lowQualScore : 222222222 2
lowQualScore : 0 0 111 1 0 0 0 0 00 0 33 111111 22 11 0 0 1 22222 66666 0 1 11 0 0 0 222 0 0 0 0 1 0 1 11 1111 33333333 1111 2222 111 0 0 3333 3333 1 00 111 22 333 22 0 44 1 000000000 0 11 2222 555555 111 0 22222 0 222 11 0 22 1 444 333333333 1 11 22 0 333 0 0 2 0 55 0 0 0
lowQualScore : . . ... . . . . . .. . .. ...... .. .. . . . ..... ..... . . .. . . . ... . . . . . . . .. .... ........ .... .... ... . . .... .... . .. ... .. ... .. . .. . ......... . .. .... ...... ... . ..... . ... .. . .. . ... ......... . .. .. . ... . . . . .. . . .
lowQualScore : 7 7 999 4 7 6 6 6 99 6 00 888888 11 55 6 6 3 55555 55555 6 3 55 6 6 6 555 6 6 6 6 2 6 2 44 3333 66666666 9999 5555 111 6 6 2222 6666 2 88 111 11 000 99 7 00 4 555555555 7 00 2222 222222 222 7 55555 7 222 00 7 55 5 222 999999999 6 99 22 8 777 8 0 4 8 11 8 9 9
consensus : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
Reference ( gi|34884 ) : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---T-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34868 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCA-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--A---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34867 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----T-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---TC--A---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34870 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-ATA---C-----GT-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--ACAA---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-T--GG-TA-T-G---------A-G--T--T-AT--T-T-C-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34869 : aATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-TG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AT-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-------T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34885 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GCC------T---C-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-C-G---------A-G--T--T-AT--T-T-C-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34872 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AT-A---A-----A-A--T----GCC------T---C-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-C--T-TTG-T-TT
gi|34886 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-G--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A----A---A-TG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-G---A-----G-A--T----GCT------T---A-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-TGC-C-C--T-TTG-T-T
gi|34871 : ATAC-AAG---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AT-A---A-----A-A--T----GCC------T---C-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34873 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------G--A--C-GA-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--TC-G---A-----A-A--T----GCG------T---A-T-----T-T---T--AC-T--GG-TT-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-CTT-T--T-TTG-T-TTA
gi|34874 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AT-G---A-----T-T--T----GCC------T---A-T-----T-A---T--AC-C--GG-TA-C-A---------A-G--G--T-A---T-T-C-C-C--C-TT
gi|34887 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----GT-TC-G--T-T-T-CG---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CA--A---TTG--T-A--AC-A---A-----T-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AT-T--GA-TA-C-A---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-ATAt
gi|34889 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----A----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GCC------T---C-T-----T-T---T--AC-C--AG-AA-C-G---------A-G--T--T-A---T-
gi|34877 : ATAC-A-GG--T-TA-G-T-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACA-G--T----T--------A----T----G---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-A---A-----C-A--T----TCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--AG-AA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTA-T-TTA
gi|34878 : aATAC-A-G---T---------------GT-T--AC------A--A--T-GG-AC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-AA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-CA-T-TTG-T-TTA
gi|34888 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-AAACGAT-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-TG-A----A----T-C--TG---GC--G---TTG--T-A--TC-G---A-----T-A--T----GCC------C---A-T-----T-T---T--AC-C--GA-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-T
gi|34890 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----AT-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A------------------------------------------A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AT-C--GG-TA-C-T---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34879 : ATGC-A-A---T-CA-G-C-TCT-C--AT-C--AC------A--A--C-GG-CC-G-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GAC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----C-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---A-----T-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--G
gi|34892 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-AC-A-----C-----GT-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-CTC-G--T----T--------A----T----A---A-CA-A----A----T-C-----------------A--T-A--A------T-----T-A--T----GCT------T---A-T-----T-G---T--AC-T--GG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-TAC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34893 : ATAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T----A---A-C--A----A----T-A--TG---CC-----------T-A---------C-----A-G--T----G--------T---A-T-----T-T---T--GC-C--GG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-T-T-C-CA-T-TTG-T-TTA
gi|34894 : ATACCA-A---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------------C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-GATT-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-GA-T----T--------A----TA---A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G----TA--T-AG-AC-G---T-----ATA--T----GCCCCTA--T---G-T-----T-T---T--AC-CG-GG-TA-T-G---------A-G--TGCT-A---TCT-T-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34875 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-TGGCCAA--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CG--T---TTG--T-----C-A---T-----A-T--T----TGC------T---A-T-----T-A---T--AC-C--GG-TA-C-A---------A-G--G--T-A---T-T-C-C-C--C-TT
gi|34891 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC-----------------------------------------------------------A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---G-----A-A--T----GCCTA----T---A-T-----T-T---T--AC-T--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTAt
gi|34895 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--TT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----TT-TC-G--T-T-T-GC---G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---
gi|34880 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--T--C-AG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-TG-A----A----T-T--TG---CC--A---TCGCTT-A--AC-
gi|34898 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-ACT-C--GT-T--AC--------------GG-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--C----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--T
gi|34896 : ATAT-A-GACAT-CA-G---TCTGC--GT-T--AC------A--C--G-GG-GC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-TC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----TA---A---A-CGAA----A----T-C--TG---CCA-A---TTGT-T-A--AT-G---A-----A-A--T----GCT------G---A-T-----G-T---TCAACGC--GG-TA-C-A---------A-G--T--T-----T-T-CGC-C--T-TTG-TGTTA
gi|34899 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-T-T-C--TT-TG-AC------A--A--CAGG-CC-A-----CACT--AT-TC-A--T-T-TGCC---G-A-TCTA-TTT-G-GCC-G--C----C--------A----T--------A-CA-C----A----T-C--TG---CCATG---TTG--T-A--AT-GA--T-----A-A--T----GTC------T---A-T-----TCT---T--AC-C--GGATC-C-A---------A-GTTT--T-A---T-T-T-C-CCGT-TTA-T-TTA
gi|34881 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-----T-T--AC---------A--C-GG-CC-A-----CG----GTATC-G--A-T-T-CC---A-A-TC-A-TTTAT-TCC-G--TCGTAT--------A----T----A---ATCG-A----A----T-CTTTG---CCT-A---TTAT-T-A--AC-GA--A-----A-A--T----GCC------------T-----T-A---T--AC-T--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---A-T-C-C-C--T-T
gi|34882 : aATAC---G---T-CA-C-C-TCT-G--GT-T---C------ATCA--C-GG-CCGA-----C-----GT-TT----T-T-C-CC---C-A-TC-C-ATT-T-GCC-G--T----TT-------G----T----A---A-CG-AT---A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-ATAATTG---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-TTA-T--AC-T--GG-GA-TCG---------ACT--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-Tgatta
gi|34900 : aatATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTGT-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-G--T----T--------A----T----A---G-CG-A----A----T-T--TG---GC--G---ATG--
