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Reference ( gi|116536 ) : CATGCGC-GTGCATT---A--A-C-TTTCGA--AGTT--TAC--A-T---TTT-T-G----A-A---GG--CCA-ATA-GTGCTTTTGGTT--T-TC----------------A-TCACA-----TTCTT--TCG---AAA-TT------GG----G-GG---T-----T-T-G---------A-G---T----G-TGTCTT-GA-A-ACT-----CTCT-----A-ACCGA--TCT--G---CA--A-------G--TC--AA-----A-A---T-TA---C--AAAT--C--T--G----C-A-C-GTGCA-TGCAC-GT---G------T-GC-TT-C---ATTTT-GA-T-T-GGATAAT-GCT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA-AGA----G-AAT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116537 : CATGCGC-GTGCATT---A--A-C-TTTCGA--AGTT--TAC--A-T---TTT-T-G----A-A---GG--CCA-ATA-GTGCTTTTGGTT--T--C----------------A-TCACA-----TTCTT--TCG---AAA-TT------GG----G-G----T-----T-T-G---------A-G--------G-TGTCTT-GA-A-ACT-----CTCT-----A-ACCGA--TCT--G---CA--A-------G--TC--AA-----A-A---T-TA---C--AAAT--C--T--G----C-A-C-GTGCA-TGCAC-GT---G------T-GC-TT-C---ATTTT-GA-T-T-GGATAAT-GCT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA-AGA----G-AAT--GA-AT-TCATATTTA
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gi|116544 : CATGCGCTGTGCATT---G--A-CCTTTCGA--AGTC--TAC--A-C---TTT-T-GC---A-A---GG--CCACATACGCGCTTTGTTTT--T-TC----------------AATCATA-----TTCTT--TCG---AAAGTT------GG----GTGA---T-----T-T-G---------A-AGATT----G-TGTA---GA-A-ACT-----CTCT-----A-ACCGA--TCA--G---CA--A-------G--TC--AA-----ACA---C-TT---CTCAATT--T--T--G----C-ATC-GTGCA-TGCAC-GT---T------TTGCCTT-A---ATTTT-GA-T-T-GGATAAT-AC-----AACA----C-------GTCTGGTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA-AGA----GCAAT--GACAT-TCATATTTA
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gi|116557 : CATGCGC-GTGCATT---C--T-C-TTTTGA--AATT--TAA--A-C---ATT-T-G----A-A---GG--ACC-ATA-GCGCTGTTCATT--T-TC----------------A-aaatgatgcaaacaatatcaaatt
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gi|116550 : cgtttactaacttcggaatctgcctaacattttttcttcttcttcattgaaaccctttcataatatatgataagttgataTT-GA-A-ACT------TGT-----A-ATTGA--TCT--A---CA--TT------G--TC--AA-----A-A---T-CA---C--CATT--T--T--G----C-A-C-GTGCA-TGCCC-GT---G------T-GC-TT-C---ATTTT-GA-T-T-GGATGA-------------------------------TA-A----CTT---TC--TA--A-T-
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gi|116570 : -----A-ACTGAA-CCT--G---CA-------------TCGTAA-----A-A---T-TT---C--GCAT--TATT--G----CGA-C-GTGCAGTGCAC-GT---G------TTGC-TTTC---ATTTTTGA-T-T-GTAAACT-G------AAAA----C-------GTCT-GTT-A----ATT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GACGGA----C-AAT--GT-ATATCACATTTA
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gi|116558 : ATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTTG--GCT---TCCTAAC-T---TCC-G-G----A-ATCAG---TC---TA-ACTTTTT--T-ATT-C----------------TTCA-AT-GA----AT-CAT-TTG---ATA-T---TCAC-----AA----G--G------T-A-G----G---T----A--GA-AC-TTGA-GACC-----CT-T---A-ATT--GA--TTG--G---TA--T-------GA-T---C--A---AA-A----T-T-C--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-C-TG-C-A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TC--ATT-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116559 : ATGCGC-GTGCATT-GTAA-TTTTGA--TGT---C--TAAA-T---GTTAT-T----A-T--AC---TCT-AT--GAGATCT--T-ACA-T----------------TTGA-TT-GA----ATAGTT-TTG---AAA-T------------GT----A--T-AT-T-T-C-A----G---T----A--TG-TA-TTGG-GACT-----CTTTGTTA-ATT--GG--T----G----A--T-------T--T---C--A---AA-A----T-CAT--T----------ATC-CC--G----C--A-C-ACGCT-CG----------CA-CGT---GC-G-C-TG-A-A-ATC-T-GAT-T-GGATGATA-TT------------C-------GTAT-GTGCATATTCTT---TCTTTA--A-T-G-A
gi|116560 : TCT--T-CTT-C----------------TTCA-TTGAA----ACCCTT-TCA---TAA-TATAT--------GA----T--A-AG-T-T-G-A-------------------TA-TTAA-GAC------CACT---A-ACT--GA--TAT--C---CA--TT------G--T---C--A---AC-A----T-CAC--A----------ATA-AT--G----C--A-C-GCGCA-TG----------TA-CATACAGT-G-T-TG-C-A-TTT-T-AAT-T-GAATAATA-CT----TAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----GA---ATG-----TA--AT--AA-GT-TTATATTTA
gi|116561 : cgtttactaacttcggaatctgcctaacatttttTCAA--AGG---T---ATA-T---CTT-C-A----ATA--GC---TCA-ATA-----TTT--T--CT-T----------------TTCA-AT-AA----ATTTGA-TTA---AAA-T---T--------TG----G--G-TTGT-T-A-A----A---T-----------T-TTAG-GACT-----TT-T---C-ATT--GA--TAT------CA--T-------GA-T---T--G---AA-A----T-CAC--ATACCCGCGATAGC-TA--A----C--A-C-GTGCGCTGAAATAGCTAACA-CGT---GT-G-C-TG-A-A-TTT-T-GAT-T-GGATGATA-CT----TAAA----C-------GCCA-ATA-A----CT
gi|116562 : A--GGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--GG---AAT-ATA-GCGTTTT--T-GTT-T----------------TTGA-TC-AA----ATTCTT-TTC---AAA-T---T--------GG----G--G-CT-T-T-G-G----G---G----A--TGTTT-TTGG-TACT-----CTTT---A---C--AA--ATT--G---CG--ATG-----G--T---T--A---AT-A----T-TACTGG----------CCA-TT----------A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---AT-G-C-TA-T-A-TTC-T-GAT-G-GGATGATT-TT----GAAATCACC-------ATAT-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-TGGTGCAA---ACAT----GA--AG--AA-AT-TTATACT
gi|116563 : A--AGT---T--TAAT-T---TTT-T-G----A-A--GG---ACC-ATA-GCGCTTT--T-TTT-TTTTCTTTTTTTTTTTTTTTA-TC-AA----ATTCGT-TTG---AAA-T---T--------GG----G--C-CT-C-T-G-A----G---TACACA--TG-TC-TTGG-TACT-----CTTT---A---C--AA--ACT--GTTTTA--G-------G--T---T--A---AA-A----T-
gi|116564 : T---T--AATA-T---TTT-C-G----A-A--GG---CCT-ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TC-AA----ATTCAT-TAG---AAG-T---T--------TA----A--G-AT-T-T-C-A----G---T----G--TG-TC-TTGG-TATT-----TTCT---A-AGT--GA--TCT--G---CA--A-------G--T---C--A---AA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTCCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CGTA-C---TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AA---------------------A-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--GA-AT-TCATTTTTAca
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gi|116566 : TT--T-ATT-T----------------TTT--TC-AA----ATTATT-TTG---AAA-T---T--------GG----G--C--T-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGG-TACT-----CTTT---A---C--AA--ACT--G---CT--ATG-----G--T---T--A---AA-A----T-TACT-G----------ACC-AT-------C--A-C-ACGCA-TA----------CA-CAT---GC-G-G-TA---A-TTTCC-GAC-T-GAA
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Reference ( family-375 ) : CATGCGC-GTGCATT-GNC--TTTCGA--AGT---T--TANA-T---TTT-T-G----A-A--GGN---C--A-ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCGAA-----TTCTTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGANACT-----CTCT---A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--N--G---T---CAAA-A----T-TNC--G----------ANT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----NA--AT--GA-AT-TCATATTTA
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gi|116546 : CATGCGC-GTGCATG-ATC--TTTCAA--AGT---T--CAAA-T---TTT-T-G----A-A--AGA---C--C-AGA-GCGC-TT--T-G-T-T----------------TTCA-TTAAA-----ATGTTTTG---A-AA-T---T--------GA----G--G-CT-T-T-G-A----G---T----T--TG-TC-TTGATTCT-----CTTT-----AT----T--GT--TAT--G-----------G---T---TGAA-A----T-TAG--T----------GGC-GT--A----C--A-T-CTGCA-TA----------CA-CCT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGATGATT-TT----AAAAT---C-------G-CC-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-T-----AATGCAAA-----CATTATA-AA-AT-TTATACT
gi|116547 : CATGCAC-GTGCATC-GTC--TTTTAA--AGG---T--CCAA-T---TCT-TCG----A-T--TGA---C--C-ATA-ACG-TTT--T-GTT-T----------------TT-G-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T--------GA----T----AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TC-TTCATGGT-----TCTT---A-AT----A--GAGGTTT--A---T-A--G--A-------CAAA-A----T-TCC-------------ATT-TCA-G----C--A-C-GTGCA-TG----------CG-CGT---GT-GCCTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGACGAT--TT----GAAA----T-------TGCT-GTA-A----CTT---CT--TA--A-
gi|116548 : CATGCGC-GTGCATT-GTC--TTTCCA--AAT---T--TAAA-T---TTT-T-G----A-A--GGA---C--C-TTA-TCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TC-AATTTTTTTTTTTTT---A-AG-T---T---------G----T--G-AT-T-T-G-A----A---T----G--TG-TC-TTGGTTCTGTGGGCTTTG--A-ATGTTAC--AA--ATT--G---T-T--G--G---T---TAAA-A----T-TAC-----------------TT--GCCATC--A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---GT-G-CCG-A----A-TT
