lowQualScore : 2222 22222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333
lowQualScore : 9999999 11111 666 66 0 4444 0 0 2 2222 0 1 3333333333333333 666666666666 44444444444444444444444 0 0 1 0 0 2 22 0 0 00 333333333333333333333333333333333 2222222 0 1 0 0 0 0 22 11 0 1 1 11 0 0 0 000 5 000 111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 44 22 22 0 5 999 1
lowQualScore : ....... ..... ... .. . .... . . . .... . . ................ ............ ....................... . . . . . . .. . . .. ................................. ....... . . . . . . .. .. . . . .. . . . ... . ... ...... ............................................................................................ .. .. .. . . ... .
lowQualScore : 2222222 88888 111 11 6 0000 5 5 7 2222 5 1 5555555555555555 111111111111 99999999999999999999999 7 5 0 5 5 1 33 9 5 66 999999999999999999999999999999999 4444444 5 4 5 1 5 5 33 22 9 4 5 22 5 5 5 999 4 999 555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 55 99 11 8 0 666 0
consensus : ATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGG-CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGTA---------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTA---T------GNAC-TG--AC--TGAG---------G-----------TA---------TGG-----AGC----------AT----G-------G------G-CTGG-TATGGAG--TA-TAGGAACCGGTAT-GGAGT
Reference ( gi|20935 ) : ATAGACCAGTATGGA-----A-CA-----TGAG-CTGA-T-ATG-A-GGT-A-TA-GA--C-A-G-TA----------------TGG------------AGTA---------------------ATGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GGCTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GTAC-TG--AC--TGAG---------G-----------T----------TAG-----AGC----------AT----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-TAGGAGCCAGTAT-GGAGT
gi|20942 : ATAGACCAGTATGGG-----AGTA-----TGGG-CTGG-T-ATG-A-GGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCATGTACTGACTGAGGTTAGAGCATGAGC-TGA-TAT-G-AGG--T-A-TAGGAGCCAGTATG---------------G----------------AGTG------A-T-G-G-CTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---T------G
gi|20919 : ATAGACCAGTATGGA-----A-CA-----TGAG-CTGA-T-ATG-A-GGT-A-TA-GA--C-A-G-TA----------------TGG------------AGTA---------------------ATGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GGCTGG-TATG-AG-G--T-A-ggc
gi|20919 : atagaccagtatggagtgtgggctggtatggtggtatggactggtatgggaattATAGACCAGTATGGA-----G-TG-----TGGG-CTGG-T-ATG-GTGGT-A-TG-GA--CTG-G-TA----------------TGGGAATTATAGACCAGTATGGAAC---------------ATGAGC-TGA-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--C-AGTATG---------------G----------------AGT-------AAT-G-GGCTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-ATGGGA---GTA---T------GGGC-TG--GTA-TGAG---------G-----------T----------
gi|20920 : ATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----CGAG-CTGA-T-ATG-A-GGT-A--A-GAC-C-A-G-TA----------------TGT------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACTAG-T-AT-GGA---GCA---T------GAGC-TG--ATA-TGAA---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------A-------------------------G-TATGGAG--TG-T--GGGCTGGTAT-GGa
gi|20921 : ATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----CGAG-CTGA-T-ATG-A-GGT-A--A-GAC-C-A-G-TA----------------TGT------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACTAG-T-AT-GGA---GCA---T------GAGC-TG--ATA-TGAA---------G-----------T----------
gi|20936 : atggactggttatggagtATAGACTAGTATAGA-----A-CA-----TGAG-CTGA-T-ATT-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------ATT----------------------ATGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGT-------G-T-G-GGCTGG-TATA-AA-G--C-A-TG-G--ATTGG-T-AT-AAA---GAA---T------GAAT-TG--a
gi|20949 : atggactgctatggagtATAGACCAGTATGGA-----G-TA-----TGGG-CTGG-G-ATG-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGGTGTGTGGGCT--GGTACGGTGT---------------ATGGAC-TGC-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--CTAGTAT----------------A---------------GAAC-------A-T-G-AGCTGA-TATT-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---gtatgg
gi|20916 : gtatgaggtATGGACTGGTATGGA-----G-TA-----TGGA-CTGG-TTATG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------CGAGC-TGA-TAT-G-AGG--T-A--AGA--CCAGTATG---------------T----------------AGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTA---T------GGAC-TG--tta
gi|20916 : acaaaccagtatggatggtacagtgtACAAACCAGTATGGA--------------------TGG-T-ACA-G-TGT-A-TG-GA--CTG-G-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-TGGTTAT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-C-G-AGCTGA-TATG-AG-G--T-A--A-G--ACCAG-T-AT-GTA---GTA---T------GGAC-TG--GTA-TGAG---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------A-------------------------G-TATGGAG--TA-T-GGA-CTGGTAT-GGAGTgtatggagta
gi|20914 : ATAGACTAGTATAGA-----A-CA-----TGAG-CTGA-T-ATT-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------ATT----------------------ATGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGT-------G-T-G-GGCTGG-TATA-AA-G--C-A-a
gi|20939 : atagaccagtatggtgtgtgggctggtacggtgtatggactgctatggagtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TG-GAC-C-A-A-TT----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-T-G-TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTAC----------------G---------------GAGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------T-----------T----------TGG-----AGT----------ATA---G-------G------A-CAGG-TTTGGAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-ATGAA-GAT-A-TG-GA--C-A-A-TT----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTAC----------------G---------------GAGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--A-CAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------GT----------T----------TGG-----AGT----------ATA---G-------G------A-CAGG-TTTGGAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGca
gi|20944 : ATAGACCAATATGGA-----G-TA-----TAGG-CTCG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TGGA--CCAAT-TT---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATC-AA-G--T-A-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---A------GTGC-TG--ca
gi|20937 : tagactggtatgaagtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TG-GAC-C-A-A-TT----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTAC----------------G---------------GAGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------GT----------T----------TGG-----AGT----------Agtatggagta
gi|20945 : ataggctcgtatgaagtATAGACCA-TATGGA-----G-TA-----TAGG-CTCG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TGGA--CCAAT-TT---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACT-G-TATC-AA-G--T-A-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---A------GTGC-TG--
gi|20941 : tagactggtatggaagtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TG-GAC-C-A-A-TT----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-T-G-TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTAC----------------G---------------GAGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------T-----------T----------TGG-----AGT----------AT----gtatggagta
gi|20946 : ataggctcgtatgaagtATAGACCAATATGGA-----G-TA-----TAGG-CTCG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-AAGA-T-A-TGGA--C-AAT-TT---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATC-AA-G--T-A-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---A------GTGC-TG--aggacaggtttggagta
gi|20943 : tagactggtatgaagtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-ATGAA-GAT-A-TG-GA--C-A-A-TT----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTAC----------------G---------------GAGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--A-CAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------GT----------T----------TGG-----AGT----------Agtatggagta
gi|20924 : ataggctcgtatgaagtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-GTG-G-AGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA------------------A------------AATAT--------------------ATGGAC-TGG-TTT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------GTGTATGGAC------AAGTGTGATGAA-T-G-GAGTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------
gi|20953 : ataggacaggtttggagtATAGACCAGTATGGA-----G-TA-----TGGG-CTGG-G-ATG-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------TGT----------------------GTGGGC-TGG-TAC-G-GTG--T-A-TGGA--CTGCTAT----------------G---------------GAGT-------A-T-A-GACTAG-TATcagctggtgtggtgta
gi|20931 : atagggggtatgaggtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-GTG-G-AGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA------------------A------------AATAT--------------------ATGGAC-TGG-TTT-G-GAG--TAA-TAGA--CCAGTATG---------------GTGTATGGACAAGTGTGAGA-------A-T-G-GAGTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---aga
gi|20925 : ataggacaggtttggagtATAGACCAGTATGGA-----A-CA-----TGAG-CTGA-T-ATG-A-GGTAA-TACGAC-C-A-GATA----------------CGT------------A--A---------------------ATGGGCGTGG-TATAG-AGG--T-A-AAGA--CCA-TAT----------------G---------------GAGTA------A-T-G-CGCTGG-TATG-AG-G--T-A-
gi|20925 : atagaccagtatggagtgtgggctggtatgggtgtatgggactggtatggggaatATAGACCAGTATGGA-----G-TG-----TGGG-CTGG-T-ATG---GGT--------------G-TA----------------TG----------------------------------------GGAC-TGG-TAT-G-GGGAAT-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAAC-------A-T-G-AGCTGA-TATG-AG-G--TAA-TACG--ACCAGAT-AC-GTA---A-A---T------GGGCGTGGTAT--AGAG---------G-----------TAAAGACCATATGG-----AGTA---------AT----G-------C------G-CTGG-TATGAGG--TA-
gi|20933 : ATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-GTG-G-AGT-A-TA-GAC-C-A-G-TAAAATATATGACTGGTTTGG------------AGTA---------------------ATAGAC-CAG-TAT-G-GTG--T-A-TGGA--CAAGTGTG---------------AT--------------GA---------A-T-G-GAGTGG-TATG--G-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------
gi|20938 : ataggacaggtttggagtATAGACCATTACGGA-----G-AA-----AGTG-CTGG-T-ATG-G-AGT-A-TA-AA--C-A-G-TA----------------TGG------------AG-A---------------------ATGGAC-AGG-TTT-G-GAG--T-A-TAGG--ACAGGTTT---------------G---------------GAGT-------A-T-A-GACCAG-TATG-GA-G--C-A-TG-G--ACTGG-T-GT-GGA---GTA---T------cagctggtgtggtgta
gi|20927 : atggactggtatcaagtATGGACCAATTTGGA-----G-TA-----TGGA-CTGG-T-ATC-A-AGT-A-TA-GA--CCA-T-TA----------------CGG------------AGAA---------------------A-GTGC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAAA--CCAGTAT----------------G---------------GAGA-------A-T-G-GACAGG-TTTG-GA-G--T-A-TAGG--ACAGG-T-TT-GGA---GTA---T------A-----G--AC--C-AG---------T-----------A----------TGG-----AGC----------AT----G-------G------A-CTGG-TGTGGAG--TA-TAG--ACCAGTAagaccagta
gi|20929 : ATGGACCAATTTGGA-----G-TA-----TGGA-CTG--T-ATC-A-AGT-A-TA-GA--CCA-T-TA----------------CGG------------AGAA---------------------A-GTGC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAAA--CCAGTATGGAGAATGGACAGTTTG---------------GAGT-------A-TAG-GACAGG-TTTG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GGAC-TG--GTG-TGGA---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------A
gi|20930 : ATGGACTGGTGTGGA-----G-TA-----TAGA-CCAG-T-AAA-A-TAT-A-TG-GA--CTG-G-TT----------------TGG------------AGTA---------------------ATAGAC-CAG-TAT-G-GTG--T-A-TGGA--CAAGTGTG---------------A---------------GA---------A-T-G-GAGTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T-------CAC-TG--G---TGTG---------G-----------T-------------------GT----------AA----G-------G------A-CTAA-TGTGATG--TA-T-GGA-CTGGTAT-GGAGgta
gi|20917 : ATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TGGA-CTGG-T-GTG-G-AGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA------------------A------------AATAT--------------------ATGGAC-TGG-TTT-G-GAG--TAA-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------T-GT-------A-T-G-GACAAG-TGTG-AG-A----A-TG-G--AGTGG-T-AT-GGA---GTA---ca
gi|20917 : ataaacagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtATGGACAGGTTTGGA-----G-TA-----TAGGACAGG-T-TTG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TGT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAAA---------------A---------------TA-T-------A-T-G-GACTGG-TTTG-GA-G--T-AATA-G--ACCAG-T-AT-GG----------T------GTAT-GG--AC----AA---------G-----------T----------GTG-----AGA----------AT----G-------G------A-GTGG-TATGGAG--TA-
gi|20913 : ataaacagtatggagaATGGACAGGTTTGGA-----G-TA-----TAGGACAGG-T-TTG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TGT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAAA---------------A---------------TA-T-------A-T-G-GACTGG-TTTG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGT---GTA---T------GGAC-
gi|20956 : ataaaccagtatggagaATAGACCAGTATGGA-----G-TG-----TGGG-CTGG-T-ATG---GGT--------------G-TA----------------TG----------------------------------------GGAC-TGG-TAT-G-GGGAAT-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAAC-------A-T-G-AGCTGA-TATG-AG-G--T-A-aagtgtgatgaatggagt
gi|20918 : tggagtATAAACCAGTATGGA---------------GA-------------------A-TG-GA--C-A-G-TT----------------TGG------------AGTA---------------------TAGGAC-AGG-TTT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-GACTGG-TGTG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-A---AA-----A---T------ATA--TG--AC--TG-G---------T-----------T----------TGG-----AGTA---------AT----A-------G------A-CCAG-TATGGTG--TA-T-GGA-CAAGTGT-a
gi|20910 : ATAGACCAGTATGG---------------T------------------GT-A-TG-GA--CAA-G-TG----------------TGA------------TG-A---------------------ATGGAG-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-C-AGCTGG-TGTG-GT-G--T-A-AG-G--ACTAA-T-GT-G-------A---T------GTAT-GG--AC--T--G---------G-----------TA---------TGG-----AGC----------AA----G-------G------A-CTAG-TGTGGTG--TA--AGGA-CTGGTAT-GGAGTatgaatggagt
gi|20912 : ATAGACCAGTATGG---------------T------------------GT-A-TG-GA--CAA-G-TG----------------T-G------------AG-A---------------------ATGGAG-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T---CACTGG-TGTG-GT-G--T-A-AG-G--ACTAA-T-GT-G-------A---T------GTAT-GG--AC--T--G---------G-----------TA---------TGG-----AGC----------AG----G-------A--------CTAG-TGTGGTG--TA--AGGA-CTGGTAT-GGAGTa
gi|20926 : ACAAACCAGTATGGACTGGTA-CAGTGTATGGA-CTGG-T-ATG-G-AGT-A-TG-GA--CTG-G-TA----------------TGG------------AGTA---------------------a
gi|20911 : atggactggtatggagcaaggactagtgtggtgtaaggactggtatggagtATAGACCAGTATGGA-----G-CA-----TCAG-CTGG-T-GTG-G-TGT-A-AG-GAACT-A-A-TG----------------TGA------------TGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-GAG--C-A-AGGA--CTAGTGTG---------------G---------------T-GT-------A-A-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-
gi|20948 : atagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatgggtATGGACTGGTATGGA-----G-CA-----GGA--CTAG-T-GTG-G-TGT-A-AG-GA--CTG-G-TA----------------TGG------------AGTACAAACCAGT------------ATGGAC-TGG-TAC-A-GTG--T-A-TGGA--CTGAT------------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-
gi|20947 : actggtgtggtgtaaggactaatgtgatgtAGACCAGTATGTA-----G-TA-----TGGA-CTGG-T-ATG-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--CTAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-AGCTGA-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---T------GGGC-TG--G---TATG---------G-----------T------------------GGT----------AT----G-------G------A-CTGG-TATG
gi|20957 : CCAGTATGGA-----G-CA-----CGAG-CTGACT-ATG-A-GGT-ACTA-GAC-C-A-G-TA----------------TGT------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-AAG--g
gi|20950 : tatactGTATGGT-----G-TA-----TTAGACTGG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-A-TA----------------TGG------------AGTA----------------------TAGGC-TCG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TG-G--ACCAA-T-TT-GGA---GTA---
gi|20952 : gtattgagtataagttgGTATGGT-----G-TA-----TTAGACTGG-T-ATGGA-AGT-A-TA-GA--C-C-A-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATAGGC-TCG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TG-G--ACCAA-T-TT-GGA---GTA---
gi|20928 : ATGGA-----G-TA-----TGGA-CTGG-T-ATG-G-AGT-A-TA-GA--C-A---TA----------------TGG------------AGC----------------------ACGAGC-TGA-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------TAGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-AG-G--
gi|20934 : atggactggtacagtgtatggactgA-----TGGG-CTGG-T-ATG-A-GGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGGG-----------AGTA----------------------TGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-TACTGA-C-TG-AG-G--T------------------T-AGA---GCA---T------GAGC-TG--ATA-TGAG---------G-----------TA---------TAGGAGCCAGT----------AT----GGAGTGATG------G-CTGG-TATGAGG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGTagga
gi|20936 : A-----TGGA-CTGC-T-ATG-G-AGT-A-TA-GA--CTA-G-TA----------------TAG------------AACA----------------------TGAGC-TGA-TAT-T-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GATT-------A-T-G-GGCTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---T------G-----G--GC--T--G---------G-----------TA---------TAA-----AGC----------AT----G-------G------A-TTGG-TATAAAG--AA-T--GAATTGGTAT-GG
