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consensus                     :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
Reference ( gi|59434 )        :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---AA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59433                      :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59436                      :    TTTTTCTC--GC-TA--GT-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G--T---AA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59435                      :    TTTTTCTC--GC-TATAGA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-G--GA-G-AT---GA-T-C-TC--AC---T----A-------A-----A---------G---G-GA---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59430                      :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-
gi|59440                      :   tTTTTTCTC--AC-TA--GA-G-------------G-G--------AT--A-A-----T-TG-CATGCG--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-TTGTT
gi|59429                      :    TTTTTCTT--GT-TA--GA-A--------A--A-G-A--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-------A-T-C-TC--AC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--A--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59441                      :   tTTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CT-T----G--TTT---T-A------G-C--GA-T-AA---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----AGGGACCTAGG---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59414                      :    TTTTTTTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TA-C----A--TGT---T-A------G-C--AA-G-------A-T-C-TT--GC---T----AT------A-----C---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59443                      :  ttTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------AG-G-G-G--------ATA-A-A-----T-CG-C----G--TTT---TAA------G-C-----G-AT---GA-T-CTTC--GC---T----A-------T-----A---------G---G-GGA--AA--G--T-G-TT-A------C-C-A-AC-CTGT
gi|59444                      :    TTTTTCTC--GT-GA--GC-G--------A--G-G-A--------A-----A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-GT---GA-T-C-TC--AC---T----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59439                      :    TTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--CTT---T-A------G-G--GG-G-------A-T-C-TC--GC---T----ATTGTCGCATTATTG---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59437                      :    TTTTTCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-A-A--------AT--C-A-----G-CA-T----G--TTT---T-A------G-T--GA-G-GA---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---GAG----AA--T--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59447                      :    TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-----------------------------------------------------------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGCT
gi|59446                      :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-ACG--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------GAT--GA---AT---A-------C--GC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------T-C-C-AC-TTTTT
gi|59431                      :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-T----A--TTT---T-A------G-T--GA-G-AA---GA-T-C-TC--GC---T----
gi|59442                      :   tTTTATCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTTAAAT-A------G-C--GA-G-AA---GA-T-C-TC--GC---A----G-------T-----A---------G---GAG----AG--G--T-G-TT-T------C-C-T-AC-ATGTT
gi|59424                      :    TTTTTCTGTGGC-TA--GA-G--------A--GCG-G--------AT--A-A-----T--G-T----C--TTT---T--------G-C--GA-G-TT---AA-T-CGTC--TC--------A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-ATAC-TTGT
gi|59445                      :  ttTTTTTCTC--GC-TA--GA-GTCTAAGAGA--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--TA-G-GTGAAGA-C-C-TC------------------------------------------------A--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59432                      :    TTTTCCTT--GC-CA--GA-G--------G--G-G-G--------GA--A-A-----T-CG-C----GC-TTT---T-A------C-C--GA-G-ATG--AA-T-C--C--TC---T----A-------AC----A---------GGCCG-G----AA--GC-T-G-TTCC------C-C-A-AC-CCG
gi|59438                      :   tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--T-G-GATATATATAT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--GA-G-A----AT-T-C-TT--GC---T----A----------------------------------TA--G--T-A-TT-C------C-C-A-A
gi|59448                      :    TTTTTCTC--AG-TT--GA-A--------C--G-G-G--------AT--ACA-----T------------TTT---T-A------G-T--GA-G-AT--------T-TC--GC---T----A-------A-----A---------GA--G-G----AA--G--T-G-AT-C------C-C-G-AC-CTG
gi|59426                      :    TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G-------------------------------------------------------------A-----G---------G---G-A----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-TC-CTGTT
gi|59407                      :   ttTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-CG-T----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-AA---AA-T-C-TC--GCT--T----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59405                      : tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-T-TA--GC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-T-A-AC-CTGTT
gi|59449                      : tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---TA-T-C-TC--TT---TG---A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
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gi|59409                      : tttaTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-T-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-G--GA-G-AA---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AAT-G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59410                      : tttaTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AA-G-------A-T-C-TC--AT---T----A-------A-----A---------GA--G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59412                      : tttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
gi|59411                      :  ttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
gi|59451                      :  ttaTTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AA-G-A----A----C-TC--AC---C----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59417                      :     TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------C--G-G-G--------AT--G-A-----T-CA-T----G--TTT---A-A------G-C--AA-G-AA---CA-T-C-TC--GC---TATAAA-------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59454                      : tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----TCCG-C-------CTT---T-A------G-C--GA-A-TT---A----C-TC---C---T----A-------A-----G---------G---G-G----AG--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59416                      :     TTTTCTC--GCATA--GA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-CT-C----C--TTT---T-A------A-C--GA-G-AT---GA-A-C-TC--AC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-
gi|59404                      : tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--G
