lowQualScore                  :                       111                                                                                                        
lowQualScore                  :               0 22 0  333  0 0 222222  0 0  0 222 0    11 99   11  1 0 0      1111   0 11 0      0         22   1                
lowQualScore                  :               . .. .  ...  . . ......  . .  . ... .    .. ..   ..  . . .      ....   . .. .      .         ..   .                
lowQualScore                  :               1 11 8  111  7 7 111111  7 7  7 000 7    00 44   00  5 7 7      5555   7 00 7      7         22   6                
consensus                     :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
Reference ( gi|44849 )        :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44830                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCAACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44843                      : aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGATG--GCT-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44844                      :  aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGT-CCGGCCGTTT
gi|44851                      :  aATACAGTAAAATAC--C-CG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-A-G-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACA--GCC-GGTCCTGGCCGTTTTc
gi|44841                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCT-GGTCCCGGCCATTTTCtc
gi|44850                      :  aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44833                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-GTGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGC
gi|44848                      : aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GAC-GGTCCC
gi|44831                      :   ATACAGTAAAATAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACT--GCC-GG-CCCGG--GTTTTC
gi|44845                      : aaATACAGTAAA-TAC--C-TG---T--T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--ACC-GATCCCGGC
gi|44834                      :  aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-A-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44853                      : aaATACAGTAAAATAC--G-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TT-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44852                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TT-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGTattttcaaggtccc
gi|44842                      :   ATACAGTAAA-TAC--CCTG---TA-T-C------TC-G-AAACG--A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCTGGGTCCCGCCAATTTTCattttcaaggtcccatgccct
gi|44855                      :  aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-A---T-TGGT--TT-ATC--TC-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGTC
gi|44854                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------T--G-AA-C-----TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44856                      :   ATACAGTAAAATAT--C-TT---TA-T-C------TC-G-AA-T---A-TGGT--TT-ATC--TC-A-A-ATATCC----TGC-T--T-ATCTCG-AAGTCAACT--GTC-
gi|44858                      :   ATACAGTAAACTAT--C-TG---TA-T-C------TA-G-GA-T---A-TAGG--TT-ATC--TC-A-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCA-AAGTCAATATTGCC-GGTCCC
gi|44857                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-GAAA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC---A-ATA-TC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44846                      :   ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-TCC------TC-G-AA-----A-T-GT--TT-ATC--TCAG-A-ATACCC----GGT-T-----TGTCG-AAATCGACG--GGC-CGTCCC
gi|44837                      :  aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-----A-TG----TT-ATTTGTC-G-A-ATA--C----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44847                      : aaATA-AGTAAA-TAC----TGC--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGTTGTT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CG--T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44839                      :  aATACAGTCAAACTT--C-CG---TA-T-T------TC-A-AA-C---A-CTGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCA----TGG-C--T-ATGTCG-AAGT
gi|44840                      : aaATACAGTTGAACTT--C-GG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACTGAT-----ATC--TC-G-A-ATACCC----TGG-C--T-ATGTCG-CAGT
gi|44832                      :  aaTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACAC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCggttctgaagtccct
gi|44860                      : aagTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--AC-G-A-ATA-CC----CGC-TGAT-ATGTCG-AAGTCGATG--GCC-GGT-CCGGCCGTTTTC
gi|44859                      :    TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----CGCTT--T-ATGTCG-AAGT-GACG--GCC--GTCCTGG-CGTTTTC
gi|44861                      :    TACAGTAAGATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---G-TGGT--TT-ATC--------------C----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTT
gi|44835                      :    TACAGTAAA-TAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TTTATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGCCG-AACTCGACG--GCC-AGTCCGGGCCTTTTtc
gi|44836                      : aacTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-AGGT--TA-TTC--TC-G-A-ATACCTTGAATGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTC
gi|44862                      :  aacACAGTAAAATAC--C-TGGATTA-T-C------TC-G-AA-CGACA-TGGT--TT-ATC--TC-G-GCATACCC----T-C-T--T-ATGTCG-A
gi|44838                      :     ACAGTAAAA-AA--C-TG---TA-T-CCATCTCTC-G-A--C---A-TGGT--TTTATG--TC-G-A-ATA-CC----TGC----T-ATGTCGCAAGTC
gi|44865                      :    aaataTAAACT-C--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCT-AAGT
gi|44864                      :         TAAATTACTCC-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-TGACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccaagccct
gi|44863                      :         TAAAATACTCC-TGA--TACT-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TCCG-A-ATACCC----CGC-T--TAATGTCG-AAGT
gi|44871                      :          AAAACTC--C-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatttttaaggtcccacgccct
