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lowQualScore                  :                                        .  ...    ...  . .     . .       ................................................................... .........     . . ..    . ..    .   ...    
lowQualScore                  :                                        2  666    999  3 5     5 5       7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000     6 6 00    4 55    7   111    
consensus                     :                                  TTTTCT-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGGTA----AC---------C----A--TC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-AGGTNT--GCCG-AAT--GATTT
Reference ( gi|12743 )        :                                  TTTTCC-TCC--TTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----A--TC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CA-AGGTGT--GCCG-AAT--TATTT
gi|12742                      :                                  TTTTCC-TCC--ATCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTAGTA----AC---------T----A--TC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAA-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--GGTTT
gi|12741                      :                                  TTTTCC-GCA--TTCG---GCTA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----A--CC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATTAG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--GATTT
gi|12738                      :                                  TTTTCT-TCA--TTTG---GAAA-ACCTT-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----G--CC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--GATTT
gi|12740                      :                          acgttatcTTTTCC-TCA--TTCG---GCAA-ACCTT-A-GCTGATT--------CTGGTA----TC---------C----G--CC-A---AT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--GATTT
gi|12731                      :                               atcTTTTCTGTCCA-CTCG---GCAC-ACCTC-G-GCCGATT--------GTGATA---------------------------------T-A--G---GTTCCGGT---A---------G-CAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--GATTT
gi|12732                      :                         cacgtcccaTTTTCTGTCCA-CTCG---GCAC-ACCTC-G-GCCAATT--------GTGAT---------------------A--TA-G---GT-T-C--G---GT-------------------ATCAG-C-CG-AGGCTC--GCCG-AAT--GATTTt
gi|12733                      :                         cacgtcccaTTTTCTGTCCA-CTCG---GCAC-ACCTC-G-ACCGATT--------GTGATA-----------------------TA-G---GT-T----G---CG----GT---A----------TCAG-A-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--GATTTt
gi|12736                      :                         cacgtcccaTTTTCTGTCC--CACGATCGCAC-ACCTC-G-GCCGAT------------GTG----AT--------------A--TA-G---GT-T-C--C---CG----GT---A---------A-CAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--GATTTt
gi|12735                      :                         cacgtctcaTTTTCTGTCCATCTCG---GCAC-ACCTCTGCGCCGATT--------GTGATA---------------------------------T-A--G---GTTCTGGT---A----------TCAG-C-CG-AGGTTC--GCCGCAAT--GATTTt
gi|12734                      :                         cgcgtcgcaTTTTCTGTCCA-CTCG---GCAC-ACCTC-G-GCCGATT-----------GTA----A----------T----A--TA-G---GT-TCC--G---GT-------------------ATTAG-C-CG-ATATTC--GGCG-AAT--T-TTTt
gi|12737                      :                         cacgtcccaTTTTCTGTCCA-CTCG---GCACCACCTC-G-CCAGAT-----------GGTG----AT--------------A--TA-G---GT-T-C--G----C----GT---A---------ATCA--C-CG-AGGTTTC-GCCG-AAT--GATTT
gi|12746                      :                         acgttcccaaTTTCC-AC----TCG---GATC-ACCTC-G-GCCGATTA-------CATCTA----AT---------G----A--T------GT-T-A--G---G----------A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-At
gi|12781                      :                                      cC-TCA--TTCG---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---ttg
gi|12763                      :                                      ta-TCC--TTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----A--TC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CA-AGGTGT--GCCG-AAT--tt
gi|12761                      :                                        -TCC--TTCG---GCAA-ACCTC-A-GCTGATT--------CTGATA----AC---------C----A--TC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ACCAT-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--
gi|12764                      :                                       c-TCG--TTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----G--CC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CG-ACGTGT--TCCG-AGT--
gi|12759                      :                                        -TCA--TTTG---GAAA-ACCTT-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----G--CC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--
gi|12758                      :                                       c-TCA--TTCG---GCAA-ACCTT-A-GCTGATT--------CTGGTA----TC---------C----G--CC-A---AT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--
gi|12762                      :                                       c-TCA--TTCA---GTAA-ACCTT-G-GCTGATT--------TTGGTA----AC---------C----G--CC-C---AT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-GG-AAGTGT--GCCG-AGT--
gi|12754                      :                                       c-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCCCTA---------------C----A--TT-A------T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-AGGTGT--GCCG-A
gi|12752                      :                                     cag-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTAATT--------CCGG-A----AC---------CT---ACTTC-ATACGT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-A-GTGT--GCCG-AGT--
gi|12765                      :                                       c-TCT--CTCG---GAAT-ACCTC-G-GCCGAT--------------A----AC--------------A--TC-T---GT-A-G--G---ATACC-GC---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-Atatt
gi|12756                      :                                        -TCA--TTCA---GCGA--CCTC-G-ACAGATT--------CCGG-A----AC---------CTGACA--TC-A------T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-TG-A-GTGT--GCCG-AGT--tttt
gi|12731                      :                                       c-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGCTA--------CCGG-A----AC---------CTAT-A--TC-A----------------------C---A---------ATCGG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--
gi|12755                      :                     cacgtcccattttctgtcc-TCA--TTCA---GCGA-ACCTC-G-GCAGATT--------CCGG-A----ACCTGA-----C----A--TC-A------T-A--G---AT----GT---AC--------AT-GG-C-TG-AGGTGT--GCtttt
gi|12749                      :                                   cactc-TCA--TTCG---ACAA-ACTTC-G-GCTGATT--------CCGGTATTCTA----------C----A--TC-A---A-----------------GT---A---------ATCGA-C-CG-AGGTGA--TCCG-AGT--
gi|12732                      :                                     tcc-TCA--TTCG---GCGA-GCCTC-G-GCTGATA--------CCG--A----AC---------CTAT-A--TC-A----------------------C---A---------ATTGG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--t
gi|12733                      :                     cacgtcccattttctgtcc-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-TCTGATA--------CC-GCA----AC---------CTAT-A--TC-A----------------------C---A---------ATCGG-T-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--tttt
gi|12736                      :                     cacgtcccattttctgtcc-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGTTA--------CCGGGA----AC---------C-----------------T-A--T---AT----CA---C---------ATCGG-C-CG-AGGTGT--GCtttt
gi|12782                      :              cacgtctcattttctgtcccacgatc-TCCA-TTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CC-GTG----ACCTA------C----A--TC-A---tttt
