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Reference ( gi|80511 ) : AAATG-C--T-T-ATT--CAG-T-G-T-G-T--T-AATT---G--A--T-A--T-G-----GA-T-GC--T---A---T-AA-T-T-C-ACAA-TT----AC-T--------A----TA----G----T-T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T-A-----CT----A-A-A-C--AT--TT-C-T---G-T--A-TC---A--------A-ATA--C---A-GAT-G-T--C------------------G--CTGT--C-C-TTT-A-A------T--A-----GC-----C-CT----C---GGC--G-G-G-G-C-----CC-T----T--G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
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gi|80547 : A----A----T-T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T-ATA---CT----A-A-A-C--AT--TA-A-T---G-T--A-TC---A--------A-ATA--C---A-GAT-G-
gi|80548 : --C-ATG---T-A-TGA--CC--A-G-T-A-----CT----A-A-AAC--AT--TA-A-T---G-T--A-TC---A--------A-ATA--C---A-GAT-G-T--C------------------G--CTTT--C-C-TTT-G-A------T--A-----GC-----C-CT----C---GGC--G-G-G-G-C-----CC-T----T--A-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-A--T-TTT-CTAGT
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gi|80550 : ----A-A-A-C--TT--GT-T-T---A-TC-A-CC---A--------T-ATG--C---A-GAT-G-T--------------------------GT--A-T-TTT-A-A------T--AAAA--GCATTTGC-CT----T---GGC--G-G-G-G-T-----CC-T----T--G-C-T-G-A-AT-T-T-G--TCA-G--T-GTT-CTAGT
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gi|80553 : -T---G-T--A-T---------------ATG--C---A-GAT-G-T--------------------------GT--A-C-ATT-A-A---------A-----ACATTTGC-CT----C---AGC--G-G-T-G-C-----CC-T----T--G-C-T-G-A-CT-T-T-G--TCA-G--T-GTT-CTAGT
gi|80554 : --------A-ATA--C---A-GAA-G-T---------------------A--CTTTAAC-C-TTT-G-A------T--G-----GC-----C-CTT---C---GGG--C-G-G-G-T-----CC-T----T--G-C-T-G-A-CCAA-T-G--TCA-G--T-TTTCCTAGT
gi|80555 : -ATA--C---A-GAT-G-T--C------------------A--CTTT--C-C-TTT-G-A------T--A-----GC-----C-CT----C---GGT--G-G-G-G-C-----CC-T----T--G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
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gi|80572 : -G-G-C-----CT-T----T--G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|80539 ): TGTGAACACTATAATTCAAAATCTACCGTATAATTGGTACTTAACTGAAATTTGGCAAACTGGTTTGTCACCATATACAGATGTGTATATTAAAATAATTGCTTCAGCGGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAATGTTCTAGT
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Reference ( family-324 ) : AAATG-C--T-T-ATT--CA-G-T-G-T-G-T--TAATT---G--A--T-A--T-GG--A-T-GT--T---A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T-----T-A--N-T-A---TAG----T-T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T-----A--CT----A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GA-TG------------------T---C-G--CTNT-----CC-TTT-G-A-T----A-----G-----------------C-----C-CT----C---GGC--G-G-G-G-C-----CC-T----T--G-C-TG-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
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gi|80514 : AAATG-C--T-T-ACTTCCA-G-T-G-T-G-T--TAATT---G--AA-T-A--T-GG--A-T-GT--T---A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TA-A--T-A---T-----AG----TGT-T--C-ACA---T-A-A-A--CC--A-GTT--A-----CT----A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-AC---C---ACGAT-G------------------T--C-G--C-GT----CC-ATT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-T--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-AGCC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80515 : AAATG-CCCT-T-ATT--CA-G-T-G-T-G-T--TAATTT--G--A--TTA--T-GG--A-T-GT--T---A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TA-A--T-A---T-----AG----T-T-T--C-ACAT--T-A-T-A--CC--A-GTT--A-----CT----A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------ATTCA--------ACAT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-G--CTGT----CCATTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-T--GC---G-G-C-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCACGTCT-TTT-CTA
