lowQualScore : 11 111 11 1111111111111111111 111 11
lowQualScore : 1 1 44 66 11 2 1 11 111 33 2 1 1 1 2 000 1 00 0 0 0 0 222 0 11 222 11 3333 222222 0 8888888888888888888 1 3 222 0 11 0 11 9999999999999 1 33 11 0 2 0 1 0 11 11 111 8888 222 333333333 0 11 0 66666666666 0 0 222 3 2222222 00 333333 22 0 88888888 555 777 0
lowQualScore : . . .. .. .. . . .. ... .. . . . . . ... . .. . . . . ... . .. ... .. .... ...... . ................... . . ... . .. . .. ............. . .. .. . . . . . .. .. ... .... ... ......... . .. . ........... . . ... . ....... .. ...... .. . ........ ... ... .
lowQualScore : 1 1 99 22 44 0 0 44 888 44 0 0 0 0 0 000 9 99 9 9 9 9 555 9 22 555 22 1111 666666 9 5555555555555555555 9 3 222 8 99 8 99 3333333333333 6 00 99 8 4 8 6 9 22 11 555 4444 333 333333333 9 22 9 77777777777 9 9 444 4 8888888 00 666666 00 9 66666666 888 444 9
consensus : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-N-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--N---A--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGGT
Reference ( gi|85747 ) : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-C-A-TTTTGA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC-----T--T---A--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-G--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-TAG-G-AAAATC-ACTGGT
gi|85745 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-C-A-TTTTGA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC-----T--A---A--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-ACTGAT
gi|85744 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-GTT-T-T-GATAT-C-A-TTTTGA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC-----T--A---A--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG----------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-ACTGAT
gi|85743 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-C-A-TTTTGA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CC--A----T------A-AAAC-----T--A---A--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTTTC-CCAA--C--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85748 : ATGTG-GA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-C-A-TTT-GA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC-----T--A---A--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------GTAAAA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85749 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-T-A-TCTTCA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC-----T--G---A--T-TTT-TCC-CAATT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-G-------GT--AT------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGATa
gi|85746 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--TAT---A--ATTG-T-T-T-GATAT-C-A-TTTTGA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC--------T---A--A-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A---A--T-CA-AC-A-A-TTTTC-CCAA--T--TC---GAA--A---A---------GC-C--A-CA------------G-ACC-TT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-ACTGAT
gi|85750 : ATGTGTGA-A-AT--A---G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-TGT-GATAT-C-A-TTTTGA-AAACT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------T-AAGT-----TACT---A--T-TTTT-CC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AAATA--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GGAACC-CT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85751 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-G--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATGT-T-A-CTT-AA-AA-CA-T-A---TT-T--A---CG--A----C------A-AAAC-----T--G---A--T-TTTC-CC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTT-C-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-G-------GT--AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AATATC-ACTG
gi|85752 : ATGTGTGA-A-AC--AAT-G--GC-A-A--TAG---A--AT-G-T-T-T-GAAAT-A-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---TG--A----T------A-AAAA-----T--G---A--T-TTTT-CC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TG--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CGAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------AG-ACC-CT--T-T-------TT--AA------A--ATG--------T-A-TAA-A-AAAATC-AATGGTa
gi|85753 : ATCTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATGT-G-A-TTTT-A-AA-CT-T-A---TT-T--T---CG--A----T------A-AAGT-----G--G---A--T-TTTT-CC-AAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTTCC-CCAA--T--TC---G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---T-T-------GT--AA------A--A-AG-------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85754 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--TAT---A--GT-G-T-T-T-GATAT-G-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---AT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--G---A--T-ATTT-CC-CAATT---T-G--AC-TG--C-------------A-A--TA--T-CG-AC-T-TTTTTTC-CCAA--T--TG---G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-GCTG
gi|85756 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--TAT---C--AT-G-T-T-T-AATAT-G-A-TTTTAA-AA-CT-T-G---TT-T--A---CG--A----T------A-AAA---------T---A--GATTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-GTTTTCC-TTAA--T--TC---A-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GG-GCC-C---T-T-------GC--AA------A--A-GATTAT---T-A-TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85757 : ATGTGCAA-A-AT--AAATG--G--A-A--TAT---A--AT-T-T-T-T-GATAT-G-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CA--A----T------A-AAAC-----T--G---A----TTTTTCC-CGTTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-AATTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------CC-C--A-AA-----------AG-AAT-C---T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGa
gi|85755 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GGTAT-G-A-TTTCAA-AA-CT-T-T---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--G---A--T-TTTT--C-CAATG---T-G--AC-TG--A-------------A-A--AA--T-TT-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---A-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GA-ACC-C---T-T-------GTAAAA------A--A-A--------T-A-CAG-A-AAAATC-GCTG
gi|85758 : ATGTGTAA-A-ATG-AA--G--AC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAA-C-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---CA--A----T------A-A----------------------------CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AA-TA--T-CA-AT-A-GTTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CG-----------GA-ACT-C---T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-GATAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85761 : ATTTGCAA-A-TT--AA--A--TC-A-A--TAA---A--CT-G-T-T----ATAT-TGA-TTT--A-AA-CT-T-A---TT-G--A---CT--A----T------A-AAAT-----T--T---A--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-AATTTTC-CCAA--T--TC---A-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---T-T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-TGG-A-AAAACC-ACTGa
gi|85759 : ATGTGTAA-A-AT--AAAAG--GC-A-A--TAT---A--GT-G-T-T-T-GATAT-G-A-TTAAAA-AA-CT-T-A---AT-T--A---CG--A----T------A-AAAA-----T--TG--A--T-ATTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------T-A--TA--T-CA-AC---ATTTTTT-CCAA--T--T----G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-----T-T-------ATA-AA------A--A-A--------T-A-TAG-GAAAAATC-GATGGT
gi|85760 : ATATGTTT-A-AT--AA--G--GC-A-G--TAT---A--AT-G-T-T-T-AATAT-G-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---TG--A----T------A-AAAT-----T--A---A--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-CA-AC-A-ATTTTCC-C---------T---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---A-T-------GT--AA------A--A-A--------
gi|85762 : ATATGTAA-A-GC--AA--ATTGC-A-G--TATTATA--AT-G-T-T-T-TATAT-G-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--AATATG--A----T------A-AGAT-----T--G---A--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---A-A--A---A---------GT-C--G-CA-----------GG-A---CT--T-T-------TT--AA------C--A-ATTTTTTTTT-T-TAG-A-AAATTC-ACTG
gi|85763 : ATGTGTGA-A--T--AA--G--GC-A-A--T-T---AT-AT-G-T-T-TCGATAT-G-A-TTTTGAGAA-CT-T-AG--TT-T--AT--CG--A----T------A-A--C-----T--A---A--T-TAT--CG-CAATTA--T-G--AC-TGG-A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTTGC-TAGA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------GG---C-CT--T-T-------GT--AA------AAGA-A--------T-GTTAG-A-GAAATC-AATGGT
gi|85764 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--TAT---A-----G-T-T-A-AACTT-A-A-TT------A-C----A---TG-T--A---CG--A----C------A-AAAA-----T--T---G--A-CATTTCT-CATTT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-TTTTTTC-ACAA--T--TG---G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGAT
gi|85765 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-G-AATTTT---AA-GT-C-A---TT---------G--A----T-------------------------------TTTCCACAATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-ACTTTTC-ACAA--T--TT---G-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC-C---T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-TAA-A-GAAATC-CCTG
