lowQualScore                  :      0  88 0   0   222 22  0 7  0 1111 0 0 00  0  0       0   0  1111 6    111 111 333 111111  00 2222222  22222  1111    00 1  1  0    
lowQualScore                  :      .  .. .   .   ... ..  . .  . .... . . ..  .  .       .   .  .... .    ... ... ... ......  .. .......  .....  ....    .. .  .  .    
lowQualScore                  :      7  88 7   7   777 22  6 2  6 3333 6 6 88  6  6       6   6  3333 0    111 111 333 888888  99 1111111  22222  4444    99 3  4  7    
consensus                     :  AAAA-ATC-A-ACG-AAC---C--GA-AACG-A----A-A-C--TC-GA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
Reference ( gi|66636 )        :  AAAA-ATT-A-ACG-AAC---C--AA-AGCG-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66610                      :  AAAA-ATT-A-ACG-AAC---C--AA-AACG-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CCA-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66609                      : cAAAA-ATT-A-ACG-AAC---C--GA-AACG-A----A-A-C--TC-AA-ACTCGAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66642                      : cAAAA-ATC-A-ATG-AAC---T--GA-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AA-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66638                      :  AAAA-ATC-A-ACA-AAC---C--AA-AATG-A----A-A-C--TT-GA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAA---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66612                      :  AAAA-ATC-A-ACG-AAC---T--GA-AATG-A----A-A-C--TC-GA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-AA-CA-
gi|66641                      : cAAAA-ATC-A-ACA-AAC---C--AA-AATG-A----A-A-C--TC-GA-ACTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66640                      :  AAAA-ATC-A-ACA-AAC---C--AA-AATG-A----A-A-C--TC-GA-ACTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66637                      :  AAAA-ATC-A-ACA-AAT---C--AA-AATG-A----A-A-C--TC-AG-ACTTGAT-CTA-CA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66643                      :  AAAA-ATC-A-ATG-AAC---C--AA-AACA-A----A-A-C--TC-GA-CCTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-T
gi|66611                      :  AAAA-ATC-A-ATG-AAT---G--AA-AACG-A----A-A-C--TT-CA-ACTTGAT-CTG-TA----TTTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66645                      : cAAAA-AT--A-ACTCAAC---C--AA-AACG-A----A-A-C--TC-GA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------ACACCTGAC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66647                      :  AAAA-ATC-A-ACG-ACC---C--GA-AACG-A----A-A-C--TC--------GAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66648                      :  AAAA-ATC-A-ACG-AAC---T--TA-AACG-A----A-A-C--TA-GG-ACTTGAT-CTG-TA----ATTCGC---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TT-TA-AAAA
gi|66644                      :  AAAA-ATC-A-ACA-ATC---C--GA-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TT----ACTCTT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AA
gi|66646                      :  AAAA-ATC-A-ATG-AAC---T--GA-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-TTG--A----ACTCAT---T---A---G------TA--T-------AC-----AT----CTAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66623                      :  AAAA-ATC-A-ACG-AAC---C--GT-AACA-A----A-A-C--TC-GA-ACTTGAT-CTG-TC----AGTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGT--A-TA-AA-AA
gi|66617                      : cAAAT-ATC-A-ACG-AAC---C--AA-AACA-A----A-A-C--AC-AA-A-TTGAT-CTG-TA----ACTTAT---G---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66616                      : cAAAA-ATC-A-TCG-AAC---C--AG-AACG-A----A-A-C--TT-AA-ACTCGAT-CGG-TT----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AG----CAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66621                      : cAAAA-ATC-A-ACG-AAG---C--AA-AACG-A----A-A-C--TC-AA-TCTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--C-------AC-----A
gi|66639                      : cAAAA-ATC-A-ACA-AAC---A--AA-AACG-A----A-C-C--TC-AA-ACTTGAT-ATG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AT-----AT----CTGT--A-TA-CA-AAAA
gi|66650                      :  AAAA-ATC-A-ACG-AACTG-C--AT-GGCACA----ATA-C--TC-AA-ACTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66622                      :  AAAA-ATC-A-ACG-AAC---C--GA-AACG-A----A-A-T--TG-AA-ACGCAAT-TTG-TA----ACTTAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CT-AAAA
gi|66651                      : cAAAC-ATA-A-ATG-AAC---C--AA-AACG-A----A-A-C--TT-GA-ATTTGAT-CAG-TA----ACTCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66627                      :  AAAC-ATG-A-ACG-AAC---C--AA-AACG-A----A-A-C--TC-AG-ATTTGAT-CTG-TA----GCTCATCCAT---ATACA------TG--T-------AC-----AC----ATGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66619                      : cAAAA-ATA-A-ACA-AAC---C--AA-AACA-A----A-A-C--TC-AA-GTCTGAT-CTG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TATCA-AA
gi|66625                      : cAAAA-ATC-A-ACG-AAC---C--GA-A-CG-A----A-A-C--TC-GA-A-TTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------T---T-------AT-----AA----CTGC--A-CA-CA-CAAA
gi|66629                      : cAAAA-ACC-A-TCG-AAC---T--GA-AACG-G----A-A-A--TC-AA-ACTCGAT-CTG-TA----ACTCGT---T---A---G------TA--T-------AC-----AA----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66653                      : cAAAA-ATC-G-GCT-AAC---C--AA-A-----------A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---TTAAA---A------TATGT-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAAA
gi|66620                      :  AAAA-ATC-A-ACG-AAC---CA-AA-AACA-A----A-A-C--T--GG-ATTTGAT-CTG-TT----ACTCAT---A---A---A------TA--T-------AC-----GC----TAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66652                      : cAAAA-ATA-A-ACA-AAC---C--TA-AACC-A----A-A-C--TC-AA-ACTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--
gi|66632                      :  AAAA-ATC-A-TCG-AAC---C--GG-AACA-A----A-C-T--TC-GA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----A
gi|66655                      : cAAAA-ATC-A-ACA-AAC---C--GA-AACA-A----A-A-T--TC-GA-ACTTGAT-CTG-TA----AGTCAT---T-------T------TA--A-------AC-----AA----CTGC--ATTC-CA-AAAA
gi|66654                      :  AAAA-ATC-A-ACA-GAC---C--AA-AACA-A----A-A-T--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66659                      :  AAAA-ATC-A-ACG-GAC---C--AA-ATCG-A----A-A-T--TC-AA-ACTTGAT-CAG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66657                      :  AAAATATC-A-ATG-A-C---C--AA-AACG-A----A-AAC--TCAAA-ATTTGATGCTG-TA----ACTCAT---T---AT--A------TA--T-------ACT----AC----CTGC--ATTA-CC-AAAA
