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Reference ( gi|109321 )       :                 ATTTGTCTGGACGATGATCGTGATAATCGTTTT---AA--AAATT--GGTAC-----AT---GCA--TGTCGC-C--------GACCAGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--CTTTT-----G---G----A---C--C-AAAAT-T-T------C------A----CT--C------CC----AA-----A------A-----------A-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGTA
gi|109332                     :                            CGATAATTGTCGTAGTTGTTTT---CA--AAATTA-GGTACCATTGAT---G-A--TTTCGC-C--------GACTAGAA-AAAA-AAC--T----G--A-T-CTCT----C-TA------GGACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--CTTTC-----T---G----A---C--C-AAAAT-G-T------T------A----CT--C------CC----AA-----A------A-----------A-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGTA
gi|109333                     :                        tgatgatagATCGTCATAGTTGTTTTCAAAATTAAATT--GGTACCATTGAT---G-A--TTTCGC-C--------ATCTAGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGATTCG----C----T--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--CTTTT-----G---T----A---C--C-AAAAT-T-T------T------A----CT--C------CC----CA-----A------A-----------A-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GAGA------G--T-A--T-A--T--AT-GGTA
gi|109334                     :                                    GTCATAGCTGTTTT---CA--AAATT--GGTACCATTGAT---G-A--TTTCGC-C--------GACTAGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC------TA------TGACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--CTTTT-----G---G----A---C--C-AAAAT-T-T------T------A----CT--C------CT----AA-----A------A-----------A-------T------C------------CG-ACAT-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGTA
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gi|109312                     :                                               gTT---CA--AAATTCCGTTAA-----ATATCGCT--TGTTGTAT--------GACAAGAA-AAAT-A-C--T-------A-T-GACA----T-TA------GTACTCG----C----A--T--A--TA-A-G-T-CAGA-CA--------TA------GA--CTTAA-----G---G----A---T--T-GATAT-T-T------T------A----CT--C------CCCA--AA-----A------A-----------A-------A------A------------CG-AC-T-T-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGTA
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gi|109358                     :                                                                                                   tgccaAGAA-AAAT-A-C--C----G--A-T-CTCC----C-TA------GGACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CATACATG--TA------GA--TCTTT-----G---G----A---C--C--AAAT-T-T------T------A----CC--T------CC----AC-----A------A-----------A-------T------C------------CT-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGTA
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gi|109315                     :                                     attaggtactgactatactatcattgacgcattcaaaattctgttaaatatcgcttattgtcttgcaAGAG-AAAT-A-T--T-------A-T-GACA----T-TA------GTACACG----C----A--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CC--------TA------GA--CTTCA-----G---G----A---T--C-GATAT-T-T------G------A----TTC-C------CC----CC-----A------A-----------A-------T-------------------CG-AC-T-T-AT--A-T-------GTGA------G--T-A--T-A--T--AC-GTTA
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gi|109319                     :                                                                                       tcgctagttgtatagcaAGAA-AAAT-A-T--T-------A-T-AACA----T-TA------GTATGTG----C----A--T--A--TA-A-G-T-TGGA-C----------A------GA--CTTCA-----G---G----A---T--C---GAT-T-------------------------------------AA-----A---------------------------------C------------CG-AC-T-T-AT--G-T-------GCGA------C--T-A--T-A--C--AT-GGTA
gi|109327                     : atttgctactgactaaactgtcattgacgctttcaaaattccattaaatgtcgctagttgtantgctttcaaaattccattaaatgtcactagttgtatggcaAGAA-AAAT-A-T--T----T--A-T-GAC--------A------GTATGCG----C----A--T--A--TA-A-G-T-TGGA-CA--------TA------GA--CTTCA-----G---G----C---T--C-GATGT-T-T-------------A----CT--C------CC----
gi|109342                     :                                   ttccttctaactaaaccgtcattattatattccttcgaaattccgtgaaatgtcgctagttatgtggcaAGAA-AAAT-A-T--T----ATAA-C-ATTT----A-TA------GTACGTG----CATATT--T--A--TA-C-G-T-CGGT-CA--------TA------GA--CTTCA-----G---G----A---T--C-GATAT-T-T------T------A----CT--C------CC----ccttaacgacaagctacacttgagcaatgcgagtatttac
gi|109367                     :                                                                                                    tggcaGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGACTCA----C----C--T--A--TA-A-G-T-CAGA-CA--------TA------GA--CTTTT-----G---G----A---C--C-AAAAT-T-T------T------A----CT--C------CC-----A-----A------A-----------A-------T------C------------CA-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AT-GGTA
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gi|109377                     :                                                                                                                                            -TA------GGACACG----C----C--T--T--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TAA-----GA--CGTTT-----G---G----A---T--CTAAAAT-C-T------T------A----CT--C------CT----AA-----A------A-----------A-------T------C------------CG-AC-T-A-AT--A-G-------GCGAT-----G--T-A--T-A--T--ACTGGTA
gi|109334                     :                                                                                                                                                      tACTCG----C----C--T--A--TA-ATG-T-CGGA-T----------------------TTTTA----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--TCA--T-A--
gi|109332                     :                                                                                       gtcatagctgttttcaaaattggtaccattgatgatttcgccgactagaaaaatactgatctccACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T----------------------TTTT-----G---GG---A---G--T-AACAT-T-T------T------G----GT--C------------AG-----A------A-----------AGTCTATGT------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacggta
gi|109335                     :                                                               tgatgatagcgataattgtcgtagttgttttcaaaattaggtaccattgatgatttcgccgactagaaaaaaaactgatctctctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------G------G--------T------CC----AT-----A------A-----------GTCTATT-T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--TCA--T-A--atatacggta
gi|109333                     :                                                                                                  ttcaaaattggtaccatcgatgatttcgccgactagaaaaatactgatctcccACTCT----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA------------------------TTTTGG---G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT---------AC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-A-------GCGA------A--T-atatacggta
gi|109348                     :                                                                          atcgtcatagttgttttcaaaattaaattggtaccattgatgatttcgccatctagaaaaatactgatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T----------------------TTTTA----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--TCA--T-A--atatatggta
gi|109352                     :                                                                                                                                    agaaaaatactgatctcccACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-C--------------T-------GA--TTTTT-----G---GG---A---G--T-GAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacggt
gi|109349                     :                                                                                                                                agaaaaagactgatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT---------CC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------TG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatatggta
gi|109370                     :                                                                                                                                agaaaaatactgatctctctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G-----G--C------CC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------CG-AC-T-T-GT--A-G-------GCGA------G--T-atatac
gi|109353                     :                                                                                                                                  aaaaatactgatctctctaggACTCG----C----C--TGTA--TA-A-G-T-CGGA-T----------------------TTTT-----G---GG---A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----G---C------CC----AA-----A------A-----------G-------T------CTCTGTC------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatatggta
gi|109367                     :                                                                                                                               agaagaaatactgatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-TG---------------------GA--TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT---------CC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------TG-AC-T-T-AT--A-G-------GTGA------G--T-atatacggta
