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Reference ( gi|98801 ) : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA---AG-G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT---CACTACCC-CCT--T-GG-CACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GT-T---C---AA-AAA-AGAG-T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-G-------------A-AAC-TTCA---A-----C---AC--GC---AA-AAC----CAG--AC-----C-------T---TG-TA-----GT-C-----C-----GT---T-AACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AAG-A--TT-GCCAAAA
gi|98797 : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA---TG-G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT---AACAACCC-CCT----GG-CACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GT-T---C---GA-AAA-AGAG-T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGTCA--GG-G-------------A-AAC-TACATTTA-----C---AC--TC---AA-AAC----CAA--AC-----A-------T---TG-TA-----AT-C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AAT-A--TT-GCCAAAA
gi|98782 : tATGTCG--CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---GA---GG-G---TG-CC--C-CA-TGT--C-AAGGAT---CACAACCA-CCT--T-GG-CACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GT-T---C---GA-AAA-AGAG-T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-G-------------A-AAC-TTCA---A-----C---AT--TC---AA-AAC----CAA--AC-----A-------T---TG-CA-----GT-C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTG-GAATG-GCGTA-A-AAC-A--TT-
gi|98783 : tttATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA---TG-G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT---CACAACCC-CCT--T-GC-CAAG-CA-A--AAGATA-A---T---TTCCCTGAT-GT-T---C----A-AAA-AGGG-C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGTCA--GG-G-------------A-AAT-TTCA---A-----C---AC--TC---AA-AGC----CAA--AC-----A-------T---TA-CA-----GT-C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTA-AAATG-GC-TG-A-AAT-A--TA-GCTAAAA
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gi|98784 : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA---AG-A---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT---C-CAACCC-CCT--A-GG-CACA-CA-A--AAGATC-G---T---TT-CCTGATAGT-TC--C---GA-GAA-AGAG-T-----A-G-GCTC------A-C--TGAGGGGCCGTCA--GT-G---------------AAC-TTCA---A-----C---AC--TC---AA-AAC----CAG--AC-----A-------T---GGTTA-----GT-C-----C-----GT---T-AACCGCCAGTGAAAATG-GCTTG-A-AAC-A--TT-GCCAAAA
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Reference ( family-369 ) : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--GG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------GT-C-NG---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
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gi|98819 : caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgAGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTTCA--GG-GA-AAC-T-------T-A---A---TA-C--TC-AAAAATA--A---AT--A--T--------T-T-CT-------GG-T-AG---C---T----A------GCCGCC-TTG-AAA
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gi|98826 : TC------A-C--TGG-GAGC-GTCA--GA-AA-AAC-T-------TTA---AATCCC-T--TT-AAAACCG--T---TCGTA--T--------T-C-AA-------AT-A-CG---G---T----A------ACCGCT-TTA-AACTG-AC-TG-A-AATA--TT-ACCAAAA
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gi|98828 : --TAA-GGCCTTTCAT-AG-GA-ATC-T-------TCA---A---CA-T--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GCCC-----G---C---C----A------ACCACC-GTG-AAAT--GC-CA-A-AAT
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . T . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . T . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . G . TA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . T . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . A . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . A . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . A . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . T . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . CC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . T . AT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . A . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . T . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . A . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . G . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . G . AT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . T . GC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . A . GT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . A . GC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ***
originalCons : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--GG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
finalCons : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--GG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
Alignments
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consensus : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--GG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
Reference ( family-369 ) : ATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--GG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
gi|98782 : ATGTCG--CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---GA--GG---G---TG-CC--C-CA-TGT--C-AAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-T--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-GAATG-GCGTA-A-AACA--TT-
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gi|98793 : tttaaaATGCA---CATCGGA-T-AGCACGT--CA---AA--AG---G---TG-CC--C-TG-TGT--C-AAAGAT-CACAACTT-CCT----