gi|66634                      :  AAAA-ATC-T-ACA-AGC-------A-AGCA-C----A-A-CATTC-AA-ACTTAAT-ATG-TG----ACTCAA---A---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66613                      : cAAAA-ATC-A-ACA-------C--A----CG-A----A-A-C--TG-GA-ATTTGAC-CTG-TA----ACTCAT---T-------A------TT--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAA
gi|66628                      : cAAAA-ATA-A-ACA-AAC---CGGAA-AACC-CCCCCA-A-C--TC-AA-ACTCAAT-TTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-CA-CA-AAA
gi|66656                      : cAAAA-ATC-A-ACA-AAC---C--AA-CATG-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTGCCA----ACTCA
gi|66633                      :  AAAT-ATC-T-ACA-AACA--C--AGGAACA-A----A-G-C--TC-AA-ACTTTAT-CTG-TA----ACTCAG---C---A---A------TA--TACCCATAAC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66649                      : cAAAA-ATC-ACAC--AAC---C--GA-TACG-A----A-A-T--TC-GA-ACTTGAC-TTG-TA----ACTTAC---T---A---A------AA--T-------AC-----AC----CTGT--A-T--TA-AAAA
gi|66658                      :  AAAA-ATC-A-TTA-AAC---C--GG-AACA-A----A-A-C--TA-AA-ACTCAAT-CTG-AA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----A------TGT--A-CA-
gi|66624                      :  AAAA-GTC-C-ACA-AAC---C--GA-AAAG-A----A-A-C--AT-AA-ACTACAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---ATACATGTA--T-------AT-----AC----CTAC--A-T
gi|66660                      :  cAAA-ATC-A-ACG-AAC---C--GA-AACG-A----A-A-T--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--C-------AT-----AC----CTCC--A-TA-CA-GAAA
gi|66618                      :   AAA-ATTCA-ACA-AACTGGC--AA----G-A----A-A-C--TC-AA-ACTCGAT-ATG-TA----ACTCGT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA
gi|66662                      :  cAAA-ATC-A-ACG-ATC---CG-AA-AATG-A----A-A-C--TT-GA-TCTTGAT-CTC-GA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-GAAA
gi|66663                      :   AAA-ATC-A-TTG-AAG---T--TA-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-CA----AATCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AC----ATCC--A-TA-CA-AAAA
gi|66626                      :   AAA-ATTCA-ACA-AAC---C--AA-ACCG-T----A-A-C--AC-GA-TCTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----TT-C--A-TGTCA-AAA
gi|66630                      :  cAGA-ATTCA-ACG-AAC---T--AT-AACG-A----A-A-C--TT-TA-AATTGGT-CTG-TA----ACTCAT---T---G---T------TG--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66635                      :  cAAA-ATC-A-TCG-AAC---C--GG-AACG-A----A-A-C--TC-AC-ACTCGAT-CTG-TACGTGACCCCT---T---A---C------TA--T-------AC-----AC----TAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66631                      : cgAAA-ATTCA-ACA-AAC---C--AA-AACA-A----A-A-T--TT-AA-ACTTGAT-AT--TA----ACTCAT---G---A---A------TA--T-------AC-----CC----ATGCAAA-TA-CA-AAAA
gi|66661                      :  cAAA-ATC-A-ATG-AAT---T--GG-AACA-A----A-A-T--TC-AA-AGTCGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---G------TA--T-------AC-----GCTGGTCTGC--A-TA-TA-AAAA
gi|66666                      :   AAA-ATC-A-ATG-AAC---C--AG-ACAA-A----A-A-C--AC-AA-ACTCAAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----
gi|66665                      :   AAA-ATC-A-ACA-AAG---C--AG-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACT------------------CAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66615                      :      -ATC-A-ACG-AAC---C--GA-AACG-A----A-A-T--TT-AA-TCTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TA-CC-AAAA
gi|66667                      :   cagatTC-A-ACG-AAC---C--AA-AGCG-A----A-A-C--TC-GA-ATGTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CATAAAA
gi|66668                      :        TC-A-ACA-AAC---C--GG-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACTCAAT-CTG-TG----ACTCAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-TA-CA-AAAA
gi|66669                      :                -AAC---C--AA-AACG-A----A-A-C--AC-GA-ATTTGAT-CTG-TA----ACTTAC---T---A---A------TA--T-------AT-----AC----CGGC--A-TA-TA-AAA
gi|66671                      :                  aC---C--GG-AACA-A----A-A-C--TC-AA-ACTCAAT-CTG-TA----ACTTAG---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66614                      :                    ---C--AA-AATG-A----A-A-C--TC-AG-ACTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CCAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66670                      :          caaatatcaa---C--GA-AACG-A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----ACTCTT---T---GAT-A------TA--T-------AC-----AC----CTCG--A-TA-CA-AAAA
gi|66672                      :                    aagt--AA-ATCA-A----C-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-TA----A-TCAT---T---A---A------CA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TG-CA-AA
gi|66664                      :                           a-AACG-G----A-A-C--TC-GA-TCTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---G---AAT-A------TA--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66673                      :               aaaaccatcaaaagtcCA-A----A-A-A--TC-AACAC--GAT-CTG-TA----GCGCAT---T---A---A------TG--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66674                      :                                 -A----A-A-C--TC-AA-ACTTGAT-CTG-CA----ACTCAT---T---A---T------TA--T-------AT-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66675                      :                                   ----A-A-C--TC-AA-ATTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------GT-----AC----CTGC--A-CA-CA-AAA
gi|66676                      :                                                     CTTGAT-CTG-TA----GCTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA





Alignments
lowQualScore                  :                    0    0   0   0 11  1111 222222     1 00  1  0      0   0  1111      111 111 333 111111  00 2222222  22222  1111    00 1  1  0    
lowQualScore                  :                    .    .   .   . ..  .... ......     . ..  .  .      .   .  ....      ... ... ... ......  .. .......  .....  ....    .. .  .  .    
lowQualScore                  :                    7    7   7   6 77  3333 444444     2 88  8  6      6   6  2222      000 000 333 888888  88 0000000  22222  4444    99 3  4  7    
consensus                     :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
