lowQualScore                  :        0  0 1  222 0 11  222   0 1 444 11 2 22 0 11 0 0 0 22 00 1 1 1111 1  0  11  0 1  00 44 22 222 1 11 0 1 1 1 7777777777  111 0 11   1 0 11  0 2 0     
lowQualScore                  :        .  . .  ... . ..  ...   . . ... .. . .. . .. . . . .. .. . . .... .  .  ..  . .  .. .. .. ... . .. . . . . ..........  ... . ..   . . ..  . . .     
lowQualScore                  :        9  7 5  777 7 77  999   7 3 888 77 5 33 6 55 6 6 6 00 88 5 0 1111 0  5  77  5 0  77 11 44 111 0 22 5 0 0 0 7777777777  444 5 22   5 5 77  5 0 5     
consensus                     :     CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
Reference ( gi|81317 )        :     CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81318                      :     CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81272                      :     CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-A--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81271                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81278                      :   tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CT-AT--GT-T-AG--A-GA--A---CTT--T-A-T-A-C----------TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81277                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81282                      :   ttCAT-GG-T--A---T-A--CA---CTC-A-C---A--A-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T--TT---T-G--CCC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81274                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-A-G-TCAGA
gi|81281                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---G-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-C--GA---G-TCAAA
gi|81280                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--G-T--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-G-AG--A-GAAGA---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81319                      :   ttCAT-GG-TTGA---T-A--CA---CTC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-A----T-CC-AT---T-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-T-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81273                      :     CAT-GG-T-GA---T-A--CA---GTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AT--G-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81279                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--AT-T-AG--A-T---A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81306                      :   tcCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CA-AA--GT-T-AG--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------A--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81285                      :    tCAT-GG-T-GA-----A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-AG--ACGA--A---C-T--T-A-T-A-A-------C--CT---T-G--ACC-T-C--GA-G-G-TCAA
gi|81287                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---ACAT-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-ATT-A-C----------CT---T-G--ACC-TCT--GA-GTG-TCAAA
gi|81305                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AC-AA--GT-T-AG--A-AA--A-----T--A-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--TA-G-G-TCAA
gi|81290                      :    tCAT-GG-T-GAA--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-ATC-------C--TT---T-GGAACCAT-T--GA-GAG-TTAAA
gi|81289                      :   ttCAT-GG-T-GA---C----CA---CTC-A-CT--A--T-T--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-CG------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-GATCAAA
gi|81309                      :   ttCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-G--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AA--GT-T-AG--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C--TT---C-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81307                      :    tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-T---G--T-G--C-C--A-A-T-A--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-TA--A---C-T--T-A-A-A-C-------C--TT---T-G--ACC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81304                      :    tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A------T-CC-AA--GT-T-AC--A-A---------T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81293                      :    tCAT-GG-TTGAC--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A----A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T--G--T-GA--T---G-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACCTT-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81292                      :   ttCAT-GG-T-GA---TCA--CAAGACT--A-T---A--T-GAGC-A--A-G-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81297                      :   ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-T-C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A--------TC-AT--GT-T-A---A-GATGA---T-T--T-A-T-A-C-------T--TT---G-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81288                      :   ttCAT-GG-A-AC---C-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--------------C-AC--GT-T-AG--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81320                      :   tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-G-C--T--C-A-A----T-CC-AT--GT-C-A---A-AA--A---C-T--T-T-G-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-CCAAA
gi|81275                      :     CAT-G--T-GA---T-T--CAAT-CCC-A-C---A--T-GG-T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-TTGGA-A-G-TCAGA
