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lowQualScore                  :              11  22 0 4444444 11  4 0 0  1 0 222 0 1 1  00 0 0 0 222 0 22 0 1  11 1 22 11  00    555 0 1111 0 0  0  0 222 1  7777   3    
lowQualScore                  :              ..  .. . ....... ..  . . .  . . ... . . .  .. . . . ... . .. . .  .. . .. ..  ..    ... . .... . .  .  . ... .  ....   .    
lowQualScore                  :              44  00 6 8888888 33  9 5 5  4 5 000 5 0 4  66 9 5 9 333 5 66 5 8  55 4 55 66  66    555 9 0000 5 5  5  5 333 1  8888   3    
consensus                     :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACNAATA
Reference ( gi|35185 )        :          AGAA--TA--T-A-----C-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--A-AACGAATA
gi|35179                      :          AGAA--TA--T-A-----C-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--TCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-GACGAATA
gi|35177                      :          AGAA--TA--T-A-----T-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGtgtac
gi|35178                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---GCG-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACTAATAtatgtac
gi|35176                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-AGT-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACTAATAgtgtac
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gi|35194                      :          AGAA--TAATT-A-------A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-C-G---A-G--T-A-AA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGAATAttaaataatgta
gi|35195                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AG--T-G-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-G-A----C-G-AA-TC-C---A-TA--tgtac
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gi|35184                      :          AGAA--TA--T-A-----T-A--CT-T-T-GA-C-A-----G-G-AA--T-A-T-G-----G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-G-AA-TT-C---ATTA--T-AACTAATAtgtac
gi|35199                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T---GA-C-A---G-G-G-AA--TTA-T-G---AAG--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-T--C---A-TA--tgtac
gi|35196                      :          AGAA--T---T-A-------A--CT-TCT-GAAC-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-GA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TT--A-Ata
gi|35207                      :          AGAA--T---T-A-----A-A--CT-G-T-GA-C-A---G-G-G-----T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-G-AA-TT-C---A-TA--cta
gi|35206                      :          AGAA--T---T-A-----A-A--CT-G-T-GA-C-A---G-G-G-----T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-G-AA-TT-C---A-TA--tactaaca
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gi|35190                      :          AGAA--CA--T-G-----A-A--AT-T-T-GA-C-A---G-G-A-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-TA--T-AC-T--A---CCTG-C-C-A----A-G-AA-TA-C---A-CA--T-AACTAATA
gi|35205                      :          AGAA--TA--T-T-----T-A--AA-T-T-AA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-ctatac
gi|35201                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--
gi|35210                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-ACG-G-G-A-AA--T-A-T-GA--A-G--T-C-TA--TCA--T--A---CCTG---C-A----A-GAAA-TC-C---A-TA--
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gi|35203                      :          AGAA--TG--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--gtgt
gi|35211                      :          AGAA--TA--TGA-----T-A--CT-T-T-GA-C-AACAG-G-G-AA--A-G-C-G---A----T-T-CA--T-A--T---CTGCCTG-C-CCA----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGAATA
gi|35209                      :          AGAAGTCA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-------A--T-C-TA--T-A-----AC--CCTG-C-C-AGAAGG-G-AA-TC-C---ACTA--T-AACTAATAtgta
gi|35215                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CT-G-A-AA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G-----G--C-T-AA--T-AT-T--AC--CCTA-C-A-A----A-G-AA-TC-CG--A-TA--ATAACTAATAtatac
gi|35213                      :          AGAA--T---T-A-----A-A--CT-----GAAC-A---G-G-G-AA--T---T-GGA-A-G--T-C-CAA-T-A--T--AC--CCTG---C-A----A-G-AA-TC-C---A-CA--T-AA
gi|35214                      :          AGAA--TA--T-A-----A-A--CC-G-T-GA-C-A---G-------------------A-G--T-C-CA--G-A-----GC--CCTG-T-C-A----A-G-AT-TC-C---A-TA--T-AACTAATAtataatata
gi|35216                      :           GAAC-TA--T-A-----T-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-A-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGAACAatg
gi|35217                      :           GAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-G--T--AC--CCTG-C-C-A----A-C-AA-TC-C---G-Tagtac
gi|35218                      :           GAA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-CCA---G-GCG-GA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-AC-T--A---CCTG-T-G-A----A-G-AA-TC-A---A-TA--ATAACTAATAgt
gi|35220                      :           GAA--TA--A-T-----C-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-GAAA--T-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGAAatgta
gi|35219                      :           GAA--TA--A-T-----C-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-GAAA--T-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGAAatatgtac
gi|35222                      :            AA--TA--T-A-----T-AA-CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--C--AC--CCTG-T-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AAatatgtac
gi|35188                      :            AA--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GG-C-A---G-G-GTAA--T-G-T-G---A-C--T-C--A--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A---AG-TT-T---A-TA--tataaatcatatac
gi|35230                      :        agtaAG--TA--T-A-------A--CT-T---GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-GA-T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-CAC-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACTAATAaactaataatgta
gi|35223                      :          atAA--TAA-T-A-----T-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-A-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA----A--T--AA--CCCG-C-C-A----A-G-AA-TC-CAATA-TA--T-AACGAATA
gi|35225                      :            AA--TA--T-A-----A-A--CT-T---GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-CAA----A-G-AA-AT-C---A-TA--tgtac
gi|35226                      :            AA--TAA-T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--G-A-T-G---G-A--T-C-CA--T-AAGT--AC--CCTG-C-C-A----A-G--A-TC-C---A-TA--ATAACTAATAta
gi|35224                      :            AA--TA--T-A-----A-A--CT-T-TTGA-C-A---G-G-G-AA--T-A-TGG---A-G--G-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C------A-G-AA-TC-C---A--A--T-AACTAATAgatata
gi|35228                      :            AA--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GAAC-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--A---CTTG-C-C-A----A-G-A-----C---A-TA--A-atgta
gi|35221                      :            AA--TA--A-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--Ctaata
gi|35179                      :             A--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GG-C-A---G-A-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A-
gi|35177                      : agaatatacactA--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GG-C-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A-gacgaatatgtac
gi|35176                      : agaatatatactA--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GG-C-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CAC-T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A---AG-TT-T---A-TA--aacgatatgtac
gi|35216                      :         agaaA--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GT-T-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A-aactaataatgtac
gi|35181                      : gaactatatactA--TA--T-G-----A-A--TTCT-T-GG-C-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A-aacgaacaagtac
gi|35183                      : agaatataaaatA--TA--T-G-----G-A--TT-C-T-G--C-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A---AG-TT-T---A-TA--aactaatattg
gi|35222                      :         agaaA--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GA-C-A---G-G-G-TG--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T--TC--CCTG-T-C-A----A-aactaata
gi|35180                      :  aatatataactA--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GG-C-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---G-A--C-T-CA--T-A--T---T--CCTG-T-C-A----A---AG-TT-T---A-TA--aatataaatcatatac
gi|35229                      :         agaaA--TA--T-A-----T-A--CT-T-T-GA-C-A---C-G-G-AA--T---T-G---A-G--T-CGCA--T-A--TT-AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TATGA-AACGAATAaattaaataatgta
gi|35236                      :             A--TA--T-G-----G-A--TTCT-T-GG-C-A---G-G-G-TA--T-G-T-G---A-A--G-T-CA--T-A--T--TT--CCTG-T-C-A----A-tagtac
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gi|35234                      :            tA--TA--T-G-----G-A--CTCT-T-GG-C-A---G-G-G-TA--T-A-T-G---A-A-----------------------CTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AATTAATAcata
gi|35231                      :             t--TA--T-A-----A-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-G-AA--T-T-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-C-C-G----G-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACTAATAatacac
gi|35226                      :              --TA--T-G-----G-A--TC-T-T-GG-C-A---G-G-G-TACTT-A-T-G---G-A--T-C-CA--T-C--T--TC--CCTG-T-C-A----A-aagta
gi|35235                      :      aataataaactA--T-A-----T-A--CT-T-T-TT-C-A---G-G-G-AA--T-A-T-G---A-A--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-AACGAATAataactaatagatata
gi|35236                      :                     -A-----T-A--CT-T-T-GA-C-A---G-G-A-AA--T-A-T-G---A-C--T-T-CA--C-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-G-AA-TC-C---A-TA--T-GGCGAATtgtac
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gi|35227                      :                                                        A--T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CATG-C-C-A----A-T-AA-TC-C---A-TA--T-AACTAATAtacatgtaactaatagtgta
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lowQualScore                  :                ..  . .. ... .. ..  .  .  . . ... . .   . . . . ... . .. . .  .. . .. ..  ..    . . . .... .   .  . ... ...... . ...... ..   ..    