gi|44877                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGatattcaaggtcccatgcct
gi|44867                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------CC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44874                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44872                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGAT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44870                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-A-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44866                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAattttcaaggtcccatgcct
gi|44869                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGG---TT-ATC--TC-GAA-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44868                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CAGT--T--ATC--TC-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaatcccacgccct
gi|44875                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TCAG-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGT
gi|44873                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-C-AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44878                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---A-CGGT--A--ATC--TC-G-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44876                      :          AAAACTC--C-TGA--TA-T--------TC---AA-C---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44879                      :           AGATAC----TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCTGTTT
gi|44880                      :           AAACTC--C-TGA--TA-T-C------TT-G-AA-C---A-TAGT--A--ATC--TC-A-A-ATACCC----CGC-T-----TGTCG-AAGTc
gi|44881                      :              TAT--C-TG---TA-T-C------TT-C-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TT-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATATCT-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTCattttcaaggtcccgtgcctt
gi|44882                      :                 --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---A-TGGT--TT-ATC--TC-G-A-AT---------GC-T--T-ATGTCG-AAATCGACG--GCC-GATCCCGACCGTTTTC
gi|44883                      :                 --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-T---A-TGGT--TT-ATC--TC-A-A-ATATCC----CAC-T--T-ATATCA-AAGTCGACT--GCC-AGTCACCGATGTTTTC
gi|44885                      :                       ---TA-T-C------TC-A-AA-T---A-CGGT--T--ATC--TC-G-A-ATACCC----TGA-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44884                      :                                                     aGT--TT-ATC--TC-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTTG-AAGTCAACT--GCC-GGTCCCattttcaaggtcccgtgccct





Alignments
lowQualScore                  :                          111                                                                                                        
lowQualScore                  :                    22 0  222  0 0 222222  0 0  0 222 0    9999   11 0 0 0 0      1111   0 11 0      0         22   1                
lowQualScore                  :                    .. .  ...  . . ......  . .  . ... .    ....   .. . . . .      ....   . .. .      .         ..   .                
lowQualScore                  :                    00 7  999  7 7 111111  7 7  7 000 8    6666   00 7 7 7 7      5555   7 00 7      7         11   5                
consensus                     :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
Reference ( family-350 )      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44830                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCAACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44831                      :    aaATACAGTAAAATAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACT--GCC-GG-CCCGG--GTTTTC
gi|44832                      :     aaTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACAC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44833                      :   aagATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---AGTGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGC
gi|44834                      :    aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-A-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44835                      :     aaTACAGTAAA-TAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--TTATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGCCG-AACTCGACG--GCC-AGTCCGGGCCTTTT
gi|44836                      :    aacTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---AAGGTT--A-TTC--T-C-G-A-ATACCTTGAATGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTC
gi|44837                      :   aacATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-----ATG--T--T-ATTTGT-C-G-A-ATA--C----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44838                      :      aaACAGTAAAA-AA--C-TG---TA-T-CCATCTCTC-G-A--C---ATGGTT--TTATG--T-C-G-A-ATA-CC----TGC----T-ATGTCGCAAGTC
gi|44839                      : aaataATACAGTCAAACTT--C-CG---TA-T-T------TC-A-AA-C---ACTGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCA----TGG-C--T-ATGTCG-AAGT
gi|44840                      :    aaATACAGTTGAACTT--C-GG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACTGAT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGG-C--T-ATGTCG-CAGT
gi|44841                      :    aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCT-GGTCCCGGCCATTTTCggttctgaagtccct
gi|44842                      :     aATACAGTAAA-TAC--CCTG---TA-T-C------TC-G-AAACG--ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCTGGGTCCCGCCAATTTTC
gi|44843                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGATG--GCT-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44844                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGT-CCGGCCGTTT
gi|44845                      :     aATACAGTAAA-TAC--C-TG---T--T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--ACC-GATCCCGGCc
gi|44846                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-TCC------TC-G-AA-----AT-GTT--T-ATC--T-CAG-A-ATACCC----GGT-T-----TGTCG-AAATCGACG--GGC-CGTCCC
