lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                            2222222222222222222222222222222222222222222                               1111111                                            111111                            
lowQualScore                  :             1        1   2222 2       1 1 11      1 333 111         1   333 111 1 1   1 444444 1  11 33333 2 1    666666 1 22   1       111  33  1 11 1   1 3333333 1  444 222  1 11 1      1  333333   22 6666666666666666666666666666666666666666666 1       0   1    0 0  1  0 0  5555555 11 0 0   33   222  2 22222 1  0 11   0 22  444444  0 11 2222  11 1 0   0     
lowQualScore                  :             .        .   .... .       . . ..      . ... ...         .   ... ... . .   . ...... .  .. ..... . .    ...... . ..   .       ...  ..  . .. .   . ....... .  ... ...  . .. .      .  ......   .. ........................................... .       .   .    . .  .  . .  ....... .. . .   ..   ...  . ..... .  . ..   . ..  ......  . .. ....  .. . .   .     
lowQualScore                  :             3        3   7777 5       2 2 66      1 000 999         1   111 999 1 1   0 444444 0  44 77777 1 1    999999 0 33   0       777  33  0 44 0   0 2222222 0  222 888  0 44 0      0  555555   44 3333333333333333333333333333333333333333333 0       7   4    7 7  5  7 7  2222222 88 8 8   44   999  4 00000 6  8 11   8 22  777777  8 11 6666  11 7 9   9     
consensus                     : CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----G-CA-----GT--C-----N-----GC---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
Reference ( gi|61743 )        : CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----G-TA-----GT--C-----C-----GT---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-G-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----A-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61745                      : CGTGTCAAGGAT-CACTACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---A-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--G-CAAAAC-CA--G---ACC--T--------T----G-TA-----GT--C-----C-----GT---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-G-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61746                      : CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AATATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----T-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-TA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--G---ACC--T--------T----G-TA-----GT--C-----C-----GT---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-AATA----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61747                      : CGTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCT------GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CATTTA---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----G-TA-----AT--C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCCAAAAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CT----T-AA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61744                      : CGTGTCAAAGAT-CACAACCT-CCT----T-GGCATGC-A-A--AAGATT-G---T---TTTCCTGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-CAAAAC-CA--G---ACA--T--------T----A-CA-----GT--C-----A-----GC---T-AACTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-G--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61748                      : CGTGTCAAGAAT-CAGAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------A-AGCGT-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--AG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----A-CA-----GT--C-----A-----GC---T-AACCCCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GTC--AAA---AT-G-----A-CG-T--AAA-A--CA----A-TG-A--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61749                      : CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GCCAAGC-A-A--AAGATA-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C-----A-AAA-A------G-GG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAGC-CA--A---ACA--T--------T----A-CA-----GT--C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-A-GCT--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-AA-A--A----TA--A-T-CAT-TCAAT
gi|61750                      : CATGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----G-CA-----GT--C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTG-GAAT-G-GCGTA-A-AA-C-----A--T-T--------A---AT------------------------------TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61752                      : CGTGTCAAGGAT-C-CAACCC-CCT----A-GGCACAC-A-A--AAGATC-G---T---TT-CCTGATAGTTC--C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGAGGGGCCGT---CA--GT-G----AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--G---ACA--T--------G----GTTA-----GT--C-----C-----GT---T-AACCGCCAGTGAAAAT-G-GCTTG-A-AA-C-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CC-G--AAA-A--CATT--A-TT-A--A----TA--ATT-CAA-TCAAT
gi|61753                      : CGTGTCAAG-AT-CACAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATCCG---TACATTCCCTGAT-GTTATTC---G-AGAAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CACTGG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--GCC-ACA--T--------T----G-TC-----TTC-C-----C-----GT---TAAACCGCC-GTG-AAAT-GCGC-TG-A-AA-T-----AG-T-T-GCCA-AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CAT---T-TA-A--A----T---A-T-CAACTCAAT
gi|61751                      : CGTGTCAAGGAA-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TAA-AGACCGT---CA--GG-A--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----G-CA-----GT--C-----A-----CC---T-AACCGCC-GTG-AAA
gi|61754                      : CGTGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GTCACGC-A-A--ACGATC-G---T---TCCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGC---CAG-GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TAAAAC-CA--A---ACAATT--------T----G-CA-----GT--A-----A-----GT---T-AATCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-
gi|61756                      : CGTGT-AAGGGT-AACAACCC-CCG----TAGGCACGCCA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTG-T-GAT---C---G-A-AAA-A------ATAG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGG-GG--CGT---CA---G-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAGAGT-CA--------G--T--------T----T-TA-----A----------------------AAACGCC-GTG-ACAT-G-GC-TG-A-AA-T-----ATGT-T-GCC--AAA---CC-G-----G-CG-T---AA-A--CA----T-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAATcaat
gi|61755                      : CATGTCAAGGCT-AACAACCC-C-T----T-GGCATGC-A-A--AAAAAA-G---T---TTCCCAGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--A-----A-G-GCTC------A-T--TGG-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CACAAC-CA--A---ACA--T--------A----T-T-------T--C-----A-----GT---T-A-----C-ATGTAAAT-G-GC-TA-A-AA-T-----A--A-T-GCC--AAAAACAT-G-----T-CA-T--CAA-A--CA----T-CA-A--T----CA--A-C-CAA-TCAGT
gi|61757                      : CGTGTCATAGAT-CACAACCT-C-T----T-GGCACGC-C-A--AAGATC-G---A---TTCTCTGAG-GTT---C---A-G-GAA-A------T-AG--T-----A-G-ACTC------A-T--TG--GGGCCAT---CA--GG-G--A-AAC----------------------------CAGAAC-AA--A---ATA--T--------A----T-T-------T--C-----A-----GT---T-AAC-GCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-T-----G-CG-T--AAA-A--CG----A-CA-A--T----TA--A-T-CCA-TTAA
gi|61758                      : CGTGTCAAGGAT-CACAGCAC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-GT--T---TTCCCTGAA-GTC---T---GAA-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--
gi|61759                      : CATGTCAAGAAT-CACAGCCC-CCT----T-GACACAC-A-A--AAGATC-G---T---CTTCCTGAT-GTT---C---G-A-AGACA------A-CA--T-----A-G-TCTC------A-C--AGA-AAGCCAA---CA--GC-A--A-AAC-T-------C-CA---T---AA-C--T-CACTGC-CA--A---A-------------T----A-TA-----TT--T-----C-----A----------GCT-AT----AT-A-GC-TG-G-AA-T-----A--T-T-GAG--AAA---AT-G-----G-CG-T--A
gi|61760                      : CGTGTCAAGGAT-CAAAACCC-CCT----T-TGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCACTAAC-TTT---C-----A-TAA-A------G-Atcaaccatacaagttataaa
gi|61761                      : CGTGCCAAGGAT-CAGAACTC-CCT----T-GGCACGC-A-G--AAGATC-G---T---TTC
gi|61762                      :  GTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCC----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-GA---A---CA-T--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----A-CA-----AT--C-----C-----GC---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-TC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-AA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61763                      :  GTGTCAGGGAGACACATCGC-CCCACAAT-GTCACGC-C-ATTAAGATC-G---T---TTCCCTGAG-TTT---CTTAA-A-AAA-A------A-AG--------A-G-GC-C------ATC--TGA-GGGCCGT---TG--AG-G--AGAAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TCAAAC-CA--G---A-A--T--------TG---G-TA-----GT--------C-----GTA--T-AACCGCC-GT---AAT-G-G--TG-ATAA-T-----A--T-T-GCC--CAA---ACAG-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-C--A----TA--A-T-CAA-TCGAT
gi|61764                      :  GTGTCAAGGAT-CACAACTT-TTT----T-GACATGC-A-A--ATAACT-G---T---TTCTTTGGT-TTT---C---G-A-CCA-A------G-GG--A-----A-G-GCTT------A-C--TGA-AAGTCGT---CA--GG-A--A-AAC-TAAAGTTAT-AA---A---CC-T--T-GAAAAG-CAATA---ATA--T--------T----T-CA-----TT--TA----CTAATAGT---T--ACTAAC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-A-----G-CA-T--TAA-ATCCA----A-T
gi|61767                      :   TGTCTAGGAT-CACAACCT-TCT----T-GTCACGC-A-A--AATATC-G---T---GTCCCTGAT-GTT---C---G-A-TAA-A------G-AG--C-----A-G-ACTC------T-C--TGA-TGGCCGT---CA--GG-G--A-AAA-T-------T-CA---T---CA-T--T-TAAAAC-C----------------------------TA-----GC--T-----T-----AC---T-GAT------TG-AAAT-G-GC-TG-A-AC-T-----A--T-T-GAC--AGA---AT-ATTTTTG-TG-T--AAA-A--CA----A-T--A--A----CA--A-A-CAA-TC
gi|61765                      :   TGTCAACGAT-CAC---CC-CCT----T-CGCAAAC-A-G--AA-ATC-A---T---TTTTC-GAT-GTT---T---G-A-AG------------G--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-C--AACGCA--T---ACA----------------G-CA---------------------GC---T-AACTG-C-GTG-AAAT-G-G--TG-A---------------T-ATC--AAAT--AT-G-----A-CG-T---AA-A--CG----A-TAGG--A----TACCA-T-CAA-Ttcaa
gi|61768                      :   TGTCAAGGTT-CAAAACCC-CCA----T-GGCACAC-ACA--AAAATC-A---T---TTCTCTGGT-TTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-G-GCTC------C-CA-TG--GAGTTG----CA---G-G--A-AGT-T-------T-CA---A---AATC--T-C----T-C-------ACA--T--------T----T-CA-----TT--C-----A-----GTTTAT-AACCTCA-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-CATGCATGTA--T-T-GTC--AGA---AC-G-----G-TG-T--TAA-A--CC----C-AA-A--A----CA--A-T-CAA-TCGA
gi|61769                      :   TGTCAAGAAT-CACAACCC-CCT----T-GTACCGC-A-A--A------------------CT-AT--TT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-C-ACTC------A-T--TGG-GGGCCAT---TG--GA-G--A-AAC-T-------C-CA---AG--CT-T--T-CCAAAA-CA--ATTCATA--T--------TTC--A-TATACATGT--------T-----GT---T-AACCACC-GCA-AAAT-G-G
gi|61766                      :   TGTCAAAGAT-CACAACCC-CCT----T-CGCAAAC-A-A--AAGATC-A---T---TTaaat
gi|61770                      :     TCAAGGAT-CA-AACACGCCT----T-GT---------------TT-G---T---TTCCCTGAT-TTT---C---A-A-AAA-A------G-AA--C-----T-G-GCTC------A-CCATGA-GG--CAT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATAC-CG--A---AC-----------------G-TA-----TT--T-----CTTTTAAT---T-AACCCCC-GTA-AAAT-A-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-ACC--AAC---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CC----A-AA-A--G----TG--A-T-CAA-TC
gi|61771                      :     TCAAGG-T-TATAACCC-TGT----T-GGTACTC-A-A--AATATC-C---T---TTCCCTGAT--TT---C---G-G-AA---------G-AG--T-----A-C-GCTC------A-C--TGG-GAGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-T-------C-CA---A---CT-C--T-CACTAC-CA--A---A
gi|61772                      :        AGGAT-AACAACCC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCTTTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--TCTACTA-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----G-CA-----GT--C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--A----TA--A-T-CTA-TCAAT
gi|61773                      :            T-CACAACCC-CCT----T-GGCGCGC-T-A--AAGCTC-G---T---TTCTTTAAT-ATT---T---A-A-AAA-A------G-AG--G-----A-G-GCTC------A-G--CGA-GGGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-A-------T-C
gi|61774                      :                 AACCC-CCT----TGGGCACGC---A--AAGATC-G---G---TTTTCCGAT-GTT---C---G-A-AAA-AAT----A-GG--TA----A-G-GCTCA-----A-C--TGA-GGG-CGT---C---GG-G--A-AAC-T-------T-C----A---CA-CTTT-C-AAAC-CA--G---AC---T--------T----G-TA-----GT--CG----T-----GT---T-AACCGCC-GTG--AAT-G-GC-TGAA-AA-G-----A--T-T-GCC--AAAG--ACGG-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-C--G----TA--ACT-CA
