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lowQualScore                  :     7   5   4  0000 00 9 00 4 2222 4 9    0000  3 11 88 3  2 2 2 88888  33   0000 111 4 1 1  00000 66 55 66666 0 33 9  22 7 11 8888 99 11111 999999999 333 3 7 5 55 66666 7 000 7 7 00 00 7 3333 00 7 000000 7 999999 77 999 99 44444  00000 4444 33 00 00  7 4 5555 00 00  99 33333333333333 1   33  7 7 99 7 44444 7 777 4 4 4 7777777 4 00 4444444  8 999 4 999   00 77 222 5    
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Reference ( gi|39989 )        : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G-G--A-A---TA-T-ATTTG---AT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCT
gi|39988                      : AAAT-CAT-AGA-CT----A--G-G--A-A---TA-T-ATTTT---AC-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CAA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCT
gi|39990                      : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G-G--A-A---TA-T-ATTTT---AT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AAAAT-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-AA-T---G-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTta
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gi|39993                      : AAAT-CAT-GTA-CT----A--A-A--A-A---CA-T-ATCTA---------------------------TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTata
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gi|40008                      :  AAT-CATTGGA-CT----A--C-G--G-ACATTA-T-ATTTT---AT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TAAACGA----T---T-T-T-TT-----C--T--CT----A-C--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A-G--G--G-T----CCGG-G------G-G--C-T-A--T---G--A-----TT-----T----A--G--G--GTCC-G----G--T--CGGTG--------------G-AAA--GC-G-G--G-AGGAACA-T--TC-A-ATC-------A-C--A-------TTAT---TAA---TTT--T--A---G-GCCT
gi|40009                      :  AAT-CAT-AGA-CT----A--C-G--ATA---TT-T-ATTT----AT-C--C--AAGA-A-A-A-G---T---CAA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-C--C----AT-A-----A---------T---A-ATA-A--T---G-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----A----A--------GT-C-G----GGTT--C---G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----G-----A-A-A-A-------A-C--A-------TT-T---T-A----TT--T--A---G-GCCT
gi|40010                      :   AT-CAT-G-A-CT----A--G------A---TA-T-ATTTC---AT-CAGC--A-AA-C-A-G-G---TA--CGA----T---T-TCT-TT-----C--T--TCAGTAA-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T-------A-A--T---G-T-T---T-A-G--G--GAT----C--G-G------ATG--C-T-A--T---A--T-----TT-----G----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--C--------------G-GTA--GC-GCG--A-A-----ACC--TC-A-AGA-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---GCGCCTca
gi|40011                      :   AC-CAT-GGAACTGAATA--G-A--A-A---TACT-ATTTCTT-AT-C--C--T-GA-A-A-AAG---TA--CGA----A---T-T-T-TT-----CA-T--C-----A-A--A-A---T-T--C----A--A-----A---------T---ACG-A-A--T---G-T-TATAT-A-GGAG--G-TATAAC--G-G------G-A--CTT-A--T---AAGA-----TTATG--T----A--T--G--GT-C-G----G--CAACG--G--------------GTTTAGCGC-G-G--A-AC----A-C--TCTACA-C-------A-C--A-------CT-T---T-A---TTT--C--A---G-ta
gi|40012                      :    T-CAT-G-A-CT----A--GTG--A-A---T--T-ATTTT---AT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--TGT----A---T-T-A-TT-----C--T--C-----A-A--ACCA--T-T--C----A--A-----A---------T-----A-A-A--T---G-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G-----CGTCG--------------G-TTAG-GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-ACTTTTT--T--A---G-GCC
gi|40014                      :       AT-GGA-CC----A--G-G--A-A---CA-T-ATTTT---TT-C--T--G-GA-A-A-A-A---AA--AGG----T---T-----------------------------A-AA--T-T--C----AGAA-----A---------T---A-A-A-A--A---AAT-C---T-A-G--G--G-T----C--G-A------G-A--T-T-A--C---A--A-----TT-----C----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-A-G--A-A-----A-C--CC-A-A-C-------A-A--A-------TG-C---T-A---TTT--T--A---C-GCCTct
gi|40013                      :       AT-AGG-CT----A--GAG--A-A---TA-T-AGTAGTAAAC-T--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---TAT-TATTG----CG-T--C-----A-A--A-AA--TGT--CTACAA--A-----G---------T---A-A-A-A--TG--G-T-T---T-A-A--G--G-T----C--A-G------G-G--C-TAA--T---A--AGG---TC-----TTATAA--G--G--GT-A-G----G--T--CG--GACGAAACGCCGGGTA-TGA--GC-G-G--ATA-----A-C--CA-A-G-C-------A-C--A-------TT-C---T-A---TTTTAT--A---G-GCCT
gi|40015                      :        T-GGA-CT----A--C-T--A-A---CA-T-ATTTT---AT-C-----A-AA-A-A-A-A---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-T-G--G--G-T----C--G-G------G-G--T-C-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----A--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-C-A-T-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-ACCT
gi|40016                      :            A-CC----A--G-G--A-A---GA-T-ATTTT---TT-C--C--A-GA-A-A-A-AATTTA---GA----T---TAT-T-TT-----C--C-------------A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-T---TTA-G--G--G-T----C--A-G------G-GATT-T-AATT---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--TG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-T--TC-A-A-C---------T--A-------TTAT---T-A---TTT--T--A---A-GCCTta
gi|40017                      :                                                 -C--C--A-GA-A-A-G-A---TA--T------T---T-T-T-TT-----C--TTTC-----A-A--A-AA--T-A--A----A--A-----A---------A---A-A-G-A--A---G-T-TC--T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--A-T-T--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CA--G----------------TTA--GT-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-A--T-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTt
gi|40018                      :                                                a-C--C--A-GA-A-A-AAG---TA--CGA----A---T-T-T-TT-----T--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------TCAAA-A-A-A--T---G-T-T---T-ATG--GGTG-T----T--G-GA-----G-G--C-T-A--T---A--A-----AT-----T----AG-G--G--GT-CAG----G--T--CG--G--------------T-TTAC-GT-G-C--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A----A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---
gi|40019                      :                                                   --C--A-GA-A-ACA-G---TA---GA----T---T-T-A-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-G-------A--A-----A---------T---A-A-AGA--T---G-T-T---T---G--G--G-T----C--G-G------G----C-T----T---A--A-----TT----------------G--GT-C-G----G--T--CGTCG--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-ACtaggcatt
gi|40022                      :                                                            -A-A-A-G----A--CAA----T---T-T-T-TT-----T--T--G-----G-A--A-AA--T-TA-C----A--A-----AATTTTCCAAT---A-A-A-A--A---G-TGT---T-A-G--G--G-T----T--G-G------G-G--T-G-A--A---A--A-----AA-----T----A--G--G--GT-C-C----G--T--CA--G--------------A-TGA--CA-G-T--A-A-----A-C-------A-C-------A-C--A-------TT-T---T-----TTT--T------G-GCCT