gi|116549 : CACGCGC-ATGCATT-GTCA-TTTGAA--AGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--GGA---T--C-ATA-AAGTTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCAAA-----TTCTTCTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-TC-T-T-A-G----G---T----AT-TA-TC-TTGGT--TA----CTAT---A-GT----T--AA--TT-------------------------AA-A----T-GGC--C----------GT-----------C--A-T-GTGCA-TA----------CA-CAT---AT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGATGAT
gi|116550 : CATGCGC-GTGC----GAA--TTTTG----GTACAC--TAAA-T---TCG---G----A-ACTAGT---C-----TA-ACATTTT--C-ATT-C----------------TTCA-TTGA-------TATATTG---T-AA--------------GA----A--C-AT------------G---T----A--GA-TA-TTGAAACT------TGT---A-AT----T--GA--TCT--A---C-A--TT-G---T---CAAA-A----T-CAC--C----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CC-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATGA-------------------------------TA-A----CTT---TC--TA--A-T-
gi|116551 : CATGCAC-GTGCATCCGTC--TTTTAA--AGG---T--CCAA-T---TCT-TCG----A-T--GGA---C--A--TA-ACGTTTT--T--TT-T----------------CTTG-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T---------G----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TCTTTGATGGT-----CTAA---ATAG----T--GG--TTT--A---A-T--A--G---T---CAAA-AAAATT-CCC--C----------ATT-TA--G----CA-A-C-GTGCA-TG----------CG-CGT---GT-G-CTG-A----A-ACT-T-CCTAT-GGACATTT-TT----GAAA----T--------TGC-GTA-A----CTT---TC--
gi|116552 : CATGCGC-GGGCATT-GTC--TTTTAA--ACG---T--TAAA-T---TTT-A-G----A-A--GGC---C--A-ATA-GCGCTTT--T-GAT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCTTTTG---C-AA-T---C--------GG----A--G-AT-T-
gi|116553 : CATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTG----GC---C--TA-A-C---TTC-G-G----A-ATCAGT---C-----TA-ACTTTTT--T-ATT-TC---------------TTCA-ATGAA-----ATCATTTG---A----T---TCAC-----AA----G--G----T-T---A----G---T----A--GA-AC-TTGAGATC-----CTG----A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--G--A---TTCTCAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TTTGG----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-TGGGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---T
gi|116554 : CATGCGA-CT-CATT-GAC--TTTCGAGAAGT---T--TCGA-T---TTT-G-A----G-A--GGG---CCCA-ATA-GCG-TTT--T-GTT-T----------------TTTA-TCA--------TCTTTCGGAAA-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-ACATAG---G----G--TA------GA-ACT-----CTCT---T-AT-------GA--TCCTGG---C-A--T--AGCAT---CAAA-A----TGTTC--A----------ATT-TT--G------------------G----------CA-CGT---GT-G-CT
gi|116555 : CATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTT----GT---TCCTA-A-C---TTC-G-G----A-ATCAGT---C-----TA-AC-TTTT--T-ATT-T----------------TCAA-TTAAA-----T-CATTTG---A-TA-T---T--------CACACAG--G-AT-G-TAG-A----A---------------C-TTGAGACC-----CTG----A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-T----T-TTC--G----------ATT-TT--G----T--A-C-GTGCG-TG-----------A-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T--GATAAT--CA----AAAA----TA------GTCT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AT-T-----TA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattttccaa
gi|116556 : CATGCAC-GTGCATC-GTC--TTTAAA--GGT---C--CAT--T---CTT-C-G----A-T--TGA---C--C-ATA-ACGTTTT--TTGTT-T----------------CTTG-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T--------GA----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TC-TTGATG-T-----CT-T---A-AG----AAAGA--GTT--A---T-A-----G---T---CAAA-A----T-TTC-------------ATT-TCA-G----C--A-C-GCGCA-TG----------CG-CGT---GTAG-CTG-A----A-TTC-T-GA--T-GGACATT---T----GAAA----T-------TGCC-GTA-A-----TT---TC--T------------T-----AA---AAA-----TG--AT--G
gi|116557 : CATGCGC-GTGCATT-CTC--TTTTGA--AAT---T--TAAA-C---ATT-T-G----A-A--GGA---C--C-ATA-GCGCTGT--T-CAT-T----------------TTCA-caaacaatatcaaatt
gi|116558 : ATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTTG--GCT---TCCTAAC-T---TCC-G-G----A-ATCAGT---C-----TA-ACTTTTT--T-ATT-C----------------TTCA-ATGAA-----T-CATTTG---A-TA-T---TCAC-----AA----G--G------T-A-G----G---T----A--GA-AC-TTGAGACC-----CT-T---A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-A----T-T-C--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TC--ATT-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116559 : ATGCGC-GTGCATT-GTAA-TTTTGA--TGT---C--TAAA-T---GTTAT-T----A-T--ACT---C--T-AT--GAGATCT--T-ACA-T----------------TTGA-TTGAA-----TAGTTTTG---A-AA-T------------GT----A--T-AT-T-T-C-A----G---T----A--TG-TA-TTGGGACT-----CTTTGTTA-AT----T--GG--T----G-----A--T--T---T---CAAA-A----T-CAT--T----------ATC-CC--G----C--A-C-ACGCT-CG----------CA-CGT---GC-G-CTG-A----A-ATC-T-GAT-T-GGATGATA-TT------------C-------GTAT-GTGCATATTCTT---TCTTTA--A-T-G-A
gi|116560 : TCT--T-CTT-C----------------TTCA-TTGAA-----ACCCTTTC---ATAA-TATAT--------GA----T--A-AG-T-T-G-A-------------------TA-TTAAGAC------CACT---A-AC----T--GA--TAT--C---C-A--TT-G---T---CAAC-A----T-CAC--A----------ATA-AT--G----C--A-C-GCGCA-TG----------TA-CATACAGT-G-TTG-C----A-TTT-T-AAT-T-GAATAATA-CT----TAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----GA---ATG-----TA--AT--AA-GT-TTATATTTA
gi|116561 : cgtttactaacttcggaatctgcctaacatttttTCAA--AGG---T---ATA-T---CTT-C-A----ATA--GCT---C--A-ATA-----TTT--T--CT-T----------------TTCA-ATAAA-----TTTGATTA---A-AA-T---T--------TG----G--G-TTGT-T-A-A----A---T-----------T-TTAGGACT-----TT-T---C-AT----T--GA--TAT------C-A--T--GA--T---TGAA-A----T-CAC--ATACCCGCGATAGC-TA--A----C--A-C-GTGCGCTGAAATAGCTAACA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTT-T-GAT-T-GGATGATA-CT----TAAA----C-------GCCA-ATA-A----CT
gi|116562 : A--GGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--GGA---A--T-ATA-GCGTTTT--T-GTT-T----------------TTGA-TCAAA-----TTCTTTTC---A-AA-T---T--------GG----G--G-CT-T-T-G-G----G---G----A--TGTTT-TTGGTACT-----CTTT---A-------C--AA--ATT--G---C-GATG--G---T---TAAT-A----T-TACTGG----------CCA-TT----------A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---AT-G-CTA-T----A-TTC-T-GAT-G-GGATGATT-TT----GAAATCACC-------ATAT-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-TGGTGCAA---ACAT----GA--AG--AA-AT-TTATACT
gi|116563 : A--AGT---T--TAAT-T---TTT-T-G----A-A--GGA---C--C-ATA-GCGCTTT--T-TTT-TTTTCTTTTTTTTTTTTTTTA-TCAAA-----TTCGTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C-CT-C-T-G-A----G---TACACA--TG-TC-TTGGTACT-----CTTT---A-------C--AA--ACT--GTTTT-A--G--G---T---TAAA-A----T-
gi|116564 : T---T--AATA-T---TTT-C-G----A-A--GGC---C--T-ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCAAA-----TTCATTAG---A-AG-T---T--------TA----A--G-AT-T-T-C-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTATT-----TTCT---A-AG----T--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTCCA-TG----------CA-CGT---GT-G-C-G-T----ACTTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AA---------------------A-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--GA-AT-TCATTTTTAca
gi|116565 : TT--T-TTT-T----------------CTCT-TCAGA-----TTCTTTTG---A-AA-T---T---------G----G--G-CT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTACT-----CTTT---A-------C--AA--ATT--G---CTAT-G--G---T---TAAA-A----T-TAC--
gi|116566 : TT--T-ATT-T----------------TTT--TCAAA-----TTATTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C--T-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTACT-----CTTT---A-------C--AA--ACT--G---CTAT-G--G---T---TAAA-A----T-TACT-G----------ACC-AT-------C--A-C-ACGCA-TA----------CA-CAT---GC-G-GTA------A-TTTCC-GAC-T-GAA
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gi|116568 : tgttatcagatcagatattcaTCA-TCAAA-----TTCTTTCG---A-AA-T---T--------AG----A--G-AT-T-T-G-A----A---TAT--G--TG-TA-TAGAAACT-----CTTT---A-AC----C--GA--TCA--G---C-A--A--A---T---CAGA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A------------------------CGT---GT-G-CTT-A----A-TTT-T-G