gi|61775                      :                          ----T-GGCACGA-T-A--AAGATC-----C---CTCCCTG---------C---G-C-AAA----------------------G-GCCC-----------TGA-GGGCCGAGCACA--GG-CCTA-AAT-T-------TGCA---G---CC-C--TTCATAGG-CA--A--------T--------G----G-TG-----A---------C-----GT--------CTCC-----AAAT-G-AG-TG-A-AA-T-----A--T-T-CTC--GAG---TG-G-----GACG-T--AAA-A--CA----G-CA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61776                      :                                    CAC-A-A--AAGAAT-G---T---TTCCCTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-G-TATC------A-C--AGA-TGGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---CA-C--T-CAAAAC-AA--A---ATA--T--------T----T-CA-----GT--T-----A-----GC---T-AGCCGCC-GTA-AAAA-A-TC-T--A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---A
gi|61777                      :                                      C-A-A--AAAGTT-GACTT---TCCCCCGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-ATGCTC------A----TGA-GGGTCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---C---TA-C--T-TAAAAC-CA--A---taatttaa
gi|61778                      :                                              AGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---TA-C--T-CAAAAA-TA--A---ATA--T--------TTCTGG-TA---------------------GC---T-AGCCGCC-TTG-AAAgtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgttacagtcagctaaccgccgtaaaatgactgaaatattgccaaaatggcgtaaaacctcaaataatcaatcaat
gi|61779                      :                                                ATG-G---T---TTCCC-GAT-GTT---C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-A-GCTC------A-C--TGG-GAGCCAT---CA--GA-G--A-TAT-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATAC-CA--G---ACA--TATTCTAGGT----A-TA-----TT--T-----A-----AT---T-AACTGAC-GTT-AAGT-G-GC-TC-A-A
gi|61780                      :                                                   -G---T---TTCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-CCTC------A-C--CGA-ATGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CA---A---CG-C--T-CTAAAT-CA--A---ACA--T--------T----G-CA-----AT--T-----G-----GC---T-AACCGCC---G-AAAT--------------------A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--AT----T-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCctatagcaaaga
gi|61781                      :                                                                   AT-ATT---T---G-A-AAG-ACCCGGTG-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GAAG--A-AACCT-------T-CAT--A---CA-C--T-CAAA---CA--G---ACAA-T--------T----G-TA-----GT--C-----C-----GT---T-AACCTCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-AT----A--T-TGGCC--AAA---AC-G-----G-CG-TTAAAA-A--CC----ATTA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61782                      :                                                                                     AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---ACA-------------------------------------------------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCA--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61783                      :                                                                                     AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CAAG-A---CA-C--T-CAAAAC-CA--A---AC-------------------------------------------------AACCGCC-GTG---AT-G-GT-TG---AA-T-----A--T-T-GCA--AAA---ATGG-----G-CG-T--AAA-A--C-----A-TT-A--A----TA--A-T-CAA-T
gi|61784                      :                                                                                      A-A------G-AG--T-----T-G-GCTT------A-C--AGA-GGGCCGT---CA--AG-G----AAT-T-------C-CA---A---AA-C--T-AGATAC-CG--A---ACA--TATTTCA--T----T-TA-----AA--C-----T------T---T-AACCATC-GTT-AAAT-A-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-
gi|61785                      :                                                                                                                 TC------A-C--TGG-GAGC-GT---CA--GA-A--A-AAC-T-------T-TA---AATCCC-T--T-TAAAAC-CG-----------T--------TC---G-TA-----TT--CAAATAC-----GG---T-AACCGCT-TTA-AACT-G-AC-TG-A-AA-T-----A--T-T-ACC--AAA---AT-G-----G-TG-T--CAA-ACCCA----A--A-A--A-----A--A-T-CTG-TCAA
gi|61786                      :                                                                                                                            --TGA-GGATCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-AA---A---CA-C--A-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----A-CA-----GT--A-----A-----GC---T-AACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--ATA-A--CC----T-CA-A--A----TA--A-T-CAA-CCAAT
gi|61787                      :                                                                                                                            --TAA-GGCCTTT---CAT-AG-G--A-ATC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAAC-CA--A---ACA--T--------T----A-CA-----GC--C-----C-----GC---C-AACCACC-GTG-AAA--------------------------T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--AA----T-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61788                      :                                                                                                                                                                                 -C--T-CACA---CA--C---ACA--T--------T----A-CA-----TTTAC-----C----------T-AAACGCC-GTA-CAAT-G-TC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GTT--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-C--A----TA--A-T-AAG-TAAAT
gi|61789                      :                                                                                                                                                                                               A--A---ACA--C--------T----T-CA-----GT--T-----A-----GC---T-CACCGCC-GTA-AAAT-G-AT-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-GG-C--AAA-A--CA----T-TA-A--A----CA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61777                      :                                                                                                                                                                                                         --T--------T----A-CA-----GT--C-----A-----GC---T-AACCGCC-GTA-AAAT-G-AC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CC----T-CA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61792                      :                                                                                                                         caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatg---T-GACCGCT-GTA-AAAT-G-GC-TG-G-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AT-G-----G-AG-T--AAA-A--CA----T-CA-A--C----TA--G-T-CAA-TCCAT
gi|61793                      :                                                                                                                                                                                                                                                          ACTGCC-TTG-AAAT-G-GC-TG-C-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAGT
gi|61790                      :                                                                                                                                                                                                                                                          ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--GAA---AC-G-----G-CG-T--AAACG--CATTTTA-AA-A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61791                      :                                                                                                                                                                                                                                           aacgtcagaatcatcACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-------A--TAT-GCC--GAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-G--CATT--A-AA-A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61794                      :                                                                                                                                                                                                                                           aacgtcagaatcatcACCTTC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CT----T-TA-A--A----TA--A-
gi|61797                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-G-----A--T-T-GCCA-AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--G----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61799                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-G-----A--T-T-GCT--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--T----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61795                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-CA-G-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----A-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61798                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AC-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-CT-A--A----CA--A-T-CAA-TCA
gi|61796                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-GA----A--T-T-GCC---AA---AC-G-----G-CGCT--AAA-A--CA----T-TA-T--A----TA--A-TACAA-TCAAT
gi|61800                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CCACT-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCC--AAA---AC-A-----G-CA-T--AAA-A--TA----T-CA-A--A----CA--A-T-CAA-CC
gi|61801                      :                                                                                                                                                                                                                                                           CCGCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-G-AA-T-----G--T-T-GAC--AAA---AC-A-----G-CG-T---AA-A--C-----G-TA-A--AGCACCA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61802                      :                                                                                                                                                                                                                                                            CGTC-TTA-AAATTA-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCCC-AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-A--AC---CA--C-T-CAA-TCcaa
gi|61803                      :                                                                                                                                                                                                                                                             GCC-GTG-AAAT-G-AC-TG-A-AA-G-----A--T-T-GCC--AAA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--
gi|61804                      :                                                                                                                                                                                                                                                              CC-GT----AT-G-AG-TG-A-AA-T-----A--T-T-CTC--AAG---AG-A-----GACG-T--AAA-A--CA----A-CA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAATaacattatata
gi|61805                      :                                                                                                                                                                                                                                                               C-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA-G-----A--T-T-GCC---AA---AC-G-----G-CG-T--AAA-A--CA----T-TA-T--A----TA--A-T-CAA-TCA
gi|61806                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    -AAAT-G-GC-TG-A-AA-T-----A--T-T-GCA--AAA---AT-G-----G-CG-T--AAA-A--C-----A-TC-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61807                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       AT-G-AG-TG-A-AA-T-----A--T-T-CTC--GAA---GG-G-----A-CG-A--AAA-A--CA----T-CA-A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                           1        1   2222 2       1 1 11      1 222 111         1   333 111 1 1   1 444444 1  11 33333 2 1    666666 1 22   1       111  33  1 11 1   1 3333333 1  444 222  1 11         444444  44 22 666666666666  3333333  6666 3333333 3333 222222      0   1    0 0  1  1 1  222222 0 11 0 0   22   222 0 2 11111 1  1 11 11  0 11  0  2222 11 11 2222  11 1 0   0     
lowQualScore                  :                                                                                           .        .   .... .       . . ..      . ... ...         .   ... ... . .   . ...... .  .. ..... . .    ...... . ..   .       ...  ..  . .. .   . ....... .  ... ...  . ..         ......  .. .. ............  .......  .... ....... .... ......      .   .    . .  .  . .  ...... . .. . .   ..   ... . . ..... .  . .. ..  . ..  .  .... .. .. ....  .. . .   .     