Reference ( family-309 )      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66609                      :                AAAA-ATTA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTCGAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66610                      :               cAAAA-ATTA-ACG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CCA-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66611                      :               cAAAA-ATCA-ATG-AAT-G-AAA----A------CGAAA-C--TTCAA-CTTGAT-CTG-TA----TTTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66612                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-T-GAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-AA-CA-
gi|66613                      :               cAAAA-ATCA-AC---AC----------A------CGAAA-C--TGGAA-TTTGAC-CTG-TA----ACTCAT---T-------A------TT--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAA
gi|66614                      :               cAAAT-ATCA-ACA-AA-----------A------TGAAA-C--TCAGA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CCAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66615                      :                   c-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TTAAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TA-CC-AAAA
gi|66616                      :           cagatAAAA-ATCA-TCG-AAC-C-AGA----A------CGAAA-C--TTAAA-CTCGAT-CGG-TT----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AG----CAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66617                      :               cAAAT-ATCA-ACG-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--ACAAA--TTGAT-CTG-TA----ACTTAT---G---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66618                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-T-GGC----A------AGAAA-C--TCAAA-CTCGAT-ATG-TA----ACTCGT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA
gi|66619                      :               cAAAA-ATAA-ACA-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--TCAAG-TCTGAT-CTG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TATCA-AA
gi|66620                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-CAAAA----A------CAAAA-C--T-GGA-TTTGAT-CTG-TT----ACTCAT---A---A---A------TA--T-------AC-----GC----TAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66621                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAG-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--C-------AC-----A
gi|66622                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TGAAA-CGCAAT-TTG-TA----ACTTAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CT-AAAA
gi|66623                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GTA----A------CAAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TC----AGTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGT--A-TA-AA-AA
gi|66624                      :               cAAAA-GTCC-ACA-AAC-C-GAA----A------AGAAA-C--ATAAA-CTACAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---ATACATGTA--T-------AT-----AC----CTAC--A-T
gi|66625                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA-----------CGAAA-C--TCGAA--TTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------T---T-------AT-----AA----CTGC--A-CA-CA-CAAA
gi|66626                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-C-AAA----C------CGTAA-C--ACGAT-CTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----TT-C--A-TGTCA-AAA
gi|66627                      :               cAAAC-ATGA-ACG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAGA-TTTGAT-CTG-TA----GCTCATCCAT---ATACA------TG--T-------AC-----AC----ATGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66628                      :               cAAAA-ATAA-ACA-AAC-C-GGA----AAACCCCCCCAA-C--TCAAA-CTCAAT-TTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-CA-CA-AAA
gi|66629                      :               cAAAA-ACCA-TCG-AAC-T-GAA----A------CGGAA-A--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCGT---T---A---G------TA--T-------AC-----AA----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66630                      :               cAGAA-TTCA-ACG-AAC-T-ATA----A------CGAAA-C--TTTAA-ATTGGT-CTG-TA----ACTCAT---T---G---T------TG--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66631                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-C-AAA----A------CAAAA-T--TTAAA-CTTGAT-AT--TA----ACTCAT---G---A---A------TA--T-------AC-----CC----ATGCAAA-TA-CA-AAAA
gi|66632                      :               cAAAA-ATCA-TCG-AAC-C-GGA----A------CAAAC-T--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----A
gi|66633                      :               cAAAT-ATCT-ACA-AACACAGGA----A------CAAAG-C--TCAAA-CTTTAT-CTG-TA----ACTCAG---C---A---A------TA--TACCCATAAC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66634                      :               cAAAA-ATCT-ACA-AGC----AA----G------CACAA-CATTCAAA-CTTAAT-ATG-TG----ACTCAA---A---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66635                      :                cAAA-ATCA-TCG-AAC-C-GGA----A------CGAAA-C--TCACA-CTCGAT-CTG-TACGTGACCCCT---T---A---C------TA--T-------AC-----AC----TAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66636                      :              cgAAAA-ATTA-ACG-AAC-C-AAA----G------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66637                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAT-C-AAA----A------TGAAA-C--TCAGA-CTTGAT-CTA-CA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66638                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TTGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAA---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66639                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-A-AAA----A------CGAAC-C--TCAAA-CTTGAT-ATG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AT-----AT----CTGT--A-TA-CA-AAAA
gi|66640                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66641                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66642                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-T-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AA-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66643                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--TCGAC-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-T
gi|66644                      :                AAAA-ATCA-ACA-ATC-C-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TT----ACTCTT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AA