gi|44847                      :     aATA-AGTAAA-TAC----TGC--TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTTGTT-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CG--T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44848                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GAC-GGTCCC
gi|44849                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44850                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44851                      :      ATACAGTAAAATAC--C-CG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-G-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACA--GCC-GGTCCTGGCCGTTTT
gi|44852                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TT-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGTtc
gi|44853                      :      ATACAGTAAAATAC--G-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-T-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44854                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------T--G-AA-C----TGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCattttcaaggtccc
gi|44855                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-A---TTGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGTC
gi|44856                      :      ATACAGTAAAATAT--C-TT---TA-T-C------TC-G-AA-T---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATATCC----TGC-T--T-ATCTCG-AAGTCAACT--GTC-
gi|44857                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-GAAA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C---A-ATA-TC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44858                      :      ATACAGTAAACTAT--C-TG---TA-T-C------TA-G-GA-T---ATAGGT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCA-AAGTCAATATTGCC-GGTCCC
gi|44859                      :       TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGCTT--T-ATGTCG-AAGT-GACG--GCC--GTCCTGG-CGTTTTC
gi|44860                      :       TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--A-C-G-A-ATA-CC----CGC-TGAT-ATGTCG-AAGTCGATG--GCC-GGT-CCGGCCGTTTTC
gi|44861                      :       TACAGTAAGATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---GTGGTT--T-AT---------------CC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTT
gi|44862                      :        ACAGTAAAATAC--C-TGGATTA-T-C------TC-G-AA-CGACATGGTT--T-ATC--T-C-G-GCATACCC----T-C-T--T-ATGTCG-Atc
gi|44863                      :            TAAAATACTCC-TGA--TACT-C------TC-G-AA-C---ACGG-T--T-ATC--TCC-G-A-ATACCC----CGC-T--TAATGTCG-AAGT
gi|44864                      :            TAAATTACTCC-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-TGACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatttttaaggtcccacgccct
gi|44865                      :            TAAACT-C--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCT-AAGT
gi|44866                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAattttcaaggtcccaagccct
gi|44867                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------CC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44868                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACAGTT----ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44869                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGG-T--T-ATC--T-C-GAA-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44870                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-A-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaatcccacgccct
gi|44871                      :             AAAACTC--C-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44872                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGATT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatattcaaggtcccatgcct
gi|44873                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-C-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44874                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGT
gi|44875                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TCAG-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGT
gi|44876                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T--------TC---AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44877                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44878                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTA----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44879                      :              AGATAC----TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCTGTTTattttcaaggtcccatgccct
gi|44880                      :              AAACTC--C-TGA--TA-T-C------TT-G-AA-C---ATAGTA----ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T-----TGTCG-AAGTc
gi|44881                      :                 TAT--C-TG---TA-T-C------TT-C-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-T-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATATCT-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTCattttcaaggtcccgtgcctt
gi|44882                      :                    --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-AT---------GC-T--T-ATGTCG-AAATCGACG--GCC-GATCCCGACCGTTTTC
gi|44883                      :                    --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-T---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATATCC----CAC-T--T-ATATCA-AAGTCGACT--GCC-AGTCACCGATGTTTTC
gi|44884                      :                                                        GTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTTG-AAGTCAACT--GCC-GGTCCC
gi|44885                      :          tatattgtaatacagt---TA-T-C------TC-A-AA-T---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGA-T--T-ATGTCG-AAGT





Alignments
lowQualScore                  :                          111                                                                                                        
lowQualScore                  :                    22 0  222  0 0 222222  0 0  0 222 0    9999   11 0 0 0 0      1111   0 11 0      0         22   1                
lowQualScore                  :                    .. .  ...  . . ......  . .  . ... .    ....   .. . . . .      ....   . .. .      .         ..   .                