gi|20915 : A-----TGGA-CTGG-T-ATG-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATGGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--CTAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-AGCTGA-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---T------GGGC-TG--G---TATG---------G-----------T------------------GGT----------AT----G-------G------A-CTGG-TATGGGAATTA-TAG--ACCAGTAT-GGA
gi|20937 : A-----TAGG-CTCG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TGGA--CCAAT-TT---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATC-AA-G--T-A-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---A------GTGC-T----------G---------G-----------TA---------TGG-----AGT----------AT----A-------A------A-CCAG-TATGGAG--AA-T-GGA-CAGGTTT-GGAGT
gi|20941 : A-----TAGG-CTCG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TGGA--CCAAT-TT---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACT-G-TATC-AA-G--T-A-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---A------GTGC-T----------G---------G-----------TA---------TGG-----AGT----------AT----A-------A------A-CCAG-TATGGAG--AA-T-GGA--CAGTTT-GGAGTa
gi|20943 : A-----TAGG-CTCG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-AAGA-T-A-TGGA--C-AAT-TT---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GACTGG-TATC-AA-G--T-A-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---A------GTGC-T----------G---------G-----------TA---------TGG-----AGT----------AT----A-------A------A-CAG--TATGGAG--AA-T-GGA-CAGGTTT-GGAGTataggacaggtttggagta
gi|20932 : A-----TGGA-CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TG-GA--CCA-A-TT----------------TGG------------AGTA----------------------TGGAC-TGG-TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTAC----------------G---------------GAGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------GT----------T----------TGG-----AGT----------ATA---G-------G------A-CAGG-TTTGGAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGa
gi|20938 : A-----TGGA-CTGG-T-ATC-A-AGT-A-TA-GA--CCA-T-TA----------------CGG------------AGAA---------------------A-GTGC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAAA---CAGTAT----------------G---------------GAGA-------A-T-G-GACAGG-TTTG-GA-G--T-A-TAGG--ACAGG-T-TT-GGA---GTA---T------A-----G--AC--C-AG---------T-----------A----------TGG-----AGC----------AT----G-------G------A-CTGG-TGTGGAG--TA-TAG--ACCAGTAca
gi|20922 : A-----TGGA-CTGG-T-ATG-G-AGC-A-AG-GA--CTA-G-TG----------------TGG------------TGTA---------------------A-GGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-CAAA--CCAGTATG---------------GATGGTACA-------GTGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-TG-G--ACTGG-TTAT-GGA---GTA---T------A-----G--AC--C-AG---------T-----------A----------TGG-----AGC----------AC----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-
gi|20928 : A-----TGGA-CTGG-T-ACA-G-TGT-A-TG-GA--C-T-G--A----------------TGG------------AGTA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-TAGA--C--ATATG---------------G----------------AGC-------A-C-G-AGCTGA-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GTA---GTA---T------GGAC-TG--GTA-TGAG---------G-----------
gi|20913 : A-----TAAA-CCAG-T-ATG-G-AGA-A-TG-GA--C-A-GGTT----------------TGG------------AGTA---------------------TAGGAC-AGG-TTT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G----------------AGC-------A-T-G-GACTGG-TGTG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-A---AA-----A---T------ATAT-GG--AC--TG-G---------T-----------T----------TGG-----AGT----------AT----A-------G------A-CCAG-TATGGTG--TA-T-GGA-CAAGTGT-agga
gi|20923 : A-----TGGA-CTGG-T-ATG-G-AGC-A--G-GA--CTA-G-TG----------------TGG------------TGTA---------------------A-GGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-CAAA--CCAGTATG---------------GACTGGTACA------GTGT-------A-T-G-GACTG---ATG-GA-G--T-A-TG-G--ACTGG-T-AT-GGA---GTA---T------A-----G--AC--ATA---------------------------------TGG-----AGC----------AC----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-atgaatggagt
gi|20926 : A-----TGGA-CTGG-T-ATG-G-AGC-A-AG-GA--CTA-G-TG----------------TGG------------TGTA---------------------A-GGAC-TGG-TAT-G-GAG--T-A-CAAA--CCAGTATG---------------GACTGGTACA------GTGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-TG-G--ACTGG-T-AT-GGA---GTA---
gi|20944 : -CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-A-TA----------------TGG------------AGTA----------------------TAGGC-TCG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TG-G--ACCAA-T-TT-GGA---GTA---T------GGAC-TG--GTA-TCAA---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------ATTACGG-------AGAAAGTG-CTGG-TATGGAG--TA-
gi|20945 : taga-CTGG-T-ATGGA-AGT-A-TA-GA--C-C-A-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATAGGC-TCG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TG-G--ACCAA-T-TT-GGA---GTA---T------GGAC-TG--TA--TCAA---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------ATTACGG-------AGAAAGTG-CTGG-TATGGAG--TA-
gi|20946 : taga-CTGG-T-ATG-A-AGT-A-TA-GA--CCA-A-TA----------------TGG------------AGTA----------------------TAGGC-TCG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-GACTGG-TATGAAG-A--T-A-TG-G--A-CAA-T-TT-GGA---GTA---T------GGAC-TG--GTA-TCAA---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------ATTACGG-------AGAAAGTG-CTGG-TATGGAG--TA-
gi|20948 : taga-CTGG-T-GTG-G-TGT-A-AG-GA--CTA-A-TG----------------TGA------------TGTA----------------------TGGAC-TGG-TAT-G-GAG--C-A--GGA--CTAGTGTG---------------G---------------T-GT-------A-A-G-GACTGG-TATG-GA-G--T-A-CA-A--ACCAG-T-AT-GGACTGGTACAGT------GTAT-GG--AC--TGA---------------------------------TGG-----AGT----------AT----G-------G------A-CTGG-TATGGAG--TA-
gi|20955 : aTGG-T-ATG-A-G-T-A-TAAGT--T-G-G-TA----------------TGG------------TGTA---------------------TTAGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAATATG---------------G----------------AGT-------A-T-A-GGCTCG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GGAC-TG--
gi|20954 : gTGG-T-ATT-G-AGT-A-TAAGT--T-G-G-TA----------------TGG------------TGTA---------------------TTAGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAATATG---------------G----------------AGT-------A-T-A-GGCTCG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GGAC-TG--GTA-TGAA---------G-----------T----------gtatgaag
gi|20953 : gGG-T-ATG-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATGGGC-TGG-GAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------T-GT-------G-T-G-GGCTGG-TACG-GT-G--T-A-TG-G--ACTGC-T-AT-GGA---GTA---T------AGAC-Ta
gi|20949 : ataggg-T-ATG-A-GGT-A-TA-GAC-C-A-G-TA----------------TGG------------AGT----------------------ATGGGC-TGG-GAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------T-GT-------G-T-G-GGCTGG-TACG-GT-G--T-A-TG-G--ACTGC-T-AT-GGA---GTA---T------A-----G--AC--T-AG---------T-----------A----------TAG-----AAC----------AT----G-------A------G-CTGA-TATTAGG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAagtataga
gi|20951 : g-T-ATG-A-G-T-A-TAAGT--T-G-G-TA----------------TGG------------TGTA---------------------TTAGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAATATG---------------G----------------AGT-------A-T-A-GGCTCG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GGAC-TG--tta
gi|20911 : g-T-ATG-G-TGT-A-TG-GA--C-AAG-TG----------------TGA------------TG-A---------------------ATGGAG-TGG-TAT-G--GG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G----------------AGC-------A-T-C-AGCTGG-TGTG-GT-G--T-A--A-GGAACTAA-T-GT-G-------A---T------GTAT-GG--AC--TG-----------G-----------TA---------TGG-----AGC----------AA----G-------G------A-CTAG-TGTGGTG--TA--AGGA-CTGGTAT-GGAGTgtatgaagatatggacaatttggagta
gi|20950 : atagaccagTG-A-G-T-A-TAAGT--T-G-G-TA----------------TGG------------TGTA---------------------TTAGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAATATG---------------G----------------AGT-------A-T-A-GGCTCG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------G-----G--AC--T--G---------G-----------TA---------TGA-----AGT----------AT----G-------G------A-CCAA-TTTGGAG--TA-a
gi|20924 : gtatTG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TGT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAAA---------------A---------------TA-T-------A-T-G-GACTGG-TTTG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGT---GTA---T------GGAC--A--AG--TGTG---------A-----------T------------G-----A------------AT----G-------G------A-GTGG-TATGGAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAG
gi|20931 : ataggacaggttTG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TGT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTAAA---------------A---------------TA-T-------A-T-G-GACTGG-TTTG-GA-G--T-AATA-G--ACCAG-T-AT-GG----------T------GTAT-GG--AC----AA---------G-----------T----------GTG-----AGA----------AT----G-------G------A-GTGG-TATGGAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGcatcagctggtgtggtgta
gi|20933 : ataggacaggttTG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGCA----------------------TGGAC-TGG-TGT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTA---------------------------------AAAT-------A-T-ATGACTGG-TTTG-GA-G--TAA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGT---GTA---T------GGAC--A--AG--TGTG---------A-----------T------------G-----A------------AT----G-------G------A-GTGG-TATG-GG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGca
gi|20956 : ataggacaggttTG-G-AGT-A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGG------------AGTG----------------------TGGGC-TGG-TAT-G--GG--T------------GTATG---------------G---------------GA-----------------CTGG-TATG-GG-GAAT-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---ACA---T------GAGC-TG--ATA-TGAG---------G-----------T----------catcagctggtgtggtgta
gi|20942 : -A-TA-GA--CCA-G-TA----------------TGGG-----------AGTA----------------------TGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-T-G-TACTGA-C-TG-AG-G--T------------------T-AGA---GCA---T------GAGC-TG--ATA-TGAG---------G-----------TA---------TAGGAGCCAGT----------AT----GGAGTGATG------G-CTGG-TATGAGG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGTaa
gi|20929 : -A-TG-GA--CCA-A-TT----------------TGG------------AGTA----------------------TGGAC-TG--TAT-C-AAG--T-A-TAGA--CCATTACG---------------G----------------AGA-------A-A-G-TGCTGG-TATG-GA-G--T-A-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---T------G-----G--AC----AG---------T-----------T----------TGG-----AGT----------ATA---G-------G------A-CAGG-TTTGGAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGgtgggc
gi|20957 : --C-A-G-TA----------------TGG------------AGC----------------------ACGAGC-TGACTAT-G-AGG--T-ACTAGA--CCAGTAT----------------G---------------TAGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-AA-G--catggactggtgtggagtatagaccagta
gi|20952 : tatactc-G-TA----------------TGG------------TGTA---------------------TTAGAC-TGG-TAT-GGAAG--T-A-TAGA--CCA-TATG---------------G----------------AGT-------A-T-A-GGCTCG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GG--------------------------------------------------------------------------AGC----------AT----G-------G------A-CTGG-TATGAAG--TA-T-GGA-CCAATTT-GGAGT
gi|20934 : ---------------------ATGGGC-TGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GGCTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GTAC-TG--AC--TGAG---------G-----------T----------TAG-----AGC----------AT----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-TAGGAGCCAGTAT-GGAGTa
gi|20919 : ---------------------ATAGAC-CAG-TAT-G-GAG--T-G-TGGG--CTGGTATG---------------G---------------TGGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-GG-AATT-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---ACA---T------GAGC-TG--ATA-TGAG---------G-----------TATAGACAGTATGG-----AGTA---------AT----G-------G------G-CTGG-TATGAGG--TA-TAG--ACCAGTATGGGAGTgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagt
gi|20914 : ---------------------ATAGAC-CAG-TAT-G-GTG--T-G-TGGG--CTGGTACG---------------G---------------T-GT-------A-T-G-GACTGC-TATG-GA-G--T-A-TA-G--ACTAG-T-AT-AGA---ACA---T------GAGC-TG--ATA-TTAG---------G-----------TA---------TAG-----ACCAGTATGGATTAT----G-------G------G-CTGG-TATGAGG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGTatgggctggtatgaggta
gi|20941 : ---------------------ATAGGC-TCG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G----------------AGC-------A-T-G-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TG-G--ACCAA-T-TT-GGA---GTA---T------GGAC-TG--TA--TCAA---------G-----------TA---------TAG-----ACC----------ATTACGG-------AGAAAGTG-CTGG-TATGGAG--TA-TA--AACCAGTAT-GGAGgtgggctggtataaagca
gi|20946 : TAGAC-TGG-TAT-G-AAG--T-A-TAGA--CCAATATG---------------G----------------AGT-------A-T-A-GGCTCG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GGAC-TG--GTA-TGAA---------GATATGGACAATT----------TGG-----AGT----------AT----G-------G------A-CTGG-TATCAAG--TA-TAG--ACCATTAC-GGAGaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20955 : -TGG-TAT-G-AG---T-A-TAAG--TTGGTATG---------------G---------------T-GT-------A-TTA-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAA-T-AT-GGA----------------GTA----------------------------------------------TAG---------------------------------------G-CTCG-TATGAAG--TA-TAGA--CCAGTAT-GGAGaaagtgctggtatggagta
gi|20954 : g-TGG-TAT-T-GAG--T-A-TAAG--TTGGTATG---------------G---------------T-GT-------A-TTA-GACTGG-TATG-AA-G--T-A-TA-G--ACCAA-T-AT-GGA----------------GTA----------------------------------------------TAG---------------------------------------G-CTCG-TATGAAG--TA-TAGA--CCAGTAT-GGAGcatggactggtatgaag
gi|20953 : gGG-TAT-G-AGG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G----------------AGT-------A-T-G-GGCTGG-GATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGT---GTG---T------GGGC-TG--G---TACG---------G-----------T-------------------GT----------AT----G-------G------A-CTGC-TATGGAG--TA-TAG--ACTAGTAT-AGAcatggactggtatgaagta
gi|20956 : atagggT-G-GAG--T-A-TAGA--CCAGTATG---------------G----------------AGT-------G-T-G-GGCTGG-TATG-GGTG--T-A-TG-GG-ACTGG-T-AT-GGG---GAA---T------ATA---G--AC--C-AG---------T-----------A----------TGG-----AAC----------AT----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-
gi|20957 : --T-A-TACT--CCAGTAT----------------G---------------GAGC-------A-C-G-AGCTGACTATG-AG-G--T-ACTA-G--ACCAG-T-AT-GTA---GTA---T------GGAC-TG--a
gi|20942 : -A-TAGA--CCAGTATG---------------G---------------GAGT-------A-T-G-GGCTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T------GTAC-TG--AC--TGAG---------G-----------T----------TAG-----AGC----------AT----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-TAGGAGCCAGTAT-GGAGTgtatgaag
gi|20928 : -A-TGGA--CTGGTACA---------------G---------------T-GT-------A-T-G-GACTG---ATG-GA-G--T-A-TG-G--ACTGG-T-AT-GGA---GTA---T------A-----G--AC--ATA---------------------------------TGG-----AGC----------AC----G-------A------G-CTGA-TATGAGG--TA-TAG--ACCAGTAT-GTAGTgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagtgtgggc
gi|20926 : -A-TGGA--CTGGTATG---------------G----------------AGC-------A-A-G-GACTAG-TGTG-GT-G--T-A-AG-G--ACTGG-T-AT-GGA---GTA---CAAACCAGTAT-GG--AC--T--G---------G-----------TA---------CAG-----TGT----------AT----G-------G------A-CTGG-TATGGAG--TA-T-GGA-CTGGTAT-GGAGTatggactggtatgaggagga
gi|20947 : AGA--CCAGTATG---------------T----------------AGT-------A-T-G-GACTGG-TATG-AG-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTA---T------GGAC-TGGTAT--GGAGTATAGACTAG-----------TA---------TGG-----AGC----------AT----G-------A------G-CTGA-TATGAAG--TA-TAG--ACCAGTAT-GGAGTa
gi|20951 : G-TATG-AG----T-A-TA-A--GTTGG-T-AT-GG----------T------GTA-----------------------------------T----------TAG-----A-----------------------------------CTGG-TATGAAG--TA-TAGA--CCAATAT-GGAGTgtgggctggtatggtggtatggactggtatgg
gi|20956 : TG-GA-G--T-A-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---T------GGGC-TG--GTA-TG-G---------G-----------T-------------------GT----------AT----G-------G------GACTGG-TATGGGGAATA-TAGA--CCAGTAT-GGAataggctcgtatgaagtatagaccagtatggagcatggactggtatgaagatatggacaatttggagta
gi|20957 : --T-A-TA-C--TCCAG-T-AT-GGA---GCA---C------GAGC-TG--ACTATGAG---------G-----------TAC--------TAG-----ACC----------A-------------------------G-TATGTAG--TA-T-GGA-CTGGTAT-GAAGacatgagctgatatgaggtaa
gi|20957 : ----------TGG-----AGC----------AC----G-------A------G-CTGACTATGAGG--TACTAGA--CCAGTAT-GTAGT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222 111111111111 777777777777777777777 33
lowQualScore : 2 0 1 1 0 0 11 0 0 11 0 3333333333333333333333333 0 1 1 0 11 666666666666 0 0 0 0 11111 11 22 0 0 11 2 0 0 111 111 1 999999999999999999999 0 0 0 2 1111 3333333333 5 2222222 1 0 33 1 11 3
lowQualScore : . . . . . . .. . . .. . ......................... . . . . .. ............ . . . . ..... .. .. . . .. . . . ... ... . ..................... . . . . .... .......... . ....... . . .. . .. .