gi|109372                     :                                                                                                                                 gaaaaatactgatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-TGGA-T----------------------TTTT-----G---GG---A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------------AA-----A------A-----------AGTCTATGT------C------------CA-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatatggta
gi|109371                     :                                                                                                                                  aaaaatactgatctccctaggACTTG----T----C--T--A--TA-A-G-T-C---------------A------GA--TTTTT-----G---GG---A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GTGA------G--T-atatatacggta
gi|109355                     :                                                                                                                                  aaaaatactgatctccataggACTCC----C----C--T--A--TA-A-G-T-CCGA-T---------------------TTTTT-----G---G----A---G--T-AAAAC-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------G-----------GCTATG--T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacggta
gi|109346                     :                                                                                                                                agaaaaatactgatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T-------------------T--CG-----TC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCAA------G--T-atatacggta
gi|109343                     :                                                                                                                              gctagaaaaatgctgattccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-TT--------T------------TTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----AT---------CC----AA-----A------A-----------G-------TCCATGCC------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------atatacggta
gi|109337                     :                                                                                                                     tgactagaaaaatactgatctccctatgactcgaACTTG----C----T--T--A--TA-A-G-T-CGGA--------------------G--TTTTA-----G---A----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AATGTCTA------T-----------G-------T------C------------CG-AA-T-T-A---G-G-------GAGA------G--T-atatatggta
gi|109361                     :                                                                                                     gttaaaaattgctacatttcgccgactagaaaaatactgatctccataggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-C-----------------------TTTGG---G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT---------GC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------TG-AC-T-T-AA--A-G-------GCAA------G--T-atatac
gi|109373                     :                                                                                                                                agaaaaatactgatctccctaggACTCG----A----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA------------------------TTTT-----G---GGG--A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------C-----AA-----A------G-----------G-------T------CTTATGTT-----CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacagta
gi|109344                     :                                                                                                                                  aaaaatactgatcttcctaggACTCG----C----C--T--A--TA-T-G-T-CAGA------------------------TTTT-----G---GGG--A---G--T-AAGAT-T-TT-----C------A----T----------CC----AA-----A------A-----------G-------T------CTATGTC------CA-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacggta
gi|109364                     :                                                                                                                           tgactagaaaaacactgatctccttaggACTCA----C----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA--A---------------------TTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT---------CC----AA-----A------AGTCTAT-----G-------T------C------------TG-AC-T-T-AA--A-G-------GCGA------G--T-atatacggta
gi|109375                     :                                                                                                                                agaaaaatactgatctccctaggACTCG----C-------T--A--TA-A-G-T-CGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---G--T-GAAAT-T-T------T------G----GT---------CC----AA-----A------ATCTAT------G-------T------C------------CG-AC-TAT-AT--A-G-------GCGA------G--T----C-C--T--AC-GGatatccg
gi|109356                     :                                                                                                                                      aaaataatactgatctcACTCG----C----C--T--A---A-A-A-T-CGGA-T----------------------TTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------G------G----TT--C------CA----AAGTCT-A------T-----------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--TCA--T-A--ataatacggta
gi|109354                     :                                                                                                                                    agaaaaatactgatctcccACTCG----C-------T--A--TA-A-G-T-CGGA-T----------------------TTTT-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AAGTCT-A------T-----------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--TCA--T-A--atatacggta
gi|109359                     :                                                                                                                                    agaaaaatactgaactctcACTCA----C----C--T--A--TA-A-G-T-TGG--------------------GT--TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-G-T------T------G----GT--T------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AA-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacggt
gi|109357                     :                                                                                                                                agaaaaataccgatctccctcggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-AGGA-------------------------TTTGTG--G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----G------ATCTACATGTATG-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-C-------GCGA------G--T-atatacag
gi|109358                     :                                                                                                                                agaaaaataccaatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-AGGA-T----------------------TTGT-----G---G----A---GG-T-AAAAT-T-T------G------G----T----------CC----AA-----A------G-----------A-------T------CTACATGTATGTCCG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacggta
gi|109363                     :                                                                                                                                agaaaaataccgatctccctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-A-T-CGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---A--T-AAAAT-T-T------T------G----GT--CG-----AC----AAGTCT-A------T-----------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------TCGA------G--T-atatacggta
gi|109362                     :                                                                                                                                agataaatactgaactccttaggACTCG----C----C--T--A--TT-A-G-T-C---------------A------GA--TTTTT-----G---GG---A---G--T-ATAAT-T-T------T------G----GT--T------CT----AA-----A------GTCG--------A-------T------CTC----------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCAA------G--T-atata
gi|109368                     :                                                                                                                                agaaaaatactgatttcccttggACCCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CG---------------------GA--TTTTT-----G---G----A---G--T-GAAAT-C-T------T------G----GT--C------CA----AAAGTCTA------A-----------G-------T------C------------CG-AC---T-AT--A-G-------GC-A------G--T-atatacagta
gi|109374                     :                                                                                                                                  gaaaaatagtgatctcctaagACTCG----C----C-----------A-G-T-C---------------A------GA--TTTTT-----G---GG---A---G--T-ACAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-atatacagta
gi|109347                     :                                                                                                                                  aaaaatactgatcttcctgggACTCG----C----CG-T--A--TA-A-G-T-CGGA-T----------------------TTTT-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------T------G--------G------CC----AA-----A------A-----------AGTCTATGT------C------------CG-AC---T-GT--A-G-------GCGA------G--T-a
