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lowQualScore                  :    .   .  ...     .  .. ....... .. ...  . .. . .....  .. .   . .  .. ................  .  .....  ................................ . ............  .. . .  ........ . . .. .. ..   ....  .... . ....   ........ ... ..... . . . ..  ... ..... . ....   ...     .........   .        .. .   ..... ..        
lowQualScore                  :    2   3  000     2  99 2222222 77 111  1 66 3 99999  77 1   1 2  55 4444444444444444  1  77777  88888888888888888888888888888888 0 000000000000  33 0 0  44444444 9 8 22 22 22   0000  3333 9 9999   11111111 111 66666 8 9 9 44  000 55555 9 3333   444     888888888   0        44 0   66666 44        
consensus                     : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGCG-G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
Reference ( gi|80462 )        : CTACATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAT---G-A----TTA--------T---C--T--G-C-T-C--AGCT-G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80464                      : CTATGTG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------A------CA-TT-----TA------------T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--TCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGCT-GAAATTA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----G--ATTTAATA
gi|80465                      : CTATATG-TAA--TTTCA-TA--G-------C--G---TA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--T--G-C-C-T--AGCG-G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCCCTG--C-GTT-----A--ATTTAAT
gi|80468                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-C--T-A-----CA--T-GCA-C-TA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------CA-T------------TG--C-A-TG--------A-T-A--T--T--CCT----GGC---G-A----TTA--------T---C--G--A-C-T-C--AGCT-G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTTAAT-TTT-----A--ATTTAATA
gi|80463                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-A-----CA--T-GCA-C-CA--G---------C------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--C-T-TG--------A-C-A--T--T--CCT----GAC---G-A----CTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGCG-G----CA-A-A--TCG--GCTAGA---------AA---TTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80467                      : CTATATA-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GTA-C-CA--A---------T------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---T--G--G-C-T-T--AGCA-A----CA-A-G--TTG--GCTTGA---------AAC-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATT
gi|80469                      : CTATATG-AA---TTTCA-TAT-G-------T--A---CA-C--T-A-----CA--T-GCA-C-TA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------CA-T------------TG--C-A-TG--------A-T-A--T--T--CCT----G-C---G-A----TTA--------T---C--G--A-C-T-C--AGCT-G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACT
gi|80471                      : CTACTTG-GAA--TTTCA-TA--T-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GTA-C-CA--A---------A------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TATAC-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-T--AGCA-G----TA-A-A--TCG--GCTACA---------ACA-TTTCACTC--C-GAT-----A--ATT
gi|80470                      : CTGTATG-AA---TTTCA-CA--G-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-ACA-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA------------T------------------TG-T------------TG--C-A-TA----------T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGAG-G----CATA-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTC-----A--ATCTAATA
gi|80472                      : CTATATG-AAA--TTTCA-AA--G-------T--A---CA-TATT-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------CGACTAGTA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--A--A-C-A-C--AGAG-G----TG-A-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80474                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TATAG-------T--A---TA-T--T-A-----CA--T-CCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA------------T------------------CA-T------------CA--C-A-TA--------A-C-A--T--T--CCT----GAT---G-A----TTG--------T---T--G--G-C-T-C--AGAG-G----TA-A-A--ACG--TCTAG-----------------CACTG--C-GTGA----A--ATCTAATA
gi|80473                      : CTATATA-AAA--TTTCA-CA--A-------T--G---TA-T--A-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----TG------------T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-T--T--T--CCA----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--CGC------------G--T-----CCAGA---------CAA-TTTCGGTC--C-GTT-----A--ATTTGATA
gi|80466                      : CTATATGTAAA--TTTCA-TA--GC------T--G---TA-T--T-G-----CC--A-GCATC-CA--AT--------C------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--C-GGTA--------A-T-A--T--T--CCTT---GAC---G-A----TTA--------TAT-C--T--GAC-C-T--AGCG-G----CA-AAG--TCG--GCTAGA---------AAA-TTCCCCTG--C--TT-----A--ATTTA
gi|80475                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---TA-T--T-G-----TA--T-GTA-C-CA--A---------A------TA-TC-----TA------------A------------------TG-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------TAGGC--T--G---T-G--GGAT-A-----A-A-A--T-G--TCTAGA---------AAA-TCTCAGAT--C-GTT-----G--ATTAAA
gi|80477                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--------------T-GCA-C-CATGT---------C------CATTC-----TA------------TA-----------------TA-T------------TA--T-A-TATCATATGTA-T-A--T--T--TAT----GAC---T-A----TTA--------T---C-----G-C-T-C-------G----AA-A-A--GCG--AATAGA---------AAA-TTTCACTA--C-GTT-----A--ATTTAATA
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gi|80478                      : CTGTATG-AAA--TTTTA-TA--G-------C--A---CA-T--T-C-----CA--T-GCA-T--A--G---------C------CA-TC-----T-------------------------------------------------------------------------T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGC-----------------------AGC---------AAA-TTTCACTC--T-CTT-----A--ATTTAACA
gi|80480                      : CTATATG-AAAACTGTCA--A--G-------T--C---CA-T--T-G-----CAA-T-GCA-C-CA--A----------------CA-TC-----TA------------TATAAATTATATTATTATATA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-AATT--T--TCT----GAC---T-A----CTAAAAGTATTT---C--G--G-C-T-C--AGC--G----GA-A-A--CCG--AAT-GA---------AAA-TTTTA