gi|40020                      :                                                                      agA--CTA----T---T-T-T-TT-------------------A--A-AA--T-T----------------A-------------A-A-A-A--T-----T-C---T-A-G--G--G-T----C--G-G------T-G--T-T-A--T---A--A-----TT-----C----A--A--G-----C-T----G--T--CA--G--------------G-TTT--CT-G-G--A-A-----A-C--TCGA-A-C-------A-A--T-------TT-T---T-A----TT--C--A---G-GCTTta
gi|40025                      :                                                                    aaaaaaacaa----T---T-T-T-TC-----C--C--C-----G-ATGA-AA--T-T--C----G--A-----A---------T---A-A-A-A--A---T-T-T---T-A-C--G--G-T----C--G-GGAATTCG-G--C---A--TCCAA--A-----AT-----T----A--G--GTAGT--------G--T--CG--G--------------G-AAA--AC-G-C--A-A-----A-A---C-A-A-C-------A-C--A-------TA-T---T-A---TTT--TC-A---G-GGCT
gi|40026                      :                                                                                         -T-TT-----C--A--C-----ACA--A-AA--T-T--C----A--ATGGCAA---------T---A-C-A-A--T---T-C-T---T-C-C--G--G-T----C--G-C------A-G--C-G-A--T---T--T-----TT-----T----C--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------GATTG--G--G-G--A-A-----A-C---A-A-A-CG------A-T--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCC
gi|40027                      :                                                                                         -T-TT-----C-------------A--A-AT--T-T--C----C--A-----A---------T---A-A-A-AAAT---G-T-T---T-A-G--G--G-T-------A-G------G-G--C-TGA--A---A--A-----AA-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G-----------------TG--AC-A-GATA-A-----A-C--TC---A-C-------A-C--AATAC---TT-T---T-T---TTT--T--T---G-GCC
gi|40028                      :                                                                                                    --T--C-----A-A--A-AA--T-G--A----A--A-----A---------A---A-A-A-A--T-----T-C---T-A-G--G--A-T----C--A-T------G-A--T-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--TG--A--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TG-A-A-C-------A-A--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GTCTcta
gi|40030                      :                                                                                                          -----A-A--A-AA--T-G--G----A--A-----A---------A---A-A-A-A------G-T-T---T-A-G--G--G-T----C--A-G------G-G----T-C--T---A--A-----TC-----T----A--G--G--GA-A-G----G--T--AG--G--------------G-TAA--CC-T-G--A-A----------CC-ATA-C-------A-T--A-------TT-T---T-T---TCT--T--ATTTG-GCCT
gi|40029                      :                                                                                                          -----A-A--A-AA-------C----G--A-----G---------T---A-A-A-A--TAAAG-C-------A-G--G--G-T----C--G-G------C-C--C-G-A--T---A--T-----AT-----T----A--G--A--GT-C-G----G--T--CG--A--------------G-TT---CC-G-G--A-A-----A-CAGTC-A-T-G-------ATT--A-------AT-T---T-A---TTT--T------G-GCCTta
gi|40031                      :                                                                                                                -A--A-AA--T-T--T----GC-A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-C-T---T-C-C--G--G-T----C--G-C------G-C--C-G-A--T---T--T-----TT-----T----G--G--G--GT-C-A----G--T--CG--G--------------GATTA--G--G-G--A-A-----A-C---A-A-A-TG------A-T--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTta
gi|40032                      :                                                                                                                  --A-AA--T-A--C----A--A-----A---------T---A-A-AGA--T---T-T-T---C-A-G-------T----C--G-G------A-A--C-G-A---------A-----TT-----T----ACTG--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-AAA--CC-G-C--A-A-----A-C---A-A-A-C-------A-CA-A-------TT-T---T-A---ATT--T--A---G-GCCTca
gi|40021                      :                                                                                                                  --A-AA--T-A--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--G---A-T-T---T-C-A--G----T----C--G-G------A-A--C-G-A---------A-----TT-----T----ACTG--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-AAA--CC-G-C--A-A-----A-C---A-A-A-C-------A-CA-A-------TT-T---T-A---ATT--T--A---G-GCCT
gi|40033                      :                                                                                                   aaaaaaatatgacctggt-AA--T-T--G----A--T-----A---------T---A-A-A-A------A-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------A-A--G-A-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TAA--TC-G-----------------TT-A-A-C-------A-C--ACCTATTTTT-T---T-A---TTT---------G-GCCTta
gi|40034                      :                                                                                                                       A--T-T--T----A--A-----A---------A---ATA-A-A--T-----T-C---C-A-G--G--G-T----A--G-G------G-T--G-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----C--T--TG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--AC-A-G-C-------A-A--A-------TTGT---T-A---ATT--T--G---A-ACC
gi|40035                      :                                                                                                                        --T-T--T----A--A-----A-------------A-A-A-A--T-----------T-A-A--G--G-T-------G-G------G-G------A--G---A--AATT--TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C-------A-C-------G-CCTA-------TT-TTTAT-A---TTT--T--T---G-GCCT
gi|40036                      :                                                                                                                           -T--C----A--A-----A---------------A-A-A--T---T-T-G---T-A-G--G--G-A----A--G-G------G-A------A--T---A--G-----T-----------A--GTAG--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-A--A-A-----A-C--TT-G-G-C-------A-C----------TT-T---T-A---TTT--A--A---G-GCCTta
gi|40037                      :                                                                                                                                     --A-----A---------T---A-A-A-A--A---C-T-T---T-T-G--G--G-T----C--G-G-------------C-A--G---G--A-----CT-----TCCTAA--G--A--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-CGA--GG-G-G--A-A-----A-C---A-A-A-CT------A-T--A-------TT-T---T-A---ATT--T--T---G-GCCTt
gi|40038                      :                                                                                                                                        -----A---------T---A-A-A-A--A---A-A-T---T-A-G--A--G-T----C--G-GCGA---G-G--A-A-A--A---A--A-----T-----------A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--CC-G-T--A-A-----A-C--AC-G-G-A-------A-C--T-------TT-T---T-T---TTT--T--A---G-GCCT
gi|40024                      :                                                                                                                                              ---------T---A-A-C-A--T---A-C-C---T-A-G--G--G-A----C--G-A------A-G--T-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-GCATGG--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------G-A--A-------TT-A---T-A---TTT--T--G---G-GCC