lowQualScore                  :                77  4 99 999 88 99  6  6  8 6 555 6 2   2 2 6 6 000 6 55 6 2  44 8 66 00  88    6 2 2 3333 6   6  6 555 000000 0 333333 11   77    
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Reference ( family-305 )      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--AAC-NAATA
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gi|35216                      :             GAAC-TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-A-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--AAC-GAACA
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gi|35218                      :             GAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-CCA---G-GCGGA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-AC-T--A---CCTG-T-G-A----A-GAA-TC-A---A------TAA------T--AAC-TAATA
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gi|35220                      :                 gaA-T--A---ATCA--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAAAT-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--AAC-GAAatatgtac
gi|35221                      :            gaAA--TA-A--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--Catatgtac
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gi|35223                      :              AA--TA-T--A---------CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA----A--T--AA--CCCG-C-C-A----A-GAA-TC-CAATA------T-A------T--AAC-GAATAtataaatcatatac
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gi|35225                      :              AA--TA-T--A---A--A--CT-T--GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-CAA----A-GAA-AT-C---A------T-A------T--Aatgta
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lowQualScore                  :                77  4 99 999 88 99  6  6  8 6 555 6 2   2 2 6 6 000 6 55 6 2  44 8 66 00  88    6 2 2 3333 6   6  6 555 000000 4 333333 11 6  88    
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Reference ( family-305 )      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
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gi|35229                      :               A--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---C-G-GAA-T---T-G---A-G--T-CGCA--T-A--TT-AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------TGAA-AC-GAATA
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Reference ( family-305 )      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35176                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-AGT-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35177                      :            AGAA--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-atgtac
gi|35178                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---GCG-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAgatatgtac
gi|35179                      :            AGAA--TA-T--A---C--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--TCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--G-AC-GAATAgtgtac
gi|35180                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G--AA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AT-TAAtgtac
gi|35181                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--AT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAataatgta
gi|35182                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-T-GAA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AT--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAttg
gi|35183                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C--------A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAttgta
gi|35184                      :            AGAA--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G--AA-T-A-T-G-----G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-GAA-TT-C---AT-----T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35185                      :            AGAA--TA-T--A---C--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------A--A-AC-GAATAtgtac
gi|35186                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TC-GA-C-A---G-T-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------
gi|35187                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-AAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-T
gi|35188                      :            AGTA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-CACA--T----T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-AT-----T--A-AC-TAATAtaatat
gi|35189                      :            AGAA--TA-T--A---C--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-GA-T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG-C-A-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAatgta
gi|35190                      :            AGAA--CA-T--G---A--A--AT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-TA--T-AC-T--AC--C-TG-C-C-A----A-GAA-TA-C---A------C-A------T--A-AC-TAATAtgtac
gi|35191                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-A---A-G--T-C-TA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----G-GAA-TC-C---T------T-A------T--A-AC-GAATActatac
gi|35192                      :            AGGA--TA-T--A---A--A--CT-TC-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-CCA---A-G--T-C-CA--T-A--A--GC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtgt
gi|35193                      :            AGAA--TA-T--A---A--AAGCT-TT-GA-C-A---G-GCGAA-T-A-T-G---A-GG-T-C-CA--TTA--T--AC--CATG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAatg
