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Reference ( gi|85819 )        : TCTCTAAA-TAAA-CG----T-AT-G-T-AA-G-G-----C---CA--T--A--G--A---T--TT--G---AA--A--T-TG-A-T-A-A-C-G--AA--GGT---C----A--T-C-A-A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CAT--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGA--G------A---A-T--C--A--T--A-G---A-A-A-------A-A--A----TA---T--A-T-C--A-T-C-A-------T-A-C-C--A---AT--AG----TC-C-A-A--C--A-T-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-TCC-A----TA-GG--C-AA--CGAGAA
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gi|85844                      :    aTAAA-GAAA-TA----T-AG-G-T-A--------------CA--T--A--A--C---T--TT--T---AG--A--T-TA-A-T-A-A-T-G--GT--GCT---A----A--C-C-A-A-T--T--TC-T--A-T------A-T--A----AA-TAT--T-T-C-G-A---TCTTA-C-C-T------C-C--G-------------------T-TC-C------C------CA--G-T--T-C---A--TGG--A-G-----GTCA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-C-A-----------------TA---TT-A-C-C--A-T-C-A-------T-A-C-A--A---AT--AA----TC-C-A-A--C--A-T-T--A--A-GC-A-TA-----------CCT--t
gi|85846                      : taagTAAA-GAAA-TG----T------C-GA-G-G-----CA--CA--T--A---------T--TT--C---AA--A--T-AA-A-T-A-A-T-G--TT--GGT---A----A--C-C-A-A-C--T--TC-A--C-T------A-T--A----AA-CAT--T-T-C-A-A---TT----T-C-C------
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gi|85862                      :           AAA-AG----A-AT-A-T-CG-G-G-----G---CA--T--A--T--A---T--TT--C---AA--A--T-TA-A-T-A-A-T-G--GG--GGA---A----A--C-C-A-A-C--T--TT-G--TGT------A-C--A----AA-CAT--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-T--G---A----C--C----A--T-
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gi|85845                      :                                                                      ---AA--A--T-TA-A-T-A-G-T-G--GG--GGT---A----A--C-C-A-A-C--G--TC-A--C-T------A-T--A----AA-CAT--A-T-C-A-A---TT----T-C-C------C-A--G---A----T--C---------TC-A---ATTC------TT--G-T--C-C---A--GGA--G-G-----GTAA--G------A---T-T--T--T--T--A-G---A-G-A-------A-A--A----AA---T--A-A-C--A-tgcgaagaa
gi|85856                      :                                                tgaataaaagaatattggggac---AA--C--T-TA-A-T-A-A-T-G--CA--GAA---A----A--T-C-A---------TC-T--C-T------A-T--A----CG-CAT--T-T-C-A-A---GT----C-C-T------T-G--G---G----T--C----G--CCTC-C---A-TC------TT--C-T--T------------------------A--G------A---A-T--T--C--T--A-A---A-A-AT------A-A--A----AA---TC-A-C-C--G-T-C-C-------TTA-C-C--A---AC--AG----CT-C-A-A--C--T-T-T--G--A-GT-A-CC-----------CCT--T-TCC-G----TA-
gi|85860                      :                                                   ataaaccaatatcgggatcacatt--A--T-TA-A-T-A-A-T-G--GT--GA---------A--C-C-A-A-C--T--TT-T--G-T------A-C--A----AA-CAT--T-T-TTA-A---TT----C-C-C------C-T--G---A----C--C----A--T-TC-C-----TC-------T--G-T--C-A---A--TGA--A-A-----GTTA--G------A---AGT--T--T--T--A-G-------A-------A-A--A----T----T--ACC-C--A-T-C-A-------T-A---C--A---AC--AA----TC-C---A--C--T-T-T--A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T-C-G----TA-GA--C-AA--CGAGAAtaaaaagaaga
gi|85876                      :                                                   aaaaaaatatcggagtggcatataatttccaat-A-T-A-A-TAG--AT--GGT--------A--C-C-A-A-T--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-CAT--T-TAT-ATA---T------------------A--G---A----T-------A--T-T------A-TA------TG--A-T--C-C---A--TGG--G-G-----ATCA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-TTA-------A-A--A----T----T--A-C-C--A-T-C-AA------T-A-C-C--A---A---AC----AC-C-A-A--C--T-T-TA-A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T-C-G----T--GA--C-AA--CAAGA
gi|85875                      :                                                                                   a-A-T-A-A-TAG--AT--GGT--------A--C-C-A-A-T--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-CAT--T-TAT-ATA---T------------------A--G---A----T-------A--T-T------A-TA------TG--A-T--C-C---A--TGG--G-G-----ATCA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-TTA-------A-A--A----T----T--A-C-C--A-T-C-AA------T-A-C-C--A---A---AC----AC-C-A-A--C--T-T-TA-A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T-C-G----T--GA--C-AA--CAAGA
gi|85874                      :                                                                                   a-A-T-A-A-TAG--AT--GGT--------A--C-C-A-A-T--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-CAT--T-TAT-ATA---T------------------A--G---A----T-------A--T-T------A-TA------TG--A-T--C-C---A--TGG--G-G-----ATCA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-TTA-------A-A--A----T----T--A-C-C--A-T-C-AA------T-A-C-C--A---A---AC----AC-C-A-A--C--T-T-TA-A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T-C-G----T--GA--C-AA--CAAGA
gi|85877                      :                                                                                                  aA--GGT---G----A--T-C-A-G-C--T--TC-T--T-A------A-A--G----AA-CAT--T-T-C-A-A---TT----C-C-C------C-A--G---A----T--T----A--C-TC-T---A-TC------TTC-A-A--C-C---G--CG---A-G-----GTCA--G------A---A-T--T--C--T--A-G---A-G-A-------A-A--A----TT---T--G-C-CATA-T-T-A-------T-A-G-T--A---AC--AG----TC-C-A-ATTC----T-T--A--A-GT-G-GT-----------CCT--T-T-A-G----TA-GA--C-AA--CAAGAA
gi|85878                      :                                                                                                        T---C----G--T-A-A-G-C--T--TC-T--C-T------A----A----AA-CGT--T-T-C-A-A---TT----T-C-C------C-A--G---A----T--C----A--T-TC-C---A-TC------AT--A-T--C-C---A--TGA--G-A-----GTAA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-A-A-------A-A--G----CT---T--G-C-C--A-T-C-C-------T-A---C--A---ATC-AA----TC-T-T-A--T--T-T-T--A--T-GT-A-CC-----------CCT--T-TTT-G----TA-GA--C-AA--CGAgaa
gi|85861                      :                                                                                                         ---C----A--T---A-A-C--T--TA-T--T-TGTCC--A-T--A----AC-AAT--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-T--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------CT--G-T--C-A---A--TG---A-A-----GTTA--G------A---A-T--T--T--T--A-GAAAA-A-A-------A-A--A----TT---T--A-C-C--ATT-C-AT------T-A-CAA--A---AC--AA----TT-C-C-A--C--GTT-T--A--A-GTCA-CC-----------CCT--T-TTC-GGT--TA-GA--C-TA--CGAGAA
gi|85879                      :                                                        aaagaaaagtcgggacataatatatatcaacattaataaatggtaggtaaacc----A--C-C-A-A-C--T--TT-T--G-T------A-C--A----AA-CAT--T-T-T-T-A---TT----C-C-C------C-T--A---A----C--G----A--C-TC-C---A-TC------TT--G-T--T-A---A--TGA--A-C-----GTTC--G------A---A-T--A--T--T--A-G---A-T-A-------A-A--A----TT---T--A-C-C--A-T-C-A-------T-G-C-A--A---AC--AA----TC-C-------------C--A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-TTC-G----TA-GA--C-AA--TGAGAAga