lowQualScore                  :                    00 7  999  7 7 111111  7 7  7 000 8    6666   00 7 7 7 7      5555   7 00 7      7         11   5                
consensus                     :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
Reference ( family-350 )      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44830                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCAACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44831                      :    aaATACAGTAAAATAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACT--GCC-GG-CCCGG--GTTTTC
gi|44832                      :     aaTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACAC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44833                      :   aagATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---AGTGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGC
gi|44834                      :    aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-A-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44835                      :     aaTACAGTAAA-TAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--TTATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGCCG-AACTCGACG--GCC-AGTCCGGGCCTTTT
gi|44836                      :    aacTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---AAGGTT--A-TTC--T-C-G-A-ATACCTTGAATGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTC
gi|44837                      :   aacATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-----ATG--T--T-ATTTGT-C-G-A-ATA--C----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44838                      :      aaACAGTAAAA-AA--C-TG---TA-T-CCATCTCTC-G-A--C---ATGGTT--TTATG--T-C-G-A-ATA-CC----TGC----T-ATGTCGCAAGTC
gi|44839                      : aaataATACAGTCAAACTT--C-CG---TA-T-T------TC-A-AA-C---ACTGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCA----TGG-C--T-ATGTCG-AAGT
gi|44840                      :    aaATACAGTTGAACTT--C-GG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACTGAT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGG-C--T-ATGTCG-CAGT
gi|44841                      :    aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCT-GGTCCCGGCCATTTTCggttctgaagtccct
gi|44842                      :     aATACAGTAAA-TAC--CCTG---TA-T-C------TC-G-AAACG--ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCTGGGTCCCGCCAATTTTC
gi|44843                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGATG--GCT-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44844                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGT-CCGGCCGTTT
gi|44845                      :     aATACAGTAAA-TAC--C-TG---T--T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--ACC-GATCCCGGCc
gi|44846                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-TCC------TC-G-AA-----AT-GTT--T-ATC--T-CAG-A-ATACCC----GGT-T-----TGTCG-AAATCGACG--GGC-CGTCCC
gi|44847                      :     aATA-AGTAAA-TAC----TGC--TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTTGTT-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CG--T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44848                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GAC-GGTCCC
gi|44849                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44850                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44851                      :      ATACAGTAAAATAC--C-CG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-G-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACA--GCC-GGTCCTGGCCGTTTT
gi|44852                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TT-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGTtc
gi|44853                      :      ATACAGTAAAATAC--G-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-T-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44854                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------T--G-AA-C----TGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCattttcaaggtccc
gi|44855                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-A---TTGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGTC
gi|44856                      :      ATACAGTAAAATAT--C-TT---TA-T-C------TC-G-AA-T---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATATCC----TGC-T--T-ATCTCG-AAGTCAACT--GTC-
gi|44857                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-GAAA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C---A-ATA-TC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44858                      :      ATACAGTAAACTAT--C-TG---TA-T-C------TA-G-GA-T---ATAGGT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCA-AAGTCAATATTGCC-GGTCCC
gi|44859                      :       TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGCTT--T-ATGTCG-AAGT-GACG--GCC--GTCCTGG-CGTTTTC
gi|44860                      :       TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--A-C-G-A-ATA-CC----CGC-TGAT-ATGTCG-AAGTCGATG--GCC-GGT-CCGGCCGTTTTC
gi|44861                      :       TACAGTAAGATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---GTGGTT--T-AT---------------CC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTT
gi|44862                      :        ACAGTAAAATAC--C-TGGATTA-T-C------TC-G-AA-CGACATGGTT--T-ATC--T-C-G-GCATACCC----T-C-T--T-ATGTCG-Atc
gi|44863                      :            TAAAATACTCC-TGA--TACT-C------TC-G-AA-C---ACGG-T--T-ATC--TCC-G-A-ATACCC----CGC-T--TAATGTCG-AAGT
gi|44864                      :            TAAATTACTCC-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-TGACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatttttaaggtcccacgccct
gi|44865                      :            TAAACT-C--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCT-AAGT
gi|44866                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAattttcaaggtcccaagccct
gi|44867                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------CC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44868                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACAGTT----ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44869                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGG-T--T-ATC--T-C-GAA-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44870                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-A-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaatcccacgccct
gi|44871                      :             AAAACTC--C-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44872                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGATT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatattcaaggtcccatgcct
gi|44873                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-C-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44874                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGT
gi|44875                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TCAG-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGT
gi|44876                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T--------TC---AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44877                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44878                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTA----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44879                      :              AGATAC----TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCTGTTTattttcaaggtcccatgccct
gi|44880                      :              AAACTC--C-TGA--TA-T-C------TT-G-AA-C---ATAGTA----ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T-----TGTCG-AAGTc
gi|44881                      :                 TAT--C-TG---TA-T-C------TT-C-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-T-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATATCT-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTCattttcaaggtcccgtgcctt
gi|44882                      :                    --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-AT---------GC-T--T-ATGTCG-AAATCGACG--GCC-GATCCCGACCGTTTTC
gi|44883                      :                    --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-T---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATATCC----CAC-T--T-ATATCA-AAGTCGACT--GCC-AGTCACCGATGTTTTC
gi|44884                      :                                                        GTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTTG-AAGTCAACT--GCC-GGTCCC
gi|44885                      :          tatattgtaatacagt---TA-T-C------TC-A-AA-T---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGA-T--T-ATGTCG-AAGT


blockSeqs                     :                    TC    GAT      CATCTC         GAC      GTT                    TGAA                         TT   G
blockSeqs                     :                    TC    C        .              G        TT                     .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        TT                     .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        A                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     A        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                            .    .
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        T                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                    .     .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                          .        .              .        .                      .                                  
blockSeqs                     :                                                           .                      .                                  


blockSeqCons                  :      
originalCons                  :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
finalCons                     :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC





Alignments
lowQualScore                  :                          111                                                                                                        
lowQualScore                  :                    22 0  222  0 0 222222  0 0  0 222 0    9999   11 0 0 0 0      1111   0 11 0      0         22   1                
lowQualScore                  :                    .. .  ...  . . ......  . .  . ... .    ....   .. . . . .      ....   . .. .      .         ..   .                
lowQualScore                  :                    00 7  999  7 7 111111  7 7  7 000 8    6666   00 7 7 7 7      5555   7 00 7      7         11   5                
consensus                     :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
Reference ( family-350 )      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44830                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCAACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44831                      :    aaATACAGTAAAATAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACT--GCC-GG-CCCGG--GTTTTC
gi|44832                      :     aaTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACAC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44833                      :   aagATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---AGTGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGC
gi|44834                      :    aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-A-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44835                      :     aaTACAGTAAA-TAT--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--TTATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGCCG-AACTCGACG--GCC-AGTCCGGGCCTTTT
gi|44836                      :    aacTACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---AAGGTT--A-TTC--T-C-G-A-ATACCTTGAATGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTC
gi|44837                      :   aacATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-----ATG--T--T-ATTTGT-C-G-A-ATA--C----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44838                      :      aaACAGTAAAA-AA--C-TG---TA-T-CCATCTCTC-G-A--C---ATGGTT--TTATG--T-C-G-A-ATA-CC----TGC----T-ATGTCGCAAGTC
gi|44839                      : aaataATACAGTCAAACTT--C-CG---TA-T-T------TC-A-AA-C---ACTGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCA----TGG-C--T-ATGTCG-AAGT
gi|44840                      :    aaATACAGTTGAACTT--C-GG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACTGAT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGG-C--T-ATGTCG-CAGT
gi|44841                      :    aaATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCT-GGTCCCGGCCATTTTCggttctgaagtccct
gi|44842                      :     aATACAGTAAA-TAC--CCTG---TA-T-C------TC-G-AAACG--ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--A-ATGTCG-AAGTCGCCG--GCTGGGTCCCGCCAATTTTC