gi|66645                      :                AAAA-AT-A-ACTCAAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------ACACCTGAC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66646                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-T-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-TTG--A----ACTCAT---T---A---G------TA--T-------AC-----AT----CTAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66647                      :                AAAA-ATCA-ACG-ACC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGA-------T-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66648                      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-T-TAA----A------CGAAA-C--TAGGA-CTTGAT-CTG-TA----ATTCGC---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TT-TA-AAAA
gi|66649                      :                AAAA-ATCACAC--AAC-C-GAT----A------CGAAA-T--TCGAA-CTTGAC-TTG-TA----ACTTAC---T---A---A------AA--T-------AC-----AC----CTGT--A-T--TA-AAAA
gi|66650                      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-T-GCATGGCA------CAATA-C--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66651                      :                AAAC-ATAA-ATG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TTGAA-TTTGAT-CAG-TA----ACTCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66652                      :                AAAA-ATAA-ACA-AAC-C-TAA----A------CCAAA-C--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--
gi|66653                      :                AAAA-ATCG-GCT-AAC-C-AAA----A------C--------TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---TTAAA---A------TATGT-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAAA
gi|66654                      :                AAAA-ATCA-ACA-GAC-C-AAA----A------CAAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66655                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-GAA----A------CAAAA-T--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----AGTCAT---T-------T------TA--A-------AC-----AA----CTGC--ATTC-CA-AAAA
gi|66656                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAC----A------TGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTGCCA----ACTCA
gi|66657                      :                AAAATATCA-ATG-A-C-C-AAA----A------CGAAAAC--TCAAAATTTGATGCTG-TA----ACTCAT---T---AT--A------TA--T-------ACT----AC----CTGC--ATTA-CC-AAAA
gi|66658                      :                AAAA-ATCA-TTA-AAC-C-GGA----A------CAAAA-C--TAAAA-CTCAAT-CTG-AA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----A------TGT--A-CA-
gi|66659                      :                AAAA-ATCA-ACG-GAC-C-AAA----T------CGAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CAG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66660                      :                 AAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--C-------AT-----AC----CTCC--A-TA-CA-GAAA
gi|66661                      :                 AAA-ATCA-ATG-AAT-T-GGA----A------CAAAA-T--TCAAA-GTCGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---G------TA--T-------AC-----GCTGGTCTGC--A-TA-TA-AAAA
gi|66662                      :                 AAA-ATCA-ACG-ATC-C-GAA----AA-----TGAAA-C--TTGAT-CTTGAT-CTC-GA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-GAAA
gi|66663                      :                 AAA-ATCA-TTG-AAG-T-TAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-CA----AATCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AC----ATCC--A-TA-CA-AAAA
gi|66664                      :                                      A----A------CGGAA-C--TCGAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---G---AAT-A------TA--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66665                      : aaaaccatcaaaagtcAAA-ATCA-ACA-AAG-C-AGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CT------------------CAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66666                      :                 AAA-ATCA-ATG-AAC-C--AG----A------CAAAAAC--ACAAA-CTCAAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----
gi|66667                      :                      TCA-ACG-AAC-C-AAA----G------CGAAA-C--TCGAA-TGTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CATAAAA
gi|66668                      :                      TCA-ACA-AAC-C-GGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTCAAT-CTG-TG----ACTCAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-TA-CA-AAAA
gi|66669                      :                             -AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--ACGAA-TTTGAT-CTG-TA----ACTTAC---T---A---A------TA--T-------AT-----AC----CGGC--A-TA-TA-AAA
gi|66670                      :                                a-C-GAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCTT---T---GAT-A------TA--T-------AC-----AC----CTCG--A-TA-CA-AAAA
gi|66671                      :                            aagtC-C-GGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTCAAT-CTG-TA----ACTTAG---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66672                      :                                                      A-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----A-TCAT---T---A---A------CA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TG-CA-AA
gi|66673                      :                                   aaaatcaac------CAAAA-A--TC-AA-CACGAT-CTG-TA----GCGCAT---T---A---A------TG--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66674                      :                                                    AAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-CA----ACTCAT---T---A---T------TA--T-------AT-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66675                      :                                                     AA-C--TCAAA-TTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------GT-----AC----CTGC--A-CA-CA-AAA
gi|66676                      :                                                                -CTTGAT-CTG-TA----GCTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA





Alignments
lowQualScore                  :                    0    0   0   0 11  1111 222222     1 00  1  0      0   0  1111      111 111 333 111111  00 2222222  22222  1111    00 1  1  0    
lowQualScore                  :                    .    .   .   . ..  .... ......     . ..  .  .      .   .  ....      ... ... ... ......  .. .......  .....  ....    .. .  .  .    