gi|12786                      :                                      ta-TCA--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATA--------CCGGAA----ACTCTA-----C----A--TC-A---atttt
gi|12744                      :                                        -TCA--TTCG---GCCA-ACCTC-A-GCTGATT--------CCGG-A----AG---------T----A--TG-AG--GT-T-C--G---A-----AT---A---------TT----C-CG-AGGTTG--GCCG-AGT--
gi|12748                      :                                 tttgccc-TCA--TTCG---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CC-TTA----ACCTA------C----A--TC-A---
gi|12777                      :         gtccggaatcagccgattttggccgaatggt-TCA--TTCG---GCCA-ACCTC-G-GCTAATT--------C
gi|12763                      :                     gccgaagtttaatgtaggttttg--TTCG---GCAC-ACCTT-G-GCTGATTACATCTAACTGATG----GT---------T----A--CC-A---G----------------------A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-AAt
gi|12757                      :                                           a--TTCG---GCTA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC---------C----A--CC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATTAG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--gga
gi|12760                      :                                           c--TTCG---GCTA-AC-TC-G-GCTGATT--------CTGGTA----AC--------------A--CC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAG-C-CG-AGGCGT--GCCG-AGT--tg
gi|12753                      :                                           c--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGGAA----GCCTA------C----G--TC-A----T-T-A--G---TT----GT---A---------ATCGG-C-CG-AGGTGT--GCTG-Atg
gi|12768                      :                                         cag--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGGAA----GCCTA------C----G--TC-A----T-T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-AGGTtg
gi|12766                      :                                            --TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTAATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---ATGT-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-A---GT--GCCtg
gi|12750                      :                                            --TTCG---GCGA-ATCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTACATATAC----A--TC-A------T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-AGtggt
gi|12747                      :                                        tcca--TCCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------GCGG-A----AC---------C---------------------------------T---A---------ATCGG-G-CG-AGGTGT--GCCG-Atg
gi|12767                      :                                      gttcag--TTCA---GCCA-ACCTC-G-GATGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-AT--GT-T-C--G---AT----GC---A---------ATCGG-T-Ctg
gi|12771                      :                                    cactccga--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGGAA----ACCTA------C----A--TC-A---tg
gi|12780                      :                                 cagccgaggta--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---tg
gi|12775                      :                                          ta--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---t
gi|12779                      :                                   gccgaggta--TTCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----AC---------C----tggt
gi|12734                      :                                     ttgtgta--TTCG---CCGA-ATATC-G-GCTAATA--------CCGG-A----AC---------CT---A--T------AT-T-A-------------C---A---------ATCGG-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--tg
gi|12770                      :                         cacgtcccattttctgtcc--TTCG---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---ttttt
gi|12769                      :                                 cagccgaggta--TTCG---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---tg
gi|12772                      :                                 cagccgagatt--TTCG---GCTA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---tg
gi|12776                      :                                 cagccgaggta--TTTG---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGGGA----CCTA-------C----A--TC-A---tg
gi|12783                      :                                   gccgaggtt--TTCG---GACA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---taa
gi|12745                      :                                          ta--TTCC---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----AC---------C----tg
gi|12785                      : tctgagcactcggccaacctcagaatattcgtacctcatagta--TTCG---ACCA-ACCTC-G-ACTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---tg
gi|12778                      :                                          ta--TTTG---GCCA-ACCTC-G-GTTGATT--------CCGGGA----CCTA-------C----A--TC-A---tg
gi|12774                      :                                   gccgaggta--TTCG---GCCA-ATTTC-G-GCTGATT--------CCGA-A----ACCTA------C----A--TC-A---tg
gi|12742                      :                                    cagccgaggtaTCG---GCAC-ACCTC-G-GTTGATTA-------CATCTA----AC---------T----G--AT-A---GT-T-A--C----T----AG---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-Atgggttt
gi|12741                      :                                     ttttcctccaTCG---GCAC-ACCTC-G-GCTAATTACATCTAACTGGTG----GT---------T----A--CC-A---G----------------------A---------ATCAG-C-CG-AGGTTA--GCCG-AAT--gtggttt
gi|12738                      :                                       ttttccgcTCG---GCAC-ACCTC-G-GCTGATTA-------CATCTA----AC---------T----G--GC-G---GT-T-A--C---CA----G----A---------ATCAG-C-CA-AGGTTT--TCCA-AAT--gtgattt
gi|12740                      :                               acgttatcttttcttcTCG---GCAC-ACCTC-G-GCTGATT------------------AC--------------A--TCTA---AT-T-G--GCGGAT----ACCAGA---------ATCAG-C-TA-AGGTTT--GCCG-AAT--gtgattt
gi|12761                      :                                    atcttttcctcTCG---GCAC-ACCTC-G-GATGGTTACATCTAACTGATG----GT---------T----A--TC-A---G----------------------A---------ATCAG-C-TG-AGGTTT--GCCG-AAgtgattt
gi|12751                      :                                            cacTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CTAGTA----AC---------T----A--TC-A---GT-T-A--G---AT----GT---A---------ATCAA-C-CG-AGGTGT--GCCG-AGT--gga
gi|12751                      :                                             ccTCG---GCAC-ACCTC-G-GTTGATTA-------CATCTA----AC---------T----G--AT-A---GT-T-A--C----T----AG---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-A
gi|12757                      :                                           ccacTCG---GCAC-ACCTC-G-GCTAATTACATCTAACTGGTG----GT---------T----A--CC-A---G----------------------A---------ATCAG-C-CG-AGGTTA--GCCG-AAT--
gi|12764                      :                                            cacTCG---GAAC-ACGTC-G-GCTGATTA-------CATCTA----AC---------T----G--GC-G---GT-T-A--C---CA----G----A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-AAg
gi|12759                      :                                             acTCG---GCAC-ACCTC-G-GCTGATTA-------CATCTA----AC---------T----G--GC-G---GT-T-A--C---CA----G----A---------ATCAG-C-CA-AGGTTT--TCCA-AAT--cga
gi|12758                      :                                            cacTCG---GCAC-ACCTC-G-GCTGATT------------------AC--------------A--TCTA---AT-T-G--GCGGAT----ACCAGA---------ATCAG-C-TA-AGGTTT--GCCG-AAT--ga
gi|12760                      :                                            cacTCG---GCAC-GCCTC-G-GCTGATTACATCTAACTGGT-----GT---------T----A--CC-A---G----------------------A---------ATCAG-C-CG-AGTTA---GCCG-AAT--ga
