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Reference ( gi|33877 ) : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--CGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--G-C--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---CT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CC--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33878 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-AT-A---A-CT--TT--A--G-C--T-T--T-----G-AA--C---C-A------G---AA-----GA-T---A---CT----GC---------AA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CT--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------CA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--A-C-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
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gi|33901 : GAGCTTA------TA-TATC--T--C--TTA--T--TGTA-CN-N-NN-NN--N-N-NN-N---N-NN--NN--N--N-N--N-N--N-----N-NN--N---N-N------N---NN-----NN-N---N---NN----NN--------NNN-N-------N-N--N---N-NN-N---N-N--N-N--NN-N-NN---N--NN--N-N-N-N--N--N--------N-N-N--NN---N-N-----N-N--NN----N-N--N-N--N-N-----------NNTC--A---A--A---ATG---A--G-T-A---G-CG-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----TC---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-T-T-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33903 : AGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---AACT--TT--A--GGC--T-T--T-----G-AAA-C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---CTT---GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-TT--A-C--C----GA-T-AG---A--CT--A-A------T--T--------G-TGT--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-TTTG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-GGTCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-CTTAT-AA----A-T-G-T-C-tgct
gi|33902 : AGCTTA------TA-T--C--T--T--TAA--T---GTA-CA-A-GT-CG--TTA-GT-A------C--TT--A--G-C--T-T--TT----G-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---CT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---AAC--C-A--GA-T--C---A--CT--T-G-A-T--TG-T--------G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-C----A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GT--A--T-G--T-C--C-GA-A-GTT---T-AA----A-T-G-T-C-GTACgccactgtt
gi|33904 : AGCTTA------TA-T--A-----C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGA-G-A-GT-ATCGA-CTA-TT--AA-G-C--T-T--T-----G-AA--CAAGT-A------G---AA-----AT-T---AAGGCTCA--GA--------AAA-A-------A-A--A---T-TC-CTATA-C--C-A--GA-T-AT---AA-CCATG-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----CAT--T-T--G-A-----------TTATTTA---C--A---A-G---G--G-T-A---GACA-A-A--ACA-G-TCT----G-GAAC-T----TT---------GGT-A--T-GA-T-C--C-GA---G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ctgtt
gi|33905 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTAAAT--TG-A-CA-A-GT-CG--T-AAGT-A---A-GT--TT--A--G-C--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---CT----GC--------AAA-A-------A-A--AAATT-GC-C---T-A--C-A--GA-T-AC---A--CT--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------TCAC--A---A--A---A-G---G--C-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----TTC--------GTC-A--T-G--TCC--C-GA-A-G-T---T-AA----A-TGG-T-C-ATtctgtt
gi|33906 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A-----CT--TC--AT-G-C--T-T--TT----G-AA--C---T-AA-----G---AA-----G--T---A---CT----GC--------AAA-A-------A-A--AA--T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CT--G-A-A-T--T--T--------G---C--TT---C-T-----G-T--AT----CTT--T-T--G-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GACC-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AAG---A-T-G-T---ATAgactgtt
gi|33907 : TA------TA-T--C--C--T--TTA--A--TGTA-CAGA-GT-CG--C-A--C-A---A-CT--TTC-A--G-C--T-T--T-----T-ATTTC---T-A------GG--AA-----GAAT---A---CT-----C--------AAA-A-------C-A------T-CC-T---A-C--C-A--GAAT-AC---A--CT--G-A-A-G--T--T--------GGTAT--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-A---G-CA-A-A--ACA-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-GA-T-C--C-GA-A-------T-AA----A-T-G-TCC-ATACatgtt
gi|33908 : A------TA----C--T--C--TTA--T--TGTAGCA-A-GT-TG--TCA-GT-A---A-CT--TT--A--G-C--T-T--T-----G-AT--C---T-A------C---AA-----GA-T-------CT----GCAGAAAAAAAAA-A-------G-A--A---T-CCGC---A-C--CAA--GA-T-AC---T--CT--G-A-ATT--T--T--------G-C-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------T-----GT--A--A---A-G---G--tgtt
gi|33909 : -T--C--T--T--TAA--T---GTA-CA-A-GT-CGGAT-A-GT-A---A-CT--TT--A--G-C--TGT--T-----G-AA--C---T-A------GGAAAA-----GA-T---AT--CT----GC--------AAA-AG------A-A--A---CACC-T---A-C--C-A--GA-T-ACG--A--CT--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-TT----G-TCAAT----C-T--A-T--G-A-----------T-----A---A--A---A-A---GCGG-T-AAGCG-CA-A-ACAA-G-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-CA-C-GA-A-G-T---TAAA----A-T-G-T-C--TAC
gi|33910 : GTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--G-C--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---CT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CT--A-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33912 : tcaaaGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--G-C--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T----------------------------------------------CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CT--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----GT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgtt
gi|33913 : GTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--C-C--T-T--T-----G-AA--C---T-ATA----G---AA-----GA-T---A---CT----GC--------AAA-AAAAAAAAA-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CC--G-A-A-T--T--T--------G-T-A--TT---C-TG----G-T--AT----T-T--T-T--G-A-----------TTAAAAA---A--A---A-G---G--T-T-A---C-CA-A-A--A-A---TCT----G-GA-CTT----TT---------GCC-A--T-G--TCC--C-GA-A-T-T---A-AA----A-T-G-T-CTATACtgtt
gi|33911 : GTA-C----GT-TC--T-A-GT-ATTAA-GTGCTT--A--G-C--A-TAAT-----G-AAAAT---T-A------GG--AA-----GAAT---A---CT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-TGAC---AATCT--G-AGA-T--T--T----------T-T--TTGTGCAT-----G-T--AT----C-T--T-T--G-AATTACAAGGATT-----A---G--A---A-G---G--T-T-A---GCCA-A-A--A-A-GATCTGGTCG-GA-C-T----TT---------GTC-ACTT-G--T-C--C-GA-ATG-T---T-AA----A-tgtt
gi|33914 : aaaTA-CA-A-AT-T-----A-GT-A---A-CTGTTT--A--G-CA-T-T--T-----G-AA--T---C-ATG----A---AA-----GA-T---A---CTT---GC--------AAATA-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-TTAC---A--CT--G-A-A-T--TGGT--------GAT-T--TT---C-T-----GGTG-AT----C-T--T-C--GTA-----------G-----A---A--A---A-A---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-GATCT----G----C-TCCTATT---------GTC-A--T-G--T----C-GA---------T-AA----A-T-G-T---ATA
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gi|33916 : -TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--G-CA-T-T--T-----G-AG--C---T-ACATGTAA---AA-----GA-T---A---CT----GC--------ATA-A-------A--------T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-AC---A--GT--T-A-A-T--T--T--------G-C-C--TT---C-T-----G-T--AC----C-A--A-T--A-T-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GAC-G--T-G----C--T-AA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GCACtgtt
gi|33917 : --G-C--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---CT----GC--------AAA-A-------A-ATAA---T-CC-C---A-C--C-A--GT-T-AC---A--CT--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------T-----AT--A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-G---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
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gi|33920 : A-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-GC---A--C---------T--T--T--------G-A-T--TT---C-TCTCAAA-T--AT----C-T--T-T----A-----------T-----C---ATGA---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--G-C-G-TAC----G-CA-C-T----TA---------GTA-G--T-T--T-C--C-GG-A---C---T-AA----A-T-G-T-C-ACAC
gi|33921 : -A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--CT--G-A-A-T--T--T--------G-T-T--TT---C-A-----A-T--AT----C-T--T-T--A-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
gi|33923 : -A-C--T--T--------A-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------T-----A---A--A---A-AGTTG--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-T-T----G-GA-C-T----TT---------GTCTA--TCG--T-C--G-TATA-G-T---T-AG----A-T-G-T-CGATACtgtt
gi|33922 : -A-T--C--T--------T-T-C--TT---C-T-----G-TT-AT----C-T--T-T--G-T-----------TC----A---A--A---A-T---G--G-C-A---G-CA-A-A--C-A-G-TCT----G-CA-C-A----TT---------GCC-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-TA----A-A-G-T-T-GCAC
gi|33924 : atgcatttg-T--T--T--------A-T-T--TC---C-T-----A-C--TT----C-C--T-T--A-A---------------------G--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-GA-T-T----TG---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AC----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33925 : --TT---C-T-----G-T--AT----C-T--T-T--G-A-----------TG----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----GAGA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-CAATACtgtt
gi|33926 : -T-----G-T--AC----C-C--T-T--G-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-C---G-GC-G-A--A-A-C-TCC----G-GA-C-T----TTT--------GTC-G--T-G--T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tcgtt