gi|116569 : ---T--------GG----G--G-A--------A----G---T----AGATG-TT-TGAAGACC-----CT-T---A-AC----T--GA--CCT--G---C-A--GTTG---T---CCAA-A----TATTC--G----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GTGG-CTT-CG---A-TTT-T-AAT-T-GGATAAT--CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTTCC-TC--TATTA-TGG-AA-TC----GA---CGAC----AA--AT--G---T-TCACATT
gi|116570 : ---A-AC----T--GAA-CCT--G---C-A--TC-G---T----AAA-A----T-TTC--GC---------ATTATT--G----CG-A-C-GTGCAGTG----------CA-CGT---GTTG-CTTTC----A-TTT-TTGAT-T-G--TAA-A-CTG---AAAA----C-------GTCT-GTT-A----ATT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GAC--GGA-----CA--AT--GT-ATATCACATTTA
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gi|116573 : T-----CCCT---A-AC----G--GA--TCT--G---C-A--TC-G---T---TAAA-A----T-TAT--T----------ATT-TT--G----C--C-C-GTGCA-TG----------TG-CGT---GC-A-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T------ATG-CT----AAAA----C-------ACCT-GTA-A----CTT---CA--TA--A-T-G-AA-T-----AC---AGA-----GA--AT--AA-AA-TCATATTTA
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Reference ( family-375 ) : CATGCGC-GTGCATT-GNC--TTTCGA--AGT---T--TANA-T---TTT-T-G----A-A--G--GNCN--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCGAA-----TTCNTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGANACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--N--G---T---CAAA-A----T-TNC--G----------ANT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----NA--AT--GA-AT-TCATATTTA
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gi|116538 : CATACAC-GTGCATT-GG-------GA--ATT---TGGTGCA-CCAATTT-T-GGAATA-A--G--TTCA--AC-----TTTT--T-ATTCT----------------TTCA-TTAAA-----ATCGTATG---A-GA-T---TTATATGGAGA----GTAG-ATAT-T-G-A----A---T-------------TCGAAACC-----C----CT-A-AC----T--GA--TCA--G---C-A--TC-G---T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-T-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-T-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAAAA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----AA---AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116539 : CATACAC-GTGCATT-GG-------GA--ATT---TGGTGCA-CCAATTT-T-GGAATA-A--G--TTCA--A----CTTTTT--T-ATT-C----------------TTCA-TTAAA-----ATCGTATG---A-GA-T---TTATATGGAGA----GTAG-ATAT-T-G-A----A---T-------------TCGAAACC-----C----CT-A-AC----T--GA--TCA--G---C-A--TC-G---T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-T-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-T-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAAAA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----AA---AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116540 : CATGCGC-GTGCATT-GGC--TTTCGA--AGT---T--TAGA-T---TTT-T-G----A-A--G--GCCA--ATA-GTGATTT--T-ATT-T----------------T-CA-TCAAA-----TTCTTTCG---A-AA-C---T--------GG----A--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TAC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-G----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATG-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----GA---AGA-----GA--AC--GA-AT-TCATATTTA
gi|116541 : CATGCGC-GTGTATA-GAC--TTTCGA--AGT---T--TAGA-T---TAT-T-G----A-A--G--ACCA--ATA-GCGCTTT--T-GTT-G----------------TTCA-TCAAA-----TTCTTTCA---A-AA-T---T--------AG----G--A-AT-T-T-T-A----G---T----G--TT-TC-TTGAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TAT--C---C-A--A--G---T---CAAA-A----A-TAC--A----------AAT-TT--G----C--A-C-GTTCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTC-A----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATG-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----A
gi|116542 : CATGCGC-GTGCATT-GTC--TTTTAA--ACT---T--TAAT-T---TTT-T-G----A-A--G--GACC--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCATTTG---C-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TT-TC-TTGATACT-----CT---TT---AC----A--GA--T-T--GT--T-T--T--G---T---TAGA-A----T-TACT-G----------ACC-AT-------C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GGT-T-GGATTATT-TT----AAAA----taaag
gi|116543 : CATGCAC-GTGCATT-GGGAATTTCGT--ACA---C--CA-A-T---TTT-G-G----A-A--GAAGTCC--A-----ACTTTATT-ATT-C----------------TTCA-TTGAA-----ATCGTGTG---A-TA-T---T--------TG----T--ATAT-G-T-GGA----G---T----A--GA-TA-TTGAGACC-----CT----T-C-AC----T--GA--TCT--G---C-A--TC-G---T---CAAA-A----T-TTC--G----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------TA-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAG----T-------GTCT-GCA-A----CTT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GA---AGATACCGTA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116544 : CATGCGCTGTGCATT-GACC-TTTCGA--AGT---C--TACA-C---TTT-T-GC---A-A--G--GCCAC-ATACGCGCTTT--G-TTT-T----------------TTCAATCATA-----TTCTTTCG---A-AAGT---T--------GG----GT-G-AT-T-T-G-A----AGATT----G--TG-TA---GAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCA--G---C-A--A--G---T---CAAACA----C-TTCTCA----------ATT-TT--G----C--ATC-GTGCA-TG----------CA-CGT---TT----TG-CCTTAA-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-C-----AACA----C-------GTCTGGTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGAG----CA--AT--GACAT-TCATATTTA
gi|116545 : CATGCAC-ACACATT-GTC--TTTAAA--A--------CACAAT---TTT-T-G----A-T--G--GATG--ATA-GCACTTT--T-GTT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCTTTTG---C-AA-T---T--------TG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TC-TC-TTGATACT-----CT---TT-A---------------------------------------CAAA-T----TGTAC------------------T--G-------A-C-CTGCA-TA----------CA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTA-T-AAA-T-GGATGATT-AT----AAAA----
gi|116546 : CATGCGC-GTGCATG-ATC--TTTCAA--AGT---T--CAAA-T---TTT-T-G----A-A--A--GACC--AGA-GCGC-TT--T-G-T-T----------------TTCA-TTAAA-----ATGTTTTG---A-AA-T---T--------GA----G--G-CT-T-T-G-A----G---T----T--TG-TC-TTGATTCT-----CT---TT---AT----T--GT--TAT--G-----------G---T---TGAA-A----T-TAG--T----------GGC-GT--A----C--A-T-CTGCA-TA----------CA-CCT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGATGATT-TT----AAAAT---C-------G-CC-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-T-----AATGCAAA-----CATTATA-AA-AT-TTATACT
gi|116547 : CATGCAC-GTGCATC-GTC--TTTTAA--AGG---T--CCAA-T---TCT-TCG----A-T--T--GACC--ATA-ACG-TTT--T-GTT-T----------------TT-G-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T---------G----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TC-TTCATGGT-----TC---TT-A-AT----A--GAGGTTT--A---T-A-----G---A---CAAA-A----T-TCC-------------ATT-TCA-G----C--A-C-GTGCA-TG----------CG-CGT---GT-GCCTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGACGAT--TT----GAAA----T-------TGCT-GTA-A----CTT---CT--TA--A-
gi|116548 : CATGCGC-GTGCATT-GTC--TTTCCA--AAT---T--TAAA-T---TTT-T-G----A-A--G--GACC--TTA-TCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TC-AATTTTTTTTTTTTT---A-AG-T---T---------G----T--G-AT-T-T-G-A----A---T----G--TG-TC-TTGGTTCTGTGGGCT---TTGA-ATGTTAC--AA--ATT--G---T-T--G--G---T---TAAA-A----T-TAC-----------------TT--GCCATC--A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---GT-G-CCG-A----A-TT
gi|116549 : CACGCGC-ATGCATT-GTCA-TTTGAA--AGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--G--GATC--ATA-AAGTTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCAAA-----TTCTTCTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-TC-T-T-A-G----G---T----AT-TA-TC-TTGGT--TA----CT---AT-A-GT----T--AA--TT-------------------------AA-A----T-GGC--C----------GT-----------C--A-T-GTGCA-TA----------CA-CAT---AT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGATGAT
gi|116550 : CATGCGC-GTGC----GAA--TTTTG----GTACAC--TAAA-T---TCG---G----A-ACTA--GTC----TA-ACATTTT--C-ATT-C----------------TTCA-TTGA-------TATATTG---T-AA--------------GA----A--C-AT------------G---T----A--GA-TA-TTGAAACT------T---GT-A-AT----T--GA--TCT--A---C-A--TT-G---T---CAAA-A----T-CAC--C----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CC-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATGA-------------------------------TA-A----CTT---TC--TA--A-T-
