lowQualScore : 1111
lowQualScore : 1 22 3 1 1 1 1 1 44444 11 333 22 1 1 666666666 1 55 1 1 33 1 1 0 1 0 0 1 1 0 555 3 2222 0 3333 0 0 11 0 1 0 2 1 22 11 1 11 1 0 333333 0 1 0 0
lowQualScore : . .. . . . . . . ..... .. ... .. . . ......... . .. . . .. . . . . . . . . . ... . .... . .... . . .. . . . . . .. .. . .. . . ...... . . . .
lowQualScore : 4 00 9 3 3 3 2 2 77777 66 222 77 1 2 666666666 1 00 1 1 11 1 6 8 6 8 8 5 5 8 444 9 1111 7 0000 7 7 00 7 5 7 2 5 66 11 6 11 6 8 222222 8 7 9 9
consensus : AGGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Reference ( gi|73028 ) : AGGCCT-ATT--GAAG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73029 : AGGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TC-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-T-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73030 : AGGC-T-GTT--GAGG-AA-A-TT-CT-G-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-A-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73032 : AGGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-ATT---CTGTTTA--GT---A--G-G-G---------T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-C-GGGAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73033 : AAGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-TA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GCAATCTC-G-GAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-AAG--T-GC-A------A-G
gi|73034 : AGGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---C-A--TA-A-AA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTT-G-GGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAGTAT-GC-AT-----A-GAT-A-T-GGCC
gi|73031 : AGGC-T-GTT--GAGG-AA-A-TT-CT-G-----CTGTTTA--G----A--G-G-G-----T---G-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--G-AGGCTC-A-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73035 : AGGCCT-ATT--AAGG-AA-A-TT-CT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G------------AGTTTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73036 : AGGCCT-ATT--AAGG-AA-A-TT-CT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---TTA--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G------------AGTTTC-G-GGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-
gi|73037 : AGGCCT-ACT--GAGG-AA-T-TT-----------TGTT-A--GT---A--G-G-G-----G---T-AA-TA-AACA--A-A-A-CA-G-T-TTG-TTGAACA--GGAGTCTC-G-GGAAA----C-A-A--T-CG-ACC--GT-T-G-ACG-C--G-GAG--T-G--A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73039 : AGGC-T-GTT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--AT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA---------------AAA----C-A-G--T-TG--CCT-AT-
gi|73040 : AGGCTT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CT-G-T-T-G-T
gi|73041 : AGGCCT-ATT--GAGG-GC-A-TT-CT-A-----CTGATTA--AT---AA-G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--G
gi|73038 : AGGCCTGATT--GAGG-AA-A-TT-TT-A-----CA---TA--GT---A--A-G-A-----G-----AGGTA-A-CA--A-A---CA-G-T-T-G-T-----A--AGGGTCTCGG-GGAAG----C-A-C--TGCG--CCTGGT-TGGTGCTTT--GTGAG--T-GC-ACGTTCTA-ACT-G-T-TGCC
gi|73042 : AAGTCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-
gi|73043 : GGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC---GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73044 : GGCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73045 : GGCC--ATT--TGAG-AA-A-TT-CTTA-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G---------T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T---G-TTGA-CA--GGGGTCTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-A---C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73046 : GGCAT-ATG--GAGG-AA-A-TT-CC-AAGTAACTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--------CA-A-T-T-G-TTGA-CA--GGAG-CTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------T-GC--G-T-TGC
gi|73047 : GGACT-ATT--GAGG-AA---TT-CT-A-----CT-TTT---GT---A--G-A-G-----GATAT-AA-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-G-G--------C-A-GGAT-CG-A-CT-GT-T
gi|73048 : GGCCT-ATTTCGGGG-GA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G------------------------------------T-G-TTGA-CA--GGGGTCTCGG-GGAAA----C-A-G--C-C--------T-TGG-AC--
gi|73049 : GCCT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTG--GT---ATAG-G-A-----G---T-A--TA-G-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACTT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73050 : GCCT-ATT--GAAG-GA-A-TT-TA-A-----CTGTTTA--GT---T--G-G-G-----G---T-AA-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CAATGGAGTCTC-G-GGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT---T-TGCC
gi|73051 : GCCT-ATT--GAGG-AA-AATT-CT-A-----CTGTTTACAGTTTTA--GAG-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA---T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTCAG-GAAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-G--GGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-TGTGCC
gi|73052 : GCCT-ATT--GAGG-AA-A-TTTCT-A-----CTGTT----AT---A--G-G-G-----GATTT-A--TA-A-CA--A-A-A-CATG-T-TTG-TTGA-CA--GGGGTCTC-G-GG