gi|12762                      :                                            cacTCG---GCAC-ACTTC-C-GCTGATTA-------CATCTA----AT---------G----G--GC-G---GT-T-ACCA---A----------A---------ATCAG-C-CA-AGGTTT--ACTG-AAT--g
gi|12754                      :                                            cacTCG---GCAC-ACCTC-G-GCCGATT-----------ACA----TC---------T----A--TA-A---TG-T-A--G---GG----G----A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--ga
gi|12746                      :                                            cagTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------CC--TA----A----------C----A--TC-A----T-T-A--G---AT----GT---A---------ATCGG-C-CG-AGGTGA--TCCG-AGT--ga
gi|12753                      :                                         ctttccTCA---GCAC-ACCTC-G-GCCGATTACAA----CTAATG----AC------------------------GT-A-G--G---CTTCC-GG---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--ttg
gi|12752                      :                                            cagTCG---GCAC-AC-TC-G-GCCGATTA-------CATCTA----ACG--------T----A--TG-A---AG-T-A--G---GTTCC-GG---A---------ATTAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AATGATATTg
gi|12765                      :                                            cacTCG---GCAA-ACCTC-G-GCTGATT--------GCGGTA----TC---------C--------T-A------C-A--G---AT----GT---T---------ATCGG-C-CG-AGGTAT--TCCG-A
gi|12739                      :                                               TCG---GCCA-ACCTC-G-GC-GATT--------GTGAT---------------------A--TA-G---GT-T-C--G---GG----TT---A---------TTCAGCC-CG-AGGTGTTCGCCG-AAT--gagatttt
gi|12773                      :                           gttccattttatctgtccacTCG---GCCA-ACCTC-G-GCTGATT--------CCGG-A----ACCTA------C----A--TC-A---gaaatttt
gi|12745                      :                                    cagccgaggtaTCG---GCCA-ACCTC-A-GAATATT--------C--GTA----CCT--------C----A--T--A---GT---A--G---GTTCC-GG---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTG--GCGG-AAT--gtg
gi|12735                      :                                       tctgagcacCG---GCGA-ACCTC-G-GCTGATA--------CCAG-A----AC---------CTAT-A--TC-A----------------------C---A---------ATCGG-CGCAGAGGTGT--GCCG-Ag
gi|12768                      :                                   cgcgtcgcattttctgtccatc-ACCTC-G-GCCGATTACAT----CTAATG----AC------------------------GT-A-G--G---CTTCC-GG---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--caatgatttt
gi|12748                      :                                                             TC-A-GCCGATT--------TTGG-------C---------CGA--A--T--G---GT-T----G---AT----GT---AGGTTAAGGAATCAG-C-CG-AGGTTG--GCCG-AAT--g
gi|12771                      :                                                                                                                                 gtccggaa---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--ga
gi|12780                      :                                                                                                              cagccgaggtatgatgtaggtttccgg---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--g
gi|12775                      :                                                                                                                        tatgatgtaggttccgg---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--
gi|12782                      :                                                                                                                 gccgaggtatgatgtaggttccgg---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTT--GCCG-AAT--ggt
gi|12779                      :                                                                                                                        tatgatgtaggtcacgg---A---------ATCAG-C-CG-AGGTTC--GCCG-AAT--ggaatttt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12784 ): TATGATGTAGGTTCCGGAATCAACCGCGGTTCACCGAATGCTTCT






Alignments
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lowQualScore                  :                                 88     7    8 7  00     7      222    1 5555  66666666666666 00   111111  1      1      1 1     4 1     22      
consensus                     :                           TTTTCT--TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACC--------C----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGATTT
Reference ( family-352 )      :                           TTTTCT--TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGGTA----AC---------C----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGTNT-GCCGA-ATGATTT
gi|12731                      :                                 --TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGCTA---CCGG-A----AC---------CTAT-A--TCA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTG
gi|12732                      :               cacgtcccattttctgtc--TCATT-CGGCGA-GC--CTCGG-CTGATA---CCG--A----AC---------CTAT-A--TCA-------------CA-ATTGGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGtttt
gi|12733                      :               cacgtcccattttctgtc--TCATT-CGGCGA-AC--CTCGT-CTGATA---CC-GCA----AC---------CTAT-A--TCA-------------CA-ATCGGT-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGtttt
gi|12734                      :                   cacgtcccattttctgtcATT-CGCCGA-AT--ATCGG-CTAATA---CCGG-A----AC---------CT---A--T-----AT-TA-----CA-ATCGGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGtttt
gi|12735                      :               cacgtcccattttctgtc--TCATTGCGGCGA-AC--CTCGG-CTGATA---CCAG-A----AC---------CTAT-A--TCA-------------CA-ATCGGCGCAGAGGTGT-GCCGAGATGtttt
gi|12736                      :               cgcgtcgcattttctgtc--TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGTTA---CCGGGA----AC---------C----------------TA-TATCAC-ATCGGC-C-GAGGTGT-GCtttt
gi|12737                      : cacgtctcattttctgtcccacgatcTTTTCTGTCCACT-CGGCACCAC--CTCGC-CAGAT------GGTG----AT--------------A--TAG---GT-TC-G-CGTA-ATCA-C-C-GAGGTTTCGCCGA-ATGATTTtttt
gi|12738                      :                 acgttcccaaTTTTCT--TCATT-TGGAAA-AC--CTTGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----G--CCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGATTTt
gi|12739                      :                        acgttatcT--TCATT-CGGCGA-ACACCTCGGGCTGAATAACCCG--A----AC---------CTAT-A--TCA-------------CA-ATCG-C-C-GAGGTTG-GCCGA-GTG
gi|12740                      :          gttccattttatctgtcTTTTCC--TCATT-CGGCAA-AC--CTTAG-CTGATT---CTGGTA----TC---------C----G--CCA---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGATTTatttt
gi|12741                      :                        atcTTTTCC--GCATT-CGGCTA-AC--CTCGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----A--CCA---GT-TA-GATGTA-ATTAGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGATTT
gi|12742                      :                           TTTCCT--CCAT--CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CTAGTA----AC---------T----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTGGTTT
gi|12743                      :                          tTTTTCC--TCCTT-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-AAGGTGT-GCCGA-ATTATTT
gi|12744                      :                                 --TCATT-CGGCCA-AC--CTCAG-CTGATT---CCGG-A----AG---------T----A--TGAG--GT-TC-GA-ATA-TT---C-C-GAGGTTG-GCCGA-GTG
gi|12745                      :                              tttgccCATT-CCGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----AC---------CTACTA--TGA---GG-TACGA-ATA-TT---C-T-GAGGTTG-GCCGA-GTG
gi|12746                      :                              tctgagCAAT-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CC--TA----AC--------------A--TCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGTGA-TCCGA-GTG