gi|34901 : ATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT--------------------------------------C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T----A---A-C
gi|34902 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----CT-TTTG--T-T-T----------------TT-T-GGC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-T--TG---GC--G---ATG--
gi|34897 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GC-C--AC------A--A--C-GG-TC-A-----A-----GT-TC-T--T-T-T-aattgaatttccgccatttt
gi|34904 : ATAT-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----CT-TTTG--T-T-C-TCTTGA-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-T--TG---GC--G---ATG----A--AT-T---G-----A-A--TTTCCGCC----------A-T-----T-T---T--GA-A--GA-AA-A-A---------A-G--T--T-A---------C-C--G-TTG-T-TT
gi|34903 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-C-----C-----TT-TT-G--T-TCT-TT---G-A----A-TCT-T-GGC-G--T----T--------AT---T----A---A-CG------A----T-T--TG---GC--G---
gi|34905 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--A---TTG--T-A--AT-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-T--GG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTAcataattgaatttcccatttt
gi|34906 : TAC-A-G---T-CA-C-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTA--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-T--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34908 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----AT-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-G--T----T--------T----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTA--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-A---------A-G--T--T-AT--T-T-C-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34909 : TAC-A-G---C-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----C-C--TA---CC--G---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-C-A---------A-G--T--T-A---T-T-CTC-C--T-TTG-T-TTA
gi|34907 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GTC------T---C-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34910 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--TAA--AT-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-T--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-CT-T-TTG-T-TTA
gi|34911 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----AT-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------C---A-T-----T-T---T--AA-C--AG-TA-C-A---------A-G--T--T-A---T-T-C-CTC--T-TTG-T-TTA
gi|34913 : TAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----GT-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T----T---A-CG-A----A----T-C--TG---TC--A---TTG--T-A--AT-G---A-----A-A--T----GCC------A---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--TAA---T-C-C-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34914 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A----A---A-CA-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-AC-AT-G---TAACAAA-A--T----GCC------T---C-T-----T-T---T--AC-C--AG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-C--C-TT
gi|34876 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-A--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--A----T--------A----G----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--------G--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AA-C--GG-CA-C-C---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTAt
gi|34915 : agTAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-A---A-----A-A--T----GCCGTCAGTT---A-CAGCGAT-T---T--AC-C--GG-TA-
gi|34917 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------T--A--C-AG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-T-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T----A---T-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-G---A-----T-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---
gi|34916 : TAC-C-A---T-CA-GGC-TCT-C---T-G--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-GT-T-T-T-CT---G-A-TC-A--TT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CA-A----ATCC-T-C--TG---CT--GCGTTTGT-T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCCG-----T---ATT-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-CG-T-TTA-T-TTA
gi|34919 : TAC-A-G---T-CA-T-T-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----AT-TC-A--T-T-T-TC---A-A-TC-A-ATT-T-GCT-G--T----T--------C----T----A---A-CG-A----G----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-A---A-----T-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--A
gi|34918 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCG-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----AT-TC-G--T-T-T-CC---C-A-GC-A-TTT-T-GCC-T--T----T--------G----T----A---A-CG-A--------------TA---C----------------------------------------GCC------T---A-T-----T-C---T--AT-C--AG-TA-C-A---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34912 : TAC-A-G---T-CA-G-CCTCT-G--GT-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---ATA-TC-A-TTTGT-GCC-G--T----T--------A----A----A---A-TG-AT---A----T-C--TG---CT--GT--TTA--T-A--GA-GA--T-----A-A-------GCT------T---A-T-----T-T---T--AC-CAAAG-TA-T-G---------A-G--T--A-A---T-T-T-G-C--TCTTG-T-T
gi|34920 : TAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------AT-AGTC-GGACC-A-----T-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-ACCCT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-CG-ATTATA----T-C--TGCCTCC--GT--TTG--T-AT-AC-AGACC-----A-AATT----GCC------TACAA-T-----T-A---T--AC-T--AA-CA-T-GTTCTACGACG-T--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-T
gi|34883 : TAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTGT-TC------T-T-CT---G-AATC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-T--TG---
gi|34921 : agTAC-A-G---T-CA-A-T-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTGT-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-T--TG---GC--G---ATG--gtgatgaattg
gi|34922 : AC-A-A---T-CA-G-C-T-T-C---T-T--AC------A--A--C-GG-C--A-----------GT-TC-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TCT-T-GCaattgaatttccgctattttgaagaaacagttctgcctttttgt
gi|34924 : C-A-G---T-AA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----G--------A----T----A---A-CG-A----ATCTGT-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---T-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TT
gi|34925 : C-A-G---TTCA-G-C-GCT-CTGGT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--TCT-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----TAA------A----C----A---A-TG-AT---A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-T--AC-G---A-----G-A--TA---GCT------T---A-T-----T-T---T--AC-CA-AG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-T-G-C-T--C-TTG-T-T
gi|34923 : C-A-G---TTCA-G-C-TCT----GT-T--AC------A--A--C-GT-CGGA-----C-----AT-TC-A--T-T-T-CCT--G-A-TC-A-TTT-T-ACCTA--T----T-------------T----A---A-CG-A----AT---T-C--TG---CC--G---TAT--T-AAGAC-G---CAAA--A-A--T----GCC------T---A-------T-T---T--AC-C--GG-TA-C-GA--------A-G--T--T-ATTTT-T-C-C-C--T-TTG-T-
gi|34926 : -A-G---T-CAAG-C-TCT-C--GT-TC-AC------A--A--C-GT-CC-------------GT-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A--TT-T-GCC-GGTT----C--------A----T----A---A-CG-A----A------C--TG---C---------A--T-A--AC-A---TA----A-A--T----GCC------T---C-T-----T-T-------C-C--AACTA-C-G---------A----T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTA
gi|34927 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------ATTATT----A---G-C--A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--A--C--GG-TA-A-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-T
gi|34928 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--AA-C-GG-CC-A-----C-----GT-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------A----T----
gi|34929 : -C-TCT-C--GTGT--ACTATTGTAT-A--C-GG-CT-A-----A-----GT-TC-G--T-C-T-TCTG-G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----TCTATACTGA----T----AGATA-CG-A----AA---TAT--TG---CC--CC--TTG--T-A--AT-G---A-----A-A--T----GCC------T---A-TA----T-TTTAT--AC-C--GG-TAGC-G---------ATG--TTGT-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-T
gi|34879 : T-C--GT-T--AC------A--A--C-GG--C-A-----G-----GT-TC-G--T-T----------A-TA-A-TGT-C-AAA-A--T----G--------A----TCGGAA---A-CG-A----A----CGC--GG---CC--G---TTG--T-G--AT-G---
gi|34930 : aatgcaatcagctct-T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T----A---A-TG-A----T----T-C--TG---CT--A---TTG--T-A--AC-G---A-----A-A--C----GAC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-T-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTGAT-TTAtatgcctattttaccg
gi|34931 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GC--G--T----T-------------T----A---A-TG-A----T----T-C--T----CT--A---TTG----A--A--G---------A-A--C----GAC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-T-G---------A-GA-T--T-A---T-T-C-C-C--T-TT
gi|34933 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A---------A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-----------A-A--A----GCC------------T-----C-T---T--AC-C--AG-t