gi|73054 : CT-ATT--GAGA-AA-A-TT-CT-A-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G-----G---G-A--TA-A-CA--A-A-G-CA-G-C-T-G-TTGA-CA--GCAGTCTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--
gi|73055 : CT-ATT--GAGG-AA-A-TT-CT-A-----C-GTTTA--GT---A--G-G-G-----T---G-A--TA-A-CA--A-A-A-C--G-T-T-G-TTGA-CA--GG-GTCTC-G-GGAA-----C-A-G--T-GG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-AGT--T-GC-A------A-GCTCG-T-TGCC
gi|73053 : CT-ATT--GGAGGAA-A-TT-CT-A-----CTG-TTA--GTA--A--G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-C-CA-GTT-T-GTTTGA-C---GGAGTCTC-G-GGAAACACTC-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-G
gi|73056 : CT-ACT----AG-AATA-TC-CT----------TTTA--AT---A--G-G-------------A--TA-------------CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-A--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73057 : G-GA-A-TT-CT-T-----CTGTTTA--GT---A--G-A-T-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-C--------TA--GG-GCCTT-G-GGCAA----C-A-G--
gi|73058 : g-AA-A-TT-AT-A-----CAAGTTC--GT---A--C-A-A-----G---T-A--TA-------------CA-G-T-G-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-T-T-TG
gi|73059 : -TT-CT-A-----TT-CTCA--G----A--G-G-G-----A---------A-A-CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-A-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-CAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73060 : T-CT-A-----TTGTTT---GC---A--A-G-T---------T-A--TGCA-CA--A-GTA-TACG-T-T-G-TTGA-CT--GG-GTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-C--ATCT-GT-TGG-AC--C--G--AG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGTC
gi|73061 : T-A-----CTGTTTA--AA---A--G-GCGTACACG---T-A--TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GGAATCTT-G-GAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-
gi|73062 : TTA--AT---A--A-C-A-----G---T-A--TA---CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGT-G-CGAAA----C-G-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-T
gi|73063 : --G-G-G-----G---T-A--TA-A-CA--A-A-ATCA-G-TAT-G--TGA--A--GGAGACT--G-CAAAA----TAA-G--T-CACACCT-ATGTGG-ACT-C--G-GAG--TCGC-A------A-GCT-G-T-TG
gi|73064 : -----G---T-A--TA-A------------A-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-ATCTGA-AC--C--G-GAG--TGGC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73065 : A-A-CA--ATATA-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGAGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73074 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73073 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73072 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73067 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-AAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73066 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AT--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73078 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73076 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-TT--GGGGTTGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCC-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73070 : -A-CA-A-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--A-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73068 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGG-AC--C--T-GAG--T-AC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73075 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-T-GGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73077 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-T-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-C------A-GCTGG-T-TGCC
gi|73071 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-G-GGAAA----C-A-G--T-CA-ATCT-GT-TGG-GC--C--A-GAC--T-GA-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73069 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAG--G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGGAAC--C--T-GAG--T--C-A------T-GCT-G-T-TGC
gi|73079 : -CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GG-GTAGA-T-GGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73080 : -CA-G-T-T-GATTGA-CT--GGGGTA---GAGGAAA----C-A-G--T-CGGACTT-GT-TGG--C--T--GAGAG--T-GC-A------A-GTT-GCT-TGCC
gi|73081 : -T-T-A-TCAA-CA--GG-GTCTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------ATGCT-G-A-TGCC
gi|73082 : A--GGAGTCTC-G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73084 : -G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73085 : -G-GGAAA----C-A-G--T-CC-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73086 : -G-GGAAA----C-ACG--T-CG-ACCT-GTGTTG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73083 : -G-GGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--CGTG-GAG--T-GCAA------A-GCT-C-G-TGCC
gi|73087 : -GGGAA----C-A-G----CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2 1 44444 11 444 22 1 1 666666666 1 3 1 1 33 1 1 0 1 1 0 0 1 0 333 8888 3333 0 0 11 0 1 0 2 1 22 11 1 11 1 0 333333 0 1 0 0
lowQualScore : . .. . . . ..... .. ... .. . . ......... . . . . .. . . . . . . . . . ... .... .... . . .. . . . . . .. .. . .. . . ...... . . . .