gi|81312                      :   ttCAT-GT-T-CA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-CCCA-ACA-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AA--A--A--A---C-T--T-A-C-A-C-------C--TG---T-C--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81295                      :    tCAT-GA---GA---T-A--CA---CTCGA-C---A--TTG--C-C--AGA-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AGGAA-AA--A---CTT--T-G-T---C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GAGG-G-TCAAA
gi|81313                      :   ttCAT-GGCT-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C----A-A-T--A--T-A-A----T-CT-A---GT-T-GG--A--A--A---C-TG-T-A-C---C-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81311                      :    tCATAGG-T-GA---T-A--CA---CTC-AAC---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-ATA----T-CC-ATT-GT-T-AG--A--A--A---C-TACT-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-TA-GA-GTG-TCCAA
gi|81308                      :    tCAT-GG-T-GA---A-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AA-AA--GT-T-AG--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--GTC---A--AA-G-G-TCAA
gi|81299                      :    tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--TT-T-AG--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------
gi|81314                      :   tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCA-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GA-T-AG--A-AA--A---C-A--T-A-
gi|81301                      :    tCAT-GG-T-GA---T-A---G---CTA-A-A---T--T-G--C-C--A-A-A---------A-A----T-CC-AT--GT---AG--A-AA--A---C-T--T-A-A-A-C-------T--TT-----A--ACC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81302                      :   ttCAT-GG-T-GATATT-A--CA-------A-T---A--T-G--C-CA-A-A-A-T--A--T-ACA----T-CC-AC--GT-T-----A-AA--A---T-G--T-A-T---C-------C--TT---T-G--ACC---T--GA-G-T-CCAAA
gi|81276                      :    tcAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-C-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81283                      :   tttAT-GG-T-G----T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A------A----T-CC-AT--GT-T-GG--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81286                      :   tttAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A-A----T-CT-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T--TT---T-G--ACC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81321                      :   tttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTT-AAC---A--T-G--C-C--A-A-A-T--AAAT-A-A----T-CC-AT--GT-A-AG--A-GA--A---C-T--T-A-TAA-C-------C--TT---T-G--ACC-T-TG-GA-G-G-TCAAA
gi|81291                      :      AT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--A-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-GT--CT-T-AC--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-C--GA---A-TCAAA
gi|81310                      :   ttgAT-TG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----A-CC-AA--GT-T-AA--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81298                      :    ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-G-C---GATT-G--C-C--A-A-A-T--A--TTA-C----C-CC-AT--GT-T-AG--A-TA--A---C-T--T---T-A-C-------TACTT---T-G--ACCCT-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81322                      :  ttcaAT-GG-T-GA---T-ATTCAG--CTC-A-TCTTA--TTG--C-C--A-A-A-T-----T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A------------TT---T-GT-ATC-T-C--GA-G-G-TCAAA
gi|81296                      :       T-GG-T-GA---T-A--CA---CTC---C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-ATA-GT-TAAG--A-GA--A---T-T--T-A-T-A-C-------C--TT---TGG--ACC-T-T--GA---G-TCA
gi|81300                      :  ttcatT-GG-T-GA---T----CA---CTC-G-C---A--T-G--CAC--A-A-A-T--A--T-A-A----T-C--AT--GT---AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TTG--T-G--A-C-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81303                      :   ttcat-GG-T-GA---T-A--C-----TC---C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A--------CG-AG--AT-T-AG--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--AC----T--GA-G-G-TCAAA
gi|81324                      :   ttcattcG-T-GA---T-G--CA---CTC-G-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-TC-AA--GT-T-AG--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81327                      :          G-T-GA---C-A--CA---TCC-A-CCT-A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-AA--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81284                      :          G-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--G-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-TAAG--A-AA--ACT-C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-GCAAA
gi|81326                      : ttcataagtG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-TTAA--T-A-A----T-CC-AC--CCAT-AG--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C----------TT---T-G--ACC-T-T--GA-T-G-TCAAA
gi|81325                      :          G-T-GA---T-A--T-----TC-A-ATA-A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--GT-T-AG--A-AAT-A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81316                      :          G-T-GA---T-A--CC---CAC-A-----A--T-G--C------A-C-T--A--T-A------C-CC-AT--GT-T-AG--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--A-C-T-T--GA-A-G-T
gi|81328                      :     tcaaaG-T-GA---T-G--CA---C---------A----G--C-C--A-A---T--A--T-A-A------AC-AT--GT-T-AG--A-TG--A---C-T--C-A-T-G-A-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-T
gi|81294                      :           -T-GA---T-AA-CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT-----T-AG--A-GAC-A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81329                      :               ttcat-A--CA---CCC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GC--A---C-T--T-A-T-C-C-------T--AT---T-G--ACC-T-T--AA-A-G-GCA