gi|85880                      :                                                                                                                     -C-A-ATC--T--TC-T--T-T------A-T--ATA--AA-CAT--T-T-T-ATA---TT----T-C-T------C-C--G---A----T--C----A--T-TCTC---A-TC------TTT-A-T--C-TCAAG--TGA--A-A-----GTGA--G------A---ATT--T--A--T--ATG---A-A-A-------ATA--A----TT---T--A-T-C--ga
gi|85881                      :                                                                                                                                --TC-TA-T-T------G-T--A----AA-TAT--C-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-A--G---A----T--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--G-T--C-C---A--TGA------------GA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-A-AAAC----A-A--A----T----T--A-C-C--A-T-C-A-------T-A-C-A--A---AC--AA----TC-C-A-T--C--T-C-G--A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-CTC-G----TA-GA--C-AA--CGAGA
gi|85882                      :                                                                                                                                --TC-TA-T-T------G-T--A----AA-TAT--C-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-A--G---T----C----------T-TC-C---A-TC------TT--G-T--C-C---A--TGA------------GA--G------A---A-T--T--T--T--A-G---A-A-A-------A-AC-A----AA---T--A-C-C--A-T-C-A-------T-A-C-A--A---AC--AA----TC-C-A-T--C--T-C-G--A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-CTC-GT---TA-GA--C-AA--CGAGA
gi|85883                      :                                                                                                                                --TC-T--T-T------A-T--AT---AA-TAT--C-TAT-ATA---TT----C-C-C------C-TCAG---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--G-T--C-C---G--TGA--G-A-----GTCA--G------A---A-TTCC--A--G--G-G---G-A-A-------A-A--A-------------------A-T-C---------T-A-C-C--A---AC--AA----CC-C-A-A--C--T-T-A--A--A-AT-A-CC-----------CCT--T-TTC-G----TG-GA--C-AA--CGAGAA
gi|85884                      :                                                                                                                                           ------A-T--A----AA-CAT--T-T-C-A-A---TT----C-C-C------C-A--G---A----T--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--G-T--C-C---A--TGA--C-A-----TTCA--G------A---A-T--T--T--T--T-GGGCA-A-A-------A-A--A----T----T--A-C-C--A-T-C-A-------T-A---C--A---A----------C-C-A-A--C--T-T-T--A--A-GC---CT-----------CTC--T-TTC-G----TA-GA--C-AA--TGAGAAgaat
gi|85833                      :                                                                                                                                                            A-TAC--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAG------A---A-T--C--A--T--A-G---A-A-A-----------------TA---TCGA-T-C--A-T-C-A-------C-AAC-C--A---AC--AG----TC-CCA-A--C--A-T-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-TCC-A----TA-GG--C-AA--CGAGAAga
gi|85832                      :                           tttataaataaaacatatgtcaggcgtacatagatttttgagattataacgagtcatcatatttctaattattcaaatcattttaatttctcctcccgaccaaatttcgcaatcttatgattatgtttgA-TAC--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAG------A---A-T--C--A--T--A-G---A-A-A-----------------TA---TCGA-T-C--A-T-C-A-------C-AAC-C--A---AC--AG----TC-CCA-A--C--A-T-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-TCC-A----TA-GG--C-AA--CGAGAAgaat
gi|85885                      :                            tttataaataaaacatatgtcaggcgtacatagatttttgagattataacgagtcatcatatttctaattattcaaatcattttaatttctcctcccgaccaaatttcgcaatcttatgattatgtttg-CAT--T-T-C-A-A---TT----C-C-C------C-A--G---A----T--C----A--T-TG-C---A-T-------------T--C-T-------GA--G-G-----GTCA--G------A---A-C--T--T--T--A-A---A-A-A-------A-A--A-------------------------A-------T-A-C-T--A---AC--AA----TC-C-A-G--C--T-T-C--A--A-GT-A-GC-----------CTT--T-TCC-C----TA-GA--C-AA--CGAGAgaat
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gi|85887                      :                                                                                                                                                                          -A---TT----C-A-A------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TT------TT--T-T--C-T---A--T-A--A-A-----GTGA--G------A---A-TT-C--A--T--A-G---A-A-A-------A-A--AAATTTA---T--A-T-TCAA-T-C-A-------C-A-A-T--A---AT--AG----TC-C-A-A--C--A-T-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-TCC-G----TA-GG--C-AA--CGAGAA
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Reference ( family-278 )      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-G-G---G-----C---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AA--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--C-----A--CCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTNA--GAA--T--T--N-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TA---T--A--CC--A-T---C-A--T-A--C-C--A---A-C-AG----TC-C-A-A-C--NT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAA
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gi|85824                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-C----T-AT---TC-G-G---G-----T---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AA--A--TTA--A-A--A-AACGG-A---GG-C--C-----A--CCA--A-C--T---C-T--G-T------A----A----AA-CA-T--T-----A-A---TT----C-T-C------C-C--G---A----C--C----A--T--C-C---A-TC------TT--A-T--C-T---A----A--A-A-----G-AA--GAA--TATT--A-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----AAAGTT--A--CC-------------C-A--C-C--A---A-T-AG----TC---A-A-C--AT-T--A--AAGT-AACA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAAgaat
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gi|85826                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAA--------------TC-G-G---G-----C---CA--T--A--G---C---TA-T--G---AA--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--C-----A--TCA--A-C--T--CC-T--T-T------A-T--A----GA-CA-T--T-T-T-A-A---CT----C-C-T------C-C--G---A----T--C----A--T-TT-C---A-TC------TT--A-T--C-G---A--TGA--A-A-----GTGA--GAA--T--T--A-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----AA---TC-G--TC--A-T---C-A--T-A--
gi|85827                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAA--CG---T-AT-G-TC-ACG---G-----C---CA--T--A--T---AAATTT-T--G---AG--A--T-A--A-T--ACA-CGA-A---GG-TT-C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--T-C------A-T--A----AA-CA-A--T-T-T-A-AT--TT----C-C-C------C-C--G---A----G--C----A--T-TC-C---A-TCT-----TT--ATT--C-T---GATTGA--A-AG----GTGA--GAA--TCAT--T-T------A-A----A-A-A-------A-A---A----GA---TG-A--TCA-A-T---CGA--T-A--C-C--A---A-T-AG----TC-CAA-A-CA-GG-T--A--A-AT-G-CA-----------CA---T-T--CC-G--TA-GG--C-AA--CGAGAA