lowQualScore                  :                    7    7   7   6 77  3333 444444     2 88  8  6      6   6  2222      000 000 333 888888  88 0000000  22222  4444    99 3  4  7    
consensus                     :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
Reference ( family-309 )      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66609                      :                AAAA-ATTA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTCGAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66610                      :               cAAAA-ATTA-ACG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CCA-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66611                      :               cAAAA-ATCA-ATG-AAT-G-AAA----A------CGAAA-C--TTCAA-CTTGAT-CTG-TA----TTTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66612                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-T-GAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-AA-CA-
gi|66613                      :               cAAAA-ATCA-AC---AC----------A------CGAAA-C--TGGAA-TTTGAC-CTG-TA----ACTCAT---T-------A------TT--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAA
gi|66614                      :               cAAAT-ATCA-ACA-AA-----------A------TGAAA-C--TCAGA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CCAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66615                      :                   c-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TTAAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TA-CC-AAAA
gi|66616                      :           cagatAAAA-ATCA-TCG-AAC-C-AGA----A------CGAAA-C--TTAAA-CTCGAT-CGG-TT----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AG----CAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66617                      :               cAAAT-ATCA-ACG-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--ACAAA--TTGAT-CTG-TA----ACTTAT---G---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66618                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-T-GGC----A------AGAAA-C--TCAAA-CTCGAT-ATG-TA----ACTCGT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA
gi|66619                      :               cAAAA-ATAA-ACA-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--TCAAG-TCTGAT-CTG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TATCA-AA
gi|66620                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-CAAAA----A------CAAAA-C--T-GGA-TTTGAT-CTG-TT----ACTCAT---A---A---A------TA--T-------AC-----GC----TAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66621                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAG-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--C-------AC-----A
gi|66622                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TGAAA-CGCAAT-TTG-TA----ACTTAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CT-AAAA
gi|66623                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GTA----A------CAAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TC----AGTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGT--A-TA-AA-AA
gi|66624                      :               cAAAA-GTCC-ACA-AAC-C-GAA----A------AGAAA-C--ATAAA-CTACAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---ATACATGTA--T-------AT-----AC----CTAC--A-T
gi|66625                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA-----------CGAAA-C--TCGAA--TTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------T---T-------AT-----AA----CTGC--A-CA-CA-CAAA
gi|66626                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-C-AAA----C------CGTAA-C--ACGAT-CTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----TT-C--A-TGTCA-AAA
gi|66627                      :               cAAAC-ATGA-ACG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAGA-TTTGAT-CTG-TA----GCTCATCCAT---ATACA------TG--T-------AC-----AC----ATGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66628                      :               cAAAA-ATAA-ACA-AAC-C-GGA----AAACCCCCCCAA-C--TCAAA-CTCAAT-TTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-CA-CA-AAA
gi|66629                      :               cAAAA-ACCA-TCG-AAC-T-GAA----A------CGGAA-A--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCGT---T---A---G------TA--T-------AC-----AA----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66630                      :               cAGAA-TTCA-ACG-AAC-T-ATA----A------CGAAA-C--TTTAA-ATTGGT-CTG-TA----ACTCAT---T---G---T------TG--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66631                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-C-AAA----A------CAAAA-T--TTAAA-CTTGAT-AT--TA----ACTCAT---G---A---A------TA--T-------AC-----CC----ATGCAAA-TA-CA-AAAA
gi|66632                      :               cAAAA-ATCA-TCG-AAC-C-GGA----A------CAAAC-T--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----A
gi|66633                      :               cAAAT-ATCT-ACA-AACACAGGA----A------CAAAG-C--TCAAA-CTTTAT-CTG-TA----ACTCAG---C---A---A------TA--TACCCATAAC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66634                      :               cAAAA-ATCT-ACA-AGC----AA----G------CACAA-CATTCAAA-CTTAAT-ATG-TG----ACTCAA---A---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66635                      :                cAAA-ATCA-TCG-AAC-C-GGA----A------CGAAA-C--TCACA-CTCGAT-CTG-TACGTGACCCCT---T---A---C------TA--T-------AC-----AC----TAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66636                      :              cgAAAA-ATTA-ACG-AAC-C-AAA----G------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66637                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAT-C-AAA----A------TGAAA-C--TCAGA-CTTGAT-CTA-CA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66638                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TTGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAA---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66639                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-A-AAA----A------CGAAC-C--TCAAA-CTTGAT-ATG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AT-----AT----CTGT--A-TA-CA-AAAA
gi|66640                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66641                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66642                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-T-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AA-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66643                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--TCGAC-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-T
gi|66644                      :                AAAA-ATCA-ACA-ATC-C-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TT----ACTCTT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AA
gi|66645                      :                AAAA-AT-A-ACTCAAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------ACACCTGAC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66646                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-T-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-TTG--A----ACTCAT---T---A---G------TA--T-------AC-----AT----CTAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66647                      :                AAAA-ATCA-ACG-ACC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGA-------T-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66648                      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-T-TAA----A------CGAAA-C--TAGGA-CTTGAT-CTG-TA----ATTCGC---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TT-TA-AAAA
gi|66649                      :                AAAA-ATCACAC--AAC-C-GAT----A------CGAAA-T--TCGAA-CTTGAC-TTG-TA----ACTTAC---T---A---A------AA--T-------AC-----AC----CTGT--A-T--TA-AAAA