lowQualScore                  :                                                                                           3        2   6666 4       1 1 66      1 999 888         1   000 999 1 1   0 222222 0  44 66666 1 0    888888 0 33   0       777  22  0 33 0   0 2222222 0  111 888  0 33         444444  11 33 666666666666  2222222  5555 1111111 0000 555555      7   4    7 7  4  4 4  000000 7 77 7 7   55   888 7 3 99999 5  5 11 11  8 11  8  8888 11 11 5555  11 6 8   9     
consensus                     :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
Reference ( family-316 )      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------GT-C-NG---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61743                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-TA-------GT-C-CG---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-AT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61744                      :                                                                               CGTGTCAAAGAT-CACAACCT-CCT----T-GGCATGC-A-A--AAGATT-G---T---TTTCCTGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--TCAAAACCA--G---AC--A--T--------T-A-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--G--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61745                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACTACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---A-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--GCAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-TA-------GT-C-CG---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61746                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AATATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----T-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-TA---A---CA-C--TCAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-TA-------GT-C-CG---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--AATA----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61747                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCT------GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CATTTA---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-TA-------AT-C-AG---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCAAAAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61748                      :                                                                               CGTGTCAAGAAT-CAGAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------A-AGCGT-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--AG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTC--AAA---A-T-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-AT----G--A--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61749                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GCCAAGC-A-A--AAGATA-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C-----A-AAA-A------G-GG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAGCCA--A---AC--A--T--------T-A-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-A-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAT-TCAAT
gi|61750                      :                                                                               CATGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-T--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACCGCC-GTG-GAAT-G-GCGTA-A-AA------C-A--T-T-A--------------------------------------A-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61751                      :                                                                               CGTGTCAAGGAA-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TAA-AGACCGT---CA--GG-A--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------GT-C-AC---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAA
gi|61752                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-C-CAACCC-CCT----A-GGCACAC-A-A--AAGATC-G---T---TT-CCTGATAGTTC--C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGAGGGGCCGT---CA--GT-G----AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--G---AC--A--T--------G-GTTA-------GT-C-CG---T---T----A------ACCGCCAGTGAAAAT-G-GCTTG-A-AA------C-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CC-G--A--AA-A--CA-TT----ATTA--A----TA--ATT-CAA-TCAAT
gi|61753                      :                                                                               CGTGTCAAG-AT-CACAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATCCG---TACATTCCCTGAT-GTTATTC---G-AGAAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CACTGG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--GCC-AC--A--T--------T-G-TC-------TTCC-CG---T---TA---A------ACCGCC-GTG-AAAT-GCGC-TG-A-AA------T-AG-T-T-GCCA-AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CATTT----A--A--A----T---A-T-CAACTCAAT
gi|61754                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GTCACGC-A-A--ACGATC-G---T---TCCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGC---CAG-GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TTAAAACCA--A---AC--AATT--------T-G-CA-------GT-A-AG---T---T----A------ATCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-ACAA------T-
gi|61755                      :                                                                               CATGTCAAGGCT-AACAACCC-C-T----T-GGCATGC-A-A--AAAAAA-G---T---TTCCCAGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--A-----A-G-GCTC------A-T--TGG-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--TCACAACCA--A---ACATA--T--------T-T-CA-------GT------------T----A-----------C-ATGTAAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--A-T-GCC--AAAAACA-T-G-----T-CA-T--C--AA-A--CA-TC----A--A--T----CA--A-C-CAA-TCAGT
gi|61756                      :                                                                               CGTGT-AAGGGT-AACAACCC-CCG----TAGGCACGCCA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTG-T-GAT---C---G-A-AAA-A------ATAG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGG-GG--CGT---CA---G-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--TCAG--------------------------------A-------GT-C-AG---T---TTTAAA------AACGCC-GTG-ACAT-G-GC-TG-A-AA------T-ATGT-T-GCC--AAA---C-C-G-----G-CG-T-----AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61757                      :                                                                               CGTGTCATAGAT-CACAACCT-C-T----T-GGCACGC-C-A--AAGATC-G---A---TTCTCTGAG-GTT---C---A-G-GAA-A------T-AG--T-----A-G-ACTC------A-T--TG--GGGCCAT---CA--GG-G--A-AAC-----------CA---G---AA-C----AAAAT--------AT--A--T--------T-T-CA-------GT------------T----A------AC-GCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-T-----G-CG-T--A--AA-A--CG-AC----A--A--T----TA--A-T-CCA-TTAA
gi|61758                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAGCAC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-GT--T---TTCCCTGAA-GTC---T---GAA-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--
gi|61759                      :                                                                               CATGTCAAGAAT-CACAGCCC-CCT----T-GACACAC-A-A--AAGATC-G---T---CTTCCTGAT-GTT---C---G-A-AGACA------A-CA--T-----A-G-TCTC------A-C--AGA-AAGCCAA---CA--GC-A--A-AAC-T-------C-CA---T---AA-C--TCACTGCCA--AAT-AT--A--T--------T-------------T-C-AG---C---T----A--------------T----AT-A-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GAG--AAA---A-T-G-----G-CG-T--ATCAA-C--CA-T
gi|61760                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CAAAACCC-CCT----T-TGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCACTAAC-TTT---C-----A-TAA-A------G-Aacaagttataaa
gi|61761                      :                                                                               CGTGCCAAGGAT-CAGAACTC-CCT----T-GGCACGC-A-G--AAGATC-G---T---TTC
gi|61762                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCC----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-GA---A---CA-T--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-CA-------AT-C-CG---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61763                      :                                                                                GTGTCAGGGAGACACATCGC-CCCACAAT-GTCACGC-C-ATTAAGATC-G---T---TTCCCTGAG-TTT---CTTAA-A-AAA-A------A-AG--------A-G-GC-C------ATC--TGA-GGGCCGT---TG--AG-G--AGAAC-T-------T-CA---A---CA-C--TTCAAACCA--G---A---A--T--------TGG-TA-------GT-C-GT---A---T----A------ACCGCC-GT---AAT-G-G--TG-ATAA------T-A--T-T-GCC--CAA---A-CAG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-CAA-TCGAT
gi|61764                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-CACAACTT-TTT----T-GACATGC-A-A--ATAACT-G---T---TTCTTTGGT-TTT---C---G-A-CCA-A------G-GG--A-----A-G-GCTT------A-C--TGA-AAGTCGT---CA--GG-A--A-AAC-TAAAGTTAT-AA---A---CC-T--TGAAAAGCAATA---AT--A--T--------T-T-CA--------T-T-TA---C---T----AATAGTTACTAAC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--T--AA-A--
gi|61765                      :                                                                                 TGTCAACGAT-CAC---CC-CCT----T-CGCAAAC-A-G--AA-ATC-A---T---TTTTC-GAT-GTT---T---G-A-AG------------G--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--TC--AAC--------GC--A-----------T-A-CA-------G--C-AG---C---T----A------ACTG-C-GTG-AAAT-G-G--TG----A------T-A--T-----C--AAAT--A-T-G-----A-CG-T--A--AA-C--GA-TA----G--G--A----TACCA-T-CAA-Ttccaat
gi|61766                      :                                                                                 TGTCAAAGAT-CACAACCC-CCT----T-CGCAAAC-A-A--AAGATC-A---T---TT
gi|61767                      :                                                                                 TGTCTAGGAT-CACAACCT-TCT----T-GTCACGC-A-A--AATATC-G---T---GTCCCTGAT-GTT---C---G-A-TAA-A------G-AG--C-----A-G-ACTC------T-C--TGA-TGGCCGT---CA--GG-G--A-AAA-T-------T-CA---T---CA-T--TTAAAACC---------------------------TA-------GC-T-TA---C---T----G------AT------TG-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GAC--AGA---A-T-ATTTTTG-TG-T--A--AA-A--CA-AT-------A--A----CA--A-A-CAA-TC
gi|61768                      :                                                                                 TGTCAAGGTT-CAAAACCC-CCA----T-GGCACAC-ACA--AAAATC-A---T---TTCTCTGGT-TTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-G-GCTC------C-CA-TG--GAGTTG----CA---G-G--A-AGT-T-------T-CA---A---AATC--TC----TC-------AC--A--T--------T-T-CA-------TT-C-AG---TTTAT----A------ACCTCA-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-CATGCATGT-A--T-T-GTC--AGA---A-C-G-----G-TG-T--T--AA-A--CC-CA----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCGAtcaa
gi|61769                      :                                                                                 TGTCAAGAAT-CACAACCC-CCT----T-GTACCGC-A-A--A------------------CT-AT--TT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-C-ACTC------A-T--TGG-GGGCCAT---TG--GA-G--A-AAC-T-------C-CA---AG--CT-T--TCCAAAACA--ATTCAT--A--T--------T-T-CATATACATGT---TG---T---T----A------ACCACC-GCA-AAAT-G-----G-A-AA------T-
gi|61770                      :                                                                                   TCAAGGAT-CA-AACACGCCT----T-GT---------------TT-G---T---TTCCCTGAT-TTT---C---A-A-AAA-A------G-AA--C-----T-G-GCTC------A-CCATGA-GG--CAT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---AA-C--TCAATACCG--A---ACGTA--T--------T-T-CT-------TT-T-AA---T---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAC---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-AA----A--A--G----TG--A-T-CAA-TC
gi|61771                      :                                                                                   TCAAGG-T-TATAACCC-TGT----T-GGTACTC-A-A--AATATC-C---T---TTCCCTGAT--TT---C---G-G-AA---------G-AG--T-----A-C-GCTC------A-C--TGG-GAGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-T-------C-CA---A---CT-C--TCACTACCA--A---A
gi|61772                      :                                                                                      AGGAT-AACAACCC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCTTTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--TCTACTA-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CTA-TCAAT
gi|61773                      :                                                                                          T-CACAACCC-CCT----T-GGCGCGC-T-A--AAGCTC-G---T---TTCTTTAAT-ATT---T---A-A-AAA-A------G-AG--G-----A-G-GCTC------A-G--CGA-GGGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-A-------T-C
gi|61774                      :                                                                                               AACCC-CCT----TGGGCACGC---A--AAGATC-G---G---TTTTCCGAT-GTT---C---G-A-AAA-AAT----A-GG--TA----A-G-GCTCA-----A-C--TGA-GGG-CGT---C---GG-G--A-AAC-T-------T-C----A---CA-CTTTC-AAACCA--G---AC-----T--------T-G-TA-------GT-CGTG---T---T----A------ACCGCC-GTG--AAT-G-GC-TGAA-AA------G-A--T-T-GCC--AAAG--A-CGG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--G----TA--ACT-CA
gi|61775                      :                                                                                                        ----T-GGCACGA-T-A--AAGATC-----C---CTCCCTG---------C---G-C-AAA----------------------G-GCCC-----------TGA-GGGCCGAGCACA--GG-CCTA-AAT-T-------TGCA---G---CC-C--TT--------------C--A--TA-------G-G-CA-------AT----G---G---T----G------AC-GTC-TCC-AAAT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAG---T-G-G-----GACG-T--A--AA-A--CA-GC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61776                      :                                                                                                                  CAC-A-A--AAGAAT-G---T---TTCCCTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-G-TATC------A-C--AGA-TGGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---CA-C--TCAAAACAA--A---AT--A--T--------T-T-CA-------GT-T-AG---C---T----A------GCCGCC-GTA-AAAA-A-TC-T--A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-
gi|61777                      :                                                                                                                    C-A-A--AAAGTT-GACTT---TCCCCCGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-ATGCTC------A----TGA-GGGTCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---C---TA-C--TTAAAACCA--A---taatttaa
gi|61777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       --T--------T-A-CA-------GT-C-AG---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAATgtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgttacagtcagctaaccgccgtaaaatgactgaaatattgccaaaatggcgtaaaacctcaaataatcaatcaat
gi|61778                      : caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgAGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---TA-C--TCAAAAATA--A---AT--A--T--------T-T-CT-------GG-T-AG---C---T----A------GCCGCC-TTG-AAA
gi|61779                      :                                                                                                                              ATG-G---T---TTCCC-GAT-GTT---C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-A-GCTC------A-C--TGG-GAGCCAT---CA--GA-G--A-TAT-T-------T-CA---A---AA-C--TCAATACCA--G---AC--A--TATTCTAGGT-A-TA-------TT-T-AA---T---T----A------ACTGAC-GTT-AAGT-G-GC-TC-A-AC------T-A--T-A-GCA--AAG---A-
