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Reference ( gi|27531 )        :                                                  TGACAACTAGTAAA------C-------CATCG-A-T-TTG-----A-CAACTAGTAAATAG-T-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----C-------T----A-------A---------------TA-------A-------A-------C--------C-----A-T----CT-T--C-TT-----GA---C--A---AC--A-----AGTGA--ATA-----------G-TAAACCATCGTCTT---GAC--AACTAGTGA--GTAGTGA
gi|27511                      :                                                  TGATA--TAGTGAG------T-------TGTCT-A-T-TGG-----A-CAACTAGCGAATAA-T-GAGC-TATCACCT-----A---A------------------A-------G---------------TA-------A-------A----------------C-----A-T----TT-----------------------------------AGAGA--ATA-----------G-CGGACTGTCGCTTT---GAC--GACTAGCGA--ATAGTGA
gi|27510                      :                                          acttatagTGATA--TAGTGAG------T-------TGTCT-A-T-TGG-----A-CAACTAGCGAATAA-T-GAGC-TATCACCT-----A---A------------------A-------G---------------TA-------A-------A----------------C-----A-T----TT-----------------------------------AGAGA--ATA-----------G-CGGACTGTCGCTTT---GAC--GACTAGCGA--ATAGTGAgctgtccc
gi|27509                      :                                          acttatagTGATA--TAGTGAG------T-------TGTCT-A-T-TGG-----A-CAACTAGCGAATAA-T-GAGC-TATCACCT-----A---A------------------A-------G---------------TA-------A-------A----------------C-----A-T----TT-----------------------------------AGAGA--ATA-----------G-CGGACTGTCGCTTT---GAC--GACTAGCGA--ATAGTGAgctgtccc
gi|27552                      :                                          acttatagTGACAAACAGTGGG------C-------TGTCG-C-C-TAG-----A-CAACTGACAAACAG-T-GGAC-TGTCGCCTAGAC-A---A-----C-------C----A-------G---------------TG-------A-------A-------gctgtccc
gi|27550                      :                                           ggacaacTGACAAACAGTGGG------C-------TGTCG-C-C-TAG-----A-CAACTGACAAACAG-T-GGAC-TGTCGCCTAGAC-A---A-----C-------C----A-------G---------------TG-------A-------A-------ttgtaagctgt
gi|27551                      :                                    gttgcccggacaacTGACAAACAGTGGG------T-------TGTCG-C-C-TGG-----A-CAACTAGCAAACAG-T-AAAA-TGTTGCCCGGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------A-------C--------ttgtaagctgt
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gi|27538                      :                                                   GACAACTAGCAAA------C-------AGTAA-AAT-TTGCCCGGA-CAACTGACAAACAG-T-GGGC-TGTCGCCTAGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------A-------C--------tagtgaaccatc
gi|27534                      :                                  acagtggttgtcgcctgGACAACTAGCAAA------CAGTAATATATCG-C-C-CGG-----A-CAACTGACAAACAG-T-GGGC-TGTCG-CTAGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------C--------agtggactgtc
gi|27533                      :                                  acagtgggttgtcactgGACAACTAGCAAA------C-------AGTAA-AATGTTGCCCGGA-CAACTGACAAACAG-T-GGGC-TGTCGCCTAGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------A-------C--------agtaa
gi|27540                      :                                 acagtgggttgtcgcctgGACAACTAGCAAA------CAGTAATATATCG-C-C-CGG-----A-CAACTGACAAACAG-T-G-GC-TGTCCGCTAGACAA---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------C--------agtggactgtc
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gi|27539                      : tagtgaatagcgagctgtcccagacaattagtgaatagtgagctgtccctaaCAAC-AGTAAA------A-------TGTCG-C-C-CGG-----A-CAACTGACAAACAG-T-GGAC-TGTCGCCTGGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------C--------cc
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gi|27529                      :                                                   agtAAATAGTGAA------C-------CATCG-T-C-TTG-----A-CAACTAGTAAATAG-G-GAAC-CTTTG--TTGAC-A---A-----G-------T----A-------AATAG-----------TG-------A-------A-------C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACCATC
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gi|27518                      :                                                  tagtAAATAGTGAA------C-------TGTTG-C-A-TGG-----A-CAACTAGCGAATAG-T-GGAC-TGTCA-CTT--C-A---A-----C-------T----AGTGTATTG---------------TA-------T-------A-------C--------T-----A-T----C--G--C-TT-----GA---CCAA---AC--T-----AGTAAATATA-----------G-TGAGCTGTC
gi|27521                      :                                                  tagtAAATAGTGAA------C-------TGTTG-C-A-TGG-----A-CAACTAGCGAATAG-T-GGAC-TGTC--CTT--C-A---A-----C-------T----AGTGTATTG---------------TA-------T-------A-------C--------T-----A-T----C--G--C-TT-----GA---CCTA---AC--T-----AGT-A--ATA-----------
gi|27515                      :                                                  tagtAACTAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCtatgagctgtc
gi|27514                      : tagtgaatagcgagctgtcccagacaattagtgaatagtgagctgtccctaaaAACTAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCcc
gi|27528                      :   tagtgaaatagcgagctgtcccagacaattagtgaatagtgagctgtccctaaaTAGTAAA------C-------CATCG-T-C-TTG-----A-CAACTAGTGAGTAG-T-GAAT-CATCGTCCTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TAAAGAGTGA-------A-------C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--A-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACCATCcc
gi|27527                      :                                                   agtgaaTAGTAAA------C-------CATCG-T-C-TTG-----A-CAACTAGTGAGTAG-T-GAAT-CATCGTCCTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TAAAGAGTGA-------A-------C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--A-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACCATC
gi|27547                      :                                                   agtgaaTAGTGAA------T-------CATCG-T-C-CTG-----A-CAACTAGTAAAGAG-T-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----CAAG----T----A-------AATATATTTACTAATGTG-------A-------A-------C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G--GAACCATC
gi|27519                      :                                                         TAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAA-----A-CAACT-------AG-T-GAGC-TGTCCCCATGAC-A---A-----T-------T----A-------G---------------TG-------A-------ATAG----T--------G-----A-C----CT-T--C-TG-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAA--ACTGTCT
gi|27513                      :                                                  tagtgaaTAATAAA------C-------TGTT--A-T-TTG-----AACAACTAATAAATAG-T-GAAC-TGTCGTTTTGAC-A---A-----C-------A----A-------A---------------TA-------A-------A-------c
gi|27512                      :                          atagtgaaataatgcctggacagccaatgcaTAATAAA------C-------TGTT--A-T-TTG-----AACAACTAATAAATAG-T-GAAC-TGTCGTTTTGAC-A---A-----C-------A----A-------A---------------TA-------A-------A-------tattgagcatgtc
gi|27520                      :                          atagtgaaataatgcctggacagccaatgcaTAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAA-----A-CAACT-------AG-T-GAGC-TGTC-CCATGAC-A---A-----T-------T----A-------G---------------TG-------A-------ATAG----T--------G-----A-C----CT-T--C-TG-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAA--ACTGTCTtattgagcatgtc
gi|27545                      :                                                  tagtgaaTAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-AT-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-Tc
gi|27517                      :                                                         TAGCGGA------C-------TGTCG-C-T-TTG-----A-CGACTAGCGAATAG-T-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TT-------G-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-CGAGCTGTC
gi|27543                      :                                                  tagagaaTAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-AT-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAcc
gi|27544                      :                                                         TAGTGAG------C-------TGTCC-C-C-TAG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----C--C--C-AT-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAcct
gi|27522                      :                                                         TAGCGGA------C-------TGTCG-C-T-TTG-----A-CGACTAGCGAATAG-T-GAGC-TGTC-CCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------GT--------------TT-------G-------G-------C--------T-----GTT----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----A-TGA--ATA-----------G-CGAGCTGTCGCCTA---AAC--AAGTAGTTA--Gcct
gi|27537                      :                                                  tagagaaTAGTGAA------C-------TGTCG-T-T-TTG-----A-CAACAAATAAATAT-T-GAGCATGTCACCTGGGC-A---ATGCATT-------T----A-------G---------------TA-------A-------------------------------------CT-T--G-ATGCAAAGA---C--A---ACTTAT----AGTGAT-ATA-----------G-TGAGTTGTC-TATTG--GAC--AACTAGCGA--ATAATGActgttcc
