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lowQualScore                  :       4  8   4 4 0000  00 11 4 4   4 4 33 1 111  11 0 55 888 222 4 222  4 6666 4 66  2 999   6 2  2222 2  666 6 22 6  2 88 222        
consensus                     :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
Reference ( gi|9817 )         :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CT--CATCTGTA
gi|9813                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9811                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9822                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT--G-T--CA--CATCTGTA
gi|9823                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T---A-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9826                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATC
gi|9828                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AGC-T-G--CCT---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
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gi|9809                       :  ACTTA-GA-GTA-G-T----CA--T-TA-G-AAA-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-G-GT-GA-T--CG--CATCTGTA
gi|9814                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-GC-C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GCAT----T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-AG---A-A-CT-GGTT--CG--CATCTGTA
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gi|9833                       :  ACTTA-GA-GCA-G-A----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---G---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-AG---A-G-AT-TG-T--CG--CATCTG
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gi|9843                       :  ATTTA-GA-ACA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GC-T----T-T---------AGA-G-G-----------------T-GG-T--CT--CATCTGTA
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gi|9824                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9812                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9841                       :  ACTTA-GA---A-G------CA--T-AG-A-AAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-C---AT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-GG---A-AGGT-GG-T--CT--CATCTGTA
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gi|9825                       :  ACTTA-GAAGCA-GCT----TA--CATA-G-AA--T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-TTTAA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--
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gi|9827                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-T---CT--C-C--A---------T---GC-TGG--T-T--GG-GCG-AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9858                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-C-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T----GA-GCA-AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTG
gi|9835                       :  ACTTA-GA-GCG-G-T----CA--T-AA-G-AAC-T-A--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----A-T--CA-G---AGA-G-AT----T-GG---T-G-GT-GG-A--CG--CAGCTGTA
gi|9859                       :  ACTTA-GT-TAA-G-T----TA--T-CA-T-GAC-T-G--C-TTT-CT--A-T--G---A---C-T---GT-T----T-G--AG-GG--AGA-G-GT----C-AG---A-A-CT-GG-T--CA--CATCTGTA
gi|9838                       :  ACTTG-GA-GCA-G-TTCTGCA--T------GAC-T-G--C-T---TTG-A-T--G---A---C-T---GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9860                       :  ACTTG-GA-GCA-G-T----TT--T-CA-T-GAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATTTGTA
gi|9872                       :  ACTTA------A-G-T----TAACT-TA-G-AAC-A-G--C-T---CT--G-CT-G---A---C-T---GC-T----C-T--A
gi|9849                       :  ACTTA-AA--CA-G-TT---CA--T-CT-G-A-C-T-G--C-T---CTC-A-C--G---A---C-T---GG-T----T-T--AGCA---AGA-G-GT----T-AG---A-G-GT-GG-T--CG--CATCTGTAttaagagaggttagaggtggtcgcctctgta
gi|9845                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-TC--CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-T--GG-GCGAGGA-G-GT----TAAG---A-A-AT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9853                       :  ACTTA-AA-ACA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-TTTTCC--A-C--G---A---C-T---GG-T----TGT--GC-A---AGA-G-GT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9854                       :  ACTTA-GA-ACA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-TGT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GG-G---AAAAG-GT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9834                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TT--T-CA-T-GAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GC----T-AG---A-A-GT-GA-T--CG--CATCTGTA
gi|9850                       :  ACTTA-AA--CA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-T---CTCCA-C--G---A---C-T---GG-T----T----AG-GCA-AGA-G-GT----T-AG---A-G-GT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9856                       :  ACGTA-GA-GCA-G-T----TA--T-CA-T-GAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---A-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCTATA
gi|9857                       :  ACTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-GATT-T---CC--A-T--G---A---C-TT--GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-AT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9831                       :  ACTTA-GA-GCA-G-TTTCTCA--T------GAC-T-G--C-T---TTTTA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-GA-GA-T--CG--CATCTGTA
gi|9821                       :  ACTTA-GA-ACT-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T-G--GACA---AAA-G-GT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCT
gi|9855                       :  ATTTA-GA--CG-T-T----CA--T-TA-G-A-C-T-GG-C-T---AA--A-C--G---T---C-C---G--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-GG---G----T-GG-T--CG--CATC
gi|9813                       :   CTTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---
gi|9811                       :  aCTTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9822                       :  aCTTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9826                       :  aCTTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagaactgtcacatctgta
gi|9828                       :  aCTTA-AA-GCA-G-T----CG--T-AA-A-GGC-A-G--C-T---CTA-A-T--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagaactggtcgcatc
gi|9829                       :  aCTTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--C-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9862                       :  aCTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-TTTAAT-T--AA-G---AGA-G-GT----TAAG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTAaaagaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9861                       :   CTCA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-A--G---A---T-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-G-AT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9861                       :   CTTA-AA-GCA-A-T----C---T-TA-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--GA-G---
gi|9814                       :   CTTA-AATGCA-G-T----CG--T-AA-A-GGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagagatggtcgcatctgta
gi|9863                       :  aCTTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---TT--A----G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GTTGAAT-AG---A-A-CT-GG-T--TTCGCATCTGTAagagcgttagaactggttcgcatctgta
gi|9863                       :   CTTA-AA-GCA-G-T----C-----TA-A-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---
gi|9815                       :   CTTA-CA-GCG-G-T----CG--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttgaatagaactggtttcgcatctgta
gi|9865                       :  aCTTA-AA-ACG-G-T----CG--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-agatgttagaggtggtcgcatatgta
gi|9840                       :   CTTA--A-GCA-G-T----CG--T-AA-A-AGC-A-G--T-T---TA--A-T--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagaggtggtcgtatctgta
gi|9869                       :  aCTTA-AA-GTC-G-T----CA--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--Aagagcttagcaactggtcgcatctgta
gi|9839                       :   CTTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---agaggttagatgtggtcgcatatgta
gi|9832                       :  aCTTA-AA-GCG-G-T----CG--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-C--AA-G---agaggt
gi|9864                       :  aCTTA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--T-TTT-CC--A-T--G---A---T-T---GA-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCTGTAagaggttaaaggaggtagcat
gi|9862                       :    TTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-G-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---
gi|9865                       :    TTA-AA-GCG-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-G-GT-GG-T--CG--TATCTGTAttaagagaggttaagaactggtcgcatctgta
gi|9871                       :    TTA--A-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--T-T---CT--A-T--G---A---C-T---GC-T----C-T--A
gi|9870                       :    TTA--A-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--T-T---CT--A-T--G---A---C-T---GC-T----C-T--Atagaggttagaactggttgcatctgta
gi|9866                       :    TTA-GA-GCA-G-T----CA--T-TAAG-AGC-T-G--C-T----T--A-C--G---AA--C-T---GC-T----T-----A-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-TTACG--CATCTGTAtagaggttagaactggttgcatctgta
gi|9867                       :    TTA-GA-GCA---T----CA--T-TA-G-AAC-TTG--TAT---TT--A-T--G---A---C-T---GC-T----T----AA-G---AGA-G-GT----T-AGTAAA-A-CG-TG-A--CC--CATCTGTA
gi|9838                       :    TCA-AA-GCA-G-T----CA--TGCA-G-AAC-T-G--C-T---CC--A-
gi|9823                       :  actTA-AA-GCA-G-T----CG--T--A-A-AGC-A-G--T-T---CT--AAT--G---A---C-T---GC-T----C-T--AA-G---tgactgttgggcgagaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9871                       :    aTA-GA-GCA-G-T----CA--T--A-G-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--TG--CATCTGTAgagaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9870                       :     TA-GA-GCA-G-T----CA--T--A-G-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--TG--CATCTGTA
gi|9869                       :     TA-GA-GCA-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-G---AC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-T-GT-GG-T--CG--CATATGTA
gi|9872                       :     TA-GA-GCA-G-T----CA--G-CA-G-AGC-T-G--T-T---CT--A-A--GTTAA---C-TTAAG--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-G-GT-GG-T--CG--CCTCTGTA
gi|9868                       :     TA-GA-GCA-G-T----TC--T-CA-T-GAC-T-G--C-T---TTTCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-AG---A-A-GT-GG-T--CG--CATCTGTA
gi|9873                       :     TA-GA-GCA-G-T----CA--G-TA-G-AAC-T-G--T-T---CT--A-A--G---------------------T-T--AA-C----------T----T-AG---A-G-CT-GG-T--TG--CATCTGTA
gi|9824                       :      A-GA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-
gi|9812                       :   actA-GA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-ccatgactggttgggcgagaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9830                       :   actA-GA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-ccatgactggttgggcgagaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9827                       :   actA-GA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-ccctgactggttgggcgagaggttagaactggtcgcatctg
gi|9858                       :   actA-AA-GCG-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-ccatgctggttgggcgagaggttagaactggtcgcatctgta
gi|9860                       :   actA-AA-GCA-G-T----CA--T-GA-A-AAC-T-G--C-T---CC--A-ccacgactggttgagcaagaggttagaactggtcgcatctg
gi|9853                       :   actA-AA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--T-T---TT--A-ccatgactggttgggcgagaggttagaactggtcgcatttgta
gi|9868                       :   actA-AA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-tccacgactggttgtgcaagaggttagaagtggtcgcatctgta
gi|9834                       :      A-AA-GCA-G-T----CA--T-GA-A-AAC-T-G--C-T---CT--A-tcatgactggttgggcgagaggttagaagtggtcgcatctgta
gi|9850                       :   actA-GA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--T-T---ccatgactggttgggcgagaggctagaagtgatcgcatctgta
gi|9864                       : acttaA-AA-ACA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-ccacgactggttaggcaagaggttagaggtggtcgcatctgta
gi|9856                       :    ctA-AA-GCA-G-T----CA--T-GA-T-AAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---ccatgattgattgggcgagaggttagaagtggtcgcatctgta
gi|9831                       :     aA-AA-GCA-G-T----CA--T-GA-GAAAC-T-G--C-T---CT--A-ccatgaatggttgggcgagaggttagaagtggtcgcatctata