gi|40039                      :                                                                                                                 aaataaatcttacttttaatatttctgat---------T---A-A-A-A--A---A-T-T---T-A-G--G--G-T----T--G-G------G-A--G-A-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-A-G--A-A-----A-C--AC-A-C-CT------A-T--A-------TT-T---T-----TTT--T------G-GCC
gi|40040                      :                                                                                                                                              ---------T---A-A-A-A--C---A-T-T---T-A-G--G--G-T----C--G-G------G-G--A-A-A--T---T--T-----TT-----T----T--G--G--GT-T-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A---------------A-A-C-------A-C--C-------TT-T---------TTT--T--A-----GCCT
gi|40041                      :                                                                                                                                                        ---A-A-A-A--T-----T-T---T-A-G--G--G-T----T--G-G-------------T-A--A---A--AATTTTTT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CT--G--------------G-TAA--TC-A-G--A-A-----A-C-------A-C-------A-C--A-------TT-T---T-T---TTT--T--T---G-GCCTta
gi|40023                      :                                                                                                                                                        ---A-A-A-A--T-----------T-C-G--G--G-T----C--A-G------G-A--G-G-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--T--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C--AC-A-C-CT------A-T--T-------TT-T---T-A---TTT--T--ta
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Reference ( family-341 )      : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G-G--A-A---TA-T-ATT--T--TAT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCT
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gi|40007                      : AAAG-CAT-GCA-CC----G--T-A--A-A---CA-TTATT--T--TAT-C--A--A-TA-A-A-A-T---TTT-CAG----T---T-T-T-TT-----CCCT--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-C---T-A--G--G--G-T----C------------------------------------------------A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--T--------------G-TGA--GC-G-G--A-A-----A-C--TG-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCC
gi|40008                      :  AAT-CATTGGA-CT----A--C-G--G-ACATTA-T-ATT--T--TAT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TAAACGA----T---T-T-T-TT-----C--T--CT----A-C--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----CCGG-G------G-G--C-T-A--T---G--A-----TT-----T----A--G--G--GTCC-G----G--T--CGGTG--------------G-AAA--GC-G-G--G-AGGAACA-T--TC-A-ATC-------A-C--A-------TTAT---TAA---TTT--T--A---G-GCCT
gi|40009                      :  AAT-CAT-AGA-CT----A--C-G--ATA---TT-T-ATT--T---AT-C--C--AAGA-A-A-A-G---T---CAA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-C--C----AT-A-----A---------T---A-ATA-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----A----A--------GT-C-G----GGTT--C---G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----G-----A-A-A-A-------A-C--A-------TT-T---T-A----TT--T--A---G-GCCT
gi|40010                      :   AT-CAT-G-A-CT----A--G------A---TA-T-ATT--T--CAT-CAGC--A-AA-C-A-G-G---TA--CGA----T---T-TCT-TT-----C--T--TCAGTAA-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T-------A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--GAT----C--G-G------ATG--C-T-A--T---A--T-----TT-----G----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--C--------------G-GTA--GC-GCG--A-A-----ACC--TC-A-AGA-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---GCGCCTca
gi|40011                      :   AC-CAT-GGAACTGAATA--G-A--A-A---TACT-ATT--TCTTAT-C--C--T-GA-A-A-AAG---TA--CGA----A---T-T-T-TT-----CA-T--C-----A-A--A-A---T-T--C----A--A-----A---------T---ACG-A-A--T---G-T-TATAT-A--GGAG--G-TATAAC--G-G------G-A--CTT-A--T---AAGA-----TTATG--T----A--T--G--GT-C-G----G--CAACG--G--------------GTTTAGCGC-G-G--A-AC----A-C--TCTACA-C-------A-C--A-------CT-T---T-A---TTT--C--A---G-ta
gi|40012                      :    T-CAT-G-A-CT----A--GTG--A-A---T--T-ATT--T--TAT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--TGT----A---T-T-A-TT-----C--T--C-----A-A--ACCA--T-T--C----A--A-----A---------T-----A-A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G-----CGTCG--------------G-TTAG-GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-ACTTTTT--T--A---G-GCC
gi|40013                      :       AT-AGG-CT----A--GAG--A-A---TA-T-AGTAGT--AAA-CT-C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---TAT-TATTG----CG-T--C-----A-A--A-AA--TGT--CTACAA--A-----G---------T---A-A-A-A--TG--G-T-T---T-A--A--G--G-T----C--A-G------G-G--C-TAA--T---A--AGG---TC-----TTATAA--G--G--GT-A-G----G--T--CG--GACGAAACGCCGGGTA-TGA--GC-G-G--ATA-----A-C--CA-A-G-C-------A-C--A-------TT-C---T-A---TTTTAT--A---G-GCCTct
gi|40014                      :       AT-GGA-CC----A--G-G--A-A---CA-T-ATT--T--TTT-C--T--G-GA-A-A-A-A---AA--AGG----T---T-----------------------------A-AA--T-T--C----AGAA-----A---------T---A-A-A-A--A---AAT-C---T-A--G--G--G-T----C--G-A------G-A--T-T-A--C---A--A-----TT-----C----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-A-G--A-A-----A-C--CC-A-A-C-------A-A--A-------TG-C---T-A---TTT--T--A---C-GCCT
gi|40015                      :        T-GGA-CT----A--C-T--A-A---CA-T-ATT--T--TAT-C-----A-AA-A-A-A-A---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-T--G--G--G-T----C--G-G------G-G--T-C-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----A--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-C-A-T-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-ACCT
gi|40016                      :            A-CC----A--G-G--A-A---GA-T-ATT--T--TTT-C--C--A-GA-A-A-A-AATTTA---GA----T---TAT-T-TT-----C--C-------------A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-T---TTA--G--G--G-T----C--A-G------G-GATT-T-AATT---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--TG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-T--TC-A-A-C---------T--A-------TTAT---T-A---TTT--T--A---A-GCCTta
gi|40017                      :                                                  -C--C--A-GA-A-A-G-A---TA--T------T---T-T-T-TT-----C--TTTC-----A-A--A-AA--T-A--A----A--A-----A---------A---A-A-G-A--A---G-T-TC--T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--A-T-T--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CA--G----------------TTA--GT-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-A--T-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTt
gi|40018                      :                                                 a-C--C--A-GA-A-A-AAG---TA--CGA----A---T-T-T-TT-----T--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------TCAAA-A-A-A--T---G-T-T---T-AT-G--GGTG-T----T--G-GA-----G-G--C-T-A--T---A--A-----AT-----T----AG-G--G--GT-CAG----G--T--CG--G--------------T-TTAC-GT-G-C--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A----A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---
