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lowQualScore                  :       . . .. .. . . ..  .... . . .   .  ...  .  ...   .... ...  .  .. .. .... .......... ..   ........   . .. . ...... . . ...... ... .. ........................ .. .   .   .. ... ..  ... ..  .... .   .... ..  ... . ..   .     
lowQualScore                  :       8 8 66 00 7 7 11  5555 4 7 7   7  999  7  222   2222 888  7  99 99 7777 2222222222 66   11111111   1 00 7 222222 7 7 000000 333 00 444444444444444444444444 00 7   7   00 888 55  333 00  3333 5   7777 22  444 7 00   9     
consensus                     : ACAAGA-T-A--AN-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---A-A-----A-----T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AACAT
Reference ( gi|36787 )        : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-AAA---ATG--ACC-AACAT
gi|36794                      : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CT---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------A---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-CCATTT---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAG---TCG--ACC-AACAT
gi|36793                      : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-ATA-GC---AT-C---------------GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-A------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ATC-AACAT
gi|36789                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA---------TT-A--A-A------C-A-T------T---T--T---A-A-----A-----TAGATTCT--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ATG--ACC-AACAT
gi|36788                      : ACAATA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----CTT-C--A-A------T-G-T------T---C--T---T-A-----AG----T------T--A-TTT-CAA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ATG--ACT-AACAT
gi|36791                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----TAAAATAA---A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C---------------------------C--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AAAAT
gi|36792                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----T---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--G-----GTT-G--A-A------T-A-T------T------------------------T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-CAC----A-GAA---ACG--ACC-AACAT
gi|36795                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--A--C----T----------A--AAA---------TT-A--A-A------T---T------T---T--T---A-A-----A-----TAGATTCT--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ATT--ATC-AACAT
gi|36790                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--T----T----------A--AAA---------TT-A--A-A------C-A-T------T---T--T---A-A-----A-----TAGATTCT--A-TTT-CTA--A---A--GA---A--AA----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AACAT
gi|36796                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GT---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--A-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C---------------------------T--A-TTT-CC---A---A--GA---C--AC----A-AAC----A-GAA---ATG--ACC-AACAT
gi|36797                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--------TTA-A--A-A------T---T------T---T--T---A-A-----AGAGATT------C--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--ACATGTA-TAC----A-GAA---AGG--ACC-AACAT
gi|36807                      : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----T---GG-CC--A--C----T----------A--AGT--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---A-A-----G-----C------T--A-TTT-CCA--A---AC-GACC-A--AC----A-TA
gi|36798                      : ACAATA-T-A--AT-T-T-T--AA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-GTAGACCT-A-T------T---C--T---T-A-----A-----TCTAAGCT--A-TTT-CC---A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GCA---ACG--ACT-AACAT
gi|36805                      : ACAGGA-T-A--AG-T-G-C--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--A--C----TA---------A--AAA--T-----TTG-A--A-A------T-A-A------T---C--A---A-A-----A-----C------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AG----A-TAC----A-GAA---ACG--
gi|36804                      : ACGAGA-T-A--AT-T-T-C--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-GC--G--C----TA---------A--AAA--T-----TTTAA--A-A------T-A-T------T---CTAT---A-A-----G-----T------T--A-CTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----
gi|36800                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CAAATAAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA----------T-A--A-A------C-A-T------T---T--T---A-A-----A-----TAGATTCT--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC------T-C----A-GAA---ACG--ACC-AA
gi|36799                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AC-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--ATT--T-----TTT-A--A-G------T-A-TTCTTAAT---C--T---A-A-----A-----T------T--A-TTT-AC---A---T--GA---A--GC----A-TAC----A-GAA---TCG--ACT-AACA
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gi|36813                      : ACATGA-T-A--AA-G-C-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--C--C----T----------G--AAA--T-----TTT-A--A-T------A-A-T------T---C--T---A-C-----G-----C------T--A-TTT-TCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC------ATA---ACG--ACC-AA
gi|36806                      : ACAAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-AC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----T---A--A-A------A-A-T------T---T--T---A-A-----A-----TAGATTCT--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AG-----------------------G--ACC-AACAT
gi|36814                      : ACAAGA-T-A--GG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CT---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A--------G---C--T---A-C-----A------------T--A-TTT-CTA--A---A--AA---A--A
gi|36803                      : ACAAGA-TGA--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----CG--GG-CCGAG--C----T-------------AAA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C---------------------------T--A-TTT-CCA--A---AG-GA---A--AA----A-GAC----A-GAA---ACG--ACC-AAaaatattcagaa
gi|36815                      : ACAAGG-T-A--AT-T-T-T--AA----T-G-C-AAA-GC---AT-C----AAT----C---GG-CC--T--C----T----------A--AAA--------TTT-G--A-A------C-A-T------T---C---------------------------T--A-TTT-CC-------A--GA---A--AC----A-TAC----A---------G--ACC-AACAT
gi|36808                      : ACAAGA-C-A--AA-T-T-TT-GA----T-G-C-AAA----------------T----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTTGA--A-A------T-T-T------T---C--T---------------------------A-TTT-CCA--A---A--GA---A--GC----A-TAC----A-GGA---ACG--ACC-AACAT
gi|36802                      : ACAAGA-A-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---GT-CA---AAT----C---GA-CC--G--C---------------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------C---A--T---A-A-----G-----CAAGA--T--A-GTT-CGA--A---A--GA---A--ACGTGTA-TAT----A-GAA---ACG--ACC-AAC
gi|36821                      : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--
gi|36809                      : ACAAGA-C-A--AT-T-T-T--GA----T-T-T-G-----------CA---AAT----C---GG-CC--G--CGC--T----------A--AAA--T-----TTT-G--A-A------T---T------T---C--T---------------------------A-TTT-CCA--A---A--GA---A--GC----A-TAC------AGA---ACG--ACC-AACATgaaacacagaaacgaccaacat
gi|36823                      : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GACTCTT-G-C-AAA-GC---GT-AA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TCT-A--A-A------T-G-T------
gi|36818                      : ACAAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AGT----C---GG-CC--G--C----T--------------AA--T-----TT--------------T-A-T------T------------------------------------TTT------------------A--AT----A-TAT----A-GAA---ACG--ACC-AAGATatacagaatcgaccaacat
gi|36816                      : ACAAGA---A--AA-T-T-T--------T-G-C-AA----------CA---AAT----C---GG-CC--G--C----A----------A--AAA--T-----TT--A--A-T------T-A-T------T---A--T---A-A-----A-----CATGA--T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACA--ATC-AAC
gi|36810                      : ACAAGA-C-A--AT-T-T-TT-GA----TTG-C-AAA----------------T----C---GG-CC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTT-G--A-A------T---T------T---C--T---------------------------A-TTT-CCA--A---A--GA---A--GC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC--ACAT
gi|36811                      : ACAAGA-C-A--AA-T-T-T--------T-G-----A-GT---GG-CA---AAT----C---GG-CC--GGGC----T----------A--AAA--T-----TTTGA--A-A------T---T------T---C--T---------------------------A-TTT-CCA--A---A--GA---A--GC----A-TAC----AGGAA---ACG--ACC--ACAT