gi|61780                      :                                                                                                                                 -G---T---TTCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-CCTC------A-C--CGA-ATGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CA---A---CG-C--TCTAAATCA--A---AC--A--T--------T-G-CA-------AT-T-GG---C---T----A------ACCGCC----------------G-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AT-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TC
gi|61781                      :                                                                                                                                                 AT-ATT---T---G-A-AAG-ACCCGGTG-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GAAG--A-AACCT-------T-CAT--A---CA-C--TCAAA--CA--G---AC--AA-T--------T-G-TA-------GT-C-CG---T---T----A------ACCTCC-GTG-AAAT-G-GC-TGAA-AA------T-A--T-TGGCC--AAA---A-C-G-----G-CGTT--A--AA-AACCA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61782                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC--A--------------------------------------------------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61783                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CAAG-A---CA-C--TCAAAACCA--A---AC----------------------------------------------A------ACCGCC-GTG---AT-G-GT-TG---AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-TGG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT-------A--A----TA--A-T-CAA-T
gi|61784                      :                                                                                                                                                                    A-A------G-AG--T-----T-G-GCTT------A-C--AGA-GGGCCGT---CA--AG-G--A-A-T-T-------C-CA---A---AA-C--TAGATACCG--A---AC--A--TAT------T-T-CA-------TT-T-AAACTT---T----A------ACCATC-GTT-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-
gi|61785                      :                                                                                                                                                                                               TC------A-C--TGG-GAGC-GT---CA--GA-A--A-AAC-T-------T-TA---AATCCC-T--TTAAAACCG--T---TCGTA--T--------T-C-AA-------AT-A-CG---G---T----A------ACCGCT-TTA-AACT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAA---A-T-G-----G-TG-T--C--AA-A--CC-CA----A--A--A----AA--A-T-CTG-TCAA
gi|61786                      :                                                                                                                                                                                                          --TGA-GGATCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-AA---A---CA-C--ACAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-CA-------GT-A-AG---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--TA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-CCAAT
gi|61787                      :                                                                                                                                                                                                          --TAA-GGCCTTT---CAT-AG-G--A-ATC-T-------T-CA---A---CA-T--TCAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-CA-------GC-C-CG---C---C----A------ACCACC-GTG-AAA---------------------------T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61788                      :                                                                                                                                                                                                                                                               -C--TCACA--CA--C---AC--A--T--------T-A-CA-------TT-T-AC---C---T----A------AACGCC-GTA-CAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTT--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-AAG-TAAAT
gi|61789                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           A--A---AC--A--C--------T-T-CA-------GT-T-AG---C---T----C------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-GG-C--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AACG--CA-TTTTAAA--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aacgtcagaatcatc------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA--------A--TAT-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-G--CA-TTAA--A--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61792                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aacgtcagaatcatc---T----G------ACCGCT-GTA-AAAT-G-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-AG-T--A--AA-A--CA-TC----A--A--C----TA--G-T-CAA-TCCAT
gi|61793                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ------ACTGCC-TTG-AAAT-G-GC-TG-C-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAGT
gi|61794                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ------ACCTTC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TT----A--A--A----TA--A-
gi|61795                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-CA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61796                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------GAA--T-T-GCC---AA---A-C-G-----G-CGCT--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-TACAA-TCAAT
gi|61797                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---AAC-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--G----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61798                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC----T--A--A----CA--A-T-CAA-TCA
gi|61799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--T----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61800                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCACT-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--A--AA-A--TA-TC----A--A--A----CA--A-T-CAA-CC
gi|61801                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCGCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-G-AA------T-G--T-T-GAC--AAA---A-C-A-----G-CG-T-----AA-A--CG--T----A--A--AGCACCA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61802                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGTC-TTA-AAATTA-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCC-AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--AC---CA--C-T-CAA-TCcaa
gi|61803                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCC-GTG-AAAT-G-AC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-TAAA--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--
gi|61804                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CC-GT----AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--AAG---A-G-A-----GACG-T--A--AA-A--CA-AC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              C-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA-----C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCA
gi|61806                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC-------A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61807                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAA---G-G-G-----A-CG-A--A--AA-A--CA-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111111                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                           1        1   2222 2       1 1 11      1 222 111         1   333 111 1 1   1 444444 1  11 33333 2 1    666666 1 22   1       111  33  1 11 1   1 3333333 1  222 444  1 11 1        444444  44 22 33333333 0000000  3333333    4444444444444 2222 222222      0   1    0 0  1  1 1  222222 0 11 0 0   22   222 0 1 11111 2  1 11 11  0 11  0  2222 11 11 2222  11 1 0   0     
lowQualScore                  :                                                                                           .        .   .... .       . . ..      . ... ...         .   ... ... . .   . ...... .  .. ..... . .    ...... . ..   .       ...  ..  . .. .   . ....... .  ... ...  . .. .        ......  .. .. ........ .......  .......    ............. .... ......      .   .    . .  .  . .  ...... . .. . .   ..   ... . . ..... .  . .. ..  . ..  .  .... .. .. ....  .. . .   .     
lowQualScore                  :                                                                                           3        2   6666 4       1 1 66      1 999 888         1   000 999 1 1   0 222222 0  44 66666 1 0    888888 0 33   0       777  22  0 33 0   0 2222222 0  888 111  0 33 0        444444  11 33 55555555 2222222  2222222    2222222222222 0000 555555      7   4    7 7  4  4 4  000000 7 77 7 7   55   888 7 5 99999 3  5 11 11  8 11  8  8888 11 11 5555  11 6 8   9     
consensus                     :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
Reference ( family-316 )      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61743                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-AT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61744                      :                                                                               CGTGTCAAAGAT-CACAACCT-CCT----T-GGCATGC-A-A--AAGATT-G---T---TTTCCTGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--G--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61745                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACTACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---A-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--G-CAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61746                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AATATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----T-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-TA---A---CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--AATA----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61747                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCT------GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CATTTA---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------ATCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCAAAAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61748                      :                                                                               CGTGTCAAGAAT-CAGAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------A-AGCGT-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--AG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTC--AAA---A-T-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-AT----G--A--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61749                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GCCAAGC-A-A--AAGATA-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C-----A-AAA-A------G-GG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAGCCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-A-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAT-TCAAT
gi|61750                      :                                                                               CATGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-GAAT-G-GCGTA-A-AA------C-A--T-T-A--------------------------------------A-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61751                      :                                                                               CGTGTCAAGGAA-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TAA-AGACCGT---CA--GG-A--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----C---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAA
gi|61752                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-C-CAACCC-CCT----A-GGCACAC-A-A--AAGATC-G---T---TT-CCTGATAGTTC--C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGAGGGGCCGT---CA--GT-G----AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--A--T--------G-GT----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCCAGTGAAAAT-G-GCTTG-A-AA------C-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CC-G--A--AA-A--CA-TT----ATTA--A----TA--ATT-CAA-TCAAT
gi|61753                      :                                                                               CGTGTCAAG-AT-CACAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATCCG---TACATTCCCTGAT-GTTATTC---G-AGAAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CACTGG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--GCC-AC--A--T--------T-GTCTTCCC-------GTTA------------------A------ACCGCC-GTG-AAAT-GCGC-TG-A-AA------T-AG-T-T-GCCA-AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CATTT----A--A--A----T---A-T-CAACTCAAT
gi|61754                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GTCACGC-A-A--ACGATC-G---T---TCCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGC---CAG-GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TAAAACCA--A---AC--AATT--------T-G-----CA-------GTAA-----G---T---T----A------ATCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-ACAA------T-
gi|61755                      :                                                                               CATGTCAAGGCT-AACAACCC-C-T----T-GGCATGC-A-A--AAAAAA-G---T---TTCCCAGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--A-----A-G-GCTC------A-T--TGG-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CACAACCA--A---ACATA--T--------T-----------------TCA-----G---T---T----A-----------C-ATGTAAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--A-T-GCC--AAAAACA-T-G-----T-CA-T--C--AA-A--CA-TC----A--A--T----CA--A-C-CAA-TCAGT
gi|61756                      :                                                                               CGTGT-AAGGGT-AACAACCC-CCG----TAGGCACGCCA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTG-T-GAT---C---G-A-AAA-A------ATAG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGG-GG--CGT---CA---G-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAG------------------------------------A-------GTCA-----G---T---TTTAAA------AACGCC-GTG-ACAT-G-GC-TG-A-AA------T-ATGT-T-GCC--AAA---C-C-G-----G-CG-T-----AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61757                      :                                                                               CGTGTCATAGAT-CACAACCT-C-T----T-GGCACGC-C-A--AAGATC-G---A---TTCTCTGAG-GTT---C---A-G-GAA-A------T-AG--T-----A-G-ACTC------A-T--TG--GGGCCAT---CA--GG-G--A-AAC-----------CA---G---AA-C-----AAAAT--------AT--A--T--------T-----------------TCA-----G---T---T----A------AC-GCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-T-----G-CG-T--A--AA-A--CG-AC----A--A--T----TA--A-T-CCA-TTAA
gi|61758                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAGCAC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-GT--T---TTCCCTGAA-GTC---T---GAA-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--
gi|61759                      :                                                                               CATGTCAAGAAT-CACAGCCC-CCT----T-GACACAC-A-A--AAGATC-G---T---CTTCCTGAT-GTT---C---G-A-AGACA------A-CA--T-----A-G-TCTC------A-C--AGA-AAGCCAA---CA--GC-A--A-AAC-T-------C-CA---T---AA-C--T-CACTGCCA--AAT-AT--A--T--------T-----------------TCA-----G---C---T----A--------------T----AT-A-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GAG--AAA---A-T-G-----G-CG-T--ATCAA-C--CA-T
gi|61760                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CAAAACCC-CCT----T-TGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCACTAAC-TTT---C-----A-TAA-A------G-Aacaagttataaa
gi|61761                      :                                                                               CGTGCCAAGGAT-CAGAACTC-CCT----T-GGCACGC-A-G--AAGATC-G---T---TTC