gi|40019                      :                                                    --C--A-GA-A-ACA-G---TA---GA----T---T-T-A-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-G-------A--A-----A---------T---A-A-AGA--T---G-T-T---T----G--G--G-T----C--G-G------G----C-T----T---A--A-----TT----------------G--GT-C-G----G--T--CGTCG--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-ACtaggcatt
gi|40020                      :                                                                         A--CTA----T---T-T-T-TT-------------------A--A-AA--T-T----------------A-------------A-A-A-A--T-----T-C---T-A--G--G--G-T----C--G-G------T-G--T-T-A--T---A--A-----TT-----C----A--A--G-----C-T----G--T--CA--G--------------G-TTT--CT-G-G--A-A-----A-C--TCGA-A-C-------A-A--T-------TT-T---T-A----TT--C--A---G-GCTT
gi|40021                      :                                                                                                         aaaaaaacaa--A-AA--T-A--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--G---A-T-T---T-C--A--G----T----C--G-G------A-A--C-G-A---------A-----TT-----T----ACTG--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-AAA--CC-G-C--A-A-----A-C---A-A-A-C-------A-CA-A-------TT-T---T-A---ATT--T--A---G-GCCT
gi|40022                      :                                           aaaaaaatatgacctggt-A-A-A-G----A--CAA----T---T-T-T-TT-----T--T--G-----G-A--A-AA--T-TA-C----A--A-----AATTTTCCAAT---A-A-A-A--A---G-TGT---T-A--G--G--G-T----T--G-G------G-G--T-G-A--A---A--A-----AA-----T----A--G--G--GT-C-C----G--T--CA--G--------------A-TGA--CA-G-T--A-A-----A-C-------A-C-------A-C--A-------TT-T---T-----TTT--T------G-GCCTta
gi|40023                      :                                                                                                                                                       ag---A-A-A-A--T-----------T-C--G--G--G-T----C--A-G------G-A--G-G-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--T--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C--AC-A-C-CT------A-T--T-------TT-T---T-A---TTT--T--ta
gi|40024                      :                                                                                                                                  aaaattgatttta---------T---A-A-C-A--T---A-C-C---T-A--G--G--G-A----C--G-A------A-G--T-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-GCATGG--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------G-A--A-------TT-A---T-A---TTT--T--G---G-GCCttttggcctta
gi|40025                      :                                                  aaataaatcttacttttaatatttctgat----T---T-T-T-TC-----C--C--C-----G-ATGA-AA--T-T--C----G--A-----A---------T---A-A-A-A--A---T-T-T---T-A--C--G--G-T----C--G-GGAATTCG-G--C---A--TCCAA--A-----AT-----T----A--G--GTAGT--------G--T--CG--G--------------G-AAA--AC-G-C--A-A-----A-A---C-A-A-C-------A-C--A-------TA-T---T-A---TTT--TC-A---G-GGCT
gi|40026                      :                                                                                          -T-TT-----C--A--C-----ACA--A-AA--T-T--C----A--ATGGCAA---------T---A-C-A-A--T---T-C-T---T-C--C--G--G-T----C--G-C------A-G--C-G-A--T---T--T-----TT-----T----C--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------GATTG--G--G-G--A-A-----A-C---A-A-A-CG------A-T--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCC
gi|40027                      :                                                                                          -T-TT-----C-------------A--A-AT--T-T--C----C--A-----A---------T---A-A-A-AAAT---G-T-T---T-A--G--G--G-T-------A-G------G-G--C-TGA--A---A--A-----AA-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G-----------------TG--AC-A-GATA-A-----A-C--TC---A-C-------A-C--AATAC---TT-T---T-T---TTT--T--T---G-GCC
gi|40028                      :                                                                                                     --T--C-----A-A--A-AA--T-G--A----A--A-----A---------A---A-A-A-A--T-----T-C---T-A--G--G--A-T----C--A-T------G-A--T-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--TG--A--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TG-A-A-C-------A-A--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GTCTcta
gi|40029                      :                                                                                                           -----A-A--A-AA-------C----G--A-----G---------T---A-A-A-A--TAAAG-C-------A--G--G--G-T----C--G-G------C-C--C-G-A--T---A--T-----AT-----T----A--G--A--GT-C-G----G--T--CG--A--------------G-TT---CC-G-G--A-A-----A-CAGTC-A-T-G-------ATT--A-------AT-T---T-A---TTT--T------G-GCCT
gi|40030                      :                                                                                                           -----A-A--A-AA--T-G--G----A--A-----A---------A---A-A-A-A------G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--A-G------G-G----T-C--T---A--A-----TC-----T----A--G--G--GA-A-G----G--T--AG--G--------------G-TAA--CC-T-G--A-A----------CC-ATA-C-------A-T--A-------TT-T---T-T---TCT--T--ATTTG-GCCTta
gi|40031                      :                                                                                                                 -A--A-AA--T-T--T----GC-A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-C-T---T-C--C--G--G-T----C--G-C------G-C--C-G-A--T---T--T-----TT-----T----G--G--G--GT-C-A----G--T--CG--G--------------GATTA--G--G-G--A-A-----A-C---A-A-A-TG------A-T--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTta
gi|40032                      :                                                                                                                   --A-AA--T-A--C----A--A-----A---------T---A-A-AGA--T---T-T-T---C-A--G-------T----C--G-G------A-A--C-G-A---------A-----TT-----T----ACTG--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-AAA--CC-G-C--A-A-----A-C---A-A-A-C-------A-CA-A-------TT-T---T-A---ATT--T--A---G-GCCTca
gi|40033                      :                                                                                                                      -AA--T-T--G----A--T-----A---------T---A-A-A-A------A-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------A-A--G-A-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TAA--TC-G-----------------TT-A-A-C-------A-C--ACCTATTTTT-T---T-A---TTT---------G-GCCT
gi|40034                      :                                                                                                                        A--T-T--T----A--A-----A---------A---ATA-A-A--T-----T-C---C-A--G--G--G-T----A--G-G------G-T--G-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----C--T--TG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--AC-A-G-C-------A-A--A-------TTGT---T-A---ATT--T--G---A-ACC
