lowQualScore                  :                                                                                                                                                       11    
lowQualScore                  :     6   1    6       1   1 3333 1         22 22   1 1     1 1    22             2222       1 2222  11  0 0 33 2222 22 33  22  33333 33    0   0       99    
lowQualScore                  :     .   .    .       .   . .... .         .. ..   . .     . .    ..             ....       . ....  ..  . . .. .... .. ..  ..  ..... ..    .   .       ..    
lowQualScore                  :     3   1    0       7   7 7777 7         33 22   6 6     6 5    33             3333       5 6666  00  7 7 11 2222 44 55  11  88888 22    8   8       11    
consensus                     :  AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
Reference ( gi|106526 )       :  AACTGTCACCGGCTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAACGAAT
gi|106515                     :  AACCGTCTCTGGTTCCGACA-TTA-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-AAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GT--CT-----G--TACA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106516                     : aAACCGTCTCCGGTTCGGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-GTGA-CGATTTGCAAATAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-ACCTAAGGAGAAT
gi|106517                     : aAACCGTCTTCGGTTCCGATA-TTT-A----C-ATGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-TAGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGAA-T----GT--AG-G-A--T----AT-T--GC--CT-----G--TCCATCTT-CTCTAAGGAGAAT
gi|106519                     : aAACGGTTACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-TAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--
gi|106518                     : aAACCGTTTCCGGTTCTGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTCGCAAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-A--T----A--T--aatatatatatattctctatagagaat
gi|106520                     : aAACCGTCTCCGGTTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-------------------AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GT--CT-----G--TCCA-CTT-ATCTA
gi|106522                     : aAACCGTCGCTGATTCTTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--AAA-T-CAAAA-C-AACA-AGGCTTGTGAAGGT----ACGTGGA-T----GT--AG-G-------------------CT-----G--TCCA-CTT-CTTTAAAGAGAAT
gi|106514                     : aAACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----T-GCGTTTTCC--A--GAA-T-CAATA-C-AT---------------AA----AAGTGG------------------------A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAA
gi|106528                     : aAACCGTCTCCGGTTCAGACA-TTT-A----T-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATgaaaat
gi|106529                     :   ACTGTCATCAATTCCAGAA-TTT-A----C-AAGTTTTCC--A--AAAAT-CAAGA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAAAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--TAGGC--CT-----G--TCCA-CTT-ATCTAAAGAGAAT
gi|106530                     :   ACCGTCACCGGTACCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-----------------GGTTTACGAAGAG----AAGTGGA-T----GT--GG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCTA-CTC-TTCTAAAGAGAAT
gi|106521                     :   ACCGTCACCGGTTCCAACA-TTT-A----C-ACATTTCGC--A--GGT-T-CTAAA-C-ACGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T----GC--TG-G-C--T----A--
gi|106531                     : agACAGTCACCGGTTCCAGTA-TTT-A----C-ACATTTTCC--A------------A-G-ATG---------------G----ATGTACA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--AT-----G--TCCA-CTT-CTCCAAAActtttcttcaaaga
gi|106532                     :   ACCGTCACCGGTTTCTATA-TCG-A----C-ATATTTCCC--A--GAA-T-CAAAG-T-TCGA-AGGCTTGCaaaa
gi|106525                     :    CCGTCATTTGTTTCAGAA-TTT-A----C-ACGTTTCCC--A--GAA-T-TAATG-C-ATAA-AGGTTTGCAAAGAG----
gi|106524                     :   aatGTCATCGGTTCCGGCA-TTG-AAAATC-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATAA-AGGTTTGCGAAGAG----A-----A-T----GT-------C--TC---AT-T--GT--CT-----G--TCCA-CAT-TTCCAAAGAGAAT
gi|106527                     :    aagtcACCGTTGCCGGTA-TTT-A----C-AC-TTTTCC--A--GAG-T-CAA---C-ATG-----------------------TGAA-T----GT--AG-G-C--T----A--C--GT--CT-----G--CCCA-CTT-CTCTAAGGAGAAT
gi|106533                     :          aCGGTTCCGGCC-TTTTA----C-AAGTTTTCC--A--TAA-T-CAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAG-GAG-T----AT--AG-A-C--C----A--T--GC--CT-----A--TCCA-CTTATTCTAAAGAGAAT
gi|106534                     :            GGTTCCGACA-TC--A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106535                     :            GGTTTCTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--AAAGAA-T-TAAAA-CCATAA-AGGTTTGCGAAAAG----AAGT-GA-T----GA--AA-G-C--T----A--A--GC--
gi|106523                     :             GTTCCGACAATTT-A----CCACGTTTTCCGCA--GAA-T-CAAAA-C-ATGATAGGTTT-CGGACAGTAGTAAGTGGA-T----GT--AGAG-C--T----T--T--GC--CT-----G--TTCA-CTT-CTC
gi|106536                     :  aaaccgttcttGTTCCGGCA-TTT-A----C-A-ATTTTTC--A--G-A-T-AAAAACC-ATG----------GAA------------GG-T----GT--AG-A---------A--T--GC--TT-----A--TCCA-CTT-ATCTAAAGAGAATaaga
gi|106537                     :                CCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--------------------TGA--GGTTTGCGAAAAG----AAGTA--------------------------------C--CT-----G--TCCA-CTT-TTCTAAAGAGAAT