gi|12747                      :                               ctttcCATC-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---GCGG-A----AC---------C-----------------------TA-ATCGGG-C-GAGGTGT-GCCGA-CTGA
gi|12748                      :                                  gtCATT-CGGCCA-AA--ATCGG-CTGATT---CCGG
gi|12748                      :                               gt--TCATT-CGGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CC-TTA----ACCTA------C----A--TCA---AC-C---AT-----TCGGC-C-AAAATCG-GCTGA-gttgatgtaggttaaggaatcagccgaggttggccgaatga
gi|12749                      :                         gtccggaa--TCATT-CGACAA-AC--TTCGG-CTGATT---CCGGTATTCTA----------C----A--TCA---A--------GTA-ATCGAC-C-GAGGTGA-TCCGA-GTG
gi|12750                      :                                  tcCATT-CGGCGA-AT--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTACATATAC----A--TCA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGt
gi|12751                      :                                   tccaT-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CTAGTA----AC---------T----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTG
gi|12752                      :                                c--TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTAATT---CCGG-A----AC---------CT---ACTTCATACGT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GA-GTGT-GCCGA-GTG
gi|12753                      :                                    CATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGGAA----GCCTA------C----G--TCA----T-TA-GTTGTA-ATCGGC-C-GAGGTGT-GCTGA-CTGtatt
gi|12754                      :                                 --TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCCCTA---------------C----A--TTA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGTGT-GCCGA-CTG
gi|12755                      :                                 --TCATT-CAGCGA-AC--CTCGG-CAGATT---CCGG-A----ACCTGA-----C----A--TCA------TA-GATGTACAT-GGC-T-GAGGTGT-G-CGA-GTG
gi|12756                      :                                 --TCATT-CAGCGA--C--CTCGA-CAGATT---CCGG-A----AC---------CTGACA--TCA------TA-GATGTA-ATCGGC-T-GA-GTGT-GCCGA-GTG
gi|12757                      :                                    CATT-CGGCTA-AC--CTCGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----A--CCA---GT-TA-GATGTA-ATTAGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTG
gi|12758                      :                                 --TCATT-CGGCAA-AC--CTTAG-CTGATT---CTGGTA----TC---------C----G--CCA---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTG
gi|12759                      :                                 --TCATT-TGGAAA-AC--CTTGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----G--CCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTG
gi|12760                      :                                    CATT-CGGCTA-AC---TCGG-CTGATT---CTGGTA----AC--------------A--CCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGCGT-GCCGA-GTG
gi|12761                      :                                 --TCCTT-CGGCAA-AC--CTCAG-CTGATT---CTGATA----AC---------C----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ACCATC-C-GAGGTGT-GCCGA-GTG
gi|12762                      :                                 --TCATT-CAGTAA-AC--CTTGG-CTGATT---TTGGTA----AC---------C----G--CCC---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-G-GAAGTGT-GCCGA-GTG
gi|12763                      :                                 --TCCTT-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----A--TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-AAGGTGT-GCCGA-A
gi|12764                      :                                 --TCGTT-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CTGGTA----AC---------C----G--CCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GACGTGT-TCCGA-G
gi|12765                      :                                       T-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---GCGGTA----TC---------C--------TA------CA-GATGTT-ATCGGC-C-GAGGTAT-TCCGA-GAGATTT
gi|12766                      :                                    CATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTAATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---ATGTA-GATGTA-ATCGGC-C-GAG---T-GCCt
gi|12767                      :                                    CATT-CAGCCA-AC--CTCGG-ATGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCAT--GT-TC-GATGCA-ATCGGT-C-gt
gi|12768                      :                            cactccgaCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGGAA----GCCTA------C----G--TCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT
gi|12769                      :                                    CATT-CGGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12770                      :                         cagccgagattCATT-CGGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12771                      :                         cagccgaggtaCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGGAA----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12772                      :                         cagccgaggtaCATT-CGGCTA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12773                      :                         cagccgaggtaCACT-CGGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12774                      :                         cagccgaggtaCATT-CGGCCA-AT--TTCGG-CTGATT---CCGA-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12775                      :                         cagccgaggtaCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---ggttt
gi|12776                      :                        gccgaggta--TTATT-TGGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGGGA----CCTA-------C----A--TCA---gt
gi|12777                      :                        gccgaggtt--TCATT-CGGCCA-AC--CTCGG-CTAATT---CCAA-A----AC---------C----
gi|12778                      :                    gccgaagtttaatgtaCATT-TGGCCA-AC--CTCGG-TTGATT---CCGGGA----CCTA-------C----A--TCA---t
gi|12779                      :                           gccgaggtaCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----AC---------C----
gi|12780                      :                              ttgtgtaATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12781                      :                               ta--TCATT-CGGCCA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12782                      :                              taT--CCATT-CGGCAA-AC--CTCGG-CTGATT---CC-GTG----ACCTA------C----A--TCA---gtt
gi|12783                      :                                  taCATT-CGGACA-AC--CTCGG-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---atttt
gi|12784                      :                                  taCATT-CGGTGA-AC--CGCGG-TTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---
gi|12785                      :                                  taCATT-CGACCA-AC--CTCGA-CTGATT---CCGG-A----ACCTA------C----A--TCA---cttct
gi|12786                      :                               ta--TCATT-CGGCGA-AC--CTCGG-CTGATA---CCGGAA----ACTCTA-----C----A--TCA---





Alignments
lowQualScore                  :                                                                           22222222       1111                                                 
lowQualScore                  :                                     0    33 11     0        00  0 0 1  1  88888888  11   0000 1  1    1 555555555      1 1     1              
lowQualScore                  :                                     .    .. ..     .        ..  . . .  .  ........  ..   .... .  .    . .........      . .     .              