lowQualScore : 4 99 4 5 2 66666 66 333 66 1 1 666666666 1 3 1 1 00 1 6 8 5 5 8 8 5 8 444 7777 7777 7 7 00 7 5 7 2 5 55 11 6 11 6 8 222222 8 7 8 9
consensus : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Reference ( family-333 ) : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73028 : AGGCCT-ATT--G-AAGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73029 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TCCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-T-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73030 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73031 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--G----A--G-G-G-----T---G-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GAGG-CTC-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73032 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-ATT---CTGTTTA--GT---A--G-G-G---------T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-CGGGAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73033 : AAGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-TA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GCAATCTC-GGAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-AAG--T-GC-A------A-G
gi|73034 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---C-A-TA-A-AA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTT-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAGTAT-GC-AT-----A-GAT-A-T-GGCC
gi|73035 : AGGCCT-ATT--A-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-------------GAGTTTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73036 : AGGCCT-ATT--A-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---TTA-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G------------AGTTTC-GGGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-
gi|73037 : AGGCCT-ACT--G-AGGAAT-TT----------TGTT-A--GT---A--G-G-G-----G---T-AATA-AACA--A-A-A-CA-G-T-TTG-TTGAACA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-A--T-CG-ACC--GT-T-G-ACG-C--G-GAG--T-G--A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73038 : AGGCCTGATT--G-AGGAAA-TTTT-A-----C---ATA--GTA--A--G-A-G-----A---G-G-TA-A-C---A-A-A-CA-G-T-T-G-T-----A--AGGGTCTCGGGGAAG----C-A-C--TGCG--CCTGGT-TGGTGCTTT--GTGAG--T-GC-ACGTTCTA-ACT-G-T-TGCC
gi|73039 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--AT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-C
gi|73040 : AGGCTT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CT-G-T-T-G-Taaaacagttgcctat
gi|73041 : AGGCCT-ATT--G-AGGGCA-TTCT-A-----CTGATTA--AT---AA-G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--G
gi|73042 : AAGTCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-
gi|73043 : GGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC--GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73044 : GGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73045 : GGCCA-TTT--G-AG-AAA-TTCTTA-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G---------T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T---G-TTGA-CA--GGGGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-A---C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73046 : GGCAT-ATG--G-AGGAAA-TTCC-AAGTAACTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--------CA-A-T-T-G-TTGA-CA--GGAG-CTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------T-GC--G-T-TGC
gi|73047 : GGACT-ATT--G-AGGAA--TTCT-A-----CT-TTT---GT---A--G-A-G-----GATAT-AATA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GG--------C-A-GGAT-CG-A-CT-GT-T
gi|73048 : GGCCT-ATTTCG-GGGGAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----------------------------------T-G-TTGA-CA--GGGGTCTCGGGGAAA----C-A-G--C-C--------T-TGG-AC--
gi|73049 : GCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTG--GT---ATAG-G-A-----G---T-A-TA-G-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACTT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73050 : GCCT-ATT--G-AAGGAA-TTTA-A-----CTGTTTA--GT---T--G-G-G-----G---T-AATA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CAATGGAGTCTC-GGGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT---T-TGCC
gi|73051 : GCCT-ATT--G-AGGAAAATTCT-A-----CTGTTTACAGTTTTA--GAG-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA---T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC-AGGAAAA---C-A-G--T-CG-ATCT-GG--GG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-TGTGCC
gi|73052 : GCCT-ATT--G-AGGAAATTTCT-A-----CTGTT----AT---A--G-G-G-----GATTT-A-TA-A-CA--A-A-A-CATGTT-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC-GGG
gi|73053 : CT-ATT--GGAGGAAA-TTCT-A-----CTG-TTA--GTA--A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-C-CA-GTT-T-GTTTGA-C---GGAGTCTC-GGGAAACACTC-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-G
