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lowQualScore                  :      66  2    0  111111      4  22 22 666   9 9  9 9    11111111 8  88  8 8      8  8 8 333 8    8 333333  777777 111 4444    7  11  444 7 00 7 88 00  8  88  8 8 8 444   66 8   8 444 666666 444  00000 5555  8   8 8   9999999 4 000000 8888   6    0   44  666  33  0000000000   3 3    4     
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Reference ( gi|102672 )       :  ATGT--GGCAGTG-TG--T---GATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGC-C---A------G---AG-----GA---CC-CGG-G-TTC-----A-AAT------C----CCAGCAGA-GGC--ATG-GAA--AA--T-------GTC-T-CTGT-TACAT
gi|102651                     :  ATGT--GGCAGTG-TG--A---GATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-A-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGT-C---A------G---AG-----GT---CC-CGG-G-TTC-----G-AAT------C----CCAGCAGA-GAC--ATG-G-A--AA--T-------GTC-T-CTGT-TACAT
gi|102674                     : aATGT--GATAGTG-TG--A---AATACA-GG--T--C---TTC-G-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TTGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGC-T---A------G---AG-----GA---CC-TGG-G-TTC-----A-AAT------C----CCATCAGA-GGC--ATG-AAA--AA--T-------GTC-T-CTGC-TACAT
gi|102648                     :  ATGT--GGTAGTG-TG--T---GATATA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCTT-T------TA------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GCT--G-TGC-C---A------G---AG-----GT---CC-CGG-G-TTC-----G-ATC------C----TCAGCAGA-GGC--AT--GAA--AA--T-------ATC-T-CTGT-TACA
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gi|102666                     : aATGT--GATTGTG-TGAGT---GATA-A-TG--C--A---TTC-C-TA-C-T-----------------GG-C-TAGTGA-GT-T-A---A-TCCT-T------TA------G---A----TTGA-TT--GA---T-A--G-A--G--TG-GT--GG-A-C-T---TGT--G-TGT-C---A------G---A------AA---CC-CAG-G-CTC-----A-AAT------C----CCATCAGT-GGC--AT--AAA--AA--T-------GTC-T-Ct
gi|102676                     : aATAT--GGTAGTG-TT--A---GATATA-TG--A--C---GT----TA-C-TGGA--------T-CT--GG-T-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TTGA-TC--AG---C-A--G-A--T--CA-CT--GG-A-T-T---GTT--G-TGT-G---A------A---AG-----AT---CC-CGG-G-TTC-----G-ATT------C----CCATCAGG-AAC--AT
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gi|102665                     : aATGT--GGTAGTG-TG--A---GTTGCA-AC--C--C---TAC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------A---C----TCGA-TC--GG---T-C--G-A--GCCCA-CT--AT-A-C-T---
gi|102668                     : aATGTCGGGTAGTA-TG--A---GA-ACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-AAGC--------T-CT--GG-C-TCGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TCTTGG---T-A--G-
gi|102678                     : aATGT--GGTAGTG-TA--G---AAAACA-AG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GC-C-TATTAG-AT-T-A---A-CCCT-G------TA------
gi|102669                     :  ATGT--GGTAGTG--G--TA--GATACATGA--C--C---TTC-C-TA-T-TGGC--------T-CT--GA-C-TAGTGG-GT-T-A---A-
gi|102679                     : aATAT--GGTAGTG-TT--A---GACACACAA--C--C---TTG-A--A-G-TAGC--------T-TT--GG-C-TAGTAG-TT-T-A---A-CCCT-T------TC------G---T----TCAA-TC--AT---A-A--G-A--G--CA-CT--AG-A-
gi|102680                     :  ATGT--GCTAGTG-TT--A---GATACA-GA--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-C
gi|102664                     :  ATGT--GGTAGTG--G--AAAAGATACACGA--C--C---TTC-C-TA-T-TGGC--------T-CT--GA-C-GAGCGG-GT-T-A---
gi|102681                     :  aTGT--GGTAGTG-TG--A---GATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-C-TAGCGG-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TT--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGC-C---A------G---AG-----GA---CC-CGG-G-TTC-----A-AAT------C----CCAGCTGA-GGC--ATG-AAA--AA--T-------GTT-T-CTGT-TACAT
gi|102682                     :   TGT--GGTAGTG-TA--G---AAAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGCTGAGTAGCT-CT--GG-C-TAGTGG-AT-T-A---A-CCCT-G------TA------G---C----TCAA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGC-C---AG-----G---AG-----GT---CT-CGG-G-TTC-----G-ATC------C----TCAGCAGA-GGC--AC----A--AACCT-------GTC-T-CTGT-TACA
gi|102683                     :   TGT--GGCAGTG-TG--T---GATACA-GG--CGGCGGGTTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT---G-C-TAGTGG-TT-T-ATACG-CCCT-TTTA---TG------G---C----TCGA-TC--GGGGAT-A--ATA--A--CA-CTGGGG-A-C-T---GTT--G-TGC-C---A------G---AG-----GA---CCGCGG-GTTTC-----ATAATGGGGAACTACACCAGCAGA-GGCGGATG-AAA--
gi|102684                     :   TGT--GGTAGTG-CT--A---GATATATGG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGT--------T-TT--GG-T-TAGTGG-GC-T-A---A-TCTA-T------TA------A---A----TCGA-TC--TGAA-C-A--G-A--G--CA-CT--AG-A-CAT---CTT---------------------------------------GA-G-TTC-----A-ATT------C----TCAACCGA-GGC--
gi|102687                     :   TGT--GGTAGTG-CT--A---GATACATGG--C--C---TTC-T-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GC-T-A---A-CCTA-T------TA------A---A----TCAA-
gi|102654                     :    GT--GGTAGTG-TG--A---GATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAATGG-AT-T-A---G-CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TT--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-A-T---GTT--C-TGC-T---A------G---AG-----GA---CC-CGG-G-TTC-----A-AAT------C----CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AA--T-------GTC-T-CTGT-TACA
gi|102671                     : aagGT--GGTAGTG--G--TA--GATACA-TGAAC--C---TTC-C-TA-T-TGGC--------T-CT--GA-C-TAGTGG-GT-T-A---A-
gi|102688                     :  aaaT--GGTAGTG-TA--G---AAAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TACC--------T-CT--GG-G-TAGTGC-GT-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TCGA-
gi|102670                     :         GCAGTGGTG--TTC-AATACATGA--C--C---TTC-C-TA-C-TAG---------------------------------------------------A------G---C----TCAA-AC--CA---C-C--G-A--G--CA-TT--GG-C-C-C---ATC--G-TGT-C---G------G---AG-----GT---CC-TGG-G-TTC-------GAT------C----C
gi|102691                     :        aatAGTG-TG--A---GATACA-GG--C--C---TTC-CCTG-C-TAGC--------T-CG--GG-C-TA-TGG--------------TT-T------TA------G---T----CTGA-TC--AG---T-A--A-A--G--CA-CA--GG-A-C-T---GTC--A-TGT-C---A------G---AG-----GA---CG-CGG-G-TTC-----A-AAT------T----CCAACAGA-GGC--ATG-AAA--AA--T-------GTC-C-CTGT-TACAt
