lowQualScore : 11111 11 111111
lowQualScore : 2 4 00000 333 55555 2 2 55555 4444 55555 4 2 00 1 3 1 22 1 1 1 222 44 55 33 55 1 333 999 6666 9 4444 3 1 1 555 44 1 22 333 4444 555 22 4 2 2 6666666 4 9999999999 888888888 2 2 77 4444 555 2 333 2 55555 22 2 22 2 22 8 2 2 44 1 3 9 1 444 55555555 1 3 44 444 1 222 111111 5555555 1 1 1 22 22 999999 22 22 3333 44444 1 222 1 1 33 333 2222 2 1 5555555 11 22 11 2 11
lowQualScore : . . ..... ... ..... . . ..... .... ..... . . .. . . . .. . . . ... .. .. .. .. . ... ... .... . .... . . . ... .. . .. ... .... ... .. . . . ....... . .......... ......... . . .. .... ... . ... . ..... .. . .. . .. . . . .. . . . . ... ........ . . .. ... . ... ...... ....... . . . .. .. ...... .. .. .... ..... . ... . . .. ... .... . . ....... .. .. .. . ..
lowQualScore : 4 4 88888 999 66666 1 1 33333 5555 33333 0 0 55 9 6 7 44 7 7 7 999 00 66 88 66 7 000 444 0000 3 0000 8 9 9 222 55 9 66 333 2222 555 88 0 0 0 5555555 2 2222222222 444444444 2 2 55 5555 888 1 777 1 66666 99 1 99 1 99 7 2 0 33 8 9 3 7 444 22222222 5 1 33 888 5 888 999999 2222222 6 6 6 22 22 999999 22 22 4444 22222 7 888 1 1 66 444 3333 2 1 1111111 55 77 66 3 66
consensus : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CG---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTT-C-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
Reference ( gi|91675 ) : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-AATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CG---TTT--CCCCA----GCGAAGA----T-T-T-TTT-T-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AATATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATCT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG---C-----GAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----TT--A--C----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91676 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCC--A--T--TTTT--G-CA---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-T-G-TTT-T-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----AGCAG---ATTG-GG---AGAG-CAGAGGATAAGAGTGG--C-TT--GC---------ATCT-TTTA-CTTA--TAAT-CTGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----AC-----GC-GT---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91677 : ATATG-TCAAA-GT--------------------------------TG-----TAGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CA---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTA-T-CCCCTTGA-T--AT---GGGTT----A---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GG---TAAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-AAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AACT-CCAGATTT-G---TT---------TTTT-T-TT-AAA---A-TGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--T----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91679 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TT--GATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--AA-T--TTTT--G-CG---TTT--TTAAAA---GCAAAAA----T-T-T-TCC-C-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-ATTT--AAAT-CTGGATTT-G---TTT---GT---TTTT-T-TT-GAA---A-TAG---C-----ATT-------TT-T-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GC-AC---G-G-ATGATGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TG-AGGC--AGCCTaa
gi|91678 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTTGAATTT-T----A--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CG---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-T-T-ATC-C-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T-------------------------CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----AAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTT---GGGTTTTTT-T-TT-TAA---A-CGG---C-----AAT-------TTAC-G-----GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GT-GC---A-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCTaa
gi|91680 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----ATGTACTG-----TAGG-A-TTT-GATTT-T-T-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--A-CG---TTT--TCCCA----GCAAAGA----TAT-TGTTT-C-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGT----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGTGT--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTTTCAAAT-TTGGATTT-GAAATTT---G----TTCT-T-TT-AAA---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GC----------GTGACGTT--AAAGG---TA----G-A-TT-------T--AA-------T-AAGC--AGCCTaa
gi|91681 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-G--TT-T-C-CA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T--TTT---G-CA---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTT-TTCC--TTCA-T--AT---GGGTA----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-AACCCA----TGCAG---AT-----------------G-----GAGTGG--C-TTTCAC-GAT--AACATCT-TTTA-CTCT--AAAT-TCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TTCAAA---A-CGG---C-----AAT-------TT-CGGG-T--GAAA--A-----CT--A--C----GC-----AC-AT---G-A-GTGAC-CT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91682 : ATAT--TCAA--GT-----A---GTATCTA-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTTTGATTT-T-CTAA--GT-CC-AT-T---TCGTTA--TA-TTTT--G-CG---TTTTCCCCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTG-T-CCG-TTCA-T--AT---GG-TT----T---G--TAAT-C-C-------TTTGCTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAGG--ATTG-GA-----GG-CAGAG-----GAGTGGGGC-TT--GC-GAT--AACATCT-TTAAACCAT--AAATTCCAGATTTTG---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---AACGGGCAC-----G-T-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--ATAC----GC-----GC-GC---G-G-GTG-CGT----AACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTga
gi|91683 : ATATGGTCAAAAGT-----A---A-----A-G-TC-----AT----GG-----TAGGGA-TTTGAATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TTA--A--T--TTTTTTG-CA---TTTTTCACCA----GCAAAAG----A-T-C-TTT-C-CT--TTCA-T--AT---GGGTT----T---GGTTAGT-CAC-------TTT-TTGC----------A---------AA-AACCAT-CCA----TGCAG---ATTGAGG---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TA--GC-GAT--AACATCT-TCGA--------------GGA----A---TTT--------TTTT-T-TT--AT---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GCTT--GAAAGCC-----GT--A--C----GC-----CC-GC---G-GAGGGACGTT---AACG---TA----G-AGAT-------TGGAA--CT--TTAAGGC--GGCCT
gi|91685 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----AAT-AC-----AA----TT-----TAGGGA-TTT-GATTT-TTC-AA--GT-CC-CA-GAGTTCA--A--T--TTTC--G-CG---TTT--TCCCA----GCCAAGAATTCT-T-T-TCT-C-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----TT--G--TA-T-C-C-------ATT-CTGC----------A---------AAATAC-AA-TCA----TTCAG---A----------------AAA-----GAGTGA--C-TT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCTGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TT-TAA---A-C
gi|91687 : ATGTG-TCCAA-ATTA---A---G-----A-A-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GATTT-TTC-AA--AT-C--AA-G---TAA--A--T--TTTT--G-CG---TCT--atagaattaattttaggcagcctaa
gi|91684 : ATTTG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GTTTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-ttgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtattttttttttttttttttttttttttttttttaaataaacggcaatctcgctgaaaccatttctacgctgtcagccggatgacgttaaaatgtagaaattaactttcaggcagcct
gi|91686 : ATATG-TCCAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCT--A--T--TTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttttttaacggcaatttcgctgaatcctacgcgcgcg
gi|91688 : TATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT-----G-----TAG--A-TTT-GATTT---C-AA--GT-CC-AA-----TCAT-A--T--TTTTG-G-CA---TTT--TAACA----GC-AAGA----T-T-T-TTT-T-CC--TTCA-G--AT---GGGTT----T---G--T--T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-T-------------T-------------------AG-CAGAG-----GAGT-G--C-TT--GC-AAT--G--------------TT--AA---CCGGAT-T-G---GTT---G----TTTT-T-TT-AAAGG-A-CGC---A-----AAT-------TT-T-GC-T--GAAA--C-----CTTGA--C----AT-----GC-GC---A-G-GTGACGTT---AACGAT-TA----G-A----------T--AAGGCT--TT-AGGTCGAGCCT
gi|91689 : ATG-TCAAAAGT-----ACGAA-----A-T-ATCAACAAT----TG-----TAGG-AATTT-GATTT-A-C-AA--GT-C---A-G---TCA--A--TATTCTT--AACGCAATTT--TCCGA----GAAAAGA----T-T-G-TTTAT-TC--TCCA-TTAACCCCGAGTTATGAT---A--TA-TAC-C-------TAT-CTAC----------A---------AA--AC-A--CCAAACATGCAAGAAATTG-AGAAGTGAG-CAGAG-----G-GTGG--C-TA--GCAGAT--AGCAACTATATA-CTTA--AAAT-ACCGATTT-GA--TTT---G----TTTTAT-AT-AAA---G-CGA---CAG---AAA-------TC-C-GC----AAAA--G-----TG--A--CAAAGAC-----GC-CCTCAA-G-ACGACGTT--CAATG---TA----C-A-ATGA-----C--AA--TTACTT-AGAC--aa
