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gi|73615                      :              aaaTTT-AT-A-TCTT----AA-AT-----------C----------AAT---T--T--CA-AT-AAA-G-GAGAA---G-AG-------TTT-GACAT----GA-G-----AGAGAT-ACTCC
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gi|73612                      :            aaaaacCT-AA-A-TCTC----AA-GA----------------------AAT-A-TAGC--CA-GT-AAA-A-GAGAA---ATAGA------TTT-G-CAT----GA-------GGAGAT-
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|73616 ): TCTAAATCTTAAGTCAAAAGTCAGCAAAAGAGAAAAGCTTTACATGAAGGAGGTATCC






Alignments
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Reference ( family-364 )      : AAAAA-GTCT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AN-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
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gi|73585                      : AAAAA-TTCT-ATA-T--------CTC-------AA-GTC----------A-AA-A-------G----CCA-AT-AAA-G-GAGAA------A-AACTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-TCT
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gi|73593                      : AGAAA-GGTT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AC-A-------T----CCA-GT-AAA-G-CAGAA------G-AGCGT------TGCAT----AA-G-----
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blockSeqs                     :                 .          TTGA     A   .            A  CCCAAGC ATAT                  .      T     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  TT      T                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  A       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            C  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            C  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
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blockSeqs                     :                 .          .        .   .            A  .       .                     .      .     .          .       .    
blockSeqs                     :                 .          .        .   .            T  .       .                     .      .     .          .       .    
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Reference ( family-364 )      : AAAAA-GTCT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AN-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73574                      : AAAGATGTCT-AAA-C--------CTC-------AA-GCC----------A-AT-A-------T----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------G-AGATT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73575                      : AAAAA-GTCT-AAT-C--------TTC-------AA-ACC----------A-AA-A-------G----CCA-AT-AAA-G-GAGAA------G-AACTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73576                      : AAAAA-GCCT-AAA-C--------ATC-------AA-GCC----------A-AT-A-------G----CTG-AT-AGA-G-GAGAA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ATTCC
gi|73577                      : AAAAA-GTCT-AAA-T--------CTC-------AA-GCCAAAAGCCAGNA-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------G-AG
gi|73578                      : AAAAA-GTCC-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------A-AGTGT------TGCGT----GA-G-----GGAGAT-ATTC
gi|73579                      : AGAAA-GTCT-AAA-T--------CTCTTGA---AA-GCC----------A-AT-A-------G----CCA-AT-AAA-G-GAGAT------T-AACTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACGCC
gi|73580                      : AAAAA-GTCT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-AT-AAA-G-GAGAA------C-AGCTT------TGCAT----TA-G-----GGAGGT-
gi|73581                      : AAAAA-GTCT-AAA-T--------CTT-------AA-GCC----------A-CT-G-------G----T-A-GT-AAA-A-GAGAA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-AC
gi|73582                      : AAAAA-GTCT-AAAAC--------CTC-------AA-GCC----------A-TT-A-------G----CCA-GT--AA-G-GA-AA------G-AACTT------T-TAT----GA-