gi|80481                      :  TATATG-AAA--TT-CA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--TTACA-C-CA--A---------C------CA-TGATA--TA------------TA-----------------TA-TG-----------TA--T-GGTA--------A-T-A--T--T--TCT----GAT-----A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGC--G----AA-A-G--CCG--AATAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80482                      :  TATATG-AAA--TTTCA-CA--GACAGTATT--AAATCA-T--TAG-----TA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----GA------------T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTT--------T---T--G--G-C-G-TAAAGGT-G----AA-A-----CG--TCTGGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----AATATTTAA
gi|80484                      :   ATATG-AA----TTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-------A---------C------CA-TC-----TAATA---------TA-----------------TA-T------------TA--T-G-TA--------A-T-A--T------------GAT---G-ACTATTTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGCG-G----AA-A-G--CCG--ATAAGA---------AAA-TTTCACTC--CAGTT--------ATTTAATA
gi|80491                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------TCGGC--TCGG-C-T-C--AGCT-G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80492                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA------------T-------------------A-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---CGCTCGG-C-T-C--AGCT-G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80485                      :     ATG-AAA--TTCCA-TA--G-------G--A---CA-T--T-GGCTTGCA--C-ACA-C-CA--A---------C------CA-TC-----AA------------T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A---A--T--TATCCT----GAG---G-A----TTA--------T---C--T--G-A-T-C--AGCT-G----TA-A-A--TCT--GCTTG----------AAA-TTTCACTC--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80487                      :    tATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T--TA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA------------T------------------CA-TATTATATATCAATA--C-G-TA--------A-T-A--T--T--TCTTG--GAC---T-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGCTGG----AA-A-G--CCG--AATGAA---------TAT-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80488                      :    tATG-AA---TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--TTG-----CA--T--TA-CGCA--A---------CG-----CA-TC-----TAATATATTATATAT------------------CA-A------------TA--C-G-TA--------A-T-A--T--T--TCT----GAC---T-A----TTA--------TT--C--G--G-C-T----AGCT-G----GA-A-G--CCG--AACGAA---------TAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80486                      :    tATG-ATA--TTTCT-AA--G-------T--C---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-C---A---------C------CA-TC-----CA------------T------------------TATT------------TA--C-T-TA--------A-T-A--T-------T----GGC---G-A------A---------------T--G-----C--AGCG-G----TA-A-A--TCG--CATAG----------AAA-TTTCACTT--C-GTTAACGAA--ATTTAATA
gi|80490                      :    tATG-AAT--TATCA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GTA-C--G--A---------C-----------------------------------------------------------------TA--C-A-TA---------------------CCT----GAG---G-A----TTA--------T---C--G--A-C-C-C--AGAG-G----TA-A-A--T-G--TCTATA---------ACA-TTTCAATT--C-GTT-----A--AT
gi|80483                      :     tTG-AAA--TATTA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TA-----TA------------T------------------AA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--T--ACT----GAC---G-A----TCA--------T---C--G--G-C-T-C--AAAG-G----TA-A-A--CCC--CCTAGA---------AAA-T
gi|80489                      :  tatcTG-GAG--CTCCA-CA--G-------T------TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA------------T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--TACA--CCT----GAC---A-A----TCA--------
gi|80493                      :      tg-AAA--TTTCAATA--A-------A--A---CA-T--T-A-----CG--T-A-A-C-CA--A---------C------CA-TT-----TA------------T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGCA-G----CA-A-G--TCG--GTTAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTACTAgagggggatccggttagaa
gi|80479                      :        -AAA--TTTCA-TA--G-------T------CG-T--T-G-----CA--T-GCA-CTCA--A---------C------CA-TC-----TG------------T------------------CA-A------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CT------ATACGG-A----TAA--------T---C-----G-CTT-C--AGAT-G----C
gi|80494                      :        ctataagaTCA-CA--G-------T--A---TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA------------T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--A--CCT----GAC---A-A----TCA--------caaa
gi|80495                      :                     A--G-------T--A---TAAT--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--AATACTAGTACATGTTGTA-TC-----TA------------T------------------AA-T------------CA--C-A-TG--------A-T-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TTA--------T---C--G--G-C-T-C--AGAG-G----TA-A-A--ACG--GCTAGA---------AAA-TCTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80496                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TCC----TA------------T-------------------A-T------------TA--C-A-TA--------A-TTA--T--T--CCT----GAC---G-A----TTT--------T---C--T--G-C-T-CAAAGAT-G----TA-A-A--TCG----TAAACCGTTTCGCAAA-TTTCATTC--C-GTT-----A--GATAAATA
gi|80497                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TC-----TAG-----------TAATAA-------------TA-T------------TA--C-A-TA--------ATT-A--T--T--CCT----GAC---G-A----TAT--------T---C--G--G-C-T-C--AG
gi|80498                      :                                                             A-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA------------G------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--C--CTTTACGAAT---A-A----TTG--------T---C--T--G--------AGAG-G----TA-A-A--TCG--TCTAGA---------AAA--TGCAGTT--C-GTT-----G--ATTTtgaaat
