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Reference ( gi|55649 )        : AAAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----C--TG----T-A--CCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----GT--AC--------T-GA--C------T--GT--AA-----------A-T----T--T-------GG-CTT-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--AAT-G--TA--AA-GC-A-G--CA-A--T-C---A-AA-ATATA
gi|55651                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----C--TG----T-G--ACA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--AT-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----G-A------T----GT--AC--------T-GA--C------T--GT--AA-----------A-T----T--T-------GG-CTT-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--AAC-G--CA--AA-GC-A-G--CA-A--T-C---A-AA-ATATA
gi|55653                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----C--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--AT-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----G-A------T----GT--AC--------T-GA--C------T--GT--AA-----------A-T----T--T-------GG-CTA-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----A-T--AAC-G--CA--AA-GC-A-G--CA-A--T-C---A-AA-ATACA
gi|55656                      : AAAG-GC-A-T-AGTACCCC-GG-A-C----C--TG----T-G--TTA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----A-G-A-T-G-TC--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----GT--AC--------T-GA--C------T--GT--AA-----------A-T----G--T-------GG-CTT-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--AAC-G--CA--AA-GC-A-G--CA-A--T-C---A-AA-ATATt
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gi|55661                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----A--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--A-G----C-G-A-T-G-TC--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-A------T----GT--AC--------T-GA--C--------------A-----------A-T----T--T-------GT-CTT-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--ACC-G--CA--AA-GC-A-G--CA-A--T-C---A-AA-ATATA
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gi|55647                      : AAAG-GC-A-T-A---ATCC-GG-A-T----C--TC----T-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--AT-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------T----AT--AC--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--A-------GA-TTT-G--AA-G-G-T---TG-A-TA-T-----T-T--TAC-A--TA--TA-TCTA-----A-A--T-C---A-AA-ATATt
gi|55665                      : AAAG-GC-A-T-G---TTCT-GG-A-TGAGGC--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--T------A-G-T--G-G----C-G-A-T-A-AC--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-A----G-C------T----AT--AC--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-G--CA-G------------------------------G--TA--AA-GC-A-T--CT-A--T-C---A-AA-ATATA
gi|55669                      : AAAG-GC-A-T-A---GCCC-GG-AAT----C--T-----T-G--TCG--CGT-A---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--GT-TT-GC--T----G-G--A-CT-T----G-C------T----GT--AT-----------------------------------------A-T----T--T-------GG-CTT-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--
gi|55670                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCG-GG-A-T----A--TG----T-G--GCA--CGC-G---A--T------G-A-T--G-G----T-G-A-T-A-TT--TT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--AC--------T-GA--A------C--GT--AC-----------A-T-------------------------CA-G-A-T---T-------T-----TAT--AA------A--AA-GG-A-T--CA-A--T-C---A-AT-ATAT
gi|55677                      : AAAGCGC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----C--TG----T-CGTCAA--CAT-GC--A--T------G-A-T----G----C-GAA-T-G-TCA-AT-TT-GCCTT----G-GA-A-AT-G----G-C------T----GT--A-----------AA--T------T--GC--GG-----------A-T----T--------------CT-G--CA-C-A-TTC-TG-A-GA-T-----T-----ATCGC-TA--AA-GC-A-G--CA-A--TACA--A-AA-ATATA
gi|55672                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCG-GA-A-T----A--TG----T-G--TCA--TGT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-----TT--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----CT--AC--------T-G
gi|55664                      : AAAG-GC-A-T-A---ACCC-GG-A-T----C--TG----T-G--TCA--CAT-GGA-A--T------G-G-TG-G-G----C-G-A-TAG-TC--ATATT-GT--T----G-GAAA-CT-A----ATT------T----GT--ACA-------T-GA--C------T---T--AACAGACTTTCACA-T----T--T-------GGACTT-GTCCAGG-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--gacgcacatcaga
gi|55658                      : AAAG-GC-A-T-A---CTCC-GA-A-T----C--TG----T-----CA--CAT-G---A--T------G-A-TG-G-G----C-G-ATT-A-CC--AT-TT--C--C----G-T--A-TT-G----G-C------T----AA--GT--------T-GA--A------T--GCG-AA-----------A-T----C--A-------GA-TTT-T--CACG-G-T---AG-T-GA-T-----T-TTGAAC-A--TT--AA-AC-A-T--AA-G--T-C---A-AA-ATATA
gi|55675                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-A-A----C--TG----T-G--CCG--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-t
gi|55671                      : AAAG-GC-A-T-G---TCCC-GG-A-T----C--TG----T-G--TGA--CAC-TCCTA--T--------A-T--A-G------A-A-T-G-G---AT-CG-G--------G-G--A-AT-G----G-A------T----AT--ATATAT----T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTC-G--CA-G-G-T---TG-A-GA-T-----T-T--TAC-A--TA--AA-AC-A-T--CA-G--T-C---A-AA-a
gi|55673                      : AAAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----C--TC----C-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-
gi|55676                      : AAAG-GC-A-T-A---CCAT-GT-A-A----C--TG----C-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--AT-Ta
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gi|55659                      : AAAG-GC-ATT-A---CTCT-GATATT----C--TG----TCA--CTA--TGT-G---A-----------A-T--A-GGCAAC-G-A-T-A-CC--AT-TT-CC--G----A-G--A-TT-G----G-CG-----T----ATA-AT--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----TCAT-------GA-TTT----CACG-G-T---AG-T-GA-T-----T-T--Aggcaaa
gi|55680                      :  AAG-AC-A-T-A---CCCC-GG-A-T----C--TG----T-G--TCG--CAT-G---A--T------G-A-C--G-G----C-G-A-T-A-TC--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--AT--------T-GA--G------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-G--CA-G-G-T---GG-A-GA-T-----T-T--TAC-A--TA--AA-GC-ATA--TATA--T-C---A-GA-TTATActacattaacataagtgcaaatata
gi|55683                      :  AAA-GC-A-T-A---GCCA-GG-A-A----C--TG----T-G--TCA--CATTG---A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--AT-TT-GC--T----GTG--A-C--G----G-C------T----GT--AC--------T-TA--C------C--GT--AA-------------T----T--T-------GG-CTT-G--GT-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--ATC-G--TA--AA-GC-A-G--CA-AC-T-C---G-AA-ATAT
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gi|55688                      :  AAG-GC-A-T-A---CCCC-GG-G-T----C--CG----A-G--TCA--CAT-C---A--T------G-A-T--G-G----C-G---T-A-AT--AA-TC-GC--T----G-G--G-CT-G----G-C------T----AA--AC--------T-GA--C------T--AC--AC-----------A-C----T---------------------G-G-A-T---T-------T-----T-C--A------CA--AA-GC-A-T--CA-A--T-C---A-AA-ATATA
gi|55681                      :  AAGTGC-A-T-A---CTC--GG-A-T----C--TC----T-G--TCA--CAT-G---AT-T------G-A-T--A-G----G-G-A-T-A-CC--AT-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G--------T----ATA-AC--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--A-------GATTTT-G--CA-A-G-T---TG-A-GA-T-----T-T--TAC-A--TT--AA-AC-A----TA-A--T-C---A-A
gi|55687                      :  AAA-AC-A-T-A---ACCA-GG-A-T----T--T-----T-G--TCA--CGT-G---A--T------G-A-T--G-G--------A-T-A-TT--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----ATA-AG--------T-GT--C------T--TC--AA-----------C-C----C--T-------GA-TTT-G--CA-C-G-T---TGCG-GA-T-----T-T--TAA-A--CA--AA-GC-A-A--TG-A--A-G---A-AA-ATACA