gi|106538                     :                                 -ACTTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGCTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T----TT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAA
gi|106539                     :                                              --GAA-TTCAAAA-G---GA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGATT----GCAGAG-G-C----------T--GC--CTA----G--TTCA-CTT-CTCTAAAGAGAAgaga
gi|106541                     :                                                             -ATGA-AAGTTTGCGAAGAG----AAATGAA-T----GC--AG-G-C--TCATAA--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTACAGAGAAT
gi|106543                     :                                                                        TGTAAAGAG----AAGTGGA-T----GT--AG-G-T--T----A--T--GC--CT-----A--TCCA-CTT-CTCTA
gi|106544                     :                                                                          CGAAGAG----AAGTGGAAT----AT--AG-T-CC-T----A--C--TC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAAtttaagagaa
gi|106542                     :                                                                            AAGAG----AA-TAGA-C----AT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAgagaat
gi|106534                     :                                                                      gtctctaAGAG----AAGTGGA-C--------AG-G-C-------A--TA-GC--CT-----ACATCCA-CTT-CTCTgaaaat
gi|106538                     :                             ggttccgacatcacacgtttttcagaatcaaaacatgaaggtttgcaaAGAG----AAGTGGA-C--------AG-G-C-------A--TA-GC--CT-----AAATCCA-CTT-CTCTaaagagaat
gi|106541                     :                                           acttttttcagaatcaaaacatgaagctttgcgaAGAG----AAGTGGA-------C--AG-G-CATT----A--TGAGC--CT-----GCATTCA-TTT-CTCTaaagaga
gi|106539                     :                                                               atgaaagtttgcgaAGAG----AAGTGAA-C-----T--AG-G-C-------A-----GC--CTCTGCAA--TCCA-CTT-CTCTacagagaat
gi|106543                     :                                                      gaattcaaaaggaaggtttgcgaAGAG----AAGTGGA-------T--AG-G-CA-T----A-----AC--CTAC---A--TCCA-CTT-CTCTaaagagaa
gi|106544                     :                                                                        tgtaaAGAG----AAGTGGA-CAGGAGT--AG-GAC--T----A--T--AT------------TCCA-CTT-CTCTatttaagagaa
gi|106545                     :                                                                          cgaAGAG----AAGTGGA----------A-------T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAATaaaagagaat
gi|106545                     :                                                                             AGAG----AAGTGGA-C--------AG-G-CA-T----A--T----------------TCCA-CTT-CTCT
gi|106546                     :                                                                               AG----ATGTGTA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA--GT-CTCTAAAGAGAATaaagagaat
gi|106547                     :                                                                                G----ATGTGGA-T----GT--TG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106548                     :                                                                                      AGGGGA-T----GT--AG-G-C--T----T--T--GC--AT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106549                     :                                                                                      AATGGA-T----GT--AG-C-C--T----A--T--GC--TT-----G--TCCA-TTT-CTCTAAA
gi|106550                     :                                                                                      AGTAGA-CAG--GT--AG-G-G--T----C--T--GT--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAATga
gi|106551                     :                                                                                       GTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TTCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106540                     :                                                                                       GTGGA-T----GT--AG-G-C--T----AAAT--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106552                     :                                                               acatacatgtatgtaaggctatatGTGGA-T----GT--AG-A-C--T----A--T--GT--CT-----G--TCCC-CTT-TTCTGAAAAGAAT
gi|106553                     :                                                                                       GTGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CT
gi|106555                     :                                                                                       GTGAA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GTGTCT-----G--TCCA-CTT-CTCTCAA
gi|106554                     :                                                                                       GTGAA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GTGTCT-----G--TCCA-CTT-CTCTCAAga
gi|106556                     :                                                                                        TGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAATga
gi|106557                     :                                                                                        TGGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTA
gi|106558                     :                                                                                        TGGA-T----GT--GG-A-C--T----------GT--CT-----G--TCCA-CTC-CTCTAAAGAGAATgtaaagagaat
gi|106560                     :                                                                                         GGA-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GT--CT-----G--TCCT-CTT-CTCTAATAAGAAT
gi|106559                     :                                                                                         GGA-T----GC--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-GTCTAA
gi|106561                     :                                                                                           A-T----GT--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCTT-CTT-CTTTAAAGAGAATtgagaat
gi|106562                     :                                                                                           A-T----GC--AG-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-TTCT
gi|106563                     :                                                                                            -T----GT--AG-G-C--T----A--T--GT--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGGGAATttacagagaat
gi|106564                     :                                                                                                    --AG-G-C--T----A--T--GT--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT
gi|106565                     :                                                                                                       G-G-C--T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTGACGAGAAT
gi|106566                     :                                                                                                            --T----A--T--GC--CT-----G--TCCA-CTT-CTCTAAAGAGAAT





Alignments
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lowQualScore                  :           .            .   . .... .         .. ..   . .     . .    ..             ....       . ..  ..  .  . .... .. ..  ..  .     . ..  .   ... . ...        
lowQualScore                  :           6            7   7 5555 6         22 11   5 5     5 5    88             7777       7 22  11  8  8 6666 77 11  22  8     8 11  8   555 9 555        
consensus                     :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
Reference ( family-360 )      :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106514                     :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----T-GCGTTTTCC--A--GAA-T-CAATA-C-AT---------------AA----AAGTGG--------------------A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAAAAT
gi|106515                     :   aAACCGTCTCTGGTTCCGACA-TTA-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-AAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTACA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106516                     :   aAACCGTCTCCGGTTCGGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-GTGA-CGATTTGCAAATAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-ACC---T-A---AGGAGAAT
gi|106517                     :   aAACCGTCTTCGGTTCCGATA-TTT-A----C-ATGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-TAGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGAA-T--GT--AG-GA-T----AT-T--GC--CT-GTCCATC--TT-CTC---T-A---AGGAGAAT
gi|106518                     :   aAACCGTTTCCGGTTCTGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTCGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GA-T----A--T--
gi|106519                     :   aAACGGTTACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-TAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-TAA--A--T--AT--AT-ATATA----TT-CTC---T-A---TAGAGAAT
gi|106520                     :   aAACCGTCTCCGGTTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-------------------AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-ATC---T-A---
gi|106521                     :    aACCGTCACCGGTTCCAACA-TTT-A----C-ACATTTCGC--A--GGT-T-CTAAA-C-ACGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GC--TG-GC-T----A---------CT-------T--TT-CTT---C-A---AAGA
gi|106522                     :  agAACCGTCGCTGATTCTTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--AAA-T-CAAAA-C-AACA-AGGCTTGTGAAGGT----ACGTGGA-T--GT--AG-G-----------------CT-GTCCA-C--TT-CTT---T-A---AAGAGAAT
gi|106523                     :   aAACCGTT-CTTGTTCCGACAATTT-A----CCACGTTTTCCGCA--GAA-T-CAAAA-C-ATGATAGGTTT-CGGACAGTAGTAAGTGGA-T--GT--AGAGC-T----T--T--GC--CT-GTTCA-C--TT-CTC---------AAGA
gi|106524                     :      aCGTCATCGGTTCCGGCA-TTG-AAAATC-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATAA-AGGTTTGCGAAGAG----A-----A-T--GT------C-TC---AT-T--GT--CT-GTCCA-C--AT-TTC---C-A---AAGAGAAT
gi|106525                     :  aagtCCGTCATTTGTTTCAGAA-TTT-A----C-ACGTTTCCC--A--GAA-T-TAATG-C-ATAA-AGGTTTGCAAAGAG----
gi|106526                     : aatAACTGTCACCGGCTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAACGAAT
gi|106527                     :           ACCGTTGCCGGTA-TTT-A----C-AC-TTTTCC--A--GAG-T-CAA---C-ATG-----------------------TGAA-T--GT--AG-GC-T----A--C--GT--CT-GCCCA-C--TT-CTC---T-A---AGGAGAAT
gi|106528                     :   aAACCGTCTCCGGTTCAGACA-TTT-A----T-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-AT