gi|27536                      :                                                        aTAGTGAA------C-------TGTCG-T-T-TTG-----A-CAACAAATAAATAT-T-GAGCATGTCACCTGGGC-A---ATGCATT-------T----A-------G---------------TA-------A-------------------------------------CT-T--G-ATGCAAAGA---C--A---ACTTAT----AGTGAT-ATA-----------G-TGAGTTGTC-TATTG--GAC--AACTAGCGA--ATAATGAgctatc
gi|27546                      :                                                        aTAGTGAA------C-------TGTCG---T-TTG-----A-CAACAAATAAATAT-T-GAGCATGTCACCTGGGC-A---ATGCATT-------T----A-------G---------------TA-------A-------------------------------------------C-TT-----GATTGC--AAAGAC--ACTTATAGTGAT-ATA-----------G-TGAGTTGTC-TATTG--GAC--AACTAGCGA--ATAATGAgctatc
gi|27535                      :                                                          AGTGGA------C-------TGTCG-C-C-TAG-----A-CAACCAGTGAATTG-T-AAGC-TGTGATATTGAC-A---A-----G-------T----T-------G---------------TA-------A-------A-------T--------T-----G-T----CG-C--C-T-------A---G--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACTGTTGCATG---GAC--AACTAGCGA--ATAGTGgctatc
gi|27532                      :                                                        acAGTGGA------C-------TGTCG-C-C-TAG-----A-CAACCAGTGAATTG-T-AAGC-TGTGATATTGAC-A---A-----AG------T----T-------G---------------TA-------A-------A-------T--------T-----G-T----CG-C--C-T-------A---G--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACTGTTGCATG---GAC--AACTAGCGA--ATAGTGgactgtc
gi|27541                      :                                                        acAGTGGA------C-------TGTCG-C-C-TGG-----A-CAACTAGCAAACAG-TAAAAA-TGTCGCCCCGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------ACAGTGGTC--------T-----G-T----CG-C--C-TA-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAAgactgtcc
gi|27539                      :                                                        acAGTGGA------C-------TGTCG-T-C-TGG-----A-CA-CTAGCCAACAG-T-AAAA-TGTCGCCCGGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------AACAGTGGA-------C--------T-----G-T----CG-C--C-TG-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAatgt
gi|27524                      :                                                         acGTGAA------C-------CATCG-T-C-TTG-----A-CAACTAGTAAATAG-T-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----CAAG----TA---A-------A---------------TAGCG----A-------A-------C--------C-----A-T----CG-T--C-CT-----GA---A--A---ACT-A-----A---A--AGA-----------G-TGAACCATC
gi|27538                      :                                                                       tagtaatagTCG-C-C-TGG-----A-CAACTAGCAAACAG-T-AAAA-T-TTGCCCGGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------ACAGTGGGC--------T-----G-T----CG-C--C-TA-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGACTGTC
gi|27533                      :                                                                      acagtggttgTCG-C-C-TGG-----A-CAACTAGCAAACAG-T-AAAA-TGTTGCCCGGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------ACAGTGGGC--------T-----G-T----CG-C--C-TA-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGACTGTC
gi|27553                      :                                                                               acagtgggttgG-----A-CAACTAGTAAATAG---GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------ATAGGTGAA-------C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACCATC
gi|27542                      :                                                                                          G-----A-CAATTAGTGAATAG-C-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----G-------T----A-------G---------------TT-------A-------G-------C--------T-----G-T----TC-C--C-TA-----GA---T--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-CGAGCTGTC--CCA---GAC--AATTAGTGA--ATAGTGA
gi|27516                      :                                                                         tagttggctgtcccctaG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTC-CCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCgctgtccc
gi|27515                      :                                                                    tagtgaatagcgagctgtcccaG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTC--CCTAAA-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCcc
gi|27514                      :                                                                    tagtgaatagcgagctgtcccaG-----A-CAATTAGTGAATAG-T-GAGC-TGTC--CCTAAA-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCcc
gi|27552                      :                                                                   tagtgaaatagcgagctgtcccaG-----A-CAACTGACAAACAG-T-GGGC-TGTCGCCTAGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------AACAGTGGA-------C--------T-----G-T----CG-C--C-TA-----GA---C--A---AC--C-----AGTGA--ATT-----------G-TAAGCcc
gi|27550                      :                                                                                         gG-----A-CAACTGACAAACAG-T-GGGC-TGTCGCCTAGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------AACAGTGGA-------C--------T-----G-T----CG-C--C-TA-----GA---C--A---AC--C-----AGTGA--ATT-----------G-TAAGCtgt
gi|27534                      :                                                                                  gttgcccgG-----A-CAACTAGCAAACAG-T-AATA-TATCGCCCGGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------A-------C--------A-----G-TGGG-CTGTCGC-TA-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAtgt
gi|27540                      :                                                                         acagtgggttgtcactgG-----A-CAACTAGCAAACAG-T-AATA-TATCGCCCGGAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------ACAGTGG-C--------T-----G-T----CC-G--C-TA-----GA---CA-A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAA
gi|27523                      :                                                                                     acagtgggttgtcactgTAGTAAATAG-G-GAAC-CTTTGT--TGAC-A---A-----G-------T----A-------AATAG-----------TG-------A-------A-------C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACTAGTAA--ATAGTGA
gi|27524                      :                                                                                                      TAGTAA-TAGGT-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------A-------ATAGTGAAC--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--A-----AGTAA--ATA-----------G-CGAACCATCGTCCT---GAA--AACTAA-AA--G-AGTGAaccatc
gi|27519                      :                                                                                                      TAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-AT-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TG----ACCTTCTG---GAC--AACTAGCAA--ACAGTAAaccatc
gi|27520                      :                                                                                                      TAGTGAATAG-T-GAGC-TGTCCCCTAAAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----C--C--C-AT-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TG----ACCTTCTG---GAC--AACTAGCAA--ACAGTAAaactgtctc
gi|27518                      :                                                                                                      TAGTAAATAG-T-GAAC-TGTTGCATGGAC-A---A-----C-------TAGCGA-------A---------------TAGTG----G-------A-------C--------T-----G-T----C--A--C-TT----------C--A---AC--T-----AGTGT--ATT-----------G-TATACTATCG-CTT---GACCAAACTAGTAAATATAGTGAaactgtctc
gi|27521                      :                                                                                                      TAGTAAATAG-T-GAAC-TGTTGCATGGAC-A---A-----C-------TAGCGA-------A---------------TAGTG----G-------A-------C--------T-----G-T----C-----C-TT----------C--A---AC--T-----AGTGT--ATT-----------G-TATACTATCG-CTT---GACCTAACTAGTAA--gctgtc
gi|27525                      :                                                                                                       AGTAAATAG-T-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------A-------ATAGTGAAC--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--ATA-----------G-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACAAGTAA--ATAGTGAtatatgagctgtc
gi|27526                      :                                                                                                       AGTAAATAG-T-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------A-------ATAGGGAAC--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---A----------GTAA--ATA-----------G-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACTAGTAA--ATAGTGAaccatc
gi|27528                      :                                                                                                       AGTGAATAG-T-AAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----CTAGTGAGT----A-------G---------------TG-------A-------A-------T--------C-----A-T----CG-T--C-CT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--AGA-----------G-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACAAGTAA--ATAGTGAaccatc