gi|55689                      :  AGG-GC-A-T-A---CCCC-AG-A-T----C--TA----T-G--TCA--C------------------------G-G----T---A-T-G-----AT-TT-GC--TCTCGG-G--A-TT-T----G-C------T----AG--AC--------T-GT--C------T--GC--AA-----------ACT----C--T-------GA-TTT-G--CA-G-G-T---AG-ACGATT-----T-T--AAA-G---A--AA-GC-A-G--TA-A--C-C---A-AT-ATATt
gi|55686                      :  AAG-GC-A-T-A---CCAT-GG-A-A----C----------A--CTGGTCAG-C---A--T------G-A-T--G-G----C-G-AGT-A-CC--AT-TTCGC--T----G-G--A-TT-G----G-CATAACAT----GT--ACATTGTATTT-GA--A------T--GC--AA-----------A-C----T--G-------AG-TTT-G--CA-G---T---TG-A-GA-T-----T-T--TATCA--TA--AA-AC-A-ATCCA-G--T-C---AGAA-ATATA
gi|55682                      :  AAG-GC---T-A---CTCC-GG-A-T----C--TC----T-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----G-G-A-T---TCA-AT-TT-CC--T----G-GT-A-TT-T----G-C------T----AT--AT--------T-G----------T--GC--AA-----------A-T----C--A-------GA-TTT-------G-ATT---TG-A-GATT-----T-T--AAT----TA------C-A-T--AA-G--T-C---A-AATATAT
gi|55690                      :  AGG-GC-A-T-G---CCCTTGG-A-C----C--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--TCAA---G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TA--AT-TT-GC--T------A--A-CT------G-C------C----GT--AT--------T-
gi|55692                      :    G-GC-A-T-A---TCCC-GG-A-T----C--TGACACT-G--TTA--CAT-G---A--G------G-A-T--G-G----C-G-A-G-A-TC--AT-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--ATAT------T-GA--A------T--GT--AA-----------C-A----C--T-------GA-TTT-A--CA-G-G-T---TA-A-GA-T-----T-T--AAC-A--TA--AA-GC-A-T--CA-A--T-C---A-AA-ATATAatacaga
gi|55691                      :    G-GC-T-T-A---CGCC-TG-A-T----CACTG----T-----CA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--AT-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------T----AT--AT--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-C----C--A-------GA-TTT-G--CA-G-G-T---TG-A-GA-T-----T-T--TTC-A--TT--AA-GC-A-T--AA-G--T-C---A-AA-ATATAt
gi|55695                      :            -A---CCCC-GG-A-T----C--TG----T-G--TCA--CGT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--AT-TT-GC--T----C-G--A-CT-G----A-CTACTAGT----AT--AC--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------Gt
gi|55694                      :            -A---CCCC-GG-A-T----C---G----C-G--TCA--CAT-G---AGGT------G-A-TATG-G----C-A-A-T-T-AC--AT-TT-TC--T----G-A--A-CT-G----G-CA-----T----TT--AT--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------AA-TTT-G--TA-G-G-T---TG-A--A-T-----T-T----T-G--CAT-AA-AC-A-T--CA-G--T-T---A-AA-ATATAat
gi|55693                      :            -A---CCCC-GG-A-T----C---G----C-G--TCA--CAT-G---AGGT------G-A-TATG-G----C-A-A-T-T-AC--AT-TT-TC--T----G-A--A-CT-G----G-CA-----T----TT--AT--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------AA-TTT-G--TA-G-G-T---TG-A--A-T-----T-T----T-G--CAT-AA-AC-A-T--CA-G--T-T---A-AA-ATATA
gi|55696                      :              ---CTCC-GG-A-T----C--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--T------GAA-T--G-G----CTG-A-T-G-TC--ATGTT-GT--T----G-G--A-CTCG----G-A------T----GTCAAC--------TGGA--CCAGGAGT--GT---A-----------A-T----T--T-------GG-CTT-G--CA-G-A-TTTGTG-A-TA-T-----A-C--AAC-G--CAC-AA-GC-A-G--C--A--T-C---A-AA-A-ATA
gi|55697                      :                    C-GG-A-T----C--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TT------------T----G-G--A-CT-G----G-A------T----GT--AC--------T-GA--C------T--GA--AA-----------A-T----T--T-------GG-CTT-G--CA-G-A-T---TG-A-GA-T-----T-T--AA
gi|55698                      :                       G-A-T----C--TG----T----TTA--CAT-G---A--G------G-AAT--G-G----C-G-A-G-A-TC--ATGTT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--AT--------TTGA--A------T--GT--AA------------------C--T-------GAATTT-A--CA-G---T---T--A-GA-T-----T-T--AAC-A--TA--AA-GC-A-T--CA-A--T-------AA-ATATAc
gi|55699                      :                        -A-T----T--TG----T-G--TCA--CAT-G---A--A------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--AT-TT-AC--T----G-G--A-CT-G----G-CTA----T----AT--AC--------T-CA--C------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-G--CA-G-G-T---TG-A-AG-TC----T-T--TAC-A--CA--AT-GC-A-T--CA-A--T-C---A-AA-ATATA
gi|55702                      :                            ----C--TG----T-----CA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--AT-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------T----AA--AT--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--A-------GA-TTT-G--CA-G-G-T---TG-A-GA-T-----T-T--TAC-A--TT--AA-AC-A-
gi|55704                      :                            ----C--TG----T-----CA--CGT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-G-TTA-TT--AT-TT-AC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--ATATTA----T-GA--A------C--GC---A-----------A-T----C--T-------TA-TTT-G--CA-G-G-T---TG-A-TA-T-----C-T----T-C--TAACAA-GC-A-T--C--A--T-C---A-AA-ATtttattattaagtctaaatatat
gi|55703                      :                            ----C--TG----T-----CA--CGT-G---G--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CT--AT-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------T----AC--AC--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----
gi|55705                      :                                               CA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TC--AT-TC-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--AC--------T-GA--------------------------------------------------TTT-G--CA---A-T---TG-A-GA-C-----T-T--TAC-A--TA--AA-GC-A-T--CC-A--T-C---A-AA-ATGTA
gi|55700                      :                                            tgtCA--CAT-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--AT-AT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------T----AT--A
gi|55706                      :                                             atctcttgt-G---A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TTTTAT-TT-AC--T----G-G--AACT-G----G-C------T----CT--AC--------T-GAAAC---------GC--AG-----------A-T----T--TTTTTTCTGA-TTT-AA-CA-G---T---TG-AAGA-T-----T-T--TAT-A--CA--AA-GC-A-T--CA-A--T-C---A-AA-A-ATAt
gi|55701                      :                                                              tgtcattg-A-T--GCG----C-G-A-T-A-TC--AT-TTTGA--T----G-G--A-CT-G----G-C------T----AT--AC--------T-G---C------TAAGC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-G--CA-GCG-T---TG-A-GA-TC----T-T--TAC-G--CA--AA-AC-A-T--CA-AGGT-CAAAA-AA-ATATA
gi|55707                      :                                                                                                        ctctgcaca-G--A-CT-G----G-C------T----AT--AC--------T-GA--A------C--GG--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-G--TA-G-G-T---TA-A-TA-T-----T-T--TAT-A--CA--AA-GC-A-C--CA-A--T-C---A-AA-ATA
gi|55708                      :                                                                                                                           ----G-C------T----AT--AT--------T-GA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-T--AA-G-G-T---TG-A-GA-T-----T-C--TAC-A--TA--AA-GT-A-T--CA-A--T-C---A-AA-ATGTAaat
gi|55709                      :                                                                                                                                  ------T----AT--AC--------T-TA--A------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTT-G--CA-G-G-T---TG-A-AA-T-----T-T--CTT-A--CA--AA-GA-A-T--AA-A--T-C---A-AA-ATATA
gi|55710                      :                                                                                                                                                   --------T-GA---------T--GC--AA-----------A-T----C--T-------GA-TTA-G--CA-G-G-T---TG-A-GA-T-----T-T--TAC-A--TG--AA-GC-A-T--CA-A--T-C---A-AA-ATACA