gi|35194                      :            AGAA--TAAT--T---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-C-G---A-G--T-A-AA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAatg
gi|35195                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAG-T-G-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-G-A----C-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-tgtac
gi|35196                      :            AGAA--T--T--A---A--C--TT-CT-GAAC-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-GA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T--------T--A-AC-T
gi|35197                      :            AGAA--TA-T--ATACATCA--CT-TT--A-C-AA--G-G-GAA-T-A-T-G---A-GGTT-C-CAATC-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------TA-A-AC-GAATA
gi|35198                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--AC-TT-GA-C-------G-GAA-TTA-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--TA-AC--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtgtac
gi|35199                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-T--GA-C-A---G-G-GAA-TTA-T-G---AAG--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-T--C---A------T-A------T--A-at
gi|35200                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G----AA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--A---CCTGTC-C-A----A-GAAGTC-CAG-A------T-A------T--A-AC-GAATA
gi|35201                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--tgtac
gi|35202                      :            AGAA--TA-T--A---AT-A--AT-AT-GA-C-A---G-G-GAA-T-G-T-G---A-T--T-C-CA--A-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AA-GAATA
gi|35203                      :            AGAA--TG-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--
gi|35204                      :            AGAA--TA-C--A---T--A--CA-TA-GA-C-A---T-G-GAA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GA---------A------T-A------T--T-AC-GAATA
gi|35205                      :            AGAA--TA-TTTA---A--A-----TT-AA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-tgtac
gi|35206                      :            AGAA--T--T--A---A--A--CT-GT-GA-C-A---G-G-G---T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T----AC-TAACA
gi|35207                      :            AGAA--T--T--A---A--A--CT-GT-GA-C-A---G-G-G---T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T----AC-TAACA
gi|35208                      :            AGAA--TA-G--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--C-A--T-----------------------AA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35209                      :            AGAAGTCA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-------A--T-C-TA--T-A-----AC--CCTG-C-C-AGAAGG-GAA-TC-C---AC-----T-A------T--A-AC-TAATAgtgt
gi|35210                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-ACG-G-G-AAA-T-A-T-GA--A-G--T-C-TA--TCA--T--A---CCTG-C-A-A----G-AAA-TC-C---A------T-A------T--ACAC--AATAtatac
gi|35211                      :            AGAA--TA-T--G---AT-A--CT-TT-GA-C-AACAG-G-GAA-A-G-C-G---A----T-T-CA--T-A--T---CTGCCTG-C-CCA----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAtgtac
gi|35212                      :            AGAA--GA-T--A---TT-A--CT-T--GA-C-A---G-G--AA-T-A-T-G---A-G--T-C-----T-A--T--AC--CCTG-CTC-A----A-AAT-TC-C---A------T-A------TA-A-AC-GAATAtgta
gi|35213                      :            AGAA--T--T--A---A--A--CT----GAAC-A---G-G-GAA-T---T-GGA-A-G--T-C-CAA-T-A--T--AC--CCTG-C---A----A-GAA-TC-C---A------C-A------T--A-ATATAATA
gi|35214                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CC-GT-GA-C-A---G-----------------A-G--T-C-CA--G-A-----GC--CCTG-T-C-A----A-GAT-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAta
gi|35215                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-GA-AA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G-----G--C-T-AA--T-AT-T--AC--CCTA-C-A-A----A-GAA-TC-CG--A------TAA------T--A-AC-TAATAatg
gi|35216                      :             GAAC-TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-A-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAACA
gi|35217                      :             GAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-G--T--AC--CCTG-C-C-A----A-CAA-TC-C---G------T-G------T--agtac
gi|35218                      :             GAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-CCA---G-GCGGA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-AC-T--A---CCTG-T-G-A----A-GAA-TC-A---A------TAA------T--A-AC-TAATA
gi|35219                      :                   A-T--A---ATCA--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAAAT-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAAatgta
gi|35220                      :                 gaA-T--A---ATCA--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAAAT-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAAatatgtac
gi|35221                      :            gaAA--TA-A--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--Catatgtac
gi|35222                      :              AA--TA-T--AT--A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--C--AC--CCTG-T-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-A
gi|35223                      :              AA--TA-T--A---------CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA----A--T--AA--CCCG-C-C-A----A-GAA-TC-CAATA------T-A------T--A-AC-GAATAtataaatcatatac
gi|35224                      :           aatAA--TA-T--A---A--A--CT-TTTGA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-GG--A-G--G-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C------A-GAA-TC-C---A--------A------T--A-AC-TAATAtgtac
