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lowQualScore                  :     .. .     ....   .  .  . . ...  ..  .. ... . . ...  .  . ..  ... .. ...... . .. .   .... . ... ............ ..  .   . ..... ... . . .  ..... .. ..  . .   .. . .. . .. .. ..  ........ ... ......... . . .. ..... . ....... ..........   . .. .... ... .. .. .. . . ...  ..  .. ....  .  . .  . .... .  . . ..  . . . . . ..   .  .. .  .  .. .  . .. .... . .    
lowQualScore                  :     99 2     7777   1  1  1 3 222  55  66 999 1 1 777  1  1 00  888 55 111111 2 44 0   0000 0 777 000000000000 33  0   0 88888 444 0 0 0  22222 33 33  9 0   33 0 33 0 22 11 22  55555555 666 999999999 9 9 11 33333 7 9999999 0000000000   9 00 8888 666 11 11 33 9 9 444  99  11 0000  8  5 9  8 8888 8  7 7 11  7 7 7 9 7 00   9  99 9  9  11 9  8 55 9999 0 0    
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Reference ( gi|20971 )        : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-CG-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---G------------C--CA-TTT-T-----G---T-A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T----CG-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T-A-C-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20974                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CG--TTA-A---C-G-A---AG-CG-A--TT---A--A------G-T--A-TGG----A-A---G------------C--CA-TTT-T-----G---T-A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T----CG-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T-A-CAA--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20972                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---C-G-A---AG-CG-G--TT---A--A------T-C--A-TGG----A-A---G------------C--CA-TTT-T-----G---T-A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T----CT-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T-A-C-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|20975                      : AAAT--G-CAAAA--A-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-CG-G--TT---G--A------C-T--A-TGG----A-A---G------------C--CA-TTT-T-----G---T-A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---GTATAGCTACT-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T----C--TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T-A-C-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20976                      : AAAT--G-CAAAA--A-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-CG-G--TT---G--A------C-T--A-TGG----A-A---G------------C--CA-TTT-T-----G---T-A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---GTATAGCTACT-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-CAAC-G-G---CT--TG--T----CG-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T-A-C-A---TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-TAACATat
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Reference ( family-361 )      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-NC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20971                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20972                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------T-C--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----T-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20973                      : AAAT--G-CAAAA-GA-TTA-A--GA-T-T---CA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------CATCAA-TGGA---A-A---GC--CA--TT-T-----G---T------------ACT-CCCCATGC--A--TCTT-GTT--C-T--T-G--A--C--A---------G---G---------T-A-TA-A-----T-T-------G----------TCT-C--A----G---G--TA-T-CC-G-G---CT--TG--T--C----C-T--C-AA-T----CAAA-A-T--GCGC-T--AC-A----T-TT--C-TCATG--C-AG-T--A----G---ACATat
gi|20974                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CG--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-A--TT---A--A------G-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--ACAA--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20975                      : AAAT--G-CAAAA--A-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---G--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---GTATAGCTACT-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C------TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|20976                      : AAAT--G-CAAAA--A-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---G--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---GTATAGCTACT-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-CAAC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A---TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-TAACATat
gi|20977                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---AA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-A--TT---A--A------T-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AT--------G---A---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TT-C-AC-G-G---CT--TC--T--C----G-TC-T-AA-T----A-AA-A-T--TT-C-T--CC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20978                      : AAAT--G-CAAAA-A--GAA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGT----A-A---TC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T---------------------T--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------A----------TCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20979                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-TT-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--C------C-T--A-TAGTTCTA-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----T--A--TG-T-ATT--C-T--T-G--A--G--AG--------G---G---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--CG--T--C----A-TC-C-TA-T----C-AA-A-G--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T-GCAT
gi|20980                      : AAAT--G-CAAAA-A--GTA-AC-GA-T-T---CA--TT--G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GCA-CA-TTT-T-----G---T------------A-T--C-----C--A--TC-T-ATT--C----T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A--------G--TA-C-CC-G-G----T--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-TGCGC-C-T--AC-A--TTT-TT--T-CC-TG--C-AG-T--A----GAT-ACATat
gi|20981                      : AAAT----CAAAA-TA--TA-AC--A-T-T---C---TTA-A---C-G-A---AG-C--G----TT---A--AG-----C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--AC----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-GC--CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-C--A----G-TAACATa
gi|20982                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-ACAGA-T-T----G--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CATTTT-T-----GT--T------------A-C-CC-----A--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A-----AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G-----------CT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C--A-T----C-CA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TTC-C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-gt
gi|20983                      : AAAT--G-CAAAA-AG-GTA-AC-GA-T-TT--CG--TTA-A---C---A---AG-C--G-A--TT---A--A------C-TG-A-TGG----A-G---AC--CA-TTT-TTTTTTG---T------------A-T-CC--------A--TC-T--TT--C-T--T-G-----C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-CTAA----T---G--TA-C-A--G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AAAT----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20984                      : AAAT--G-CAAAA-AG-TTA-GC-GA-T-TT--CC--TTA-A---C-G-A---TG-C--G-G--TT---A--A------C-A--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-G-----T---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CAT-C--A--------G--TT-C-CC-G-G---CC--TA--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TGC-C-AG-T--A----G-T-a