gi|59455                      : tttaTTTTCTC--GC-TA--GATG--------AT-G-G-G--------AT--A-A-----T-T--C----G--CTT---T-A------G-C--GA-G-AT---TA-T-CGTC---C---T----AAG-----A-----A---------G---G-G----AA--GATT-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59452                      :     TTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C---A-A-AG---AA---C-TC--ACCCAC----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--TCG-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59419                      :     TTTTTTC--AC-TA--AA-A--------A--G-G-A--------AA--A-A-----TTCG-C----C--TTT---C-A------G-T--GA-G-CT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-GAGTTAA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59450                      : tttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------ATTTA-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-T-------------------------------------------------------T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59408                      :     TTTTCTG--GC-AA--GA-G--------A--G-G-ATA------AT--A-A-----T-CGGC----G--ATT---T-ATATACGA-T--GA-GCAT---GA-T-C-TC--GC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59453                      : tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------T--G-G-G--------AT--A-A-------CA-C----A--TTT------------GTT--GA-G-A----AG-T-C-TT--GC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-G-AC-CTGTT
gi|59423                      :     TTTTCTC--GC-----GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--CTT---T-GTAC---A-T--GA-G-AT----A-T-C-TC--GC---T----A-------A-----T---------G---G-G----AA--G--T-G-TT--------C-C-A-A--CTGTT
gi|59421                      : tttaTCTTCTC--GC-TA--GA-G--------G--T-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---
gi|59415                      : tttaTTTTCTT--GC-TT--GG-G--------A--T-G-G--------AT--A-AATTAAT-CA-C----G--TTT---T-A------G-T--GA-G-AA---GA-T-C-TC--ACT--T----T-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-T------C-C-A-AC-
gi|59422                      :  ttgTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-
gi|59425                      :  ttaTTTTCTT--GT-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TCT---T-A------G-C-----------------T-TC--------------------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-GC-
gi|59413                      :  tttaTTTCTC--GC-TA--GA-G-----------G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--GTT---T-A------G-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------T-----A---------G---G-A----AA--G--T-G--T-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59420                      :  tttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-G----C--CTT---T-A------T-------G-GT---AA-TGT-TC--GCCG-T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TA-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59456                      :  tttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------GT--A-A-----T-C-------------------------A-C--GA-G-AT---GA-T-C-TC--GA---T----A-------T-----A---------G---GTG----AA--G--T-G-TT-T------C-
gi|59428                      :      TTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-C--C----C--CTT---T-A------T-------G-GT---TA-T-CTTC--GCCGGT----A-------A-----AC--------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-A-AT-CTG
gi|59427                      : ttttaTTTCTT--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------A---A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------T-G--TA-A-AT---G--T-T-TC--GTCG-T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TG-C------C-C-A-A--CTGT
gi|59451                      :  ttttaTTCTT--GC-TA--AA-A--------T--G-T-G--------AT--T-A-----T-CC-C----T--CTT---T-A------G-C--GA-G-AT---AA-
gi|59457                      :       TTCTC--GC-TC--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----C-CG-T----G---------------------------------A-T-C-TC--GC---T----GC------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTTctcaccacaggggaagtgttcccaacctgt
gi|59458                      :       TTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-T--------------------------------------A-T-C-TC--GC---T----A-------AT----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-
gi|59405                      :        TCTC--GC-TA--AA-A--------G--G-C-G--------AT--T-A-----T-CC-C----T--CTC---T-A------G-C--GA-G-AA---AA-T-
gi|59404                      :     tttTCTC--GC-TA--AA-A--------G--G-C-G--------AT--T-A-----T-CC-C----T--CTC---T-A------G-C--GA-G-AA---AA-T-tgatttagctaaaggggaagtgttcctaacctgtt
gi|59459                      :     tttTCTC--GC-CA--AA-G--------A--G-G-G--------AA--A-A-----T-CG-C----A--TTT---C-A------G-C--AA-G-AA---GA-C-C-TC--GC---tgatctcg
gi|59460                      :         CTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-G---------------------------A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59461                      :          TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----GGTTTT---T-A------G-C--GA-G-AA---GA-T-C-TC--GC---TTC--A-------T-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-CAAATTTC-CAA-AC-CTGTT
gi|59462                      :          TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------TA--A-A-----T-CG-C----A--CTTCC-T-A------A-CCAGA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-GATT-T------C-C-A-
gi|59463                      :           C--GC-TA--GA-G--------ACGG-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--TTT---T-A------G-C--GA-G--T---GATT-C-TC--GC---T----A-------AC----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-A-A-CC-CTG
gi|59464                      :                -TA--AG-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-G--GA-G-------A-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AAAGG--T-G-TT-T------C-C-A-AT-CTG
gi|59465                      :                                                  T--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------T-C--GA-G-AA---GA-T-C-TC--GC---T----ATC-----T-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59418                      :                                                      -A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA-A-AG---GA-T-C-TC--GC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTATT
gi|59440                      :                                                             tttttttctcg--TTT---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------
gi|59455                      :                                         tttttctcactagagggataattgcatgcgt--TCT---T-A------G----GACG-AT---AA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---C-G----AA--T--T-A-TC-C------C-ggggaagtgttcccaacttgtt
gi|59436                      :                                                          ttttctcgctagatgatTT---T-A------G-C--GA-G-AT---TA---C-TC--GC---T----A-------A-----A---------agggaagattgttcccaacc
gi|59405                      :                                              tttttctcgctagtgagggataatcgcgtTT---T-A------G-C--TA-A-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------A---G-G----ggggaagtgttcccaacctg
gi|59406                      :                                              tttattttctcgctagagagggataatcgTT---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------ggggaagtgttcctaacctgtt
gi|59412                      :                                           tttattttctcgcaaaagaaggataatcgcatTT---T-AT-----G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------A---G-GC---AA--T--T-A-TG-C------C-C-ggggaagtgttcccaacct