gi|35225                      :              AA--TA-T--A---A--A--CT-T--GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-CAA----A-GAA-AT-C---A------T-A------T--A-atgta
gi|35226                      :              AA--TAAT--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-G-A-T-G---G-A--T-C-CA--T-AAGT--AC--CCTG-C-C-A----A-G-A-TC-C---A------TAA------T--A-AC-TAATA
gi|35227                      :                                                       A-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CATG-C-C-A----A-TAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAgatata
gi|35228                      : aacagatacgttgAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GAAC-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--A---CTTG-C-C-A----A-G----------A------C-A------T--A-A--TAATAatgt
gi|35229                      :               A--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---C-G-GAA-T---T-G---A-G--T-CGCA--T-A--TT-AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------TGAA-AC-GAATA
gi|35230                      :              AG--TA-T--A---A------C-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-GA-T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-CAC-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtagtac
gi|35231                      :              at--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-T-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-C-C-G----G-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35232                      :                                --CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--G-C--A--T-A--CTGAC--CCTG-C---A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAaagta
gi|35233                      :        tatatttA--TA-T--T---C--A--CT-TT-G--C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--TGC-CA--TGA--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------TCA------T--A-tgta
gi|35234                      :              tA--TA-T--G---G--A--CTCTT-GG-C-A---G-G-GTA-T-A-T-G---A-A-----------------------CTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AT-TAATA
gi|35235                      :                  tA-T--A---T--A--CT-TT-TT-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-A--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAatacac
gi|35236                      :                             --A--CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-C--T-T-CA--C-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--G-GC-GAATtgtac
gi|35237                      :                           at--A--CT-TT-GA-C-A---T-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-T-CA--T-A--T--AC--CTTA-C-C-A----A-AAA-TC-C---A------T-A------T--ttgtac
gi|35238                      :                                   T-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-TA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TA-C---A------C-A------T--A-AC-TAATA
gi|35239                      :                                    -TT-GA-C-A---G----AA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---ATACATGT-A------T--A-AC-TAATActatac
gi|35240                      :                                    -TT-GA-T-T---G-G-GAA-T-A-C-A---A-G--T-C-CA--T-T--T--CC--CACG-C-A-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T--A-AC-TAACAatat
gi|35241                      :                                          -C-G---G-A-AAA-T-A-T-GGGAA-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----ATGAA-TCGC---A------T-A------T--A-AC-GAATAatat
gi|35242                      :                                                    -GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-ATACATGT--A-AC-TAATAtgt
gi|35243                      :                                                              -G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----G-GAA-TC-A---A------T-A------T--A-AC-GAAgtgta
gi|35244                      :                                                                ---A-G--T-T-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAG-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAgttgtac
gi|35245                      :                                                                             A--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtgtac


blockSeqs                     :                GT  A    TAC TC           A   ACA   C   A T     GGA   GT   A  AT T AG TG          T C GAAG          AAT TACATG A TACATG GA    AT
blockSeqs                     :                C   A    T   TC           A   CG    C   A T     GA    A    G  A  C C  A           A A .             AG  T      A T      A     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   TC           A   A     .   . .     A     G    .  .  G T  T           . . .             G   C      A .      A     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   T            .   .     .   . .     G     A    .  .  . C  .           . . .             .   .      C .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   T            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   T            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                .   .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     G 
blockSeqs                     :                    .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     T 
blockSeqs                     :                    .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .     . 