gi|9874                       :    act-GA-ACA-G-T----CA--T-TA-A-AAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--CG--CATCTGTAttatgactggttgggcgagaggttagaagagatcgcatctgta
gi|9845                       :       -GA-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-
gi|9875                       :      actA-ACG-G-T----CA--T-TA-G-AAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--GA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-G-AT-GG-T--CG--CATATGTAccatgactggtttgggcgaggaggttaagaaatggtcgcatctgta
gi|9854                       :         A-GCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--T-T---CT--A-
gi|9857                       :         actCA-G-T----CA--T-GA-G-AAC-T-G--C-T---CT--A-gtccatgactggttggggaaaaggttagaagtggtcgcatctgta
gi|9873                       :          actA-G-T----TAACT-TA-G-AAC-A-G--T-T---CT--A-CT-G---A---C-T---GC-T----C-T--Aatttccatgacttgttgggcgagagattagaagtggtcgcatctgta
gi|9876                       :                        --T-TG-G-GAC-T-G--G-T---GT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-AG---A-A-CT-GG-T--TG--CATCTGTAtagagctggttgcatctgta
gi|9877                       :                        --T-TA-G-AAT-C-G--C-T---CG--G-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GC----T-AG---A-





Alignments
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lowQualScore                  :      .  .   . . ....   .  .    . . .. . ...  .. . .. ... ... . ... .. .... ....  . ...   . .  .... . . ... . ... . . .. ..          
lowQualScore                  :      6  6   6 6 1111   6  6    6 6 99 7 333  22 6 88 000 666 6 666 99 0000 7777  3 777   6 1  2222 6 6 666 6 999 6 6 00 00          
consensus                     : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
Reference ( family-303 )      : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9808                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-TA-GTAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9809                       : ACTTA-GA-GTA-G-T----CAT-TA-GAAA-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-A--T--CGCATCTGTA
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gi|9814                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-GC-C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GCAT----T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-A-G---A-A-C-T-G-GT-T--CGCATCTGTA
gi|9815                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----G-T--AA-G---AGA-T-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9816                       : ACTTA-GA-GCG-A-T----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---A---A-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-A--T--CACATTTGTA
gi|9817                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9818                       : ACTTG-GA-GCG-G-C----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-T--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CACATCAGTA
gi|9819                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-AT-GAAC-T-G--C-T---GT--A-C--G---A---C-C---GT-T----C-T--AA-G---AGA-A-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGTATCTGTA
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gi|9821                       : ACTTA-GA-ACT-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T-G--GACA---AAA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCT
gi|9822                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T---G--T--CACATCTGTA
gi|9823                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T---A-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9824                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9825                       : ACTTA-GAAGCA-GCT----TACATA-GAA--T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-TTTAA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TA-CGCAT
gi|9826                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATC
gi|9827                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CT--C-C--A---------T---GC-TGG--T-T--GG-GCG-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9828                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--CCT---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9829                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-GAA-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9830                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CT--C-CCTG---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTG
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gi|9832                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-A---A-G-G-A-G-G--T--AGCAT
gi|9833                       : ACTTA-GA-GCA-G-A----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---G---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-A-G---A-G-A-T-T-G--T--CGCATCTG
gi|9834                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TTT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GC----T-A-G---A-A-G-T-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9835                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-AA-GAAC-T-A--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----A-T--CA-G---AGA-G-AT----T-G-G---T-G-G-T-G-G--A--CGCAGCTGTA
gi|9836                       : ACTTA-GA-GCAAG-T----CAT-TA-GAACAT-G--C-C---TTC-A-C--G---A---C-T---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TC-CGCATCTGTA
gi|9837                       : ACTTA-GA-ACA-G-T----CAG-CA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---G-C---GT-T----T-T--AA-G---CGA-T-GT----T-A-G---A-A-A-T-A-G--T--CGCATCTTTA
gi|9838                       : ACTTG-GA-GCA-G-TTCTGCAT-----GAC-T-G--C-T---TTG-A-T--G---A---C-T---GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9839                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----
gi|9840                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA--AAC-T-G--CTT---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-G-CT----T-A-GC--A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9841                       : ACTTA-GA---A-G------CAT-AG-AAAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-C---AT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-G-G---A-AGG-T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9842                       : ACTTAAGA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--C-T---TT----C--G---A---CTT---GC-T----T-A--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T---G--T--CGCATCTGTA