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gi|85829                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAAA-TG---T-AT-G-TC-A-GT--G-----C---CA--TCAA--G---A---TT-T--G---AG--T--TTA--A-T--ATA-CGA-A---GG-TACC-----A--TCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AAGCA-T--TGT-T-A-A---TT----C-C-CTCA---T-C--G---ACG--C--C----A--G-TC-C---A-TC------TT--ATT--C-TA--A--TGA--A-A-----GTTA--GAA--T--TC-A-T------A-G----A-A-A-------A-A---G----TA---T--AGTAC--A-T---C-A--T-A--C-CTTAT--A-T-AGTT--TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CAATATTTTATTGCCT--T-TCCCC-GTTTA-GG--C-AATTCGAGAAgcaat
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gi|85831                      :                                                                                                                              tctaTCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TT-G-G---G-----T---CA--T--A--G---A---CT-T--G---AA--A--TTT--A-T--A-A-CGG-A---AG-C--C-----A--TCA--A-G--T--TT-T--T-T------A-A--A----AA-CA-T--T-T-C-A-A---CT----C-C-C------C-C--G---A----C--G----A--T-TC-C---A-TC------CT--A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGA--at
gi|85832                      :                                                                                                                                      TAAATAAAACA---T-AT-G-TC-A-G---G-----CGTACA--T--A--G---A---TT-TTTG---AG--A--TTA----T--A-A-CGA------G-T--C-----A--TCAT-A-T--T--TC-TAAT-T------A-TTCA----AATCA-T--T-T-T-A-A---TTTCTCC-T-C------C-C--G---A----C--CAA--A--T-TT-CGCAA-TC------TT--A-TGAT-T---A--TG
gi|85832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaA-TA-C--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAGAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A------------------TA---TCGA--TC--A-T---C-A--C-AA-C-C--A---A-C-AG----TC-CCA-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-T--CC-A--TA-GG--C-AA--CGAGAAtttgatactttgttacttcgccaatttcatatctatgaaagtgaaagaatcatagaaatatcgatcatcacaaccaacagtcccaacattaagtacacctattccataggcaacgagaagaat
gi|85833                      :     tttataaataaaacatatgtcaggcgtacatagatttttgagattataacgagtcatcatatttctaattattcaaatcattttaatttctcctcccgaccaaatttcgcaatcttatgattatgtttgTAAATAAAACA---T-AT-G-TC-A-G---G-----CGTACA--T--A--G---A---TT-TTTG---AG--A--TTA----T--A-A-CGA------G-T--C-----A--TCAT-A-T--T--TC-TAAT-T------A-TTCA----AATCA-T--T-T-T-A-A---TTTCTCC-T-C------C-C--G---A----C--CAA--A--T-TT-CGCAA-TC------TT--A-TGAT-T---A--TGgaat
gi|85833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaA-TA-C--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAGAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A------------------TA---TCGA--TC--A-T---C-A--C-AA-C-C--A---A-C-AG----TC-CCA-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-T--CC-A--TA-GG--C-AA--CGAGAAtttgatactttgttacttcgccaatttcatatctatgaaagtgaaagaatcatagaaatatcgatcatcacaaccaacagtcccaacattaagtacacctattccataggcaacgagaagaat
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gi|85835                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---G-----C---CA--T--A--G---G---TT-T--G---AG--A--TTA--A-T--A-A-CGA-A---AG-T--C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-
gi|85836                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---GAGAGTC---TA--T--ACCG---A---CTGT--C---AA--A--ATATTA-T--ATA-CGGTAC--GG-C--A-----A--GCA--A-CG-TGATC-T--TCT------A-T--AATATAA-CA-TA-T-T-T-ATA---TT------C-A------C-C--G---A----CGTC----AAGT-TC-C---A-TG------CTAAA-T--A-T---A--TGG--ATA-----GTTA--GAA--T--TAAA-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TT---T--A--TC--A-TC--C-A--A-A--C-C--A---A-T-AGATCTCC-C-A-A-CTAGT-T--A--A-TT-T-AA-----------CCTG-T-T--CC-G--TA-G------A--CGAGAA
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gi|85841                      :                                                                                                                                     aTAAATAA--CGATTC-AT-G-TC-GTG---G-----TT--CA--T--A--G---A---TT-G--G---AA--AATTTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-C--C-----A--ACA--A-C--T--TC-TA-T-T------A-T-------AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----C-T-C------C-C--G---A----C--C----AT-T-TC-C---A-TT------AT--A-TA-C-TA--A--TGA--A-A-----GTAA---AA--TTAT--T-T------A-G----A-A-A-------A-A---T----TA---T------C--A-T---C-A--A-A--C-C--A---A-T--G----TC-CAA-A-C--ATAT--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAA
gi|85842                      :                                                                                                                                      TAAATAAA-CG---T-ATTG-TC-A-G---G-----C----A--T--A--G---A---TG-T--G---AA--A--TTA--AGC--A-A-CGA-A---GG-T--C-----AT-CCA--A-C--T--C-----T-T------A-T--A----AA-CC-TCTT-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T------TGA--ATA-----ATGA--GA------T--A-T------C-A----A-ATA-------G-A---A----TA---T-----------T---A-A--T-A--C-C------A-T-AG----TC-C-ACA-C--AT-TTAA--A-G--A-CA-----------TTTTCT-T--CC-G--TATGG--CAAA--CGAGGAgaa
gi|85843                      :                                                                                                                                      TAAATAAA-CT---T-AT-G-TC-T-G---G-----T---CA--T--A------A---TT-T--G---AA--A--TTA--A-T--A-A-CG---------------------CCA--C-A--T--TC----T-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-----A---TT----C-T-C------C-C--GA--A----C--C----A--T-TCAA---A-TC------TT--A-T--CTT---A--TTA--A-A-----GT-A--GAA-----G--A-T------A-G----A-A-A-------A-ATC-A----TA---T--A--TC--A-----C-A--A-A--C-C--A---A---AGC---TC-C-A-A-C--TT-T-------GT-A-CA-----------CC---T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--C-AGAAcaa
gi|85844                      :                                                                                                                                      TAAGTAAA-GA---A-AT-A-TA-G-G---T-----A---CA--T--A--A---C---TT-T--T---AG--A--TTA--A-T--A-A-TGG-T---GC-T--A-----A--CCA--A-T--T--TC-T--A-T------A-T--A----AA-TA-T--T-T-C-G-A---TCTTA-C-C-T------C-C--G-------------------T-TC-C------C------CA--G-T--T-C---A--TGG--A-G-----GTCA--GAA--T--T--T-T------A-G----------------A-C---A----TAT--T--A--CC--A-T---C-A--T-A--C-A--A---A-T-AA----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GC-A-TA-----------CCT--gaat
gi|85845                      :                                                                                                                                      TGAATAAA-AG---A-AT-A-TT-G-G---G-------------------G---A---C---------AA--A--TTA--A-T--A-G-TGG-G---GG-T--A-----A--CCA--A-C--G--TC-A--C-T------A-T--A----AA-CA-T--A-T-C-A-A---TT----T-C-C------C-A--G---A----T--C---------TC-A---ATTC------TT--G-T--C-C---A--GGA--G-G-----GTAA--GAT--T--T--T-T------A-G----A-G-A-------A-A---A----AA---T--A--AC--A-