blockSeqs                     :                    .    .   .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                             .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                             .            .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                                          .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                                          .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                                          .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                                          .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                                          .   .     .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .      .       
blockSeqs                     :                                                    .   . .     .     .    .  .  . .  .           . . .             .   .      . .              
blockSeqs                     :                                                        . .     .     .    .  .  . .  .                                                         
blockSeqs                     :                                                                .     .    .  .  . .  .                                                         
blockSeqs                     :                                                                .     .    .  .                                                                 
blockSeqs                     :                                                                              .                                                                 


blockSeqCons                  :            
originalCons                  :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
finalCons                     :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA





Alignments
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lowQualScore                  :                ..  . .. ... .. ..  .  .  . . ... . .   . . . . ... . .. . .  .. . .. ..  ..    . . . .... .   .  . ... ...... . ...... .. .  ..    
lowQualScore                  :                77  4 99 999 88 99  6  6  8 6 555 6 2   2 2 6 6 000 6 55 6 2  44 8 66 00  88    6 2 2 3333 6   6  6 555 000000 4 333333 11 6  88    
consensus                     :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
Reference ( family-305 )      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35176                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-AGT-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35177                      :            AGAA--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-atgtac
gi|35178                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---GCG-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAgatatgtac
gi|35179                      :            AGAA--TA-T--A---C--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--TCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--G-AC-GAATAgtgtac
gi|35180                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G--AA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AT-TAAtgtac
gi|35181                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--AT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAataatgta
gi|35182                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-T-GAA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AT--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAttg
gi|35183                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C--------A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAttgta
gi|35184                      :            AGAA--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G--AA-T-A-T-G-----G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-GAA-TT-C---AT-----T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35185                      :            AGAA--TA-T--A---C--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------A--A-AC-GAATAtgtac
gi|35186                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TC-GA-C-A---G-T-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------
gi|35187                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-AAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-T
gi|35188                      :            AGTA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-CACA--T----T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-AT-----T--A-AC-TAATAtaatat
gi|35189                      :            AGAA--TA-T--A---C--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-GA-T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG-C-A-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAatgta
gi|35190                      :            AGAA--CA-T--G---A--A--AT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-TA--T-AC-T--AC--C-TG-C-C-A----A-GAA-TA-C---A------C-A------T--A-AC-TAATAtgtac
gi|35191                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-A---A-G--T-C-TA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----G-GAA-TC-C---T------T-A------T--A-AC-GAATActatac