gi|20985                      : AAAT--G-CCAAA-AGCGTA-AC-GAAT-T---CA--TT--A---C-G-ACTGAGAC--G-G--TT---A--A------C-TT-A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---TT-----------A-T-CCGC---C--A--TC-T-AT---A-T--T-G--AG-C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------GG---------CCT-C--AA---T---G--TATC-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TCGC-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG----AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20986                      : AGAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-AA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TA---A--A------C-G--A-TGG----A-A---GA--CA-TTT-T-----G---TATCCCATTTTGTA-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------A---GTAGATC---T-A-T--A-----T-T-------G----------TCC-C--A----T---G--TA-A-CC-G-G---CT--TT--T--C----A-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-T-T--GT-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T-ACATa
gi|20987                      : AAAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-TCTCCA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-GT-TT---A--A------CTT--ATTGG----A-A---GCCGCA-TTT-T-----G---T------------A-T-CA-----C--A--TC-T--TT--C-T--T-G--A--CAAAG--------G---A---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TC-T-AC-C-G----T--TG--T--T----G-GC-C-AA-T----C-AATA-T--GC-C-TA-AC-AG-TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--ATACTG-T-ACAT
gi|20988                      : AATT--G-CAAAA-AC-ATA-AG-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG---------------------------------------------C--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----C--A--TA-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------C-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---A--TT-T-CC-G-G---CTTGTG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-C-T--TC-ATTTTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|20989                      : AATT--G-CAAAA-AC-ATA-AG-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG---------------------------------------------C--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----C--A--TA-T-ATT--C-T--T-G--A--C--
gi|20990                      : AAAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTA-A---C-G-A---AG-C--A-G--TT---A--A------C-C--A-TGA----A-A---GC--CA-TTT-T-----A---T------------A-T-TC-----C--A--TC-G-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-T-------T----------TCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-T
gi|20991                      : AAATT-G-CAAAA-AA--TA-A--GA-T-T---AA--TTA-A---C-A-A---TG-C--G-GC-TT---A--A-------------TAG----ACA---GC---A-TTT-T-----G---T--------------T-CC-----C--A--TC-A-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-TA-A-----T-G-------G----------CCT----A----T---G--TT-C-CC-G-G---CTC-TG--T--C----G-TCGC-AA-T----CAAA-A-T--GC-T-T--GC-----TT-TT--CATC-TG--C-TGCT--A----G-T-TCA
gi|20992                      : AAATTGG-CCAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---AT--TTT-A---C-G-A---AA-C--G-A--CT---A--A------C-T--A-TGG----A-AAATG---CA-TTT-CG----G---T------------A-T-AC-----C--A--TC-T-AAT--CTT--T-T--A--C--AG--------G---G---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCC-CA-A----T---G--TA-T-CC-G-G---TT--TG--T---------TC-A-AA-T----C-AA-A-T--GC-T-T--GCTAT-TTT-TT--C-TC-TAC-C-AG-T--G----G-T-ACA
gi|20993                      : AACT--G-CAAAA-A--GTA-AC-GA-T-T---CG--TTC-AA--CAG-A---AG-C--G-GGTTT---A--AAAAAACCAT--A-TGG----A-AA--GC--CA-TTT-T-----GGACT------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-GC-A--C--AG--------GGTAG---------T-A-T--A-----C-G-------GTCTATAGATACCT-C--A----T---G--TA-CGAG-G-G---CT--TG-----C----G-TCAC-AA-T----T-CA-A-T--GC-CTT--AC-A--TTT-TT--C-TC-TGGACAAG-TTGA----A-T-ACAT
gi|20994                      : AAAT--G--AAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-AATCT---G--C------C-T--A-TGA----ATA---G---CA-TTT-T---------T------------A-T-CC-----C--ATCTC-T-ATT--C-T--T-G--AG-C--AA--------G---G---------TAA-T--A-----T-T-------G----------CCC-CA-A----A---G--TA-C-AC-G-G---CTG-TG--T--A----G-CT-C-AA-T------AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--at
gi|20995                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-GA-AA-T-T---TAACTTT-A---C-G-A---GT-CAGA-G--TT---G--A------CGT--A-TAA----A-A---GC--CA-TTTCT-----G---T------------A-T-CC-----C--A---C-T-ATT--C-T--T-GGTA--CT-AG--------G---G---------T-A-TCGA-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-CC-A------C--TG--TCCC----G-TC-CTAA-T----C-AA-A-T--GC-C-
gi|20996                      : AAAT--GGCAAAA-AA-GTACAC-GA-T-C---AG--TTA-A---C-GGA---AG-C--G-A--GT---AGAA------C-G--A--GG----A-A---GG--CA-TTT-TAT---G---T------------ACT-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--TAG--AG-C--AG--------G-------------T-A-T--------T-GC------G----------CTTTC--A--------G--TA-C-AC-G-----CTG-TG--T--C----G-TC-A-AT-T----C-AA-A-T--GCAC-TA-GC-A---TT-TT--C-TC-GA--C-AG-TACA----G-T-ACAT
gi|20997                      : AAAT--G-CAAAATGG-GTA-AC-G--T-T---CA--TCT-ATAGC-G-A---AG-C--G-G--TTTCTA--A------CAT--A-TGA----A-C---GC--CA-TTT-C-----G---TC-----------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-CTGT-G--AGTC--AGGGAAAGACG---G---------T-A-C--ATTTTTT-GGAAAATTG----------CCT-T--AAGTTT---G--GG-C-AT-G-GTCCCT--TGGCT--CTGGCG-TC-C-AA------C-GA-A-T--GT-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--T--G-T--A----G-T-ACA
gi|20998                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-A-A---AG-C--A-G--TT---A--T------C-T--A-TGG----A-C---GC--CA-ACT-T-----G---
gi|20999                      :  AAT--G-CAAAA-TA--TA-AC--A-T-T---CC--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--CT---A--A------C-TT-A-TGG----A-AA--GC--CA-TTT-------G---T------------A-TGCC-----C--A--TC-TTATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G-------------T-A-T--A-----TTG-------G----------CCT-C--A----TCGAG---A-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-TC---C-AA-A-T--G--C-T--AC-A--TTT-TTTCT-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACA
gi|21000                      :  AAT--G-CAAAA-C--GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---GG-C----G--TT---G--A------CAT--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A---TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATatat
gi|21001                      :  AAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--G------C-T--A-TGG----A-A---GC--CC-TTT-T-----G---T------------A-T-CG-----C--A--TT-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---A---------T-A-C--A-----T-G-------a
gi|21002                      :   AT--G-CAAAAAAA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---T-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------A----------TCT-C--A----T---G--TA-C-TC-G-T---TT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--AC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-GCGTat
gi|21003                      :    T--G-CAAAA-AA-ATA-AC-GA-TAT---AA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGA----C-A---GC--CA-TTT-T-----GA--T------------A-T-CC-----C--A--TT-A-ATT--C-T--T-G--A--C--GG--------G---G---------T---T--AAG---T-G-------G----------C---T--A----T---G--TT-C-CC-G-G---TC--TG--T--C----G-TCGC-AA-T----C-AA-A-T--CC-T-T--GC-----TT-TT--C-TC-TG--C-TGCT--A----G-T-at
gi|21004                      :     --G-CTAAA-AA-GTA-A--GA-T-T---TA--TTT-A---C-A-A---AG-C--G-G--CT---A--A------T-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----CTCA--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----C---A--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----A-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--