lowQualScore                  :                                     7    22 00     7        99  7 7 4  4  00000000  00   9999 1  2    1 333333333      1 1     1              
consensus                     :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CCTA------CA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
Reference ( family-352 )      :                          TTTTCTTCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CC--------CA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12731                      :                                TCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGCTA--CC-G-G-AA-CC--------TA--T-----AT-CA----C-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12732                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-A--GCCTC-GGCTGATA--CC---G-AA-CC--------TA--T-----AT-CA----C-A---------ATTGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12733                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-A--ACCTC-GTCTGATA--CC-G-C-AA-CC--------TA--T-----AT-CA----C-A---------ATCGGT-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12734                      :                cacgtcccattttctgtcATT-CGCCG-A--ATATC-GGCTAATA--CC-G-G-AA-CC--------TA--T-----AT-TA----C-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12735                      :              cacgtcccattttctgtcTCATTGCGGCG-A--ACCTC-GGCTGATA--CC-A-G-AA-CC--------TA--T-----AT-CA----C-A---------ATCGGCGCAGAGGT-GTGCCGAGtttt
gi|12736                      :           cgcgtcgcattttctgtccatTCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGTTA--CCGG-G-AA-CC--------TA--T-----------ATCA-C---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCtttt
gi|12737                      :      cacgtctcattttctgtcccacgatcTCATT-CGGCGAA--ACCTC-GG-TGATT--AC-GCG-AA-CC--------TA--T-----AT-CA----C-C---------ATCTGG-C-GAGGTGGTGCCGAGTGtttt
gi|12738                      :       acgttcccaattttctgtcTTTTCTTCATT-TGGAA-A--ACCTT-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CG--CCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTTtttt
gi|12739                      :                       acgttatcTTCATT-CGGCG-AACACCTCGGGCTGAATAACC-C-G-AA-CC--------TA--T-----AT-CA----C-A---------ATC-GC-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12740                      :         gttccattttatctgtcTTTTCCTCATT-CGGCA-A--ACCTT-AGCTGATT--CT-G-G-TA-TC--------CG--CCA---AT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTTatttt
gi|12741                      :                       atcTTTTCCGCATT-CGGCT-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CA--CCA---GT-TAGATGT-A---------ATTAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12742                      :                          TTTCCTCCAT--CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-A-G-TA-AC--------TA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGGTTT
gi|12743                      :                         tTTTTCCTCCTT-CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-AAGGT-GTGCCGAATTATTT
gi|12744                      :                                TCATT-CGGCC-A--ACCTC-AGCTGATT--CC-G-G-AA--G--------TA--TGAG--GT-TCGA-AT-A---------TT---C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12745                      :                           tttgccCATT-CCGCC-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CC--------TA--CTA----T-GAGGTACGA---------ATATTC-T-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12746                      :                           tctgagCAAT-CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-T-A-A------------CA--TCA----T-TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
gi|12747                      :                            ctttcCATC-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--GC-G-G-AA-CC---------------------------T-A---------ATCGGG-C-GAGGT-GTGCCGACTGA
gi|12748                      :                               gtCATT-CGGCC-A--AAATC-GGCTGATT--CC-G-G-A
gi|12748                      :                                                 gTC-AGCCGATT--TT-G-G----CC--------GA--ATG---GT-T-GATGT-AGGTTAAGGAATCAGC-C-GAGGT-TGGCCGAATGAgttgatgtaggttaaggaatcagccgaggttggccgaatga
gi|12748                      :                        gtccggaaTCATT-CGGCC-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-T-T-AA-CCTA------CA--TCA---
gi|12749                      : gtccggaatcagccgattttggccgaatggtTCATT-CGACA-A--ACTTC-GGCTGATT--CC-G-G-TA-TTCTA-----CA--TCA---A-------GT-A---------ATCGAC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
gi|12750                      :                               tcCATT-CGGCG-A--ATCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CCTACATATACA--TCA------TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GAGt
gi|12751                      :                                tccaT-CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-A-G-TA-AC--------TA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12752                      :                               cTCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTAATT--CC-G-G-AA-CC--------TACTTCATACGT-TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12753                      :                                 CATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AAGCCTA------CG--TCA----T-TAGTTGT-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCTGACTGtatt
gi|12754                      :                                TCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--CC--------CCTA------CA--TTA------TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGACTG
gi|12755                      :                                TCATT-CAGCG-A--ACCTC-GGCAGATT--CC-G-G-AA-CCTGA-----CA--TCA------TAGATGT-AC--------AT-GGC-T-GAGGT-GTG-CGAGTG
gi|12756                      :                                TCATT-CAGCG-A---CCTC-GACAGATT--CC-G-G-AA-CCTGA-----CA--TCA------TAGATGT-A---------ATCGGC-T-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12757                      :                                 CATT-CGGCT-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CA--CCA---GT-TAGATGT-A---------ATTAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12758                      :                                TCATT-CGGCA-A--ACCTT-AGCTGATT--CT-G-G-TA-TC--------CG--CCA---AT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12759                      :                                TCATT-TGGAA-A--ACCTT-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CG--CCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12760                      :                                 CATT-CGGCT-A--AC-TC-GGCTGATT--CT-G-GTAA-C----------A--CCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-GAGGC-GTGCCGAGTG
gi|12761                      :                                TCCTT-CGGCA-A--ACCTC-AGCTGATT--CT-G-A-TA-AC--------CA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ACCATC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12762                      :                                TCATT-CAGTA-A--ACCTT-GGCTGATT--TT-G-G-TA-AC--------CG--CCC---AT-TAGATGT-A---------ATCAGC-G-GAAGT-GTGCCGAGTG
gi|12763                      :                                TCCTT-CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CA--TCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-AAGGT-GTGCCGAAT
gi|12764                      :                                TCGTT-CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--CT-G-G-TA-AC--------CG--CCA---GT-TAGATGT-A---------ATCAGC-C-GACGT-GTTCCGAGT
gi|12765                      :                                    T-CGGCA-A--ACCTC-GGCTGATT--GC-G-G-TA-TC--------C----TA------CAGATGT-T---------ATCGGC-C-GAGGT-ATTCCGAGAGATTT
gi|12766                      :                                 CATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTAATT--CC-G-G-AA-CCTA------CA--TCA---ATGTAGATGT-A---------ATCGGC-C-GA----GTGCCt
gi|12767                      :                                 CATT-CAGCC-A--ACCTC-GGATGATT--CC-G-G-AA-CCTA------CA--TCAT--GT-TCGATGC-A---------ATCGGT-C-TCGGA-GTGgt
gi|12768                      :                                 CATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AAGCCTA------CG--TCA----T-TAGATGT-A---------ATCGGC-C-GAGGT-
gi|12769                      :                                 CATT-CGGCC-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CCTA------CA--TCA---
gi|12770                      :                      cagccgagattCATT-CGGCC-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CCTA------CA--TCA---
gi|12771                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCG-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-GAAA-CCTA------CA--TCA---
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gi|12773                      :                      cagccgaggtaCACT-CGGCC-A--ACCTC-GGCTGATT--CC-G-G-AA-CCTA------CA--TCA---