gi|80516 : AAATA-C--T-T-ATT--AA-G-T-G-T-G-T--TAATT---A--A--T-A--T-GA--A-T-AT--G---A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TC-A--T-A---T-----AG----A-T-T--C-TCA---A-A-T-A--CC--A-G-A--A-----CT----A---A-A-C--AT----TA-C----------A---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---AG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80517 : AAATA-C--T-T-ATT--AA-G-T-G-T-G-T--TAATTA--A--A--T-A--T-GA--A-T-AT--T---GGATT-A-A-T-T-C-AC-AT--T--TC-A--T-A---T-----AGATGTT-C-T--CGACA-----A-T-A--CC--A-G----A-----CT----A---A-A-C--AT----AT-A----------A---G-TTA-----A-TC---------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--C-TT----CC-TTT-G-A-T----A---G------C-CT----C---AG-C--G----ATG-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80518 : AAATG-T--T-T-ATT--CT-C-T-T-T-G-T--TAATT---A--A--T-A--T-AG--A-T-AC--G---A---T-A-A-T-T-C-ACAGT--T--TA-A--T-A---T-----AG----T-T-T--C-ACA---G-A-T-A--CC--A-G-A--A-----CT----A---A-A-C--AT----TA-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-T-----CC-T----T-------------G-C-C-T-A-CC-A-C-G--TCA-A--T-TTT-CTAGT
gi|80519 : AAATA-C--T-T---T--CA-G-T-G-T-G-T--TA-TT---G--A--T-A--T-GG--A-T-GT--T---A---T-A-A-T-TTC-ACAAT--T--TA-A--T-A---T-----AG----T-T-------CA---T-A-T-A--CC--A-G-T--A-----CT----A---ATA-C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A--T-A----C-----GAT-G------------------T--C-G--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----T---GG-C---------G-G-C-----CCTT----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-GT-T-TTT-CTAGT
gi|80520 : AAATG-C--T-TTATT--CA-G-T-G-T-G-T--TAATT---G--A--T-A--T-GG----T-GT--TTA-A---TTA-A-T-T-C-ACAAT--T--T------------------------------------------T----CC--A-G-T--A-----CT----A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------AATCA--------A-AT-A----C-----GAT-G------------------T--C-G--CGTT----CC-TTT-GGA-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80521 : AAATG-CC-T-T-ATT--CA-G-T-G-TCG-T--TCATTTGAG--ACTT-A----GG--A-T--T--T---A---T-A-A-TGT-CGACAAT--T---A-A--T-A---T-----AGG---T-T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T--------CTA---A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--CTG--CTGT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-GTA-C-----CC-T----TTG-----------G-C-T-G-A-CC-A-T-GTCTCA-G--T-TTT-C
gi|80522 : AAATG-C--TGT-ATT--CA-G-T-GCT-G-T---AATTC--G--A--TTA--T-GG--A-T-GTG-T---A---T-A-A-T-TTC-ACAAT--T--TA-AG-T-A---T-----AAGC--T-T-T--C-ACA---T-A-T-ATACC--A-G-TC-A-----CT----A---A-A----AT----TT-C----------TTAGG-T-------A-TCA--------ACAT-A----C---A-G-T-G------------------T--C-G--CTGT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-A-C-G-----CC-T----T-------------GCC-T-GAA-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80523 : AAATG-C--T-T-ATT--CT-T-T-G-T-G-T--TAATT---A--A--T-G--T-CATCA-T-GA--TCCGA---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TA-A--T-ACAAT-----AG----T-T-T--C-ACA---A-A-T-A--CC--A-G-A--A-----CTGTATA---A-A-C--AT----TA-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GA------------------------------------------T-G-A-T----A---GC-----C-TTGAGAC---AG-C--A----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80524 : AAA-G-C--T-T-ATT--CATG-T-G-T---T--TACTT---G--A--T-A--T-GG--AGT-GT--T---A---T-A-AAT-T-C-ACAAT--T--TA-AC-T-A---T-----AG------T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T---------C----A---G-A-A--AC----TT-C----------TGC-G-T-------A-TCA--------ACAT-AC---C---A-GAT-G------------------T----G--TTGT----CC--TT-G-A-T----A---GC-----C-CT----T---GA-C--G----G-G-G-G-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80525 : AAATGGC--T-T-ATTT-CA-G-T-G-T-G-T--TGATT---G--A--T-A--TTGG--A-T-GT--TT--A---TTA-A-T-T-C-ACA----T--TA-A--T-A---T-----AG----T-T-TATC-ACA---T---T-A--CC--CTG-T--A-----CT----A---A-A-C--AT----TT-A----------T---GAT-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-GTCCGCTTTTCCTTTGATGT--C-G--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----G-AC----C---CG-T--G----G-G-G-
