G-C-AGGC-TAA-T-CAG-TG-GTCT-GTAT
gi|98762 : CATGCCA-G-C-T-A-TTCA-G--T-G-GT-----GT-A-T--------------------C---CAAAG-----G------T-AT--------AT---C----CATGTA--G-AT-TTAG-A---A-TA---C-A-G---G-C-C-----CC---CC-T-T-C-A--CCA--GCTCCGATT---CC-A-C----TACCA------------C-T-A-TA-A--TGTT-CC-TCC-C-CC-A--CTTGA-T---G-C-A-GC-T-A-T-TAGCTGAG--T-GTAT
gi|98763 : CATGC-AAG-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT--------------T-----C---CAT-C---------G------T-A----------C---C----C-T-CA--G-ATAT--G-A-C-A-TT---C-A-G---G-C-C-----C--G-CC-T---C-A--CCA--GTTCC---A---CC-A-A----T----------------C-T-C-AT-A--TG-T-CC-TTC-T-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-C
gi|98764 : CATGC-A-G-C-T-AAG-CA-G--T-G-G------GT-AAT----------T-----C---C---C---------A------T-ATC-------AT---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-G----C-------C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCT-----TA--CC-A-C-----A-CA------------T-T-C-GC-ATTTG-T-CT-TCC-CTTT-A--C---A-TATCG-CAA-GG-T-G-T-CAG-
gi|98765 : CATGC-A-A-T-T-G-T-CA-G--T-G-GG-----GT-A-T----------T-----C---A---C---------A------T-GTGT------AC---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----TT-G-CC-T-T-T-A--TCA--GCTCC---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--T
gi|98766 : CATGC-A-G-A-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------
gi|98767 : ATGC-A-G-C-TTA-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C---C---------C------A-ATCT------AT---C----C-TGTA--G-AT-T--C-A-C-A-T----CTA-G---C-C-C-----CCTG-CC-C-T-C-A--CCA--GTCCT---T---CC-A-C----CT-CA------------C---C-AC-A--TT-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-ccctctaccctgt
gi|98768 : ATGC-A-G-C-T-A-T-TA-GC-T-GAGT-----GT-A-TA---------T-----C---C---C---------GGATTCTC-A---------TT---C----C-TGTATAG-AT-C--G-A-C-A-T----C-A-G-------C-----CC-A-CC---T-C-AC-CCG--GCTCC---T---CC-A-T----CA-CA------------C-
gi|98769 : TGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GC-A-T----------T-----C---C---C---------G------T---------------------C---------AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-A-----TA-G-CC-T-T-T-A--CCA--GCTCC---T---CC-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-AC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98770 : TGC-A-G-T-T-G-T-TA-G--T-G-GT-----AT-A-T----------T-----C---C---C---------G------TCATT-------AT---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CT-A-C----CA-CA------------C-T-C-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98771 : TGC-A-G-C-T-A-T-CA-A--T-G-GT-----GT-T-T----------T-----C---C---C---------C------C-CTCT------AC---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-T-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCC---T---CA-G-C----TA-TT------------C-T-T-AT-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98772 : TGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----A---T---C---------G------TCATC-------AT---C----T-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--CCA--GCTCT---T---CC-A-C----CA-TA------------C-G-C-AC-A--TG-T-CC-TCT-A-TA-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-AA-G--T-GCAT
gi|98773 : TGC-A-G-C-T-A-T-CA-G--T-G-GTT----GC-A-A----------T-----C---C---C---------G------T-A---------AT---CATGCC-TGTA--G-AT----G-ATC-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-T-C-A--ACA--GCTTC-------CC-A-CG---CA-CA------------C-T-C-AC----TG-T--C-TCC-G-T--A--C---ATT---G-C-A-AC-T-A-T-CA--TG-G--T-GTAT
gi|98774 : TGC-A-GGC-T-A-T-CATG--G-G-GT-----ATGA-T----------T-----C---C---C---------CCTC---T-A----------C---C----C-TGTA--G-AT-T--G-AAC-AGT----C-A-G---CGC-C-----CC-G-CCAT-T-C----CCA--GCTCC---A---CC-ACC----TA-C-------------C-T-C-A--A---G-T-CC-TCG-C--C-A--CA--A-T---G-C-A-GCTT-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98775 : -A-G-G-T-G-T-CA-G--T-GTGTTT---GT-A-C----------T-----C---C---C---------A------T-ATTT------ATTC-C----C-ATTA--GTAT-T--GGA-C-A-T----T-A-GT--C-C-C-----CC-G-CC-T-TTC-A--CCA--G-TCC---T---CT-A-C----CA-CA------------C---C-AC-T--GG-T-CC-TCC-C-TT-A--C---A-T---GCC-A-GC-T-ATT-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98776 : -G-C-T-A-T-CA-G--TTG-GT-----GT-G-TATTGTCAGTGT-----C---CTTTC----------------T-A---------AC---C----T-TCTA--G-AT-T--GGA-C-A-TGA--C-A-G---C-A-CGGTGACC-C-AT-T-T-C-AT-CCA--GCTCC---T---CC-A-C----TA-CA------------CCT-CTAC-A--TG-T-CT-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-ATAT-A-T-CAG-
gi|98777 : -T-CA-G--T-G-GA-----GA-A-T----------TGC---C---C---C---------T------T-T---------AC---C----C-TG-A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-GGCCC-C-C-----CC-GCCC-T-T-C-A---CA--ACTCC-------AC-A-C----CA-CAT-----------C-T-C-AC-A--GG-T-CC-TCC----C-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG--G-G--T-GTAT
gi|98778 : -----GT-A-C----------C-----C---C---C---------A------T-AT--------AT---C----C-TTTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CA-T-T-C-A--TCA--GCTCC---T---CC-A-C----TA-CA------------C-G-C-AC-A--TC-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTA
gi|98779 : T---C----C-TGTA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CT-G-CC-T-T-T-A--GCA--ACTCC---T---CC-G-C----CA-TA------------C-T-A-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--C-GTAT
gi|98780 : A--G-AT-T--G-A-C-A------C-ATG---C-C-T-----CT-T-TT-T-T-C-A--GCA--ACACC---T---TC-A-C----AA-TA------------C-C-C-AA-A--TT-T-CC-ATT-C-TC-A--C---A-A---G-C-G-GC-T-G-T-CAA-AG-G--T-GTAT
gi|98781 : -C----TA-TA------------T-C-T-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-A--T-GTAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111 3333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 1 2 1 1 1 1 22 1 2 66666 0 1 1111111111111111 222 22 2222222222222222222222222222222222222 333 0 0 11 1 0 11 1 1 0 0 5555 0 0 222 0 0 44444 0 1 1 0 1 22 1 22 222 1 33333333 1 666666666666 33 1 1 11 1 1 1 2 1 1 22 222 2 111 1 1 2 3 1 1 1 1 1 11 1
lowQualScore : . . . . . . . .. . . ..... . . ................ ... .. ..................................... ... . . .. . . .. . . . . .... . . ... . . ..... . . . . . .. . .. ... . ........ . ............ .. . . .. . . . . . . .. ... . ... . . . . . . . . . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 9 9 33 0 9 77777 9 9 1111111111111111 666 66 2222222222222222222222222222222222222 333 9 9 33 9 9 33 9 9 9 9 1111 9 9 666 9 9 22222 9 9 9 9 0 33 0 33 666 0 77777777 0 888888888888 22 0 0 33 0 0 0 0 0 0 77 777 9 777 0 0 0 0 0 0 0 1 2 66 2
consensus : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