gi|9843                       : ATTTA-GA-ACA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GC-T----T-T---------AGA-G-G-------------------T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9844                       : ACTTA-GA--CA-G-T----CAG-CA-GAAC-T-G--C-T---TT--AAC--G---GGACC-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATC-GTA
gi|9845                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CCC-A-T--G---A---C-T---GG-T----T-T--GG-GCGAGGA-G-GT----T-AAG---A-A-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9846                       : ACTTA-GA-TCA-G-T----CAT-TA-GA-C-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-G-G-----T-A-G---A-A-C-TGG-G--T--CGCATATGTA
gi|9847                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--------------------------------C-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9848                       : ACTTG-GA-GTA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-A--C-A---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-
gi|9849                       : ACTTA-AA--CA-G-TT---CAT-CT-GA-C-T-G--C-T---CTC-A-C--G---A---C-T---GG-T----T-T--AGCA---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9850                       : ACTTA-AA--CA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-C--G---A---C-T---GG-T----T----AG-GCA-AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9851                       : ACTT--GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGA-C-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-A-G---A-A-C-T-G-GA-T--CGCATCTG
gi|9852                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----C-T-TA-GAA--T-G--C-T-----------------------------T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--C--CGCATCTGTA
gi|9853                       : ACTTA-AA-ACA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TTTTCC--A-C--G---A---C-T---GG-T----TGT--GC-A---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9854                       : ACTTA-GA-ACA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TGT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GG-G---AAAAG-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9855                       : ATTTA-GA--CG-T-T----CAT-TA-GA-C-T-GG-C-T---AA--A-C--G---T---C-C---G--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-G-G---G-----T-G-G--T--CGCATC
gi|9856                       : ACGTA-GA-GCA-G-T----TAT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---A-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTATA
gi|9857                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-GATT-T---CC--A-T--G---A---C-TT--GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-AT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9858                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-C-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T----GA-GCA-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTG
gi|9859                       : ACTTA-GT-TAA-G-T----TAT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CT--A-T--G---A---C-T---GT-T----T-G--AG-GG--AGA-G-GT----C-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CACATCTGTA
gi|9860                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----TTT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATTTGTA
gi|9861                       :  CTCA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-A--G---A---T-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9862                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-TTTAAT-T--AA-G---AGA-G-GT----TAA-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9863                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A----G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GTTGAAT-A-G---A-A-C-T-G-GTTT--CGCATCTGTA
gi|9864                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--T-TTT-CC--A-T--G---A---T-T---GA-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9865                       :   TTA-AA-GCG-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGTATCTGTA
gi|9866                       :   TTA-GA-GCA-G-T----CAT-TAAGAGC-T-G--C-T----T--A-C--G---AA--C-T---GC-T----T-----A-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TTACGCATCTGTA
gi|9867                       :   TTA-GA-GCA---T----CAT-TA-GAAC-TTG--TAT---TT--A-T--G---A---C-T---GC-T----T----AA-G---AGA-G-GT----T-A-GTAAA-A-CGT-G-A--C--C-CATCTGTA
gi|9868                       :    TA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---TTTCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9869                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-G---AC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-T-G-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9870                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT--A-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9871                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT--A-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9872                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAG-CA-GAGC-T-G--T-T---CT--A-A--GTTAA---C-TTAAG--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCCTCTGTA
gi|9873                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAG-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-A--G---------------------T-T--AA-C----------T----T-A-G---A-G-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9874                       :      -GA-ACA-G-T----CAT-TA-AAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9875                       :        A-ACG-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--GA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-A-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9876                       :                       T-TG-GGAC-T-G--G-T---GT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9877                       :                       T-TA-GAAT-C-G--C-T---CG--G-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GC----T-A-G---A-----T-GTG--T--CG





Alignments
lowQualScore                  :      0  0   0 0 3333   0  0    0 0 11 1 777  66 0 00 111 111 0 111 11 2222 1111  6 444   0 1  1111 0 0 111 0 222 0 0 22 22          
lowQualScore                  :      .  .   . . ....   .  .    . . .. . ...  .. . .. ... ... . ... .. .... ....  . ...   . .  .... . . ... . ... . . .. ..          