gi|27527                      :                                                                                                       AGTGAATAG-T-AAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----CTAGTGAGT----A-------G---------------TG-------A-------A-------T--------C-----A-T----CG-T--C-CT-----GA---C--A---AC--T-----AGTAA--AGA-----------G-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACAAGTAA--ATAGTGAaccatc
gi|27529                      :                                                                                                       AGTAAATAG-T-GAAC-CATCGTCTTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------A-------A-------T--------AGGGA-A-C----CT-T--TGTT-----GA---C--A---A----------GTAA--ATA-----------G-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACTAGTAA--ATAGTGAaccatc
gi|27530                      :                                                                                                         TGAATAG-C-GAGC-TGTCGCCTAAAC-A---A-----G-------T----A-------G---------------TT-------A-------G-------C--------T-----G-T----TC-C--C-TA-----GA---T--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-CGAGCTGTC--CCA---GAC--AATTAGTGA--ATAGTGAaccatc
gi|27513                      :                                                                                                            ATAG-T-GAAA-TAATGCCTGGAC-A---G-----CCAATGCAT----A-------A---------------TA-------A-------A-------C--------T-----G-T----TA-T--T-TG-----AA---C--A---AC--T-----AATAA--ATA-----------G-TGAACTGTCGTTTT---GAC--AACAAATAA--ATATTGAgctgtccc
gi|27512                      :                                                                                                            ATAG-T-GAAA-TAATGCCTGGAC-A---G-----CCAATGCAT----A-------A---------------TA-------A-------A-------C--------T-----G-T----TA-T--T-TG-----AA---C--A---AC--T-----AATAA--ATA-----------G-TGAACTGTCGTTTT---GAC--AACAAATAA--ATATTGAgcatgtc
gi|27541                      :                                                                                                            ACAG-T-GGAC-TGTCGCCTGGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------CAGTAAAAAT-----G-T----CG-C--C-CC-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGTCTGTCGCCTA---GAC--AACTAGCAA--ACAGTAAgcatgtc
gi|27539                      :                                                                                                            ACAG-T-GGAC-TGTCGTCTGGAC-ACTAG-----C-------C----A-------ACAG------------TA-------A-------A-------A--------T-----G-T----CG-C--C-CG-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGACTGTCGCCTG---GAC--AACTAGCAA--ACAGTAAaatgt
gi|27533                      :                                                                                                            ACAG-T-GGGT-TGTCGCCTGGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------C--------AGTAAAA-T----GT-TGCC-CG-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGGCTGTCGCCTA---GAC--AACTGACAA--ACAGTG
gi|27547                      :                                                                                                             TAG-T-GAAT-CATCGTCCTGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------A-------AGAGTGAAC--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--A-----AGTAA--ATATATTTACTAATG-TGAACCATCGTCTT---GAC--AACTAGTAA--ATAGgactgtc
gi|27548                      :                                                                                                             TAG-T-GAGC-TGTCCCCATGAC-A---A-----T-------T----A-------G---------------TG-------A-------A-------T--------A-----G-TGAC-CT-T--C-TG-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAA--ACTGTCTCCCGGAC--AACTGACAA--ACAGTGgaaccatc
gi|27538                      :                                                                                                                          TCGCCTGGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------C--------A-----G-TAAAATT-TGCC-CG-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGGCTGTCGCCTA---GAC--AACTGACAA--ACAGTGgactgtc
gi|27534                      :                                                                                                                    acagtggttgCTGGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------CA-------A-------A-------CAGTAATA-T-----A-T----CG-C--C-CG-----GA---C--A---AC--T-----GACAA--ACA-----------G-TGGGCTGTCG-CTA---GAC--AACTAGCAA--ACAGTAAgactgtc
gi|27553                      :                                                                                                                   acagtgggttgtcaGAC-A---A-----C-------T----A-------G---------------TA-------A-------ATAGGAA-C--------C-----A-T----CG-T--C-TT-----GA---C--A---AC--T-----AGT-A--ATA-----------GGTGAACCATCGTCTT---GAC--AACTAGTAA--ATAGTGA
gi|27551                      :                                                                                                                                 GAC-A---A-----C-------T----G-------A---------------CA-------A-------A-------CAGTGGGT-T-----G-T----CG-C--C-TG-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAAAATGTTGCCCG---GAC--AACTGACAA--ACAGTGaccatc
gi|27545                      :                                                                                                                                        gttgcccg-------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCCCCTA---AAC--AACTAGTGA--Gggctgtc
gi|27543                      :                                                                                                                                                -------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCCCCTA---AAC--AACTAGTGA--Gctgtccccatgacaattagtgaatagt
gi|27544                      :                                                                                                                                                -------T----A-------G---------------TG-------A-------G-------C--------T-----G-T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCCCCTA---AAC--AACTAGTGA--Gctgtccccatgacaattagtgaatagtgacct
gi|27549                      :                                                                                                                                                                                                                             -T----CC-C--C-TA-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-CGAGCTGTCCCCTA---AAC--AAGTAGTTA--Gctgtcccatgacaattagtgaatagtgacct
gi|27540                      :                                                                                                                                                                                                                                   gctg--C-TG-----GA---C--A---AC--T-----AGCAA--ACA-----------G-TAATATATCGCCCG---GAC--AACTGACAA--ACAGTGctgttccctagataattagtgaaatagcgagctgtcccagacaattagtgaatagtgagctgtccc
gi|27517                      :                                                                                                                                                                                                                            acagtgggttgtca-TT-----GA---C--G---AC--T-----AGCGA--ATA-----------G-TGAGCTGTCCCCTA---AAC--AACTAGTgctgtccgctagacaaactagcaaacagtaa
gi|27516                      :                                                                                                                                                                                                                       tagagaatagcggactgtcgct-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTC-CCTA---AAC--AACTAGTGA--Gtggctgtcccctagacaattagtgaatagcgagctgtccc
gi|27514                      :                                                                                                                                                                                                                       tagtgaatagcgagctgtccca-----GA---C--A---AT--T-----AGTGA--ATA-----------G-TGAGCTGTC--CCT---AAA--AACTAGTGA--Gctgtcccctagacaattagtgaatagtgagctgtccc
gi|27515                      :                                                                                                                                                                                                                                            tagtgaaatagcgagctgtccca-----AGTGA--ATA-----------G-CGAGCTGTC--CCA---GAC--AATTAGTGA--ATAGTGActgtcccctagacaattagtgaatagtgagctgtccc





Alignments
lowQualScore                  :              11                                                     2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                              
lowQualScore                  :            2 88            33  1         0           44   3   4     3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 8888888 1   1   22   111 333    0 33   0      1   22  1   1                
lowQualScore                  :            . ..            ..  .         .           ..   .   .     ..................................................................................... . ....... .   .   ..   ... ...    . ..   .      .   ..  .   .                