gi|80499                      :                                                                                       A-TC-----TA------------T------------------TA-T------------TA--CGA-TA--------A-T-A--T--T--CCC-----AT---G-A----TTA--------T---C--G--GAC-A-C--AGAT-G----GA-A-A--ACG--ACTAGA---------AAAATTTCAA-C--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80501                      :                                                                                                 A------------T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--T--CCT----TAC---GAA----TAA--------T---T--G--G-C-T-G--AGAG-G----TA-A-A--TCG--TCTGGA---------AAA--TGCAGTC--T-GTT-----G--ATTT
gi|80500                      :                                                                                                                                  A-T------------TA--T-A-TA--------A-T-A--T--T--CAT----AAC---A-A----TTG--------T---C--G--G-C-T-C--GGG--G----TA-A-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCATTT--C-GTT-----G--AT
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gi|80503                      :                                                                                                                                     ------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--T--CCT----TAC---G-A----TTA--------T---C--G--A-C-T-C--AGAT-G----CA-A-G--TTG--
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Reference ( family-390 )      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80462                      : CTACATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAT-G-ATT-A--------T---CT----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
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gi|80489                      :    TGTG-GAG--CTCCA-CA--G-------T------TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA-----T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--TACACCT--GAC-A-ATC-A--------
gi|80490                      :    TATG-AAT--TATCA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GTA-C--G--A---------C----------------------------------------------------------TA--C-A-TA-------------------CCT--GAG-G-ATT-A--------T---CG----A-C-CCAG-A-G--G----TA-A-A--T-G--TCTATA---------ACA-TTTCAATT--C-GTT-----A--ATgagggggatccggttagaa
gi|80491                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-ATCGGC---T---CG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80492                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T-------------------A-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CGCTCGG-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80493                      :        -AAA--TTTCAATA--A-------A--A---CA-T--T-A-----CG--T-A-A-C-CA--A---------C------CA-TT-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-A--G----CA-A-G--TCG--GTTAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTACTA
gi|80494                      :                TCA-CA--G-------T--A---TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA-----T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--ACCT--GAC-A-ATC-A--------
gi|80495                      :                     A--G-------T--A---TAAT--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--AATACTAGTACATGTTGTA-TC-----TA-----T------------------AA-T------------CA--C-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-A--ACG--GCTAGA---------AAA-TCTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80496                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TCC----TA-----T-------------------A-T------------TA--C-A-TA--------ATT-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-T--------T---CT----G-C-TCAA-A-GATG----TA-A-A--TCG----TAAACCGTTTCGCAAA-TTTCATTC--C-GTT-----A--GATAAATA
gi|80497                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TC-----TAGTAA-TAA----------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-TTA--T--TCCT--GAC-G-ATA-T--------T---CG----G-C-TCAG-T-G--
gi|80498                      :                                                             A-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA-----G------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--CCTT--TAC-GAATA-A--------T---TG----T-C-TGAG-A-G--G----TA-A-A--TCG--TCTAGA---------AAA--TGCAGTT--C-GTT-----G--ATTTaaat
gi|80499                      :                                                                                       A-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--CGA-TA--------A-T-A--T--TCCC---AT-G-ATT-A--------T---CG----GAC-ACAGAT-G--G----AA-A-A---CG--ACTAGA---------AAAATTTCAA-C--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80500                      :                                                                                           -----TA-----G------------------TA-T------------TA--T-A-TA--------A-T-A--T--TCAT--AAC-A-ATT-G--------T---CG----G-C-TCGG---G--G----TA-A-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCATTT--C-GTT-----G--AT
gi|80501                      :                                                                                                 A-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--TCCT--TAC-GAATA-A--------T---TG----G-C-TGAG-A-G--G----TA-A-A--TCG--TCTGGA---------AAA--TGCAGTC--T-GTT-----G--ATTT
gi|80502                      :                                                                                                                              ------------TA--C-A-CC--------A-T-A--T--TCCT--TGT-G-ATT-G--------T---CA----G-C-TCTG-A-G--G----TA-A-A--ATG--TCTAGA---------AAA-TTTCACCA--C-GTC-----A--ATTTAGTA
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Alignments
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lowQualScore                  :        1   33     1  22 5555555 11 222  1 11 2 22222  22 1   1 2  11 7777777777777777  1  55555  222222222222222222222222  1 888888888888  11 1 1  33333333 0 1 11 22    22   0 1   0 55555555 333  1111 0 0    222 11 66666 0 44444  666     333333333   0        11 1   33333 11        
lowQualScore                  :        .   ..     .  .. ....... .. ...  . .. . .....  .. .   . .  .. ................  .  .....  ........................  . ............  .. . .  ........ . . .. ..    ..   . .   . ........ ...  .... . .    ... .. ..... . .....  ...     .........   .        .. .   ..... ..        