gi|33927 : -T--T-T--G-T-----------A-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-C-TCT----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-GGTC-C--C-GA-A-G-TC--T-AA----A-T-G-TCC-ATACgcagtgtt
gi|33928 : ---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----A-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-AA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-GTACtgtt
gi|33929 : ----G-GA-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-AGACtgtt
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Reference ( family-346 ) : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAN--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
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gi|33874 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--AGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
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gi|33876 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GT--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-T-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-A-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33877 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAT--CGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-CG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33878 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAT--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-AT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---C-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC---------AA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------CA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--A-C-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33879 : GAGTTTA------TA-T-----------TTAA--TGTA-CA-A-GT-TG--C-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-C--A---C-CA-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--T-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33880 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTA-CA-A-AT-TG--T-A-CTTA---A-CT--TT--A--CC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-A-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----A--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TTT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-T-A---T-AA----A-T-G-T-C-ACACtg
gi|33881 : GAGCTTA------TA-T--A--T--C--TTAT--TGTA-CA-A-GT-TT--T-A-GC-A---G-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---C-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--------TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TA-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-CAA---G-CACA-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--CGGA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33882 : GACCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T-------C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----CT-T--T-TG-A-----------C-----ATAGA--A---A-G---G--GTT-A---G-CA-A-A--A-A-C-TCT----G-G-A-C-T----TTGTCCATGTCGTC-A--T-G--T-C--T-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33883 : GAGCTTACACATGTA-T--C--TTTC--TTAT--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-TT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--AA-T-AC---A--G-TT-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-CG-T-----------T-----A---A--A---A-AT--G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A---T----TT---------GTC-G--T-G--T-T--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-T-ATACtgtt
gi|33884 : GAGCTTA------TA-T------------------ATA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-AC-C---A-C--C-A--AA-T-AC---T--C-TG-A-A-T--T--T---G------TA---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-C---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tgtt
gi|33885 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAT--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--AC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------T-A--A---T-CC-C---A-A--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C--T--T-TC-A-----------T-----A---A--A---A-A---GT-G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-A----TT---------G--------G--TAC--C--------T------A----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33886 : GAGCTTA------TA-T--C--T------TAT--TGTA-TA-T-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GC--T-T--C-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------ATA--A---T-TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G-TT-A-A-T--T--T---G-T-T--TA---G-T-----A-T--AT----C--T--T-TG-T-----------TG----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-C-A-C-T----TA---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-A-T-C-ATAtgtt
gi|33887 : GGGTTCA------TA-T--C--T--C--TTAT--TGCA-CA-T-AT-TG--T-A-GT-A---A-CC--TC--A--GT--T-T--T-----TTAA--C---T-A----------AA-----GG-T---A---C-A----GC--------AAA-A---------A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--T-AT-A-A-T--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--A-TA-T-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-ttgtt
gi|33888 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTT-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--ATAGC--T-T--T-----G-AA--CG--T-GT-----G---AA-----GA-T---A---C------GC--------AAA-A-------ATA--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--TTT-G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----T--C--T-TG-A-----------T-----A---A--AC--A-A---G--G-T-G---A-GA-A-A--A-A-G-TCT----G-A-A-C------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-TGC-ATACgtccgaatttaagtatcgcactgtt
gi|33889 : GAG-TTA------TA-T--C--T--CGATTA---TGTA-CA-AAGT-CG--T-A-GT-A---AACT--TT--A--GTCTT-T--T-----G-AAA-C---T-A------C---AA-----AT-T---G---C-C----AA--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--A-G--GA-T-ACG--A--C-TG-A-A-T--T--T-------T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---GC-G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TC-----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
gi|33890 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAT--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCAAAA----AAA-A-------A-A--A---T-CA-C---A-C--C-A---A-T-AC---A--C-GG-A-A-T-------------------------------------------T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tgtt
gi|33891 : GAGCTTA------TAAT--C--T--C--TTAA--TGTA-CA---GT-CG--C-A-AT-A---A-CT--TT--A--GCG-T-T--T-----G-AA--C---TTA------GGA-AA-----GA-T-------C-T----GC--------CAA-A-------A-A--A---T-TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A----T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--AAAGA-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT------G-A-C-T----TG---------GTC-A--T-G--T----C-GA-A-G-TA--T-AA----ATT-G-T-C-
gi|33892 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TG-A--G-A-GT-T---T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----A-AA--C---A-G------G---AA-----GA-TGATA---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G---T--TT---G-T-----G-T--AT----C-----T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---A-CA-A-A--A-CTG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-G-------T-AA----A-T-GTT-C-ATAtatgtt
gi|33893 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--T-AA--TGTA--A-A-GTGCG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--C-T--TTTTTAA-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---A-TCGACAT--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---ATC--C-A--GA-T-ACGACA--C-TGTA-A-T--T--T---G-T-TATTC---C-T-----G-T--AT----C--TA-T-TG-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---GACA-A-A--A-A---TCT----G-A----------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33894 : GAGCT---------A-T--CATT--C--TTAA--TTTA-CA-A-GT-CT--T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-AA-----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-AATA---T-CC-T---A-CAGC-ATTAA-T-CC---A--C-TG-A-A-CGGT--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--A-----C--TACT-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---A--G-T-----G-CT-C-A--A-A-G-TCTAA--G-G-A-C-C----TT---------GTCTA--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTtgt
gi|33895 : GAGTTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTA-CG-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-TC--TC--A--GC--T-T--T-----T-AA--G---T-A------A---AATTAAGGA-C---C---C-T----GC--------AAG-A-------A-C------T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AA---A--A-GG-T-A-T--T--T---G-T-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--C-TA-A-----------C-----A---A--A---AAG---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-GCT----G-A-A-A-T----TT---------GTC-A--T-G--T-G--C-GA-A-G-C---T-AA----A-T-G-T-cactatt
gi|33896 : GGGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA---TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TTTTA--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------GG--AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--CCA--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---T-T-----