lowQualScore                  :            0 22            00  0         9           88   9   5     8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 3333333 8   9   44   666 111    9 99   9      3   22  0   8                
consensus                     :         TGATAAATAGTGAACCGTCGCCTNGACAACTAGCGAATAGTGAGC-TGTCGCCTNGACAA-----C-------T-------A-------G-T--------A-------A-------A------------------C--------CG-T-------CGCCTNGAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAGCCGTCGCCTNGAC-AACTAGCGAATAGTGA
Reference ( family-402 )      :         TGACAACTAGTGAACTGTCGCCTNGACAACTAGCGAATAGTGAGC-CGTCGCCTNGACAA-----C-------T-------A-------G-T--------A-------A-------A------------------C--------CG-T-------CGCCTNGAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAACCGTCGCCTNGAC-AACTAGCGAATAGTGA
gi|27509                      :         TGATA--TAGTGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCT----AA---------------------A-------G-T--------A-------A-------A------------------C------------------------------ATT---T---AGAG-A--ATA-GCGGACTGTCGCTTTGAC-GACTAGCGAATAGTGA
gi|27510                      : acttatagTGATA--TAGTGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCT----AA---------------------A-------G-T--------A-------A-------A------------------C------------------------------ATT---T---AGAG-A--ATA-GCGGACTGTCGCTTTGAC-GACTAGCGAATAGTGAgctgtccc
gi|27511                      : acttatagTGATA--TAGTGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCT----AA---------------------A-------G-T--------A-------A-------A------------------C------------------------------ATT---T---AGAG-A--ATA-GCGGACTGTCGCTTTGAC-GACTAGCGAATAGTGAgctgtccc
gi|27512                      :                                     acttatagATAGTGAAA-TAATGCCTGGACAG-----CCAATGCAT-------A-------A-T--------A-------A-------A------------------C--------TG-T-------TATTTGAAC--AAC---T---AATA-A--ATA-GTGAACTGTCGTTTTGAC-AACAAATAAATATTGAgctgtccc
gi|27513                      :                                             ATAGTGAAA-TAATGCCTGGACAG-----CCAATGCAT-------A-------A-T--------A-------A-------A------------------C--------TG-T-------TATTTGAAC--AAC---T---AATA-A--ATA-GTGAACTGTCGTTTTGAC-AACAAATAAATATTGAgcatgtc
gi|27514                      :             AAATAGCGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CCTAAA-AA-----C-------T-------A-------G-T--------G-------A-------G------------------C--------TG-T-------CCCCTAGAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAGCTGTCgcatgtc
gi|27515                      :           tagtgTAGCGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CCTAAA-AA-----C-------T-------A-------G-T--------G-------A-------G------------------C--------TG-T-------CCCCTAGAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAGCTGTCcc
gi|27516                      :         tagtgaaTAGCGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CCTAAACAA-----C-------T-------A-------G-T--------G-------A-------G------------------C--------TG-T-------CCCCTAGAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAGCTGTCcc
gi|27517                      :         tagtgaaTAGCGGACTGTCGCTTTGACGACTAGCGAATAGTGAGC-TGTCCCCTAAACAA-----C-------T-------A-------G-T--------T-------G-------G------------------C--------TG-T-------CCCCTAGAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAGCTGTCcc
gi|27518                      :      tagagaaAAATAGTGAACTGTTGCATGGACAACTAGCGAATAGTGGAC-TGTCACTT---CAA-----C-------T-------AGTGTATTG-T--------A-------T-------A------------------C--------TA-T-------CG-CTTGACCAAAC---T---AGTA-AATATA-GTGAGCTGTCcc
gi|27519                      :                                   tagtTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCCTAAACAA-----C-------T-------A-------G-T--------G-------A-------G------------------C--------TG-T-------CCCCATGAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTG-ACCTT---CTGGAC-AACTAGCAAACAGTAA
gi|27520                      :                                       TAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCCTAAACAA-----C-------T-------A-------G-T--------G-------A-------G------------------C--------TG-T-------C-CCATGAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTG-ACCTT---CTGGAC-AACTAGCAAACAGTAAaactgtctc
gi|27521                      :             AAATAGTGAACTGTTGCATGGACAACTAGCGAATAGTGGAC-TGT--CCTT--CAA-----C-------T-------AGTGTATTG-T--------A-------T-------A------------------C--------TA-T-------CG-CTTGACCTAAC---T---AGT--A--ATATATGAGCTGTCaactgtctc
gi|27522                      :            tagtTAGCGGACTGTCGCTTTGACGACTAGCGAATAGTGAGC-TGTC-CCTAAACAA-----C-------T-------A-------GTT--------T-------G-------G------------------C--------TGTT-------CCCCTAGAC--AAT---T---A-TG-A--ATA-GCGAGCTGTCGCCTAAAC-AAGTAG
gi|27523                      :                                tagagaaTAGTAAATAGGGAAC-CTTTG--TTGACAA-----G-------T-------AAATA---G-T--------G-------A-------A------------------C--------CA-T-------CGTCTTGAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAACCATCGTCTTGAC-AACTAGTAAATAGTGAttagctgttcc
gi|27524                      :                  GTGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTCTTGACAA-----C-------A-------A-------G-T--------AAATAGCGA-------A------------------C--------CA-T-------CGTCCTGAA--AAC---T---A--A-A--AGA-GTGAACCATCaccatc
gi|27525                      :    tagtaatagAAATAGTGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTCTTGACAA-----C-------T-------A-------G-T--------AAATAGTGA-------A------------------C--------CA-T-------CGTCTTGAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAACCATC
gi|27526                      :          agtAAATAGTGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGGGAAC-CATCGTCTTGACAA-----G-------T-------AAATA---G-T--------G-------A-------A------------------C--------CA-T-------CGTCTTGAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAACCATC
gi|27527                      :             agtTAGTAAACCATCGTCTTGACAACTAGTGAGTAGTGAAT-CATCGTCCTGACAA-----C-------T-------A-------G-T--------AAAGAGTGA-------A------------------C--------CA-T-------CGTCTTGAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAACCATC
gi|27528                      :          agtgaaTAGTAAACCATCGTCTTGACAACTAGTGAGTAGTGAAT-CATCGTCCTGACAA-----C-------T-------A-------G-T--------AAAGAGTGA-------A------------------C--------CA-T-------CGTCTTGAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAACCATC
gi|27529                      :       agtgaaAAATAGTGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGGGAAC-CTTTG--TTGACAA-----G-------T-------AAATA---G-T--------G-------A-------A------------------C--------CA-T-------CGTCTTGAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAACCATC
gi|27530                      :                                        agtGAATAGCGAGC-TGTCGCCTAAACAA-----G-------T-------A-------G-T--------T-------A-------G------------------C--------TG-T-------TCCCTAGAT--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAGCTGT--CCCAGAC-AATTAGTGAATAGTGA
gi|27531                      :        tTGACAACTAGTAAACCATCGATTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTCTTGACAA-----C-------T-------A-------A-T--------A-------A-------A------------------C--------CA-T-------CTTCTTGAC--AAC---A---AGTG-A--ATA-GTAAACCATCGTCTTGAC-AACTAGTGAGTAGTGAgctgtccc
gi|27532                      :                 AGTGGACTGTCGCCTAGACAACCAGTGAATTGTAAGC-TGTGATATTGACAA-----AG------T-------T-------G-T--------A-------A-------A------------------T--------TG-T-------CGCCTAGA----AC---T---AGTA-A--ATA-GTGAACTGTTGCATGGAC-AACTAGCGAATAGTG