Reference ( family-405 ) : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98737 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------TC-A------TC---AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CT-G-CC-T-TC-A--TC-A--GTTCT---TTC-AC----T---A-TA------------C--CT-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98738 : CATGC-A-G-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------CTC---C---C--C----G------T--C------T----AT---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CC-A-CC-T-TC-A--TC-A--GTTCT---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98739 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---CACC----A------T--AGACTATT----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-
gi|98740 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---T--T----G------T--A-----------AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCT-AC----A---G-TA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98741 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------TCT--AT---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--TTTCC---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-GC-A--TG-G-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTA
gi|98742 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GC-----GT-A-T----------T-----C---C--C----A------TT-A------TC---AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-A---C-C-C-----CT-G-CC-T-TT-A--CC-A--GTTCT---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-T-AC-G--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98743 : CATGC-A-A-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--T----G------TC-A------TT---AT---------C---C-TG-TA--G-AA-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AT-A--TG-T-CC-TCT-C-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98744 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-TAA--------C-----C---A--C----T------T--C------T----AA---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TA-A--TC-A--GATCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98745 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C--C----A------T--C------TCT--AC---------C---A-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-A----T-A-G---C-C-C-----CC-T-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-AC----C---A-TT------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAA-TG-G--T-GTAT
gi|98746 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C--C----A------T--C------TCT--AC---------C---C-TG-TA--T-AT-T--G-A-T-A-T----T-A-G---C-C-C-----CA-G-CC-T-TC-A--CA-A--GCTCC---TTC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-A-CC-ATT-C-GT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98747 : CATGC-A-G-C-T-A-G-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----C---C--C----A------C--A------T-----T---------CACAC-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-AC-T-TT-A--TC-A--GTTCC---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAA--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------T-----T---------CAGTC-TG-TA--A-AT-T--G-A-C-A-A----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-AC----T---A-TA------------C------------G-T-TC-TCC-C-TC-A--T---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------acatatacgtcctctctcacatgcagctatcagtggtgtat
gi|98749 : catgcagctgtcaatggtgtattcccccattcagtctgtaaattgacaacagcccccgccttcaccagctccttcactatacgttctccctcatatgcaactatacatatacgtcctctctcaCATGC-A-G-C-T-A-G-CAT--T-G-GC-----AT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--CCC----T----AT---------C---C-TG-TA--T-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-A---T-T-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCA-AC----T---A-TA------------C--TT-GC-A--TG-T-CC-TCC-C-AT-G--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98750 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--A-A-GT-----GC-A-T----------T-----C---C--T----C------TTTC------T----AC---------C---C-TT-TA--G-AT-T--C-G-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TA-G--CA-A--GCTTC---TCC-AC----T---A-CA------------C--TC-AC-G--TG-T-CC-CCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAT-TG-G--C-ATAT
gi|98751 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TGCCACC---C--C----A------T---------------T---------C---T-TG-TA--G-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-ACACCGC---A-CA------------C--T--AA-A--TG-A-CC-TCT-C-CT-A--C---A-T---
gi|98752 : CATGC-A-A-TAT-A-T-CAGGCT-G-CT-----GT-C-A----------C-----C---C--C----A------T--A------T----ATA--------C---C-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-TCCACC-A-G---C-C-CT----CC-G-CA-T-TC-ATCTC-A--GCTCC---TCC-AC----TA--A-CA------------CG-CC-AC-A--TC-T-CCATCT-C-TT-C--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-TCCAG-TG-G--TCGTAT
gi|98753 : CATGC-A-G-T-T-A-TCCAG--T-G-GTC----GT-A-T----------T-----C---T--C----G------
gi|98753 : ----G------T--A------T-----T---------C---C-TT-TA----AT-T--G---C-A-T----C-G-------C-C-----CA-G-CC-CACC-A--CC-A--GTTCT---TCC-AC----T---A-TAATGAAAATGAAGT--TA-AA-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A------A-T---G-C-A-GCAT-G-T-GAA-GA-G--T-GTATccattttaaatttcgtctttcccctgaacataataggtattcctttaattgcatcgcccagcccaccaccagttcttccactataatgaaaatgaagttaaaatgtcctccctcaatgcagcatgtgaagagtgtat
gi|98754 : catgcagttatccagtggtcgtattctcgccattttaaatttcgtctttcccctgaacataatagCATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--T------T----AC---------C---C-TG--A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G-----C-C-----CC-A-CC-T-TCGA--CT-A--G-TCT---TTC-AC----CATTA-TA------------C--CA-GG-G--TG-T-CC-CTC-C-CG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98755 : CATGC-A---C-G-A-T-CAG--T-GTGT------T-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------C----ATTACTAGATAC---C-TG-TA--G-AT-T--A-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TC-A--CC----GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-T-----C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98756 : CATGC-A-GGC-T-AAT-CAG--T-G-GTCT---GT-A-T----------T-----CGCCC--C----G------TC-A------T----ATT--------C---C-TG-TA--GTAT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-AT-GCTCC---CCC-A-----C---A-CA------------C--TC-ACAA--TG-T-CC-TCCGC-CC-A--C---A-T---G-C-A--C-G-A-T-CAG-
gi|98757 : CGTGC-A-A-T-C-A-T--AG----G-GT-----GT-A-T----------C-----CA--C--C----A------T--C------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-GTCC-T-TC-A--CT-AGTGTCCC---TCC-AC----C---A-TA------------C--CC-AC-A--TG-TGTC-TTG-C-TT-AATC---ATT---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-