gi|36801                      : ACAA-A-T-A--ATCT-T-T--GA----T-G-C-AA--GC---AT-CA---GATACATC---GG-CC--G--C----T----------A--CAA--A-----TCT-A--A-A------C-A-T------T---T--T---A-A-----A-----TAGATTCT--AATTTGCCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---CCG--ACC-AAGAT
gi|36822                      : ACCAGA-T-A--AT-TAT-T--GA----T-G-C-AAA-GCG--AT-CA---AAT----T---GG-CC--G--CTAAAT----------A--AAA--TAAAAATTA-A--A-A------T-A-T------T---T--------------------C------T--C-TTT-CCA--A---A--AA---A--AT----A-TA-----A-GAA---ACGACACC-AACAT
gi|36817                      : ACAAGA-T-A--AG-C-T-TTCGA----T-G-C-AAA-GC----T-CA---AGT----C---CG-CC--G--C----T--------------AA--T-----TT--------------T-A-T------T---T--T---T-A---------------------A-TTT-CAA--AC--A--GA---AATAT----A-TAT----A-GAA---ACG--ACC-AA
gi|36820                      : ACAAGA-A-A--CT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG--C--G--C---------------A--AA---------TTT-A--A-A-------------------------------------------------T--A-TTT-TCA--A---A--G----A--AC----A-TAC----A-GAATCGACA--ACC-AACGT
gi|36824                      : ACAATA-C-A--AG-T-T-T--GA----T-G-T-AAA-GC---AT-AA---AAT----C---GG-CT--G--C----A----------A--AAA--T-----TT
gi|36819                      : ACAAGAAT-A--AT-T-T-T--GG----T-G-C-AAA-AC-------------------------------------T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---A-AGCTACA-----TG-----T--A-TTT-CAA--A---A--GA---A--AC----A-TTC----A-GAA---ACG--ACC-AAC
gi|36825                      :  CAAGA-T-G--AC-T-T-T--AA----C-G-C-AAA-GC---AT-CA---ATT----T-------------------------------------T-----TCT-A--A-A------T-A-T------T---G--T---A-A-----G-----C------C--A-CTT-GCA--A---A--GA---A--AC----A-TAG----A-GAA---ACG--ACC-AATAT
gi|36826                      :   AATA-T-A--AC-T-T-T--GA----T-G-T-AAA-GC---AT-CA---AAT----CATCGG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AACAT
gi|36827                      :   AAGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA--C---ATCCA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT----A-A------T-A-T------T---C--T---G-A-----AT----T------T--A-TTT-CCA--T---ATGGA---A--AC----ATTAC----A-GAA---TCG--ACC-AACAT
gi|36828                      :   AAGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C---------------------------T--A-TTT-TCA--A---A--GAACCA--AC----A-TAT----A-
gi|36829                      :   AAGA-T-A--AG-T-G-T--AA----T-G-C-AAA-GA---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--TG----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---A-A-----G-----A------T--A-TTT-GTA--A---A--TA---A--AC----A-TTC----A-GAA---ACA--GCA-AACA
gi|36830                      :    AGA-T-A--AG-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---TAT----C---GG-GC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--G-A------T-A-T------T---C--T---G-A-----G-----T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AACAT
gi|36831                      :    AGA-T-ATTAG-T-T-T--GA----T-GGC-AAA-GC---AT-CA---AATT---C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-GACA-A------T-AGT------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-C----ATTTA--GA---A--AC----A-TAC----A-GGA---AT
gi|36834                      :    AAA-T-A--AG-C-C-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---CAT----C---GG-CC--G--C----T----------AACAAA--A-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---G--T---A-A-----G-----C------T--A-TTC-Ccgagcggca
gi|36833                      :    AGA-G-A--AA-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-G----AT-TA---A-T----A---GG-CC--T--C----A----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------C---A--TTA-GCA-----A-----A------T--A-CTT-CCA--AG--A--AA---A--AC----A-TGC----A-TAG---ACG--ACC-AACAT
gi|36832                      :    AGA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-CGAAA-GC---AT-CA---AGT----C---GG--C--G--C----T----------AT-AAA--T-----T--------A------G-A-T------T---C--------------------C------T--A-TTT-CCA--A---A--G----A--CC----ATTAC----A-GAA---ACG---CC-AATAT
gi|36836                      :     GA-T-A--AT-T-T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----T---GG-CT--G--C----T----------G--AGA--G-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---C--T---T-ATTCT-A-----TAAAGC-T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TGC----A-GAA---ACA--ACC-AACAT
gi|36835                      :     GA-T-AG-AG-T-T-T--GA------G-C-AA--GC----T-TA---TAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGAGAT-----TTT-A--GCA------T-A-T------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT--CA--A---C--GA---A--AC----A-TAC------AGA---ATGA-ACCAAACAT
gi|36837                      :     GA-T-A--AT-T-T-TT-GA----T-G-C-AA--GC---AT-CA---AAT----T---GG-CT--G--C----TG---------A--GAG--T-----TTT-A--T-ATTT---T-A-T------T---C--TATAA-A-----G-----C------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--A-----A-TGC----A-GAA---ACA----C-AACAT
gi|36839                      :      A-T-A--AT-T-T-TTCGA----TTG-C-AAA-GCCACAT-CA---AAT----C---GGGCC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTA-A--A-AAT----T-A-T------TATAC--T-----------A-----T------TCTA-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----AGAAA---ACG--ACC-AACAT
gi|36840                      :       -T-A--AT-T-T-T--AA----T-G-C-AAA-AC---AT-CA---AAT----A---AG-A---A--T----C----------A--AAG--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---A-A-----A-----T------G--A-TTT-C
gi|36841                      :               -T-C-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-G------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AACATataaa
gi|36842                      :                 -T-T--CA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GC-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T-----------A-----TTC----T--A-TTT-CTA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACG--ACC-AACA
gi|36843                      :                 -T-T--GA----T-G-C-AAA-GC---AT-CA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--------TTT-A--A-A------TAA-T------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TTT-CAT--T---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAT---ACG--ACC--ACAT
gi|36838                      :                 -T-T--GA----T-G-C-AAATGC---AT-CA---AGT----CCG-AG-CC--G--C----TGTTTTTTAAAA--AAA--T------------A-A------T-A-T------T---T--T---G-A-----G-----C------C--A-TTG-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TACCGTGA-GAA---ACG--ACC-AACGT
gi|36844                      :              gataggattgA----T-G-C-AAA--C---AC-CA---AAT----C---GA-CC--G--C----T----------A--AAA--C-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---A--T---A-A-----G-----C------T--A-TTT-CCA--A---A--GA---
gi|36845                      :                                  -AAA-AC---AT-CA---AAT----C---GG-AC--A--C----T----------A--AAA--T-----TGT-A--A-A------T-A-T------G---C--T---A-A-----G-----G------T--T-TAT-CC---A---A--GA---A--AC----A-CAC----A-GAA---ACA--ACC-AATAT
gi|36846                      :                                                                    --G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---G-A-----A-----T------T--A-TGC-CCA--A---A--GA---A--AC----A-TAC----A-GAA---ACA--ACT-A

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Reference ( family-334 )      :                                        ACAAGA-T-A--AN-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36787                      :                                        ACAAGA-T-A--AG-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--A-AA---A-TG--ACC-AACAT
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gi|36806                      :                                        ACAAGA-T-A--AT-T-TT--GA----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----T---A--A-A------A-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----------------G---------G--ACC-AACAT
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gi|36817                      :                                        ACAAGA-T-A--AG-C-TTTCGA----T-G-C-AAA-GC----TC-A---AGT----C---CG-CC--G--C----T----------A--A----T-----TTT-A-----------T---T------T---T--T---------A--A---------------------TTT-CA---A--AC--A--GA---AAT----A-TAT----ATAG-AA---A-CG--ACC-AA
gi|36818                      :                                        ACAAGA-T-A--AG-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AGT----C---GG-CC--G--C----T--------------AA--T-----TT--------------T-A-T------T-----------------------------------------TTT---------------------AAT----A-TAT----A--G-AA---A-CG--ACC-AAGAT