gi|21005                      :        -CAAAA-AC-GTA-AC-GA-TGT---CA--TTTTA---C-G-A---GGGC--G-G--TT---A--A------C-T--AATGG----A-A---GC---A-TTT-T-----GATTC------------A-TTCC-----C--A--TCAT-ATTATC-T--T-------C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---GCTCA-C-AC-G-C---TT--TG--T--C----GTTC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-CTT--AC-A--TTT-TT--T-TC-T
gi|21006                      :           AAA-AA-GGA-AC-GA-T-T---TT--TTTTA---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--CC-A-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21007                      :                               ---CA--TTT-A---C-G-A---AA-C--G-G--TT---AT-A------TAT--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CCATCTAC--A--TTGT-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----TAG-------G----------TCT-T--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TT--T--C----G-CC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-AT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T--CATat
gi|21008                      :                                   A--TTT-A---A-G-A---AG-C--G-G--TT---A--T------C-T--A-TGG----A-A---AT--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--G--C--AA--------G---G---------T-A-C--A-----A-G-------G----------GTT-C--G----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--AC-C-T--GT-A--ATT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATatt
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Reference ( family-361 )      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-NC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
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gi|20976                      : AAAT--G-CAAAA--A-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---G--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---GTATAGCTACT-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-CAAC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A---TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-TAACATat
gi|20977                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---AA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-A--TT---A--A------T-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AT--------G---A---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TT-C-AC-G-G---CT--TC--T--C----G-TC-T-AA-T----A-AA-A-T--TT-C-T--CC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20978                      : AAAT--G-CAAAA-A--GAA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGT----A-A---TC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T---------------------T--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------A----------TCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20979                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-TT-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--C------C-T--A-TAGTTCTA-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----T--A--TG-T-ATT--C-T--T-G--A--G--AG--------G---G---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--CG--T--C----A-TC-C-TA-T----C-AA-A-G--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T-GCAT
gi|20980                      : AAAT--G-CAAAA-A--GTA-AC-GA-T-T---CA--TT--G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GCA-CA-TTT-T-----G---T------------A-T--C-----C--A--TC-T-ATT--C----T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A--------G--TA-C-CC-G-G----T--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-TGCGC-C-T--AC-A--TTT-TT--T-CC-TG--C-AG-T--A----GAT-ACATat
gi|20981                      : AAAT----CAAAA-TA--TA-AC--A-T-T---C---TTA-A---C-G-A---AG-C--G----TT---A--AG-----C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--AC----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-GC--CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-C--A----G-TAACATa
gi|20982                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-ACAGA-T-T----G--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CATTTT-T-----GT--T------------A-C-CC-----A--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A-----AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G-----------CT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C--A-T----C-CA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TTC-C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-gt
gi|20983                      : AAAT--G-CAAAA-AG-GTA-AC-GA-T-TT--CG--TTA-A---C---A---AG-C--G-A--TT---A--A------C-TG-A-TGG----A-G---AC--CA-TTT-TTTTTTG---T------------A-T-CC--------A--TC-T--TT--C-T--T-G-----C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-CTAA----T---G--TA-C-A--G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AAAT----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20984                      : AAAT--G-CAAAA-AG-TTA-GC-GA-T-TT--CC--TTA-A---C-G-A---TG-C--G-G--TT---A--A------C-A--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-G-----T---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CAT-C--A--------G--TT-C-CC-G-G---CC--TA--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TGC-C-AG-T--A----G-T-a
gi|20985                      : AAAT--G-CCAAA-AGCGTA-AC-GAAT-T---CA--TT--A---C-G-ACTGAGAC--G-G--TT---A--A------C-TT-A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---TT-----------A-T-CCGC---C--A--TC-T-AT---A-T--T-G--AG-C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------GG---------CCT-C--AA---T---G--TATC-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TCGC-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG----AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20986                      : AGAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-AA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TA---A--A------C-G--A-TGG----A-A---GA--CA-TTT-T-----G---TATCCCATTTTGTA-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------A---GTAGATC---T-A-T--A-----T-T-------G----------TCC-C--A----T---G--TA-A-CC-G-G---CT--TT--T--C----A-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-T-T--GT-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T-ACATa
gi|20987                      : AAAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-TCTCCA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-GT-TT---A--A------CTT--ATTGG----A-A---GCCGCA-TTT-T-----G---T------------A-T-CA-----C--A--TC-T--TT--C-T--T-G--A--CAAAG--------G---A---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TC-T-AC-C-G----T--TG--T--T----G-GC-C-AA-T----C-AATA-T--GC-C-TA-AC-AG-TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--ATACTG-T-ACAT
gi|20988                      : AATT--G-CAAAA-AC-ATA-AG-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG---------------------------------------------C--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----C--A--TA-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------C-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---A--TT-T-CC-G-G---CTTGTG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-C-T--TC-ATTTTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|20989                      : AATT--G-CAAAA-AC-ATA-AG-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG---------------------------------------------C--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----C--A--TA-T-ATT--C-T--T-G--A--C--
