lowQualScore                  :                                                                                    11111111                                              
lowQualScore                  :     3 1 0      1 1  1 111   0 555   0  777777777 1 11 0 1   111  11111 11  11 1111 11111111 333 33  0 333 4444 44444 0 0   22 11 111     
lowQualScore                  :     . . .      . .  . ...   . ...   .  ......... . .. . .   ...  ..... ..  .. .... ........ ... ..  . ... .... ..... . .   .. .. ...     
lowQualScore                  :     0 8 6      1 1  1 555   5 777   5  111111111 1 88 5 1   555  44444 33  55 9999 88888888 111 00  6 777 6666 22222 6 6   55 44 000     
consensus                     : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
Reference ( gi|2799 )         : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2797                       : TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2801                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAAAA---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CGG--T--C---TGTCct
gi|2800                       : TTTA-T-A-TGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2798                       : TTTA-T-A-CGACCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----T--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2802                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2821                       : TCTA-T-A-TGCCCG-C-AT-A---TAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2803                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------T---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2806                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CTT--T--C---TGTC
gi|2831                       : TTTA-T-T-CACCCG-C-GT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGT
gi|2805                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-T---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--AT-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGTCC
gi|2832                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-G---T----T-----G-T-ACG--T--C---TGTC
gi|2809                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---A----C-----A-T-CCG--T--C---TCTCC
gi|2804                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-ATTAGCG-GG---------C-G--T-A-TTA---GG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2811                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---C----C-----G-T-CCG--T--C---CATCgctgtccct
gi|2808                       : TTTA-T-T-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-GTAT-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-TAG--T--C---TGTCCtgtctct
gi|2820                       : TTTA-T-A-CGTTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----T-T-CCA--T--C---TGTCct
gi|2817                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-A--T-A-TCA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2819                       : TCTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----------G-T-CTC--T--C---TGTCCtct
gi|2813                       : TTTA-T-A-TGCTCA-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----T-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCc
gi|2833                       : TTTA-T-A-TGCCCG-C-GT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A--------C---G--CT-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTCct
gi|2816                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G--T-A--CA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2824                       : TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GC---------T-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTC
gi|2828                       : TTTA-T-A-CGCTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------A-G--C-A-TTA---TA-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----A-T-CCG--T--T---TGT
gi|2807                       : TTTA-T-A-CACCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GGAAAAGCAGGC-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCT--T--C---TGTCC
gi|2822                       : TTTA-T-A-CACCCG-CTAT-A---AAA-A---GTG-GG---------T-G--T-A-TTA---T------C--TA--T----A-C------T---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2812                       : TTTA-T-G-CGCCAG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GGGG-------C-G--C-A-TTA---TA-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2836                       : TCTA-T-AGCGCCCG---AC-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CTGG---T----CGG---G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2829                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--TAC--A-G------C---AT-CT-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCCtct
gi|2810                       : TTTA-A-A-CGCCCG-C-AA-A---AAA-AAAGGCG-GG---------T-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------T---G--CT-G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCCct
gi|2825                       : TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G--T-A-TTA---TG--------TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2818                       : TTTA-T-A-CGCCTG-C-GT-A---AAA-T---ATG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-T------C---A--CT-G---T----C-----G-T-TCG--T--C---TTTCC
gi|2834                       : TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-GC-T-ATTTA---TG-----CA-TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGT
gi|2823                       : TTTA-T-G-CTCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CA-G---TTGCCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2826                       : TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G--TGA-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C------CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2835                       : TTTA-T-A-CGC------AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------T---GT-CC-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2837                       : TTTA-T-A-CGCCCG-A-AT-A---AAA-A---ACG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-ct
gi|2815                       : TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TATTT----T-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCC
gi|2814                       : TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TATTT----T-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2840                       : TTTA-TCA-TGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------CGG--T-A--TG---TG-----C--TA--T----A-AC-----C---G--CT-G---T----C-----GTT-CCG--TCGC---TGTCCct