gi|36819                      :                                        ACAAGAAT-A--AT-T-TT--GG----T-G-C-AAA-AC-------------------------------------T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--AGCTACA-----TG-----TA-TTT-CA---A--A---A--GA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CG--ACC-AAC
gi|36820                      :                                        ACAAGA-A-A--CT-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG--C--G--C---------------A--AA---------TTT-A--A-A--------------------------------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--G----AAC----A-TAC----A--G-AATCGA-CA--ACC-AACGT
gi|36821                      :                                        ACAAGA-T-A--AG-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--
gi|36821                      :                                                                                                                                                                                                                        ---A--A---A--GA---AAC----A---C----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATgaaacacagaaacgaccaacat
gi|36822                      : acaagataagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctaACCAGA-T-A--AT-TATT--GA----T-G-C-AAA-GCG--ATC-A---AAT----T---GG-CC--G--CTAAAT----------A--AAA--TAAAAATTA-A--A-A------T-A-T------T---T---------------------------C------TC-TTT-CC---A--A---A--AA---AAT----A-TA-----A--G-AA---A-CGACACC-AACAT
gi|36823                      :                                        ACAAGA-T-A--AG-T-TT--GACTCTT-G-C-AAA-GC---GTA-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TCT-A--A-A------T-G-T-------------------------------------------------------------------------------A-TAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36824                      :                                        ACAATA-C-A--AG-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATA-A---AAT----C---GG-CT--G--C----A----------A--AAA--T-----TT
gi|36825                      :                                         CAAGA-T-G--AC-T-TT--AA----C-G-C-AAA-GC---ATC-A---ATT----T-------------------------------------T-----TCT-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------CA-CTT-GC---A--A---A--GA---AAC----A-TAG----A--G-AA---A-CG--ACC-AATAT
gi|36826                      :                                          AATA-T-A--AC-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATC-A---AAT----CATCGG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36827                      :                                          AAGA-T-A--AG-T-TT--GA----T-G-C-AAA--C---ATCCA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT----A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----AT----T------TA-TTT-CC---A--T---ATGGA---AAC----ATTAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36828                      :                                          AAGA-T-A--AT-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--GAACCAAC----A-TAT----A--
gi|36829                      :                                          AAGA-T-A--AG-T-GT--AA----T-G-C-AAA-GA---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--TG----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----G-----A------TA-TTT-GT---A--A---A--TA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CA--GCA-AACA
gi|36830                      :                                           AGA-T-A--AG-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---TAT----C---GG-GC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--G-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----G-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36831                      :                                           AGA-T-ATTAG-T-TT--GA----T-GGC-AAA-GC---ATC-A---AATT---C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-GACA-A------T-AGT------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C-------ATTTA--GA---AAC----A-TAC----A--G-GA---ATCG--AGC-GGCA
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gi|36833                      :                                           AGA-G-A--AA-T-TT--GA----T-G-C-AAA-G----ATT-A---A-T----A---GG-CC--T--C----A----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------CA--T--T---------AGCA-----A-----A------TA-CTT-CC---A--AG--A--AA---AAC----A-TGC----A--T-AG---A-CG--ACC-AACAT
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gi|36836                      :                                            GA-T-A--AT-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----T----------G--AGA--G-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---C--TTATTCTATAA--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TGC----A--G-AA---A-CA--ACC-AACAT
gi|36837                      :                                            GA-T-A--AT-T-TTT-GA----T-G-C-AA--GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----TG---------A--GAG--T-----TTT-A--T-ATTT---T-A-T------T---C--TATA------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----A-TGC----A--G-AA---A-CA----C-AACAT
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gi|36845                      :                                                                        -AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-AC--A--C----T----------A--AAA--T-----TGT-A--A-A------T-A-T------G---C--T---------A--A-----G-----G------TT-TAT-CC------A---A--GA---AAC----A-CAC----A--G-AA---A-CA--ACC-AATAT
gi|36846                      :                                                                                                          --G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TGC-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CA--ACT-A

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lowQualScore                  :                                              7 7 88 9999 4  44  5555 4 7 7   7  999   7 222   1111 888  7  99 99 7777 4444444444 66   66666666   1 99 7 111111 7 7 000000 999 4444444444444444444444444444444444  7   7  222 00 666 44  222   0000 4   5555 88 8  333 8  11   8     
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Reference ( family-334 )      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36787                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--A-AA---A-TG--ACC-AACAT
gi|36788                      :                                        ACAATA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----CTT-C--A-A------T-G-T------T---CT-T---------A--A-----G-----T------TA-TTT-CA---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-TG--ACT-AACAT
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gi|36790                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--T----T----------A--AAA---------TT-A--A-A------C-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CT---A--A---A--GA---AAA----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36791                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----TAAAATAA---A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------CA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AAAAT
gi|36792                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--G-----GTT-G--A-A------T-A-T------T-------------------------------T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-CAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36793                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-ATA-GC---ATC----------------GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-A------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ATC-AACAT
gi|36794                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-T---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------A---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---ATTT---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AG---T-CG--ACC-AACAT
gi|36795                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--A--C----T----------A--AAA---------TT-A--A-A------T---T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-TT--ATC-AACAT
gi|36796                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GT---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--A-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-CC------A---A--GA---CAC----A-AAC----A--G-AA---A-TG--ACC-AACAT
gi|36797                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--------TTA-A--A-A------T---T------T---T--T---------A--A-----AGAGATT------CA-TTT-CC---A--A---A--GA---AACATGTA-TAC----A--G-AA---A-GG--ACC-AACAT
