lowQualScore                  :                       111                                                                                                                                    
lowQualScore                  :       2222 555   555  555 0 33 0  222  1 0  0  11 11111     11 11 11 111 4444444444  0   111111 22 0  1111 0 666 2  0 222222 99999   1    2222 5 11 77  0    
lowQualScore                  :       .... ...   ...  ... . .. .  ...  . .  .  .. .....     .. .. .. ... ..........  .   ...... .. .  .... . ... .  . ...... .....   .    .... . .. ..  .    
lowQualScore                  :       5555 888   666  666 9 11 9  333  6 8  8  11 99999     88 00 88 333 7777777777  7   777777 00 7  5555 7 444 2  7 222222 44444   5    6666 6 22 00  9    
consensus                     : GTCATT----CG--TCA--GAT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCT
Reference ( gi|68834 )        : GTCATT----CA--TCA--AAT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--C--CAG-TTTT----ATT--GG-TA-TTCT
gi|68837                      : GTCATT----CA--TGA--AAT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AA-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TT-TTCT
gi|68840                      : GTCATT----CA--TCA--AAT---A-A--A-TA---TT-T-GA-TT--G-----CTAAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-A------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCt
gi|68841                      : GTCATT----CG--TCA--AAT---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAGATA--T--G---C----------AG-TTC-G----G--A-GA----G-T---A-TC-C------A--T--CAA-TTTT----ACT--GA-TA-Tccgtt
gi|68839                      : GTCATT----CG--TGA--AAT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---G----------AA-TTC-A----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCT
gi|68835                      : GTCATT----TG--TCA--GATG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---T----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-CATGTGGA--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTtgtt
gi|68836                      : GTCATT----CA--TCA--GATG--A-A--G-TA---TT-TTCA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---A----------GG-TTC-G----G--G-AA----A-C---A-CC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--TA-TA-TTtatt
gi|68838                      : GTCATC----CG--TCA--GATG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----CTTAG--A--T--G---T----------AG-TTC-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A--TTATAGTTTTT----ACT--GA-TA-TCCTattcttgt
gi|68847                      : GTCAGT----CA--TCA--AGT---A-G--G-TA---TA-T-CA-TT--C-----GTTTA--A--A--G---C----------AT-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--CGG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTtgt
gi|68844                      : GTCATT----TG--TCA--GATG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---T----------AG-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A--T--CAG-TTtgt
gi|68843                      : GTCATT----TG--TCA--GATG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---T----------AG-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A--T--CAG---TT----GTT--GA-TT-TTCgttgatttttcgt
gi|68842                      : GTCATT----CG--TCA--TTTG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----CTTAG--A--T--G---T----------AG-TGC------A--G-GA----G-C---A-TC-G------A--A--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTgtg
gi|68846                      : GTCATT----CG--TCA--GAT---A-A--G-TAATATT-T-CA-TT--G-----GTAAG--A--T--A---TG---------AT-TTT-G----T--A-GA----A-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTtgtt
gi|68850                      : GCCATT----CG--TCA--AAT---A-A--G-T------------------------TAG--A--T--A---C----------AG-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TA-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTggtt
gi|68849                      : GTTATT----TG--TCAT-AAT---GTA--G-TA---GT-A-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTT-A----G--G-GAGCATG-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--Gt
gi|68848                      : GTCATT----TG--TCA--GGT---A-AA-G-TA---TT-T-TA-TA--C-----GTTAG--G--G--G---C----------AG-TTC-A----G--G-CA----C-C---A-TC-C------A--T--CAT-TTTT----ACT--AA-TA-TTCTaatatatttttgt
gi|68852                      : GTCATT----CG--T----GATTGGG-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTT-GGGTTG--G-GA----G-C---A-TC-C------A--A--TA--TTTT----Acgtt
gi|68845                      : GTCATT----C---T-----ATG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAT--A--TCTA---C----------AG-TTC-A----G--G-GG----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACTAAAA-TA-TTCTc
gi|68851                      : GCCATT----CG--TTA--GATG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--A-----GTT--------------------------G-T--------A--G-GA----G-C---A-TC-C------A--C--CAG-TTTT----AGT--GA-TA-TTCTtgtt
gi|68856                      : GTCAAC----CG--TCA--AAT---A-A--G-T-----T-T-CA-TT--A-----GATAA--A--T--G---C----------AG-TTC-C----A--G-GA----A-C---A-TC-C------A--T--CAtgtt
gi|68853                      : GTCATT----CG--TCA--TATG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TC--G-----GTGAT--A--T--G--------------------------G--G-GA----G-C---T-TC-C------A--T--CAG-TTT
gi|68854                      : GTTATT----TG--TCG--AA---------G-TA---GT-C-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--A---TTCTATCATATAG-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--TAG-TTT
gi|68855                      : GTCATTTTGTCA--TAA--GA----A-A--A-TAA--TTGT-CC-TT--G-----GTTAA--A--T--G---C----------AG-TTG-G----G--G-AG----G-C---A-TCAC------A--T--CAG-TTTgtac
gi|68857                      :  TCATT----CG--TCA--TGTG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAA--A--T--G---T----------AG-TTC-G----G--G-AA----G-C---T-TC-C------T--T--CAG-TTTT----GCT--GG-TA-TTCT
gi|68858                      :  TCATC----CT--TCA--TATG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-ATC-A----G--C-GT----T-C---A-TC-C------A--T--CAC-TTTT----ACT--CA-TA-TTCTtgtt
gi|68862                      :  TCATT----CGCGTCA--AAT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTA---A--T------C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-T------C--T--CAG-TTCT----tgtt
gi|68859                      :  TCATT----TG--TCA--TAT---G-A--G-TA---GT-T-TA-TTAAG-----GTTAC--A--T--G---C----------AC-TTA-G----G--G-GA----G-C---A-TA-T------A--T--CAG-TTTT----GCT--GA-CA-TTCT