lowQualScore : 7 9 8 3 8 8 11 8 8 11 8 0000000000000000000000000 8 5 5 7 00 444444444444 7 7 7 7 99999 00 88 7 7 00 0 7 7 222 222 0 222222222222222222222 8 8 8 4 8888 6666666666 3 9999999 4 9 33 8 55 4
consensus : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA---------------------A-TGGACTGGTATGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------GAGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-G--ACCGG-T-AT-GGA---GTA---TGGACTG--------G----------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GAC-TGGTATGG--AGT-ATAGG-ACCAGTATGGAGT
Reference ( family-384 ) : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGGCTGG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA---------------------A-TGGACTGGTATGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------GAGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTA---TGNACTGAC-T--GAG----------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GGC-TGGTATGG--AGT-ATAGGAACCGGTATGGAGT
gi|20910 : A-T-AGACCAG-T-ATG--GTG-TA-TG--GACAAGTGT-GATG-A---------------------A-TGGAGTGGTATGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG----------AGC-A-T-CA-GC-----TGGT--GTGGTG--TA-AG-G--ACTAA-T-GT-GAT---GTA---TGGACTG-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------A-G-------GAC-TAGTGTGG--TGT-A-AGGA-CTGGTATGGAGT
gi|20911 : A-T-AGACCAG-T-ATG--GTG-TA-TG--GACAAGTGT-GATG-A---------------------A-TGGAGTGGTATGG--G-T-A-TAG--ACCAGTATGG----------AGC-A-T-CA-GC-----TGGT--GTGGTG--TA--A-GGAACTAA-T-GT-GAT---GTA---TGGACTG-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------A-G-------GAC-TAGTGTGG--TGT-A-AGGA-CTGGTATGGAGTa
gi|20912 : A-T-AGACCAG-T-ATG--GTG-TA-TG--GACAAGTGT-G-AG-A---------------------A-TGGAGTGGTATGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGC-A-T--C-AC-----TGGT--GTGGTG--TA-AG-G--ACTAA-T-GT-GAT---GTA---TGGACT---------G----------GTA-T-G-G-AGC----A------------G-------GAC-TAGTGTGG--TGT-A-AGG-ACTGGTATGGAGTa
gi|20913 : ATAAACCAGTATGG-AGAA-T-GGACAGG-T-TTG--GAG-TA-TA------------------------------------------GGACAGGTTTGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGC-A-T-GG-AC-----TGGT--GTGGAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AA-AAT---ATA---TGGACT---------G----------GTT-T-G-G-AGT----A----------T-A-------GAC-CAGTATGG--TGT-ATGGa
gi|20913 : ATAGACCAGTATGG-TGTA-T-GGACAAG-T-GTG--ATG-AA-TG--GAacaagtgtgatgaatggagt
gi|20914 : ataaaccagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGT---GTG---TGGGCTG-------------------GTA-C-G-G-TGT----A----------T-G-------GAC-TGCTATGG--AGT-ATAG--ACTAGTATAGAgt
gi|20914 : TGGGCTGGTACGG-TGTA-T-GGACTGC-T-ATG--GAG-TA-TA--GACTAGTAT-AGAACA-----------------------TGAGCTGATATTAG-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG----------ATT-A-T-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---TGGGCT---------G----------GTA-T-A-A-AGC----A----------acatgagctgatattaggtatagaccagtatggattatgggctggtatgaggtatagaccagtatggagtgtgggctggtataaagca
gi|20915 : atagaccagtatggtgtgA-T-GGACTGG-T-ATG--AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT----------------------A-TGGACTGGTATGGA-G-T-A-TAG--ACTAGTAT-G---------GAGC-A-T-GA-GC-----TGAT--ATGAAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---TGGGCT---------G----------GTA-T-G-GTGGT----A----------T-G-------GAC-TGGTATGGGAATT-ATAG--ACCAGTATGGA
gi|20916 : -A-CAA--ACCAGTATGGATGGTACA-GTGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TG-G--ACTGGTT-AT-GGA---GTA---TAGACC---------A----------GTA-T-G-G-AGC----A----------C-G-------AGC-TGATATGA--GGT-A-AG--ACCAGTATGTAGT
gi|20916 : ATGGACTGGTATGG-AGTA-T-GGACTGG-TTATG--GAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGCA-----------------------CGAGCTGATATGAG-G-T-A--AG--ACCAGTATGT----------AGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTA---TGGACT---------G----------GTA-T-G-G-AGT----A----------atggactggtatgaggtatagaccagtatggagtatggactggtatggagta
gi|20917 : acaaaccagtatggatggtacagtgtA-TA--AAC-AGTAT-GGAG-A---------------------A-TGGACAGGTTTGGA-G-T-A-TAG--GACAGGTTTG---------GAGT-A-T-AG-AC-----CAGT--ATGGAG--CA-TG-G--ACTGG-T-GT-GGA---GTA---TAGACC-AG-T--AAA----------ATA-T------------A----------T-G-------GAC-TGGTTTGG--AGTAATAG--ACCAGTATGGTGT
gi|20917 : G-T-ATG--GAG-AA-TG--GACAGGTTT-GGAGTA---------------------T-AGGACAGGTTTGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGC-A-T-GG-AC-----TGGT--GTGGAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AA-AAT---ATA---TGGACTGGT-TTGGAGTAATAGACCAGTA-T-G-G-TGT----A----------T-G-------GAC-AAGTGT-G--AGA-AT-GGAG-TGGTATGGAGTatggacaagtgtgagaatggagtggtatggagta
gi|20917 : ataaacaATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-GTG--GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATAT--------------------A-TGGACTGGTTTGGA-G-TAA-TAG--ACCAGTATGG---------T-GT-A-T-GG-AC-----AAGT--GT-GAG--AA-TG-G--AGTGG-T-AT-GGA---GTA---a
gi|20918 : ataaacagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtA-TA--AACCAGTAT-GGAG-A---------------------A-TGGAC-AGTTTGGA-G-T-A-TAG--GACAGGTTTG---------GAGT-A-T-AG-AC-----CAGT--ATGGAG--CA-TG-G--ACTGG-T-GT-GGA---GTA---TAGACC-AG-T--AAA----------ATA-T------------A----------T---------GAC-TGGTTTGG--AGTAATAG--ACCAGTATGGTGT
gi|20918 : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-GTG--GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATAT--------------------A-T-GACTGGTTTGGA-G-TAA-TAG--ACCAGTATGG---------T-GT-A-T-GG-ACAAGTGTGATGAATGGAG--Tatggacaagtgtgatgaatggagt
gi|20919 : ataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagtA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---TGGGCT---------G----------GTA-T-G-GTGGT----A----------T-G-------GAC-TGGTATGGGAATT-ATAG--ACCAGTATGGA
gi|20919 : TGGGCTGGTATGGTGGTA-T-GGACTGG-T-ATGGGAAT-TA-TA--GACCAGTAT-GGAACA-----------------------TGAGCTGATATGAG-G-T-A-TAG--AC-AGTATGG----------AGT-AAT-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGGA---GTA---TGGGCTGGTAT--GAG----------GTA-acatgagctgatatgaggtatagacagtatggagtaatgggctggtatgaggtatagaccagtatgggagtatgggctggtatgaggta
gi|20919 : atagaccagtatggagtgATAGACCAGTATGG-AACA-T-GAGCTGA-T-ATG--AGG-TA-TA--GAC-AGTAT-GGAGTA---------------------A-TGGGCTGGTATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------GAGT-A-T-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-
gi|20920 : atagaccagtatggagtgtgggctggtatggtggtatggactggtatgggaattATAGACCAGTATGG-AGCA-C-GAGCTGA-T-ATG--AGG-TA--A--GACCAGTAT-GTAGT----------------------A-TGGACTGGTATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-G--ACTAG-T-AT-GGA---GCA---TGAGCTGA-------------------TA-T-G-A-AGT----A----------T-A-------GAC-CAGTATGG--AGT-GTGGG--CTGGTATGG
gi|20921 : ATAGACCAGTATGG-AGCA-C-GAGCTGA-T-ATG--AGG-TA--A--GACCAGTAT-GTAGTA-----------------------TGGACTGGTATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG----------AGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-G--ACTAG-T-AT-GGA---GCA---TGAGCTGATAT--GAA----------GTA-
gi|20922 : atggactggttatggagtA-T-GGACTGG-T-ATG--GAG-CA-AG--GACTAGTGT-GGTGTA---------------------A--GGACTGGTATGGA-G-T-A-CAA--ACCAGTATGGATGGTACA-GTGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TG-G--ACTGG-TTAT-GGA---GTA---TAGACCA-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------C-G-------AGC-TGATATGA--GGT-A
gi|20923 : A-T-GGACTGG-T-ATG--GAG-CA--G--GACTAGTGT-GGTGTA---------------------A--GGACTGGTATGGA-G-T-A-CAA--ACCAGTATGGACTGGTACAGTGT-A-T-GG-AC-----TG----ATGGAG--TA-TG-G--ACTGG-T-AT-GGA---GTA---TAGAC---------------------ATA-T-G-G-AGC----A----------C-G-------AGC-TGATATGA--GGT-A
gi|20924 : -G-------GAC-AGGTTTGG--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAG
gi|20924 : ataATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-GTG--GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATAT--------------------A-TGGACTGGTTTGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------T-GT-A-T-GG-AC-----AAGT--GTGATG--AA-TG-G--AGTGG-T-AT-GGA---GTA---TAGACC---------A----------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-C-------AGC-TGGTGTGG--TGT-Acatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatggagtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20925 : ataggacaggtttggagt---------------------A-TAGACCAGTATGGA-G-T-G-TGG--GCTGGTATGG---------GTGT-A-T-GGGAC-----TGGT--ATGGGGAATA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---ACA---TGAGCTGATAT--GAG----------GTAAT-ACG-ACC----AGATACGTAAAT-G-------GGCGTGGTATAG--AG--GTAAAGACCA-TATGGAGT
gi|20925 : AGACCA-TATGG-AGTAAT-GCGCTGG-T-ATG--AGG-TA-aatgcgctggtatgaggta
gi|20926 : atagaccagtatggagtgtgggctggtatgggtgtatgggactggtatggggaatatagaccagtatggaacatgagctgatatgaggtaatacgaccagatacgtaaatgggcgtggtatagaggtaaA-T-GGACTGG-T-ATG--GAG-CA-AG--GACTAGTGT-GGTGTA---------------------A--GGACTGGTATGGA-G-T-A-CAA--ACCAGTATGGACTGGTACAGTGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-TG-G--ACTGG-T-AT-GGA---GTA---
gi|20927 : ATGGACCAATTTGG-AGTA-T-GGACTGG-T-ATC--AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAG-A---------------------A-AGTGCTGGTATGGA-G-T-A-TAA--ACCAGTAT-G---------GAGA-A-T-GG-AC-----AGGT--TTGGAG--TA-TAGG--ACAGG-T-TT-GGA---GTA---TAGACC---------A----------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GAC-TGGTGTGG--AGT-ATAG--ACCAGTA
gi|20928 : A-T-GGACTGG-T-ACA--GTG-TA-TG--GACTG--AT-GGAGTA-----------------------TGGACTGGTATGGA-G-T-A-TAG--AC--ATATGG----------AGC-A-C-GA-GC-----TGAT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GTA---GTA---TGGACTGGTAT--GAG----------G
gi|20929 : ATGGACCAATTTGG-AGTA-T-GGACTG--T-ATC--AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAGAA---------------------AGTG--CTGGTATGGA-G-T-A-TAA--ACCAGTATGG----------AGA-A-T-GG-AC------AGT--TTGGAG--TA-TA-G--GACAGGT-TT-GGA---GTA---TAGACCA-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GAC-TGGTGTGG--AGT-ATAG--ACCAGTAagga
gi|20930 : ATGGACTGGTGTGG-AGTA-T-AGACCAG-T-A----AAA-TA-TATGGACTGGTTT-GGAGTA---------------------A-TAGACCAGTATGGT-G-T-A-TGG--ACAAGTGTGA---------GA---A-T-GG-AG-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---T-CACT---------G----------GTG-T-G-G-TGT----A----------A-G-------GAC-TAATGTGA--TGT-AT--GGACTGGTATGGAG
gi|20931 : -GGACAGG-T-TTG--GAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGCA-----------------------TGGACTGGTGTGGA-G-T-A-TAG--ACCAGTAAAA---------TA-T-A-T-GG-AC-----TGGT--TTGGAG--TAATA-G--ACCAG-T-AT-GGT---GTA---TGGAC---------AA----------GTG-T-G---AGA----A----------T-G-------GAG-TGGTATGG--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAGca
gi|20932 : ataA-T-GGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT----------------------A-TGGACTGGTATCAA-G-T-A-TAG--ACCATTAC-G---------GAGA-A-A-GT-GC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---TGGAC---------AG----------GTT-T-G-G-AGT----A----------TAG-------GAC-AGGTTTGG--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAGca
gi|20933 : -G-------GAC-AGGTTTGG--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAGca
gi|20933 : ataATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-GTG--GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATAT--------------------A-TG-ACTGGTTTGGA-G-T-AATAG--ACCAGTATGG---------T-GT-A-T-GG-AC-----AAGT--GTGATG--AA-TG-G--AGTGG-T-AT-GG----GTA---TAGACCA-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-C-------AGC-TGGTGTGG--TGT-Acatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatgggtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20934 : ataggacaggtttggagt---------------------A-TGGGCTGGTATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------GAGT-A-T-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---TGTACTGAC-T--GAG----------GT--T-A-G-AGC----A----------T-G-------AGC-TGATATGA--GGT-ATAGGAGCCAGTATGGAGT
gi|20934 : A-T-GGGCTGG-T-ATG--AGG-TA-TA--GACCAGTATGGGAGT----------------------A-TGGGCTGGTATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGC-A-T-GT-AC-----TG----ACTGAG---------------G-T--T-AGA---GCA---TGAGCTGATAT--GAG----------GTA-TAG-G-AGCCAGTA----------T-GGAGTGATGGC-TGGTATGA--GGT-ATAG--ACCAGTATGGAGTgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagt
gi|20935 : ATAGACCAGTATGG-AACA-T-GAGCTGA-T-ATG--AGG-TA-TA--GAC-AGTAT-GGAGTA---------------------A-TGGGCTGGTATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------GAGT-A-T-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---TGTACTGAC-T--GAG----------GT--T-A-G-AGC----A----------T-G-------AGC-TGATATGA--GGT-ATAGGAGCCAGTATGGAGT
gi|20936 : A-T-GGACTGC-T-ATG--GAG-TA-TA--GACTAGTAT-AGAAC----------------------A-TGAGCTGATATTAG-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GATT-A-T-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---TGGGCT---------G----------GTA-T-A-A-AGC----A----------T-G-------GAT-TGGTATAA--AGA-AT--GAATTGGTATGG
gi|20937 : A-TA-G--GCTCG-T-AT-GAA---GTA---TAGACCA-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GAC-TGGTATGA--AGT-AT--GGACCAATTTGGAGT
gi|20937 : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT----------------------A-TGGACTGGTATCAA-G-T-A-TAG--ACCATTAC-G---------GAGA-A-A-GT-GC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---TGGAC---------AG----------GTT-T-G-G-AGT----A----------atggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20938 : ataggctcgtatgaagtA-T-GGACTGG-T-ATC--AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAGAA---------------------AGTG--CTGGTATGGA-G-T-A-TAA--AC-AGTATGG----------AGA-A-T-GG-AC-----AGGT--TTGGAG--TA-TA-G--GACAGGT-TT-GGA---GTA---TAGACCA-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GAC-TGGTGTGG--AGT-ATAG--ACCAGTA
gi|20939 : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT----------------------A-TGGACT-GTATCAA-G-T-A-TAG--ACCATTAC-G---------GAGA-A-A-GT-GC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---TGGAC----------A----------GTT-T-G-G-AGT----A----------TAG-------GAC-AGGTTTGG--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-ATG--AAGATA-TG--GA-CAATTT-GGAGT----------------------A-TGGACTGGTATCAA-G-T-A-TAG--ACCATTAC-G---------GAGA-A-A-GT-GC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-A--A-CAG-T-AT-GGA---GAA---TGGAC---------AG----------GTT-T-G-G-AGT----A----------TAG-------GAC-AGGTTTGG--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAGca
gi|20941 : A-TA-G--GCTCG-T-AT-GAA---GTA---TAGACCA-------------------GTA-T-G-G-AGC----A----------T-G-------GAC-TGGTATGA--AGT-AT--GGACCAATTTGGAGTca
gi|20941 : ATAGACCAGTATGG-AGCA-T-GGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT----------------------A-TGGACT-GTATCAA-G-T-A-TAG--ACCATTAC-G---------GAGA-A-A-GT-GC-----TGGT--ATGGAG--TA-TA-A--ACCAG-T-AT-GGA---GAA---TGGAC----------A----------GTT-T-G-G-AGT----A----------TAG-------GAC-AGGTTTGG--AGT-Aatggactgtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20942 : ataggctcgtatgaagt-A-TAG--ACCAGTATGG---------GAGT-A-T-GG-GC-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---TGTACTGAC-T--GAG----------GT--T-A-G-AGC----A----------T-G-------AGC-TGATATGA--GGT-ATAGGAGCCAGTATGGAGT
gi|20942 : ATAGACCAGTATGGGAGTA-T-GGGCTGG-T-ATG--AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGCATGTACTGACTGAGGTTAGAGCA-TGAGCTGATATGAG-G-T-A-TAGGAGCCAGTAT-G---------GAGTGA-T-GG--C-----TGGT--ATGAGG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---TGGGCgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagtgtgggc
gi|20943 : A-T-AGGCTCG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGC----------------------A-TGGACTGGTATGAA-GAT-A-TGG--A-CAAT-TTG---------GAGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATCAAG--TA-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---AGTGCT---------G----------GTA-T-G-G-AGT----A----------T-A-------AAC--AGTATGG--AGA-AT--GGACAGGTTTGGAGT
gi|20944 : -TA-G--ACTGG-T-AT-GAA---GTA---TAGACCAA-------------------TA-T-G-G-AGT----A----------T-A-------GGC-TCGTATGA--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAGa
gi|20944 : ATAGACCAATATGG-AGTA-T-AGGCTCG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGC----------------------A-TGGACTGGTATGAA-G-T-A-TGG--ACCAAT-TTG---------GAGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATCAAG--TA-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---AGTGCT---------G----------GTA-T-G-G-AGT----A----------catggactggtatgaagtatggaccaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagta
gi|20945 : tagactggtatgaagt----------T-A-------GAC-TGGTATGGA-AGT-ATAG--ACC-ATATGGAGT
gi|20945 : ATAGACCA-TATGG-AGTA-T-AGGCTCG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGC----------------------A-TGGACTGGTATGAA-G-T-A-TGG--ACCAAT-TTG---------GAGT-A-T-GG-AC-----T-GT--ATCAAG--TA-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---AGTGCT---------G----------GTA-T-G-G-AGT----A----------ataggctcgtatgaagtatagaccagtatggagcatggactggtatgaagtatggaccaatttggagtatggactgtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagta
gi|20946 : tagactggtatggaagt-TA-G--ACTGG-T-AT-GAA---GTA---TAGACCAA-------------------TA-T-G-G-AGT----A----------T-A-------GGC-TCGTATGA--AGT-ATAG--ACCAGTATGGAG
gi|20946 : ATAGACCAATATGG-AGTA-T-AGGCTCG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGC----------------------A-TGGACTGGTATGAA-GAT-A-TGG--A-CAAT-TTG---------GAGT-A-T-GG-AC-----TGGT--ATCAAG--TA-TA-G--ACCAT-T-AC-GGA---GAA---AGTGCT---------G----------GTA-T-G-G-AGT----A----------catggactggtatgaagatatggacaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagta
gi|20947 : tagactggtatgaagtAGACCAGTATGT-AGTA-T-GGACTGG-T-ATG--AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT----------------------A-TGGACTGGTATGGA-G-T-A-TAG--ACTAGTAT-G---------GAGC-A-T-GA-GC-----TGAT--ATGAAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GTG---TGGGCT---------G----------GTA-T-G-GTGGT----A----------T-G-------GAC-TGGTATGG--
gi|20948 : CTGG-T-GTG--GTG-TA-AG--GACTAATGT-GATGTA-----------------------TGGACTGGTATGGA-G-C-A--GG--ACTAGTGTGG---------T-GT-A-A-GG-AC-----TGGT--ATGGAG--TA-CA-A--ACCAG-T-AT-GGACTGGTACAGTGTATGGAC-T--G--------------A-T-G-G-AGT----A----------T-G-------GAC-TGGTATGG--AGT-A
gi|20949 : aG-T-ATG--AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT----------------------A-TGGGCTGGGATGAG-G-T-A-TAG--ACCAGTATGG---------T-GT-G-T-GG-GC-----TGGT--ACGGTG--TA-TG-G--ACTGC-T-AT-GGA---GTA---TAGACT---------A----------GTA-T-A-G-AAC----A----------T-G-------AGC-TGATATTA--GGT-ATAG--ACCAGTATGGA
gi|20950 : G-T-AT-TGA---GTA---TAAGTTG-------------------GTA-T-G-G-TGT----A----------TTA-------GAC-TGGTATGA--AGT-ATAG--ACCAATATGGAGTtta
gi|20950 : GTATGG-TGTA-TTAGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT----------------------A-TAGGCTCGTATGAA-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGC-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGAAG--TA-TG-G--ACCAA-T-TT-GGA---GTA---ataggctcgtatgaagtatagaccagtatggagcatggactggtatgaagtatggaccaatttggagta
gi|20951 : gtattgagtataagttgG-T-AT-G-A---GTA---TAAGTTG-------------------GTA-T-G-G-TGT----A----------TTA-------GAC-TGGTATGA--AGT-ATAG--ACCAATATGGAGT
gi|20951 : GTATGG-TGTA-TTAGACTGG-T-ATG--AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT----------------------A-TAGGCTCGTATGAA-G-T-A-TAG--ACCAGTAT-G---------GAGC-A-T-GG-AC-----TGGT--ATGAAGA-TA-TG-G--A-CAA-T-TT-GGA---GTA---ataggctcgtatgaagtatagaccagtatggagcatggactggtatgaagatatggacaatttggagta
gi|20952 : gtatgagtataagttgGTAT-GGTGTA---------------------T-TAGACTGGTATGGAAG-T-A-TAG--ACCA-TATGG----------AGT-A-T-AG-GC-----TCGT--ATGAAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---TGGACT---------G----------GTA-T-G-A-AGT----A----------T-G-------GAC-CAATTTGG--AGT-A
gi|20953 : ATAGACCAGTATGG-AGTA-T-GGGCTGG-G-ATG--AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGTGT----------------------G-TGGGCTGGTACGGT-G-T-A-TGG--ACTGCTAT-G---------GAGT-A-T-AG-AC-----TAGT--ATAGA
gi|20954 : atagggggtatgaggtTGG-T-ATT--GAG-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA---------------------T-TAGACTGGTATGAA-G-T-A-TAG--ACCAATAT-G---------GAGT-A-T-AG-GC-----TCGT--ATGAAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---TGGACTGGTAT--GAA----------GTA-
gi|20955 : gTGG-T-ATG--A-G-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA---------------------T-TAGACTGGTATGAA-G-T-A-TAG--ACCAATATGG----------AGT-A-T-AG-GC-----TCGT--ATGAAG--TA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---GCA---TGGACT---------G----------GTA-T-G-A-AG
gi|20956 : gT-GGAGTA-----------------------TAGACCAGTATGGA-G-T-G-TGG--GCTGGTATGG---------GTGT-A-TGGG-AC-----TGGT--ATGGGGAATA-TA-G--ACCAG-T-AT-GGA---ACA---TGAGCTGATAT--GAG----------GTA-
gi|20957 : CCAGTATGG-AGCA-C-GAGCTGACT-ATG--AGG-TACTA--GACCAGTAT-GTAGT----------------------A-TGGACTGGTATGAA-G-a
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111 22222222222 111111111111111111
lowQualScore : 3 0 0 11 0 0 0 0 11 0 66666 0 0 11 2 666666666666 11 1111 11111 11 11 0 0 1 1 44 666666666666666666 1 0 11 0 1 4444 22222222222 2 3333333333 333 3 0 22 0 888888888888888888 3 333333
lowQualScore : . . . .. . . . . .. . ..... . . .. . ............ .. .... ..... .. .. . . . . .. .................. . . .. . . .... ........... . .......... ... . . .. . .................. . ......