lowQualScore                  :      6  6   6 6 1111   6  6    6 6 99 7 333  22 6 88 000 666 6 666 99 0000 7777  3 777   6 1  2222 6 6 666 6 999 6 6 00 00          
consensus                     : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
Reference ( family-303 )      : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9808                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-TA-GTAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9809                       : ACTTA-GA-GTA-G-T----CAT-TA-GAAA-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9810                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-TA-GCAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---AT-T----C-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9811                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9812                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9813                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9814                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-GC-C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GCAT----T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-A-G---A-A-C-T-G-GT-T--CGCATCTGTA
gi|9815                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----G-T--AA-G---AGA-T-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9816                       : ACTTA-GA-GCG-A-T----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---A---A-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-A--T--CACATTTGTA
gi|9817                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9818                       : ACTTG-GA-GCG-G-C----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-T--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CACATCAGTA
gi|9819                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-AT-GAAC-T-G--C-T---GT--A-C--G---A---C-C---GT-T----C-T--AA-G---AGA-A-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGTATCTGTA
gi|9820                       : ACTTA-GT-ACG-A-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---ATA-G-GT----T-A-G---AGG-C-T---G--T--CGCATCTGTA
gi|9821                       : ACTTA-GA-ACT-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T-G--GACA---AAA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCT
gi|9822                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T---G--T--CACATCTGTA
gi|9823                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T---A-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9824                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9825                       : ACTTA-GAAGCA-GCT----TACATA-GAA--T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-TTTAA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TA-CGCAT
gi|9826                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATC
gi|9827                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CT--C-C--A---------T---GC-TGG--T-T--GG-GCG-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9828                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--CCT---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9829                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-GAA-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9830                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CT--C-CCTG---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTG
gi|9831                       : ACTTA-GA-GCA-G-TTTCTCAT-----GAC-T-G--C-T---TTTTA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-A-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9832                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-A---A-G-G-A-G-G--T--AGCAT
gi|9833                       : ACTTA-GA-GCA-G-A----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---G---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-A-G---A-G-A-T-T-G--T--CGCATCTG
gi|9834                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TTT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GC----T-A-G---A-A-G-T-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9835                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-AA-GAAC-T-A--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----A-T--CA-G---AGA-G-AT----T-G-G---T-G-G-T-G-G--A--CGCAGCTGTA
gi|9836                       : ACTTA-GA-GCAAG-T----CAT-TA-GAACAT-G--C-C---TTC-A-C--G---A---C-T---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TC-CGCATCTGTA
gi|9837                       : ACTTA-GA-ACA-G-T----CAG-CA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---G-C---GT-T----T-T--AA-G---CGA-T-GT----T-A-G---A-A-A-T-A-G--T--CGCATCTTTA
gi|9838                       : ACTTG-GA-GCA-G-TTCTGCAT-----GAC-T-G--C-T---TTG-A-T--G---A---C-T---GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9839                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----
gi|9840                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA--AAC-T-G--CTT---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-G-CT----T-A-GC--A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9841                       : ACTTA-GA---A-G------CAT-AG-AAAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-C---AT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-G-G---A-AGG-T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9842                       : ACTTAAGA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--C-T---TT----C--G---A---CTT---GC-T----T-A--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T---G--T--CGCATCTGTA
gi|9843                       : ATTTA-GA-ACA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GC-T----T-T---------AGA-G-G-------------------T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9844                       : ACTTA-GA--CA-G-T----CAG-CA-GAAC-T-G--C-T---TT--AAC--G---GGACC-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATC-GTA
gi|9845                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CCC-A-T--G---A---C-T---GG-T----T-T--GG-GCGAGGA-G-GT----T-AAG---A-A-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9846                       : ACTTA-GA-TCA-G-T----CAT-TA-GA-C-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-G-G-----T-A-G---A-A-C-TGG-G--T--CGCATATGTA
gi|9847                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--------------------------------C-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9848                       : ACTTG-GA-GTA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-A--C-A---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-
gi|9849                       : ACTTA-AA--CA-G-TT---CAT-CT-GA-C-T-G--C-T---CTC-A-C--G---A---C-T---GG-T----T-T--AGCA---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9850                       : ACTTA-AA--CA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-C--G---A---C-T---GG-T----T----AG-GCA-AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9851                       : ACTT--GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGA-C-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-A-G---A-A-C-T-G-GA-T--CGCATCTG
gi|9852                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----C-T-TA-GAA--T-G--C-T-----------------------------T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--C--CGCATCTGTA