gi|68861                      :  TCATT-----G--TCAG-AAT---G-AAGG-TA---TT---CA-AT--A-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-tgt
gi|68860                      :  TTATT----CG--TTA--GATG--A-A--G-TA---TT-T-G------G-----GCTAG--A--T--G---C----------AGTTTT-G----G--G-GA----G-C-----TT-A------A--T--CAGTTTTT----ACT--GA-AA-TTCT
gi|68863                      :   CATT----CA--TCA--TATG--A-A--G-TA---TT----------G-----ATTAA--T--T--G---T----------AG-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TT-TTtgt
gi|68864                      :    ATT----CG--TCG--GATG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----GTTAG--A--A--G---C----------AG-GCC-A----G--G-GA----G-T---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACC--GA-TA-TTCTtgtt
gi|68865                      :    ATT----CA--ACAGTATT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--GGCCC----------AA-TTC-G----G--A-AC----A-T---A-TT-T------A--T--CAG-TTTT----ACT-----TA-TTtgtt
gi|68866                      :     TT----TG--TCA--GAT---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG--ATCT--G---C----------AT-TTC------G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--TAG--TCT----ACT--GA-TA-TTCTtctgtt
gi|68867                      :     TT----TG--TCA--AAT---A-AA-G-TA---TT-C-TA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTT-G----G--G-GA----C-C---A-CC-C------A--T--CAC-TTGT----ACT--TT-TA-TTCTtgt
gi|68869                      :      T----CG--TCA--AAT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTAAA--A--T--G---C----------AT-ATC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TA-C------A--T--CGG-TTTTACTAATC--GA-TA-TTCT
gi|68870                      :             --TCA--AAT---G-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----ATAAG--A--T--G---C----------AA-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTtgtt
gi|68871                      :                CA--GATG--A-A--G-TA---CT-T-TA-TT--G-----ATCAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----A--A-GA----tgtt
gi|68873                      :                      T---A-A--GATA---TT-T-CAATT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AA-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TAGTTCTatagtcattgtatttatgat
gi|68875                      :                    atT---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTAG--A--TC-G---C----------AA-TTC-G----G--G-GA----G-CAATA-TT-C------A--T--CAT-TTTT----ACT--GA-TA-TTgtt
gi|68872                      :                     at---A-A--G-TA---TT---CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-CTT-G----G--GTGA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG--TTT----ACT--GA-TA-TTCTtcttgtt
gi|68878                      :                   atga---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AA-TTC-G----G--G-GG----G-C---A-TT-C------A---------TTTT----ACT--GA-TA-TTTTtgt
gi|68874                      :                       ---A-A--A-TA---GT-T-CA-TG--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-T------A--T--CAG--TTT----ATT--tg
gi|68879                      :                    atg---A-A--G-GA---TTGT-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--T-GA----G-C---A-TC-C------A--T--C-G-TTTTA---ACT--AA-TA-TTTTctacactgatattttt
gi|68876                      :                       ---A-A--G-T----TT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---T----------AG-TTC-T----G--G-GA----G-C---G-TA-C------A--T--CAG-ATTT----ACT--Gtgt
gi|68880                      :                         tg-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAGA-A--T--G---C----------AA-TTT-G----G--G-GA----GAT---A-TT-C------AT-T--CAG-TCTT----A-T--GA-TA-TTTT
gi|68881                      :                                -TA---AT-T-CA-TT--G-----GTTAG--A--T--G---T----------AG-TCA-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A--T--CAG-CCTT----ACT--GA-TA-TTtgtt
gi|68882                      :                                -TA---TT-C-CA-TT--A-----GTTAG--A--T--G---CA---------AG-TTT------T--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--CAA-TTTT----ACT--GA-TA-Ttcctgtt
gi|68877                      :                                  A---TT-A-CA-TT--A-----GTTAG--A--T--G---C----------AA-TTT------G--G-GA----A-C---ATTC-C------A--T--CAT-CTTT----ATT--GA-TA-Tctgtt
gi|68883                      :                              tgaaA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG--A--T--A---C----------AG-TTT------G--G-AA----G-C---G-TT-T------T--A--CAG-TTTT----ACT--GT-TA-GTCT
gi|68884                      :                                       T-T-CA-TT--GTGTAGGTTAG--A--T--A---C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-CA-TTCTcgtt
gi|68885                      :                                        -T-CA-TT--C-----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTCTT----G--G-AA----G-C---A-TC-C------AATC--AAA-TTTT-----CT--GA-TA-TTCTt
gi|68886                      :                                             -TT--G-----GTTAG--A--T--G---C----------TG-TTC-G----T--T-AA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--AA-TA-TTCTtgt
gi|68887                      :                                                   -----GTTAG--A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-C------A--T--CAG-TCTT----ACT--GA-TA-TTCTtgtt
gi|68888                      :                                                             --A--T--G---C----------AG-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TGTT----ACA--GT-TA-TTCTtgtt
gi|68868                      :                                                             --A--T--G---C----------AG-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-C------A--T--CAG-TGTT----ACC--AGTTA-TTCTtgtt
gi|68889                      :                                                             ttcctcatgaatgcatgccatggtgaaca-G----A--G-GA----G-C---A-TA-C------A--T--CAG-TTTT----ACT--GA-TA-TTCTtgtt





Alignments
lowQualScore                  :                                               111                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                1 11   55555 1 666 0 33 0  222  1 0  0  11 11111     0 11 22 111 3333333333 0 0   0 1111 22 0  1111 0 666 2  0 222222 0 11   1 0  222222 0   3333 111   0    
lowQualScore                  :                                . ..   ..... . ... . .. .  ...  . .  .  .. .....     . .. .. ... .......... . .   . .... .. .  .... . ... .  . ...... . ..   . .  ...... .   .... ...   .    