gi|36798                      :                                        ACAATA-T-A--A--T-T-TT--AA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-GTAGACCT-A-T------T---C--T---------T--A-----A-----TCTAAGCTA-TTT-CC------A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-CA---A-CG--ACT-AACAT
gi|36799                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ACC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--ATT--T-----TTT-A--A-G------T-A-TTCTTAAT---C--T---------A--A-----A-----T------TA-TTT-AC------A---T--GA---AGC----A-TAC----A--G-AA---T-CG--ACT-AACA
gi|36800                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-AAATAAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA----------T-A--A-A------C-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC------T-C----A--G-AA---A-CG--ACC-AA
gi|36801                      :                                        ACAA-A-T-A--A--TCT-TT--GA----T-G-C-AA--GC---ATC-A---GATACATC---GG-CC--G--C----T----------A--CAA--A-----TCT-A--A-A------C-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTAATTTGCC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---C-CG--ACC-AAGAT
gi|36802                      :                                        ACAAGA-A-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---GTC-A---AAT----C---GA-CC--G--C---------------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------C---A--T---------A--A-----G-----CAAGA--TA-GTT-CG---A--A---A--GA---AACGTGTA-TAT----A--G-AA---A-CG--ACC-AAC
gi|36803                      :                                        ACAAGA-TGA--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----CG--GG-CCGAG--C----T-------------AAA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-CC---A--A---AG-GA---AAA----A-GAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AA
gi|36804                      :                                        ACGAGA-T-A--A--T-T-TC--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-GC--G--C----TA---------A--AAA--T-----TTTAA--A-A------T-A-T------T---CTAT---------A--A-----G-----T------TA-CTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----
gi|36805                      :                                        ACAGGA-T-A--A--G-T-GC--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--A--C----T----------A--AAAA-T-----TTG-A--A-A------T-A-A------T---C--A---------A--A-----A-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAG----A-TAC----A--G-AA---A-CG--
gi|36806                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----T---A--A-A------A-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----------------G---------G--ACC-AACAT
gi|36807                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CC--A--C----T----------A--AGT--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---AC-GACC-AAC----A-TA
gi|36808                      :                                        ACAAGA-C-A--AA-T-T-TT--GA----T-G-C-AAA----------------T----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTTGA--A-A------T-T-T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----A--G-GA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36809                      :                                        ACAAGA-C-A--A--T-T-TT--GA----T-T-T-G----------C-A---AAT----C---GG-CC--G--CGC--T----------A--AAA--T-----TTT-G--A-A------T---T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----A--G--A---A-CG--ACC-AACAT
gi|36810                      :                                        ACAAGA-C-A--A--T-T-TTT-GA----TTG-C-AAA----------------T----C---GG-CC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTT-G--A-A------T---T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC--ACAT
gi|36811                      :                                        ACAAGA-C-A--AA-T-T-TT--GA--------------GT---GGC-A---AAT----C---GG-CC--GGGC----T----------A--AAA--T-----TTTGA--A-A------T---T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----AG-G-AA---A-CG--ACC--ACAT
gi|36812                      :                                        ACAAGA-T-ATAA--T-T-CT--TT----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----C---AG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--T-G------T-A-T------T---C--T---------T--A-----A-----TCTAAGCTA-TTT-CC---A--A---A---A---AGC----A-TAC----A--A-AA---A-CG--ACT-AACAT
gi|36813                      :                                        ACATGA-T-A--A--A-G-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--C--C----T----------G--AAA--T-----TTT-A--A-T------A-A-T------T---C--T---------A--C-----G-----C------TA-TTT-TC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--T--A---A-CG--ACC-AA
gi|36814                      :                                        ACAAGA-T-A--G--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-T---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A--------G---C--T---------A--C-----A------------TA-TTT-CTAAAA--A---A--AA---AAT----A-TTC----A--G-AA---
gi|36815                      :                                        ACAAGG-T-A--A--T-T-TT--AA----T-G-C-AAA-GC---ATC-----AAT----C---GG-CC--T--C----T----------A--AAA--------TTT-G--A-A------C-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-CC----------A--GA---AAC----A-TAC----A------------G--ACC-AACAT
gi|36816                      :                                        ACAAGA-A-A--A--T-T-TT--G---------C-AA---------C-A---AAT----C---GG-CC--G--C----A----------A--AAA--T-----TT--A--A-T------T-A-T------T---A--T---------A--A-----A-----CATGA--TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CA--ATC-AAC
gi|36817                      :                                        ACAAGA-T-A--AGCT-T-TC--GA----T-G-C-AAA-GC----TC-A---AGT----C---CG-CC--G--C----T----------A--A----T-----TTT-A-----------T---T------T---T--T---------A--A---------------------TTT-CA---A--AC--A--GA---AAT----A-TAT----ATAG-AA---A-CG--ACC-AA
gi|36818                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AGT----C---GG-CC--G--C----T--------------AA--T-----TT--------------T-A-T------T-----------------------------------------TTT---------------------AAT----A-TAT----A--G-AA---A-CG--ACC-AAGAT
gi|36819                      :                                        ACAAGAAT-A--A--T-T-TT--GG----T-G-C-AAA-AC-------------------------------------T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--AGCTACA-----TG-----TA-TTT-CA---A--A---A--GA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CG--ACC-AAC
gi|36820                      :                                        ACAAGA-A-A--C--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG--C--G--C---------------A--AA---------TTT-A--A-A--------------------------------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--G----AAC----A-TAC----A--G-AATCGA-CA--ACC-AACGT
gi|36821                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--
gi|36821                      :                                                                                                                                                                                                                          ---A--A---A--GA---AAC----A---C----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATgaaacacagaaacgaccaacat
gi|36822                      : acaagataagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctaACCAGA-T-A--A--T-TATT--GA----T-G-C-AAA-GCG--ATC-A---AAT----T---GG-CC--G--CTAAAT----------A--AAA--TAAAAATTA-A--A-A------T-A-T------T---T---------------------------C------TC-TTT-CC---A--A---A--AA---AAT----A-TA-----A--G-AA---A-CGACACC-AACAT
gi|36823                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GACTCTT-G-C-AAA-GC---GTA-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TCT-A--A-A------T-G-T-------------------------------------------------------------------------------A-TAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36824                      :                                        ACAATA-C-A--A--G-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATA-A---AAT----C---GG-CT--G--C----A----------A--AAA--T-----TT
gi|36825                      :                                         CAAGA-T-G--A--C-T-TT--AA----C-G-C-AAA-GC---ATC-A---ATT----T-------------------------------------T-----TCT-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------CA-CTT-GC---A--A---A--GA---AAC----A-TAG----A--G-AA---A-CG--ACC-AATAT
gi|36826                      :                                          AATA-T-A--A--C-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATC-A---AAT----CATCGG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36827                      :                                          AAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA--C---ATCCA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT----A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----AT----T------TA-TTT-CC---A--T---ATGGA---AAC----ATTAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36828                      :                                          AAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--GAACCAAC----A-TAT----A--