gi|9853                       : ACTTA-AA-ACA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TTTTCC--A-C--G---A---C-T---GG-T----TGT--GC-A---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9854                       : ACTTA-GA-ACA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TGT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GG-G---AAAAG-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9855                       : ATTTA-GA--CG-T-T----CAT-TA-GA-C-T-GG-C-T---AA--A-C--G---T---C-C---G--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-G-G---G-----T-G-G--T--CGCATC
gi|9856                       : ACGTA-GA-GCA-G-T----TAT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---A-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTATA
gi|9857                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-GATT-T---CC--A-T--G---A---C-TT--GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-AT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9858                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-C-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T----GA-GCA-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTG
gi|9859                       : ACTTA-GT-TAA-G-T----TAT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CT--A-T--G---A---C-T---GT-T----T-G--AG-GG--AGA-G-GT----C-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CACATCTGTA
gi|9860                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----TTT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATTTGTA
gi|9861                       :  CTCA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-A--G---A---T-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9862                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-TTTAAT-T--AA-G---AGA-G-GT----TAA-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9863                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A----G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GTTGAAT-A-G---A-A-C-T-G-GTTT--CGCATCTGTA
gi|9864                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--T-TTT-CC--A-T--G---A---T-T---GA-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9865                       :   TTA-AA-GCG-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGTATCTGTA
gi|9866                       :   TTA-GA-GCA-G-T----CAT-TAAGAGC-T-G--C-T----T--A-C--G---AA--C-T---GC-T----T-----A-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TTACGCATCTGTA
gi|9867                       :   TTA-GA-GCA---T----CAT-TA-GAAC-TTG--TAT---TT--A-T--G---A---C-T---GC-T----T----AA-G---AGA-G-GT----T-A-GTAAA-A-CGT-G-A--C--C-CATCTGTA
gi|9868                       :    TA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---TTTCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9869                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-G---AC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-T-G-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9870                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT--A-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9871                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT--A-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9872                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAG-CA-GAGC-T-G--T-T---CT--A-A--GTTAA---C-TTAAG--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCCTCTGTA
gi|9873                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAG-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-A--G---------------------T-T--AA-C----------T----T-A-G---A-G-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9874                       :      -GA-ACA-G-T----CAT-TA-AAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9875                       :        A-ACG-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--GA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-A-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9876                       :                       T-TG-GGAC-T-G--G-T---GT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9877                       :                       T-TA-GAAT-C-G--C-T---CG--G-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GC----T-A-G---A-----T-GTG--T--CG


blockSeqs                     :                 TTCT               AT C TTT  CC      TTA GAC   TAA CA TTAA TTT   C CGA     C  TGAA     TAA   GG      TT TA
blockSeqs                     :                 TCTG               C  T TT   CC      .   A     T   C  GG   GT    C CG      C  .        C     CG      T  A 
blockSeqs                     :                 T                  G  A TT   TT      .   .     .   T  .    T     C AA      .  .        .     G       A  C 
blockSeqs                     :                 .                  .  . GT   CC      .   .     .   C  .    T     C CA      .  .        .     A       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . TT   TC      .   .     .   G  .    T     C CA      .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . TT   C       .   .     .   C  .    G     C G       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . TT   G       .   .     .   C  .    T     C .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . TT   C       .   .     .   T  .    T     C .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . TT   C       .   .     .   C  .    T     C .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     C .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     C .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    G     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    G     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    G     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    G     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    G     . .       .  .        .     A       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    G     . .       .  .        .     A       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    A     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     A       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    G     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    G     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    G     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    G     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    G     . .       .  .        .     A       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   A  .    G     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    G     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   G  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     G       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    T     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    T     . .       .  .        .     A       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   C  .    .     . .       .  .        .     C       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   T  .    .     . .       .  .        .     .       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   .  .    .     . .       .  .        .     .       .  . 
blockSeqs                     :                 .                  .  . .    .       .   .     .   .  .    .     . .       .  .        .     .       .  . 
blockSeqs                     :                                    .  . .    .       .   .     .   .  .    .     . .       .  .        .                  
blockSeqs                     :                                    .  . .    .       .   .     .   .  .    .     . .       .  .                           