gi|91690 : TG-TCAAA-GTGAAGTA---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAG--A-TTT-GTTTT-T-T-AAAAGT-CCCAA-G---TCA--A--T--TTTTT-G-C---------------------AAAA----T-T-G-TTT-T-CC--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-C-C-T-------TTT-CAGCATTGAACACTA---------AG-TAC-A--TCA----T-CAG---ATTG-GG---TGA--CAGAG-----GAGTGG--C-TG--CC-GATAAAACATCT-TTTA-CTTTG-AAAT-CCGGAATT-----TTC---G----TTTT-T-TT-TAA---C-TAA---C-----AAT-------TT-C-GC-TTGGAAA--C-----CT-----C----GA-----GCTGC-----G-GTGACGTTAGAGACG---TA----A-G-AA-------T--AA--C---TT-AGGC--ACCCTagctta
gi|91691 : -TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T--TTTT--G-CG---TTT--TCACA----GCAAAGA------T-T-TTT-T-CC--TTTA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-CTTAAAAGTTT-CTGC----------A---------aa
gi|91692 : -TCAAA-GTT----A---G-----A-TTAC-----AT----TG------AGG-A-TTT-GATTTGT-C-AA--GT-CC-AAAG---TAA--AATT--TTTT--G-CG---TTT--CAC-A----GCAAAGA----T-T-T-TTT---CC--TTTA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TT
gi|91693 : AAA-TT-----A---T-----A-T-AC-----AT----TGCTATGTAGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--AT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CG---TTT--TCCCA----GGAAAGA----CCT-T-TTT-T-TC--TTAA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTGC----------A---------AA-CAC-A--GCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-TAGA
gi|91694 : -T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GATTT---C-AG--GT-CC-A--G---TCA--AC-T--TTTT--G-AG---TTT--TCCCA----GGCAAGA----T-A-T-TTT---CC--TTCAAC--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTTCCTGC----------A---------AA-TAC----TCA----TGCAG----TTG-GG---TGAGCCAGAG-----GAGTGG--CTTT--GC-GAT--AA-AT-T-TTTA-CTTT--AACT-C--GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TA-AAA---A-CGG---CCAAAAAATAAAGAAATT-T-GT-T--GAAA--A-----CT--A--C----GC-----AC-GC---C-G-GTGAC-TT--AAA-G---TA----GAA-ATTACTTTAT--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91695 : AGG-A-TTT-GATTT-T-C-AA--GTCCC-AA-A---TCA--T--T--TTTT--G-TG---TCT--aa
gi|91696 : -T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CA---TTT--TCCCATGCAGCAAAGA----T-T-T-TTT-T-CA--TTCC-T--AT---GGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----T--------------------------G-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATttgggcaaaggcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataattaaatccggatttgttttttttttttaaaacggcaatacctacgcgcgcgggtgacgttaaacgta
gi|91697 : -C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CG---CTT--TCCCG----GAAAAGA----T-T-T-TTT-T-CC--TTAA-C--CC---GAGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTAC----------A---------AA-CCC-A--ACA----TGCAT---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGA---C-----AAT-------TC----------------------------------C-----GC-GT---G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----C-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGAC--
gi|91698 : -AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T--TTTT--G-CA--------------------AAGA----T-T-T-TTT-C-CT--TTCA-T--AT---GGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CAGC----------ATTGAACACTAG-TAC-A--TCA----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGT
gi|91699 : -AA-G---TCA--A--T--TTTT--C-CG---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTT-C-CC--TTTA-T--AT---
gi|91700 : --TTTT--G-CG---TTT--TCCCA----GCAAAGA----T-TGT-TTT-C-CC--TTCA-T--AT---AG-TA----TAAAG--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--CCA----TGCAG---ATTG-GT---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGAT------------------TTTT-T-TT--AA---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-ATGC--AGCCT
gi|91701 : A----TGCAG---ATTG-GG---TGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AGAT-
gi|91702 : GTGG--C-TT--GA-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-GCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AT------CAG---C-----AAT-------TT-C-AC-T--GAAA--C-----TT--A--T----GC-----GC-AC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--
gi|91703 : G--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTA--AAAT-CCGTATTT-G---TTT---G----TTTT-T-T-----------------------------------C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCT
gi|91705 : TA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTTTTGG----TTTT-T-TT-TG------CGA---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----AC-----GT-GC---A-G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AAC-CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91704 : TA-CGTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---A----TTTT-C-CT-TAA---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----a
gi|91695 : TT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TTTAAA---A-CGG---C-----AAT---------------------A--C-----CT--A--C----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----
gi|91706 : aggatttgattttcaagtcccaaatcattttttgtgtctttgggcaaaggcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataa--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGG---C-----AAT-------TC----------------------------------C-----GC-GT---G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGGT--AGCCT
gi|91707 : CGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAA--C-----CT--A--C----GC-----GC-GC---G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TC-AGGC--AGTCT
gi|91708 : GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG---A-----AAT-------TT-C-CC-T--GAAA--T-----CT--A--T----GC-----GC-GC---G-G-GTGATGTT--AAACGTACTA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91709 : ---TTT---G----GTTT-T-TA-AAA---A-CAA---C-----AAT-------TT-C-GC-T--G-AA--C-----CT--A--C----GC-----GT-GC---GCG-GTGACATCA-AAATT---TAATTTG-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91687 : ---TTT---T----TTTT-T-TT-AAATAAA-CGG---C-----AAT-------CT-C-GC-T--GAAA--CCATTTCT--A--C----GCTGTCAGC--C---G-G-ATGACGTTA-AAATG---TA----GAA-AT-------T--AA--CT--TTCAGGC--AGCCT
gi|91684 : atgtgtccaaattaagaaacattgtaagatttgatttttcaaatcaagtaaatttttgcgtctttgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtattttttttttttttttttttt----TTTT-T-TT-AA------CGG---C-----AAT-------TT-C-GC-T--GAAT--C-----CT--A--C----GC-----GC-GC---G-
gi|91710 : atttgtcaaagtagatacattgtaagatttgtttttcaagtccaagtcaatttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtC---A-G-GGGACGTT--AACCG---TA----G-A-AT-------T--AC--CT--TT-AGGC--AGCTT
gi|91719 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91715 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91717 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91712 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91718 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91714 : -G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91713 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCT
gi|91716 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-CGGC--AGCCT
gi|91711 : -G-GTGAAGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91721 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCTa
gi|91720 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGT--AGCCT
gi|91722 : CGTT--AAACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91685 : TT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCTaa
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 2 4 00000 333 55555 2 2 55555 4444 55555 3 1 1 5 1 1 1 22 1 1 1 222 33 55 3 7777 1 22 22 5555 5555 1 1 1 44 222 1 3333 4444 555 22 3 1 1 6666666 4 8888888888 888888888 2 2 8888888 333 2 555 2 55555 22 2 22 2 22 2 1 44 1 1 444 44444444 1 3 44 444 1 1 66666 1 5555555 1 1 55555 22 1 33333 1 22 22 44444 1 1 1 1 33 333 2222 2 1 5555555 11 22 11 2 11
lowQualScore : . . ..... ... ..... . . ..... .... ..... . . . . . . . .. . . . ... .. .. . .... . .. .. .... .... . . . .. ... . .... .... ... .. . . . ....... . .......... ......... . . ....... ... . ... . ..... .. . .. . .. . . .. . . ... ........ . . .. ... . . ..... . ....... . . ..... .. . ..... . .. .. ..... . . . . .. ... .... . . ....... .. .. .. . ..