gi|33897 : GAGCTGA------TG-T--C--T--C--TTATAATGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A-----------------------C-----------------A-----GA-T---G---C-T----GC--------AAA-A----------------T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G-TT-A-A-T--T--T---G-T-C--CC---C-T-----G-T--AT----C--T--C-T--A-----------TTC---A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-C-A-C-T----TT---------G
gi|33898 : GAGCTTA------TG-T--T--T--C--TTAT--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-AGTAA-CA--TT--A--GC--T-T--TT----A-AA--C---T-T------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAG-A-------A-T------T-TC-G---A-C--C-A--GA-T-AC---G-----G-A-A-T--T--CAGAG-T-T--TA---A-T-----G-T--ATAGTAC--T--TATA-T-----------T-----A---AC-A---A-G---T--G-T-A---G-CT-T-T--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTG-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----
gi|33899 : GACCTTA------TA-C--C--T--C--TTGT--TGAA-CA-A-GA-TA--T-G-CG-A---A-AT--TC--A--GG--T-T--T-----G-AA--T---T-G------C---AAC----GT-T---T---T-T----G---------AAA-A-------A-A--A---T-AC-T---ATC--C-A--GA-T-AC---A--C-AA-G-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--C-TG-T-----------T-----A---G--A---ATG---G--G-T-G---G-CT-A-A--A-A-G-ACT----T-G-A-T-T----TT---------GTT-A--T-G--T-T--C----A-T-T---T-AATTTTA-T-G-T-C-ACA
gi|33900 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAG--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-AC-A---A-CC--TC--A--GCT-T-T--T-----G-AA--C---T-A------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------A
gi|33901 : GAGCTTA------TA-TATC--T--C--TTAT--TGTA-CN-N-NN-NN--N-N-NN-N---N-NN--NN--N--NN--N-N--N-----N-NN--N---N-N------N---NN-----NN-N---N---N-N----NN--------NNN-N-------N-N--N---N-NN-N---N-N--N-N--NN-N-NN---N--N-NN-N-N-N--N--N---N-N-N--NN---N-N-----N-N--NN----N--N--N-NN-N-----------NNTC--A---A--A---ATG---A--G-T-A---G-CG-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TC---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-T-T-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33902 : AGCTTA------TA-T--C--T-----TTAA--TGTA-CA-A-GT-CG--TTA-GT-A------C--TT--A--GC--T-T--TT----G-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---AAC--C-A--GA-T--C---A--C-TT-G-A-T--TG-T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-C----A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GT--A--T-G--T-C--C-GA-A-GTT---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgct
gi|33903 : AGCTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GTAA---A-CT--TT--AG-GC--T-T--T-----GAAA--C---T-AG-----G---AA-----GA-T---A---CTT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CCTT---A-C--C----GA-T-AG---A--C-TA-A------T--T---G-TGT--TT---C-T-----G-T--AT----CTTT--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-AGG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-CTTAT-AA----A-T-G-T-C-ctgtt
gi|33904 : AGCTTA------TA-T--A-----C--TTAA--TGTA-CA-A-GT-CGA-G-A-GT-ATCGA-CTA-TT--AA-GC--T-T--T-----G-AA--CAAGT-A------G---AA-----AT-T---AAGGC-TCA--GA--------AAA-A-------A-A--A---T-TC-CTATA-C--C-A--GA-T-AT---AACCATG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----CA-T--T-TG-ATTATT------T-----A---C--A---A-G---G--G-T-A---GACA-A-A--ACA-G-TCT----G-GAA-C-T----TT---------GGT-A--T-GA-T-C--C-G--A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-gccactgtt
gi|33905 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTAAATTG-A-CA-A-GT-CG--T-AAGT-A---A-GT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--AAATT-GC-C---T-A--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TCAC--A---A--A---A-G---G--C-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TTC--------GTC-A--T-G--TCC--C-GA-A-G-T---T-AA----A-TGG-T-C-ATtctgtt
gi|33906 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTAA--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A-----CT--TC--AT-GC--T-T--TT----G-AA--C---T-AA-----G---AA-----G--T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--AA--T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G---C--TT---C-T-----G-T--AT----CT-T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-ACC-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AAG---A-T-G-T---ATAgactgtt
gi|33907 : TA------TA-T--C--C--T--TTAA--TGTA-CAGA-GT-CG--C-A--C-A---A-CT--TTC-A--GC--T-T--T-----T-ATTTC---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T-----C--------AAA-A-------C-A------T-CC-T---A-C--C-A--GAAT-AC---A--C-TG-A-A-G--T--T---GGTAT--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-A---G-CA-A-A--ACA-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-GA-T-C--C-GA-A-------T-AA----A-T-G-TCC-ATACatgtt
gi|33908 : A------TA----C--T--C--TTAT--TGTAGCA-A-GT-TG--TCA-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AT--C---T-A------C---AA-----GA-T-------C-T----GCAGAAAAAAAAA-A-------G-A--A---T-CCGC---A-C--CAA--GA-T-AC---T--C-TG-A-ATT--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----GT--A--A---A-G---G--tgtt
gi|33909 : -T--C--T-----TTAA--TGTA-CA-A-GT-CGGAT-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--TGT--T-----G-AA--C---T-A------GGAAAA-----GA-T---AT--C-T----GC--------AAA-AG------A-A--A---CACC-T---A-C--C-A--GA-T-ACG--A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-TT----G-TCAAT----C--T--A-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---GCGG-T-AAGCG-CA-A-ACAA-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-CA-C-GA-A-G-T---TAAA----A-T-G-T-C--TAC
gi|33910 : GTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33911 : tcaaaG--T-A-TT-A---A-GTGCTT--A--GC--A-TAAT-----G-AAAAT---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-TGAC---AATC-TG-AGA-T--T--T-----T-T--TTGTGCAT-----G-T--AT----C--T--T-TG-AATTACAAGGATT-----A---G--A---A-G---G--T-T-A---GCCA-A-A--A-A-GATCTGGTCG-G-A-C-T----TT---------GTC-ACTT-G--T-C--C-GA-ATG-T---T-AA----A-tgtt
gi|33912 : aaagtacgttctaGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T-----------------------------------------------CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----GT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTAC
gi|33913 : GTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--CC--T-T--T-----G-AA--C---T-ATA----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-AAAAAAAAA-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-CG-A-A-T--T--T---G-T-A--TT---C-TG----G-T--AT----T--T--T-TG-A-----------TTAAAAA---A--A---A-G---G--T-T-A---C-CA-A-A--A-A---TCT----G-G-A-CTT----TT---------GCC-A--T-G--TCC--C-GA-A-T-T---A-AA----A-T-G-T-CTATACtgtt
gi|33914 : TA-CA-A-AT-----T-A-GT-A---A-CTGTTT--A--GCA-T-T--T-----G-AA--T---C-ATG----A---AA-----GA-T---A---C-TT---GC--------AAATA-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-TTAC---A--C-TG-A-A-T--TGGT---GAT-T--TT---C-T-----GGTG-AT----C--T--T-CGTA-----------G-----A---A--A---A-A---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-GATCT----G-----C-TCCTATT---------GTC-A--T-G--T----C-GA---------T-AA----A-T-G-T---ATAtgtt
gi|33915 : --T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C-TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-A--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtctgtt
gi|33916 : taG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GCA-T-T--T-----G-AG--C---T-ACATGTAA---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------ATA-A-------A--------T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-AC---A--G-TT-A-A-T--T--T---G-C-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--A--A-TA-T-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GAC-G--T-G----C--T-AA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GCACtgtt
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Alignments
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Reference ( family-346 ) : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
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gi|33874 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--AGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
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gi|33884 : GAGCTTA------TA-T--------------------ATA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-AC-C---A-C--C-A--AA-T-AC---T--C--TG-A-A-T--T--T---G------TA---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-C---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tgtt
gi|33885 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--AC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------T-A--A---T-CC-C---A-A--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C--T--T-TC-A-----------T-----A---A--A---A-A---GT-G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-A----TT---------G--------G--TAC--C--------T------A----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33886 : GAGCTTA------TA-T--C--T------TA--T--TGTA-TA-T-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GC--T-T--C-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------ATA--A---T-TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-T-T--TA---G-T-----A-T--AT----C--T--T-TG-T-----------TG----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-C-A-C-T----TA---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-A-T-C-ATAtgtt