gi|36829                      :                                          AAGA-T-A--A--G-T-GT--AA----T-G-C-AAA-GA---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--TG----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----G-----A------TA-TTT-GT---A--A---A--TA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CA--GCA-AACA
gi|36830                      :                                           AGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---TAT----C---GG-GC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--G-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----G-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36831                      :                                           AGA-T-ATTA--G-T-TT--GA----T-GGC-AAA-GC---ATC-A---AATT---C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-GACA-A------T-AGT------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C-------ATTTA--GA---AAC----A-TAC----A--G-GA---ATCG--AGC-GGCA
gi|36832                      :                                           AGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-CGAAA-GC---ATC-A---AGT----C---GG--C--G--C----T----------AT-AAA--T-----T--------A------G-A-T------T---C---------------------------C------TA-TTT-CC---A--A---A--G----ACC----ATTAC----A--G-AA---A-CG---CC-AATAT
gi|36833                      :                                           AGA-G-A--A--A-T-TT--GA----T-G-C-AAA-G----ATT-A---A-T----A---GG-CC--T--C----A----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------CA--T--T---------AGCA-----A-----A------TA-CTT-CC---A--AG--A--AA---AAC----A-TGC----A--T-AG---A-CG--ACC-AACAT
gi|36834                      :                                           AAA-T-A--A--G-C-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---CAT----C---GG-CC--G--C----T----------AACAAA--A-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------TA-TTC-C
gi|36835                      :                                            GA-T-AG-A--G-T-TT--GA------G-C-AA--GC----TT-A---TAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGAGAT-----TTT-A--GCA------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C----A--A---C--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---T-GA--ACCAAACAT
gi|36836                      :                                            GA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----T----------G--AGA--G-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---C--TTATTCTATAA--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TGC----A--G-AA---A-CA--ACC-AACAT
gi|36837                      :                                            GA-T-A--A--T-T-TTT-GA----T-G-C-AA--GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----TG---------A--GAG--T-----TTT-A--T-ATTT---T-A-T------T---C--TATA------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----A-TGC----A--G-AA---A-CA----C-AACAT
gi|36838                      :                                            GA-T-AGGA--T-TGTT--GA----T-G-C-AAATGC---ATC-A---AGT----CCG-AG-CC--G--C----TGTTTTTTAAAA--AAA--T------------A-A------T-A-T------T---T--T---------G--A-----G-----C------CA-TTG-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TACCGTGA--G-AA---A-CG--ACC-AACGT
gi|36839                      :                                             A-T-A--A--T-T-TTTCGA----TTG-C-AAA-GCCACATC-A---AAT----C---GGGCC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTA-A--A-AAT----T-A-T------TATAC--T---------A--T-----T-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--GAAA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36840                      :                                              -T-A--A--T-T-TT--AA----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----A---AG-A---A--T----C----------A--AAG--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------GA-TTT-C
gi|36841                      :                                                        -T-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-G------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATataaa
gi|36842                      :                                                          -TT--CA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GC-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--T-----T-----C------TA-TTT-CT---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACA
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gi|36844                      :                                                                A----T-G-C-AAA--C---ACC-A---AAT----C---GA-CC--G--C----T----------A--AAA--C-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---A--T---------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---
gi|36845                      :                                                                          -AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-AC--A--C----T----------A--AAA--T-----TGT-A--A-A------T-A-T------G---C--T---------A--A-----G-----G------TT-TAT-CC------A---A--GA---AAC----A-CAC----A--G-AA---A-CA--ACC-AATAT
gi|36846                      :                                                                                                            --G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TGC-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CA--ACT-A

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Reference ( family-334 )      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36787                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--A-AA---A-TG--ACC-AACAT
gi|36788                      :                                        ACAATA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----CTT-C--A-A------T-G-T------T---CT-T---------A--A-----G-----T------TA-TTT-CA---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-TG--ACT-AACAT
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gi|36795                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--A--C----T----------A--AAA---------TT-A--A-A------T---T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-TT--ATC-AACAT
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gi|36800                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-AAATAAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA----------T-A--A-A------C-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC------T-C----A--G-AA---A-CG--ACC-AA
gi|36801                      :                                        ACAA-A-T-A--A--TCT-TT--GA----T-G-C-AA--GC---ATC-A---GATACATC---GG-CC--G--C----T----------A--CAA--A-----TCT-A--A-A------C-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTAATTTGCC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---C-CG--ACC-AAGAT
gi|36802                      :                                        ACAAGA-A-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---GTC-A---AAT----C---GA-CC--G--C---------------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------C---A--T---------A--A-----G-----CAAGA--TA-GTT-CG---A--A---A--GA---AACGTGTA-TAT----A--G-AA---A-CG--ACC-AAC
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gi|36805                      :                                        ACAGGA-T-A--A--G-T-GC--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--A--C----T----------A--AAAA-T-----TTG-A--A-A------T-A-A------T---C--A---------A--A-----A-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAG----A-TAC----A--G-AA---A-CG--
gi|36806                      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----T---A--A-A------A-A-T------T---T--T---------A--A-----A-----TAGATTCTA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----------------G---------G--ACC-AACAT
gi|36807                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CC--A--C----T----------A--AGT--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---AC-GACC-AAC----A-TA
gi|36808                      :                                        ACAAGA-C-A--AA-T-T-TT--GA----T-G-C-AAA----------------T----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTTGA--A-A------T-T-T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----A--G-GA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36809                      :                                        ACAAGA-C-A--A--T-T-TT--GA----T-T-T-G----------C-A---AAT----C---GG-CC--G--CGC--T----------A--AAA--T-----TTT-G--A-A------T---T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----A--G--A---A-CG--ACC-AACAT