lowQualScore : 2 2 33333 777 33333 0 0 00000 2222 00000 8 9 9 7 8 7 7 33 7 6 6 888 88 44 1 2222 7 44 44 4444 7777 8 8 8 33 555 8 9999 0000 222 66 8 9 9 2222222 0 8888888888 000000000 1 1 9999999 555 0 555 0 33333 88 0 88 0 88 1 9 11 7 6 222 77777777 5 0 77 666 5 5 00000 5 0000000 5 5 44444 11 5 88888 5 11 11 00000 6 5 1 1 66 333 2222 2 1 0000000 55 66 55 2 55
consensus : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
Reference ( family-385 ) : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91675 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-AA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTCCC--C--A----GCGAAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AATATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATCT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----G-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----T-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91676 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCC--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-G-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CAAGC---AG-ATTG---GGAGAG-CAGAGGATAAGAGTGG--C-TT--G---------CATCT-TTTA-CTTA--TAAT-CTGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CAC-----GC-GT-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91677 : ATATG-TCAAA-GT--------------------------------TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TTATC-C-CCTTGA-TA----TGGGTT----A---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTAAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-AAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AACT-CCAGATTT-G---TT---------TTTT-T-TT-AAA---A-TGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--TGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91678 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GAATTT-T----A--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-AT--C-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T-------------------------CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----AAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTT---GGGTTTTTT-T-TT-TAA---A-CGG-C-----A-AT-------TTAC-G---------GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GT-GC-A-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCTaa
gi|91679 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TT--GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--AA-T-TTTT----GC-GTTTTTA--A--AA---GCAAAAA----T-T-T-TC--C-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-ATTT--AAAT-CTGGATTT-G---TTT---GT---TTTT-T-TT-GAA---A-TAG-C-----A-TT-------TT-T-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-AC-G-G-ATGATGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TG-AGGC--AGCCTaa
gi|91680 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----ATGTACTG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-T-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----AC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----TAT-TGTT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGT----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGT--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTTTCAAAT-TTGGATTT-GAAATTT---G----TTCT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC--------GTGACGTT--AAAGG---TA----G-A-TT-------T--AA-------T-AAGC--AGCCTaa
gi|91681 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-G---TT-T-C-CA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T-TTT-----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-TTCCTTCA-TA----TGGGTA----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-AACC----CATGC---AG-AT----------------G-----GAGTGG--C-TTTCAC-GAT--AACATCT-TTTA-CTCT--AAAT-TCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TTCAAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-CGGG-----T--GAAA-A-----C-T--A--CGC-----AC-AT-G-A-GTGAC-CT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91682 : ATAT--TCAA--GT-----A---GTATCTA-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTTTGA-TTT-T-CTAA--GT-CC-AT-T---TCGTTA--TATTTT----GC-GTTTTCC--CCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTG-T-C-CGTTCA-TA----TGG-TT----T---G--TAAT-C-C-------TTTGCTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AGGATTG---GA--GG-CAGAG-----GAGTGGGGC-TT--GC-GAT--AACATCT-TTAAACCAT--AAATTCCAGATTTTG---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---AACGGGC-----ACGT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--ATACGC-----GC-GC-G-G-GTG-CGT----AACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTga
gi|91683 : ATATGGTCAAAAGT-----A---A-----A-G-TC-----AT----GG-----TAGGGA-TTT-GAATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TTA--A--T-TTTTTT--GC-ATTTTTCACC--A----GCAAAAG----A-T-C-TT--T-C-CTTTCA-TA----TGGGTT----T---GGTTAGT-CAC-------TTT-TTGC----------A---------AA-AACCAT-C----CATGC---AG-ATTGA--GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TA--GC-GAT--AACATCT-TCGA--------------GGA----A---TTT--------TTTT-T-TT--AT---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GCT----T--GAAAGC-----CGT--A--CGC-----CC-GC-G-GAGGGACGTT---AACG---TA----G-AGAT-------TGGAA--CT--TTAAGGC--GGCCT
gi|91684 : ATTTG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GT-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----G
gi|91684 : ----TTTT-T-TT-AA------CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAT-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttttttaacggcaatttcgctgaatcctacgcgcgcg
gi|91685 : atttgtcaaagtagatacattgtaagatttgtttttcaagtccaagtcaatttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATATG-TCAAA-GT-----A---G-----AAT-AC-----AA----TT-----TAGGGA-TTT-GA-TTT-TTC-AA--GT-CC-CA-GAGTTCA--A--T-TTTC----GC-GTTTTCC--C--A----GCCAAGAATTCT-T-T-TC--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----TT--G--TA-T-C-C-------ATT-CTGC----------A---------AAATAC-AA-T----CATTC---AG-A---------------AAA-----GAGTGA--C-TT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCTGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TT-TAA---A-C
gi|91685 : TT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCTatagaattaattttaggcagcctaa
gi|91686 : atatgtcaaagtagaatacaatttagggatttgatttttcaagtcccagagttcaattttcgcgttttcccagccaagaattcttttctcccttcatatgggttttgtatccattctgcaaaatacaatcattcagaaaagagtgacttgcgataacattttttactttaaatcctgatttgttttttttttATATG-TCCAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCT--A--T-TTTaa
gi|91687 : ATGTG-TCCAA-ATTA---A---G-----A-A-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GATTTT-T-C-AA--AT--C-AA-G---TAA--A--T-TTTT----GC-GTCTT
gi|91687 : TTT-T---TTT---T----TTTT-T-TT-AAATAAA-CGG-C-----A-AT-------CT-C-GC-----T--GAAA-CCATTTC-T--A--CGCTGTCAGC--C-G-G-ATGACGTTA-AAATG---TA----GAA-AT-------T--AA--CT--TTCAGGC--AGCCTtgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtattttttttttttttttttttttttttttttttaaataaacggcaatctcgctgaaaccatttctacgctgtcagccggatgacgttaaaatgtagaaattaactttcaggcagcct
gi|91688 : atgtgtccaaattaagaaacattgtaagatttgatttttcaaatcaagtaaatttttgcgtctttgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtatttttttttttttttttTATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT-----G-----TAG--A-TTT-GA-TTT---C-AA--GT-CC-AA-----TCAT-A--T-TTTTG---GC-ATTTTAA--C--A----GC-AAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTCA-GA----TGGGTT----T---G--T--T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-T-------------T-------------------AG-CAGAG-----GAGT-G--C-TT--GC-AAT--G--------------TT--AA---CCGGA-TT-G---GTT---G----TTTT-T-TT-AAAGG-A-CGC-A-----A-AT-------TT-T-GC-----T--GAAA-C-----C-TTGA--CAT-----GC-GC-A-G-GTGACGTT---AACGAT-TA----G-A----------T--AAGGCT--TT-AGGTCGAGCCT