gi|33887 : GGGTTCA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGCA-CA-T-AT-TG--T-A-GT-A---A-CC--TC--A--GT--T-T--T-----TTAA--C---T-A----------AA-----GG-T---A---C-A----GC--------AAA-A---------A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--T--AT-A-A-T--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--A-TA-T-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-ttgtt
gi|33888 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTT-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--ATAGC--T-T--T-----G-AA--CG--T-GT-----G---AA-----GA-T---A---C------GC--------AAA-A-------ATA--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--TTT-G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----T--C--T-TG-A-----------T-----A---A--AC--A-A---G--G-T-G---A-GA-A-A--A-A-G-TCT----G-A-A-C------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-TGC-ATACgtccgaatttaagtatcgcactgtt
gi|33889 : GAG-TTA------TA-T--C--T--CGATTA-----TGTA-CA-AAGT-CG--T-A-GT-A---AACT--TT--A--GTCTT-T--T-----G-AAA-C---T-A------C---AA-----AT-T---G---C-C----AA--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--A-G--GA-T-ACG--A--C--TG-A-A-T--T--T-------T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---GC-G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TC-----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
gi|33890 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCAAAA----AAA-A-------A-A--A---T-CA-C---A-C--C-A---A-T-AC---A--C--GG-A-A-T-------------------------------------------T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tgtt
gi|33891 : GAGCTTA------TAAT--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA---GT-CG--C-A-AT-A---A-CT--TT--A--GCG-T-T--T-----G-AA--C---TTA------GGA-AA-----GA-T-------C-T----GC--------CAA-A-------A-A--A---T-TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A----T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--AAAGA-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT------G-A-C-T----TG---------GTC-A--T-G--T----C-GA-A-G-TA--T-AA----ATT-G-T-C-
gi|33892 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TG-A--G-A-GT-T---T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----A-AA--C---A-G------G---AA-----GA-TGATA---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G---T--TT---G-T-----G-T--AT----C-----T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---A-CA-A-A--A-CTG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-G-------T-AA----A-T-GTT-C-ATAtatgtt
gi|33893 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--T-A--A--TGTA--A-A-GTGCG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--C-T--TTTTTAA-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---A-TCGACAT--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---ATC--C-A--GA-T-ACGACA--C--TGTA-A-T--T--T---G-T-TATTC---C-T-----G-T--AT----C--TA-T-TG-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---GACA-A-A--A-A---TCT----G-A----------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33894 : GAGCT---------A-T--CATT--C--TTA--A--TTTA-CA-A-GT-CT--T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-AA-----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-AATA---T-CC-T---A-CAGC-ATTAA-T-CC---A--C--TG-A-A-CGGT--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--A-----C--TACT-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---A--G-T-----G-CT-C-A--A-A-G-TCTAA--G-G-A-C-C----TT---------GTCTA--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTtgt
gi|33895 : GAGTTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CG-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-TC--TC--A--GC--T-T--T-----T-AA--G---T-A------A---AATTAAGGA-C---C---C-T----GC---------AA-G-------A-A--C---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AA---A--A--GG-T-A-T--T--T---G-T-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--C-TA-A-----------CA----A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-GCT----G-A-A-A-T----TT---------GTC-A--T-G--T-G--C-GA-A-G-C---T-AA----A-T-G-T-cactatt
gi|33896 : GGGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA-----TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TTTTA--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------GG--AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--CCA--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---T-T-----
gi|33897 : GAGCTGA------TG-T--C--T--C--TTATAA--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A-----------------------C-----------------A-----GA-T---G---C-T----GC--------AAA-A----------------T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-T-C--CC---C-T-----G-T--AT----C--T--C-T--A-----------TTC---A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-C-A-C-T----TT---------G
gi|33898 : GAGCTTA------TG-T--T--T--C--TTA--T--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-AGTAA-CA--TT--A--GC--T-T--TT----A-AA--C---T-T------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAG-A-------A-T------T-TC-G---A-C--C-A--GA-T-AC---G------G-A-A-T--T--CAGAG-T-T--TA---A-T-----G-T--ATAGTAC--T--TATA-T-----------T-----A---AC-A---A-G---T--G-T-A---G-CT-T-T--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTG-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----
gi|33899 : GACCTTA------TA-C--C--T--C--TTG--T--TGAA-CA-A-GA-TA--T-G-CG-A---A-AT--TC--A--GG--T-T--T-----G-AA--T---T-G------C---AAC----GT-T---T---T-T----G---------AAA-A-------A-A--A---T-AC-T---ATC--C-A--GA-T-AC---A--C--AA-G-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--C-TG-T-----------T-----A---G--A---ATG---G--G-T-G---G-CT-A-A--A-A-G-ACT----T-G-A-T-T----TT---------GTT-A--T-G--T-T--C----A-T-T---T-AATTTTA-T-G-T-C-ACA
gi|33900 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--G--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-AC-A---A-CC--TC--A--GCT-T-T--T-----G-AA--C---T-A------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------A
gi|33901 : GAGCTTA------TA-TATC--T--C--TTA--T--TGTA-CN-N-NN-NN--N-N-NN-N---N-NN--NN--N--NN--N-N--N-----N-NN--N---N-N------N---NN-----NN-N---N---N-N----NN--------NNN-N-------N-N--N---N-NN-N---N-N--N-N--NN-N-NN---N--N--NN-N-N-N--N--N---N-N-N--NN---N-N-----N-N--NN----N--N--N-NN-N-----------NNTC--A---A--A---ATG---A--G-T-A---G-CG-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TC---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-T-T-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33902 : AGCTTA------TA-T--C--T-----TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--TTA-GT-A------C--TT--A--GC--T-T--TT----G-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---AAC--C-A--GA-T--C---A--C--TT-G-A-T--TG-T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-C----A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GT--A--T-G--T-C--C-GA-A-GTT---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgct
gi|33903 : AGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GTAA---A-CT--TT--AG-GC--T-T--T-----GAAA--C---T-AG-----G---AA-----GA-T---A---CTT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CCTT---A-C--C----GA-T-AG---A--C--TA-A------T--T---G-TGT--TT---C-T-----G-T--AT----CTTT--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-AGG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-CTTAT-AA----A-T-G-T-C-ctgtt
gi|33904 : AGCTTA------TA-T--A-----C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGA-G-A-GT-ATCGA-CTA-TTA-A--GC--T-T--T-----G-AA--CAAGT-A------G---AA-----AT-T---AAGGC-TCA--GA--------AAA-A-------A-A--A---T-TC-CTATA-C--C-A--GA-T-ATA--A--CCATG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----CA-T--T-TG-ATTATT------T-----A---C--A---A-G---G--G-T-A---GACA-A-A--ACA-G-TCT----G-GAA-C-T----TT---------GGT-A--T-GA-T-C--C-G--A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-gccactgtt
gi|33905 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--AATTG-A-CA-A-GT-CG--T-AAGT-A---A-GT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--AAATT-GC-C---T-A--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TCAC--A---A--A---A-G---G--C-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TTC--------GTC-A--T-G--TCC--C-GA-A-G-T---T-AA----A-TGG-T-C-ATtctgtt
gi|33906 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-----A-CT--TC--AT-GCT-T-T--T-----G-AA--C---TAA------G---AA-----G--T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G---C--TT---C-T-----G-T--AT----CT-T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-ACC-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AAG---A-T-G-T---ATAgactgtt
gi|33907 : TA------TA-T--C--C--T--TTA--A--TGTA-CAGA-GT-CG--C-A--C-A---A-CT--TTC-A--GC--T-T--T-----T-ATTTC---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T-----C--------AAA-A-------C-A------T-CC-T---A-C--C-A--GAAT-AC---A--C--TG-A-A-G--T--T---GGTAT--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-A---G-CA-A-A--ACA-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-GA-T-C--C-GA-A-------T-AA----A-T-G-TCC-ATACatgtt
gi|33908 : A------TA----C--T--C--TTA--T--TGTAGCA-A-GT-TG--TCA-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AT--C---T-A------C---AA-----GA-T-------C-T----GCAGAAAAAAAAA-A-------G-A--A---T-CCGC---A-C--CAA--GA-T-AC---T--C--TG-A-ATT--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----GT--A--A---A-G---G--tgtt