gi|36810                      :                                        ACAAGA-C-A--A--T-T-TTT-GA----TTG-C-AAA----------------T----C---GG-CC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTT-G--A-A------T---T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC--ACAT
gi|36811                      :                                        ACAAGA-C-A--AA-T-T-TT--GA--------------GT---GGC-A---AAT----C---GG-CC--GGGC----T----------A--AAA--T-----TTTGA--A-A------T---T------T---C--T---------A------------------------TTT-CC---A--A---A--GA---AGC----A-TAC----AG-G-AA---A-CG--ACC--ACAT
gi|36812                      :                                        ACAAGA-T-ATAA--T-T-CT--TT----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----C---AG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--T-G------T-A-T------T---C--T---------T--A-----A-----TCTAAGCTA-TTT-CC---A--A---A---A---AGC----A-TAC----A--A-AA---A-CG--ACT-AACAT
gi|36813                      :                                        ACATGA-T-A--A--A-G-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--C--C----T----------G--AAA--T-----TTT-A--A-T------A-A-T------T---C--T---------A--C-----G-----C------TA-TTT-TC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--T--A---A-CG--ACC-AA
gi|36814                      :                                        ACAAGA-T-A--G--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-T---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A--------G---C--T---------A--C-----A------------TA-TTT-CTAAAA--A---A--AA---AAT----A-TTC----A--G-AA---
gi|36815                      :                                        ACAAGG-T-A--A--T-T-TT--AA----T-G-C-AAA-GC---ATC-----AAT----C---GG-CC--T--C----T----------A--AAA--------TTT-G--A-A------C-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-CC----------A--GA---AAC----A-TAC----A------------G--ACC-AACAT
gi|36816                      :                                        ACAAGA-A-A--A--T-T-TT--G---------C-AA---------C-A---AAT----C---GG-CC--G--C----A----------A--AAA--T-----TT--A--A-T------T-A-T------T---A--T---------A--A-----A-----CATGA--TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CA--ATC-AAC
gi|36817                      :                                        ACAAGA-T-A--AGCT-T-TC--GA----T-G-C-AAA-GC----TC-A---AGT----C---CG-CC--G--C----T----------A--A----T-----TTT-A-----------T---T------T---T--T---------A--A---------------------TTT-CA---A--AC--A--GA---AAT----A-TAT----ATAG-AA---A-CG--ACC-AA
gi|36818                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AGT----C---GG-CC--G--C----T--------------AA--T-----TT--------------T-A-T------T-----------------------------------------TTT---------------------AAT----A-TAT----A--G-AA---A-CG--ACC-AAGAT
gi|36819                      :                                        ACAAGAAT-A--A--T-T-TT--GG----T-G-C-AAA-AC-------------------------------------T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--AGCTACA-----TG-----TA-TTT-CA---A--A---A--GA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CG--ACC-AAC
gi|36820                      :                                        ACAAGA-A-A--C--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG--C--G--C---------------A--AA---------TTT-A--A-A--------------------------------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--G----AAC----A-TAC----A--G-AATCGA-CA--ACC-AACGT
gi|36821                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--
gi|36821                      :                                                                                                                                                                                                                          ---A--A---A--GA---AAC----A---C----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATgaaacacagaaacgaccaacat
gi|36822                      : acaagataagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctaACCAGA-T-A--A--T-TATT--GA----T-G-C-AAA-GCG--ATC-A---AAT----T---GG-CC--G--CTAAAT----------A--AAA--TAAAAATTA-A--A-A------T-A-T------T---T---------------------------C------TC-TTT-CC---A--A---A--AA---AAT----A-TA-----A--G-AA---A-CGACACC-AACAT
gi|36823                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GACTCTT-G-C-AAA-GC---GTA-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TCT-A--A-A------T-G-T-------------------------------------------------------------------------------A-TAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36824                      :                                        ACAATA-C-A--A--G-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATA-A---AAT----C---GG-CT--G--C----A----------A--AAA--T-----TT
gi|36825                      :                                         CAAGA-T-G--A--C-T-TT--AA----C-G-C-AAA-GC---ATC-A---ATT----T-------------------------------------T-----TCT-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------CA-CTT-GC---A--A---A--GA---AAC----A-TAG----A--G-AA---A-CG--ACC-AATAT
gi|36826                      :                                          AATA-T-A--A--C-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATC-A---AAT----CATCGG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36827                      :                                          AAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA--C---ATCCA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT----A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----AT----T------TA-TTT-CC---A--T---ATGGA---AAC----ATTAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36828                      :                                          AAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--GAACCAAC----A-TAT----A--
gi|36829                      :                                          AAGA-T-A--A--G-T-GT--AA----T-G-C-AAA-GA---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--TG----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----G-----A------TA-TTT-GT---A--A---A--TA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CA--GCA-AACA
gi|36830                      :                                           AGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---TAT----C---GG-GC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--G-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----G-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36831                      :                                           AGA-T-ATTA--G-T-TT--GA----T-GGC-AAA-GC---ATC-A---AATT---C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-GACA-A------T-AGT------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C-------ATTTA--GA---AAC----A-TAC----A--G-GA---ATCG--AGC-GGCA
gi|36832                      :                                           AGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-CGAAA-GC---ATC-A---AGT----C---GG--C--G--C----T----------AT-AAA--T-----T--------A------G-A-T------T---C---------------------------C------TA-TTT-CC---A--A---A--G----ACC----ATTAC----A--G-AA---A-CG---CC-AATAT
gi|36833                      :                                           AGA-G-A--A--A-T-TT--GA----T-G-C-AAA-G----ATT-A---A-T----A---GG-CC--T--C----A----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------CA--T--T---------AGCA-----A-----A------TA-CTT-CC---A--AG--A--AA---AAC----A-TGC----A--T-AG---A-CG--ACC-AACAT
gi|36834                      :                                           AAA-T-A--A--G-C-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---CAT----C---GG-CC--G--C----T----------AACAAA--A-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------TA-TTC-C
gi|36835                      :                                            GA-T-AG-A--G-T-TT--GA------G-C-AA--GC----TT-A---TAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGAGAT-----TTT-A--GCA------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C----A--A---C--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---T-GA--ACCAAACAT
gi|36836                      :                                            GA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----T----------G--AGA--G-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---C--TTATTCTATAA--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TGC----A--G-AA---A-CA--ACC-AACAT
gi|36837                      :                                            GA-T-A--A--T-T-TTT-GA----T-G-C-AA--GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----TG---------A--GAG--T-----TTT-A--T-ATTT---T-A-T------T---C--TATA------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----A-TGC----A--G-AA---A-CA----C-AACAT