gi|109350                     :                                                                                                                                caaaaaaactgattctctctaggACTCG----C----C--T--A--TA-A-G-T-CG----A--------T-----------TTTTT-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------------------GT--C------CA----AAAGTTTA------A-----------G-------T------T------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCAA------atatatggta
gi|109351                     :                                                                                                                               agaaaaatgctgatctctctaggaACTCG----C----C--T--A---A-A-G-T-CG----------------------A--TTTTT-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------G------G-----T--C------CA----AA-----AGTTTA-A-----------G-------T------T------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCAA------atataggta
gi|109378                     :                                                                                                                               agaaaaatgctgatctctctaggaACTCG----T----C--T--A--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--CTTTT-----G---G----G---C--A-AAAAT-T-T------T------A----CT--C------CC----AA-----G------A-----------A-------T------C------------CA-AC-T-T-AA--A-G-------GTGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGTAatactacggta
gi|109378                     :                                                                                                                                                       ACTCA----C----C--T--T--TA-A-G-T-TGGA-T----------------------TCTT-----G---GG---A---G--T-AAAAT-T-T------T------------TG-C------CC----AA-----A------A-----------G-------T------CTATGTC------CG-AC-T-T-AT--A-G-------ACGA------G--T-
gi|109313                     :                                                                                                                                                       ACTCG----C----A--T--A--TA-A-G-T-CGG--------------------GT--TTTTT-----G---GG---A---G--T-AAAAT-A-T------C------G----AC--C------CT----GA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--atatacggta
gi|109312                     :                                                               attttctgctgactataccgaaattgacgcattcaaaattccgttaaatatcgcttgttgtatggcatgaaaaacattatgacattagACTCG----C----A--T--A--TA-A-G-T-CG-------------------------TTTTTTTTGGG---G----A---G--T-AAAAT-A-T------C------A----AT--C------CT----TA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------TG-AC-T-T-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--atatacggta
gi|109314                     :                                                               atttgctactaactataccgtcattgacgcattcaaaattccgttaaatatcgcttgttgtatgacaagaaaaatactatgacattagACTCG----C----A--T--A--TA-A-G-T-CGG-------------------------TTTT-----GTGGG----A---G--T-AAAAT-A-T------C------G----AT--C------TT----GA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT------------GCGA------G--T-A--atatacggta
gi|109380                     :                                                               atttgctactgaatatacggtcattgacgcattcaaaattccgtttaatatcgcttgttgtatgacaagaagaatattatgacattagACTCG----C----T--T--A--TA-A-G-T-CGGA-T---------------------TTTTT-----G---G----GT--C--C-AAAAG-T--------------------CT----------------------A------T-----------G-------T------C------------TG-AC-T-T-AT--A-A-------GCGatttacgtta
gi|109324                     :                                                                                                                                                       ACCCG----C----A--T--A--TA-A-G-T-CTG------------------------TTTTTTG---G---G----A---G--T-AAAAT-A-T------C------G----AT--C------CT----GA-----A------G-------------------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-T-------TCGC------G--T-A--acatgtatatacggta
gi|109316                     :                                                                   tttgctactgactatattaatataccgtcattgacccattcaaatatcgccttttgtatggcaagaaaaatattacgacattagACTCG----C----A--T--A--TA-A-A-T-CG-------------T-----------TTTTT-----G---GGAGTA---A--C-AAAAT----------C------G----AT--C------CT----GA-----A------GTCGAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-T-------GCGC------G--T-A--atatacggta
gi|109385                     :                                                                   attttccactgattaaaccgtcattgacgcattcaaattccgttaaatatcgctagttgtatggcaagaaaaatattatattagACTCG----C----C--T--A--GA-A-G-T-TGGA-T---------------------TTTTG-----G---G----A---G--T-AAAAT-T-T------atacaccgta
gi|109326                     :                                                                                                                                                  gaccaATTCG----C----AG-T--A--GA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--CTTCG-----G---G----A---T--C-GATTT-T-T------TA-----A----CT--C------CC----AA-----A------A-----------A--------------C------------CG-AC---T-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--AC-GGatatacggta
gi|109379                     :                                                               ttggtactgacaaacacagtcattgacgcatttcaaaatttcattaaatattgctagctttatggcaagaaaatgttatgacattaatACTCG----C----TCAT--A--TA-A-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--C-TTT-----G---G----AT--C--C-AAAATCT-T------T------A----CT--C------CC----AA-----A------A-----------A-------
gi|109360                     :                                                                                                                                                        CTCG----C----CC-T--A--TA-A-G-T-CGGA-T----------------------TTTT-----G---G----G---A--G-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-
gi|109376                     :                                                                                                                           agaaaaatactgatctccctagtcctaggCTCG----C----CC-T--A--TA-A-G-TTCGGA-T----------------------TTTT-----G---G----G---A--G-AAAAT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-gtatatacagta
gi|109345                     :                                                                                                                                      aaaatactgattccctaggTCA----C----C--T--A--AA-A-G-T-C---------------A------GA--TTTTT-----G---GG---A---G--T-AAACT-T-T------T------G----GT--C------CA----AA-----A------GTCTAT------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-G-------GCGA------G--T-gtatatacagta
gi|109377                     :                                                                                                                             tgccaagaaaaatactgatctcccaaggTCG----C----C--T--A--TT-A-G-T-CG---------------------GA--TTTTTA----G---G----A---G--T-AAGAT-T-T------T------A----GA--T------CC----AA-----ACGTCTTAT----------G-------T------C------------CG-AC-T-T-AA--A-G-------GCGT------G--T-ttat
gi|109380                     :                                                                                                                                                     ttaggCG----C----T--T--A--TA-A-G-T-CAGA-CA--------TA------GA--CTTTT-----G---G----A---C--C----------------C------A---------------------AA-----A------A-----------A-------T------C------------CG-AC-T-T-AT--A-A-------GCGAGTACATG--T-A--T-A--T--AC-GGTAtgtatatactggta
gi|109325                     :                                                                                                                                                          CG----C----A--T--G--TA-A-G-T-TGGA-CATACATGCGTA------GA--CTTCA-----G---G----A---T--C-GGGA--T-T------C------ATTTTCT--C------CC----TA-----A------A-----------A-------A------C------------AA-GC-T-A-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T----T--AC-GGTA
gi|109341                     :                                                             tttcttactgattaactgtcattgaccgcattcaaaattccgttaaaatgtccgctactgcgtggcgaagaaaaaatatttatgacattatatgG----C----A--T--A--CA-A-G-T-CAAA-CA--------CACTAA--AA--CTTCA-----C---A----A---T--C-ACAAT-T-T------T------A----CT--C------CA----AA-----A------G-----------A--------------C------------CA-AC-T-T-AC--A-GTACATATGTGA------G--T-A--T-A--T--
gi|109381                     :                                                                                                                                gttgtgcagcaagaaaaaatttccagcagtactatgca--T--A--TA-A-G-T-TGGA-TA--------TA------GA---TATC-----G---G----AG--T--C-AAAAT-T-T------G------A----TT--C------TC----AA-----A------G-----------C-------T------G------------TG-AC-T-T-AC--A-T-------GCGA------G--T-ATAT-A--T--AC-AGTA
gi|109331                     :                                                                                                                                                                      --T--A--TA-A-GAT-CCGA-CA--------CA------GG--CTTTG-----A---G----A---T--C-AATTG-T-T------T------A----CTTCC------CC----AA-----A------A-----------A-------T--------------------G-AT-C-T-GT--A-T-------GCGA------G--T-T--T-A--T--AC-GG