gi|73054 : CT-ATT--G-AGAAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G-----G---G-A-TA-A-CA--A-A-G-CA-G-C-T-G-TTGA-CA--GCAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--
gi|73055 : CT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----C-GTTTA--GT---A--G-G-G-----T---G-A-TA-A-CA--A-A-A-C--G-T-T-G-TTGA-CA--GGG-TCTC-GGGAA-----C-A-G--T-GG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-AGT--T-GC-A------A-GCTCG-T-TGCC
gi|73056 : CT-ACT----AGAATA-TCCT----------TTTA--AT---A--G-G-------------A-TA-------------CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-A--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73057 : GGGAA-TTCT-T-----CTGTTTA--GT---A--G-A-T-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T----------CT--AGGGCCTT-GGGCAA----C-A-G--
gi|73058 : AAA-TTAT-A-----CAAGTTC--GT---A--C-A-A-----G---T-A-TA-------------CA-G-T-G-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-T-T-TG
gi|73059 : -TTCT-A-----TT-CTCA--G----A--G-G-G-----A--------A-A-CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-CAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73060 : TCT-A-----TTGTTT---GC---A--A-G-T---------T-A-TGCA-CA--A-GTA-TACG-T-T-G-TTGA-CT--GGG-TAGA-GGGAAA----C-A-G--T-C--ATCT-GT-TGG-AC--C--G--AG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGTC
gi|73061 : T-A-----CTGTTTA--AA---A--G-GCGTACACG---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GGAATCTT-GGAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-
gi|73062 : TTA--AT---A--A-C-A-----G---T-A-TA---CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGT-GCGAAA----C-G-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-T
gi|73063 : --G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-ATCA-G-TAT-G--TGA--A--GGAGACT--GCAAAA----TAA-G--T-CACACCT-ATGTGG-ACT-C--G-GAG--TCGC-A------A-GCT-G-T-TG
gi|73064 : -----G---T-A-TA-A------------A-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-ATCTGA-AC--C--G-GAG--TGGC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73065 : A-A-CA--ATATA-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGAGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73066 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AT--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73067 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-AAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73068 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGG-AC--C--T-GAG--T-AC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73069 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAG--GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGGAAC--C--T-GAG--T--C-A------T-GCT-G-T-TGC
gi|73070 : -A-CA-A-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--A-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73071 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ATCT-GT-TGG-GC--C--A-GAC--T-GA-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73072 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73073 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73074 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73075 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-TGGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73076 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-TT--GGGGTTGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCC-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73077 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-TGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-C------A-GCTGG-T-TGCC
gi|73078 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73079 : -CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGG-TAGA-TGGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73080 : -CA-G-T-T-GATTGA-CT--GGGGTAG--AGGAAA----C-A-G--T-CGGACTT-GT-TGG--C--T--GAGAG--T-GC-A------A-GTT-GCT-TGCC
gi|73081 : -T-T-A-TCAA-CA--GGG-TCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------ATGCT-G-A-TGCC
gi|73082 : --GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73083 : a-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--CGTG-GAG--T-GCAA------A-GCT-C-G-TGCC
gi|73084 : -GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73085 : -GGGAAA----C-A-G--T-CC-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73086 : -GGGAAA----C-ACG--T-CG-ACCT-GTGTTG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73087 : GGGAA----C-A-G----CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2 1 44444 11 444 22 1 1 666666666 1 3 1 1 33 1 1 0 1 1 0 0 1 0 333 8888 3333 0 0 11 0 1 0 2 1 22 11 1 11 1 0 333333 0 1 0 0
lowQualScore : . .. . . . ..... .. ... .. . . ......... . . . . .. . . . . . . . . . ... .... .... . . .. . . . . . .. .. . .. . . ...... . . . .