gi|85846                      :                                                                                                                                      TGAGTAAA-GA---A-AT-G-TC-G-A---G-----G---CA--C--A--T---A---TT-T--C---AA--A--TAA--A-T--A-A-TGT-T---GG-T--A-----A--CCA--A-C--T--TC-A--C-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-C-A-A---TT----T-C-C------
gi|85847                      :                                                                                                                                       AAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---G-----C---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AG--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--A-----A--TCA--A-T--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-T-A-A---CT----C-C-
gi|85848                      :                                                                                                                                       AAAAAAA-AG---A-AT-A-TC-G-G---A-----A---CA--T--A--T---A---TT-T--C---AG--A--TTA--A-T--A-A-TGG-T---GG-A--A-----A--CCA--A-C--T--TT-T--A-T------A-C--A----AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----T-C-C------C-T--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--G-T--C-A---A--TGA--A-A-----GTTCT-GGA--T--T--T-T------A-G----A-G-A-------A-A---A----
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gi|85850                      :                                                                                                                                        AATAGA--A---T-AT-T-AC-G-G---G-----G---CA--T--A--G---A---TT-T--C---AA--A--TTA--A-T----A-TGG-T---GGAT--A-----A--CCA--A-C--T--TT-TG-T-T------AGC--A----AA-CATT--T-T-T-A-A---TT----CGC-C------C-T--G---A----CT-C----A--T-TC-T---ACTC------CT--GTT--C-A---A--TGA--A-A-----GTTA--GAA--T--T--T-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----AAT--T--A--CC--A-T---C-AT-T-A--C-A--AT--A-C-AA----TC-C-C-A-C---T-T--A--ACGT-A-CC-----------CTT--T-T--TC-G--TA-GA--C-AA--CG-GAAga
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gi|85852                      :                                                                                                                              aacaaaataAAATGAA------T-AT-G--C-G-G---G-----A---CA--T--A--G---A---TT-C------AA--A--TTAT-A-T--G-G-TGT-A---AA-C--C-----A--C----A----------T--T-T------G-T--C----AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-T--G---A----C--C----G--T-TC-C---A--C------CT--G-T--C-TA--A--TG---A-A-----GTTA--GGAATT--T--T-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----T----T--A--CC--A-T---T-A--T-A----C--A---A-C-AC----TC-C-C-A-C--TT-T--A--A-GT-ACCG-----------CCT--TCT--TC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAAga
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gi|85876                      :                                                                                                                                                                                                                   A--A-T--A-A-TAG-AT--GG-T--------A--CCA--A-T--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-CA-T--T-TAT-ATA---T------------------A--G---A----T-------A--T-T------A-TA------TG--A-T--C-C---A--TGG--G-G-----ATCA--GAA--T--T--T-T------A-G----A-TTA-------A-A---A----T----T--A--CC--A-T---CAA--T-A--C-CA-A---A-C-A------C-C-A-A-C--TT-TA-A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T---C-G--T--GA--C-AA--CAAGA
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Reference ( family-278 )      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-G-G---G-----N---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AA--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--C-----A--CCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTNA--GAA--T--T--N-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TA---T--A--CC--A-T---C-A--T-A--C-C--A---A-C-AG----TC-C-A-A-C--NT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAA
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gi|85823                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TCAG-G---G-----C---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AG--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--C-----A--TCA--A-A--C--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA------T-T-A-A---AA----C-T-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T----T---A--TGA--A-A-----GTGA--GAA--------A-T------A-G----A-A-AAATATATA-A---A----TA---T--A--TC--A-T---C-A--C-A--C-C--A---A-T-AG----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--TC-G--T--GG--C-AA--TGAGAAgaat
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gi|85826                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAA--------------TC-G-G---G-----C---CA--T--A--G---C---TA-T--G---AA--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--C-----A--TCA--A-C--T--CC-T--T-T------A-T--A----GA-CA-T--T-T-T-A-A---CT----C-C-T------C-C--G---A----T--C----A--T-TT-C---A-TC------TT--A-T--C-G---A--TGA--A-A-----GTGA--GAA--T--T--A-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----AA---TC-G--TC--A-T---C-A--T-A--
gi|85827                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAA--CG---T-AT-G-TC-ACG---G-----C---CA--T--A--T---AAATTT-T--G---AG--A--T-A--A-T--ACA-CGA-A---GG-TT-C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--T-C------A-T--A----AA-CA-A--T-T-T-A-AT--TT----C-C-C------C-C--G---A----G--C----A--T-TC-C---A-TCT-----TT--ATT--C-T---GATTGA--A-AG----GTGA--GAA--TCAT--T-T------A-A----A-A-A-------A-A---A----GA---TG-A--TCA-A-T---CGA--T-A--C-C--A---A-T-AG----TC-CAA-A-CA-GG-T--A--A-AT-G-CA-----------CA---T-T--CC-G--TA-GG--C-AA--CGAGAA
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gi|85829                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAAA-TG---T-AT-G-TC-A-GT--G-----C---CA--TCAA--G---A---TT-T--G---AG--T--TTA--A-T--ATA-CGA-A---GG-TACC-----A--TCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AAGCA-T--TGT-T-A-A---TT----C-C-CTCA---T-C--G---ACG--C--C----A--G-TC-C---A-TC------TT--ATT--C-TA--A--TGA--A-A-----GTTA--GAA--T--TC-A-T------A-G----A-A-A-------A-A---G----TA---T--AGTAC--A-T---C-A--T-A--C-CTTAT--A-T-AGTT--TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CAATATTTTATTGCCT--T-TCCCC-GTTTA-GG--C-AATTCGAGAAgcaat
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gi|85832                      :                                                                                                                                      TAAATAAAACA---T-AT-G-TC-A-G---G-----CGTACA--T--A--G---A---TT-TTTG---AG--A--TTA----T--A-A-CGA------G-T--C-----A--TCAT-A-T--T--TC-TAAT-T------A-TTCA----AATCA-T--T-T-T-A-A---TTTCTCC-T-C------C-C--G---A----C--CAA--A--T-TT-CGCAA-TC------TT--A-TGAT-T---A--TG