gi|27533                      :               acAGTGGGTTGTCGCCTGGACAACTAGCAAACAGTAAAA-TGTTGCCCGGACAA-----C-------TGACAAACA-------G-T--------G-------G-------G------------------C--------TG-T-------CGCCTAGAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGACTGTCgactgtcc
gi|27534                      :                                           acACAGTGGGT-TGTCAC-TGGACAA-----C-------T-------A-------G-C--------A-------A-------A------------------C--------AG-TAATATATCGCCCGGAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGGCTGTCG-CTAGAC-AACTAGCAAACAGTAA
gi|27535                      :                 AGTGGACTGTCGCCTAGACAACCAGTGAATTGTAAGC-TGTGATATTGACAA-----G-------T-------T-------G-T--------A-------A-------A------------------T--------TG-T-------CGCCTAG----AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAACTGTTGCATGGAC-AACTAGCGAATAGTG
gi|27536                      :              acTAGTGAACTGTCGTTTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACCTGGGCAA-----TGCATT--T-------A-------G-T--------A-------A-------C------------------T--------TG-A-------TGCAAAGAC--AAC---TTATAGTG-AT-ATA-GTGAGTTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGAgactgtc
gi|27537                      :               aTAGTGAACTGTCGTTTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACCTGGGCAA-----TGCATT--T-------A-------G-T--------A-------A-------C------------------T--------TG-A-------TGCAAAGAC--AAC---TTATAGTG-AT-ATA-GTGAGTTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGAgctatc
gi|27538                      :                                            aACAGTG-GT-TGTCGCCTGGACAA-----C-------T-------A-------G-C--------A-------A-------A------------------C--------AG-TAAAATT-TGCCCGGAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGGCTGTCGCCTAGAC-AACTGACAAACAGTGgctatc
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gi|27540                      :                                           acACAGTGGGT-TGTCAC-TGGACAA-----C-------T-------A-------G-C--------A-------A-------A------------------C--------AG-TAATATATCGCCCGGAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTG-GCTGTCCGCTAGACAAACTAGCAAACAGTAA
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Reference ( family-402 )      :                                                                                   TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGCGAATAGTGAGC-TGTCGCCTNGAC----AA-----C----------T-------A-------G-T--------A-------A-------A-------C--------CG-T-------CGCCTNGAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAGCCGTCGCCTNGAC-AACTAGCGAATAGTGA
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lowQualScore                  :                   3     5   11  0                     7    6  77777 9   9999 7777777 22222 000000000000000 7777777 22 9999999 8 111111  77777777 22 9 666666     6666   44   666 111    9 99   9     0 1   44  2   1                
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Reference ( family-402 )      :         TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGTGAATAGTGAGC-TGTCGCC-----TNGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGCCTN---GAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CCGTCGCCTGGAC-AACTAGCGAATAGTGA
gi|27509                      :         TGATA--TAG-TGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCTAAAGTAAAC----ATTTAGAGA-----A-------T-------A-------G--C-------G-G------AC--------T--G-T------CGCTTT---GAC--GAC---T---AGCG-A--ATA-GTGAG-CTGTC
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gi|27511                      : acttatagTGATA--TAG-TGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCTAAAGTAAAC----ATTTAGAGA-----A-------T-------A-------G--C-------G-G------AC--------T--G-T------CGCTTT---GAC--GAC---T---AGCG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27512                      :       acttatagATAG-TGAAATAATGCCTGGACAGCCAATGCATAATAAAC-TGTTATT-----TGAAC----A-------A-----C-------T-------AATAAATAG--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGTTTT---GAC--AAC---A---AATA-A--ATA-TTGAG-Ccc
gi|27513                      :               ATAG-TGAAATAATGCCTGGACAGCCAATGCATAATAAAC-TGTTATT-----TGAAC----A-------A-----C-------T-------AATAAATAG--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGTTTT---GAC--AAC---A---AATA-A--ATA-TTGAG-Catgtc
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gi|27515                      :       tagtgTGAATAG-CGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CC-----TAAA-----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27516                      :         tagTGAATAG-CGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27517                      :           tagAATAG-CGGACTGTCGCTTTGACGACTAGCGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------T-G------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAG-CTGTCcc
gi|27518                      :       tagagTAAATAG-TGAACTGTTGCATGGACAACTAGCGAATAGTGGAC-TGTCACT-----T---C----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------GTATTGTATAC--------T--A-T------CG-CTT---GACCAAAC---T---AGTA-AATATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27519                      :                                     tagTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGA--CCTT---CTGGAC-AACTAGCAAACAGTAA
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gi|27521                      :            TAAATAG-TGAACTGTTGCATGGACAACTAGCGAATAGTGGAC-TGT--CC-----TT--C----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------GTATTGTATAC--------T--A-T------CG-CTT---GACCTAAC---T---AGT--A--ATATATGAG-CTGTCaactgtctc
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gi|27524                      :           tagAATAGGTGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----CAAGTAAAT-------A-------G--C-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCCT---GAA--AAC---T---A--A-A--AGA-GTGAA-CCATC
gi|27525                      :        tagtTAAATAG-TGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----CTAGTAAAT-------A-------G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC
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gi|27533                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAA-T--G-T------TGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCGCCTAGAC-AACTGACAAACAGTGgactgtcc
gi|27534                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCAC------TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAATA-T--A-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCG-CTAGAC-AACTAGCAAACAGTAAgactgtc
gi|27535                      :               ACAG-TGGACTGTCGCCTAGACAACCAGTGAATTGTAAGC-TGTGATA-----TTGAC----A-------A-----G-------T-------T-------G--T-------A-A------AT--------T--G-T------CGCCTA---G----AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CTGTTGCATGGAC-AACTAGCGAATAGTG
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Alignments
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lowQualScore                  :                   3     4   33  0                     7    6  77777 9   9999 7777777 22222 111111111111111 7777777 22 9999999 8 111111  66666666 22 9 666666     6666   44   666 111    9 99   9     0 2   11      0                
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Reference ( family-402 )      :         TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGTGAATAGTGAGC-TGTCGCC-----TNGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGCCTN---GAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CCGTCGCCTGGAC-AACTAGCGAACAGTGA