gi|55711                      :                                                                                                                                                                            t--AA-----------A-T----C--T-------AG-TTT-G--TA-G-G-T---TG-A-GA-T-----T-T--TGC-G--CA--AA-GC-A-T--CA-A--T-C---A-AA-ATATAt

Unaligned ( gi|55678 ): AAAAGCTCATCTCCGGTTACTGATCACATGAATATGCTATAAATTTCCTGGATTGCCTTATATTGAAATGCATAATCAGATT

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lowQualScore                  :     .  .. . . ...    .   .. ....   .... .  .. .  ....  . .. .. ...... . . .. . .... . . . . .  .. . .  .  .. .... . .. .  . .... . ......  .... .. . ........ ....... . .. ..... ..... .. .  . .......  . . .....    ..  . . . ...  . .  ... .  . . ....... ..  .   .... ........ . .. . ... .       
lowQualScore                  :     7  00 9 8 777    8   55 0000   4444 3  99 7  1111  7 66 88 888888 7 3 11 7 4444 7 7 0 3 7  33 7 0  4  99 5555 4 33 4  7 4444 7 333333  4444 66 0 33333333 1111111 7 99 66666 66666 66 7  3 2222222  7 7 77777    77  7 7 7 222  4 4  333 4  5 7 7777777 66  8   8888 88888888 8 66 8 999 8       
consensus                     : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-C---GC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
Reference ( family-313 )      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AN-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTNA-C---GC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55646                      : AAAG-GC--A-T-A---CTCC-GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CA-G-ATTAATTTTG--CA-G-G-T---TA-A-GA---T-TTTA-C---AT--A--AC-ACA--T-A--------A-G--T-C---A-AAATATA
gi|55647                      : AAAG-GC--A-T-A---ATCC-GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CA-G-A-----TTTG--AA-G-G-T---TG-A-TA---T-TTTA-C---AT--A------TA--T-CTA------A-A--T-C---A-AAATATt
gi|55648                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTC----C-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTT--CA-G-G-C---TG-A-GA---T-TTTA-CTTAAC--AT-AA---A--T-C--------A-G--T-C---A-AAATAT
gi|55649                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-AC--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TG----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----T--A-AA-T-------TT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-T---GT--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55650                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCT-TGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--G------G-A-T--T-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-A--T-CT-G----G-T------TA----T--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTA--CA-G-G-T---TA-A-GC---T-TTTA-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-ATATATA
gi|55651                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GA--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----G-A------TG----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----T--A-AA-T-------TT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55652                      : AAAA-GC--A-T-A---CCCG-GGT--T----ATG----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TT--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-C-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TATA--CA-G-G-T---TG-G-GA---T-TTTA-T---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55653                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----G-A------TG----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----T--A-AA-T-------TT-G-G-----CTAG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-ATAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATACA
gi|55654                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GC--C-AC-----T-G--A--TTATGGAG-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----G-C------TACTAGT--A-CAT------T-------G-AA-C-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CG-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-T---GCATA--AA-GCA--T-T--------A-A--T-C---A-AAATGTAt
gi|55655                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GAA--C----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--A----G-G--A-CT-G----G-C------TT----T--A-C--------T-------G-AC-C-----G-----T--A-AA-T-------TT-G-G-----TTTG--CA-C-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-T---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55656                      : AAAG-GC--A-T-AGTACCCC-GGA--C----CTG----T-GT--T-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----A-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TG----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----T--A-AA-T-------GT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATAT
gi|55657                      : AAAG-GC--A-T-AGTACCCC-GGA--C----CTG----T-GT--T-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----A-G-A-T-G-TC--A---TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TG----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----TTAA-AA-T-------GT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-T--A-C---A-AAATAT
gi|55658                      : AAAG-GC--A-T-A---CTCC-GAA--T----C------T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-TG-G-G----C-G-ATT-A-CC--A-T-TT--C--C----G-T--A-TT-G----G-C------TA----A--G-T--------T-------G-AA-T-----G-----CG-A-AA-T-------CA-G-A-----TTTT--CACG-G-T---AG-T-GA---T-TTTG-A---AC--ATTAA-ACA--T-A--------A-G--T-C---A-AAATATA
gi|55659                      : AAAG-GC--A-T-T---ACTC-TGA--TA---TTC----T-GT--C-ACT---AT-G-----T------G-AAT--A-GGCAAC-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--G----A-G--A-TT-G----G-CG-----TA----T--AAT--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T--------T-C-A-----T---------------------GA---T-TTCA-C---Gt
gi|55660                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--A----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--T--T------G-A-T--G-G----C-G-G-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TG----T--A-C--------T---------------------------------------------------TTTG--TA-G-G-T---TA-A-GA---T-TTTA-C---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAgtagtgatttactacattaacataagtgcaaatata
gi|55661                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----ATG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--A-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-A------TG----T--A-C--------T-------G-AC------------------AA-T-------TT-G-T-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAC-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55662                      : AAAG-GC--A-T-A---TCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TT----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----T--A-AA-T-------TT-T-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA--------------G----------------C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55663                      : AAAG-GC--A-T-A---ACCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-GG-A--T------G-G-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-GCATGA-C------TT----T--A-C--------A-------G-AC-T-----T-----C--A-AA-T-------TT-G-A-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------G-A--T-C---A-AAATATt
gi|55664                      : AAAG-GC--A-T-A---ACCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-GGAA--T------G-G-TG-G-G----C-G-A-T-AGTC--A-TATT-GT--T----G-GAAA-CT-A----ATT------TG----T--A-CA-------T-------G-AC-TTAACAGACTTTC--A-CA-T-------TTGG-A-----CTTGTCCA-G-GAT---TG-A-GA---T-TT