gi|85832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaA-TA-C--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAGAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A------------------TA---TCGA--TC--A-T---C-A--C-AA-C-C--A---A-C-AG----TC-CCA-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-T--CC-A--TA-GG--C-AA--CGAGAAtttgatactttgttacttcgccaatttcatatctatgaaagtgaaagaatcatagaaatatcgatcatcacaaccaacagtcccaacattaagtacacctattccataggcaacgagaagaat
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gi|85833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaA-TA-C--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAGAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A------------------TA---TCGA--TC--A-T---C-A--C-AA-C-C--A---A-C-AG----TC-CCA-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-T--CC-A--TA-GG--C-AA--CGAGAAtttgatactttgttacttcgccaatttcatatctatgaaagtgaaagaatcatagaaatatcgatcatcacaaccaacagtcccaacattaagtacacctattccataggcaacgagaagaat
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gi|85835                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---G-----C---CA--T--A--G---G---TT-T--G---AG--A--TTA--A-T--A-A-CGA-A---AG-T--C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-
gi|85836                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---GAGAGTC---TA--T--ACCG---A---CTGT--C---AA--A--ATATTA-T--ATA-CGGTAC--GG-C--A-----A--GCA--A-CG-TGATC-T--TCT------A-T--AATATAA-CA-TA-T-T-T-ATA---TT------C-A------C-C--G---A----CGTC----AAGT-TC-C---A-TG------CTAAA-T--A-T---A--TGG--ATA-----GTTA--GAA--T--TAAA-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TT---T--A--TC--A-TC--C-A--A-A--C-C--A---A-T-AGATCTCC-C-A-A-CTAGT-T--A--A-TT-T-AA-----------CCTG-T-T--CC-G--TA-G------A--CGAGAA
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gi|85841                      :                                                                                                                                     aTAAATAA--CGATTC-AT-G-TC-GTG---G-----TT--CA--T--A--G---A---TT-G--G---AA--AATTTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-C--C-----A--ACA--A-C--T--TC-TA-T-T------A-T-------AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----C-T-C------C-C--G---A----C--C----AT-T-TC-C---A-TT------AT--A-TA-C-TA--A--TGA--A-A-----GTAA---AA--TTAT--T-T------A-G----A-A-A-------A-A---T----TA---T------C--A-T---C-A--A-A--C-C--A---A-T--G----TC-CAA-A-C--ATAT--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAA
gi|85842                      :                                                                                                                                      TAAATAAA-CG---T-ATTG-TC-A-G---G---------CA--T--A--G---A---TG-T--G---AA--A--TTA--AGC--A-A-CGA-A---GG-T--C-----AT-CCA--A-C--T--C-----T-T------A-T--A----AA-CC-TCTT-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T------TGA--ATA-----ATGA--GA------T--A-T------C-A----A-ATA-------G-A---A----TA---T-----------T---A-A--T-A--C-C------A-T-AG----TC-C-ACA-C--AT-TTAA--A-G--A-CA-----------TTTTCT-T--CC-G--TATGG--CAAA--CGAGGAgaa
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gi|85844                      :                                                                                                                                      TAAGTAAA-GA---A-AT-A-TA-G-G---T-----A---CA--T--A--A---C---TT-T--T---AG--A--TTA--A-T--A-A-TGG-T---GC-T--A-----A--CCA--A-T--T--TC-T--A-T------A-T--A----AA-TA-T--T-T-C-G-A---TCTTA-C-C-T------C-C--G-------------------T-TC-C------C------CA--G-T--T-C---A--TGG--A-G-----GTCA--GAA--T--T--T-T------A-G----------------A-C---A----TAT--T--A--CC--A-T---C-A--T-A--C-A--A---A-T-AA----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GC-A-TA-----------CCT--gaat
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gi|85875                      :                                                                                                                                                                                                                   A--A-T--A-A-TAG-AT--GG-T--------A--CCA--A-T--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-CA-T--T-TAT-ATA---T------------------A--G---A----T-------A--T-T------A-TA------TG--A-T--C-C---A--TGG--G-G-----ATCA--GAA--T--T--T-T------A-G----A-TTA-------A-A---A----T----T--A--CC--A-T---CAA--T-A--C-CA-A---A-C-A------C-C-A-A-C--TT-TA-A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T---C-G--T--GA--C-AA--CAAGA
gi|85876                      :                                                                                                                                                                                                                   A--A-T--A-A-TAG-AT--GG-T--------A--CCA--A-T--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-CA-T--T-TAT-ATA---T------------------A--G---A----T-------A--T-T------A-TA------TG--A-T--C-C---A--TGG--G-G-----ATCA--GAA--T--T--T-T------A-G----A-TTA-------A-A---A----T----T--A--CC--A-T---CAA--T-A--C-CA-A---A-C-A------C-C-A-A-C--TT-TA-A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T---C-G--T--GA--C-AA--CAAGA
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gi|85880                      :                                                                                                                                                                                                                                                       CA--ATC--T--TC-T--T-T------A-T--ATA--AA-CA-T--T-T-T-ATA---TT----T-C-T------C-C--G---A----T--C----A--T-TCTC---A-TCT-----TT--A-T--C-TCAAG--TGA--A-A-----GTGA--GAAT-T--T--A-T------ATG----A-A-A-------ATA---A----TT---T--A--TC--ga
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gi|85889                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TC------AT--A-T--C-T---A--TCA--A-A-----GTGA--GAA--T--C--A-T------A-G----A-G-A-------A-A---A----TA---T--A--TC--A-T---C-A--T-A--T-C--A---A-T-AG----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GG--C-AA--CGAGAAga
gi|85890                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -G----A-G-A-------A-A---A----TT---T--A--CC--A-T---C-A--C-A--C-A--A---A-C-AA----TT-C-C-A-C--TT-T--A--A-GT-A-CC-----------CCT--T-T--TC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAAgaat
gi|85891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttatgaaatgtgt-T---A--TGA--A-A-----GTTA--GAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TA---T--A--TC--A-T---C-A--T-A--C-C--A---A-T-AG----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CTT--T-T--CC-G--TA-CG--C-AA--CGAGAga
gi|85892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---A--TGA--A-A-----GTGA--GAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----CA---T--A--TC--G-T---C-A--T-A--C-C--A---A-T-AG----TC-C-A-A-C--AC-T--T--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GG--C-AA--CGAGAAcgaat