lowQualScore                  :        2   00     2  88 0000000 66 111  1 55 2 88888  66 1   1 2  55 9999999999999999  1  44444  222222222222222222222222  0 999999999999  33 0 9  33333333 9 8 22 44    11   9 7   9 11111111 333  8888 9 9    555 22 00000 9 66666  111     777777777   9        44 0   55555 44        
consensus                     : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
Reference ( family-390 )      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80462                      : CTACATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAT-G-ATT-A--------T---CT----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80463                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-A-----CA--T-GCA-C-CA--G---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-T-TG--------A-C-A--T--TCCT--GAC-G-ACT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-A--TCG--GCTAGA---------AA---TTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
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gi|80478                      : CTGTATG-AAA--TTTTA-TA--G-------C--A---CA-T--T-C-----CA--T-GCA-T--A--G---------C------CA-TC-----T------------------------------------------------------------------T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-A--G----C---------------------------AAA-TTTCACTC--T-CTT-----A--ATTTAACA
gi|80479                      : CTATAAG-AAAA-TTTCA-TA--G-------T------CG-T--T-G-----CA--T-GCA-CTCA--A---------C------CA-TC-----TG-----T------------------CA-A------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCTA--TACGG-ATA-A--------T---CG----C-T-TCAG-
gi|80480                      : CTATATG-AAAACTGTCA--A--G-------T--C---CA-T--T-G-----CAA-T-GCA-C-CA--A----------------CA-TC-----TA-----TATAAATTATATTATTATATA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-AATT--TTCT--GAC-T-ACT-AAAAGTATTT---CG----G-C-TCAG-C-G--G-----A-A-A--CCG--AAT-GA---------AAA-TTTTAatgccaaa
gi|80481                      :  TATATG-AAA--TT-CA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--TTACA-C-CA--A---------C------CA-TGATA--TA-----TA-----------------TA-TG-----------TA--T-GGTA--------A-T-A--T--TTCT--GAT---ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--A-----A-A-G--CCG--AATAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80482                      :  TATATG-AAA--TTTCA-CA--GACAGTATT--AAATCA-T--TAG-----TA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----GA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-T--------T---TG----G-C-GTAA-A-G--G----TG-A-A--ACG--TCTGGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----AATATTTAA
gi|80483                      :  TATCTG-AAA--TATTA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TA-----TA-----T------------------AA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--TACT--GAC-G-ATC-A--------T---CG----G-C-TCAA-A-G--G----TA-A-A--CCC--CCTAGA---------AAA-T
gi|80484                      :   ATATG-AA----TTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-------A---------C------CA-TC-----TAATA--TA-----------------TA-T------------TA--T-G-TA--------A-T-A--T--GA-T--GAC-T-ATTTA--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----AA-A-G--CCG--ATAAGA---------AAA-TTTCACTC--CAGTT--------ATTTAATA
gi|80485                      :    TATG-AAA--TTCCA-TA--G-------G--A---CA-T--T-GGCTTGCA--C-ACA-C-CA--A---------C------CA-TC-----AA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A---A--TTATCCT--GAG-G-ATT-A--------T---CT----G-A-TCAG-C-T--G----TA-A-A--TCT--GCTTG----------AAA-TTTCACTC--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80486                      :    TATG-ATA--TTTCT-AA--G-------T--C---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-C---A---------C------CA-TC-----CA-----T------------------TATT------------TA--C-T-TA--------A-T-A--T-----T--GGC-G-A---A--------T----G---------CAG-C-G--G----TA-A-A--TCG--CATAG----------AAA-TTTCACTT--C-GTTAACGAA--ATTTAATA
gi|80487                      :    TATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T--TA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------CA-TATTATATATCAATA--C-G-TA--------A-T-A--T--TTCTTGGAC-T-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-CTG--G----AA-A-G--CCG--AATGAA---------TAT-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80488                      :    TATG-AA---TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--TTG-----CA--T--TA-CGCA--A---------CG-----CA-TC-----TAATATAT------------------TA-TATATCAA-----TA--C-G-TA--------A-T-A--T--TTCT--GAC-T-ATT-A--------TT--CG----G-C-T-AG-C-T--G----GA-A-G--CCG--AACGAA---------TAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80489                      :    TGTG-GAG--CTCCA-CA--G-------T------TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA-----T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--TACACCT--GAC-A-ATC-A--------
gi|80490                      :    TATG-AAT--TATCA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GTA-C--G--A---------C----------------------------------------------------------TA--C-A-TA-------------------CCT--GAG-G-ATT-A--------T---CG----A-C-CCAG-A-G--G----TA-A-A--T-G--TCTATA---------ACA-TTTCAATT--C-GTT-----A--ATgagggggatccggttagaa
gi|80491                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-ATCGGC---T---CG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80492                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T-------------------A-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CGCTCGG-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80493                      :        -AAA--TTTCAATA--A-------A--A---CA-T--T-A-----CG--T-A-A-C-CA--A---------C------CA-TT-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-A--G----CA-A-G--TCG--GTTAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTACTA
gi|80494                      :                TCA-CA--G-------T--A---TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA-----T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--ACCT--GAC-A-ATC-A--------