gi|34932 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A---------A---A-CG-A----A----T-C--TG---CT--G---TTG--T-A--AC-----------A-A--A----GCC------------T-----C-T---T--AC-C--AG-aaacggattat
gi|34934 : -A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--TC-G---A-----T-A--T----GTC------T---A-C-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-TCC-C-C--T-TTG-T-TTAaaacggattat
gi|34935 : ----T--------G----T----A---A-CG-A----A----T-C--TG---CC--G---TTG--T-A--AC-G---A-----T-A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--TG-TA-C-G---------A-G--T--T-A---T-T-C-C-CT-T-TTG-T-TTA
gi|34936 : -A--T----GCC------T---A-T-----T-T---T--AC-C--GG-TA-C-G---------A-G--C--T-A---T-TAC-A-C--T-TTG-T-TTA
Alignments
lowQualScore : 0 0 111 1 0 0 0 0 00 0 33 111111 22 11 0 0 1 22222 55555 0 0 1 11 0 0 0 222 0 0 0 0 1 0 1 11 1111 33333333 1111 1 111 0 0 3333 3333 0 00 111 22 222 111111 22 1 44444 0 1 222 0 1 333 00 444444 111 0 22222 0 111 00 00 0 33 3333333 1 0 1 22 22 0 11 0 0 0
lowQualScore : . . ... . . . . . .. . .. ...... .. .. . . . ..... ..... . . . .. . . . ... . . . . . . . .. .... ........ .... . ... . . .... .... . .. ... .. ... ...... .. . ..... . . ... . . ... .. ...... ... . ..... . ... .. .. . .. ....... . . . .. .. . .. . . .
lowQualScore : 7 7 888 3 6 6 6 6 99 6 00 888888 11 55 6 6 3 55555 99999 6 6 3 55 6 6 6 555 6 6 6 6 2 6 2 44 3333 66666666 9999 2 111 6 6 2222 6666 6 88 111 11 333 888888 11 3 00000 6 3 555 7 3 888 99 888888 111 7 33333 7 111 99 99 7 88 7777777 4 7 5 55 00 7 00 8 8 8
consensus : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
Reference ( family-302 ) : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34867 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---TC--A---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34868 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCA-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--A---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34869 : aATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-------T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34870 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-ATA---C-----G-T-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-CAA---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34871 : aATAC-AAG---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-T-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34872 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-T-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TT-CCC-TTTG-T-TT
gi|34873 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------G--A--C-GA-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-AA-T---GC--G------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TT-CG-A-G--T--T-A--TTCTTT-TTTG-T-TTA
gi|34874 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-T-G---A-TT-T---GC--C------T---A-T-----T-A---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--G--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34875 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-TGGCCAA--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CG--T---T------TG--T-C-----A-T-----A-TT-T---G---C------T---A-T-----T-A---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--G--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34876 : aTAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-A--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--A----T--------A----G-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--------------G--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--A-C--GG-------CA-CC-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34877 : agATAC-A-GG--T-TA-G-T-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACA-G--T----T--------A----T-G---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-CA-T---TC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------AA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTA-T-TTA
gi|34878 : aATAC-A-G---T---------------GT-T--AC------A--A--T-GG-AC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-AA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCA-TTTG-T-TTA
gi|34879 : aATGC-A-A---T-CA-G-C-TCT-C--AT-C--AC------A--A--C-GG-CC-G-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GAC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----C-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--G
gi|34880 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--T--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-TT--G---CC--A---T------CGCTT-A-----A-C-
gi|34881 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-----T-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----GGTATC-G--A-T-T-CC---A-A-TC-A-TTTAT-TCC-G--TCGTAT--------A----T-A---ATCG-A----A----T-CTTTG---CCT-A---T------TA--TTA-----A-C-G---A-AAAT---GC--C------T-----------T-A---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--ATCCC---TTG-A-TTA
gi|34882 : aATAC---G---T-CA-C-C-TCT-G--GT-T---C------ATCA--C-GG-CCGA-----C-----G-T-TT----T-T-C-CC---C-A-TC-C-ATT-T-GCC-G--T----TT-------G----T-A---A-CG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-ATA---A-TTG---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--ATAC-T--GG-------GATCG-A-C--T--TTA--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34883 : aatTAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC------T-T-CT---G-AATC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G-------------------G--T-G-----A-T-G---A-AT-T---G
gi|34884 : agATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---T-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TT-CCC-TTTG-T-TTA
gi|34885 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34886 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-G--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-TG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-GA-T---GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTGCCC-TTTG-T-T
gi|34887 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CG---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CA--A---T------TG--T-A-----A-C-A---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--T-T--GA-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-ATA
gi|34888 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-AAACGAT-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-CT--G---GC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-TA-T---GC--C------C---A-T-----T-T---T--A--C-C--GA-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34889 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------AA-CG-A-G--T--T-A--
gi|34890 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A---------------------------------------A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--T-C--GG-------TA-CT-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34891 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A-------------------------------------------------------TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---G-AA-T---GC--CTA----T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34892 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-AC-A-----C-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-CTC-G--T----T--------A----T-A---A-CA-A----A----T-C-----------------------A--T-A-----A-T-T------A-T---GC--T------T---A-T-----T-G---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTACCC-TTTG-T-TTA
gi|34893 : ATAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T-A---A-C--A----A----T-AT--G---CC------T------------------A-C-------AG-T---G----------T---A-T-----T-T---T--G--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTTCCA-TTTG-T-TTA
gi|34894 : ATACCA-A---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------------C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-GATT-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-GA-T----T--------A----TAA---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G----------TA--T-AG----A-C-GT--A-TA-T---GC--CCCTA--T---G-T-----T-T---T--A--C-CG-GG-------TA-TG-A-G--TGCT-A--TCTTCC-TTTG-T-TTA
gi|34895 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--TT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----T-T-TC-G--T-T-T-GC---G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---
gi|34896 : ATAT-A-GACAT-CA-G---TCTGC--GT-T--AC------A--C--G-GG-GC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-TC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----TAA---A-CGAA----A----T-CT--G---CCA-A---T------TGT-T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--T------G---A-T-----G-T---TCAA--CGC--GG-------TA-CA-A-G--T--T----TTCGCC-TTTG-TGTTA
gi|34897 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GC-C--AC------A--A--C-GG-TC-A-----A-----G-T-TC-T--T-T-T-
gi|34898 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-ACT-C--GT-T--AC--------------GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--C----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--