lowQualScore : 4 99 4 5 2 66666 66 333 66 1 1 666666666 1 3 1 1 00 1 6 8 5 5 8 8 5 8 444 7777 7777 7 7 00 7 5 7 2 5 55 11 6 11 6 8 222222 8 7 8 9
consensus : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Reference ( family-333 ) : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73028 : AGGCCT-ATT--G-AAGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73029 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TCCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-T-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73030 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73031 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--G----A--G-G-G-----T---G-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GAGG-CTC-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73032 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-ATT---CTGTTTA--GT---A--G-G-G---------T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-CGGGAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73033 : AAGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-TA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GCAATCTC-GGAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-AAG--T-GC-A------A-G
gi|73034 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---C-A-TA-A-AA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTT-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAGTAT-GC-AT-----A-GAT-A-T-GGCC
gi|73035 : AGGCCT-ATT--A-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-------------GAGTTTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73036 : AGGCCT-ATT--A-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---TTA-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G------------AGTTTC-GGGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-
gi|73037 : AGGCCT-ACT--G-AGGAAT-TT----------TGTT-A--GT---A--G-G-G-----G---T-AATA-AACA--A-A-A-CA-G-T-TTG-TTGAACA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-A--T-CG-ACC--GT-T-G-ACG-C--G-GAG--T-G--A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73038 : AGGCCTGATT--G-AGGAAA-TTTT-A-----C---ATA--GTA--A--G-A-G-----A---G-G-TA-A-C---A-A-A-CA-G-T-T-G-T-----A--AGGGTCTCGGGGAAG----C-A-C--TGCG--CCTGGT-TGGTGCTTT--GTGAG--T-GC-ACGTTCTA-ACT-G-T-TGCC
gi|73039 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--AT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-C
gi|73040 : AGGCTT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CT-G-T-T-G-Taaaacagttgcctat
gi|73041 : AGGCCT-ATT--G-AGGGCA-TTCT-A-----CTGATTA--AT---AA-G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--G
gi|73042 : AAGTCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-
gi|73043 : GGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC--GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73044 : GGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73045 : GGCCA-TTT--G-AG-AAA-TTCTTA-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G---------T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T---G-TTGA-CA--GGGGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-A---C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73046 : GGCAT-ATG--G-AGGAAA-TTCC-AAGTAACTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--------CA-A-T-T-G-TTGA-CA--GGAG-CTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------T-GC--G-T-TGC
gi|73047 : GGACT-ATT--G-AGGAA--TTCT-A-----CT-TTT---GT---A--G-A-G-----GATAT-AATA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GG--------C-A-GGAT-CG-A-CT-GT-T
gi|73048 : GGCCT-ATTTCG-GGGGAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----------------------------------T-G-TTGA-CA--GGGGTCTCGGGGAAA----C-A-G--C-C--------T-TGG-AC--
gi|73049 : GCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTG--GT---ATAG-G-A-----G---T-A-TA-G-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACTT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73050 : GCCT-ATT--G-AAGGAA-TTTA-A-----CTGTTTA--GT---T--G-G-G-----G---T-AATA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CAATGGAGTCTC-GGGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT---T-TGCC
gi|73051 : GCCT-ATT--G-AGGAAAATTCT-A-----CTGTTTACAGTTTTA--GAG-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA---T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC-AGGAAAA---C-A-G--T-CG-ATCT-GG--GG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-TGTGCC
gi|73052 : GCCT-ATT--G-AGGAAATTTCT-A-----CTGTT----AT---A--G-G-G-----GATTT-A-TA-A-CA--A-A-A-CATGTT-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC-GGG
gi|73053 : CT-ATT--GGAGGAAA-TTCT-A-----CTG-TTA--GTA--A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-C-CA-GTT-T-GTTTGA-C---GGAGTCTC-GGGAAACACTC-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-G
gi|73054 : CT-ATT--G-AGAAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G-----G---G-A-TA-A-CA--A-A-G-CA-G-C-T-G-TTGA-CA--GCAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--
gi|73055 : CT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----C-GTTTA--GT---A--G-G-G-----T---G-A-TA-A-CA--A-A-A-C--G-T-T-G-TTGA-CA--GGG-TCTC-GGGAA-----C-A-G--T-GG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-AGT--T-GC-A------A-GCTCG-T-TGCC