gi|85893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--A-A-----GTCA--AAG--T--T--A-T------C-ATGTTA-A-A-------A-A---A----TA---T--A--CC--A-T---C-A--T-A--A-A--A---A-C-AA----CC-C-T-A-C--TT-T--A--A-GT-A-T------------CCT--T-T--TC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAAgaat
gi|85894                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -T---T-A--T-A--C-C--A-----T-AG----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CTT--T-T--CC-G--TA-AA--C-AA--CGAGAAga
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blockSeqs                     :                                                                                                                                              GGT              . .   T          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   AT     TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       T    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   AAAT      A  .   .  . .   . A    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   AT     CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   AAAT      .  .   .  . .   . A    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   T          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   AT     CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   TAT       .  .   .  . .   . C    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   T          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   AAT       .  .   .  . .   . C    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  G     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              TGT              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   C      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   T          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . C    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   GA        .  .   .  . .   . C    .  C    .       A      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   T          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      A .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . C    .  C    .       A      . A     A   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CTA              . .   T          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      CA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . A    .  C    .       A      . C     A   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              AGA              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . C     T   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      CA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      G    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      A .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       C      . C     A   . .  .  .  . . G              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CTT              . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . A    .  A    .       G      . C     T   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              GAA              . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . G     T   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              AGA              . .   G          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      A .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . A    .  A    .       G      . C     T   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              GAA              . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     A   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CGT              . .   A          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . T     T   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              AGA              . .   G          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   T      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . C     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              AGA              . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   AT        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . C     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CCA              . .   A          .  .  .  .   .      T       .  .    .  . .  . .   A      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . C    .  C    .       A      . T     C   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              AGA              . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  A     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     T   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              TGT              . .   G          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   G      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  A     .    .  . .      T .    .  .  C    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     T   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              TGT              . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  A     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . C     C   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CT               . .   A          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  A    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              CA               . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  A     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   TG        .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              GA               . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  A     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              AT               . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  A     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   CG        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . C     T   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              GA               . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      G    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  A     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . A    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              T                . .   G          .  .  .  .   .      T       .  .    .  . .  . .   A      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . C    .  A    .       C      . A     T   . .  .  .  . . A              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .                . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  A    .       