gi|116551 : CATGCAC-GTGCATCCGTC--TTTTAA--AGG---T--CCAA-T---TCT-TCG----A-T--G--GAC---ATA-ACGTTTT--T--TT-T----------------CTTG-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T---------G----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TCTTTGATGGT-----CT---AA-ATAG----T--GG--TTT--A---A-T--A--G---T---CAAA-AAAATT-CCC--C----------ATT-TA--G----CA-A-C-GTGCA-TG----------CG-CGT---GT-G-CTG-A----A-ACT-T-CCTAT-GGACATTT-TT----GAAA----T--------TGC-GTA-A----CTT---TC--
gi|116552 : CATGCGC-GGGCATT-GTC--TTTTAA--ACG---T--TAAA-T---TTT-A-G----A-A--G--GCCA--ATA-GCGCTTT--T-GAT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCTTTTG---C-AA-T---C--------GG----A--G-AT-T-
gi|116553 : CATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTG----GC---C--TA-A-C---TTC-G-G----A-ATCA--GTC----TA-ACTTTTT--T-ATT-TC---------------TTCA-ATGAA-----ATCATTTG---A----T---TCAC-----AA----G--G----T-T---A----G---T----A--GA-AC-TTGAGATC-----CT---G--A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--G--A---TTCTCAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TTTGG----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-TGGGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---T
gi|116554 : CATGCGA-CT-CATT-GAC--TTTCGAGAAGT---T--TCGA-T---TTT-G-A----G-A--G--GGCCCAATA-GCG-TTT--T-GTT-T----------------TTTA-TCA--------TCTTTCGGAAA-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-ACATAG---G----G--TA------GA-ACT-----CT---CT-T-AT-------GA--TCCTGG---C-A--T--AGCAT---CAAA-A----TGTTC--A----------ATT-TT--G------------------G----------CA-CGT---GT-G-CT
gi|116555 : CATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTT----GT---TCCTA-A-C---TTC-G-G----A-ATCA--GTC----TA-AC-TTTT--T-ATT-T----------------TCAA-TTAAA-----T-CATTTG---A-TA-T---T--------CACACAG--G-AT-G-TAG-A----A---------------C-TTGAGACC-----CT---G--A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-T----T-TTC--G----------ATT-TT--G----T--A-C-GTGCG-TG-----------A-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T--GATAAT--CA----AAAA----TA------GTCT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AT-T-----TA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattttccaa
gi|116556 : CATGCAC-GTGCATC-GTC--TTTAAA--GGT---C--CAT--T---CTT-C-G----A-T--T--GACC--ATA-ACGTTTT--TTGTT-T----------------CTTG-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T--------GA----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TC-TTGATG-T-----CT----T-A-AG----AAAGA--GTT--A---T-A-----G---T---CAAA-A----T-TTC-------------ATT-TCA-G----C--A-C-GCGCA-TG----------CG-CGT---GTAG-CTG-A----A-TTC-T-GA--T-GGACATT---T----GAAA----T-------TGCC-GTA-A-----TT---TC--T------------T-----AA---AAA-----TG--AT--G
gi|116557 : CATGCGC-GTGCATT-CTC--TTTTGA--AAT---T--TAAA-C---ATT-T-G----A-A--G--GACC--ATA-GCGCTGT--T-CAT-T----------------TTCA-caaacaatatcaaatt
gi|116558 : ATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTTG--GCT---TCCTAAC-T---TCC-G-G----A-ATCA--GTC----TA-ACTTTTT--T-ATT-C----------------TTCA-ATGAA-----T-CATTTG---A-TA-T---TCAC-----AA----G--G------T-A-G----G---T----A--GA-AC-TTGAGACC-----CT----T-A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-A----T-T-C--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TC--ATT-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116559 : ATGCGC-GTGCATT-GTAA-TTTTGA--TGT---C--TAAA-T---GTTAT-T----A-T--A--CTCT--AT--GAGATCT--T-ACA-T----------------TTGA-TTGAA-----TAGTTTTG---A-AA-----T--------GT----A--T-AT-T-T-C-A----G---T----A--TG-TA-TTGGGACT-----CTTTGTT-A-AT----T--GG----T--G-----A--T--T---T---CAAA-A----T-CAT--T----------ATC-CC--G----C--A-C-ACGCT-CG----------CA-CGT---GC-G-CTG-A----A-ATC-T-GAT-T-GGATGATA-TT------------C-------GTAT-GTGCATATTCTT---TCTTTA--A-T-G-A
gi|116560 : TCT--T-CTT-C----------------TTCA-TTGAA-----ACCCTTTC---ATAA-TATAT--------GA----T--A-AG-T-T-G-A-------------------TA-TTAAGAC------CA---CT-A-AC----T--GA--TAT--C---C-A--TT-G---T---CAAC-A----T-CAC--A----------ATA-AT--G----C--A-C-GCGCA-TG----------TA-CATACAGT-G-TTG-C----A-TTT-T-AAT-T-GAATAATA-CT----TAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----GA---ATG-----TA--AT--AA-GT-TTATATTTA
gi|116561 : cgtttactaacttcggaatctgcctaacatttttTCAA--AGG---T---ATA-T---CTT-C-A----ATA--G--CTCA--ATA-----TTT--T--CT-T----------------TTCA-ATAAA-----TTTGATTA---A-AA-T---T--------TG----G--G-TTGT-T-A-A----A---T-----------T-TTAGGACT-----TT----T-C-AT----T--GA--TAT------C-A--T--GA--T---TGAA-A----T-CAC--ATACCCGCGATAGC-TA--A----C--A-C-GTGCGCTGAAATAGCTAACA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTT-T-GAT-T-GGATGATA-CT----TAAA----C-------GCCA-ATA-A----CT
gi|116562 : A--GGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--G--GAAT--ATA-GCGTTTT--T-GTT-T----------------TTGA-TCAAA-----TTCTTTTC---A-AA-T---T--------GG----G--G-CT-T-T-G-G----G---G----A--TGTTT-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ATT--G---C-GATG--G---T---TAAT-A----T-TACTGG----------CCA-TT----------A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---AT-G-CTA-T----A-TTC-T-GAT-G-GGATGATT-TT----GAAATCACC-------ATAT-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-TGGTGCAA---ACAT----GA--AG--AA-AT-TTATACT
gi|116563 : A--AGT---T--TAAT-T---TTT-T-G----A-A--G--GACC--ATA-GCGCTTT--T-TTT-TTTTCTTTTTTTTTTTTTTTA-TCAAA-----TTCGTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C-CT-C-T-G-A----G---TACACA--TG-TC-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ACT--GTTTT-A--G--G---T---TAAA-A----T-
gi|116564 : T---T--AATA-T---TTT-C-G----A-A--G--GCCT--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCAAA-----TTCATTAG---A-AG-T---T--------TA----A--G-AT-T-T-C-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTATT-----TT---CT-A-AG----T--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTCCA-TG----------CA-CGT---GT-G-C-G-T----ACTTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AA---------------------A-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--GA-AT-TCATTTTTAca
gi|116565 : TT--T-TTT-T----------------CTCT-TCAGA-----TTCTTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C--T-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ATT--G---CTAT-G--G---T---TAAA-A----T-TAC--
gi|116566 : TT--T-ATT-T----------------TTT--TCAAA-----TTATTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C--T-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ACT--G---CTAT-G--G---T---TAAA-A----T-TACT-G----------ACC-AT-------C--A-C-ACGCA-TA----------CA-CAT---GC-G-GTA------A-TTTCC-GAC-T-GAA
gi|116567 : A-----TTCATT-G---A-AA-T---C-------------------AT-T-T-G-A-------------------TA-TTAAGA-T-----CC---CT-A-AC----T--GA--TCT--G---C-AT-C--G---T---C-AA-G----T-CCC--A----------A---TT--G----CAAA-C-GTCCA-TG----------CA-AGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-AAT-T-AGATACTA-TTTTCAAAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--
gi|116568 : tgttatcagatcagatTCA-TCAAA-----TTCTTTCG---A-AA-T---T--------AG----A--G-AT-T-T-G-A----A---TAT--G--TG-TA-TAGAAACT-----CT---TT-A-AC----C--GA--TCA--G---C-A--A--A---T---CAGA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTG
gi|116569 : ---T--------GG----G--G-A--------A----G---T----AGATG-TT-TGAAGACC-----CT----T-A-AC----T--GA--CCT--G---C-A--GTTG---T---CCAA-A----TATTC--G----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GTGG-CTT-CG---A-TTT-T-AAT-T-GGATAAT--CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTTCC-TC--TATTA-TGG-AA-TC----GA---CGAC----AA--AT--G---T-TCACATTtgcttaattttg
gi|116570 : -A-AC----T--GAA-CCT--G---C-A--TC-G---T----AAA-A----T-TTC--GC---------ATTATT--G----CG-A-C-GTGCAGTG----------CA-CGT---GTTG-CTTTC----A-TTT-TTGAT-T-G--TAA-A-CTG---AAAA----C-------GTCT-GTT-A----ATT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GAC--GGA-----CA--AT--GT-ATATCACATTTA
gi|116571 : gatattgagcgcctttaaC-TTGAGACC-----CT------G-AA----C--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CACCGT----T-G-CTG-C----ATTTT-T-GAT-T-GAATAATA-C-----AAAA----T-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AATT-----AA---AGA-----TA--ATTGAA-AC-TGATATTCA