gi|106529                     :     ACTGTCATCAATTCCAGAA-TTT-A----C-AAGTTTTCC--A--AAAAT-CAAGA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAAAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--TAGGC--CT-GTCCA-C--TT-ATC---T-A---AAGAGAAT
gi|106530                     :     ACCGTCACCGGTACCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-----------------GGTTTACGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--GG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCTA-C--TC-TTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106531                     :     ACAGTCACCGGTTCCAGTA-TTT-A----C-ACATTTTCC--A------------A-G-ATG---------------G----ATGTACA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--AT-GTCCA-C--TT-CTC---C-A---AAAAAAA
gi|106532                     :     ACCGTCACCGGTTTCTATA-TCG-A----C-ATATTTCCC--A--GAA-T-CAAAG-T-TCGA-AGGCTTGC
gi|106533                     :             CGGTTCCGGCC-TTTTA----C-AAGTTTTCC--A--TAA-T-CAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAG-GAG-T--AT--AG-AC-C----A--T--GC--CT-ATCCA-C--TTATTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106534                     :              GGTTCCGACA-TC--A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106535                     :              GGTTTCTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--AAAGAA-T-TAAAA-CCATAA-AGGTTTGCGAAAAG----AAGT-GA-T--GA--AA-GC-T----A--A--GC--
gi|106536                     :               GTTCCGGCA-TTT-A----C-A-ATTTTTC--A--G-A-T-AAAAACC-ATG----------GAA------------GG-T--GT--AG-A-------A--T--GC--TT-ATCCA-C--TT-ATC---T-A---AAGAGAAT
gi|106537                     :                  CCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--------------------TGA--GGTTTGCGAAAAG----AAGTA----------------------------C--CT-GTCCA-C--TT-TTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106538                     :                                   -ACTTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGCTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--TT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGA
gi|106539                     :                                                --GAA-TTCAAAA-G---GA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGATT--GCAGAG-GC---------T--GC--CTAGTTCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAA
gi|106540                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----AAAT--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106541                     :                                       acatacatgtatgtaaggctatat-ATGA-AAGTTTGCGAAGAG----AAATGAA-T--GC--AG-GC-TCATAA--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---CAGAGAAT
gi|106542                     :                                                                              AAGAG----AA-TAGA-C--AT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAAAAT
gi|106543                     :                                                                   gtctctaTGTAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GT-T----A--T--GC--CT-ATCCA-C--TT-CTC---T-ATTTAAGAGAA
gi|106544                     :                                                                            CGAAGAG----AAGTGGAAT--AT--AG-TCCT----A--C--TC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---TAA---AAGAGAAT
gi|106545                     :                                                                               AGAG----AAGTGGA--------A-----T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106546                     :                                                                                 AG----ATGTGTA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA----GT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106547                     :                                                                                  G----ATGTGGA-T--GT--TG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106548                     :                                                                                        AGGGGA-T--GT--AG-GC-T----T--T--GC--AT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106549                     :                                                                                        AATGGA-T--GT--AG-CC-T----A--T--GC--TT-GTCCA-T--TT-CTC---T-A---AAGA
gi|106550                     :                                                                                        AGTAGA-CAGGT--AG-GG-T----C--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106551                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTTCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106552                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-AC-T----A--T--GT--CT-GTCCC-C--TT-TTC---T-G---AAAAGAAT
gi|106553                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CT
gi|106554                     :                                                                                         GTGAA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GTGTCT-GTCCA-C--TT-CTC---T-C---AAGA
gi|106555                     :                                                                                         GTGAA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GTGTCT-GTCCA-C--TT-CTC---T-C---AAGA