gi|73583                      : AAAAA-GTGT-AAA-T--------CTC-------AA-GTC----------A-AA-A-------G----CCA-TT-AAA-G-GGTTA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-GCTCC
gi|73584                      : AAAAA-GTAA-AAA-G--------CTG-------AA-GTC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-A-GAGAA------A-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73585                      : AAAAA-TTCT-ATA-T--------CTC-------AA-GTC----------A-AA-A-------G----CCA-AT-AAA-G-GAGAA------A-AACTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-TCT
gi|73586                      : AAAAA-GTCT-CAA-C--------CCC-------AA-GCC----------A-ATTATT-----G----TCA-GT-AAA-T-GAGAA------G-AGTTT------TGCAC----GA-G-----GGAGCT-ACTCC
gi|73587                      : AAAAA-ATAT-CAA-T--------CTT-------AA-GTC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AA--G-GAGAA------A-AGCTT------TGAAT----GA-G-----GGAAAT-ACTCC
gi|73588                      : AAAAT-GTCT-AAA-T--------C-------------------------A-AA-G-------A----CCA-GT-AAA-G-GAATA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GTAGAT-ACT
gi|73589                      : AAAAT-GTCT-AAA-T--------C---------------------------AA-A-------G----ACA-GT-AAA-G-GAATA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GTAGAT-ACT
gi|73590                      : AAAAT-GTCT-AAA-T--------C---------------------------AA-A-------G----ACA-GC-AAA-G-GAATA------G-AGCTT------TCCAT----GA-G-----ATAGAT-ACTCC
gi|73591                      : AAAAC-GTCT-AAA-T--------CAC-------AA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA----------CTTTACATGTACAT----GA-A-----GGAGAT-ACTCC
gi|73592                      : AAAAA-GTCT-AAA-T--------CGC-------AA-GCC----------A-TT-A-------A----ACA-GT-AA-----AGAA------G-AACTT------TGCAT----CA-G-----GAGAAT-ACTCC
gi|73593                      : AGAAA-GGTT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AC-A-------T----CCA-GT-AAA-G-CAGAA------G-AGCGT------TGCAT----AA-G-----
gi|73594                      : AAAAA-GTCT-AAA-G--------CTC-------AA-GCT----------A-AT-ACCCGAGCGATATCCA-GT-AAA-A-TAGAA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GAAAAT-A
gi|73595                      : AAAAA-GTCT-AAG----------CTC-------AA-GCT----------A-AT-ACCCAAGCGATATCCA-GT-AAATA-GAGA-------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GAAAA
gi|73596                      : AAACA-GTTT-AAA-C--------TTC-------AA-GCC----------A-AT-A-------G----ACT-GC-ACA-G-AAAAA------G-AGATT------TGCAT----G--G-----GAAGAT-ACTCC
gi|73597                      : AAAAA-GCCT-AAA-T--------CTC-------AA-G-C----------A-AA-A-------GT---CTA-GG-AAG-G-GAGAA------A-AACTT------TGTAT----GA-G-----GGGGGT-ATT
gi|73598                      : AAAAT-GTTT-TAA-T--------TTC-------GA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------G-AGCTT------TG
gi|73599                      : AAAAA-GTCT-AG--T--------CTC-------AA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-A-AACAA------C-ATCC---------CAT----GA-G-----AGAGAT-ACGCC
gi|73600                      : AAAAA-GTAT-CAA-T--------ATA-------AA-ATC----------A-AA-A-------A----CCA-GT-ACA-G-GAGAA------G-CAATT------TGTAT----GA-G-----GGATGT-ACTCC
gi|73601                      :  AAAA-GTGT-ACA-C--------CTC-------AA-GCC----------A-AT-A-------G----CCA-GT-ATA-G-GAGAA------G-AGCTT------TACAT----GA-G-----GGAGATAACTCC
gi|73602                      :  AAAA-GTCA-AAA-T--------CGC-------AA-ACC----------A-AC-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------G-AGCTT------TACAT----CA-G-----GGAGAC-ATTCC
gi|73603                      :  AAAA-GTGT-AAA-C--------GTC-------AA-GCT----------A-AT-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGAAGAGGTTG-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ATTC