gi|73056 : CT-ACT----AGAATA-TCCT----------TTTA--AT---A--G-G-------------A-TA-------------CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-A--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73057 : GGGAA-TTCT-T-----CTGTTTA--GT---A--G-A-T-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T----------CT--AGGGCCTT-GGGCAA----C-A-G--
gi|73058 : AAA-TTAT-A-----CAAGTTC--GT---A--C-A-A-----G---T-A-TA-------------CA-G-T-G-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-T-T-TG
gi|73059 : -TTCT-A-----TT-CTCA--G----A--G-G-G-----A--------A-A-CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-CAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73060 : TCT-A-----TTGTTT---GC---A--A-G-T---------T-A-TGCA-CA--A-GTA-TACG-T-T-G-TTGA-CT--GGG-TAGA-GGGAAA----C-A-G--T-C--ATCT-GT-TGG-AC--C--G--AG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGTC
gi|73061 : T-A-----CTGTTTA--AA---A--G-GCGTACACG---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GGAATCTT-GGAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-
gi|73062 : TTA--AT---A--A-C-A-----G---T-A-TA---CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGT-GCGAAA----C-G-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-T
gi|73063 : --G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-ATCA-G-TAT-G--TGA--A--GGAGACT--GCAAAA----TAA-G--T-CACACCT-ATGTGG-ACT-C--G-GAG--TCGC-A------A-GCT-G-T-TG
gi|73064 : -----G---T-A-TA-A------------A-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-ATCTGA-AC--C--G-GAG--TGGC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73065 : A-A-CA--ATATA-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGAGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73066 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AT--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73067 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-AAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73068 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGG-AC--C--T-GAG--T-AC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73069 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAG--GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGGAAC--C--T-GAG--T--C-A------T-GCT-G-T-TGC
gi|73070 : -A-CA-A-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--A-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73071 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ATCT-GT-TGG-GC--C--A-GAC--T-GA-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73072 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73073 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73074 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73075 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-TGGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73076 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-TT--GGGGTTGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCC-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73077 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-TGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-C------A-GCTGG-T-TGCC
gi|73078 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73079 : -CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGG-TAGA-TGGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73080 : -CA-G-T-T-GATTGA-CT--GGGGTAG--AGGAAA----C-A-G--T-CGGACTT-GT-TGG--C--T--GAGAG--T-GC-A------A-GTT-GCT-TGCC
gi|73081 : -T-T-A-TCAA-CA--GGG-TCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------ATGCT-G-A-TGCC
gi|73082 : --GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73083 : a-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--CGTG-GAG--T-GCAA------A-GCT-C-G-TGCC
gi|73084 : -GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73085 : -GGGAAA----C-A-G--T-CC-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73086 : -GGGAAA----C-ACG--T-CG-ACCT-GTGTTG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73087 : GGGAA----C-A-G----CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
blockSeqs : G TC G A T AGTAA CA TTT TA A C TACACG T A C A GT T T T T T AAT CTCG CACT GA C G T TT GT T TA C CGTTCT C
blockSeqs : . . . T . TT . A A . . GATA . A . . GT . T C T A A CTCG A . G C A G . A . G T G
blockSeqs : . . . . . . . A . . . GATT . A . . . . . . . . A CTC A . . G . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A TTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A TTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T CTT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A CTT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T AGT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T TGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T AGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A CTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
finalCons : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2 1 44444 11 444 22 1 1 666666666 1 3 1 1 33 1 1 0 1 1 0 0 1 0 333 8888 3333 0 0 11 0 1 0 2 1 22 11 1 11 1 0 333333 0 1 0 0
lowQualScore : . .. . . . ..... .. ... .. . . ......... . . . . .. . . . . . . . . . ... .... .... . . .. . . . . . .. .. . .. . . ...... . . . .