gi|116572 : -TTGAGACC-----CC---TA-A-AT----T--GA--TCT--G---C-A--TC-A---T---CAAA-A----T-TTC--G----------ATT-TT--A----C--A-C-ATGCA-TG----------CA-TGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-AT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-T-AA-T----------AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116573 : T-----CC---CT-A-AC----G--GA--TCT--G---C-A--TC-G---T---TAAA-A----T-TAT--T----------ATT-TT--G----C--C-C-GTGCA-TG----------TG-CGT---GC-A-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T------ATG-CT----AAAA----C-------ACCT-GTA-A----CTT---CA--TA--A-T-G-AA-T-----AC---AGA-----GA--AT--AA-AA-TCATATTTA
gi|116574 : ttgtaaTGAGACC-----CT---G--A-AT----T--GA--TC---G---T-A--TCAG---T---CAAG-A----------------------AAT-TT--G----A--A-C-ATT---TG----------CA-CGTT--GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAAT---C-------G-CT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AATT-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116575 : TGAGACT-----C----CT-A-AC----G--GA--TCC--G---C-A--TT-G---T---CAAA-A----T-AAC--C----------CTT-TT--G----C--A-T-GCGCA-TG------------------------------------TT-T-GA-------------------AGAA------------GTTT-GTA-A----C-T---TC--TG--A-T-A-AA-T-----AA---AGG-----GA--AT--GA-GT-ACATATTCA
gi|116576 : ---T---TAAA-A----T-TACT-G----------ACC-TT-------C--A-C-GTGCA-TA----------CA-TGT---GT-G-CTG-A----A-TCC-T-GAT-T-GGATGGTT-TT----AAAA----T-------CACC-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-ATAA-T-----AT---AGA-----
gi|116577 : aa--G---T---TGAA-A----T-TAC--T----------AGC-TA--T----C--A-C-ATGTA-TG----------CA-CAT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGACTATT-TT----AAAAT---C-------ACCA-ATA-A----TTT---TC--TT--A-T-G-TA-T-----GA---
gi|116578 : AAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-CCGT-CG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-ATT-T-TAT-T-GGATAATA-C-----AAAAGTC-C-------G-CC-GTA-A----CTT---TT--T---A-T-A-AA-T----------AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATCT
gi|116579 : -TG----------CC-CGT---GT-G-CTT-A----A-TTT-T-GAT-T-GAATAATAGTT----AAAA----CTAATACAGTTT-CTT-G-----TT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----
gi|116580 : aaattcactg-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-T----A-TTT-T-AAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----TTT---TC--TA--A-T-G-CA-T-----AA---AGG-----GA--AT--GA-CT-CCATATTTA
gi|116581 : -TG----------CA-CGT---GT-G-CTG----------------------ATAATA-CT----CTAA----C-------AACT-GTA-A----CTTCGATC--TA--C-T-G-AA-T-----AA---A-A-----AA--AT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116582 : T-G-CTG-T----A-TTT-T-GAT-T-GGATATTA-CA----AAAA----C-------ATAT-GTA-A----CTT---TC--TT--A-T-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116583 : ATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---CC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--AA-AT-TCATATTTA
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Reference ( family-375 ) : CATGCGC-GTGCATT-GNC--TTTCGA--AGT---T--TANA-T---TTT-T-G----A-A--G--GNCN--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCGAA-----TTCNTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGANACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--N--G---T---CAAA-A----T-TNC--G----------ANT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----NA--AT--GA-AT-TCATATTTA
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gi|116570 : -A-AC----T--GAA-CCT--G---C-A--TC-G---T----AAA-A----T-TTC--GC---------ATTATT--G----CG-A-C-GTGCAGTG----------CA-CGT---GTTG-CTTTC----A-TTT-TTGAT-T-G--TAA-A-CTG---AAAA----C-------GTCT-GTT-A----ATT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GAC--GGA-----CA--AT--GT-ATATCACATTTA
gi|116571 : gatattgagcgcctttaaC-TTGAGACC-----CT------G-AA----C--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CACCGT----T-G-CTG-C----ATTTT-T-GAT-T-GAATAATA-C-----AAAA----T-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AATT-----AA---AGA-----TA--ATTGAA-AC-TGATATTCA
gi|116572 : -TTGAGACC-----CC---TA-A-AT----T--GA--TCT--G---C-A--TC-A---T---CAAA-A----T-TTC--G----------ATT-TT--A----C--A-C-ATGCA-TG----------CA-TGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-AT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-T-AA-T----------AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116573 : T-----CC---CT-A-AC----G--GA--TCT--G---C-A--TC-G---T---TAAA-A----T-TAT--T----------ATT-TT--G----C--C-C-GTGCA-TG----------TG-CGT---GC-A-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T------ATG-CT----AAAA----C-------ACCT-GTA-A----CTT---CA--TA--A-T-G-AA-T-----AC---AGA-----GA--AT--AA-AA-TCATATTTA
gi|116574 : ttgtaaTGAGACC-----CT---G--A-AT----T--GA--TC---G---T-A--TCAG---T---CAAG-A----------------------AAT-TT--G----A--A-C-ATT---TG----------CA-CGTT--GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAAT---C-------G-CT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AATT-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116575 : TGAGACT-----C----CT-A-AC----G--GA--TCC--G---C-A--TT-G---T---CAAA-A----T-AAC--C----------CTT-TT--G----C--A-T-GCGCA-TG------------------------------------TT-T-GA-------------------AGAA------------GTTT-GTA-A----C-T---TC--TG--A-T-A-AA-T-----AA---AGG-----GA--AT--GA-GT-ACATATTCA
gi|116576 : ---T---TAAA-A----T-TACT-G----------ACC-TT-------C--A-C-GTGCA-TA----------CA-TGT---GT-G-CTG-A----A-TCC-T-GAT-T-GGATGGTT-TT----AAAA----T-------CACC-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-ATAA-T-----AT---AGA-----
gi|116577 : aa--G---T---TGAA-A----T-TAC--T----------AGC-TA--T----C--A-C-ATGTA-TG----------CA-CAT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGACTATT-TT----AAAAT---C-------ACCA-ATA-A----TTT---TC--TT--A-T-G-TA-T-----GA---
gi|116578 : AAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-CCGT-CG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-ATT-T-TAT-T-GGATAATA-C-----AAAAGTC-C-------G-CC-GTA-A----CTT---TT--T---A-T-A-AA-T----------AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATCT
gi|116579 : -TG----------CC-CGT---GT-G-CTT-A----A-TTT-T-GAT-T-GAATAATAGTT----AAAA----CTAATACAGTTT-CTT-G-----TT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----
gi|116580 : aaattcactg-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-T----A-TTT-T-AAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----TTT---TC--TA--A-T-G-CA-T-----AA---AGG-----GA--AT--GA-CT-CCATATTTA
gi|116581 : -TG----------CA-CGT---GT-G-CTG----------------------ATAATA-CT----CTAA----C-------AACT-GTA-A----CTTCGATC--TA--C-T-G-AA-T-----AA---A-A-----AA--AT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116582 : T-G-CTG-T----A-TTT-T-GAT-T-GGATATTA-CA----AAAA----C-------ATAT-GTA-A----CTT---TC--TT--A-T-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116583 : ATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---CC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--AA-AT-TCATATTTA
gi|116584 : AATA-CT----AAAA----T-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-C-----GA---AGA-----CA--AT--GT-AT-TCCTACTTA
blockSeqs : T C GGAA C GA ACA GGTGC A CAA TC GAAT T CT AA C CCA C C AT TG C TTTCTTTTTTTTTTTT A A TTTTT T GAA T G ATA TATATGGAGAGTAGA A G A G CATA GAT ACACATG T A GTGGG TTGAATGTTAC GG CTG TTTT ATG GCA TCT AAAT G A ATACCCGCGAT A A TG CCAT AA T C C AAATAGCTAA ACA A CCTTA C C T A G AG TTCA CTAATACA T G C TATT CGA TT ATT T G T T GGTGC TGC TACCGT TT TG C A
blockSeqs : . . ACC C . . GGTGC . CAA TC GAAT . TC . T AC . T . G . C . A . G . . . . TATATGGAGAGTAGA A G . . . . ATGTG . A A TTGTTAATT A T TT GTT A . . G T TCA A . A . A . . G . T G CG T . . . . G G TCACC T . . . CC . A . . . T C C GC . A . .
blockSeqs : . . TCA C . . CCTAA . . AT C . TC . T A . T . A . . . A . G . . . . CACACAGGA G G . . . . AGATG . A . AAATAGT . A CT TCA A . . A T TGG A . A . G . . . . . T TC . . . . . A . GTCC T . . . . . A . . . . . . TG . . . .
blockSeqs : . . TAA T . . CCTA . . T . . TC . C A . A . A . . . A . T . . . . CACAAGG . . . . . . ATTA . A . TAAGAAA . A CT TC A . . . A TG T . . . . . . . . . . C . . . . . A . TC T . . . . . A . . . . . . CA . . . .