gi|98758 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----C---C--C----A------TC-A------T----AC---------C---C-T--TA--G-A--T--G-A-CAA-T----C-A-G---C-CAC-----CC-G-CC-T-TC-A---C-A--G-TCC---TCCTAC----T---A-CA------------C--TC-A--A--TG-T-CC-TCC-C-CT-A--C---ATT---G-C-AGGC-T-A-T-CA--TG-G--G-GTAT
gi|98759 : CATGC-A-G-C-T-A-T-C-G--T-G-GTTGTTGAT-A-T----------T-----C---C--C----CACATTCT--AG-----T----AC---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----C----CC-T-T--A--CC----GCTCC---TCC-AC----A---C-CA------------C--TC-AC-A--TG-T--C-TCC-C-CT-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98760 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG----G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--CACA-G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT------G-C-A-T----C-A-G---C-C-CA----CC-G-CC-T-AC-A--T------CTCC---TCT--C----C---A-CA------------CT-TC-AC-A--TG-T-CC-TCCTC-TC-AACC---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAG-AT-G--T-GT
gi|98761 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAG--A-T-GT-----GTCACT----------T-----C---C--C----A------T--T------C----AT---------T---C-CA-TA----AT-T--G-A-C-A-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCCG--TCT-AT----C-----CA------------A--CC-AC-A--T--T-CC-TCC-C-CCAA--C---A-T---G-C-AGGC-TAA-T-CAG-TG-GTCT-GTAT
gi|98762 : CATGCCA-G-C-T-A-TTCAG--T-G-GT-----GT-A-T--------------------C--CAAAGG------T--A------T----AT---------C---CATG-TA--G-AT-TTAG-A---A-TA---C-A-G---G-C-C-----CC---CC-T-TC-A--CC-A--GCTCCGATTCC-AC----T---ACCA------------C--TA-TA-A--TGTT-CC-TCC-C-CC-A--CTTGA-T---G-C-A-GC-T-A-T-TAGCTGAG--T-GTAT
gi|98763 : CATGC-AAG-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT--------------T-----C---CATC----G------T--A------C---------------C---C-T--CA--G-ATAT--G-A-C-A-TT---C-A-G---G-C-C-----C--G-CC-T--C-A--CC-A--GTTCC-------AC----C---A-AT------------C--TC-AT-A--TG-T-CC-TTC-T-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-C
gi|98764 : CATGC-A-G-C-T-AAG-CAG--T-G-G------GT-AAT----------T-----C---C--C----A------T--A------TC---AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-G----C-------C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCT-------T-AC----C---A-CA------------CATTC-GC-ATTTG-T-CT-TCC-CTTT-A--C---A-TATCG-CAA-GG-T-G-T-CAG-
gi|98765 : CATGC-A-A-T-T-G-T-CAG--T-G-GG-----GT-A-T----------T-----C---A--CAT--G------T--G------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----TT-G-CC-T-TT-A--TC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--T
gi|98766 : CATGC-A-G-A-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TCC---C---C--C----C------T--C------T----AC---------C---C-TG-T
gi|98767 : ATGC-A-G-C-TTA-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--CCA--A------T--C------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--C-A-C-A-T----CTA-G---C-C-C-----CCTG-CC-C-TC-A--CC-A--GTCCT---TCC-AC----C---T-CA------------C---C-AC-A--TT-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-
gi|98768 : ATGC-A-G-C-T-A-T-TAGC-T-GAGT-----GT-A-TA---------T-----C---C--C----G------G--A------TTCTCATT--------C---C-TG-TATAG-AT-C--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--------A-CC-T--C-A--CCCG--GCTCC---TCC-AT----C---A-CA------------C--
gi|98769 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GC-A-T----------T-----C---C--C----G------T-----------------------------C----------AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-A-----TA-G-CC-T-TT-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-AC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98770 : TGC-A-G-T-T-G-T-TAG--T-G-GT-----AT-A-T----------T-----C---C--C----G------TC-A------TT---AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCT-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98771 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAA--T-G-GT-----GT-T-T----------T-----C---C--C----CCC----T--C------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-T-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCA-GC----T---A-TT------------C--TT-AT-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98772 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----A---T--C----G------TC-A------TC---AT---------C---T-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCT---TCC-AC----C---A-TA------------C--GC-AC-A--TG-T-CC-TCT-A-TA-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-AA-G--T-GCAT
gi|98773 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GTT----GC-A-A----------T-----C---C--C----G------T--AAT----C----ATG--------C---C-TG-TA--G-AT----G-ATC-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--AC-A--GCTTC----CC-ACG---C---A-CA------------C--TC-AC----TG-T--C-TCC-G-T--A--C---ATT---G-C-A-AC-T-A-T-CA--TG-G--T-GTAT
gi|98774 : TGC-A-GGC-T-A-T-CA---T-G-GG-----GT-A-TGATT------C-----C---C--C----C------T--C------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-AAC-AGT----C-A-G---CGC-C-----CC-G-CCAT-TC----CC-A--GCTCC---ACC-AC----CT--A-C-------------C--TC-A--A---G-T-CC-TCG-C--C-A--CA--A-T---G-C-A-GCTT-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98775 : -A-G-G-T-G-T-CAG--T-GTGTTT---GT-A-C----------T-----C---C--C----A------T--A------TTT--ATTC-------C---C-AT-TA--GTAT-T--GGA-C-A-T----T-A-GT--C-C-C-----CC-G-CCTT-TC-A--CC-A--G-TCC---TCT-AC----C---A-CA------------C---C-AC-T--GG-T-CC-TCC-C-TT-A--C---A-T---GCC-A-GC-T-ATT-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98776 : -G-C-T-A-T-CAG--TTG-GT-----GT-G-TATTGTCAGTGT-----C---C--T----T------T--C------T----AA---------C---C-TTCTA--G-AT-T--GGA-C-A-TGA--C-A-G---C-A-CGGTGACC-C-AT-T-TC-AT-CC-A--GCTCC---TCC-AC----T---A-CAC-----------C--TCTAC-A--TG-T-CT-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-ATAT-A-T-CAG-
gi|98777 : -T-CAG--T-G-GA-----GA-A-T----------TG----C---C--C----C------T--T------T----AC---------C---C-TG--A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-GGCCC-C-C-----CC-GCCC-T-TC-A---C-A--ACTCC----AC-AC----C---A-CAT-----------C--TC-AC-A--GG-T-CC-TCC----C-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG--G-G--T-GTAT
gi|98778 : -----GT-A-C----------C-----C---C--C----A------T--A------T----AT---------C---C-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CA-T-TC-A--TC-A--GCTCC---TCC-AC----T---A-CA------------C--GC-AC-A--TC-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTA
gi|98779 : T---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CT-G-CC-T-TT-A--GC-A--ACTCC---TCC-GC----C---A-TA------------C--TA-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--C-GTAT
gi|98780 : A--G-AT-T--G-A-C-A------C-ATG---C-C-T-----CT-T-TT-T-TC-A--GC-A--ACACC---TTC-AC----A---A-TA------------C--CC-AA-A--TT-T-CC-ATT-C-TC-A--C---A-A---G-C-G-GC-T-G-T-CAA-AG-G--T-GTAT
gi|98781 : -AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-A--T-GTAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111 3333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 1 2 1 1 1 1 22 1 2 66666 0 1 1111111111111111 222 22 2222222222222222222222222222222222222 333 0 0 11 1 0 11 1 1 0 0 5555 0 0 222 0 0 44444 0 1 1 0 1 22 1 22 222 1 33333333 1 666666666666 33 1 1 11 1 1 1 2 1 1 22 222 2 111 1 1 2 3 1 1 1 1 1 11 1
lowQualScore : . . . . . . . .. . . ..... . . ................ ... .. ..................................... ... . . .. . . .. . . . . .... . . ... . . ..... . . . . . .. . .. ... . ........ . ............ .. . . .. . . . . . . .. ... . ... . . . . . . . . . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 9 9 33 0 9 77777 9 9 1111111111111111 666 66 2222222222222222222222222222222222222 333 9 9 33 9 9 33 9 9 9 9 1111 9 9 666 9 9 22222 9 9 9 9 0 33 0 33 666 0 77777777 0 888888888888 22 0 0 33 0 0 0 0 0 0 77 777 9 777 0 0 0 0 0 0 0 1 2 66 2
consensus : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
Reference ( family-405 ) : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98737 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------TC-A------TC---AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CT-G-CC-T-TC-A--TC-A--GTTCT---TTC-AC----T---A-TA------------C--CT-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98738 : CATGC-A-G-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------CTC---C---C--C----G------T--C------T----AT---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CC-A-CC-T-TC-A--TC-A--GTTCT---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98739 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---CACC----A------T--AGACTATT----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-
gi|98740 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---T--T----G------T--A-----------AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCT-AC----A---G-TA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98741 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------TCT--AT---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--TTTCC---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-GC-A--TG-G-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTA
gi|98742 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GC-----GT-A-T----------T-----C---C--C----A------TT-A------TC---AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-A---C-C-C-----CT-G-CC-T-TT-A--CC-A--GTTCT---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-T-AC-G--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98743 : CATGC-A-A-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--T----G------TC-A------TT---AT---------C---C-TG-TA--G-AA-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AT-A--TG-T-CC-TCT-C-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98744 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-TAA--------C-----C---A--C----T------T--C------T----AA---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TA-A--TC-A--GATCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98745 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C--C----A------T--C------TCT--AC---------C---A-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-A----T-A-G---C-C-C-----CC-T-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-AC----C---A-TT------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAA-TG-G--T-GTAT
gi|98746 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C--C----A------T--C------TCT--AC---------C---C-TG-TA--T-AT-T--G-A-T-A-T----T-A-G---C-C-C-----CA-G-CC-T-TC-A--CA-A--GCTCC---TTC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-A-CC-ATT-C-GT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98747 : CATGC-A-G-C-T-A-G-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----C---C--C----A------C--A------T-----T---------CACAC-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-AC-T-TT-A--TC-A--GTTCC---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAA--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------T-----T---------CAGTC-TG-TA--A-AT-T--G-A-C-A-A----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-AC----T---A-TA------------C------------G-T-TC-TCC-C-TC-A--T---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------acatatacgtcctctctcacatgcagctatcagtggtgtat
gi|98749 : catgcagctgtcaatggtgtattcccccattcagtctgtaaattgacaacagcccccgccttcaccagctccttcactatacgttctccctcatatgcaactatacatatacgtcctctctcaCATGC-A-G-C-T-A-G-CAT--T-G-GC-----AT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--CCC----T----AT---------C---C-TG-TA--T-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-A---T-T-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCA-AC----T---A-TA------------C--TT-GC-A--TG-T-CC-TCC-C-AT-G--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98750 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--A-A-GT-----GC-A-T----------T-----C---C--T----C------TTTC------T----AC---------C---C-TT-TA--G-AT-T--C-G-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TA-G--CA-A--GCTTC---TCC-AC----T---A-CA------------C--TC-AC-G--TG-T-CC-CCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAT-TG-G--C-ATAT
gi|98751 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TGCCACC---C--C----A------T---------------T---------C---T-TG-TA--G-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-ACACCGC---A-CA------------C--T--AA-A--TG-A-CC-TCT-C-CT-A--C---A-T---
gi|98752 : CATGC-A-A-TAT-A-T-CAGGCT-G-CT-----GT-C-A----------C-----C---C--C----A------T--A------T----ATA--------C---C-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-TCCACC-A-G---C-C-CT----CC-G-CA-T-TC-ATCTC-A--GCTCC---TCC-AC----TA--A-CA------------CG-CC-AC-A--TC-T-CCATCT-C-TT-C--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-TCCAG-TG-G--TCGTAT
gi|98753 : CATGC-A-G-T-T-A-TCCAG--T-G-GTC----GT-A-T----------T-----C---T--C----G------