gi|55665                      : AAAG-GC--A-T-G---TTCT-GGA--TGAGGCTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------A-G-T--G-G----C-G-A-T-A-AC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-A----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T----------------------------A--AA-GCA--T-C--------T-A--T-C---A-AAATATA
gi|55666                      : AAAG-GC--A-T-A---GCCA-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TG----T--A-C--------T-------T-AC-C-----G-----T--A-AA-T-------TT-G-G-----CTTG--GT-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAT-C---GT--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---G-AAATATA
gi|55667                      : AGAG-GCC-ACT-A---CCCC-GGA--T----CTA----T-GT--C-AC----AT-G--A-----------A-T--G-A----C-G-AGT-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----G-A------TG----T--A-C--------T-------G-AC-------G-----T--A-AA-T-------TT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA-----TTAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATA
gi|55668                      : AAAG-GC--A-T-A---GCCC-GGAA-T----CT-----T-GT--C-GC----GT-A--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-TGG-TC--GTT-TT-GC--T----G-G--A-CT-T----G-C------TG----T--A-T--------T--------------------------------T-------TT-G-GC----TTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-C---GC--A--AA-GCA--G-C----------A--T-C---A-AAATATA
gi|55669                      : AAAG-GC--A-T-A---GCCC-GGAA-T----CT-----T-GT--C-GC----GT-A--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--G-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-T----G-C------TG----T--A-T---------------------------------------A-T-------TT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TT
gi|55670                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCG-GGA--T----ATG----T-GG--C-AC----GC-G--A--T------G-A-T--G-G----T-G-A-T-A-TT--T-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-C-----G-----T--A-CA-T-------C------------------------------A-GA---T-TTTA-T---AA--A--AA-GGA--T-C--------A-A--T-C---A-ATATAT
gi|55671                      : AAAG-GC--A-T-G---TCCC-GGA--T----CTG----T-GTGAC-ACTCCTAT-AT-A--G------A-A-T--G-G------------A-TC--G------G--------G-G--A-AT-G----G-A------TA----T--A-TATAT----T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTCG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-C---AT--A--AA-ACA--T-C--------A-G--T-C---A-AA
gi|55672                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCG-GAA--T----ATG----T-GT--C-AT----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-----A-TT--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TC----T--A-C--------T-------G-GA-C-----G-----C--A-CA-T-------CA-G-A-----
gi|55673                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTC----C-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-
gi|55674                      : AAAG-GC--A-T-A---TCCT-AGA--T----ATG----TTGT--C-AC----AT-C--A--T------G---T---------C-A-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-C----G-C------TA----G--A-TG-------T-------A-AA-G-----G-----C--A-AA-
gi|55675                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--A----CTG----T-GC--C-GC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-
gi|55676                      : AAAG-GC--A-T-A---CCAT-GTA--A----CTG----C-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-T
gi|55677                      : AAAGCGC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----TCGT--CAAC----AT-GC-A--T------G-A-T----G----C-GAA-T-G-TCA-A-T-TT-GCCTT----G-GA-A-AT-G----G-C------TG----T--A------------------A-AT-T-----G-----C--G-GA-T------------------TCTG--CA-C-A-TTC-TG-A-GA-----TTAT-C---GCT-A--AA-GCA--G-C--------A-A--TACA--A-AAATATA
gi|55678                      : AAAA-GCTCA-T-----CTCC-GGT--TA---CTG------AT--C-AC----AT-G--A--A------T-A-T----G----C-T-A-T-A--A--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----C-CT-----TA----T--A-T--------T-------GAAA-T-----G-----C--ATAA-T-------CA-G-A-----TT
gi|55679                      :  AAG-GC--A-T-A---CTCC-GAA--T----CCC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--ATTT-G----G-C------TA----A--T-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AATT-------CA-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-C---AT--T--AA-ACA--T-A--------G-A--T-C---A-AAATAT
gi|55680                      :  AAG-AC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-GC----AT-G--A--T------G-A-C--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-T--------T-------G-AG-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---GG-A-GA---T-TTTA-C---AT--A--AA-GCA--TAT--------ATA--T-C---A-GATTATA
gi|55681                      :  AAGTGC--A-T-A---CTC--GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--TT-----G-A-T--A-G----G-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G--------TA----T--AAC--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CA-G-AT----TTTG--CA-A-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-C---AT--T--AA-ACA--T----------A-A--T-C---A-A
gi|55682                      :  AAG-GC----T-A---CTCC-GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----G-G-A-T---TCA-A-T-TT-CC--T----G-GT-A-TT-T----G-C------TA----T--A-T--------T-------G----T-----G-----C--A-AA-T-------CA-G-A-----TTTG-----A-T-T---TG-A-GA---T-TTTA-A---TT--A------CA--T-A--------A-G--T-C-----AAATATA
gi|55683                      :  AAA-GC--A-T-A---GCCA-GGA--A----CTG----T-GT--C-AC----ATTG--A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--A-T-TT-GC--T----GTG--A-C--G----G-C------TG----T--A-C--------T-------T-AC-C-----G-----T----AA-T-------TT-G-G-----CTTG--GT-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAT-C---GT--A--AA-GCA--G-C--------A-AC-T-C---G-AAATATt
gi|55684                      :  AAA-GC--A-TTA---GCCA-GGA-------CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--A-T-TT-GC--T----GTG--A-C--G----G-CT-----TG----T--A-C--------T-------T-AC-C-----G-----G--T-AA-T-------TT-G-G-----CTTG--GT-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAT-C---GT--A--AATGCA--G-C--------A-AC-T-CG--A-AAATAT
gi|55685                      :  AAG-GC--A-T-A---CCCC-GAG--T----CTG----T-GT----AC----GT-G--G--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-GT-TC--T----G-G--G-CT-A----C-C------TA----T--G-C--------T-------G-TC-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-T-A-----TTTA--CA-C-G-T---TGCA-GA---T-TTCA-A---AC--A--AA-ACC--T-C--------A-A--T-C---A-AAA
gi|55686                      :  AAG-GC--A-T-A---CCAT-GGAACA----CTG------GT--C-A--------GC-A--T------G-A-T--G-G----C-G-AGT-A-CC--A-T-TTCGC--T----G-G--A-TT-G----G-CATAACATG----T--A-CATTGTATTT-------G-AA-T-----G-----C--A-AA---------CT-G-AG----TTTG--CA---G-T---TG-A-GA---T-TTTATC---AT--A--AA-ACAATC-C--------A-G--T-C---AGAAATATA
gi|55687                      :  AAA-AC--A-T-A---ACCA-GGA--T----TT-----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G--------A-T-A-TT--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----TA-A-G--------T-------G-TC-T-----T-----C--A-AC-C-------CT-G-A-----TTTG--CA-C-G-T---TGCG-GA---T-TTTA-A---AC--A--AA-GCA--A-T--------G-A--A-G---A-AAATACA
gi|55688                      :  AAG-GC--A-T-A---CCCC-GGG--T----CCG----A-GT--C-AC----AT-C--A--T------G-A-T--G-G----C-G---T-A-AT--A-A-TC-GC--T----G-G--G-CT-G----G-C------TA----A--A-C--------T-------G-AC-T-----A-----C--A-CA---------CT-G-----------------------------GA---T-TTT--C---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAt
gi|55689                      :  AGG-GC--A-T-A---CCCC-AGA--T----CTA----T-GT--C-A-----------------------------------C-G-G-T-A-TG--A-T-TT-GC--TCTCGG-G--A-TT-T----G-C------TA----G--A-C--------T-------G-TC-T-----G-----C--A-AACT-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---AG-ACGA---T-TTTA-A---AG--A--AA-GCA--G-T--------A-A--C-C---A-ATATAT
gi|55690                      :  AGG-GC--A-T-G---CCCTTGGA--C----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--TCAA---G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TA--A-T-TT-GC--T------A--A-CT-G----C-CGTAT--TA----T--A-C--------A-------G-A
gi|55691                      :    G-GC--T-T-A---CGCC-TGA--T----CAC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------TA----T--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-C-------CA-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTT-C---AT--T--AA-GCA--T-A--------A-G--T-C---A-AAATATA
gi|55692                      :    G-GC--A-T-A---TCCC-GGA--T----CTGACACT-GT--T-AC----AT-G--A--G------G-A-T--G-G----C-G-A-G-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-TAT------T-------G-AA-T-----G-----T--A-AC-A-------CT-G-A-----TTTA--CA-G-G-T---TA-A-GA---T-TTAA-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAt
gi|55693                      :             -A---CCCC-GGA--T----C-G----C-GT--C-AC----AT-G--AGGT------G-A-TATG-G----C-A-A-T-T-AC--A-T-TT-TC--T----G-A--A-CT-G----G-CA-----TT----T--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-A-A-----TTTG--TA-G-G-T---TG-A--A---T-TTTG-C---AT--A--AA--CA--T-C--------A-G--T-T---A-AAATATAt
gi|55694                      :             -A---CCCC-GGA--T----C-G----C-GT--C-AC----AT-G--AGGT------G-A-TATG-G----C-A-A-T-T-AC--A-T-TT-TC--T----G-A--A-CT-G----G-CA-----TT----T--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-A-A-----TTTG--TA-G-G-T---TG-A--A---T-TTTG-C---AT--A--AA--CA--T-C--------A-G--T-T---A-AAATATA
gi|55695                      :             -A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----C-G--A-CT-G----A-CTACTAGTA----T--A-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----T
gi|55696                      :               ---CTCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------GAA-T--G-G----CTG-A-T-G-TC--A-TGTT-GT--T----G-G--A-CTCG----G-A------TG----TCAA-C--------TGGACCAGG-AG-T-----G-----T----AA-T-------TT-G-G-----CTTG--CA-G-A-TTTGTG-A-TA---T-ACAA-C---GC--AC-AA-GCA--G-C----------A--T-C---A-AAA-ATA
gi|55697                      :                     C-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TT-------------T----G-G--A-CT-G----G-A------TG----T--A-C--------T-------G-AC-T-----G-----A--A-AA-T-------TT-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA---T-TTAA-C---
gi|55698                      :                        GA--T----CTG----T--T--T-AC----AT-G--A--G------G-AAT--G-G----C-G-A-G-A-TC--A-TGTT-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--ATT--------T-------G-AA-T-----G-----T--A-A----------CT-GAA-----TTTA--CA---G-T---T--A-GA---T-TTAA-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-------AAATATA
gi|55699                      :                         A--T----TTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--A------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-AC--T----G-G--A-CT-G----G-CTA----TA----T--A-C--------T-------C-AC-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-AG---TCTTTA-C---AC--A--AT-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55700                      :                          --T----CT-----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-AT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------TA----T--A-
gi|55701                      :                                                                    atc-A-T--GCG----C-G-A-T-A-TC--A-T-TTTGA--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G--C-TAA---G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-GCG-T---TG-A-GA---TCTTTA-C---GC--A--AA-ACA--T-C--------A-AGGT-CAAAA-AAATATAt
gi|55702                      :                           ctctgcaca----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------TA----A--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CA-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-C---AT--T--AA-ACA--T-TTATTATTAA-G--T-C---T-AAATATA
gi|55703                      :                                   c----T-GT--C-AC----GT-G--G--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CT--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-C------TA----C--A-C--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------t
gi|55704                      :                                   c----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-G-TTA-TT--A-T-TT-AC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-TATTA----T-------G-AA-C-----G-----C----AA-T-------CT-T-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-TATCTT-CTAA-C----------AA-GCA--T-C----------A--T-C---A-AAAT
gi|55705                      :                                   c----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TC--A-T-TC-GC--T----G-G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-A-----------------------------------------TTTG--CA-A---T---TG-A-GA---C-TTTA-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------C-A--T-C---A-AAATGTA
gi|55706                      :                                    ----T-GT--C-AT----TG-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TTTTA-T-TT-AC--T----G-G--AACT-G----G-C------TC----T--A-C--------T-------G-AAAC-----G-----C--A-GA-TTTTTTTTCT-G-A-----TTTAA-CA-G---T---TG-AAGA---T-TTTA-T---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAA-ATA
gi|55707                      :                                                                                                                   -G--A-CT-G----G-C------TA----T--A-C--------T-------G-AA-C-----G-----G--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--TA-G-G-T---TA-A-TA---T-TTTA-T---AC--A--AA-GCA--C-C--------A-A--T-C---A-AAATA
gi|55708                      :                                                                                                                             ----G-C------TA----T--A-T--------T-------G-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTT--AA-G-G-T---TG-A-GA---T-TCTA-C---AT--A--AA-GTA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATGTAaat
gi|55709                      :                                                                                                                                    ------TA----T--A-C--------T-------T-AA-T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-AA---T-TTCT-T---AC--A--AA-GAA--T-A--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55710                      :                                                                                                                                                      --------T-------G-A--T-----G-----C--A-AA-T-------CT-G-A-----TTAG--CA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTA-C---AT--G--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATACA
gi|55711                      :                                                                                                                                                                                 t-----C--A-AA-T-------CT-A-G-----TTTG--TA-G-G-T---TG-A-GA---T-TTTG-C---GC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAt

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lowQualScore                  :     .  .. . . ...    .   .. ....   .... .  .. .  ....  . .. .. ...... . . .. . .... . . . . .  .. . .  .  .. .... . .. .  . ....  ...... ..... .... .. . ........  .. .......  .... .. .......  . ....... .. . . .....    ..  . . . ...  . .   .  ...... . ....... ..  .   .... ........ . .. . ... .       