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gi|27533                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAA-T--G-T------TGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCGCCTAGAC-AACTGACAAACAGTGgactgtcc
gi|27534                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCAC------TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAATA-T--A-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCG-CTAGAC-AACTAGCAAACAGTAAgactgtc
gi|27535                      :               ACAG-TGGACTGTCGCCTAGACAACCAGTGAATTGTAAGC-TGTGATA-----TTGAC----A-------A-----G-------T-------T-------G--T-------A-A------AT--------T--G-T------CGCCTA---G----AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CTGTTGCATGGAC-AACTAGCGAATAGTG
gi|27536                      :               ATAG-TGAACTGTCGTTTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACC-----TGGGC----A-------A-----TGCATT--T-------A-------G--T-------A-A------CT--------T--G-A------TGCAAA---GAC--AAC---TTATAGTG-AT-ATA-GTGAG-TTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGAgactgtc
gi|27537                      :               ATAG-TGAACTGTCGTTTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACC-----TGGGC----A-------A-----TGCATT--T-------A-------G--T-------A-A------CT--------T--G-A------TGCAAA---GAC--AAC---TTATAGTG-AT-ATA-GTGAG-TTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGAgctatc
gi|27538                      :                                              ACAGTG-GT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------AC--------A--G-TAAAATTTGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCGCCTAGAC-AACTGACAAACAGTGgctatc
gi|27539                      :                                              ACAGTGGAC-TGTCGTC-----TGGAC----A-------------C-------T-------A-------G--C-------C-A------ACAGTAAAA-T--G-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGA-CTGTCGCCTGGAC-AACTAGCAAACAGTAAgactgtc
gi|27540                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCAC------TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAATA-T--A-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTG-G-CTGTCCGCTAGACAAACTAGCAAACAGTAA
gi|27541                      :                                              ACAGTGGAC-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAAAT--G-T------CGCCCC---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGT-CTGTCGCCTAGAC-AACTAGCAAACAGTAA
gi|27542                      :                TAG-TTGGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGCGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----G-------T-------A-------G--T-------T-A------GC--------T--G-T------TCCCTA---GAT--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAG-CTGT--CCCAGAC-AATTAGTGAATAGTGAaatgt
gi|27543                      :                TAG-TGAGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAgctgtccc
gi|27544                      :                TAG-TGAGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------C-CCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAcct
gi|27545                      :                TAG-TGAGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTcct
gi|27546                      :                TAG-TGAACTGTCG-TTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACC-----TGGGC----A-------ATGCATT-------T-------A-------G--T---------A------AC--------TTGA-T------TGCAAA---GAC---ACTTAT---AGTG-AT-ATA-GTGAG-TTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGA
gi|27547                      :                TAG-TGAATCATCGTCCTGACAACTAGTAAAGAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----C-------A-------A-------G--T-------A-A------ATA-------T--A-T----------TT---------AC---T---AATG---------TGAA-CCATCGTCTTGAC-AACTAGTAAATAGgctatc
gi|27548                      :                                               TAGTGAGC-TGTCCCC-----ATGAC----A-------A-----T-------T-------A-------G--T-------G-A------AT--------A--G-T------GACCTTCTGGAC--AAC---T---AGCA-A--ACA-GTAAAACTGTCTCCCGGAC-AACTGACAAACAGTGgaaccatc
gi|27549                      :                        CTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGCGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----G-------T-------A-------G--T-------T-A------GC--------T--G-T------TCCCTA---GAT--AAT---T---AGTGAA--ATA-GCGAG-CTGT--CCCAGAC-AATTAGTGAATAGTGAgactgtc
gi|27550                      :                         gGTTGCCCGGACAACTGACAAACAGTGGGC-TGTCGCC-----TAGAC----A-------A-----C-------TGACAAACA-------G--T-------G-G------AC--------T--G-T------CGCCTA---GAC--AAC---C---AGTG-A--ATT-GTAAG-CTGTgctgtccc
gi|27551                      :                          GTTGCCCGGACAACTGACAAACAGTGGGT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAA-T--G-T------TGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTC
gi|27552                      :                                  GACAACTGACAAACAGTGGGC-TGTCGCC-----TAGAC----A-------A-----C-------TGACAAACA-------G--T-------G-G------AC--------T--G-T------CGCCTA---GAC--AAC---C---AGTG-A--ATT-GTAAG-CTGT
gi|27553                      :                                 gGACAACTAGTAAATAG-GAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--TAATAGGTG-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC


blockSeqs                     :                   G     T   TA  G                     A    A  TAAAG A   AAGT TTTAGAG TGCAT TAGTAAAT        ATAAATA TT AATAGGT T TTGTAT  AGTAAAAA TG   AAAATT     TCTG   CA   TTA TAT      AT           T   GC      A
blockSeqs                     :                   .     T   TA  G                     A    A  TAAAG A   .    TTTAGAG .     AAGTAAAT        ATAAATA .  .       T TTGTAT  AGTAAAA  .    .          T      CT   .   TAT      T            T   GT      .
blockSeqs                     :                   .     T   GC  G                     A    A  .     G   .    .       .     TAGTAAAT        AATA    .  .       . .       AGTAATA  .    .          T      .    .   .        T            T   GC      .
blockSeqs                     :                   .     T   GC  G                     .    A  .     G   .    .       .     TAGTAAAG        .       .  .       . .       AGTAAAA  .    .          T      .    .   .        T            T   GC      .
blockSeqs                     :                   .     T   GC  A                     .    C  .     A   .    .       .     TAGTAAAG        .       .  .       . .       AGTAATA  .    .          T      .    .   .        .            T   GC      .
blockSeqs                     :                   .     T   GC  A                     .    A  .     A   .    .       .     TGACAAAC        .       .  .       . .       AGTAAAA  .    .          A      .    .   .        .            T   TA      .
blockSeqs                     :                   .     T   GC  A                     .    C  .     A   .    .       .     TGACAAAC        .       .  .       . .       A        .    .          A      .    .   .        .            T   TA      .
blockSeqs                     :                   .     T   GC  T                     .    C  .     A   .    .       .     GCATTT          .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            C   GC      .
blockSeqs                     :                   .     T   GT  G                     .    G  .     A   .    .       .     GCATTT          .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            C   GC      .