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lowQualScore                  :                                     7    22   00     7      00  7 7 7  11  66666666  7    666666  1  1   1      1 1     1              
consensus                     :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
Reference ( family-352 )      :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12731                      :                                TCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGCTA--CC-G-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
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gi|12733                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-AAC--CTCGT-CTGATA--CC-G-C-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGT-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12734                      :                cacgtcccattttctgtcATT-CGCCG-AAT--ATCGG-CTAATA--CC-G-G-AA--CC------T-AT-ATTA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
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gi|12737                      :      cacgtctcattttctgtcccacgatcTCATT-CGGCGAAAC--CTCGG--TGATT--AC-GCG-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CC-ATCTGG-C-GAGGTGGTGCCGAGTGtttt
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gi|12739                      :                        acgttatcTCATT-CGGCG-AACACCTCGGGCTGAATAACC-C-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCG-C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
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gi|12742                      :                          TTTTCCTCCAT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-A-G-TA--AC------T-A---TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGGTTT
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gi|12744                      :                                TCATT-CGGCC-AAC--CTCAG-CTGATT--CC-G-G-AA------------GT-ATGAG--GT-TC-GA-ATA-TT---C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
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gi|12747                      :                            ctttcCATC-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--GC-G-G-AA--CC----------------------------TA-ATCGGG-C-GAGGT-GTGCCGACTGA
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gi|12748                      :                               gTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-T-T-AA--CC------T-AC-ATCA---gttgatgtaggttaaggaatcagccgaggttggccgaatga
gi|12749                      : gtccggaatcagccgattttggccgaatggtTCATT-CGACA-AAC--TTCGG-CTGATT--CC-G-GTAT--TC------T-AC-ATCA---A--------GTA-ATCGAC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
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gi|12751                      :                                tccaT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-A-G-TA--AC------T-A---TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12752                      :                               cTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-TTCATACGT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12753                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AAG-CC------T-AC-GTCA----T-TA-GTTGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCTGACTGtatt
gi|12754                      :                                TCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC---------CC------T-AC-ATTA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGACTG
gi|12755                      :                                TCATT-CAGCG-AAC--CTCGG-CAGATT--CC-G-G-AA--CC------TGAC-ATCA------TA-GATGTACAT-GGC-T-GAGGT-GTG-CGAGTG
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gi|12765                      :                                    T-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--GC-G-G-TAT-CC------T-AC-A------------GATGTT-ATCGGC-C-GAGGT-ATTCCGAGAGATTT
gi|12766                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---ATGTA-GATGTA-ATCGGC-C-GA----GTGCCt
gi|12767                      :                                 CATT-CAGCC-AAC--CTCGG-ATGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCAT--GT-TC-GATGCA-ATCGGT-C-TCGGA-GTGgt
gi|12768                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AAG-CC------T-AC-GTCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-
gi|12769                      :                                 CATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
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Alignments
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lowQualScore                  :                                     0    33   11     0      11  0 0 7  33  44444444  0    000000  1  0   1      1 1     1              
lowQualScore                  :                                     .    ..   ..     .      ..  . . .  ..  ........  .    ......  .  .   .      . .     .              
lowQualScore                  :                                     7    22   00     7      00  7 7 7  11  66666666  7    666666  1  1   1      1 1     1              
consensus                     :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
Reference ( family-352 )      :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12731                      :                                TCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGCTA--CC-G-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12732                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-AGC--CTCGG-CTGATA--CC---G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATTGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12733                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-AAC--CTCGT-CTGATA--CC-G-C-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGT-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12734                      :                cacgtcccattttctgtcATT-CGCCG-AAT--ATCGG-CTAATA--CC-G-G-AA--CC------T-AT-ATTA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12735                      :              cacgtcccattttctgtcTCATTGCGGCG-AAC--CTCGG-CTGATA--CC-A-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGCGCAGAGGT-GTGCCGAGtttt
gi|12736                      :           cgcgtcgcattttctgtccatTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGTTA--CCGG-G-AA--CC------T-AT-ATCA--------------C-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCtttt
gi|12737                      :      cacgtctcattttctgtcccacgatcTCATT-CGGCGAAAC--CTCGG--TGATT--AC-GCG-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CC-ATCTGG-C-GAGGTGGTGCCGAGTGtttt
gi|12738                      :       acgttcccaattttctgtcTTTTCTTCATT-TGGAA-AAC--CTTGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------GCCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTTtttt
gi|12739                      :                        acgttatcTCATT-CGGCG-AACACCTCGGGCTGAATAACC-C-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCG-C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12740                      :         gttccattttatctgtcTTTTCCTCATT-CGGCA-AAC--CTTAG-CTGATT--CT-G-G-TA--TC------C-GC---CA---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTTaatttt
gi|12741                      :                       atcTTTTCCGCATT-CGGCT-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ACCA---GT-TA-GATGTA-ATTAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12742                      :                          TTTTCCTCCAT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-A-G-TA--AC------T-A---TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGGTTT
gi|12743                      :                          TTTTCCTCCTT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-AAGGT-GTGCCGAATTATTT
gi|12744                      :                                TCATT-CGGCC-AAC--CTCAG-CTGATT--CC-G-G-AA------------GT-ATGAG--GT-TC-GA-ATA-TT---C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12745                      :                           tttgccCATT-CCGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-ACTATGA---GG-TACGA-ATA-TT---C-T-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12746                      :                           tctgagCAAT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-T-A-A--------------C-ATCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
gi|12747                      :                            ctttcCATC-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--GC-G-G-AA--CC----------------------------TA-ATCGGG-C-GAGGT-GTGCCGACTGA
gi|12748                      :                               gtCATT-CGGCC-AAA--ATCGG-CTGATT--CC-G-G-A
gi|12748                      :                               gTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-T-T-AA--CC------T-AC-ATCA---gttgatgtaggttaaggaatcagccgaggttggccgaatga
gi|12749                      : gtccggaatcagccgattttggccgaatggtTCATT-CGACA-AAC--TTCGG-CTGATT--CC-G-GTAT--TC------T-AC-ATCA---A--------GTA-ATCGAC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