gi|59411                      :                                                         ttattttttcgctagagaTT---T-AT-----G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------A---G-GC---AA--T--T-A-TG-C------C-C-ggggaagatgttccgcaactttgtt
gi|59419                      :                                                         ttattttttcgctagagaTT---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-G-C-TC--AC---TG---A-------A-----A---------G---GCG----AA--T--T-T-TT-C------C-ggggaagatgttccgcaactttgtt
gi|59462                      :                                                        tttattttttcactaaaaaTT---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TCTGGT---T----A---------------------------G-G----AA--G--T-G-gggagttaaatgttcccaacctg
gi|59433                      :                                                         tcgctagagagggtaaatcg---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------ggggaagtgatttcca
gi|59430                      :                                                tttttctcgctagagagggataatcgcgt---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------taggggaagtgttcccaacctgtt
gi|59413                      :                                               ttttttctcgctagagagggataatcgcat---T-A------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------C---G-G----tagggaagtgttccca
gi|59466                      :                                                  tttatttctcgctagaggggataatca---T-A------G-A--AA-G-AT---GA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-C-TT-C------C-C-A-AC-CTGTTtaggaaagtgtcccaacctgtt
gi|59421                      :                                                                                   ------G-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------
gi|59404                      :                                                          tttatcttctcgctagaggtggataatcacgt-C--GA-G-AT---CA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------A---G-G----
gi|59449                      :                                                               tttattttctcgctagagagggataatcg--GA-G-AT---AA-T-C-TC--GC---T----A-------A-----A---------
gi|59467                      :                                                                      ttttctcgctagagagggataattgcgt-AT---GA-T-A-TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--T--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTGTTtttgaaggggaagtgttcccaacctgt
gi|59468                      :                                                                                                              -TC--GC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59469                      :                                                                                                                    C---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT





Alignments
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lowQualScore                  :                   00  0  00  0 22222222 22 0 0 44444444  11 0 11111 0  0 5555555   222 0 222222 0 00   222  222  2    666 2222 99999999999999999999999 222 2 4444  11 22 0 0  0 111111 1 0 0  1     
lowQualScore                  :                   ..  .  ..  . ........ .. . . ........  .. . ..... .  . .......   ... . ...... . ..   ...  ...  .    ... .... ....................... ... . ....  .. .. . .  . ...... . . .  .     
lowQualScore                  :                   99  7  99  7 44444444 22 7 7 77777777  66 6 66666 6  6 0000000   000 6 999999 6 99   555  333  5    444 9999 11111111111111111111111 555 0 9999  66 99 7 7  7 999999 3 7 7  5     
consensus                     :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
Reference ( family-314 )      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59404                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCG
gi|59405                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TT-TAGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-T-A-AC-CTGTT
gi|59406                      :        tttaTTTTCTC--GC-AA--AA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59407                      :        tttaTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-CG-T----G--TTT---T-A------G-C--GAG-AAAA---TC-TCGCT--T----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59408                      :        tttaTTTTCTG--GC-AA--GA-G--------A--G-G-ATA------AT--A-A-----T-CGGC----G--ATT---T-ATATACGA-T--GAGCATGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59409                      :        tttaTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-T-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-G--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AAT-G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
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gi|59411                      :        tttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
gi|59412                      :         ttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
gi|59413                      :          ttaTTTCTC--GC-TA--GA-G-----------G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--GTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------T-----A---------G---G-A----AA--G--T-G--T-C------C-C-A-AC-CTGTT
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gi|59417                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------C--G-G-G--------AT--G-A-----T-CA-T----G--TTT---A-A------G-C--AAG-AACA---TC-TCGC---TATAAA-------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59418                      :                                                         ttta-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAA-AGGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTATT
gi|59419                      : tttttttctcgTTTTTTC--AC-TA--AA-A--------A--G-G-A--------AA--A-A-----TTCG-C----C--TTT---C-A------G-T--GAG-CTGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GAGTTAA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59420                      :         tttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-G----C--CTT---T-A------T-G--GTA-ATG-----T-TCGCCG-T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TA-C------C-C-A-AC-CTGTT
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gi|59423                      :         ttaTTTTCTC--GC-----GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--CTT---T-GTAC---A-T--GAG-AT-A---TC-TCGC---T----A-------A-----T---------G---G-G----AA--G--T-G-TT--------C-C-A-A--CTGTT
gi|59424                      :       tttaTTTTTCTGTGGC-TA--GA-G--------A--GCG-G--------AT--A-A-----T--G-T----C--TTT---T--------G-C--GAG-TTAA---TCGTCTC--------A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-ATAC-TTGT
gi|59425                      :          ttTTTTCTT--GT-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TCT---T-A------G-C--------------T-TC------------------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-GC-
gi|59426                      :       tttaTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--------------------------------------------------------A-----G---------G---G-A----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-TC-CTGTT
gi|59427                      :           ttTTTCTT--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------A---A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------T-G--TAA-ATG----TT-TCGTCG-T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TG-C------C-C-A-A--CTGT