gi|73604                      :  AAAA-ACCT-AAG-T--------ATC-------AA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAA-A-GAGAA------G-AGTTT------TGCATTCAGGA-G-----GGATAT-ACTCC
gi|73605                      :  AAAA-GACT-AAA-T--------CTC-------AA-ACC----------A-AA-C-------A----CCA-GT-AAT-G-GAGAA------G-AGCTT------TGCAA----GC-A-----GGAGAT-
gi|73606                      :  AGAA-GACT-AAA-T--------CTC-------AAAGAA----------A-AT-A-------G----CCAAGT-AAA-AAGAGAA------A-GATTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-
gi|73607                      :  AAAG-GTCT-AAA-TGTATATAACTCTTTTTAAAA-GTC----------A-AA-AA------G----CCA-GTTGAA-G-GAGAA------GCAGCTT-------GCAC----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73608                      :   AAA-GTCT-AAA-T--------CTT-------AA-GCC----------A-GA-A-------G----CCA-AT-AAA-C-GAGAA------G-ATTTT------TGCAT----GA-T-----GGAGAT-ACTCC
gi|73609                      :   AAA-GTCT-AAA-C--------CTC-------AA-GCC----------A-AT-A-------G----CTA-GT-AAA-G-AGGAA------G-TTCTT------TGCAT----CA-T-----GTAGAT-ACCCC
gi|73610                      :   AAA-GTCTTAAA-C--------CTC-------AA-GCC----------A-AT-A-------G----CTA-GT-AAA-G-AGGAA------G-TTCTT------TGCAT----CA-T-----GTAGAT-ACCCC
gi|73611                      :   AAA-GT-T-AAA-T--------CTC-------A--GTC----------A-AT-A-------G----CC--GT-AAA-G--AGAA------A----TT------TGCTT----GA-G-----GGAGA
gi|73612                      :    AA-G-CT-AAA-T--------CTC-------AA-GAA----------ATAT-A-------G----CCA-GT-AAA-A-GAGAA------ATAGATT------TGCAT----GA-------GGAGAT-
gi|73613                      :     A-GTCT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-AA-A-------G----CCA-GT-AAC-G-GAGAA------G-AGCTT------TGCAT----TA-A-----GGAGAA-ATTCC
gi|73614                      :     A-GTCT-AAA-T--------CTC-------AA-GCC----------A-GT-A-------G----TCA-GA-ATA-G-GAGAA------A-AACTT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-GC
gi|73615                      :     A-ATTT-ATA-T--------CTT-------AA-ATC----------A-AT---------T----TCA-AT-AAA-G-GAGAA------G-AGTTT------GACAT----GA-G-----AGAGAT-ACTCC
gi|73616                      :        TCT-AAA-T--------CTT-------AA-GTC----------A-AA-A-------G----TCA-GC-AAA-A-GAGAA------A-AGCTT------TACAT----GA-A-----GGAGGT-A-TCC
gi|73617                      :           -AAA-T--------CTT-------CA-GCC----------A-CT-A-------G----CCA-GT-AAA-G-GAGGA------T-AGCTT------TGTAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73618                      :           -AAG-T--------CTC-------AA-ACC----------A-AA-A-------G----CTA-GA-AAA-G-GAGAA------T-ACCTT------TGCAT----GATGGATCCGGAGAT-ACTCC
gi|73619                      :             AA-C--------CTC-------AAAGCC----------A-AT-A-------T----CCA-GT-AAA-G-AAGAA------G-AGATT------TGCAT----GA-G-----GGAGAT-ACTCC
gi|73620                      :              A-T--------ATT-------AA-GCC----------A-AA-A-------A----CCA-GT-AAA-G-GAGAA------T-ACCTT------TGCAT----GC-G-----GGAGA
gi|73621                      :                                                                 ----CCA-GC-AA--G-AAGAC------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----AGAGAT-ACTCC
gi|73622                      :                                                      ata-------G----CCA-GT-AAA-A-GAGAA------G-AAGTT------TGCAT----GA-G-----AGAGAT-ACGCC
gi|73623                      :                                                                      CA-GT-AAA-G-GAGAA------G-GTCTT------TGCAT----GA-G-----GGACAT-ACTCC
gi|73624                      :                                                                      CA-GT-AAA-G-TAGAA------G-AGCTT------TGCAT----GA-G-----GGAGGT-AGTCC
gi|73625                      :                                                                       A-GT-AAA-G-GAGAT------G-AGCCT------TGCAT----TA-G-----GGAGAT-ACTC