gi|36838                      :                                            GA-T-AGGA--T-TGTT--GA----T-G-C-AAATGC---ATC-A---AGT----CCG-AG-CC--G--C----TGTTTTTTAAAA--AAA--T------------A-A------T-A-T------T---T--T---------G--A-----G-----C------CA-TTG-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TACCGTGA--G-AA---A-CG--ACC-AACGT
gi|36839                      :                                             A-T-A--A--T-T-TTTCGA----TTG-C-AAA-GCCACATC-A---AAT----C---GGGCC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTA-A--A-AAT----T-A-T------TATAC--T---------A--T-----T-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--GAAA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36840                      :                                              -T-A--A--T-T-TT--AA----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----A---AG-A---A--T----C----------A--AAG--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------GA-TTT-C
gi|36841                      :                                                        -T-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-G------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATataaa
gi|36842                      :                                                          -TT--CA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GC-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--T-----T-----C------TA-TTT-CT---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACA
gi|36843                      :                                                          -TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--------TTT-A--A-A------TAA-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CA---T--T---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AT---A-CG--ACC--ACAT
gi|36844                      :                                                                A----T-G-C-AAA--C---ACC-A---AAT----C---GA-CC--G--C----T----------A--AAA--C-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---A--T---------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---
gi|36845                      :                                                                          -AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-AC--A--C----T----------A--AAA--T-----TGT-A--A-A------T-A-T------G---C--T---------A--A-----G-----G------TT-TAT-CC------A---A--GA---AAC----A-CAC----A--G-AA---A-CA--ACC-AATAT
gi|36846                      :                                                                                                            --G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TGC-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CA--ACT-A


blockSeqs                     :                                                  TA GCT  A  TC  CTCT T          CAC     AAT   ACAT ATC           TAAA GTTTTTTAAA AC   TAAAAA     A      TAGACC     TCTTAA ATA TTATTCTATAAAGC                             AAA    TTT TG  ACC   ATGT T   CGTG TA    TCG    AC
blockSeqs                     :                                                  TT TC   G  T   .    T          G       .     T    CG            GC   AAAATAA    T    GAT        G      TTT        .      A   TAAATAGATTC                                .      C   G   CC    GTGT T   .    G     .      . 
blockSeqs                     :                                                  GG AT   .  T   .    .          .       .     .    G             C    A          .    AT         G      AT         .      .   TAAATAGATTC                                .      G   C   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  G  AT   .  .   .    .          .       .     .    .             C    G          .    TG         .      .          .      .   TAAATAGATTC                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TTAATCTAAGC                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAATAGATTC                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    G          .      .          .      .   TAAATAGATTC                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAATAGATTC                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TTAATCTAAGC                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    A          .      .          .      .   TAAGCTACATG                                .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAAGAGATT                                 .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGCAAGA                                  .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    A          .      .          .      .   TAAACATGA                                  .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TATAAAGC                                   .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TATAAGT                                    .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAGCAAA                                    .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TTAAGT                                     .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAATT                                     .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   AAAAC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TACGC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  A    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGA                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAGT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAGC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TATTC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TATTC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  C    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGC                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  C    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAAGG                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    A          .      .          .      .   TGAAT                                      .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    G          .      .          .      .   TACA                                       .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TAA                                        .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TA                                         .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TA                                         .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TA                                         .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  A    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   TA                                         .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   T                                          .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  G    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    C          .      .          .      .   C                                          .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   C                                          .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    T          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    .          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .     .    .   .    .     .      . 
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    .          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .     .    .   .    .     .        
blockSeqs                     :                                                  .  T    .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    .          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .     .    .   .    .              
blockSeqs                     :                                                          .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    .          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .     .    .   .                   
blockSeqs                     :                                                          .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    .          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .     .    .                       
blockSeqs                     :                                                          .  .   .    .          .       .     .    .             .    .          .    .          .      .          .      .   .                                          .      .   .   .                                  