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gi|59431                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-T----A--TTT---T-A------G-T--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----
gi|59432                      :          tTTTTCCTT--GC-CA--GA-G--------G--G-G-G--------GA--A-A-----T-CG-C----GC-TTT---T-A------C-C--GAG-ATGA---AT-CCTC---T----A-------AC----A---------GGCCG-G----AA--GC-T-G-TTCC------C-C-A-AC-CCG
gi|59433                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59434                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATAA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59435                      :           TTTTTCTC--GC-TATAGA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-G--GAG-ATGA---TC-TCAC---T----A-------A-----A---------G---G-GA---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59436                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GT-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG--TAA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59437                      :           TTTTTCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-A-A--------AT--C-A-----G-CA-T----G--TTT---T-A------G-T--GAG-GAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---GAG----AA--T--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
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gi|59439                      :           TTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--CTT---T-A------G----GGG---GA---TC-TCGC---T----ATTGTCGCATTATTG---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59440                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G-------------G-G--------AT--A-A-----T-TG-CATGCG--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-TTGTT
gi|59441                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CT-T----G--TTT---T-A------G-C--GAT-AAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AGGGACCTAGG---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59442                      :           TTTATCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTTAAAT-A------G-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---A----G-------T-----A---------G---GAG----AG--G--T-G-TT-T------C-C-T-AC-ATGTT
gi|59443                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------AG-G-G-G--------ATA-A-A-----T-CG-C----G--TTT---TAA------G-C----G-ATGA---TCTTCGC---T----A-------T-----A---------G---G-GGA--AA--G--T-G-TT-A------C-C-A-AC-CTGT
gi|59444                      :           TTTTTCTC--GT-GA--GC-G--------A--G-G-A--------A-----A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-C--GAG-GTGA---TC-TCAC---T----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59445                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-GTCTAAGAGA--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--TAG-GTGAAGACC-TC----------------------------------------------A--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59446                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-ACG--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T--------------AG-ATGA---AT-ACGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------T-C-C-AC-TTTTT
gi|59447                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G------------------------------------------------------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGCT
gi|59448                      :           TTTTTCTC--AG-TT--GA-A--------C--G-G-G--------AT--ACA-----T------------TTT---T-A------G-T--GAG-AT------T-TCGC---T----A-------A-----A---------GA--G-G----AA--G--T-G-AT-C------C-C-G-AC-CTG
gi|59449                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATTA---TC-TCTT---TG---A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
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gi|59452                      :            TTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AAA---GA---AC-TCACCCAC----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--TCG-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59453                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------T--G-G-G--------AT--A-A-------CA-C----A--TTT------------GTT--GAG-AAG----TC-TTGC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-G-AC-CTGTT
gi|59454                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-C--C----GC-CTT---T-A------G-C--GA--ATTA----C-TC-C---T----A-------A-----G---------G---G-G----AG--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59455                      :            TTTTCTC--GC-TA--GATG--------AT-G-G-G--------AT--A-A-----T-T--C----G--CTT---T-A------G-C--GAG-ATTA---TCGTC-C---T----AAG-----A-----A---------G---G-G----AA--GATT-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59456                      :             TTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------GT--A-A-----T-C-------------------------A-C--GAG-ATGA---TC-TCGA---T----A-------T-----A---------G---GTG----AA--G--T-G-TT-T------C-
gi|59457                      :              TTCTC--GC-TC--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----C-CG----------------------------------TGA---TC-TCGC---T----GC------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59458                      :              TTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-T----------------------------------A---TC-TCGC---T----A-------AT----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-
gi|59459                      :               TCTC--GC-CA--AA-G--------A--G-G-G--------AA--A-A-----T-CG-C----A--TTT---C-A------G-C--AAG-AAGA---CC-TCGC---
gi|59460                      :                CTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-----------------------A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59461                      :                 TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----GGTTTT---T-A------G-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---TTC--A-------T-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-CAAATTTC-CAA-AC-CTGTT
gi|59462                      :                 TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------TA--A-A-----T-CG-C----A--CTTCC-T-A------A-CCAGAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-GATT-T------C-C-A-
gi|59463                      :                  C--GC-TA--GA-G--------ACGG-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG--TGAT--TC-TCGC---T----A-------AC----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-A-A-CC-CTG
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gi|59465                      :                                                         T--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------T-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----ATC-----T-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
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Alignments
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lowQualScore                  :                   ..  .  ..  . ........ .. . . ........  .. . ..... .  . .......   ... . ...... . ..   ...  ...  .    ... .... ....................... ... . ....  .. .. . .  . ...... . . .  .     