gi|40035                      :                                                                                                                         --T-T--T----A--A-----A-------------A-A-A-A--T-----------T-A--A--G--G-T-------G-G------G-G------A--G---A--AATT--TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C-------A-C-------G-CCTA-------TT-TTTAT-A---TTT--T--T---G-GCCT
gi|40036                      :                                                                                                                            -T--C----A--A-----A---------------A-A-A--T---T-T-G---T-A--G--G--G-A----A--G-G------G-A------A--T---A--G-----T-----------A--GTAG--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-A--A-A-----A-C--TT-G-G-C-------A-C----------TT-T---T-A---TTT--A--A---G-GCCTta
gi|40037                      :                                                                                                                                      --A-----A---------T---A-A-A-A--A---C-T-T---T-T--G--G--G-T----C--G-G-------------C-A--G---G--A-----CT-----TCCTAA--G--A--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-CGA--GG-G-G--A-A-----A-C---A-A-A-CT------A-T--A-------TT-T---T-A---ATT--T--T---G-GCCTt
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Reference ( family-341 )      : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G-G--A-A---TA-T-ATT--T--TAT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCT
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gi|40000                      : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G----A-A---TA-T-ATT--T--TTTTC--C--A-GA-A-A-A-A---TAG-CGA----T---T-T-T-TG-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G---T---T-A--G--G--G-T----C--GTG------G-G--C-T-AG-T---A--A-----TT-----T----A-----G--GT-CGG----G--T--CG--G--------------G-TAT--GC---G--A-A-----A-C--TC-C-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GTCT
gi|40001                      : AAAT-CAT-G-A-CT----A--G-A--A-A----A-T-ATT--T--TTT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---T-T-T-TTTTTCTC--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A---------------T---A-A-A-A--T---G---T---T-AGTG--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A------T-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-CT-TC-A-A-C-------A-C-----------T-T---T-AT--TTT--T--A---G-GCCTt
gi|40002                      : AAAT-TAT-GGA-CT----A--G-G--A-A-----------------------C--A-CA-A-A-------TA--CTA----T---T-T-T-TTT----C--T--A-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-T---T-T--G--G--G-T----C--A-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-A----A--T--CA--G--------------G-ATA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTA--T--A---G-GCCT
gi|40003                      : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G-G--A-A---TA-T-AAT--A--TAT-C--C--A-GA-ACA-A-G---TAT-CGAT---T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--TGTTAC----A--A-----A---------T---A-A-A-A--TG--G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--A-G------G-G--C-T-A--T---AATA-----TC-----T----AG-G--G--GT-A-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A----TC-A-A-C-------ACC--A-------TT-C---T-A---TTT--T--A---GCGCCTta
gi|40004                      : AAAT-CAT-GGA-CT----A--G-G--A-A---CA-T-ATT--T--CAT-C--C--A-GA-A-A-A-AAA-TA--CGC----T---T-T-C-GT-----C--T--C-----A-A----------T--C------------------------------------------T-T---T-A--G--G--G-T----T--G-G------G-G--C-A-A--T---A--A-----TT-----TT---A--A--G--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-G-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTG--T--A---G-GCCT
gi|40005                      : AAAT-CAT-GGA-CT----AATG-G--A-A---TA-T-GTT--C--TA--C--CGAA-GAGA-A-A-G---TA--CGA----TATTT-T-T-TT-----C--T--C-----A-G--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-AC-T---G---T---T-A--C--G--G-T----C--G-G------G-G--C---A--TC--A--AC----TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--GGCT-----------G-TTA--GCGG-G--A-A-----A-C--TC---A-C-------A-CA-A-------TTAT---T-A---TTT--TTAG---G-GCCTta
gi|40006                      : AACT-CGT-GGA--T----A--G-G--A-A---CA-T-ATT--T--TAT-CG-C--A-AA-A-A-A-AAT-TA--TGC----A---T-T-C-AT-----C--T--C-----ACA--A-AA--T-T--C----A--G-----A---------T---AGA-A-A--T---C-T-T---T-A--G--G--G-T----C----G------G-G--C-C-A--T---A--A-----TT-----TA---A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TT-C-A-C-------A-C--A-------TT-T---
gi|40007                      : AAAG-CAT-GCA-CC----G--T-A--A-A---CA-TTATT--T--TAT-C--A--A-TA-A-A-A-T---TTT-CAG----T---T-T-T-TT-----CCCT--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-C---T-A--G--G--G-T----C------------------------------------------------A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--T--------------G-TGA--GC-G-G--A-A-----A-C--TG-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCC
gi|40008                      :  AAT-CATTGGA-CT----A--C-G--G-ACATTA-T-ATT--T--TAT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TAAACGA----T---T-T-T-TT-----C--T--CT----A-C--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----CCGG-G------G-G--C-T-A--T---G--A-----TT-----T----A--G--G--GTCC-G----G--T--CGGTG--------------G-AAA--GC-G-G--G-AGGAACA-T--TC-A-ATC-------A-C--A-------TTAT---TAA---TTT--T--A---G-GCCT
gi|40009                      :  AAT-CAT-AGA-CT----A--C-G--ATA---TT-T-ATT--T---AT-C--C--AAGA-A-A-A-G---T---CAA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-C--C----AT-A-----A---------T---A-ATA-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----A----A--------GT-C-G----GGTT--C---G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----G-----A-A-A-A-------A-C--A-------TT-T---T-A----TT--T--A---G-GCCT
gi|40010                      :   AT-CAT-G-A-CT----A--G------A---TA-T-ATT--T--CAT-CAGC--A-AA-C-A-G-G---TA--CGA----T---T-TCT-TT-----C--T--TCAGTAA-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T-------A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--GAT----C--G-G------ATG--C-T-A--T---A--T-----TT-----G----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--C--------------G-GTA--GC-GCG--A-A-----ACC--TC-A-AGA-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---GCGCCTca
gi|40011                      :   AC-CAT-GGAACTGAATA--G-A--A-A---TACT-ATT--TCTTAT-C--C--T-GA-A-A-AAG---TA--CGA----A---T-T-T-TT-----CA-T--C-----A-A--A-A---T-T--C----A--A-----A---------T---ACG-A-A--T---G-T-TATAT-A--GGAG--G-TATAAC--G-G------G-A--CTT-A--T---AAGA-----TTATG--T----A--T--G--GT-C-G----G--CAACG--G--------------GTTTAGCGC-G-G--A-AC----A-C--TCTACA-C-------A-C--A-------CT-T---T-A---TTT--C--A---G-ta
gi|40012                      :    T-CAT-G-A-CT----A--GTG--A-A---T--T-ATT--T--TAT-C--C--A-GA-A-A-A-G---TA--TGT----A---T-T-A-TT-----C--T--C-----A-A--ACCA--T-T--C----A--A-----A---------T-----A-A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G-----CGTCG--------------G-TTAG-GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-ACTTTTT--T--A---G-GCC
gi|40013                      :       AT-AGG-CT----A--GAG--A-A---TA-T-AGTAGT--AAA-CT-C--A-GA-A-A-A-G---TA--CGA----T---TAT-TATTG----CG-T--C-----A-A--A-AA--TGT--CTACAA--A-----G---------T---A-A-A-A--TG--G-T-T---T-A--A--G--G-T----C--A-G------G-G--C-TAA--T---A--AGG---TC-----TTATAA--G--G--GT-A-G----G--T--CG--GACGAAACGCCGGGTA-TGA--GC-G-G--ATA-----A-C--CA-A-G-C-------A-C--A-------TT-C---T-A---TTTTAT--A---G-GCCTct
