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Reference ( gi|43291 ) : CATT-TAA-A--GGATTT-A-CA-A-A--TA------T----C----------A-G-AAAAGG-T---TTG--------T---------T----A--C-----TA-------AT-A----AA-T-------A--------A-GA-C--C--T--A-A--T-TT---T-A--T--G-C--T-C-AT--TC--T-A-T--C-T-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAA-TT-C-A-TT-T-CGG-A-G------T-GG-A--T-C------------C--AC-TCC-GATTTG
gi|43292 : CATT-TAA-A--GGATTT-A-CA-A-A--TA------T----A----------A-G-AAAAGG-T---TAG--------T---------T----A--C-----TA-------CT-A----AA-T-------A--------A-GA-C--C--T--A-A--T-TT---T-A--T--G-C--T-C-AT--TG--T-A-T--C-T-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAA-TT-C-A-TT-T-CGG-A-G------T-GG-A--T-C------------C--AC-TCC-GATTTG
gi|43293 : CATT-TAA-A--GGATTT-A-CA-A-A--TA------T----C----------A-G-AAAAGG-T---TTG--------T---------T----A--C-----TA-------AT-A----AA-T-------A--------A-GA-C--C--T--A-A--T-TT---T-A--T--G-C--T-C-AT--TC--T-A-T--C-G-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAA-TT-C-A-AT-T-CGG-A-G------T-GG-A--T-C------------C--AT-TCG-GA
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gi|43313 : TT-TTA-A--GGATTT-A-CA-A-A--TA------T----A----------A-G-AAAAGT-T---TTTATTTTTTTT---------T----A--C-----TA-------CT-A----AA-T-------T--------A-AA-CC--T--A--A--T-GT---T-A--T----C--TAC-AC--TC--T-A-T--C-T-AA--A-A-G-C-T-G---T-G-TAA-TT-A-A-TT-TGCGG-A-G------TGGG-A--TC------------C--AC-TCC-GATTTG
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Reference ( family-311 ) : CATT-TAA-A--GGATTT-A-CA-A-A--TA------T----C----------A-G-AAAAGG-T---TTG--------T---------T----A--C-----TA-------AT-A----AA-T-------A--------A-GA-CC--T--A--A--T-TT---T-A--T--G-C--T-C-AT--TC--T-A-T--C-T-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAA-TT-C-A-TT-T-CGG-A-G------T-GG-A--TC------------C--AC-TCC-GATTTG
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gi|43350 : --T-C-ATC-TC--T-ACT--C-C-AA--T-A-G-CAT-G---T-G-AAA-TT-C-AATT-T-CGG-AAG------T-GG-A--TC------------C--AC-T-C-GATTTG
gi|43351 : --T-C-AT--TC--T-A-T--C-T-AA--A-A-G-G-T-G---T-G-AAA-TT-A-A-TT-T-CGG-A-G------A-GG-A--TC------------C--AC-TCC-GATTTG
gi|43352 : --T-C-AC--TC--T-A-T--C-T-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAA-TT-G-A-TT-T-CGG-A-G------T-GG-A--TC------------C--AC-TCC-GATTTG
gi|43353 : --T-C-AT--TC--T-A-T--C-T-AA--T-A-T-C-T-G---T-G-AAA-TT-C-A-TT-T-CGG-A-A------T-GA-A--TT------------C--AC-TCC-AATTTG
gi|43354 : ---T-G-AAA-TT-C-A-TT-T-CGG-G-GAGC---T-GG-A--TC------------C--AC-TCC-GATTTG
gi|43355 : --T-C-ATA-TCG-T-A-T--C-T-AA--A-A-G-C-T-G---T-G-AAA-GTAC-A-CT-T-GGG-A-G------T-GG-A--TC------------C--AC-TCT-GATTT
gi|43356 : --T-C-AT--TCG-T-A-TT-C-T-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAATTT-C-ATTT-T-CGGAA-G------T-GG-A--TC------------CCAAC-TCC-GATT
gi|43357 : --T-C-AT--TC--T-A-T--C-G-AA--T-A-G-C-T-G---T-G-AAA-TT-C-A-AT-T-CGG-A-G------T-GG-A--TC------------C--AT-TCG-GA