gi|102690                     :           AGTG-TG------AATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-CGTAGC--------T-CT--G--C-TACTGG--T-T-A---A-CCCT-T------TA------G---C----TC-A-TC--GA---T-A--G-AT-G--CACCT--GGCA-C-----GTA--G-C-C-C---AT-----GTTTAG-----GT---CC-TGG-A-TTCATGCAA-AAT------C----CCA-CAGA-GGC--A-A-CAA--AC--TC------GTCTT-CTGTATACA
gi|102689                     :           tGTG-CG--A---GATG-A-GG--G--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-A-GAGTAG-GT-T-A---A-CCCA-T------TA------G---C----TCCA-TA--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-C-C-T---ATC--A-TGC-G---A------G---AA-----GG---CC-CGG-G-TTC-----A-AAT------C----CC
gi|102667                     :          tgGTG-AG--T---GATA-A-TG--C--A---TTC-C-TA-C-TGGC---------------G---TAGTGA-GT-T-A---A-TCCT-T------TA------G---A----T-GA-TT--GA---T-A--G-A--G--TG-GT--G--A-C-T---TGT--G-TGT-C---A------G---AA------A---CC-CAG-G-CTC-----A-AAT------C----CCATCAGT-GGC--AT--AAA--AA--T-------GTC-T-CCGT-TACA
gi|102663                     :        aatgtgttgt--T---GAT----GG--C--C---TTC-T-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGT-G-GC-T-A---A-C------------A------GATAA----TCAA-TC---T---T-A--C-ATGG--CA-CTC-GG-ATC-T---G-T--G-TGC-C--------------AG-----GATT-CT-CGA-G-TTC-----G-AAT------C----TCAAC
gi|102686                     :     aatgatggtaagtgctaagaATA-A-GG--C--T---TTCAC-TA-T-CAGT--------A-ATAAGG-C-GAGTAG-TT-C-A---A-CCCT-T-------A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-TC--TG-A-C-T---ATC--A-TGT-CGAAA------G---AA-----GG---GC-CGG-G-TTC-----A-AAT------
gi|102685                     :        tgtgtgtaggccttgtacgaaA-GG--T--C---TTC---TA-C-TAAC--------T-A---AG-C-GAGTAA-GT-T-A-----CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--TG-A-C-T---ATC--A-TGC-G---A------G---AG-----GG---CC-CGG-G-TTC-----A-AAT------gctctcag
gi|102692                     :      tatggtaggccttgtacgaaatca-GA--C--C---TTC---TA-T-T--C--------TACT--GGACGCAGTGG-GT-T-A---AGCCCT-T------TA------GG--C----TCGAGTC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGC-C---AC-----G---AG-----GA---CC-CAG-G-TTT-----C-AAT------C----CCATCAGATTGC--ATGAAAA--AA--T-------GTC-T--TGT-TACATgttcag
gi|102693                     :                                             -C-TATC-TAGC--------T-TTT-GG-C-TAGTAGCGC-T-A-----CCCTAC------TA------T---CCAAATCTA-TC--TA---C-A--G-A--G--CA-CT--AG-A-C-T---GTTTAG-TGCTC---ATTATTCG---AT-----CA---C----G-G-TTC-----G-ATT------C----TCAACAGA-AGC--AT----A--AC--C-------ATC-TCCTGT-TTCAT
gi|102694                     :                                                  -C-TTGT--------T-CT--AG-T-TAGTGG-GT-TTA---A-GCCT-C------TA------G---C----TTGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CG-CT--GG-A-C-A---GTC--A-TGC-C---A------G---AT-----GT---TC-CCG-G-TTC-----G-A-------------TCACCAGA-GGC--
gi|102695                     :                                                        C--------T-TT--AG-C-TAGTGG-GT-G-A---A-CATT-T------TT------G---C----TCAA-TC--TG---T-A--G-A--G--CA-CC--GG-A-G-T---ACC--A-TGC-C---A------G---AG-----GT---TG-CGG-G-TTT-----G-AAT------A----TCAAATGA-GGC--ATG-AAC--CA----------G---T-CTGT-TACAT
gi|102696                     :                                                                  -CT--GG-C-TAGTAG-GT-T-A---A-CC-T-G------TA------A---CA---TCAA-TT--CG---T-ACAG-A--G--CA-CT--AG-A-C-C---GTT--G-TGC-C---A------G---AG-----AT---CT-CGA-G-TTC-----G-ATT------CAG--CCAG
gi|102697                     :                                                                    T--GG-G-CAGTGG-ATAT-C---A-GCCT-GGA----TA------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC--TG-A-C-TA--GTA--A-TGC-----A------G---GG-----GT---CC-CGG-G-TTC-----G-ATT------C----Ctctctgtttcat
gi|102698                     :                                                                           -TAGTGG-GC-C-A------CCT-T------AA------G---C----TAAA-TT--TG---T-A--G-A--C--CA-CT--GG-A-C-T---ATT--G-TAC-T---A------G---AG-----GT---CT-CAA-T-TTT-----G-ATT------C----TAAGCAGA-GGC--------A--AA--T-------G-----CTGT-tggttcagc
gi|102699                     :                                                                                GG-GT-T-A-----CCCT-T------TA------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GCT--G-TGC-C---A------G---AG-----G----TC-CGG-G-TTC-----G-ATC------C----TCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AA----------GTC-T-CTG
gi|102700                     :                                                                                       -A---A-CCCT-G-------A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-C---TTC--G-TGC-G---A------G---AG-----TG---CC-CGG-T-TTC-----A-ATC------C----CCATCAGA-G----ATA-AAACGAA--T-------GTA-T-CTGT-AACAT
gi|102701                     :                                                                                       -A---A-CCCC-T------GA------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-C---CTTC-GTTGC-G---A------G---AG-----TG---CC-CGGTT-TTC-----A-AATC-----C----CCATCAGA-G----ATA-AAACGAA--T-------GTA-T-CTGT-AACAT
gi|102704                     :                                                                                                    ------TA------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC--TG-A-C-TA--GTA--A-TGC-----A------G---GG-----GT---CC-CGG-G-TTC-----G-ATT------C----CCGG
gi|102703                     :                                                                                                    ------TA------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC--TG-A-C-TA--GTG--A-TG--C---A------G---GG-----GT---CC-TGG-G-TTC-----G-ATT------C----CCGG
gi|102702                     :                                                                                                    ------TA------G---C----TC-A-GC--GG---TTA--G-A--G--CA-CC--TG-A-C-T---GGTA-A-TG--C---A------G---GG-----GT---CC-CAG-G-TTC-----G-ATT------C----CC