lowQualScore                  :                                1 55   88888 0 111 9 00 9  222  6 8  8  11 99999     7 00 77 333 9999999999 7 7   7 5555 00 7  5555 7 222 1  7 888888 7 00   5 7  999999 8   7777 444   9    
consensus                     :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
Reference ( family-351 )      :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68834                      :                         GTCATTC-A--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-C--CAG-T-TT------T-ATT----G---GTA-TTCT
gi|68835                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-CATGTGGA-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68836                      :                         GTCATTC-A--TCA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-TTCA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---A----------G-G-TTC-G----G--G-AA----A-C---A-CC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----T---ATA-TTtatt
gi|68837                      :                         GTCATTC-A--TGA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATT-TTCTattcttgt
gi|68838                      :                         GTCATCC-G--TCA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----CTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A-TTATAGTT-TT------T-ACT----G---ATA-TCCTt
gi|68839                      :                         GTCATTC-G--TGA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---G----------A-A-TTC-A----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgt
gi|68840                      :                         GTCATTC-A--TCA---A-A-T---A-A--A-TA---TT-T-GA-TT--G-----CTAAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-A------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCtgtt
gi|68841                      :                         GTCATTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-A--TATG---C----------A-G-TTC-G----G--A-GA----G-T---A-TC-C------A-T--CAA-T-TT------T-ACT----G---ATA-Tccgtt
gi|68842                      :                         GTCATTC-G--TCA---T-T-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----CTTAG-A--T--G---T----------A-G-TGC-A----G--G--A----G-C---A-TC-G------A-A--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68843                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A-T--CAG-T-TG------T---T----G---ATT-TTCtgtt
gi|68844                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A-T--CAG-T-TG------T---T----G---ATT-TTgtg
gi|68845                      :                         GTCATTC----T-------A-TG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAT-A--TCTA---C----------A-G-TTC-A----G--G-GG----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACTAA--A---ATA-TTCTtcgt
gi|68846                      :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TAATATT-T-CA-TT--G-----GTAAG-A--T--A---TG---------A-T-TTT-G----T--A-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68847                      :                         GTCAGTC-A--TCA---A-G-T---A-G--G-TA---TA-T-CA-TT--C-----GTTTA-A--A--G---C----------A-T-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CGG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTggtt
gi|68848                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-G-T---A-AA-G-TA---TT-T-TA-TA--C-----GTTAG-G--G--G---C----------A-G-TTC-A----G--G-CA----C-C---A-TC-C------A-T--CAT-T-TT------T-ACT----A---ATA-TTCTtgt
gi|68849                      :                         GTTATTT-G--TCAT--A-A-T---GTA--G-TA---GT-A-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-A----G--G-GAGCATG-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----GAATATA-TTTTcgtt
gi|68850                      :                         GCCATTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-T------------------------TAG-A--T--A---C----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TA-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgt
gi|68851                      :                         GCCATTC-G--TTA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--A-----GTT--------------------------G-T--------A--G-GA----G-C---A-TC-C------A-C--CAG-T-TT------T-AGT----G---ATA-TTCTt
gi|68852                      :                         GTCATTC-G--T-----G-A-TTGGG-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-GGGTTG--G-GA----G-C---A-TC-C------A-A--TA--T-TT------T-ACtgtt
gi|68853                      :                         GTCATTC-G--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TC--G-----GTGAT-A--T--G---------------------------G--G-GA----G-C---T-TC-C------A-T--CAG-T-TT------
gi|68854                      :                         GTTATTT-G--TCG-----------A-A--G-TA---GT-C-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--A---TTCTATCATATA-G-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--TAG-T-TTG-----T-AC
gi|68855                      :                         GTCATTTTG--TCATAAG-A-----A-A--A-TAA--TTGT-CC-TT--G-----GTTAA-A--T--G---C----------A-G-TTG-G----G--G-AG----G-C---A-TCAC------A-T--CAG-T-TT------
gi|68856                      :                         GTCAACC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-T-----T-T-CA-TT--A-----GATAA-A--T--G---C----------A-G-TTC-C----A--G-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CA
gi|68857                      :                          TCATTC-G--TCA---T-G-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAA-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---T-TC-C------T-T--CAG-T-TT------T-GCT----G---GTA-TTCT
gi|68858                      :                          TCATCC-T--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-ATC-A----G--C-GT----T-C---A-TC-C------A-T--CAC-T-TT------T-ACT----C---ATA-TTCTtgtt
gi|68859                      :                          TCATTT-G--TCA---T-A-T---G-A--G-TA---GT-T-TA-TTAAG-----GTTAC-A--T--G---C----------A-C-TTA-G----G--G-GA----G-C---A-TA-T------A-T--CAG-T-TT------T-GCT----G---ACA-TTCTtgtt
gi|68860                      :                          TTATTC-G--TTA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-T-G------G-----GCTAG-A--T--G---C----------A-GTTTT-G----G--G-GA----G-C-----TT-A------A-T--CAGTT-TT------T-ACT----G---AAA-TTCTtgt
gi|68861                      :                          TCATT--G--TCA---G-AAT---G-AAGG-TA---TT---CA-AT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-tgt
gi|68862                      :                          TCATTC-GCGTCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTA--A--T------C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-T------C-T--CAG-T-TC------T-
gi|68863                      :                           CATTC-A--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---TT----------G-----ATTAA-T--T--G---T----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATT-TT