gi|61762                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCC----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-GA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------ATCC-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61763                      :                                                                                GTGTCAGGGAGACACATCGC-CCCACAAT-GTCACGC-C-ATTAAGATC-G---T---TTCCCTGAG-TTT---CTTAA-A-AAA-A------A-AG--------A-G-GC-C------ATC--TGA-GGGCCGT---TG--AG-G--AGAAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TCAAACCA--G---A---A--T--------T-GG----TA-------GTCG-----T---A---T----A------ACCGCC-GT---AAT-G-G--TG-ATAA------T-A--T-T-GCC--CAA---A-CAG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-CAA-TCGAT
gi|61764                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-CACAACTT-TTT----T-GACATGC-A-A--ATAACT-G---T---TTCTTTGGT-TTT---C---G-A-CCA-A------G-GG--A-----A-G-GCTT------A-C--TGA-AAGTCGT---CA--GG-A--A-AAC-TAAAGTTAT-AA---A---CC-T--T-GAAAAGCAATA---AT--A--T--------T-T-----CA-------TTTA---------C---T----AATAGTTACTAAC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--T--AA-A--
gi|61765                      :                                                                                 TGTCAACGAT-CAC---CC-CCT----T-CGCAAAC-A-G--AA-ATC-A---T---TTTTC-GAT-GTT---T---G-A-AG------------G--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-C--AAC--------GC--A-----------T-A-----CA-------G-CA-----G---C---T----A------ACTG-C-GTG-AAAT-G-G--TG----A------T-A--T-----C--AAAT--A-T-G-----A-CG-T--A--AA-C--GA-TA----G--G--A----TACCA-T-CAA-Ttccaat
gi|61766                      :                                                                                 TGTCAAAGAT-CACAACCC-CCT----T-CGCAAAC-A-A--AAGATC-A---T---TT
gi|61767                      :                                                                                 TGTCTAGGAT-CACAACCT-TCT----T-GTCACGC-A-A--AATATC-G---T---GTCCCTGAT-GTT---C---G-A-TAA-A------G-AG--C-----A-G-ACTC------T-C--TGA-TGGCCGT---CA--GG-G--A-AAA-T-------T-CA---T---CA-T--T-TAAAACC------------------------------------------TA-----G---C---T----T------ACTGAT--TG-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GAC--AGA---A-T-ATTTTTG-TG-T--A--AA-A--CA-AT-------A--A----CA--A-A-CAA-TC
gi|61768                      :                                                                                 TGTCAAGGTT-CAAAACCC-CCA----T-GGCACAC-ACA--AAAATC-A---T---TTCTCTGGT-TTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-G-GCTC------C-CA-TG--GAGTTG----CA---G-G--A-AGT-T-------T-CA---A---AATC--T-C----TC-------AC--A--T--------T-T-----CA-------TTCA-----G---TTTAT----A------ACCTCA-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-CATGCATGT-A--T-T-GTC--AGA---A-C-G-----G-TG-T--T--AA-A--CC-CA----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCGAtcaa
gi|61769                      :                                                                                 TGTCAAGAAT-CACAACCC-CCT----T-GTACCGC-A-A--A------------------CT-AT--TT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-C-ACTC------A-T--TGG-GGGCCAT---TG--GA-G--A-AAC-T-------C-CA---AG--CT-T--T-CCAAAACA--ATTCAT--A--T--------T-T-----CATATACATGTT------G---T---T----A------ACCACC-GCA-AAAT-G-----G-A-AA------T-
gi|61770                      :                                                                                   TCAAGGAT-CA-AACACGCCT----T-GT---------------TT-G---T---TTCCCTGAT-TTT---C---A-A-AAA-A------G-AA--C-----T-G-GCTC------A-CCATGA-GG--CAT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATACCG--A---ACGTA--T--------T-T-----CT-------TTTA-----A---T---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAC---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-AA----A--A--G----TG--A-T-CAA-TC
gi|61771                      :                                                                                   TCAAGG-T-TATAACCC-TGT----T-GGTACTC-A-A--AATATC-C---T---TTCCCTGAT--TT---C---G-G-AA---------G-AG--T-----A-C-GCTC------A-C--TGG-GAGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-T-------C-CA---A---CT-C--T-CACTACCA--A---A
gi|61772                      :                                                                                      AGGAT-AACAACCC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCTTTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--TCTACTA-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CTA-TCAAT
gi|61773                      :                                                                                          T-CACAACCC-CCT----T-GGCGCGC-T-A--AAGCTC-G---T---TTCTTTAAT-ATT---T---A-A-AAA-A------G-AG--G-----A-G-GCTC------A-G--CGA-GGGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-A-------T-C
gi|61774                      :                                                                                               AACCC-CCT----TGGGCACGC---A--AAGATC-G---G---TTTTCCGAT-GTT---C---G-A-AAA-AAT----A-GG--TA----A-G-GCTCA-----A-C--TGA-GGG-CGT---C---GG-G--A-AAC-T-------T-C----A---CA-CTTT-C-AAACCA--G---AC-----T--------T-G-----TA-------GTCGT----G---T---T----A------ACCGCC-GTG--AAT-G-GC-TGAA-AA------G-A--T-T-GCC--AAAG--A-CGG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--G----TA--ACT-CA
gi|61775                      :                                                                                                        ----T-GGCACGA-T-A--AAGATC-----C---CTCCCTG---------C---G-C-AAA----------------------G-GCCC-----------TGA-GGGCCGAGCACA--GG-CCTA-AAT-T-------TGCA---G---CC-C--TTCATAGGCA--A-------------------T-G--------------GTGA---------------------------CGTC-TCC-AAAT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAG---T-G-G-----GACG-T--A--AA-A--CA-GC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61776                      :                                                                                                                  CAC-A-A--AAGAAT-G---T---TTCCCTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-G-TATC------A-C--AGA-TGGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---CA-C--T-CAAAACAA--A---AT--A--T--------T-T-----CA-------GTTA-----G---C---T----A------GCCGCC-GTA-AAAA-A-TC-T--A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-
gi|61777                      :                                                                                                                    C-A-A--AAAGTT-GACTT---TCCCCCGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-ATGCTC------A----TGA-GGGTCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---C---TA-C--T-TAAAACCA--A---taatttaa
gi|61777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAATgtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgttacagtcagctaaccgccgtaaaatgactgaaatattgccaaaatggcgtaaaacctcaaataatcaatcaat
gi|61778                      : caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgAGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---TA-C--T-CAAAAATA--A---AT--A--T--------T-T-----CT-------GGTA-----G---C---T----A------GCCGCC-TTG-AAA
gi|61779                      :                                                                                                                              ATG-G---T---TTCCC-GAT-GTT---C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-A-GCTC------A-C--TGG-GAGCCAT---CA--GA-G--A-TAT-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATACCA--G---AC--A--TATTCTAGGT-A-----TA-------TTTA-----A---T---T----A------ACTGAC-GTT-AAGT-G-GC-TC-A-AC------T-A--T-A-GCA--AAG---A-
gi|61780                      :                                                                                                                                 -G---T---TTCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-CCTC------A-C--CGA-ATGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CA---A---CG-C--T-CTAAATCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------ATTG-----G---C---T----A------ACCGCC----------------G-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AT-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TC
gi|61781                      :                                                                                                                                                 AT-ATT---T---G-A-AAG-ACCCGGTG-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GAAG--A-AACCT-------T-CAT--A---CA-C--T-CAAA--CA--G---AC--AA-T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCTCC-GTG-AAAT-G-GC-TGAA-AA------T-A--T-TGGCC--AAA---A-C-G-----G-CGTT--A--AA-AACCA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61782                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A---------------------------------------------------------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61783                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---AGA-CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A---------------------------------------------------------ACCGCC-GTG-A--T-G-GT-TG-A-A-------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----GGCG-T--A--AA-A--CA-TT-------A--A----TA--A-T-CAA-T
gi|61784                      :                                                                                                                                                                    A-A------G-AG--T-----T-G-GCTT------A-C--AGA-GGGCCGT---CA--AG-G----AAT-T-------C-CA---A---AA-C--T-AGATACCG--A---ACATA--T--------T-T-----CA-------TTTA-----AACTT---T----A------ACCATC-GTT-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-
gi|61785                      :                                                                                                                                                                                               TC------A-C--TGG-GAGC-GT---CA--GA-A--A-AAC-T-------T-TA---AATCCC-T--T-TAAAACCG-------------T--------TCG-----TA-------TTCAAATACG---G---T----A------ACCGCT-TTA-AACT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAA---A-T-G-----G-TG-T--C--AA-A--CC-CA----A--A--A----AA--A-T-CTG-TCAA
gi|61786                      :                                                                                                                                                                                                          --TGA-GGATCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-AA---A---CA-C--A-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTAA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--TA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-CCAAT
gi|61787                      :                                                                                                                                                                                                          --TAA-GGCCTTT---CAT-AG-G--A-ATC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GCCC-----G---C---C----A------ACCACC-GTG-AAA---------------------------T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61788                      :                                                                                                                                                                                                                                                               -C--T-CACA--CA--C---AC--A--T--------T-A-----CA-------TTTA-----C---C---T----A------AACGCC-GTA-CAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTT--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-AAG-TAAAT
gi|61789                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            A--A---AC--A--C--------T-T-----CA-------GTTA-----G---C---T----C------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-GG-C--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AACG--CA-TTTTAAA--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aacgtcagaatcatc------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA--------A--TAT-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-G--CA-TTAA--A--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61792                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacgtcagaatcatc---T----G------ACCGCT-GTA-AAAT-G-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-AG-T--A--AA-A--CA-TC----A--A--C----TA--G-T-CAA-TCCAT
gi|61793                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACTGCC-TTG-AAAT-G-GC-TG-C-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAGT
gi|61794                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACCTTC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TT----A--A--A----TA--A-
gi|61795                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-CA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61796                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------GAA--T-T-GCC---AA---A-C-G-----G-CGCT--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-TACAA-TCAAT
gi|61797                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---AAC-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--G----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61798                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC----T--A--A----CA--A-T-CAA-TCA
gi|61799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--T----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61800                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCACT-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--A--AA-A--TA-TC----A--A--A----CA--A-T-CAA-CC
gi|61801                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-G-AA------T-G--T-T-GAC--AAA---A-C-A-----G-CG-T-----AA-A--CG--T----A--A--AGCACCA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61802                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTC-TTA-AAATTA-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCC-AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--AC---CA--C-T-CAA-TCcaa
gi|61803                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCC-GTG-AAAT-G-AC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-TAAA--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--
gi|61804                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CC-GT----AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--AAG---A-G-A-----GACG-T--A--AA-A--CA-AC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA-----C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCA
gi|61806                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC-------A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61807                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAA---G-G-G-----A-CG-A--A--AA-A--CA-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111111                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                           1        1   2222 2       1 1 11      1 222 111         1   333 111 1 1   1 444444 1  11 33333 2 1    666666 1 22   1       111  33  1 11 1   1 3333333 1  222 444  1 11 1        444444  44 22 33333333 0000000  3333333    4444444444444 2222 222222      0   1    0 0  1  1 1  222222 0 11 0 0   22   222 0 1 11111 2  1 11 11  0 11  0  2222 11 11 2222  11 1 0   0     
lowQualScore                  :                                                                                           .        .   .... .       . . ..      . ... ...         .   ... ... . .   . ...... .  .. ..... . .    ...... . ..   .       ...  ..  . .. .   . ....... .  ... ...  . .. .        ......  .. .. ........ .......  .......    ............. .... ......      .   .    . .  .  . .  ...... . .. . .   ..   ... . . ..... .  . .. ..  . ..  .  .... .. .. ....  .. . .   .     