lowQualScore : 0 9 8 11 8 6 8 8 11 8 11111 8 8 88 3 000000000000 33 6666 99999 11 00 8 8 4 5 22 555555555555555555 5 7 00 7 4 6666 77777777777 2 2222222222 666 5 9 44 9 222222222222222222 5 444444
consensus : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGGA-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACC-----------------GG-TAT-GGAG--T-AT-G----GACTG-G------GTATGG-A----------G-T-AT-G-GACCGGTATGG--AGT-A---------------TAGGA-CCGGT------ATGGAGT
Reference ( family-384 ) : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGGA-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGT-ATG----GAC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACC-----------------GG-TAT-GGAG--T-AT-G----GACTG-G------GTATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTATGG--AGT-A---------------TAGGA-CCAGT------ATGGAGT
gi|20910 : AT-AGACCAG-TAT--G-GTG-TA-TG--GACAAGTGT-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGGA-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGC-ATC----AGC-----T--GGT--GTGGT-G-TA-AG-G--ACT-----------------AA-TGT-GATG--T-AT-G----GACTG-G-------TATGG-A----------G-C-AA-G-GACTAGTGTGG--TGT-A----------------AGGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20911 : AT-AGACCAG-TAT--G-GTG-TA-TG--GACAAGTGT-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGC-ATC----AGC-----T--GGT--GTGGT-G-TA--A-GGAACT-----------------AA-TGT-GATG--T-AT-G----GACTG-G-------TATGG-A----------G-C-AA-G-GACTAGTGTGG--TGT-A----------------AGGA-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20912 : AT-AGACCAG-TAT--G-GTG-TA-TG--GACAAGTGT-G-AG-A-A-TGGAGTGGT-ATGGA-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGC-ATC-----AC-----T--GGT--GTGGT-G-TA-AG-G--ACT-----------------AA-TGT-GATG--T-AT-G----GACTG-G-------TATGG-A----------G-C-A--G-GACTAGTGTGG--TGT-A----------------AGGA-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20913 : ATAAACCAGTATGG-AGAAT-GGACAGG-TTT--G-GAG-TA-TA----------------------GGACAGGT-TTGGA-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ATG----GAC-----T--GGT--GTGGA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAA-AATA--T-AT-G----GACTG-G------TT-TGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--TGT-A---------------T-GGA-CAAGT------GTGa
gi|20913 : ATAGACCAGTATGG-TGTAT-GGACAAG-TGT--G-ATG-AA-TG--GAatgaatggagt
gi|20914 : ataaaccagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGTG--T-GT-G----GGCTG-G-------TACGG-T----------G-T-AT-G-GACTGCTATGG--AGT-A---------------TA-GA-CTAGT------ATAGAgt
gi|20914 : TGGGCTGGTACGG-TGTAT-GGACTGC-TAT--G-GAG-TA-TA--GACTAGTAT-AGAACA---TGAGCTGAT-ATTAG-G--T-ATAGACCAGTATGG----------ATT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--T-GT-G----GGCT--G------GTATAA-A----------G-C-Aacatgagctgatattaggtatagaccagtatggattatgggctggtatgaggtatagaccagtatggagtgtgggctggtataaagca
gi|20915 : atagaccagtatggtgtgAT-GGACTGG-TAT--G-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGGA-G--T-ATAGACTAGTATGG----------AGC-ATG----AGC-----T--GAT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--T-GT-G----GGCTG-G-------TATGGTG----------G-T-AT-G-GACTGGTATGGGAATT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGA
gi|20916 : ACAAACCAGTATGG-A---------TGG-TAC--A-GTG-TA-TG--GACTGGTAT-GGAGTA---TGGACTGGTTATGGA-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ACG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA--A-G--ACC-----------------AG-TAT-GTAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGA-G----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--AGT-A---------------T-GGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20917 : ATAAAC-AGTATGG-AGAAT-GGACAGG-TTT--G-GAG-TA-TA----------------------GGACAGGT-TTGGA-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ATG----GAC-----T--GGT--GTGGA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAA-AATA--T-AT-G----GACTG-G------TT-TGG-A----------G-TAAT-A-GACCAGTATGG--TGT-A---------------T-GGA-CAAGTGTGAGAATGGAGTa
gi|20917 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TGT--G-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-TGGACTGGT-TTGGA-G--TAATAGACCAGTATGG---------T-GT-ATG----GAC-----A--AGT--GT-GA-G-AA-TG-G--AGT-----------------GG-TAT-GGAG--T-Aggtatggagta
gi|20918 : ataaacagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtA-TA--AACCAGTAT-GGAG-A-A-TGGAC-AGT-TTGGA-G--T-ATAGGACAGGTTTG---------GAGT-ATA----GAC-----C--AGT--ATGGA-G-CA-TG-G--ACT-----------------GG-TGT-GGAG--T-AT-A----GACCA-G---------TAA-A----------A-T-AT-ATGACTGGTTTGG--AGTAA---------------TA-GA-CCAGT------ATGGTGT
gi|20918 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TGT--G-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-T-GACTGGT-TTGGA-G--TAATAGACCAGTATGG---------T-GT-ATG----GACAAGTGT--GATGAATGGA-G-Tatggacaagtgtgatgaatggagt
gi|20919 : ataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagtA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--T-GT-G----GGCTG-G-------TATGGTG----------G-T-AT-G-GACTGGTATGGGAATT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGA
gi|20919 : TGGGCTGGTATGGTGGTAT-GGACTGG-TATGGG-AAT-TA-TA--GACCAGTAT-GGAAC--A-TGAGCTGAT-ATGAG-G--T-ATAGA-CAGTAT-G---------GAGTAATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TATGGGAG--T-AT-G----GGCT--G------GTATGA-G----------G-T-Aacatgagctgatatgaggtatagacagtatggagtaatgggctggtatgaggtatagaccagtatgggagtatgggctggtatgaggta
gi|20919 : atagaccagtatggagtgATAGACCAGTATGG-AACAT-GAGCTGA-TAT--G-AGG-TA-TA--GAC-AGTAT-GGAGTA-A-TGGGCTGGT-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-
gi|20920 : atagaccagtatggagtgtgggctggtatggtggtatggactggtatgggaattATAGACCAGTATGG-AGCAC-GAGCTGA-TAT--G-AGG-TA--A--GACCAGTAT-GTAGT--A-TGGACTGGT-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGT-ATG----GAC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACT-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-G----AGCT--G------ATATGA-A----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--AGT-G---------------T-GGG-CTGGT------ATGG
gi|20921 : -AT-G----GACTG-G------TTATGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--AGC-ACGAGCTGATATGAGGTAAGA-CCAGT------ATGTAGT
gi|20921 : ATAGACCAGTATGG-AGCAC-GAGCTGA-TAT--G-AGG-TA--A--GACCAGTAT-GTAGT--A-TGGACTGGT-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGT-ATG----GAC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACT-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-G----AGCT--G------ATATGA-A----------G-T-Aatggactggtatgaggtatagaccagtatggagtatggactggtatggagtatagactagtatggagcatgagctgatatgaagta
gi|20922 : atggactggttatggagtAT-GGACTGG-TAT--G-GAG-CA-AG--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGGA-G--T-ACAAACCAGTATGGATGGTACA-GTGT-ATG----GAC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TG-G--ACT-----------------GGTTAT-GGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AC-G-AGCTGATATGA--GGT-A---------------
gi|20923 : AT-GGACTGG-TAT--G-GAG-CA--G--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGGA-G--T-ACAAACCAGTATGGACTGGTACAGTGT-ATG----GAC-----T--G----ATGGA-G-TA-TG-G--ACT-----------------GG-TAT-GGAG--T-AT-A----GAC----------ATATGG-A----------G-C-AC-G-AGCTGATATGA--GGT-A---------------
gi|20924 : -G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--AGC-A---------------T-GGA-CTGGT------GTGGAGT
gi|20924 : ataATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TGT--G-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-TGGACTGGT-TTGGA-G--T-ATAGACCAGTATGG---------T-GT-ATG----GAC-----A--AGT--GTGAT-G-AA-TG-G--AGT-----------------GG-TAT-GGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-C-AGCTGGTGTGG--TGT-A---------------atagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatggagtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20925 : ataggacaggtttggagtATAGACCAGTATGG-AGTGT-GGGCTGG-TAT--G-G-G-T-----------GTAT-GG---------GACTGGT-ATGGG-GAAT-ATAGACCAGTATGG---------AA-C-ATG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TAATACG--ACC-----------------AGATAC-GTAA----AT-G----GGCGT-G------GTATAG-A----------GGT-AA-A-GACCA-TATGG--AGT-A---------------ATGCG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20926 : AT-GGACTGG-TAT--G-GAG-CA-AG--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGGA-G--T-ACAAACCAGTA------------------TG----GAC-----T--GGT--ACAGT-G-TA-TG-G--ACT-----------------GG-TAT-GGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGG-A----------G-T-Aa
gi|20927 : ATGGACCAATTTGG-AGTAT-GGACTGG-TAT--C-AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAG-A-A-AGTGCTGGT-ATGGA-G--T-ATAAACCAGTAT-G---------GAGA-ATG----GAC-----A--GGT--TTGGA-G-TA-TAGG--ACA-----------------GG-TTT-GGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTGTGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------
gi|20928 : AT-GGACTGG-TAC--A-GTG-TA-TG--GACTG--AT-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGGA-G--T-ATAGAC--ATATGG----------AGC-ACG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GTAG--T-AT-G----GACT--G------GTATG
gi|20929 : ATGGACCAATTTGG-AGTAT-GGACTG--TAT--C-AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGGA-G--T-ATAAACCAGTATGG----------AGA-ATG----GAC--------AGT--TTGGA-G-TA-TA-GG-ACA-----------------GG-TTT-GGAG--T-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTGTGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------aggagga
gi|20930 : ATGGACTGGTGTGG-AGTAT-AGACCAG-TA-----AAA-TA-TATGGACTGGTTT-GGAGTA-A-TAGACCAGT-ATGGT-G--T-ATGGACAAGTGTGA---------GA---ATG----GAG-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-C-----ACTG-GTGTGGTGTAAGG-ACTAATGTGATG-T-AT-G-GACTGGTATGG--AGC-A---------------
gi|20931 : -GGACAGG-TTT--G-GAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGCA---TGGACTGGT-GTGGA-G--T-ATAGACCAGTAAAA---------TA-T-ATG----GAC-----T--GGT--TTGGA-G-TAATA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGTG--T-AT-G----GAC-A-A------GTGTG--A----------G-A-AT-G-GAGTGGTATGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20932 : ataAT-GGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGTA---TGGACTGGT-ATCAA-G--T-ATAGACCATTACGG----------AGA-AAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTTGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20933 : -G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--AGC-A---------------T-GGA-CTGGT------GTGGAGTca
gi|20933 : ataATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TGT--G-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-T-GACTGGT-TTGGA-G--TAATAGACCAGTATGG---------T-GT-ATG----GAC-----A--AGT--GTGAT-G-AA-TG-G--AGT-----------------GG-TAT-GG-G--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-C-AGCTGGTGTGG--TGT-A---------------atagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatgggtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20934 : ataggacaggtttggagt-A-TGGGCTGGT-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-GTACTGACTGAG------GT-TAG-A----------G-C-AT-G-AGCTGATATGA--GGT-A---------------TAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20934 : AT-GGGCTGG-TAT--G-AGG-TA-TA--GACCAGTATGGGAGT--A-TGGGCTGGT-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ATGTACTGAC-----TGAGGT---TAGA-G-CA-TG-A--GCT-----------------GA-TAT-GAGG--T-ATAG----GAGCC-A------GTATGG-A----------G-TGAT-G-G-CTGGTATGA--GGT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGAGTgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagt
gi|20935 : ATAGACCAGTATGG-AACAT-GAGCTGA-TAT--G-AGG-TA-TA--GAC-AGTAT-GGAGTA-A-TGGGCTGGT-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-GTACTGACTGAG------GT-TAG-A----------G-C-AT-G-AGCTGATATGA--GGT-A---------------TAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20936 : AT-GGACTGC-TAT--G-GAG-TA-TA--GACTAGTAT-AGAACA---TGAGCTGAT-ATTAG-G--T-ATAGACCAGTATGG----------ATT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--T-GT-G----GGCT--G------GTATAA-A----------G-C-AT-G-GATTGGTATAA--AGA-A---------------T-GAA-TTGGT------ATGG
gi|20937 : A-TA-G--GCT-----------------CG-TAT-GAAG--T-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTATGA--AGT-A---------------T-GGA-CCAAT------TTGGAGT
gi|20937 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCAA-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGA-AAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-Aatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20938 : ataggctcgtatgaagtAT-GGACTGG-TAT--C-AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGGA-G--T-ATAAAC-AGTATGG----------AGA-ATG----GAC-----A--GGT--TTGGA-G-TA-TA-GG-ACA-----------------GG-TTT-GGAG--T-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTGTGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------
gi|20939 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCAA-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGA-AAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--A-AT-G----GAC---A------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTTGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TAT--G-AAGATA-TG--GA-CAATTT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCAA-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGA-AAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--A-C-----------------AG-TAT-GGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTTGG--AGT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20941 : A-TA-G--GCT-----------------CG-TAT-GAAG--T-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTATGA--AGT-A---------------T-GGA-CCAAT------TTGGAGTca
gi|20941 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-GGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCAA-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGA-AAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--A-AT-G----GAC---A------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTTGG--AGT-A---------------atggactgtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20942 : ataggctcgtatgaagt-ATAGACCAGTATGG---------GAGT-ATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-GTACTGACTGAG------GT-TAG-A----------G-C-AT-G-AGCTGATATGA--GGT-A---------------TAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20942 : ATAGACCAGTATGGGAGTAT-GGGCTGG-TAT--G-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGC--A-TGTACTGAC--TGAG-G--T--TA--------------------GAGC-ATG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA-TA-GGAGCC-----------------AG-TAT-GGAG--TGAT-G----G-CT--G------GTATGA-G----------G-T-AT-A-GACCAGTATGG--AGT-G---------------TGGGgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagtgtgggc
gi|20943 : AT-AGGCTCG-TAT--G-AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGCA---TGGACTGGT-ATGAA-GA-T-ATGGAC-AAT-TTG---------GAGT-ATG----GAC-----T--GGT--ATCAA-G-TA-TA-G--ACCATTACGGAGAAAGTGCTGG-TAT-GGAG--T-AT-A----AAC---A------GTATGG-A----------G-A-AT-G-GACAGGTTTGG--AGT-A---------------c
gi|20944 : T-AGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT--A-TAGGCTCGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-G-TA-TG-G--ACC-----------------AA-TTT-GGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATCA-A----------G-T-AT-A-GACCATTACGG--AG--A---------------AAGTG-CTGGT------ATGGAGT
gi|20945 : T-AGACTGG-TAT--GGAAG-TA-TA--GACCA-TAT-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGC-ATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-G-TA-TG-G--ACC-----------------AA-TTT-GGAG--T-AT-G----GACTG---------TATCA-A----------G-T-AT-A-GACCATTACGG--AGA-A----------------AGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20946 : T-AGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT--A-TAGGCTCGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-GATA-TG-G--A-C-----------------AA-TTT-GGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATCA-A----------G-T-AT-A-GACCATTACGG--AG--A---------------AAGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20947 : AGACCAGTATGT-AGTAT-GGACTGG-TAT--G-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATGGA-G--T-ATAGACTAGTAT-G---------GAGC-ATG----AGC-----T--GAT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--T-GT-G----GGCT--G------GTATGGTG----------G-T-AT-G-GACTGGTATGG--a
gi|20948 : GACTAATGTGA-TGTAT-GGACTGG-TAT--G-GAG-CA--G--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGGA-G--T-ACAAACC-----------------AGT-ATG----GAC-----T--GGT--ACAGT-G-TA-TG-G--ACT-----------------G---AT-GGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGG-A----------G-T-A
gi|20949 : actggtgtggtgtaagG-TAT--G-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT--A-TGGGCTGGG-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTATGG---------T-GT-GTG----GGC-----T--GGT--ACGGT-G-TA-TG-G--ACT-----------------GC-TAT-GGAG--T-AT-A----GACT--A------GTATAG-A----------A-C-AT-G-AGCTGATATTA--GGT-A---------------TA-GA-CCAGT------ATGGA
gi|20950 : GT--ATTGA-G-TA-TA-A--GTT-----------------GG-TAT-GGTG--T-ATTA----GACTG-G-------TATGA-A----------G-T-AT-A-GACCAATATGG--AGT-A---------------TAGG--CTCGT------ATGAAGTtta
gi|20950 : GTATGG-TGTATTAGACTGG-TAT--G-AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT--A-TAGGCTCGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGC-ATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-G-TA-TG-G--ACC-----------------AA-TTT-GGAG--T-Aatagaccagtatggagcatggactggtatgaagtatggaccaatttggagta
gi|20951 : gtattgagtataagttgG-TAT--G-A-G-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGT-ATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------GAT-AT-G-GAC-AATTTGG--AGT-A---------------
gi|20952 : GTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGGAAG--T-ATAGACCA-TATGG----------AGT-ATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-T-AT-G-GACCAATTTGG--AGT-A---------------
gi|20953 : GG-TAT--G-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT--A-TGGGCTGGG-ATGAG-G--T-ATAGACCAGTATGG---------T-GT-GTG----GGC-----T--GGT--ACGGT-G-TA-TG-G--ACT-----------------GC-TAT-GGAG--T-AT-A----GACT--A------GTATAG-A----------
gi|20954 : atagggTGG-TAT--T-GAG-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGT-ATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-T-A
gi|20955 : gTGG-TAT--G-A-G-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGAA-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGT-ATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACC-----------------AG-TAT-GGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-