lowQualScore                  :                   99  7  99  7 44444444 22 7 7 77777777  66 6 66666 6  6 0000000   000 6 999999 6 99   555  333  5    444 9999 11111111111111111111111 555 0 9999  66 99 7 7  7 999999 3 7 7  5     
consensus                     :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
Reference ( family-314 )      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59404                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCG
gi|59405                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TT-TAGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-T-A-AC-CTGTT
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gi|59411                      :        tttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
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gi|59414                      :       tttaTTTTTTTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TA-C----A--TGT---T-A------G-C--AA----GA---TC-TTGC---T----AT------A-----C---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
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gi|59416                      :         ttgTTTTCTC--GCATA--GA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-CT-C----C--TTT---T-A------A-C--GAG-ATGA---AC-TCAC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-
gi|59417                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------C--G-G-G--------AT--G-A-----T-CA-T----G--TTT---A-A------G-C--AAG-AACA---TC-TCGC---TATAAA-------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59418                      :                                                         ttta-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAA-AGGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTATT
gi|59419                      : tttttttctcgTTTTTTC--AC-TA--AA-A--------A--G-G-A--------AA--A-A-----TTCG-C----C--TTT---C-A------G-T--GAG-CTGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GAGTTAA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59420                      :         tttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-G----C--CTT---T-A------T-G--GTA-ATG-----T-TCGCCG-T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TA-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59421                      :        tttaTCTTCTC--GC-TA--GA-G--------G--T-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---
gi|59422                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---T
gi|59423                      :         ttaTTTTCTC--GC-----GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--CTT---T-GTAC---A-T--GAG-AT-A---TC-TCGC---T----A-------A-----T---------G---G-G----AA--G--T-G-TT--------C-C-A-A--CTGTT
gi|59424                      :       tttaTTTTTCTGTGGC-TA--GA-G--------A--GCG-G--------AT--A-A-----T--G-T----C--TTT---T--------G-C--GAG-TTAA---TCGTCTC--------A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-ATAC-TTGT
gi|59425                      :          ttTTTTCTT--GT-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TCT---T-A------G-C--------------T-TC------------------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-GC-
gi|59426                      :       tttaTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--------------------------------------------------------A-----G---------G---G-A----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-TC-CTGTT
gi|59427                      :           ttTTTCTT--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------A---A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------T-G--TAA-ATG----TT-TCGTCG-T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TG-C------C-C-A-A--CTGT
gi|59428                      :        ttttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-C--C----C--CTT---T-A------T------G-GTTA---TCTTCGCCGGT----A-------A-----AC--------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-A-AT-CTG
gi|59429                      :      ttttaTTTTTCTT--GT-TA--GA-A--------A--A-G-A--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA----GA---TC-TCAC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--A--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59430                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-
gi|59431                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-T----A--TTT---T-A------G-T--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----
gi|59432                      :          tTTTTCCTT--GC-CA--GA-G--------G--G-G-G--------GA--A-A-----T-CG-C----GC-TTT---T-A------C-C--GAG-ATGA---AT-CCTC---T----A-------AC----A---------GGCCG-G----AA--GC-T-G-TTCC------C-C-A-AC-CCG
gi|59433                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59434                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATAA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59435                      :           TTTTTCTC--GC-TATAGA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-G--GAG-ATGA---TC-TCAC---T----A-------A-----A---------G---G-GA---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59436                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GT-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG--TAA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59437                      :           TTTTTCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-A-A--------AT--C-A-----G-CA-T----G--TTT---T-A------G-T--GAG-GAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---GAG----AA--T--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59438                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--T-G-GATATATATAT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--GAG-A--AT--TC-TTGC---T----A----------------------------------TA--G--T-A-TT-C------C-C-A-A
gi|59439                      :           TTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--CTT---T-A------G----GGG---GA---TC-TCGC---T----ATTGTCGCATTATTG---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59440                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G-------------G-G--------AT--A-A-----T-TG-CATGCG--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-TTGTT
gi|59441                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CT-T----G--TTT---T-A------G-C--GAT-AAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AGGGACCTAGG---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59442                      :           TTTATCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTTAAAT-A------G-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---A----G-------T-----A---------G---GAG----AG--G--T-G-TT-T------C-C-T-AC-ATGTT
gi|59443                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------AG-G-G-G--------ATA-A-A-----T-CG-C----G--TTT---TAA------G-C----G-ATGA---TCTTCGC---T----A-------T-----A---------G---G-GGA--AA--G--T-G-TT-A------C-C-A-AC-CTGT
gi|59444                      :           TTTTTCTC--GT-GA--GC-G--------A--G-G-A--------A-----A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-C--GAG-GTGA---TC-TCAC---T----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59445                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-GTCTAAGAGA--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--TAG-GTGAAGACC-TC----------------------------------------------A--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59446                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-ACG--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T--------------AG-ATGA---AT-ACGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------T-C-C-AC-TTTTT
gi|59447                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G------------------------------------------------------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGCT
gi|59448                      :           TTTTTCTC--AG-TT--GA-A--------C--G-G-G--------AT--ACA-----T------------TTT---T-A------G-T--GAG-AT------T-TCGC---T----A-------A-----A---------GA--G-G----AA--G--T-G-AT-C------C-C-G-AC-CTG
gi|59449                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATTA---TC-TCTT---TG---A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59450                      :            TTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------ATTTA-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-T-----------------------------------------------------T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59451                      :            TTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AAG-A--A----C-TCAC---C----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59452                      :            TTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AAA---GA---AC-TCACCCAC----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--TCG-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59453                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------T--G-G-G--------AT--A-A-------CA-C----A--TTT------------GTT--GAG-AAG----TC-TTGC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-G-AC-CTGTT
gi|59454                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-C--C----GC-CTT---T-A------G-C--GA--ATTA----C-TC-C---T----A-------A-----G---------G---G-G----AG--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59455                      :            TTTTCTC--GC-TA--GATG--------AT-G-G-G--------AT--A-A-----T-T--C----G--CTT---T-A------G-C--GAG-ATTA---TCGTC-C---T----AAG-----A-----A---------G---G-G----AA--GATT-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59456                      :             TTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------GT--A-A-----T-C-------------------------A-C--GAG-ATGA---TC-TCGA---T----A-------T-----A---------G---GTG----AA--G--T-G-TT-T------C-