gi|98794 : tttG-CC--C-CG-TGC--C-AAGGAT-CAGAACTC-CCT----T-GGCACG-CA-G--AAGATC-G---T---TTC
gi|98795 : tttatttccgacggatgGCC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--AG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AATATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----T-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCTTCA--GG-GA-AAC-T-------TTA---A---CA-C--TC-AAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
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gi|98797 : ttATGTC---CGTCGGA-T-GGGACGT--TA---AA--TG---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-AACAACCC-CCT------GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------ACATTTA---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------ATCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
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gi|98810 : GTCGGA-T-GTGACGA--TA---AA--GG---G---TG-GC--A-CG-TGT--C-AAGGAA-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TAA-AGACCGTCA--GG-AA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----C---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAA
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gi|98812 : CGT--TA---AA--GG---G---TG-CT--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAGCAC-TCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-GT--T---TTCCCTGAA-GTC---T---GAA-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--
gi|98813 : T--CA---AA--TA---G---TG-CC--C-CG-TGT--C-AAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AAGA--TT-GCCAAAA
gi|98814 : C--C-TG-TGT--C-AAGGAT-CACAACTT-TTT----T-GACATG-CA-A--ATAACT-G---T---TTCTTTGGT-TTT---C---G-A-CCA-A------G-GG--A-----A-G-GCTT------A-C--TGA-AAGTCGTCA--GG-AA-AAC-TAAAGTTATAA---A---CC-T--TG-AAAAGCAATA---AT--A--T--------T-T-----CA-------TTTA---------C---T----AATAGTTACTAAC-GTA-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
gi|98815 : -TGT--C-TAGGAT-CACAACCT-TCT----T-GTCACG-CA-A--AATATC-G---T---GTCCCTGAT-GTT---C---G-A-TAA-A------G-AG--C-----A-G-ACTC------T-C--TGA-TGGCCGTCA--GG-GA-AAA-T-------TCA---T---CA-T--TT-AAAACC------------------------------------------TA-----G---C---T----T------ACTGAT--TG-AAATG-GC-TG-A-ACTA--TT-GACAGAA
gi|98816 : AGGAT-AACAACCC-TCT----T-GGCACG-CA-A--AAGATC-G---T---TTCTTTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--TCTACTA-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
gi|98817 : T-CACAACCC-CCT----T-GGCGCG-CT-A--AAGCTC-G---T---TTCTTTAAT-ATT---T---A-A-AAA-A------G-AG--G-----A-G-GCTC------A-G--CGA-GGGCCGTTA--GG-GA-AAC-A-------TC
gi|98818 : -CA-A--AAAGTT-GACTT---TCCCCCGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-ATGCTC------A----TGA-GGGTCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---C---TA-C--TT-AAAACCA--A---
gi|98818 : --T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAATG-AC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAAgtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgttacagtcagctaaccgccgtaaaatgactgaaatattgccaaaa
gi|98819 : caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgAGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTTCA--GG-GA-AAC-T-------T-A---A---TA-C--TC-AAAAATA--A---AT--A--T--------T-T-----CT-------GGTA-----G---C---T----A------GCCGCC-TTG-AAA
gi|98820 : ATG-G---T---TTCCC-GAT-GTT---C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-A-GCTC------A-C--TGG-GAGCCATCA--GA-GA-TAT-T-------TCA---A---AA-C--TC-AATACCA--G---AC--A--TATTCTAGGT-A-----TA-------TTTA-----A---T---T----A------ACTGAC-GTT-AAGTG-GC-TC-A-A
gi|98821 : -G---T---TTCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-CCTC------A-C--CGA-ATGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------ACA---A---CG-C--TC-TAAATCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------ATTG-----G---C---T----A------ACCGCC---------------G-A-AATA--TT-GCCAAAA
gi|98822 : AT-ATT---T---G-A-AAG-ACCCGGTG-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGTCA--GAAGA-AACCT-------TCAT--A---CA-C--TC-AAA--CA--G---AC--AA-T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCTCC-GTG-AAATG-GC-TGAA-AATA--TTGGCCAAAA
gi|98823 : AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC-----------------------------------------------------A------ACCGCC-GTG-AAATG-GT-TG-A-AATA--TT-GCAAAAA
gi|98824 : AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TCAAG-A---CA-C--TC-AAAACCA--A---AC-----------------------------------------------------A------ACCGCC-GTG---ATG-GT-TG---AATA--TT-GCAAAAA
gi|98825 : A-A------G-AG--T-----T-G-GCTT------A-C--AGA-GGGCCGTCA--AG-G--AAT-T-------CCA---A---AA-C--TA-GATACCG--A---ACATA--T--------T-T-----CA-------TTTA-----AACTT---T----A------ACCATC-GTT-AAATA-GC-TG-A-AATA--TT-
gi|98826 : TC------A-C--TGG-GAGC-GTCA--GA-AA-AAC-T-------TTA---AATCCC-T--TT-AAAACCG-------------T--------TCG-----TA-------TTCAAATACG---G---T----A------ACCGCT-TTA-AACTG-AC-TG-A-AATA--TT-ACCAAAA
gi|98827 : --TGA-GGATCGTCA--GG-GA-AAC-T-------TAA---A---CA-C--AC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTAA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAATG-GC-TG-A-AATA--TT-GCCAAAA
gi|98828 : --TAA-GGCCTTTCAT-AG-GA-ATC-T-------TCA---A---CA-T--TC-AAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GCCC-----G---C---C----A------ACCACC-GTG-AAAT--GC-CA-A-AAT
gi|98829 : A-GGGCCGTTA--GG-GA-AAC-T-------TCA---A---CA-C--TCAAAAACCA--G---Aggcgtaaaa
gi|98830 : CCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AAGA--TT-GCCAAAA
gi|98831 : CCGCC-GTG-AAATG-GC-TG-A-AAGA--TT-GCTAAAA