gi|106556                     :                                                                                          TGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
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gi|106558                     :                                                                                          TGGA-T--GT--GG-AC-T----------GT--CT-GTCCA-C--TC-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106559                     :                                                                                           GGA-T--GC--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-GTC---T-A---ATGAGAAT
gi|106560                     :                                                                                           GGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCT-C--TT-CTC---T-A---ATAAGAAT
gi|106561                     :                                                                                             A-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCTT-C--TT-CTT---T-A---AAGAGAAT
gi|106562                     :                                                                                             A-T--GC--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-CTTTT-CTT---T-A---CAGAGAAT
gi|106563                     :                                                                                              -T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGGGAAT
gi|106564                     :                                                                                                    --AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106565                     :                                                                                                       G-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-G---ACGAGAAT
gi|106566                     :                                                                                                           -T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT





Alignments
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lowQualScore                  :           .            .   . .... .         .. ..   . .     . .    ..             ....       . ..  ..  .  . .... .. ..  ..  .     . ..  .   ... . ...        
lowQualScore                  :           6            7   7 5555 6         22 11   5 5     5 5    88             7777       7 22  11  8  8 6666 77 11  22  8     8 11  8   555 9 555        
consensus                     :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
Reference ( family-360 )      :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106514                     :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----T-GCGTTTTCC--A--GAA-T-CAATA-C-AT---------------AA----AAGTGG--------------------A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAAAAT
gi|106515                     :   aAACCGTCTCTGGTTCCGACA-TTA-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-AAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTACA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106516                     :   aAACCGTCTCCGGTTCGGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-GTGA-CGATTTGCAAATAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-ACC---T-A---AGGAGAAT
gi|106517                     :   aAACCGTCTTCGGTTCCGATA-TTT-A----C-ATGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-TAGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGAA-T--GT--AG-GA-T----AT-T--GC--CT-GTCCATC--TT-CTC---T-A---AGGAGAAT
gi|106518                     :   aAACCGTTTCCGGTTCTGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTCGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GA-T----A--T--
gi|106519                     :   aAACGGTTACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-TAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-TAA--A--T--AT--AT-ATATA----TT-CTC---T-A---TAGAGAAT
gi|106520                     :   aAACCGTCTCCGGTTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-------------------AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-ATC---T-A---
gi|106521                     :    aACCGTCACCGGTTCCAACA-TTT-A----C-ACATTTCGC--A--GGT-T-CTAAA-C-ACGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GC--TG-GC-T----A---------CT-------T--TT-CTT---C-A---AAGA
gi|106522                     :  agAACCGTCGCTGATTCTTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--AAA-T-CAAAA-C-AACA-AGGCTTGTGAAGGT----ACGTGGA-T--GT--AG-G-----------------CT-GTCCA-C--TT-CTT---T-A---AAGAGAAT
gi|106523                     :   aAACCGTT-CTTGTTCCGACAATTT-A----CCACGTTTTCCGCA--GAA-T-CAAAA-C-ATGATAGGTTT-CGGACAGTAGTAAGTGGA-T--GT--AGAGC-T----T--T--GC--CT-GTTCA-C--TT-CTC---------AAGA
gi|106524                     :      aCGTCATCGGTTCCGGCA-TTG-AAAATC-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATAA-AGGTTTGCGAAGAG----A-----A-T--GT------C-TC---AT-T--GT--CT-GTCCA-C--AT-TTC---C-A---AAGAGAAT
gi|106525                     :  aagtCCGTCATTTGTTTCAGAA-TTT-A----C-ACGTTTCCC--A--GAA-T-TAATG-C-ATAA-AGGTTTGCAAAGAG----
gi|106526                     : aatAACTGTCACCGGCTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAACGAAT
gi|106527                     :           ACCGTTGCCGGTA-TTT-A----C-AC-TTTTCC--A--GAG-T-CAA---C-ATG-----------------------TGAA-T--GT--AG-GC-T----A--C--GT--CT-GCCCA-C--TT-CTC---T-A---AGGAGAAT
