lowQualScore : 111111111111111 2222222 111 1 33333333333333333333 111111111 1111 111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 1
lowQualScore : 6 111 111111111111111 11 0 7777777 22222222 0 222 111 111 1111 11 22 0 1 11 1 1 0 0 888 5 44444444444444444444 0 0 0 0 0 0 0 1 0 222 0 111 888888888 111 00 3333 00 1 0 777777777 0 0 1 111111 33 1 1111 22 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55 55 2 666 555 999999 3 3 3 5555 3 0 8 3 6
lowQualScore : . ... ............... .. . ....... ........ . ... ... ... .... .. .. . . .. . . . . ... . .................... . . . . . . . . . ... . ... ......... ... .. .... .. . . ......... . . . ...... .. . .... .. ................................................................................................................................................................ .. .. . ... ... ...... . . . .... . . . . .
lowQualScore : 5 666 222222222222222 88 7 0000000 55555555 7 666 000 888 8888 44 55 6 2 44 7 2 6 6 111 1 22222222222222222222 6 6 6 6 6 6 6 1 6 111 6 000 222222222 000 88 4444 88 2 6 777777777 6 6 7 777777 11 7 2222 55 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 00 33 4 555 000 000000 1 3 3 5555 0 8 0 2 7
consensus : TCT-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----CCC---CTC-----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------C--T----G-----C------A--G----T---T-----T-------T--G---A---GG--G-------TG---T---T-------A--A-A-GT--TT---G-------GT---C-A-GCA---ACT------AA-----CCCTC--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGA-AAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
Reference ( gi|27440 ) : TCT-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---G---C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-T-TCGCTCTC-----CTC---CTCG----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------A-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------C--T----G-----C------A--G----T---T-----T-------T--G---A---GG--G-------TG---T---T-------A--A-A-GT--TT---G-------GT---C-A-GCA---ACT------AA-----CCCTC--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27441 : TCT-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---G---C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-T-TCGCTCTC-----CTC---CTCG----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------A-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------C--T----G-----C------A--G----T---T-----T-------T--G---A---GG--G-------TG---T---T-------A--A-A-GT--TT---G-------GT---C-A-GCA---ACT------AA-----CCCTC--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27439 : TCT-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---G---C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-T-TCGCTCTC-----CTC---CTCG----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------A-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------C--T----G-----C------A--G----T---T-----T-------T--G---A---GG--G-------TG---T---T-------A--A-A-GT--TT---G-------GT---C-A-GCA---ACT------AA-----CCCTC--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27443 : TCT-TCTCGTGTCTCTC---T-C---------CTCC--C-T-------C--------TC-TCTTTC---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTCT----CTCT--CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T-------------C------A--G----T---A-----T-------C--A---A---------------TG---T---G-------G--G-A-ATAATC---A-------AT---T-A--CT---GCT------AA--------TC--ACT--GG--A-GCCCAA---A---G--AAT-A-A-AG----GAGTTTG
gi|27444 : TCT-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT----T---C---C--------TC-T----C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-CAT-C-TCTCTCTT-----CTC---TCTA----CTC-T-C-T-C-T-C-T--T-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TCA--C--TCT-C-TCTCGTTCA-T-CT-C-T------C--TT-T----CTCA-TAAAC------T--T----G-----C------AT-G----T---C-----TAAGTTCAT--G---A---GAT-A-------TG---T---T-------A--G-A-GT--------------------------A---A--------AA-----TCCAC--GTTG-TA--A-AC--AA---A---ATCAAT-A-G-AGTTAAAAGTTTTAAAA-AAC-
gi|27488 : TCT-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---G---C--------TC-TT---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-
gi|27445 : tctcttctctctctctctctctctctctcatctctcttctctctcTCTCTCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------G-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CT-----C--T-----------------A--A----T---A-----C-------T--A---A---GGCAG-------TG---T---G-------A--G-A-GT--TT---gtgcgtgttggaagtttttacgtagtaaataattcaattgataaaacgtaaataaa
gi|27446 : TCT-CCTC---TCTCTC---A-TAACCATAACCTCT--C-TTTCG---CCGGTAGAATA-TG---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-------T---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T----------C--T----G-----T---------G----T---T-----T-------T--G---G---AA--G-------TT---T---TTACTATAA--A-A-GT------------------------ACA---ATT------AA-----TA--A--ATT--TA--A-A---AC---A---A--AAT-GCG-AG----ATATCT--AGAAAAC-CTTTT
gi|27447 : TCT-CCTC---TCTCTC-----------------CT--C-T---G---C--------TC-TC---------T---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTCT----CTCT--CTC-----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-CAT------C--TC-C----ATC--T---C------T--T----------T------A--T----T---T-----T-------T--A---A---AG--G-----------------------------G-GG--TT---G-------GT---T-T-GCA---ACTTCCCCGAACACTTCCCTC--CTT--TG--A-A---
gi|27448 : TCT-TTCT---TATCTC---TGT---------CTCT--C-T---GT--C--------TC-TC---T---GCT---CT----C--T--C-C-C--T-C-T-C-T-C-TC-CTCTCT----CTC---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------CC---TC--T----C--TCT-C-T---------T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------G--T----C-----T------A--A--------------T-------T--A---A---AA--A-------TG---C---T-------A--A-A-G
gi|27449 : TCC-TCTC---TCTCTC---C-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-CT-T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TTC---CTCT----CTC-TCC-T-C-T-C-T-CT-CT--T-CT---C-C-------TC---TC--TT---C--TCT-C-T-------CTT-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CAAATAAT--T----A-----C------A--G----TA--T-----T-------T--G---A---------------TG---TA--T-------G--A-A-AT--T
gi|27450 : tcTCC-TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---T---C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TC---T--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---T------C--T----
gi|27498 : TCTCTCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-TCTCTCTCTC-----TCT---CTCG----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-Cttttttttttaggg
gi|27453 : tccTCT-CCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CC-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TT---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CT-----C--T----T-----C------A--G----gtgttgagtgtg
gi|27457 : TCTCTCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---T---C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--TCC-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------
gi|27456 : TCTCTCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-TCC-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TCT--C--TCTCC-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C-----------------------------------T---T-----T-------T--T---A---GG--G-------
gi|27458 : TCT-TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TT---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-TCT-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------
gi|27452 : TCTCTCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TT---C---TCTACTCT----C--T--C-T-C--TCC-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------CC---TC--TC---TGGTCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------C-------G------------A--G----A---T-----T-------T--G---A---
gi|27461 : TCT-TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--TT-C-T-C--T-C-T-C-T-C-TC-CTCTCTCTCTCTT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TCTCTCTCTC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T-------------C------A--T----T---TTC---T-------T--G---A---G
gi|27460 : TCC-TCTT---TCTCTCC--T-T---------CTCT--CCT---G---C--------TC-TCT--C---TCT---CCA---C--T--C---C--T-T-T-C-T-C-TCTCTCTC-----CTCT--CTCG------C-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CTCTCC-T-------CC---TC--TC---C--TCT-G-C-------A-T-CT-CTT------C--TC-T----CTC--T---CT-----C--T----T-----C------A-------------------------T--G---A-------A-------T----T---T-------A--A-A-GT--TA---G-------G
gi|27455 : TCT-CCTC---TCTCTC---C-C---------CTCT--C-----G---C--------TC-TCT--C---TTT---CT----CGCT--C-T-C--T-C-T-C-TCC-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TCT--C--TCTCC-T-------C-T-CT-C-T------C--CC-T----CTT--T---C------A--TAC--G-----C------A--A----C---T-----T-------T--GCT-A---TG--G-------TGACCT---T-------A--A-
gi|27459 : TCT-TCTC---TCTCTC-----T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---C-----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TC-CTCTC-----CTCT--CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------A--T--------------------A----T---T-----T-------T--G---A---G
gi|27454 : TCTCTCTC---TCTCTC---C-T---------CTCT--C-T---CT--C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-TTC--T-C-T-T-C-T-CCTCTCTCT----CTCT--CTC-----TTC-T-C-T-C-T-C-TGCT-C---TTCT---C-TC------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------CTCTC-TATTATTT--TA--T------C--T----G-----C------A--T----C---T-----TTTATC--T--G---A----G--G-------TT---T---T-------A--A-A-G
gi|27451 : CC-TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--TCC-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CGT----T--T----T-----T------A--T----T---T-----T-------T--T---A---GG--G-------
gi|27462 : tccCT-CCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T------------------------C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-----ACTCTC-------T---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------------------------------A----T---T-----T-------T--T---A---AT--G-------TG---T---T-------C--A-A-
gi|27463 : CT-TCTC---TCTCTC-----T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC---T---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-TCTCTCTCTT-----CTCTCTCTC-----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CTCC---T-CT---C-C-------TT---TC--TC---C--TCT-------------T-CT---T------C--TC-T----CTC--T---C---------------------------------------T-----T-------T--G---G---GT--G-------TG---T---T-------A--A-
gi|27464 : CT-TCCC---TATCTC---T-T---------CTCTGCC-T---T---C--------TCCTT---C---TCT---CTTCACC--T--C-TGC--T-C-T-C-T-T-TCCCTCTC------TC---CTCT----TTC-T-CAT-C-T---T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-T-C------T--TC-T----CTC--T----------C--T----G------------------------T-----G-------T--G---A---GGT-G-------TG---T---TGG-----A--T-A-GT--TT---
gi|27466 : CC-TCTC---TCTCTCG--T-T---------CTCT--C-T---C---C--------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C----C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----CTC------------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------CG-TC-T----CTC--T---A------T--C----G-----C------A-------T---T-----T-------C--A---A---G
gi|27465 : CC-TCTC---TCTCTCTCAT-C---------CTCT--C-T-------C--------TC-T----C---TCT---CT----C--T--C-T-C----C-T-C-T-C-TC-CTCTCT----CTC---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TA-------CT-C-T-------A---CT-C-T------C--TC-C----TTT--T---C------T--T-------------------------T---T-----T-------TCAA---A---GG--G-------CG------------------G-G-GT--TTCAAG-------CC---C-C-GCA---ACT------TA-----GTCCC--ATA--TG--A-A---
gi|27467 : T-TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T---C---T--------TC-TC---CTGATCT---CT----C--T--C---C--T-C-T-C-T------CTCTC-----CTC---C---------C-T-C-T-C-T-C-T--T-C---T-C----C-C-------TC---TCGGTC---C--TC------------A-T-CT-CGT------C--TC-T----TTCA-TAA-C------T--T----G-----CATGTATA--G----T---T-----CA------T--G---A----G--A-------TG---T---T-------A--G-G-GT----------------------A-AAA---TCT------AA------------GTT--TGTAA-A---AG---A---A--AATCA-ATAGATC-AAGTTTAAAA--AACTGTTT------TTGT--ACCTTAAAAAA
gi|27468 : -TCTC---TCTCTC---T-----------CTCT--C-T---C---C--------TC-TC---T---CCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-------T---CTC------TC-T-C-T-C---C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-------------CT-C-T------C--TC-T----CTG--A---C------C--T----GATCCCC------A--C----TACCC-----A-------T--G---A---CG--T-------AG---T---T-------A--A-T-TC--TT---AGGGACACGT---C-A-GCA---A-T------AG-------CTT--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27470 : -TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTCATT---C------C--A----G-----A------A--A----T---T-----TA------T--A---A---AGT-G-------TG---C---TGC-----A--A-A-G----T---G-------CT---C-A-GAA---A
gi|27481 : -TCTC---TCTCTC-----T---------CTCT--C-T-------C--------TC-T----C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-T--CTCTT-----CTC---TTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CTCC-T------C--TC-T----CTC--T---CT-----C--T----C-----C------A-----------T-----T-------C--C---A---GT--GAAACCT-TG---T---C-------C--A-A-AT--TC---T-------GT---C-ATGCAC--ACCG-----AG-----CCATC--ATT--TG--
gi|27473 : -TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--T-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TTCT--CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-T---C-CT---C---------TC---TC--TC---T--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TCAT----CTC--T---C------T--T----G-----C------G--GGCATC---T-----T-------T--GTA-A---GG--T-------TG---T---T-------