gi|68864                      :                            ATTC-G--TCG---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----GTTAG-A--A--G---C----------A-G-GCC-A----G--G-GA----G-T---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACC----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68865                      :                            ATTC-A--ACA---GTA-TT--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--GGCCC----------A-A-TTC-G----G--A-AC----A-T---A-TT-T------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----T---AT--TTCTtgtt
gi|68866                      :                             TTT-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-ATCT--G---C----------A-T-TTC------G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--TAG---TC------T-ACT----G---ATA-TTCTgtt
gi|68867                      :                             TTT-G--TCA---A-A-T---A-AA-G-TA---TT-C-TA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-G----G--G-GA----C-C---A-CC-C------A-T--CAC-T-TG------T-ACT----T---TTA-TTCTtgt
gi|68868                      :                                                                                     -A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-GT------T-ACCA---G---TTA-TTCT
gi|68869                      : ttcctcatgaatgcatgccatggtgaacaTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTAAA-A--T--G---C----------A-T-ATC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TA-C------A-T--CGG-T-TT------T-ACTAATCG---ATA-TTCTtgtt
gi|68870                      :                                  --TCA---A-A-T---G-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----ATAAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68871                      :                                     CA---G-A-TG--A-A--G-TA---CT-T-TA-TT--G-----ATCAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----A--A-GA----A-T---A-GT-C------A-T--T-G-TATT------T-A-T----G---ATtgtt
gi|68872                      :                                               ---A-A--G-TA---TT---CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-CTT-G----G--GTGA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG---TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68873                      :                                         atga-T---A-A--GATA---TT-T-CAATT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATAGTTCTtgt
gi|68874                      :                                             at---A-A--A-TA---GT-T-CA-TG--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-T------A-T--CAG-T-TTATTCTAC-ACT----G---ATA-TTTTgtt
gi|68875                      :                                          atg-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTAG-A--TC-G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAATA-TT-C------A-T--CAT-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTt
gi|68876                      :                                             at---A-A--G-T----TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-T----G--G-GA----G-C---G-TA-C------A-T--CAG-A-TT------T-ACT----G---tcttgtt
gi|68877                      :                                                        tgA---TT-A-CA-TT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTT------G--G-GA----A-C---ATTC-C------A-T--CAT-C-TT------T-ATT----G---ATA-T
gi|68878                      :                                           tgaa---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GG----G-C---A-TT-C------A--------T-TT------T-ACT----G---ATA-TTTT
gi|68879                      :                                               ---A-A--G-GA---TTGT-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--T-GA----G-C---A-TC-C------A-T--C-G-T-TT------TAACT----A---ATA-TTTTtg
gi|68880                      :                                                   -A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAGAA--T--G---C----------A-A-TTT-G----G--G-GA----GAT---A-TT-C------ATT--CAG-T-CT------T-A-T----G---ATA-TTTTtgt
gi|68881                      :                                                        -TA---AT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TCA-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CAG-C-CT------T-ACT----G---ATA-TTtgtt
gi|68882                      :                                                        -TA---TT-C-CA-TT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------AAG-TTT-T----G--G--A----G-C---A-TC-C------A-T--CAA-T-TT------T-ACT----G---ATA-Ttcctgtt
gi|68883                      :                                                          A---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-A--T--A---C----------A-G-TTT------G--G-AA----G-C---G-TT-T------T-A--CAG-T-TT------T-ACT----G---TTA-GTCTctgtt
gi|68884                      :                                                               T-T-CA-TT--GTGTAGGTTAG-A--T--A---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ACA-TTCTcgtt
gi|68885                      :                                                                -T-CA-TT--C-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTCTT----G--G-AA----G-C---A-TC-CA-----A-T--CAA-A-TT------T-TCT----G---ATA-TTCTt
gi|68886                      :                                                                     -TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------T-G-TTC-G----T--T-AA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----A---ATA-TTCTtgt
gi|68887                      :                                                                           -----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-C------A-T--CAG-T-CT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68888                      :                                                                                     -A--T--G---C----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-GT------T-ACA----G---TTA-TTCTtgtt
gi|68889                      :                                                                                                                  -G----A--G-GA----G-C---A-TA-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt





Alignments
lowQualScore                  :                                               111                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                1 11   55555 1 666 0 33 0  222  1 0  0  11 11111     0 11 22 111 3333333333 0 0   0 1111 22 0  1111 0 666 2  0 222222 0 11   1 0  222222 0   3333 111   0    
lowQualScore                  :                                . ..   ..... . ... . .. .  ...  . .  .  .. .....     . .. .. ... .......... . .   . .... .. .  .... . ... .  . ...... . ..   . .  ...... .   .... ...   .    