G      . A     A   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   A          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  A     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   CT        .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   G          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . T     T   . .  .  .  . . T              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   T      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      C .    .  .  A    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . T    .  T    .       A      . A     C   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   G          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   T      CC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   C          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   T      TA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      A .    .  .  A    .        .      . .       . .   AA        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   T          .  .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   G      TC         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  A     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                               . .   .          .  .  .  .   .      T       .  .    .  . .  . .   A      AA         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      G    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   TT        .  .   .  . .   . T    .  A    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .   .          .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      TG         .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     T   . .  .  .  . . T              .    T     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                .  .  .  .   .      G       .  .    .  . .  . .   A      A          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      C .    .  .  C    .        .      . .       . .   CA        .  .   .  . .   . T    .  C    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                   .  .  .   .      C       .  .    .  . .  . .   A      A          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   TA        .  .   .  . .   . A    .  T    .       G      . C     A   . .  .  .  . . A              .    C     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                   .  .  .   .      A       .  .    .  . .  . .   T      T          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . C    .  C    .       A      . A     A   . .  .  .  . . A              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                         .   .      .       .  .    .  . .  . .   A      C          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      A .    .  .  A    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . T    .  T    .       G      . C     T   . .  .  .  . . G              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .      .       .  .    .  . .  . .   A      C          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  A     .    .  . .      T .    .  .  T    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . T    .  A    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .      .       .  .    .  . .  . .   T      T          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . C    .  C    .       A      . A     T   . .  .  .  . . C              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                    .       .  .    .  . .  . .   A      T          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  C     .    .  . .      G .    .  .  C    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . T    .  A    .       G      . T     A   . .  .  .  . . A              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                    .  . .  . .   A      T          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      T    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      G .    .  .  T    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . T    .  C    .       G      . A     A   . .  .  .  . . A              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                    .  . .  . .   .      .          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  C     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . T    .  C    .       .      . A     T   . .  .  .  . . A              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                    .  . .  . .   .      .          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      C .    .  .  A    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . T    .  A    .       .      . .     A   . .  .  .  . . A              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                  .      .          .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       G    .  T     .    .  . .      C .    .  .  T    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . .    .  C    .       .      . .     A   . .  .  .  . . .              .    .     .         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    .    .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . .    .  .    .       .      . .     .   . .  .  .  . . .              .    .     .          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                         .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      A    .   .    .  .    .     . .   .  .       T    .  A     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .   T         .  .   .  . .   . .    .               .      . .     .   . .  .  .  . . .              .                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                         .  . .        .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       C    .  T     .    .  . .      T .    .  .  A    .        .      . .       . .   .         .  .   .  . .   . .    .                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                       .    .        .  .     .  . .    .   . .    .    .   .      C    .   .    .  .    .     . .   .  .       A    .  T     .    .  . .      G .    .  .  A    .        .      . .       . .             .  .   .  .                                                                                                   
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Reference ( family-278 )      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-G-G---G-----N---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AA--A--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GG-T--C-----A--CCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-T-A-A---TT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTNA--GAA--T--T--N-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TA---T--A--CC--A-T---C-A--T-A--C-C--A---A-C-AG----TC-C-A-A-C--NT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GA--C-AA--CGAGAA