gi|27474 : -TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T---T---C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTCT----CTC---TTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TCTC----TC---TC--TC---C--TCT-C-C-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CTCT---C--T----G-----C------A--A----T---
gi|27475 : tc-TCTC---TCTCTC---TCT---------CTCT--C-T---C---C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--TT-C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTCTCT--CTC---CTC-----TCC-T-T-T-A-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------CC---TC--CC---C--TC--------------T-CT-C-T------C--TCAT----CCCA-T---T------T--T----A-----C------A--G----T---T-----T-------T--G---A----A--G-------TG---A---T-------C--G-A-GT--TC---G-------
gi|27471 : -TCTC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CT-----C--T----G-----
gi|27476 : -TCTC---TCTCTCC--T-T---------CTCT--C-T---T---C--------TC-TC---C---TCTCT-CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----CTCT--CTCT----CTC-T-C-T-C---C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TCTCTTC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TCTT----CTC--T---CT-----C--T----G-----C------
gi|27477 : CTC---TCTCTC-----T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC--------------------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------G--T----A-----C------A--A----C---A-----A-------T--G---A---AC--G-------GG---G---T-------A--C-A-GT--TT---A-------GT---
gi|27478 : CTC---TCTCTC---T-----------CTCT--C-T---C---C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-CTT-C-T-C-TTACTCTC-------T---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TC---T--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T----------C--T----G-----C------A--T----T---TC----T-------T--GT--A---GG--A-------GG---T---T-------A--
gi|27482 : TC---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TT---C---TCT----T----C--TTAC-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCT------CTT---CTCG-----TC-T-C-T-C-T-C-T-CC-C---T-CT---T-C-------TC---TC--TT---C--TCT-CTT-------A-T-TC-T-T------CA-TC-T----CTT--T---C------T--T----C-----C------T--G----T---T-------------------------G--G-------TG---T------------------G---TT---G-------GT---T-A-CCA-----T------A-------CTTC--ATA--TC--A-A---AGTCCA---A------G-A-AG----AAG-CTGAAGAAAA
gi|27483 : C---TCT-TC---T-T---------CTCTT-C-T---A---C--------TC-TCAT-C---TCT---CT----C--T--C-T-CCTT-C-T-C-T-T----CTCTC-----TCT---CTC-----TTC-T---T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T------------------------C------AATG----T---T-----T-------C--T---A---TG--A-------TA---T---T-------A--A-T-GT--GT---A-------GT---
gi|27484 : C---TCTCTC---T-T---------CTCT--C-T---CTCTC--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-TCTCTCTCTC-----TCT---CTCG----T-C-T-C-T-C-T-C-T-CT-CA--T-CT---C-T--------C---TC--TC------TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTT--T---T------C--T----T-----T------T--T----T---T-----T-------T--T---A---GG--G-------
gi|27480 : C---TCTCTC---T-----------CTCT--C-T-------C--------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-C-------TC---TC--T----C--TCT-C-C---------T-CT-C-T------CA-TT-T----TTG--T---T------C--T----T-----T--------------T---T-----C-------T--A---A---GG--G--------G---------------A--A-G-GC--CG---G-------GT-------GCA---AC-------AATCC--CCCTC--G
gi|27486 : ---TCTCTC---T-----------CTCT--C-T---C---C--------TC-TC---C---TCT---CT----CA-T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TC--------------------------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------CT---CC--TCT--C--TCT-C-T---------T-CT-C-T------CT-TC-T----CTC--T---CT-----C--T----AAT---T------A--G----T---G-----T-------T--G---A---AT--GACAACAATG---T---TG------A--A-A-GC--TT---A-------AA---C-A---A---ATT------AA-------------TT--TG--A-A---A
gi|27487 : CCCCC---C-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-T----CTCTC-----TCT---CTCA----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T--T----C-----C------C--A----T---T-----T-------T--T---A----G--T-------TT---T---T-------G--A-A-GT--
gi|27488 : TCTC---T-T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C--T-CAT-C-T------CTCTT-----CTC------------TC-T-C-T-CTT-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---T--GCT-C-T---------T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C---------------------------------------T-----C-------T--G---T---GC--G-------TG---T---TG------G--A-A-GT--TTTTAC-------GT-----A-GTA---AAT------AA-------TTC--AAT--TG--ATA---AA---ACGTA--AAT-A-A-A
gi|27472 : TCTC---C-----------CTCT--C-T---T---C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------CC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-TCCTCTCC--TC-T----CTC--T---C------C--T-----------------A--G----T---G-----G-------T--A---A---GA--G-------T----T---T-------A--G-G-GT--TC---G-------TT---C-
gi|27442 : -T---------CTCT--C-C---T---C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCT------CTC------------TC-T-C-T-C---C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-------------CT-C-T------C--TC-T----CTG--A---C------C--T----GATCCCC------A--C----TACCC-----A-------T--G---A---CG--T-------AG---T---T-------A--A-T-TC--TT---AGGGACACGT---C-A-GCA---A-T------AG-------CTT--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27490 : -T---------CTCT--C-CAGGG---C--------TC-TT---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCT------CTC-----------TTC-T-C-T-T-C-C-T-CT-C---T-CT---C-T---------------------C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------A--T--------------------G----T---T-----T-------T--G---A------------------------T-------A--A-A-GT--TA---G-------TTACAC-A-A-A---ATT------AA-----TTC-----TT--TA--A-A---AA---ATT-A--AAT-
gi|27469 : -T---------CTCT--C-T-------C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--T----T-C--T-C-T-C-T-C-T--CTCTC-----AT----CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---CGT-------GC---TC--TT---C--T-T-C-C-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------CATT----C-----C------A--G----------------------T--G---A---AAC-C-------TG---T---C-------C--A-A-AT--CT---T-------GT---C-ATGCAC--ACC------GA-----CCATC--ATT--
gi|27491 : tc-T---------TTTT--C-T---G---C--------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TCTCTC--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---T------C--T----C-----T------A--A----TGAAT-----T-------T--G---A---
gi|27492 : ---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-TCT-TCTCTCTC-----TCT---CTCGC---TTC-T-C-T-C-T-C-TCCT-C---T-CT---C---------TC---TC--TC---A--TCT-C-T---------C-CT-C-T------C----------CTC--T---T------C--T----------C------A--T----T---C-----T-------T--A---A---AC--A-------TG---T---TC------A--ATA-GT--CT-----------TT---T-A-GCA---A-T------AA-----
gi|27485 : ---------CTCT--C-T-------C--------TC-TCT--C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTC-----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TC---T--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---T------C--T----
gi|27479 : CT--C-T---G---C--------TC-TC---C---TCT---CT----C--TG-C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC--------------------TC-T-C-T-C-TTC-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---T------C--T----ctctctctctcgtaatgcttgttaaa
gi|27494 : ---C--------TC-TA---C---TCT---CT----C--T--CAT-C--T-C-T-C-T-A-TCTCTCTC-----GTC------------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T--T----GATAA-T------A--G----T---TTCCAAT-------T--T---A---GG--G------------------------A--A-ATGT--TT---G-------AT---T-A-AAA---ATT------AA-----ctctctctctctctctctctctctctcct
gi|27495 : ---C--------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-T-CCTCTCTC-----T-----CTC-----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TT---C--TCT-C-----------T-CT-C-T------C--TC-T----C-C--T---C------T--T----A-----C--------------------------------T--C---A---GG--G-------GG---T--------------A-A-GT--CT---A-------CA---C-A-GCA---A
gi|27489 : --------TC-TC-------TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T---T-C-TCTATCTC-----ATCT--CTCGTCTCTTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-CTCAT-CT---C-T-------TC---TC--TCTTTC--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T--T-----------------A--A----T---T-----T-------C--------------A-------CT---T---T-------A--A-A-GT--TT------------T---C-T-ACA---ATT------G---------TA--TTT--TG--A-A---AA---A---
gi|27493 : C-TG---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---CA-----C--T----G------------A-----------C-----C-------T--G---A---AG--G-------CG---T---A-------A--A-T-GT--TC---A-------GT---CTG-GCT---ACT------A
gi|27496 : -TC---A---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T----------C--T----G-----T------G-----------T-----G-------T--G---T---GT--G-------TG---TTTGT-------ATTA-A-GC--TT---G-------G--------------ACT------TA------CCTC--CTT--C-----A---AA---A---A--AAT-A-A-
gi|27497 : -TT---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----TTC--T---C------T-------------C------A--A----T---T-----T-------T--GGAAA---AG--C-------TG---A---T-------A--A-A-
gi|27498 : -TC---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-------T---CTC-------C-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CG-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T--C----T-----C---------G----T---G-----T-------T--G---A---GT--G-------TG---
gi|27499 : C---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC--------------------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T---------------------C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T----------C--T----G-----T------A--A--------T-----T-------T--G---A---GG--T-------TG-------T-------G--A-A-TT--GT---G-------TT---C-A-CCACATATT------AA-----C
gi|27500 : C---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-TAC-T-C-TCTCTCTT-----CTC---CTC------TCGT-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---T------C--TCTCAG-----T------G--G----T---T-----TG------T--G---A---TG--A--------G---T---T-------T--G-A-GT--TT---G-------
gi|27501 : ---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC--------------------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------A--T----G-----C------A--G----T---C-----A-------T--G---G---TG--G-------TA---T---T-------G--A-
gi|27502 : ---C---TCT---CT----C--T--A-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-TC------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C---------------------------------------T-----C-------T--G---A---TT--G-------GA---T---T-------G--A-A-AT--TT---G-------CT---C-T-GCC---ATT------A
gi|27503 : ---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTA-----CT----CTCG-----TC-T-C-T-C-T-C-T-----------T---C-T-------TC---TC--TC---C--TCT-C-T-------CTT-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---A------C--T-------------------------T---T-----T-------T--T---A---AG--G-------T----T---T-------A--A-A-AT--TG---G-------G
gi|27504 : ---C---TCT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-C-TCTCTCTC-----TCT---CTC------TC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T--TA---G-----C------G--G----G---CA----T-------T--A---A---AG--G-------TG---T---
gi|27505 : CT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-T-T----CTCTC-----TTC----TC-----TTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C-T-------TC---TC--TC------TCT-C-T-----------CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------A--T----G-----C------A--G----T---C-----A-------T--G---G---TG--G-------TA---T---T-------G--A-
gi|27506 : CT---CT----C--T--C-T-C--T-C-T-C-C-T-T--CTCTT-----CTC---CTCT----TTC-T-C-T-C-T-CGT-CT-C---T-CT---C-G-------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-TGCT-C-T---------TC-T----CTC--T---C------CG-T----G-----A------G--G----G---T-----C-------T------C---GG--G-------TG---TA--G-------A--A-A-GG--TC---C-------GC---C-A-GCA---
gi|27507 : CGCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--TCT--C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T---C------T--G----G-----A------A--A----T---T-----T-------G--G---AATTGC--G-------TGGA-T---C-------A--A-A-TT--TT---
gi|27508 : GCTCTC-----TCT---CTCT----CTC-T-C-T-C-T-C-T-CT-C---T-CT---C---------TC---TC--T----C--TCT-C-T-------C-T-CT-C-T------C--TC-T----CTC--T----------C--T----G-----T---------G----T---T-----T-------T--G-------GA--A-------TA---T---T-------A-------T--TT---A-------CT---T-A-GAA---ACG------AA------AGTCAAATTAATGT-A-A---TA---A---A--AAC-A-A-AG----AA
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111 111111111111 111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 1
lowQualScore : 5 111 1 0 8888888 0 333333 2 1111 00000000 0 00 0 0 1 333333 0 1 3333 1 1 0 0 11 0 00 88888 0 111111 0 0 0 333 1111 1 1 0 888888888888 111 333 00 0 1 0 1 00 33333 22 1111 22 1 0 00 3333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 55 2 666 444 888 33 2 3 3 4444 1 7 0 2
lowQualScore : . ... . . ....... . ...... . .... ........ . .. . . . ...... . . .... . . . . .. . .. ..... . ...... . . . ... .... . . . ............ ... ... .. . . . . .. ..... .. .... .. . . .. ....... ......................................................................................................................................... .. .. . ... ... ... .. . . . .... . . . .