gi|98753 : ----G------T--A------T-----T---------C---C-TT-TA----AT-T--G---C-A-T----C-G-------C-C-----CA-G-CC-CACC-A--CC-A--GTTCT---TCC-AC----T---A-TAATGAAAATGAAGT--TA-AA-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A------A-T---G-C-A-GCAT-G-T-GAA-GA-G--T-GTATccattttaaatttcgtctttcccctgaacataataggtattcctttaattgcatcgcccagcccaccaccagttcttccactataatgaaaatgaagttaaaatgtcctccctcaatgcagcatgtgaagagtgtat
gi|98754 : catgcagttatccagtggtcgtattctcgccattttaaatttcgtctttcccctgaacataatagCATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--T------T----AC---------C---C-TG--A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G-----C-C-----CC-A-CC-T-TCGA--CT-A--G-TCT---TTC-AC----CATTA-TA------------C--CA-GG-G--TG-T-CC-CTC-C-CG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98755 : CATGC-A---C-G-A-T-CAG--T-GTGT------T-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------C----ATTACTAGATAC---C-TG-TA--G-AT-T--A-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TC-A--CC----GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-T-----C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98756 : CATGC-A-GGC-T-AAT-CAG--T-G-GTCT---GT-A-T----------T-----CGCCC--C----G------TC-A------T----ATT--------C---C-TG-TA--GTAT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-AT-GCTCC---CCC-A-----C---A-CA------------C--TC-ACAA--TG-T-CC-TCCGC-CC-A--C---A-T---G-C-A--C-G-A-T-CAG-
gi|98757 : CGTGC-A-A-T-C-A-T--AG----G-GT-----GT-A-T----------C-----CA--C--C----A------T--C------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-GTCC-T-TC-A--CT-AGTGTCCC---TCC-AC----C---A-TA------------C--CC-AC-A--TG-TGTC-TTG-C-TT-AATC---ATT---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-
gi|98758 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----C---C--C----A------TC-A------T----AC---------C---C-T--TA--G-A--T--G-A-CAA-T----C-A-G---C-CAC-----CC-G-CC-T-TC-A---C-A--G-TCC---TCCTAC----T---A-CA------------C--TC-A--A--TG-T-CC-TCC-C-CT-A--C---ATT---G-C-AGGC-T-A-T-CA--TG-G--G-GTAT
gi|98759 : CATGC-A-G-C-T-A-T-C-G--T-G-GTTGTTGAT-A-T----------T-----C---C--C----CACATTCT--AG-----T----AC---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----C----CC-T-T--A--CC----GCTCC---TCC-AC----A---C-CA------------C--TC-AC-A--TG-T--C-TCC-C-CT-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98760 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG----G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--CACA-G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT------G-C-A-T----C-A-G---C-C-CA----CC-G-CC-T-AC-A--T------CTCC---TCT--C----C---A-CA------------CT-TC-AC-A--TG-T-CC-TCCTC-TC-AACC---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAG-AT-G--T-GT
gi|98761 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAG--A-T-GT-----GTCACT----------T-----C---C--C----A------T--T------C----AT---------T---C-CA-TA----AT-T--G-A-C-A-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCCG--TCT-AT----C-----CA------------A--CC-AC-A--T--T-CC-TCC-C-CCAA--C---A-T---G-C-AGGC-TAA-T-CAG-TG-GTCT-GTAT
gi|98762 : CATGCCA-G-C-T-A-TTCAG--T-G-GT-----GT-A-T--------------------C--CAAAGG------T--A------T----AT---------C---CATG-TA--G-AT-TTAG-A---A-TA---C-A-G---G-C-C-----CC---CC-T-TC-A--CC-A--GCTCCGATTCC-AC----T---ACCA------------C--TA-TA-A--TGTT-CC-TCC-C-CC-A--CTTGA-T---G-C-A-GC-T-A-T-TAGCTGAG--T-GTAT
gi|98763 : CATGC-AAG-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT--------------T-----C---CATC----G------T--A------C---------------C---C-T--CA--G-ATAT--G-A-C-A-TT---C-A-G---G-C-C-----C--G-CC-T--C-A--CC-A--GTTCC-------AC----C---A-AT------------C--TC-AT-A--TG-T-CC-TTC-T-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-C
gi|98764 : CATGC-A-G-C-T-AAG-CAG--T-G-G------GT-AAT----------T-----C---C--C----A------T--A------TC---AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-G----C-------C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCT-------T-AC----C---A-CA------------CATTC-GC-ATTTG-T-CT-TCC-CTTT-A--C---A-TATCG-CAA-GG-T-G-T-CAG-
gi|98765 : CATGC-A-A-T-T-G-T-CAG--T-G-GG-----GT-A-T----------T-----C---A--CAT--G------T--G------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----TT-G-CC-T-TT-A--TC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--T
gi|98766 : CATGC-A-G-A-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TCC---C---C--C----C------T--C------T----AC---------C---C-TG-T
gi|98767 : ATGC-A-G-C-TTA-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--CCA--A------T--C------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--C-A-C-A-T----CTA-G---C-C-C-----CCTG-CC-C-TC-A--CC-A--GTCCT---TCC-AC----C---T-CA------------C---C-AC-A--TT-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-
gi|98768 : ATGC-A-G-C-T-A-T-TAGC-T-GAGT-----GT-A-TA---------T-----C---C--C----G------G--A------TTCTCATT--------C---C-TG-TATAG-AT-C--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--------A-CC-T--C-A--CCCG--GCTCC---TCC-AT----C---A-CA------------C--
gi|98769 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GC-A-T----------T-----C---C--C----G------T-----------------------------C----------AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-A-----TA-G-CC-T-TT-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-AC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98770 : TGC-A-G-T-T-G-T-TAG--T-G-GT-----AT-A-T----------T-----C---C--C----G------TC-A------TT---AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCT-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98771 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAA--T-G-GT-----GT-T-T----------T-----C---C--C----CCC----T--C------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-T-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCA-GC----T---A-TT------------C--TT-AT-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98772 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----A---T--C----G------TC-A------TC---AT---------C---T-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCT---TCC-AC----C---A-TA------------C--GC-AC-A--TG-T-CC-TCT-A-TA-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-AA-G--T-GCAT
gi|98773 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GTT----GC-A-A----------T-----C---C--C----G------T--AAT----C----ATG--------C---C-TG-TA--G-AT----G-ATC-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--AC-A--GCTTC----CC-ACG---C---A-CA------------C--TC-AC----TG-T--C-TCC-G-T--A--C---ATT---G-C-A-AC-T-A-T-CA--TG-G--T-GTAT