gi|20956 : gTGGA-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGT-GTG----GGC-----T--GGT--ATGGGTG-TA-TG-GG-ACT-----------------GG-TAT-GGGGAAT-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------A-C-AT-G-AGCTGATATGA--GGT-A---------------
gi|20957 : CCAGTATGG-AGCAC-GAGCTGACTAT--G-AGG-TACTA--GACCAGTAT-GTAGT--A-TGGACTGGT-ATGAA-G--a
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111111 222 11
lowQualScore : 1 0 0 2 1 0 11 0 0 4444 0 11 0 11 2 6 5555555555 2 1111 22222 11 11 0 0 1 3 33 1 0 11 1 0 3333 333 2222222 1 3333333333 1 1 3 0 0 0 11 0 88 2 333333
lowQualScore : . . . . . . .. . . .... . .. . .. . . .......... . .... ..... .. .. . . . . .. . . .. . . .... ... ....... . .......... . . . . . . .. . .. . ......
lowQualScore : 5 8 8 1 6 8 11 8 2 7777 8 11 8 11 4 8 0000000000 0 7777 00000 11 11 8 8 6 2 00 4 8 11 6 8 3333 777 7777777 5 3333333333 5 5 4 9 3 9 22 9 22 2 222222
consensus : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-GAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGCATG----GGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACCGG-TATGGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGG-A----------G-T-AT-G-GACCGGTAT-GG--AGT-ATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
Reference ( family-384 ) : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-AAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGTATG----GGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACCGG-TATGGAG--T-AT-G----GACTG-G------GTATGG-A----------G-T-AT-G-GACCGGTAT-GG--AGT-ATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
gi|20910 : ATAGACCAG-TATG-GTG-TA-TG--GACAAGTGT-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGCATC----AGC-----T--GGT--GTGGT-G-TA-AG-G--ACTAA-TGTGATG--T-AT-G----GACTG-G-------TATGG-A----------G-C-AA-G-GACTAGTGT-GG--TGT-A-AGGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20911 : ATAGACCAG-TATG-GTG-TA-TG--GACAAGTGT-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG----G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGCATC----AGC-----T--GGT--GTGGT-G-TA--A-GGAACTAA-TGTGATG--T-AT-G----GACTG-G-------TATGG-A----------G-C-AA-G-GACTAGTGT-GG--TGT-A-AGGA-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20912 : ATAGACCAG-TATG-GTG-TA-TG--GACAAGTGT-G-AG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGCATC----A-C-----T--GGT--GTGGT-G-TA-AG-G--ACTAA-TGTGATG--T-AT-G----GACTG-G-------TATGG-A----------G-C-A--G-GACTAGTGT-GG--TGT-A-AGGA-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20913 : ATAAACCAGTATGG-AGAATGGACAGG-TTTG-GAG-TA-TA--G--------------------GACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGCATG----GAC-----T--GGT--GTGGA-G-TA-TA-G--ACCAG-TAAAATA--T-AT-G----GACTG-G------TT-TGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--TGT-AT-GGA-CAAGT------GTGa
gi|20913 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGACAAG-TGTG-ATG-AA-TG--GAatgaatggagt
gi|20914 : ataaaccagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtATAGACCAG-TATG-GTG-TG-TG--GGCTGGTAC-GGTGTA---TGGACTGCT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTATAG---------AA-CATG----AGC-----T--GAT--ATTAG-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAT--T-AT-G----GGCTG-G-------TATGA-G----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGT-GT-GGG-CTGGT------ATAAAGgt
gi|20915 : ATGGACTGG-TATG-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTATGG----------AGCATG----AGC-----T--GAT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--T-GT-G----GGCT--G------GTATGGTG----------G-T-AT-G-GACTGGTAT-GGGAATT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAca
gi|20916 : ACAAACCAGTATGG-A--------TGG-TACA-GTG-TA-TG--GACTGGTAT-GGAGTA---TGGACTGGTTATGG--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGCACG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA--A-G--ACCAG-TATGTAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGA-G----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGT-AT-GGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20917 : ATAAAC-AGTATGG-AGAATGGACAGG-TTTG-GAG-TA-TA--G--------------------GACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGCATG----GAC-----T--GGT--GTGGA-G-TA-TA-G--ACCAG-TAAAATA--T-AT-G----GACTG-G------TT-TGG-A----------G-TAAT-A-GACCAGTAT-GG--TGT-AT-GGA-CAAGTGTGAGAATGGAGTa
gi|20917 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TGTG-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-TGGACTGGT-TTGG--A-G--TAATAGACCAGTATGG---------T-GTATG----GAC-----A--AGT--GT-GA-G-AA-TG-G--AGTGG-TATGGAG--T-Aggtatggagta
gi|20918 : ataaacagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtA-TA--AACCAGTAT-GGAG-A-A-TGGAC-AGT-TTGG--A-G--T-ATAGGACAGGTTTG---------GAGTATA----GAC-----C--AGT--ATGGA-G-CA-TG-G--ACTGG-TGTGGAG--T-AT-A----GACCA-G---------TAA-A----------A-T-AT-ATGACTGGTTT-GG--AGTAATA-GA-CCAGT------ATGGTGT
gi|20918 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TGTG-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-T-GACTGGT-TTGG--A-G--TAATAGACCAGTATGG---------T-GTATG----GACAAGTGT--GATGAATGGA-G-Tatggacaagtgtgatgaatggagt
gi|20919 : ataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagtATAGACCAGTATGG-AGTGTGGGCTGG-TATG-G------------------T-GG--TA---TGGACTGGT-ATGGGAA-T--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAACATG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA-TA-G--A-CAG-TATGGAG--TAAT-G----GGCT--G------GTATGA-G----------G-T-AT-A-GACCAGTATGGG--AGT-AT-GGG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20919 : ATAGACCAGTATGG-AACATGAGCTGA-TATG-AGG-TA-TA--GAC-AGTAT-GGAGTA-A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGTATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-a
gi|20920 : atagaccagtatggagtgtgggctggtatggtggtatggactggtatgggaattATAGACCAGTATGG-AGCACGAGCTGA-TATG-AGG-TA--A--GACCAGTAT-GTAGT--A-TGGACTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGTATG----GAC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACTAG-TATGGAG--C-AT-G----AGCT--G------ATATGA-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGT-GT-GGG-CTGGT------ATGG
gi|20921 : -AT-G----GACTG-G------TTATGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGC-AC-GAG-CTGAT------ATGAGGT
gi|20921 : ATAGACCAGTATGG-AGCACGAGCTGA-TATG-AGG-TA--A--GACCAGTAT-GTAGT--A-TGGACTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGTATG----GAC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACTAG-TATGGAG--C-AT-G----AGCT--G------ATATGA-A----------G-T-Aaagaccagtatgtagtatggactggtatgaggtatagaccagtatggagtatggactggtatggagtatagactagtatggagcatgagctgatatgaagta
gi|20922 : atggactggttatggagtATGGACTGG-TATG-GAG-CA-AG--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGG---------A------------------T--GGT--ACAGT-G-TA-TG-G--ACTGG-TATGGAG--T-AT-G----GACTG-G------TTATGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGC-AC-GAG-CTGAT------ATGAGGT
gi|20923 : ATGGACTGG-TATG-GAG-CA--G--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGGACTGGTACAGTGTATG----GAC-----T--G----ATGGA-G-TA-TG-G--ACTGG-TATGGAG--T-AT-A----GAC----------ATATGG-A----------G-C-AC-G-AGCTGATAT-GA--GGT-Aa
gi|20924 : -G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGC-AT-GGA-CTGGT------GTGGAGT
gi|20924 : ataATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TGTG-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-TGGACTGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------T-GTATG----GAC-----A--AGT--GTGAT-G-AA-TG-G--AGTGG-TATGGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-C-AGCTGGTGT-GG--TGT-Aatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatggagtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20925 : ataggacaggtttggagtATAGACCAGTATGG-AGTGTGGGCTGG-TATG-G-G-T-----------GTAT-GG---------GACTGGT-ATGG--G-GAAT-ATAGACCAGTATGG---------AA-CATG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TAATACG--ACCAGATACGTAA----AT-G----GGCGT-G------GTATAG-A----------GGT-AA-A-GACCA-TAT-GG--AGT-AATGCG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20926 : ATGGACTGG-TATG-GAG-CA-AG--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGG---------A------------C-----T--GGT--ACAGT-G-TA-TG-G--ACTGG-TATGGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGG-A----------G-T-Aa
gi|20927 : ATGGACCAATTTGG-AGTATGGACTGG-TATC-AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAG-A-A-AGTGCTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAACCAGTAT-G---------GAGAATG----GAC-----A--GGT--TTGGA-G-TA-TAGG--ACAGG-TTTGGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTGT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------
gi|20928 : ATGGACTGG-TACA-GTG-TA-TG--GACTG--AT-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGAC--ATATGG----------AGCACG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGTAG--T-AT-G----GACT--G------GTATG
gi|20929 : ATGGACCAATTTGG-AGTATGGACTG--TATC-AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAACCAGTATGG----------AGAATG----GAC--------AGT--TTGGA-G-TA-TAGG--ACAGG-TTTGGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTGT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------aggagga
gi|20930 : ATGGACTGGTGTGG-AGTATAGACCAG-TA---AAA-TA-TATGGACTGGTTT-GGAGTA-A-TAGACCAGT-ATGG--T-G--T-ATGGACAAGTGTGA---------GA--ATG----GAG-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-C-----ACTG-GTGTGGTGTAAGG-ACTAATGTGATG-T-AT-G-GACTGGTAT-GG--AGC-A
gi|20931 : GGACAGG-TTTG-GAG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGCA---TGGACTGGT-GTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAAAA---------TA-TATG----GAC-----T--GGT--TTGGA-G-TAATA-G--ACCAG-TATGGTG--T-AT-G----GAC-A-A------GTGTG--A----------G-A-AT-G-GAGTGGTAT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20932 : ataATGGACTGG-TATG-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGTA---TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTACGG----------AGAAAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACCAG-TATGGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20933 : -G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGC-AT-GGA-CTGGT------GTGGAGTca
gi|20933 : ataATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TGTG-GAG-TA-TA--GACCAGTA---AAATATA-T-GACTGGT-TTGG--A-G--TAATAGACCAGTATGG---------T-GTATG----GAC-----A--AGT--GTGAT-G-AA-TG-G--AGTGG-TATGG-G--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-C-AGCTGGTGT-GG--TGT-Aatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatgggtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20934 : ataggacaggtttggagt-A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGTATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-GTACTGACTGAG------GT-TAG-A----------G-C-AT-G-AGCTGATAT-GA--GGT-ATAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20934 : ATGGGCTGG-TATG-AGG-TA-TA--GACCAGTATGGGAGT--A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGCATGTACTGAC-----TGAGGT---TAGA-G-CA-TG-A--GCTGA-TATGAGG--T-ATAG----GAGCC-A------GTATGG-A----------G-TGAT-G-G-CTGGTAT-GA--GGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAGTgatggctggtatgaggtatagaccagtatggagt
gi|20935 : ATAGACCAGTATGG-AACATGAGCTGA-TATG-AGG-TA-TA--GAC-AGTAT-GGAGTA-A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------GAGTATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-GTACTGACTGAG------GT-TAG-A----------G-C-AT-G-AGCTGATAT-GA--GGT-ATAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20936 : ATGGACTGC-TATG-GAG-TA-TA--GACTAGTAT-AGAACA---TGAGCTGAT-ATTA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG----------ATTATG----GGC-----T--GGT--ATGAG-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--T-GT-G----GGCT--G------GTATAA-A----------G-C-AT-G-GATTGGTAT-AA--AGA-AT-GAA-TTGGT------ATGG
gi|20937 : A-TA-G--GCTCG-TATGAAG--T-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTAT-GA--AGT-AT-GGA-CCAAT------TTGGAGT
gi|20937 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGAAAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACCAG-TATGGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-Aatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20938 : ataggctcgtatgaagtATGGACTGG-TATC-AAG-TA-TA--GACCATTAC-GGAG-A-A-AGTGCTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAA-CAGTAT-G---------GAGAATG----GAC-----A--GGT--TTGGA-G-TA-TAGG--ACAGG-TTTGGAG--T-AT-A----GACC--A------GTATGG-A----------G-C-AT-G-GACTGGTGT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------
gi|20939 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGAAAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACCAG-TATGGAG--A-AT-G----GAC---A------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-AAGATA-TG--GA-CAATTT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGAAAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--A-CAG-TATGGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTT-GG--AGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20941 : -AT-A-GGCTCGTAT-GA--AGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20941 : ------GTATGA-A----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGC-AT-GGA-CTGGT------ATGAAGTcatggactggtatgaagtatggaccaatttggagtatggactgtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20941 : ataggctcATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-AAG-TA-TG--GACCAATTT-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGAAAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--ACCAG-TATGGAG--A-AT-G----GAC---A------GTTTGG-A----------G-T-ATAG-GACAGGTTT-GG--AGT-Aatggaccaatttggagtatggactgtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20942 : ataggctcgtatgaagtATAGACCAGTATGGGAGTATGGGCTGG-TATG-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGC--A-TGTACTGAC--TGA--G-G--T--TA--------------------GAGCATG----AGC-----T--GAT--ATGAG-G-TA-TA-GGAGCCAG-TATGGAG--TGAT-G----G-CT--G------GTATGA-G----------G-T-AT-A-GACCAGTAT-GG--AGT-GTGGG
gi|20943 : -AT-A-GGCTCGTAT-GA--AGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGAGc
gi|20943 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGACTGG-TATG-AAGATA-TG--GA-CAATTT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G---------GAGAAAG----TGC-----T--GGT--ATGGA-G-TA-TA-A--A-CAG-TATGGAG--A-AT-G----GAC-A-G------GTTTGG-A----------G-T-Acatggactggtatgaagatatggacaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaacagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20944 : ataggctcgtatgaagtTAGACTGG-TATG-AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT--A-TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGCATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-G-TA-TG-G--ACCAA-TTTGGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATCA-A----------G-T-AT-A-GACCATTAC-GG--AG--AAAGTG-CTGGT------ATGGAGT
gi|20945 : TAGACTGG-TATGGAAG-TA-TA--GACCA-TAT-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGCATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-G-TA-TG-G--ACCAA-TTTGGAG--T-AT-G----GACTG---------TATCA-A----------G-T-AT-A-GACCATTAC-GG--AGA-A-AGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20946 : TAGACTGG-TATG-AAG-TA-TA--GACCAATAT-GGAGT--A-TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G---------GAGCATG----GAC-----T--GGT--ATGAA-GATA-TG-G--A-CAA-TTTGGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATCA-A----------G-T-AT-A-GACCATTAC-GG--AG--AAAGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20947 : AGACCAGTATGT-AGTATGGACTGG-TATG-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTAT-G---------GAGCATG----AGC-----T--GAT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--T-GT-G----GGCT--G------GTATGGTG----------G-T-AT-G-GACTGGTAT-GG--a
gi|20948 : ACTG-G-------TGTGG-T----------G-T-AA-G-GACTAATGT-GA--TGT-AT-GGA-CTGGT------ATGGAG
gi|20948 : GACTAATGTGA-TGTATGGACTGG-TATG-GAG-CA--G--GACTAGTGT-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACC-----------------AGTATG----GAC-----T--GGT--ACAGT-G-TA-TG-G--ACTG---ATGGAG--T-AT-G----GACT--G------GTATGG-A----------G-T-Acaggactagtgtggtgtaaggactggtatggagtacaaaccagtatggactggtacagtgtatggactgatggagtatggactggtatggagta
gi|20949 : actggtgtggtgtaagG-TATG-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT--A-TGGGCTGGG-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------T-GTGTG----GGC-----T--GGT--ACGGT-G-TA-TG-G--ACTGC-TATGGAG--T-AT-A----GACT--A------GTATAG-A----------A-C-AT-G-AGCTGATAT-TA--GGT-ATA-GA-CCAGT------ATGGA
gi|20950 : G-TATT-GAG-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGTATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-T-AT-G-GACCAATTT-GG--AGT-Atta
gi|20951 : G-TATG-A-G-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGTATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------GAT-AT-G-GA-CAATTT-GG--AGT-A
gi|20952 : GTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGG--AAG--T-ATAGACCA-TATGG----------AGTATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-T-AT-G-GACCAATTT-GG--AGT-A
gi|20953 : GG-TATG-AGG-TA-TA--GACCAGTAT-GGAGT--A-TGGGCTGGG-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------T-GTGTG----GGC-----T--GGT--ACGGT-G-TA-TG-G--ACTGC-TATGGAG--T-AT-A----GACT--A------GTATAG-A----------
gi|20954 : atagggTGG-TATT-GAG-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGTATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-T-A
gi|20955 : gTGG-TATG-A-G-TA-TA--AGTTGGTAT-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG----------AGTATA----GGC-----T--CGT--ATGAA-G-TA-TA-G--ACCAG-TATGGAG--C-AT-G----GACT--G------GTATGA-A----------G-
gi|20956 : gTGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG----------AGTGTG----GGC-----T--GGT--ATGGGTG-TA-TG-GG-ACTGG-TATGGGGAAT-AT-A----GACCA-G-------TATGG-A----------A-C-AT-G-AGCTGATAT-GA--GGT-A
gi|20957 : CCAGTATGG-AGCACGAGCTGACTATG-AGG-TACTA--GACCAGTAT-GTAGT--A-TGGACTGGT-ATGA--A-G--a
Alignments
lowQualScore : 1111 111111111 11
lowQualScore : 1 1 44444 33 0 1 55555555555555555 0 8888 0 11 0 11 0 4 888888888 2 5555555555555555 1111 11 0 55555555555555555 0 11 2 1 22 2 0 0 1 0 2222 0 0 11 1 1 2 3 2 0 11 88 1 0 333333
lowQualScore : . . ..... .. . . ................. . .... . .. . .. . . ......... . ................ .... .. . ................. . .. . . .. . . . . . .... . . .. . . . . . . .. .. . . ......