gi|81315                      :                      --CA---CTA-A-T------T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--------T--TAA-T-A-C----------CT---T-G--ACC-T-T--GT-A-G-TCAAA
gi|81332                      :                tcatgatgtaagtaag-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CCTAT--G--T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-ACC-------T--TT---T-G--ATC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81330                      :                                -A-C---A--T-G--C-C--A-A-AAT--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-AG--A-GA--A---T-T--T-C-A-C-C-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81331                      :                             cca-A-C---A--T-G--C-A--A-C-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT---AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TT---T-G--ATC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81333                      :                               a-A-C---A--T-G--C-A--A-A-C-T--T--G-A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C--TTTGAT-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81334                      :                                  -C---A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-AAATAT-CC-AT--GT-T-AG--A-GG--AATTC-T--T-A-T-A-CCGAT---T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-GAG-TCAAA
gi|81335                      :                                  -C---A--T-GACC-C--A-G-A-T--G--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------T--TT---T-G--AGC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81336                      :                                             --C-C--G-G-A-C--A--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--G---C-T--T-A-T-A-A-------T--GT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81337                      :                                                -C--A-A-A-C--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81323                      :                                                     -A-A-T--A----A-A----T-CC-AC--GT-T-AA--A-----A---C-T--T-A-T-A-C-------A--TT---T-G--CCC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81346                      :                                              gtgatacatactataaaac-A-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AC--A---C-T--T-A-T-A-A-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81338                      :                                                                 -A-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81343                      :                                                                 -A-A----C-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--AA--C-T--T-A-T-A-A-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81347                      :                                                                 -A-A----T-CC-AT--GT-T-AG--A-AA--A---C-C--T-A---A---------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81342                      :                                                                 -A-A----T-CC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-C--T-A-TGA-G-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81344                      :                                                                 -A-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-A--G-A-T-A-A-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81348                      :                                                                 -A-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-T--A-A-T-A-A-------T--TT---T-G--ACA-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81349                      :                                                                 -A-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-CACTGTAAT--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81350                      :                                                                 -A-A----T-TC-ATCAGT-T-AA--A-AA--A---C-T--T-AAT-A-A-------T--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81341                      :                                                                 -A-A----T-TC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A-------T--TT-----G--ACC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81339                      :                                                                 -A-A----T-CC-AT--GT-T-AA--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G--CT---T-G--ACC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81345                      :                                                                 -A-A----T-CC-AT--GT-T-AA--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81340                      :                                                                 -A-A----T-CC-AT--GT-T-AA--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G--TT---T-G--ACC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81276                      :                                                                                                                           --TT---T-G--ACC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81286                      :                                                                     tttatggtgatacacccacatgccaaatataatccatgtcagagaacttatacc--TT---T-G--ACC-T-T--AA-G-G-TCAAA





Alignments
lowQualScore                  :                  0  0 1  222 0 11  222   0 1 444 11 2 22 0 11 0 0 0 22 11 1 1 1111 1  0  11  0 0 1 00 44 11 222 0 00 0 1 1 1 2222222 2222 0 111 0 11 0  1 0 11  0 2 0     
lowQualScore                  :                  .  . .  ... . ..  ...   . . ... .. . .. . .. . . . .. .. . . .... .  .  ..  . . . .. .. .. ... . .. . . . . ....... .... . ... . .. .  . . ..  . . .     