gi|80495                      :                     A--G-------T--A---TAAT--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--AATACTAGTACATGTTGTA-TC-----TA-----T------------------AA-T------------CA--C-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-A--ACG--GCTAGA---------AAA-TCTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80496                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TCC----TA-----T-------------------A-T------------TA--C-A-TA--------ATT-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-T--------T---CT----G-C-TCAA-A-GATG----TA-A-A--TCG----TAAACCGTTTCGCAAA-TTTCATTC--C-GTT-----A--GATAAATA
gi|80497                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TC-----TAGTAA-TAA----------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-TTA--T--TCCT--GAC-G-ATA-T--------T---CG----G-C-TCAG-T-G--
gi|80498                      :                                                             A-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA-----G------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--CCTT--TAC-GAATA-A--------T---TG----T-C-TGAG-A-G--G----TA-A-A--TCG--TCTAGA---------AAA--TGCAGTT--C-GTT-----G--ATTTaaat
gi|80499                      :                                                                                       A-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--CGA-TA--------A-T-A--T--TCCC---AT-G-ATT-A--------T---CG----GAC-ACAGAT-G--G----AA-A-A---CG--ACTAGA---------AAAATTTCAA-C--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80500                      :                                                                                           -----TA-----G------------------TA-T------------TA--T-A-TA--------A-T-A--T--TCAT--AAC-A-ATT-G--------T---CG----G-C-TCGG---G--G----TA-A-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCATTT--C-GTT-----G--AT
gi|80501                      :                                                                                                 A-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--TCCT--TAC-GAATA-A--------T---TG----G-C-TGAG-A-G--G----TA-A-A--TCG--TCTGGA---------AAA--TGCAGTC--T-GTT-----G--ATTT
gi|80502                      :                                                                                                                              ------------TA--C-A-CC--------A-T-A--T--TCCT--TGT-G-ATT-G--------T---CA----G-C-TCTG-A-G--G----TA-A-A--ATG--TCTAGA---------AAA-TTTCACCA--C-GTC-----A--ATTTAGTA
gi|80503                      :                                                                                                                              ------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--TAC-G-ATT-A--------T---CG----A-C-TCAG-A-T--G----CA-A-G--TTG--
gi|80504                      :                                                                                                                                                   A--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---TG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-T-G--TCT--GCTAGA---------AAA-TTTCATTC--C-GTT-----A--ATTTGATA
gi|80505                      :                                                                                                                                                   A--------A-TCA--T--CCCT--GAC-A-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-AACTTG----TAG----------AAA-TTTCAGT---C-GTT-----A--ATTT
gi|80506                      :                                                                                                                                                               -A--T--CCCT--GAC-A-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-AACTTG----TAGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----A--ATTT
gi|80507                      :                                                                                                                                                                               -G-ATG-A--------T---CA----T-T-TCAG-A-G--G----TA-A-A--ACG--TCCAGA---------AAA-TCCCAGTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80508                      :                                                                                                                                                                                     -A--------T---CA----G-C-TCAG-C-T--T----CA-A-G--TTG--GCTAGA---------AA--TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAACA
gi|80509                      :                                                                                                                                                                                       --------T---CG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TTG--GCTAGA---------AAA-TTTTCCTT--T-GTT-----G--ATTTAATA


blockSeqs                     :        T   AC     A  TA ACAGTAT GT AAT  A AT A GCTTG  AT T   T T  TG ATACTAGTACATGTTG  T  CTATA  TATAAATTATATTATTATA       T ATTATATATCAA  TA   G  TCATATGT   T AT TA    TG     A     AAAGTATT ATC  CTCG        CT  AT AAATT   AACT   AAG     CCGTTTCGC            AA A   AACGA AT