gi|102705                     :                                                                                                    ------TA------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC--TG-A-C-TAGAGAT--G-----C---A------G---GG-----GT---CC-CGG-G-TTC-----G-ATT------C----CCGG
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gi|102707                     :                                                                                                                            CGA-TC--AG---A-A--G-A--G--CA-CT--GG-A-C-T---GTT--G-TGC-C---A------G---AG-----GA---CC-CAG-A-TTC-----A-ATT------C----CCAGCAAA-
gi|102708                     :                                                                                                                                      ---T-A--G-A--G--CA-CT--AG-A-T-T---GTT--G-TGC-C---T------G---AG-----AT---CT-CGA-G-TTC-----G-ATT------C----TCAACTGA-GGC--TT-------AA--TTACGCCAGTC-T-CTGT-TTCAT
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Alignments
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lowQualScore                  :       1 11 1   0 3333  0 22  111 22     6  11 11 111   0 0  0 0    33333333 0  22  0 0      0  0 0 111 0    0 333333 111 444444 222 3333    0  11  333 0 22 0 11 11  0  0  11 0  444   22 0  22222222 0 111 444444 111   1  0   0    444444444  1 0 222   2    1   11  00   33   4444444   1     1     
lowQualScore                  :       . .. .   . ....  . ..  ... ..     .  .. .. ...   . .  . .    ........ .  ..  . .      .  . . ... .    . ...... ... ...... ... ....    .  ..  ... . .. . .. ..  .  .  .. .  ...   .. .  ........ . ... ...... ...   .  .   .    .........  . . ...   .    .   ..  ..   ..   .......   .     .     
lowQualScore                  :       0 33 0   9 9999  9 55  666 55     2  22 22 666   9 9  9 9    00000000 8  88  8 8      8  8 8 333 8    8 999999 333 666666 000 3333    7  00  333 7 00 7 88 00  7  7  88 7  333   55 7  77777777 8 333 444444 333   0  8   8    999999999  7 8 555   3    0   44  22   22   1111111   2     3     
consensus                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GANT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
Reference ( family-317 )      :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGNCC-CGG-GTTC---------GANT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
gi|102648                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GT---G--ATATA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCTT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GCT--G-TG--------C-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--ATG--AA--AAT-------ATC-TCTGT-TACA
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gi|102659                     :   aATG-T--G-GTA-G----TG-C--GA---G--ATACA-T---C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-TT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCGT-T------T---ACATGTAG---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CTATCTGA-CGC--ATA-ATA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
gi|102660                     :   aATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAG-----------------------------------------------------------------C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-GT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-TGC-GTTC---------AAAT-C---CCATCAGA-TGC--ATG-AAA--A
gi|102661                     :   aATG-T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCG-------------AAG----G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------T-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--t
gi|102662                     :   aATA-T--G-GTA-G----TG-C--TA---G--ATGCATGG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CTC-GG-C-TAGTGG--C-T-A---A-CATA-T------T---A------A---A----TCAA-TC--TG---T-ACAG-A--G--CA-CT-CG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---ATATCT-CGA-GTTC---------GATT-C---TCAACcccaggttcgatcctcagcagaggcacaaacttgtctctgttacat
gi|102663                     :   aATGAT--G-GTAAG----TGCT--AA---G--ATGAT-GG--C--C---TTC-T-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGT-G-GC-T-A---A-C---------------A------GATAA----TCAA-TC---T---T-A--C-ATGG--CA-CTCGG--ATCT---G-T--G-TG--------C-C---A------G---GATTCT-CGA-GTTC---------GAAT-C---TCAAC
gi|102664                     :   aATG-T--G-GTA-G----TG----GAAAAG--ATACACGA--C--C---TTC-C-TA-T-TGGC--------T-CT--GA-C-GAGCGG-GT-T-A---
gi|102665                     :   aATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--TTGCA-AC--C--C---TAC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------A---C----TCGA-TC--GG---T-C--G-A--GCCCA-CT-AT--A-CT---
gi|102666                     :   aATG-T--G-ATT-G----TG-T--GA---GTGATA-A-TG--C--A---TTC-C-TA-C-T-----------------GG-C-TAGTGA-GT-T-A---A-TCCT-T------T---A------G---A----TTGA-TT--GA---T-A--G-A--G--TG-GT-GG--A-CT---TGT--G-TG--------T-C---A------G---A-AACC-CAG-GCTC---------AAAT-C---CCATCAGT-GGC--AT--AAA--AAT-------GTC-TC
gi|102667                     :   aATG-T--G-TT--G----TG-T--GA---GTGATA-A-TG--C--A---TTC-C-TA-C-TGGC---------------G---TAGTGA-GT-T-A---A-TCCT-T------T---A------G---A----T-GA-TT--GA---T-A--G-A--G--TG-GT-G---A-CT---TGT--G-TG--------T-C---A------G---AA-ACC-CAG-GCTC---------AAAT-C---CCATCAGT-GGC--AT--AAA--AAT-------GTC-TCCGT-TACA
gi|102668                     :   aATG-TCGG-GTA-G----TA-T--GA---G--A-ACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-AAGC--------T-CT--GG-C-TCGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TCTTGG---T-A--G-
gi|102669                     :   aATG-T--G-GTA-G----TG-G--TA---G--ATACATGA--C--C---TTC-C-TA-T-TGGC--------T-CT--GA-C-TAGTGG-GT-T-A---A-
gi|102670                     :   aATG-C--A-GTG-G----TG-T--TC---A--ATACATGA--C--C---TTC-C-TA-C-TAG------------------------------------------------------A------G---C----TCAA-AC--CA---C-C--G-A--G--CA-TT-GG--C-CC---ATC--G-TG--------T-C---G------G---AGGTCC-TGG-GTTC---------GA-T-C---C
gi|102671                     :     aG-T--G-GTA-G----TG-G--TA---G--ATACA-TGAAC--C---TTC-C-TA-T-TGGC--------T-CT--GA-C-TAGTGG-GT-T-A---A-t
gi|102672                     : aaaATG-T--G-GCA-G----TG-T--GT---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-GAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