lowQualScore                  :                  8  7 4  777 7 66  888   6 2 777 77 5 33 6 44 6 6 6 00 44 0 0 1111 0  5  77  5 5 0 77 33 77 111 5 77 5 0 0 0 8888888 6666 5 444 5 22 5  0 5 77  5 1 5     
consensus                     :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
Reference ( family-272 )      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81271                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81272                      :             tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-A--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81273                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---GTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-T--G-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81274                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-A-G-TCAGA
gi|81275                      :             ttCAT-G--T-GA---T-T--CAAT-CCC-A-C---A--T-GG-T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TTGGA-A-G-TCAGA
gi|81276                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-C-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81277                      :            tttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81278                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CT-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---CTT--T-A-T-A---------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81279                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--AT-T-A-G--A-T---A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81280                      :             tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--G-T--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-G-A-G--A-GAAGA---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81281                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---G-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-C--GA---G-TCAAA
gi|81282                      :             ttCAT-GG-T--A---T-A--CA---CTC-A-C---A--A-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--C-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81283                      :              ttAT-GG-T-G----T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A------A----T-CC-AT--GT-T-G-G--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81284                      :                 tttG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--G-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-TAA-G--A-AA--ACT-C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-GCAAA
gi|81285                      :      ttcataagtCAT-GG-T-GA-----A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-A-G--ACGA--A---C-T--T-A-T-A-A-------C----C-T---T-G--A-CC-T-C--GA-G-G-TCAA
gi|81286                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A-A----T-CT-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81287                      :            tttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---ACAT-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-ATT-A-C-------C------T---T-G--A-CC-TCT--GA-GTG-TCAAA
gi|81288                      :             ttCAT-GG-A-AC---C-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--------------C-AC--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81289                      :             tcCAT-GG-T-GA---C----CA---CTC-A-CT--A--T-T--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-CG------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-GATCAAA
gi|81290                      :             ttCAT-GG-T-GAA--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-ATC-------C----T-T---T-GGAA-CCAT-T--GA-GAG-TTAAA
gi|81291                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--A-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-GT--CT-T-A-C--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-C--GA---A-TCAAA
gi|81292                      :            ttgCAT-GG-T-GA---TCA--CAAGACT--A-T---A--T-GAGC-A--A-G-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81293                      :             ttCAT-GG-TTGAC--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A----A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T---G--T-GA--T---G-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CCTT-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81294                      :                   tt-T-GA---T-AA-CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT-----T-A-G--A-GAC-A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81295                      :          ttcatCAT-GA---GA---T-A--CA---CTCGA-C---A--TTG--C-C--AGA-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-GGAA-AA--A---C-T--T---T-GTC-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GAGG-G-TCAAA
gi|81296                      :               ttT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC---C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-ATA-GT-T-AAG--A-GA--A---T-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---TGG--A-CC-T-T--GA---G-TCA
gi|81297                      :          ttcatCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-T-C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A--------TC-AT--GT-T-AAG--A-TG--A---T-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---G-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81298                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-G-C---GATT-G--C-C--A-A-A-T--AT-T-A-C----C-CC-AT--GT-T-A-G--A-TA--A---C-T--T---T-A-CTA-----C----T-T---T-G--ACCC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81299                      :           ttcaCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--TT-T-A-G--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------
gi|81300                      :               tcT-GG-T-GA---T----CA---CTC-G-C---A--T-G--CAC--A-A-A-T--A--T-A-A----T-C--AT--GT---A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-TG--T-G--A--C-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81301                      :          ttcatCAT-GG-T-GA---T-A---G---CTA-A-A---T--T-G--C-C--A-A-A---------A-A----T-CC-AT--GT---A-G--A-AA--A---C-T--T-A---A-A-------C----T-T---T-A--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81302                      :             ttCAT-GG-T-GATATT-A--CA-------A-T---A--T-G--C-CA-A-A-A-T--A--T-ACA----T-CC-AC--GT-T------A-AA--A---T-G--T-A-T---C-------C----T-T---T-G--A-CC---T--GA-G-T-CCAAA
gi|81303                      :                tc-GG-T-GA---T-A--C-----TC---C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A--------CG-AG--AT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-C----T--GA-G-G-TCAAA