gi|85767 : ATGTGTAAGA-AT--AA--A-----A-A--TGT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-G-T-TTTTAA-AA-CT-------TT-T--A---CG-------T------T-GAAT-----T--G---A--T-TTCTTCC-CATTT---T-G--AC-TG--A-------------ATA--TAC-T-CGCAC-A-CTTTTTCGCCAA--T--TT---G-GATA---A---------GC-C----------------------------T-T-------GC--TA------A--A-A--------T-----A-G-AAAATC-ACTG
gi|85766 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-G-AATTTT---AA-GT-C-A---TT---------G--A----T-------------------------------TTTCCACAATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-ACTTTTC-ACAA--T--TT---G-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC-----T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-TAA-A-GAAATC--CTG
gi|85768 : ATGTCTGA-A-AT--AAT-G--GC-A-A--TAT---G--AT-G-T-G-T-TATAT-G-A-TTT-AA-AA-CT-TTA---AT-T--A---CGTTA----T------ATAAAT-----T--G---A--T-ATTTTC---AATT---TTG--AC-TG--A-------------ATA--TA--T-CG--C-A---TTTTC-CCAA--T--GG---G-G--ATTGA---------TCTC--A--A-----------AG-ACG-CTC-T-T-------GT--AA------A--T-A--------T-A-TGGAG-AAAAT
gi|85769 : ATGTGTAG-A-AT--AA--G--AA-A-A--TAT---A--TTTG-T-T-T-GATAT---G-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-TTTA---CA--T----T------G-AA-------T--T---G--A-TTTTTCC-CAATTAACT-G--GCGTG--ATATTTCATTACATA-A--TA--TGCG-AC-A-CATTTTC-GCAA--T--TT---G-A--A---A---------G--------------------G------CC--T-T-------GT--AC------A--A-A--------T-A-T-G-A-AAAACC-tcagctg
gi|85770 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--TAT---A--AT-A-T-T-T-GATAT-G-A-TTT--A-AA-CG-T-AACTTT-T--T---TG--A----C------A-AAATAATGAC--A---A--T-TTTTTTC-CAAAT---T-G--A
gi|85771 : GTGTTA-ATAT--AAA-G--GC-AGA--TAT---A---T-G-T-T-T-AATAT---A-TTTTGA-A--CTGT-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--G---A----TTTTTCC-CAATT---G-T--AC-TG--G-------------A-A--AA-------AC-A-TTTTTTagagccacaagtccctcgaaaaaa
gi|85772 : TGTGA-C-CT--A---G--GC-A-AGTTAT---G--AT-A-TCT-T-GATAT-C-A-TTT-AA-AA-CT-T-G---TT-T--A---CG--A----T------A-AAA---------T---G--A-TTTTTCC-TAGTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--ACCA-----------GG-A-C-CT--T-T-------GT--AA------A--A--------------TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85773 : TGTAA-A-AT--AA--A--ATTA-A--TGT---A--AT-G-T-T-A-GACAC-C-A-TTCT-A-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--G---A--T-ATTT-CC-CAAAT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTATT-CCAA--T--TC---C-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------CG-A-C-CG--T-T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-TAG-A-AAATTT-ACTG
gi|85774 : GTAA-A-AT--AAA-G--GA-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GTTAT-G-A-TTTT-A-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------C-AAAT-----T--G---A--T-TTTT-CC-TAATT---T-G--AT-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TT---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGGT
gi|85775 : GTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T---------T-A-T-G-T-GAT--------TTT-A-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------G-TGA------T--T---A--A-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--C---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---T-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATG-ACTG
gi|85776 : GA-A-ATT-AA--G--TT-A-A--T-T---AC-AT-G-T-----AATAT-G-A-TTTTAA-AG-CT-T-A---TT-T--A---TG--A----T------A-AAA------T--T---A--T-TTTT--C-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-TA-AC-A-ATTTATC-CCAA--T--TT---GAA--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-A-C-CT--T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATT-A
gi|85778 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-AATAT-A-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---GT--A----TTTTACTA-AAAT-----T--T---A--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-TG-AC-A-GTTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-ACC-CT--T-C-------TT--CA------A--G-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGGT
gi|85777 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--AAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-G-A-TTTTAA-AA-CT-T-A---TT-T--A---TG--A----T------A-GA-T-----T--T---G--A-TTTTTCC-CAATT---T-G--AA-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---A-A--A---A---------GC-C--A-CT-----------GG-ACC-CT--TAT-------G---AA------A--A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-
gi|85779 : A-A-AT--AAA-G--GA-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-A-A-TTTT-A-AA-CT-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--G---A----TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-AGAAA-------------A-A--TA--T-CGAACAA-ATTTTTC-CCAAATT--CC---G-A--A---A---------GT-C--A-CACTATATGACAGGG-ACC-C---T-T-------GT--AA------A--A-A--------T-
gi|85780 : -A-AT--AAA-G--GCTA-A--TAT---ACCAT-G-T-T-T-GATATGC-A-TTTTGA-AA-CT---A---TTAT--A---CG--AGA--T------A-AAGA-----C--T---ACCT-TTTTCCC-CAATT---C-GGAAC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-ACATTTTTC-CCAA--T--TT---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACCGCT--T-T-------GT--AAAC----A--A-A--------TAA-TAG-A-AAAATC-ACaataga
gi|85781 : --AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-TATAT-G-A-TTTTAA-AG-CG-T-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAT-----T--G---A--T-TTTTCTC-C-ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--C-CA-AC-ATTTTTTTC-CTAA--T--TT---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--TGT-------G---AA------A--A-A--------T-A-TTG-A-ACAATC-ACTGAT
gi|85782 : --AA--G--GC-A-A--TAT---A--AT-G-T-T-T-GATAT-TGA-CTTTAA-AA-TT-T-A---AT-T--T---CG--ATAATT------A-AAAG-----T--TTGAA--T-TTTTTCA-C-ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AATTA--T-CG-AC-G-A
gi|85783 : C-A-A--TGT---A-------T-T-TAGATAT-C-A-ATT--A-AA----T-A---TT--------CA--A----T------A----------T--T---G--A-TTTTTCA-CAATT---T-G--AT-AA--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-TTTCTTC----A--T--CA---T-A--A---A---------GG-T--C-TA-----------GG--CT-CC--T-T-------AT--GA------A--A-A--------T-G-TAGAA-AAAAAC-ACTG
gi|85784 : TAT-C-A-TTTTGA-AA-CT-C-A---TT-T--A---CG--A----T------A-AAAC-----T--T---G----TTTTTCC-CAATT---G-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-
gi|85785 : TAT-C-A-TT--------CT-A-A---TT-T--A---CC--A----C------A-AA----------T---G--A-TTTTTCT-CAATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---A-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GTG-GT--T-T-------A---AA------A--A-A--------C-G--AA-A-AAAATC-ACTG
gi|85786 : TAT-C-A-TT--------CT-A-A---TT-T--A---CC--A----C------A-AA----------T---G--A-TTTTTCC-CAATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-ATTTTTC-CTAA--T--TCAAAG-G--G---A---------G--------------------GG-GTG-GTAGT-T--------T--AA------A--A-AT-------T-G-AAA-A-AAAATC-ACTGGTa
gi|85788 : -A---TT-T--A---CT--A----C------A-AA----------T---G--A-TTTTTCG-CAATT---T-G--AG-AA--A-------------A-A--TG--T-CG-CT-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---A-A--A---G---------G
gi|85789 : G--A----T------A-AA-C-----T--G---A--T-TTTTCCCGCAATT---A-T--AC-TG--ATATAGCTGGGT--A-A--TACTT-CGTAC-A--TTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CAG----------GG-ACC-CT--T-TTTAGCGAGT--AGTTGAGCA--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTGAT
gi|85792 : -TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-CG-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--TGT-------GA--AA------A--A-A--------T---TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85791 : -TTTTTCC-CAATT---T-GG-AC-TG--ATT-----------A-A--TA--T-CG-A--A-ATTTTTC-CCAA--TAATA---G-C--AG--A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C---A-T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACTG
gi|85790 : a-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-GG-AA-A-ATTTTTC-CCAA--T--TT---G-A--A---ACTTCAGAAAGC-CCTA-CATGTA-------GG-ACC-CT--TGT-------GA--AA------A--A-A--------T-A-TAG-A-AAAATC-ACa
gi|85787 : tgaTTTCCACAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-G--TG--C-CT-AC-A-ATGTTTA-CCAA--T--AC---G-A--A---C---------AC-C--A-CA------------A-ACT-C---T-T-------GC--AA------AG-A-A--------T-G-TAG-A-AAAATC-AC
gi|85793 : taaaacttcttttgaacagttgaatcgaaATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-TTTTTTC-TTAA--T--TC---A-A--A---G---------TT-C--A-CA-----------GG-ATC-C---T-T-------GT--AA------A--A--------------------AAAATC-ACTG
gi|85794 : --A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-ATTTTTC-CCAA--T--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C-----T-------GT--AA------A--A-A----------G-TAA-G-AAAATCAACTGa
gi|85795 : a--TC---G-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT--T-T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-TTG-A-AAAATA-AC
Alignments
lowQualScore : 11 11
lowQualScore : 1 1 44 55 11 2 1 11 1 111 22 2 1 1 1 2 0 33 1 11 0 1 0 0 22 0 111 222 11 11 666666 0 11 444 3333 88 3 222 0 11 0 11 8888888888888 1 22 11 0 2 0 1 0 0 11 11 2 11 222 333333333 0 11 0 66666666666 0 0 11 33 2222222 99 333333 11 0 88888888 2 0 22 0 0 0 0
lowQualScore : . . .. .. .. . . .. . ... .. . . . . . . .. . .. . . . . .. . ... ... .. .. ...... . .. ... .... .. . ... . .. . .. ............. . .. .. . . . . . . .. .. . .. ... ......... . .. . ........... . . .. .. ....... .. ...... .. . ........ . . .. . . . .