gi|102673                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---C-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TGTCAGAGACT-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------AATC-C---TCAGCAGA-GGC--AC--AAA--TCT-------GTC-TCTGT-TGCAT
gi|102674                     :    ATG-T--G-ATA-G----TG-T--GA---A--ATACA-GG--T--C---TTC-G-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TTGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-T---A------G---AGGACC-TGG-GTTC---------AAAT-C---CCATCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGC-TACAT
gi|102675                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-TTACATGT---A------A---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GA--A-CT---GTT--G-T
gi|102676                     :    ATA-T--G-GTA-G----TG-T--TA---G--ATATA-TG--A--C---GT----TA-C-TGGA--------T-CT--GG-T-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TTGA-TC--AG---C-A--G-A--T--CA-CT-GG--A-TT---GTT--G-TG--------T-G---A------A---AGATCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCATCAGG-AAC--AT
gi|102677                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-G--GA---G--ATAGA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A-----CCCT-T------T---ACCTC--G---CGA--TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CAG-GTTC---------AAAT-C---CCATCAGA-TGC--ATG-AAA--AAT-------G---TCTGT-TACATattctttcctattaca
gi|102678                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-AG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GC-C-TATTAG-AT-T-A---A-CCCT-G------T---A------
gi|102679                     :    ATA-T--G-GTA-G----TG-T--TA---G--ACACACAA--C--C---TTG-A--A-G-TAGC--------T-TT--GG-C-TAGTAG-TT-T-A---A-CCCT-T------T---C------G---T----TCAA-TC--AT---A-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-
gi|102680                     :    ATG-T--G-CTA-G----TG-T--TA---G--ATACA-GA--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-C
gi|102681                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-C-TAGCGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TT--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CCAGCTGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTT-TCTGT-TACAT
gi|102682                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGCTGAGTAGCT-CT--GG-C-TAGTGG-AT-T-A---A-CCCT-G------T---A------G---C----TCAA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---AG-----G---AGGTCT-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--AC--AAA--CCT-------GTC-TCTGT-TACA
gi|102683                     :     TG-T--G-GCA-G----TG-T--GT---G--ATACA-GG--CGGCGGGTTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--G--C-TAGTGG-TT-T-ATACG-CCCT-T------TTATG------G---C----TCGA-TC--GGGGAT-A--ATA--A--CA-CT-GGGGA-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACCGCGG-GTTTCATAATGGGGAAC-TACACCAGCAGA-GGCGGATG-AAA--
gi|102684                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-C--TA---G--ATATATGG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGT--------T-TT--GG-T-TAGTGG-GC-T-A---A-TCTA-T------T---A------A---A----TCGA-TC--TGAA-C-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-C----------------------------------------ATCT-TGA-GTTC---------AATT-C---TCAACCGA-GGC--
gi|102685                     :     TA-T--G-GTA-GGCCTTG-TACGA---A--ATCAA-GG--T--C---TTC---TA-C-TAAC--------T-A---AG-C-GAGTAA-GT-T-A-----CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-TG--A-CT---ATC--A-TG--------C-G---A------G---AGGGCC-CGG-GTTC---------AAAT-
gi|102686                     :     TG-T--GTGTA-GGCCTTG-TACGA---A--ATA-A-GG--C--T---TTCAC-TA-T-CAGT--------A-ATAAGG-C-GAGTAG-TT-C-A---A-CCCT-T----------A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-TC-TG--A-CT---ATC--A-TG--------T-CGAAA------G---AAGGGC-CGG-GTTC---------AAAT-gttcag
gi|102687                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-C--TA---G--ATACATGG--C--C---TTC-T-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GC-T-A---A-CCTA-T------T---A------A---A----TCAA-gctctcag
gi|102688                     :       -T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TACC--------T-CT--GG-G-TAGTGC-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-
gi|102689                     :              TG-G----TG-C--GA---G--ATG-A-GG--G--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-A-GAGTAG-GT-T-A---A-CCCA-T------T---A------G---C----TCCA-TA--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--C-CT---ATC--A-TG--------C-G---A------G---AAGGCC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CC
gi|102690                     :              TA-G----TG-T--GA------ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-CGTAGC--------T-CT--G--C-TACTGG--T-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TC-A-TC--GA---T-A--G-AT-G--CACCT-GGC-A-C----GTA--G-C---------C-C---AT-----GTTTAGGTCC-TGG-ATTCATGCA----AAAT-C---CCA-CAGA-GGC--AAC-AAA--CTC-------GTCTTCTGTATACA
gi|102691                     :               A-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-CCTG-C-TAGC--------T-CG--GG-C-TA-TGG--------------TT-T------T---A------G---T----CTGA-TC--AG---T-A--A-A--G--CA-CA-GG--A-CT---GTC--A-TG--------T-C---A------G---AGGACG-CGG-GTTC---------AAAT-T---CCAACAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-CCTGT-TACA
gi|102692                     :                                         -GA--C--C---TTC---TA-T-T--C--------TACT--GGACGCAGTGG-GT-T-A---AGCCCT-T------T---A------GG--C----TCGAGTC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---AC-----G---AGGACC-CAG-GTTT---------CAAT-C---CCATCAGATTGC--ATGAAAA--AAT-------GTC-T-TGT-TACAT
gi|102693                     :                                                        -C-TATC-TAGC--------T-TTT-GG-C-TAGTAGCGC-T-A-----CCCTAC------T---A------T---CCAAATCTA-TC--TA---C-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-CT---GTTTAG-TG--------CTC---ATTATTCG---A--TCA-C-G-GTTC---------GATT-C---TCAACAGA-AGC--AT--AAC--CAT-------CTC--CTGT-TTCAT