lowQualScore                  :                                                                                           3        2   6666 4       1 1 66      1 999 888         1   000 999 1 1   0 222222 0  44 66666 1 0    888888 0 33   0       777  22  0 33 0   0 2222222 0  888 111  0 33 0        444444  11 33 55555555 2222222  2222222    2222222222222 0000 555555      7   4    7 7  4  4 4  000000 7 77 7 7   55   888 7 5 99999 3  5 11 11  8 11  8  8888 11 11 5555  11 6 8   9     
consensus                     :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
Reference ( family-316 )      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61743                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-AT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61744                      :                                                                               CGTGTCAAAGAT-CACAACCT-CCT----T-GGCATGC-A-A--AAGATT-G---T---TTTCCTGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--G--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61745                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACTACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---A-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--G-CAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61746                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AATATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----T-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-TA---A---CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--AATA----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61747                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCT------GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CATTTA---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------ATCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCAAAAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61748                      :                                                                               CGTGTCAAGAAT-CAGAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------A-AGCGT-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--AG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTC--AAA---A-T-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-AT----G--A--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61749                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GCCAAGC-A-A--AAGATA-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C-----A-AAA-A------G-GG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAGCCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-A-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAT-TCAAT
gi|61750                      :                                                                               CATGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-GAAT-G-GCGTA-A-AA------C-A--T-T-A--------------------------------------A-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61751                      :                                                                               CGTGTCAAGGAA-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TAA-AGACCGT---CA--GG-A--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----C---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAA
gi|61752                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-C-CAACCC-CCT----A-GGCACAC-A-A--AAGATC-G---T---TT-CCTGATAGTTC--C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGAGGGGCCGT---CA--GT-G----AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--A--T--------G-GT----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCCAGTGAAAAT-G-GCTTG-A-AA------C-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CC-G--A--AA-A--CA-TT----ATTA--A----TA--ATT-CAA-TCAAT
gi|61753                      :                                                                               CGTGTCAAG-AT-CACAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATCCG---TACATTCCCTGAT-GTTATTC---G-AGAAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CACTGG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--GCC-AC--A--T--------T-GTCTTCCC-------GTTA------------------A------ACCGCC-GTG-AAAT-GCGC-TG-A-AA------T-AG-T-T-GCCA-AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CATTT----A--A--A----T---A-T-CAACTCAAT
gi|61754                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GTCACGC-A-A--ACGATC-G---T---TCCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGC---CAG-GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TAAAACCA--A---AC--AATT--------T-G-----CA-------GTAA-----G---T---T----A------ATCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-ACAA------T-
gi|61755                      :                                                                               CATGTCAAGGCT-AACAACCC-C-T----T-GGCATGC-A-A--AAAAAA-G---T---TTCCCAGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--A-----A-G-GCTC------A-T--TGG-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CACAACCA--A---ACATA--T--------T-----------------TCA-----G---T---T----A-----------C-ATGTAAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--A-T-GCC--AAAAACA-T-G-----T-CA-T--C--AA-A--CA-TC----A--A--T----CA--A-C-CAA-TCAGT
gi|61756                      :                                                                               CGTGT-AAGGGT-AACAACCC-CCG----TAGGCACGCCA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTG-T-GAT---C---G-A-AAA-A------ATAG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGG-GG--CGT---CA---G-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAG------------------------------------A-------GTCA-----G---T---TTTAAA------AACGCC-GTG-ACAT-G-GC-TG-A-AA------T-ATGT-T-GCC--AAA---C-C-G-----G-CG-T-----AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61757                      :                                                                               CGTGTCATAGAT-CACAACCT-C-T----T-GGCACGC-C-A--AAGATC-G---A---TTCTCTGAG-GTT---C---A-G-GAA-A------T-AG--T-----A-G-ACTC------A-T--TG--GGGCCAT---CA--GG-G--A-AAC-----------CA---G---AA-C-----AAAAT--------AT--A--T--------T-----------------TCA-----G---T---T----A------AC-GCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-T-----G-CG-T--A--AA-A--CG-AC----A--A--T----TA--A-T-CCA-TTAA
gi|61758                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAGCAC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-GT--T---TTCCCTGAA-GTC---T---GAA-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--
gi|61759                      :                                                                               CATGTCAAGAAT-CACAGCCC-CCT----T-GACACAC-A-A--AAGATC-G---T---CTTCCTGAT-GTT---C---G-A-AGACA------A-CA--T-----A-G-TCTC------A-C--AGA-AAGCCAA---CA--GC-A--A-AAC-T-------C-CA---T---AA-C--T-CACTGCCA--AAT-AT--A--T--------T-----------------TCA-----G---C---T----A--------------T----AT-A-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GAG--AAA---A-T-G-----G-CG-T--ATCAA-C--CA-T
gi|61760                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CAAAACCC-CCT----T-TGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCACTAAC-TTT---C-----A-TAA-A------G-Aacaagttataaa
gi|61761                      :                                                                               CGTGCCAAGGAT-CAGAACTC-CCT----T-GGCACGC-A-G--AAGATC-G---T---TTC
gi|61762                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCC----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-GA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------ATCC-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61763                      :                                                                                GTGTCAGGGAGACACATCGC-CCCACAAT-GTCACGC-C-ATTAAGATC-G---T---TTCCCTGAG-TTT---CTTAA-A-AAA-A------A-AG--------A-G-GC-C------ATC--TGA-GGGCCGT---TG--AG-G--AGAAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TCAAACCA--G---A---A--T--------T-GG----TA-------GTCG-----T---A---T----A------ACCGCC-GT---AAT-G-G--TG-ATAA------T-A--T-T-GCC--CAA---A-CAG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-CAA-TCGAT
gi|61764                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-CACAACTT-TTT----T-GACATGC-A-A--ATAACT-G---T---TTCTTTGGT-TTT---C---G-A-CCA-A------G-GG--A-----A-G-GCTT------A-C--TGA-AAGTCGT---CA--GG-A--A-AAC-TAAAGTTAT-AA---A---CC-T--T-GAAAAGCAATA---AT--A--T--------T-T-----CA-------TTTA---------C---T----AATAGTTACTAAC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--T--AA-A--
gi|61765                      :                                                                                 TGTCAACGAT-CAC---CC-CCT----T-CGCAAAC-A-G--AA-ATC-A---T---TTTTC-GAT-GTT---T---G-A-AG------------G--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-C--AAC--------GC--A-----------T-A-----CA-------G-CA-----G---C---T----A------ACTG-C-GTG-AAAT-G-G--TG----A------T-A--T-----C--AAAT--A-T-G-----A-CG-T--A--AA-C--GA-TA----G--G--A----TACCA-T-CAA-Ttccaat
gi|61766                      :                                                                                 TGTCAAAGAT-CACAACCC-CCT----T-CGCAAAC-A-A--AAGATC-A---T---TT
gi|61767                      :                                                                                 TGTCTAGGAT-CACAACCT-TCT----T-GTCACGC-A-A--AATATC-G---T---GTCCCTGAT-GTT---C---G-A-TAA-A------G-AG--C-----A-G-ACTC------T-C--TGA-TGGCCGT---CA--GG-G--A-AAA-T-------T-CA---T---CA-T--T-TAAAACC------------------------------------------TA-----G---C---T----T------ACTGAT--TG-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GAC--AGA---A-T-ATTTTTG-TG-T--A--AA-A--CA-AT-------A--A----CA--A-A-CAA-TC
gi|61768                      :                                                                                 TGTCAAGGTT-CAAAACCC-CCA----T-GGCACAC-ACA--AAAATC-A---T---TTCTCTGGT-TTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-G-GCTC------C-CA-TG--GAGTTG----CA---G-G--A-AGT-T-------T-CA---A---AATC--T-C----TC-------AC--A--T--------T-T-----CA-------TTCA-----G---TTTAT----A------ACCTCA-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-CATGCATGT-A--T-T-GTC--AGA---A-C-G-----G-TG-T--T--AA-A--CC-CA----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCGAtcaa
gi|61769                      :                                                                                 TGTCAAGAAT-CACAACCC-CCT----T-GTACCGC-A-A--A------------------CT-AT--TT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-C-ACTC------A-T--TGG-GGGCCAT---TG--GA-G--A-AAC-T-------C-CA---AG--CT-T--T-CCAAAACA--ATTCAT--A--T--------T-T-----CATATACATGTT------G---T---T----A------ACCACC-GCA-AAAT-G-----G-A-AA------T-
gi|61770                      :                                                                                   TCAAGGAT-CA-AACACGCCT----T-GT---------------TT-G---T---TTCCCTGAT-TTT---C---A-A-AAA-A------G-AA--C-----T-G-GCTC------A-CCATGA-GG--CAT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATACCG--A---ACGTA--T--------T-T-----CT-------TTTA-----A---T---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAC---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-AA----A--A--G----TG--A-T-CAA-TC
gi|61771                      :                                                                                   TCAAGG-T-TATAACCC-TGT----T-GGTACTC-A-A--AATATC-C---T---TTCCCTGAT--TT---C---G-G-AA---------G-AG--T-----A-C-GCTC------A-C--TGG-GAGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-T-------C-CA---A---CT-C--T-CACTACCA--A---A
gi|61772                      :                                                                                      AGGAT-AACAACCC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCTTTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--TCTACTA-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CTA-TCAAT
gi|61773                      :                                                                                          T-CACAACCC-CCT----T-GGCGCGC-T-A--AAGCTC-G---T---TTCTTTAAT-ATT---T---A-A-AAA-A------G-AG--G-----A-G-GCTC------A-G--CGA-GGGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-A-------T-C
gi|61774                      :                                                                                               AACCC-CCT----TGGGCACGC---A--AAGATC-G---G---TTTTCCGAT-GTT---C---G-A-AAA-AAT----A-GG--TA----A-G-GCTCA-----A-C--TGA-GGG-CGT---C---GG-G--A-AAC-T-------T-C----A---CA-CTTT-C-AAACCA--G---AC-----T--------T-G-----TA-------GTCGT----G---T---T----A------ACCGCC-GTG--AAT-G-GC-TGAA-AA------G-A--T-T-GCC--AAAG--A-CGG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--G----TA--ACT-CA
gi|61775                      :                                                                                                        ----T-GGCACGA-T-A--AAGATC-----C---CTCCCTG---------C---G-C-AAA----------------------G-GCCC-----------TGA-GGGCCGAGCACA--GG-CCTA-AAT-T-------TGCA---G---CC-C--TTCATAGGCA--A-------------------T-G--------------GTGA---------------------------CGTC-TCC-AAAT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAG---T-G-G-----GACG-T--A--AA-A--CA-GC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61776                      :                                                                                                                  CAC-A-A--AAGAAT-G---T---TTCCCTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-G-TATC------A-C--AGA-TGGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---CA-C--T-CAAAACAA--A---AT--A--T--------T-T-----CA-------GTTA-----G---C---T----A------GCCGCC-GTA-AAAA-A-TC-T--A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-
gi|61777                      :                                                                                                                    C-A-A--AAAGTT-GACTT---TCCCCCGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-ATGCTC------A----TGA-GGGTCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---C---TA-C--T-TAAAACCA--A---taatttaa
gi|61777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAATgtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgttacagtcagctaaccgccgtaaaatgactgaaatattgccaaaatggcgtaaaacctcaaataatcaatcaat
gi|61778                      : caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgAGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---TA-C--T-CAAAAATA--A---AT--A--T--------T-T-----CT-------GGTA-----G---C---T----A------GCCGCC-TTG-AAA
gi|61779                      :                                                                                                                              ATG-G---T---TTCCC-GAT-GTT---C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-A-GCTC------A-C--TGG-GAGCCAT---CA--GA-G--A-TAT-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATACCA--G---AC--A--TATTCTAGGT-A-----TA-------TTTA-----A---T---T----A------ACTGAC-GTT-AAGT-G-GC-TC-A-AC------T-A--T-A-GCA--AAG---A-
gi|61780                      :                                                                                                                                 -G---T---TTCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-CCTC------A-C--CGA-ATGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CA---A---CG-C--T-CTAAATCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------ATTG-----G---C---T----A------ACCGCC----------------G-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AT-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TC
gi|61781                      :                                                                                                                                                 AT-ATT---T---G-A-AAG-ACCCGGTG-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GAAG--A-AACCT-------T-CAT--A---CA-C--T-CAAA--CA--G---AC--AA-T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCTCC-GTG-AAAT-G-GC-TGAA-AA------T-A--T-TGGCC--AAA---A-C-G-----G-CGTT--A--AA-AACCA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61782                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A---------------------------------------------------------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61783                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---AGA-CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A---------------------------------------------------------ACCGCC-GTG-A--T-G-GT-TG-A-A-------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----GGCG-T--A--AA-A--CA-TT-------A--A----TA--A-T-CAA-T
gi|61784                      :                                                                                                                                                                    A-A------G-AG--T-----T-G-GCTT------A-C--AGA-GGGCCGT---CA--AG-G----AAT-T-------C-CA---A---AA-C--T-AGATACCG--A---ACATA--T--------T-T-----CA-------TTTA-----AACTT---T----A------ACCATC-GTT-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-
gi|61785                      :                                                                                                                                                                                               TC------A-C--TGG-GAGC-GT---CA--GA-A--A-AAC-T-------T-TA---AATCCC-T--T-TAAAACCG-------------T--------TCG-----TA-------TTCAAATACG---G---T----A------ACCGCT-TTA-AACT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAA---A-T-G-----G-TG-T--C--AA-A--CC-CA----A--A--A----AA--A-T-CTG-TCAA