gi|59457                      :              TTCTC--GC-TC--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----C-CG----------------------------------TGA---TC-TCGC---T----GC------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59458                      :              TTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-T----------------------------------A---TC-TCGC---T----A-------AT----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-
gi|59459                      :               TCTC--GC-CA--AA-G--------A--G-G-G--------AA--A-A-----T-CG-C----A--TTT---C-A------G-C--AAG-AAGA---CC-TCGC---
gi|59460                      :                CTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-----------------------A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59461                      :                 TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----GGTTTT---T-A------G-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---TTC--A-------T-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-CAAATTTC-CAA-AC-CTGTT
gi|59462                      :                 TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------TA--A-A-----T-CG-C----A--CTTCC-T-A------A-CCAGAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-GATT-T------C-C-A-
gi|59463                      :                  C--GC-TA--GA-G--------ACGG-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG--TGAT--TC-TCGC---T----A-------AC----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-A-A-CC-CTG
gi|59464                      :                       -TA--AG-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-G--GA----GA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AAAGG--T-G-TT-T------C-C-A-AT-CTG
gi|59465                      :                                                         T--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------T-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----ATC-----T-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59466                      :                                                                                    ---T-A------G-A--AAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-C-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59467                      :                                                                                                        -ATGA---TA-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--T--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59468                      :                                                                                                                  -TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59469                      :                                                                                                                      C---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT


blockSeqs                     :                                TCTAAGAG CG     ATATATAT  TT   ATTAA      ATGCG     AAA   TATACG        CAT  AGA  G    CGG ATAA TTGTCGCATTATTG          GCC A AGTT  AG AT        AAATTT G      T
blockSeqs                     :                                .        G      TA        A    .          GGT       CC    TAC           AT   T    T    CCA TC   AAGGGACCTAG             A   A GA    T  A         .      G      T
blockSeqs                     :                                .        T      C         .    .          GC        .     .             AT   T    T    CG  G    AAAG                    A   T A     .  A         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      C         .    .          GC        .     .             AA   .    G    CG  .    AAAG                    .   . G     .  C         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AA   .    .    T   .    AGAA                    .   . G     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AT   .    .    A   .    TCTG                    .   . G     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    A   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    T   .    TAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AA   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AT   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AA   .    .    .   .    TAC                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AG   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             CT   .    .    .   .    TAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AT   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AAC                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AT   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    ACA                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             TT   .    .    .   .    TAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AT   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             GT   .    .    .   .    CAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AA   .    .    .   .    CAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AT   .    .    .   .    CAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AT   .    .    .   .    ATG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    ACG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             GA   .    .    .   .    AAG                     .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AT   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AA   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AA   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AT   .    .    .   .    TA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             GT   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             GT   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AT                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AT   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AA   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    TA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             AT   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AA   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AA   .    .    .   .    TA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    TA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AA   .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             AT   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             AT   .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             T    .    .    .   .    TA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             A    .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             A    .    .    .   .    TA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             T    .    .    .   .    AG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             T    .    .    .   .    TG                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             .    .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             .    .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .      .
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          C         .     .             .    .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .       
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          G         .     .             .    .    .    .   .    AA                      .   . .     .  .         .      .       
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          A         .     .             .    .    .    .   .    .                       .   . .     .  .         .      .       
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          .         .     .             .    .    .    .   .    .                       .   . .     .  .         .      .       
blockSeqs                     :                                .        .      .         .    .          .         .     .             .    .    .    .   .    .                       .   . .     .  .         .      .       
blockSeqs                     :                                                          .    .          .         .     .             .    .    .    .   .    .                       .   . .     .  .                        
blockSeqs                     :                                                               .          .         .     .             .    .    .    .   .                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                    .     .             .    .    .    .                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                        .    .    .    .                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                AA*********************
originalCons                  :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
finalCons                     :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----AAA---------------------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT





Alignments
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lowQualScore                  :                   00  0  00  0 22222222 22 0 0 44444444  11 0 11111 0  0 5555555   222 0 222222 0 00   222  222  2    666 2222 99999999999999999999999 222 2 4444  11 22 0 0  0 111111 1 0 0  1     
lowQualScore                  :                   ..  .  ..  . ........ .. . . ........  .. . ..... .  . .......   ... . ...... . ..   ...  ...  .    ... .... ....................... ... . ....  .. .. . .  . ...... . . .  .     