gi|66650                      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-T-GCATGGCA------CAATA-C--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66651                      :                AAAC-ATAA-ATG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TTGAA-TTTGAT-CAG-TA----ACTCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66652                      :                AAAA-ATAA-ACA-AAC-C-TAA----A------CCAAA-C--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--
gi|66653                      :                AAAA-ATCG-GCT-AAC-C-AAA----A------C--------TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---TTAAA---A------TATGT-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAAA
gi|66654                      :                AAAA-ATCA-ACA-GAC-C-AAA----A------CAAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66655                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-GAA----A------CAAAA-T--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----AGTCAT---T-------T------TA--A-------AC-----AA----CTGC--ATTC-CA-AAAA
gi|66656                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAC----A------TGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTGCCA----ACTCA
gi|66657                      :                AAAATATCA-ATG-A-C-C-AAA----A------CGAAAAC--TCAAAATTTGATGCTG-TA----ACTCAT---T---AT--A------TA--T-------ACT----AC----CTGC--ATTA-CC-AAAA
gi|66658                      :                AAAA-ATCA-TTA-AAC-C-GGA----A------CAAAA-C--TAAAA-CTCAAT-CTG-AA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----A------TGT--A-CA-
gi|66659                      :                AAAA-ATCA-ACG-GAC-C-AAA----T------CGAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CAG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66660                      :                 AAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--C-------AT-----AC----CTCC--A-TA-CA-GAAA
gi|66661                      :                 AAA-ATCA-ATG-AAT-T-GGA----A------CAAAA-T--TCAAA-GTCGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---G------TA--T-------AC-----GCTGGTCTGC--A-TA-TA-AAAA
gi|66662                      :                 AAA-ATCA-ACG-ATC-C-GAA----AA-----TGAAA-C--TTGAT-CTTGAT-CTC-GA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-GAAA
gi|66663                      :                 AAA-ATCA-TTG-AAG-T-TAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-CA----AATCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AC----ATCC--A-TA-CA-AAAA
gi|66664                      :                                      A----A------CGGAA-C--TCGAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---G---AAT-A------TA--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66665                      : aaaaccatcaaaagtcAAA-ATCA-ACA-AAG-C-AGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CT------------------CAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66666                      :                 AAA-ATCA-ATG-AAC-C--AG----A------CAAAAAC--ACAAA-CTCAAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----
gi|66667                      :                      TCA-ACG-AAC-C-AAA----G------CGAAA-C--TCGAA-TGTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CATAAAA
gi|66668                      :                      TCA-ACA-AAC-C-GGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTCAAT-CTG-TG----ACTCAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-TA-CA-AAAA
gi|66669                      :                             -AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--ACGAA-TTTGAT-CTG-TA----ACTTAC---T---A---A------TA--T-------AT-----AC----CGGC--A-TA-TA-AAA
gi|66670                      :                                a-C-GAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCTT---T---GAT-A------TA--T-------AC-----AC----CTCG--A-TA-CA-AAAA
gi|66671                      :                            aagtC-C-GGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTCAAT-CTG-TA----ACTTAG---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66672                      :                                                      A-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----A-TCAT---T---A---A------CA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TG-CA-AA
gi|66673                      :                                   aaaatcaac------CAAAA-A--TC-AA-CACGAT-CTG-TA----GCGCAT---T---A---A------TG--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66674                      :                                                    AAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-CA----ACTCAT---T---A---T------TA--T-------AT-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66675                      :                                                     AA-C--TCAAA-TTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------GT-----AC----CTGC--A-CA-CA-AAA
gi|66676                      :                                                                -CTTGAT-CTG-TA----GCTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA


blockSeqs                     :                                   AA  TGGC AACCCC     A     A                CGTG      CCA TAA TAC TACATG     ACCCATA  ACCTG  TGGT       T  T
blockSeqs                     :                                   AG  .    A          A     C                .         .   .   AT  .          .        T      .          T  T
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   AT  .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   T   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     T                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   T   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   T   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   T   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   A   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   G   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   .   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .  .
blockSeqs                     :                                   .   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .          .   
blockSeqs                     :                                   .   .    .          .     G                .         .   .   .   .          .        .      .          .   
blockSeqs                     :                                   .   .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .      .              
blockSeqs                     :                                       .    .          .     A                .         .   .   .   .          .        .                     
blockSeqs                     :                                            .          .     A                .         .   .   .   .          .        .                     
blockSeqs                     :                                                       .     A                .         .   .   .   .                                         
blockSeqs                     :                                                       .     A                .         .   .   .                                             
blockSeqs                     :                                                       .     .                .         .   .   .                                             
blockSeqs                     :                                                                              .                                                               


blockSeqCons                  :                
originalCons                  :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
finalCons                     :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA





Alignments
lowQualScore                  :                    0    0   0   0 11  1111 222222     1 00  1  0      0   0  1111      111 111 333 111111  00 2222222  22222  1111    00 1  1  0    
lowQualScore                  :                    .    .   .   . ..  .... ......     . ..  .  .      .   .  ....      ... ... ... ......  .. .......  .....  ....    .. .  .  .    