gi|12750                      :                               tcCATT-CGGCG-AAT--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CCTACATAT-AC-ATCA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGt
gi|12751                      :                                tccaT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-A-G-TA--AC------T-A---TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12752                      :                               cTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-TTCATACGT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12753                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AAG-CC------T-AC-GTCA----T-TA-GTTGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCTGACTGtatt
gi|12754                      :                                TCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC---------CC------T-AC-ATTA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGACTG
gi|12755                      :                                TCATT-CAGCG-AAC--CTCGG-CAGATT--CC-G-G-AA--CC------TGAC-ATCA------TA-GATGTACAT-GGC-T-GAGGT-GTG-CGAGTG
gi|12756                      :                                TCATT-CAGCG-A-C--CTCGA-CAGATT--CC-G-G-AA--CC------TGAC-ATCA------TA-GATGTA-ATCGGC-T-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12757                      :                                 CATT-CGGCT-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ACCA---GT-TA-GATGTA-ATTAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12758                      :                                TCATT-CGGCA-AAC--CTTAG-CTGATT--CT-G-G-TA--TC------C-GC---CA---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12759                      :                                TCATT-TGGAA-AAC--CTTGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------GCCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12760                      :                                 CATT-CGGCT-AAC---TCGG-CTGATT--CT-G-G-TA------------AC-ACCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGC-GTGCCGAGTG
gi|12761                      :                                TCCTT-CGGCA-AAC--CTCAG-CTGATT--CT-G-ATAA--CC-----------ATCA---GT-TA-GATGTA-ACCATC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12762                      :                                TCATT-CAGTA-AAC--CTTGG-CTGATT--TT-G-GTAA--CC------G-CC---CA----T-TA-GATGTA-ATCAGC-G-GAAGT-GTGCCGAGTG
gi|12763                      :                                TCCTT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-AAGGT-GTGCCGAAT
gi|12764                      :                                TCGTT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------GCCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GACGT-GTTCCGAGT
gi|12765                      :                                    T-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--GC-G-G-TAT-CC------T-AC-A------------GATGTT-ATCGGC-C-GAGGT-ATTCCGAGAGATTT
gi|12766                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---ATGTA-GATGTA-ATCGGC-C-GA----GTGCCt
gi|12767                      :                                 CATT-CAGCC-AAC--CTCGG-ATGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCAT--GT-TC-GATGCA-ATCGGT-C-TCGGA-GTGgt
gi|12768                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AAG-CC------T-AC-GTCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-
gi|12769                      :                                 CATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12770                      :                      cagccgagattCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12771                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-GAAA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12772                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCT-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12773                      :                      cagccgaggtaCACT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12774                      :                    cagccgaggtaCCCATT-CGGCC-AAT--TTCGG-CTGATT--CC-G-A-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12775                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---ttt
gi|12776                      :                       gccgaggtaTTATT-TGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-GA--CC------T-AC-ATCA---gt
gi|12777                      :                       gccgaggttTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-A-A-AA--CC------T-AC-ATTA---
gi|12778                      :                        gccgaagttCATT-TGGCC-AAC--CTCGG-TTGATT--CC-G-G-GA--CC------T-AC-ATCA---t
gi|12779                      :                        gccgaggtaCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-A
gi|12780                      :                               ttgATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12781                      :                             taCTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12782                      :                               taCATT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-T-GA--CC------T-AC-ATCA---tt
gi|12783                      :                               taCATT-CGGAC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---gaatttt
gi|12784                      :                               taCATT-CGGTG-AAC--CGCGG-TTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12785                      :                               taCATT-CGACC-AAC--CTCGA-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---cttct
gi|12786                      :                              taTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATA--CC-G-G-AAACTC------T-AC-ATCA---


blockSeqs                     :                                          GA                         T  AC  TACATAT        TACGT   C      C      G A     G
blockSeqs                     :                                          G                          T  G   TG             GGT     .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          T  T   TG             ATG     .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          T  G   T              TGT     .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          T  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          T  .   T              AT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          T  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          T  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          T  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          T                          T  .   T              GG      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          A  .   C              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T              AT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T              GT      .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              T       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   C              A       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   G              T       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              T       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              T       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          T                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          T                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   T              .       .      .      . .     .
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T              .       .      .      . .      
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          T                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   T                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          A                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          C                          .  .   .                                             
blockSeqs                     :                                          G                          .                                                    


blockSeqCons                  :                                                                                           GT****
originalCons                  :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
finalCons                     :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCAGT----TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT





Alignments
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lowQualScore                  :                                     0    33   11     0      11  0 0 7  33  44444444  0    000000  1  0   1      1 1     1              
lowQualScore                  :                                     .    ..   ..     .      ..  . . .  ..  ........  .    ......  .  .   .      . .     .              