blockSeqs                     :                   .     T   GT  G                     .    G  .     A   .    .       .     GT              .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T   CG      .
blockSeqs                     :                   .     T   GT  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T   GC      .
blockSeqs                     :                   .     C   GT  T                     .    G  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C   TA      .
blockSeqs                     :                   .     C   GT  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C   GT      .
blockSeqs                     :                   .     C   GT  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            C   TC      .
blockSeqs                     :                   .     C   GA  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C   C       .
blockSeqs                     :                   .     C   GC  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C   G       .
blockSeqs                     :                   .     C   GC  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C   C       .
blockSeqs                     :                   .     C   GT  T                     .    A  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C   C       .
blockSeqs                     :                   .     C   GT  T                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T   .       .
blockSeqs                     :                   .     T   CC  A                     .    A  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C            
blockSeqs                     :                   .     T   CC  A                     .    A  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   CC  T                     .    A  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   CC  T                     .    A  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   GT  A                     .    G  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   CC  A                     .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          G      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   GC  A                     .    A  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          G      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   GC  A                     .    G  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     T   G   T                     .    C  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                   .     C   G   T                     .    C  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                         T   .   A                     .    C  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          G      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                             .   G                     .    C  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          G      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                             .   G                     .    A  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          G      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                                                       .    G  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          C      .    .   .        .            C            
blockSeqs                     :                                                       .    C  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                                                       .    C  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                                                       .    G  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                                                       .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                                                       .    G  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .            T            
blockSeqs                     :                                                       .    G  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .            C            
blockSeqs                     :                                                       .    .  .     A   .    .       .     A               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .                         
blockSeqs                     :                                                       .    .  .     G   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .                         
blockSeqs                     :                                                       .    .  .     A   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          G      .    .   .        .                         
blockSeqs                     :                                                       .    .  .     T   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          A      .    .   .        .                         
blockSeqs                     :                                                       .    .  .     .   .    .       .     T               .       .  .       . .       .        .    .          T      .    .   .        .                         


blockSeqCons                  :                                                               *****          *******                                                                                                                       GC
originalCons                  :         TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGTGAATAGTGAGC-TGTCGCC-----TNGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGCCTN---GAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CCGTCGCCTGGAC-AACTAGCGAACAGTGA
finalCons                     :         TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGTGAATAGTGAGC-TGTCGCC-----TNGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGCCTN---GAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CCGTCGCCTGGAC-AACTAGCGAACAGTGA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                            111111111111111                              11111111                                                                                    
lowQualScore                  :                   1     1   33  1                     2    4  66666 1   1111 8888888 22222 777777777777777 7777777 11 2222222 1 555555  88888888 11 0 222222     2222   22   111 333    0 33   0     1 1   44      2                
lowQualScore                  :                   .     .   ..  .                     .    .  ..... .   .... ....... ..... ............... ....... .. ....... . ......  ........ .. . ......     ....   ..   ... ...    . ..   .     . .   ..      .                
lowQualScore                  :                   3     4   33  0                     7    6  77777 9   9999 7777777 22222 111111111111111 7777777 22 9999999 8 111111  66666666 22 9 666666     6666   44   666 111    9 99   9     0 2   11      0                
consensus                     :         TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGTGAATAGTGAGC-TGTCGCC-----TNGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGCCTN---GAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CCGTCGCCTGGAC-AACTAGCGAACAGTGA
Reference ( family-402 )      :         TGATAAATAG-TGAACCGTCGCCTNGACAACTAGTGAATAGTGAGC-TGTCGCC-----TNGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGCCTN---GAC--AAC---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CCGTCGCCTGGAC-AACTAGCGAACAGTGA
gi|27509                      :         TGATA--TAG-TGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCTAAAGTAAAC----ATTTAGAGA-----A-------T-------A-------G--C-------G-G------AC--------T--G-T------CGCTTT---GAC--GAC---T---AGCG-A--ATA-GTGAG-CTGTC
gi|27510                      : acttatagTGATA--TAG-TGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCTAAAGTAAAC----ATTTAGAGA-----A-------T-------A-------G--C-------G-G------AC--------T--G-T------CGCTTT---GAC--GAC---T---AGCG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27511                      : acttatagTGATA--TAG-TGAGTTGTCTATTGGACAACTAGCGAATAATGAGC-TATCACCTAAAGTAAAC----ATTTAGAGA-----A-------T-------A-------G--C-------G-G------AC--------T--G-T------CGCTTT---GAC--GAC---T---AGCG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27512                      :       acttatagATAG-TGAAATAATGCCTGGACAGCCAATGCATAATAAAC-TGTTATT-----TGAAC----A-------A-----C-------T-------AATAAATAG--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGTTTT---GAC--AAC---A---AATA-A--ATA-TTGAG-Ccc
gi|27513                      :               ATAG-TGAAATAATGCCTGGACAGCCAATGCATAATAAAC-TGTTATT-----TGAAC----A-------A-----C-------T-------AATAAATAG--T-------G-A------AC--------T--G-T------CGTTTT---GAC--AAC---A---AATA-A--ATA-TTGAG-Catgtc
gi|27514                      :             AAATAG-CGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CC-----TAAA-----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CTGTCatgtc