gi|98774 : TGC-A-GGC-T-A-T-CA---T-G-GG-----GT-A-TGATT------C-----C---C--C----C------T--C------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-AAC-AGT----C-A-G---CGC-C-----CC-G-CCAT-TC----CC-A--GCTCC---ACC-AC----CT--A-C-------------C--TC-A--A---G-T-CC-TCG-C--C-A--CA--A-T---G-C-A-GCTT-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98775 : -A-G-G-T-G-T-CAG--T-GTGTTT---GT-A-C----------T-----C---C--C----A------T--A------TTT--ATTC-------C---C-AT-TA--GTAT-T--GGA-C-A-T----T-A-GT--C-C-C-----CC-G-CCTT-TC-A--CC-A--G-TCC---TCT-AC----C---A-CA------------C---C-AC-T--GG-T-CC-TCC-C-TT-A--C---A-T---GCC-A-GC-T-ATT-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98776 : -G-C-T-A-T-CAG--TTG-GT-----GT-G-TATTGTCAGTGT-----C---C--T----T------T--C------T----AA---------C---C-TTCTA--G-AT-T--GGA-C-A-TGA--C-A-G---C-A-CGGTGACC-C-AT-T-TC-AT-CC-A--GCTCC---TCC-AC----T---A-CAC-----------C--TCTAC-A--TG-T-CT-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-ATAT-A-T-CAG-
gi|98777 : -T-CAG--T-G-GA-----GA-A-T----------TG----C---C--C----C------T--T------T----AC---------C---C-TG--A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-GGCCC-C-C-----CC-GCCC-T-TC-A---C-A--ACTCC----AC-AC----C---A-CAT-----------C--TC-AC-A--GG-T-CC-TCC----C-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG--G-G--T-GTAT
gi|98778 : -----GT-A-C----------C-----C---C--C----A------T--A------T----AT---------C---C-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CA-T-TC-A--TC-A--GCTCC---TCC-AC----T---A-CA------------C--GC-AC-A--TC-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTA
gi|98779 : T---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CT-G-CC-T-TT-A--GC-A--ACTCC---TCC-GC----C---A-TA------------C--TA-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--C-GTAT
gi|98780 : A--G-AT-T--G-A-C-A------C-ATG---C-C-T-----CT-T-TT-T-TC-A--GC-A--ACACC---TTC-AC----A---A-TA------------C--CC-AA-A--TT-T-CC-ATT-C-TC-A--C---A-A---G-C-G-GC-T-G-T-CAA-AG-G--T-GTAT
gi|98781 : -AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-A--T-GTAT
blockSeqs : C G A C GC T TGTTG C ATTGTCAGTGT GCC AC CCACATTACTAGATA ACA TA T TA G T CCAC GCC GGTGA T A TC GT GAT ACCGC ATGAAAATGAAG AT TT G AT TTG T ATC C A G A A T C C A TC C
blockSeqs : . G A T C A CT A TGCCAC A AT CACATTCTAGTAC AGT . T . G A GA T T C T T T G CATT C G . T AC A T . . . G T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T TT . GATTC . . ATAGACTATTAC . . . . . . A . A . . . . . TA T T . . . . T . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . CTC . . GGATTCTCATT . . . . . . T . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . AAC . . AAAGGTATAT . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCC . . ATATTTATTC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . ACAGTATAT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TG . . GTAATCATG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . CCATCTAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATTATCAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTCATTAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATCTCTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATCTCTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . GTCCCTAT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . CTTTCTAC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . GTCATATT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATGTGTAC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . CAATCTAT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTCATTAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . CCCTCTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTCATCAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATATATA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATCATAC . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATATCAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . GTCTAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . TTCTAA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTTTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATCTAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATTCAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . CTCTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . CTCTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . TTCTAA . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . CTTTAC . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ATATAT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTAAT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . ACATT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . CCATT . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTATT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . GTAC . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . ATT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
finalCons : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111 3333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 1 2 1 1 1 1 22 1 2 66666 0 1 1111111111111111 222 22 2222222222222222222222222222222222222 333 0 0 11 1 0 11 1 1 0 0 5555 0 0 222 0 0 44444 0 1 1 0 1 22 1 22 222 1 33333333 1 666666666666 33 1 1 11 1 1 1 2 1 1 22 222 2 111 1 1 2 3 1 1 1 1 1 11 1
lowQualScore : . . . . . . . .. . . ..... . . ................ ... .. ..................................... ... . . .. . . .. . . . . .... . . ... . . ..... . . . . . .. . .. ... . ........ . ............ .. . . .. . . . . . . .. ... . ... . . . . . . . . . .. .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 9 9 33 0 9 77777 9 9 1111111111111111 666 66 2222222222222222222222222222222222222 333 9 9 33 9 9 33 9 9 9 9 1111 9 9 666 9 9 22222 9 9 9 9 0 33 0 33 666 0 77777777 0 888888888888 22 0 0 33 0 0 0 0 0 0 77 777 9 777 0 0 0 0 0 0 0 1 2 66 2
consensus : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
Reference ( family-405 ) : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98737 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------TC-A------TC---AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CT-G-CC-T-TC-A--TC-A--GTTCT---TTC-AC----T---A-TA------------C--CT-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98738 : CATGC-A-G-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------CTC---C---C--C----G------T--C------T----AT---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---T-C-C-----CC-A-CC-T-TC-A--TC-A--GTTCT---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98739 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---CACC----A------T--AGACTATT----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-