lowQualScore : 1 1 88 88 44 0 0 33 0 777 33 0 0 0 0 0 9 77 8 00 9 4 9 9 11 9 555 444 22 22 333333 9 22 222 2222 11 2 222 8 99 8 88 9999999999999 5 99 88 8 3 8 5 8 8 11 11 4 11 222 222222222 8 11 8 44444444444 8 8 99 66 7777777 66 555555 99 8 33333333 6 9 33 9 9 9 9
consensus : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
Reference ( family-363 ) : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TN-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--NA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85743 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TC-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CC--A--T------A-A--AACT--AA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--C--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85744 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-GTT-T-T-GATA-TC-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--AA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG----------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85745 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TC-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--AA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85746 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--ATTG-T-T-T-GATA-TC-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--AA----TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A---A--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCGAA--A---A---------GC-C--A-CA------------G-ACC-TT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85747 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TC-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--TA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-G--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-GAAAATC-A-CTGGT
gi|85748 : ATGTG-GA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TC-A-TTT--GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--AA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85749 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TT-A-TCTT-CA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--GA--T-TTT-TCC-CAATT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AT------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGATa
gi|85750 : ATGTGTGA-A-AT--A---G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-TGT-GATA-TC-A-TTTTGAA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------T-A--AGTT--AC--TATTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AAATA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GGAACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85751 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-TT-A-CTT--AA-AACA-T-A--TT-T---A---CG--A--C------A-A--AACT--GA--T-TTTC-CC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTT-C-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAATATC-A-CTG
gi|85752 : ATGTGTGA-A-AC--AAT-G--GC-A-A--T-AG---A--AT-G-T-T-T-GAAA-TA-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--AAAT--GA--T-TTTT-CC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TG--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CGAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------AG-ACC-CT-T--T-------TT--AA------A--ATG--------T-A-T--A-A-AAAAATC-A-ATGGTa
gi|85753 : ATCTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-TG-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---T---CG--A--T------A-A--AGTG--GA--T-TTTT-CC-AAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTCC-CCAA--T--TCG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AG-------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85754 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA--T-ATTT-CC-CAATT---T-G--AC-TG--C-------------A-A--TA--T-CG-AC-T-T-TTTTTC-CCAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85755 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GGTA-TG-A-TTTC-AA-AACT-T-T--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA--T-TTTT--C-CAATG---T-G--AC-TG--A-------------A-A--AA--T-TT-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GA-ACC-C--T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-A-C--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85756 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---C--AT-G-T-T-T-AATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATA--GA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-G-TTTTCC-TTAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GG-GCC-C--T--T-------GC--AA------A--A-GATTAT---T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85757 : ATGTGCAA-A-AT--AAATG--G--A-A--T-AT---A--AT-T-T-T-T-GATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A--AACT--GA----TTTTTCC-CGTTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------CC-C--A-AA-----------AG-AAT-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85758 : ATGTGTAA-A-ATG-AA--G--AC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-AC-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A----------------------CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AA-TA--T-CA-AT-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CG-----------GA-ACT-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------TGA-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85759 : ATGTGTAA-A-AT--AAAAG--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-TG-A-TTAA-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--TA-----A-A--AATT--GA--T-ATTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------T-A--TA--T-CA-AC---A-TTTTTT-CCAA--T--T-G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC----T--T-------ATA-AA------A--A-A--------T-A-T--AGG-AAAAATC-G-ATGGTa
gi|85760 : ATATGTTT-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--AATT--AA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-CA-AC-A-A-TTTTCC-C---------TG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GT--AA------A--A-A--------
gi|85761 : ATTTGCAA-A-TT--AA--A--TC-A-A--T-AA---A--CT-G-T-T----ATA-TTGA-TTT---A-AACT-T-A--TT-G---A---CT--A--T------A-A--AATT--TA--T-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--G-G-AAAAACC-A-CTG
gi|85762 : ATATGTAA-A-GC--AA--ATTGC-A-G--T-ATTATA--AT-G-T-T-T-TATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---AATATG--A--T------A-A--GATT--GA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GT-C--G-CA-----------GG-A---CT-T--T-------TT--AA------C--A-ATTTTTTTTT-T-T--A-G-AAAATTC-A-CTG
gi|85763 : ATGTGTGA-A--T--AA--G--GC-A-A--TTAT---A---T-G-T-T-TCGATA-TG-A-TTTT-GAGAACT-T-AG-TT-T---AT--CG--A--T------A-ACTAATT--A---------TCG-CAATTA--T-G--AC-TGG-A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTGC-TAGA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------GG---C-CT-T--T-------GT--AA------AAGA-A--------T-GTT--A-G-AGAAATC-A-ATGGT
gi|85764 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A-----G-T-T-A-AACT-TA-A-TT-------AC----A--TG-T---A---CG--A--CA-----A-A--AATT--GA----CATTTCT-CATTT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-T-TTTTTC-ACAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85765 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TG-AATTTT-AA-G--T-C-A--TT----------G--A--T-------------------------TTTCCACAATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC-CT-T----------GT--AA------A--A-AA-------T-A-T--A-A-AGAAATC-C-CTG
gi|85766 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TG-AATTTT-AA-G--T-C-A--TT----------G--A--T-------------------------TTTCCACAATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC----T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-A-AGAAATC---CTG
gi|85767 : ATGTGTAAGA-AT--AA--A-----A-A--T-GT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TG-T-TTTT-AA-AACT------TT-T---A---CG-----T------T-G--AATT--GA--T-TTCTTCC-CATTT---T-G--AC-TG--A-------------ATA--TAC-T-CGCAC-A-C-TTTTTCGCCAA--T--TTG-GATA---A---------GC-C---------------------------T--T-------GC--TA------A--A-A--------T-A--------GAAAATC-A-CTG
gi|85768 : ATGTCTGA-A-AT--AAT-G--GC-A-A--T-AT---G--AT-G-T-G-T-TATA-TG-A-TTT--AA-AACT-TTA--AT-T---A---CGTTA--T------ATA--AATT--GA--T-ATTTTC---AATT---TTG--AC-TG--A-------------ATA--TA--T-CG--C-A----TTTTC-CCAA--T--GGG-G--ATTGA---------TCTC--A--A-----------AG-ACG-CTCT--T-------GT--AA------A--T-A--------T-A-TGGA-G-AAAATTC-AGCTG
gi|85769 : ATGTGTAG-A-AT--AA--G--AA-A-A--T-AT---A--TTTG-T-T-T-GATA-TG---TTTT-AA-AACT-T-ATTTT-T---A---C---A--T------T-G--AATT--GA----TTTTTCC-CAATTAACT-G--GCGTG--ATATTTCATTACATA-A--TA--TGCG-AC-A-C-ATTTTC-GCAA--T--TTG-A--A---A---------G--------------------G------CC-T--T-------GT--AC------A--A-A--------T-A-T----G-AAAAACC-
gi|85770 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-A-T-T-T-GATA-TG-A-TTT---A-AACG-T-A---------------------------------------A--C-TTT--------TT---T-G--AC--A--A-------------A-A--TA--A-TG-AC-A-ATTTTTTT-CCAA--A--TTG-A--AG--A---------GC-C--A-CA-----------AG-TCC-C--T--C-------GA--AA------A--A-A--------
gi|85771 : GTGTTA-ATAT--AAA-G--GC-AGA--T-AT---A---T-G-T-T-T-AATA-T--A-TTTT-GA-A-CTGT-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA----TTTTTCC-CAATT---G-T--AC-TG--G-------------A-A--AA-------AC-A-T-TTTTT
gi|85772 : TGTGA-C-CT--A---G--GC-A-AGTT-AT---G--AT-A-TCT-T-GATA-TC-A-TTT--AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AAT---GA--T-TTTT-CC-TAGTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--ACCA-----------GG-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A---------------A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85773 : TGTAA-A-AT--AA--A--ATTA-A--T-GT---A--AT-G-T-T-A-GACA-CC-A-TTCT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA--T-ATTT-CC-CAAAT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTATT-CCAA--T--TCC-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------CG-A-C-CG-T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--A-G-AAAATTT-A-CTG
gi|85774 : GTAA-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GTTA-TG-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------C-A--AATT--GA--T-TTTT-CC-TAATT---T-G--AT-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85775 : GTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T------------------T--ATG-TG-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------G-T--GATT--AA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--C---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATG-A-CTG