gi|102694                     :                                                             -C-TTGT--------T-CT--AG-T-TAGTGG-GT-TTA---A-GCCT-C------T---A------G---C----TTGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CG-CT-GG--A-CA---GTC--A-TG--------C-C---A------G---ATGTTC-CCG-GTTC---------GAT-------CACCAGA-GGC--
gi|102695                     :                                                                   C--------T-TT--AG-C-TAGTGG-GT-G-A---A-CATT-T------T---T------G---C----TCAA-TC--TG---T-A--G-A--G--CA-CC-GG--A-GT---ACC--A-TG--------C-C---A------G---AGGTTG-CGG-GTTT---------GAAT-A---TCAAATGA-GGC--ATG-AAC--CA--------G---TCTGT-TACAT
gi|102696                     :                                                                             -CT--GG-C-TAGTAG-GT-T-A---A-CC-T-G------T---A------A---CA---TCAA-TT--CG---T-ACAG-A--G--CA-CT-AG--A-CC---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-CAG-CCAG
gi|102697                     :                                                                               T--GG-G-CAGTGG-ATAT-C---A-GCCT-GGA----T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---Ctctctgtttcat
gi|102698                     :                                                                                      -TAGTGG-GC-C-A------CCT-T------A---A------G---C----TAAA-TT--TG---T-A--G-A--C--CA-CT-GG--A-CT---ATT--G-TA--------C-T---A------G---AGGTCT-CAA-TTTT---------GATT-C---TAAGCAGA-GGC--------A--AAT-------G----CTGT-tggttcagc
gi|102699                     :                                                                                           GG-GT-T-A-----CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GCT--G-TG--------C-C---A------G---AGGT-C-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AA--------GTC-TCTG
gi|102700                     :                                                                                                  -A---A-CCCT-G----------A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CC---TTC--G-TG--------C-G---A------G---AGTGCC-CGG-TTTC---------AATC-C---CCATCAGA-G----ATA-AAACGAAT-------GTA-TCTGT-AACAT
gi|102701                     :                                                                                                  -A---A-CCCC-T------G---A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CC---CTTC-GTTG--------C-G---A------G---AGTGCC-CGGTTTTC---------AAATCC---CCATCAGA-G----ATA-AAACGAAT-------GTA-TCTGT-AACAT
gi|102702                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TC-A-GC--GG---TTA--G-A--G--CA-CC-TG--A-CT---GGTA-A-TG----------C---A------G---GGGTCC-CAG-GTTC---------GATT-C---CC
gi|102703                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTG--A-TG----------C---A------G---GGGTCC-TGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102704                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
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Reference ( family-317 )      :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GANT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
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gi|102677                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-G--GA---G--ATAGA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A-----CCCT-T------T---ACCTC--G---CGA--TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CAG-GTTC---------AAAT-C---CCATCAGA-TGC--ATG-AAA--AAT-------G---TCTGT-TACATattctttcctattaca
gi|102678                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-AG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GC-C-TATTAG-AT-T-A---A-CCCT-G------T---A------
gi|102679                     :    ATA-T--G-GTA-G----TG-T--TA---G--ACACACAA--C--C---TTG-A--A-G-TAGC--------T-TT--GG-C-TAGTAG-TT-T-A---A-CCCT-T------T---C------G---T----TCAA-TC--AT---A-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-
gi|102680                     :    ATG-T--G-CTA-G----TG-T--TA---G--ATACA-GA--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-C
gi|102681                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-C-TAGCGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TT--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CCAGCTGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTT-TCTGT-TACAT
gi|102682                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGCTGAGTAGCT-CT--GG-C-TAGTGG-AT-T-A---A-CCCT-G------T---A------G---C----TCAA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---AG-----G---AGGTCT-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--AC--AAA--CCT-------GTC-TCTGT-TACA
gi|102683                     :     TG-T--G-GCA-G----TG-T--GT---G--ATACA-GG--CGGCGGGTTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--G--C-TAGTGG-TT-T-ATACG-CCCT-T------TTATG------G---C----TCGA-TC--GGGGAT-A--ATA--A--CA-CT-GGGGA-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACCGCGG-GTTTCATAATGGGGAAC-TACACCAGCAGA-GGCGGATG-AAA--
gi|102684                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-C--TA---G--ATATATGG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGT--------T-TT--GG-T-TAGTGG-GC-T-A---A-TCTA-T------T---A------A---A----TCGA-TC--TGAA-C-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-C----------------------------------------ATCT-TGA-GTTC---------AATT-C---TCAACCGA-GGC--
gi|102685                     :     TA-T--G-GTA-GGCCTTG-TACGA---A--ATCAA-GG--T--C---TTC---TA-C-TAAC--------T-A---AG-C-GAGTAA-GT-T-A-----CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-TG--A-CT---ATC--A-TG--------C-G---A------G---AGGGCC-CGG-GTTC---------AAAT-
gi|102686                     :     TG-T--GTGTA-GGCCTTG-TACGA---A--ATA-A-GG--C--T---TTCAC-TA-T-CAGT--------A-ATAAGG-C-GAGTAG-TT-C-A---A-CCCT-T----------A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-TC-TG--A-CT---ATC--A-TG--------T-CGAAA------G---AAGGGC-CGG-GTTC---------AAAT-gttcag
gi|102687                     :     TG-T--G-GTA-G----TG-C--TA---G--ATACATGG--C--C---TTC-T-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GC-T-A---A-CCTA-T------T---A------A---A----TCAA-gctctcag