blockSeqs                     :        .   A      .  T  C       .  .    . .  T .      A  .   . G  .  CGACTAG           .  ATA    GTAATAA                   . ATATCAA       .    G  .          C .  AC    T      A     TCGGC    G    .           AT  .  AA      AACT   G       .                    .  .   A     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  TC                .  C      ATATAT                    . G             .    .  .          . .  .     .      .     .        T    .           C   .  C       AGT    G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  CG                .  .      ATATA                     . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       AT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      TA                        . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  A                 .  .      TA                        . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  T                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GT     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       AA     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       AT     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  A                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       AA     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       AA     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  A       AA     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  A                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           G   .  C       GC     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       AC     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       GC     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  A       AA     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      A                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       AC     C       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       GC     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  A       AT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  G       AT     C       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       GC     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GC     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       AT     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  C       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       AA     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  A       AT     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :        .   .      .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       AT     A       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                   .  .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       AA     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                      .  .       .  .    . .  . .      .  .   . .  .  G                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           T   .  T       AT     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                                         . .  . .      .  .   . .  .  G                 .  .      G                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  C       AA     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                                         . .  . .      .  .   . .  .  C                 .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  C       GT     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                                                              . .  .  .                 .  .      G                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       GT     T       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                                                                                        .  .      T                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  T       AA     G       .                    .  .   .     . 
blockSeqs                     :                                                                                           .      .                         . .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           C   .  T       GT     G       .                    .  .   .     . 
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blockSeqs                     :                                                                                                                              .             .    .  .          . .  .     .      .     .        .    .           A   .  C       G      .       .                                   
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finalCons                     : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA





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lowQualScore                  :        2   00     2  88 0000000 66 111  1 55 2 88888  66 1   1 2  55 9999999999999999  1  44444  222222222222222222222222  0 999999999999  33 0 9  33333333 9 8 22 44    11   9 7   9 11111111 333  8888 9 9    555 22 00000 9 66666  111     777777777   9        44 0   55555 44        
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Reference ( family-390 )      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80462                      : CTACATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAT-G-ATT-A--------T---CT----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80463                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-A-----CA--T-GCA-C-CA--G---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-T-TG--------A-C-A--T--TCCT--GAC-G-ACT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----CA-A-A--TCG--GCTAGA---------AA---TTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80464                      : CTATGTG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------A------CA-TT-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TTCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-T--GAAATTA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----G--ATTTAATA
gi|80465                      : CTATATG-TAA--TTTCA-TA--G-------C--G---TA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CT----G-C-CTAG-C-G--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCCCTG--C-GTT-----A--ATTTAAT
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gi|80467                      : CTATATA-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GTA-C-CA--A---------T------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---TG----G-C-TTAG-C-A--A----CA-A-G--TTG--GCTTGA---------AAC-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATT
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gi|80469                      : CTATATG-AA---TTTCA-TAT-G-------T--A---CA-C--T-A-----CA--T-GCA-C-TA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------CA-T------------TG--C-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--G-C-G-ATT-A--------T---CG----A-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCG--GCTAGA---------AAA-TTTCACT
gi|80470                      : CTGTATG-AA---TTTCA-CA--G-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-ACA-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA-----T------------------TG-T------------TG--C-A-TA----------T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----CATA-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCACTC--C-GTC-----A--ATCTAATA
gi|80471                      : CTACTTG-GAA--TTTCA-TA--T-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GTA-C-CA--A---------A------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TATAC-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TTAG-C-A--G----TA-A-A--TCG--GCTACA---------ACA-TTTCACTC--C-GAT-----A--ATT
gi|80472                      : CTATATG-AAA--TTTCA-AA--G-------T--A---CA-TATT-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------CGACTAGTA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CA----A-C-ACAG-A-G--G----TG-A-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80473                      : CTATATA-AAA--TTTCA-CA--A-------T--G---TA-T--A-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----TG-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-T--T--TCCA--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TC---C-G----------------CG--TCCAGA---------CAA-TTTCGGTC--C-GTT-----A--ATTTGATA
gi|80474                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TATAG-------T--A---TA-T--T-A-----CA--T-CCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA-----T------------------CA-T------------CA--C-A-TA--------A-C-A--T--TCCT--GAT-G-ATT-G--------T---TG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-A--ACG--TCTAG-----------------CACTG--C-GTGA----A--ATCTAATA
gi|80475                      : CTATATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---TA-T--T-G-----TA--T-GTA-C-CA--A---------A------TA-TC-----TA-----A------------------TG-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---AG----G-C-TGTG-G-G--A----TA-A-A--ATG--TCTAGA---------AAA-TCTCAGAT--C-GTT-----G--ATTAAA
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gi|80478                      : CTGTATG-AAA--TTTTA-TA--G-------C--A---CA-T--T-C-----CA--T-GCA-T--A--G---------C------CA-TC-----T------------------------------------------------------------------T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-A--G----C---------------------------AAA-TTTCACTC--T-CTT-----A--ATTTAACA
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gi|80480                      : CTATATG-AAAACTGTCA--A--G-------T--C---CA-T--T-G-----CAA-T-GCA-C-CA--A----------------CA-TC-----TA-----TATAAATTATATTATTATATA-T------------TA--C-G-TA--------A-T-AATT--TTCT--GAC-T-ACT-AAAAGTATTT---CG----G-C-TCAG-C-G--G-----A-A-A--CCG--AAT-GA---------AAA-TTTTAatgccaaa
gi|80481                      :  TATATG-AAA--TT-CA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--TTACA-C-CA--A---------C------CA-TGATA--TA-----TA-----------------TA-TG-----------TA--T-GGTA--------A-T-A--T--TTCT--GAT---ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--A-----A-A-G--CCG--AATAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80482                      :  TATATG-AAA--TTTCA-CA--GACAGTATT--AAATCA-T--TAG-----TA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TC-----GA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-T--------T---TG----G-C-GTAA-A-G--G----TG-A-A--ACG--TCTGGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----AATATTTAA
gi|80483                      :  TATCTG-AAA--TATTA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TA-----TA-----T------------------AA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--TACT--GAC-G-ATC-A--------T---CG----G-C-TCAA-A-G--G----TA-A-A--CCC--CCTAGA---------AAA-T
gi|80484                      :   ATATG-AA----TTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-------A---------C------CA-TC-----TAATA--TA-----------------TA-T------------TA--T-G-TA--------A-T-A--T--GA-T--GAC-T-ATTTA--------T---CG----G-C-TCAG-C-G--G----AA-A-G--CCG--ATAAGA---------AAA-TTTCACTC--CAGTT--------ATTTAATA
gi|80485                      :    TATG-AAA--TTCCA-TA--G-------G--A---CA-T--T-GGCTTGCA--C-ACA-C-CA--A---------C------CA-TC-----AA-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A---A--TTATCCT--GAG-G-ATT-A--------T---CT----G-A-TCAG-C-T--G----TA-A-A--TCT--GCTTG----------AAA-TTTCACTC--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80486                      :    TATG-ATA--TTTCT-AA--G-------T--C---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-C---A---------C------CA-TC-----CA-----T------------------TATT------------TA--C-T-TA--------A-T-A--T-----T--GGC-G-A---A--------T----G---------CAG-C-G--G----TA-A-A--TCG--CATAG----------AAA-TTTCACTT--C-GTTAACGAA--ATTTAATA
gi|80487                      :    TATG-AAA--TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T--TA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------CA-TATTATATATCAATA--C-G-TA--------A-T-A--T--TTCTTGGAC-T-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-CTG--G----AA-A-G--CCG--AATGAA---------TAT-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80488                      :    TATG-AA---TTTCA-TA--G-------T--A---CA-T--TTG-----CA--T--TA-CGCA--A---------CG-----CA-TC-----TAATATAT------------------TA-TATATCAA-----TA--C-G-TA--------A-T-A--T--TTCT--GAC-T-ATT-A--------TT--CG----G-C-T-AG-C-T--G----GA-A-G--CCG--AACGAA---------TAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80489                      :    TGTG-GAG--CTCCA-CA--G-------T------TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA-----T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--TACACCT--GAC-A-ATC-A--------