gi|20990                      : AAAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTA-A---C-G-A---AG-C--A-G--TT---A--A------C-C--A-TGA----A-A---GC--CA-TTT-T-----A---T------------A-T-TC-----C--A--TC-G-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-T-------T----------TCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-T
gi|20991                      : AAATT-G-CAAAA-AA--TA-A--GA-T-T---AA--TTA-A---C-A-A---TG-C--G-GC-TT---A--A-------------TAG----ACA---GC---A-TTT-T-----G---T--------------T-CC-----C--A--TC-A-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-TA-A-----T-G-------G----------CCT----A----T---G--TT-C-CC-G-G---CTC-TG--T--C----G-TCGC-AA-T----CAAA-A-T--GC-T-T--GC-----TT-TT--CATC-TG--C-TGCT--A----G-T-TCA
gi|20992                      : AAATTGG-CCAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---AT--TTT-A---C-G-A---AA-C--G-A--CT---A--A------C-T--A-TGG----A-AAATG---CA-TTT-CG----G---T------------A-T-AC-----C--A--TC-T-AAT--CTT--T-T--A--C--AG--------G---G---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCC-CA-A----T---G--TA-T-CC-G-G---TT--TG--T---------TC-A-AA-T----C-AA-A-T--GC-T-T--GCTAT-TTT-TT--C-TC-TAC-C-AG-T--G----G-T-ACA
gi|20993                      : AACT--G-CAAAA-A--GTA-AC-GA-T-T---CG--TTC-AA--CAG-A---AG-C--G-GGTTT---A--AAAAAACCAT--A-TGG----A-AA--GC--CA-TTT-T-----GGACT------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-GC-A--C--AG--------GGTAG---------T-A-T--A-----C-G-------GTCTATAGATACCT-C--A----T---G--TA-CGAG-G-G---CT--TG-----C----G-TCAC-AA-T----T-CA-A-T--GC-CTT--AC-A--TTT-TT--C-TC-TGGACAAG-TTGA----A-T-ACAT
gi|20994                      : AAAT--G--AAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-AATCT---G--C------C-T--A-TGA----ATA---G---CA-TTT-T---------T------------A-T-CC-----C--ATCTC-T-ATT--C-T--T-G--AG-C--AA--------G---G---------TAA-T--A-----T-T-------G----------CCC-CA-A----A---G--TA-C-AC-G-G---CTG-TG--T--A----G-CT-C-AA-T------AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--at
gi|20995                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-GA-AA-T-T---TAACTTT-A---C-G-A---GT-CAGA-G--TT---G--A------CGT--A-TAA----A-A---GC--CA-TTTCT-----G---T------------A-T-CC-----C--A---C-T-ATT--C-T--T-GGTA--CT-AG--------G---G---------T-A-TCGA-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-CC-A------C--TG--TCCC----G-TC-CTAA-T----C-AA-A-T--GC-C-
gi|20996                      : AAAT--GGCAAAA-AA-GTACAC-GA-T-C---AG--TTA-A---C-GGA---AG-C--G-A--GT---AGAA------C-G--A--GG----A-A---GG--CA-TTT-TAT---G---T------------ACT-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--TAG--AG-C--AG--------G-------------T-A-T--------T-GC------G----------CTTTC--A--------G--TA-C-AC-G-----CTG-TG--T--C----G-TC-A-AT-T----C-AA-A-T--GCAC-TA-GC-A---TT-TT--C-TC-GA--C-AG-TACA----G-T-ACAT
gi|20997                      : AAAT--G-CAAAATGG-GTA-AC-G--T-T---CA--TCT-ATAGC-G-A---AG-C--G-G--TTTCTA--A------CAT--A-TGA----A-C---GC--CA-TTT-C-----G---TC-----------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-CTGT-G--AGTC--AGGGAAAGACG---G---------T-A-C--ATTTTTT-GGAAAATTG----------CCT-T--AAGTTT---G--GG-C-AT-G-GTCCCT--TGGCT--CTGGCG-TC-C-AA------C-GA-A-T--GT-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--T--G-T--A----G-T-ACA
gi|20998                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-A-A---AG-C--A-G--TT---A--T------C-T--A-TGG----A-C---GC--CA-ACT-T-----G---
gi|20999                      :  AAT--G-CAAAA-TA--TA-AC--A-T-T---CC--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--CT---A--A------C-TT-A-TGG----A-AA--GC--CA-TTT-------G---T------------A-TGCC-----C--A--TC-TTATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G-------------T-A-T--A-----TTG-------G----------CCT-C--A----TCGAG---A-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-TC---C-AA-A-T--G--C-T--AC-A--TTT-TTTCT-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACA
gi|21000                      :  AAT--G-CAAAA-C--GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---GG-C----G--TT---G--A------CAT--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A---TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATatat
gi|21001                      :  AAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--G------C-T--A-TGG----A-A---GC--CC-TTT-T-----G---T------------A-T-CG-----C--A--TT-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---A---------T-A-C--A-----T-G-------a
gi|21002                      :   AT--G-CAAAAAAA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---T-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------A----------TCT-C--A----T---G--TA-C-TC-G-T---TT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--AC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-GCGTat
gi|21003                      :    T--G-CAAAA-AA-ATA-AC-GA-TAT---AA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGA----C-A---GC--CA-TTT-T-----GA--T------------A-T-CC-----C--A--TT-A-ATT--C-T--T-G--A--C--GG--------G---G---------T---T--AAG---T-G-------G----------C---T--A----T---G--TT-C-CC-G-G---TC--TG--T--C----G-TCGC-AA-T----C-AA-A-T--CC-T-T--GC-----TT-TT--C-TC-TG--C-TGCT--A----G-T-at
gi|21004                      :     --G-CTAAA-AA-GTA-A--GA-T-T---TA--TTT-A---C-A-A---AG-C--G-G--CT---A--A------T-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----CTCA--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----C---A--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----A-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--
gi|21005                      :        -CAAAA-AC-GTA-AC-GA-TGT---CA--TTTTA---C-G-A---GGGC--G-G--TT---A--A------C-T--AATGG----A-A---GC---A-TTT-T-----GATTC------------A-TTCC-----C--A--TCAT-ATTATC-T--T-------C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---GCTCA-C-AC-G-C---TT--TG--T--C----GTTC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-CTT--AC-A--TTT-TT--T-TC-T
gi|21006                      :           AAA-AA-GGA-AC-GA-T-T---TT--TTTTA---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--CC-A-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21007                      :                               ---CA--TTT-A---C-G-A---AA-C--G-G--TT---AT-A------TAT--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CCATCTAC--A--TTGT-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----TAG-------G----------TCT-T--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TT--T--C----G-CC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-AT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T--CATat
gi|21008                      :                                   A--TTT-A---A-G-A---AG-C--G-G--TT---A--T------C-T--A-TGG----A-A---AT--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--G--C--AA--------G---G---------T-A-C--A-----A-G-------G----------GTT-C--G----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--AC-C-T--GT-A--ATT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATatt
gi|21009                      :                                           ---C-G-A---AG-C--GCG--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CG-----C--A---C-T-ATT--C-T--T----A--C--AT--------G-------------T-A-C--A-----T-G-------G----------TTT-G--A----T---G--TA-C--C-G-G---CT--TT--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GT-A--ATT-GG--T-TC-TG--C-AG-T--A----G-A-AC
gi|21010                      :                                                                                 -T--A-TGT----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT----T--T-A--A--C--AG--------G---G---------C-T-T--A-----C-G-------G----------CCT-C--T----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21011                      :                                                                                   --A-TCG----A-A---AC--TA-TTT-------G---T------------A-T-CC--------A--T----ATT----T--T-G--G--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------ACT-C--A----T---T--T--C-CC-G-G---CT--CG--TG-C----C-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-TA-GC----TTT-TC--C-TC-TA--C-AG-T--A----G-