gi|102688                     :       -T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TACC--------T-CT--GG-G-TAGTGC-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-
gi|102689                     :              TG-G----TG-C--GA---G--ATG-A-GG--G--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-A-GAGTAG-GT-T-A---A-CCCA-T------T---A------G---C----TCCA-TA--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--C-CT---ATC--A-TG--------C-G---A------G---AAGGCC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CC
gi|102690                     :              TA-G----TG-T--GA------ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-CGTAGC--------T-CT--G--C-TACTGG--T-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TC-A-TC--GA---T-A--G-AT-G--CACCT-GGC-A-C----GTA--G-C---------C-C---AT-----GTTTAGGTCC-TGG-ATTCATGCA----AAAT-C---CCA-CAGA-GGC--AAC-AAA--CTC-------GTCTTCTGTATACA
gi|102691                     :               A-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-CCTG-C-TAGC--------T-CG--GG-C-TA-TGG--------------TT-T------T---A------G---T----CTGA-TC--AG---T-A--A-A--G--CA-CA-GG--A-CT---GTC--A-TG--------T-C---A------G---AGGACG-CGG-GTTC---------AAAT-T---CCAACAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-CCTGT-TACA
gi|102692                     :                                         -GA--C--C---TTC---TA-T-T--C--------TACT--GGACGCAGTGG-GT-T-A---AGCCCT-T------T---A------GG--C----TCGAGTC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---AC-----G---AGGACC-CAG-GTTT---------CAAT-C---CCATCAGATTGC--ATGAAAA--AAT-------GTC-T-TGT-TACAT
gi|102693                     :                                                        -C-TATC-TAGC--------T-TTT-GG-C-TAGTAGCGC-T-A-----CCCTAC------T---A------T---CCAAATCTA-TC--TA---C-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-CT---GTTTAG-TG--------CTC---ATTATTCG---A--TCA-C-G-GTTC---------GATT-C---TCAACAGA-AGC--AT--AAC--CAT-------CTC--CTGT-TTCAT
gi|102694                     :                                                             -C-TTGT--------T-CT--AG-T-TAGTGG-GT-TTA---A-GCCT-C------T---A------G---C----TTGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CG-CT-GG--A-CA---GTC--A-TG--------C-C---A------G---ATGTTC-CCG-GTTC---------GAT-------CACCAGA-GGC--
gi|102695                     :                                                                   C--------T-TT--AG-C-TAGTGG-GT-G-A---A-CATT-T------T---T------G---C----TCAA-TC--TG---T-A--G-A--G--CA-CC-GG--A-GT---ACC--A-TG--------C-C---A------G---AGGTTG-CGG-GTTT---------GAAT-A---TCAAATGA-GGC--ATG-AAC--CA--------G---TCTGT-TACAT
gi|102696                     :                                                                             -CT--GG-C-TAGTAG-GT-T-A---A-CC-T-G------T---A------A---CA---TCAA-TT--CG---T-ACAG-A--G--CA-CT-AG--A-CC---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-CAG-CCAG
gi|102697                     :                                                                               T--GG-G-CAGTGG-ATAT-C---A-GCCT-GGA----T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---Ctctctgtttcat
gi|102698                     :                                                                                      -TAGTGG-GC-C-A------CCT-T------A---A------G---C----TAAA-TT--TG---T-A--G-A--C--CA-CT-GG--A-CT---ATT--G-TA--------C-T---A------G---AGGTCT-CAA-TTTT---------GATT-C---TAAGCAGA-GGC--------A--AAT-------G----CTGT-tggttcagc
gi|102699                     :                                                                                           GG-GT-T-A-----CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GCT--G-TG--------C-C---A------G---AGGT-C-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AA--------GTC-TCTG
gi|102700                     :                                                                                                  -A---A-CCCT-G----------A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CC---TTC--G-TG--------C-G---A------G---AGTGCC-CGG-TTTC---------AATC-C---CCATCAGA-G----ATA-AAACGAAT-------GTA-TCTGT-AACAT
gi|102701                     :                                                                                                  -A---A-CCCC-T------G---A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CC---CTTC-GTTG--------C-G---A------G---AGTGCC-CGGTTTTC---------AAATCC---CCATCAGA-G----ATA-AAACGAAT-------GTA-TCTGT-AACAT
gi|102702                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TC-A-GC--GG---TTA--G-A--G--CA-CC-TG--A-CT---GGTA-A-TG----------C---A------G---GGGTCC-CAG-GTTC---------GATT-C---CC
gi|102703                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTG--A-TG----------C---A------G---GGGTCC-TGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102704                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102705                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTAGAGAT--G-------------C---A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102706                     :                                                                                                                      ---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102707                     :                                                                                                                                          CGA-TC--AG---A-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CAG-ATTC---------AATT-C---CCAGCAAA-
gi|102708                     :                                                                                                                                                    ---T-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-TT---GTT--G-TG--------C-C---T------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-C---TCAACTGA-GGC--TT-------AATTACGCCAGTC-TCTGT-TTCAT
gi|102709                     :                                                                                                                                                        -A--G-A--G--CA-CT-AG--A-TT---ATT--G-TG--------C-C---A------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-C---TCAACTGA-GGC--