lowQualScore                  :                   99  7  99  7 44444444 22 7 7 77777777  66 6 66666 6  6 0000000   000 6 999999 6 99   555  333  5    444 9999 11111111111111111111111 555 0 9999  66 99 7 7  7 999999 3 7 7  5     
consensus                     :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
Reference ( family-314 )      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59404                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCG
gi|59405                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TT-TAGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-T-A-AC-CTGTT
gi|59406                      :        tttaTTTTCTC--GC-AA--AA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59407                      :        tttaTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-CG-T----G--TTT---T-A------G-C--GAG-AAAA---TC-TCGCT--T----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59408                      :        tttaTTTTCTG--GC-AA--GA-G--------A--G-G-ATA------AT--A-A-----T-CGGC----G--ATT---T-ATATACGA-T--GAGCATGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59409                      :        tttaTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-T-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-G--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AAT-G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59410                      :        tttaTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AA----GA---TC-TCAT---T----A-------A-----A---------GA--G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59411                      :        tttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
gi|59412                      :         ttaTTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-GC-------AT--A-A-----T-TG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGCA--T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--GA-T-G-TT-C------CGC-A-ACTTTGTT
gi|59413                      :          ttaTTTCTC--GC-TA--GA-G-----------G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--GTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------T-----A---------G---G-A----AA--G--T-G--T-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59414                      :       tttaTTTTTTTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TA-C----A--TGT---T-A------G-C--AA----GA---TC-TTGC---T----AT------A-----C---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59415                      :          ttTTTTCTT--GC-TT--GG-G--------A--T-G-G--------AT--A-AATTAAT-CA-C----G--TTT---T-A------G-T--GAG-AAGA---TC-TCACT--T----T-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-T------C-C-A-AC-
gi|59416                      :         ttgTTTTCTC--GCATA--GA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-CT-C----C--TTT---T-A------A-C--GAG-ATGA---AC-TCAC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-
gi|59417                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------C--G-G-G--------AT--G-A-----T-CA-T----G--TTT---A-A------G-C--AAG-AACA---TC-TCGC---TATAAA-------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59418                      :                                                         ttta-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAA-AGGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTATT
gi|59419                      : tttttttctcgTTTTTTC--AC-TA--AA-A--------A--G-G-A--------AA--A-A-----TTCG-C----C--TTT---C-A------G-T--GAG-CTGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GAGTTAA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59420                      :         tttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-G----C--CTT---T-A------T-G--GTA-ATG-----T-TCGCCG-T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TA-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59421                      :        tttaTCTTCTC--GC-TA--GA-G--------G--T-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---
gi|59422                      :        tttaTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---T
gi|59423                      :         ttaTTTTCTC--GC-----GA-G--------A--A-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----C--CTT---T-GTAC---A-T--GAG-AT-A---TC-TCGC---T----A-------A-----T---------G---G-G----AA--G--T-G-TT--------C-C-A-A--CTGTT
gi|59424                      :       tttaTTTTTCTGTGGC-TA--GA-G--------A--GCG-G--------AT--A-A-----T--G-T----C--TTT---T--------G-C--GAG-TTAA---TCGTCTC--------A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-ATAC-TTGT
gi|59425                      :          ttTTTTCTT--GT-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TCT---T-A------G-C--------------T-TC------------------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-GC-
gi|59426                      :       tttaTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--------------------------------------------------------A-----G---------G---G-A----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-TC-CTGTT
gi|59427                      :           ttTTTCTT--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------A---A-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------T-G--TAA-ATG----TT-TCGTCG-T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TG-C------C-C-A-A--CTGT
gi|59428                      :        ttttaTTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-A--------AT--A-A-----T-C--C----C--CTT---T-A------T------G-GTTA---TCTTCGCCGGT----A-------A-----AC--------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-A-AT-CTG
gi|59429                      :      ttttaTTTTTCTT--GT-TA--GA-A--------A--A-G-A--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GA----GA---TC-TCAC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--A--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59430                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-
gi|59431                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-T----A--TTT---T-A------G-T--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----
gi|59432                      :          tTTTTCCTT--GC-CA--GA-G--------G--G-G-G--------GA--A-A-----T-CG-C----GC-TTT---T-A------C-C--GAG-ATGA---AT-CCTC---T----A-------AC----A---------GGCCG-G----AA--GC-T-G-TTCC------C-C-A-AC-CCG
gi|59433                      :          tTTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----AT------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59434                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATAA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59435                      :           TTTTTCTC--GC-TATAGA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-G--GAG-ATGA---TC-TCAC---T----A-------A-----A---------G---G-GA---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59436                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GT-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG--TAA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59437                      :           TTTTTCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-A-A--------AT--C-A-----G-CA-T----G--TTT---T-A------G-T--GAG-GAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---GAG----AA--T--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59438                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--T-G-GATATATATAT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--GAG-A--AT--TC-TTGC---T----A----------------------------------TA--G--T-A-TT-C------C-C-A-A