lowQualScore : 8 8 55555 11 8 6 88888888888888888 8 4444 8 11 8 11 8 0 666666666 1 4444444444444444 7777 11 8 77777777777777777 8 99 4 6 77 5 8 8 6 8 5555 8 8 11 6 7 5 6 0 9 22 99 2 4 444444
consensus : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGCAT----------------G----GGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCGG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
Reference ( family-384 ) : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGCAT----------------G----GGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCGG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
gi|20910 : ATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TATGGACAAGTG-----------------T-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------C----AGCT--GG-TGTGG-----------------T-G--TA-AG-G--ACTAA-T-GTGATGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-C-AA-GGACTAGTGT-GG--TGTA-AGGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20911 : ATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TATGGACAAGTG-----------------T-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG----G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------C----AGCT--GG-TGTGGTGTAAGGAACTAATGTGATG--TA-TG-G--ACTGG-T-ATGGAGC-AA-G----GA-C-T--AGTGTGG-TG-T-AA-GGACTGGTAT-GG--AGTAa
gi|20912 : ATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TATGGACAAGTG-----------------T-G-AG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCATCACTGGTGTGGTGTAAG----GACT--AA-TGTGA-----------------T-G--TA-TG-G--ACTGG-T-ATGGAGC-A--G----GA-C-T--AGTGTGG-TG-T-AA-GGACTGGTAT-GG--AGTA
gi|20913 : ATAAACCAGTATGG-AGAATGGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAG-------------------------------------GACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TGTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-AAAATAT-AT-G----GA-C-T--GGTTTGG-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGT------GTG
gi|20913 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGACAAGTGTGATGAATGGA-G-Tatgaatggagt
gi|20914 : ataaaccagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TGTGGGCTGGTA-----------------C-GGTGTA---TGGACTGCT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTATAG--------AA-CAT----------------G----AGCT--GA-TATTA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGATT-AT-G----GG-C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-CTGGT------ATAAAG
gi|20915 : ATGGAC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-GT-G----GG-C-T--GGTATGGTGG-T-AT-GGACTGGTAT-GGGAATTATA-GA-CCAGT------ATGGAca
gi|20916 : ACAAACCAGTATGG-A-------------TGGT--ACAGT-G-TATGGACTGGTA-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGTTATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAC----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA--A-G--ACCAG-T-ATGTAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTAT-GGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20917 : ATAAAC-AGTATGG-AGAATGGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAG-------------------------------------GACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----GACT--GG-TGTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-AAAATAT-AT-G----GA-C-T--GGTTTGG-AG-TAAT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGTGTGAGAATGGAGTa
gi|20917 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGAC-----AAGT--GT-GA-G-AATGGAGTGGTA-----------------T-GGAGTA-ggtatggagta
gi|20918 : ataaacagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtaATAAAC-----CAGT--ATGGA-G-AATGGAC-AGTT-----------------T-GGAGTA-T-AGGACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----GACT--GG-TGTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-A--AAAT-AT-AT---GA-C-T--GGTTTGG-AG-TAAT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGT------GTG
gi|20918 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGACAAGTGTGATGAATGGA-G-Tatgaatggagt
gi|20919 : ataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaATAGACCAGTATGG-AGTGTGGGC-----TGGT--ATGG---------------------------------T-GG--TA---TGGACTGGT-ATGGGAA-T--T-ATAGACCAGTATGG--------AA-CAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--A-CAG-T-ATGGAGTAAT-G----GG-C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTATGGG--AGTAT-GGG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20920 : ATAGACCAGTATGG-AGCACGAGC-----TGAT--ATGAG-G-TA-AGACCAGTA-----------------T-GTAGTA---TGGACTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGTAT----------------G----GACT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACTAG-T-ATGGAGC-AT-G----AG-C-T--GATATGA-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-CTGGT------ATGGa
gi|20921 : ATGGAC-----TGGTT-ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGCA---CGAGCTGAT-ATGA--G-G--T-A-AGACCAGTATGT---------AGTAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-AGACTAGTAT-GG--AGCAT-GAG-CTGAT------ATGAAGT
gi|20922 : ATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-CAAGGACTAGTG-----------------T-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGGATGGTACAGTGTAT----------------G----GACT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TG-G--ACTGG-TTATGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AC-GAGCTGATAT-GA--GGTAa
gi|20923 : ATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-CA-GGACTAGTG-----------------T-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGG--------A----------------------------CT--GG-TACAG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTG----ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-AGAC--ATAT-GG--AGCAC-GAG-CTGAT------ATGAGGT
gi|20924 : GGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGCA---TGGACTGGT-GTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAAAA--------TA-TAT----------------G----GACT--GG-TTTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGTGT-AT-G----GA-C-A--AGTGTGA-TG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGa
gi|20924 : ataATGGACAAGTGTGA-TGAATGGAG-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGC--A-TCAGCTGGT-GTGG--T-G--T-Acatcagctggtgtggtgta
gi|20925 : ataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtATAGACCAGTATGG-AGTGTGGGC-----TGGT--ATGG--G-T--------GTA-----------------T-GG---------GACTGGT-ATGG--G-GAAT-ATAGACCAGTATGG--------AA-CAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TAATACG--ACCAGAT-ACGTAA--AT-G----GG-CGT--GGTATAG-AGGT-AA-AGACCA-TAT-GG--AGTAATGCG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20926 : -A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--C-AAGGACTAGTGTGG--------T-GTAA----------------G----GACT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-CA-A--ACC---------AGT-AT-G----GA-C-T--GGTACAG-TG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--AGTAT-GGA-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20927 : ATGGACCAATTTGG-AGTATGGAC-----TGGT--ATCAA-G-TATAGACCATTA-----------------C-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAACCAGTAT-G--------GAGAAT----------------G----GACA--GG-TTTGG-----------------A-G--TA-TAGG--ACAGG-T-TTGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------a
gi|20928 : ATGGAC-----TGGT--ACAGT-G-TATGGACTG--A-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGAC--ATATGG---------AGCAC----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGTAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATG
gi|20929 : ATGGACCAATTTGG-AGTATGGAC-----TG-T--ATCAA-G-TATAGACCATTA-----------------C-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAACCAGTATGG---------AGAAT----------------G----GAC---AG-TTTGG-----------------A-G--TA-TA-GG-ACAGG-T-TTGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------aggagga
gi|20930 : ATGGAC-----TGGT--GTGGA-G-TATAGACCAGTAAAATATATGGACTGGTTT-GGAGTA-A-TAGACCAGT-ATGG--T-G--T-ATGGACAAGTGTGA--------GA--AT----------------G----GAGT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT------CA-C-T--GGTGTGG-TG-T-AA-GGACTAATGT-GA--TGTAT-GGA-CTGGT------ATGGAG
gi|20931 : GGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGCA---TGGACTGGT-GTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAAAA--------TA-TAT----------------G----GACT--GG-TTTGG-----------------A-G--TAATA-G--ACCAG-T-ATGGTGT-AT-G----GA-C-A--AGTGTG--AG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20932 : ataATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTACGG---------AGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20933 : -GGACAGGTTT-GG--AGTATAG-A-CCAGT------ATGGAGca
gi|20933 : ataATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--GTGGA-G-TATAGACCAGTA--------------------AAATATA-T-GACTGGT-TTGG--A-G--TAATAGACCAGTATGG--------T-GTAT----------------G----GACA--AG-TGTGA-----------------T-G--AA-TG-G--AGTGG-T-ATGG-GT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-CAGCTGGTGT-GG--TGTAcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatgggtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20934 : ataggacaggtttggagtATGGGC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------TGGGAGT--A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTAT-G--------GAGCAT----------------GTACTGACTGAGG-T-TAG-----------------A-G--CA-TG-A--GCTGA-T-ATGAGGT-ATAG----GAGC-C--AGTATGG-AG-TGAT-GG-CTGGTAT-GA--GGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGT
gi|20935 : ATAGACCAGTATGG-AACATGAGC-----TGAT--ATGAG-G-TATAGAC-AGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGTAT----------------G----GGCT--GG-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-GTACTGA-C-TGAGGT-TAG-AG-C-AT-GAGCTGATAT-GA--GGTATAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20936 : ATGGAC-----TGCT--ATGGA-G-TATAGACTAGTA-----------------T-AGAACA---TGAGCTGAT-ATTA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------ATTAT----------------G----GGCT--GG-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-GT-G----GG-C-T--GGTATAA-AG-C-AT-GGATTGGTAT-AA--AGAAT-GAA-TTGGT------ATGG
gi|20937 : -AT-AGGCTCGTAT-GA--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20937 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-Acatggactggtatgaagtatggaccaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20938 : ataggctcgtatgaagtATGGAC-----TGGT--ATCAA-G-TATAGACCATTA-----------------C-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAAC-AGTATGG---------AGAAT----------------G----GACA--GG-TTTGG-----------------A-G--TA-TA-GG-ACAGG-T-TTGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------
gi|20939 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C----AGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-GATATGGA-CAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--A-CAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20941 : AT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTAT-GGA-CT-GT------ATCAAGTca
gi|20941 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C----AGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20942 : ataggctcgtatgaagtATAGACCAGTATGGGAGTATGGGC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGC--A-TGTACTGAC--TGA--G-G--T--TA-------------------GAGCAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA-TA-GGAGCCAG-T-ATGGAGTGAT-G----G--C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGTGGG
gi|20943 : -AT-AGGCTCGTAT-GA--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGc
gi|20943 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-GATATGGA-CAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--A-CAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-Acatggactggtatgaagatatggacaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaacagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20944 : ataggctcgtatgaagtTAGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATAGACCAATA-----------------T-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------A-G--TA-TG-G--ACCAA-T-TTGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AG-AAAGTG-CTGGT------ATGGAGT
gi|20945 : TAGAC-----TGGT--ATGGAAG-TATAGACCA-TA-----------------T-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------A-G--TA-TG-G--ACCAA-T-TTGGAGT-AT-G----GA-C-T--G-TATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AGAA-AGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20946 : TAGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATAGACCAATA-----------------T-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------A-GA-TA-TG-G--AC-AA-T-TTGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AG-AAAGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20947 : AGACCAGTATGT-AGTATGGAC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-GT-G----GG-C-T--GGTATGGTGG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--a
gi|20948 : --ACTGG-T-GTGGTGT-AA-G----GA-C-T--AATGTGA-TG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--AG--CAGGA-CTAGT------GTGGTGT
gi|20948 : GACTAATGTGA-TGTATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-CA-GGACTAGTG-----------------T-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGG--------A----------------------------CT--GG-TACAG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTG----ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-Aaaggactggtatggagtacaaaccagtatggactggtacagtgtatggactgatggagtatggactggtatggagta
gi|20949 : actggtgtggtgtaagGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA---TGGGCTGGG-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG--------T-GTGT----------------G----GGCT--GG-TACGG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTGC-T-ATGGAGT-AT-A----GA-C-T--AGTATAG-AA-C-AT-GAGCTGATAT-TA--GGTATA-GA-CCAGT------ATGGA
gi|20950 : GT--ATTGA-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTAtta
gi|20951 : GT--ATG-A-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AGAT-AT-GGA-CAATTT-GG--AGTA
gi|20952 : GTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGG--AAG--T-ATAGACCA-TATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTA
gi|20953 : GGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGT--A-TGGGCTGGG-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG--------T-GTGT----------------G----GGCT--GG-TACGG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTGC-T-ATGGAGT-AT-A----GA-C-T--AGTATAG-A
gi|20954 : ataggg-----TGGT--ATTGA-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-A
gi|20955 : g-----TGGT--ATG-A-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATAT-G--------GAGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-
gi|20956 : gTGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTG---TGGGCTGGT-ATGG----G--T---------GTATGG--------GA---------------------------CT--GG-TATGG-----------------G-GAATA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAAC-AT-G----AG-C-T--GATATGA-GG-T-A
gi|20957 : --T-ATACTCCAGTATGG---------AGCAC----------------G----AGCT--GACTATGA-----------------G-G--TACTA-G--ACCAG-T-ATGTAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-a
Alignments
lowQualScore : 1111 111111111 11
lowQualScore : 1 1 44444 33 0 1 55555555555555555 0 8888 0 11 0 11 0 4 888888888 2 5555555555555555 1111 11 0 55555555555555555 0 11 2 1 22 2 0 0 1 0 2222 0 0 11 1 1 2 3 2 0 11 88 1 0 333333
lowQualScore : . . ..... .. . . ................. . .... . .. . .. . . ......... . ................ .... .. . ................. . .. . . .. . . . . . .... . . .. . . . . . . .. .. . . ......