gi|91689 : ATG-TCAAAAGT-----ACGAA-----A-T-ATCAACAAT----TG-----TAGG-AATTT-GA-TTT-A-C-AA--GT-C---A-G---TCA--A--TATTCTTAACGCAATTTTCC--G--A----GAAAAGA----T-T-G-TT--TAT-TCTCCATTAACCCCGAGTTATGAT---A--TA-TAC-C-------TAT-CTAC----------A---------AA--AC-A--CCAAACATGCAAGAA-ATTGAGAAGTGAG-CAGAG-----G-GTGG--C-TA--GCAGAT--AGCAACTATATA-CTTA--AAAT-ACCGATTT-GA--TTT---G----TTTTAT-AT-AAA---G-CGA-CAG---A-AA-------TC-C-GCAAAAGT--GACA-A-----A-G--A--CGC-----CC-TCAA-G-ACGACGTT--CAATG---TA----C-A-ATGA-----C--AA--TTACTT-AGAC--aa
gi|91690 : TG-TCAAA-GTGAAGTA---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAG--A-TTT-GT-TTT-T-T-AAAAGT-CCCAA-G---TCA--A--T-TTTT-----------T------------GCAAA-A----T-T-G-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-C-C-T-------TTT-CAGCATTGAACACTA---------AG-TAC-A--T----CAT-C---AG-ATTG---GGTGA--CAGAG-----GAGTGG--C-TG--CC-GATAAAACATCT-TTTA-CTTTG-AAAT-CCGGAATT-----TTC---G----TTTT-T-TT-TAA---C-TAA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----TTGGAAA-C-----C-T-----CGA-----GCTGC---G-GTGACGTTAGAGACG---TA----A-G-AA-------T--AA--C---TT-AGGC--ACCCTagctta
gi|91691 : -TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCA--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T---CCTTTA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-CTTAAAAGTTT-CTGC----------A---------aa
gi|91692 : -TCAAA-GTT----A---G-----A-TTAC-----AT----TG------AGG-A-TTT-GA-TTTGT-C-AA--GT-CC-AAAG---TAA--AATT-TTTT----GC-GTTT-CA--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CTTT-A-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TT
gi|91693 : AAA-TT-----A---T-----A-T-AC-----AT----TGCTATGTAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--AT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GGAAAGAC---C-T-T-TT--T-T-TCTTAA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTGC----------A---------AA-CAC-A--G----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-TAGA
gi|91694 : -T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT---C-AG--GT-CC-A--G---TCA--AC-T-TTTT----GA-GTTTTCC--C--A----GGCAAGA----T-A-T-TT--T-C-CTTCAA-CA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTTCCTGC----------A---------AA-TAC----T----CATGC---AG--TTG---GGTGAGCCAGAG-----GAGTGG--CTTT--GC-GAT--AA-AT-T-TTTA-CTTT--AACT-C--GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TA-AAA---A-CGG-CCAAAAA-ATAAAGAAATT-T-GT-----T--GAAA-A-----C-T--A--CGC-----AC-GC-C-G-GTGAC-TT--AAA-G---TA----GAA-ATTACTTTAT--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91695 : AGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GTCCC-AA-A---TCA--T--T-TTTT----GT-GTCTT-T--G--G----GCAAAGaa
gi|91695 : TT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TTTAAA---A-CGG-C-----A-AT-------------------------A-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----gcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataattaaatccggatttgttttttttttttaaaacggcaatacctacgcgcgcgggtgacgttaaacgta
gi|91696 : aggatttgattttcaagtcccaaatcattttttgtgtctttgggcaaaggcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataa-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--ATGCAGCAAAGA----T-T-T-TT--T-T-CATTCC-TA----TGGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CAT--------------------------G-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACAT
gi|91697 : -C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GCTTTCC--C--G----GAAAAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTAA-CC----CGAGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTAC----------A---------AA-CCC-A--A----CATGC---AT-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGA-C-----A-AT-------TC----------------------------------C-----GC-GT-G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----C-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGAC--
gi|91698 : -AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC--------------------AAAGA----T-T-T-TT--T-C-CTTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CAGC----------ATTGAACACTAG-TAC-A--T----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGT
gi|91699 : -AA-G---TCA--A--T-TTTT----CC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTTA-TA----T
gi|91700 : -TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-TGT-TT--T-C-CCTTCA-TA----TAG-TA----TAAAG--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GTTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT----------------TTTT-T-----AA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-ATGC--AGCCT
gi|91701 : ATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AGAT-
gi|91702 : GTGG--C-TT--GA-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-GCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT---A---T-CAG-C-----A-AT-------TT-C-AC-----T--GAAA-C-----T-T--A--TGC-----GC-AC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--
gi|91703 : G--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTA--AAAT-CCGTATTT-G---TTT---G----TTTT-T-T----------------------------------C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCT
gi|91704 : TA-CGTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---A----TTTT-C-CT-TAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--C
gi|91705 : TA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTTTTGG----TTTT-T-TT-TG------CGA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CAC-----GT-GC-A-G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AAC-CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91706 : --AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TC----------------------------------C-----GC-GT-G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGGT--AGCCTa
gi|91707 : CGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TC-AGGC--AGTCT
gi|91708 : GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-A-----A-AT-------TT-C-CC-----T--GAAA-T-----C-T--A--TGC-----GC-GC-G-G-GTGATGTT--AAACGTACTA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91709 : ---TTT---G----GTTT-T-TA-AAA---A-CAA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--G-AA-C-----C-T--A--CGC-----GT-GC-GCG-GTGACATCA-AAATT---TAATTTG-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91710 : C-A-G-GGGACGTT--AACCG---TA----G-A-AT-------T--AC--CT--TT-AGGC--AGCTT
gi|91711 : -G-GTGAAGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91712 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTa
gi|91713 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCT
gi|91714 : -G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91715 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91716 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-CGGC--AGCCT
gi|91717 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91718 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91719 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91720 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGT--AGCCT
gi|91721 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCTaa
gi|91722 : CGTT--AAACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 2 4 00000 333 55555 2 2 55555 4444 55555 3 1 1 5 1 1 1 22 1 1 1 222 33 55 3 7777 1 22 22 5555 5555 1 1 1 44 222 1 3333 4444 555 22 3 1 1 6666666 4 8888888888 888888888 2 2 8888888 333 2 555 2 55555 22 2 22 2 22 2 1 44 1 1 444 44444444 1 3 44 444 1 1 66666 1 5555555 1 1 55555 22 1 33333 1 22 22 44444 1 1 1 1 33 333 2222 2 1 5555555 11 22 11 2 11
lowQualScore : . . ..... ... ..... . . ..... .... ..... . . . . . . . .. . . . ... .. .. . .... . .. .. .... .... . . . .. ... . .... .... ... .. . . . ....... . .......... ......... . . ....... ... . ... . ..... .. . .. . .. . . .. . . ... ........ . . .. ... . . ..... . ....... . . ..... .. . ..... . .. .. ..... . . . . .. ... .... . . ....... .. .. .. . ..