lowQualScore : 4 888 0 9 9999999 8 777777 9 5555 66666666 6 88 6 6 8 000000 6 8 1111 2 8 6 6 44 6 88 44444 6 888888 6 6 6 111 2222 1 1 6 999999999999 000 222 88 6 2 6 2 88 00000 00 8888 66 8 6 88 6666666 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 33 4 555 777 333 99 9 1 1 1111 4 1 8 5
consensus : TCT-TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG--T---T--A--AA-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAACGTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
Reference ( family-300 ) : TCT-TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-C-CCC-TC------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG--T---T--A--AA-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGA-AACGTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27439 : TCT-TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CTGCT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-C-TCC-TCG-----TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG--T---T--A--AA-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAACGTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27440 : TCT-TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CTGCT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-C-TCC-TCG-----TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG--T---T--A--AA-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAACGTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27441 : TCT-TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CTGCT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-C-TCC-TCG-----TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG--T---T--A--AA-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAACGTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27442 : T-CT----CTC-------CTCT-C--TC---C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-TCTCC----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C--------C-----T--C----TC--TC-TC-TG--A-------C---------C-T-GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG--T---T--A--AT-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27443 : TCT-TCTCGTGT-CT-CTC-T----CCT-CC------CT-CT----CTCTTTCTCTCTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T---------CA--G----T---A-----T-------CA---A---------------TG--T---G--G--GA-ATAATCA-------ATT-A--C--T---GCT------AA--------T-C--ACT--GG--A-GCCCAA---A---G--AAT-A-A-AG----GAGTTTG
gi|27444 : TCT-TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CTTCCTCTCT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-CAT------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--------C-TA------CTC-TC-TC-T---C----T--TC-TCT-CT-----------TC---TCTCA--C--TCT-C-T-C-T--CGTTCAT--C----TC--TC-TT-TC--TCATAAA-C---------T-T-G-----CAT-G----T---C-----TAAGTTCATG---A---GAT-A-------TG--T---T--A--GA-GT----------------------A---A--------AA-----TCCA-C--GTTG-TA--A-AC--AA---A---ATCAAT-A-G-AGTTAAAAGTTTTAAAA-AAC
gi|27445 : -TCTC---T-CT-CTC-TC---TCT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--G-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CT--------C-T-C-----TA--A----T---A-----C-------TA---A---GGCAG-------TG--T---G--A--GA-GT--TT
gi|27446 : CT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT------------------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TG-TG--T-------T---------T-TGG-----AA--G----T---T-----T-------TT---A-------C-------TA--T---A--A--AA-GT------------------AC--A---ATT------AA--------TAA--ATT--TA--A-A---AC---A---A--AAT-GCG-AG----ATATCT-AGAA-AACCTTTT
gi|27447 : tctcctctctctcataaccataacctctctttcgccggtagaatatgTCT-CCTC---T-CT-CTC-C----TCTGCT------CT-CT----CTC--------TCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--------C-TC------TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--CA---TC--TC-CA-TC--T-------C---------T-T-------TA--T----T---T-----T-------TA---A---AG--G----------------------G-GG--TTG-------GTT-T-GC--A---ACTTCCCCGAACACTTCCCT-C--CTT--TG--A-A---
gi|27448 : TCT-TATC---T-CT-GTC-TC---TCT-GT------CT-CT----CTG-------CTCT-C--TC-C-C-T------C-TC-T----C-TCCT-C-T--CT-CT--C-C-TCT-CT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CC-----------TC---TCTC---T--CTT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TCGTC--T-------
gi|27449 : tcttTCC-TCTC---T-CT-CTC-TC---TCT-CT------CT-CT----CTC-------TTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-C-C-T--CT-CT--------C-TC------CTC-TC-TC-T---C----T-----TCT-CC-----------TC---TCTT---C--TCT-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CAAATAA---T-T-A-----CA--G----TA--T-----T-------TG---A---------------TG--TA--T--G--AA-AT--Taattaaaaatgctaaag
gi|27450 : tctcctctctctcTCT-TCTC---T-CT-CTC------TCT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT------------------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--T--TC-TT--T-------T---------T-T----------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27451 : tcctctctctctcttctcTCTCTCTC---T-CT-CTC-C----TCT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT------------------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--G-------T---------T-T-T-----TA--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27452 : tcccctctctctctcTCTCTCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CTT-------CTCTAC--TC-T-C-T------C-TC-TC---C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCTCT---CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------CC---TCTC---TGGTCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C---G------A--G----A---T-----T-------TG---A---
gi|27453 : TCT-CCTC---T-CT-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-CCT-CTC----------TC---TCTC---T--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------
gi|27454 : -TCTC---T-CT-CTC-TCCTCTCT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TC-T-CTT------C-TC-TTCTCC-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TT------CTC-TC-TC-TG--C----TCTTC-TCT-C------------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TA--TTATTTTAT---------C-T-G-----CA--T----C---T-----TTTATC--TG---A----G--G-------TT--T---T--A--AA-Gtctcttcag
gi|27455 : tcTC-T----CCT-CT------CT-CT----CCC-------CTCT-C--GC-T-C-T------C-TC-T----T-TC-T-C-G--CT-CT--C-T-CTC-TC------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-
gi|27455 : -TCTC---T-CT-CTC-C----TCT-CT------CT-CT----CTCTCT----CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC------CTC-TC-TC-T---C----CC-TC-TTT-Cctctctccctctttcatacgcaactttgctatggtgaccttaa
gi|27456 : tctcctctctctcccctctcgctctctctttctcgcTCT-TCTC---T-CT-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTC--------TCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TT--T-------atacgcaactttgctatggtgaccttaa
gi|27457 : tctctctctctcTCTCTCTC---TTCT-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C--------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-T-------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------ttaggg
gi|27458 : tctctcTCT-TCTC---T-CT-CTC-TC---TCT-CT------CT-CT----CTT-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TCTT-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------
gi|27459 : TCT-TCTC---T-CT-CTC------TCT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C---C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-C-TCT-CT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------A-T-----------A----T---T-----T-------TG---A---G
gi|27460 : TCC-TCTT---T-CT-CTC-C----T-T-CT------CT-C-----CTG-------CTCT-C--TC-T-C-TCCACTCC-TT-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-CTCTC-TCG-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCTCCT-----------CC---TCTC---C--TCTGCAT-C-T--CT----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-T-------CA-------------------------TG---A-------A-------T---T---T--A--AA-GT--TAG-------G
gi|27461 : TCT-TCTC---T-CT-CTC-TC---TCT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TCTT-C-T------C-TC-T----C-TC-TCC-T--CT-CT--C-T-CTC-TT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTCTCTCTCTCTCTC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T---------CA--T----T---TTC---T-------TG---A---G
gi|27462 : C-T----CCT-CT------CT-CT----CTT-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CTACT--C-T-CTC-T-------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C-----------------------A----T---T-----T-------TT---A---AT--G-------TG--T---T--C--AA-
gi|27463 : CT-TCTC---T-CT-CTC-T--------CT------CT-CT----CTC-------TCTT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-T-CTT-CT------CTC-TC-TCTT---C----TC-TC-TCT-CT-----------CC---TCTC---C--TTT-C-TCC-T--C-----TTCT----TC--TC-TC-TC--T-------C--------------------------------T-----T-------TG---G---GT--G-------TG--T---T--A--A
gi|27464 : CT-TCCC---T-AT-CTC-T----TCT-CTG-----CC-TT----CTC-------CT-T-C--TC-T-C-TTCAC--C-TC-TG---C-TC-T-C-T--TT-CC--C-T-CTC-TC------CTC-TT-TC-T---CATCTTC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--T----CT--TC-TC-TC--T-----------------C-T-G------------------T-----G-------TG---A---GGT-G-------TG--T---TGGA--TA-GT--TT
gi|27466 : CC-TCTC---T-CT-CTC-G----T-T-CT------CT-CT----CCT-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TCCT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-C------T------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TCG-TC-TC-TC--T-------A---------T-C-G-----CA-------T---T-----T-------CA---A---G
gi|27467 : T-TCTC---T-CT-CTC------TCT-CT------CT-CT----CTT-------CTCC-TGATC-T-C-T------C-TC------C-TC-T-C-T--CT-CT--C-C-TCC-CT------CTC-TC-T--T---C----TC-CC-TCT-CG-----------GT---CCTC---A--TCT-CGT-C-T--C-----T--T----TCA-TA-AC-TT--G-------C---------A-T-GTA---TA--G----T---T-----CA------TG---A----G--A-------TG--T---T--A--GG-GT----------------A-AA--A---TCT------AA-------------GTT--TGTAA-A---AG---A---A--AATCA-ATAGATC-AAGTTTAAAAA-ACTGTTT------TTGT--ACCTTAAAAAA
gi|27468 : T-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTC-------TCCT-C--TC-TCC-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-TC--C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C--------C-----T--C----TC--TC-TC-TG--A-------C---------C-T-GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG--T---T--A--AT-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27469 : -TCTC---T-CT-CTC------TCT-C-------CT-CT----CTC-------TTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----CATC-T-C-T--CT-CT------------------CTC-TC-TC-T---C----TC-GT-GCT-CT-----------TC---TTCC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-CA-T---T-------C-------------------CA--G----------------------TG---A---AAC-C-------TG--T---C--C--AA-AT--CTT-------GTC-ATGC--AC--ACC------GA-----CCAT-C--ATT--
gi|27470 : -TCTC---T-CT-CTC------TCT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TCATT-------C---------C-A-G-----AA--A----T---T-----TA------TA---A---AGT-G-------TG--C---TGCA--AA-G----TG-------CTC-A-GA--A---A
gi|27471 : -TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CT--------C-T-G-----
gi|27472 : -TCTC---C-CT-CTC-T----TCT-CT------C--CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-T-------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CC-----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--CCTCTCC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T--------A--G----T---G-----G-------TA---A---GA--G-------T---T---T--A--GG-GT--TCG-------TTC-
gi|27473 : -TCTC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------TT-CT----CT-------------C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC------TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTCTTCCTC----TC---TCTC---T--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCATC-TC--T-------C---------T-T-G-----CG--GGCATC---T-----T-------TGTA-A---GG--T-------TG--T---T--
gi|27474 : -TCTC---T-CT-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTT-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCTCTCTTCTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTCTCTC------TC---TCTC---C--TCT-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CTCT------C-T-G-----CA--A----T---
gi|27475 : TCTCTCTC---T-CT-CTC-C----TCT-CT------CT-CT----CTC-------TTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT----C-CTC-TC------CTT-TA-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------------CTC---C--CCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--AT-CC-CA--T-------T---------T-T-A-----CA--G----T---T-----T-------TG---A----A--G-------TG--A---T--C--GA-GT--TCG-------
gi|27476 : tctctc-TCTC---T-CT-CTCCT----TCT-CT------CT--T----CTC-------TCCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--CTC-TCC-TCT-----CTC-TC-TC-TCTCC----TC-TC-TCT-CT-----------TCTCTTCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCTTC-TC--T-------CT--------C-T-G-----C
gi|27477 : CT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------G-T-A-----CA--A----C---A-----A-------TG---A---AC--G-------GG--G---T--A--CA-GT--TTA-------GT
gi|27478 : -CT-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TT-CT-CTTAC-T-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTT---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-T---------------------C-T-G-----CA--T----T---TC----T-------TGT--A---GG--A-------GG--T---T--A--
gi|27479 : TCT-CCTC---T-CT-CTG-C----TCT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T--------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------
gi|27480 : ctctgc-CT----CTC--------TCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-T-------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT--T-----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C--------C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------C-T-tcct
gi|27481 : TCTCTCTC---T-CT-CTC------TCT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-----------C-TT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----TC-C----TC--TC-TC-TC--T-------CT--------C-T-C-----CA-----------T-----T-------CC---A---GT--GAAACCT-TG--T---C--C--AA-AT--TCT-------GTC-ATGC--AC--ACCG-----AG-----CCAT-C--ATT--TG--ctctcatttttgttctttttctaaggggaaggccgggtgcaacaatccccctcg
gi|27482 : TC---T-CT-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CTT-------CTCT-------T-C-T------T-AC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TT------CTCGTC-TC-T---C----TC-TC-CCT-CT-----------TC---TCTC---T--TCT-C-T-C-TTAT-----T--C----TTCATC-TC-TT--T-------C---------T-T-C-----CT--G----T---T-----------------------G--G-------TG--T------------G---TTG-------GTT-A-CC--A-----T------A-------CTT-C--ATA--TC--A-A---AGTCCA---A------G-A-AG----AAG-CTGAAGA-AA
gi|27483 : C---T-CT--TC-T----TCT-CTT-----CTACT----CTC-------ATCT-C--TC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-CTT--CT-CT--C-T-CTC-TC------TTC-T--TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T---------------------------CAATG----T---T-----T-------CT---A---TG--A-------TA--T---T--A--AT-GT--GTA-------GTa