gi|85776 : GA-A-ATT-AA--G--TT-A-A--T--T---AC-AT-G-T-----AATA-TG-A-TTTT-AA-AGCT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--AATT---A--T-TTTT--C-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-TA-AC-A-A-TTTATC-CCAA--T--TTGAA--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATT-A-
gi|85777 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--A-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TG-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-G--ATTT--GA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AA-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CT-----------GG-ACC-CT-TA-T-------G---AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-
gi|85778 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-TA-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---GT--A--TTTTACTA-A--AATT--TA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-TG-AC-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-ACC-CT-T--C-------TT--CA------A--G-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85779 : A-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-TA-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA----TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-AGAAA-------------A-A--TA--T-CGAACAA-A-TTTTTC-CCAAATT--CCG-A--A---A---------GT-C--A-CACTATATGACAGGG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------TAA-T--A-G-A
gi|85780 : -A-AT--AAA-G--GCTA-A--T-AT---ACCAT-G-T-T-T-GATA-TGCA-TTTT-GA-AACT---A--TTAT---A---CG--AGAT------A-A--AGAC--TACCT-TTTTCCC-CAATT---C-GGAAC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-ACA-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACCGCT-T--T-------GT--AAAC----A--A-A--------TAA-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85781 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-TATA-TG-A-TTTT-AA-AGCG-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AATT--GA--T-TTTTCTC-C-ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--C-CA-AC-ATT-TTTTTC-CTAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTG-AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AACAATC-A-CTGAT
gi|85782 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATATTG-A-CTTT-AA-AATT-T-A--AT-T---T---CG--A--TAATTA-A-A--AGTTTGAA--T-TTTTTCA-C-ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AATTA--T-CG-AC-G-A-
gi|85783 : C-A-A--T-GT---A-------T-T-TAGATA-TC-A-ATT---A-AA---T-A--TT---------CA--A--T------A------TT--GA--T-TTTT-CA-CAATT---T-G--AT-AA--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-T-TTCTTC----A--T--CAT-A--A---A---------GG-T--C-TA-----------GG--CT-CC-T--T-------AT--GA------A--A-A--------T-G-T--A-GAAAAAAAC-A-CTG
gi|85784 : TA-TC-A-TTTT-GA-AACT-C-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--AACT--TG----TTTTTCC-CAATT---G-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-
gi|85785 : TA-TC-A-TTCT-AA-----------TT-T---A---CC--A--C------A-A--A--T--GA--T-TTTT-CT-CAATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GTG-GT-T--T-------A---AA------A--A-A--------C-G----A-A-AAAAATC-A-CTG
gi|85786 : TA-TC-A-TTCT-AA-----------TT-T---A---CC--A--C------A-A--A--T--GA--T-TTT-TCC-CAATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CTAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GGT-GG-TAGT-------TT--AA------A--A-A--------T---TGAA-A-AAAAATC-A-CTGGTa
gi|85787 : T-AA-AACT-T-C--TT-TTGAA---CA--G--T------T-G--AATC--GA--A-TTT--CCACAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-G--TG--C-CT-AC-A-A-TGTTTA-CCAA--T--ACG-A--A---C---------AC-C--A-CA------------A-ACT-C--T--T-------GC--AA------AG-A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85788 : -A--TT-T---A---CT--A--C------A-A--A--T--GA--T-TTTT-CG-CAATT---T-G--AG-AA--A-------------A-A--TG--T-CG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G
gi|85789 : G--A--T------A-A--A-CT--GA--T-TTTTCCCGCAATT---A-T--AC-TG--ATATAGCTGGGT--A-A--TACTT-CGTAC-A---TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CAG----------GG-ACC-CT-T--TTTAGCGAGT--AGTTGAGCA--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85790 : -TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-GG-AA-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---ACTTCAGAAAGC-CCTA-CATGTA-------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85791 : tga-TTTTTCC-CAATT---T-GG-AC-TG--ATT-----------A-A--TA--T-CG-A--A-A-TTTTTC-CCAA--TAATAGCA--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85792 : a-TTTTTCC-CAATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T---T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85793 : ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-T-TTTTTC-TTAA--T--TCA-A--A---G---------TT-C--A-CA-----------GG-ATC-C--T--T-------GT--AA------A------------------------AAAAATC-A-CTG
gi|85794 : --A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C-----T-------GT--AA------A--A-A----------G-T--A-A-GAAAATCAA-CTGa
gi|85795 : a--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AAAAATA-A-C
Alignments
lowQualScore : 11 11
lowQualScore : 1 1 44 55 11 2 1 11 1 111 22 2 1 1 1 2 1 333 1 11 0 0 0 22 0 111 222 11 11 444444 0 22 0 2222 0 22 99 3 0 222 0 11 0 11 8888888888888 1 22 11 0 2 0 1 0 0 11 11 2 11 222 333333333 0 11 0 66666666666 0 0 11 33 2222222 99 333333 11 0 88888888 2 0 22 0 0 0 0
lowQualScore : . . .. .. .. . . .. . ... .. . . . . . . ... . .. . . . .. . ... ... .. .. ...... . .. . .... . .. .. . . ... . .. . .. ............. . .. .. . . . . . . .. .. . .. ... ......... . .. . ........... . . .. .. ....... .. ...... .. . ........ . . .. . . . .
lowQualScore : 1 1 88 88 44 0 0 33 0 777 33 0 0 0 0 0 0 000 9 44 9 9 9 11 9 555 444 22 22 111111 9 33 9 7777 8 66 88 2 8 222 8 99 8 88 9999999999999 5 99 88 8 3 8 5 8 8 11 11 4 11 222 222222222 8 11 8 44444444444 8 8 99 66 7777777 66 555555 99 8 33333333 6 9 33 9 9 9 9
consensus : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
Reference ( family-363 ) : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85743 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CC--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--C--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85744 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-GTT-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG----------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85745 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85746 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--ATTG-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A---A--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCGAA--A---A---------GC-C--A-CA------------G-ACC-TT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85747 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTT-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-G--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-GAAAATC-A-CTGGT
gi|85748 : ATGTG-GA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTT--GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85749 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-T-A-TCTT-CA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AT------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGATa
gi|85750 : ATGTGTGA-A-AT--A---G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-TGT-GATA-T-C-A-TTTTGAA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------T-A--A-G----TTA-CTATTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AAATA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GGAACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85751 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-T-T-A-CTT--AA-AACA-T-A--TT-T---A---CG--A--C------A-A--A-A----CTG-AT-TTTC-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTT-C-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAATATC-A-CTG
gi|85752 : ATGTGTGA-A-AC--AAT-G--GC-A-A--T-AG---A--AT-G-T-T-T-GAAA-T-A-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----ATG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TG--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CGAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------AG-ACC-CT-T--T-------TT--AA------A--ATG--------T-A-T--A-A-AAAAATC-A-ATGGTa
gi|85753 : ATCTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---T---CG--A--T------A-A--A-G----TGG-AT-TTTT-CC-A-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTCC-CCAA--T--TCG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AG-------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85754 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-ATTT-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--C-------------A-A--TA--T-CG-AC-T-T-TTTTTC-CCAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85755 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GGTA-T-G-A-TTTC-AA-AACT-T-T--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTT--C-C-AATG---T-G--AC-TG--A-------------A-A--AA--T-TT-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GA-ACC-C--T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-A-C--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85756 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---C--AT-G-T-T-T-AATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TAG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-G-TTTTCC-TTAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GG-GCC-C--T--T-------GC--AA------A--A-GATTAT---T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85757 : ATGTGCAA-A-AT--AAATG--G--A-A--T-AT---A--AT-T-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A--A-A----CTG-A--TTTTTCC-C-GTTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------CC-C--A-AA-----------AG-AAT-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85758 : ATGTGTAA-A-ATG-AA--G--AC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-A-C-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A------------------------C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AA-TA--T-CA-AT-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CG-----------GA-ACT-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------TGA-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85759 : ATGTGTAA-A-AT--AAAAG--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTAA-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--TA-----A-A--A-A----TTG-AT-ATTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------T-A--TA--T-CA-AC---A-TTTTTT-CCAA--T--T-G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC----T--T-------ATA-AA------A--A-A--------T-A-T--AGG-AAAAATC-G-ATGGTa