gi|21012                      :                                                                                      -TGG----A-A---AC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TT-G-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-C-T--GC-A--TGT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21013                      :                                                                                                                          ------------A-T-CC-----C--A--TT-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-------------------------------TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|21014                      :                                                                                                                                                         -T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--AT----T-G-------G----------GCT-C--A----T---G--TA-C-AC-GCG---C---TG--T--C----GCTC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-TG-GC-A--TTTATT--C-TC-TG--C-AG-T--A----a
gi|21015                      :                                                                                                                                                                         --A--T--AG--------G---G---------T-AGT--A-----A-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-ACGG-G---CT--TGT-T--C----G-TCGC-AA-T----C-AACA-T---C-C-T--AC-ATTTTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----
gi|21016                      :                                                                                                                                                                                            ---G---------T-A-T--A-----T-A-------G----------CCT-C--A----T---T--T--C-CC-G-A---AT--TG--T--C----G-TCAC-AGCT----C-AA-ACT--GC-C-T--AG-A--TTT-TTT-C-TC-TG--T-AG-T--A----G-aaagtaaacatat
gi|21017                      :                                                                                                                                                                                                ---------T-A-T--A-----TTG-------G----------CTT-C--G----T---A--TT-T-CC-G-G---CT--AG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--TC-C-CTAGC----TTT-TT--A-TC-TG--C-AG-T--A----G-A-ACAT
gi|21018                      :                                                                                                                                                                                                                                            CT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-TCAATC-AA-A-T--GC-C-T--GT-A--TTT-TT--G-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21019                      :                                                                                                                                                                                                                                            tT-C--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----A-TT-T-AA-T----C-GT-A-T--GC-C-T--GT-A--TTT-TT----TC-TG--A-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|21020                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tt-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--T-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21021                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TT-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|21022                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TT-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATgt
gi|21023                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat


blockSeqs                     :     TG G     T GC   C  A  A A CTC  AC  TT TAG A G CTG  A AG C GT  TCT GA AAAAAC A CA T   TTCT C AAT  CG        TTTTT GAC ATCCCATTTTGT C G  CCATG TC TC  T     AT   TG   GT GT AA  GGAAAGAC GTA TATAGCTAC     CG TTTTT T GAAAATT TCTATAGATA     TA AGTT CGA CT AT AA     TCC  TG  GC CC TGGC T  G    A CAAT A  T   GC  G T TA  A TT      TC       GA    C TG TACT   A
blockSeqs                     :     T  .     A A    .  .  . G T    .   TT A   . . .    G .  . AT  .   T  G      T G  A   A    T A    A         AT    ATT T            C T  ATCTA .  .   A     .    .    C  G  T   .        .   TATAGCTAC     A  AG    A C       G              A  A    .   .  A  GA     C    C   T  G  .    C  G    C C    A  C   .   A T A   T TT      C        C     C AC .      A
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . T    .   T  .   . . .    . .  . T   .   .  .      A T  .   .    . A    .         G     T   C            . .  GC    .  .   G     .    .    .  G  .   .        .   TAGATC        A  C     T .       .              A  .    .   .  A  C      .    G   .  .  .    .  A    . .    .  .   .   . . A   . G       T        C     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . C   .   .  .      G T  .   .    . .    .         .     A   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  G  .   .        .   .             .  T     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    G   .  .  .    .  G    . .    .  .   .   . . A   . T       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      A .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  G    . .    .  .   .   . . G   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      A .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  A    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      A .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . G    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . G    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . C    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . C    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  C  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   C  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . G    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  G  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  T      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . C    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . A    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . .    .  .  . . .    .   A  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :     .  .     . .    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :        .     . .    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :              . .    .  .  . . .    .   T  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :                               .    .   .  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :                                    .   .  .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :                                           .   . . .    . .  . .   .   .  .      . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  T  C      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
blockSeqs                     :                                                                                 . .  .   .    . .    .         .     .   .            . .  .     .  .   .     .    .    .  .  .   .        .   .             .  .     . .       .              .  .    .   .  A  A      .    .   .  .  .    .  .    . .    .  .   .   . . .   . .       .        .     . .  .      .