gi|27484 : -TCTC---T-CTTCTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----CTTC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC------GTC-TC-TC-T---C----TC-TCATCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TT--T-------T---------C-T-T-----TT--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27485 : cCTC---T-CT-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTC--------TCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-C---C-T-CTC-T-------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--CTCT--T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-C-G-----TA--A----T---G-----C-------T--------------------TG--T---T--A--AA-
gi|27486 : ----TCT-CT------CT-CT----CTC-------CTCT-C---C-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCC-TC-----------TC---TCTC---T--TCT-C-T-C-T--------T--C----TC--TC-TC-TC--T-------A---------A-T-------TA--G----T---G-----T-------TG---A---AT--GACAACAATG--T---TG-A--AA-GC--TTA-------AAC-A-----A---ATT------AA--------------TT--TG--A-A---A
gi|27487 : tc-CC-CCC-C----TCT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-T-CTCATT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------T---------C-C-------CA--T----T---T-----T-------T--------AG--T-------TT--T---T--G--AA-GT--
gi|27488 : T-CTC-T----TCT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T---T-CT--C-T-CTC-TC------TTC-TC-TC-T---C----TCTTC-TCT-CT-----------GC---TCTT---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T------------------------G-T-G-----C---G----T---G-----T-------TG---G---AA--G-------TT--T---T--T--AC-GT----------------A-GT--A---AAT------AA-------TT-C--AAT--TG--ATA---AA---ACGTA--AAT-A-A-A
gi|27489 : T-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTC-------TTCT-C--TA-T-C-T------CATC-T----C-TCGT-C-T---------------C-TT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TCATCT-CT-----------TC---TCTCTTTC--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-T--------A--A----T---T-----T-------C------------A-------CT--T---T--A--AA-GT--TT---------TC-T-AC--A---ATT------G---------T-A--TTT--TG--A-A---AA---A---
gi|27490 : T-CT------CT-CCAGGGCTC-------TTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TT------CTC-TT-CC-T---C----TC-TC-TCT--------------------------C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------A-T-----------G----T---T-----T-------TG---A-----------------------T--A--AA-G---TTA-------GTT-ACACAAA---ATT------AA-----TTC------TT--TA--A-A---AA---ATT-A--AAT-
gi|27491 : TCT-GCTC---T-CT-CTC-T-----CT-CT------CT-CT----CTCT------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCT----C--TCT-C-T---T--C-----T--C----T
gi|27492 : tttt-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TT------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-GCT-TC-----------TC---TCTC---T--CCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCATC-TC--T-------C---------C-T-aatgaatttga
gi|27493 : -C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-C-A-----CT--G----A---C-----C-------TG---A---AG--G-------CG--T---A--A--AT-GT--TCA-------GTCTG-GC--T---ACT------Actcctcttctcattcttaaacatgttcaatagtcttttagcaataa
gi|27494 : ctg-CT----CTA-------CTCT-C--TC-T-CAT------C-TC-T----C-TA-T-C-T--CT-CT--CGT-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC------------------TC---TCTC---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-T-GATAA-TA--G----T---TTCCAAT-------TT---A---GG--G------------------A--AATGT--TTG-------ATT-A-AA--A---ATT------AA-----
gi|27495 : -------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TTCCT-CT--C-T-CTC-TC------TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---TCTT---C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-----C--T-------C---------T-T-A-----C--------------------------TC---A---GG--G-------GG--T---------AA-GT--CTA-------CAC-A-GC--A---A
gi|27496 : TC-A----TCT-CT------CT-CT----CT--------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT------------------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------------------C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-----------------C-T-G-----TG-----------T-----G-------TG---T---GT--G-------TG--TTTGT--ATTAA-GC--TTG-------G-------------ACT------TA------CCT-C--CTT--C-----A---AA---A---A--AAT-A-A-
gi|27497 : T-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TT--T-------C---------T-C-T-----CA--A----T---T-----T-------TGGAAA---AG--C-------TG--A---T--A--AA-
gi|27498 : tTC-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT------CTC-TC------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-TC-----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-G--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-C-----------G----T---G-----T-------TG---A---GT--G-------TG--
gi|27499 : -C-CTC-TCT-----CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CTCTCTCTCTC-T-G-----TA--A--------T-----T-------TG---A---GG--T-------TG------T--G--AA-TT--GTG-------TTC-A-CC--ACATATT------AA-----C
gi|27500 : C-------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-TA---C-TC-T-C-T--CT-CT--T-C-TCC-TC------TCG-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT------------C---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TT--C-------T---------C-T-------CA--G----TGG-T-----T-------TG---T---GAT-G-------AG--T---T--T--GA-GT--TTG-------
gi|27501 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------A-T-G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA--T---T--G--A
gi|27502 : -C--TC-T-C-T------C-TA-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CTCT------C-T----------------C---T-----C-------TG---A---TT--G-------GA--T---T--G--AA-AT--TTG-------CTC-T-GC--C---ATT------A
gi|27503 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TA------CTC-TCGTC-T---C----TC-TC-T-T-CT-----------TC---TCTC---C--TCT-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------A---------C-T----------------T---T-----T-------TT---A---AG--G-------T---T---T--A--AA-AT--TGG-------G
gi|27504 : -------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-TAG-----CG--G----G---CA----T-------TA---A---AG--G-------TG--T---
gi|27505 : CT-C--TC-T-C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT-------TC-TC------TTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CT-----------TC---T------C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------A-T-G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA--T---T--G--A
gi|27506 : -------CTCT-C--TC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-C-T---T-CT--C-C-TCT-TT------CTC-TC-TC-----G----TC-TC-TCT-CG-----------TC---TCT----C--TCT-C-T-C-T--C-----TG-C----TCT-TC-TC-TC--T-------C---------CGT-G-----AG--G----G---T-----C-------T----C---GG--G-------TG--TA--G--A--AA-GG--TCC-------GCC-A-GC--A---
gi|27507 : -C-T--CT-CT--C-T-CTC-TC-------TC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-C------------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------C---------T-G-G-----AA--A----T---T-----T-------GG---AATTGC--G-------TGGAT---C--A--AA-TT--TT
gi|27508 : cg------CTC-TC-TC-T---C----TC-TC-TCT-CTC----------TC---TCTCT--C--TCT-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-TC-TC--T-------CTCTCTCT--C-T-G-----T---G----T---T-----T-------TG-------GA--A-------TA--T---T--A------T--TTA-------CTT-A-GA--A---ACG------AA------AGT-CAAATTAATGT-A-A---TA---A---A--AAC-A-A-AG----AA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27465 ): CCTCTCTCTCTCTCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTCTACTCTACTCTCTCCTTTTCTTTTTTCAAAGGGCGGGGTTTCAAGCCCCGCAACTTAGTCCCATATGAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 11111111 1111111 111111111111 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111
lowQualScore : 3 111 1 1 55555555555555 0 555555 2 1111 11111111 2222222 0 0 0 1 222222 0 1 2222 1 1 0 0 11 0 11 0 1 0 3333333 0 0 0 33333 2222 1 1 0 999999999999 11111 111 00 333 0 1 0 0 1 11 22222 11 1111 11 1 00 0 00 4444444 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 55 2 666 444 888 33 2 3 3 4444 1 7 6 0 2
lowQualScore : . ... . . .............. . ...... . .... ........ ....... . . . . ...... . . .... . . . . .. . .. . . . ....... . . . ..... .... . . . ............ ..... ... .. ... . . . . . .. ..... .. .... .. . .. . .. ....... ................................................................................................................................................ .. .. . ... ... ... .. . . . .... . . . . .
lowQualScore : 3 777 7 6 77777777777777 7 444444 8 5555 66666666 1111111 6 6 6 7 999999 6 7 4444 1 1 6 6 33 6 99 6 1 6 3333333 6 6 6 55555 3333 7 1 6 555555555555 44444 000 88 888 6 1 6 6 7 99 55555 33 8888 99 7 88 6 88 0000000 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 33 4 555 777 333 99 9 1 1 1111 4 9 7 8 5
consensus : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
Reference ( family-300 ) : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27439 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27440 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27441 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27442 : T-CT----CTC-------C-------TCT-CTC---C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-TCTC--C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C--------C-----T--C----TC--TC-T--C-TG--A-------C-------C--T------GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG---T-T-------AA-T-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27443 : TCT-TCTCGTGTCT-CTC-T----C---------CT-CC------CT-CT----CTCTTTCTCTC-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T---------------CA--G----T---A-----T-------CA---A---------------TG---T-G-------GG-A-ATAATCA-------ATT-A--C--T---GCT------AA--------T-C--ACT--GG--A-GCCCAA---A---G--AAT-A-A-AG----GAGTTTG
gi|27444 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CTTCCTCTCT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-CAT------C-TC-T----C-TC-T----------T--C-TC-TC-TA------CTC-TC-TC-T-----C----T--TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TCA--CTC-T-C-T-C-T--CGTTCAT--C----TC--TC-T--T-TC--TCATAAA-C-------T--T------G-----CAT-G----T---C-----TAAGTTCATG---A---GAT-A-------TG---T-T-------AG-A-GT----------------------A---A--------AA-----TCCA-C--GTTG-TA--A-AC--AA---A---ATCAAT-A-G-AGTTAAAAGTTTTAAAA-AAC-
gi|27445 : -TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--G-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------C-----TA--A----T---A-----C-------TA---A---GGCAG-------TG---T-G-------AG-A-GT--TT
gi|27446 : TCT-CCTC---TCT-CTC-A----TAACCATAACCT-CT------CT-TT----CGC-------CGGTAGAATATGCTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC----------TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----T---G----T---T-----T-------TG---G---AA--G-------TT---T-TTACTATAAA-A-GT------------------AC--A---ATT------AA--------TAA--ATT--TA--A-A---AC---A---A--AAT-GCG-AG----ATATCT--AGAAAAC-CTTTT
gi|27447 : TCT-CCTC---TCT-CTC-C----T---------CTGCT------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-T-----------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--CA---TC--TC-C--A-TC--T-------C-------T--T------------TA--T----T---T-----T-------TA---A---AG--G-------------------------G-GG--TTG-------GTT-T-GC--A---ACTTCCCCGAACACTTCCCT-C--CTT--TG--A-A---
gi|27448 : TCT-TATC---TCT-GTC-TC---T---------CT-GT------CT-CT----CTG-------C-------TCT-CTC-C-C-T------C-TC-T----C-TCCT-C-T--CT-CT--C--C-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TC---TCT-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--CGTC--T-------
gi|27449 : tcttTCT-CCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--TC-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----T-----TCT-CC-----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CAAATAA-T--T------A-----CA--G----TA--T-----T-------TG---A---------------TG---TAT-------GA-A-AT--Taattaaaaatgctaaag
gi|27450 : tctcctctctcTCT-TCTC---TCTTCTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-------------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--T--T--C-TT--T-------T-------T--T---------------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27451 : tcctctctctcCC-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC------C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CGT-----T--T------T-----TA--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27452 : tccTCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CTACTCT-CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT---------------------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TG---GTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C---------G------A--G----A---T-----T-------TG---A---
gi|27453 : tctctctctctcTCT-CCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-CCT-CTC----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------
gi|27454 : -TCTC---TCT-CTC-TCCTCT---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-CTT------C-TC-TTCTCC-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-TG----C----TCTTC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TA--TTATTTTAT-------C--T------G-----CA--T----C---T-----TTTATC--TG---A----G--G-------TT---T-T-------AA-A-Gtctcttcag
gi|27455 : tcTCT-CCTC---TCT-CTC-C----C---------CT-CT------CG-CT----CTCT------C-------TTT-CTC-G-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-TC-C-----T--C----TC--TC-T--C-CC--T-------C-------T--TTCATACG-----CA--A----C---T-----T-------TGCT-A---TG--G-------TGACCT-T-------AA-
gi|27456 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TC---CTC-T----------C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C--------------------------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27457 : tctctctctctc----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTC-T------------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------
gi|27457 : tcTCTCTCTC---TCT-CTC-T----C---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--ctctctctctctctctctc
gi|27458 : tctctctctctctcttctctcttctcTCT-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TCTT-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------
gi|27459 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-C-C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C--C-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T----------------A----T---T-----T-------TG---A---G
gi|27460 : TCC-TCTT---TCT-CTC-C----T----------T-CT------CT-C-----CTG-------C-------TCT-CTC-T-C-TCCACTCC-TT-T----C-TC-T-C-T--CT-CTC-C-TC-TC-TCG-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCTCCT-----------C-----C---TC--TC---CTC-TGCAT-C-T--CT----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T------------CA-------------------------TG---A-------A-------T----T-T-------AA-A-GT--TAG-------G
gi|27461 : TCT-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTCTT-C-T------C-TC-T----C-TC-TCC-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTCTCTCTCTCT-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T---------------CA--T----T---TTC---T-------TG---A---G