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
finalCons                     : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA





Alignments
lowQualScore                  :      0  0   0 0 3333   0  0    0 0 11 1 777  66 0 00 111 111 0 111 11 2222 1111  6 444   0 1  1111 0 0 111 0 222 0 0 22 22          
lowQualScore                  :      .  .   . . ....   .  .    . . .. . ...  .. . .. ... ... . ... .. .... ....  . ...   . .  .... . . ... . ... . . .. ..          
lowQualScore                  :      6  6   6 6 1111   6  6    6 6 99 7 333  22 6 88 000 666 6 666 99 0000 7777  3 777   6 1  2222 6 6 666 6 999 6 6 00 00          
consensus                     : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
Reference ( family-303 )      : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9808                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-TA-GTAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9809                       : ACTTA-GA-GTA-G-T----CAT-TA-GAAA-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9810                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-TA-GCAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---AT-T----C-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9811                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9812                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9813                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9814                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-GC-C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GCAT----T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-A-G---A-A-C-T-G-GT-T--CGCATCTGTA
gi|9815                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----G-T--AA-G---AGA-T-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9816                       : ACTTA-GA-GCG-A-T----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---A---A-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-A--T--CACATTTGTA
gi|9817                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9818                       : ACTTG-GA-GCG-G-C----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-T--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CACATCAGTA
gi|9819                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-AT-GAAC-T-G--C-T---GT--A-C--G---A---C-C---GT-T----C-T--AA-G---AGA-A-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGTATCTGTA
gi|9820                       : ACTTA-GT-ACG-A-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---ATA-G-GT----T-A-G---AGG-C-T---G--T--CGCATCTGTA
gi|9821                       : ACTTA-GA-ACT-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T-G--GACA---AAA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCT
gi|9822                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T---G--T--CACATCTGTA
gi|9823                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T---A-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9824                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9825                       : ACTTA-GAAGCA-GCT----TACATA-GAA--T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-TTTAA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TA-CGCAT
gi|9826                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATC
gi|9827                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CT--C-C--A---------T---GC-TGG--T-T--GG-GCG-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9828                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--CCT---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9829                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-GAA-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9830                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CT--C-CCTG---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTG
gi|9831                       : ACTTA-GA-GCA-G-TTTCTCAT-----GAC-T-G--C-T---TTTTA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-A-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9832                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-A---A-G-G-A-G-G--T--AGCAT
gi|9833                       : ACTTA-GA-GCA-G-A----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---G---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-TT----T-A-G---A-G-A-T-T-G--T--CGCATCTG
gi|9834                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TTT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GC----T-A-G---A-A-G-T-G-A--T--CGCATCTGTA
gi|9835                       : ACTTA-GA-GCG-G-T----CAT-AA-GAAC-T-A--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----A-T--CA-G---AGA-G-AT----T-G-G---T-G-G-T-G-G--A--CGCAGCTGTA
gi|9836                       : ACTTA-GA-GCAAG-T----CAT-TA-GAACAT-G--C-C---TTC-A-C--G---A---C-T---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TC-CGCATCTGTA
gi|9837                       : ACTTA-GA-ACA-G-T----CAG-CA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---G-C---GT-T----T-T--AA-G---CGA-T-GT----T-A-G---A-A-A-T-A-G--T--CGCATCTTTA
gi|9838                       : ACTTG-GA-GCA-G-TTCTGCAT-----GAC-T-G--C-T---TTG-A-T--G---A---C-T---GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9839                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----
gi|9840                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA--AAC-T-G--CTT---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-G-CT----T-A-GC--A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9841                       : ACTTA-GA---A-G------CAT-AG-AAAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-C---AT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-G-G---A-AGG-T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9842                       : ACTTAAGA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGC-T-G--C-T---TT----C--G---A---CTT---GC-T----T-A--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T---G--T--CGCATCTGTA
gi|9843                       : ATTTA-GA-ACA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--A---A---C-C---GC-T----T-T---------AGA-G-G-------------------T-G-G--T--CTCATCTGTA