gi|80490                      :    TATG-AAT--TATCA-CA--A-------T--A---TA-T--T-G-----CA--T-GTA-C--G--A---------C----------------------------------------------------------TA--C-A-TA-------------------CCT--GAG-G-ATT-A--------T---CG----A-C-CCAG-A-G--G----TA-A-A--T-G--TCTATA---------ACA-TTTCAATT--C-GTT-----A--ATgagggggatccggttagaa
gi|80491                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-ATCGGC---T---CG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80492                      :     ATG-AAC--TTTCA-CA--G-------T--A---CA-T--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------CA-TC-----TA-----T-------------------A-T------------TA--T-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CGCTCGG-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TCA--GCTACA---------AAA-TTTCACTC--T-GTT-----A--ATTTAGTA
gi|80493                      :        -AAA--TTTCAATA--A-------A--A---CA-T--T-A-----CG--T-A-A-C-CA--A---------C------CA-TT-----TA-----T------------------CA-T------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-C-A--G----CA-A-G--TCG--GTTAGG---------AAA-TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTACTA
gi|80494                      :                TCA-CA--G-------T--A---TA-C--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--A---------C------TA-TG-----TA-----T------------------TA-T------------TG--C-A-TA--------A-T-A--T--ACCT--GAC-A-ATC-A--------
gi|80495                      :                     A--G-------T--A---TAAT--T-G-----CA--T-GCA-C-CA--AATACTAGTACATGTTGTA-TC-----TA-----T------------------AA-T------------CA--C-A-TG--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-A--ACG--GCTAGA---------AAA-TCTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80496                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TCC----TA-----T-------------------A-T------------TA--C-A-TA--------ATT-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-T--------T---CT----G-C-TCAA-A-GATG----TA-A-A--TCG----TAAACCGTTTCGCAAA-TTTCATTC--C-GTT-----A--GATAAATA
gi|80497                      :                                        A-T--T-G-----CA--T-GCA-T-CA--A---------G------TA-TC-----TAGTAA-TAA----------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-TTA--T--TCCT--GAC-G-ATA-T--------T---CG----G-C-TCAG-T-G--
gi|80498                      :                                                             A-C-CA--A---------C------TA-TC-----TA-----G------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--CCTT--TAC-GAATA-A--------T---TG----T-C-TGAG-A-G--G----TA-A-A--TCG--TCTAGA---------AAA--TGCAGTT--C-GTT-----G--ATTTaaat
gi|80499                      :                                                                                       A-TC-----TA-----T------------------TA-T------------TA--CGA-TA--------A-T-A--T--TCCC---AT-G-ATT-A--------T---CG----GAC-ACAGAT-G--G----AA-A-A---CG--ACTAGA---------AAAATTTCAA-C--C-ATT-----A--ATTTAATA
gi|80500                      :                                                                                           -----TA-----G------------------TA-T------------TA--T-A-TA--------A-T-A--T--TCAT--AAC-A-ATT-G--------T---CG----G-C-TCGG---G--G----TA-A-A--ACG--TCTAGA---------AAA-TTTCATTT--C-GTT-----G--AT
gi|80501                      :                                                                                                 A-----T------------------TA-T------------TA--C-A-TA--------A-A-A--T--TCCT--TAC-GAATA-A--------T---TG----G-C-TGAG-A-G--G----TA-A-A--TCG--TCTGGA---------AAA--TGCAGTC--T-GTT-----G--ATTT
gi|80502                      :                                                                                                                              ------------TA--C-A-CC--------A-T-A--T--TCCT--TGT-G-ATT-G--------T---CA----G-C-TCTG-A-G--G----TA-A-A--ATG--TCTAGA---------AAA-TTTCACCA--C-GTC-----A--ATTTAGTA
gi|80503                      :                                                                                                                              ------------TA--C-A-TA--------A-T-A--T--TCCT--TAC-G-ATT-A--------T---CG----A-C-TCAG-A-T--G----CA-A-G--TTG--
gi|80504                      :                                                                                                                                                   A--------A-T-A--T--TCCT--GAC-G-ATT-A--------T---TG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-T-G--TCT--GCTAGA---------AAA-TTTCATTC--C-GTT-----A--ATTTGATA
gi|80505                      :                                                                                                                                                   A--------A-TCA--T--CCCT--GAC-A-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-AACTTG----TAG----------AAA-TTTCAGT---C-GTT-----A--ATTT
gi|80506                      :                                                                                                                                                               -A--T--CCCT--GAC-A-ATT-A--------T---CG----G-C-TCAG-A-G--G----TA-A-AACTTG----TAGA---------AAA-TTTCAGTC--C-GTT-----A--ATTT
gi|80507                      :                                                                                                                                                                               -G-ATG-A--------T---CA----T-T-TCAG-A-G--G----TA-A-A--ACG--TCCAGA---------AAA-TCCCAGTC--C-GTT-----A--ATTTAATA
gi|80508                      :                                                                                                                                                                                     -A--------T---CA----G-C-TCAG-C-T--T----CA-A-G--TTG--GCTAGA---------AA--TTTCACTC--C-GTT-----A--ATTTAACA
gi|80509                      :                                                                                                                                                                                       --------T---CG----G-C-TCAG-C-T--G----CA-A-G--TTG--GCTAGA---------AAA-TTTTCCTT--T-GTT-----G--ATTTAATA