gi|33909 : -T--C--T-----TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGGAT-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--TGT--T-----G-AA--C---T-A------GGAAAA-----GA-T---AT--C-T----GC--------AAA-AG------A-A--A---CACC-T---A-C--C-A--GA-T-ACG--A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-TT----G-TCAAT----C--T--A-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---GCGG-T-AAGCG-CA-A-ACAA-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-CA-C-GA-A-G-T---TAAA----A-T-G-T-C--TAC
gi|33910 : --TCA--A--AGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33911 : G--T-A-TT-A---A-GTGCTT--A--GC--A-TAAT-----G-AAAAT---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-TGAC---AATC--TG-AGA-T--T--T-----T-T--TTGTGCAT-----G-T--AT----C--T--T-TG-AATTACAAGGATT-----A---G--A---A-G---G--T-T-A---GCCA-A-A--A-A-GATCTGGTCG-G-A-C-T----TT---------GTC-ACTT-G--T-C--C-GA-ATG-T---T-AA----A-tgtt
gi|33912 : aaagtacgttctaGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T-----------------------------------------------CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----GT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTAC
gi|33913 : GTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--CC--T-T--T-----G-AA--C---T-ATA----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-AAAAAAAAA-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--CG-A-A-T--T--T---G-T-A--TT---C-TG----G-T--AT----T--T--T-TG-A-----------TTAAAAA---A--A---A-G---G--T-T-A---C-CA-A-A--A-A---TCT----G-G-A-CTT----TT---------GCC-A--T-G--TCC--C-GA-A-T-T---A-AA----A-T-G-T-CTATACtgtt
gi|33914 : TA-CA-A-AT-----T-A-GT-A---A-CTGTTT--A--GCA-T-T--T-----G-AA--T---C-ATG----A---AA-----GA-T---A---C-TT---GC--------AAATA-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-TTAC---A--C--TG-A-A-T--TGGT---GAT-T--TT---C-T-----GGTG-AT----C--T--T-CGTA-----------G-----A---A--A---A-A---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-GATCT----G-----C-TCCTATT---------GTC-A--T-G--T----C-GA---------T-AA----A-T-G-T---ATAtgtt
gi|33915 : --T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-A--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtctgtt
gi|33916 : taG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GCA-T-T--T-----G-AG--C---T-ACATGTAA---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------ATA-A-------A--------T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-C-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--A--A-TA-T-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GAC-G--T-G----C--T-AA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GCACtgtt
gi|33917 : t--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-ATAA---T-CC-C---A-C--C-A--GT-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----AT--A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-G---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33918 : A-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A------T-CG-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--C---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---A--G-C-A---G-CA-ATA--A-A-G-TC-----G-G-A-C-TA---TTA--------GTC-A--T-G--T-TTAT-GA-A---T---T-AG----ATT-G-T-C-tgtt
gi|33919 : AA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TT-T-TT---G-----TA-A-A-G---------G-T-T--TT---C-TT----G-TT-AT----C--C--T-TC-A-----------------A---G--A---A-A---G--G-T-C---G-CG-A-A--A-A-A-TCC----G-G-A-C-T----TTT--------GTC-G--T----T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-
gi|33920 : A-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-GC---A--C---------T--T--T---G-A-T--TT---C-TCTCAAA-T--AT----C--T--T-T--A-----------T-----C---ATGA---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--G-C-G-TAC----G-C-A-C-T----TA---------GTA-G--T-T--T-C--C-GG-A---C---T-AA----A-T-G-T-C-ACAC
gi|33921 : -A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----A-T--AT----C--T--T-TA-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
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Reference ( family-346 ) : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
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gi|33893 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--T-A--A--TGTA--A-A-GTGCG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--C-T--TTTTTAA-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---A-TCGACAT--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---ATC--C-A--GA-T-ACGACA--C--TGTA-A-T--T--T---G-T-TATTC---C-T-----G-T--AT----C--TA-T-TG-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---GACA-A-A--A-A---TCT----G-A----------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33894 : GAGCT---------A-T--CATT--C--TTA--A--TTTA-CA-A-GT-CT--T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-AA-----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-AATA---T-CC-T---A-CAGC-ATTAA-T-CC---A--C--TG-A-A-CGGT--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--A-----C--TACT-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---A--G-T-----G-CT-C-A--A-A-G-TCTAA--G-G-A-C-C----TT---------GTCTA--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTtgt
gi|33895 : GAGTTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CG-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-TC--TC--A--GC--T-T--T-----T-AA--G---T-A------A---AATTAAGGA-C---C---C-T----GC---------AA-G-------A-A--C---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AA---A--A--GG-T-A-T--T--T---G-T-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--C-TA-A-----------CA----A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-GCT----G-A-A-A-T----TT---------GTC-A--T-G--T-G--C-GA-A-G-C---T-AA----A-T-G-T-cactatt
gi|33896 : GGGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA-----TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TTTTA--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------GG--AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--CCA--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---T-T-----
gi|33897 : GAGCTGA------TG-T--C--T--C--TTATAA--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A-----------------------C-----------------A-----GA-T---G---C-T----GC--------AAA-A----------------T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-T-C--CC---C-T-----G-T--AT----C--T--C-T--A-----------TTC---A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-C-A-C-T----TT---------G
gi|33898 : GAGCTTA------TG-T--T--T--C--TTA--T--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-AGTAA-CA--TT--A--GC--T-T--TT----A-AA--C---T-T------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAG-A-------A-T------T-TC-G---A-C--C-A--GA-T-AC---G------G-A-A-T--T--CAGAG-T-T--TA---A-T-----G-T--ATAGTAC--T--TATA-T-----------T-----A---AC-A---A-G---T--G-T-A---G-CT-T-T--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTG-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----
gi|33899 : GACCTTA------TA-C--C--T--C--TTG--T--TGAA-CA-A-GA-TA--T-G-CG-A---A-AT--TC--A--GG--T-T--T-----G-AA--T---T-G------C---AAC----GT-T---T---T-T----G---------AAA-A-------A-A--A---T-AC-T---ATC--C-A--GA-T-AC---A--C--AA-G-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--C-TG-T-----------T-----A---G--A---ATG---G--G-T-G---G-CT-A-A--A-A-G-ACT----T-G-A-T-T----TT---------GTT-A--T-G--T-T--C----A-T-T---T-AATTTTA-T-G-T-C-ACA
gi|33900 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--G--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-AC-A---A-CC--TC--A--GCT-T-T--T-----G-AA--C---T-A------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------A
gi|33901 : GAGCTTA------TA-TATC--T--C--TTA--T--TGTA-CN-N-NN-NN--N-N-NN-N---N-NN--NN--N--NN--N-N--N-----N-NN--N---N-N------N---NN-----NN-N---N---N-N----NN--------NNN-N-------N-N--N---N-NN-N---N-N--N-N--NN-N-NN---N--N--NN-N-N-N--N--N---N-N-N--NN---N-N-----N-N--NN----N--N--N-NN-N-----------NNTC--A---A--A---ATG---A--G-T-A---G-CG-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TC---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-T-T-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33902 : AGCTTA------TA-T--C--T-----TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--TTA-GT-A------C--TT--A--GC--T-T--TT----G-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---AAC--C-A--GA-T--C---A--C--TT-G-A-T--TG-T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-C----A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GT--A--T-G--T-C--C-GA-A-GTT---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgct
gi|33903 : AGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GTAA---A-CT--TT--AG-GC--T-T--T-----GAAA--C---T-AG-----G---AA-----GA-T---A---CTT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CCTT---A-C--C----GA-T-AG---A--C--TA-A------T--T---G-TGT--TT---C-T-----G-T--AT----CTTT--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-AGG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-CTTAT-AA----A-T-G-T-C-ctgtt