gi|27462 : C-T----C---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CTACT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C---------------------------A----T---T-----T-------TT---A---AT--G-------TG---T-T-------CA-A-
gi|27463 : CT-TCTC---TCT-CTC-T-----------------CT------CT-CT----CTC-------T-------CTT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-TC-TT-CT------CTC-TC-TCTT-----C----TC-TC-TCT-CT-----------C-----C---TC--TC---CTT-T-C-TCC-T--C-----TTCT----TC--TC-T--C-TC--T-------C------------------------------------T-----T-------TG---G---GT--G-------TG---T-T-------AA-
gi|27464 : CT-TCCC---TAT-CTC-T----T---------CT-CTG-----CC-TT----CTC-------C-------T-T-CTC-T-C-TTCAC--C-TC-TG---C-TC-T-C-T--TT-CC--C-TC-TC-TC------CTC-TT-TC-T-----CATCTTC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--T----CT--TC-T--C-TC--T---------------C--T------G------------------T-----G-------TG---A---GGT-G-------TG---T-TGG-----AT-A-GT--TT
gi|27465 : C-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-A----T-CC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-------C----TC-TC-TCC-TC-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--T------
gi|27465 : -TCTC---TCT-CTCAT----C---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C--C-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-TC-TC-CT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TA---CTC-TAC-T-C-T--C-----T--C----CT--TT-T--C-TT--T-------ctactctactctctccttttcttttttcaaagggcggggtttcaagccccgcaacttagtcccatatgaa
gi|27466 : cctcCTC---TCT-CTC-T--------------CG-TT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----CCTC-T-C-T--CT-CT--C-TCCTC-TCT-----CTC-TC-TC-T--------------C-TCT-CT-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TCG-TC-T--C-TC--T-------A-------T--C------G-----CA-------T---T-----T-------CA---A---Gtttcaaagggcggggtttcaagccccgcaacttagtcccatatgaa
gi|27467 : cT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCC-TGA-T-C-T------C-TC-T----C-----------CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-CC-TC-T-----C----TCTTC-TC--CC-----------T-----C---TCGGTC---CTCAT-C-T-CGT--C-----T--C----TT--TCATAAC-TT--G-------C-------A--T------GTA---TA--G----T---T-----CA------TG---A----G--A-------TG---T-T-------AG-G-GT----------------A-AA--A---TCT------AA-------------GTT--TGTAA-A---AG---A---A--AATCA-ATAGATC-AAGTTTAAAA--AACTGTTT------TTGT--ACCTTAAAAAA
gi|27468 : T-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------CCT-CTC-TCC-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-TC----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C--------C-----T--C----TC--TC-T--C-TG--A-------C-------C--T------GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG---T-T-------AA-T-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27469 : T------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC---C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------ATC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------CTCGTGC---TC--TT---CT--T-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------CATT------C-----CA--G----------------------TG---A---AAC-C-------TG---T-C-------CA-A-AT--CTT-------GTC-ATGC--AC--ACC------GA-----CCAT-C--ATT--
gi|27470 : -TCTC---TCT-CTC------T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TCATT-------C-------C--A------G-----AA--A----T---T-----TA------TA---A---AGT-G-------TG---C-TGC-----AA-A-G----TG-------CTC-A-GA--A---A
gi|27471 : -TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----
gi|27472 : -TCTC---CCT-CTC-T----T---------CT-CT------C--CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--CCTCTCC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T-------------A--G----T---G-----G-------TA---A---GA--G-------T----T-T-------AG-G-GT--TCG-------TTC-
gi|27473 : -TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------TT-CT----CT--------------------CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTTCCTC----T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCAT--C-TC--T-------C-------T--T------G-----CG--GGCATC---T-----T-------TGTA-A---GG--T-------TG---T-T-------
gi|27474 : -TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCTCTCTTCTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTCTC------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCT----C--T------G-----CA--A----T---
gi|27475 : TCTCTCTC---TCT-CTC-C----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C--C-TC-TC------CTT-TA-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C-----------------------C--TC---CCC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--AT-C--C-CA--T-------T-------T--T------A-----CA--G----T---T-----T-------TG---A----A--G-------TG---A-T-------CG-A-GT--TCG-------
gi|27476 : tctctc-TCTC---TCT-CTCCT----T---------CT-CT------CT--T----CTC-------T-------CCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-CT------CTC-TC-TC-TCTCTCC----TC-TC-TCT-CT-----------T-----CTCTTC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCTT--C-TC--T-------CT------C--T------G-----C
gi|27477 : ---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------G--T------A-----CA--A----C---A-----A-------TG---A---AC--G-------GG---G-T-------AC-A-GT--TTA-------GT
gi|27478 : CT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TT-CT-CTTAC-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-T-------------------C--T------G-----CA--T----T---TC----T-------TGT--A---GG--A-------GG---T-T-------A
gi|27479 : TCT-CCTC---TCT-CTG-C----T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T--------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TCTCTCTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------
gi|27480 : ctctgcCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-T----------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C---C-T--C-----T--C----TCA-TT-T--T-TG--T-------T-------C--T------T-----T--------T---T-----C-------TA---A---GG--G--------G-------------AA-G-GC--CGG-------GT----GC--A---AC-------AATCC--CCCT-C--G
gi|27481 : TCTCTCTC---TCT-CTC------T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---------------TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----TC-C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------C-----CA-----------T-----T-------CC---A---GT--GAAACCT-TG---T-C-------CA-A-AT--TCT-------GTC-ATGC--AC--ACCG-----AG-----CCAT-C--ATT--TG--
gi|27482 : TC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-----T-C-T------T-AC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTCGTC-TC-T-----C----TC-TC-CCT-CT-----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-TTAT-----T--C----TTCATC-T--C-TT--T-------C-------T--T------C-----CT--G----T---T-----------------------G--G-------TG---T--------------G---TTG-------GTT-A-CC--A-----T------A-------CTT-C--ATA--TC--A-A---AGTCCA---A------G-A-AG----AAG-CTGAAGAAAA
gi|27483 : C---TCT--TC-T----T---------CT-CTT-----CTACT----CTC-------A-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-CTT--CT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-T--TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------------------------------CAATG----T---T-----T-------CT---A---TG--A-------TA---T-T-------AA-T-GT--GTA-------GT
gi|27484 : -TCTC---TCTTCTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----CTTC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------GTC-TC-TC-T-----C----TC-TCATCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--T-------T-------C--T------T-----TT--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27485 : cCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--C--CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-TC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--CT----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C------G-----TA--A----T---G-----C-------T--------------------TG---T-T-------AA-A-
gi|27486 : ----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-C-C-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCC-TC-----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--------T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------A-------A--T------------TA--G----T---G-----T-------TG---A---AT--GACAACAATG---T-TG------AA-A-GC--TTA-------AAC-A-----A---ATT------AA--------------TT--TG--A-A---A
gi|27487 : tcCC-CCC-C----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-TC-TCATT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--C------------CA--T----T---T-----T-------T--------AG--T-------TT---T-T-------GA-A-GT--
gi|27488 : T-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T---T-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TCTTC-TCT-CT-----------G-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T------------------------G--T------G-----C---G----T---G-----T-------TG---G---AA--G-------TT---T-T-------TA-C-GT----------------A-GT--A---AAT------AA-------TT-C--AAT--TG--ATA---AA---ACGTA--AAT-A-A-A
gi|27489 : T-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTA-T-C-T------CATC-T----C-TC---------------G-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TCATCT-CT-----------T-----C---TC--TCTTTCTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T-------------A--A----T---T-----T-------C------------A-------CT---T-T-------AA-A-GT--TT---------TC-T-AC--A---ATT------G---------T-A--TTT--TG--A-A---AA---A---
gi|27490 : T-CT------CT-CCAGGGCTC-------T-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TT-CC-T-----C----TC-TC-TCT---------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T----------------G----T---T-----T-------TG---A----------------------T-------AA-A-G---TTA-------GTT-ACACAAA---ATT------AA-----TTC------TT--TA--A-A---AA---ATT-A--AAT-
gi|27491 : TT---TTT-CTG-C----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----CT---TC-TC-TCT-CT------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--T------C-----TA--A----TGAAT-----T-------TG---A---
gi|27492 : -CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TCTT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-GC-TT------CTC-TC-TC-T-----C-----C-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---ATC-T-C-T-C----C-----T--C----TC--------C-TC--T-------T-------C--T------------CA--T----T---C-----T-------TA---A---AC--A-------TG---T-TC------AATA-GT--CT--------TTT-A-GC--A---A-T------AA-----
gi|27493 : -CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C------A-----CT--G----A---C-----C-------TG---A---AG--G-------CG---T-A-------AA-T-GT--TCA-------GTCTG-GC--T---ACT------A
gi|27494 : ctg-CT----CTA-------C-------TCT-CTC-T-CAT------C-TC-T----C-TA-T-C-T--CT-CT--CGTC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC------------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T------GATAA-TA--G----T---TTCCAAT-------TT---A---GG--G----------------------AA-ATGT--TTG-------ATT-A-AA--A---ATT------AA-----
gi|27495 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TTCCT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-------C--T-------C-------T--T------A-----C--------------------------TC---A---GG--G-------GG---T----------A-A-GT--CTA-------CAC-A-GC--A---A
gi|27496 : TC-A----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--G-TG--TG------T-------G--T------G-----TGT-G----T---T-----T--------------------G-------TA---T-T--------A-A-GC--TTG-------G-------------ACT------TA------CCT-C--CTT--C-----A---AA---A---A--AAT-A-A-
gi|27497 : T-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--T-------C-------T--C------T-----CA--A----T---T-----T-------TGGAAA---AG--C-------TG---A-T-------AA-A-
gi|27498 : tCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-TC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-G--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C----------------G----T---G-----T-------TG---A---GT--G-------TG---
gi|27499 : tc----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----TA--A--------T-----T-------TG---A---GG--T-------TG-----T-------GA-A-TT--GTG-------TTC-A-CC--ACATATT------AA-----C
gi|27500 : cC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-TA---C-TC-T-C-T--CT-CTT-C-TCCTC-TC------GTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--C-------T-------C--T------------CA--G----TGG-T-----T-------TG---T---GAT-G-------AG---T-T-------TG-A-GT--TTG-------
gi|27501 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T------G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA---T-T-------GA-
gi|27502 : -CTC-T-C-T------C-TA-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCT----C--T---------------------C---T-----C-------TG---A---TT--G-------GA---T-T-------GA-A-AT--TTG-------CTC-T-GC--C---ATT------A
gi|27503 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TA------CTC-TCGTC-T-----C----TC-TC-T-T-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------A-------C--T---------------------T---T-----T-------TT---A---AG--G-------T----T-T-------AA-A-AT--TGG-------G
gi|27504 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--TA-----G-----CG--G----G---CA----T-------TA---A---AG--G-------TG---T-
gi|27505 : -CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-T--TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---T--------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T------G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA---T-T-------GA-
gi|27506 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-C-T---T-CT--C--C-TC-TT-------TC-TC-TC-T-----CG---TC-TC-TCT-CG-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-TG-C-----T--C----T---TC-T--C-TC--T-------C-------CG-T------G-----AG--G----G---T-----C-------T----C---GG--G-------TG---TAG-------AA-A-GG--TCC-------GCC-A-GC--A---
gi|27507 : -C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--G------G-----AA--A----T---T-----T-------GG---AATTGC--G-------TGGA-T-C-------AA-A-TT--TT
gi|27508 : cg------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCTCTCTC--T------G-----T---G----T---T-----T-------TG-------GA--A-------TA---T-T-------A-----T--TTA-------CTT-A-GA--A---ACG------AA------AGT-CAAATTAATGT-A-A---TA---A---A--AAC-A-A-AG----AA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 11111111 1111111 111111111111 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111
lowQualScore : 3 111 1 1 55555555555555 0 555555 2 1111 11111111 2222222 0 0 0 1 222222 0 1 2222 1 1 0 0 11 0 11 0 1 0 3333333 0 0 0 33333 2222 1 1 0 999999999999 11111 111 00 333 0 1 0 0 1 11 22222 11 1111 11 1 00 0 00 4444444 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 55 2 666 444 888 33 2 3 3 4444 1 7 6 0 2
lowQualScore : . ... . . .............. . ...... . .... ........ ....... . . . . ...... . . .... . . . . .. . .. . . . ....... . . . ..... .... . . . ............ ..... ... .. ... . . . . . .. ..... .. .... .. . .. . .. ....... ................................................................................................................................................ .. .. . ... ... ... .. . . . .... . . . . .