blockSeqs : . . AC C . . TAC . . T . . . . C A . C . A . . . A . T . . . . CACAAGG . . . . . . ATGT . A . CTAACC . T C TC A . . . A TG A . . . . . . . . . . C . . . . . G . TA T . . . . . A . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . GC C . . TAG . . T . . . . A A . C . G . . . A . A . . . . TGTATA . . . . . . GTG . T . CTAACT . T C TC . . . . A GC C . . . . . . . . . . C . . . . . G . TC T . . . . . A . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . AC A . . TAG . . T . . . . T A . C . G . . . G . G . . . . GGGTGA . . . . . . GTG . G . CTAACT . T C TT . . . . T TG T . . . . . . . . . . G . . . . . T . TC T . . . . . A . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . TC C . . TAA . . T . . . . C C . C . A . . . A . T . . . . GGAGA . . . . . . GTT . A . CTAACC . T C TT . . . . T A T . . . . . . . . . . A . . . . . A . C G . . . . . A . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TC T . . TAC . . T . . . . A C . C . T . . . A . T . . . . AGGAA . . . . . . GTT . T . CTAACC . A C TG . . . . A G G . . . . . . . . . . A . . . . . A . C T . . . . . T . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . TC C . . CAC . . G . . . . A G . C . G . . . A . T . . . . GGGGA . . . . . . AGA . T . CTAACC . T C TG . . . . A G T . . . . . . . . . . C . . . . . T . C C . . . . . A . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TC G . . CAA . . T . . . . A C . C . G . . . G . A . . . . TGGGA . . . . . . GTG . T . TTAATA . T C TC . . . . C A T . . . . . . . . . . A . . . . . T . C T . . . . . A . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TC T . . CCA . . T . . . . A C . T . G . . . A . T . . . . GAGGC . . . . . . GTC . T . ATAGTT . T T TC . . . . A A T . . . . . . . . . . A . . . . . T . C G . . . . . T . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . AA T . . TAA . . T . . . . A C . T . G . . . G . T . . . . GGGGT . . . . . . TTG . T . GTAATT . T T TC . . . . G G T . . . . . . . . . . A . . . . . A . T C . . . . . C . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TC T . . TAA . . T . . . . T C . T . G . . . G . T . . . . GAACA . . . . . . ACA . A . CTAACT . T C TC . . . . A T A . . . . . . . . . . A . . . . . A . C T . . . . . A . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TC T . . CCA . . T . . . . A A . C . A . . . A . A . . . . GGAGA . . . . . . GTG . T . CTAAGT . G A TT . . . . C C T . . . . . . . . . . A . . . . . A . T T . . . . . A . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . CA C . . TAA . . A . . . . C C . T . G . . . G . T . . . . GGGGA . . . . . . AGA . G . CTAACT . G T A . . . . T C T . . . . . . . . . . C . . . . . A . T C . . . . . T . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . AC T . . TCG . . G . . . . T C . T . A . . . A . A . . . . GAATA . . . . . . ACA . G . TTAACC . T C A . . . . T C T . . . . . . . . . . A . . . . . A . C T . . . . . A . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . CA A . . CAT . . G . . . . G T . T . G . . . A . T . . . . GTATA . . . . . . AGA . T . TAAATT . G T A . . . . T G A . . . . . . . . . . C . . . . . T . T T . . . . . A . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TC T . . TAA . . G . . . . T A . C . A . . . G . A . . . . GATAA . . . . . . GTA . G . CTAACG . T T T . . . . T A T . . . . . . . . . . C . . . . . A . C T . . . . . A . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TC T . . TAA . . C . . . . A T . T . C . . . G . A . . . . TGGGT . . . . . . ACA . G . CTAACG . T T A . . . . A G T . . . . . . . . . . A . . . . . A . C T . . . . . T . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . CA T . . TAA . . T . . . . A C . A . A . . . G . A . . . . GGGGC . . . . . . AGA . G . TTACA . T C G . . . . A G G . . . . . . . . . . C . . . . . A . C C . . . . . A . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . G C . . AAT . . G . . . . T T . T . A . . . G . T . . . . GGGCC . . . . . . ATG . G . TCACT . T C A . . . . A T C . . . . . . . . . . A . . . . . A . C T . . . . . A . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . CA . . C . . . . T . . C . C . . . A . C . . . . TAAGA . . . . . . GTG . T . TTATT . T C G . . . . A A T . . . . . . . . . . C . . . . . A . C C . . . . . T . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . CA . . T . . . . T . . C . G . . . A . G . . . . AGAGA . . . . . . GTG . T . GAATT . T C T . . . . T A C . . . . . . . . . . A . . . . . G . C T . . . . . G . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TA . . T . . . . A . . . . T . . . A . T . . . . GGGGA . . . . . . GTG . T . CTTAT . T C T . . . . A A T . . . . . . . . . . T . . . . . A . C A . . . . . T . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . AT . . C . . . . A . . . . G . . . A . G . . . . GGGG . . . . . . . . T . GAATT . T C T . . . . A A T . . . . . . . . . . T . . . . . T . T C . . . . . T . . . . . . C . .
blockSeqs : . CA . . . . . . . C . . . . T . . . A . A . . . . GATA . . . . . . . . T . TAATT . T C T . . . . C G T . . . . . . . . . . C . . . . . T . C T . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . A . . . A . T . . . . GTGA . . . . . . . . G . TCATT . A C T . . . . T G A . . . . . . . . . . C . . . . . A . C T . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . T . . . . GATA . . . . . . . . A . TAACT . T T G . . . . T G T . . . . . . . . . . C . . . . . A . T A . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . GGGC . . . . . . . . G . GAATT . T C A . . . . T T T . . . . . . . . . . C . . . . . A . C T . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . GGGC . . . . . . . . G . TTAC . G C A . . . . T C A . . . . . . . . . . C . . . . . A . C T . . . . . A . . .
blockSeqs : . A . . . G . TTAC . T T T . . . . T T T . . . . . . . . . . A . . . . . A . C T . . . . . A . .
blockSeqs : . G . TTAC . T C . . . . . A G C . . . . . . . . . . A . . . . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : G . TTAC . C . . . . . . A . G . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . GAAC . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TTA . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : CATGCGC-GTGCATT-GNC--TTTCGA--AGT---T--TANA-T---TTT-T-G----A-A--G--GNCN--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCGAA-----TTCNTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGANACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--N--G---T---CAAA-A----T-TNC--G----------ANT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----NA--AT--GA-AT-TCATATTTA
finalCons : CATGCGC-GTGCATT-GNC--TTTCGA--AGT---T--TANA-T---TTT-T-G----A-A--G--GNCN--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCGAA-----TTCNTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGANACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--N--G---T---CAAA-A----T-TNC--G----------ANT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----NA--AT--GA-AT-TCATATTTA
Alignments
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Reference ( family-375 ) : CATGCGC-GTGCATT-GNC--TTTCGA--AGT---T--TANA-T---TTT-T-G----A-A--G--GNCN--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCGAA-----TTCNTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGANACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--N--G---T---CAAA-A----T-TNC--G----------ANT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----NA--AT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116536 : CATGCGC-GTGCATT-AAC--TTTCGA--AGT---T--TACA-T---TTT-T-G----A-A--G--GCCA--ATA-GTGCTTT--T-GGT-T----------------TTCA-TCACA-----TTCTTTCG---A-AA-T---T--------GG----G--G-GT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TAC--A----------AAT-CT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATG-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116537 : CATGCGC-GTGCATT-AAC--TTTCGA--AGT---T--TACA-T---TTT-T-G----A-A--G--GCCA--ATA-GTGCTTT--T-GGT-T----------------T-CA-TCACA-----TTCTTTCG---A-AA-T---T--------GG----G--G--T-T-T-G-A----G--------G--TG-TC-TTGAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TAC--A----------AAT-CT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATG-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116538 : CATACAC-GTGCATT-GG-------GA--ATT---TGGTGCA-CCAATTT-T-GGAATA-A--G--TTCA--AC-----TTTT--T-ATTCT----------------TTCA-TTAAA-----ATCGTATG---A-GA-T---TTATATGGAGA----GTAG-ATAT-T-G-A----A---T-------------TCGAAACC-----C----CT-A-AC----T--GA--TCA--G---C-A--TC-G---T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-T-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-T-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAAAA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----AA---AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116539 : CATACAC-GTGCATT-GG-------GA--ATT---TGGTGCA-CCAATTT-T-GGAATA-A--G--TTCA--A----CTTTTT--T-ATT-C----------------TTCA-TTAAA-----ATCGTATG---A-GA-T---TTATATGGAGA----GTAG-ATAT-T-G-A----A---T-------------TCGAAACC-----C----CT-A-AC----T--GA--TCA--G---C-A--TC-G---T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-T-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-T-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAAAA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----AA---AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116540 : CATGCGC-GTGCATT-GGC--TTTCGA--AGT---T--TAGA-T---TTT-T-G----A-A--G--GCCA--ATA-GTGATTT--T-ATT-T----------------T-CA-TCAAA-----TTCTTTCG---A-AA-C---T--------GG----A--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TAC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-G----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATG-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----GA---AGA-----GA--AC--GA-AT-TCATATTTA
gi|116541 : CATGCGC-GTGTATA-GAC--TTTCGA--AGT---T--TAGA-T---TAT-T-G----A-A--G--ACCA--ATA-GCGCTTT--T-GTT-G----------------TTCA-TCAAA-----TTCTTTCA---A-AA-T---T--------AG----G--A-AT-T-T-T-A----G---T----G--TT-TC-TTGAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TAT--C---C-A--A--G---T---CAAA-A----A-TAC--A----------AAT-TT--G----C--A-C-GTTCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTC-A----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATG-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----A
gi|116542 : CATGCGC-GTGCATT-GTC--TTTTAA--ACT---T--TAAT-T---TTT-T-G----A-A--G--GACC--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCATTTG---C-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TT-TC-TTGATACT-----CT---TT---AC----A--GA--T-T--GT--T-T--T--G---T---TAGA-A----T-TACT-G----------ACC-AT-------C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GGT-T-GGATTATT-TT----AAAA----taaag
gi|116543 : CATGCAC-GTGCATT-GGGAATTTCGT--ACA---C--CA-A-T---TTT-G-G----A-A--GAAGTCC--A-----ACTTTATT-ATT-C----------------TTCA-TTGAA-----ATCGTGTG---A-TA-T---T--------TG----T--ATAT-G-T-GGA----G---T----A--GA-TA-TTGAGACC-----CT----T-C-AC----T--GA--TCT--G---C-A--TC-G---T---CAAA-A----T-TTC--G----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------TA-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AAAG----T-------GTCT-GCA-A----CTT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GA---AGATACCGTA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116544 : CATGCGCTGTGCATT-GACC-TTTCGA--AGT---C--TACA-C---TTT-T-GC---A-A--G--GCCAC-ATACGCGCTTT--G-TTT-T----------------TTCAATCATA-----TTCTTTCG---A-AAGT---T--------GG----GT-G-AT-T-T-G-A----AGATT----G--TG-TA---GAAACT-----CT---CT-A-AC----C--GA--TCA--G---C-A--A--G---T---CAAACA----C-TTCTCA----------ATT-TT--G----C--ATC-GTGCA-TG----------CA-CGT---TT----TG-CCTTAA-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-C-----AACA----C-------GTCTGGTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGAG----CA--AT--GACAT-TCATATTTA
gi|116545 : CATGCAC-ACACATT-GTC--TTTAAA--A--------CACAAT---TTT-T-G----A-T--G--GATG--ATA-GCACTTT--T-GTT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCTTTTG---C-AA-T---T--------TG----G--G-AT-T-T-G-A----G---T----G--TC-TC-TTGATACT-----CT---TT-A---------------------------------------CAAA-T----TGTAC------------------T--G-------A-C-CTGCA-TA----------CA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTA-T-AAA-T-GGATGATT-AT----AAAA----
gi|116546 : CATGCGC-GTGCATG-ATC--TTTCAA--AGT---T--CAAA-T---TTT-T-G----A-A--A--GACC--AGA-GCGC-TT--T-G-T-T----------------TTCA-TTAAA-----ATGTTTTG---A-AA-T---T--------GA----G--G-CT-T-T-G-A----G---T----T--TG-TC-TTGATTCT-----CT---TT---AT----T--GT--TAT--G-----------G---T---TGAA-A----T-TAG--T----------GGC-GT--A----C--A-T-CTGCA-TA----------CA-CCT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGATGATT-TT----AAAAT---C-------G-CC-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-T-----AATGCAAA-----CATTATA-AA-AT-TTATACT
gi|116547 : CATGCAC-GTGCATC-GTC--TTTTAA--AGG---T--CCAA-T---TCT-TCG----A-T--T--GACC--ATA-ACG-TTT--T-GTT-T----------------TT-G-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T---------G----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TC-TTCATGGT-----TC---TT-A-AT----A--GAGGTTT--A---T-A-----G---A---CAAA-A----T-TCC-------------ATT-TCA-G----C--A-C-GTGCA-TG----------CG-CGT---GT-GCCTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGACGAT--TT----GAAA----T-------TGCT-GTA-A----CTT---CT--TA--A-
gi|116548 : CATGCGC-GTGCATT-GTC--TTTCCA--AAT---T--TAAA-T---TTT-T-G----A-A--G--GACC--TTA-TCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TC-AATTTTTTTTTTTTT---A-AG-T---T---------G----T--G-AT-T-T-G-A----A---T----G--TG-TC-TTGGTTCTGTGGGCT---TTGA-ATGTTAC--AA--ATT--G---T-T--G--G---T---TAAA-A----T-TAC-----------------TT--GCCATC--A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---GT-G-CCG-A----A-TT
gi|116549 : CACGCGC-ATGCATT-GTCA-TTTGAA--AGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--G--GATC--ATA-AAGTTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCAAA-----TTCTTCTG---A-AA-T---T--------GG----G--G-TC-T-T-A-G----G---T----AT-TA-TC-TTGGT--TA----CT---AT-A-GT----T--AA--TT-------------------------AA-A----T-GGC--C----------GT-----------C--A-T-GTGCA-TA----------CA-CAT---AT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGATGAT
gi|116550 : CATGCGC-GTGC----GAA--TTTTG----GTACAC--TAAA-T---TCG---G----A-ACTA--GTC----TA-ACATTTT--C-ATT-C----------------TTCA-TTGA-------TATATTG---T-AA--------------GA----A--C-AT------------G---T----A--GA-TA-TTGAAACT------T---GT-A-AT----T--GA--TCT--A---C-A--TT-G---T---CAAA-A----T-CAC--C----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CC-CGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATGA-------------------------------TA-A----CTT---TC--TA--A-T-
gi|116551 : CATGCAC-GTGCATCCGTC--TTTTAA--AGG---T--CCAA-T---TCT-TCG----A-T--G--GAC---ATA-ACGTTTT--T--TT-T----------------CTTG-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T---------G----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TCTTTGATGGT-----CT---AA-ATAG----T--GG--TTT--A---A-T--A--G---T---CAAA-AAAATT-CCC--C----------ATT-TA--G----CA-A-C-GTGCA-TG----------CG-CGT---GT-G-CTG-A----A-ACT-T-CCTAT-GGACATTT-TT----GAAA----T--------TGC-GTA-A----CTT---TC--
gi|116552 : CATGCGC-GGGCATT-GTC--TTTTAA--ACG---T--TAAA-T---TTT-A-G----A-A--G--GCCA--ATA-GCGCTTT--T-GAT-T----------------GTCA-TCAAA-----TTCTTTTG---C-AA-T---C--------GG----A--G-AT-T-
gi|116553 : CATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTG----GC---C--TA-A-C---TTC-G-G----A-ATCA--GTC----TA-ACTTTTT--T-ATT-TC---------------TTCA-ATGAA-----ATCATTTG---A----T---TCAC-----AA----G--G----T-T---A----G---T----A--GA-AC-TTGAGATC-----CT---G--A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--G--A---TTCTCAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TTTGG----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-TGGGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---T
gi|116554 : CATGCGA-CT-CATT-GAC--TTTCGAGAAGT---T--TCGA-T---TTT-G-A----G-A--G--GGCCCAATA-GCG-TTT--T-GTT-T----------------TTTA-TCA--------TCTTTCGGAAA-AA-T---T--------GG----G--G-AT-T-T-G-ACATAG---G----G--TA------GA-ACT-----CT---CT-T-AT-------GA--TCCTGG---C-A--T--AGCAT---CAAA-A----TGTTC--A----------ATT-TT--G------------------G----------CA-CGT---GT-G-CT
gi|116555 : CATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTT----GT---TCCTA-A-C---TTC-G-G----A-ATCA--GTC----TA-AC-TTTT--T-ATT-T----------------TCAA-TTAAA-----T-CATTTG---A-TA-T---T--------CACACAG--G-AT-G-TAG-A----A---------------C-TTGAGACC-----CT---G--A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-T----T-TTC--G----------ATT-TT--G----T--A-C-GTGCG-TG-----------A-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T--GATAAT--CA----AAAA----TA------GTCT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AT-T-----TA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattttccaa
gi|116556 : CATGCAC-GTGCATC-GTC--TTTAAA--GGT---C--CAT--T---CTT-C-G----A-T--T--GACC--ATA-ACGTTTT--TTGTT-T----------------CTTG-TTGAA-----ATCATTTG---A-AA-T---T--------GA----A--T-AT-TGT-G-A----G---T----A--CA-TC-TTGATG-T-----CT----T-A-AG----AAAGA--GTT--A---T-A-----G---T---CAAA-A----T-TTC-------------ATT-TCA-G----C--A-C-GCGCA-TG----------CG-CGT---GTAG-CTG-A----A-TTC-T-GA--T-GGACATT---T----GAAA----T-------TGCC-GTA-A-----TT---TC--T------------T-----AA---AAA-----TG--AT--G
gi|116557 : CATGCGC-GTGCATT-CTC--TTTTGA--AAT---T--TAAA-C---ATT-T-G----A-A--G--GACC--ATA-GCGCTGT--T-CAT-T----------------TTCA-caaacaatatcaaatt
gi|116558 : ATGCAC-GTGCATT-GCA--TTTTTG--GCT---TCCTAAC-T---TCC-G-G----A-ATCA--GTC----TA-ACTTTTT--T-ATT-C----------------TTCA-ATGAA-----T-CATTTG---A-TA-T---TCAC-----AA----G--G------T-A-G----G---T----A--GA-AC-TTGAGACC-----CT----T-A-AT----T--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-A----T-T-C--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAT----C-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TC--ATT-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116559 : ATGCGC-GTGCATT-GTAA-TTTTGA--TGT---C--TAAA-T---GTTAT-T----A-T--A--CTCT--AT--GAGATCT--T-ACA-T----------------TTGA-TTGAA-----TAGTTTTG---A-AA-----T--------GT----A--T-AT-T-T-C-A----G---T----A--TG-TA-TTGGGACT-----CTTTGTT-A-AT----T--GG----T--G-----A--T--T---T---CAAA-A----T-CAT--T----------ATC-CC--G----C--A-C-ACGCT-CG----------CA-CGT---GC-G-CTG-A----A-ATC-T-GAT-T-GGATGATA-TT------------C-------GTAT-GTGCATATTCTT---TCTTTA--A-T-G-A
gi|116560 : TCT--T-CTT-C----------------TTCA-TTGAA-----ACCCTTTC---ATAA-TATAT--------GA----T--A-AG-T-T-G-A-------------------TA-TTAAGAC------CA---CT-A-AC----T--GA--TAT--C---C-A--TT-G---T---CAAC-A----T-CAC--A----------ATA-AT--G----C--A-C-GCGCA-TG----------TA-CATACAGT-G-TTG-C----A-TTT-T-AAT-T-GAATAATA-CT----TAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----GA---ATG-----TA--AT--AA-GT-TTATATTTA
gi|116561 : cgtttactaacttcggaatctgcctaacatttttTCAA--AGG---T---ATA-T---CTT-C-A----ATA--G--CTCA--ATA-----TTT--T--CT-T----------------TTCA-ATAAA-----TTTGATTA---A-AA-T---T--------TG----G--G-TTGT-T-A-A----A---T-----------T-TTAGGACT-----TT----T-C-AT----T--GA--TAT------C-A--T--GA--T---TGAA-A----T-CAC--ATACCCGCGATAGC-TA--A----C--A-C-GTGCGCTGAAATAGCTAACA-CGT---GT-G-CTG-A----A-TTT-T-GAT-T-GGATGATA-CT----TAAA----C-------GCCA-ATA-A----CT
gi|116562 : A--GGT---T--CA-A-T---TTT-T-G----A-A--G--GAAT--ATA-GCGTTTT--T-GTT-T----------------TTGA-TCAAA-----TTCTTTTC---A-AA-T---T--------GG----G--G-CT-T-T-G-G----G---G----A--TGTTT-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ATT--G---C-GATG--G---T---TAAT-A----T-TACTGG----------CCA-TT----------A-C-GTGCA-TA----------CA-CGT---AT-G-CTA-T----A-TTC-T-GAT-G-GGATGATT-TT----GAAATCACC-------ATAT-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-G-TA-TGGTGCAA---ACAT----GA--AG--AA-AT-TTATACT
gi|116563 : A--AGT---T--TAAT-T---TTT-T-G----A-A--G--GACC--ATA-GCGCTTT--T-TTT-TTTTCTTTTTTTTTTTTTTTA-TCAAA-----TTCGTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C-CT-C-T-G-A----G---TACACA--TG-TC-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ACT--GTTTT-A--G--G---T---TAAA-A----T-
gi|116564 : T---T--AATA-T---TTT-C-G----A-A--G--GCCT--ATA-GCGCTTT--T-GTT-T----------------TTCA-TCAAA-----TTCATTAG---A-AG-T---T--------TA----A--G-AT-T-T-C-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTATT-----TT---CT-A-AG----T--GA--TCT--G---C-A--A--G---T---CAAA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTCCA-TG----------CA-CGT---GT-G-C-G-T----ACTTT-T-GAT-T-GGATAATA-CT----AA---------------------A-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--GA-AT-TCATTTTTAca
gi|116565 : TT--T-TTT-T----------------CTCT-TCAGA-----TTCTTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C--T-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ATT--G---CTAT-G--G---T---TAAA-A----T-TAC--
gi|116566 : TT--T-ATT-T----------------TTT--TCAAA-----TTATTTTG---A-AA-T---T--------GG----G--C--T-T-T-G-A----G---T----G--TG-TC-TTGGTACT-----CT---TT-A-------C--AA--ACT--G---CTAT-G--G---T---TAAA-A----T-TACT-G----------ACC-AT-------C--A-C-ACGCA-TA----------CA-CAT---GC-G-GTA------A-TTTCC-GAC-T-GAA
gi|116567 : A-----TTCATT-G---A-AA-T---C-------------------AT-T-T-G-A-------------------TA-TTAAGA-T-----CC---CT-A-AC----T--GA--TCT--G---C-AT-C--G---T---C-AA-G----T-CCC--A----------A---TT--G----CAAA-C-GTCCA-TG----------CA-AGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-AAT-T-AGATACTA-TTTTCAAAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--
gi|116568 : tgttatcagatcagatTCA-TCAAA-----TTCTTTCG---A-AA-T---T--------AG----A--G-AT-T-T-G-A----A---TAT--G--TG-TA-TAGAAACT-----CT---TT-A-AC----C--GA--TCA--G---C-A--A--A---T---CAGA-A----T-TTC--A----------ATT-TT--G----C--A-C-GTG
gi|116569 : ---T--------GG----G--G-A--------A----G---T----AGATG-TT-TGAAGACC-----CT----T-A-AC----T--GA--CCT--G---C-A--GTTG---T---CCAA-A----TATTC--G----------ATT-TT--G----C--A-C-GTGCA-TG----------CA-CGT---GTGG-CTT-CG---A-TTT-T-AAT-T-GGATAAT--CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTTCC-TC--TATTA-TGG-AA-TC----GA---CGAC----AA--AT--G---T-TCACATTtgcttaattttg
gi|116570 : -A-AC----T--GAA-CCT--G---C-A--TC-G---T----AAA-A----T-TTC--GC---------ATTATT--G----CG-A-C-GTGCAGTG----------CA-CGT---GTTG-CTTTC----A-TTT-TTGAT-T-G--TAA-A-CTG---AAAA----C-------GTCT-GTT-A----ATT---TC--TA--A-G-G-AA-T-----GAC--GGA-----CA--AT--GT-ATATCACATTTA
gi|116571 : gatattgagcgcctttaaC-TTGAGACC-----CT------G-AA----C--GA--TTG--G---T-A--T--GA--T---CAAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-C-GTGCG-TG----------CACCGT----T-G-CTG-C----ATTTT-T-GAT-T-GAATAATA-C-----AAAA----T-------GCCT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AATT-----AA---AGA-----TA--ATTGAA-AC-TGATATTCA
gi|116572 : -TTGAGACC-----CC---TA-A-AT----T--GA--TCT--G---C-A--TC-A---T---CAAA-A----T-TTC--G----------ATT-TT--A----C--A-C-ATGCA-TG----------CA-TGT---GT-G-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-AT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-G-T-AA-T----------AGA-----CA--AT--GT-AT-TCATATTTA
gi|116573 : T-----CC---CT-A-AC----G--GA--TCT--G---C-A--TC-G---T---TAAA-A----T-TAT--T----------ATT-TT--G----C--C-C-GTGCA-TG----------TG-CGT---GC-A-CTT-C----A-TTT-T-GAT-T------ATG-CT----AAAA----C-------ACCT-GTA-A----CTT---CA--TA--A-T-G-AA-T-----AC---AGA-----GA--AT--AA-AA-TCATATTTA
gi|116574 : ttgtaaTGAGACC-----CT---G--A-AT----T--GA--TC---G---T-A--TCAG---T---CAAG-A----------------------AAT-TT--G----A--A-C-ATT---TG----------CA-CGTT--GT-G-CTG-C----A-TTT-T-GAT-T-GGATAATA-CA----AAAAT---C-------G-CT-GTA-A----CTT---TG--TT--A-T-A-AATT-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116575 : TGAGACT-----C----CT-A-AC----G--GA--TCC--G---C-A--TT-G---T---CAAA-A----T-AAC--C----------CTT-TT--G----C--A-T-GCGCA-TG------------------------------------TT-T-GA-------------------AGAA------------GTTT-GTA-A----C-T---TC--TG--A-T-A-AA-T-----AA---AGG-----GA--AT--GA-GT-ACATATTCA
gi|116576 : ---T---TAAA-A----T-TACT-G----------ACC-TT-------C--A-C-GTGCA-TA----------CA-TGT---GT-G-CTG-A----A-TCC-T-GAT-T-GGATGGTT-TT----AAAA----T-------CACC-ATA-A----TCC---TC--TT--A-T-ATAA-T-----AT---AGA-----
gi|116577 : aa--G---T---TGAA-A----T-TAC--T----------AGC-TA--T----C--A-C-ATGTA-TG----------CA-CAT---GT-G-CTG-A----A-TTC-T-GAT-T-GGACTATT-TT----AAAAT---C-------ACCA-ATA-A----TTT---TC--TT--A-T-G-TA-T-----GA---
gi|116578 : AAA-A----T-TTC--G----------AAT-TT--G----C--A-CCGT-CG-TG----------CA-CGT---GT-G-CTG-C----A-ATT-T-TAT-T-GGATAATA-C-----AAAAGTC-C-------G-CC-GTA-A----CTT---TT--T---A-T-A-AA-T----------AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATCT
gi|116579 : -TG----------CC-CGT---GT-G-CTT-A----A-TTT-T-GAT-T-GAATAATAGTT----AAAA----CTAATACAGTTT-CTT-G-----TT---TT--TA--A-T-G-AA-T-----
gi|116580 : aaattcactg-TG----------CA-CGT---GT-G-CTT-T----A-TTT-T-AAT-T-GGATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----TTT---TC--TA--A-T-G-CA-T-----AA---AGG-----GA--AT--GA-CT-CCATATTTA
gi|116581 : -TG----------CA-CGT---GT-G-CTG----------------------ATAATA-CT----CTAA----C-------AACT-GTA-A----CTTCGATC--TA--C-T-G-AA-T-----AA---A-A-----AA--AT--GA-AT-TCATATTTA
gi|116582 : T-G-CTG-T----A-TTT-T-GAT-T-GGATATTA-CA----AAAA----C-------ATAT-GTA-A----CTT---TC--TT--A-T-A-AA-T-----AA---AGA-----TA--AT--GA-AA-TGATATTCA
gi|116583 : ATAATA-CT----AAAA----C-------GTCT-GTA-A----CTT---CC--TA--A-T-G-AA-T-----AA---AGA-----GA--AT--AA-AT-TCATATTTA
gi|116584 : AATA-CT----AAAA----T-------GTCT-GTA-A----CTT---TC--TA--A-T-G-AA-C-----GA---AGA-----CA--AT--GT-AT-TCCTACTTA