gi|81304                      :        ttcattcCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A------T-CC-AA--GT-T-A-C--A-A---------T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81305                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AC-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--A-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--TA-G-G-TCAA
gi|81306                      :              tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CA-AA--GT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------A----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81307                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-T---G--T-G--C-C--A-A-T-A--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-TA--A---C-T--T-A-A-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81308                      :              tCAT-GG-T-GA---A-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AA-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--G-TC---A--AA-G-G-TCAA
gi|81309                      :              tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-G--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AA--GT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---C-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81310                      :               tAT-TG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----A-CC-AA--GT-T-A-A--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81311                      :             ttCATAGG-T-GA---T-A--CA---CTC-AAC---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-ATA----T-CC-ATT-GT-T-A-G--A--A--A---C-TACT-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TA-GA-GTG-TCCAA
gi|81312                      :              tCAT-GT-T-CA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-CCCA-ACA-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-T--T-A-C-A-C-------C----T-G---T-C--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81313                      :              tCAT-GGCT-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C----A-A-T--A--T-A-A----T-CT-A---GT-T-G-G--A--A--A---C----T-G-T-A-C-------CT---T-T---T-G--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81314                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCA-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GA-T-A-G--A-AA--A---C-A--T-A-
gi|81315                      :                               t--CA---CTA-A-T------T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--------T--TAA-T-A-C-------C------T---T-G--A-CC-T-T--GT-A-G-TCAAA
gi|81316                      :    tcatgatgtaagtaagG-T-GA---T-A--CC---CAC-A-----A--T-G--C------A-C-T--A--T-A------C-CC-AT--GT-T-A-G--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A--C-T-T--GA-A-G-T
gi|81317                      :          tcaaaCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81318                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81319                      :               CAT-GG-TTGA---T-A--CA---CTC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-A----T-CC-AT---T-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-T-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81320                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-G-C--T--C-A-A----T-CC-AT--GT-C-A----A-AA--A---C-T--T-T-G-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-CCAAA
gi|81321                      :                AT-GG-T-GA---T-A--CA---CTT-AAC---A--T-G--C-C--A-A-A-T--AAAT-A-A----T-CC-AT--GT-A-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-TAA-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TG-GA-G-G-TCAAA
gi|81322                      :                AT-GG-T-GA---T-ATTCAG--CTC-A-TCTTA--TTG--C-C--A-A-A-T-----T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A--------------T-T---T-GT-A-TC-T-C--GA-G-G-TCAAA
gi|81323                      :                                                               -A-A-T--A----A-A----T-CC-AC--GT-T-A-A--A-----A---C-T--T-A-T-A-C-------A----T-T---T-G--C-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81324                      : gtgatacatactataaaacG-T-GA---T-G--CA---CTC-G-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-TC-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81325                      :                    G-T-GA---T-A--T-----TC-A-ATA-A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--GT-T-A-G--A-AAT-A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81326                      :                    G-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-TTAA--T-A-A----T-CC-AC--CCAT-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A---------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-T-G-TCAAA
gi|81327                      :                    G-T-GA---C-A--CA---TCC-A-CCT-A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-A-A--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81328                      :                    G-T-GA---T-G--CA---C---------A----G--C-C--A-A---T--A--T-A-A------AC-AT--GT-T-A-G--A-TG--A---C-T--C-A-T-G-A-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-T
gi|81329                      :                              -A--CA---CCC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GC--A---C-T--T-A-T---C-------C----TAT---T-G--A-CC-T-T--AA-A-G-GCA
gi|81330                      :                                          -A-C---A--T-G--C-C--A-A-AAT--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-A-G--A-GA--A---T-T--T---C-A-C-------CT---T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81331                      :                                       cca-A-C---A--T-G--C-A--A-C-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT---A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-TC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81332                      :                                         a-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CCTAT--G--T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------CT---T-T---T-G--A-TC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81333                      :                                          -A-C---A--T-G--C-A--A-A-C-T--T--G-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-TTGAT-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81334                      :                                            -C---A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-AAATAT-CC-AT--GT-T-A-G--A-GG--AATTC-T--T-A-T-A-C-------CGATTT-T---T-G--A-CC-T-T--GA-GAG-TCAAA