gi|33904 : AGCTTA------TA-T--A-----C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGA-G-A-GT-ATCGA-CTA-TTA-A--GC--T-T--T-----G-AA--CAAGT-A------G---AA-----AT-T---AAGGC-TCA--GA--------AAA-A-------A-A--A---T-TC-CTATA-C--C-A--GA-T-ATA--A--CCATG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----CA-T--T-TG-ATTATT------T-----A---C--A---A-G---G--G-T-A---GACA-A-A--ACA-G-TCT----G-GAA-C-T----TT---------GGT-A--T-GA-T-C--C-G--A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-gccactgtt
gi|33905 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--AATTG-A-CA-A-GT-CG--T-AAGT-A---A-GT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--AAATT-GC-C---T-A--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TCAC--A---A--A---A-G---G--C-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TTC--------GTC-A--T-G--TCC--C-GA-A-G-T---T-AA----A-TGG-T-C-ATtctgtt
gi|33906 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-----A-CT--TC--AT-GCT-T-T--T-----G-AA--C---TAA------G---AA-----G--T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G---C--TT---C-T-----G-T--AT----CT-T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-ACC-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AAG---A-T-G-T---ATAgactgtt
gi|33907 : TA------TA-T--C--C--T--TTA--A--TGTA-CAGA-GT-CG--C-A--C-A---A-CT--TTC-A--GC--T-T--T-----T-ATTTC---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T-----C--------AAA-A-------C-A------T-CC-T---A-C--C-A--GAAT-AC---A--C--TG-A-A-G--T--T---GGTAT--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-A---G-CA-A-A--ACA-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-GA-T-C--C-GA-A-------T-AA----A-T-G-TCC-ATACatgtt
gi|33908 : A------TA----C--T--C--TTA--T--TGTAGCA-A-GT-TG--TCA-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AT--C---T-A------C---AA-----GA-T-------C-T----GCAGAAAAAAAAA-A-------G-A--A---T-CCGC---A-C--CAA--GA-T-AC---T--C--TG-A-ATT--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----GT--A--A---A-G---G--tgtt
gi|33909 : -T--C--T-----TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGGAT-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--TGT--T-----G-AA--C---T-A------GGAAAA-----GA-T---AT--C-T----GC--------AAA-AG------A-A--A---CACC-T---A-C--C-A--GA-T-ACG--A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-TT----G-TCAAT----C--T--A-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---GCGG-T-AAGCG-CA-A-ACAA-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-CA-C-GA-A-G-T---TAAA----A-T-G-T-C--TAC
gi|33910 : --TCA--A--AGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33911 : G--T-A-TT-A---A-GTGCTT--A--GC--A-TAAT-----G-AAAAT---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-TGAC---AATC--TG-AGA-T--T--T-----T-T--TTGTGCAT-----G-T--AT----C--T--T-TG-AATTACAAGGATT-----A---G--A---A-G---G--T-T-A---GCCA-A-A--A-A-GATCTGGTCG-G-A-C-T----TT---------GTC-ACTT-G--T-C--C-GA-ATG-T---T-AA----A-tgtt
gi|33912 : aaagtacgttctaGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T-----------------------------------------------CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----GT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTAC
gi|33913 : GTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--CC--T-T--T-----G-AA--C---T-ATA----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-AAAAAAAAA-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--CG-A-A-T--T--T---G-T-A--TT---C-TG----G-T--AT----T--T--T-TG-A-----------TTAAAAA---A--A---A-G---G--T-T-A---C-CA-A-A--A-A---TCT----G-G-A-CTT----TT---------GCC-A--T-G--TCC--C-GA-A-T-T---A-AA----A-T-G-T-CTATACtgtt
gi|33914 : TA-CA-A-AT-----T-A-GT-A---A-CTGTTT--A--GCA-T-T--T-----G-AA--T---C-ATG----A---AA-----GA-T---A---C-TT---GC--------AAATA-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-TTAC---A--C--TG-A-A-T--TGGT---GAT-T--TT---C-T-----GGTG-AT----C--T--T-CGTA-----------G-----A---A--A---A-A---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-GATCT----G-----C-TCCTATT---------GTC-A--T-G--T----C-GA---------T-AA----A-T-G-T---ATAtgtt
gi|33915 : --T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-A--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtctgtt
gi|33916 : taG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GCA-T-T--T-----G-AG--C---T-ACATGTAA---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------ATA-A-------A--------T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-C-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--A--A-TA-T-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GAC-G--T-G----C--T-AA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GCACtgtt
gi|33917 : t--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-ATAA---T-CC-C---A-C--C-A--GT-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----AT--A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-G---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33918 : A-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A------T-CG-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--C---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---A--G-C-A---G-CA-ATA--A-A-G-TC-----G-G-A-C-TA---TTA--------GTC-A--T-G--T-TTAT-GA-A---T---T-AG----ATT-G-T-C-tgtt
gi|33919 : AA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TT-T-TT---G-----TA-A-A-G---------G-T-T--TT---C-TT----G-TT-AT----C--C--T-TC-A-----------------A---G--A---A-A---G--G-T-C---G-CG-A-A--A-A-A-TCC----G-G-A-C-T----TTT--------GTC-G--T----T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-
gi|33920 : A-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-GC---A--C---------T--T--T---G-A-T--TT---C-TCTCAAA-T--AT----C--T--T-T--A-----------T-----C---ATGA---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--G-C-G-TAC----G-C-A-C-T----TA---------GTA-G--T-T--T-C--C-GG-A---C---T-AA----A-T-G-T-C-ACAC
gi|33921 : -A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----A-T--AT----C--T--T-TA-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
gi|33922 : A-T-GC---A--T--TT-G-A-T--C--T---T-T-C--TT---C-T-----G-TT-AT----C--T--T-TG-T-----------TC----A---A--A---A-T---G--G-C-A---G-CA-A-A--C-A-G-TCT----G-C-A-C-A----TT---------GCC-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-TA----A-A-G-T-T-GCACtgtt
gi|33923 : -A-C--T--T---A-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-AGTTG--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-T-T----G-G-A-C-T----TT---------GTCTA--TCG--T-C--G-TATA-G-T---T-AG----A-T-G-T-CGATAC
gi|33924 : -T--T--T---A-T-T--TC---C-T-----A-C--TT----C--C--T-TA-A---------------------G--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-T-T----TG---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AC----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33925 : --TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TG----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----GAG-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-CAATACtgtt
gi|33926 : -T-----G-T--AC----C--C--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-C---G-GC-G-A--A-A-C-TCC----G-G-A-C-T----TTT--------GTC-G--T-G--T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tcgtt
gi|33927 : --T--T-TG-T-----------A-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-C-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-GGTC-C--C-GA-A-G-TC--T-AA----A-T-G-TCC-ATACgcagtgtt
gi|33928 : ---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----A-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-AA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-GTACtgtt
gi|33929 : ----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-AGACtgtt
blockSeqs : CACATG A AT AT TT GA TAA GC GA T T GTA GC TT TA CT AA TTTTA G TT AAG T CATGTAA TTAAG A GAT AGG CGAC AGAAAAAA AAAAAAA T AT AAT T TAT T AG C TT G GAC AT CA GG GG AGA G G AT GTG CTCAA A CA AGTA TT AC ATTACAAGGATT TAG TG AAG A GTT CG AGC A CA C T A GGTC CCTA GTCCATGTC T CT GT A TA TTA TTTT T G T
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blockSeqs : . . . . . . A C . . . . A C T T . T A A . . GGA . . . . T A . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . G A T . A . TTAAAA T G . T . C . C . . . . . . A . . A C . C . . C A
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blockSeqs : . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A N . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : T****************
originalCons : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
finalCons : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-AT----------------A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111 22222222222222222
lowQualScore : 333333 1 11 11 11 11 55555 1 1 1 33 22 1 0 1 333 0 33 33 33 55 0 11 44444 2 33 222 1 0000000000 33333 1 111 222 0 3333 88888888 0 3333333 1 22 111 0 1 111 2 11 1 11 0 1 333 11 11 0 0 0 11 11 222 1 1 11 111 0 44444 2 33 1111 33 11 0 0 00000000000000000 222 33 222 3 222 22 0 0 111 2 0 0 11 1 1 1 2222 0 0 0 0 2222 666666666 1 11 0 22 2 11 0 0 0 0 222 0 2222 1 0 0 2 2
lowQualScore : ...... . .. .. .. .. ..... . . . .. .. . . . ... . .. .. .. .. . .. ..... . .. ... . .......... ..... . ... ... . .... ........ . ....... . .. ... . . ... . .. . .. . . ... .. .. . . . .. .. ... . . .. ... . ..... . .. .... .. .. . . ................. ... .. ... . ... .. . . ... . . . .. . . . .... . . . . .... ......... . .. . .. . .. . . . . ... . .... . . . . .