gi|40014                      :       AT-GGA-CC----A--G-G--A-A---CA-T-ATT--T--TTT-C--T--G-GA-A-A-A-A---AA--AGG----T---T-----------------------------A-AA--T-T--C----AGAA-----A---------T---A-A-A-A--A---AAT-C---T-A--G--G--G-T----C--G-A------G-A--T-T-A--C---A--A-----TT-----C----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-A-G--A-A-----A-C--CC-A-A-C-------A-A--A-------TG-C---T-A---TTT--T--A---C-GCCT
gi|40015                      :        T-GGA-CT----A--C-T--A-A---CA-T-ATT--T--TAT-C-----A-AA-A-A-A-A---TA--CGA----T---T-T-T-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---G-T-T---T-T--G--G--G-T----C--G-G------G-G--T-C-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----A--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-C-A-T-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-ACCT
gi|40016                      :            A-CC----A--G-G--A-A---GA-T-ATT--T--TTT-C--C--A-GA-A-A-A-AATTTA---GA----T---TAT-T-TT-----C--C-------------A-AA--T-T--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-T-T---TTA--G--G--G-T----C--A-G------G-GATT-T-AATT---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--TG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-T--TC-A-A-C---------T--A-------TTAT---T-A---TTT--T--A---A-GCCTta
gi|40017                      :                                                  -C--C--A-GA-A-A-G-A---TA--T------T---T-T-T-TT-----C--TTTC-----A-A--A-AA--T-A--A----A--A-----A---------A---A-A-G-A--A---G-T-TC--T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--A-T-T--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CA--G----------------TTA--GT-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-A--T-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTt
gi|40018                      :                                                 a-C--C--A-GA-A-A-AAG---TA--CGA----A---T-T-T-TT-----T--T--C-----A-A--A-AA--T-T--C----A--A-----A---------TCAAA-A-A-A--T---G-T-T---T-AT-G--GGTG-T----T--G-GA-----G-G--C-T-A--T---A--A-----AT-----T----AG-G--G--GT-CAG----G--T--CG--G--------------T-TTAC-GT-G-C--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A----A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---
gi|40019                      :                                                    --C--A-GA-A-ACA-G---TA---GA----T---T-T-A-TT-----C--T--C-----A-A--A-AA--T-G-------A--A-----A---------T---A-A-AGA--T---G-T-T---T----G--G--G-T----C--G-G------G----C-T----T---A--A-----TT----------------G--GT-C-G----G--T--CGTCG--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-ACtaggcatt
gi|40020                      :                                                                         A--CTA----T---T-T-T-TT-------------------A--A-AA--T-T----------------A-------------A-A-A-A--T-----T-C---T-A--G--G--G-T----C--G-G------T-G--T-T-A--T---A--A-----TT-----C----A--A--G-----C-T----G--T--CA--G--------------G-TTT--CT-G-G--A-A-----A-C--TCGA-A-C-------A-A--T-------TT-T---T-A----TT--C--A---G-GCTT
gi|40021                      :                                                                                                         aaaaaaacaa--A-AA--T-A--C----A--A-----A---------T---A-A-A-A--G---A-T-T---T-C--A--G----T----C--G-G------A-A--C-G-A---------A-----TT-----T----ACTG--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-AAA--CC-G-C--A-A-----A-C---A-A-A-C-------A-CA-A-------TT-T---T-A---ATT--T--A---G-GCCT
gi|40022                      :                                           aaaaaaatatgacctggt-A-A-A-G----A--CAA----T---T-T-T-TT-----T--T--G-----G-A--A-AA--T-TA-C----A--A-----AATTTTCCAAT---A-A-A-A--A---G-TGT---T-A--G--G--G-T----T--G-G------G-G--T-G-A--A---A--A-----AA-----T----A--G--G--GT-C-C----G--T--CA--G--------------A-TGA--CA-G-T--A-A-----A-C-------A-C-------A-C--A-------TT-T---T-----TTT--T------G-GCCTta
gi|40023                      :                                                                                                                                                       ag---A-A-A-A--T-----------T-C--G--G--G-T----C--A-G------G-A--G-G-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--T--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C--AC-A-C-CT------A-T--T-------TT-T---T-A---TTT--T--ta
gi|40024                      :                                                                                                                                  aaaattgatttta---------T---A-A-C-A--T---A-C-C---T-A--G--G--G-A----C--G-A------A-G--T-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-GCATGG--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------G-A--A-------TT-A---T-A---TTT--T--G---G-GCCttttggcctta
gi|40025                      :                                                  aaataaatcttacttttaatatttctgat----T---T-T-T-TC-----C--C--C-----G-ATGA-AA--T-T--C----G--A-----A---------T---A-A-A-A--A---T-T-T---T-A--C--G--G-T----C--G-GGAATTCG-G--C---A--TCCAA--A-----AT-----T----A--G--GTAGT--------G--T--CG--G--------------G-AAA--AC-G-C--A-A-----A-A---C-A-A-C-------A-C--A-------TA-T---T-A---TTT--TC-A---G-GGCT
gi|40026                      :                                                                                          -T-TT-----C--A--C-----ACA--A-AA--T-T--C----A--ATGGCAA---------T---A-C-A-A--T---T-C-T---T-C--C--G--G-T----C--G-C------A-G--C-G-A--T---T--T-----TT-----T----C--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------GATTG--G--G-G--A-A-----A-C---A-A-A-CG------A-T--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCC
gi|40027                      :                                                                                          -T-TT-----C-------------A--A-AT--T-T--C----C--A-----A---------T---A-A-A-AAAT---G-T-T---T-A--G--G--G-T-------A-G------G-G--C-TGA--A---A--A-----AA-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G-----------------TG--AC-A-GATA-A-----A-C--TC---A-C-------A-C--AATAC---TT-T---T-T---TTT--T--T---G-GCC
gi|40028                      :                                                                                                     --T--C-----A-A--A-AA--T-G--A----A--A-----A---------A---A-A-A-A--T-----T-C---T-A--G--G--A-T----C--A-T------G-A--T-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--TG--A--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TG-A-A-C-------A-A--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GTCTcta
gi|40029                      :                                                                                                           -----A-A--A-AA-------C----G--A-----G---------T---A-A-A-A--TAAAG-C-------A--G--G--G-T----C--G-G------C-C--C-G-A--T---A--T-----AT-----T----A--G--A--GT-C-G----G--T--CG--A--------------G-TT---CC-G-G--A-A-----A-CAGTC-A-T-G-------ATT--A-------AT-T---T-A---TTT--T------G-GCCT