lowQualScore                  :                                1 55   88888 0 111 9 00 9  222  6 8  8  11 99999     7 00 77 333 9999999999 7 7   7 5555 00 7  5555 7 222 1  7 888888 7 00   5 7  999999 8   7777 444   9    
consensus                     :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
Reference ( family-351 )      :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68834                      :                         GTCATTC-A--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-C--CAG-T-TT------T-ATT----G---GTA-TTCT
gi|68835                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-CATGTGGA-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68836                      :                         GTCATTC-A--TCA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-TTCA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---A----------G-G-TTC-G----G--G-AA----A-C---A-CC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----T---ATA-TTtatt
gi|68837                      :                         GTCATTC-A--TGA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATT-TTCTattcttgt
gi|68838                      :                         GTCATCC-G--TCA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----CTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A-TTATAGTT-TT------T-ACT----G---ATA-TCCTt
gi|68839                      :                         GTCATTC-G--TGA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---G----------A-A-TTC-A----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgt
gi|68840                      :                         GTCATTC-A--TCA---A-A-T---A-A--A-TA---TT-T-GA-TT--G-----CTAAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-A------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCtgtt
gi|68841                      :                         GTCATTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-A--TATG---C----------A-G-TTC-G----G--A-GA----G-T---A-TC-C------A-T--CAA-T-TT------T-ACT----G---ATA-Tccgtt
gi|68842                      :                         GTCATTC-G--TCA---T-T-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----CTTAG-A--T--G---T----------A-G-TGC-A----G--G--A----G-C---A-TC-G------A-A--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68843                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A-T--CAG-T-TG------T---T----G---ATT-TTCtgtt
gi|68844                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A-T--CAG-T-TG------T---T----G---ATT-TTgtg
gi|68845                      :                         GTCATTC----T-------A-TG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAT-A--TCTA---C----------A-G-TTC-A----G--G-GG----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACTAA--A---ATA-TTCTtcgt
gi|68846                      :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TAATATT-T-CA-TT--G-----GTAAG-A--T--A---TG---------A-T-TTT-G----T--A-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68847                      :                         GTCAGTC-A--TCA---A-G-T---A-G--G-TA---TA-T-CA-TT--C-----GTTTA-A--A--G---C----------A-T-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CGG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTggtt
gi|68848                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-G-T---A-AA-G-TA---TT-T-TA-TA--C-----GTTAG-G--G--G---C----------A-G-TTC-A----G--G-CA----C-C---A-TC-C------A-T--CAT-T-TT------T-ACT----A---ATA-TTCTtgt
gi|68849                      :                         GTTATTT-G--TCAT--A-A-T---GTA--G-TA---GT-A-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-A----G--G-GAGCATG-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----GAATATA-TTTTcgtt
gi|68850                      :                         GCCATTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-T------------------------TAG-A--T--A---C----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TA-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgt
gi|68851                      :                         GCCATTC-G--TTA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--A-----GTT--------------------------G-T--------A--G-GA----G-C---A-TC-C------A-C--CAG-T-TT------T-AGT----G---ATA-TTCTt
gi|68852                      :                         GTCATTC-G--T-----G-A-TTGGG-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-GGGTTG--G-GA----G-C---A-TC-C------A-A--TA--T-TT------T-ACtgtt
gi|68853                      :                         GTCATTC-G--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TC--G-----GTGAT-A--T--G---------------------------G--G-GA----G-C---T-TC-C------A-T--CAG-T-TT------
gi|68854                      :                         GTTATTT-G--TCG-----------A-A--G-TA---GT-C-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--A---TTCTATCATATA-G-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--TAG-T-TTG-----T-AC
gi|68855                      :                         GTCATTTTG--TCATAAG-A-----A-A--A-TAA--TTGT-CC-TT--G-----GTTAA-A--T--G---C----------A-G-TTG-G----G--G-AG----G-C---A-TCAC------A-T--CAG-T-TT------
gi|68856                      :                         GTCAACC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-T-----T-T-CA-TT--A-----GATAA-A--T--G---C----------A-G-TTC-C----A--G-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CA
gi|68857                      :                          TCATTC-G--TCA---T-G-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAA-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---T-TC-C------T-T--CAG-T-TT------T-GCT----G---GTA-TTCT
gi|68858                      :                          TCATCC-T--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-ATC-A----G--C-GT----T-C---A-TC-C------A-T--CAC-T-TT------T-ACT----C---ATA-TTCTtgtt
gi|68859                      :                          TCATTT-G--TCA---T-A-T---G-A--G-TA---GT-T-TA-TTAAG-----GTTAC-A--T--G---C----------A-C-TTA-G----G--G-GA----G-C---A-TA-T------A-T--CAG-T-TT------T-GCT----G---ACA-TTCTtgtt
gi|68860                      :                          TTATTC-G--TTA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-T-G------G-----GCTAG-A--T--G---C----------A-GTTTT-G----G--G-GA----G-C-----TT-A------A-T--CAGTT-TT------T-ACT----G---AAA-TTCTtgt
gi|68861                      :                          TCATT--G--TCA---G-AAT---G-AAGG-TA---TT---CA-AT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-tgt
gi|68862                      :                          TCATTC-GCGTCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTA--A--T------C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-T------C-T--CAG-T-TC------T-
gi|68863                      :                           CATTC-A--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---TT----------G-----ATTAA-T--T--G---T----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATT-TT
gi|68864                      :                            ATTC-G--TCG---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----GTTAG-A--A--G---C----------A-G-GCC-A----G--G-GA----G-T---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACC----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68865                      :                            ATTC-A--ACA---GTA-TT--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--GGCCC----------A-A-TTC-G----G--A-AC----A-T---A-TT-T------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----T---AT--TTCTtgtt
gi|68866                      :                             TTT-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-ATCT--G---C----------A-T-TTC------G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--TAG---TC------T-ACT----G---ATA-TTCTgtt
gi|68867                      :                             TTT-G--TCA---A-A-T---A-AA-G-TA---TT-C-TA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-G----G--G-GA----C-C---A-CC-C------A-T--CAC-T-TG------T-ACT----T---TTA-TTCTtgt
gi|68868                      :                                                                                     -A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-GT------T-ACCA---G---TTA-TTCT
gi|68869                      : ttcctcatgaatgcatgccatggtgaacaTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTAAA-A--T--G---C----------A-T-ATC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TA-C------A-T--CGG-T-TT------T-ACTAATCG---ATA-TTCTtgtt
gi|68870                      :                                  --TCA---A-A-T---G-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----ATAAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68871                      :                                     CA---G-A-TG--A-A--G-TA---CT-T-TA-TT--G-----ATCAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----A--A-GA----A-T---A-GT-C------A-T--T-G-TATT------T-A-T----G---ATtgtt