gi|61786                      :                                                                                                                                                                                                          --TGA-GGATCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-AA---A---CA-C--A-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTAA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--TA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-CCAAT
gi|61787                      :                                                                                                                                                                                                          --TAA-GGCCTTT---CAT-AG-G--A-ATC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GCCC-----G---C---C----A------ACCACC-GTG-AAA---------------------------T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61788                      :                                                                                                                                                                                                                                                               -C--T-CACA--CA--C---AC--A--T--------T-A-----CA-------TTTA-----C---C---T----A------AACGCC-GTA-CAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTT--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-AAG-TAAAT
gi|61789                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            A--A---AC--A--C--------T-T-----CA-------GTTA-----G---C---T----C------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-GG-C--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AACG--CA-TTTTAAA--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aacgtcagaatcatc------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA--------A--TAT-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-G--CA-TTAA--A--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61792                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacgtcagaatcatc---T----G------ACCGCT-GTA-AAAT-G-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-AG-T--A--AA-A--CA-TC----A--A--C----TA--G-T-CAA-TCCAT
gi|61793                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACTGCC-TTG-AAAT-G-GC-TG-C-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAGT
gi|61794                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACCTTC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TT----A--A--A----TA--A-
gi|61795                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-CA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61796                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------GAA--T-T-GCC---AA---A-C-G-----G-CGCT--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-TACAA-TCAAT
gi|61797                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---AAC-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--G----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61798                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC----T--A--A----CA--A-T-CAA-TCA
gi|61799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--T----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61800                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCACT-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--A--AA-A--TA-TC----A--A--A----CA--A-T-CAA-CC
gi|61801                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-G-AA------T-G--T-T-GAC--AAA---A-C-A-----G-CG-T-----AA-A--CG--T----A--A--AGCACCA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61802                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTC-TTA-AAATTA-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCC-AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--AC---CA--C-T-CAA-TCcaa
gi|61803                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCC-GTG-AAAT-G-AC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-TAAA--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--
gi|61804                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CC-GT----AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--AAG---A-G-A-----GACG-T--A--AA-A--CA-AC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA-----C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCA
gi|61806                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC-------A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61807                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAA---G-G-G-----A-CG-A--A--AA-A--CA-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT


blockSeqs                     :                                                                                           A        G   ACAA A       C C TT      C ACT ACA         A   ATT TTA A G   C CCCGGT T  CG CTACT A T    TTTTGC T CA           GCA  CT    CT       AAAGTTA    TTT ATC    TT          ATTC    AT AT ATTCTAGG GTCTTC   TATACAT    AATACGG       TTAA ATAGTT          A         G  A C  TGCATG   TG       AA   AAC   A TTTTT A  T AA TC    AC     TTAA TT AT GCAC  CC T
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    G       . . .       . T   .           .   C   .   . .   . AT     .  .  A     A .    TTTTGC . A            .    G     .        .          T   GA     .           GCC     GT A  .        GT       .          GTTTA         .    .               T         T  A T  .        G        A    T     G .     G  C .  .     .      AA   .  .  C     .  C
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    A      . .            .    T     .        .          .   G      .           AAT     AT .  .        GG       .          AACTT         .    .               .         .  . .  .        .        C    G     . .     A  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           ATA     .  .  .        CG       .          TGT           .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        A        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        G        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        G        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        G        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        G        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        G        .          CC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        G        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        T        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        G        .          TA            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        G        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        G        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          AT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        A        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        G        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           G       .  .  .        G        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          AT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                           .        .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                    .   .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GT            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                        .    .       . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        A        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                     . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        T        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                     . . .       . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           C       .  .  .        .        .          CC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                 . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           A       .  .  .        .        .          GC            .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                 . .   .           .   .   .   . .   . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           .       .  .  .        .        .          C             .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                 . .   .                             . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           .       .  .  .        .        .          .             .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     . .      .  .  .     . .    .      . .            .    .     .        .          .   .      .           .       .  .  .        .        .          .             .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     . .      .                  .      . .            .    .     .        .          .   .      .           .       .  .  .        .        .          .             .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .            .    .     .        .                     .           .          .  .        .        .          .             .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .            .    .                                                .                                                        .    .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .               .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .      .    .  .  .     .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .     . .     .  . .  .     .                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .        .    .                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .        .                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .         .  . .  .                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                                                                                                


blockSeqCons                  :                                                                               
originalCons                  :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
finalCons                     :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1111111                                                                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                           1        1   2222 2       1 1 11      1 222 111         1   333 111 1 1   1 444444 1  11 33333 2 1    666666 1 22   1       111  33  1 11 1   1 3333333 1  222 444  1 11 1        444444  44 22 33333333 0000000  3333333    4444444444444 2222 222222      0   1    0 0  1  1 1  222222 0 11 0 0   22   222 0 1 11111 2  1 11 11  0 11  0  2222 11 11 2222  11 1 0   0     
lowQualScore                  :                                                                                           .        .   .... .       . . ..      . ... ...         .   ... ... . .   . ...... .  .. ..... . .    ...... . ..   .       ...  ..  . .. .   . ....... .  ... ...  . .. .        ......  .. .. ........ .......  .......    ............. .... ......      .   .    . .  .  . .  ...... . .. . .   ..   ... . . ..... .  . .. ..  . ..  .  .... .. .. ....  .. . .   .     
lowQualScore                  :                                                                                           3        2   6666 4       1 1 66      1 999 888         1   000 999 1 1   0 222222 0  44 66666 1 0    888888 0 33   0       777  22  0 33 0   0 2222222 0  888 111  0 33 0        444444  11 33 55555555 2222222  2222222    2222222222222 0000 555555      7   4    7 7  4  4 4  000000 7 77 7 7   55   888 7 5 99999 3  5 11 11  8 11  8  8888 11 11 5555  11 6 8   9     
consensus                     :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
Reference ( family-316 )      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61743                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-AT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61744                      :                                                                               CGTGTCAAAGAT-CACAACCT-CCT----T-GGCATGC-A-A--AAGATT-G---T---TTTCCTGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--G--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61745                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACTACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---A-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--G-CAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61746                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AATATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----T-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-TA---A---CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--C--T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--AATA----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61747                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCT------GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CATTTA---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----TA-------ATCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCAAAAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61748                      :                                                                               CGTGTCAAGAAT-CAGAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------A-AGCGT-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--AG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTC--AAA---A-T-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-AT----G--A--A----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61749                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCC-CCT----T-GCCAAGC-A-A--AAGATA-A---T---TTCCCTGAT-GTT---C-----A-AAA-A------G-GG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAGCCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-A-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAT-TCAAT
gi|61750                      :                                                                               CATGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-GAAT-G-GCGTA-A-AA------C-A--T-T-A--------------------------------------A-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61751                      :                                                                               CGTGTCAAGGAA-CACAACCC-CCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-T--TAA-AGACCGT---CA--GG-A--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----C---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAA
gi|61752                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-C-CAACCC-CCT----A-GGCACAC-A-A--AAGATC-G---T---TT-CCTGATAGTTC--C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGAGGGGCCGT---CA--GT-G----AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--G---AC--A--T--------G-GT----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCGCCAGTGAAAAT-G-GCTTG-A-AA------C-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CC-G--A--AA-A--CA-TT----ATTA--A----TA--ATT-CAA-TCAAT
gi|61753                      :                                                                               CGTGTCAAG-AT-CACAACCC-C-T----T-GGCACGC-A-A--AAGATCCG---TACATTCCCTGAT-GTTATTC---G-AGAAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CACTGG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--GCC-AC--A--T--------T-GTCTTCCC-------GTTA------------------A------ACCGCC-GTG-AAAT-GCGC-TG-A-AA------T-AG-T-T-GCCA-AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CATTT----A--A--A----T---A-T-CAACTCAAT
gi|61754                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAACCA-CCT----T-GTCACGC-A-A--ACGATC-G---T---TCCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--C-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGC---CAG-GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TAAAACCA--A---AC--AATT--------T-G-----CA-------GTAA-----G---T---T----A------ATCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-ACAA------T-
gi|61755                      :                                                                               CATGTCAAGGCT-AACAACCC-C-T----T-GGCATGC-A-A--AAAAAA-G---T---TTCCCAGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--A-----A-G-GCTC------A-T--TGG-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CACAACCA--A---ACATA--T--------T-----------------TCA-----G---T---T----A-----------C-ATGTAAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--A-T-GCC--AAAAACA-T-G-----T-CA-T--C--AA-A--CA-TC----A--A--T----CA--A-C-CAA-TCAGT
gi|61756                      :                                                                               CGTGT-AAGGGT-AACAACCC-CCG----TAGGCACGCCA-A--AAGATC-G---T---TTCCCTG-T-GAT---C---G-A-AAA-A------ATAG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGG-GG--CGT---CA---G-G--A-AAT-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAG------------------------------------A-------GTCA-----G---T---TTTAAA------AACGCC-GTG-ACAT-G-GC-TG-A-AA------T-ATGT-T-GCC--AAA---C-C-G-----G-CG-T-----AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61757                      :                                                                               CGTGTCATAGAT-CACAACCT-C-T----T-GGCACGC-C-A--AAGATC-G---A---TTCTCTGAG-GTT---C---A-G-GAA-A------T-AG--T-----A-G-ACTC------A-T--TG--GGGCCAT---CA--GG-G--A-AAC-----------CA---G---AA-C-----AAAAT--------AT--A--T--------T-----------------TCA-----G---T---T----A------AC-GCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-T-----G-CG-T--A--AA-A--CG-AC----A--A--T----TA--A-T-CCA-TTAA