gi|40030                      :                                                                                                           -----A-A--A-AA--T-G--G----A--A-----A---------A---A-A-A-A------G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--A-G------G-G----T-C--T---A--A-----TC-----T----A--G--G--GA-A-G----G--T--AG--G--------------G-TAA--CC-T-G--A-A----------CC-ATA-C-------A-T--A-------TT-T---T-T---TCT--T--ATTTG-GCCTta
gi|40031                      :                                                                                                                 -A--A-AA--T-T--T----GC-A-----A---------T---A-A-A-A--T---T-C-T---T-C--C--G--G-T----C--G-C------G-C--C-G-A--T---T--T-----TT-----T----G--G--G--GT-C-A----G--T--CG--G--------------GATTA--G--G-G--A-A-----A-C---A-A-A-TG------A-T--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTta
gi|40032                      :                                                                                                                   --A-AA--T-A--C----A--A-----A---------T---A-A-AGA--T---T-T-T---C-A--G-------T----C--G-G------A-A--C-G-A---------A-----TT-----T----ACTG--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-AAA--CC-G-C--A-A-----A-C---A-A-A-C-------A-CA-A-------TT-T---T-A---ATT--T--A---G-GCCTca
gi|40033                      :                                                                                                                      -AA--T-T--G----A--T-----A---------T---A-A-A-A------A-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------A-A--G-A-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TAA--TC-G-----------------TT-A-A-C-------A-C--ACCTATTTTT-T---T-A---TTT---------G-GCCT
gi|40034                      :                                                                                                                        A--T-T--T----A--A-----A---------A---ATA-A-A--T-----T-C---C-A--G--G--G-T----A--G-G------G-T--G-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----C--T--TG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--AC-A-G-C-------A-A--A-------TTGT---T-A---ATT--T--G---A-ACC
gi|40035                      :                                                                                                                         --T-T--T----A--A-----A-------------A-A-A-A--T-----------T-A--A--G--G-T-------G-G------G-G------A--G---A--AATT--TT-----T----A--G--G--GT-C-A----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C-------A-C-------G-CCTA-------TT-TTTAT-A---TTT--T--T---G-GCCT
gi|40036                      :                                                                                                                            -T--C----A--A-----A---------------A-A-A--T---T-T-G---T-A--G--G--G-A----A--G-G------G-A------A--T---A--G-----T-----------A--GTAG--GT-C-G----G--T--CA--G--------------G-TTA--GC-G-A--A-A-----A-C--TT-G-G-C-------A-C----------TT-T---T-A---TTT--A--A---G-GCCTta
gi|40037                      :                                                                                                                                      --A-----A---------T---A-A-A-A--A---C-T-T---T-T--G--G--G-T----C--G-G-------------C-A--G---G--A-----CT-----TCCTAA--G--A--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-CGA--GG-G-G--A-A-----A-C---A-A-A-CT------A-T--A-------TT-T---T-A---ATT--T--T---G-GCCTt
gi|40038                      :                                                                                                                                         -----A---------T---A-A-A-A--A---A-A-T---T-A--G--A--G-T----C--G-GCGA---G-G--A-A-A--A---A--A-----T-----------A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TTA--CC-G-T--A-A-----A-C--AC-G-G-A-------A-C--T-------TT-T---T-T---TTT--T--A---G-GCCT
gi|40039                      :                                                                                                                                               ---------T---A-A-A-A--A---A-T-T---T-A--G--G--G-T----T--G-G------G-A--G-A-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-A-G--A-A-----A-C--AC-A-C-CT------A-T--A-------TT-T---T-----TTT--T------G-GCC
gi|40040                      :                                                                                                                                               ---------T---A-A-A-A--C---A-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-G--A-A-A--T---T--T-----TT-----T----T--G--G--GT-T-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A---------------A-A-C-------A-C--C-------TT-T---------TTT--T--A-----GCCT
gi|40041                      :                                                                                                                                                         ---A-A-A-A--T-----T-T---T-A--G--G--G-T----T--G-G-------------T-A--A---A--AATTTTTT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CT--G--------------G-TAA--TC-A-G--A-A-----A-C-------A-C-------A-C--A-------TT-T---T-T---TTT--T--T---G-GCCTta
gi|40042                      :                                                                                                                                                               -A-A--T---G-T-T---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-A--C-T-A--T---A--A-----TT-----T----A--G--G--GT-T-G----G--T--CG--A--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-T-A-CACATTTTA-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCTta
gi|40043                      :                                                                                                                                                                              ---T-A--G--G--G-T----C--G-G------G-A--G-A-A--A---A--T-----TT-----T----A--G--G--GT-C-G----G--T--CG--G--------------G-TAA--TC-G-G--A-A-----A-C-------A-C-------A-CCTA-------TT-T---T-----TTT--T--G---G-ta
gi|40044                      :                                                                                                                                                                                                    --G-G------G-G--T-T-T--T---A--T-----TT-----T----A--C--A--GT-C-A----G--T--CG--G--------------G-TTA--GT-G-G--A-A-----A-C--TA-A-A-C-------A----A-------TT-TC--T-A---TTT--T--A---G-
gi|40045                      :                                                                                                                                                                                                                         --T---A--A-----TT-----T----A--G--A--AT-C-T----G--T--CG--G--------------G-TTA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A--------------ATTTTT--TT-T---T-A---TTT--T--A---G-GCCT
gi|40046                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TA--GC-G-G--A-A-----A-C--TC-A-A-C-------A-C--A-------TT-T---T-A---TTT--T--A---A-GC