gi|34899 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-T-T-C--TT-TG-AC------A--A--CAGG-CC-A-----CACT--A-T-TC-A--T-T-TGCC---G-A-TCTA-TTT-G-GCC-G--C----C--------A----T-----A-CA-C----A----T-CT--G---CCATG---T------TG--T-A-----A-T-G---ATAA-T---GT--C------T---A-T-----TCT---T--A--C-C--GGA------TC-CA-A-GTTT--T-A--TTTCCCGTTTA-T-TTA
gi|34900 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-G--T----T--------A----T-A---G-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--
gi|34901 : ATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT--------------------------------------C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-C
gi|34902 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----C-T-TTTG--T-T-T----------------TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-TTCCGC--C----------A-T-----T-T---T--
gi|34903 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-C-----C-----T-T-TT-G--T-TCT-TT---G-A----A-TCT-T-GGC-G--T----T--------AT---T-A---A-CG------A----T-TT--G---GC--G----------CA--T-A-----ATT-G---A-AT-T---TC--C------C---A-T-----T-T---T--
gi|34904 : ATAT-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----C-T-TTTG--T-T-C-TCTTGA-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-TTCCGC--C----------A-T-----T-T---T--G--A-A--GA-------AA-AA-A-G--T--T-A------CC-GTTG-T-TT
gi|34905 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--A---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34906 : TAC-A-G---T-CA-C-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TA--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34907 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GT--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34908 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-G--T----T--------T----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TA--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34909 : TAC-A-G---C-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----C-CT--A---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCTCC-TTTG-T-TTA
gi|34910 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--TAA-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCT-TTTG-T-TTA
gi|34911 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----A-T-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------C---A-T-----T-T---T--A--A-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCTC-TTTG-T-TTA
gi|34912 : TAC-A-G---T-CA-G-CCTCT-G--GT-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---ATA-TC-A-TTTGT-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-TG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------T---T-A-----T-A-G---A-GA-TAA-GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-CAAAG-------TA-TG-A-G--T--A-A--TTTGCT-CTTG-T-T
gi|34913 : TAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T-T---A-CG-A----A----T-CT--G---TC--A---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------A---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--ATCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34914 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CA-A----A----T-CT--G---CT--G---TTGTACATG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34915 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--CGTCAGTT---A-CAGCGAT-T---T--A--C-C--GG-------TA-
gi|34916 : TAC-C-A---T-CA-GGC-TCT-C---T-G--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-GT-T-T-T-CT---G-A-TC-A--TT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CA-A----ATCC-T-CT--G---CT--GCGTT------TGT-T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--CG-----T---ATT-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCG-TTTA-T-TTA
gi|34917 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------T--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-T-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T-A---T-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---
gi|34918 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCG-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---C-A-GC-A-TTT-T-GCC----T---------------------------------------------------------T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-C---GC--C------T---A-T-----T-C---T--A--T-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34919 : TAC-A-G---T-CA-T-T-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-TC---A-A-TC-A-ATT-T-GCT-G--T----T--------C----T-A---A-CG-A----G----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--
gi|34920 : TAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------AT-AGTC-GGACC-A-----T-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-ACCCT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-ATTATA----T-CT--GCCTCC--GT--T------TG--T-ATACAGA-C-C---A-AATT---GC--C------TACAA-T-----T-A---T--A--C-T--AACATGTTCTA-CG-ACGT-T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34921 : TAC-A-G---T-CA-A-T-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-T---TCCGC------T---A-T-----T-T---T--G--A-A--GA-------AA-C--A-G--T--T-C--TGCCTT-TTTG-T-
gi|34922 : AC-A-A---T-CA-G-C-T-T-C---T-T--AC------A--A--C-GG-C--A-----------G-T-TC-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TCT-T-GC
gi|34923 : C-A-G---TTCA-G-C-TCT----GT-T--AC------A--A--C-GT-CGGA-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CCT--G-A-TC-A-TTT-T-ACCTA--T----T-------------T-A---A-CG-A----AT---T-CT--G---CC--G---T------AT--T-AAG---A-C-GCAAA-AA-T---GC--C------T---A-------T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CGAA-G--T--T-ATTTTTCCC-TTTG-T-
gi|34924 : C-A-G---T-AA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----G--------A----T-A---A-CG-A----ATCTGT-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---T-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TT
gi|34925 : C-A-G---TTCA-G-C-GCT-CTGGT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--TCT-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----TAA------A----C-A---A-TG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-T-----A-C-G---A-GA-TA--GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-CA-AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTGCTC--TTG-T-T
gi|34926 : -A-G---T-CAAG-C-TCT-C--GT-TC-AC------A--A--C-GT-CC-------------G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT---GCC-GGTT----C--------A----T-A---A-CG-A----A------CT--G---C---------------A--T-A-----A-C-AT--A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---------C-C--AAC------TA-CG-A----T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34927 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------ATTATT-A---G-C--A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A----C--GG-------TA-AG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34928 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--AA-C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------A----T-
gi|34929 : -C-TCT-C--GTGT--ACTATTGTAT-A--C-GG-CT-A-----A-----G-T-TC-G--T-C-T-TCTG-G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----TCTATACTGA----T-AGATA-CG-A----AA---TATT--G---CC--CC--T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-TA----T-TTTAT--A--C-C--GG-------TAGCG-ATG--TTGT-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34930 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-TG-A----T----T-CT--G---CT--A---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-C---GA--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTGAT-TTA
gi|34931 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GC--G--T----T-------------T-A---A-TG-A----T----T-CT------CT--A---T------TG----A-----A-------G-AA-C---GA--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-GA-T--T-A--TTCCCT-TTT
gi|34932 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A------A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-A------GC--C------------T-----C-T---T--A--C-CA-GA-------AA-CG-G-A--T--T-A--
gi|34933 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A------A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-A------GC--C------------T-----C-T---T--A--C-CA-GA-------AA-CG-G-A--T--T-A--
gi|34934 : -A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-TA-T---GT--C------T---A-C-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34935 : ----T--------G----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--TG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCT-TTTG-T-TTA
gi|34936 : A-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--C--T-A--TTACAC-TTTG-T-TTA
Alignments
lowQualScore : 0 0 111 1 0 0 0 0 00 0 33 111111 22 11 0 0 1 22222 55555 0 0 1 11 0 0 0 222 0 0 0 0 1 0 1 11 1111 33333333 1111 1 111 0 0 3333 3333 0 00 111 22 222 111111 22 1 44444 0 1 222 0 1 333 00 444444 111 0 22222 0 111 00 00 0 33 3333333 1 0 1 22 22 0 11 0 0 0
lowQualScore : . . ... . . . . . .. . .. ...... .. .. . . . ..... ..... . . . .. . . . ... . . . . . . . .. .... ........ .... . ... . . .... .... . .. ... .. ... ...... .. . ..... . . ... . . ... .. ...... ... . ..... . ... .. .. . .. ....... . . . .. .. . .. . . .