lowQualScore : 3 777 7 6 77777777777777 7 444444 8 5555 66666666 1111111 6 6 6 7 999999 6 7 4444 1 1 6 6 33 6 99 6 1 6 3333333 6 6 6 55555 3333 7 1 6 555555555555 44444 000 88 888 6 1 6 6 7 99 55555 33 8888 99 7 88 6 88 0000000 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 33 4 555 777 333 99 9 1 1 1111 4 9 7 8 5
consensus : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
Reference ( family-300 ) : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27439 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27440 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27441 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27442 : T-CT----CTC-------C-------TCT-CTC---C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-TCTC--C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C--------C-----T--C----TC--TC-T--C-TG--A-------C-------C--T------GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG---T-T-------AA-T-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27443 : TCT-TCTCGTGTCT-CTC-T----C---------CT-CC------CT-CT----CTCTTTCTCTC-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T---------------CA--G----T---A-----T-------CA---A---------------TG---T-G-------GG-A-ATAATCA-------ATT-A--C--T---GCT------AA--------T-C--ACT--GG--A-GCCCAA---A---G--AAT-A-A-AG----GAGTTTG
gi|27444 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CTTCCTCTCT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-CAT------C-TC-T----C-TC-T----------T--C-TC-TC-TA------CTC-TC-TC-T-----C----T--TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TCA--CTC-T-C-T-C-T--CGTTCAT--C----TC--TC-T--T-TC--TCATAAA-C-------T--T------G-----CAT-G----T---C-----TAAGTTCATG---A---GAT-A-------TG---T-T-------AG-A-GT----------------------A---A--------AA-----TCCA-C--GTTG-TA--A-AC--AA---A---ATCAAT-A-G-AGTTAAAAGTTTTAAAA-AAC-
gi|27445 : -TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--G-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------C-----TA--A----T---A-----C-------TA---A---GGCAG-------TG---T-G-------AG-A-GT--TT
gi|27446 : TCT-CCTC---TCT-CTC-A----TAACCATAACCT-CT------CT-TT----CGC-------CGGTAGAATATGCTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC----------TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----T---G----T---T-----T-------TG---G---AA--G-------TT---T-TTACTATAAA-A-GT------------------AC--A---ATT------AA--------TAA--ATT--TA--A-A---AC---A---A--AAT-GCG-AG----ATATCT--AGAAAAC-CTTTT
gi|27447 : TCT-CCTC---TCT-CTC-C----T---------CTGCT------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-T-----------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--CA---TC--TC-C--A-TC--T-------C-------T--T------------TA--T----T---T-----T-------TA---A---AG--G-------------------------G-GG--TTG-------GTT-T-GC--A---ACTTCCCCGAACACTTCCCT-C--CTT--TG--A-A---
gi|27448 : TCT-TATC---TCT-GTC-TC---T---------CT-GT------CT-CT----CTG-------C-------TCT-CTC-C-C-T------C-TC-T----C-TCCT-C-T--CT-CT--C--C-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TC---TCT-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--CGTC--T-------
gi|27449 : tcttTCT-CCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--TC-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----T-----TCT-CC-----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CAAATAA-T--T------A-----CA--G----TA--T-----T-------TG---A---------------TG---TAT-------GA-A-AT--Taattaaaaatgctaaag
gi|27450 : tctcctctctcTCT-TCTC---TCTTCTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-------------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--T--T--C-TT--T-------T-------T--T---------------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27451 : tcctctctctcCC-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC------C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CGT-----T--T------T-----TA--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27452 : tccTCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CTACTCT-CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT---------------------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TG---GTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C---------G------A--G----A---T-----T-------TG---A---
gi|27453 : tctctctctctcTCT-CCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-CCT-CTC----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------
gi|27454 : -TCTC---TCT-CTC-TCCTCT---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-CTT------C-TC-TTCTCC-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-TG----C----TCTTC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TA--TTATTTTAT-------C--T------G-----CA--T----C---T-----TTTATC--TG---A----G--G-------TT---T-T-------AA-A-Gtctcttcag
gi|27455 : tcTCT-CCTC---TCT-CTC-C----C---------CT-CT------CG-CT----CTCT------C-------TTT-CTC-G-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-TC-C-----T--C----TC--TC-T--C-CC--T-------C-------T--TTCATACG-----CA--A----C---T-----T-------TGCT-A---TG--G-------TGACCT-T-------AA-
gi|27456 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TC---CTC-T----------C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C--------------------------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27457 : tctctctctctc----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTC-T------------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------
gi|27457 : tcTCTCTCTC---TCT-CTC-T----C---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--ctctctctctctctctctc
gi|27458 : tctctctctctctcttctctcttctcTCT-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TCTT-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------
gi|27459 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-C-C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C--C-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T----------------A----T---T-----T-------TG---A---G
gi|27460 : TCC-TCTT---TCT-CTC-C----T----------T-CT------CT-C-----CTG-------C-------TCT-CTC-T-C-TCCACTCC-TT-T----C-TC-T-C-T--CT-CTC-C-TC-TC-TCG-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCTCCT-----------C-----C---TC--TC---CTC-TGCAT-C-T--CT----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T------------CA-------------------------TG---A-------A-------T----T-T-------AA-A-GT--TAG-------G
gi|27461 : TCT-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTCTT-C-T------C-TC-T----C-TC-TCC-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTCTCTCTCTCT-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T---------------CA--T----T---TTC---T-------TG---A---G
gi|27462 : C-T----C---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CTACT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C---------------------------A----T---T-----T-------TT---A---AT--G-------TG---T-T-------CA-A-
gi|27463 : CT-TCTC---TCT-CTC-T-----------------CT------CT-CT----CTC-------T-------CTT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-TC-TT-CT------CTC-TC-TCTT-----C----TC-TC-TCT-CT-----------C-----C---TC--TC---CTT-T-C-TCC-T--C-----TTCT----TC--TC-T--C-TC--T-------C------------------------------------T-----T-------TG---G---GT--G-------TG---T-T-------AA-
gi|27464 : CT-TCCC---TAT-CTC-T----T---------CT-CTG-----CC-TT----CTC-------C-------T-T-CTC-T-C-TTCAC--C-TC-TG---C-TC-T-C-T--TT-CC--C-TC-TC-TC------CTC-TT-TC-T-----CATCTTC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--T----CT--TC-T--C-TC--T---------------C--T------G------------------T-----G-------TG---A---GGT-G-------TG---T-TGG-----AT-A-GT--TT
gi|27465 : C-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-A----T-CC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-------C----TC-TC-TCC-TC-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--T------
gi|27465 : -TCTC---TCT-CTCAT----C---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C--C-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-TC-TC-CT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TA---CTC-TAC-T-C-T--C-----T--C----CT--TT-T--C-TT--T-------ctactctactctctccttttcttttttcaaagggcggggtttcaagccccgcaacttagtcccatatgaa
gi|27466 : cctcCTC---TCT-CTC-T--------------CG-TT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----CCTC-T-C-T--CT-CT--C-TCCTC-TCT-----CTC-TC-TC-T--------------C-TCT-CT-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TCG-TC-T--C-TC--T-------A-------T--C------G-----CA-------T---T-----T-------CA---A---Gtttcaaagggcggggtttcaagccccgcaacttagtcccatatgaa
gi|27467 : cT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCC-TGA-T-C-T------C-TC-T----C-----------CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-CC-TC-T-----C----TCTTC-TC--CC-----------T-----C---TCGGTC---CTCAT-C-T-CGT--C-----T--C----TT--TCATAAC-TT--G-------C-------A--T------GTA---TA--G----T---T-----CA------TG---A----G--A-------TG---T-T-------AG-G-GT----------------A-AA--A---TCT------AA-------------GTT--TGTAA-A---AG---A---A--AATCA-ATAGATC-AAGTTTAAAA--AACTGTTT------TTGT--ACCTTAAAAAA
gi|27468 : T-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------CCT-CTC-TCC-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-TC----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C--------C-----T--C----TC--TC-T--C-TG--A-------C-------C--T------GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG---T-T-------AA-T-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27469 : T------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC---C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------ATC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------CTCGTGC---TC--TT---CT--T-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------CATT------C-----CA--G----------------------TG---A---AAC-C-------TG---T-C-------CA-A-AT--CTT-------GTC-ATGC--AC--ACC------GA-----CCAT-C--ATT--
gi|27470 : -TCTC---TCT-CTC------T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TCATT-------C-------C--A------G-----AA--A----T---T-----TA------TA---A---AGT-G-------TG---C-TGC-----AA-A-G----TG-------CTC-A-GA--A---A
gi|27471 : -TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----
gi|27472 : -TCTC---CCT-CTC-T----T---------CT-CT------C--CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--CCTCTCC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T-------------A--G----T---G-----G-------TA---A---GA--G-------T----T-T-------AG-G-GT--TCG-------TTC-
gi|27473 : -TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------TT-CT----CT--------------------CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTTCCTC----T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCAT--C-TC--T-------C-------T--T------G-----CG--GGCATC---T-----T-------TGTA-A---GG--T-------TG---T-T-------
gi|27474 : -TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCTCTCTTCTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTCTC------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCT----C--T------G-----CA--A----T---
gi|27475 : TCTCTCTC---TCT-CTC-C----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C--C-TC-TC------CTT-TA-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C-----------------------C--TC---CCC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--AT-C--C-CA--T-------T-------T--T------A-----CA--G----T---T-----T-------TG---A----A--G-------TG---A-T-------CG-A-GT--TCG-------
gi|27476 : tctctc-TCTC---TCT-CTCCT----T---------CT-CT------CT--T----CTC-------T-------CCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-CT------CTC-TC-TC-TCTCTCC----TC-TC-TCT-CT-----------T-----CTCTTC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCTT--C-TC--T-------CT------C--T------G-----C
gi|27477 : ---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------G--T------A-----CA--A----C---A-----A-------TG---A---AC--G-------GG---G-T-------AC-A-GT--TTA-------GT
gi|27478 : CT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TT-CT-CTTAC-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-T-------------------C--T------G-----CA--T----T---TC----T-------TGT--A---GG--A-------GG---T-T-------A
gi|27479 : TCT-CCTC---TCT-CTG-C----T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T--------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TCTCTCTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------
gi|27480 : ctctgcCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-T----------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C---C-T--C-----T--C----TCA-TT-T--T-TG--T-------T-------C--T------T-----T--------T---T-----C-------TA---A---GG--G--------G-------------AA-G-GC--CGG-------GT----GC--A---AC-------AATCC--CCCT-C--G
gi|27481 : TCTCTCTC---TCT-CTC------T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---------------TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----TC-C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------C-----CA-----------T-----T-------CC---A---GT--GAAACCT-TG---T-C-------CA-A-AT--TCT-------GTC-ATGC--AC--ACCG-----AG-----CCAT-C--ATT--TG--
gi|27482 : TC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-----T-C-T------T-AC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTCGTC-TC-T-----C----TC-TC-CCT-CT-----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-TTAT-----T--C----TTCATC-T--C-TT--T-------C-------T--T------C-----CT--G----T---T-----------------------G--G-------TG---T--------------G---TTG-------GTT-A-CC--A-----T------A-------CTT-C--ATA--TC--A-A---AGTCCA---A------G-A-AG----AAG-CTGAAGAAAA
gi|27483 : C---TCT--TC-T----T---------CT-CTT-----CTACT----CTC-------A-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-CTT--CT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-T--TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------------------------------CAATG----T---T-----T-------CT---A---TG--A-------TA---T-T-------AA-T-GT--GTA-------GT
gi|27484 : -TCTC---TCTTCTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----CTTC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------GTC-TC-TC-T-----C----TC-TCATCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--T-------T-------C--T------T-----TT--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27485 : cCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--C--CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-TC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--CT----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C------G-----TA--A----T---G-----C-------T--------------------TG---T-T-------AA-A-
gi|27486 : ----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-C-C-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCC-TC-----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--------T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------A-------A--T------------TA--G----T---G-----T-------TG---A---AT--GACAACAATG---T-TG------AA-A-GC--TTA-------AAC-A-----A---ATT------AA--------------TT--TG--A-A---A
gi|27487 : tcCC-CCC-C----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-TC-TCATT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--C------------CA--T----T---T-----T-------T--------AG--T-------TT---T-T-------GA-A-GT--
gi|27488 : T-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T---T-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TCTTC-TCT-CT-----------G-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T------------------------G--T------G-----C---G----T---G-----T-------TG---G---AA--G-------TT---T-T-------TA-C-GT----------------A-GT--A---AAT------AA-------TT-C--AAT--TG--ATA---AA---ACGTA--AAT-A-A-A
gi|27489 : T-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTA-T-C-T------CATC-T----C-TC---------------G-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TCATCT-CT-----------T-----C---TC--TCTTTCTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T-------------A--A----T---T-----T-------C------------A-------CT---T-T-------AA-A-GT--TT---------TC-T-AC--A---ATT------G---------T-A--TTT--TG--A-A---AA---A---
gi|27490 : T-CT------CT-CCAGGGCTC-------T-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TT-CC-T-----C----TC-TC-TCT---------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T----------------G----T---T-----T-------TG---A----------------------T-------AA-A-G---TTA-------GTT-ACACAAA---ATT------AA-----TTC------TT--TA--A-A---AA---ATT-A--AAT-
gi|27491 : TT---TTT-CTG-C----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----CT---TC-TC-TCT-CT------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--T------C-----TA--A----TGAAT-----T-------TG---A---
gi|27492 : -CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TCTT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-GC-TT------CTC-TC-TC-T-----C-----C-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---ATC-T-C-T-C----C-----T--C----TC--------C-TC--T-------T-------C--T------------CA--T----T---C-----T-------TA---A---AC--A-------TG---T-TC------AATA-GT--CT--------TTT-A-GC--A---A-T------AA-----
gi|27493 : -CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C------A-----CT--G----A---C-----C-------TG---A---AG--G-------CG---T-A-------AA-T-GT--TCA-------GTCTG-GC--T---ACT------A
gi|27494 : ctg-CT----CTA-------C-------TCT-CTC-T-CAT------C-TC-T----C-TA-T-C-T--CT-CT--CGTC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC------------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T------GATAA-TA--G----T---TTCCAAT-------TT---A---GG--G----------------------AA-ATGT--TTG-------ATT-A-AA--A---ATT------AA-----
gi|27495 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TTCCT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-------C--T-------C-------T--T------A-----C--------------------------TC---A---GG--G-------GG---T----------A-A-GT--CTA-------CAC-A-GC--A---A
gi|27496 : TC-A----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--G-TG--TG------T-------G--T------G-----TGT-G----T---T-----T--------------------G-------TA---T-T--------A-A-GC--TTG-------G-------------ACT------TA------CCT-C--CTT--C-----A---AA---A---A--AAT-A-A-
gi|27497 : T-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--T-------C-------T--C------T-----CA--A----T---T-----T-------TGGAAA---AG--C-------TG---A-T-------AA-A-
gi|27498 : tCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-TC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-G--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C----------------G----T---G-----T-------TG---A---GT--G-------TG---
gi|27499 : tc----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----TA--A--------T-----T-------TG---A---GG--T-------TG-----T-------GA-A-TT--GTG-------TTC-A-CC--ACATATT------AA-----C
gi|27500 : cC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-TA---C-TC-T-C-T--CT-CTT-C-TCCTC-TC------GTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--C-------T-------C--T------------CA--G----TGG-T-----T-------TG---T---GAT-G-------AG---T-T-------TG-A-GT--TTG-------
gi|27501 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T------G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA---T-T-------GA-
gi|27502 : -CTC-T-C-T------C-TA-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCT----C--T---------------------C---T-----C-------TG---A---TT--G-------GA---T-T-------GA-A-AT--TTG-------CTC-T-GC--C---ATT------A
gi|27503 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TA------CTC-TCGTC-T-----C----TC-TC-T-T-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------A-------C--T---------------------T---T-----T-------TT---A---AG--G-------T----T-T-------AA-A-AT--TGG-------G
gi|27504 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--TA-----G-----CG--G----G---CA----T-------TA---A---AG--G-------TG---T-
gi|27505 : -CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-T--TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---T--------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T------G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA---T-T-------GA-
gi|27506 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-C-T---T-CT--C--C-TC-TT-------TC-TC-TC-T-----CG---TC-TC-TCT-CG-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-TG-C-----T--C----T---TC-T--C-TC--T-------C-------CG-T------G-----AG--G----G---T-----C-------T----C---GG--G-------TG---TAG-------AA-A-GG--TCC-------GCC-A-GC--A---
gi|27507 : -C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--G------G-----AA--A----T---T-----T-------GG---AATTGC--G-------TGGA-T-C-------AA-A-TT--TT
gi|27508 : cg------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCTCTCTC--T------G-----T---G----T---T-----T-------TG-------GA--A-------TA---T-T-------A-----T--TTA-------CTT-A-GA--A---ACG------AA------AGT-CAAATTAATGT-A-A---TA---A---A--AAC-A-A-AG----AA
blockSeqs : C GTG T A TAACCATAAC TCCTCT G AGGG CTTTCTCT GGTAGAA A CCACTC A TCTC C C TC TA C TCTCTTC CTCTC ATCT T A TCTCTCTCTCTC TCGTG TCT G T TA GTTCA TC CTCT CA A TATTTTA CTGATCCCCACTACCCATGACGTAGTTAATTCTTAGGGACACGTCAGCAATAGCTTG AA TA T CCC TCC CGT TC C C T TTAA G C T C
blockSeqs : C . T C CCTCT ACTCT G . CT . T TCAC A G T T T C C GT CTC T T A TCTTCCTC . TTT A G C T C A G A CATAAA CTGATCCCCACTACCCATGACGTAGTTAATTCTTAGGGACACGTCAGCAATAGCTTG G T . C . TT . . . . ATC G C . C
blockSeqs : C . . . CT G A . CT . A . T A . . . T . GT G G T . TCTCTC . A . T G T . . A T G TCTCCATTCCAGTGAAACCTTGTCCAAATTCTGTCATGCACACCGAGCCATCA . . . . . . . . . . . G A . .