gi|68872                      :                                               ---A-A--G-TA---TT---CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-CTT-G----G--GTGA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG---TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68873                      :                                         atga-T---A-A--GATA---TT-T-CAATT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATAGTTCTtgt
gi|68874                      :                                             at---A-A--A-TA---GT-T-CA-TG--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-T------A-T--CAG-T-TTATTCTAC-ACT----G---ATA-TTTTgtt
gi|68875                      :                                          atg-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTAG-A--TC-G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAATA-TT-C------A-T--CAT-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTt
gi|68876                      :                                             at---A-A--G-T----TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-T----G--G-GA----G-C---G-TA-C------A-T--CAG-A-TT------T-ACT----G---tcttgtt
gi|68877                      :                                                        tgA---TT-A-CA-TT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTT------G--G-GA----A-C---ATTC-C------A-T--CAT-C-TT------T-ATT----G---ATA-T
gi|68878                      :                                           tgaa---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GG----G-C---A-TT-C------A--------T-TT------T-ACT----G---ATA-TTTT
gi|68879                      :                                               ---A-A--G-GA---TTGT-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--T-GA----G-C---A-TC-C------A-T--C-G-T-TT------TAACT----A---ATA-TTTTtg
gi|68880                      :                                                   -A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAGAA--T--G---C----------A-A-TTT-G----G--G-GA----GAT---A-TT-C------ATT--CAG-T-CT------T-A-T----G---ATA-TTTTtgt
gi|68881                      :                                                        -TA---AT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TCA-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CAG-C-CT------T-ACT----G---ATA-TTtgtt
gi|68882                      :                                                        -TA---TT-C-CA-TT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------AAG-TTT-T----G--G--A----G-C---A-TC-C------A-T--CAA-T-TT------T-ACT----G---ATA-Ttcctgtt
gi|68883                      :                                                          A---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-A--T--A---C----------A-G-TTT------G--G-AA----G-C---G-TT-T------T-A--CAG-T-TT------T-ACT----G---TTA-GTCTctgtt
gi|68884                      :                                                               T-T-CA-TT--GTGTAGGTTAG-A--T--A---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ACA-TTCTcgtt
gi|68885                      :                                                                -T-CA-TT--C-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTCTT----G--G-AA----G-C---A-TC-CA-----A-T--CAA-A-TT------T-TCT----G---ATA-TTCTt
gi|68886                      :                                                                     -TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------T-G-TTC-G----T--T-AA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----A---ATA-TTCTtgt
gi|68887                      :                                                                           -----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-C------A-T--CAG-T-CT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68888                      :                                                                                     -A--T--G---C----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-GT------T-ACA----G---TTA-TTCTtgtt
gi|68889                      :                                                                                                                  -G----A--G-GA----G-C---A-TA-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt


blockSeqs                     :                                T CG   TAAG  A TGG   AG    ATA  G       AA TGTAG       TC AT GCC TCTATCATAT         GGTT GT    GCAT   AAT T    ATGTGG   TA   T    ATTCTA     AATC AAT
blockSeqs                     :                                . .    TA    . G     A     A    G       .  .           .  CT .   G                  .    GT    .      AT  T    A        .    T    G          AA   .  
blockSeqs                     :                                . .    GT    . G     A     .    .       .  .           .  C  .   .                  .    .     .      AT  T    .        .    .    .          A    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      AT  .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      AT  .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      AT  .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    T     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . T     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . G     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    T     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    T     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    T     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    T     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    T     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    A     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                . .    G     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                  .    .     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                       .     . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                             . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                             . .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                               .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                               .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                               .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                               .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                               .     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                                     .     .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                                           .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                                           .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                                           .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                                           .    .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .          .    .  
blockSeqs                     :                                                                .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .                  
blockSeqs                     :                                                                .       .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .                  
blockSeqs                     :                                                                        .  .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .                  
blockSeqs                     :                                                                           .           .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .                  
blockSeqs                     :                                                                                       .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .    .    .                  
blockSeqs                     :                                                                                       .  .  .   .                  .    .     .      .   .    .        .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                    .    .     .      .   .                                          


blockSeqCons                  :                         
originalCons                  :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
finalCons                     :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT





Alignments
lowQualScore                  :                                               111                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                1 11   55555 1 666 0 33 0  222  1 0  0  11 11111     0 11 22 111 3333333333 0 0   0 1111 22 0  1111 0 666 2  0 222222 0 11   1 0  222222 0   3333 111   0    
lowQualScore                  :                                . ..   ..... . ... . .. .  ...  . .  .  .. .....     . .. .. ... .......... . .   . .... .. .  .... . ... .  . ...... . ..   . .  ...... .   .... ...   .    