lowQualScore : 7 7 888 3 6 6 6 6 99 6 00 888888 11 55 6 6 3 55555 99999 6 6 3 55 6 6 6 555 6 6 6 6 2 6 2 44 3333 66666666 9999 2 111 6 6 2222 6666 6 88 111 11 333 888888 11 3 00000 6 3 555 7 3 888 99 888888 111 7 33333 7 111 99 99 7 88 7777777 4 7 5 55 00 7 00 8 8 8
consensus : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
Reference ( family-302 ) : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34867 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---TC--A---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34868 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCA-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--A---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34869 : aATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-------T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34870 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-ATA---C-----G-T-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-CAA---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34871 : aATAC-AAG---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-T-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34872 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-T-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TT-CCC-TTTG-T-TT
gi|34873 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------G--A--C-GA-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-AA-T---GC--G------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TT-CG-A-G--T--T-A--TTCTTT-TTTG-T-TTA
gi|34874 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-T-G---A-TT-T---GC--C------T---A-T-----T-A---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--G--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34875 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-TGGCCAA--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CG--T---T------TG--T-C-----A-T-----A-TT-T---G---C------T---A-T-----T-A---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--G--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34876 : aTAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-A--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--A----T--------A----G-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--------------G--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--A-C--GG-------CA-CC-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34877 : agATAC-A-GG--T-TA-G-T-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACA-G--T----T--------A----T-G---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-CA-T---TC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------AA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTA-T-TTA
gi|34878 : aATAC-A-G---T---------------GT-T--AC------A--A--T-GG-AC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-AA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCA-TTTG-T-TTA
gi|34879 : aATGC-A-A---T-CA-G-C-TCT-C--AT-C--AC------A--A--C-GG-CC-G-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GAC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----C-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--G
gi|34880 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--T--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-TT--G---CC--A---T------CGCTT-A-----A-C-
gi|34881 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-----T-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----GGTATC-G--A-T-T-CC---A-A-TC-A-TTTAT-TCC-G--TCGTAT--------A----T-A---ATCG-A----A----T-CTTTG---CCT-A---T------TA--TTA-----A-C-G---A-AAAT---GC--C------T-----------T-A---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--ATCCC---TTG-A-TTA
gi|34882 : aATAC---G---T-CA-C-C-TCT-G--GT-T---C------ATCA--C-GG-CCGA-----C-----G-T-TT----T-T-C-CC---C-A-TC-C-ATT-T-GCC-G--T----TT-------G----T-A---A-CG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-ATA---A-TTG---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--ATAC-T--GG-------GATCG-A-C--T--TTA--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34883 : aatTAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC------T-T-CT---G-AATC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G-------------------G--T-G-----A-T-G---A-AT-T---G
gi|34884 : agATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---T-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TT-CCC-TTTG-T-TTA
gi|34885 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34886 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-G--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-TG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-GA-T---GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTGCCC-TTTG-T-T
gi|34887 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CG---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CA--A---T------TG--T-A-----A-C-A---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--T-T--GA-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-ATA
gi|34888 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-AAACGAT-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-CT--G---GC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-TA-T---GC--C------C---A-T-----T-T---T--A--C-C--GA-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34889 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------AA-CG-A-G--T--T-A--
gi|34890 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A---------------------------------------A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--T-C--GG-------TA-CT-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34891 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A-------------------------------------------------------TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---G-AA-T---GC--CTA----T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34892 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-AC-A-----C-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-CTC-G--T----T--------A----T-A---A-CA-A----A----T-C-----------------------A--T-A-----A-T-T------A-T---GC--T------T---A-T-----T-G---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTACCC-TTTG-T-TTA
gi|34893 : ATAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T-A---A-C--A----A----T-AT--G---CC------T------------------A-C-------AG-T---G----------T---A-T-----T-T---T--G--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTTCCA-TTTG-T-TTA
gi|34894 : ATACCA-A---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------------C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-GATT-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-GA-T----T--------A----TAA---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G----------TA--T-AG----A-C-GT--A-TA-T---GC--CCCTA--T---G-T-----T-T---T--A--C-CG-GG-------TA-TG-A-G--TGCT-A--TCTTCC-TTTG-T-TTA
gi|34895 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--TT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----T-T-TC-G--T-T-T-GC---G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---
gi|34896 : ATAT-A-GACAT-CA-G---TCTGC--GT-T--AC------A--C--G-GG-GC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-TC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----TAA---A-CGAA----A----T-CT--G---CCA-A---T------TGT-T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--T------G---A-T-----G-T---TCAA--CGC--GG-------TA-CA-A-G--T--T----TTCGCC-TTTG-TGTTA
gi|34897 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GC-C--AC------A--A--C-GG-TC-A-----A-----G-T-TC-T--T-T-T-
gi|34898 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-ACT-C--GT-T--AC--------------GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--C----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--
gi|34899 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-T-T-C--TT-TG-AC------A--A--CAGG-CC-A-----CACT--A-T-TC-A--T-T-TGCC---G-A-TCTA-TTT-G-GCC-G--C----C--------A----T-----A-CA-C----A----T-CT--G---CCATG---T------TG--T-A-----A-T-G---ATAA-T---GT--C------T---A-T-----TCT---T--A--C-C--GGA------TC-CA-A-GTTT--T-A--TTTCCCGTTTA-T-TTA
gi|34900 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-G--T----T--------A----T-A---G-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--
gi|34901 : ATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT--------------------------------------C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-C
gi|34902 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----C-T-TTTG--T-T-T----------------TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-TTCCGC--C----------A-T-----T-T---T--