blockSeqs : . . . . CT T . . CT . . . . . . . . . . TC C . . . TC . T . . . . . . . . . TTTATTTTTAAAGGGGGTTGGTTTGCAACTTCCCCGAACACTTCCCTCC . . . . . . . . . . . T A .
blockSeqs : . . . . CT . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . TCTCTCTCTGTGTTTTGGAATATTATTTACTTAGAAACGAAAGTCAAA . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . CT . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . CATTCCAGTGAAACCTGTCCAAATCTTGTCATGCACACCGACCATCA . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . CT . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . CTGCAGTTTTGAGGGTGTTAAAGTTTGGTCAGCAACTAACCCTCG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CT . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . CTGCAGTTTTGAGGGTGTTAAAGTTTGGTCAGCAACTAACCCTCG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CT . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . ATTAGTGTTGAATGACAACAATGTTGAAAGCTTAAACAAATTAA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . TTGCATGTCTAAGTTCATGAGATATGTTAGAGTAAAATCCACG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . CT . . . . . . . . . . GC . . . . TC . T . . . . . . . . . TCTGTGTTTTGGAAGTTTTTACTATAAAAGTACAATTAATAAA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . CTTTTTCTAAGGGGAAGGCCGGGTGCAACAATCCCCCTCG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . TCAGTATCAATGTGGGAATAATCAATTACTGCTAATCA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . CT . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . ATGTATAGTTCATGAGATGTTAGGGTAAAATCTAAG . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . TC . . . . TC . T . . . . . . . . . GTGCGTGTTGGAAGTTTTTACGTAGTAAATAATTCA . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . C . . . . . . . . . . TC . . . . T . T . . . . . . . . . ATGTTTTGATAAAGTTAGTTACACAAAATTAATTC . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . TC . . . . T . T . . . . . . . . . TTAATTTCACTTTAAAGTTTTCTACAATTGTAT . .
blockSeqs : . . . . C . . . C . . . . . . . . . . TC . . . . T . T . . . . . . . . . GTGTGTGTTTGTATTAAGCTTGGACTTACCTCC .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . T . . . . . . . . . TTCCTGTTGGTGTGTTGGTTACCATACTTCA
blockSeqs : . . . . C . . . G . . . . . . . . . . C . . . . C . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . C . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . C . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . T . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . G . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . T . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . T . . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . C . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . T . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : C******
originalCons : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
finalCons : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCC------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 11111111 1111111 111111111111 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111
lowQualScore : 3 111 1 1 55555555555555 0 555555 2 1111 11111111 2222222 0 0 0 1 222222 0 1 2222 1 1 0 0 11 0 11 0 1 0 3333333 0 0 0 33333 2222 1 1 0 999999999999 11111 111 00 333 0 1 0 0 1 11 22222 11 1111 11 1 00 0 00 4444444 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 55 2 666 444 888 33 2 3 3 4444 1 7 6 0 2
lowQualScore : . ... . . .............. . ...... . .... ........ ....... . . . . ...... . . .... . . . . .. . .. . . . ....... . . . ..... .... . . . ............ ..... ... .. ... . . . . . .. ..... .. .... .. . .. . .. ....... ................................................................................................................................................ .. .. . ... ... ... .. . . . .... . . . . .
lowQualScore : 3 777 7 6 77777777777777 7 444444 8 5555 66666666 1111111 6 6 6 7 999999 6 7 4444 1 1 6 6 33 6 99 6 1 6 3333333 6 6 6 55555 3333 7 1 6 555555555555 44444 000 88 888 6 1 6 6 7 99 55555 33 8888 99 7 88 6 88 0000000 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 33 4 555 777 333 99 9 1 1 1111 4 9 7 8 5
consensus : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
Reference ( family-300 ) : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27439 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27440 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27441 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CTGCT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TT-T-C-G--CT-CT--C-CT-CC-TCG-----TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-A-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------G-----CA--G----T---T-----T-------TG---A---GG--G-------TG---T-T-------AA-A-GT--TTG-------GTC-A-GC--A---ACT------AA-----CCCT-C--GTT--TG--A-A---AA---A---A--AAT-A-A-AG----AAGTCTGAAGACAAC-GTTTTCCTAGTTGTCCACTTTGGAAAATGCATCTGTTTGGCCTACCTGTCTTAAAATGGCTACAATTTCCGACTACTTGACATTATCTTTATATATTATT
gi|27442 : T-CT----CTC-------C-------TCT-CTC---C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-TCTC--C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C--------C-----T--C----TC--TC-T--C-TG--A-------C-------C--T------GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG---T-T-------AA-T-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27443 : TCT-TCTCGTGTCT-CTC-T----C---------CT-CC------CT-CT----CTCTTTCTCTC-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T---------------CA--G----T---A-----T-------CA---A---------------TG---T-G-------GG-A-ATAATCA-------ATT-A--C--T---GCT------AA--------T-C--ACT--GG--A-GCCCAA---A---G--AAT-A-A-AG----GAGTTTG
gi|27444 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CTTCCTCTCT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-CAT------C-TC-T----C-TC-T----------T--C-TC-TC-TA------CTC-TC-TC-T-----C----T--TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TCA--CTC-T-C-T-C-T--CGTTCAT--C----TC--TC-T--T-TC--TCATAAA-C-------T--T------G-----CAT-G----T---C-----TAAGTTCATG---A---GAT-A-------TG---T-T-------AG-A-GT----------------------A---A--------AA-----TCCA-C--GTTG-TA--A-AC--AA---A---ATCAAT-A-G-AGTTAAAAGTTTTAAAA-AAC-
gi|27445 : -TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--G-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------C-----TA--A----T---A-----C-------TA---A---GGCAG-------TG---T-G-------AG-A-GT--TT
gi|27446 : TCT-CCTC---TCT-CTC-A----TAACCATAACCT-CT------CT-TT----CGC-------CGGTAGAATATGCTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC----------TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----T---G----T---T-----T-------TG---G---AA--G-------TT---T-TTACTATAAA-A-GT------------------AC--A---ATT------AA--------TAA--ATT--TA--A-A---AC---A---A--AAT-GCG-AG----ATATCT--AGAAAAC-CTTTT
gi|27447 : TCT-CCTC---TCT-CTC-C----T---------CTGCT------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-T-----------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--CA---TC--TC-C--A-TC--T-------C-------T--T------------TA--T----T---T-----T-------TA---A---AG--G-------------------------G-GG--TTG-------GTT-T-GC--A---ACTTCCCCGAACACTTCCCT-C--CTT--TG--A-A---
gi|27448 : TCT-TATC---TCT-GTC-TC---T---------CT-GT------CT-CT----CTG-------C-------TCT-CTC-C-C-T------C-TC-T----C-TCCT-C-T--CT-CT--C--C-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TC---TCT-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--CGTC--T-------
gi|27449 : tcttTCT-CCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT--TC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--TC-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----T-----TCT-CC-----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CAAATAA-T--T------A-----CA--G----TA--T-----T-------TG---A---------------TG---TAT-------GA-A-AT--Taattaaaaatgctaaag
gi|27450 : tctcctctctcTCT-TCTC---TCTTCTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-T-------------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--T--T--C-TT--T-------T-------T--T---------------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27451 : tcctctctctcCC-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC------C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CGT-----T--T------T-----TA--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27452 : tccTCT-TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CTACTCT-CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT---------------------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TG---GTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C---------G------A--G----A---T-----T-------TG---A---
gi|27453 : tctctctctctcTCT-CCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-CCT-CTC----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------
gi|27454 : -TCTC---TCT-CTC-TCCTCT---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-CTT------C-TC-TTCTCC-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-TG----C----TCTTC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TA--TTATTTTAT-------C--T------G-----CA--T----C---T-----TTTATC--TG---A----G--G-------TT---T-T-------AA-A-Gtctcttcag
gi|27455 : tcTCT-CCTC---TCT-CTC-C----C---------CT-CT------CG-CT----CTCT------C-------TTT-CTC-G-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-TC-C-----T--C----TC--TC-T--C-CC--T-------C-------T--TTCATACG-----CA--A----C---T-----T-------TGCT-A---TG--G-------TGACCT-T-------AA-
gi|27456 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TC---CTC-T----------C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C--------------------------------T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27457 : tctctctctctc----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTC-T------------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------
gi|27457 : tcTCTCTCTC---TCT-CTC-T----C---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--ctctctctctctctctctc
gi|27458 : tctctctctctctcttctctcttctcTCT-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TCTT-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------
gi|27459 : TCT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-C-C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C----CT-CT--C--C-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T----------------A----T---T-----T-------TG---A---G
gi|27460 : TCC-TCTT---TCT-CTC-C----T----------T-CT------CT-C-----CTG-------C-------TCT-CTC-T-C-TCCACTCC-TT-T----C-TC-T-C-T--CT-CTC-C-TC-TC-TCG-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCTCCT-----------C-----C---TC--TC---CTC-TGCAT-C-T--CT----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T------------CA-------------------------TG---A-------A-------T----T-T-------AA-A-GT--TAG-------G
gi|27461 : TCT-TCTC---TCT-CTC-TC---T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTCTT-C-T------C-TC-T----C-TC-TCC-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTCTCTCTCTCT-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T---------------CA--T----T---TTC---T-------TG---A---G
gi|27462 : C-T----C---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CTACT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C---------------------------A----T---T-----T-------TT---A---AT--G-------TG---T-T-------CA-A-
gi|27463 : CT-TCTC---TCT-CTC-T-----------------CT------CT-CT----CTC-------T-------CTT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-TC-TT-CT------CTC-TC-TCTT-----C----TC-TC-TCT-CT-----------C-----C---TC--TC---CTT-T-C-TCC-T--C-----TTCT----TC--TC-T--C-TC--T-------C------------------------------------T-----T-------TG---G---GT--G-------TG---T-T-------AA-
gi|27464 : CT-TCCC---TAT-CTC-T----T---------CT-CTG-----CC-TT----CTC-------C-------T-T-CTC-T-C-TTCAC--C-TC-TG---C-TC-T-C-T--TT-CC--C-TC-TC-TC------CTC-TT-TC-T-----CATCTTC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--T----CT--TC-T--C-TC--T---------------C--T------G------------------T-----G-------TG---A---GGT-G-------TG---T-TGG-----AT-A-GT--TT
gi|27465 : C-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-A----T-CC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-------C----TC-TC-TCC-TC-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--T------
gi|27465 : -TCTC---TCT-CTCAT----C---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C--C-T----C-TC-T-C----CT-CT--C-TC-TC-CT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TA---CTC-TAC-T-C-T--C-----T--C----CT--TT-T--C-TT--T-------ctactctactctctccttttcttttttcaaagggcggggtttcaagccccgcaacttagtcccatatgaa
gi|27466 : cctcCTC---TCT-CTC-T--------------CG-TT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----CCTC-T-C-T--CT-CT--C-TCCTC-TCT-----CTC-TC-TC-T--------------C-TCT-CT-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TCG-TC-T--C-TC--T-------A-------T--C------G-----CA-------T---T-----T-------CA---A---Gtttcaaagggcggggtttcaagccccgcaacttagtcccatatgaa