gi|80526 : AAATG-C--T---AT----A-G-T-G---G-T---AATT---------T-G--T-GT--A-T-G-------A---T-A-A-T-T-C-ACA-T--T--TA-A--T-A---------AG----T-T-TT-C-ATA---T-A-T-A--CC----G-T--AA----CT----A---A-A-C--A------T-A----------C---G-T-------A-TCA--------C-AT-A----C---A-GA--G------------------T--C-G--CTTT----CG-TTT---A-T----A---GC-----CACT----C----G-C--G----A-G----------C-C----T-------------G-C---G-A-CT-A-T----TCA----T-TTT-CTAGT
gi|80527 : AAATG-C--T-T-ATT--CT-C-T-G-T-A-T--TAATT---A--A----A--T-GG--A-T-------------------------ACGAT-------------A---T-----AG----T-T-T--C-ACA---A-A-T-A--CC--A-G-A--A-----CT----C---G---C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----C
gi|80528 : AAATG-C--T-T-ATT--CA-G-T-G-G-G-TAGTAACT-----------A--T-GG--A-T-GT------A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TA-AG-T-G---T-----AG----T-T-T--C--CA---TAA-T-A--CC--A-G-T--A-----CT----A---A-AGC--AT----TA-C----------T---G-
gi|80529 : AATGTC--T-C-ATT--CA-G-T-GGT-GGT--TAATT---G--A--T-A--T-GG--A-T-GT--TC--A---T-ATA-T-T-T--CAAT--T--TA-A--T-A----------G----T-T------ACA---T-AAT-A--CC--C-A-T--AGATAACT----AT--A-A-C--ATCA--TT-AA---------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-TATTG------------------T--C-AGTCTTT----CC-TTT-T-A-T----A---GC-----C-CT----CGGTGG-C--G----G-G-G-------CC-T----T-------------A-C-T-G-A-CC-A-T-G--TC-------TTT-CTAGT
gi|80530 : AATG-C--T-T-ATC--CA-A-T-G-T-G-T--TCATT---G--A--T-A--T-GG--A-T-GT--T---A---T-A-A-T-T-C-AC
gi|80531 : --T-T-ATT--CA-GATAG-T-G-T--TATTT---GTTA--T-AGAT-GG--A-T-GTGAT---A---T-A-A-T-T-C-ACAATTCT--CA-ACTT-A---T-----AG----T-TGTG-C-ACAAGGT-A-T-A--CC--AGG-TAAA-----CT----GGATA-A-C--ATTATGTT-CAGTACCCACTT---G-TACTATACA-TCA--------A-AT-ATAACT---A-GAT-AC-----------------T--C-G--CTCG----GC-GTT-G-G-T----G---GT-----G-CG----T---GGTT--GAGGTG-A-G-C-----CC-T----TTTTGGGGGGCCTTG-C-T-G-A--C-A-T-G--TCA-G----TTT-CTAGT
gi|80532 : --CA-G-T-G-T-G-T--AAATT---A--A--T-A--T-GG--A-T-GT--A---A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TA-T--T-A---T-----AG----T-T-T--C-ACA---T-A-C-A--CC--A-G-T--T-----CT----A---A-A-C--AT----TA-C----------T---G-T-------A-TGA--------A-GT-A----C---A-AAT-A------------------T--C-G--CTTT----CA-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-A--TCA-G--T-TTT-CTA
gi|80533 : --TAGTT---A--A--T-A--T-AG--A-T-AT--G---A---T-A-A-T-T-T-ACAAT--T--TA-A--T-A---T-----AG----T-T-T--C-ATA---T-A-T-A--CC--A-G-T--A-----CT----A---A-A-C--AT----TA-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------TCCC-G--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---AG-C--G----G-G-G-C--------------------------------------------G--TCG-G--T-TTT-CTAGT
gi|80534 : --TAGTT------A--T-A--T-AG--A-T-TT--A---A---T-A-A-T-T---ACAAT--TGTTT-A--T-A---TCAAGTAG----T-T-T--C-ACA---A-AAT-A--CC--A-G-A--A-----CT----A---A-A-C--AG----TTGC----------T---A-T-------AATCA--------A-AT-A----TTATA-GAT-G------------------T--CCA--CTTT----TC-TTTTG-A-T--------GC-----C-CT----C---AG-C--G----C-G-G-C-----CC-TGC--T-------------G-C-T-G-A-TC-A-G-C--TAA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80537 : --T-G--T-GA--A-C-AC--T---A---T-A-A-C-T-C-A-AAT--T--CT-A--T-A---------AA----T-T-T--T-ACT---T-A---A--CT--T-T-T--T-----GC----A---A-A-C--GT----GT-T----------T---A-T-------AACCA--------T-AT-G----C---A-GAT-----------------------C-G---TGT----AC-ATT-G-A------A---ACATTTGC-CT----C---GG-CCGG----A-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CT-ATT-G--TCA-G--TGTTT-CTAGT