lowQualScore : 222222 1 55 55 55 44 77777 0 0 0 00 22 8 9 8 222 9 44 11 00 77 9 22 00000 7 33 444 8 2222222222 11111 7 555 444 9 9999 55555555 9 6666666 7 33 555 8 7 555 5 11 7 11 8 6 999 99 11 8 8 8 11 99 555 6 6 11 333 8 22222 3 44 6666 33 88 8 8 00000000000000000 888 33 111 8 000 55 8 8 333 3 8 8 11 5 5 5 6666 8 8 8 8 4444 000000000 5 11 8 66 3 88 8 8 8 8 999 8 4444 6 8 8 4 4
consensus : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
Reference ( family-346 ) : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33873 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--AGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33874 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--AGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33875 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--AGTA-CA-A-GT--G--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----GGAA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A------T-CC-T---A-C--C-A--AG-T-AC---AA-C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33876 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GT--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-T-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-A-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33877 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--CGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--CG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33878 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-AT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---C-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC---------AA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------CA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--A-C-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33879 : GAGTTTA------TA-T-----------TTA--A--TGTA-CA-A-GT-TG--C-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-C--A---C-CA-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--T-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33880 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-AT-TG--T-A-CTTA---A-CT--TT--A--CC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-A-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----A--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TTT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-T-A---T-AA----A-T-G-T-C-ACACtg
gi|33881 : GAGCTTA------TA-T--A--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TT--T-A-GC-A---G-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---C-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--------TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TA-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-CAA---G-CACA-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--CGGA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33882 : GACCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T-------C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----CT-T--T-TG-A-----------C-----ATAGA--A---A-G---G--GTT-A---G-CA-A-A--A-A-C-TCT----G-G-A-C-T----TTGTCCATGTCGTC-A--T-G--T-C--T-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33883 : GAGCTTACACATGTA-T--C--TTTC--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-TT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--AA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-CG-T-----------T-----A---A--A---A-AT--G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A---T----TT---------GTC-G--T-G--T-T--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-T-ATACtgtt
gi|33884 : GAGCTTA------TA-T--------------------ATA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-AC-C---A-C--C-A--AA-T-AC---T--C--TG-A-A-T--T--T---G------TA---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-C---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tgtt
gi|33885 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--AC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------T-A--A---T-CC-C---A-A--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C--T--T-TC-A-----------T-----A---A--A---A-A---GT-G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-A----TT---------G--------G--TAC--C--------T------A----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33886 : GAGCTTA------TA-T--C--T------TA--T--TGTA-TA-T-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GC--T-T--C-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------ATA--A---T-TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-T-T--TA---G-T-----A-T--AT----C--T--T-TG-T-----------TG----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-C-A-C-T----TA---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-A-T-C-ATAtgtt
gi|33887 : GGGTTCA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGCA-CA-T-AT-TG--T-A-GT-A---A-CC--TC--A--GT--T-T--T-----TTAA--C---T-A----------AA-----GG-T---A---C-A----GC--------AAA-A---------A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--T--AT-A-A-T--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--A-TA-T-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-ttgtt
gi|33888 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTT-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--ATAGC--T-T--T-----G-AA--CG--T-GT-----G---AA-----GA-T---A---C------GC--------AAA-A-------ATA--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--TTT-G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----T--C--T-TG-A-----------T-----A---A--AC--A-A---G--G-T-G---A-GA-A-A--A-A-G-TCT----G-A-A-C------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-TGC-ATACgtccgaatttaagtatcgcactgtt
gi|33889 : GAG-TTA------TA-T--C--T--CGATTA-----TGTA-CA-AAGT-CG--T-A-GT-A---AACT--TT--A--GTCTT-T--T-----G-AAA-C---T-A------C---AA-----AT-T---G---C-C----AA--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--A-G--GA-T-ACG--A--C--TG-A-A-T--T--T-------T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---GC-G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TC-----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
gi|33890 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--T--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GCAAAA----AAA-A-------A-A--A---T-CA-C---A-C--C-A---A-T-AC---A--C--GG-A-A-T-------------------------------------------T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tgtt
gi|33891 : GAGCTTA------TAAT--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA---GT-CG--C-A-AT-A---A-CT--TT--A--GCG-T-T--T-----G-AA--C---TTA------GGA-AA-----GA-T-------C-T----GC--------CAA-A-------A-A--A---T-TC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A----T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--AAAGA-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT------G-A-C-T----TG---------GTC-A--T-G--T----C-GA-A-G-TA--T-AA----ATT-G-T-C-
gi|33892 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TG-A--G-A-GT-T---T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----A-AA--C---A-G------G---AA-----GA-TGATA---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G---T--TT---G-T-----G-T--AT----C-----T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---A-CA-A-A--A-CTG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-G-------T-AA----A-T-GTT-C-ATAtatgtt
gi|33893 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--T-A--A--TGTA--A-A-GTGCG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--C-T--TTTTTAA-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---A-TCGACAT--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---ATC--C-A--GA-T-ACGACA--C--TGTA-A-T--T--T---G-T-TATTC---C-T-----G-T--AT----C--TA-T-TG-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---GACA-A-A--A-A---TCT----G-A----------TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33894 : GAGCT---------A-T--CATT--C--TTA--A--TTTA-CA-A-GT-CT--T-A-GT-A---A-CT--T---A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-AA-----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-AATA---T-CC-T---A-CAGC-ATTAA-T-CC---A--C--TG-A-A-CGGT--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--A-----C--TACT-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---A--G-T-----G-CT-C-A--A-A-G-TCTAA--G-G-A-C-C----TT---------GTCTA--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTtgt
gi|33895 : GAGTTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CG-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-TC--TC--A--GC--T-T--T-----T-AA--G---T-A------A---AATTAAGGA-C---C---C-T----GC---------AA-G-------A-A--C---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AA---A--A--GG-T-A-T--T--T---G-T-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--T--C-TA-A-----------CA----A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-GCT----G-A-A-A-T----TT---------GTC-A--T-G--T-G--C-GA-A-G-C---T-AA----A-T-G-T-cactatt
gi|33896 : GGGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA-----TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-A---A-CT--TTTTA--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------GG--AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--CCA--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---T-T-----
gi|33897 : GAGCTGA------TG-T--C--T--C--TTATAA--TGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A-----------------------C-----------------A-----GA-T---G---C-T----GC--------AAA-A----------------T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-T-C--CC---C-T-----G-T--AT----C--T--C-T--A-----------TTC---A---A--A---A-G---G--G-C-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-C-A-C-T----TT---------G
gi|33898 : GAGCTTA------TG-T--T--T--C--TTA--T--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-AGTAA-CA--TT--A--GC--T-T--TT----A-AA--C---T-T------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAG-A-------A-T------T-TC-G---A-C--C-A--GA-T-AC---G------G-A-A-T--T--CAGAG-T-T--TA---A-T-----G-T--ATAGTAC--T--TATA-T-----------T-----A---AC-A---A-G---T--G-T-A---G-CT-T-T--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTG-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----