lowQualScore                  :                    7    7   7   6 77  3333 444444     2 88  8  6      6   6  2222      000 000 333 888888  88 0000000  22222  4444    99 3  4  7    
consensus                     :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
Reference ( family-309 )      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66609                      :                AAAA-ATTA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTCGAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66610                      :               cAAAA-ATTA-ACG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CCA-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66611                      :               cAAAA-ATCA-ATG-AAT-G-AAA----A------CGAAA-C--TTCAA-CTTGAT-CTG-TA----TTTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66612                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-T-GAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-AA-CA-
gi|66613                      :               cAAAA-ATCA-AC---AC----------A------CGAAA-C--TGGAA-TTTGAC-CTG-TA----ACTCAT---T-------A------TT--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAA
gi|66614                      :               cAAAT-ATCA-ACA-AA-----------A------TGAAA-C--TCAGA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CCAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66615                      :                   c-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TTAAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TA-CC-AAAA
gi|66616                      :           cagatAAAA-ATCA-TCG-AAC-C-AGA----A------CGAAA-C--TTAAA-CTCGAT-CGG-TT----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AG----CAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66617                      :               cAAAT-ATCA-ACG-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--ACAAA--TTGAT-CTG-TA----ACTTAT---G---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66618                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-T-GGC----A------AGAAA-C--TCAAA-CTCGAT-ATG-TA----ACTCGT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA
gi|66619                      :               cAAAA-ATAA-ACA-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--TCAAG-TCTGAT-CTG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TATCA-AA
gi|66620                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-CAAAA----A------CAAAA-C--T-GGA-TTTGAT-CTG-TT----ACTCAT---A---A---A------TA--T-------AC-----GC----TAGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66621                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAG-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--C-------AC-----A
gi|66622                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TGAAA-CGCAAT-TTG-TA----ACTTAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CT-AAAA
gi|66623                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GTA----A------CAAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TC----AGTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGT--A-TA-AA-AA
gi|66624                      :               cAAAA-GTCC-ACA-AAC-C-GAA----A------AGAAA-C--ATAAA-CTACAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---ATACATGTA--T-------AT-----AC----CTAC--A-T
gi|66625                      :               cAAAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA-----------CGAAA-C--TCGAA--TTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------T---T-------AT-----AA----CTGC--A-CA-CA-CAAA
gi|66626                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-C-AAA----C------CGTAA-C--ACGAT-CTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----TT-C--A-TGTCA-AAA
gi|66627                      :               cAAAC-ATGA-ACG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCAGA-TTTGAT-CTG-TA----GCTCATCCAT---ATACA------TG--T-------AC-----AC----ATGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66628                      :               cAAAA-ATAA-ACA-AAC-C-GGA----AAACCCCCCCAA-C--TCAAA-CTCAAT-TTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-CA-CA-AAA
gi|66629                      :               cAAAA-ACCA-TCG-AAC-T-GAA----A------CGGAA-A--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCGT---T---A---G------TA--T-------AC-----AA----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66630                      :               cAGAA-TTCA-ACG-AAC-T-ATA----A------CGAAA-C--TTTAA-ATTGGT-CTG-TA----ACTCAT---T---G---T------TG--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66631                      :               cAAAA-TTCA-ACA-AAC-C-AAA----A------CAAAA-T--TTAAA-CTTGAT-AT--TA----ACTCAT---G---A---A------TA--T-------AC-----CC----ATGCAAA-TA-CA-AAAA
gi|66632                      :               cAAAA-ATCA-TCG-AAC-C-GGA----A------CAAAC-T--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----A
gi|66633                      :               cAAAT-ATCT-ACA-AACACAGGA----A------CAAAG-C--TCAAA-CTTTAT-CTG-TA----ACTCAG---C---A---A------TA--TACCCATAAC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66634                      :               cAAAA-ATCT-ACA-AGC----AA----G------CACAA-CATTCAAA-CTTAAT-ATG-TG----ACTCAA---A---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66635                      :                cAAA-ATCA-TCG-AAC-C-GGA----A------CGAAA-C--TCACA-CTCGAT-CTG-TACGTGACCCCT---T---A---C------TA--T-------AC-----AC----TAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66636                      :              cgAAAA-ATTA-ACG-AAC-C-AAA----G------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66637                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAT-C-AAA----A------TGAAA-C--TCAGA-CTTGAT-CTA-CA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66638                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TTGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAA---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66639                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-A-AAA----A------CGAAC-C--TCAAA-CTTGAT-ATG-TA----ACTTAA---T---A---A------TA--T-------AT-----AT----CTGT--A-TA-CA-AAAA
gi|66640                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66641                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAA----A------TGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG--A----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-ACAA