gi|2839                       : TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A--------CTT-G--CT-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCCct
gi|2838                       : TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A--------CTT-G--CT-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCCct
gi|2843                       : TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-GT-T-ATTTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---GGCCT-G---T----C-----ct
gi|2842                       : TTTA-TTA-CGCCCG-CCAT-A---AAA-A---GCG-G----------C-G--T-A-TTA---TG-----T--TA--T----ACC------C---G--CT-G---T----T-----G-T-CTGA-T--C---TG
gi|2845                       : TTTA-T-A-CGCTCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G--T-A-TTA---TG-----G--TA--T----A-G------C---------G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCctgtccct
gi|2830                       : TTTAAT-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-----GCA-GG---------CCG--T-A-TTA---TG-----C--TA--TTAACA-G------C---AT-CT-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCC
gi|2846                       : TTTA-T-A-CACCCG----T-C---GAA-G---ACG-GGA--------C-G--T-A-TTA---TG-----G--TA--T----A-G------C---G--TC-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2841                       : TTTA-T-A-CACCTG-C-AT-A---A-------GCG-GGG--------C-G--T-A-TCAA--TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-A---T----T-----G-T-CCG--G--T---CGTC
gi|2847                       : TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---GAA-G---ACA-GGA--------C-G--T-A-TTA---TG-----G--TA--T----A-G------C---------G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCCtttccc
gi|2853                       : TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT------CA-G---GCGAGG---------C-G--T-A-TTA---TG-----T--TA--T----G-G------C---G--TT-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2852                       : TTTAAT-A-CGCCCG-C--T-C---GAA-G---ACG-GA---------C-G--T-A-TTA---TG-----G--AA--T----A-G------C---------G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2854                       : TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT-C---AGA------CG-GGA--------C-G--T-A-TTA---TG-----T--TA--T----G-G------C---G--TT-G---TC---C-----G-T-CCG--T--CAGGTGTCC
gi|2849                       : TTTA-T-A-CGCCCG-T-CG-A---ATA-T---G-G-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----G--TA--T----A-G------C---------G---T----C-----G-T-CCG--T--C---
gi|2827                       : TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--T
gi|2850                       : TTTA-T-A-CCCCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A--T-A-TTA---TA-----C--TG--T---------------------------C----C-----G-T-ATG--T--C---TGTCC
gi|2848                       : TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---AAA-G---ATG-GGA--------C-G--T-A-TTA---TGGTATAC--TA--T----A-G------C---------G---T----C-----A-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2851                       : TTTA-T-A-CCCCCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G--T-A-TTA---TG-----A--TA--T----A-G------C---------G---T----C-----A-T-CCA--T--C---TGCCC
gi|2855                       : TTTA-T-A-CGCCC----AT-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G--T-A-TTA---TG-----G--TG--T----A-G------CTTTGT-CT-G---T----CTATTTG-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2844                       : TTTA-T-A-CGCCCA-C-AA-A---AAA-AT--GTG-GG---------C-A-------TA---TG-----C--TA--T----A-C------T---A--CT-G---T----CTGTTTG-T-CCT--T--T---TGTCC
gi|2857                       :  TTA-T-A-CGCCCA-C-AT-ATAAAAA-A---GCG-GG---------T-G--T-A-TTA---TG-----CTGTA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2858                       :  TTA-T-A-CGCCCG-T--T-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------TG--G--CT-G---T----CT----G-TCCCG--T--C---TGTCCct
gi|2856                       :  TTA-TTA-CGCCCG-C-AT-AC--AAA-AC--GCG-GA---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T--CG--T--C---TGTCCc
gi|2859                       :   TG-T-A-CACCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G--T-A-TTG---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2861                       :   TA-T-A-TGCCCG-C-CT-T---AAA-AT--GCA-GG---------C-A--T-A-TTG---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2860                       :   TA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G--T-A-CAT---TG-----C--TA--T----A-AC-----C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--TG-C---CGTCct
gi|2862                       :    A-T-A-CGCCCG-C-AT-C---AAA-AT--GAG-GG---------C-G--T-A-CTAGTATG-----C--TA--T----A-C------C---A--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2839                       :    A-T-A-CGCCCG-C-TT-A---TTA-G---GCG-GG---------C-G--T-A-T
gi|2838                       : ttcA-T-A-CGCCCG-C-TT-A---TTA-G---GCG-GG---------C-G--T-A-Ttatgctatacttgctgttcatagtctgtccct
gi|2864                       :    ttc-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-T---GTG-TG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---tatgctatacttgctgttcatagtctgtccct
gi|2866                       :               G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---G--CT-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGCC
gi|2865                       :               G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A--T-A-TTT---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---TTGTCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2867                       :                  -AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----C-----G-T-CCGTCT--C---TGTCCct
gi|2868                       :                  -AT-A---AAA-A---GTC-AG---------C-C--T-A-TTA---TG-----C--TA--T----A-G------C---A--CT-GT--T----T-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2863                       :                    T-A---ATA-AT--GCG-GG---------C-G--T-A-TTA---TG-----C--TT--T----A-C------C---T--CT----------------G-T-TTG--T--C---TGTCCct
gi|2869                       :            atacaccat-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G--T-A-TAA---TG-----C--TA--T----A-C------C---G--CT-G---T----ct
gi|2870                       :                                     aca---------C-G--T-A-TTG---TG-----C--TA--T----A-TATATACC---G--CT-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC





Alignments
lowQualScore                  :        3 1 0      1 1  1 111   0 555   0  777777777 1 1 0 1 00  111   0 00 11 11 22222222 111 333 0 0 333 4444 44444 0 0   22 11 111     
lowQualScore                  :        . . .      . .  . ...   . ...   .  ......... . . . . ..  ...   . .. .. .. ........ ... ... . . ... .... ..... . .   .. .. ...     