gi|80540 : --T-G--T-GA--A-C-AC--T---A---T-A-A-C-T-C-AAAAT--C--TA----T-A---------AA----T-T-T--T-ACT---T-A---A--CT--T-T-T--G-----C-----A---A-A-C--------TT-G----------T---T-T-------A-TCACCATGATAA-AT-G----C---A-GAT-A------------------TG-T-A--CATTAAAACA-TTT-G-------------------C-CT----C---AG-C--G----A-A-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CT-T-T-G--TCA-A--T-GTT-CTAGT
gi|80542 : --T-G--T-GA--A-C-AC--T---A---T-A-A-C-T-C-AAAAT--C--TATA--A-A---T-----GG----T--------ACT---T-A---A--CCGAA-A-T--A-----TTGC--A---A-A-C--------TT-C----------T-----T-------A-TCACC------ATAT-G----C---A-GAT-G------------------TG-T-A--TATTAAAACA-TTT-G-------------------C-CT----C---AG-C--G----G-G-G-C-----CC-TAAATT-------------G-C-T-G-A-CT-T-T-G--TCA-G--T-GTT-CT
gi|80543 : --A-C-GC--T---A---T-A-A-C-T-C-AAAAT--C--TA----T-A---------AA----T-T-T--T-ACT---T-A---A--CT--G-A-A--A-----TTTTGCA---A-A-CTTGT----TT-A----------T-----T-------A-CCA--------T-AT-G----C---A-GAT-G------------------TG-T-A--CATTAAAACA-TTT-G------------GC-----C-C---------AG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------C-C-T-G-A-CT-T-T-A--TCA-G--T-GTT-CTAGT
gi|80544 : -T-GA--T---G---T-A-A-T-T-C-ACATT--T--TA-A--TGA---T-----AG----T-C-AAAC-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-A--A-----CT----A---A-A-CA-AT----TA-C----------T---G-T-------A-TCC--------A-AT-A----T---A-G-------------------------------------------T-G-G------A---GC-----C-----------------------------------C-T----T-------------G-C-T-G-A-AT-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80546 : ---T-A-A-C-T-C-AAAAT--C--TA----T-A---------AA----T-T-T--T-ACT---T-A---A--CT--T-T-T--G-----C-----A---A-A-C--TT----TT-T----------T---A-TC------A-CCA--------T-AT-G----C---A-GAT-G------------------T----G-----T----AC-ATT-A-A-A----A-------------------------C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------A-C-T-G-A-CT-T-T-G--TCA-G--T-GTT-CTAGT
gi|80547 : -----AA----T-T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T--ATA---CT----A---A-A-C--AT----TA-A----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------
gi|80548 : --C-ATG---T-A-TGA--CC--A-G-T--A-----CT----A---A-AAC--AT----TA-A----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-G--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------A-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-A--T-TTT-CTAGT
gi|80549 : ----A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-T--CTTT----CC-TTT-T-A-T----A---TC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------T-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80550 : ----A---A-A-C--TT----GT-T----------T---A-TC------A-CCA--------T-AT-G----C---A-GAT-G------------------T----G-----T----AT-TTT-A-A-T----AAAAGCATTTGC-CT----T---GG-C--G----G-G-G-T-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-AT-T-T-G--TCA-G--T-GTT-CTAGT
gi|80552 : -C----------C---G-T-------A-CCA--------T-AT-G----C---A-GAT-G------------------TG-T-A--CATTAAAACA-TTT-G-------------------C-CC----C---AG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CT-T-T-G--TCA-G--T-GTT-CTAGT
gi|80554 : --------A-AT-A----C---A-GAA-G------------------T----A--CTTTAA--CC-TTT-G-A-T----G---GC-----C-CTT---C---GG-G--C----G-G-G-T-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CCAA-T-G--TCA-G--T-TTTCCTAGT