lowQualScore : 2 2 33333 777 33333 0 0 00000 2222 00000 8 9 9 7 8 7 7 33 7 6 6 888 88 44 1 2222 7 44 44 4444 7777 8 8 8 33 555 8 9999 0000 222 66 8 9 9 2222222 0 8888888888 000000000 1 1 9999999 555 0 555 0 33333 88 0 88 0 88 1 9 11 7 6 222 77777777 5 0 77 666 5 5 00000 5 0000000 5 5 44444 11 5 88888 5 11 11 00000 6 5 1 1 66 333 2222 2 1 0000000 55 66 55 2 55
consensus : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
Reference ( family-385 ) : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91675 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-AA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTCCC--C--A----GCGAAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AATATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATCT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----G-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----T-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91676 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCC--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-G-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CAAGC---AG-ATTG---GGAGAG-CAGAGGATAAGAGTGG--C-TT--G---------CATCT-TTTA-CTTA--TAAT-CTGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CAC-----GC-GT-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91677 : ATATG-TCAAA-GT--------------------------------TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TTATC-C-CCTTGA-TA----TGGGTT----A---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTAAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-AAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AACT-CCAGATTT-G---TT---------TTTT-T-TT-AAA---A-TGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--TGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91678 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GAATTT-T----A--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-AT--C-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T-------------------------CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----AAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTT---GGGTTTTTT-T-TT-TAA---A-CGG-C-----A-AT-------TTAC-G---------GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GT-GC-A-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCTaa
gi|91679 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TT--GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--AA-T-TTTT----GC-GTTTTTA--A--AA---GCAAAAA----T-T-T-TC--C-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-ATTT--AAAT-CTGGATTT-G---TTT---GT---TTTT-T-TT-GAA---A-TAG-C-----A-TT-------TT-T-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-AC-G-G-ATGATGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TG-AGGC--AGCCTaa
gi|91680 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----ATGTACTG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-T-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----AC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----TAT-TGTT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGT----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGT--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTTTCAAAT-TTGGATTT-GAAATTT---G----TTCT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC--------GTGACGTT--AAAGG---TA----G-A-TT-------T--AA-------T-AAGC--AGCCTaa
gi|91681 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-G---TT-T-C-CA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T-TTT-----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-TTCCTTCA-TA----TGGGTA----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-AACC----CATGC---AG-AT----------------G-----GAGTGG--C-TTTCAC-GAT--AACATCT-TTTA-CTCT--AAAT-TCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TTCAAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-CGGG-----T--GAAA-A-----C-T--A--CGC-----AC-AT-G-A-GTGAC-CT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91682 : ATAT--TCAA--GT-----A---GTATCTA-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTTTGA-TTT-T-CTAA--GT-CC-AT-T---TCGTTA--TATTTT----GC-GTTTTCC--CCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTG-T-C-CGTTCA-TA----TGG-TT----T---G--TAAT-C-C-------TTTGCTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AGGATTG---GA--GG-CAGAG-----GAGTGGGGC-TT--GC-GAT--AACATCT-TTAAACCAT--AAATTCCAGATTTTG---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---AACGGGC-----ACGT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--ATACGC-----GC-GC-G-G-GTG-CGT----AACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTga
gi|91683 : ATATGGTCAAAAGT-----A---A-----A-G-TC-----AT----GG-----TAGGGA-TTT-GAATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TTA--A--T-TTTTTT--GC-ATTTTTCACC--A----GCAAAAG----A-T-C-TT--T-C-CTTTCA-TA----TGGGTT----T---GGTTAGT-CAC-------TTT-TTGC----------A---------AA-AACCAT-C----CATGC---AG-ATTGA--GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TA--GC-GAT--AACATCT-TCGA--------------GGA----A---TTT--------TTTT-T-TT--AT---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GCT----T--GAAAGC-----CGT--A--CGC-----CC-GC-G-GAGGGACGTT---AACG---TA----G-AGAT-------TGGAA--CT--TTAAGGC--GGCCT
gi|91684 : ATTTG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GT-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----G
gi|91684 : ----TTTT-T-TT-AA------CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAT-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttttttaacggcaatttcgctgaatcctacgcgcgcg
gi|91685 : atttgtcaaagtagatacattgtaagatttgtttttcaagtccaagtcaatttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATATG-TCAAA-GT-----A---G-----AAT-AC-----AA----TT-----TAGGGA-TTT-GA-TTT-TTC-AA--GT-CC-CA-GAGTTCA--A--T-TTTC----GC-GTTTTCC--C--A----GCCAAGAATTCT-T-T-TC--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----TT--G--TA-T-C-C-------ATT-CTGC----------A---------AAATAC-AA-T----CATTC---AG-A---------------AAA-----GAGTGA--C-TT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCTGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TT-TAA---A-C
gi|91685 : TT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCTatagaattaattttaggcagcctaa
gi|91686 : atatgtcaaagtagaatacaatttagggatttgatttttcaagtcccagagttcaattttcgcgttttcccagccaagaattcttttctcccttcatatgggttttgtatccattctgcaaaatacaatcattcagaaaagagtgacttgcgataacattttttactttaaatcctgatttgttttttttttATATG-TCCAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCT--A--T-TTTaa
gi|91687 : ATGTG-TCCAA-ATTA---A---G-----A-A-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GATTTT-T-C-AA--AT--C-AA-G---TAA--A--T-TTTT----GC-GTCTT
gi|91687 : TTT-T---TTT---T----TTTT-T-TT-AAATAAA-CGG-C-----A-AT-------CT-C-GC-----T--GAAA-CCATTTC-T--A--CGCTGTCAGC--C-G-G-ATGACGTTA-AAATG---TA----GAA-AT-------T--AA--CT--TTCAGGC--AGCCTtgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtattttttttttttttttttttttttttttttttaaataaacggcaatctcgctgaaaccatttctacgctgtcagccggatgacgttaaaatgtagaaattaactttcaggcagcct
gi|91688 : atgtgtccaaattaagaaacattgtaagatttgatttttcaaatcaagtaaatttttgcgtctttgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtatttttttttttttttttTATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT-----G-----TAG--A-TTT-GA-TTT---C-AA--GT-CC-AA-----TCAT-A--T-TTTTG---GC-ATTTTAA--C--A----GC-AAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTCA-GA----TGGGTT----T---G--T--T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-T-------------T-------------------AG-CAGAG-----GAGT-G--C-TT--GC-AAT--G--------------TT--AA---CCGGA-TT-G---GTT---G----TTTT-T-TT-AAAGG-A-CGC-A-----A-AT-------TT-T-GC-----T--GAAA-C-----C-TTGA--CAT-----GC-GC-A-G-GTGACGTT---AACGAT-TA----G-A----------T--AAGGCT--TT-AGGTCGAGCCT
gi|91689 : ATG-TCAAAAGT-----ACGAA-----A-T-ATCAACAAT----TG-----TAGG-AATTT-GA-TTT-A-C-AA--GT-C---A-G---TCA--A--TATTCTTAACGCAATTTTCC--G--A----GAAAAGA----T-T-G-TT--TAT-TCTCCATTAACCCCGAGTTATGAT---A--TA-TAC-C-------TAT-CTAC----------A---------AA--AC-A--CCAAACATGCAAGAA-ATTGAGAAGTGAG-CAGAG-----G-GTGG--C-TA--GCAGAT--AGCAACTATATA-CTTA--AAAT-ACCGATTT-GA--TTT---G----TTTTAT-AT-AAA---G-CGA-CAG---A-AA-------TC-C-GCAAAAGT--GACA-A-----A-G--A--CGC-----CC-TCAA-G-ACGACGTT--CAATG---TA----C-A-ATGA-----C--AA--TTACTT-AGAC--aa