gi|85760 : ATATGTTT-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----TTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-CA-AC-A-A-TTTTCC-C---------TG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GT--AA------A--A-A--------
gi|85761 : ATTTGCAA-A-TT--AA--A--TC-A-A--T-AA---A--CT-G-T-T----ATA-TTG-A-TTT---A-AACT-T-A--TT-G---A---CT--A--T------A-A--A-A----TTT-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--G-G-AAAAACC-A-CTG
gi|85762 : ATATGTAA-A-GC--AA--ATTGC-A-G--T-ATTATA--AT-G-T-T-T-TATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---AATATG--A--T------A-A--G-A----TTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GT-C--G-CA-----------GG-A---CT-T--T-------TT--AA------C--A-ATTTTTTTTT-T-T--A-G-AAAATTC-A-CTG
gi|85763 : ATGTGTGA-A--T--AA--G--GC-A-A--TTAT---A---T-G-T-T-TCGATA-T-G-A-TTTT-GAGAACT-T-AG-TT-T---AT--CG--A--T------A-ACTA-A----TTA--------TCG-C-AATTA--T-G--AC-TGG-A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTGC-TAGA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------GG---C-CT-T--T-------GT--AA------AAGA-A--------T-GTT--A-G-AGAAATC-A-ATGGT
gi|85764 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A-----G-T-T-A-AACT-T-A-A-TT-------AC----A--TG-T---A---CG--A--CA-----A-A--A-A----TTG-A--CATTTCT-C-ATTT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-T-TTTTTC-ACAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85765 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-AATTTT-AA-GTC---------------------------------------A----TTG-AT-TTT--CCAC-AATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC-CT-T----------GT--AA------A--A-AA-------T-A-T--A-A-AGAAATC-C-CTG
gi|85766 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-AATTTT-AA-GTC---------------------------------------A----TTG-AT-TTT--CCAC-AATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC----T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-A-AGAAATC---CTG
gi|85767 : ATGTGTAAGA-AT--AA--A-----A-A--T-GT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-T-TTTT-AA-AACT------TT-T---A---CG-----T------T-G--A-A----TTG-AT-TTCTTCC-C-ATTT---T-G--AC-TG--A-------------ATA--TAC-T-CGCAC-A-C-TTTTTCGCCAA--T--TTG-GATA---A---------GC-C---------------------------T--T-------GC--TA------A--A-A--------T-A--------GAAAATC-A-CTG
gi|85768 : ATGTCTGA-A-AT--AAT-G--GC-A-A--T-AT---G--AT-G-T-G-T-TATA-T-G-A-TTT--AA-AACT-TTA--AT-T---A---CGTTA--T------ATA--A-A----TTG-AT-ATTTTC----AATT---TTG--AC-TG--A-------------ATA--TA--T-CG--C-A----TTTTC-CCAA--T--GGG-G--ATTGA---------TCTC--A--A-----------AG-ACG-CTCT--T-------GT--AA------A--T-A--------T-A-TGGA-G-AAAATTC-AGCTG
gi|85769 : ATGTGTAG-A-AT--AA--G--AA-A-A--T-AT---A--TTTG-T-T-T-GATA-T-G---TTTT-AA-AACT-T-ATTTT-T---A---C---A--T------T-G--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATTAACT-G--GCGTG--ATATTTCATTACATA-A--TA--TGCG-AC-A-C-ATTTTC-GCAA--T--TTG-A--A---A---------G--------------------G------CC-T--T-------GT--AC------A--A-A--------T-A-T----G-AAAAACC-
gi|85770 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-A-T-T-T-GATA-T-G-A-TTT---A-AACG-T-A-------------------------------------------AC-TTT---------TT---T-G--AC--A--A-------------A-A--TA--A-TG-AC-A-ATTTTTTT-CCAA--A--TTG-A--AG--A---------GC-C--A-CA-----------AG-TCC-C--T--C-------GA--AA------A--A-A--------
gi|85771 : GTGTTA-ATAT--AAA-G--GC-AGA--T-AT---A---T-G-T-T-T-AATA-T---A-TTTT-GA-A-CTGT-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATT---G-T--AC-TG--G-------------A-A--AA-------AC-A-T-TTTTT
gi|85772 : TGTGA-C-CT--A---G--GC-A-AGTT-AT---G--AT-A-TCT-T-GATA-T-C-A-TTT--AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----T-G-AT-TTTT-CC-T-AGTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--ACCA-----------GG-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A---------------A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85773 : TGTAA-A-AT--AA--A--ATTA-A--T-GT---A--AT-G-T-T-A-GACA-C-C-A-TTCT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-ATTT-CC-C-AAAT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTATT-CCAA--T--TCC-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------CG-A-C-CG-T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--A-G-AAAATTT-A-CTG
gi|85774 : GTAA-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GTTA-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------C-A--A-A----TTG-AT-TTTT-CC-T-AATT---T-G--AT-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85775 : GTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T------------------T--ATG-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------G-T--G-A----TTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--C---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATG-A-CTG
gi|85776 : GA-A-ATT-AA--G--TT-A-A--T--T---AC-AT-G-T-----AATA-T-G-A-TTTT-AA-AGCT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----TT--AT-TTTT--C-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-TA-AC-A-A-TTTATC-CCAA--T--TTGAA--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATT-A-
gi|85777 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--A-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-G--A-T----TTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AA-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CT-----------GG-ACC-CT-TA-T-------G---AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-
gi|85778 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-T-A-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---GT--A--TTTTACTA-A--A-A----TTT-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-TG-AC-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-ACC-CT-T--C-------TT--CA------A--G-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85779 : A-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-A-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-AGAAA-------------A-A--TA--T-CGAACAA-A-TTTTTC-CCAAATT--CCG-A--A---A---------GT-C--A-CACTATATGACAGGG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------TAA-T--A-G-A
gi|85780 : -A-AT--AAA-G--GCTA-A--T-AT---ACCAT-G-T-T-T-GATA-T-GCA-TTTT-GA-AACT---A--TTAT---A---CG--AGAT------A-A--AGA----CTA-CC-TTTTTCC-CCAATT---C-GGAAC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-ACA-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACCGCT-T--T-------GT--AAAC----A--A-A--------TAA-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85781 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-TATA-T-G-A-TTTT-AA-AGCG-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTCTC-C--ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--C-CA-AC-ATT-TTTTTC-CTAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTG-AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AACAATC-A-CTGAT
gi|85782 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATATT-G-A-CTTT-AA-AATT-T-A--AT-T---T---CG--A--T------A-ATTA-AAAGTTTGAAT-TTTTTCA-C--ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AATTA--T-CG-AC-G-A-
gi|85783 : C-A-A--T-GT---A-------T-T-TAGATA-T-C-A-ATT---A-AA---T-A--TT---------CA--A--T------A-----------TTG-AT-TTTT-CA-C-AATT---T-G--AT-AA--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-T-TTCTTC----A--T--CAT-A--A---A---------GG-T--C-TA-----------GG--CT-CC-T--T-------AT--GA------A--A-A--------T-G-T--A-GAAAAAAAC-A-CTG
gi|85784 : TA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-C-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-AC---TTG----TTTTTCC-C-AATT---G-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-
gi|85785 : CT-A-A--TT-T---A---CC--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTTT-CT-C-AATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GTG-GT-T--T-------A---AA------A--A-A--------C-G----A-A-AAAAATC-A-CTG
gi|85786 : tatcattCT-A-A--TT-T---A---CC--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CTAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GGT-GG-TAGT-------TT--AA------A--A-A--------T---TGAA-A-AAAAATC-A-CTGGTa
gi|85787 : tatcattT-AA-AACT-T-C--TT-TTGAA---CA--G--T------T-G--A-A----TCG-AA-TTT--CCAC-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-G--TG--C-CT-AC-A-A-TGTTTA-CCAA--T--ACG-A--A---C---------AC-C--A-CA------------A-ACT-C--T--T-------GC--AA------AG-A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85788 : -A--TT-T---A---CT--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTTT-CG-C-AATT---T-G--AG-AA--A-------------A-A--TG--T-CG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G
gi|85789 : G--A--T------A-A--A------CTG-AT-TTTTCCCGC-AATT---A-T--AC-TG--ATATAGCTGGGT--A-A--TACTT-CGTAC-A---TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CAG----------GG-ACC-CT-T--TTTAGCGAGT--AGTTGAGCA--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85790 : TG-AT-TTTT-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-GG-AA-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---ACTTCAGAAAGC-CCTA-CATGTA-------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85791 : -TTTTTCC-C-AATT---T-GG-AC-TG--ATT-----------A-A--TA--T-CG-A--A-A-TTTTTC-CCAA--TAATAGCA--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85792 : a-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T---T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85793 : ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-T-TTTTTC-TTAA--T--TCA-A--A---G---------TT-C--A-CA-----------GG-ATC-C--T--T-------GT--AA------A------------------------AAAAATC-A-CTG
gi|85794 : --A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C-----T-------GT--AA------A--A-A----------G-T--A-A-GAAAATCAA-CTGa
gi|85795 : a--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AAAAATA-A-C
Alignments
lowQualScore : 11 11
lowQualScore : 1 1 44 55 11 2 1 11 1 111 22 2 1 1 1 2 1 333 1 11 0 0 0 22 0 111 222 11 11 444444 0 22 0 2222 0 22 99 3 0 222 0 11 0 11 8888888888888 1 22 11 0 2 0 1 0 0 11 11 2 11 222 333333333 0 11 0 66666666666 0 0 11 33 2222222 99 333333 11 0 88888888 2 0 22 0 0 0 0
lowQualScore : . . .. .. .. . . .. . ... .. . . . . . . ... . .. . . . .. . ... ... .. .. ...... . .. . .... . .. .. . . ... . .. . .. ............. . .. .. . . . . . . .. .. . .. ... ......... . .. . ........... . . .. .. ....... .. ...... .. . ........ . . .. . . . .