gi|109318                     :                                                                                      ctactgaataaatcgtcattgactcatttaaaattttgttaaatgtctatagtggcgtggcaagaacatattatggcattatg--A--TATA-G-T-CGGA-CA--------TA------GA--TTTCA-----G---G----G---T--C-GATAT-T-T------T------A----CT--C------CA----AA-----G------A-----------A-------T------C------------CGTAC-T-T-AT--A-T-------GCGA------G--T-AT-T-A--T---C-GGTA
gi|109329                     :                                                                                   atttgctaccgactataccgtaattgacgacctaaaaatttccattaaagtcgcttgttgtatggcatgaaaaatattatgacattgtcctcccata-T-TGAA-CA--------TA------AA--ACTTC-----A---G----AGAGT--C-AAAAT-T-T------T------A----CT--C------CC----AA-----A------A-----------C-------C------C------------CA-AC-A-T-AT--A-
gi|109382                     :                                                                                                                       gttaccgattaaatcgacattaatgtatcaaaaatgccatcagatgtcgcaagaaaaattcctgtagttga--------TA------GA--CTTCA-----G---G----A---T--C-GATAT-T-T------T------A----CT--C------CA----AA-----A------T-----------A-------A------A------------CA-AC-T-T-AT--T-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--Atagaggat
gi|109383                     :                                                                                                                                                                                                       A------GA--CTTCA-----G---G----G---T--C-GATAT-T-T------T------A----CT--C------CCCCCCAA-----A------A-----------A-------A------C------------CG-AT-T-T-CT--A-T-------ACGA------G--T-A--T-A--T--AC-G
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-287 )      :                                                                                     NNNNNNNNNNNCGATAATCGTCG-TAGTTGT-----TTTCAAAATT-----GNTACCA-T-GATG-ATNTCGCC--------GACT--------AGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGGA-N---C-A-------AAAT-T---TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109332                     :             ctactgaataaatcgtcattgactcatttaaaattttgttaaatgtctatagtggcgtggcaagaacatattatggcattatgCGATAATTGTCG-TAGTTGT-----TTTCAAAATTA----GGTACCA-TTGATG-ATTTCGCC--------GACT--------AGAA-AAAA-AAC--T----G--A-T-CTCT----C-TA------GGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTCTGA-C---C-A-------AAAT-G---TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109333                     :                                                                                            tgatgatagATCGTCA-TAGTTGT-----TTTCAAAATTAAATTGGTACCA-TTGATG-ATTTCGCC--------ATCT--------AGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGATTCG----C----T--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGTA-C---C-A-------AAAT-T---TT------ACT--C------CC--------CA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GAGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
gi|109334                     :                                                                                                        GTCA-TAGCTGT-----TTTCAAAATT-----GGTACCATT-GATG-ATTTCGCC--------GACT--------AGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CT-C----C-TA------TGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGGA-C---C-A-------AAAT-T---TT------ACT--C------CT--------AA--AAATCCG-ACATT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109335                     :                                                                                                                          TTCAAAATT-----GGTACCA-TCGATG-ATTTCGCC--------GACT--------AGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------TGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-AA------TA--------G-A--CTTATGGA-C---C---------AAAT-T---TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109336                     :                                                                                                                                                                           --------AGAA-AAAT-A-T--TAT--G--A-G-TT--------TA------GTATGCA----C----A--TA--TA--AG-TCAG-A-CA------TA--------G-A--CTTTAGGA-T---T-G-------ACTT-T---TC------ACT--C------CC--------AA--AAAACTT-AC-TT-AT--A-T-------GTGA------G--T-A--T-A--TAAA-C-GGTA
gi|109337                     :                                                                                         aacattccgttaaatttcgctagttgtgtggcaTTAAAAATT-----GCTAC----------ATTTCGCC--------GACT--------AGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----A-TA------GGACTCT----C----C--C---TA--AT-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CATTTGGA-C---C-A-------AAAT-T---TT------ACT--T------CT--------AA--AACTCCG-AC-TT-AT--A-A-------GCAA------G--T-A--T-A--T--A-C-
gi|109338                     :                                                                                                                                                                                                                                 gACTCG----CAA--T--AA--TACTAG-TCGGTA-CAA-----TA--------GCA--CATTGAGA-G---C-GTTGATATAAAT-T---TA------ACT--C------CCC-------AA--AAAACTG-AC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109339                     :                                                                                                                            aaatattatggcgcatgaaaagtaatataattaatgaaaattaagta--------AGAA-AAAT-A-T--TATGAG--A-T-----------TA------GTACTCA----T----A--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------A-A--CTTAAGGA-T---C-T-------AT-T-T---TT------ACC--C------CCCCCCCCCAAATTAAAACCG-AC-TT-AT--G-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109340                     :                                                                                                                                                                    tcgctagttgtatagcaAA-AAAT-A-T--T-------A-T-GACA----T-TA------GTATGCG----C----A--TA--TA--AG-TCAG-G-CA------CA--------G-A--CTTCAGGA-T---C-G-------ATA--T---TT------ACT--C------CCCAA-----AA--AAACCCG-AC-TT-AT--A-T-------GTGA------G--T-A--T----T--A-C-GGTA
gi|109341                     :                                                                                                                                                                                                                        gcttgttgatggcaG----C----A--TA--CA--AG-TCAA-A-CA------CACTAA----A-A--CTTCACAA-T---C-A-------CAAT-T---TT------ACT--C------CA--------AA--AGA-CCA-AC-TT-AC--A-GTACATATGTGA------G--T-A--T-A--T--
gi|109342                     :                                                                                                                                     gttgtgcagcaagaaaaaatttccagcagtactatgca--------AGAA-AAAT-A-T--T----ATAA-C-ATTT----A-TA------GTACGTG----CATATT--TA--TA--CG-TCGG-T-CA------TA--------G-A--CTTCAGGA-T---C-G-------ATAT-T---TT------ACT--C------CC--------
gi|109343                     :                                                                                                                                                          tggca--------GACT--------AGAA-AAAT-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------TGACTCGATCGC----C--TA--TA--AG-TCGG-G-CA------TG--------G-A--CTTTTGGA-T---C-A-------AAAT-T---TT------ACT--C------CCA-------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
gi|109344                     :                                                                                                                                                              t--------GACT--------AGAA-AAAC-A-C--T----G--A-T-CTCC----T-TA------GGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TTGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGGA-T---G-A-------AAAT-C---TT------ACT--C------CC--------CA--AAATCTG-AC-AT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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Reference ( family-287 )      :                                                                                    NNNNNNNNNNNCGATA-ACCGTCATAG-TCGT----TTTCAAAATT-----GGTACCG-TN-ATG-ATNTCGCC--------GACT---------AGAA-AAA-T-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGGA-C--C-G-------AAAT-T---TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109326                     :                                                                                        tttcttactgat-ACAGTCATTG-ACGCA---TTTCAAAATT---------TCA-TT-A-A-ATATTGCT--------AGCTTTATGGC--AAGA-AAA-T-G-T--T-------A-T-GACA----T-TA------ATATTCG----C----AG-TA--GA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTCGGGA-T--C-G-------ATTT-T---TTA-----ACT--C------CC--------AA--AAA-CCG-AC--T-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GG