gi|91690 : TG-TCAAA-GTGAAGTA---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAG--A-TTT-GT-TTT-T-T-AAAAGT-CCCAA-G---TCA--A--T-TTTT-----------T------------GCAAA-A----T-T-G-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-C-C-T-------TTT-CAGCATTGAACACTA---------AG-TAC-A--T----CAT-C---AG-ATTG---GGTGA--CAGAG-----GAGTGG--C-TG--CC-GATAAAACATCT-TTTA-CTTTG-AAAT-CCGGAATT-----TTC---G----TTTT-T-TT-TAA---C-TAA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----TTGGAAA-C-----C-T-----CGA-----GCTGC---G-GTGACGTTAGAGACG---TA----A-G-AA-------T--AA--C---TT-AGGC--ACCCTagctta
gi|91691 : -TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCA--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T---CCTTTA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-CTTAAAAGTTT-CTGC----------A---------aa
gi|91692 : -TCAAA-GTT----A---G-----A-TTAC-----AT----TG------AGG-A-TTT-GA-TTTGT-C-AA--GT-CC-AAAG---TAA--AATT-TTTT----GC-GTTT-CA--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CTTT-A-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TT
gi|91693 : AAA-TT-----A---T-----A-T-AC-----AT----TGCTATGTAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--AT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GGAAAGAC---C-T-T-TT--T-T-TCTTAA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTGC----------A---------AA-CAC-A--G----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-TAGA
gi|91694 : -T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT---C-AG--GT-CC-A--G---TCA--AC-T-TTTT----GA-GTTTTCC--C--A----GGCAAGA----T-A-T-TT--T-C-CTTCAA-CA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTTCCTGC----------A---------AA-TAC----T----CATGC---AG--TTG---GGTGAGCCAGAG-----GAGTGG--CTTT--GC-GAT--AA-AT-T-TTTA-CTTT--AACT-C--GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TA-AAA---A-CGG-CCAAAAA-ATAAAGAAATT-T-GT-----T--GAAA-A-----C-T--A--CGC-----AC-GC-C-G-GTGAC-TT--AAA-G---TA----GAA-ATTACTTTAT--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91695 : AGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GTCCC-AA-A---TCA--T--T-TTTT----GT-GTCTT-T--G--G----GCAAAGaa
gi|91695 : TT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TTTAAA---A-CGG-C-----A-AT-------------------------A-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----gcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataattaaatccggatttgttttttttttttaaaacggcaatacctacgcgcgcgggtgacgttaaacgta
gi|91696 : aggatttgattttcaagtcccaaatcattttttgtgtctttgggcaaaggcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataa-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--ATGCAGCAAAGA----T-T-T-TT--T-T-CATTCC-TA----TGGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CAT--------------------------G-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACAT
gi|91697 : -C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GCTTTCC--C--G----GAAAAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTAA-CC----CGAGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTAC----------A---------AA-CCC-A--A----CATGC---AT-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGA-C-----A-AT-------TC----------------------------------C-----GC-GT-G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----C-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGAC--
gi|91698 : -AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC--------------------AAAGA----T-T-T-TT--T-C-CTTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CAGC----------ATTGAACACTAG-TAC-A--T----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGT
gi|91699 : -AA-G---TCA--A--T-TTTT----CC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTTA-TA----T
gi|91700 : -TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-TGT-TT--T-C-CCTTCA-TA----TAG-TA----TAAAG--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GTTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT----------------TTTT-T-----AA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-ATGC--AGCCT
gi|91701 : ATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AGAT-
gi|91702 : GTGG--C-TT--GA-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-GCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT---A---T-CAG-C-----A-AT-------TT-C-AC-----T--GAAA-C-----T-T--A--TGC-----GC-AC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--
gi|91703 : G--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTA--AAAT-CCGTATTT-G---TTT---G----TTTT-T-T----------------------------------C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCT
gi|91704 : TA-CGTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---A----TTTT-C-CT-TAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--C
gi|91705 : TA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTTTTGG----TTTT-T-TT-TG------CGA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CAC-----GT-GC-A-G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AAC-CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91706 : --AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TC----------------------------------C-----GC-GT-G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGGT--AGCCTa
gi|91707 : CGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TC-AGGC--AGTCT
gi|91708 : GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-A-----A-AT-------TT-C-CC-----T--GAAA-T-----C-T--A--TGC-----GC-GC-G-G-GTGATGTT--AAACGTACTA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91709 : ---TTT---G----GTTT-T-TA-AAA---A-CAA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--G-AA-C-----C-T--A--CGC-----GT-GC-GCG-GTGACATCA-AAATT---TAATTTG-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91710 : C-A-G-GGGACGTT--AACCG---TA----G-A-AT-------T--AC--CT--TT-AGGC--AGCTT
gi|91711 : -G-GTGAAGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91712 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTa
gi|91713 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCT
gi|91714 : -G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91715 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91716 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-CGGC--AGCCT
gi|91717 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91718 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91719 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91720 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGT--AGCCT
gi|91721 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCTaa
gi|91722 : CGTT--AAACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
blockSeqs : G A GAAGT CGA TATCT A T CAACA GTAC CTATG G A T A G T T AA C C A AGT TT AT A TAAC A AC CC TGCA ATTC A G G AT TT T ACCC ATGA AAA GT A A A TTAAAAG G ATTGAACACT TTGAACACT A C CCAAA AAG G AGA C GATAA GG T TC A AA A A TC T T AAA GGGTT A A CA TAA A G CAAAA C AAAGAAA A G AAAAG TG G CATTT G TG TA TGTCA T A C A AG TAC ATTT A G TACTTTA GG GG AC A CG
blockSeqs : . A TA . . . . . . . G . . A . . . . . . . . T A A TT . . . A C . . . G AT . . . T . G . . . C . . . . ACC . . A . . . . . . . . . G . . A TTGG . A TA GG . . AG . . . . T . . . . . . . . . . . A AT . A . GA . C . C .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
finalCons : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 2 4 00000 333 55555 2 2 55555 4444 55555 3 1 1 5 1 1 1 22 1 1 1 222 33 55 3 7777 1 22 22 5555 5555 1 1 1 44 222 1 3333 4444 555 22 3 1 1 6666666 4 8888888888 888888888 2 2 8888888 333 2 555 2 55555 22 2 22 2 22 2 1 44 1 1 444 44444444 1 3 44 444 1 1 66666 1 5555555 1 1 55555 22 1 33333 1 22 22 44444 1 1 1 1 33 333 2222 2 1 5555555 11 22 11 2 11
lowQualScore : . . ..... ... ..... . . ..... .... ..... . . . . . . . .. . . . ... .. .. . .... . .. .. .... .... . . . .. ... . .... .... ... .. . . . ....... . .......... ......... . . ....... ... . ... . ..... .. . .. . .. . . .. . . ... ........ . . .. ... . . ..... . ....... . . ..... .. . ..... . .. .. ..... . . . . .. ... .... . . ....... .. .. .. . ..