gi|34903 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-C-----C-----T-T-TT-G--T-TCT-TT---G-A----A-TCT-T-GGC-G--T----T--------AT---T-A---A-CG------A----T-TT--G---GC--G----------CA--T-A-----ATT-G---A-AT-T---TC--C------C---A-T-----T-T---T--
gi|34904 : ATAT-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----C-T-TTTG--T-T-C-TCTTGA-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-TTCCGC--C----------A-T-----T-T---T--G--A-A--GA-------AA-AA-A-G--T--T-A------CC-GTTG-T-TT
gi|34905 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--A---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34906 : TAC-A-G---T-CA-C-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TA--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34907 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GT--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34908 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-G--T----T--------T----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TA--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34909 : TAC-A-G---C-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----C-CT--A---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCTCC-TTTG-T-TTA
gi|34910 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--TAA-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCT-TTTG-T-TTA
gi|34911 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----A-T-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------C---A-T-----T-T---T--A--A-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCTC-TTTG-T-TTA
gi|34912 : TAC-A-G---T-CA-G-CCTCT-G--GT-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---ATA-TC-A-TTTGT-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-TG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------T---T-A-----T-A-G---A-GA-TAA-GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-CAAAG-------TA-TG-A-G--T--A-A--TTTGCT-CTTG-T-T
gi|34913 : TAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T-T---A-CG-A----A----T-CT--G---TC--A---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------A---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--ATCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34914 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CA-A----A----T-CT--G---CT--G---TTGTACATG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34915 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--CGTCAGTT---A-CAGCGAT-T---T--A--C-C--GG-------TA-
gi|34916 : TAC-C-A---T-CA-GGC-TCT-C---T-G--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-GT-T-T-T-CT---G-A-TC-A--TT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CA-A----ATCC-T-CT--G---CT--GCGTT------TGT-T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--CG-----T---ATT-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCG-TTTA-T-TTA
gi|34917 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------T--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-T-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T-A---T-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---
gi|34918 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCG-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---C-A-GC-A-TTT-T-GCC----T---------------------------------------------------------T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-C---GC--C------T---A-T-----T-C---T--A--T-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34919 : TAC-A-G---T-CA-T-T-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-TC---A-A-TC-A-ATT-T-GCT-G--T----T--------C----T-A---A-CG-A----G----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--
gi|34920 : TAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------AT-AGTC-GGACC-A-----T-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-ACCCT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-ATTATA----T-CT--GCCTCC--GT--T------TG--T-ATACAGA-C-C---A-AATT---GC--C------TACAA-T-----T-A---T--A--C-T--AACATGTTCTA-CG-ACGT-T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34921 : TAC-A-G---T-CA-A-T-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-T---TCCGC------T---A-T-----T-T---T--G--A-A--GA-------AA-C--A-G--T--T-C--TGCCTT-TTTG-T-
gi|34922 : AC-A-A---T-CA-G-C-T-T-C---T-T--AC------A--A--C-GG-C--A-----------G-T-TC-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TCT-T-GC
gi|34923 : C-A-G---TTCA-G-C-TCT----GT-T--AC------A--A--C-GT-CGGA-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CCT--G-A-TC-A-TTT-T-ACCTA--T----T-------------T-A---A-CG-A----AT---T-CT--G---CC--G---T------AT--T-AAG---A-C-GCAAA-AA-T---GC--C------T---A-------T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CGAA-G--T--T-ATTTTTCCC-TTTG-T-
gi|34924 : C-A-G---T-AA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----G--------A----T-A---A-CG-A----ATCTGT-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---T-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TT
gi|34925 : C-A-G---TTCA-G-C-GCT-CTGGT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--TCT-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----TAA------A----C-A---A-TG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-T-----A-C-G---A-GA-TA--GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-CA-AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTGCTC--TTG-T-T
gi|34926 : -A-G---T-CAAG-C-TCT-C--GT-TC-AC------A--A--C-GT-CC-------------G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT---GCC-GGTT----C--------A----T-A---A-CG-A----A------CT--G---C---------------A--T-A-----A-C-AT--A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---------C-C--AAC------TA-CG-A----T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34927 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------ATTATT-A---G-C--A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A----C--GG-------TA-AG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34928 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--AA-C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------A----T-
gi|34929 : -C-TCT-C--GTGT--ACTATTGTAT-A--C-GG-CT-A-----A-----G-T-TC-G--T-C-T-TCTG-G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----TCTATACTGA----T-AGATA-CG-A----AA---TATT--G---CC--CC--T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-TA----T-TTTAT--A--C-C--GG-------TAGCG-ATG--TTGT-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34930 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-TG-A----T----T-CT--G---CT--A---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-C---GA--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTGAT-TTA
gi|34931 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GC--G--T----T-------------T-A---A-TG-A----T----T-CT------CT--A---T------TG----A-----A-------G-AA-C---GA--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-GA-T--T-A--TTCCCT-TTT
gi|34932 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A------A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-A------GC--C------------T-----C-T---T--A--C-CA-GA-------AA-CG-G-A--T--T-A--
gi|34933 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A------A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-A------GC--C------------T-----C-T---T--A--C-CA-GA-------AA-CG-G-A--T--T-A--
gi|34934 : -A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-TA-T---GT--C------T---A-C-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34935 : ----T--------G----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--TG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCT-TTTG-T-TTA
gi|34936 : A-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--C--T-A--TTACAC-TTTG-T-TTA
blockSeqs : ACA T GA TATTGT TC GT G AACGA CTTTT T AT TTG A A GT CGTA CTATACTG TTAT A GAT TTAT TCTG CCT AT CGT TGTACA CT T TACAG A CAA A TCC GTCAGT ACA AGCGA TTA AA CATGTTC T C TT GC TT
blockSeqs : G T GA . T A G TA CTTTT T T TG G T A . AA T A . T TCC . T T . T A TA T T T TCC CCTA . A . G A G T T TG .
blockSeqs : . . G . T . . . CTTTT . . T . . . . T . . . T T . A C . T . AG . T . AA TA . . . A C . . A . .
blockSeqs : . . C . . . . . ACT . . . . . . . . . . . T A . . . . . . G . . . A G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
finalCons : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
Alignments
lowQualScore : 0 0 111 1 0 0 0 0 00 0 33 111111 22 11 0 0 1 22222 55555 0 0 1 11 0 0 0 222 0 0 0 0 1 0 1 11 1111 33333333 1111 1 111 0 0 3333 3333 0 00 111 22 222 111111 22 1 44444 0 1 222 0 1 333 00 444444 111 0 22222 0 111 00 00 0 33 3333333 1 0 1 22 22 0 11 0 0 0
lowQualScore : . . ... . . . . . .. . .. ...... .. .. . . . ..... ..... . . . .. . . . ... . . . . . . . .. .... ........ .... . ... . . .... .... . .. ... .. ... ...... .. . ..... . . ... . . ... .. ...... ... . ..... . ... .. .. . .. ....... . . . .. .. . .. . . .