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lowQualScore                  :                                              7 7 88 9999 4  44  5555 4 7 7   7  999   7 222   1111 888  7  99 99 7777 4444444444 66   66666666   1 99 7 111111 7 7 000000 999 4444444444444444444444444444444444  7   7  222 00 666 44  222   0000 4   5555 88 8  333 8  11   8     
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Reference ( family-334 )      :                                        ACAAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36787                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--A-AA---A-TG--ACC-AACAT
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gi|36820                      :                                        ACAAGA-A-A--C--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG--C--G--C---------------A--AA---------TTT-A--A-A--------------------------------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--G----AAC----A-TAC----A--G-AATCGA-CA--ACC-AACGT
gi|36821                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--
gi|36821                      :                                                                                                                                                                                                                          ---A--A---A--GA---AAC----A---C----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATgaaacacagaaacgaccaacat
gi|36822                      : acaagataagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctaACCAGA-T-A--A--T-TATT--GA----T-G-C-AAA-GCG--ATC-A---AAT----T---GG-CC--G--CTAAAT----------A--AAA--TAAAAATTA-A--A-A------T-A-T------T---T---------------------------C------TC-TTT-CC---A--A---A--AA---AAT----A-TA-----A--G-AA---A-CGACACC-AACAT
gi|36823                      :                                        ACAAGA-T-A--A--G-T-TT--GACTCTT-G-C-AAA-GC---GTA-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TCT-A--A-A------T-G-T-------------------------------------------------------------------------------A-TAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36824                      :                                        ACAATA-C-A--A--G-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATA-A---AAT----C---GG-CT--G--C----A----------A--AAA--T-----TT
gi|36825                      :                                         CAAGA-T-G--A--C-T-TT--AA----C-G-C-AAA-GC---ATC-A---ATT----T-------------------------------------T-----TCT-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------CA-CTT-GC---A--A---A--GA---AAC----A-TAG----A--G-AA---A-CG--ACC-AATAT
gi|36826                      :                                          AATA-T-A--A--C-T-TT--GA----T-G-T-AAA-GC---ATC-A---AAT----CATCGG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36827                      :                                          AAGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA--C---ATCCA---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT----A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----AT----T------TA-TTT-CC---A--T---ATGGA---AAC----ATTAC----A--G-AA---T-CG--ACC-AACAT
gi|36828                      :                                          AAGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-G--A-A------T-A-T------T---C----------------------------------TA-TTT-TC---A--A---A--GAACCAAC----A-TAT----A--
gi|36829                      :                                          AAGA-T-A--A--G-T-GT--AA----T-G-C-AAA-GA---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--TG----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----G-----A------TA-TTT-GT---A--A---A--TA---AAC----A-TTC----A--G-AA---A-CA--GCA-AACA
gi|36830                      :                                           AGA-T-A--A--G-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---TAT----C---GG-GC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--G-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----G-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36831                      :                                           AGA-T-ATTA--G-T-TT--GA----T-GGC-AAA-GC---ATC-A---AATT---C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-GACA-A------T-AGT------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C-------ATTTA--GA---AAC----A-TAC----A--G-GA---ATCG--AGC-GGCA
gi|36832                      :                                           AGA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-CGAAA-GC---ATC-A---AGT----C---GG--C--G--C----T----------AT-AAA--T-----T--------A------G-A-T------T---C---------------------------C------TA-TTT-CC---A--A---A--G----ACC----ATTAC----A--G-AA---A-CG---CC-AATAT
gi|36833                      :                                           AGA-G-A--A--A-T-TT--GA----T-G-C-AAA-G----ATT-A---A-T----A---GG-CC--T--C----A----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------CA--T--T---------AGCA-----A-----A------TA-CTT-CC---A--AG--A--AA---AAC----A-TGC----A--T-AG---A-CG--ACC-AACAT
gi|36834                      :                                           AAA-T-A--A--G-C-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---CAT----C---GG-CC--G--C----T----------AACAAA--A-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---G--T---------A--A-----G-----C------TA-TTC-C
gi|36835                      :                                            GA-T-AG-A--G-T-TT--GA------G-C-AA--GC----TT-A---TAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AGAGAT-----TTT-A--GCA------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-C----A--A---C--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---T-GA--ACCAAACAT
gi|36836                      :                                            GA-T-A--A--T-T-TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----T----------G--AGA--G-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---C--TTATTCTATAA--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TGC----A--G-AA---A-CA--ACC-AACAT
gi|36837                      :                                            GA-T-A--A--T-T-TTT-GA----T-G-C-AA--GC---ATC-A---AAT----T---GG-CT--G--C----TG---------A--GAG--T-----TTT-A--T-ATTT---T-A-T------T---C--TATA------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AA-----A-TGC----A--G-AA---A-CA----C-AACAT
gi|36838                      :                                            GA-T-AGGA--T-TGTT--GA----T-G-C-AAATGC---ATC-A---AGT----CCG-AG-CC--G--C----TGTTTTTTAAAA--AAA--T------------A-A------T-A-T------T---T--T---------G--A-----G-----C------CA-TTG-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TACCGTGA--G-AA---A-CG--ACC-AACGT
gi|36839                      :                                             A-T-A--A--T-T-TTTCGA----TTG-C-AAA-GCCACATC-A---AAT----C---GGGCC--G--CC---T----------A--AAA--T-----TTA-A--A-AAT----T-A-T------TATAC--T---------A--T-----T-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--GAAA---A-CG--ACC-AACAT
gi|36840                      :                                              -T-A--A--T-T-TT--AA----T-G-C-AAA-AC---ATC-A---AAT----A---AG-A---A--T----C----------A--AAG--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--A-----A-----T------GA-TTT-C
gi|36841                      :                                                        -T-CT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTT-A--A-A------T-A-G------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACATataaa
gi|36842                      :                                                          -TT--CA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GC-CC--G--C----T----------A--AAA--T-----TTC-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------A--T-----T-----C------TA-TTT-CT---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CG--ACC-AACA
gi|36843                      :                                                          -TT--GA----T-G-C-AAA-GC---ATC-A---AAT----C---GG-CC--G--C----T----------A--AAA--------TTT-A--A-A------TAA-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TTT-CA---T--T---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AT---A-CG--ACC--ACAT
gi|36844                      :                                                                A----T-G-C-AAA--C---ACC-A---AAT----C---GA-CC--G--C----T----------A--AAA--C-----TTT-T--A-A------T-A-T------T---A--T---------A--A-----G-----C------TA-TTT-CC---A--A---A--GA---
gi|36845                      :                                                                          -AAA-AC---ATC-A---AAT----C---GG-AC--A--C----T----------A--AAA--T-----TGT-A--A-A------T-A-T------G---C--T---------A--A-----G-----G------TT-TAT-CC------A---A--GA---AAC----A-CAC----A--G-AA---A-CA--ACC-AATAT
gi|36846                      :                                                                                                            --G--C----T----------A--AGA--T-----TTT-A--A-A------T-A-T------T---C--T---------G--A-----A-----T------TA-TGC-CC---A--A---A--GA---AAC----A-TAC----A--G-AA---A-CA--ACT-A