gi|33899 : GACCTTA------TA-C--C--T--C--TTG--T--TGAA-CA-A-GA-TA--T-G-CG-A---A-AT--TC--A--GG--T-T--T-----G-AA--T---T-G------C---AAC----GT-T---T---T-T----G---------AAA-A-------A-A--A---T-AC-T---ATC--C-A--GA-T-AC---A--C--AA-G-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--C-TG-T-----------T-----A---G--A---ATG---G--G-T-G---G-CT-A-A--A-A-G-ACT----T-G-A-T-T----TT---------GTT-A--T-G--T-T--C----A-T-T---T-AATTTTA-T-G-T-C-ACA
gi|33900 : GAGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--G--TGTA-TA-A-GT-TG--T-A-AC-A---A-CC--TC--A--GCT-T-T--T-----G-AA--C---T-A------A---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------A
gi|33901 : GAGCTTA------TA-TATC--T--C--TTA--T--TGTA-CN-N-NN-NN--N-N-NN-N---N-NN--NN--N--NN--N-N--N-----N-NN--N---N-N------N---NN-----NN-N---N---N-N----NN--------NNN-N-------N-N--N---N-NN-N---N-N--N-N--NN-N-NN---N--N--NN-N-N-N--N--N---N-N-N--NN---N-N-----N-N--NN----N--N--N-NN-N-----------NNTC--A---A--A---ATG---A--G-T-A---G-CG-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TC---------GTC-G--T-G--T-C--C-GA-T-T-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33902 : AGCTTA------TA-T--C--T-----TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--TTA-GT-A------C--TT--A--GC--T-T--TT----G-AA--C---T-A------GG--AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---AAC--C-A--GA-T--C---A--C--TT-G-A-T--TG-T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-C----A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GT--A--T-G--T-C--C-GA-A-GTT---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgct
gi|33903 : AGCTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GTAA---A-CT--TT--AG-GC--T-T--T-----GAAA--C---T-AG-----G---AA-----GA-T---A---CTT----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CCTT---A-C--C----GA-T-AG---A--C--TA-A------T--T---G-TGT--TT---C-T-----G-T--AT----CTTT--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-AGG-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-CTTAT-AA----A-T-G-T-C-ctgtt
gi|33904 : AGCTTA------TA-T--A-----C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGA-G-A-GT-ATCGA-CTA-TTA-A--GC--T-T--T-----G-AA--CAAGT-A------G---AA-----AT-T---AAGGC-TCA--GA--------AAA-A-------A-A--A---T-TC-CTATA-C--C-A--GA-T-ATA--A--CCATG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----CA-T--T-TG-ATTATT------T-----A---C--A---A-G---G--G-T-A---GACA-A-A--ACA-G-TCT----G-GAA-C-T----TT---------GGT-A--T-GA-T-C--C-G--A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-gccactgtt
gi|33905 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--AATTG-A-CA-A-GT-CG--T-AAGT-A---A-GT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--AAATT-GC-C---T-A--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TCAC--A---A--A---A-G---G--C-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TTC--------GTC-A--T-G--TCC--C-GA-A-G-T---T-AA----A-TGG-T-C-ATtctgtt
gi|33906 : CTTA------TA-T--C--T--C--TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CG--T-A-GT-----A-CT--TC--AT-GCT-T-T--T-----G-AA--C---TAA------G---AA-----G--T---A---C-T----GCA-------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G---C--TT---C-T-----G-T--AT----CT-T--T-TG-A-----------TAA---A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-ACC-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AAG---A-T-G-T---ATAgactgtt
gi|33907 : TA------TA-T--C--C--T--TTA--A--TGTA-CAGA-GT-CG--C-A--C-A---A-CT--TTC-A--GC--T-T--T-----T-ATTTC---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T-----C--------AAA-A-------C-A------T-CC-T---A-C--C-A--GAAT-AC---A--C--TG-A-A-G--T--T---GGTAT--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-A---G-CA-A-A--ACA-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-GA-T-C--C-GA-A-------T-AA----A-T-G-TCC-ATACatgtt
gi|33908 : A------TA----C--T--C--TTA--T--TGTAGCA-A-GT-TG--TCA-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AT--C---T-A------C---AA-----GA-T-------C-T----GCAGAAAAAAAAA-A-------G-A--A---T-CCGC---A-C--CAA--GA-T-AC---T--C--TG-A-ATT--T--T---G-C-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----GT--A--A---A-G---G--tgtt
gi|33909 : -T--C--T-----TTA--A--TGTA-CA-A-GT-CGGAT-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--TGT--T-----G-AA--C---T-A------GGAAAA-----GA-T---AT--C-T----GC--------AAA-AG------A-A--A---CACC-T---A-C--C-A--GA-T-ACG--A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-TT----G-TCAAT----C--T--A-TG-A-----------T-----A---A--A---A-A---GCGG-T-AAGCG-CA-A-ACAA-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-CA-C-GA-A-G-T---TAAA----A-T-G-T-C--TAC
gi|33910 : --TCA--A--AGTA-TA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----AA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TA-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TAT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33911 : G--T-A-TT-A---A-GTGCTT--A--GC--A-TAAT-----G-AAAAT---T-A------GG--AA-----GAAT---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-TGAC---AATC--TG-AGA-T--T--T-----T-T--TTGTGCAT-----G-T--AT----C--T--T-TG-AATTACAAGGATT-----A---G--A---A-G---G--T-T-A---GCCA-A-A--A-A-GATCTGGTCG-G-A-C-T----TT---------GTC-ACTT-G--T-C--C-GA-ATG-T---T-AA----A-tgtt
gi|33912 : aaagtacgttctaGTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CG--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T-----------------------------------------------CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----GT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTAC
gi|33913 : GTA-CA-A-GT-TG--T-A-GT-A---A-CT--TT--A--CC--T-T--T-----G-AA--C---T-ATA----G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-AAAAAAAAA-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--CG-A-A-T--T--T---G-T-A--TT---C-TG----G-T--AT----T--T--T-TG-A-----------TTAAAAA---A--A---A-G---G--T-T-A---C-CA-A-A--A-A---TCT----G-G-A-CTT----TT---------GCC-A--T-G--TCC--C-GA-A-T-T---A-AA----A-T-G-T-CTATACtgtt
gi|33914 : TA-CA-A-AT-----T-A-GT-A---A-CTGTTT--A--GCA-T-T--T-----G-AA--T---C-ATG----A---AA-----GA-T---A---C-TT---GC--------AAATA-------A-A--A---A-CC-C---A-C--C-A--GA-TTAC---A--C--TG-A-A-T--TGGT---GAT-T--TT---C-T-----GGTG-AT----C--T--T-CGTA-----------G-----A---A--A---A-A---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-GATCT----G-----C-TCCTATT---------GTC-A--T-G--T----C-GA---------T-AA----A-T-G-T---ATAtgtt
gi|33915 : --T-A-GT-A---A-CT--TT--A--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-A--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtctgtt
gi|33916 : taG--T-A-GT-A---A-CT--TC--A--GCA-T-T--T-----G-AG--C---T-ACATGTAA---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------ATA-A-------A--------T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-AC---A--G--TT-A-A-T--T--T---G-C-C--TT---C-T-----G-T--AC----C--A--A-TA-T-----------T-----A---AG-A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-G-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GAC-G--T-G----C--T-AA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GCACtgtt
gi|33917 : t--GC--T-T--T-----G-AA--C---T-A------G---AA-----GA-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-ATAA---T-CC-C---A-C--C-A--GT-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----AT--A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-G---T-AA----A-T-G-T-C-ATACtgtt
gi|33918 : A-T---A---C-T----GC--------AAA-A-------A-A------T-CG-C---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--C---G-T-T--TT---C-T-----GAT--AT----C--T--T-TG-A-----------TA----A---A--A---A-G---A--G-C-A---G-CA-ATA--A-A-G-TC-----G-G-A-C-TA---TTA--------GTC-A--T-G--T-TTAT-GA-A---T---T-AG----ATT-G-T-C-tgtt
gi|33919 : AA-A-------A-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TT-T-TT---G-----TA-A-A-G---------G-T-T--TT---C-TT----G-TT-AT----C--C--T-TC-A-----------------A---G--A---A-A---G--G-T-C---G-CG-A-A--A-A-A-TCC----G-G-A-C-T----TTT--------GTC-G--T----T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-
gi|33920 : A-A-------C-A--A---T-CC-C---A-C--C-A--TA-T-GC---A--C---------T--T--T---G-A-T--TT---C-TCTCAAA-T--AT----C--T--T-T--A-----------T-----C---ATGA---A-G---G--G-T-A---G-CA-G-A--G-C-G-TAC----G-C-A-C-T----TA---------GTA-G--T-T--T-C--C-GG-A---C---T-AA----A-T-G-T-C-ACAC
gi|33921 : -A--A---T-CC-T---A-C--C-A--GA-T-AC---A--C--TG-A-A-T--T--T---G-T-T--TT---C-A-----A-T--AT----C--T--T-TA-A-----------T-----A---A--A---AAG---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-GTACtgt
gi|33922 : A-T-GC---A--T--TT-G-A-T--C--T---T-T-C--TT---C-T-----G-TT-AT----C--T--T-TG-T-----------TC----A---A--A---A-T---G--G-C-A---G-CA-A-A--C-A-G-TCT----G-C-A-C-A----TT---------GCC-G--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-TA----A-A-G-T-T-GCACtgtt
gi|33923 : -A-C--T--T---A-T-T--TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-AGTTG--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-T-T----G-G-A-C-T----TT---------GTCTA--TCG--T-C--G-TATA-G-T---T-AG----A-T-G-T-CGATAC
gi|33924 : -T--T--T---A-T-T--TC---C-T-----A-C--TT----C--C--T-TA-A---------------------G--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----G-G-A-T-T----TG---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---A-AC----A-T-G-T-C-ATAC
gi|33925 : --TT---C-T-----G-T--AT----C--T--T-TG-A-----------TG----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----GAG-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-CAATACtgtt
gi|33926 : -T-----G-T--AC----C--C--T-TG-A-----------T-----A---A--A---A-G---G--T-T-C---G-GC-G-A--A-A-C-TCC----G-G-A-C-T----TTT--------GTC-G--T-G--T-C--C-GG-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-tcgtt
gi|33927 : --T--T-TG-T-----------A-----A---A--A---A-G---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-C-TCT----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-GGTC-C--C-GA-A-G-TC--T-AA----A-T-G-TCC-ATACgcagtgtt
gi|33928 : ---G--G-T-A---G-CA-A-A--A-A-G-TCT----A-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-AA-A-G-T---A-AA----A-T-G-T-C-GTACtgtt
gi|33929 : ----G-G-A-C-T----TT---------GTC-A--T-G--T-C--C-GA-A-G-T---T-AA----A-T-G-T-C-AGACtgtt