lowQualScore : 7 7 888 3 6 6 6 6 99 6 00 888888 11 55 6 6 3 55555 99999 6 6 3 55 6 6 6 555 6 6 6 6 2 6 2 44 3333 66666666 9999 2 111 6 6 2222 6666 6 88 111 11 333 888888 11 3 00000 6 3 555 7 3 888 99 888888 111 7 33333 7 111 99 99 7 88 7777777 4 7 5 55 00 7 00 8 8 8
consensus : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
Reference ( family-302 ) : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34867 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---TC--A---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34868 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCA-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--A---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34869 : aATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-------T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34870 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-ATA---C-----G-T-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-CAA---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34871 : aATAC-AAG---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-T-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34872 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-T-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TT-CCC-TTTG-T-TT
gi|34873 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------G--A--C-GA-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-AA-T---GC--G------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TT-CG-A-G--T--T-A--TTCTTT-TTTG-T-TTA
gi|34874 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-T-G---A-TT-T---GC--C------T---A-T-----T-A---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--G--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34875 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-TGAAC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-TGGCCAA--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CG--T---T------TG--T-C-----A-T-----A-TT-T---G---C------T---A-T-----T-A---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--G--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34876 : aTAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-A--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-G-TTT-T-GCC-G--A----T--------A----G-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--------------G--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--A-C--GG-------CA-CC-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34877 : agATAC-A-GG--T-TA-G-T-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACA-G--T----T--------A----T-G---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-CA-T---TC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------AA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTA-T-TTA
gi|34878 : aATAC-A-G---T---------------GT-T--AC------A--A--T-GG-AC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-AA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCA-TTTG-T-TTA
gi|34879 : aATGC-A-A---T-CA-G-C-TCT-C--AT-C--AC------A--A--C-GG-CC-G-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GAC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----C-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--G
gi|34880 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--T--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-TT--G---CC--A---T------CGCTT-A-----A-C-
gi|34881 : aATAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-----T-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----GGTATC-G--A-T-T-CC---A-A-TC-A-TTTAT-TCC-G--TCGTAT--------A----T-A---ATCG-A----A----T-CTTTG---CCT-A---T------TA--TTA-----A-C-G---A-AAAT---GC--C------T-----------T-A---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--ATCCC---TTG-A-TTA
gi|34882 : aATAC---G---T-CA-C-C-TCT-G--GT-T---C------ATCA--C-GG-CCGA-----C-----G-T-TT----T-T-C-CC---C-A-TC-C-ATT-T-GCC-G--T----TT-------G----T-A---A-CG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-ATA---A-TTG---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--ATAC-T--GG-------GATCG-A-C--T--TTA--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34883 : aatTAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC------T-T-CT---G-AATC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G-------------------G--T-G-----A-T-G---A-AT-T---G
gi|34884 : agATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---T-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TT-CCC-TTTG-T-TTA
gi|34885 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34886 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-G--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-TG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-GA-T---GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTGCCC-TTTG-T-T
gi|34887 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-G--T-T-T-CG---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CA--A---T------TG--T-A-----A-C-A---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--T-T--GA-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-ATA
gi|34888 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CT-AAACGAT-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-TG-A----A----T-CT--G---GC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-TA-T---GC--C------C---A-T-----T-T---T--A--C-C--GA-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34889 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------AA-CG-A-G--T--T-A--
gi|34890 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A---------------------------------------A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--T-C--GG-------TA-CT-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34891 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A-------------------------------------------------------TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---G-AA-T---GC--CTA----T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34892 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-AC-A-----C-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-CTC-G--T----T--------A----T-A---A-CA-A----A----T-C-----------------------A--T-A-----A-T-T------A-T---GC--T------T---A-T-----T-G---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTACCC-TTTG-T-TTA
gi|34893 : ATAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T-A---A-C--A----A----T-AT--G---CC------T------------------A-C-------AG-T---G----------T---A-T-----T-T---T--G--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTTCCA-TTTG-T-TTA
gi|34894 : ATACCA-A---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------------C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-GATT-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-GA-T----T--------A----TAA---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G----------TA--T-AG----A-C-GT--A-TA-T---GC--CCCTA--T---G-T-----T-T---T--A--C-CG-GG-------TA-TG-A-G--TGCT-A--TCTTCC-TTTG-T-TTA
gi|34895 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--TT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----T-T-TC-G--T-T-T-GC---G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---
gi|34896 : ATAT-A-GACAT-CA-G---TCTGC--GT-T--AC------A--C--G-GG-GC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-TC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----TAA---A-CGAA----A----T-CT--G---CCA-A---T------TGT-T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--T------G---A-T-----G-T---TCAA--CGC--GG-------TA-CA-A-G--T--T----TTCGCC-TTTG-TGTTA
gi|34897 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GC-C--AC------A--A--C-GG-TC-A-----A-----G-T-TC-T--T-T-T-
gi|34898 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-ACT-C--GT-T--AC--------------GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--C----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--
gi|34899 : ATAC-A-G---T-CA-G-C-T-T-C--TT-TG-AC------A--A--CAGG-CC-A-----CACT--A-T-TC-A--T-T-TGCC---G-A-TCTA-TTT-G-GCC-G--C----C--------A----T-----A-CA-C----A----T-CT--G---CCATG---T------TG--T-A-----A-T-G---ATAA-T---GT--C------T---A-T-----TCT---T--A--C-C--GGA------TC-CA-A-GTTT--T-A--TTTCCCGTTTA-T-TTA
gi|34900 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-G--T----T--------A----T-A---G-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--
gi|34901 : ATAC-A-G---T-TA-G-C-TCT--------------------------------------C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TT-A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-C
gi|34902 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----C-T-TTTG--T-T-T----------------TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-TTCCGC--C----------A-T-----T-T---T--