lowQualScore : 8 8 55555 11 8 6 88888888888888888 8 4444 8 11 8 11 8 0 666666666 1 4444444444444444 7777 11 8 77777777777777777 8 99 4 6 77 5 8 8 6 8 5555 8 8 11 6 7 5 6 0 9 22 99 2 4 444444
consensus : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGCAT----------------G----GGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCGG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
Reference ( family-384 ) : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGCAT----------------G----GGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCGG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
gi|20910 : ATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TATGGACAAGTG-----------------T-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------C----AGCT--GG-TGTGG-----------------T-G--TA-AG-G--ACTAA-T-GTGATGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-C-AA-GGACTAGTGT-GG--TGTA-AGGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20911 : ATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TATGGACAAGTG-----------------T-GATG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG----G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------C----AGCT--GG-TGTGGTGTAAGGAACTAATGTGATG--TA-TG-G--ACTGG-T-ATGGAGC-AA-G----GA-C-T--AGTGTGG-TG-T-AA-GGACTGGTAT-GG--AGTAa
gi|20912 : ATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TATGGACAAGTG-----------------T-G-AG-A-A-TGGAGTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCATCACTGGTGTGGTGTAAG----GACT--AA-TGTGA-----------------T-G--TA-TG-G--ACTGG-T-ATGGAGC-A--G----GA-C-T--AGTGTGG-TG-T-AA-GGACTGGTAT-GG--AGTA
gi|20913 : ATAAACCAGTATGG-AGAATGGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAG-------------------------------------GACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TGTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-AAAATAT-AT-G----GA-C-T--GGTTTGG-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGT------GTG
gi|20913 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGACAAGTGTGATGAATGGA-G-Tatgaatggagt
gi|20914 : ataaaccagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtATAGAC-----CAGT--ATGGT-G-TGTGGGCTGGTA-----------------C-GGTGTA---TGGACTGCT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTATAG--------AA-CAT----------------G----AGCT--GA-TATTA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGATT-AT-G----GG-C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-CTGGT------ATAAAG
gi|20915 : ATGGAC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-GT-G----GG-C-T--GGTATGGTGG-T-AT-GGACTGGTAT-GGGAATTATA-GA-CCAGT------ATGGAca
gi|20916 : ACAAACCAGTATGG-A-------------TGGT--ACAGT-G-TATGGACTGGTA-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGTTATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAC----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA--A-G--ACCAG-T-ATGTAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTAT-GGA-CTGGT------ATGGAGT
gi|20917 : ATAAAC-AGTATGG-AGAATGGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAG-------------------------------------GACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----GACT--GG-TGTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-AAAATAT-AT-G----GA-C-T--GGTTTGG-AG-TAAT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGTGTGAGAATGGAGTa
gi|20917 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGAC-----AAGT--GT-GA-G-AATGGAGTGGTA-----------------T-GGAGTA-ggtatggagta
gi|20918 : ataaacagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtaATAAAC-----CAGT--ATGGA-G-AATGGAC-AGTT-----------------T-GGAGTA-T-AGGACAGGT-TTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----GACT--GG-TGTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-A--AAAT-AT-AT---GA-C-T--GGTTTGG-AG-TAAT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGT------GTG
gi|20918 : ATAGACCAGTATGG-TGTATGGACAAGTGTGATGAATGGA-G-Tatgaatggagt
gi|20919 : ataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaATAGACCAGTATGG-AGTGTGGGC-----TGGT--ATGG---------------------------------T-GG--TA---TGGACTGGT-ATGGGAA-T--T-ATAGACCAGTATGG--------AA-CAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--A-CAG-T-ATGGAGTAAT-G----GG-C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTATGGG--AGTAT-GGG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20920 : ATAGACCAGTATGG-AGCACGAGC-----TGAT--ATGAG-G-TA-AGACCAGTA-----------------T-GTAGTA---TGGACTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGTAT----------------G----GACT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACTAG-T-ATGGAGC-AT-G----AG-C-T--GATATGA-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-CTGGT------ATGGa
gi|20921 : ATGGAC-----TGGTT-ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGCA---CGAGCTGAT-ATGA--G-G--T-A-AGACCAGTATGT---------AGTAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-AGACTAGTAT-GG--AGCAT-GAG-CTGAT------ATGAAGT
gi|20922 : ATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-CAAGGACTAGTG-----------------T-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGGATGGTACAGTGTAT----------------G----GACT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TG-G--ACTGG-TTATGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AC-GAGCTGATAT-GA--GGTAa
gi|20923 : ATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-CA-GGACTAGTG-----------------T-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGG--------A----------------------------CT--GG-TACAG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTG----ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-AGAC--ATAT-GG--AGCAC-GAG-CTGAT------ATGAGGT
gi|20924 : GGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGCA---TGGACTGGT-GTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAAAA--------TA-TAT----------------G----GACT--GG-TTTGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGTGT-AT-G----GA-C-A--AGTGTGA-TG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGa
gi|20924 : ataATGGACAAGTGTGA-TGAATGGAG-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGC--A-TCAGCTGGT-GTGG--T-G--T-Acatcagctggtgtggtgta
gi|20925 : ataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtATAGACCAGTATGG-AGTGTGGGC-----TGGT--ATGG--G-T--------GTA-----------------T-GG---------GACTGGT-ATGG--G-GAAT-ATAGACCAGTATGG--------AA-CAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TAATACG--ACCAGAT-ACGTAA--AT-G----GG-CGT--GGTATAG-AGGT-AA-AGACCA-TAT-GG--AGTAATGCG-CTGGT------ATGAGGT
gi|20926 : -A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--C-AAGGACTAGTGTGG--------T-GTAA----------------G----GACT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-CA-A--ACC---------AGT-AT-G----GA-C-T--GGTACAG-TG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--AGTAT-GGA-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20927 : ATGGACCAATTTGG-AGTATGGAC-----TGGT--ATCAA-G-TATAGACCATTA-----------------C-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAACCAGTAT-G--------GAGAAT----------------G----GACA--GG-TTTGG-----------------A-G--TA-TAGG--ACAGG-T-TTGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------a
gi|20928 : ATGGAC-----TGGT--ACAGT-G-TATGGACTG--A-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGAC--ATATGG---------AGCAC----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGTAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATG
gi|20929 : ATGGACCAATTTGG-AGTATGGAC-----TG-T--ATCAA-G-TATAGACCATTA-----------------C-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAACCAGTATGG---------AGAAT----------------G----GAC---AG-TTTGG-----------------A-G--TA-TA-GG-ACAGG-T-TTGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------aggagga
gi|20930 : ATGGAC-----TGGT--GTGGA-G-TATAGACCAGTAAAATATATGGACTGGTTT-GGAGTA-A-TAGACCAGT-ATGG--T-G--T-ATGGACAAGTGTGA--------GA--AT----------------G----GAGT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT------CA-C-T--GGTGTGG-TG-T-AA-GGACTAATGT-GA--TGTAT-GGA-CTGGT------ATGGAG
gi|20931 : GGAC-----AGGT--TTGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGCA---TGGACTGGT-GTGG--A-G--T-ATAGACCAGTAAAA--------TA-TAT----------------G----GACT--GG-TTTGG-----------------A-G--TAATA-G--ACCAG-T-ATGGTGT-AT-G----GA-C-A--AGTGTG--AG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20932 : ataATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTACGG---------AGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20933 : -GGACAGGTTT-GG--AGTATAG-A-CCAGT------ATGGAGca
gi|20933 : ataATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--GTGGA-G-TATAGACCAGTA--------------------AAATATA-T-GACTGGT-TTGG--A-G--TAATAGACCAGTATGG--------T-GTAT----------------G----GACA--AG-TGTGA-----------------T-G--AA-TG-G--AGTGG-T-ATGG-GT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-CAGCTGGTGT-GG--TGTAcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatgggtatagaccagtatggagcatcagctggtgtggtgta
gi|20934 : ataggacaggtttggagtATGGGC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------TGGGAGT--A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTAT-G--------GAGCAT----------------GTACTGACTGAGG-T-TAG-----------------A-G--CA-TG-A--GCTGA-T-ATGAGGT-ATAG----GAGC-C--AGTATGG-AG-TGAT-GG-CTGGTAT-GA--GGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGT
gi|20935 : ATAGACCAGTATGG-AACATGAGC-----TGAT--ATGAG-G-TATAGAC-AGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGGCTGGT-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGTAT----------------G----GGCT--GG-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-GTACTGA-C-TGAGGT-TAG-AG-C-AT-GAGCTGATAT-GA--GGTATAGGAGCCAGT------ATGGAGT
gi|20936 : ATGGAC-----TGCT--ATGGA-G-TATAGACTAGTA-----------------T-AGAACA---TGAGCTGAT-ATTA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG---------ATTAT----------------G----GGCT--GG-TATGA-----------------G-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-GT-G----GG-C-T--GGTATAA-AG-C-AT-GGATTGGTAT-AA--AGAAT-GAA-TTGGT------ATGG
gi|20937 : -AT-AGGCTCGTAT-GA--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20937 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-Acatggactggtatgaagtatggaccaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20938 : ataggctcgtatgaagtATGGAC-----TGGT--ATCAA-G-TATAGACCATTA-----------------C-GGAGAA-AGTG--CTGGT-ATGG--A-G--T-ATAAAC-AGTATGG---------AGAAT----------------G----GACA--GG-TTTGG-----------------A-G--TA-TA-GG-ACAGG-T-TTGGAGT-AT-A----GA-C-C--AGTATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------
gi|20939 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C----AGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-GATATGGA-CAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--A-CAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGca
gi|20941 : AT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTAT-GGA-CT-GT------ATCAAGTca
gi|20941 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATGGACCAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACT-GT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--ACCAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C----AGTTTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20942 : ataggctcgtatgaagtATAGACCAGTATGGGAGTATGGGC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGC--A-TGTACTGAC--TGA--G-G--T--TA-------------------GAGCAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------G-G--TA-TA-GGAGCCAG-T-ATGGAGTGAT-G----G--C-T--GGTATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGTGGG
gi|20943 : -AT-AGGCTCGTAT-GA--AGTATA-GA-CCAGT------ATGGAGc
gi|20943 : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGAA-GATATGGA-CAATT-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATCA--A-G--T-ATAGACCATTAC-G--------GAGAAA----------------G----TGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-A--A-CAG-T-ATGGAGA-AT-G----GA-C-A--GGTTTGG-AG-T-Acatggactggtatgaagatatggacaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaacagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20944 : ataggctcgtatgaagtTAGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATAGACCAATA-----------------T-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------A-G--TA-TG-G--ACCAA-T-TTGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AG-AAAGTG-CTGGT------ATGGAGT
gi|20945 : TAGAC-----TGGT--ATGGAAG-TATAGACCA-TA-----------------T-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------A-G--TA-TG-G--ACCAA-T-TTGGAGT-AT-G----GA-C-T--G-TATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AGAA-AGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20946 : TAGAC-----TGGT--ATGAA-G-TATAGACCAATA-----------------T-GGAGTA---TAGGCTCGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAGTATGG---------AGCAT----------------G----GACT--GG-TATGA-----------------A-GA-TA-TG-G--AC-AA-T-TTGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AG-AAAGTG-CTGGT------ATGGAGTa
gi|20947 : AGACCAGTATGT-AGTATGGAC-----TGGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGT--A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACTAGTAT-G--------GAGCAT----------------G----AGCT--GA-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGT-GT-G----GG-C-T--GGTATGGTGG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--a
gi|20948 : --ACTGG-T-GTGGTGT-AA-G----GA-C-T--AATGTGA-TG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--AG--CAGGA-CTAGT------GTGGTGT
gi|20948 : GACTAATGTGA-TGTATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-CA-GGACTAGTG-----------------T-GGTGTA-A--GGACTGGT-ATGG--A-G--T-ACAAACCAGTATGG--------A----------------------------CT--GG-TACAG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTG----ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-Aaaggactggtatggagtacaaaccagtatggactggtacagtgtatggactgatggagtatggactggtatggagta
gi|20949 : actggtgtggtgtaagGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA---TGGGCTGGG-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG--------T-GTGT----------------G----GGCT--GG-TACGG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTGC-T-ATGGAGT-AT-A----GA-C-T--AGTATAG-AA-C-AT-GAGCTGATAT-TA--GGTATA-GA-CCAGT------ATGGA
gi|20950 : GT--ATTGA-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTAtta
gi|20951 : GT--ATG-A-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AGAT-AT-GGA-CAATTT-GG--AGTA
gi|20952 : GTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGG--AAG--T-ATAGACCA-TATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTA
gi|20953 : GGT--ATGAG-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGT--A-TGGGCTGGG-ATGA--G-G--T-ATAGACCAGTATGG--------T-GTGT----------------G----GGCT--GG-TACGG-----------------T-G--TA-TG-G--ACTGC-T-ATGGAGT-AT-A----GA-C-T--AGTATAG-A
gi|20954 : ataggg-----TGGT--ATTGA-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATATGG---------AGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-T-A
gi|20955 : g-----TGGT--ATG-A-G-TATAAGTTGGTA-----------------T-GGTGTA-T-TAGACTGGT-ATGA--A-G--T-ATAGACCAATAT-G--------GAGTAT----------------A----GGCT--CG-TATGA-----------------A-G--TA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAGC-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-
gi|20956 : gTGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTG---TGGGCTGGT-ATGG----G--T---------GTATGG--------GA---------------------------CT--GG-TATGG-----------------G-GAATA-TA-G--ACCAG-T-ATGGAAC-AT-G----AG-C-T--GATATGA-GG-T-A
gi|20957 : --T-ATACTCCAGTATGG---------AGCAC----------------G----AGCT--GACTATGA-----------------G-G--TACTA-G--ACCAG-T-ATGTAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGA-AG-a
blockSeqs : G T AAGTG GA A AAATATATGGACTGGTT AAG GA AA G ATGGTACAG C CACTGGTGTGGTGTAA TACT GA TGTAAGGAACTAATGTG AA A C GA G A TACT GA T G A A T GA TG G GTGAGA
blockSeqs : . A AAGTG GA A . AAG . . G A C . . . . A A G G G G T . T A A A T . AG . .
blockSeqs : . T . T . . ATA . . G G C . . . . . C . G A . . . . . G A C . AG . .
blockSeqs : . T . . . . AAG . . A G C . . . . . . . . A . . . . . . A C . GG . .
blockSeqs : . T . . . . AA . . G G C . . . . . . . . A . . . . . . . T . AG . .
blockSeqs : . C . . . . AA . . G A C . . . . . . . . A . . . . . . . C . AG . .
blockSeqs : . A . . . . AT . . G A C . . . . . . . . A . . . . . . . C . AG . .
blockSeqs : . T . . . . AA . . G T C . . . . . . . . A . . . . . . . C . AG . .
blockSeqs : . T . . . . AA . . G A C . . . . . . . . A . . . . . . . C . G . .
blockSeqs : . T . . . . AA . . G T T . . . . . . . . A . . . . . . . C . G . .
blockSeqs : . C . . . . AA . . A G T . . . . . . . . A . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . C . . . . AA . . G G T . . . . . . . . G . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . C . . . . AT . . G T T . . . . . . . . G . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . C . . . . AT . . G T C . . . . . . . . A . . . . . . . C . G . .
blockSeqs : . C . . . . AT . . G G T . . . . . . . . A . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . C . . . . AT . . G G A . . . . . . . . G . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . T . . . . AT . . A G C . . . . . . . . A . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . C . . . . A . . G G A . . . . . . . . G . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . T . . . . A . . G G T . . . . . . . . A . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . T . . . . A . . G G A . . . . . . . . A . . . . . . . A . G . .
blockSeqs : . . . . . . A . . G G T . . . . . . . . A . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G G C . . . . . . . . G . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G G T . . . . . . . . G . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . . . . A . . G A T . . . . . . . . A . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G T A . . . . . . . . A . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G T A . . . . . . . . A . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G G A . . . . . . . . G . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . . . . A . . G G A . . . . . . . . A . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G . A . . . . . . . . A . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G . C . . . . . . . . A . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G . A . . . . . . . . A . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G . C . . . . . . . . A . . . . . . . C . G . .
blockSeqs : . . . . A . . G . C . . . . . . . . A . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . . . . A . . G . C . . . . . . . . A . . . . . . . C . A
blockSeqs : . . . . A . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . A . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . G . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : A*** G******** G*
originalCons : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA-A-TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGG--------GAGCAT----------------G----GGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCGG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTATAGGA-CCGGT------ATGGAGT
finalCons : ATAGACCAGTATGG-AGCATGGAC-----TGGT--ATGGA-G-TATAGACCAGTA-----------------T-GGAGTA---TGGACTGGT-ATGG--A-G--T-ATAGACCAGTATGGG--------AGCAT----------------G----GGCT--GG-TATGG-----------------A-G--TA-TA-G--ACCGG-T-ATGGAGT-AT-G----GA-C-T--GGTATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTATG-GA-CCGGT------ATGGAGT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222
lowQualScore : 1 0 0 7777777777777777777 22222 0 11 0 22 0 0 0 4 0 11 0 0 0 0 0 4 1111111111111111111 2222 0 11 55555555555555555 1 22 2 1 11 4 2 0 2222 0 11 0 1 0 1 4 2 1 11 1 1
lowQualScore : . . . ................... ..... . .. . .. . . . . . .. . . . . . . ................... .... . .. ................. . .. . . .. . . . .... . .. . . . . . . . .. . .