lowQualScore                  :     7  00 9 8 777    8   55 0000   4444 3  99 7  1111  7 66 88 888888 7 3 11 7 4444 7 7 0 3 7  33 7 0  4  99 5555 4 33 4  7 4444  333333 66666 4444 66 0 88888888  66 4444444  4444 66 8888888  3 2222222 99 7 7 77777    77  4 7 7 222  4 4   4  999999 7 1111111 55  8   5555 88888888 8 55 8 888 8       
consensus                     : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---GC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
Reference ( family-313 )      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---GC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55646                      : AAAG-GC--A-T-A---CTCC-GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--A-G-ATTAATTTTG--CA-G-G-T---TA-A-GAT-TT--T---A-C---AT--A--AC-ACA--T-A--------A-G--T-C---A-AAATATA
gi|55647                      : AAAG-GC--A-T-A---ATCC-GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--A-G-A-----TTTG--AA-G-G-T---TG-A-TAT-TT--T---A-C---AT--A------TA--T-CTA------A-A--T-C---A-AAATATt
gi|55648                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTC----C-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTT--CA-G-G-C---TG-A-GAT-TT--T---A-CTTAAC--AT-AA---A--T-C--------A-G--T-C---A-AAATAT
gi|55649                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-AC--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----G----T--A-C--------TG--AC------TG----T--A-------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-T---GT--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55650                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCT-TGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--G------G-A-T--T-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-A--T-CT-G----GT------T-----A----T--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTA--CA-G-G-T---TA-A-GCT-TT--T---A-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-ATATATA
gi|55651                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GA--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----GA------T-----G----T--A-C--------TG--AC------TG----T--A-------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55652                      : AAAA-GC--A-T-A---CCCG-GGT--T----ATG----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TT--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------CG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TATA--CA-G-G-T---TG-G-GAT-TT--T---A-T---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55653                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----GA------T-----G----T--A-C--------TG--AC------TG----T--A-------AA-T-------T--T-G-G-----CTAG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-AT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATACA
gi|55654                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GC--C-AC-----T-G--A--TTATGGAG-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----ACTAGT--A-CAT------TG--AA------CG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CG-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-T---GCATA--AA-GCA--T-T--------A-A--T-C---A-AAATGTAt
gi|55655                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GAA--C----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--A----G-G--A-CT-G----GC------T-----T----T--A-C--------TG--AC------CG----T--A-------AA-T-------T--T-G-G-----TTTG--CA-C-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-T---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55656                      : AAAG-GC--A-T-AGTACCCC-GGA--C----CTG----T-GT--T-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----A-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----G----T--A-C--------TG--AC------TG----T--A-------AA-T-------G--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATAT
gi|55657                      : AAAG-GC--A-T-AGTACCCC-GGA--C----CTG----T-GT--T-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----A-G-A-T-G-TC--A---TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----G----T--A-C--------TG--AC------TG----TTAA-------AA-T-------G--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-T--A-C---A-AAATAT
gi|55658                      : AAAG-GC--A-T-A---CTCC-GAA--T----C------T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-TG-G-G----C-G-ATT-A-CC--A-T-TT--C--C----G-T--A-TT-G----GC------T-----A----A--G-T--------TG--AA------TG----CG-A-------AA-T-------C--A-G-A-----TTTT--CACG-G-T---AG-T-GAT-TT--T---G-A---AC--ATTAA-ACA--T-A--------A-G--T-C---A-AAATATA
gi|55659                      : AAAG-GC--A-T-T---ACTC-TGA--TA---TTC----T-GT--C-ACT---AT-G-----T------G-AAT--A-GGCAAC-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--G----A-G--A-TT-G----GCG-----T-----A----T--AAT--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------TCAT-G-A-----TTT---CACG-G-T---AG-T-GAT-TTACT---A-C---AT--T--AA--CA--T-A--------A-G--T-G---C-AAATATAt
gi|55660                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--A----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--T--T------G-A-T--G-G----C-G-G-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----G----T--A-C--------T----------------------------------------------------TTTG--TA-G-G-T---TA-A-GAT-TT--T---A-C---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55661                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----ATG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--A-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GA------T-----G----T--A-C--------TG--A-------------C----------AA-T-------T--T-G-T-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---C-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55662                      : AAAG-GC--A-T-A---TCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----T----T--A-C--------TG--AC------TG----T--A-------AA-T-------T--T-T-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA----------------G----------------C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55663                      : AAAG-GC--A-T-A---ACCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-GG-A--T------G-G-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-GCATGAC------T-----T----T--A-C--------AG--AC------TT----C--A-------AA-T-------T--T-G-A-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------G-A--T-C---A-AAATATt
gi|55664                      : AAAG-GC--A-T-A---ACCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-GGAA--T------G-G-TG-G-G----C-G-A-T-AGTC--A-TATT-GT--T----G-GAAA-CT-A----AT------TTGTACA----TG-A-C--------TT--AACAGACTTT----C--A-------CA-T-------T--TGG-A-----CTTGTCCA-G-GAT---TG-A-GAT-TT--
gi|55665                      : AAAG-GC--A-T-G---TTCT-GGA--TGAGGCTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------A-G-T--G-G----C-G-A-T-A-AC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-A----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T------------------------------A--AA-GCA--T-C--------T-A--T-C---A-AAATATA
gi|55666                      : AAAG-GC--A-T-A---GCCA-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----G----T--A-C--------TT--AC------CG----T--A-------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--GT-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---T-C---GT--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---G-AAATATA