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gi|85833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttaA-TA-C--T-T-T-G-----TT----A-C-T------T-C--G---C----C--A----A--T-TT-C---A-T-----------A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGAAAGAA--T--C--A-T------A-G----A-A-A------------------TA---TCGA--TC--A-T---C-A--C-AA-C-C--A---A-C-AG----TC-CCA-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCTA-T-T--CC-A--TA-GG--C-AA--CGAGAAtttgatactttgttacttcgccaatttcatatctatgaaagtgaaagaatcatagaaatatcgatcatcacaaccaacagtcccaacattaagtacacctattccataggcaacgagaagaat
gi|85834                      : tttataaataaaacatatgtcaggcgtacatagatttttgagattataacgagtcatcatatttctaattattcaaatcattttaatttctcctcccgaccaaatttcgcaatcttatgattatgtttgTCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---G-----T---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AA--A--TTG--A-T--A-G-CAG-A---GG-C--C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--C----AA-CA-T--T-T-T-A-A---gaat
gi|85835                      :                                                                                                                                  TCTCTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---G-----C---CA--T--A--G---G---TT-T--G---AG--A--TTA--A-T--A-A-CGA-A---AG-T--C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--C-T------A-T--A----AA-
gi|85836                      :                                                                                                                                  TCTTTAAATAAA-CG---T-AT-G-TC-A-G---GAGAGTC---TA--T--ACCG---A---CTGT--C---AA--A--ATATTA-T--ATA-CGGTAC--GG-C--A-----A--GCA--A-CG-TGATC-T--TCT------A-T--AATATAA-CA-TA-T-T-T-ATA---TT------C-A------C-C--G---A----CGTC----AAGT-TC-C---A-TG------CTAAA-T--A-T---A--TGG--ATA-----GTTA--GAA--T--TAAA-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----TT---T--A--TC--A-TC--C-A--A-A--C-C--A---A-T-AGATCTCC-C-A-A-CTAGT-T--A--A-TT-T-AA-----------CCTG-T-T--CC-G--TA-G------A--CGAGAA
gi|85837                      :                                                                                                                                   CTATAATTAAA-CT---A-AT-G-TC-A-G---G-----T---CA--C--A--T---A---TT-T--C---AA--A--TTA--A-T--A-A-CGA-A---GT-T--C-----A--TCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-T-G-A---TT----C-T-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T---A--TGA--A-A-----GTGA--GAA--T--C--A-G------A-G----A-A-A-------A-A---A----TA---G--T--TC--A-T---C-A--T-A--C-C--A---A-T-AG----TT-C-A-A-C--AT-T--A--T-GT-A-CA-----------CCT--A-T--CC-G--TA-GG--C-AA--CGAGAAg
gi|85838                      :                                                                                                                                           AAA-CA-----AT-A-TT-G-G---G-----T---CA--A--A--G---A---TT-T--C---AA--A--TTA--A-A--G-T-TGA-A---GG-C--A-----A--TCA--A-C--C--TA-A--C-T------G-T--A----AA-TA-T--T-T-C-A-A---TT----C-C-C------C-G--G---A----T--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--G-T--C-C---C--TG---A-G-----GTAA--AAA--T--gaat
gi|85839                      :                                                                                                                                ctatataAAATAAA-CGAT-T-TT-A-TC-G-T---G-----T---CA--T--A--G---A---TT-T--G---AATGA--TTA--A-T--A-A-CGG-A---GC-C--C-----A--ACA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--A----AA-CA-T--C-T-G-A-A---TT----C-T-C------C-C--GAGCA----C--G----A--T-TC-C---ATTC------TTGGA-T--C-T---A--TGAATA-A-----GTGAAGAAA--T--T--A-G------T-G----A-G-A-------A-A---A----TAGT-T--AT-TC--A-T---C-A--T-ACCC-C--A---T-A-AG----TC-T-A-A-G--ATGT--AT-A-GT-A-CA-----------CCTA-G-T--CT-A--TA-GA--C-AA--CGAGAA
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gi|85844                      :                                                                                                                                      TAAGTAAA-GA---A-AT-A-TA-G-G---T-----A---CA--T--A--A---C---TT-T--T---AG--A--TTA--A-T--A-A-TGG-T---GC-T--A-----A--CCA--A-T--T--TC-T--A-T------A-T--A----AA-TA-T--T-T-C-G-A---TCTTA-C-C-T------C-C--G-------------------T-TC-C------C------CA--G-T--T-C---A--TGG--A-G-----GTCA--GAA--T--T--T-T------A-G----------------A-C---A----TAT--T--A--CC--A-T---C-A--T-A--C-A--A---A-T-AA----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GC-A-TA-----------CCT--gaat
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gi|85846                      :                                                                                                                                      TGAGTAAA-GA---A-AT-G-TC-G-A---G-----G---CA--C--A--T---A---TT-T--C---AA--A--TAA--A-T--A-A-TGT-T---GG-T--A-----A--CCA--A-C--T--TC-A--C-T------A-T--A----AA-CA-T--T-T-C-A-A---TT----T-C-C------
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gi|85870                      :                                                                                                                                                                                         ---A---TT-A--G---AA--A--TTA----T--A-A-CGG-A---GG----C-----A--ACA--A-CACT--TC-T--T-T------G----------A-TA-C--T-A-T-ATA---TT----C-T-T------T-C-----------C--C----A-----C-C---A-TC------TA--A-T--A-T---AATTGA--A-ACTCCAGTAA---AC--T--T--A-TTAAGAAA-G----A-A-A---------A---A----CG---T--A--TC--ATT---C-A--A-A--G-C--ACACA-T-AG----C------A-C--AT-T--A--A-GG-A-CA-----------ACT--T-T--CCGG--TA-GA--C-AA--C
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gi|85873                      :                                                                                                                                                                                                 T-T--A---AAT-A--TTG--A-T--A-A-CGG-A---G-----C-----A--GCA--A-C--T--TC-T--T-T------A-T--C----AA-CA-T--T-T-T-A-A---CT----C-C-C------C-C--G---A----C--C----A--T-TC-C---A-TC------TT--A-T--C-T---AG-TGA--A-A-----GTGA--GAA--T--T--A-T------A-G----A-A-A-------A-A---A----AA---T--GT-TC--A-T---C-A--C-A--C-C--A---A-T-AG----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A--T-A-CA-----------CGC--T-T--CC-G--TG-GA--C-AA--Cga
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gi|85889                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TC------AT--A-T--C-T---A--TCA--A-A-----GTGA--GAA--T--C--A-T------A-G----A-G-A-------A-A---A----TA---T--A--TC--A-T---C-A--T-A--T-C--A---A-T-AG----TC-C-A-A-C--AT-T--A--A-GT-A-CA-----------CCT--T-T--CC-G--TA-GG--C-AA--CGAGAAga
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