gi|59439                      :           TTTTTCTT--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--CTT---T-A------G----GGG---GA---TC-TCGC---T----ATTGTCGCATTATTG---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59440                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G-------------G-G--------AT--A-A-----T-TG-CATGCG--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AAG-------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-TTGTT
gi|59441                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CT-T----G--TTT---T-A------G-C--GAT-AAGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AGGGACCTAGG---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTG
gi|59442                      :           TTTATCTC--AC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTTAAAT-A------G-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---A----G-------T-----A---------G---GAG----AG--G--T-G-TT-T------C-C-T-AC-ATGTT
gi|59443                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------AG-G-G-G--------ATA-A-A-----T-CG-C----G--TTT---TAA------G-C----G-ATGA---TCTTCGC---T----A-------T-----A---------G---G-GGA--AA--G--T-G-TT-A------C-C-A-AC-CTGT
gi|59444                      :           TTTTTCTC--GT-GA--GC-G--------A--G-G-A--------A-----A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-C--GAG-GTGA---TC-TCAC---T----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-A-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59445                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-GTCTAAGAGA--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--TAG-GTGAAGACC-TC----------------------------------------------A--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59446                      :           TTTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-ACG--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T--------------AG-ATGA---AT-ACGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------T-C-C-AC-TTTTT
gi|59447                      :           TTTTTCTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G------------------------------------------------------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGCT
gi|59448                      :           TTTTTCTC--AG-TT--GA-A--------C--G-G-G--------AT--ACA-----T------------TTT---T-A------G-T--GAG-AT------T-TCGC---T----A-------A-----A---------GA--G-G----AA--G--T-G-AT-C------C-C-G-AC-CTG
gi|59449                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-ATTA---TC-TCTT---TG---A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59450                      :            TTTTTTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------ATTTA-A-----T-CG-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG-ATGA---TC-T-----------------------------------------------------T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59451                      :            TTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AAG-A--A----C-TCAC---C----AC------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59452                      :            TTATCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----A--TTT---T-A------G-C--AAA---GA---AC-TCACCCAC----A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--TCG-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59453                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------T--G-G-G--------AT--A-A-------CA-C----A--TTT------------GTT--GAG-AAG----TC-TTGC---T----A-------T-----A---------G---G-G----AA--G--T---TT-C------C-C-G-AC-CTGTT
gi|59454                      :            TTTTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-C--C----GC-CTT---T-A------G-C--GA--ATTA----C-TC-C---T----A-------A-----G---------G---G-G----AG--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CT
gi|59455                      :            TTTTCTC--GC-TA--GATG--------AT-G-G-G--------AT--A-A-----T-T--C----G--CTT---T-A------G-C--GAG-ATTA---TCGTC-C---T----AAG-----A-----A---------G---G-G----AA--GATT-G-TT-C------C-C-A-AC-
gi|59456                      :             TTTCTC--GC-TA--AA-G--------A--G-G-G--------GT--A-A-----T-C-------------------------A-C--GAG-ATGA---TC-TCGA---T----A-------T-----A---------G---GTG----AA--G--T-G-TT-T------C-
gi|59457                      :              TTCTC--GC-TC--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----C-CG----------------------------------TGA---TC-TCGC---T----GC------A-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59458                      :              TTCTC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CG-T----------------------------------A---TC-TCGC---T----A-------AT----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-
gi|59459                      :               TCTC--GC-CA--AA-G--------A--G-G-G--------AA--A-A-----T-CG-C----A--TTT---C-A------G-C--AAG-AAGA---CC-TCGC---
gi|59460                      :                CTC--AC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--G-A-----T-CG-C----G--TTT---T-A------G-C--GAG-----------------------A-------A-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59461                      :                 TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----GGTTTT---T-A------G-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---TTC--A-------T-----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-CAAATTTC-CAA-AC-CTGTT
gi|59462                      :                 TC--GC-TA--GA-G--------A--G-G-G--------TA--A-A-----T-CG-C----A--CTTCC-T-A------A-CCAGAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-GATT-T------C-C-A-
gi|59463                      :                  C--GC-TA--GA-G--------ACGG-G-G--------AT--A-A-----T-CA-C----C--TTT---T-A------G-C--GAG--TGAT--TC-TCGC---T----A-------AC----G---------G---G-G----AA--G--T-G-TT-C------C-A-A-CC-CTG
gi|59464                      :                       -TA--AG-G--------A--G-G-G--------AT--A-A-----T-TG-T----G--TTT---T-A------G-G--GA----GA---TC-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-G----AAAGG--T-G-TT-T------C-C-A-AT-CTG
gi|59465                      :                                                         T--A-A-----T-CG-C----A--TTT---T-A------T-C--GAG-AAGA---TC-TCGC---T----ATC-----T-----G---------G---G-G----AA--A--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGT
gi|59466                      :                                                                                    ---T-A------G-A--AAG-ATGA---TC-TCGC---T----A-------A-----AG--------G---G-G----AA--G--T-C-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59467                      :                                                                                                        -ATGA---TA-TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--T--T-G-TT-T------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59468                      :                                                                                                                  -TCGC---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT
gi|59469                      :                                                                                                                      C---T----A-------A-----A---------G---G-GG---AA--G--T-G-TT-C------C-C-A-AC-CTGTT