gi|102710                     :                                                                                                                                                                                       T--G-TA--------A-C---A------G---A--TCC-TGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GAC--AC--AAA--CCT-------GTC-TCTGT-TACAT
gi|102711                     :                                                                                                                                                                                       T--G-TG--------C-C---A------A---AGGACC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CCATCTGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT


blockSeqs                     :         CG       GCCT    AC  AAA TG     T  AA GG GGG               TGAGTAGC    AA                  TAC        TACATG TAT CATGTA ATA CAAA       TT  GGA   CA   TG CC        GG    AGA   TA    TCAGAGAC   GAA TTATTC TTT   T           CATAATGGG  T   ACA   G    T   GG  GA   CG   TACGCCA   T     A
blockSeqs                     :         .        GCCT    AC  .   TG     C  .  .  .                 .           C                   .          GA     .   CCTC   G   GA         .   TA    CA   T  .         C     A     C     .          .   G      .     T           ATGCA      T   AG    G    .   .   G    CG   .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      T  .  .  .                 .           T                   .          C      .   AG     .   A          .   AA    .    .  .         .     A     A     .          .   T      .     T           .          A   .     G    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      T  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     A     .     .          .   C      .     T           .          T   .     C    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      C  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     A     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      T  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     G    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      T  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   A    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     A    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     A    .   .   C    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     G    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          T   .     G    .   .   A    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     T    .   .   A    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          T   .     T    .   .   G    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     T    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     G    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          T   .     G    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     G    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     G           .          T   .     A    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     G           .          A   .     A    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     G           .          A   .     T    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     A    .   .   .    .    .         .     .
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     C    .   .   .    .    .         .      
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     A           .          A   .     A    .   .   .    .    .         .      
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     G    .   .   .    .                     
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .   .    .                     
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .                              
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          A   .     T    .   .                              
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     T    .   .                              
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .                              
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G    .   .                              
blockSeqs                     :         .        .       .   .   .      .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     G           .          T   .     G    .                                  
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blockSeqs                     :                                         .  .  .  .                 .           .                   .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     T           .          T   .     G                                       
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blockSeqs                     :                                                                                                    .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     .           .          A                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                    .          .      .   .      .   .          .   .     .    .  .         .     .     .     .          .   .      .     .           .          .                                                 
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blockSeqCons                  :    
originalCons                  :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GANT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
finalCons                     :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GANT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT





Alignments
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lowQualScore                  :       . .. .   . ....  . ..  ... ..     .  .. .. ...   . .  . .    ........ .  ..  . .      .  . . ... .    . ...... ... ...... ... ....    .  ..  ... . .. . .. ..  .  .  .. .  ...   .. .  ........ . ... ...... ...   .  .   .    .........  . . ...   .    .   ..  ..   ..   .......   .     .     