lowQualScore : 1 1 88 88 44 0 0 33 0 777 33 0 0 0 0 0 0 000 9 44 9 9 9 11 9 555 444 22 22 111111 9 33 9 7777 8 66 88 2 8 222 8 99 8 88 9999999999999 5 99 88 8 3 8 5 8 8 11 11 4 11 222 222222222 8 11 8 44444444444 8 8 99 66 7777777 66 555555 99 8 33333333 6 9 33 9 9 9 9
consensus : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
Reference ( family-363 ) : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85743 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CC--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--C--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85744 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-GTT-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG----------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85745 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85746 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--ATTG-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A---A--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCGAA--A---A---------GC-C--A-CA------------G-ACC-TT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85747 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTT-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-G--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-GAAAATC-A-CTGGT
gi|85748 : ATGTG-GA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTT--GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85749 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-T-A-TCTT-CA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AT------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGATa
gi|85750 : ATGTGTGA-A-AT--A---G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-TGT-GATA-T-C-A-TTTTGAA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------T-A--A-G----TTA-CTATTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AAATA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GGAACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85751 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-T-T-A-CTT--AA-AACA-T-A--TT-T---A---CG--A--C------A-A--A-A----CTG-AT-TTTC-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTT-C-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAATATC-A-CTG
gi|85752 : ATGTGTGA-A-AC--AAT-G--GC-A-A--T-AG---A--AT-G-T-T-T-GAAA-T-A-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----ATG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TG--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CGAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------AG-ACC-CT-T--T-------TT--AA------A--ATG--------T-A-T--A-A-AAAAATC-A-ATGGTa
gi|85753 : ATCTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---T---CG--A--T------A-A--A-G----TGG-AT-TTTT-CC-A-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTCC-CCAA--T--TCG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AG-------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85754 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-ATTT-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--C-------------A-A--TA--T-CG-AC-T-T-TTTTTC-CCAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85755 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GGTA-T-G-A-TTTC-AA-AACT-T-T--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTT--C-C-AATG---T-G--AC-TG--A-------------A-A--AA--T-TT-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GA-ACC-C--T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-A-C--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85756 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---C--AT-G-T-T-T-AATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TAG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-G-TTTTCC-TTAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GG-GCC-C--T--T-------GC--AA------A--A-GATTAT---T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85757 : ATGTGCAA-A-AT--AAATG--G--A-A--T-AT---A--AT-T-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A--A-A----CTG-A--TTTTTCC-C-GTTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------CC-C--A-AA-----------AG-AAT-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85758 : ATGTGTAA-A-ATG-AA--G--AC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-A-C-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A------------------------C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AA-TA--T-CA-AT-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CG-----------GA-ACT-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------TGA-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85759 : ATGTGTAA-A-AT--AAAAG--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTAA-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--TA-----A-A--A-A----TTG-AT-ATTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------T-A--TA--T-CA-AC---A-TTTTTT-CCAA--T--T-G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC----T--T-------ATA-AA------A--A-A--------T-A-T--AGG-AAAAATC-G-ATGGTa
gi|85760 : ATATGTTT-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----TTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-CA-AC-A-A-TTTTCC-C---------TG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GT--AA------A--A-A--------
gi|85761 : ATTTGCAA-A-TT--AA--A--TC-A-A--T-AA---A--CT-G-T-T----ATA-TTG-A-TTT---A-AACT-T-A--TT-G---A---CT--A--T------A-A--A-A----TTT-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--G-G-AAAAACC-A-CTG
gi|85762 : ATATGTAA-A-GC--AA--ATTGC-A-G--T-ATTATA--AT-G-T-T-T-TATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---AATATG--A--T------A-A--G-A----TTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GT-C--G-CA-----------GG-A---CT-T--T-------TT--AA------C--A-ATTTTTTTTT-T-T--A-G-AAAATTC-A-CTG
gi|85763 : ATGTGTGA-A--T--AA--G--GC-A-A--TTAT---A---T-G-T-T-TCGATA-T-G-A-TTTT-GAGAACT-T-AG-TT-T---AT--CG--A--T------A-ACTA-A----TTA--------TCG-C-AATTA--T-G--AC-TGG-A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTGC-TAGA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------GG---C-CT-T--T-------GT--AA------AAGA-A--------T-GTT--A-G-AGAAATC-A-ATGGT
gi|85764 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A-----G-T-T-A-AACT-T-A-A-TT-------AC----A--TG-T---A---CG--A--CA-----A-A--A-A----TTG-A--CATTTCT-C-ATTT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-T-TTTTTC-ACAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85765 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-AATTTT-AA-GTC---------------------------------------A----TTG-AT-TTT--CCAC-AATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC-CT-T----------GT--AA------A--A-AA-------T-A-T--A-A-AGAAATC-C-CTG
gi|85766 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-AATTTT-AA-GTC---------------------------------------A----TTG-AT-TTT--CCAC-AATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC----T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-A-AGAAATC---CTG
gi|85767 : ATGTGTAAGA-AT--AA--A-----A-A--T-GT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-T-TTTT-AA-AACT------TT-T---A---CG-----T------T-G--A-A----TTG-AT-TTCTTCC-C-ATTT---T-G--AC-TG--A-------------ATA--TAC-T-CGCAC-A-C-TTTTTCGCCAA--T--TTG-GATA---A---------GC-C---------------------------T--T-------GC--TA------A--A-A--------T-A--------GAAAATC-A-CTG
gi|85768 : ATGTCTGA-A-AT--AAT-G--GC-A-A--T-AT---G--AT-G-T-G-T-TATA-T-G-A-TTT--AA-AACT-TTA--AT-T---A---CGTTA--T------ATA--A-A----TTG-AT-ATTTTC----AATT---TTG--AC-TG--A-------------ATA--TA--T-CG--C-A----TTTTC-CCAA--T--GGG-G--ATTGA---------TCTC--A--A-----------AG-ACG-CTCT--T-------GT--AA------A--T-A--------T-A-TGGA-G-AAAATTC-AGCTG
gi|85769 : ATGTGTAG-A-AT--AA--G--AA-A-A--T-AT---A--TTTG-T-T-T-GATA-T-G---TTTT-AA-AACT-T-ATTTT-T---A---C---A--T------T-G--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATTAACT-G--GCGTG--ATATTTCATTACATA-A--TA--TGCG-AC-A-C-ATTTTC-GCAA--T--TTG-A--A---A---------G--------------------G------CC-T--T-------GT--AC------A--A-A--------T-A-T----G-AAAAACC-
gi|85770 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-A-T-T-T-GATA-T-G-A-TTT---A-AACG-T-A-------------------------------------------AC-TTT---------TT---T-G--AC--A--A-------------A-A--TA--A-TG-AC-A-ATTTTTTT-CCAA--A--TTG-A--AG--A---------GC-C--A-CA-----------AG-TCC-C--T--C-------GA--AA------A--A-A--------
gi|85771 : GTGTTA-ATAT--AAA-G--GC-AGA--T-AT---A---T-G-T-T-T-AATA-T---A-TTTT-GA-A-CTGT-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATT---G-T--AC-TG--G-------------A-A--AA-------AC-A-T-TTTTT
gi|85772 : TGTGA-C-CT--A---G--GC-A-AGTT-AT---G--AT-A-TCT-T-GATA-T-C-A-TTT--AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----T-G-AT-TTTT-CC-T-AGTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--ACCA-----------GG-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A---------------A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85773 : TGTAA-A-AT--AA--A--ATTA-A--T-GT---A--AT-G-T-T-A-GACA-C-C-A-TTCT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-ATTT-CC-C-AAAT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTATT-CCAA--T--TCC-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------CG-A-C-CG-T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--A-G-AAAATTT-A-CTG
gi|85774 : GTAA-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GTTA-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------C-A--A-A----TTG-AT-TTTT-CC-T-AATT---T-G--AT-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85775 : GTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T------------------T--ATG-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------G-T--G-A----TTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--C---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATG-A-CTG
gi|85776 : GA-A-ATT-AA--G--TT-A-A--T--T---AC-AT-G-T-----AATA-T-G-A-TTTT-AA-AGCT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----TT--AT-TTTT--C-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-TA-AC-A-A-TTTATC-CCAA--T--TTGAA--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATT-A-
gi|85777 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--A-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-G--A-T----TTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AA-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CT-----------GG-ACC-CT-TA-T-------G---AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-
gi|85778 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-T-A-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---GT--A--TTTTACTA-A--A-A----TTT-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-TG-AC-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-ACC-CT-T--C-------TT--CA------A--G-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85779 : A-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-A-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-AGAAA-------------A-A--TA--T-CGAACAA-A-TTTTTC-CCAAATT--CCG-A--A---A---------GT-C--A-CACTATATGACAGGG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------TAA-T--A-G-A
gi|85780 : -A-AT--AAA-G--GCTA-A--T-AT---ACCAT-G-T-T-T-GATA-T-GCA-TTTT-GA-AACT---A--TTAT---A---CG--AGAT------A-A--AGA----CTA-CC-TTTTTCC-CCAATT---C-GGAAC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-ACA-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACCGCT-T--T-------GT--AAAC----A--A-A--------TAA-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85781 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-TATA-T-G-A-TTTT-AA-AGCG-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTCTC-C--ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--C-CA-AC-ATT-TTTTTC-CTAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTG-AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AACAATC-A-CTGAT
gi|85782 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATATT-G-A-CTTT-AA-AATT-T-A--AT-T---T---CG--A--T------A-ATTA-AAAGTTTGAAT-TTTTTCA-C--ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AATTA--T-CG-AC-G-A-
gi|85783 : C-A-A--T-GT---A-------T-T-TAGATA-T-C-A-ATT---A-AA---T-A--TT---------CA--A--T------A-----------TTG-AT-TTTT-CA-C-AATT---T-G--AT-AA--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-T-TTCTTC----A--T--CAT-A--A---A---------GG-T--C-TA-----------GG--CT-CC-T--T-------AT--GA------A--A-A--------T-G-T--A-GAAAAAAAC-A-CTG
gi|85784 : TA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-C-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-AC---TTG----TTTTTCC-C-AATT---G-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-
gi|85785 : CT-A-A--TT-T---A---CC--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTTT-CT-C-AATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GTG-GT-T--T-------A---AA------A--A-A--------C-G----A-A-AAAAATC-A-CTG
gi|85786 : tatcattCT-A-A--TT-T---A---CC--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CTAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GGT-GG-TAGT-------TT--AA------A--A-A--------T---TGAA-A-AAAAATC-A-CTGGTa
gi|85787 : tatcattT-AA-AACT-T-C--TT-TTGAA---CA--G--T------T-G--A-A----TCG-AA-TTT--CCAC-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-G--TG--C-CT-AC-A-A-TGTTTA-CCAA--T--ACG-A--A---C---------AC-C--A-CA------------A-ACT-C--T--T-------GC--AA------AG-A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85788 : -A--TT-T---A---CT--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTTT-CG-C-AATT---T-G--AG-AA--A-------------A-A--TG--T-CG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G
gi|85789 : G--A--T------A-A--A------CTG-AT-TTTTCCCGC-AATT---A-T--AC-TG--ATATAGCTGGGT--A-A--TACTT-CGTAC-A---TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CAG----------GG-ACC-CT-T--TTTAGCGAGT--AGTTGAGCA--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85790 : TG-AT-TTTT-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-GG-AA-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---ACTTCAGAAAGC-CCTA-CATGTA-------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85791 : -TTTTTCC-C-AATT---T-GG-AC-TG--ATT-----------A-A--TA--T-CG-A--A-A-TTTTTC-CCAA--TAATAGCA--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85792 : a-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T---T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85793 : ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-T-TTTTTC-TTAA--T--TCA-A--A---G---------TT-C--A-CA-----------GG-ATC-C--T--T-------GT--AA------A------------------------AAAAATC-A-CTG
gi|85794 : --A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C-----T-------GT--AA------A--A-A----------G-T--A-A-GAAAATCAA-CTGa
gi|85795 : a--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AAAAATA-A-C
blockSeqs : G T TA AT TT T GT TAT CC T C TG A TG TT TGA ATA TT GA TTTACT CT AAGT TA TT A AAC GA AA TATTTCATTACAT T AA CT C C AT AA A AT TTG CTTCAGAAA CT CTATATGACAG TC AG TTAGCGA AA TTGAGC AG TTTTTTTT G GG
blockSeqs : . . TA AA . T . . C T A GC A T G . T . . A TT C T TT A A G G TATAGCTGGGT T AT C A T . . A . G . . TGTA T A . AA AC G ATTAT A GA
blockSeqs : . . G T . . . . . . . C . T . . . . . A . . T TT A . . . TT . A . T . . . C . . . . G T G . A . . G A .