lowQualScore : 4 99 4 5 2 66666 66 333 66 1 1 666666666 1 3 1 1 00 1 6 8 5 5 8 8 5 8 444 7777 7777 7 7 00 7 5 7 2 5 55 11 6 11 6 8 222222 8 7 8 9
consensus : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
Reference ( family-333 ) : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CN--GGGGTCNC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73028 : AGGCCT-ATT--G-AAGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73029 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TCCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-T-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73030 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73031 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--G----A--G-G-G-----T---G-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GAGG-CTC-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73032 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-ATT---CTGTTTA--GT---A--G-G-G---------T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-CGGGAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73033 : AAGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-TA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GCAATCTC-GGAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-AAG--T-GC-A------A-G
gi|73034 : AGGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---C-A-TA-A-AA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTT-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAGTAT-GC-AT-----A-GAT-A-T-GGCC
gi|73035 : AGGCCT-ATT--A-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-------------GAGTTTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73036 : AGGCCT-ATT--A-AGGAAA-TTCT-G-----CTGTTTA--AC---A--G-G-G-----T---TTA-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G------------AGTTTC-GGGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-
gi|73037 : AGGCCT-ACT--G-AGGAAT-TT----------TGTT-A--GT---A--G-G-G-----G---T-AATA-AACA--A-A-A-CA-G-T-TTG-TTGAACA--GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-A--T-CG-ACC--GT-T-G-ACG-C--G-GAG--T-G--A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73038 : AGGCCTGATT--G-AGGAAA-TTTT-A-----C---ATA--GTA--A--G-A-G-----A---G-G-TA-A-C---A-A-A-CA-G-T-T-G-T-----A--AGGGTCTCGGGGAAG----C-A-C--TGCG--CCTGGT-TGGTGCTTT--GTGAG--T-GC-ACGTTCTA-ACT-G-T-TGCC
gi|73039 : AGGC-T-GTT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--AT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-C
gi|73040 : AGGCTT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CT-G-T-T-G-Taaaacagttgcctat
gi|73041 : AGGCCT-ATT--G-AGGGCA-TTCT-A-----CTGATTA--AT---AA-G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--G
gi|73042 : AAGTCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-
gi|73043 : GGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC--GGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73044 : GGCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73045 : GGCCA-TTT--G-AG-AAA-TTCTTA-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G---------T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T---G-TTGA-CA--GGGGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-A---C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73046 : GGCAT-ATG--G-AGGAAA-TTCC-AAGTAACTGTTTA--GT---A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--------CA-A-T-T-G-TTGA-CA--GGAG-CTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------T-GC--G-T-TGC
gi|73047 : GGACT-ATT--G-AGGAA--TTCT-A-----CT-TTT---GT---A--G-A-G-----GATAT-AATA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCTC-GG--------C-A-GGAT-CG-A-CT-GT-T
gi|73048 : GGCCT-ATTTCG-GGGGAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--G-G-G-----------------------------------T-G-TTGA-CA--GGGGTCTCGGGGAAA----C-A-G--C-C--------T-TGG-AC--
gi|73049 : GCCT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----CTGTTTG--GT---ATAG-G-A-----G---T-A-TA-G-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CA--GGAGTCGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACTT-GT-TGG-AC--A--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73050 : GCCT-ATT--G-AAGGAA-TTTA-A-----CTGTTTA--GT---T--G-G-G-----G---T-AATA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CAATGGAGTCTC-GGGAAAA---C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT---T-TGCC
gi|73051 : GCCT-ATT--G-AGGAAAATTCT-A-----CTGTTTACAGTTTTA--GAG-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA---T-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC-AGGAAAA---C-A-G--T-CG-ATCT-GG--GG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-TGTGCC
gi|73052 : GCCT-ATT--G-AGGAAATTTCT-A-----CTGTT----AT---A--G-G-G-----GATTT-A-TA-A-CA--A-A-A-CATGTT-T-G-TTGA-CA--GGGGTCTC-GGG