lowQualScore                  :                                1 55   88888 0 111 9 00 9  222  6 8  8  11 99999     7 00 77 333 9999999999 7 7   7 5555 00 7  5555 7 222 1  7 888888 7 00   5 7  999999 8   7777 444   9    
consensus                     :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
Reference ( family-351 )      :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68834                      :                         GTCATTC-A--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-C--CAG-T-TT------T-ATT----G---GTA-TTCT
gi|68835                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-CATGTGGA-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68836                      :                         GTCATTC-A--TCA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-TTCA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---A----------G-G-TTC-G----G--G-AA----A-C---A-CC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----T---ATA-TTtatt
gi|68837                      :                         GTCATTC-A--TGA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATT-TTCTattcttgt
gi|68838                      :                         GTCATCC-G--TCA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----CTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A-TTATAGTT-TT------T-ACT----G---ATA-TCCTt
gi|68839                      :                         GTCATTC-G--TGA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---G----------A-A-TTC-A----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgt
gi|68840                      :                         GTCATTC-A--TCA---A-A-T---A-A--A-TA---TT-T-GA-TT--G-----CTAAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-A------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCtgtt
gi|68841                      :                         GTCATTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-A--TATG---C----------A-G-TTC-G----G--A-GA----G-T---A-TC-C------A-T--CAA-T-TT------T-ACT----G---ATA-Tccgtt
gi|68842                      :                         GTCATTC-G--TCA---T-T-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----CTTAG-A--T--G---T----------A-G-TGC-A----G--G--A----G-C---A-TC-G------A-A--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68843                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A-T--CAG-T-TG------T---T----G---ATT-TTCtgtt
gi|68844                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----GGTG-GA----G-C---ATTC-C------A-T--CAG-T-TG------T---T----G---ATT-TTgtg
gi|68845                      :                         GTCATTC----T-------A-TG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAT-A--TCTA---C----------A-G-TTC-A----G--G-GG----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACTAA--A---ATA-TTCTtcgt
gi|68846                      :                         GTCATTC-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TAATATT-T-CA-TT--G-----GTAAG-A--T--A---TG---------A-T-TTT-G----T--A-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68847                      :                         GTCAGTC-A--TCA---A-G-T---A-G--G-TA---TA-T-CA-TT--C-----GTTTA-A--A--G---C----------A-T-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CGG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTggtt
gi|68848                      :                         GTCATTT-G--TCA---G-G-T---A-AA-G-TA---TT-T-TA-TA--C-----GTTAG-G--G--G---C----------A-G-TTC-A----G--G-CA----C-C---A-TC-C------A-T--CAT-T-TT------T-ACT----A---ATA-TTCTtgt
gi|68849                      :                         GTTATTT-G--TCAT--A-A-T---GTA--G-TA---GT-A-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-A----G--G-GAGCATG-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----GAATATA-TTTTcgtt
gi|68850                      :                         GCCATTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-T------------------------TAG-A--T--A---C----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TA-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgt
gi|68851                      :                         GCCATTC-G--TTA---G-A-TG--A-A--A-TA---TT-T-CA-TT--A-----GTT--------------------------G-T--------A--G-GA----G-C---A-TC-C------A-C--CAG-T-TT------T-AGT----G---ATA-TTCTt
gi|68852                      :                         GTCATTC-G--T-----G-A-TTGGG-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-GGGTTG--G-GA----G-C---A-TC-C------A-A--TA--T-TT------T-ACtgtt
gi|68853                      :                         GTCATTC-G--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TC--G-----GTGAT-A--T--G---------------------------G--G-GA----G-C---T-TC-C------A-T--CAG-T-TT------
gi|68854                      :                         GTTATTT-G--TCG-----------A-A--G-TA---GT-C-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--A---TTCTATCATATA-G-TTT-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--TAG-T-TTG-----T-AC
gi|68855                      :                         GTCATTTTG--TCATAAG-A-----A-A--A-TAA--TTGT-CC-TT--G-----GTTAA-A--T--G---C----------A-G-TTG-G----G--G-AG----G-C---A-TCAC------A-T--CAG-T-TT------
gi|68856                      :                         GTCAACC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-T-----T-T-CA-TT--A-----GATAA-A--T--G---C----------A-G-TTC-C----A--G-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CA
gi|68857                      :                          TCATTC-G--TCA---T-G-TG--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAA-A--T--G---T----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---T-TC-C------T-T--CAG-T-TT------T-GCT----G---GTA-TTCT
gi|68858                      :                          TCATCC-T--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---GT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-ATC-A----G--C-GT----T-C---A-TC-C------A-T--CAC-T-TT------T-ACT----C---ATA-TTCTtgtt
gi|68859                      :                          TCATTT-G--TCA---T-A-T---G-A--G-TA---GT-T-TA-TTAAG-----GTTAC-A--T--G---C----------A-C-TTA-G----G--G-GA----G-C---A-TA-T------A-T--CAG-T-TT------T-GCT----G---ACA-TTCTtgtt
gi|68860                      :                          TTATTC-G--TTA---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-T-G------G-----GCTAG-A--T--G---C----------A-GTTTT-G----G--G-GA----G-C-----TT-A------A-T--CAGTT-TT------T-ACT----G---AAA-TTCTtgt
gi|68861                      :                          TCATT--G--TCA---G-AAT---G-AAGG-TA---TT---CA-AT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-tgt