lowQualScore : 2 2 33333 777 33333 0 0 00000 2222 00000 8 9 9 7 8 7 7 33 7 6 6 888 88 44 1 2222 7 44 44 4444 7777 8 8 8 33 555 8 9999 0000 222 66 8 9 9 2222222 0 8888888888 000000000 1 1 9999999 555 0 555 0 33333 88 0 88 0 88 1 9 11 7 6 222 77777777 5 0 77 666 5 5 00000 5 0000000 5 5 44444 11 5 88888 5 11 11 00000 6 5 1 1 66 333 2222 2 1 0000000 55 66 55 2 55
consensus : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
Reference ( family-385 ) : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91675 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-AA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTCCC--C--A----GCGAAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AATATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATCT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----G-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----T-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91676 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCC--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-G-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CAAGC---AG-ATTG---GGAGAG-CAGAGGATAAGAGTGG--C-TT--G---------CATCT-TTTA-CTTA--TAAT-CTGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CAC-----GC-GT-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91677 : ATATG-TCAAA-GT--------------------------------TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TTATC-C-CCTTGA-TA----TGGGTT----A---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTAAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-AAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AACT-CCAGATTT-G---TT---------TTTT-T-TT-AAA---A-TGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--TGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91678 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GAATTT-T----A--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-AT--C-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T-------------------------CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----AAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTT---GGGTTTTTT-T-TT-TAA---A-CGG-C-----A-AT-------TTAC-G---------GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GT-GC-A-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCTaa
gi|91679 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TT--GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--AA-T-TTTT----GC-GTTTTTA--A--AA---GCAAAAA----T-T-T-TC--C-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-ATTT--AAAT-CTGGATTT-G---TTT---GT---TTTT-T-TT-GAA---A-TAG-C-----A-TT-------TT-T-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-AC-G-G-ATGATGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TG-AGGC--AGCCTaa
gi|91680 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----ATGTACTG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-T-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----AC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----TAT-TGTT--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGT----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGT--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTTTCAAAT-TTGGATTT-GAAATTT---G----TTCT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC--------GTGACGTT--AAAGG---TA----G-A-TT-------T--AA-------T-AAGC--AGCCTaa
gi|91681 : ATATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-G---TT-T-C-CA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T-TTT-----GC-ATTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-TTCCTTCA-TA----TGGGTA----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-AACC----CATGC---AG-AT----------------G-----GAGTGG--C-TTTCAC-GAT--AACATCT-TTTA-CTCT--AAAT-TCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TTCAAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-CGGG-----T--GAAA-A-----C-T--A--CGC-----AC-AT-G-A-GTGAC-CT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91682 : ATAT--TCAA--GT-----A---GTATCTA-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTTTGA-TTT-T-CTAA--GT-CC-AT-T---TCGTTA--TATTTT----GC-GTTTTCC--CCCA----GCAAAGA----T-T-T-TTG-T-C-CGTTCA-TA----TGG-TT----T---G--TAAT-C-C-------TTTGCTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AGGATTG---GA--GG-CAGAG-----GAGTGGGGC-TT--GC-GAT--AACATCT-TTAAACCAT--AAATTCCAGATTTTG---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---AACGGGC-----ACGT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--ATACGC-----GC-GC-G-G-GTG-CGT----AACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTga
gi|91683 : ATATGGTCAAAAGT-----A---A-----A-G-TC-----AT----GG-----TAGGGA-TTT-GAATTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TTA--A--T-TTTTTT--GC-ATTTTTCACC--A----GCAAAAG----A-T-C-TT--T-C-CTTTCA-TA----TGGGTT----T---GGTTAGT-CAC-------TTT-TTGC----------A---------AA-AACCAT-C----CATGC---AG-ATTGA--GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TA--GC-GAT--AACATCT-TCGA--------------GGA----A---TTT--------TTTT-T-TT--AT---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GCT----T--GAAAGC-----CGT--A--CGC-----CC-GC-G-GAGGGACGTT---AACG---TA----G-AGAT-------TGGAA--CT--TTAAGGC--GGCCT
gi|91684 : ATTTG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GT-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----G
gi|91684 : ----TTTT-T-TT-AA------CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAT-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttttttaacggcaatttcgctgaatcctacgcgcgcg
gi|91685 : atttgtcaaagtagatacattgtaagatttgtttttcaagtccaagtcaatttttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATATG-TCAAA-GT-----A---G-----AAT-AC-----AA----TT-----TAGGGA-TTT-GA-TTT-TTC-AA--GT-CC-CA-GAGTTCA--A--T-TTTC----GC-GTTTTCC--C--A----GCCAAGAATTCT-T-T-TC--T-C-CCTTCA-TA----TGGGTT----TT--G--TA-T-C-C-------ATT-CTGC----------A---------AAATAC-AA-T----CATTC---AG-A---------------AAA-----GAGTGA--C-TT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCTGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TT-TAA---A-C
gi|91685 : TT--AAACA---TA----G-A-AT-------T--AA--TT--TT-AGGC--AGCCTatagaattaattttaggcagcctaa
gi|91686 : atatgtcaaagtagaatacaatttagggatttgatttttcaagtcccagagttcaattttcgcgttttcccagccaagaattcttttctcccttcatatgggttttgtatccattctgcaaaatacaatcattcagaaaagagtgacttgcgataacattttttactttaaatcctgatttgttttttttttATATG-TCCAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCT--A--T-TTTaa
gi|91687 : ATGTG-TCCAA-ATTA---A---G-----A-A-AC-----AT----TG-----TAAG-A-TTT-GATTTT-T-C-AA--AT--C-AA-G---TAA--A--T-TTTT----GC-GTCTT
gi|91687 : TTT-T---TTT---T----TTTT-T-TT-AAATAAA-CGG-C-----A-AT-------CT-C-GC-----T--GAAA-CCATTTC-T--A--CGCTGTCAGC--C-G-G-ATGACGTTA-AAATG---TA----GAA-AT-------T--AA--CT--TTCAGGC--AGCCTtgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtattttttttttttttttttttttttttttttttaaataaacggcaatctcgctgaaaccatttctacgctgtcagccggatgacgttaaaatgtagaaattaactttcaggcagcct
gi|91688 : atgtgtccaaattaagaaacattgtaagatttgatttttcaaatcaagtaaatttttgcgtctttgggcgaatcgtgcaaacaaccgatgaaaactcggacaagtcaaacctgaacggctactgtaaatccgtatttttttttttttttttTATG-TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT-----G-----TAG--A-TTT-GA-TTT---C-AA--GT-CC-AA-----TCAT-A--T-TTTTG---GC-ATTTTAA--C--A----GC-AAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTCA-GA----TGGGTT----T---G--T--T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-T-------------T-------------------AG-CAGAG-----GAGT-G--C-TT--GC-AAT--G--------------TT--AA---CCGGA-TT-G---GTT---G----TTTT-T-TT-AAAGG-A-CGC-A-----A-AT-------TT-T-GC-----T--GAAA-C-----C-TTGA--CAT-----GC-GC-A-G-GTGACGTT---AACGAT-TA----G-A----------T--AAGGCT--TT-AGGTCGAGCCT