gi|27467 : cT-TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCC-TGA-T-C-T------C-TC-T----C-----------CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-CC-TC-T-----C----TCTTC-TC--CC-----------T-----C---TCGGTC---CTCAT-C-T-CGT--C-----T--C----TT--TCATAAC-TT--G-------C-------A--T------GTA---TA--G----T---T-----CA------TG---A----G--A-------TG---T-T-------AG-G-GT----------------A-AA--A---TCT------AA-------------GTT--TGTAA-A---AG---A---A--AATCA-ATAGATC-AAGTTTAAAA--AACTGTTT------TTGT--ACCTTAAAAAA
gi|27468 : T-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------CCT-CTC-TCC-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-TC----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C--------C-----T--C----TC--TC-T--C-TG--A-------C-------C--T------GATCCCCA--C----TACCC-----A-------TG---A---CG--T-------AG---T-T-------AA-T-TC--TTAGGGACACGTC-A-GC--A---A-T------AG-------CT-T--GAT--TG--A-A---AA---A---C--AAT-A-A-AG----
gi|27469 : T------CT-CT----CTC---------------TCT-CTC---C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------ATC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------CTCGTGC---TC--TT---CT--T-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------CATT------C-----CA--G----------------------TG---A---AAC-C-------TG---T-C-------CA-A-AT--CTT-------GTC-ATGC--AC--ACC------GA-----CCAT-C--ATT--
gi|27470 : -TCTC---TCT-CTC------T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TCATT-------C-------C--A------G-----AA--A----T---T-----TA------TA---A---AGT-G-------TG---C-TGC-----AA-A-G----TG-------CTC-A-GA--A---A
gi|27471 : -TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----
gi|27472 : -TCTC---CCT-CTC-T----T---------CT-CT------C--CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--CCTCTCC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T-------------A--G----T---G-----G-------TA---A---GA--G-------T----T-T-------AG-G-GT--TCG-------TTC-
gi|27473 : -TCTC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------TT-CT----CT--------------------CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTTCCTC----T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCAT--C-TC--T-------C-------T--T------G-----CG--GGCATC---T-----T-------TGTA-A---GG--T-------TG---T-T-------
gi|27474 : -TCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCTCTCTTCTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTCTCTC------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-C-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCT----C--T------G-----CA--A----T---
gi|27475 : TCTCTCTC---TCT-CTC-C----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C--C-TC-TC------CTT-TA-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C-----------------------C--TC---CCC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--AT-C--C-CA--T-------T-------T--T------A-----CA--G----T---T-----T-------TG---A----A--G-------TG---A-T-------CG-A-GT--TCG-------
gi|27476 : tctctc-TCTC---TCT-CTCCT----T---------CT-CT------CT--T----CTC-------T-------CCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-CT------CTC-TC-TC-TCTCTCC----TC-TC-TCT-CT-----------T-----CTCTTC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TCTT--C-TC--T-------CT------C--T------G-----C
gi|27477 : ---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------G--T------A-----CA--A----C---A-----A-------TG---A---AC--G-------GG---G-T-------AC-A-GT--TTA-------GT
gi|27478 : CT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TT-CT-CTTAC-TC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-T-------------------C--T------G-----CA--T----T---TC----T-------TGT--A---GG--A-------GG---T-T-------A
gi|27479 : TCT-CCTC---TCT-CTG-C----T---------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T--------TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TCTCTCTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------C--T------
gi|27480 : ctctgcCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-T----------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CC-----------T-----C---TC--T----CTC-T-C---C-T--C-----T--C----TCA-TT-T--T-TG--T-------T-------C--T------T-----T--------T---T-----C-------TA---A---GG--G--------G-------------AA-G-GC--CGG-------GT----GC--A---AC-------AATCC--CCCT-C--G
gi|27481 : TCTCTCTC---TCT-CTC------T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---------------TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----TC-C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------C-----CA-----------T-----T-------CC---A---GT--GAAACCT-TG---T-C-------CA-A-AT--TCT-------GTC-ATGC--AC--ACCG-----AG-----CCAT-C--ATT--TG--
gi|27482 : TC---TCT-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CTT-------C-------TCT-----T-C-T------T-AC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTCGTC-TC-T-----C----TC-TC-CCT-CT-----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-TTAT-----T--C----TTCATC-T--C-TT--T-------C-------T--T------C-----CT--G----T---T-----------------------G--G-------TG---T--------------G---TTG-------GTT-A-CC--A-----T------A-------CTT-C--ATA--TC--A-A---AGTCCA---A------G-A-AG----AAG-CTGAAGAAAA
gi|27483 : C---TCT--TC-T----T---------CT-CTT-----CTACT----CTC-------A-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-CTT--CT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-T--TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------------------------------CAATG----T---T-----T-------CT---A---TG--A-------TA---T-T-------AA-T-GT--GTA-------GT
gi|27484 : -TCTC---TCTTCTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----CTTC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------GTC-TC-TC-T-----C----TC-TCATCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--T-------T-------C--T------T-----TT--T----T---T-----T-------TT---A---GG--G-------
gi|27485 : cCTC---TCT-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--C--CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-TC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--CT----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C------G-----TA--A----T---G-----C-------T--------------------TG---T-T-------AA-A-
gi|27486 : ----T---------CT-CT------CT-CT----CTC-------C-------TCT-C-C-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCC-TC-----------T-----C---TC--TC---TTC-T-C-T-C-T--------T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------A-------A--T------------TA--G----T---G-----T-------TG---A---AT--GACAACAATG---T-TG------AA-A-GC--TTA-------AAC-A-----A---ATT------AA--------------TT--TG--A-A---A
gi|27487 : tcCC-CCC-C----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-T--T-C-T--CT-CT--C-TC-TCATT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--C------------CA--T----T---T-----T-------T--------AG--T-------TT---T-T-------GA-A-GT--
gi|27488 : T-CTC-T----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TCAT----C-TC-T-C-T---T-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TCTTC-TCT-CT-----------G-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T------------------------G--T------G-----C---G----T---G-----T-------TG---G---AA--G-------TT---T-T-------TA-C-GT----------------A-GT--A---AAT------AA-------TT-C--AAT--TG--ATA---AA---ACGTA--AAT-A-A-A
gi|27489 : T-CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTC-------T-------TCT-CTA-T-C-T------CATC-T----C-TC---------------G-TC-TC-TT------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TCATCT-CT-----------T-----C---TC--TCTTTCTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T-------------A--A----T---T-----T-------C------------A-------CT---T-T-------AA-A-GT--TT---------TC-T-AC--A---ATT------G---------T-A--TTT--TG--A-A---AA---A---
gi|27490 : T-CT------CT-CCAGGGCTC-------T-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TT------CTC-TT-CC-T-----C----TC-TC-TCT---------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T----------------G----T---T-----T-------TG---A----------------------T-------AA-A-G---TTA-------GTT-ACACAAA---ATT------AA-----TTC------TT--TA--A-A---AA---ATT-A--AAT-
gi|27491 : TT---TTT-CTG-C----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----CT---TC-TC-TCT-CT------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------T-------C--T------C-----TA--A----TGAAT-----T-------TG---A---
gi|27492 : -CTC-T--------------CT-CT------CT-CT----CTCT------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TCTT----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-GC-TT------CTC-TC-TC-T-----C-----C-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TC---ATC-T-C-T-C----C-----T--C----TC--------C-TC--T-------T-------C--T------------CA--T----T---C-----T-------TA---A---AC--A-------TG---T-TC------AATA-GT--CT--------TTT-A-GC--A---A-T------AA-----
gi|27493 : -CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C------A-----CT--G----A---C-----C-------TG---A---AG--G-------CG---T-A-------AA-T-GT--TCA-------GTCTG-GC--T---ACT------A
gi|27494 : ctg-CT----CTA-------C-------TCT-CTC-T-CAT------C-TC-T----C-TA-T-C-T--CT-CT--CGTC-TC-TCT-----CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC------------------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--T------GATAA-TA--G----T---TTCCAAT-------TT---A---GG--G----------------------AA-ATGT--TTG-------ATT-A-AA--A---ATT------AA-----
gi|27495 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-TTCCT-CT--C-TC-TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---TC--TT---CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-------C--T-------C-------T--T------A-----C--------------------------TC---A---GG--G-------GG---T----------A-A-GT--CTA-------CAC-A-GC--A---A
gi|27496 : TC-A----T---------CT-CT------CT-CT----CT--------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-T-------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT------------------------------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--G-TG--TG------T-------G--T------G-----TGT-G----T---T-----T--------------------G-------TA---T-T--------A-A-GC--TTG-------G-------------ACT------TA------CCT-C--CTT--C-----A---AA---A---A--AAT-A-A-
gi|27497 : T-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--T-------C-------T--C------T-----CA--A----T---T-----T-------TGGAAA---AG--C-------TG---A-T-------AA-A-
gi|27498 : tCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-TC-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-G--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--C----------------G----T---G-----T-------TG---A---GT--G-------TG---
gi|27499 : tc----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CT------C--T------G-----TA--A--------T-----T-------TG---A---GG--T-------TG-----T-------GA-A-TT--GTG-------TTC-A-CC--ACATATT------AA-----C
gi|27500 : cC-------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-TA---C-TC-T-C-T--CT-CTT-C-TCCTC-TC------GTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--T----CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TT--C-------T-------C--T------------CA--G----TGG-T-----T-------TG---T---GAT-G-------AG---T-T-------TG-A-GT--TTG-------
gi|27501 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T------G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA---T-T-------GA-
gi|27502 : -CTC-T-C-T------C-TA-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCT----C--T---------------------C---T-----C-------TG---A---TT--G-------GA---T-T-------GA-A-AT--TTG-------CTC-T-GC--C---ATT------A
gi|27503 : C-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TA------CTC-TCGTC-T-----C----TC-TC-T-T-CT-----------T-----C---TC--TC---CTC-T-C-T-CTT--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------A-------C--T---------------------T---T-----T-------TT---A---AG--G-------T----T-T-------AA-A-AT--TGG-------G
gi|27504 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T-C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--TA-----G-----CG--G----G---CA----T-------TA---A---AG--G-------TG---T-
gi|27505 : -CTC-T-C-T------C-TC-T----C-TC-T---T--CT-CT--C-T--TC-TC------TTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CT-----------T-----C---T--------CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------A--T------G-----CA--G----T---C-----A-------TG---G---TG--G-------TA---T-T-------GA-
gi|27506 : -------C-------TCT-CTC-T-C-T------C-TC-C----T-TC-T-C-T---T-CT--C--C-TC-TT-------TC-TC-TC-T-----CG---TC-TC-TCT-CG-----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-TG-C-----T--C----T---TC-T--C-TC--T-------C-------CG-T------G-----AG--G----G---T-----C-------T----C---GG--G-------TG---TAG-------AA-A-GG--TCC-------GCC-A-GC--A---
gi|27507 : -C-T--CT-CT--C-TC-TC-TC-------TC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-C------------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------C-------T--G------G-----AA--A----T---T-----T-------GG---AATTGC--G-------TGGA-T-C-------AA-A-TT--TT
gi|27508 : cg------CTC-TC-TC-T-----C----TC-TC-TCT-CTC----------T-----C---TC--TCT--CTC-T-C-T-C-T--C-----T--C----TC--TC-T--C-TC--T-------CTCTCTCTC--T------G-----T---G----T---T-----T-------TG-------GA--A-------TA---T-T-------A-----T--TTA-------CTT-A-GA--A---ACG------AA------AGT-CAAATTAATGT-A-A---TA---A---A--AAC-A-A-AG----AA