lowQualScore                  :        0 8 6      2 1  1 555   5 888   5  222222222 1 1 5 1 77  555   5 77 55 88 88888888 999 888 5 5 666 6666 77777 6 6   55 44 000     
consensus                     :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
Reference ( family-290 )      :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2797                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2798                       :    TTTA-T-A-CGACCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2799                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2800                       :    TTTA-T-A-TGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2801                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAAAA---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CGG--T--C---TGTC
gi|2802                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2803                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2804                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-ATTAGCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---GGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2805                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-T---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---A-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGTCCgctgtccct
gi|2806                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTT--T--C---TGTC
gi|2807                       :    TTTA-T-A-CACCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GGAAAAGCAGGC-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCT--T--C---TGTCC
gi|2808                       :    TTTA-T-T-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-TATTA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-TAG--T--C---TGTCC
gi|2809                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---A----C-----A-T-CCG--T--C---TCTCCct
gi|2810                       :    TTTA-A-A-CGCCCG-C-AA-A---AAA-AAAGGCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCC
gi|2811                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---C----C-----G-T-CCG--T--C---CATCct
gi|2812                       :    TTTA-T-G-CGCCAG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GGGG-------C-G-C-A-T--TA---TAC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCtgtctct
gi|2813                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2814                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--ATTT--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2815                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--ATTT--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2816                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A----CA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---CGTCct
gi|2817                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-A-T-A-T--CA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2818                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-GT-A---AAA-T---ATG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------T-C---A---C-T-G---T----C-----G-T-TCG--T--C---TTTCCtct
gi|2819                       :    TCTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----------G-T-CTC--T--C---TGTCC
gi|2820                       :    TTTA-T-A-CGTTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----T-T-CCA--T--C---TGTCc
gi|2821                       :    TCTA-T-A-TGCCCG-C-AT-A---TAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2822                       :    TTTA-T-A-CACCCG-CTAT-A---AAA-A---GTG-GG---------T-G-T-A-T--TA---T-C-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2823                       :    TTTA-T-G-CTCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-A-G---TTGCCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2824                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GC---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTCct
gi|2825                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G-T-A-T--TA---TG--T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2826                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G-TGA-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C-------C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2827                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--
gi|2828                       :    TTTA-T-A-CGCTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------A-G-C-A-T--TA---TAC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--T---TGT
gi|2829                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-A---GCATC-T-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCC
gi|2830                       :    TTTAAT-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-----GCA-GG---------CCG-T-A-T--TA---TGC-T--A--TTAA------C-A---GCATC-T-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCCct
gi|2831                       :    TTTA-T-T-CACCCG-C-GT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTct
gi|2832                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-ACG--T--C---TGTC
gi|2833                       :    TTTA-T-A-TGCCCG-C-GT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A--------C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2834                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-GCT-ATT--TA---TGCAT--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGT
gi|2835                       :    TTTA-T-A-CGC------AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---GT--C-C-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2836                       :    TCTA-T-AGCGCCCG---AC-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-TGG---T----CGG---G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2837                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-A-AT-A---AAA-A---ACG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-tct
gi|2838                       :    TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------CTT---G---C-T-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCC
gi|2839                       :    TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------CTT---G---C-T-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCCct
gi|2840                       :    TTTA-TCA-TGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------CGG-T-A----TG---TGC-T--A--TA-A------C-C---G---C-T-G---T----C-----GTT-CCG--TCGC---TGTCCct
gi|2841                       :    TTTA-T-A-CACCTG-C-AT-A---A-------GCG-GGG--------C-G-T-A-T--CAA--TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-A---T----T-----G-T-CCG--G--T---CGTCct
gi|2842                       :    TTTA-TTA-CGCCCG-CCAT-A---AAA-A---GCG-G----------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--AC-----C-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CTGA-T--C---TGtttccc
gi|2843                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-GTT-ATT--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---GGC-C-T-G---T----C-----ctgtccct
gi|2844                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AA-A---AAA-AT--GTG-GG---------C-A--------TA---TGC-T--A--T--A------C-T---A---C-T-G---T----CTGTTTG-T-CCT--T--T---TGTCC
gi|2845                       :    TTTA-T-A-CGCTCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2846                       :    TTTA-T-A-CACCCG----T-C---GAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------G-C---G---T-C-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2847                       :    TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---GAA-G---ACA-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCC
gi|2848                       :    TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---AAA-G---ATG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------C-TATAG---C---G---T----C-----A-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2849                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-T-CG-A---ATA-T---G-G-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCG--T--C---
gi|2850                       :    TTTA-T-A-CCCCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TAC-T--G--T---------C-C---G---TAT-G---T----CT----G-T-CC
gi|2851                       :    TTTA-T-A-CCCCCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGA-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----A-T-CCA--T--C---TGCCCct
gi|2852                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C--T-C---GAA-G---ACG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGG-A--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2853                       :    TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT------CA-G---GCGAGG---------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--G------G-C---G---T-T-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2854                       :    TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT-C---AGA------CG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--G------G-C---G---T-T-G---TC---C-----G-T-CCG--T--CAGGTGTCC
gi|2855                       :    TTTA-T-A-CGCCC----AT-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--G--T--A------G-CTTTGT--C-T-G---T----CTATTTG-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2856                       :     TTA-TTA-CGCCCG-C-AT-AC--AAA-AC--GCG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T--CG--T--C---TGTCC
gi|2857                       :     TTA-T-A-CGCCCA-C-AT-ATAAAAA-A---GCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-TGTA--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2858                       :     TTA-T-A-CGCCCG-T--T-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--AG-----T-G---G---C-T-G---T----CT----G-TCCCG--T--C---TGTCCct
gi|2859                       :      TG-T-A-CACCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCc
gi|2860                       :      TA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A-C--AT---TGC-T--A--TA-A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--TG-C---CGTCct
gi|2861                       :      TA-T-A-TGCCCG-C-CT-T---AAA-AT--GCA-GG---------C-A-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2862                       :       A-T-A-CGCCCG-C-AT-C---AAA-AT--GAG-GG---------C-G-T-A-C--TAGTATGC-T--A--T--A------C-C---A---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2863                       :                       T-A---ATA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--T--T--A------C-C---T---C-T----------------G-T-TTG--T--C---TGTCC
gi|2864                       : atacaccat-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-T---GTG-TG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---ct
gi|2865                       :                  G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TT---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---TTGTCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2866                       :                  G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGCCct
gi|2867                       :                     -AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCGTCT--C---TGTCC
gi|2868                       :                     -AT-A---AAA-A---GTC-AG---------C-C-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---A---C-T-GT--T----T-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2869                       :                        -A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--AA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----ct
gi|2870                       :                                        aca---------C-G-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--ATATATAC-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC





Alignments
lowQualScore                  :        3 1 0      1 1  1 111   0 555   0  777777777 1 1 0 1 00  111   0 00 11 11 22222222 111 333 0 0 333 4444 44444 0 0   22 11 111     
lowQualScore                  :        . . .      . .  . ...   . ...   .  ......... . . . . ..  ...   . .. .. .. ........ ... ... . . ... .... ..... . .   .. .. ...     