gi|68862                      :                          TCATTC-GCGTCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTA--A--T------C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-T------C-T--CAG-T-TC------T-
gi|68863                      :                           CATTC-A--TCA---T-A-TG--A-A--G-TA---TT----------G-----ATTAA-T--T--G---T----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATT-TT
gi|68864                      :                            ATTC-G--TCG---G-A-TG--A-A--G-TA---TT-C-CA-TT--G-----GTTAG-A--A--G---C----------A-G-GCC-A----G--G-GA----G-T---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACC----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68865                      :                            ATTC-A--ACA---GTA-TT--A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--GGCCC----------A-A-TTC-G----G--A-AC----A-T---A-TT-T------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----T---AT--TTCTtgtt
gi|68866                      :                             TTT-G--TCA---G-A-T---A-A--G-TA---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-ATCT--G---C----------A-T-TTC------G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--TAG---TC------T-ACT----G---ATA-TTCTgtt
gi|68867                      :                             TTT-G--TCA---A-A-T---A-AA-G-TA---TT-C-TA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTT-G----G--G-GA----C-C---A-CC-C------A-T--CAC-T-TG------T-ACT----T---TTA-TTCTtgt
gi|68868                      :                                                                                     -A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-GT------T-ACCA---G---TTA-TTCT
gi|68869                      : ttcctcatgaatgcatgccatggtgaacaTC-G--TCA---A-A-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTAAA-A--T--G---C----------A-T-ATC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TA-C------A-T--CGG-T-TT------T-ACTAATCG---ATA-TTCTtgtt
gi|68870                      :                                  --TCA---A-A-T---G-A--A-TA---TT-T-CA-TT--G-----ATAAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68871                      :                                     CA---G-A-TG--A-A--G-TA---CT-T-TA-TT--G-----ATCAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----A--A-GA----A-T---A-GT-C------A-T--T-G-TATT------T-A-T----G---ATtgtt
gi|68872                      :                                               ---A-A--G-TA---TT---CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-CTT-G----G--GTGA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG---TT------T-ACT----G---ATA-TTCT
gi|68873                      :                                         atga-T---A-A--GATA---TT-T-CAATT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAT-A-TT-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATAGTTCTtgt
gi|68874                      :                                             at---A-A--A-TA---GT-T-CA-TG--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-AA----G-C---A-TC-T------A-T--CAG-T-TTATTCTAC-ACT----G---ATA-TTTTgtt
gi|68875                      :                                          atg-T---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--------GTTAG-A--TC-G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GA----G-CAATA-TT-C------A-T--CAT-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTt
gi|68876                      :                                             at---A-A--G-T----TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TTC-T----G--G-GA----G-C---G-TA-C------A-T--CAG-A-TT------T-ACT----G---tcttgtt
gi|68877                      :                                                        tgA---TT-A-CA-TT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTT------G--G-GA----A-C---ATTC-C------A-T--CAT-C-TT------T-ATT----G---ATA-T
gi|68878                      :                                           tgaa---A-A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-A-TTC-G----G--G-GG----G-C---A-TT-C------A--------T-TT------T-ACT----G---ATA-TTTT
gi|68879                      :                                               ---A-A--G-GA---TTGT-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--T-GA----G-C---A-TC-C------A-T--C-G-T-TT------TAACT----A---ATA-TTTTtg
gi|68880                      :                                                   -A--G-TA---TT-T-CA-TT--G-----GTTAGAA--T--G---C----------A-A-TTT-G----G--G-GA----GAT---A-TT-C------ATT--CAG-T-CT------T-A-T----G---ATA-TTTTtgt
gi|68881                      :                                                        -TA---AT-T-CA-TT--G-----GTTAG-A--T--G---T----------A-G-TCA-G----G--G-GA----A-C---A-TC-C------A-T--CAG-C-CT------T-ACT----G---ATA-TTtgtt
gi|68882                      :                                                        -TA---TT-C-CA-TT--A-----GTTAG-A--T--G---C----------AAG-TTT-T----G--G--A----G-C---A-TC-C------A-T--CAA-T-TT------T-ACT----G---ATA-Ttcctgtt
gi|68883                      :                                                          A---TT-T-TA-TT--G-----GTTAG-A--T--A---C----------A-G-TTT------G--G-AA----G-C---G-TT-T------T-A--CAG-T-TT------T-ACT----G---TTA-GTCTctgtt
gi|68884                      :                                                               T-T-CA-TT--GTGTAGGTTAG-A--T--A---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ACA-TTCTcgtt
gi|68885                      :                                                                -T-CA-TT--C-----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTCTT----G--G-AA----G-C---A-TC-CA-----A-T--CAA-A-TT------T-TCT----G---ATA-TTCTt
gi|68886                      :                                                                     -TT--G-----GTTAG-A--T--G---C----------T-G-TTC-G----T--T-AA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----A---ATA-TTCTtgt
gi|68887                      :                                                                           -----GTTAG-A--T--G---C----------A-G-TTC-G----G--G-GA----G-C---A-TT-C------A-T--CAG-T-CT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt
gi|68888                      :                                                                                     -A--T--G---C----------A-G-TTC-A----G--G-GA----G-C---A-TC-C------A-T--CAG-T-GT------T-ACA----G---TTA-TTCTtgtt
gi|68889                      :                                                                                                                  -G----A--G-GA----G-C---A-TA-C------A-T--CAG-T-TT------T-ACT----G---ATA-TTCTtgtt