gi|34903 : ATAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-C-----C-----T-T-TT-G--T-TCT-TT---G-A----A-TCT-T-GGC-G--T----T--------AT---T-A---A-CG------A----T-TT--G---GC--G----------CA--T-A-----ATT-G---A-AT-T---TC--C------C---A-T-----T-T---T--
gi|34904 : ATAT-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----C-----C-T-TTTG--T-T-C-TCTTGA-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-TTCCGC--C----------A-T-----T-T---T--G--A-A--GA-------AA-AA-A-G--T--T-A------CC-GTTG-T-TT
gi|34905 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--A---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34906 : TAC-A-G---T-CA-C-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CT---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TA--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34907 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GT--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34908 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-G--T----T--------T----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TA--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTTCCC-TTTG-T-TTA
gi|34909 : TAC-A-G---C-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----C-CT--A---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCTCC-TTTG-T-TTA
gi|34910 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---C-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------G----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--TAA-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-T--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCT-TTTG-T-TTA
gi|34911 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCC-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----A-T-TC-G--T-T-T-CA---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------C---A-T-----T-T---T--A--A-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCTC-TTTG-T-TTA
gi|34912 : TAC-A-G---T-CA-G-CCTCT-G--GT-T--AC------A-----C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---ATA-TC-A-TTTGT-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-TG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------T---T-A-----T-A-G---A-GA-TAA-GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-CAAAG-------TA-TG-A-G--T--A-A--TTTGCT-CTTG-T-T
gi|34913 : TAC-A-G---T-CA-A-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----T-----G-T-TC-A--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T-T---A-CG-A----A----T-CT--G---TC--A---T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------A---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--ATCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34914 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CA-A----A----T-CT--G---CT--G---TTGTACATG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---T--A--C-C--AG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTT
gi|34915 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----A-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-AA-T---GC--CGTCAGTT---A-CAGCGAT-T---T--A--C-C--GG-------TA-
gi|34916 : TAC-C-A---T-CA-GGC-TCT-C---T-G--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-GT-T-T-T-CT---G-A-TC-A--TT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CA-A----ATCC-T-CT--G---CT--GCGTT------TGT-T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--CG-----T---ATT-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCG-TTTA-T-TTA
gi|34917 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------T--A--C-AG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-T-TC-A-TTT-T-TCC-G--T----T--------A----T-A---T-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---
gi|34918 : TAC-A-G---T-CA-G-C-TCG-C--GT-T--AC------A--A--T-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-G--T-T-T-CC---C-A-GC-A-TTT-T-GCC----T---------------------------------------------------------T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-C---GC--C------T---A-T-----T-C---T--A--T-C--AG-------TA-CA-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34919 : TAC-A-G---T-CA-T-T-TCT-T--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-TC---A-A-TC-A-ATT-T-GCT-G--T----T--------C----T-A---A-CG-A----G----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--
gi|34920 : TAT-A-G---T-CA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------AT-AGTC-GGACC-A-----T-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-ACCCT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-CG-ATTATA----T-CT--GCCTCC--GT--T------TG--T-ATACAGA-C-C---A-AATT---GC--C------TACAA-T-----T-A---T--A--C-T--AACATGTTCTA-CG-ACGT-T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34921 : TAC-A-G---T-CA-A-T-TCT-C--GA-T--A-------A--A--C-CG-CC-A-----CCTTTTG-T-TC----T-T-T-TG---A-A-TC----TT-T-GGC-A--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-TT--G---GC--G---A------TG--A-A-----T-T-G---A-AT-T---TCCGC------T---A-T-----T-T---T--G--A-A--GA-------AA-C--A-G--T--T-C--TGCCTT-TTTG-T-
gi|34922 : AC-A-A---T-CA-G-C-T-T-C---T-T--AC------A--A--C-GG-C--A-----------G-T-TC-G--T-T-T-CC---A-A-TC-A-TCT-T-GC
gi|34923 : C-A-G---TTCA-G-C-TCT----GT-T--AC------A--A--C-GT-CGGA-----C-----A-T-TC-A--T-T-T-CCT--G-A-TC-A-TTT-T-ACCTA--T----T-------------T-A---A-CG-A----AT---T-CT--G---CC--G---T------AT--T-AAG---A-C-GCAAA-AA-T---GC--C------T---A-------T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CGAA-G--T--T-ATTTTTCCC-TTTG-T-
gi|34924 : C-A-G---T-AA-G-C-TCT-C--GT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TC-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----G--------A----T-A---A-CG-A----ATCTGT-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---T-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TT
gi|34925 : C-A-G---TTCA-G-C-GCT-CTGGT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--TCT-T-CC---A-A-TC-A-TTT-T-GCC-G--T----TAA------A----C-A---A-TG-AT---A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-T-----A-C-G---A-GA-TA--GC--T------T---A-T-----T-T---T--A--C-CA-AG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTGCTC--TTG-T-T
gi|34926 : -A-G---T-CAAG-C-TCT-C--GT-TC-AC------A--A--C-GT-CC-------------G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-G-TC-A-TTT---GCC-GGTT----C--------A----T-A---A-CG-A----A------CT--G---C---------------A--T-A-----A-C-AT--A-AA-T---GC--C------T---C-T-----T-T---------C-C--AAC------TA-CG-A----T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34927 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--A--C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------ATTATT-A---G-C--A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A----C--GG-------TA-AG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34928 : -G-C-TCT-C--AT-T--AC------A--AA-C-GG-CC-A-----C-----G-T-TT-G--T-T-T-CC---G-A-TC-A-TTT-T-ACC-A--T----T--------A----T-
gi|34929 : -C-TCT-C--GTGT--ACTATTGTAT-A--C-GG-CT-A-----A-----G-T-TC-G--T-C-T-TCTG-G-A-TC-A-TTT-T-GCT-G--T----TCTATACTGA----T-AGATA-CG-A----AA---TATT--G---CC--CC--T------TG--T-A-----A-T-G---A-AA-T---GC--C------T---A-TA----T-TTTAT--A--C-C--GG-------TAGCG-ATG--TTGT-A--TTCCCC-TTTG-T-T
gi|34930 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GCC-G--T----T--------A----T-A---A-TG-A----T----T-CT--G---CT--A---T------TG--T-A-----A-C-G---A-AA-C---GA--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTGAT-TTA
gi|34931 : -T-CT---A-A-TT-A-TTT-T-GC--G--T----T-------------T-A---A-TG-A----T----T-CT------CT--A---T------TG----A-----A-------G-AA-C---GA--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-TG-A-GA-T--T-A--TTCCCT-TTT
gi|34932 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A------A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-A------GC--C------------T-----C-T---T--A--C-CA-GA-------AA-CG-G-A--T--T-A--
gi|34933 : -CC---G---TC-A-TTT---GCT-G--T----A--------A------A---A-CG-A----A----T-CT--G---CT--G---T------TG--T-A-----A-C-A---A-A------GC--C------------T-----C-T---T--A--C-CA-GA-------AA-CG-G-A--T--T-A--
gi|34934 : -A-TTT-T-GCT-G--T----T--------A----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----T-C-G---A-TA-T---GT--C------T---A-C-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCC-TTTG-T-TTA
gi|34935 : ----T--------G----T-A---A-CG-A----A----T-CT--G---CC--G---T------TG--T-A-----A-C-G---A-TA-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--TG-------TA-CG-A-G--T--T-A--TTCCCT-TTTG-T-TTA
gi|34936 : A-T---GC--C------T---A-T-----T-T---T--A--C-C--GG-------TA-CG-A-G--C--T-A--TTACAC-TTTG-T-TTA