gi|109327                     :                                                                                    ttggtactgacaaacA-ACCGTCATTA-TTATATTCCTTCGAAATT---------CCG-TG-A-A-ATGTCGCTAGTTATGTGGCA---------AGAA-AAA-T-A-T--T----T--A-T-GAC--------A------GTATGCG----C----A--TA--TA--AG-TTGG-A-CA------TA--------G-A--CTTCAGGC-T--C-G---------ATGT---TT------ACT--C------CC--------
gi|109330                     :                                                                                                              ttccttctaactaCAAAATT---------CCG-TT-A-A-ATGT-GT---------GGCA---------AGAA-AAA-T-A-TCAT----G--A-----CA----C-TA------ATATGCG----C----A--CA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTCATGC-T--C-G-------ATTT-T---TT------ACT--CCCTCTTCC--------AA--AAAACCG-AC-TT-AT--ccttaacgacaagctacacttgagcaatgcgagtatttac
gi|109331                     :                                                                                                                                                                                                              ctactgggctatttccctcaccgcaaatgacaaacg--TA--TA--AGATCCG-A-CA------CA--------G-G--CTTTGAGA-T--C----------AAT-TGT-TT------ACTTCC------CC--------AA--AAAT--G-AT-CT-GT--A-T-------GCGA------G--T-T--T-A--T--A-C-GG
gi|109332                     :            ctactgaataaatcgtcattgactcatttaaaattttgttaaatgtctatagtggcgtggcaagaacatattatggcattatgCGATA-ATTGTCGTAG-TTGT----TTTCAAAATTA----GGTACCA-TTGATG-ATTTCGCC--------GACT---------AGAA-AAA-A-AAC--T----G--A-T-CTCT----C-TA------GGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTCTGA-C--C-A-------AAAT-G---TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109333                     :                                                                                           tgatgatag-ATCGTCATAG-TTGT----TTTCAAAATTAAATTGGTACCA-TTGATG-ATTTCGCC--------ATCT---------AGAA-AAA-T-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------GGATTCG----C----T--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGTA-C--C-A-------AAAT-T---TT------ACT--C------CC--------CA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GAGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
gi|109334                     :                                                                                                        GTCATAG-CTGT----TTTCAAAATT-----GGTACCATTG-ATG-ATTTCGCC--------GACT---------AGAA-AAA-T-A-C--T----G--A-T-CT-C----C-TA------TGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CTTTTGGA-C--C-A-------AAAT-T---TT------ACT--C------CT--------AA--AAATCCG-ACATT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109335                     :                                                                                                                         TTCAAAATT-----GGTACCA-TCGATG-ATTTCGCC--------GACT---------AGAA-AAA-T-A-C--T----G--A-T-CTCC----C-TA------TGACTCG----C----C--TA--TA--AG-TCGG-A-AA------TA--------G-A--CTTATGGA-C--C---------AAAT-T---TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109337                     :                                                                                                                   aacattTTAAAAATT-----GCTAC----------ATTTCGCC--------GACT---------AGAA-AAA-T-A-C--T----G--A-T-CTCC----A-TA------GGACTCT----C----C--C---TA--AT-TCGG-A-CA------TA--------G-A--CATTTGGA-C--C-A-------AAAT-T---TT------ACT--T------CT--------AA--AACTCCG-AC-TT-AT--A-A-------GCAA------G--T-A--T-A--T--A-C-
gi|109338                     :                                                                                                                                                                                                                                  gACTCG----CAA--T--AA--TACTAG-TCGGTA-CAA-----TA--------GCA--CATTGAGA-G--C-GTTGATATAAAT-T---TA------ACT--C------CCC-------AA--AAAACTG-AC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109339                     :                                                                                                                           aaatattatggcgcatgaaaagtaatataattaatgaaaattaagta---------AGAA-AAA-T-A-T--TATGAG--A-T-----------TA------GTACTCA----T----A--TA--TA--AG-TCGG-A-CA------TA--------A-A--CTTAAGGA-T--C-T-------AT-T-T---TT------ACC--C------CCCCCCCCCAAATTAAAACCG-AC-TT-AT--G-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109320                     : atttgctactgactaaactgtcattgacgctttcaaaattccattaaatgtcgctagttgtant--A-ACAATCATT-AAC-G----CACT-CAAAGTA---------CTGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--T--GT----TG----GCAA--GGA-AAAT-A-T--T----ACCACA-T-TTAAT----T-TA------GTATT---T-G----C----A--CA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TG------G-A--CTTAAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TTTAAC--ACC--C------CC--------
gi|109321                     :                                              atttgctaatgacaaCGAT--G-ATCGTGATA-ATC-G----TTTT-AAAAATT---------G-GTACAT-GC--ATGTCGC---C---------------G----ACCA--GAA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TC------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTAccccccaaagtcttatatcgagtgcat
gi|109322                     :                                                      atttgtctgga--A-ACTGTCATT-GAC-G----CATT-CAAAATT---------CCGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--G--GTA---TG----GCAA--G
gi|109323                     :                                                     atttgctactgacta-ACTGTCATTTAAC-A----GATT-AAAAATT---------TCAT---TTAA--ATGTCAC---TAAT--T--GT----TGT---GCCA---AG-AAAT-A----T----G----A-T-TA-TC----A-TG------GGCAT---A-A----C----A--TA--TA--A----G-TCAG-A-CA---------A------G-A--CTTCAGGA---T--T-A-------AAAA---T--TC------ACT--A------CC--------AA--
gi|109324                     :                                               atttgcgcagactaggAT--ATACCGTCATT-GAC-C----CATT-CAAA--------------------------TATCGC---C--T--TTTGTA---TG----GCAA--GAA-AAAT-A-T--TAC--G----A------CA----T-TA------GTACG---C-G----A----A--TA--TA--A----G-TCGG-A-C-----------------------TTCAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAAACAG-AC-TT-AT--A-T-------GCGG------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109325                     :                                             tttgctactgactatattaT--A-ACTGTCATT-GACCG----CATT-CAAAATT---------CCGT---TAAA--ATGTCCG---C--TACT--GCG---TG----GCGAAGAAA-AAAT-A-T--T----T----A-T-GA-CA----T-TA-------TATG---C-G----C----A--TG--TA--A----G-TTGG-A-CATACATGCGTA------G-A--CTTCAGGA---T--C-G-------GGATTCAT--TT------TCT--C------CC--------TA--AAAACAA-GC-TA-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T----T--A-C-GGTA
gi|109326                     :                                                        tttcttactgat-ACAGTCATT-GAC-G----CATTTCAAAATT---------TCAT---T-AA--ATATTGCTAGC--T--T--TA----TG----GCAA--GAA-AA-T-G-T--T---------A-T-GA-CA----T-TA------ATATT---C-G----C----AG-TA--GA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTCGGGA---T--C-G-------ATTT---T--TTA-----ACT--C------CC--------AA--AAA-CCG-AC--T-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GG
gi|109327                     :                                                  ttggtactgacaaac--A-ACCGTCATT-ATT-ATATTCCTT-CGAAATT---------CCGT---G-AA--ATGTCGC---TAGT--T--ATG---TG----GCAA--GAA-AAAT-A-T--T----T----A-T-GA-C--------A------GTATG---C-G----C----A--TA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TA------G-A--CTTCAGGC---T--C-G---------ATG--T--TT------ACT--C------CC--------
gi|109328                     :                                                    ttccttctaacta--A-ACCGTCATT-GAC-G----CATT-CAAAccttaacgacaagctacacttgagcaatgcgagtatttac
gi|109329                     :                                                  gctactgattaCGATTAA-ATCGACATT-AAT-G----TATC-AAAAATG---------CCAT---C-AG--ATGTCGC--------------------------AA--GAA-AAAT---------------------T-CC----TGTA------G---T---T-G-------------------------A-TTGA-A-CA--------TA------A-A--ACTTCAGAGAGT--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AACCCCA-AC-AT-AT--A-
gi|109330                     :                                                                                       gttac-CAAAATT---------CCGT---T-AA--ATGT---------------GT-----G----GCAA--GAA-AAAT-A-TCAT----G----A------CA----C-TA------ATATG---C-G----C----A--CA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTCATGC---T--C-G-------ATTT---T--TT------ACT--CCCTCTTCC--------AA--AAAACCG-AC-TT-AT--tagaggat
gi|109331                     :                             ctactgggctatttccctcaccgcaaatgacaaacg--A-ATCGTCATT-GAC-T----CATT-TAAAATT---------TTGT---T-AA--ATGTC-T---A--T--A--GTGGCGTG----GCAA--GAA-CA-T-A-T--T---------A-T-GG-CA----T-TA------TG---------------------TA--TA--A----GATCCG-A-CA--------CA------G-G--CTTTGAGA---T--C----------AAT---TGTTT------ACTTCC------CC--------AA--AAAT--G-AT-CT-GT--A-T-------GCGA------G--T-T--T-A--T--A-C-GG