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lowQualScore                  :     .. .     . ..   .  .  . . ...  ..  .. ... . . ...  . .. . ..  ... .. ...... . .. .   .... . ...  ..  .   . ..... ... ............ . .  ..... .. ..  . .   .. . .. . .. .. ..  ........ ... ......... . . .. ..... . ....... ..........   . .. .... ... .. .. .. . . ...  ..  .. .. .... .  . .  . .... .  . . ..  . . ..  . ..   .  .. .  .  .. .  . .. .... . .    
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Reference ( family-361 )      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-NC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
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gi|20977                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---AA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-A--TT---A--A------T-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AT--------G---A---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TT-C-AC-G-G---CT--TC--T--C----G-TC-T-AA-T----A-AA-A-T--TT-C-T--CC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20978                      : AAAT--G-CAAAA-A--GAA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGT----A-A---TC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T---------------------T--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------A----------TCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|20979                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-TT-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--C------C-T--A-TAGTTCTA-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----T--A--TG-T-ATT--C-T--T-G--A--G--AG--------G---G---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--CG--T--C----A-TC-C-TA-T----C-AA-A-G--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T-GCAT
gi|20980                      : AAAT--G-CAAAA-A--GTA-AC-GA-T-T---CA--TT--G---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GCA-CA-TTT-T-----G---T------------A-T--C-----C--A--TC-T-ATT--C----T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A--------G--TA-C-CC-G-G----T--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-TGCGC-C-T--AC-A--TTT-TT--T-CC-TG--C-AG-T--A----GAT-ACATat
gi|20981                      : AAAT----CAAAA-TA--TA-AC--A-T-T---C---TTA-A---C-G-A---AG-C--G----TT---A--AG-----C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--AC----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-GC--CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-C--A----G-TAACATa
gi|20982                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-ACAGA-T-T----G--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CATTTT-T-----GT--T------------A-C-CC-----A--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A-----AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G-----------CT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C--A-T----C-CA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TTC-C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-gt
gi|20983                      : AAAT--G-CAAAA-AG-GTA-AC-GA-T-TT--CG--TTA-A---C---A---AG-C--G-A--TT---A--A------C-TG-A-TGG----A-G---AC--CA-TTT-TTTTTTG---T------------A-T-CC--------A--TC-T--TT--C-T--T-G-----C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-CTAA----T---G--TA-C-A--G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AAAT----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20984                      : AAAT--G-CAAAA-AG-TTA-GC-GA-T-TT--CC--TTA-A---C-G-A---TG-C--G-G--TT---A--A------C-A--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-G-----T---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CAT-C--A--------G--TT-C-CC-G-G---CC--TA--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TGC-C-AG-T--A----G-T-a
gi|20985                      : AAAT--G-CCAAA-AGCGTA-AC-GAAT-T---CA--TT--A---C-G-ACTGAGAC--G-G--TT---A--A------C-TT-A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---TT-----------A-T-CCGC---C--A--TC-T-AT---A-T--T-G--AG-C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------GG---------CCT-C--AA---T---G--TATC-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TCGC-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG----AG-T--A----G-T-ACAT
gi|20986                      : AGAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-AA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-G--TA---A--A------C-G--A-TGG----A-A---GA--CA-TTT-T-----G---TATCCCATTTTGTA-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------A---GTAGATC---T-A-T--A-----T-T-------G----------TCC-C--A----T---G--TA-A-CC-G-G---CT--TT--T--C----A-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-T-T--GT-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T-ACATa
gi|20987                      : AAAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-TCTCCA--TTT-G---C-G-A---AG-C--G-GT-TT---A--A------CTT--ATTGG----A-A---GCCGCA-TTT-T-----G---T------------A-T-CA-----C--A--TC-T--TT--C-T--T-G--A--CAAAG--------G---A---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TC-T-AC-C-G----T--TG--T--T----G-GC-C-AA-T----C-AATA-T--GC-C-TA-AC-AG-TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--ATACTG-T-ACAT
gi|20988                      : AATT--G-CAAAA-AC-ATA-AG-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG---------------------------------------------C--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----C--A--TA-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------C-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---A--TT-T-CC-G-G---CTTGTG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-C-T--TC-ATTTTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|20989                      : AATT--G-CAAAA-AC-ATA-AG-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG---------------------------------------------C--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----C--A--TA-T-ATT--C-T--T-G--A--C--