lowQualScore                  :        0 8 6      2 1  1 555   5 888   5  222222222 1 1 5 1 77  555   5 77 55 88 88888888 999 888 5 5 666 6666 77777 6 6   55 44 000     
consensus                     :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
Reference ( family-290 )      :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2797                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2798                       :    TTTA-T-A-CGACCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2799                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2800                       :    TTTA-T-A-TGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2801                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAAAA---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CGG--T--C---TGTC
gi|2802                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2803                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2804                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-ATTAGCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---GGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2805                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-T---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---A-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGTCCgctgtccct
gi|2806                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTT--T--C---TGTC
gi|2807                       :    TTTA-T-A-CACCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GGAAAAGCAGGC-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCT--T--C---TGTCC
gi|2808                       :    TTTA-T-T-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-TATTA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-TAG--T--C---TGTCC
gi|2809                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---A----C-----A-T-CCG--T--C---TCTCCct
gi|2810                       :    TTTA-A-A-CGCCCG-C-AA-A---AAA-AAAGGCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCC
gi|2811                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---C----C-----G-T-CCG--T--C---CATCct
gi|2812                       :    TTTA-T-G-CGCCAG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GGGG-------C-G-C-A-T--TA---TAC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCtgtctct
gi|2813                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2814                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--ATTT--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2815                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--ATTT--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2816                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A----CA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---CGTCct
gi|2817                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-A-T-A-T--CA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2818                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-GT-A---AAA-T---ATG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------T-C---A---C-T-G---T----C-----G-T-TCG--T--C---TTTCCtct
gi|2819                       :    TCTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----------G-T-CTC--T--C---TGTCC
gi|2820                       :    TTTA-T-A-CGTTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----T-T-CCA--T--C---TGTCc
gi|2821                       :    TCTA-T-A-TGCCCG-C-AT-A---TAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2822                       :    TTTA-T-A-CACCCG-CTAT-A---AAA-A---GTG-GG---------T-G-T-A-T--TA---T-C-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2823                       :    TTTA-T-G-CTCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-A-G---TTGCCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2824                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GC---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTCct
gi|2825                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G-T-A-T--TA---TG--T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2826                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G-TGA-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C-------C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2827                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--
gi|2828                       :    TTTA-T-A-CGCTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------A-G-C-A-T--TA---TAC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--T---TGT
gi|2829                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-A---GCATC-T-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCC
gi|2830                       :    TTTAAT-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-----GCA-GG---------CCG-T-A-T--TA---TGC-T--A--TTAA------C-A---GCATC-T-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCCct
gi|2831                       :    TTTA-T-T-CACCCG-C-GT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTct
gi|2832                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-ACG--T--C---TGTC
gi|2833                       :    TTTA-T-A-TGCCCG-C-GT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A--------C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2834                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-GCT-ATT--TA---TGCAT--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGT
gi|2835                       :    TTTA-T-A-CGC------AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---GT--C-C-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2836                       :    TCTA-T-AGCGCCCG---AC-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-TGG---T----CGG---G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2837                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-A-AT-A---AAA-A---ACG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-tct
gi|2838                       :    TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------CTT---G---C-T-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCC
gi|2839                       :    TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------CTT---G---C-T-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCCct
gi|2840                       :    TTTA-TCA-TGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------CGG-T-A----TG---TGC-T--A--TA-A------C-C---G---C-T-G---T----C-----GTT-CCG--TCGC---TGTCCct
gi|2841                       :    TTTA-T-A-CACCTG-C-AT-A---A-------GCG-GGG--------C-G-T-A-T--CAA--TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-A---T----T-----G-T-CCG--G--T---CGTCct
gi|2842                       :    TTTA-TTA-CGCCCG-CCAT-A---AAA-A---GCG-G----------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--AC-----C-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CTGA-T--C---TGtttccc
gi|2843                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-GTT-ATT--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---GGC-C-T-G---T----C-----ctgtccct
gi|2844                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AA-A---AAA-AT--GTG-GG---------C-A--------TA---TGC-T--A--T--A------C-T---A---C-T-G---T----CTGTTTG-T-CCT--T--T---TGTCC
gi|2845                       :    TTTA-T-A-CGCTCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2846                       :    TTTA-T-A-CACCCG----T-C---GAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------G-C---G---T-C-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2847                       :    TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---GAA-G---ACA-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCC
gi|2848                       :    TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---AAA-G---ATG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------C-TATAG---C---G---T----C-----A-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2849                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-T-CG-A---ATA-T---G-G-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCG--T--C---
gi|2850                       :    TTTA-T-A-CCCCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TAC-T--G--T---------C-C---G---TAT-G---T----CT----G-T-CC
gi|2851                       :    TTTA-T-A-CCCCCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGA-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----A-T-CCA--T--C---TGCCCct
gi|2852                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C--T-C---GAA-G---ACG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGG-A--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2853                       :    TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT------CA-G---GCGAGG---------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--G------G-C---G---T-T-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2854                       :    TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT-C---AGA------CG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--G------G-C---G---T-T-G---TC---C-----G-T-CCG--T--CAGGTGTCC
gi|2855                       :    TTTA-T-A-CGCCC----AT-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--G--T--A------G-CTTTGT--C-T-G---T----CTATTTG-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2856                       :     TTA-TTA-CGCCCG-C-AT-AC--AAA-AC--GCG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T--CG--T--C---TGTCC
gi|2857                       :     TTA-T-A-CGCCCA-C-AT-ATAAAAA-A---GCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-TGTA--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2858                       :     TTA-T-A-CGCCCG-T--T-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--AG-----T-G---G---C-T-G---T----CT----G-TCCCG--T--C---TGTCCct
gi|2859                       :      TG-T-A-CACCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCc
gi|2860                       :      TA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A-C--AT---TGC-T--A--TA-A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--TG-C---CGTCct
gi|2861                       :      TA-T-A-TGCCCG-C-CT-T---AAA-AT--GCA-GG---------C-A-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2862                       :       A-T-A-CGCCCG-C-AT-C---AAA-AT--GAG-GG---------C-G-T-A-C--TAGTATGC-T--A--T--A------C-C---A---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2863                       :                       T-A---ATA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--T--T--A------C-C---T---C-T----------------G-T-TTG--T--C---TGTCC
gi|2864                       : atacaccat-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-T---GTG-TG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---ct
gi|2865                       :                  G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TT---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---TTGTCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2866                       :                  G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGCCct
gi|2867                       :                     -AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCGTCT--C---TGTCC
gi|2868                       :                     -AT-A---AAA-A---GTC-AG---------C-C-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---A---C-T-GT--T----T-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2869                       :                        -A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--AA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----ct
gi|2870                       :                                        aca---------C-G-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--ATATATAC-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC


blockSeqs                     :        A C        T T  T TAA     TTA      AAAAGCAGG C C   T     GTA        TT TA TATATAC  ATA CAT     TGT TGCC TGTTT       TC CG AGG
blockSeqs                     :        A T        T C  T C       AAG      GG        G T   T     A          TT A  CT       TTT CAT     TGT TGTC TATTT       T  G  .  
blockSeqs                     :        A T        . .  . .       T        G         . .   .     .          .  A  CT       .   GC      T   C    GG          T  .  .  
blockSeqs                     :        A .        . .  . .       T        A         . .   .     .          .  .  CC       .   T       T   C    T           A  .  .  
blockSeqs                     :        A .        . .  . .       C        A         . .   .     .          .  .  GT       .   T       T   C    T           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       T        A         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   C    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       T        A         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       T        A         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       T        A         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        A         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  T        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :        . .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  G        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :          .        . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  C        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :                   . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  .        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :                   . .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  .        .   .       .   .    .           .  .  .  
blockSeqs                     :                     .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  .        .   .       .   .    .                    
blockSeqs                     :                     .  . .       .        .         . .   .     .          .  .  .        .   .       .   .    .                    
blockSeqs                     :                        . .       .        .         . .   .     .          .  .  .        .   .       .   .                         
blockSeqs                     :                        . .       .        .         . .   .     .          .  .  .        .   .                                     
blockSeqs                     :                                           .         . .   .     .                                                                   


blockSeqCons                  :    
originalCons                  :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
finalCons                     :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC





Alignments
lowQualScore                  :        3 1 0      1 1  1 111   0 555   0  777777777 1 1 0 1 00  111   0 00 11 11 22222222 111 333 0 0 333 4444 44444 0 0   22 11 111     
lowQualScore                  :        . . .      . .  . ...   . ...   .  ......... . . . . ..  ...   . .. .. .. ........ ... ... . . ... .... ..... . .   .. .. ...     