gi|27515                      :       tagtgTGAATAG-CGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CC-----TAAA-----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27516                      :         tagTGAATAG-CGAGCTGTC--CCAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTC-CC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27517                      :           tagAATAG-CGGACTGTCGCTTTGACGACTAGCGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------T-G------GC--------T--G-T------CCCCTA---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAG-CTGTCcc
gi|27518                      :       tagagTAAATAG-TGAACTGTTGCATGGACAACTAGCGAATAGTGGAC-TGTCACT-----T---C----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------GTATTGTATAC--------T--A-T------CG-CTT---GACCAAAC---T---AGTA-AATATA-GTGAG-CTGTCcc
gi|27519                      :                                     tagTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGA--CCTT---CTGGAC-AACTAGCAAACAGTAA
gi|27520                      :                                        TAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------C-CCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGA--CCTT---CTGGAC-AACTAGCAAACAGTAAaactgtctc
gi|27521                      :            TAAATAG-TGAACTGTTGCATGGACAACTAGCGAATAGTGGAC-TGT--CC-----TT--C----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------GTATTGTATAC--------T--A-T------CG-CTT---GACCTAAC---T---AGT--A--ATATATGAG-CTGTCaactgtctc
gi|27522                      :           tagAATAG-CGGACTGTCGCTTTGACGACTAGCGAATAGTGAGC-TGTC-CC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------GTTT-------G--------GC--------T--GTT------CCCCTA---GAC--AAT---T---A-TG-A--ATA-GCGAG-CTGTCGCCTAAAC-AAGTAG
gi|27523                      :       tagagTAAATAG-GGAACCTTTG--TTGACAA---GTAAATAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----CTAGTAAAT-------A-------G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATCttagctgttcc
gi|27524                      :           tagAATAGGTGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----CAAGTAAAT-------A-------G--C-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCCT---GAA--AAC---T---A--A-A--AGA-GTGAA-CCATC
gi|27525                      :        tagtTAAATAG-TGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----CTAGTAAAT-------A-------G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC
gi|27526                      :          agTAAATAG-TGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGGGAAC-CATCGTC-----TTGACAAGTA-------A-----A-------T-------A-------G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC
gi|27527                      :          agTGAATAG-TAAACCATCGTCTTGACAACTAGTGAGTAGTGAAT-CATCGTC-----CTGAC----A-------A-----C-------TAGTAAAGA-------G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC
gi|27528                      :          agTGAATAG-TAAACCATCGTCTTGACAACTAGTGAGTAGTGAAT-CATCGTC-----CTGAC----A-------A-----C-------TAGTAAAGA-------G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---A---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC
gi|27529                      :          agTAAATAG-TGAACCATCGTCTTGACAACTAGTAAATAGGGAAC-CTTTG-------TTGAC----A-------A-----G-------T-------AAATA---G--T-------G-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC
gi|27530                      :                                         agTGAATAGCGAGC-TGTCGCC-----TAAAC----A-------A-----G-------T-------A-------G--T-------T-A------GC--------T--G-T------TCCCTA---GAT--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAG-CTGT--CCCAGAC-AATTAGTGAATAGTGA
gi|27531                      :         TGACAACTAG-TAAACCATCGATTTGACAACTAGTAAATAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----C-------T-------A-------A--T-------A-A------AC--------C--A-T------CTTCTT---GAC--AAC---A---AGTG-A--ATA-GTAAA-CCATCGTCTTGAC-AACTAGTGAGTAGTGAgctgtccc
gi|27532                      :               ACAG-TGGACTGTCGCCTAGACAACCAGTGAATTGTAAGC-TGTGATA-----TTGAC----A-------A-----AG------T-------T-------G--T-------A-A------AT--------T--G-T------CGCCTA---GA----AC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CTGTTGCATGGAC-AACTAGCGAATAGTG
gi|27533                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAA-T--G-T------TGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCGCCTAGAC-AACTGACAAACAGTGgactgtcc
gi|27534                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCAC------TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAATA-T--A-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCG-CTAGAC-AACTAGCAAACAGTAAgactgtc
gi|27535                      :               ACAG-TGGACTGTCGCCTAGACAACCAGTGAATTGTAAGC-TGTGATA-----TTGAC----A-------A-----G-------T-------T-------G--T-------A-A------AT--------T--G-T------CGCCTA---G----AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CTGTTGCATGGAC-AACTAGCGAATAGTG
gi|27536                      :               ATAG-TGAACTGTCGTTTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACC-----TGGGC----A-------A-----TGCATT--T-------A-------G--T-------A-A------CT--------T--G-A------TGCAAA---GAC--AAC---TTATAGTG-AT-ATA-GTGAG-TTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGAgactgtc
gi|27537                      :               ATAG-TGAACTGTCGTTTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACC-----TGGGC----A-------A-----TGCATT--T-------A-------G--T-------A-A------CT--------T--G-A------TGCAAA---GAC--AAC---TTATAGTG-AT-ATA-GTGAG-TTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGAgctatc
gi|27538                      :                                              ACAGTG-GT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------AC--------A--G-TAAAATTTGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTCGCCTAGAC-AACTGACAAACAGTGgctatc
gi|27539                      :                                              ACAGTGGAC-TGTCGTC-----TGGAC----A-------------C-------T-------A-------G--C-------C-A------ACAGTAAAA-T--G-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGA-CTGTCGCCTGGAC-AACTAGCAAACAGTAAgactgtc
gi|27540                      :                                              ACAGTGGGT-TGTCAC------TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAATA-T--A-T------CGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTG-G-CTGTCCGCTAGACAAACTAGCAAACAGTAA
gi|27541                      :                                              ACAGTGGAC-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAAAT--G-T------CGCCCC---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGT-CTGTCGCCTAGAC-AACTAGCAAACAGTAA
gi|27542                      :                TAG-TTGGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGCGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----G-------T-------A-------G--T-------T-A------GC--------T--G-T------TCCCTA---GAT--AAT---T---AGTG-A--ATA-GCGAG-CTGT--CCCAGAC-AATTAGTGAATAGTGAaatgt
gi|27543                      :                TAG-TGAGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAgctgtccc
gi|27544                      :                TAG-TGAGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------C-CCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTGAcct
gi|27545                      :                TAG-TGAGCTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGTGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--T-------G-A------GC--------T--G-T------CCCCAT---GAC--AAT---T---AGTG-A--ATA-GTcct
gi|27546                      :                TAG-TGAACTGTCG-TTTGACAACAAATAAATATTGAGCATGTCACC-----TGGGC----A-------ATGCATT-------T-------A-------G--T---------A------AC--------TTGA-T------TGCAAA---GAC---ACTTAT---AGTG-AT-ATA-GTGAG-TTGTCTATTGGAC-AACTAGCGAATAATGA
gi|27547                      :                TAG-TGAATCATCGTCCTGACAACTAGTAAAGAGTGAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----C-------A-------A-------G--T-------A-A------ATA-------T--A-T----------TT---------AC---T---AATG---------TGAA-CCATCGTCTTGAC-AACTAGTAAATAGgctatc
gi|27548                      :                                               TAGTGAGC-TGTCCCC-----ATGAC----A-------A-----T-------T-------A-------G--T-------G-A------AT--------A--G-T------GACCTTCTGGAC--AAC---T---AGCA-A--ACA-GTAAAACTGTCTCCCGGAC-AACTGACAAACAGTGgaaccatc
gi|27549                      :                        CTGTCCCCTAGACAATTAGTGAATAGCGAGC-TGTCCCC-----TAAAC----A-------A-----G-------T-------A-------G--T-------T-A------GC--------T--G-T------TCCCTA---GAT--AAT---T---AGTGAA--ATA-GCGAG-CTGT--CCCAGAC-AATTAGTGAATAGTGAgactgtc
gi|27550                      :                         gGTTGCCCGGACAACTGACAAACAGTGGGC-TGTCGCC-----TAGAC----A-------A-----C-------TGACAAACA-------G--T-------G-G------AC--------T--G-T------CGCCTA---GAC--AAC---C---AGTG-A--ATT-GTAAG-CTGTgctgtccc
gi|27551                      :                          GTTGCCCGGACAACTGACAAACAGTGGGT-TGTCGCC-----TGGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--C-------A-A------ACAGTAAAA-T--G-T------TGCCCG---GAC--AAC---T---GACA-A--ACA-GTGGG-CTGTC
gi|27552                      :                                  GACAACTGACAAACAGTGGGC-TGTCGCC-----TAGAC----A-------A-----C-------TGACAAACA-------G--T-------G-G------AC--------T--G-T------CGCCTA---GAC--AAC---C---AGTG-A--ATT-GTAAG-CTGT
gi|27553                      :                                 gGACAACTAGTAAATAG-GAAC-CATCGTC-----TTGAC----A-------A-----C-------T-------A-------G--TAATAGGTG-A------AC--------C--A-T------CGTCTT---GAC--AAC---T---AGTA-A--ATA-GTGAA-CCATC