gi|20990                      : AAAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTA-A---C-G-A---AG-C--A-G--TT---A--A------C-C--A-TGA----A-A---GC--CA-TTT-T-----A---T------------A-T-TC-----C--A--TC-G-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-T-------T----------TCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-T
gi|20991                      : AAATT-G-CAAAA-AA--TA-A--GA-T-T---AA--TTA-A---C-A-A---TG-C--G-GC-TT---A--A-------------TAG----ACA---GC---A-TTT-T-----G---T--------------T-CC-----C--A--TC-A-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-TA-A-----T-G-------G----------CCT----A----T---G--TT-C-CC-G-G---CTC-TG--T--C----G-TCGC-AA-T----CAAA-A-T--GC-T-T--GC-----TT-TT--CATC-TG--C-TGCT--A----G-T-TCA
gi|20992                      : AAATTGG-CCAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---AT--TTT-A---C-G-A---AA-C--G-A--CT---A--A------C-T--A-TGG----A-AAATG---CA-TTT-CG----G---T------------A-T-AC-----C--A--TC-T-AAT--CTT--T-T--A--C--AG--------G---G---------T-A-C--A-----T-G-------G----------TCC-CA-A----T---G--TA-T-CC-G-G---TT--TG--T---------TC-A-AA-T----C-AA-A-T--GC-T-T--GCTAT-TTT-TT--C-TC-TAC-C-AG-T--G----G-T-ACA
gi|20993                      : AACT--G-CAAAA-A--GTA-AC-GA-T-T---CG--TTC-AA--CAG-A---AG-C--G-GGTTT---A--AAAAAACCAT--A-TGG----A-AA--GC--CA-TTT-T-----GGACT------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-GC-A--C--AG--------GGTAG---------T-A-T--A-----C-G-------GTCTATAGATACCT-C--A----T---G--TA-CGAG-G-G---CT--TG-----C----G-TCAC-AA-T----T-CA-A-T--GC-CTT--AC-A--TTT-TT--C-TC-TGGACAAG-TTGA----A-T-ACAT
gi|20994                      : AAAT--G--AAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---AG-C--G-AATCT---G--C------C-T--A-TGA----ATA---G---CA-TTT-T---------T------------A-T-CC-----C--ATCTC-T-ATT--C-T--T-G--AG-C--AA--------G---G---------TAA-T--A-----T-T-------G----------CCC-CA-A----A---G--TA-C-AC-G-G---CTG-TG--T--A----G-CT-C-AA-T------AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--at
gi|20995                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-GA-AA-T-T---TAACTTT-A---C-G-A---GT-CAGA-G--TT---G--A------CGT--A-TAA----A-A---GC--CA-TTTCT-----G---T------------A-T-CC-----C--A---C-T-ATT--C-T--T-GGTA--CT-AG--------G---G---------T-A-TCGA-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TA-C-CC-A------C--TG--TCCC----G-TC-CTAA-T----C-AA-A-T--GC-C-
gi|20996                      : AAAT--GGCAAAA-AA-GTACAC-GA-T-C---AG--TTA-A---C-GGA---AG-C--G-A--GT---AGAA------C-G--A--GG----A-A---GG--CA-TTT-TAT---G---T------------ACT-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--TAG--AG-C--AG--------G-------------T-A-T--------T-GC------G----------CTTTC--A--------G--TA-C-AC-G-----CTG-TG--T--C----G-TC-A-AT-T----C-AA-A-T--GCAC-TA-GC-A---TT-TT--C-TC-GA--C-AG-TACA----G-T-ACAT
gi|20997                      : AAAT--G-CAAAATGG-GTA-AC-G--T-T---CA--TCT-ATAGC-G-A---AG-C--G-G--TTTCTA--A------CAT--A-TGA----A-C---GC--CA-TTT-C-----G---TC-----------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-CTGT-G--AGTC--AGGGAAAGACG---G---------T-A-C--ATTTTTT-GGAAAATTG----------CCT-T--AAGTTT---G--GG-C-AT-G-GTCCCT--TGGCT--CTGGCG-TC-C-AA------C-GA-A-T--GT-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--T--G-T--A----G-T-ACA
gi|20998                      : AAAT--G-CAAAA-AA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-A-A---AG-C--A-G--TT---A--T------C-T--A-TGG----A-C---GC--CA-ACT-T-----G---
gi|20999                      :  AAT--G-CAAAA-TA--TA-AC--A-T-T---CC--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--CT---A--A------C-TT-A-TGG----A-AA--GC--CA-TTT-------G---T------------A-TGCC-----C--A--TC-TTATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G-------------T-A-T--A-----TTG-------G----------CCT-C--A----TCGAG---A-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-TC---C-AA-A-T--G--C-T--AC-A--TTT-TTTCT-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACA
gi|21000                      :  AAT--G-CAAAA-C--GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-A---C-G-A---GG-C----G--TT---G--A------CAT--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--AC-A---TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATatat
gi|21001                      :  AAT--G-CAAAA-CA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--G------C-T--A-TGG----A-A---GC--CC-TTT-T-----G---T------------A-T-CG-----C--A--TT-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---A---------T-A-C--A-----T-G-------a
gi|21002                      :   AT--G-CAAAAAAA-GTA-AC-GA-T-T---CA--TTT-G---T-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------A----------TCT-C--A----T---G--TA-C-TC-G-T---TT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--AC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-GCGTat
gi|21003                      :    T--G-CAAAA-AA-ATA-AC-GA-TAT---AA--TTA-A---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGA----C-A---GC--CA-TTT-T-----GA--T------------A-T-CC-----C--A--TT-A-ATT--C-T--T-G--A--C--GG--------G---G---------T---T--AAG---T-G-------G----------C---T--A----T---G--TT-C-CC-G-G---TC--TG--T--C----G-TCGC-AA-T----C-AA-A-T--CC-T-T--GC-----TT-TT--C-TC-TG--C-TGCT--A----G-T-at
gi|21004                      :     --G-CTAAA-AA-GTA-A--GA-T-T---TA--TTT-A---C-A-A---AG-C--G-G--CT---A--A------T-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CT-----CTCA--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----C---A--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----A-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--
gi|21005                      :        -CAAAA-AC-GTA-AC-GA-TGT---CA--TTTTA---C-G-A---GGGC--G-G--TT---A--A------C-T--AATGG----A-A---GC---A-TTT-T-----GATTC------------A-TTCC-----C--A--TCAT-ATTATC-T--T-------C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---GCTCA-C-AC-G-C---TT--TG--T--C----GTTC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-CTT--AC-A--TTT-TT--T-TC-T