gi|109332                     :                                                   ctactgaataCGAT--A-ATTGTCGTA-GTT-G----TTTT-CAAAATTAGGTA----CCAT---T-GATGATTTCGC---C---------------G----ACTA--GAA-AAAA-AAC--T----G----A-T-CT-CT----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTCTGA---C--C-A-------AAAT---G--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109333                     :                                                           tgatgatag-ATCGTCATA-GTT-G----TTTT-CAAAATTAAATTGGTACCAT---T-GATGATTTCGC---C--A--T---------------CTA--GAA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGATT---C-G----C----T--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGTA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------CA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GAGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
gi|109334                     :                                                                        GTCATA-GCT-G----TTTT-CAAAATTGGTA-----CCAT---T-GATGATTTCGC---C---------------G----ACTA--GAA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC------TA------TGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CT--------AA--AAATCCG-ACATT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109335                     :                                                                                          TT-CAAAATTGGTA-----CCAT---C-GATGATTTCGC---C---------------G----ACTA--GAA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------TGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-AA--------TA------G-A--CTTATGGA---C--C---------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109336                     :                                                                                              AACATT---------CCGT---T-AA--ATTTCGC---TAGT--T--GTG---TG----GCAA--GAA-AAAT-A-T--TAT--G----A-G-TT---------TA------GTATG---C-A----C----A--TA--TA--A----G-TCAG-A-CA--------TA------G-A--CTTTAGGA---T--T-G-------ACTT---T--TC------ACT--C------CC--------AA--AAAACTT-AC-TT-AT--A-T-------GTGA------G--T-A--T-A--TAAA-C-GGTA
gi|109337                     :                                                                                          TT-AAAAATT-----------GC---T-AC--ATTTCGC---C---------------G----ACTA--GAA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----A-TA------GGACT---C-T----C----C--C---TA--A----T-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CATTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--T------CT--------AA--AACTCCG-AC-TT-AT--A-A-------GCAA------G--T-A--T-A--T--A-C-
gi|109338                     :                                                                                                                                                                                                               gACT---C-G----CAA--T--AA--TACTA----G-TCGGTA-CAA-------TA------GCA--CATTGAGA---G--C-GTTGATATAAAT---T--TA------ACT--C------CCC-------AA--AAAACTG-AC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109342                     :                                                                                                                                       gttgtgca----TG----GCAA--GAA-AAAT-A-TTAT----A----A-C-AT-TT----A-TA------GTACG---T-G----CATATT--TA--TA--C----G-TCGG-T-CA--------TA------G-A--CTTCAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CC--------
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gi|109346                     :                                                                                                                                                     ----GCTA--GAA-AAAT-G-C--T----G----A-T--T-CC----C-TA------GGACT---T-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTG-A---C--G-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109349                     :                                                                                                                                                            A--GAA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CT----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCAG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-
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Reference ( family-287 )      :                                                  NNNNNNNNNNNCGAT--A-ACCGTCATT-G----AC-GCATT-CAAAA--TT---------CCGT---T-AA--ATGTCGC---C--T--T--GT----TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-G-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109318                     :                                                    attaggtactgactat-ACCGTAATT-G----AC-G-ACC-TAAAAATTT---------CCAT---T-AA--A-GTCGC---T--TGTT--GTA---TG----GC-ATG-AA-AAAT-A-T--T----ATGACA-T-TG-TC----C-T----------------------C----C--CA--TA--ATATAG-TCGG-A-CA--------TA------G-A--TTTCAGGG---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CA--------AA--GAATCCGTAC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T----T--ATC-GGTA
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gi|109319                     :                                                                       atttgctactgacta-GCTTT-CAAAA--TT---------CCAT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--T--GTA---TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-T--T---------A-T-AA-CA----T-TA------GTATG---T-G----C----A--TA--TA--A----G-TTGG-A-CA----------------G-A--CTTCAGGA---T--C-G-------A---------TT------A--------------------------AA-CCG-AC-TT-AT--G-T-------GCGA------C--T-A--T-A--C--A-T-GGTAtantgctttcaaaattccattaaatgtcactagttgtatggcaagaaaaatattataacattagtatgtgcatataagttggacagacttcaggatcgattaaaccgacttatgtgcgactatacatggta
gi|109320                     : atttgctactgactaaactgtcattgacgctttcaaaattccattaaatgtcgctagttgtant--A-ACAATCATT-A----AC-GCACT-CAAAG--TA---------CTGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--T--GT----TG----GC-AAG-GA-AAAT-A-T--T----ACCACA-T-TTAAT----T-TA------GTATT---T-G----C----A--CA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TG------G-A--CTTAAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TTTAAC--ACC--C------CC--------
gi|109321                     :                                              atttgctaatgacaaCGAT--G-ATCGTGATA-A----TC-GTTTT-AAAAA--TT---------G-GTACAT-GC--ATGTCGC---C---------------G----AC-CAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TC------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTAccccccaaagtcttatatcgagtgcat
gi|109322                     :                                                      atttgtctgga--A-ACTGTCATT-G----AC-GCATT-CAAAA--TT---------CCGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--G--GTA---TG----GC-AAG-
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gi|109327                     :                                                  ttggtactgacaaac--A-ACCGTCATT-ATTATAT-TCCTT-CGAAA--TT---------CCGT---G-AA--ATGTCGC---TAGT--T--ATG---TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-T--T----T----A-T-GA-C--------A------GTATG---C-G----C----A--TA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TA------G-A--CTTCAGGC---T--C-G---------ATG--T--TT------ACT--C------CC--------
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gi|109329                     :                                                  gctactgattaCGATTAA-ATCGACATT-A----AT-GTATC-AAAAA--TG---------CCAT---C-AG--ATGTCGC---------------------------AAG-AA-AAAT---------------------T-CC----TGTA------G---T---T-G-------------------------A-TTGA-A-CA--------TA------A-A--ACTTCAGAGAGT--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AACCCCA-AC-AT-AT--A-
gi|109330                     :                                                               gttac-ACCGCAAAT-G----AC-AAACG-CAAAA--TT---------CCGT---T-AA--ATGT---------------GT-----G----GC-AAG-AA-AAAT-A-TCAT----G----A------CA----C-TA------ATATG---C-G----C----A--CA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTCATGC---T--C-G-------ATTT---T--TT------ACT--CCCTCTTCC--------AA--AAAACCG-AC-TT-AT--tagaggat
gi|109331                     :                                              ctactgggctatttccctc--A-ATCGTCATT-G----AC-TCATT-TAAAA--TT---------TTGT---T-AA--ATGTC-T---A--T--A--GTGGCGTG----GC-AAG-AA-CA-T-A-T--T---------A-T-GG-CA----T-TA------TG---------------------TA--TA--A----GATCCG-A-CA--------CA------G-G--CTTTGAGA---T--C----------AAT---TGTTT------ACTTCC------CC--------AA--AAAT--G-AT-CT-GT--A-T-------GCGA------G--T-T--T-A--T--A-C-GG
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gi|109338                     :                                                                                                                                                                                                                 gACT---C-G----CAA--T--AA--TACTA----G-TCGGTA-CAA-------TA------GCA--CATTGAGA---G--C-GTTGATATAAAT---T--TA------ACT--C------CCC-------AA--AAAACTG-AC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109318                     :                                                    attaggtactgactat-ACCGTAATT-G----AC-G-ACC-TAAAAATTT---------CCAT---T-AA--A-GTCGC---T--TGTT--GTA---TG----GC-ATG-AA-AAAT-A-T--T----ATGACA-T-TG-TC----C-T----------------------C----C--CA--TA--ATATAG-TCGG-A-CA--------TA------G-A--TTTCAGGG---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CA--------AA--GAATCCGTAC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T----T--ATC-GGTA