lowQualScore                  :        0 8 6      2 1  1 555   5 888   5  222222222 1 1 5 1 77  555   5 77 55 88 88888888 999 888 5 5 666 6666 77777 6 6   55 44 000     
consensus                     :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
Reference ( family-290 )      :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2797                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2798                       :    TTTA-T-A-CGACCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2799                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2800                       :    TTTA-T-A-TGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2801                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAAAA---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CGG--T--C---TGTC
gi|2802                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2803                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2804                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-ATTAGCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---GGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2805                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-T---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---A-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGTCCgctgtccct
gi|2806                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTT--T--C---TGTC
gi|2807                       :    TTTA-T-A-CACCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GGAAAAGCAGGC-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCT--T--C---TGTCC
gi|2808                       :    TTTA-T-T-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-TATTA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-TAG--T--C---TGTCC
gi|2809                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---A----C-----A-T-CCG--T--C---TCTCCct
gi|2810                       :    TTTA-A-A-CGCCCG-C-AA-A---AAA-AAAGGCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCC
gi|2811                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---C----C-----G-T-CCG--T--C---CATCct
gi|2812                       :    TTTA-T-G-CGCCAG-C-TT-A---AAA-A---GCG-GGGG-------C-G-C-A-T--TA---TAC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCtgtctct
gi|2813                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2814                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--ATTT--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2815                       :    TTTA-T-A-TGCTCA-C-ATTA---AAA-A---GTG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--ATTT--T------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTGT-T--C---TGTCCct
gi|2816                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A----CA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---CGTCct
gi|2817                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCG-GA---------C-A-T-A-T--CA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2818                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-GT-A---AAA-T---ATG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------T-C---A---C-T-G---T----C-----G-T-TCG--T--C---TTTCCtct
gi|2819                       :    TCTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----------G-T-CTC--T--C---TGTCC
gi|2820                       :    TTTA-T-A-CGTTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----T-T-CCA--T--C---TGTCc
gi|2821                       :    TCTA-T-A-TGCCCG-C-AT-A---TAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2822                       :    TTTA-T-A-CACCCG-CTAT-A---AAA-A---GTG-GG---------T-G-T-A-T--TA---T-C-T--A--T--A------C-T---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2823                       :    TTTA-T-G-CTCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-A-G---TTGCCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCCct
gi|2824                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GC---------T-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTCct
gi|2825                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G-T-A-T--TA---TG--T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2826                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-G----------C-G-TGA-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C-------C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2827                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-----GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--
gi|2828                       :    TTTA-T-A-CGCTCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------A-G-C-A-T--TA---TAC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--T---TGT
gi|2829                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-A---GCATC-T-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCC
gi|2830                       :    TTTAAT-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-----GCA-GG---------CCG-T-A-T--TA---TGC-T--A--TTAA------C-A---GCATC-T-GTGTT----C-----G-T-TCG--T--C---TGTCCct
gi|2831                       :    TTTA-T-T-CACCCG-C-GT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGTct
gi|2832                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-TT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-ACG--T--C---TGTC
gi|2833                       :    TTTA-T-A-TGCCCG-C-GT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A--------C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---CGTC
gi|2834                       :    TTTA-T-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------C-GCT-ATT--TA---TGCAT--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---CGT
gi|2835                       :    TTTA-T-A-CGC------AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-T---GT--C-C-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2836                       :    TCTA-T-AGCGCCCG---AC-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-TGG---T----CGG---G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2837                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-A-AT-A---AAA-A---ACG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-tct