gi|9844                       : ACTTA-GA--CA-G-T----CAG-CA-GAAC-T-G--C-T---TT--AAC--G---GGACC-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATC-GTA
gi|9845                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CCC-A-T--G---A---C-T---GG-T----T-T--GG-GCGAGGA-G-GT----T-AAG---A-A-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9846                       : ACTTA-GA-TCA-G-T----CAT-TA-GA-C-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-G-G-----T-A-G---A-A-C-TGG-G--T--CGCATATGTA
gi|9847                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--------------------------------C-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9848                       : ACTTG-GA-GTA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-A--C-A---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-
gi|9849                       : ACTTA-AA--CA-G-TT---CAT-CT-GA-C-T-G--C-T---CTC-A-C--G---A---C-T---GG-T----T-T--AGCA---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9850                       : ACTTA-AA--CA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---CTCCA-C--G---A---C-T---GG-T----T----AG-GCA-AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9851                       : ACTT--GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAGA-C-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC------T-T--AA-G---AGA-GCGT----T-A-G---A-A-C-T-G-GA-T--CGCATCTG
gi|9852                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----C-T-TA-GAA--T-G--C-T-----------------------------T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--C--CGCATCTGTA
gi|9853                       : ACTTA-AA-ACA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TTTTCC--A-C--G---A---C-T---GG-T----TGT--GC-A---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9854                       : ACTTA-GA-ACA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-TGT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GG-G---AAAAG-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9855                       : ATTTA-GA--CG-T-T----CAT-TA-GA-C-T-GG-C-T---AA--A-C--G---T---C-C---G--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-G-G---G-----T-G-G--T--CGCATC
gi|9856                       : ACGTA-GA-GCA-G-T----TAT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---A-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTATA
gi|9857                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-GATT-T---CC--A-T--G---A---C-TT--GT-T----G-G--GC-G---AGA-G-AT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9858                       : ACTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-C-G--C-TTT-CC--A-C--G---A---C-T---GG-T----T----GA-GCA-AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTG
gi|9859                       : ACTTA-GT-TAA-G-T----TAT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CT--A-T--G---A---C-T---GT-T----T-G--AG-GG--AGA-G-GT----C-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CACATCTGTA
gi|9860                       : ACTTG-GA-GCA-G-T----TTT-CA-TGAC-T-G--C-TTT-CC--A-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATTTGTA
gi|9861                       :  CTCA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-A--G---A---T-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-A-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9862                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-T---GC-TTTAAT-T--AA-G---AGA-G-GT----TAA-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9863                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---TT--A----G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GTTGAAT-A-G---A-A-C-T-G-GTTT--CGCATCTGTA
gi|9864                       :  CTTA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--T-TTT-CC--A-T--G---A---T-T---GA-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9865                       :   TTA-AA-GCG-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-C--G---A---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGTATCTGTA
gi|9866                       :   TTA-GA-GCA-G-T----CAT-TAAGAGC-T-G--C-T----T--A-C--G---AA--C-T---GC-T----T-----A-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--TTACGCATCTGTA
gi|9867                       :   TTA-GA-GCA---T----CAT-TA-GAAC-TTG--TAT---TT--A-T--G---A---C-T---GC-T----T----AA-G---AGA-G-GT----T-A-GTAAA-A-CGT-G-A--C--C-CATCTGTA
gi|9868                       :    TA-GA-GCA-G-T----TCT-CA-TGAC-T-G--C-T---TTTCA-T--G---A---C-T---GG-T----T-G--GGCG---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-G-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9869                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--C-T---CT--A-T--G---A---C-G---AC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-T-G-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9870                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT--A-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9871                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAT--A-GAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T----AA-T---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9872                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAG-CA-GAGC-T-G--T-T---CT--A-A--GTTAA---C-TTAAG--T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-G-T-G-G--T--CGCCTCTGTA
gi|9873                       :    TA-GA-GCA-G-T----CAG-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-A--G---------------------T-T--AA-C----------T----T-A-G---A-G-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9874                       :      -GA-ACA-G-T----CAT-TA-AAAC-T-G--C-T---TT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--CGCATCTGTA
gi|9875                       :        A-ACG-G-T----CAT-TA-GAAC-T-G--T-T---CT--A-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--GA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-G-A-T-G-G--T--CGCATATGTA
gi|9876                       :                       T-TG-GGAC-T-G--G-T---GT--A-C--G---A---C-T---GC-T----T-T--AA-G---AGA-G-GT----T-A-G---A-A-C-T-G-G--T--TGCATCTGTA
gi|9877                       :                       T-TA-GAAT-C-G--C-T---CG--G-C--G---G---C-C---GT-T----T-T--AA-G---AGA-G-GC----T-A-G---A-----T-GTG--T--CG