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gi|109319                     :                                                                       atttgctactgacta-GCTTT-CAAAA--TT---------CCAT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--T--GTA---TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-T--T---------A-T-AA-CA----T-TA------GTATG---T-G----C----A--TA--TA--A----G-TTGG-A-CA----------------G-A--CTTCAGGA---T--C-G-------A---------TT------A--------------------------AA-CCG-AC-TT-AT--G-T-------GCGA------C--T-A--T-A--C--A-T-GGTAtantgctttcaaaattccattaaatgtcactagttgtatggcaagaaaaatattataacattagtatgtgcatataagttggacagacttcaggatcgattaaaccgacttatgtgcgactatacatggta
gi|109320                     : atttgctactgactaaactgtcattgacgctttcaaaattccattaaatgtcgctagttgtant--A-ACAATCATT-A----AC-GCACT-CAAAG--TA---------CTGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--T--GT----TG----GC-AAG-GA-AAAT-A-T--T----ACCACA-T-TTAAT----T-TA------GTATT---T-G----C----A--CA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TG------G-A--CTTAAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TTTAAC--ACC--C------CC--------
gi|109321                     :                                              atttgctaatgacaaCGAT--G-ATCGTGATA-A----TC-GTTTT-AAAAA--TT---------G-GTACAT-GC--ATGTCGC---C---------------G----AC-CAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TC------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTAccccccaaagtcttatatcgagtgcat
gi|109322                     :                                                      atttgtctgga--A-ACTGTCATT-G----AC-GCATT-CAAAA--TT---------CCGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--G--GTA---TG----GC-AAG-
gi|109323                     :                                                     atttgctactgacta-ACTGTCATTTA----AC-AGATT-AAAAA--TT---------TCAT---TTAA--ATGTCAC---TAAT--T--GT----TGT---GCCAAG-AA-A--T-A----T----G----A-T-TA-TC----A-TG------GGCAT---A-A----C----A--TA--TA--A----G-TCAG-A-CA---------A------G-A--CTTCAGGA---T--T-A-------AAAA---T--TC------ACT--A------CC--------AA--
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gi|109327                     :                                                  ttggtactgacaaac--A-ACCGTCATT-ATTATAT-TCCTT-CGAAA--TT---------CCGT---G-AA--ATGTCGC---TAGT--T--ATG---TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-T--T----T----A-T-GA-C--------A------GTATG---C-G----C----A--TA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TA------G-A--CTTCAGGC---T--C-G---------ATG--T--TT------ACT--C------CC--------
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gi|109329                     :                                                  gctactgattaCGATTAA-ATCGACATT-A----AT-GTATC-AAAAA--TG---------CCAT---C-AG--ATGTCGC---------------------------AAG-AA-AAAT---------------------T-CC----TGTA------G---T---T-G-------------------------A-TTGA-A-CA--------TA------A-A--ACTTCAGAGAGT--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AACCCCA-AC-AT-AT--A-
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gi|109334                     :                                                                        GTCATA-G----CT-GTTTT-CAAAA--TTGGTA-----CCAT---T-GATGATTTCGC---C---------------G----AC-TAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC------TA------TGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CT--------AA--AAATCCG-ACATT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109338                     :                                                                                                                                                                                                                 gACT---C-G----CAA--T--AA--TACTA----G-TCGGTA-CAA-------TA------GCA--CATTGAGA---G--C-GTTGATATAAAT---T--TA------ACT--C------CCC-------AA--AAAACTG-AC-TT-AT--A-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109342                     :                                                                                                                                         gttgtgca----TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-TTAT----A----A-C-AT-TT----A-TA------GTACG---T-G----CATATT--TA--TA--C----G-TCGG-T-CA--------TA------G-A--CTTCAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CC--------
gi|109343                     :                                                                                                                                                 ----TG----AC-TAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------TGACT---C-GATCGC----C--TA--TA--A----G-TCGG-G-CA--------TG------G-A--CTTTTGGA---T--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CCA-------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
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gi|109366                     :                                                                                                                                                               AG-AA-AAAA-A-T--T----G----A-T-CT-TC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCAC-A-TA--------TA------T-A--C-TTTGGA---C--C-A-------ACAA---T--TC------ACTA-T------CT--------AA--AAATCCG-A--TT-ATA-A-G-------GCGA------G--TAA--T-GATT--A-C-GGTA
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gi|109370                     :                                                                                                                                                                 -AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CT----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--CA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGG---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
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gi|109372                     :                                                                                                                                                                 -AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TTGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTTGA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCA-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------GTAT-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109377                     :                                                                                                                                                                                                       -TA------GGACA---C-G----C----C--TT--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TAA-----G-A--CGTTTGGA---T--CTA-------AAAT---C--TT------ACT--C------CT--------AA--AAATCCG-AC-TA-AT--A-G-------GCGAT-----G--T-A--T-A--T--A-CTGGTA
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gi|109379                     :                                                                                                                                                                                                                  ACT---C-G----C----TCATA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--C-TTTGGAT--C--C-A-------AAATC--T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAA
gi|109380                     :                                                                                                                                                                                                                     ---C-G----C----T--TA--TA--A----G-TCAG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C-----------------------------------C------CA--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-A-------GCGAGTACATG--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109381                     :                                                                                                                                                                                                                                     --TA--TA--A----G-TTGG-A-TA--------TA------G-A---TATCGGAG--T--C-A-------AAAT---T--TG------ATT--C------TC--------AA--AGCTGTG-AC-TT-AC--A-T-------GCGA------G--T-ATAT-A--T--A-C-AGTA
gi|109382                     :                                                                                                                                                                                                                                                               --------TA------G-A--CTTCAGGA---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CA--------AA--ATAAACA-AC-TT-AT--T-T-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-
gi|109383                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        A------G-A--CTTCAGGG---T--C-G-------ATAT---T--TT------ACT--C------CCCCCC----AA--AAAACCG-AT-TT-CT--A-T-------ACGA------G--T-A--T-A--T--A-C-G