gi|106528                     :   aAACCGTCTCCGGTTCAGACA-TTT-A----T-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-AT
gi|106529                     :     ACTGTCATCAATTCCAGAA-TTT-A----C-AAGTTTTCC--A--AAAAT-CAAGA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAAAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--TAGGC--CT-GTCCA-C--TT-ATC---T-A---AAGAGAAT
gi|106530                     :     ACCGTCACCGGTACCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-----------------GGTTTACGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--GG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCTA-C--TC-TTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106531                     :     ACAGTCACCGGTTCCAGTA-TTT-A----C-ACATTTTCC--A------------A-G-ATG---------------G----ATGTACA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--AT-GTCCA-C--TT-CTC---C-A---AAAAAAA
gi|106532                     :     ACCGTCACCGGTTTCTATA-TCG-A----C-ATATTTCCC--A--GAA-T-CAAAG-T-TCGA-AGGCTTGC
gi|106533                     :             CGGTTCCGGCC-TTTTA----C-AAGTTTTCC--A--TAA-T-CAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAG-GAG-T--AT--AG-AC-C----A--T--GC--CT-ATCCA-C--TTATTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106534                     :              GGTTCCGACA-TC--A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106535                     :              GGTTTCTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--AAAGAA-T-TAAAA-CCATAA-AGGTTTGCGAAAAG----AAGT-GA-T--GA--AA-GC-T----A--A--GC--
gi|106536                     :               GTTCCGGCA-TTT-A----C-A-ATTTTTC--A--G-A-T-AAAAACC-ATG----------GAA------------GG-T--GT--AG-A-------A--T--GC--TT-ATCCA-C--TT-ATC---T-A---AAGAGAAT
gi|106537                     :                  CCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--------------------TGA--GGTTTGCGAAAAG----AAGTA----------------------------C--CT-GTCCA-C--TT-TTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106538                     :                                   -ACTTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGCTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--TT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGA
gi|106539                     :                                                --GAA-TTCAAAA-G---GA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGATT--GCAGAG-GC---------T--GC--CTAGTTCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAA
gi|106540                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----AAAT--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106541                     :                                       acatacatgtatgtaaggctatat-ATGA-AAGTTTGCGAAGAG----AAATGAA-T--GC--AG-GC-TCATAA--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---CAGAGAAT
gi|106542                     :                                                                              AAGAG----AA-TAGA-C--AT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAAAAT
gi|106543                     :                                                                   gtctctaTGTAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GT-T----A--T--GC--CT-ATCCA-C--TT-CTC---T-ATTTAAGAGAA
gi|106544                     :                                                                            CGAAGAG----AAGTGGAAT--AT--AG-TCCT----A--C--TC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---TAA---AAGAGAAT
gi|106545                     :                                                                               AGAG----AAGTGGA--------A-----T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106546                     :                                                                                 AG----ATGTGTA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA----GT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106547                     :                                                                                  G----ATGTGGA-T--GT--TG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106548                     :                                                                                        AGGGGA-T--GT--AG-GC-T----T--T--GC--AT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106549                     :                                                                                        AATGGA-T--GT--AG-CC-T----A--T--GC--TT-GTCCA-T--TT-CTC---T-A---AAGA
gi|106550                     :                                                                                        AGTAGA-CAGGT--AG-GG-T----C--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106551                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTTCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106552                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-AC-T----A--T--GT--CT-GTCCC-C--TT-TTC---T-G---AAAAGAAT
gi|106553                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CT
gi|106554                     :                                                                                         GTGAA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GTGTCT-GTCCA-C--TT-CTC---T-C---AAGA
