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Reference ( gi|5859 ) : CTCTCTCT----C-TC-TCTC-T-C-TC----TC-T-C-TCTCT----CTC-T-CTC--TCTC-T----------------T-TCTCTC----TC------T-----C-TC-----------AC------GC---G-----A-----G----C---G----C-G--T--AC---T----TG--T----GGA----T-----------C--T--A----C-A-T--C-TA-AT-T--TA-CT--TTTG-T--CAGA---GCCAAT---TTGAT-AT---A-TC---T-TACA-ATATT-G--CGAAAATTATCGACAGCTTAAATTGCTTACAACAGAGTA
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|5858 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT--TCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C----C-TC-----------A--C-GC---G-----A-----G----C---G----C-G-T--AC---T----TG--T----GGA----T-----------C--T--A----C-A-T--C-TA-AT-T--TA-CT--TTTG-TCAGA---GCCAAT---TTGAT-A----A-TC---T-TACA-ATATT-G--CGAAAATTATCGACAGCTTAAATTGCTTACAACAGAGTA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|5874 : ctcttCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------A--A-AG---G-----A-----G----C---A----C-ATT--AC---T----CG--T----GTA----T-----------
gi|5875 : ctctctCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--T-TC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-CT-------------------------------------------------------C---T----TC--T----GGA----C-----------T--T--A----C-G-T--C-T--AC-C--TA--------G-ACAGA---GCCAA
gi|5876 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--T-TC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-CT-------------------------------------------------------C---T----TC--T----GGA----C-----------T--T--A----C-G-T--C-T--AC-C--TA--------G-ACAGA---GCCAA
gi|5877 : CTCTTCCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-CCT-CT-CTCTCTC-TCTT--CTTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-T----------------------G-----T-----G----C---G----C---T--A---------TG--T-----GA----T-----------C--T--
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gi|5879 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCCT--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TCTTC-----------A--T-TC---AAATGTA-----G----CA--G----T-G-TC-AC---TCAAGTG--T----TGA----------------C--T--A----CTA-T--A-TACAT-T--TA-CT--T
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gi|5882 : CTCT----C--C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC--------------C-TC---T-----C-----T----C---G----T-GTT--AC---A----TG--T----AAA----T-----------T--G--A----C-G-T--T-TACAT-T--T
gi|5883 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---AC-TG-----------A--C-CT---G-----A-----A----G---G----C-G-T--A
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|5868 : ctCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----TCAAC---AC-TCA----------A--C-AT---G-----A-----C----C---ACTGTC-A-T--ATATAT----TG--T----GGAATGTT-----------C--T--A----C-A-T--G-TA-A
gi|5869 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-CTT-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------T--C-GT---GCCTC-A-----A----T---A----T-G-T--AT---T----CG-------GAA----T-----------T--T--AAG--C-A-T--C-T
gi|5870 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC--C-----------A--T-GT---AT----AT----A----T---A----C-G-T--A---------TG--T----GGA----TA----------C--T--A----
gi|5871 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---CA-TTGA---------A--C-AT---G-----A-----G----C---G------G-TAGAC---T----TA--T------A----T--------------T--A----C-A-T--
gi|5872 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C----C-TT-----------A--G-GCT--G-----A-----T----C---A----T-G-T--AA---T----TG--
gi|5873 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-T-T-CTTC----T-C-T-CT-CTCTCTC--CTC--TCTC-TC----------------T-C-TC-C----T---C---TC-TC-----------T--C-TG---G-----A-----G--------------------AT---C----TA--T----AGA----T-----------C--T--A----T-A-T--CAGA-AT-T--TA-
gi|5874 : ctcttCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------A--A-AG---G-----A-----G----C---A----C-ATT--AC---T----CG--T----GTA----T-----------
gi|5875 : ctctctCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--T-TC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-CT-------------------------------------------------------C---T----TC--T----GGA----C-----------T--T--A----C-G-T--C-T--AC-C--TA--------G-ACAGA---GCCAA
gi|5876 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--T-TC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-CT-------------------------------------------------------C---T----TC--T----GGA----C-----------T--T--A----C-G-T--C-T--AC-C--TA--------G-ACAGA---GCCAA