gi|35192                      :            AGGA--TA-T--A---A--A--CT-TC-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-CCA---A-G--T-C-CA--T-A--A--GC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtgt
gi|35193                      :            AGAA--TA-T--A---A--AAGCT-TT-GA-C-A---G-GCGAA-T-A-T-G---A-GG-T-C-CA--TTA--T--AC--CATG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAatg
gi|35194                      :            AGAA--TAAT--T---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-C-G---A-G--T-A-AA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAatg
gi|35195                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAG-T-G-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-G-A----C-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-tgtac
gi|35196                      :            AGAA--T--T--A---A--C--TT-CT-GAAC-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-GA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T--------T--A-AC-T
gi|35197                      :            AGAA--TA-T--ATACATCA--CT-TT--A-C-AA--G-G-GAA-T-A-T-G---A-GGTT-C-CAATC-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------TA-A-AC-GAATA
gi|35198                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--AC-TT-GA-C-------G-GAA-TTA-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--TA-AC--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtgtac
gi|35199                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-T--GA-C-A---G-G-GAA-TTA-T-G---AAG--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-T--C---A------T-A------T--A-at
gi|35200                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G----AA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--A---CCTGTC-C-A----A-GAAGTC-CAG-A------T-A------T--A-AC-GAATA
gi|35201                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--tgtac
gi|35202                      :            AGAA--TA-T--A---AT-A--AT-AT-GA-C-A---G-G-GAA-T-G-T-G---A-T--T-C-CA--A-A--T--AC--CCTG-T-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AA-GAATA
gi|35203                      :            AGAA--TG-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--
gi|35204                      :            AGAA--TA-C--A---T--A--CA-TA-GA-C-A---T-G-GAA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GA---------A------T-A------T--T-AC-GAATA
gi|35205                      :            AGAA--TA-TTTA---A--A-----TT-AA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-tgtac
gi|35206                      :            AGAA--T--T--A---A--A--CT-GT-GA-C-A---G-G-G---T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T----AC-TAACA
gi|35207                      :            AGAA--T--T--A---A--A--CT-GT-GA-C-A---G-G-G---T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CTTG---C-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T----AC-TAACA
gi|35208                      :            AGAA--TA-G--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--C-A--T-----------------------AA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35209                      :            AGAAGTCA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-------A--T-C-TA--T-A-----AC--CCTG-C-C-AGAAGG-GAA-TC-C---AC-----T-A------T--A-AC-TAATAgtgt
gi|35210                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-ACG-G-G-AAA-T-A-T-GA--A-G--T-C-TA--TCA--T--A---CCTG-C-A-A----G-AAA-TC-C---A------T-A------T--ACAC--AATAtatac
gi|35211                      :            AGAA--TA-T--G---AT-A--CT-TT-GA-C-AACAG-G-GAA-A-G-C-G---A----T-T-CA--T-A--T---CTGCCTG-C-CCA----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAtgtac
gi|35212                      :            AGAA--GA-T--A---TT-A--CT-T--GA-C-A---G-G--AA-T-A-T-G---A-G--T-C-----T-A--T--AC--CCTG-CTC-A----A-AAT-TC-C---A------T-A------TA-A-AC-GAATAtgta
gi|35213                      :            AGAA--T--T--A---A--A--CT----GAAC-A---G-G-GAA-T---T-GGA-A-G--T-C-CAA-T-A--T--AC--CCTG-C---A----A-GAA-TC-C---A------C-A------T--A-ATATAATA
gi|35214                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CC-GT-GA-C-A---G-----------------A-G--T-C-CA--G-A-----GC--CCTG-T-C-A----A-GAT-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAta
gi|35215                      :            AGAA--TA-T--A---A--A--CT-GA-AA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G-----G--C-T-AA--T-AT-T--AC--CCTA-C-A-A----A-GAA-TC-CG--A------TAA------T--A-AC-TAATAatg
gi|35216                      :             GAAC-TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-A-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAACA
gi|35217                      :             GAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-G--T--AC--CCTG-C-C-A----A-CAA-TC-C---G------T-G------T--agtac
gi|35218                      :             GAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-CCA---G-GCGGA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-AC-T--A---CCTG-T-G-A----A-GAA-TC-A---A------TAA------T--A-AC-TAATA
gi|35219                      :                   A-T--A---ATCA--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAAAT-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAAatgta
gi|35220                      :                 gaA-T--A---ATCA--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAAAT-A-T-G---A-G--T-C-------A--T--CA--CCT--C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAAatatgtac
gi|35221                      :            gaAA--TA-A--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--Catatgtac
gi|35222                      :              AA--TA-T--AT--A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--C--AC--CCTG-T-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-A
gi|35223                      :              AA--TA-T--A---------CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA----A--T--AA--CCCG-C-C-A----A-GAA-TC-CAATA------T-A------T--A-AC-GAATAtataaatcatatac
gi|35224                      :           aatAA--TA-T--A---A--A--CT-TTTGA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-GG--A-G--G-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C------A-GAA-TC-C---A--------A------T--A-AC-TAATAtgtac
gi|35225                      :              AA--TA-T--A---A--A--CT-T--GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-CAA----A-GAA-AT-C---A------T-A------T--A-atgta
gi|35226                      :              AA--TAAT--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-G-A-T-G---G-A--T-C-CA--T-AAGT--AC--CCTG-C-C-A----A-G-A-TC-C---A------TAA------T--A-AC-TAATA
gi|35227                      :                                                       A-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CATG-C-C-A----A-TAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAgatata
gi|35228                      : aacagatacgttgAA--TA-T--A---A--A--CT-TT-GAAC-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--A---CTTG-C-C-A----A-G----------A------C-A------T--A-A--TAATAatgt
gi|35229                      :               A--TA-T--A---T--A--CT-TT-GA-C-A---C-G-GAA-T---T-G---A-G--T-CGCA--T-A--TT-AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------TGAA-AC-GAATA
gi|35230                      :              AG--TA-T--A---A------C-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-GA-T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-CAC-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtagtac
gi|35231                      :              at--TA-T--A---A--A--CT-TT-GA-C-A---G-G-GAA-T-T-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTA-C-C-G----G-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATA
gi|35232                      :                                --CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--G-C--A--T-A--CTGAC--CCTG-C---A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAaagta
gi|35233                      :        tatatttA--TA-T--T---C--A--CT-TT-G--C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-G--TGC-CA--TGA--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------TCA------T--A-tgta
gi|35234                      :              tA--TA-T--G---G--A--CTCTT-GG-C-A---G-G-GTA-T-A-T-G---A-A-----------------------CTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AT-TAATA
gi|35235                      :                  tA-T--A---T--A--CT-TT-TT-C-A---G-G-GAA-T-A-T-G---A-A--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAatacac
gi|35236                      :                             --A--CT-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-C--T-T-CA--C-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--G-GC-GAATtgtac
gi|35237                      :                           at--A--CT-TT-GA-C-A---T-G-GAA-T-A-T-G---A-G--T-T-CA--T-A--T--AC--CTTA-C-C-A----A-AAA-TC-C---A------T-A------T--ttgtac
gi|35238                      :                                   T-TT-GA-C-A---G-G-AAA-T-A-T-G---A-G--T-C-TA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TA-C---A------C-A------T--A-AC-TAATA
gi|35239                      :                                    -TT-GA-C-A---G----AA-T-A-C-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---ATACATGT-A------T--A-AC-TAATActatac
gi|35240                      :                                    -TT-GA-T-T---G-G-GAA-T-A-C-A---A-G--T-C-CA--T-T--T--CC--CACG-C-A-A----A-GAA-TT-C---A------T-A------T--A-AC-TAACAatat
gi|35241                      :                                          -C-G---G-A-AAA-T-A-T-GGGAA-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----ATGAA-TCGC---A------T-A------T--A-AC-GAATAatat
gi|35242                      :                                                    -GAA-T-A-T-G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-ATACATGT--A-AC-TAATAtgt
gi|35243                      :                                                              -G---A-G--T-C-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----G-GAA-TC-A---A------T-A------T--A-AC-GAAgtgta
gi|35244                      :                                                                ---A-G--T-T-CA--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAG-TC-C---A------T-A------T--A-AC-GAATAgttgtac
gi|35245                      :                                                                             A--T-A--T--AC--CCTG-C-C-A----A-GAA-TC-C---A------T-A------T--A-AC-TAATAtgtac