blockSeqs : . . T A . . . . . . . C . T . . . . . . . . T TT G . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . A . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . C . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . A . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . C . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . C . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . C . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . C . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . A . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . G . A . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . C TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . T TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : TT
originalCons : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
finalCons : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
Alignments
lowQualScore : 11 11
lowQualScore : 1 1 44 55 11 2 1 11 1 111 22 2 1 1 1 2 1 333 1 11 0 0 0 22 0 111 222 11 11 444444 0 22 0 2222 0 22 99 3 0 222 0 11 0 11 8888888888888 1 22 11 0 2 0 1 0 0 11 11 2 11 222 333333333 0 11 0 66666666666 0 0 11 33 2222222 99 333333 11 0 88888888 2 0 22 0 0 0 0
lowQualScore : . . .. .. .. . . .. . ... .. . . . . . . ... . .. . . . .. . ... ... .. .. ...... . .. . .... . .. .. . . ... . .. . .. ............. . .. .. . . . . . . .. .. . .. ... ......... . .. . ........... . . .. .. ....... .. ...... .. . ........ . . .. . . . .
lowQualScore : 1 1 88 88 44 0 0 33 0 777 33 0 0 0 0 0 0 000 9 44 9 9 9 11 9 555 444 22 22 111111 9 33 9 7777 8 66 88 2 8 222 8 99 8 88 9999999999999 5 99 88 8 3 8 5 8 8 11 11 4 11 222 222222222 8 11 8 44444444444 8 8 99 66 7777777 66 555555 99 8 33333333 6 9 33 9 9 9 9
consensus : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
Reference ( family-363 ) : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85743 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CC--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--C--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85744 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-GTT-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG----------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85745 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85746 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--ATTG-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A---A--T-CA-AC-A-A--TTTTC-CCAA--T--TCGAA--A---A---------GC-C--A-CA------------G-ACC-TT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85747 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTT-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-G--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-GAAAATC-A-CTGGT
gi|85748 : ATGTG-GA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-C-A-TTT--GA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85749 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-T-A-TCTT-CA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----CTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AT------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGATa
gi|85750 : ATGTGTGA-A-AT--A---G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-TGT-GATA-T-C-A-TTTTGAA-AACT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------T-A--A-G----TTA-CTATTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AAATA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GGAACC-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85751 : ATGTGTGA-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-T-T-A-CTT--AA-AACA-T-A--TT-T---A---CG--A--C------A-A--A-A----CTG-AT-TTTC-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTT-C-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--G-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAATATC-A-CTG
gi|85752 : ATGTGTGA-A-AC--AAT-G--GC-A-A--T-AG---A--AT-G-T-T-T-GAAA-T-A-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----ATG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TG--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CGAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------AG-ACC-CT-T--T-------TT--AA------A--ATG--------T-A-T--A-A-AAAAATC-A-ATGGTa
gi|85753 : ATCTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATG-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---T---CG--A--T------A-A--A-G----TGG-AT-TTTT-CC-A-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTCC-CCAA--T--TCG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AG-------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85754 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-ATTT-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--C-------------A-A--TA--T-CG-AC-T-T-TTTTTC-CCAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85755 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GGTA-T-G-A-TTTC-AA-AACT-T-T--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTT--C-C-AATG---T-G--AC-TG--A-------------A-A--AA--T-TT-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GA-ACC-C--T--T-------GTAAAA------A--A-A--------T-A-C--A-G-AAAAATC-G-CTG
gi|85756 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---C--AT-G-T-T-T-AATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TAG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-G-TTTTCC-TTAA--T--TCA-A--A---A---------GA-C--A-CA-----------GG-GCC-C--T--T-------GC--AA------A--A-GATTAT---T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85757 : ATGTGCAA-A-AT--AAATG--G--A-A--T-AT---A--AT-T-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A--A-A----CTG-A--TTTTTCC-C-GTTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------CC-C--A-AA-----------AG-AAT-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85758 : ATGTGTAA-A-ATG-AA--G--AC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-A-C-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---CA--A--T------A-A------------------------C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AA-TA--T-CA-AT-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CG-----------GA-ACT-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------TGA-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85759 : ATGTGTAA-A-AT--AAAAG--GC-A-A--T-AT---A--GT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTAA-AA-AACT-T-A--AT-T---A---CG--A--TA-----A-A--A-A----TTG-AT-ATTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------T-A--TA--T-CA-AC---A-TTTTTT-CCAA--T--T-G-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC----T--T-------ATA-AA------A--A-A--------T-A-T--AGG-AAAAATC-G-ATGGTa
gi|85760 : ATATGTTT-A-AT--AA--G--GC-A-G--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----TTA-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-CA-AC-A-A-TTTTCC-C---------TG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GT--AA------A--A-A--------
gi|85761 : ATTTGCAA-A-TT--AA--A--TC-A-A--T-AA---A--CT-G-T-T----ATA-TTG-A-TTT---A-AACT-T-A--TT-G---A---CT--A--T------A-A--A-A----TTT-AT-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-ATTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--G-G-AAAAACC-A-CTG
gi|85762 : ATATGTAA-A-GC--AA--ATTGC-A-G--T-ATTATA--AT-G-T-T-T-TATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---AATATG--A--T------A-A--G-A----TTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GT-C--G-CA-----------GG-A---CT-T--T-------TT--AA------C--A-ATTTTTTTTT-T-T--A-G-AAAATTC-A-CTG
gi|85763 : ATGTGTGA-A--T--AA--G--GC-A-A--TTAT---A---T-G-T-T-TCGATA-T-G-A-TTTT-GAGAACT-T-AG-TT-T---AT--CG--A--T------A-ACTA-A----TTA--------TCG-C-AATTA--T-G--AC-TGG-A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTGC-TAGA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------GG---C-CT-T--T-------GT--AA------AAGA-A--------T-GTT--A-G-AGAAATC-A-ATGGT
gi|85764 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A-----G-T-T-A-AACT-T-A-A-TT-------AC----A--TG-T---A---CG--A--CA-----A-A--A-A----TTG-A--CATTTCT-C-ATTT---T-A--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-T-TTTTTC-ACAA--T--TGG-A--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85765 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-AATTTT-AA-GTC---------------------------------------A----TTG-AT-TTT--CCAC-AATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC-CT-T----------GT--AA------A--A-AA-------T-A-T--A-A-AGAAATC-C-CTG