gi|21006                      :           AAA-AA-GGA-AC-GA-T-T---TT--TTTTA---C-G-A---AG-C--G-G--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--CC-A-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21007                      :                               ---CA--TTT-A---C-G-A---AA-C--G-G--TT---AT-A------TAT--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CCATCTAC--A--TTGT-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----TAG-------G----------TCT-T--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TT--T--C----G-CC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-AT--C-TC-TG--C-AG-T--A----A-T--CATat
gi|21008                      :                                   A--TTT-A---A-G-A---AG-C--G-G--TT---A--T------C-T--A-TGG----A-A---AT--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--G--C--AA--------G---G---------T-A-C--A-----A-G-------G----------GTT-C--G----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--AC-C-T--GT-A--ATT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATatt
gi|21009                      :                                           ---C-G-A---AG-C--GCG--TT---A--A------C-T--A-TGG----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CG-----C--A---C-T-ATT--C-T--T----A--C--AT--------G-------------T-A-C--A-----T-G-------G----------TTT-G--A----T---G--TA-C--C-G-G---CT--TT--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GT-A--ATT-GG--T-TC-TG--C-AG-T--A----G-A-AC
gi|21010                      :                                                                                 -T--A-TGT----A-A---GC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT----T--T-A--A--C--AG--------G---G---------C-T-T--A-----C-G-------G----------CCT-C--T----T---G--TA-C-AC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-T--GC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21011                      :                                                                                   --A-TCG----A-A---AC--TA-TTT-------G---T------------A-T-CC--------A--T----ATT----T--T-G--G--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------ACT-C--A----T---T--T--C-CC-G-G---CT--CG--TG-C----C-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-TA-GC----TTT-TC--C-TC-TA--C-AG-T--A----G-
gi|21012                      :                                                                                      -TGG----A-A---AC--CA-TTT-T-----G---T------------A-T-CC-----C--A--TC-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------TCT-C--A----T---G--TT-G-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--GT-C-T--GC-A--TGT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21013                      :                                                                                                                          ------------A-T-CC-----C--A--TT-T-ATT--C-T--T-G--A--C--AA--------G---G---------T-A-T--A-----T-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-------------------------------TT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat
gi|21014                      :                                                                                                                                                         -T-ATT--C-T--T-G--A--C--AG--------G---G---------T-A-T--AT----T-G-------G----------GCT-C--A----T---G--TA-C-AC-GCG---C---TG--T--C----GCTC-C-AA-T----C-AA-A-T--GC-C-TG-GC-A--TTTATT--C-TC-TG--C-AG-T--A----a
gi|21015                      :                                                                                                                                                                         --A--T--AG--------G---G---------T-AGT--A-----A-G-------G----------CCT-C--A----T---G--TA-C-ACGG-G---CT--TGT-T--C----G-TCGC-AA-T----C-AACA-T---C-C-T--AC-ATTTTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----
gi|21016                      :                                                                                                                                                                                            ---G---------T-A-T--A-----T-A-------G----------CCT-C--A----T---T--T--C-CC-G-A---AT--TG--T--C----G-TCAC-AGCT----C-AA-ACT--GC-C-T--AG-A--TTT-TTT-C-TC-TG--T-AG-T--A----G-aaagtaaacatat
gi|21017                      :                                                                                                                                                                                                ---------T-A-T--A-----TTG-------G----------CTT-C--G----T---A--TT-T-CC-G-G---CT--AG--T--C----G-TC-C-AA-T----C-AA-A-T--TC-C-CTAGC----TTT-TT--A-TC-TG--C-AG-T--A----G-A-ACAT
gi|21018                      :                                                                                                                                                                                                                                            CT-C--A----T---G--TT-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----G-TC-C-AA-TCAATC-AA-A-T--GC-C-T--GT-A--TTT-TT--G-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21019                      :                                                                                                                                                                                                                                            tT-C--A----T---G--TA-C-CC-G-G---CT--TG--T--C----A-TT-T-AA-T----C-GT-A-T--GC-C-T--GT-A--TTT-TT----TC-TG--A-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|21020                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tt-A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--T-AG-T--A----G-T-ACAT
gi|21021                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A-T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TT-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATa
gi|21022                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TT-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATgt
gi|21023                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T--GC-C-T--AC-A--TTT-TT--C-TC-TG--C-AG-T--A----G-T-ACATat