gi|61758                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CACAGCAC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-GT--T---TTCCCTGAA-GTC---T---GAA-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--
gi|61759                      :                                                                               CATGTCAAGAAT-CACAGCCC-CCT----T-GACACAC-A-A--AAGATC-G---T---CTTCCTGAT-GTT---C---G-A-AGACA------A-CA--T-----A-G-TCTC------A-C--AGA-AAGCCAA---CA--GC-A--A-AAC-T-------C-CA---T---AA-C--T-CACTGCCA--AAT-AT--A--T--------T-----------------TCA-----G---C---T----A--------------T----AT-A-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GAG--AAA---A-T-G-----G-CG-T--ATCAA-C--CA-T
gi|61760                      :                                                                               CGTGTCAAGGAT-CAAAACCC-CCT----T-TGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCACTAAC-TTT---C-----A-TAA-A------G-Aacaagttataaa
gi|61761                      :                                                                               CGTGCCAAGGAT-CAGAACTC-CCT----T-GGCACGC-A-G--AAGATC-G---T---TTC
gi|61762                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-AACAACCC-CCC----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCCCTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGACCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-GA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------ATCC-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TA----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61763                      :                                                                                GTGTCAGGGAGACACATCGC-CCCACAAT-GTCACGC-C-ATTAAGATC-G---T---TTCCCTGAG-TTT---CTTAA-A-AAA-A------A-AG--------A-G-GC-C------ATC--TGA-GGGCCGT---TG--AG-G--AGAAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-TCAAACCA--G---A---A--T--------T-GG----TA-------GTCG-----T---A---T----A------ACCGCC-GT---AAT-G-G--TG-ATAA------T-A--T-T-GCC--CAA---A-CAG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-CAA-TCGAT
gi|61764                      :                                                                                GTGTCAAGGAT-CACAACTT-TTT----T-GACATGC-A-A--ATAACT-G---T---TTCTTTGGT-TTT---C---G-A-CCA-A------G-GG--A-----A-G-GCTT------A-C--TGA-AAGTCGT---CA--GG-A--A-AAC-TAAAGTTAT-AA---A---CC-T--T-GAAAAGCAATA---AT--A--T--------T-T-----CA-------TTTA---------C---T----AATAGTTACTAAC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--T--AA-A--
gi|61765                      :                                                                                 TGTCAACGAT-CAC---CC-CCT----T-CGCAAAC-A-G--AA-ATC-A---T---TTTTC-GAT-GTT---T---G-A-AG------------G--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T----------CA-C--T-C--AAC--------GC--A-----------T-A-----CA-------G-CA-----G---C---T----A------ACTG-C-GTG-AAAT-G-G--TG----A------T-A--T-----C--AAAT--A-T-G-----A-CG-T--A--AA-C--GA-TA----G--G--A----TACCA-T-CAA-Ttccaat
gi|61766                      :                                                                                 TGTCAAAGAT-CACAACCC-CCT----T-CGCAAAC-A-A--AAGATC-A---T---TT
gi|61767                      :                                                                                 TGTCTAGGAT-CACAACCT-TCT----T-GTCACGC-A-A--AATATC-G---T---GTCCCTGAT-GTT---C---G-A-TAA-A------G-AG--C-----A-G-ACTC------T-C--TGA-TGGCCGT---CA--GG-G--A-AAA-T-------T-CA---T---CA-T--T-TAAAACC------------------------------------------TA-----G---C---T----T------ACTGAT--TG-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GAC--AGA---A-T-ATTTTTG-TG-T--A--AA-A--CA-AT-------A--A----CA--A-A-CAA-TC
gi|61768                      :                                                                                 TGTCAAGGTT-CAAAACCC-CCA----T-GGCACAC-ACA--AAAATC-A---T---TTCTCTGGT-TTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-G-GCTC------C-CA-TG--GAGTTG----CA---G-G--A-AGT-T-------T-CA---A---AATC--T-C----TC-------AC--A--T--------T-T-----CA-------TTCA-----G---TTTAT----A------ACCTCA-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-CATGCATGT-A--T-T-GTC--AGA---A-C-G-----G-TG-T--T--AA-A--CC-CA----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCGAtcaa
gi|61769                      :                                                                                 TGTCAAGAAT-CACAACCC-CCT----T-GTACCGC-A-A--A------------------CT-AT--TT---G---G-A-AAA-A------G-AG--T-----G-C-ACTC------A-T--TGG-GGGCCAT---TG--GA-G--A-AAC-T-------C-CA---AG--CT-T--T-CCAAAACA--ATTCAT--A--T--------T-T-----CATATACATGTT------G---T---T----A------ACCACC-GCA-AAAT-G-----G-A-AA------T-
gi|61770                      :                                                                                   TCAAGGAT-CA-AACACGCCT----T-GT---------------TT-G---T---TTCCCTGAT-TTT---C---A-A-AAA-A------G-AA--C-----T-G-GCTC------A-CCATGA-GG--CAT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATACCG--A---ACGTA--T--------T-T-----CT-------TTTA-----A---T---T----A------ACCCCC-GTA-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAC---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-AA----A--A--G----TG--A-T-CAA-TC
gi|61771                      :                                                                                   TCAAGG-T-TATAACCC-TGT----T-GGTACTC-A-A--AATATC-C---T---TTCCCTGAT--TT---C---G-G-AA---------G-AG--T-----A-C-GCTC------A-C--TGG-GAGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-T-------C-CA---A---CT-C--T-CACTACCA--A---A
gi|61772                      :                                                                                      AGGAT-AACAACCC-TCT----T-GGCACGC-A-A--AAGATC-G---T---TTCTTTGAT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--TCTACTA-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CTA-TCAAT
gi|61773                      :                                                                                          T-CACAACCC-CCT----T-GGCGCGC-T-A--AAGCTC-G---T---TTCTTTAAT-ATT---T---A-A-AAA-A------G-AG--G-----A-G-GCTC------A-G--CGA-GGGCCGT---TA--GG-G--A-AAC-A-------T-C
gi|61774                      :                                                                                               AACCC-CCT----TGGGCACGC---A--AAGATC-G---G---TTTTCCGAT-GTT---C---G-A-AAA-AAT----A-GG--TA----A-G-GCTCA-----A-C--TGA-GGG-CGT---C---GG-G--A-AAC-T-------T-C----A---CA-CTTT-C-AAACCA--G---AC-----T--------T-G-----TA-------GTCGT----G---T---T----A------ACCGCC-GTG--AAT-G-GC-TGAA-AA------G-A--T-T-GCC--AAAG--A-CGG-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--G----TA--ACT-CA
gi|61775                      :                                                                                                        ----T-GGCACGA-T-A--AAGATC-----C---CTCCCTG---------C---G-C-AAA----------------------G-GCCC-----------TGA-GGGCCGAGCACA--GG-CCTA-AAT-T-------TGCA---G---CC-C--TTCATAGGCA--A-------------------T-G--------------GTGA---------------------------CGTC-TCC-AAAT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAG---T-G-G-----GACG-T--A--AA-A--CA-GC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61776                      :                                                                                                                  CAC-A-A--AAGAAT-G---T---TTCCCTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-G-TATC------A-C--AGA-TGGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---CA-C--T-CAAAACAA--A---AT--A--T--------T-T-----CA-------GTTA-----G---C---T----A------GCCGCC-GTA-AAAA-A-TC-T--A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-
gi|61777                      :                                                                                                                    C-A-A--AAAGTT-GACTT---TCCCCCGAT-GTT---T---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-ATGCTC------A----TGA-GGGTCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---C---TA-C--T-TAAAACCA--A---taatttaa
gi|61777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T--------T-A-----CA-------GTCA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAATgtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgttacagtcagctaaccgccgtaaaatgactgaaatattgccaaaatggcgtaaaacctcaaataatcaatcaat
gi|61778                      : caaaaagttgactttcccccgatgtttgaaaaagagtaatgctcatgagggtcgtcagggaaacttcactacttaaaaccaagtctggtgcataaaaattggtaccgtataatgatttatatgAGAAT-G---T---TTCCTTGAT-GTT---T---A-A-AAA-A------G-AG--A-----C-T-GATC------A-C--AGA-TAGTCTT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T--A---A---TA-C--T-CAAAAATA--A---AT--A--T--------T-T-----CT-------GGTA-----G---C---T----A------GCCGCC-TTG-AAA
gi|61779                      :                                                                                                                              ATG-G---T---TTCCC-GAT-GTT---C---G-A-GAA-A------G-AG--T-----A-A-GCTC------A-C--TGG-GAGCCAT---CA--GA-G--A-TAT-T-------T-CA---A---AA-C--T-CAATACCA--G---AC--A--TATTCTAGGT-A-----TA-------TTTA-----A---T---T----A------ACTGAC-GTT-AAGT-G-GC-TC-A-AC------T-A--T-A-GCA--AAG---A-
gi|61780                      :                                                                                                                                 -G---T---TTCCCTGGT-GTT---C---G-A-AAA-A------G-AG--T-----A-G-CCTC------A-C--CGA-ATGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------A-CA---A---CG-C--T-CTAAATCA--A---AC--A--T--------T-G-----CA-------ATTG-----G---C---T----A------ACCGCC----------------G-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AT-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TC
gi|61781                      :                                                                                                                                                 AT-ATT---T---G-A-AAG-ACCCGGTG-AG--T-----A-G-GCTC------A-C--TGA-GGGCCGT---CA--GAAG--A-AACCT-------T-CAT--A---CA-C--T-CAAA--CA--G---AC--AA-T--------T-G-----TA-------GTCC-----G---T---T----A------ACCTCC-GTG-AAAT-G-GC-TGAA-AA------T-A--T-TGGCC--AAA---A-C-G-----G-CGTT--A--AA-AACCA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61782                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---A---CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A---------------------------------------------------------ACCGCC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAA
gi|61783                      :                                                                                                                                                                   AA-A------G--G--T-----AAG-GCTCTTTTGCA-C--TGA-GGGCCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-CA---AGA-CA-C--T-CAAAACCA--A---AC--A---------------------------------------------------------ACCGCC-GTG-A--T-G-GT-TG-A-A-------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----GGCG-T--A--AA-A--CA-TT-------A--A----TA--A-T-CAA-T
gi|61784                      :                                                                                                                                                                    A-A------G-AG--T-----T-G-GCTT------A-C--AGA-GGGCCGT---CA--AG-G----AAT-T-------C-CA---A---AA-C--T-AGATACCG--A---ACATA--T--------T-T-----CA-------TTTA-----AACTT---T----A------ACCATC-GTT-AAAT-A-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-
gi|61785                      :                                                                                                                                                                                               TC------A-C--TGG-GAGC-GT---CA--GA-A--A-AAC-T-------T-TA---AATCCC-T--T-TAAAACCG-------------T--------TCG-----TA-------TTCAAATACG---G---T----A------ACCGCT-TTA-AACT-G-AC-TG-A-AA------T-A--T-T-ACC--AAA---A-T-G-----G-TG-T--C--AA-A--CC-CA----A--A--A----AA--A-T-CTG-TCAA
gi|61786                      :                                                                                                                                                                                                          --TGA-GGATCGT---CA--GG-G--A-AAC-T-------T-AA---A---CA-C--A-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GTAA-----G---C---T----A------ACCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--TA-A--CC-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-CCAAT
gi|61787                      :                                                                                                                                                                                                          --TAA-GGCCTTT---CAT-AG-G--A-ATC-T-------T-CA---A---CA-T--T-CAAAACCA--A---AC--A--T--------T-A-----CA-------GCCC-----G---C---C----A------ACCACC-GTG-AAA---------------------------T-GCC--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--AA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61788                      :                                                                                                                                                                                                                                                               -C--T-CACA--CA--C---AC--A--T--------T-A-----CA-------TTTA-----C---C---T----A------AACGCC-GTA-CAAT-G-TC-TG-A-AA------T-A--T-T-GTT--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--C--A----TA--A-T-AAG-TAAAT
gi|61789                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            A--A---AC--A--C--------T-T-----CA-------GTTA-----G---C---T----C------ACCGCC-GTA-AAAT-G-AT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-GG-C--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----CA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AACG--CA-TTTTAAA--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aacgtcagaatcatc------ACCGCT-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA--------A--TAT-GCC--GAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-G--CA-TTAA--A--A--A----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61792                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacgtcagaatcatc---T----G------ACCGCT-GTA-AAAT-G-GC-TG-G-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-T-G-----G-AG-T--A--AA-A--CA-TC----A--A--C----TA--G-T-CAA-TCCAT
gi|61793                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACTGCC-TTG-AAAT-G-GC-TG-C-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAGT
gi|61794                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ACCTTC-GTG-AAAT-G-GT-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CT-TT----A--A--A----TA--A-
gi|61795                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-CA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----A-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61796                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------GAA--T-T-GCC---AA---A-C-G-----G-CGCT--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-TACAA-TCAAT
gi|61797                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---AAC-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--G----TA--A-C-CAA-TCAAT
gi|61798                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AC------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC----T--A--A----CA--A-T-CAA-TCA
gi|61799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCT--AAA---A-C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--T----AA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61800                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCACT-GTA-AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCC--AAA---A-C-A-----G-CA-T--A--AA-A--TA-TC----A--A--A----CA--A-T-CAA-CC
gi|61801                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGCC-ATA-AAAT-G-GC-TA-G-AA------T-G--T-T-GAC--AAA---A-C-A-----G-CG-T-----AA-A--CG--T----A--A--AGCACCA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61802                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTC-TTA-AAATTA-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCCC-AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--A--AC---CA--C-T-CAA-TCcaa
gi|61803                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCC-GTG-AAAT-G-AC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA---A-C-G-----G-CG-TAAA--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--
gi|61804                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CC-GT----AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--AAG---A-G-A-----GACG-T--A--AA-A--CA-AC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61805                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-GTG-AAAT-G-GC-TG-A-AA------G-A--T-T-GCC--AAA-----C-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TT----A--T--A----TA--A-T-CAA-TCA
gi|61806                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AAAT-G-GC-TG-A-AA------T-A--T-T-GCA--AAA---A-T-G-----G-CG-T--A--AA-A--CA-TC-------A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT
gi|61807                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AT-G-AG-TG-A-AA------T-A--T-T-CTC--GAA---G-G-G-----A-CG-A--A--AA-A--CA-TC----A--A--A----TA--A-T-CAA-TCAAT