lowQualScore : 9 4 9 2222222222222222222 22222 8 99 8 66 8 8 8 9 8 11 8 8 8 9 9 1 7777777777777777777 6666 8 11 88888888888888888 7 00 4 6 99 1 4 8 6666 8 11 8 7 9 7 8 2 0 33 1 1
consensus : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG---------------GAGCATG----GGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTAT-GGA-CCGGTATGGAGT
Reference ( family-384 ) : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG---------------GAGCATG----GGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACCGGTATGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-T-AT-GGACCGGTAT-GG--AGTAT-GGA-CCGGTATGGAGT
gi|20910 : AT-A-------------------GAC-----CAG-T--ATGGT-G--TA-TGGACAAGTGTGA-TGA-AT-GGAGTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATC----AGC-TG--GTGTGG-----------------T-G--T-AAG-G--ACTAATGTGATGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-C-AA-GGACTAGTGT-GG--TGTAA-GGA-CTGGTATGGAGT
gi|20911 : AT-A-------------------GAC-----CAG-T--ATGGT-G--TA-TGGACAAGTGTGA-TGA-AT-GGAGTGGT-ATGG----GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATC----AGC-TG--GTGTGGTGTAAGGAACTAATGTGATG--T-ATG-G--ACTGGTATGGAGC-AA-G----GA-CT--AGT-GTGG-TG-T-AA-GGACTGGTAT-GG--AGTAa
gi|20912 : AT-A-------------------GAC-----CAG-T--ATGGT-G--TA-TGGACAAGTGTG--AGA-AT-GGAGTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATC----A-C-TG--GTGTGG-----------------T-G--T-AAG-G--ACTAATGTGATGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-C-A--GGACTAGTGT-GG--TGTAA-GGA-CTGGTATGGAGT
gi|20913 : ATAAACCAGTATGG-AGAAT-G-------------------GAC-----AGG-T--TTGGA-G--TA-TAG-------------------GACAGGT-TTGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATG----GAC-TG--GTGTGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTAAAATAT-AT-G----GA-CT--GGT-TTGG-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGTGTGa
gi|20913 : ATAGACCAGTATGG-TGTAT-G-------------------GACAAGTGTGA-TGAATGGA-G--Tatgaatggagt
gi|20914 : ataaaccagtatggagaatggacaggtttggagtataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtAT-A-------------------GAC-----CAG-T--ATGGT-G--TG-TGGGCTGGTACGG-TGT-AT-GGACTGCT-ATGG--A-GT-A-TA-GACTAG-TATAG---------------AA-CATG----AGC-TG--ATATTA-----------------G-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGATT-AT-G----GG-CT--GGT-ATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-CTGGTATAAAG
gi|20915 : AT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAG-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GACTAG-TAT-G---------------GAGCATG----AGC-TG--ATATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGT-GT-G----GG-CT--GGT-ATGGTGG-T-AT-GGACTGGTAT-GGGAATTAT-AGA-CCAGTATGGAca
gi|20916 : ACAAACCAGTATGG-A---------------------------------TGG-T--ACAGT-G--TA-TGGACTGGTATGG-AGT-AT-GGACTGGTTATGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCACG----AGC-TG--ATATGA-----------------G-G--T-A-A-G--ACCAGTATGTAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTAT-GGA-CTGGTATGGAGT
gi|20917 : -ATA-A--AC-AGTATGGAGA-AT-G----GA-CA--GGT-TTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAGa
gi|20917 : ATGGACAGGTTTGG-AGTATAG-------------------GAC-----AGG-T--TTGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AT-GGACTGGT-GTGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TAAAA---------------TA-TATG----GAC-TG--GTTTGG-----------------A-G--TAATA-G--ACCAGTATGGTGT-AT-G----GA-CA--AGT-GT-G-AG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTAcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtaatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgagaatggagtggtatggagta
gi|20918 : ataaacagtatggagaAT-A-------------------AAC-----CAG-T--ATGGA-G--AA-TGGAC-AGTTTGG-AGT-ATAGGACAGGT-TTGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATG----GAC-TG--GTGTGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTA--AAAT-AT-AT---GA-CT--GGT-TTGG-AG-TAAT-AGACCAGTAT-GG--TGTAT-GGA-CAAGTGTG
gi|20919 : ATAGACCAGTATGG-AGTGT-G-------------------GGC-----TGG-T--ATGG------------------TGG---T-AT-GGACTGGT-ATGGGAA-TT-A-TA-GACCAG-TATGG---------------AA-CATG----AGC-TG--ATATGA-----------------G-G--T-ATA-G--A-CAGTATGGAGTAAT-G----GG-CT--GGT-ATGA-GG-T-AT-AGACCAGTATGGG--AGTAT-GGG-CTGGTATGAGGTatgaatggagt
gi|20920 : ATAGACCAGTATGG-AGCAC-G-------------------AGC-----TGA-T--ATGAG-G--TA--AGACCAGTATGT-AGT-AT-GGACTGGT-ATGA--G-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGTATG----GAC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACTAGTATGGAGC-AT-G----AG-CT--GAT-ATGA-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-CTGGTATGGa
gi|20921 : AT-G-------------------GAC-----TGG-TT-ATGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AC-GAGCTGAT-ATGA--G-GT-A--A-GACCAG-TATGT----------------AGTATG----GAC-TG--GTATGA-----------------G-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-T-AT-AGACTAGTAT-GG--AGCAT-GAG-CTGATATGAAGT
gi|20922 : AT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGGA-G--CA-AGGACTAGTGTGG-TGT-AA-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-CA-AACCAG-TATGG---------------A--------------TG--GTACAG-----------------T-G--T-ATG-G--ACTGGTATGGAGT-AT-G----GA-CT--GGTTATGG-AG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGCAC-GAG-CTGATATGAGGTa
gi|20923 : AT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGGA-G--CA--GGACTAGTGTGG-TGT-AA-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-CA-AACCAG-TATGG---------------A------------C-TG--GTACAG-----------------T-G--T-ATG-G--ACTG--ATGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-T-AT-AGAC--ATAT-GG--AGCAC-GAG-CTGATATGAGGTa
gi|20924 : -G-------------------GAC-----AGG-T--TTGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AT-GGACTGGT-GTGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TAAAA---------------TA-TATG----GAC-TG--GTTTGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGTGT-AT-G----GA-CA--AGT-GTGA-TG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAGa
gi|20924 : ataATGGAGTGGTATGG-AGTAT-A-------------------GAC-----CAG-T--ATGGA-G--CA-TCAGCTGGTGTGG-TGT-Acatcagctggtgtggtgta
gi|20924 : ataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaATAGACCAGTATGG-AGCAT-C-------------------AGC-----TGG-T--GTGGT-G--TA-
gi|20925 : ataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatggactggtttggagtatagaccagtatggtgtatggacaagtgtgatgaatggagtggtatggagtATAGACCAGTATGG-AGTGT-GGGCTGGTATGGGTGTATGGGAC-----TGG-T--ATGGG-GAATA-TAGACCAGTATGG-AAC-AT-GAGCTGAT-ATGA--G-GTAA-TACGACCAGATACGT---------------AA--ATG----GGCGTG--GTATAG-----------------AGG--T-AAA-G--ACC-ATATGGAGTAAT-G----CG-CT--GGT-ATGA-GG-T-A
gi|20926 : AT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGGA-G--CA-AGGACTAGTGTGG-TGT-AA-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-CA-AACCAG-TATGG---------------A------------C-TG--GTACAG-----------------T-G--T-ATG-G--ACTGGTATGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATGG-AG-T-A
gi|20927 : ATGGACCAATTTGG-AGTAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATCAA-G--TA-TAGACCATTACGG-AGA-AA-GTGCTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-AACCAG-TAT-G---------------GAGAATG----GAC-AG--GTTTGG-----------------A-G--T-ATAGG--ACAGGTTTGGAGT-AT-A----GA-CC--AGT-ATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTA
gi|20928 : AT-G-------------------GAC-----TGG-T--ACAGT-G--TA-TGGACTG--ATGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GAC--A-TATGG----------------AGCACG----AGC-TG--ATATGA-----------------G-G--T-ATA-G--ACCAGTATGTAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATG
gi|20929 : ATGGACCAATTTGG-AGTAT-G-------------------GAC-----TG--T--ATCAA-G--TA-TAGACCATTACGG-AGA-AA-GTGCTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-AACCAG-TATGG----------------AGAATG----GAC--A--GTTTGG-----------------A-G--T-ATA-GG-ACAGGTTTGGAGT-AT-A----GA-CC--AGT-ATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTAaggagga
gi|20930 : AT-G-------------------GAC-----TGG-T--GTGGA-G--TA-TAGACCAGTAAAA-TAT-AT-GGACTGGT-TTGG--A-GT-AATA-GACCAG-TATGGTGTATGGACAAGTGTGAGAATG----GAG-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-C-----A-CT--GGT-GTGG-TG-T-AA-GGACTAATGT-GA--TGTAT-GGA-CTGGTATGGAG
gi|20931 : -G-------------------GAC-----AGG-T--TTGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AT-GGACTGGT-GTGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TAAAA---------------TA-TATG----GAC-TG--GTTTGG-----------------A-G--TAATA-G--ACCAGTATGGTGT-AT-G----GA-CA--AGT-GT-G-AG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAGca
gi|20932 : ataAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-G--TA-TGGACCAATTTGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATCA--A-GT-A-TA-GACCAT-TAC-G---------------GAGAAAG----TGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-A--ACCAGTATGGAGA-AT-G----GA-CA--GGT-TTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAGca
gi|20933 : -G-------------------GAC-----AGG-T--TTGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AT-GGACTGGT-GTGG--A-GT-A-TA-GACCAG-TA------------------AAATATAT---GAC-TG--GTTTGG-----------------A-G--TAATA-G--ACCAGTATGGTGT-AT-G----GA-CA--AGT-GTGA-TG-A-AT-GGAGTGGTAT-GG---GTAT-AGA-CCAGTATGGAGca
gi|20933 : ataATGGACAAGTGTGA-TGAAT-G-------------------GAG-----TGG-T--ATGG--G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AT-CAGCTGGT-GTGG--T-GT-A-catcagctggtgtggtgta
gi|20934 : ataggacaggtttggagtatagaccagtatggagcatggactggtgtggagtatagaccagtaaaatatatgactggtttggagtaatagaccagtatggtgtAT-G-------------------GGC-----TGG-T--ATGAG-G--TA-TAGACCAGTATGGGAGT-AT-GGGCTGGT-ATGA--G-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATGTACTGAC-TGAGGT-TAG-----------------A-G--C-ATG-A--GCTGATATGAGGT-ATAG----GAGCC--AGT-ATGG-AG-TGAT-GG-CTGGTAT-GA--GGTAT-AGA-CCAGTATGGAGT
gi|20935 : ATAGACCAGTATGG-AACAT-G-------------------AGC-----TGA-T--ATGAG-G--TA-TAGA-CAGTATGG-AGTAAT-GGGCTGGT-ATGA--G-GT-A-TA-GACCAG-TATGG---------------GAGTATG----GGC-TG--GTATGA-----------------G-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-GTACTGA-CTGAGGT--TAG-AG-C-AT-GAGCTGATAT-GA--GGTATAGGAGCCAGTATGGAGT
gi|20936 : AT-G-------------------GAC-----TGC-T--ATGGA-G--TA-TAGACTAGTATAG-AAC-AT-GAGCTGAT-ATTA--G-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------ATTATG----GGC-TG--GTATGA-----------------G-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGT-GT-G----GG-CT--GGT-ATAA-AG-C-AT-GGATTGGTAT-AA--AGAAT-GAA-TTGGTATGG
gi|20937 : -AT-AGGCTCGTAT-GA--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAG
gi|20937 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-G--TA-TGGACCAATTTGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATCA--A-GT-A-TA-GACCAT-TAC-G---------------GAGAAAG----TGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-A--ACCAGTATGGAGA-AT-G----GA-CA--GGT-TTGG-AG-T-Acatggactggtatgaagtatggaccaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20938 : ataggctcgtatgaagtAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATCAA-G--TA-TAGACCATTACGG-AGA-AA-GTGCTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-AAC-AG-TAT-G---------------GAGAATG----GAC-AG--GTTTGG-----------------A-G--T-ATAGG--ACAGGTTTGGAGT-AT-A----GA-CC--AGT-ATGG-AG-C-AT-GGACTGGTGT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTA
gi|20939 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-G--TA-TGGACCAATTTGG-AGT-AT-GGACT-GT-ATCA--A-GT-A-TA-GACCAT-TAC-G---------------GAGAAAG----TGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-A--ACCAGTATGGAGA-AT-G----GA-C---AGT-TTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAG
gi|20940 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-GA-TA-TGGA-CAATTTGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATCA--A-GT-A-TA-GACCAT-TAC-G---------------GAGAAAG----TGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-A--A-CAGTATGGAGA-AT-G----GA-CA--GGT-TTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAGca
gi|20941 : ATA----GGC-TC--GTATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTAT-GGA-CT-GTATCAAGTca
gi|20941 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-G--TA-TGGACCAATTTGG-AGT-AT-GGACT-GT-ATCA--A-GT-A-TA-GACCAT-TAC-G---------------GAGAAAG----TGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-A--ACCAGTATGGAGA-AT-G----GA-C---AGT-TTGG-AG-T-ATAGGACAGGTTT-GG--AGTAatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaaccagtatggagaatggacagtttggagtataggacaggtttggagta
gi|20942 : ataggctcgtatgaagtATAGACCAGTATGGGAGTAT-G-------------------GGC-----TGG-T--ATGAG-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGC-AT-GTACTGAC--TGA--G-GT---TA----------------------------GAGCATG----AGC-TG--ATATGA-----------------G-G--T-ATA-GGAGCCAGTATGGAGTGAT-G----G--CT--GGT-ATGA-GG-T-AT-AGACCAGTAT-GG--AGTGT-GGG-
gi|20943 : -AT-AGGCTCGTAT-GA--AGTAT-AGA-CCAGTATGGAG
gi|20943 : ATAGACCAGTATGG-AGCAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-GA-TA-TGGA-CAATTTGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATCA--A-GT-A-TA-GACCAT-TAC-G---------------GAGAAAG----TGC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ATA-A--A-CAGTATGGAGA-AT-G----GA-CA--GGT-TTGG-AG-T-Acatggactggtatgaagatatggacaatttggagtatggactggtatcaagtatagaccattacggagaaagtgctggtatggagtataaacagtatggagaatggacaggtttggagta
gi|20944 : ataggctcgtatgaagtT-A-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-G--TA-TAGACCAATATGG-AGT-AT-AGGCTCGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATG----GAC-TG--GTATGA-----------------A-G--T-ATG-G--ACCAATTTGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AGAAA-GTG-CTGGTATGGAGT
gi|20945 : T-A-------------------GAC-----TGG-T--ATGGAAG--TA-TAGACCA-TATGG-AGT-AT-AGGCTCGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAG-TATGG----------------AGCATG----GAC-TG--GTATGA-----------------A-G--T-ATG-G--ACCAATTTGGAGT-AT-G----GA-CT--G-T-ATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AGAAA-GTG-CTGGTATGGAGTa
gi|20946 : T-A-------------------GAC-----TGG-T--ATGAA-G--TA-TAGACCAATATGG-AGT-AT-AGGCTCGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAG-TAT-G---------------GAGCATG----GAC-TG--GTATGA-----------------A-GA-T-ATG-G--A-CAATTTGGAGT-AT-G----GA-CT--GGT-ATCA-AG-T-AT-AGACCATTAC-GG--AGAAA-GTG-CTGGTATGGAGTa
gi|20947 : AGACCAGTATGT-AGTAT-G-------------------GAC-----TGG-T--ATGAG-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-AT-GGACTGGT-ATGG--A-GT-A-TA-GACTAG-TAT-G---------------GAGCATG----AGC-TG--ATATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGT-GT-G----GG-CT--GGT-ATGGTGG-T-AT-GGACTGGTAT-GG--a
gi|20948 : AC-----TGG-T--GTGGT-G--TA-AGGACTAATGTGA-TGT-AT-GGACTGGT-ATGG--A-GC-A--G-GACTAG-TGTGG---------------T-GTAAG----GAC-TG--GTATGG-----------------A-G--T-ACA-A--ACC-------AGT-AT-G----GA-CT--GGT-ACAG-TG-T-AT-GGACTG--AT-GG--AGTAT-GGA-CTGGTATGGAGT
gi|20949 : G-T--ATGAG-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-AT-GGGCTGGG-ATGA--G-GT-A-TA-GACCAG-TATGG---------------T-GTGTG----GGC-TG--GTACGG-----------------T-G--T-ATG-G--ACTGCTATGGAGT-AT-A----GA-CT--AGT-ATAG-AA-C-AT-GAGCTGATAT-TA--GGTAT-AGA-CCAGTATGGAa
gi|20950 : G-T--ATTGA-G--TA-TAAGTTGGTATGG-TGT-ATTAGACTGGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAA-TATGG----------------AGTATA----GGC-TC--GTATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTAtta
gi|20951 : G-T--ATG-A-G--TA-TAAGTTGGTATGG-TGT-ATTAGACTGGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAA-TATGG----------------AGTATA----GGC-TC--GTATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-AGAT-AT-GGA-CAATTT-GG--AGTA
gi|20952 : GTATGG-TGT-ATTAGACTGGT-ATGG--AAGT-A-TA-GACCA--TATGG----------------AGTATA----GGC-TC--GTATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-AG-T-AT-GGACCAATTT-GG--AGTA
gi|20953 : GG-T--ATGAG-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-AT-GGGCTGGG-ATGA--G-GT-A-TA-GACCAG-TATGG---------------T-GTGTG----GGC-TG--GTACGG-----------------T-G--T-ATG-G--ACTGCTATGGAGT-AT-A----GA-CT--AGT-ATAG-A
gi|20954 : ataggg-----TGG-T--ATTGA-G--TA-TAAGTTGGTATGG-TGT-ATTAGACTGGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAA-TATGG----------------AGTATA----GGC-TC--GTATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-AG-T-A
gi|20955 : g-----TGG-T--ATG-A-G--TA-TAAGTTGGTATGG-TGT-ATTAGACTGGT-ATGA--A-GT-A-TA-GACCAA-TATGG----------------AGTATA----GGC-TC--GTATGA-----------------A-G--T-ATA-G--ACCAGTATGGAGC-AT-G----GA-CT--GGT-ATGA-AG-
gi|20956 : gTGGA-G--TA-TAGACCAGTATGG-AGT-GT-GGGCTGGT-ATGG----GT-----------G-TATGG---------------GA-----------C-TG--GTATGG-----------------G-GAAT-ATA-G--ACCAGTATGGAAC-AT-G----AG-CT--GAT-ATGA-GG-T-A
gi|20957 : CCAGTATGG-AGCAC-G-------------------AGC-----TGACT--ATGAG-G--TACTAGACCAGTATGT-AGT-AT-GGACTGGT-ATGA--A-Ga