gi|80555 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-T--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80556 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C----G-C--G----G-G-G-G-----CC-T----T-------------G-CAT-G-A-CCAA-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80557 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CT-T----T-------------A-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80558 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---AC-----C-CT----C---AG-C--G----GTG-GCC-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80559 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--A-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CC----C---GG-C--G----G-G-GCC-----CC-T----T-------------G-T-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CGAGT
gi|80560 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-AT-CTTT----CC-TTT-G-A-TGT--A---AC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-TT
gi|80561 : -AT-A----C---A-GAT-GG-----------------T--C-T--CCTT----TC-TTT-G-A-T----A----T-----C-CT----C---G--C--G----G-G---C-----CC-T----T-------------GGC-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80562 : T-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CT-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80563 : T-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTG----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CT-T----T-------------A-CTT-G-A-CC-ATT-G--TCA-G----TTT-CTAGT
gi|80564 : T-A----C---AAGAT-G------------------T--C-A---TTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-TC----A---AG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-TGG--TCA-GT-T-TTT-CTAGT
gi|80565 : T-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG----G----G-G-G-------CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAG
gi|80566 : -A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-AAT----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-C-C-----CCTT----T-------------G-C-TGG-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80567 : -A----C---A-GAT-T------------------T--C-A--CTTT----C--TTT-G-C-T----A---GC-----C-CA----T---GG-C--G----G-G-G-CTTTTTCC-T----T-------------G-CAT-G-A-CT-G-T----TCA-G--TGTTT-CTAGT
gi|80568 : ----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTC----GC-TTT---A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-------TC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-TGG--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80569 : T----CC-TTT-G-A-T----T---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-A-A-CC-A-C-G--TCA-T--T-TTG-CTAGT
gi|80570 : -TTT-G-A-TTTTCA---GCA----C-CT----C---GG-C--G----G-G---C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80571 : ---GC-----C-CT----C---AG-C--A----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-GTA-CT-T-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80572 : -G-G-C-----CT-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . A . T . . . . . . . T . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . A . T . . . . . . . T . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-324 ) : AAATG-C--T-T-ATT--CA-G-T-G-T-G-T--TAATT---G--A--T-A--T-GG--A-T-GT--T---A---T-A-A-T-T-C-ACAAT--T--TA-A--T-A---T-----AG----T-T-T--C-ACA---T-A-T-A--CC--A-G-T--A-----CT----A---A-A-C--AT----TT-C----------T---G-T-------A-TCA--------A-AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-G--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
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gi|80557 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CT-T----T-------------A-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80558 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---AC-----C-CT----C---AG-C--G----GTG-GCC-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80559 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--A-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CC----C---GG-C--G----G-G-GCC-----CC-T----T-------------G-T-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CGAGT