gi|73053 : CT-ATT--GGAGGAAA-TTCT-A-----CTG-TTA--GTA--A--G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-C-CA-GTT-T-GTTTGA-C---GGAGTCTC-GGGAAACACTC-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-G
gi|73054 : CT-ATT--G-AGAAAA-TTCT-A-----CTGTTTA--GT---A--A-G-G-----G---G-A-TA-A-CA--A-A-G-CA-G-C-T-G-TTGA-CA--GCAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--
gi|73055 : CT-ATT--G-AGGAAA-TTCT-A-----C-GTTTA--GT---A--G-G-G-----T---G-A-TA-A-CA--A-A-A-C--G-T-T-G-TTGA-CA--GGG-TCTC-GGGAA-----C-A-G--T-GG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-AGT--T-GC-A------A-GCTCG-T-TGCC
gi|73056 : CT-ACT----AGAATA-TCCT----------TTTA--AT---A--G-G-------------A-TA-------------CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-A--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73057 : GGGAA-TTCT-T-----CTGTTTA--GT---A--G-A-T-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T----------CT--AGGGCCTT-GGGCAA----C-A-G--
gi|73058 : AAA-TTAT-A-----CAAGTTC--GT---A--C-A-A-----G---T-A-TA-------------CA-G-T-G-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-T-T-TG
gi|73059 : -TTCT-A-----TT-CTCA--G----A--G-G-G-----A--------A-A-CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-AGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-CAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73060 : TCT-A-----TTGTTT---GC---A--A-G-T---------T-A-TGCA-CA--A-GTA-TACG-T-T-G-TTGA-CT--GGG-TAGA-GGGAAA----C-A-G--T-C--ATCT-GT-TGG-AC--C--G--AG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGTC
gi|73061 : T-A-----CTGTTTA--AA---A--G-GCGTACACG---T-A-TA-A-CA--A-A-A-CA-G-T-T-G-TCGA-CA--GGAATCTT-GGAAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-
gi|73062 : TTA--AT---A--A-C-A-----G---T-A-TA---CAGTA-T-A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGT-GCGAAA----C-G-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--T--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-T
gi|73063 : --G-G-G-----G---T-A-TA-A-CA--A-A-ATCA-G-TAT-G--TGA--A--GGAGACT--GCAAAA----TAA-G--T-CACACCT-ATGTGG-ACT-C--G-GAG--TCGC-A------A-GCT-G-T-TG
gi|73064 : -----G---T-A-TA-A------------A-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-ATCTGA-AC--C--G-GAG--TGGC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73065 : A-A-CA--ATATA-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGAGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73066 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AT--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73067 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--T--G-AAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73068 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGG-AC--C--T-GAG--T-AC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73069 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAG--GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCC-GT-TGGAAC--C--T-GAG--T--C-A------T-GCT-G-T-TGC
gi|73070 : -A-CA-A-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--A-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73071 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ATCT-GT-TGG-GC--C--A-GAC--T-GA-A------A-GTT-G-T-TGCC
gi|73072 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73073 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73074 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73075 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-TGGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73076 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-TT--GGGGTTGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCC-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73077 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-TGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-C------A-GCTGG-T-TGCC
gi|73078 : -A-CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGGGTAGA-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73079 : -CA-G-T-T-G-TTGA-CT--GGG-TAGA-TGGATA----C-A-A--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73080 : -CA-G-T-T-GATTGA-CT--GGGGTAG--AGGAAA----C-A-G--T-CGGACTT-GT-TGG--C--T--GAGAG--T-GC-A------A-GTT-GCT-TGCC
gi|73081 : -T-T-A-TCAA-CA--GGG-TCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CA-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------ATGCT-G-A-TGCC
gi|73082 : --GGAGTCTC-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GG-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73083 : a-GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--CGTG-GAG--T-GCAA------A-GCT-C-G-TGCC
gi|73084 : -GGGAAA----C-A-G--T-CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73085 : -GGGAAA----C-A-G--T-CC-ACCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC
gi|73086 : -GGGAAA----C-ACG--T-CG-ACCT-GTGTTG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGC
gi|73087 : GGGAA----C-A-G----CG-ATCT-GT-TGG-AC--C--G-GAG--T-GC-A------A-GCT-G-T-TGCC