gi|2838                       :    TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------CTT---G---C-T-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCC
gi|2839                       :    TTCA-T-A-CGCCCG-C-CT-A---ATA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------CTT---G---C-T-GT--T----C-----A-T--AG--T--C---TGTCCct
gi|2840                       :    TTTA-TCA-TGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GTG-GG---------CGG-T-A----TG---TGC-T--A--TA-A------C-C---G---C-T-G---T----C-----GTT-CCG--TCGC---TGTCCct
gi|2841                       :    TTTA-T-A-CACCTG-C-AT-A---A-------GCG-GGG--------C-G-T-A-T--CAA--TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-A---T----T-----G-T-CCG--G--T---CGTCct
gi|2842                       :    TTTA-TTA-CGCCCG-CCAT-A---AAA-A---GCG-G----------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--AC-----C-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CTGA-T--C---TGtttccc
gi|2843                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-C-AT-A---AAA-A---GCG-GG---------T-GTT-ATT--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---GGC-C-T-G---T----C-----ctgtccct
gi|2844                       :    TTTA-T-A-CGCCCA-C-AA-A---AAA-AT--GTG-GG---------C-A--------TA---TGC-T--A--T--A------C-T---A---C-T-G---T----CTGTTTG-T-CCT--T--T---TGTCC
gi|2845                       :    TTTA-T-A-CGCTCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2846                       :    TTTA-T-A-CACCCG----T-C---GAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------G-C---G---T-C-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2847                       :    TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---GAA-G---ACA-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCA--T--C---TGTCC
gi|2848                       :    TTTA-T-A-CGCCCG----T-C---AAA-G---ATG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------C-TATAG---C---G---T----C-----A-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2849                       :    TTTA-T-A-CGCCCG-T-CG-A---ATA-T---G-G-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCG--T--C---
gi|2850                       :    TTTA-T-A-CCCCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TAC-T--G--T---------C-C---G---TAT-G---T----CT----G-T-CC
gi|2851                       :    TTTA-T-A-CCCCCG----T-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGA-T--A--T--A------------G---C---G---T----C-----A-T-CCA--T--C---TGCCCct
gi|2852                       :    TTTAAT-A-CGCCCG-C--T-C---GAA-G---ACG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGG-A--A--T--A------------G---C---G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTC
gi|2853                       :    TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT------CA-G---GCGAGG---------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--G------G-C---G---T-T-G---TC---C-----G-T-CCG--T--C---TG
gi|2854                       :    TTTA-T-A-CGCCCGTC-TT-C---AGA------CG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGT-T--A--T--G------G-C---G---T-T-G---TC---C-----G-T-CCG--T--CAGGTGTCC
gi|2855                       :    TTTA-T-A-CGCCC----AT-C---AAA-G---ACG-GGA--------C-G-T-A-T--TA---TGG-T--G--T--A------G-CTTTGT--C-T-G---T----CTATTTG-T-CTG--T--C---TGTCC
gi|2856                       :     TTA-TTA-CGCCCG-C-AT-AC--AAA-AC--GCG-GA---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T--CG--T--C---TGTCC
gi|2857                       :     TTA-T-A-CGCCCA-C-AT-ATAAAAA-A---GCG-GG---------T-G-T-A-T--TA---TGC-TGTA--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CTG--T--C---TGTCCct
gi|2858                       :     TTA-T-A-CGCCCG-T--T-A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--AG-----T-G---G---C-T-G---T----CT----G-TCCCG--T--C---TGTCCct
gi|2859                       :      TG-T-A-CACCCG-T-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-G-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCCc
gi|2860                       :      TA-T-A-CGCCCA-C-AT-A---AAA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A-C--AT---TGC-T--A--TA-A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--TG-C---CGTCct
gi|2861                       :      TA-T-A-TGCCCG-C-CT-T---AAA-AT--GCA-GG---------C-A-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2862                       :       A-T-A-CGCCCG-C-AT-C---AAA-AT--GAG-GG---------C-G-T-A-C--TAGTATGC-T--A--T--A------C-C---A---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCct
gi|2863                       :                       T-A---ATA-AT--GCG-GG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--T--T--A------C-C---T---C-T----------------G-T-TTG--T--C---TGTCC
gi|2864                       : atacaccat-A-CGCCTG-C-AT-A---AAA-T---GTG-TG---------C-G-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---ct
gi|2865                       :                  G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TT---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---TTGTCC-----A-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2866                       :                  G-C-AT-A---AAA-A---GCA-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---G---C-T-G---T----T-----G-T-CCA--T--C---TGCCct
gi|2867                       :                     -AT-A---AAA-A---GCG-GG---------C-A-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCGTCT--C---TGTCC
gi|2868                       :                     -AT-A---AAA-A---GTC-AG---------C-C-T-A-T--TA---TGC-T--A--T--A------G-C---A---C-T-GT--T----T-----G-T-CCG--T--C---TGTCC
gi|2869                       :                        -A---AAA-A---GCG-GG---------C-G-T-A-T--AA---TGC-T--A--T--A------C-C---G---C-T-G---T----ct
gi|2870                       :                                        aca---------C-G-T-A-T--TG---TGC-T--A--T--ATATATAC-C---G---C-T-G---T----C-----G-T-CCG--T--C---TGTCC