lowQualScore                  :       0 33 0   9 9999  9 55  666 55     2  22 22 666   9 9  9 9    00000000 8  88  8 8      8  8 8 333 8    8 999999 333 666666 000 3333    7  00  333 7 00 7 88 00  7  7  88 7  333   55 7  77777777 8 333 444444 333   5  8   8    999999999  7 8 555   3    0   44  22   22   1111111   2     3     
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Reference ( family-317 )      :    ATG-T--G-GTA-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--GG-C-TAGTGG-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGTCC-CGG-GTTC---------GANT-C---CCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT
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gi|102688                     :       -T--G-GTA-G----TG-T--AG---A--AAACA-GG--C--C---TTC-C-TA-C-TACC--------T-CT--GG-G-TAGTGC-GT-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-
gi|102689                     :              TG-G----TG-C--GA---G--ATG-A-GG--G--C---TTC-C-TA-C-TAGC--------T-CT--AG-A-GAGTAG-GT-T-A---A-CCCA-T------T---A------G---C----TCCA-TA--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--C-CT---ATC--A-TG--------C-G---A------G---AAGGCC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CC
gi|102690                     :              TA-G----TG-T--GA------ATACA-GG--C--C---TTC-C-TA-CGTAGC--------T-CT--G--C-TACTGG--T-T-A---A-CCCT-T------T---A------G---C----TC-A-TC--GA---T-A--G-AT-G--CACCT-GGC-A-C----GTA--G-C---------C-C---AT-----GTTTAGGTCC-TGG-ATTCATGCA----AAAT-C---CCA-CAGA-GGC--AAC-AAA--CTC-------GTCTTCTGTATACA
gi|102691                     :               A-G----TG-T--GA---G--ATACA-GG--C--C---TTC-CCTG-C-TAGC--------T-CG--GG-C-TA-TGG--------------TT-T------T---A------G---T----CTGA-TC--AG---T-A--A-A--G--CA-CA-GG--A-CT---GTC--A-TG--------T-C---A------G---AGGACG-CGG-GTTC---------AAAT-T---CCAACAGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-CCTGT-TACA
gi|102692                     :                                         -GA--C--C---TTC---TA-T-T--C--------TACT--GGACGCAGTGG-GT-T-A---AGCCCT-T------T---A------GG--C----TCGAGTC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---AC-----G---AGGACC-CAG-GTTT---------CAAT-C---CCATCAGATTGC--ATGAAAA--AAT-------GTC-T-TGT-TACAT
gi|102693                     :                                                        -C-TATC-TAGC--------T-TTT-GG-C-TAGTAGCGC-T-A-----CCCTAC------T---A------T---CCAAATCTA-TC--TA---C-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-CT---GTTTAG-TG--------CTC---ATTATTCG---A--TCA-C-G-GTTC---------GATT-C---TCAACAGA-AGC--AT--AAC--CAT-------CTC--CTGT-TTCAT
gi|102694                     :                                                             -C-TTGT--------T-CT--AG-T-TAGTGG-GT-TTA---A-GCCT-C------T---A------G---C----TTGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CG-CT-GG--A-CA---GTC--A-TG--------C-C---A------G---ATGTTC-CCG-GTTC---------GAT-------CACCAGA-GGC--
gi|102695                     :                                                                   C--------T-TT--AG-C-TAGTGG-GT-G-A---A-CATT-T------T---T------G---C----TCAA-TC--TG---T-A--G-A--G--CA-CC-GG--A-GT---ACC--A-TG--------C-C---A------G---AGGTTG-CGG-GTTT---------GAAT-A---TCAAATGA-GGC--ATG-AAC--CA--------G---TCTGT-TACAT
gi|102696                     :                                                                             -CT--GG-C-TAGTAG-GT-T-A---A-CC-T-G------T---A------A---CA---TCAA-TT--CG---T-ACAG-A--G--CA-CT-AG--A-CC---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-CAG-CCAG
gi|102697                     :                                                                               T--GG-G-CAGTGG-ATAT-C---A-GCCT-GGA----T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---Ctctctgtttcat
gi|102698                     :                                                                                      -TAGTGG-GC-C-A------CCT-T------A---A------G---C----TAAA-TT--TG---T-A--G-A--C--CA-CT-GG--A-CT---ATT--G-TA--------C-T---A------G---AGGTCT-CAA-TTTT---------GATT-C---TAAGCAGA-GGC--------A--AAT-------G----CTGT-tggttcagc
gi|102699                     :                                                                                           GG-GT-T-A-----CCCT-T------T---A------G---C----TCGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GCT--G-TG--------C-C---A------G---AGGT-C-CGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GGC--ATG-AAA--AA--------GTC-TCTG
gi|102700                     :                                                                                                  -A---A-CCCT-G----------A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CC---TTC--G-TG--------C-G---A------G---AGTGCC-CGG-TTTC---------AATC-C---CCATCAGA-G----ATA-AAACGAAT-------GTA-TCTGT-AACAT
gi|102701                     :                                                                                                  -A---A-CCCC-T------G---A------C---C----TGGA-TC--GG---T-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CC---CTTC-GTTG--------C-G---A------G---AGTGCC-CGGTTTTC---------AAATCC---CCATCAGA-G----ATA-AAACGAAT-------GTA-TCTGT-AACAT
gi|102702                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TC-A-GC--GG---TTA--G-A--G--CA-CC-TG--A-CT---GGTA-A-TG----------C---A------G---GGGTCC-CAG-GTTC---------GATT-C---CC
gi|102703                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTG--A-TG----------C---A------G---GGGTCC-TGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102704                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102705                     :                                                                                                               ------T---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTAGAGAT--G-------------C---A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102706                     :                                                                                                                      ---A------G---C----TCAG-TG--GT---T-A--G-A--G--CA-CC-TG--A-CTA--GTA--A-TG--------C-----A------G---GGGTCC-CGG-GTTC---------GATT-C---CCGG
gi|102707                     :                                                                                                                                          CGA-TC--AG---A-A--G-A--G--CA-CT-GG--A-CT---GTT--G-TG--------C-C---A------G---AGGACC-CAG-ATTC---------AATT-C---CCAGCAAA-
gi|102708                     :                                                                                                                                                    ---T-A--G-A--G--CA-CT-AG--A-TT---GTT--G-TG--------C-C---T------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-C---TCAACTGA-GGC--TT-------AATTACGCCAGTC-TCTGT-TTCAT
gi|102709                     :                                                                                                                                                        -A--G-A--G--CA-CT-AG--A-TT---ATT--G-TG--------C-C---A------G---AGATCT-CGA-GTTC---------GATT-C---TCAACTGA-GGC--
gi|102710                     :                                                                                                                                                                                       T--G-TA--------A-C---A------G---A--TCC-TGG-GTTC---------GATC-C---TCAGCAGA-GAC--AC--AAA--CCT-------GTC-TCTGT-TACAT
gi|102711                     :                                                                                                                                                                                       T--G-TG--------C-C---A------A---AGGACC-CGG-GTTC---------AAAT-C---CCATCTGA-GGC--ATG-AAA--AAT-------GTC-TCTGT-TACAT