gi|55667                      : AGAG-GCC-ACT-A---CCCC-GGA--T----CTA----T-GT--C-AC----AT-G--A-----------A-T--G-A----C-G-AGT-G-TC--A-T-TT-GT--T----G-G--A-CT-G----GA------T-----G----T--A-C--------TG---A------CG----T--A-------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GA--TT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C--------A-A--T-C---A-AAATA
gi|55668                      : AAAG-GC--A-T-A---GCCC-GGAA-T----CT-----T-GT--C-GC----GT-A--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-TGG-TC--GTT-TT-GC--T----G-G--A-CT-T----GC------T-----G----T--A-T--------T-------------------------------T-------T--T-G-GC----TTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-C---GC--A--AA-GCA--G-C----------A--T-C---A-AAATATA
gi|55669                      : AAAG-GC--A-T-A---GCCC-GGAA-T----CT-----T-GT--C-GC----GT-A--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TC--G-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-T----GC------T-----G----T--A-T--------------------------------------A-T-------T--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--
gi|55670                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCG-GGA--T----ATG----T-GG--C-AC----GC-G--A--T------G-A-T--G-G----T-G-A-T-A-TT--T-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------CG----T--A-------CA-T-------C--------------------------------A-GAT-TT--T---A-T---AA--A--AA-GGA--T-C--------A-A--T-C---A-ATATAT
gi|55671                      : AAAG-GC--A-T-G---TCCC-GGA--T----CTG----T-GTGAC-ACTCCTAT-AT-A--G------A-A-T--G-G------------A-TC--G------G--------G-G--A-AT-G----GA------T-----A----T--A-TATAT----TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTCG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---AT--A--AA-ACA--T-C--------A-G--T-C---A-AA
gi|55672                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCG-GAA--T----ATG----T-GT--C-AT----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-----A-TT--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----C----T--A-C--------TG--GA------CG----C--A-------CA-T-------C--A-G-A-----
gi|55673                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTC----C-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-
gi|55674                      : AAAG-GC--A-T-A---TCCT-AGA--T----ATG----TTGT--C-AC----AT-C--A--T------G---T---------C-A-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-C----GC------T-----A----G--A-TG-------TA--AA------GG----C--A-------AA-
gi|55675                      : AAAG-GC--A-T-A---CCCC-GGA--A----CTG----T-GC--C-GC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-
gi|55676                      : AAAG-GC--A-T-A---CCAT-GTA--A----CTG----C-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-T
gi|55677                      : AAAGCGC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----TCGT--CAAC----AT-GC-A--T------G-A-T----G----C-GAA-T-G-TCA-A-T-TT-GCCTT----G-GA-A-AT-G----GC------T-----G----T--A--------------AAT-----TG----C--G-------GA-T--------------------TCTG--CA-C-A-TTC-TG-A-GAT-TA--T-----C---GCT-A--AA-GCA--G-C--------A-A--TACA--A-AAATATA
gi|55678                      : AAAA-GCTCA-T-----CTCC-GGT--TA---CTG------AT--C-AC----AT-G--A--A------T-A-T----G----C-T-A-T-A--A--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----CCT-----T-----A----T--A-T--------TGA-AA------TG----C--AT------AA-T-------C--A-G-A-----TT
gi|55679                      :  AAG-GC--A-T-A---CTCC-GAA--T----CCC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--ATTT-G----GC------T-----A----A--T-C--------TG--AA------TG----C--A-------AATT-------C--A-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---AT--T--AA-ACA--T-A--------G-A--T-C---A-AAATAT
gi|55680                      :  AAG-AC--A-T-A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-GC----AT-G--A--T------G-A-C--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-T--------TG--AG------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---GG-A-GAT-TT--T---A-C---AT--A--AA-GCA--TAT--------ATA--T-C---A-GATTATA
gi|55681                      :  AAGTGC--A-T-A---CTC--GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--TT-----G-A-T--A-G----G-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----G-------T-----A----T--AAC--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--A-G-AT----TTTG--CA-A-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---AT--T--AA-ACA--T----------A-A--T-C---A-A
gi|55682                      :  AAG-GC----T-A---CTCC-GGA--T----CTC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----G-G-A-T---TCA-A-T-TT-CC--T----G-GT-A-TT-T----GC------T-----A----T--A-T--------TG----------TG----C--A-------AA-T-------C--A-G-A-----TTTG-----A-T-T---TG-A-GAT-TT--T---A-A---TT--A------CA--T-A--------A-G--T-C-----AAATATA
gi|55683                      :  AAA-GC--A-T-A---GCCA-GGA--A----CTG----T-GT--C-AC----ATTG--A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--A-T-TT-GC--T----GTG--A-C--G----GC------T-----G----T--A-C--------TT--AC------CG----T----------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--GT-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---T-C---GT--A--AA-GCA--G-C--------A-AC-T-C---G-AAATATt
gi|55684                      :  AAA-GC--A-TTA---GCCA-GGA-------CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-C-T--G-G----T-G-A-T-G-CC--A-T-TT-GC--T----GTG--A-C--G----GCT-----T-----G----T--A-C--------TT--AC------CG----G--T-------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--GT-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---T-C---GT--A--AATGCA--G-C--------A-AC-T-CG--A-AAATAT
gi|55685                      :  AAG-GC--A-T-A---CCCC-GAG--T----CTG----T-GT----AC----GT-G--G--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-GT-TC--T----G-G--G-CT-A----CC------T-----A----T--G-C--------TG--TC------TG----C--A-------AA-T-------C--T-T-A-----TTTA--CA-C-G-T---TGCA-GAT-TT--C---A-A---AC--A--AA-ACC--T-C--------A-A--T-C---A-AAA
gi|55686                      :  AAG-GC--A-T-A---CCAT-GGAACA----CTG------GT--C-A--------GC-A--T------G-A-T--G-G----C-G-AGT-A-CC--A-T-TTCGC--T----G-G--A-TT-G----GCATAACAT-----G----T--A-CATTGTATTTG--AA------TG----C--A-------AA---------C--T-G-AG----TTTG--CA---G-T---TG-A-GAT-TT--T---ATC---AT--A--AA-ACAATC-C--------A-G--T-C---AGAAATATA
gi|55687                      :  AAA-AC--A-T-A---ACCA-GGA--T----TT-----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G--------A-T-A-TT--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A--------------AG------TGTCTTC--A-------AC-C-------C--T-G-A-----TTTG--CA-C-G-T---TGCG-GAT-TT--T---A-A---AC--A--AA-GCA--A-T--------G-A--A-G---A-AAATACA
gi|55688                      :  AAG-GC--A-T-A---CCCC-GGG--T----CCG----A-GT--C-AC----AT-C--A--T------G-A-T--G-G----C-G---T-A-AT--A-A-TC-GC--T----G-G--G-CT-G----GC------T-----A----A--A-C--------TG--AC------TA----C--A-------CA---------C--T-G-----------------------------GAT-TT--T-----C---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAt
gi|55689                      :  AGG-GC--A-T-A---CCCC-AGA--T----CTA----T-GT--C-A-----------------------------------C-G-G-T-A-TG--A-T-TT-GC--TCTCGG-G--A-TT-T----GC------T-----A----G--A-C--------TG--TC------TG----C--A-------AACT-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---AG-ACGAT-TT--T---A-A---AG--A--AA-GCA--G-T--------A-A--C-C---A-ATATAT