gi|106555                     :                                                                                         GTGAA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GTGTCT-GTCCA-C--TT-CTC---T-C---AAGA
gi|106556                     :                                                                                          TGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106557                     :                                                                                          TGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTCTAGT-A---AAGAGAAT
gi|106558                     :                                                                                          TGGA-T--GT--GG-AC-T----------GT--CT-GTCCA-C--TC-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106559                     :                                                                                           GGA-T--GC--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-GTC---T-A---ATGAGAAT
gi|106560                     :                                                                                           GGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCT-C--TT-CTC---T-A---ATAAGAAT
gi|106561                     :                                                                                             A-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCTT-C--TT-CTT---T-A---AAGAGAAT
gi|106562                     :                                                                                             A-T--GC--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-CTTTT-CTT---T-A---CAGAGAAT
gi|106563                     :                                                                                              -T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGGGAAT
gi|106564                     :                                                                                                    --AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106565                     :                                                                                                       G-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-G---ACGAGAAT
gi|106566                     :                                                                                                           -T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT


blockSeqs                     :           T            A   T AAAT C         GC AA   A T     C C    TA             TAGT       T AG  AG       CATA AA AG  GT          TT      TAG   TTT
blockSeqs                     :           T            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          A .   .        AA   T  .   GT          .       .     .  
blockSeqs                     :           T            .   . .    .         .  .    . .     . .    C              .          . .   .        C    T  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           T            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           T            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           G            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           T            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           A            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :           .            .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                        .   . .    .         .  .    . .     . .    A              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                        .   . .    .         .  .    . .     . .    .              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                        .   . .    .         .  .    . .     . .    .              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                        .   . .    .         .  .    . .     . .    .              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                        .   . .    .         .  .    . .     . .    .              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                   .         .  .    . .     . .    .              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                .    . .     . .    .              .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                               .                   .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                   .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                   .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                   .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                   .          . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                              . .   .        .    .  .   .           .       .     .  
blockSeqs                     :                                                                                                    .        .    .  .   .           .                
blockSeqs                     :                                                                                                             .    .  .   .                            
blockSeqs                     :                                                                                                             .    .  .                                