blockSeqs                     :     T   T   A  GAAT AT T CG T CATT C T   AG CT   T AG GA A  G C C AATT   AA   AAAA ATT A C A  TTTCT CC TT CAGTA C TG    AA G TA TACA GA TGGCA ATTTTCCAA CAA G   G AA AAAG    ATA   GT         ATAA      GAATTC   ATTT   AT CCA AT ATTTT  ATATA TATA CT          G CATG        GT ACGAAACGCCGGGT T   GC      AA   GGAAC   AGT T C T ACATTTT C CT CCTATTT  A TTA A CTT      TA TTT C
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  A .  . T    . .   .  .    . G  .  .  . . . AAA    G    T    .   A . .  T     A  .  T     C .     .  G A  .    T  .     A         .   C   G A  GG      C     T          A         CGA      CTT    G  C   AG ATT    ATG   CCTA CT          A .           TC GCT            A   G       AT   C       TT  G T G T       T CT TTTTT    A C   A T        C  .   C
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . T  .  .  . . . AAT    T    A    .   . . .  G     G  .  .     . .     .  . .  .    C  .     .         .   T   . C  GG      .     .          .         A        CTA    .  .   .  GG     .     T    G           . .           TC CT             A   C       .    .       T   . . . G       . A  ATAC     A .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . AA     T    T    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  AA      .     .          .         .        CTG    .  .   .  T      .     A    G           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . G       . A  .        G .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . AG     .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  C      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       C   . . . T       . A  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . AG     .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . T       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  C       .     .          .         .        CA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  C       .     .          .         .        CA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . T      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  C       .     .          .         .        CC     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . T    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :     .   .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :         .   .  .    .  . .  . C    . .   .  .    . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        TT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       C   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :         .   .  .    .  . .  . G    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        TC     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       C   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :         .   .  .    .  . .  . .    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        AT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :             .  .    .  . .  . .    . .   .  .    . .  .  .  . . . A      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                  . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                  . .  .  .  . . . G      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        TT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                    .  .  .  . . . .      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                             . . . .      .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  A       .     .          .         .        TG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                          .    .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        GG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       A   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                               .    .   . . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  A       .     .          .         .        TT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                          . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                          . .  .     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        TT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                     .  .  .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       C   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                           .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        CG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                           .     . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        CG     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       A   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                 . .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        GA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                   .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  A       .     .          .         .        GT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       A   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                   .     .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  T       .     .          .         .        AA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       A   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  C       .     .          .         .        GA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  A       .     .          .         .        AA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  . .  .    .  .     .         .   .   . .  A       .     .          .         .        CT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                            . .  .    .  .     .         .   .   . .  A       .     .          .         .        GA     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       T   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .  .     .         .   .   . .  G       .     .          .         .        TT     .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                         .     .         .   .   . .  .       .     .          .         .        C      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .         .   .   . .  .       .     .          .         .        C      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .         .   .   . .  .       .     .          .         .        T      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .         .   .   . .  .       .     .          .         .        C      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .   .   . .  .       .     .          .         .        T      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .   .   . .  .       .     .          .         .        .      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 . .  .       .     .          .         .        .      .  .   .  .      .     .    .           . .           .  .              .   .       .    .       .   . . . .       . .  .        . .   . .        .  .   .
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