lowQualScore                  :                                     7    22   00     7      00  7 7 7  11  66666666  7    666666  1  1   1      1 1     1              
consensus                     :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
Reference ( family-352 )      :                          TTTTCCTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12731                      :                                TCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGCTA--CC-G-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12732                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-AGC--CTCGG-CTGATA--CC---G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATTGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12733                      :              cacgtcccattttctgtcTCATT-CGGCG-AAC--CTCGT-CTGATA--CC-G-C-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGT-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12734                      :                cacgtcccattttctgtcATT-CGCCG-AAT--ATCGG-CTAATA--CC-G-G-AA--CC------T-AT-ATTA-------------CA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGtttt
gi|12735                      :              cacgtcccattttctgtcTCATTGCGGCG-AAC--CTCGG-CTGATA--CC-A-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCGGCGCAGAGGT-GTGCCGAGtttt
gi|12736                      :           cgcgtcgcattttctgtccatTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGTTA--CCGG-G-AA--CC------T-AT-ATCA--------------C-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCtttt
gi|12737                      :      cacgtctcattttctgtcccacgatcTCATT-CGGCGAAAC--CTCGG--TGATT--AC-GCG-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CC-ATCTGG-C-GAGGTGGTGCCGAGTGtttt
gi|12738                      :       acgttcccaattttctgtcTTTTCTTCATT-TGGAA-AAC--CTTGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------GCCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTTtttt
gi|12739                      :                        acgttatcTCATT-CGGCG-AACACCTCGGGCTGAATAACC-C-G-AA--CC------T-AT-ATCA-------------CA-ATCG-C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12740                      :         gttccattttatctgtcTTTTCCTCATT-CGGCA-AAC--CTTAG-CTGATT--CT-G-G-TA--TC------C-GC---CA---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTTaatttt
gi|12741                      :                       atcTTTTCCGCATT-CGGCT-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ACCA---GT-TA-GATGTA-ATTAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGATTT
gi|12742                      :                          TTTTCCTCCAT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-A-G-TA--AC------T-A---TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTGGTTT
gi|12743                      :                          TTTTCCTCCTT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-AAGGT-GTGCCGAATTATTT
gi|12744                      :                                TCATT-CGGCC-AAC--CTCAG-CTGATT--CC-G-G-AA------------GT-ATGAG--GT-TC-GA-ATA-TT---C-C-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12745                      :                           tttgccCATT-CCGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-ACTATGA---GG-TACGA-ATA-TT---C-T-GAGGT-TGGCCGAGTG
gi|12746                      :                           tctgagCAAT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-T-A-A--------------C-ATCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
gi|12747                      :                            ctttcCATC-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--GC-G-G-AA--CC----------------------------TA-ATCGGG-C-GAGGT-GTGCCGACTGA
gi|12748                      :                               gtCATT-CGGCC-AAA--ATCGG-CTGATT--CC-G-G-A
gi|12748                      :                               gTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-T-T-AA--CC------T-AC-ATCA---gttgatgtaggttaaggaatcagccgaggttggccgaatga
gi|12749                      : gtccggaatcagccgattttggccgaatggtTCATT-CGACA-AAC--TTCGG-CTGATT--CC-G-GTAT--TC------T-AC-ATCA---A--------GTA-ATCGAC-C-GAGGT-GATCCGAGTG
gi|12750                      :                               tcCATT-CGGCG-AAT--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CCTACATAT-AC-ATCA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGt
gi|12751                      :                                tccaT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-A-G-TA--AC------T-A---TCA---GT-TA-GATGTA-ATCAAC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12752                      :                               cTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-TTCATACGT-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12753                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AAG-CC------T-AC-GTCA----T-TA-GTTGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCTGACTGtatt
gi|12754                      :                                TCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC---------CC------T-AC-ATTA------TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-GTGCCGACTG
gi|12755                      :                                TCATT-CAGCG-AAC--CTCGG-CAGATT--CC-G-G-AA--CC------TGAC-ATCA------TA-GATGTACAT-GGC-T-GAGGT-GTG-CGAGTG
gi|12756                      :                                TCATT-CAGCG-A-C--CTCGA-CAGATT--CC-G-G-AA--CC------TGAC-ATCA------TA-GATGTA-ATCGGC-T-GA-GT-GTGCCGAGTG
gi|12757                      :                                 CATT-CGGCT-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ACCA---GT-TA-GATGTA-ATTAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12758                      :                                TCATT-CGGCA-AAC--CTTAG-CTGATT--CT-G-G-TA--TC------C-GC---CA---AT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12759                      :                                TCATT-TGGAA-AAC--CTTGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------GCCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12760                      :                                 CATT-CGGCT-AAC---TCGG-CTGATT--CT-G-G-TA------------AC-ACCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GAGGC-GTGCCGAGTG
gi|12761                      :                                TCCTT-CGGCA-AAC--CTCAG-CTGATT--CT-G-ATAA--CC-----------ATCA---GT-TA-GATGTA-ACCATC-C-GAGGT-GTGCCGAGTG
gi|12762                      :                                TCATT-CAGTA-AAC--CTTGG-CTGATT--TT-G-GTAA--CC------G-CC---CA----T-TA-GATGTA-ATCAGC-G-GAAGT-GTGCCGAGTG
gi|12763                      :                                TCCTT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------ATCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-AAGGT-GTGCCGAAT
gi|12764                      :                                TCGTT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CT-G-GTAA--CC-----------GCCA---GT-TA-GATGTA-ATCAGC-C-GACGT-GTTCCGAGT
gi|12765                      :                                    T-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--GC-G-G-TAT-CC------T-AC-A------------GATGTT-ATCGGC-C-GAGGT-ATTCCGAGAGATTT
gi|12766                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---ATGTA-GATGTA-ATCGGC-C-GA----GTGCCt
gi|12767                      :                                 CATT-CAGCC-AAC--CTCGG-ATGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCAT--GT-TC-GATGCA-ATCGGT-C-TCGGA-GTGgt
gi|12768                      :                                 CATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AAG-CC------T-AC-GTCA----T-TA-GATGTA-ATCGGC-C-GAGGT-
gi|12769                      :                                 CATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12770                      :                      cagccgagattCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12771                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-GAAA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12772                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCT-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12773                      :                      cagccgaggtaCACT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12774                      :                    cagccgaggtaCCCATT-CGGCC-AAT--TTCGG-CTGATT--CC-G-A-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12775                      :                      cagccgaggtaCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---ttt
gi|12776                      :                       gccgaggtaTTATT-TGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-GA--CC------T-AC-ATCA---gt
gi|12777                      :                       gccgaggttTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTAATT--CC-A-A-AA--CC------T-AC-ATTA---
gi|12778                      :                        gccgaagttCATT-TGGCC-AAC--CTCGG-TTGATT--CC-G-G-GA--CC------T-AC-ATCA---t
gi|12779                      :                        gccgaggtaCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-A
gi|12780                      :                               ttgATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12781                      :                             taCTCATT-CGGCC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12782                      :                               taCATT-CGGCA-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-T-GA--CC------T-AC-ATCA---tt
gi|12783                      :                               taCATT-CGGAC-AAC--CTCGG-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---gaatttt
gi|12784                      :                               taCATT-CGGTG-AAC--CGCGG-TTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---
gi|12785                      :                               taCATT-CGACC-AAC--CTCGA-CTGATT--CC-G-G-AA--CC------T-AC-ATCA---cttct
gi|12786                      :                              taTCATT-CGGCG-AAC--CTCGG-CTGATA--CC-G-G-AAACTC------T-AC-ATCA---