gi|44843                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGATG--GCT-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44844                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGT-CCGGCCGTTT
gi|44845                      :     aATACAGTAAA-TAC--C-TG---T--T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--ACC-GATCCCGGCc
gi|44846                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-TCC------TC-G-AA-----AT-GTT--T-ATC--T-CAG-A-ATACCC----GGT-T-----TGTCG-AAATCGACG--GGC-CGTCCC
gi|44847                      :     aATA-AGTAAA-TAC----TGC--TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTTGTT-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CG--T--T-ATGTCG-AAGTC
gi|44848                      :     aATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GAC-GGTCCC
gi|44849                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTC
gi|44850                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCC
gi|44851                      :      ATACAGTAAAATAC--C-CG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-G-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACA--GCC-GGTCCTGGCCGTTTT
gi|44852                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TT-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGTtc
gi|44853                      :      ATACAGTAAAATAC--G-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-T-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44854                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------T--G-AA-C----TGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCT----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCattttcaaggtccc
gi|44855                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-A---TTGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGTC
gi|44856                      :      ATACAGTAAAATAT--C-TT---TA-T-C------TC-G-AA-T---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATATCC----TGC-T--T-ATCTCG-AAGTCAACT--GTC-
gi|44857                      :      ATACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-GAAA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C---A-ATA-TC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44858                      :      ATACAGTAAACTAT--C-TG---TA-T-C------TA-G-GA-T---ATAGGT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCA-AAGTCAATATTGCC-GGTCCC
gi|44859                      :       TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGCTT--T-ATGTCG-AAGT-GACG--GCC--GTCCTGG-CGTTTTC
gi|44860                      :       TACAGTAAAATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--A-C-G-A-ATA-CC----CGC-TGAT-ATGTCG-AAGTCGATG--GCC-GGT-CCGGCCGTTTTC
gi|44861                      :       TACAGTAAGATAC--C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---GTGGTT--T-AT---------------CC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTT
gi|44862                      :        ACAGTAAAATAC--C-TGGATTA-T-C------TC-G-AA-CGACATGGTT--T-ATC--T-C-G-GCATACCC----T-C-T--T-ATGTCG-Atc
gi|44863                      :            TAAAATACTCC-TGA--TACT-C------TC-G-AA-C---ACGG-T--T-ATC--TCC-G-A-ATACCC----CGC-T--TAATGTCG-AAGT
gi|44864                      :            TAAATTACTCC-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-TGACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatttttaaggtcccacgccct
gi|44865                      :            TAAACT-C--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCT-AAGT
gi|44866                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAattttcaaggtcccaagccct
gi|44867                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------CC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44868                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACAGTT----ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44869                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGG-T--T-ATC--T-C-GAA-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44870                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-A-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaatcccacgccct
gi|44871                      :             AAAACTC--C-TA---TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44872                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGATT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTatattcaaggtcccatgcct
gi|44873                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-C-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgccct
gi|44874                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTTG-AAGT
gi|44875                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TCAG-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCA-AAGT
gi|44876                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T--------TC---AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTattttcaaggtcccatgcct
gi|44877                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAG
gi|44878                      :             AAAACTC--C-TGA--TA-T-C------TC-G-AA-C---ACGGTA----ATC--T-C-G-A-ATACCC----CAC-T--T-ATGTCG-AAGT
gi|44879                      :              AGATAC----TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T--T-ATGTCG-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCTGTTTattttcaaggtcccatgccct
gi|44880                      :              AAACTC--C-TGA--TA-T-C------TT-G-AA-C---ATAGTA----ATC--T-C-A-A-ATACCC----CGC-T-----TGTCG-AAGTc
gi|44881                      :                 TAT--C-TG---TA-T-C------TT-C-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-T-G-A-ATACCC----CGC-T--T-ATATCT-AAGTCGACG--GCC-GGTCCCGGCCGTTTTCattttcaaggtcccgtgcctt
gi|44882                      :                    --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-C---ATGGTT--T-ATC--T-C-G-A-AT---------GC-T--T-ATGTCG-AAATCGACG--GCC-GATCCCGACCGTTTTC
gi|44883                      :                    --C-TG---TA-T-C------TC-G-AA-T---ATGGTT--T-ATC--T-C-A-A-ATATCC----CAC-T--T-ATATCA-AAGTCGACT--GCC-AGTCACCGATGTTTTC
gi|44884                      :                                                        GTT--T-ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGC-T--T-ATGTTG-AAGTCAACT--GCC-GGTCCC
gi|44885                      :          tatattgtaatacagt---TA-T-C------TC-A-AA-T---ACGGTT----ATC--T-C-G-A-ATACCC----TGA-T--T-ATGTCG-AAGT