gi|98740 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---T--T----G------T--A-----------AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCT-AC----A---G-TA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98741 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------TCT--AT---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--TTTCC---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-GC-A--TG-G-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTA
gi|98742 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GC-----GT-A-T----------T-----C---C--C----A------TT-A------TC---AT---------T---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-A---C-C-C-----CT-G-CC-T-TT-A--CC-A--GTTCT---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-T-AC-G--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98743 : CATGC-A-A-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--T----G------TC-A------TT---AT---------C---C-TG-TA--G-AA-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AT-A--TG-T-CC-TCT-C-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98744 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-TAA--------C-----C---A--C----T------T--C------T----AA---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TA-A--TC-A--GATCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98745 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C--C----A------T--C------TCT--AC---------C---A-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-A----T-A-G---C-C-C-----CC-T-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-AC----C---A-TT------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAA-TG-G--T-GTAT
gi|98746 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----A---C--C----A------T--C------TCT--AC---------C---C-TG-TA--T-AT-T--G-A-T-A-T----T-A-G---C-C-C-----CA-G-CC-T-TC-A--CA-A--GCTCC---TTC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-A-CC-ATT-C-GT-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98747 : CATGC-A-G-C-T-A-G-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----C---C--C----A------C--A------T-----T---------CACAC-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-T-C-----CC-G-AC-T-TT-A--TC-A--GTTCC---TTC-AC----T---A-TA------------T--CT-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-TT-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAA--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------T-----T---------CAGTC-TG-TA--A-AT-T--G-A-C-A-A----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-AC----T---A-TA------------C------------G-T-TC-TCC-C-TC-A--T---A-T---G-C-A-AC-T-A-T-
gi|98748 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------acatatacgtcctctctcacatgcagctatcagtggtgtat
gi|98749 : catgcagctgtcaatggtgtattcccccattcagtctgtaaattgacaacagcccccgccttcaccagctccttcactatacgttctccctcatatgcaactatacatatacgtcctctctcaCATGC-A-G-C-T-A-G-CAT--T-G-GC-----AT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--CCC----T----AT---------C---C-TG-TA--T-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-A---T-T-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCA-AC----T---A-TA------------C--TT-GC-A--TG-T-CC-TCC-C-AT-G--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98750 : CATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--A-A-GT-----GC-A-T----------T-----C---C--T----C------TTTC------T----AC---------C---C-TT-TA--G-AT-T--C-G-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TA-G--CA-A--GCTTC---TCC-AC----T---A-CA------------C--TC-AC-G--TG-T-CC-CCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-G-CAT-TG-G--C-ATAT
gi|98751 : CATGC-A-A-T-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TGCCACC---C--C----A------T---------------T---------C---T-TG-TA--G-AT-T--A-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TTC-ACACCGC---A-CA------------C--T--AA-A--TG-A-CC-TCT-C-CT-A--C---A-T---
gi|98752 : CATGC-A-A-TAT-A-T-CAGGCT-G-CT-----GT-C-A----------C-----C---C--C----A------T--A------T----ATA--------C---C-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-TCCACC-A-G---C-C-CT----CC-G-CA-T-TC-ATCTC-A--GCTCC---TCC-AC----TA--A-CA------------CG-CC-AC-A--TC-T-CCATCT-C-TT-C--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-TCCAG-TG-G--TCGTAT
gi|98753 : CATGC-A-G-T-T-A-TCCAG--T-G-GTC----GT-A-T----------T-----C---T--C----G------
gi|98753 : ----G------T--A------T-----T---------C---C-TT-TA----AT-T--G---C-A-T----C-G-------C-C-----CA-G-CC-CACC-A--CC-A--GTTCT---TCC-AC----T---A-TAATGAAAATGAAGT--TA-AA-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A------A-T---G-C-A-GCAT-G-T-GAA-GA-G--T-GTATccattttaaatttcgtctttcccctgaacataataggtattcctttaattgcatcgcccagcccaccaccagttcttccactataatgaaaatgaagttaaaatgtcctccctcaatgcagcatgtgaagagtgtat
gi|98754 : catgcagttatccagtggtcgtattctcgccattttaaatttcgtctttcccctgaacataatagCATGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--C----G------T--T------T----AC---------C---C-TG--A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G-----C-C-----CC-A-CC-T-TCGA--CT-A--G-TCT---TTC-AC----CATTA-TA------------C--CA-GG-G--TG-T-CC-CTC-C-CG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-G--T-GTAT
gi|98755 : CATGC-A---C-G-A-T-CAG--T-GTGT------T-A-T----------T-----C---C--C----C------C--A------C----ATTACTAGATAC---C-TG-TA--G-AT-T--A-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-A-CC-T-TC-A--CC----GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-T-T-----C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98756 : CATGC-A-GGC-T-AAT-CAG--T-G-GTCT---GT-A-T----------T-----CGCCC--C----G------TC-A------T----ATT--------C---C-TG-TA--GTAT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-AT-GCTCC---CCC-A-----C---A-CA------------C--TC-ACAA--TG-T-CC-TCCGC-CC-A--C---A-T---G-C-A--C-G-A-T-CAG-
gi|98757 : CGTGC-A-A-T-C-A-T--AG----G-GT-----GT-A-T----------C-----CA--C--C----A------T--C------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C---T----C-A-G---C-C-C-----CC-GTCC-T-TC-A--CT-AGTGTCCC---TCC-AC----C---A-TA------------C--CC-AC-A--TG-TGTC-TTG-C-TT-AATC---ATT---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-
gi|98758 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------A-----C---C--C----A------TC-A------T----AC---------C---C-T--TA--G-A--T--G-A-CAA-T----C-A-G---C-CAC-----CC-G-CC-T-TC-A---C-A--G-TCC---TCCTAC----T---A-CA------------C--TC-A--A--TG-T-CC-TCC-C-CT-A--C---ATT---G-C-AGGC-T-A-T-CA--TG-G--G-GTAT