gi|91689 : ATG-TCAAAAGT-----ACGAA-----A-T-ATCAACAAT----TG-----TAGG-AATTT-GA-TTT-A-C-AA--GT-C---A-G---TCA--A--TATTCTTAACGCAATTTTCC--G--A----GAAAAGA----T-T-G-TT--TAT-TCTCCATTAACCCCGAGTTATGAT---A--TA-TAC-C-------TAT-CTAC----------A---------AA--AC-A--CCAAACATGCAAGAA-ATTGAGAAGTGAG-CAGAG-----G-GTGG--C-TA--GCAGAT--AGCAACTATATA-CTTA--AAAT-ACCGATTT-GA--TTT---G----TTTTAT-AT-AAA---G-CGA-CAG---A-AA-------TC-C-GCAAAAGT--GACA-A-----A-G--A--CGC-----CC-TCAA-G-ACGACGTT--CAATG---TA----C-A-ATGA-----C--AA--TTACTT-AGAC--aa
gi|91690 : TG-TCAAA-GTGAAGTA---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAG--A-TTT-GT-TTT-T-T-AAAAGT-CCCAA-G---TCA--A--T-TTTT-----------T------------GCAAA-A----T-T-G-TT--T-T-CCTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-C-C-T-------TTT-CAGCATTGAACACTA---------AG-TAC-A--T----CAT-C---AG-ATTG---GGTGA--CAGAG-----GAGTGG--C-TG--CC-GATAAAACATCT-TTTA-CTTTG-AAAT-CCGGAATT-----TTC---G----TTTT-T-TT-TAA---C-TAA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----TTGGAAA-C-----C-T-----CGA-----GCTGC---G-GTGACGTTAGAGACG---TA----A-G-AA-------T--AA--C---TT-AGGC--ACCCTagctta
gi|91691 : -TCAAA-GT-----A---G-----A-T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TAA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCA--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T---CCTTTA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-CTTAAAAGTTT-CTGC----------A---------aa
gi|91692 : -TCAAA-GTT----A---G-----A-TTAC-----AT----TG------AGG-A-TTT-GA-TTTGT-C-AA--GT-CC-AAAG---TAA--AATT-TTTT----GC-GTTT-CA--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CTTT-A-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TT
gi|91693 : AAA-TT-----A---T-----A-T-AC-----AT----TGCTATGTAGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--AT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GGAAAGAC---C-T-T-TT--T-T-TCTTAA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTGC----------A---------AA-CAC-A--G----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-TAGA
gi|91694 : -T-AC-----AT----TG-----TAGG-A-TTT-GA-TTT---C-AG--GT-CC-A--G---TCA--AC-T-TTTT----GA-GTTTTCC--C--A----GGCAAGA----T-A-T-TT--T-C-CTTCAA-CA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTTCCTGC----------A---------AA-TAC----T----CATGC---AG--TTG---GGTGAGCCAGAG-----GAGTGG--CTTT--GC-GAT--AA-AT-T-TTTA-CTTT--AACT-C--GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TA-AAA---A-CGG-CCAAAAA-ATAAAGAAATT-T-GT-----T--GAAA-A-----C-T--A--CGC-----AC-GC-C-G-GTGAC-TT--AAA-G---TA----GAA-ATTACTTTAT--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91695 : AGG-A-TTT-GA-TTT-T-C-AA--GTCCC-AA-A---TCA--T--T-TTTT----GT-GTCTT-T--G--G----GCAAAGaa
gi|91695 : TT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---T----TTTT-T-TTTAAA---A-CGG-C-----A-AT-------------------------A-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----gcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataattaaatccggatttgttttttttttttaaaacggcaatacctacgcgcgcgggtgacgttaaacgta
gi|91696 : aggatttgattttcaagtcccaaatcattttttgtgtctttgggcaaaggcaggtctaatctgtgcaaaaacaacgatgaacccagataaaccaaacctgaactgtaactttataataa-T-C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-ATTTTCC--C--ATGCAGCAAAGA----T-T-T-TT--T-T-CATTCC-TA----TGGGTT----T---G--TG-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CAT--------------------------G-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AACAT
gi|91697 : -C-AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC-GCTTTCC--C--G----GAAAAGA----T-T-T-TT--T-T-CCTTAA-CC----CGAGTT----T---G--TA-T-C-C-------CTT-CTAC----------A---------AA-CCC-A--A----CATGC---AT-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGA-C-----A-AT-------TC----------------------------------C-----GC-GT-G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----C-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGAC--
gi|91698 : -AA--GT-CC-AA-G---TCA--A--T-TTTT----GC--------------------AAAGA----T-T-T-TT--T-C-CTTTCA-TA----TGGGTT----T---G--TA-T-C-C-------TTT-CAGC----------ATTGAACACTAG-TAC-A--T----CATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGT
gi|91699 : -AA-G---TCA--A--T-TTTT----CC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-T-T-TT--T-C-CCTTTA-TA----T
gi|91700 : -TTTT----GC-GTTTTCC--C--A----GCAAAGA----T-TGT-TT--T-C-CCTTCA-TA----TAG-TA----TAAAG--TA-T-C-C-------TTT-CTGC----------A---------AA-TAC-A--C----CATGC---AG-ATTG---GTTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-CT--GC-GAT--AACATTT-TTTA-CTTT--AAAT-CCAGATTT----------------TTTT-T-----AA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-ATGC--AGCCT
gi|91701 : ATGC---AG-ATTG---GGTGAG-CAGAG-----GAGTGG--C-TT--GC-GAT--AGCATCT-TTTA-CTTT--AGAT-
gi|91702 : GTGG--C-TT--GA-GAT--AACATCT-TTTA-CTTT--AAAT-GCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT---A---T-CAG-C-----A-AT-------TT-C-AC-----T--GAAA-C-----T-T--A--TGC-----GC-AC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--
gi|91703 : G--C-TT--GC-GAT--AACATCT-TTTA-CTTA--AAAT-CCGTATTT-G---TTT---G----TTTT-T-T----------------------------------C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCT
gi|91704 : TA-CGTT--AAAT-CCGGATTT-G---TTT---A----TTTT-C-CT-TAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--C
gi|91705 : TA-CTTT--AAAT-CCAGATTT-G---TTTTTGG----TTTT-T-TT-TG------CGA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CAC-----GT-GC-A-G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AAC-CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91706 : --AAAT-CCGGATTT-G---TTT---G----TTTT-TATT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TC----------------------------------C-----GC-GT-G-G-ACGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------G--AA--AT--TT-AGGT--AGCCTa
gi|91707 : CGGATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--GAAA-C-----C-T--A--CGC-----GC-GC-G-G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TC-AGGC--AGTCT
gi|91708 : GATTT-G---TTT---G----TTTT-T-TT-AAA---A-CGG-A-----A-AT-------TT-C-CC-----T--GAAA-T-----C-T--A--TGC-----GC-GC-G-G-GTGATGTT--AAACGTACTA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91709 : ---TTT---G----GTTT-T-TA-AAA---A-CAA-C-----A-AT-------TT-C-GC-----T--G-AA-C-----C-T--A--CGC-----GT-GC-GCG-GTGACATCA-AAATT---TAATTTG-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91710 : C-A-G-GGGACGTT--AACCG---TA----G-A-AT-------T--AC--CT--TT-AGGC--AGCTT
gi|91711 : -G-GTGAAGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91712 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTa
gi|91713 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGAC--AGCCT
gi|91714 : -G-GTGACGTT--AAATG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91715 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT
gi|91716 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-CGGC--AGCCT
gi|91717 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91718 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------C--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91719 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCTaa
gi|91720 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----A-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGT--AGCCT
gi|91721 : -G-GTGACGTT--AAACG---TA----G-A-AT-------T--AA--CT--TA-AGGC--AGCCTaa
gi|91722 : CGTT--AAACG---TA----C-A-AT-------T--AA--CT--TT-AGGC--AGCCT