gi|5877 : CTCTTCCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-CCT-CT-CTCTCTC-TCTT--CTTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-T----------------------G-----T-----G----C---G----C---T--A---------TG--T-----GA----T-----------C--T--
gi|5878 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------A--T-AC---T-----A-----T----C---G----C-A-T--Agtccaaacagaatcagtctgggcagaagcttataagtcttatcaaaactatc
gi|5879 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCCT--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TCTTC-----------A--T-TC---AAATGTA-----G----CA--G----T-G-TC-AC---TCAAGTG--T----TGA----------------C--T--A----CTA-T--A-TACAT-T--TA-CT--T
gi|5880 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-CTT-CT-CTGTCTCGTCTCGTTCTCGTC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------T--C--C---G-----T-----G----C---G----C------AC---C----TG--T----G
gi|5881 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T--T-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TCT---------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------T--C-GT---A-----A-----------------------T--GC---T----TG--T----TAA----A-----------C--T--G----C-A-T--cgtgtatgtgtctaacaatcttattgctatgcggtattaatgtttgaaagaatctt
gi|5882 : CTCT----C--C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC--------------C-TC---T-----C-----T----C---G----T-GTT--AC---A----TG--T----AAA----T-----------T--G--A----C-G-T--T-TACAT-T--T
gi|5883 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---AC-TG-----------A--C-CT---G-----A-----A----G---G----C-G-T--A
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gi|5887 : ctCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------T--C-TC---T-----C-----T----C---T----T-G-T--GT---T----CG--G----GGG----T-----------C--T--G----T-G-T--T-TA-CC-C--TA-CT--CTT
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gi|5889 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TC-----------T--C-TC---T-----------G----T---G----T-G-T--AT---A----TA--T----GGA----
gi|5890 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-T------------G--T-GT---G-----T-----G----T---G----T-G-T--GT---T----TG--T----
gi|5891 : CTCTCTCT----CT-C-TCT-C-TCC-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTCT---T---C---TC-TCCGCTCTTCTCAA--CGGC---G-----A-----G----C---GGGATCAG-T--AC---T----TGACT----GGA----T-----------
gi|5892 : CTCTCTAT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T--T-CTCTCTT-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTA----T---T---CC-TC-----------A--T-CT---G-----A-----A----C---G----C-G-C--AT---T----T
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gi|5897 : ctctctCTCTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-T-----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-CTTCTC----T---C---TC--C-----------A--C--C---G-----A-----G----C---G----
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gi|5905 : tCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-GCTTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---TC-TG-----------A--T-GT---G-----GAT---G----C---A----C-G-T--GC---G----TGT-T----GGA----
gi|5906 : CTCTCTCT----CT-CTTCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TCT---------------T-C-TCTC----T---C---TCTTC-----------T--C-GT---G-----T-----G----T---G----T-G-T--GC---G----TG--T----TAA----T-----------C--T--
gi|5907 : CTCTCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------G-C-TCTG----T-----------------------A--T-GT---G-----T-----G----T---G----T-G-T--GG---TG---TG--T----GCAG---T-----------C--T--A----T-A-TACT-TA-GT-A--TA-CT--T
gi|5908 : TCT----CT-C-TCT-C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-TCTC--TCTC-TC----------------T-C-TTTTATAAT---A---TC-TC-----------A---------------AT----G----T---G----T-G-T--AA---T----TG--TCGGGGGG----TGGGGGCAGAAAC--T--G----T-ATT--C-TG-AC-C--TA-CT--TTCG-TTTGA---CCCACT---GTAA--AT---G-AC---T-TTTAGATATT-ATTTGAAAAT
gi|5909 : -C-T-C-TC----T-C-T-CT-CTCTCTC-CCTC--TCTC-TC----------------T-C-TCTC----T---C---T--TC-----------A-----------------------------------T-G-T--AC---A----TG--T----A---------------------T--A----T-A-T--T-----T-T--TATCT--CCTA-TATGA---ACATAT---TTTAA-AA---A-TC---A-CACT-TTTTT-G--CGAAAATTAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5893 ): CTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCCTCTCCTTCCTCCCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTGTCACCCAGACATATTATATTGCTCATATTTGCTGTATTATCAGTAATTTTAAAAAAGATAAATACAATTTTACCTAAATATCG
Unaligned ( gi|5900 ): CTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTTCTCCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATGTATACTGTATATAATTTGCTGTTATGGCAAGACAAGAAATATC