gi|66642                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-T-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AA-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66643                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-C-AAA----A------CAAAA-C--TCGAC-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-T
gi|66644                      :                AAAA-ATCA-ACA-ATC-C-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TT----ACTCTT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AA
gi|66645                      :                AAAA-AT-A-ACTCAAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---A------TA--T-------ACACCTGAC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66646                      :                AAAA-ATCA-ATG-AAC-T-GAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-TTG--A----ACTCAT---T---A---G------TA--T-------AC-----AT----CTAC--A-TA-CA-AAAA
gi|66647                      :                AAAA-ATCA-ACG-ACC-C-GAA----A------CGAAA-C--TCGA-------T-CTG-TA----ATTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66648                      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-T-TAA----A------CGAAA-C--TAGGA-CTTGAT-CTG-TA----ATTCGC---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TT-TA-AAAA
gi|66649                      :                AAAA-ATCACAC--AAC-C-GAT----A------CGAAA-T--TCGAA-CTTGAC-TTG-TA----ACTTAC---T---A---A------AA--T-------AC-----AC----CTGT--A-T--TA-AAAA
gi|66650                      :                AAAA-ATCA-ACG-AAC-T-GCATGGCA------CAATA-C--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-
gi|66651                      :                AAAC-ATAA-ATG-AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--TTGAA-TTTGAT-CAG-TA----ACTCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66652                      :                AAAA-ATAA-ACA-AAC-C-TAA----A------CCAAA-C--TCAAA-CTCGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--
gi|66653                      :                AAAA-ATCG-GCT-AAC-C-AAA----A------C--------TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---TTAAA---A------TATGT-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CC-AAAA
gi|66654                      :                AAAA-ATCA-ACA-GAC-C-AAA----A------CAAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66655                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-GAA----A------CAAAA-T--TCGAA-CTTGAT-CTG-TA----AGTCAT---T-------T------TA--A-------AC-----AA----CTGC--ATTC-CA-AAAA
gi|66656                      :                AAAA-ATCA-ACA-AAC-C-AAC----A------TGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTGCCA----ACTCA
gi|66657                      :                AAAATATCA-ATG-A-C-C-AAA----A------CGAAAAC--TCAAAATTTGATGCTG-TA----ACTCAT---T---AT--A------TA--T-------ACT----AC----CTGC--ATTA-CC-AAAA
gi|66658                      :                AAAA-ATCA-TTA-AAC-C-GGA----A------CAAAA-C--TAAAA-CTCAAT-CTG-AA----ACTCAT---C---A---A------TA--T-------AC-----A------TGT--A-CA-
gi|66659                      :                AAAA-ATCA-ACG-GAC-C-AAA----T------CGAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CAG-TA----ACTTGT---T---A---
gi|66660                      :                 AAA-ATCA-ACG-AAC-C-GAA----A------CGAAA-T--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---C---A---A------TA--C-------AT-----AC----CTCC--A-TA-CA-GAAA
gi|66661                      :                 AAA-ATCA-ATG-AAT-T-GGA----A------CAAAA-T--TCAAA-GTCGAT-CTG-TA----ACTTAT---T---A---G------TA--T-------AC-----GCTGGTCTGC--A-TA-TA-AAAA
gi|66662                      :                 AAA-ATCA-ACG-ATC-C-GAA----AA-----TGAAA-C--TTGAT-CTTGAT-CTC-GA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-GAAA
gi|66663                      :                 AAA-ATCA-TTG-AAG-T-TAA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-CA----AATCAT---T---G---A------TA--T-------AC-----AC----ATCC--A-TA-CA-AAAA
gi|66664                      :                                      A----A------CGGAA-C--TCGAT-CTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---G---AAT-A------TA--T-------AC-----AC----CAGC--A-TA-CA-AAA
gi|66665                      : aaaaccatcaaaagtcAAA-ATCA-ACA-AAG-C-AGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CT------------------CAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66666                      :                 AAA-ATCA-ATG-AAC-C--AG----A------CAAAAAC--ACAAA-CTCAAT-CTA-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----
gi|66667                      :                      TCA-ACG-AAC-C-AAA----G------CGAAA-C--TCGAA-TGTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AA----CTGC--A-TA-CATAAAA
gi|66668                      :                      TCA-ACA-AAC-C-GGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTCAAT-CTG-TG----ACTCAA---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CACT--A-TA-CA-AAAA
gi|66669                      :                             -AAC-C-AAA----A------CGAAA-C--ACGAA-TTTGAT-CTG-TA----ACTTAC---T---A---A------TA--T-------AT-----AC----CGGC--A-TA-TA-AAA
gi|66670                      :                                a-C-GAA----A------CGAAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----ACTCTT---T---GAT-A------TA--T-------AC-----AC----CTCG--A-TA-CA-AAAA
gi|66671                      :                            aagtC-C-GGA----A------CAAAA-C--TCAAA-CTCAAT-CTG-TA----ACTTAG---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-AA-AAAA
gi|66672                      :                                                      A-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-TA----A-TCAT---T---A---A------CA--T-------AC-----AC----CTTC--A-TG-CA-AA
gi|66673                      :                                   aaaatcaac------CAAAA-A--TC-AA-CACGAT-CTG-TA----GCGCAT---T---A---A------TG--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAAA
gi|66674                      :                                                    AAA-C--TCAAA-CTTGAT-CTG-CA----ACTCAT---T---A---T------TA--T-------AT-----AC----CTGC--A-TA-CA-AAA
gi|66675                      :                                                     AA-C--TCAAA-TTTGAT-CTG-TA----ACTCAT---T---A---A------TA--T-------GT-----AC----CTGC--A-CA-CA-AAA
gi|66676                      :                                                                -CTTGAT-CTG-TA----GCTCAT---T---A---A------TA--T-------AC-----AC----CTGC--A-TA-CA-AA