gi|80560 : -AT-A----C---A-GAT-G------------------T--C-AT-CTTT----CC-TTT-G-A-TGT--A---AC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-TT
gi|80561 : -AT-A----C---A-GAT-GG-----------------T--C-T--CCTT----TC-TTT-G-A-T----A----T-----C-CT----C---G--C--G----G-G---C-----CC-T----T-------------GGC-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80562 : T-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CT-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80563 : T-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTG----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CT-T----T-------------A-CTT-G-A-CC-ATT-G--TCA-G----TTT-CTAGT
gi|80564 : T-A----C---AAGAT-G------------------T--C-A---TTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-TC----A---AG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-TGG--TCA-GT-T-TTT-CTAGT
gi|80565 : T-A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-A-T----A---GC-----C-CT----C---GG----G----G-G-G-------CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAG
gi|80566 : -A----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTT----CC-TTT-G-AAT----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-C-C-----CCTT----T-------------G-C-TGG-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80567 : -A----C---A-GAT-T------------------T--C-A--CTTT----C--TTT-G-C-T----A---GC-----C-CA----T---GG-C--G----G-G-G-CTTTTTCC-T----T-------------G-CAT-G-A-CT-G-T----TCA-G--TGTTT-CTAGT
gi|80568 : ----C---A-GAT-G------------------T--C-A--CTTC----GC-TTT---A-T----A---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-------TC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-TGG--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80569 : T----CC-TTT-G-A-T----T---GC-----C-CT----C---GG-C--G----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-A-A-CC-A-C-G--TCA-T--T-TTG-CTAGT
gi|80570 : -TTT-G-A-TTTTCA---GCA----C-CT----C---GG-C--G----G-G---C-----CC-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80571 : ---GC-----C-CT----C---AG-C--A----G-G-G-C-----CC-T----T-------------G-C-T-GTA-CT-T-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
gi|80572 : -G-G-C-----CT-T----T-------------G-C-T-G-A-CC-A-T-G--TCA-G--T-TTT-CTAGT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|80535 ): TAATTTGTGAACACTATAACTCAAAATCTATAAATTTTACTTAACTTTTGCAAACTTGTTTATCCCCATATGCAGATGTGTACATTAAAACATTTGCCTCAGCAGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAGTGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80538 ): TGTGAACACTATAACTCAAAATCTATACATTTTACTTGACTGAAATTTTGCAAATATGCAGATGTGTACATTAAAATATTTGCCTCATCGGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAGTGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80545 ): TATAATTCAAAATCTAGAAATGGTACTTAACCGAAATTTTGCAAACTTGTTTATCACCATATGCAGATGTGTACATTAAAATATTTGCTTCAGCGGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAGTGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80536 ): TGTGAACACTATAAACTCAAAATCTATAAATTTTACTTAACTTTTGCAAACTTGTTTATCCCCATATGCAGATGTGTACATTAAAACATTTGCCTCAGCAGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAGTGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80551 ): AACTTCTTTGTCACCATATGCAGATGTGTACATTAAAACATTTTCCTCAGCGGGGCCCTTGTTGACTTTGCCAGTGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80539 ): TGTGAACACTATAATTCAAAATCTACCGTATAATTGGTACTTAACTGAAATTTGGCAAACTGGTTTGTCACCATATACAGATGTGTATATTAAAATAATTGCTTCAGCGGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAATGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80553 ): TGTATATGCAGATGTGTACATTAAAACATTTGCCTCAGCGGTGCCCTTGCTGACTTTGTCAGTGTTCTAGT
Unaligned ( gi|80541 ): TGTGAACACTATAATTCAAAATCTCTAAATTTTTCTAACTTTTGCAAACTTGTTTATCACCACATGCAGATGTGTACATTAAAACATTTGCCTCAGCAGGGCCCTTGCTGACTTTGTCAGTGTTTTAGT