gi|55690                      :  AGG-GC--A-T-G---CCCTTGGA--C----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--TCAA---G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TA--A-T-TT-GC--T------A--A-CT-G----CCGTAT--T-----A----T--A-C--------AG--A
gi|55691                      :    G-GC--T-T-A---CGCC-TGA--T----CAC----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----GC------T-----A----T--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-C-------C--A-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---T-C---AT--T--AA-GCA--T-A--------A-G--T-C---A-AAATATA
gi|55692                      :    G-GC--A-T-A---TCCC-GGA--T----CTGACACT-GT--T-AC----AT-G--A--G------G-A-T--G-G----C-G-A-G-A-TC--A-T-TT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-TAT------TG--AA------TG----T--A-------AC-A-------C--T-G-A-----TTTA--CA-G-G-T---TA-A-GAT-TT--A---A-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAt
gi|55693                      :             -A---CCCC-GGA--T----C-G----C-GT--C-AC----AT-G--AGGT------G-A-TATG-G----C-A-A-T-T-AC--A-T-TT-TC--T----G-A--A-CT-G----GCA-----T-----T----T--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-A-A-----TTTG--TA-G-G-T---TG-A--AT-TT--T---G-C---AT--A--AA--CA--T-C--------A-G--T-T---A-AAATATAt
gi|55694                      :             -A---CCCC-GGA--T----C-G----C-GT--C-AC----AT-G--AGGT------G-A-TATG-G----C-A-A-T-T-AC--A-T-TT-TC--T----G-A--A-CT-G----GCA-----T-----T----T--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-A-A-----TTTG--TA-G-G-T---TG-A--AT-TT--T---G-C---AT--A--AA--CA--T-C--------A-G--T-T---A-AAATATA
gi|55695                      :             -A---CCCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-GC--T----C-G--A-CT-G----ACTACTAGT-----A----T--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----T
gi|55696                      :               ---CTCC-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------GAA-T--G-G----CTG-A-T-G-TC--A-TGTT-GT--T----G-G--A-CTCG----GA------T-----G----TCAA-C--------TG--GA------C-----C--AGGAGTGTAA-T-------T--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-TTTGTG-A-TAT-AC--A---A-C---GC--AC-AA-GCA--G-C----------A--T-C---A-AAA-ATA
gi|55697                      :                     C-GGA--T----CTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-G-TT-------------T----G-G--A-CT-G----GA------T-----G----T--A-C--------TG--AC------TG----A--A-------AA-T-------T--T-G-G-----CTTG--CA-G-A-T---TG-A-GAT-TT--A---A-C---
gi|55698                      :                        GA--T----CTG----T--T--T-AC----AT-G--A--G------G-AAT--G-G----C-G-A-G-A-TC--A-TGTT-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--ATT--------TG--AA------TG----T--A-------A----------C--T-GAA-----TTTA--CA---G-T---T--A-GAT-TT--A---A-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-------AAATATA
gi|55699                      :                         A--T----TTG----T-GT--C-AC----AT-G--A--A------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TC--A-T-TT-AC--T----G-G--A-CT-G----GCTA----T-----A----T--A-C--------TC--AC------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-AGTCTT--T---A-C---AC--A--AT-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55700                      :                          --T----CT-----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-AT-CC--T----G-G--A-TT-G----GC------T-----A----T--A-
gi|55701                      :                                                                    atc-A-T--GCG----C-G-A-T-A-TC--A-T-TTTGA--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TGCTAA-------G----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-GCG-T---TG-A-GATCTT--T---A-C---GC--A--AA-ACA--T-C--------A-AGGT-CAAAA-AAATATAt
gi|55702                      :                           ctctgcaca----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CC--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----GC------T-----A----A--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--A-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---AT--T--AA-ACA--T-TTATTATTAA-G--T-C---T-AAATATA
gi|55703                      :                                   c----T-GT--C-AC----GT-G--G--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-CT--A-T-TT-CC--T----G-G--A-TT-G----GC------T-----A----C--A-C--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------t
gi|55704                      :                                   c----T-GT--C-AC----GT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-G-TTA-TT--A-T-TT-AC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-TATTA----TG--AA------CG----C--A-------A--T-------C--T-T-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-TAT-CT--TCTAA-C----------AA-GCA--T-C----------A--T-C---A-AAAT
gi|55705                      :                                   c----T-GT--C-AC----AT-G--A--T------G-A-T--G-G----C-A-A-T-A-TC--A-T-TC-GC--T----G-G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--A------------------------------------------------TTTG--CA-A---T---TG-A-GAC-TT--T---A-C---AT--A--AA-GCA--T-C--------C-A--T-C---A-AAATGTA
gi|55706                      :                                    ----T-GT--C-AT----TG-G--A--T------G-A-T--G-G----C-G-A-T-A-TTTTA-T-TT-AC--T----G-G--AACT-G----GC------T-----C----T--A-C--------TG--AAA-----CG----C--A-------GA-TTTTTTTTC--T-G-A-----TTTAA-CA-G---T---TG-AAGAT-TT--T---A-T---AC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAA-ATA
gi|55707                      :                                                                                                                   -G--A-CT-G----GC------T-----A----T--A-C--------TG--AA------CG----G--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--TA-G-G-T---TA-A-TAT-TT--T---A-T---AC--A--AA-GCA--C-C--------A-A--T-C---A-AAATA
gi|55708                      :                                                                                                                             ----GC------T-----A----T--A-T--------TG--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTT--AA-G-G-T---TG-A-GAT-TC--T---A-C---AT--A--AA-GTA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATGTAaat
gi|55709                      :                                                                                                                                   ------T-----A----T--A-C--------TT--AA------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTTG--CA-G-G-T---TG-A-AAT-TT--C---T-T---AC--A--AA-GAA--T-A--------A-A--T-C---A-AAATATA
gi|55710                      :                                                                                                                                                                       A------TG----C--A-------AA-T-------C--T-G-A-----TTAG--CA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---A-C---AT--G--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATACA
gi|55711                      :                                                                                                                                                                             ttg----C--A-------AA-T-------C--T-A-G-----TTTG--TA-G-G-T---TG-A-GAT-TT--T---G-C---GC--A--AA-GCA--T-C--------A-A--T-C---A-AAATATAt