gi|98759 : CATGC-A-G-C-T-A-T-C-G--T-G-GTTGTTGAT-A-T----------T-----C---C--C----CACATTCT--AG-----T----AC---------C---C-CG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----C----CC-T-T--A--CC----GCTCC---TCC-AC----A---C-CA------------C--TC-AC-A--TG-T--C-TCC-C-CT-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98760 : CATGC-A---C-T-A-T-CAG----G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--CACA-G------T--A------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT------G-C-A-T----C-A-G---C-C-CA----CC-G-CC-T-AC-A--T------CTCC---TCT--C----C---A-CA------------CT-TC-AC-A--TG-T-CC-TCCTC-TC-AACC---A-T---G-C-A-GC-T-G-T-CAG-AT-G--T-GT
gi|98761 : CATGC-A-G-C-T-G-T-CAG--A-T-GT-----GTCACT----------T-----C---C--C----A------T--T------C----AT---------T---C-CA-TA----AT-T--G-A-C-A-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCCG--TCT-AT----C-----CA------------A--CC-AC-A--T--T-CC-TCC-C-CCAA--C---A-T---G-C-AGGC-TAA-T-CAG-TG-GTCT-GTAT
gi|98762 : CATGCCA-G-C-T-A-TTCAG--T-G-GT-----GT-A-T--------------------C--CAAAGG------T--A------T----AT---------C---CATG-TA--G-AT-TTAG-A---A-TA---C-A-G---G-C-C-----CC---CC-T-TC-A--CC-A--GCTCCGATTCC-AC----T---ACCA------------C--TA-TA-A--TGTT-CC-TCC-C-CC-A--CTTGA-T---G-C-A-GC-T-A-T-TAGCTGAG--T-GTAT
gi|98763 : CATGC-AAG-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT--------------T-----C---CATC----G------T--A------C---------------C---C-T--CA--G-ATAT--G-A-C-A-TT---C-A-G---G-C-C-----C--G-CC-T--C-A--CC-A--GTTCC-------AC----C---A-AT------------C--TC-AT-A--TG-T-CC-TTC-T-CC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-C
gi|98764 : CATGC-A-G-C-T-AAG-CAG--T-G-G------GT-AAT----------T-----C---C--C----A------T--A------TC---AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-G----C-------C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCT-------T-AC----C---A-CA------------CATTC-GC-ATTTG-T-CT-TCC-CTTT-A--C---A-TATCG-CAA-GG-T-G-T-CAG-
gi|98765 : CATGC-A-A-T-T-G-T-CAG--T-G-GG-----GT-A-T----------T-----C---A--CAT--G------T--G------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----TT-G-CC-T-TT-A--TC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--T
gi|98766 : CATGC-A-G-A-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------TCC---C---C--C----C------T--C------T----AC---------C---C-TG-T
gi|98767 : ATGC-A-G-C-TTA-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------T-----C---C--CCA--A------T--C------T----AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--C-A-C-A-T----CTA-G---C-C-C-----CCTG-CC-C-TC-A--CC-A--GTCCT---TCC-AC----C---T-CA------------C---C-AC-A--TT-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-
gi|98768 : ATGC-A-G-C-T-A-T-TAGC-T-GAGT-----GT-A-TA---------T-----C---C--C----G------G--A------TTCTCATT--------C---C-TG-TATAG-AT-C--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C--------A-CC-T--C-A--CCCG--GCTCC---TCC-AT----C---A-CA------------C--
gi|98769 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GC-A-T----------T-----C---C--C----G------T-----------------------------C----------AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-A-----TA-G-CC-T-TT-A--CC-A--GCTCC---TCC-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-AC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98770 : TGC-A-G-T-T-G-T-TAG--T-G-GT-----AT-A-T----------T-----C---C--C----G------TC-A------TT---AT---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----TC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCT-AC----C---A-CA------------C--TC-AC-A--TG-T-CC-TCT-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98771 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAA--T-G-GT-----GT-T-T----------T-----C---C--C----CCC----T--C------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-T-T----T-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCC---TCA-GC----T---A-TT------------C--TT-AT-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98772 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GT-----GT-A-T----------C-----A---T--C----G------TC-A------TC---AT---------C---T-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--CC-A--GCTCT---TCC-AC----C---A-TA------------C--GC-AC-A--TG-T-CC-TCT-A-TA-A--C---A-T---G-C-A-GC-T-A-T-CAG-AA-G--T-GCAT
gi|98773 : TGC-A-G-C-T-A-T-CAG--T-G-GTT----GC-A-A----------T-----C---C--C----G------T--AAT----C----ATG--------C---C-TG-TA--G-AT----G-ATC-A-T----C-A-G---C-C-C-----CC-G-CC-T-TC-A--AC-A--GCTTC----CC-ACG---C---A-CA------------C--TC-AC----TG-T--C-TCC-G-T--A--C---ATT---G-C-A-AC-T-A-T-CA--TG-G--T-GTAT
gi|98774 : TGC-A-GGC-T-A-T-CA---T-G-GG-----GT-A-TGATT------C-----C---C--C----C------T--C------T----AC---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-AAC-AGT----C-A-G---CGC-C-----CC-G-CCAT-TC----CC-A--GCTCC---ACC-AC----CT--A-C-------------C--TC-A--A---G-T-CC-TCG-C--C-A--CA--A-T---G-C-A-GCTT-A-T-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98775 : -A-G-G-T-G-T-CAG--T-GTGTTT---GT-A-C----------T-----C---C--C----A------T--A------TTT--ATTC-------C---C-AT-TA--GTAT-T--GGA-C-A-T----T-A-GT--C-C-C-----CC-G-CCTT-TC-A--CC-A--G-TCC---TCT-AC----C---A-CA------------C---C-AC-T--GG-T-CC-TCC-C-TT-A--C---A-T---GCC-A-GC-T-ATT-CAG-TG-G--T-GTAT
gi|98776 : -G-C-T-A-T-CAG--TTG-GT-----GT-G-TATTGTCAGTGT-----C---C--T----T------T--C------T----AA---------C---C-TTCTA--G-AT-T--GGA-C-A-TGA--C-A-G---C-A-CGGTGACC-C-AT-T-TC-AT-CC-A--GCTCC---TCC-AC----T---A-CAC-----------C--TCTAC-A--TG-T-CT-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-ATAT-A-T-CAG-
gi|98777 : -T-CAG--T-G-GA-----GA-A-T----------TG----C---C--C----C------T--T------T----AC---------C---C-TG--A--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-GGCCC-C-C-----CC-GCCC-T-TC-A---C-A--ACTCC----AC-AC----C---A-CAT-----------C--TC-AC-A--GG-T-CC-TCC----C-A--C---A-T---G-C-A--C-T-A-T-CAG--G-G--T-GTAT
gi|98778 : -----GT-A-C----------C-----C---C--C----A------T--A------T----AT---------C---C-TT-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-T-----CC-G-CA-T-TC-A--TC-A--GCTCC---TCC-AC----T---A-CA------------C--GC-AC-A--TC-T-CC-TCT-C-TT-A--C---A-T---G-C-A-GT-T-A-T-CAG-TG-G--T-GTA
gi|98779 : T---------C---C-TG-TA--G-AT-T--G-A-C-A-T----C-A-G---C-C-C-----CT-G-CC-T-TT-A--GC-A--ACTCC---TCC-GC----C---A-TA------------C--TA-AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TC-A--C---A-T---G-C-A-AT-T-A-T-CAG-TG-G--C-GTAT
gi|98780 : A--G-AT-T--G-A-C-A------C-ATG---C-C-T-----CT-T-TT-T-TC-A--GC-A--ACACC---TTC-AC----A---A-TA------------C--CC-AA-A--TT-T-CC-ATT-C-TC-A--C---A-A---G-C-G-GC-T-G-T-CAA-AG-G--T-GTAT
gi|98781 : -AC-A--TG-T-CC-TCC-C-TG-A--C---A-T---G-C-A-GC-A-G-T-AAG-AG-A--T-GTAT