blockSeqCons                  :                                                                    A*
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finalCons                     :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGAA-GGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT





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lowQualScore                  :           6            7   7 5555 6         22 11   5 5     5 5    88             7777       7 22  11  8  8 6666 77 11  22  8     8 11  8   555 9 555        
consensus                     :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
Reference ( family-360 )      :    AACCGTCACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
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gi|106515                     :   aAACCGTCTCTGGTTCCGACA-TTA-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-AAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTACA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
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gi|106519                     :   aAACGGTTACCGGTTCCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-TAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-TAA--A--T--AT--AT-ATATA----TT-CTC---T-A---TAGAGAAT
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gi|106526                     : aatAACTGTCACCGGCTCCGACA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAACGAAT
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gi|106528                     :   aAACCGTCTCCGGTTCAGACA-TTT-A----T-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-AT
gi|106529                     :     ACTGTCATCAATTCCAGAA-TTT-A----C-AAGTTTTCC--A--AAAAT-CAAGA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAAAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--TAGGC--CT-GTCCA-C--TT-ATC---T-A---AAGAGAAT
gi|106530                     :     ACCGTCACCGGTACCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--A--GAA-----------------GGTTTACGAAGAG----AAGTGGA-T--GT--GG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCTA-C--TC-TTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106531                     :     ACAGTCACCGGTTCCAGTA-TTT-A----C-ACATTTTCC--A------------A-G-ATG---------------G----ATGTACA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--AT-GTCCA-C--TT-CTC---C-A---AAAAAAA
gi|106532                     :     ACCGTCACCGGTTTCTATA-TCG-A----C-ATATTTCCC--A--GAA-T-CAAAG-T-TCGA-AGGCTTGC
gi|106533                     :             CGGTTCCGGCC-TTTTA----C-AAGTTTTCC--A--TAA-T-CAAAT-C-ATGA-AGGTTTGCGAAGAG----AAG-GAG-T--AT--AG-AC-C----A--T--GC--CT-ATCCA-C--TTATTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106534                     :              GGTTCCGACA-TC--A----C-ACGTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGGTTTGCAAAGAG----AAGTGGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106535                     :              GGTTTCTGCA-TTT-A----C-ACGTTTTTC--AAAGAA-T-TAAAA-CCATAA-AGGTTTGCGAAAAG----AAGT-GA-T--GA--AA-GC-T----A--A--GC--
gi|106536                     :               GTTCCGGCA-TTT-A----C-A-ATTTTTC--A--G-A-T-AAAAACC-ATG----------GAA------------GG-T--GT--AG-A-------A--T--GC--TT-ATCCA-C--TT-ATC---T-A---AAGAGAAT
gi|106537                     :                  CCGGCA-TTT-A----C-ACGTTTTCC--------------------TGA--GGTTTGCGAAAAG----AAGTA----------------------------C--CT-GTCCA-C--TT-TTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106538                     :                                   -ACTTTTTTC--A--GAA-T-CAAAA-C-ATGA-AGCTTTGCGAAGAG----AAGTGGA-T--TT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGA
gi|106539                     :                                                --GAA-TTCAAAA-G---GA-AGGTTTGCGAAGAG----AAGTGGATT--GCAGAG-GC---------T--GC--CTAGTTCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAA
gi|106540                     :                                                                                         GTGGA-T--GT--AG-GC-T----AAAT--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106541                     :                                       acatacatgtatgtaaggctatat-ATGA-AAGTTTGCGAAGAG----AAATGAA-T--GC--AG-GC-TCATAA--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---CAGAGAAT
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gi|106550                     :                                                                                        AGTAGA-CAGGT--AG-GG-T----C--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
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gi|106555                     :                                                                                         GTGAA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GTGTCT-GTCCA-C--TT-CTC---T-C---AAGA
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gi|106560                     :                                                                                           GGA-T--GT--AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCT-C--TT-CTC---T-A---ATAAGAAT
gi|106561                     :                                                                                             A-T--GT--AG-GC-T----A--T--GC--CT-GTCTT-C--TT-CTT---T-A---AAGAGAAT
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gi|106564                     :                                                                                                    --AG-GC-T----A--T--GT--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT
gi|106565                     :                                                                                                       G-GC-T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-G---ACGAGAAT
gi|106566                     :                                                                                                           -T----A--T--GC--CT-GTCCA-C--TT-CTC---T-A---AAGAGAAT