gi|85766 : ATGTGTGA-A-A-------G--GC-A-T--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-AATTTT-AA-GTC---------------------------------------A----TTG-AT-TTT--CCAC-AATG---T-G--AT-TG--G-------------A-A--TA--T-CG-GT-A-A-CTTTTC-ACAA--T--TTG-T--A---A---------AA-C--G-CA-----------TG-ACC----T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-A-AGAAATC---CTG
gi|85767 : ATGTGTAAGA-AT--AA--A-----A-A--T-GT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-T-TTTT-AA-AACT------TT-T---A---CG-----T------T-G--A-A----TTG-AT-TTCTTCC-C-ATTT---T-G--AC-TG--A-------------ATA--TAC-T-CGCAC-A-C-TTTTTCGCCAA--T--TTG-GATA---A---------GC-C---------------------------T--T-------GC--TA------A--A-A--------T-A--------GAAAATC-A-CTG
gi|85768 : ATGTCTGA-A-AT--AAT-G--GC-A-A--T-AT---G--AT-G-T-G-T-TATA-T-G-A-TTT--AA-AACT-TTA--AT-T---A---CGTTA--T------ATA--A-A----TTG-AT-ATTTTC----AATT---TTG--AC-TG--A-------------ATA--TA--T-CG--C-A----TTTTC-CCAA--T--GGG-G--ATTGA---------TCTC--A--A-----------AG-ACG-CTCT--T-------GT--AA------A--T-A--------T-A-TGGA-G-AAAATTC-AGCTG
gi|85769 : ATGTGTAG-A-AT--AA--G--AA-A-A--T-AT---A--TTTG-T-T-T-GATA-T-G---TTTT-AA-AACT-T-ATTTT-T---A---C---A--T------T-G--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATTAACT-G--GCGTG--ATATTTCATTACATA-A--TA--TGCG-AC-A-C-ATTTTC-GCAA--T--TTG-A--A---A---------G--------------------G------CC-T--T-------GT--AC------A--A-A--------T-A-T----G-AAAAACC-
gi|85770 : ATGTGTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T-AT---A--AT-A-T-T-T-GATA-T-G-A-TTT---A-AACG-T-A-------------------------------------------AC-TTT---------TT---T-G--AC--A--A-------------A-A--TA--A-TG-AC-A-ATTTTTTT-CCAA--A--TTG-A--AG--A---------GC-C--A-CA-----------AG-TCC-C--T--C-------GA--AA------A--A-A--------
gi|85771 : GTGTTA-ATAT--AAA-G--GC-AGA--T-AT---A---T-G-T-T-T-AATA-T---A-TTTT-GA-A-CTGT-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATT---G-T--AC-TG--G-------------A-A--AA-------AC-A-T-TTTTT
gi|85772 : TGTGA-C-CT--A---G--GC-A-AGTT-AT---G--AT-A-TCT-T-GATA-T-C-A-TTT--AA-AACT-T-G--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----T-G-AT-TTTT-CC-T-AGTT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--ACCA-----------GG-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A---------------A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85773 : TGTAA-A-AT--AA--A--ATTA-A--T-GT---A--AT-G-T-T-A-GACA-C-C-A-TTCT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-ATTT-CC-C-AAAT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTATT-CCAA--T--TCC-A--A---A---------GC-C--A-TA-----------CG-A-C-CG-T--T-------GT--AA------A--A-AT-------T-A-T--A-G-AAAATTT-A-CTG
gi|85774 : GTAA-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GTTA-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------C-A--A-A----TTG-AT-TTTT-CC-T-AATT---T-G--AT-TG--A-------------A-A--TA--T-TG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85775 : GTAA-A-AT--AAA-G--GC-A-A--T------------------T--ATG-T-G-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------G-T--G-A----TTA-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--C---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATG-A-CTG
gi|85776 : GA-A-ATT-AA--G--TT-A-A--T--T---AC-AT-G-T-----AATA-T-G-A-TTTT-AA-AGCT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-A--A-A----TT--AT-TTTT--C-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--A-TA-AC-A-A-TTTATC-CCAA--T--TTGAA--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-A-C-CT-T--T-------GT--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATT-A-
gi|85777 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--A-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-G-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---TG--A--T------A-G--A-T----TTG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AA-TG--A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---A---------GC-C--A-CT-----------GG-ACC-CT-TA-T-------G---AA------A--A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-
gi|85778 : A-A-ATTAAA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-AATA-T-A-A-TTTT-AA-AACT-T-A--TT-T---A---GT--A--TTTTACTA-A--A-A----TTT-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-TG-AC-A-G-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GA-ACC-CT-T--C-------TT--CA------A--G-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGGT
gi|85779 : A-A-AT--AAA-G--GA-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATA-T-A-A-TTTT-AA-A-CT-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-A--TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-AGAAA-------------A-A--TA--T-CGAACAA-A-TTTTTC-CCAAATT--CCG-A--A---A---------GT-C--A-CACTATATGACAGGG-ACC-C--T--T-------GT--AA------A--A-A--------TAA-T--A-G-A
gi|85780 : -A-AT--AAA-G--GCTA-A--T-AT---ACCAT-G-T-T-T-GATA-T-GCA-TTTT-GA-AACT---A--TTAT---A---CG--AGAT------A-A--AGA----CTA-CC-TTTTTCC-CCAATT---C-GGAAC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AC-ACA-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACCGCT-T--T-------GT--AAAC----A--A-A--------TAA-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85781 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-TATA-T-G-A-TTTT-AA-AGCG-T-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-A----TTG-AT-TTTTCTC-C--ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--C-CA-AC-ATT-TTTTTC-CTAA--T--TTG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--T--T-------GTG-AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AACAATC-A-CTGAT
gi|85782 : --AA--G--GC-A-A--T-AT---A--AT-G-T-T-T-GATATT-G-A-CTTT-AA-AATT-T-A--AT-T---T---CG--A--T------A-ATTA-AAAGTTTGAAT-TTTTTCA-C--ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-AATTA--T-CG-AC-G-A-
gi|85783 : C-A-A--T-GT---A-------T-T-TAGATA-T-C-A-ATT---A-AA---T-A--TT---------CA--A--T------A-----------TTG-AT-TTTT-CA-C-AATT---T-G--AT-AA--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-T-TTCTTC----A--T--CAT-A--A---A---------GG-T--C-TA-----------GG--CT-CC-T--T-------AT--GA------A--A-A--------T-G-T--A-GAAAAAAAC-A-CTG
gi|85784 : TA-T-C-A-TTTT-GA-AACT-C-A--TT-T---A---CG--A--T------A-A--A-AC---TTG----TTTTTCC-C-AATT---G-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AT-A-
gi|85785 : CT-A-A--TT-T---A---CC--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTTT-CT-C-AATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GTG-GT-T--T-------A---AA------A--A-A--------C-G----A-A-AAAAATC-A-CTG
gi|85786 : tatcattCT-A-A--TT-T---A---CC--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTT-TCC-C-AATT---T-G--AG-GA--A-------------A-A--TG--T-TG-CT-A-A-TTTTTC-CTAA--T--TCA-A--A---G---------G-------GA-----------GG-GGT-GG-TAGT-------TT--AA------A--A-A--------T---TGAA-A-AAAAATC-A-CTGGTa
gi|85787 : tatcattT-AA-AACT-T-C--TT-TTGAA---CA--G--T------T-G--A-A----TCG-AA-TTT--CCAC-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-G--TG--C-CT-AC-A-A-TGTTTA-CCAA--T--ACG-A--A---C---------AC-C--A-CA------------A-ACT-C--T--T-------GC--AA------AG-A-A--------T-G-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85788 : -A--TT-T---A---CT--A--C------A-A--A-------TG-AT-TTTT-CG-C-AATT---T-G--AG-AA--A-------------A-A--TG--T-CG-CT-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCA-A--A---G---------G
gi|85789 : G--A--T------A-A--A------CTG-AT-TTTTCCCGC-AATT---A-T--AC-TG--ATATAGCTGGGT--A-A--TACTT-CGTAC-A---TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CAG----------GG-ACC-CT-T--TTTAGCGAGT--AGTTGAGCA--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTGAT
gi|85790 : TG-AT-TTTT-CC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-GG-AA-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TTG-A--A---ACTTCAGAAAGC-CCTA-CATGTA-------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-C
gi|85791 : -TTTTTCC-C-AATT---T-GG-AC-TG--ATT-----------A-A--TA--T-CG-A--A-A-TTTTTC-CCAA--TAATAGCA--G---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C--A--T-------GTA-AA------A--A-A--------T-A-T--A-G-AAAAATC-A-CTG
gi|85792 : a-TTTTTCC-C-AATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TT--T-CG-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-TG-T-------GA--AA------A--A-A--------T---T--A-G-AAAAATC-A-CTGa
gi|85793 : ATT---T-G--AC-TG--A-------------A-A--TA--T-CG-AA-A-T-TTTTTC-TTAA--T--TCA-A--A---G---------TT-C--A-CA-----------GG-ATC-C--T--T-------GT--AA------A------------------------AAAAATC-A-CTG
gi|85794 : --A-------------A-A--TA--T-CA-AC-A-A-TTTTTC-CCAA--T--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-C-----T-------GT--AA------A--A-A----------G-T--A-A-GAAAATCAA-CTGa
gi|85795 : a--TCG-A--A---A---------GC-C--A-CA-----------GG-ACC-CT-T--T-------TA--AA------A--A-A--------T-A-T--T-G-AAAAATA-A-C