gi|109384                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGA---C--C-A-------AAAT---T--TC------ACT--C------TC--------AA--AAATCCG-AT-TT-AT--A-G-------GCAA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
gi|109385                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                          GA---C--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCA-AC-TT-CT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA


blockSeqs                     :                                                                 TA T         T TTAT  C     T     AT  AAATTGGTA    ACA T  TG       ATAGTGGCG           TCTT  C               CA ATGAC       TC    AAAA G  GTCCTA     ATG   ATCG ATATT        CT TATA           TACATGCG  CATGTA         A   GAG    GTTGATAT     TCA GT  TTATTA   TC CCTCTT  CCCCCCCA           T  A     AC GTACATAT     GTACAT           AT
blockSeqs                     :                                                                 .  T         . .     .     .     .   AGGTA        .   A  TG       TTGTTGTA            ATG   G               TA ACCAC       G     AG   G  .          .     .    AAT          T  .              TACATG    CTAA           A   T      TA           G   G   TAAC     C  CG      CCCC               A  A     A  CG           G                C 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   GGTA         .   .  TG       TTGTTGTA            T     .               A  ATGAG       G     .    .  .          .     .    TCA          .  .              A         A              A   G      G            C   .   A        A  .       CAA                .  .     .  GG           G                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   GGTA         .   .  TG       TTTTTGTA            .     .               .  ACG         G     .    .  .          .     .    AG           .  .              .         A              A   .      G            .   .   .        .  .       TA                 .  .     .  TG           T                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTTGTA            .     .               .  ATG         A     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       A                  .  .     .  GG           .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TTGTTGTA            .     .               .  G           T     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       C                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTTGTA            .     .               .  G           A     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       A                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTGGTA            .     .               .  G           T     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        CTTTTGTA            .     .               .  T           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        CTACTGCG            .     .               .  T           T     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGCTTTA            .     .               .  G           G     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                 .  .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTTATG            .     .               .  G           G     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              A   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTTGTG            .     .               .  G           G     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              G   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTTGTA            .     .               .  G           G     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAGTTGT             .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              C   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        TAATTGT             .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        CTTAT               .     .               .  A           C     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              G   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        CTAGT               .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              C   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        CATCT               .     .               .  G           T     .    .  .          .     .    T            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        CTTGT               .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                    .         . .     .     .     .   .            .   .  .        GT                  .     .               .  G           G     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                              . .     .     .     .   .            .   .  .        C                   .     .               .  G           T     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                      .     .     .   .            .   .  .        C                   .     .               .  G           A     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  A            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                            .     .   .            .   .  .        C                   .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              G   .      T            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                            .     .   .            .   .  .        C                   .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                   C                   .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    A            .  .              .         .              A   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .                   .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              A   .      G            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              A   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .     .               .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .     .               .  A           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .                     .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           T     .    .  .          .     .    G            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              G   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              A   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  G           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           C     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           .     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  G            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           .     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  A            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           .     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .           .     .    .  .          .     .    C            .  .              .         .              T   .      A            .   .   .        .  .       .                  .  .     .  T            .                . 
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Reference ( family-287 )      :                                                  NNNNNNNNNNNCGAT--A-ACCGTCATT-G----AC-GCATT-CAAAA--TT---------CCGT---T-AA--ATGTCGC---C--T--T--GT----TG----GC-AAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------GGACT---C-G----C----C--TA--TA--A----G-TCGG-A-CA--------TA------G-A--CTTTTGGA---C--C-G-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-C-GGTA
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gi|109322                     :                                                      atttgtctgga--A-ACTGTCATT-G----AC-GCATT-CAAAA--TT---------CCGT---T-AA--ATGTCAC---TAGT--G--GTA---TG----GC-AAG-
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gi|109329                     :                                                  gctactgattaCGATTAA-ATCGACATT-A----AT-GTATC-AAAAA--TG---------CCAT---C-AG--ATGTCGC---------------------------AAG-AA-AAAT---------------------T-CC----TGTA------G---T---T-G-------------------------A-TTGA-A-CA--------TA------A-A--ACTTCAGAGAGT--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CC--------AA--AACCCCA-AC-AT-AT--A-
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gi|109343                     :                                                                                                                                                 ----TG----AC-TAG-AA-AAAT-A-C--T----G----A-T-CT-CC----C-TA------TGACT---C-GATCGC----C--TA--TA--A----G-TCGG-G-CA--------TG------G-A--CTTTTGGA---T--C-A-------AAAT---T--TT------ACT--C------CCA-------AA--AAATCCG-AC-TT-AT--A-G-------GCGA------G--T-A--T-A--T--A-T-GGTA
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