gi|81335                      :                                            -C---A--T-GACC-C--A-G-A-T--G--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-GC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81336                      :                                                       --C-C--G-G-A-C--A--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--G---C-T--T-A-T-A-A-------T----G-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81337                      :                                                          -C--A-A-A-C--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81338                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81339                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----C-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81340                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81341                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A------------T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81342                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-TGA-G-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81343                      :                                                                           -A-A----C-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--AA--C-T--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81344                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-A--G-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81345                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81346                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AC--A---C-T--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81347                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-C--T-A---A---------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81348                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--A-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CA-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81349                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-CACTGTAAT----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81350                      :                                                                           -A-A----T-TC-ATCAGT-T-A-A--A-AA--A---C-T--T-AAT-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA





Alignments
lowQualScore                  :                  0  0 1  222 0 11  222   0 1 444 11 2 22 0 11 0 0 0 22 11 1 1 1111 1  0  11  0 0 1 00 44 11 222 0 00 0 1 1 1 2222222 2222 0 111 0 11 0  1 0 11  0 2 0     
lowQualScore                  :                  .  . .  ... . ..  ...   . . ... .. . .. . .. . . . .. .. . . .... .  .  ..  . . . .. .. .. ... . .. . . . . ....... .... . ... . .. .  . . ..  . . .     
lowQualScore                  :                  8  7 4  777 7 66  888   6 2 777 77 5 33 6 44 6 6 6 00 44 0 0 1111 0  5  77  5 5 0 77 33 77 111 5 77 5 0 0 0 8888888 6666 5 444 5 22 5  0 5 77  5 1 5     
consensus                     :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
Reference ( family-272 )      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81271                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81272                      :             tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-A--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81273                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---GTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-T--G-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81274                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-A-G-TCAGA
gi|81275                      :             ttCAT-G--T-GA---T-T--CAAT-CCC-A-C---A--T-GG-T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TTGGA-A-G-TCAGA
gi|81276                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-C-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81277                      :            tttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81278                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CT-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---CTT--T-A-T-A---------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81279                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--AT-T-A-G--A-T---A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81280                      :             tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--G-T--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-G-A-G--A-GAAGA---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81281                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---G-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-C--GA---G-TCAAA
gi|81282                      :             ttCAT-GG-T--A---T-A--CA---CTC-A-C---A--A-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--C-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81283                      :              ttAT-GG-T-G----T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A------A----T-CC-AT--GT-T-G-G--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81284                      :                 tttG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--G-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-TAA-G--A-AA--ACT-C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-GCAAA
gi|81285                      :      ttcataagtCAT-GG-T-GA-----A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-A-G--ACGA--A---C-T--T-A-T-A-A-------C----C-T---T-G--A-CC-T-C--GA-G-G-TCAA
gi|81286                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A-A----T-CT-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81287                      :            tttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---ACAT-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-ATT-A-C-------C------T---T-G--A-CC-TCT--GA-GTG-TCAAA
gi|81288                      :             ttCAT-GG-A-AC---C-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--------------C-AC--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81289                      :             tcCAT-GG-T-GA---C----CA---CTC-A-CT--A--T-T--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-CG------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-GATCAAA
gi|81290                      :             ttCAT-GG-T-GAA--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-ATC-------C----T-T---T-GGAA-CCAT-T--GA-GAG-TTAAA
gi|81291                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--A-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-GT--CT-T-A-C--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-C--GA---A-TCAAA
gi|81292                      :            ttgCAT-GG-T-GA---TCA--CAAGACT--A-T---A--T-GAGC-A--A-G-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81293                      :             ttCAT-GG-TTGAC--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A----A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T---G--T-GA--T---G-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CCTT-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81294                      :                   tt-T-GA---T-AA-CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT-----T-A-G--A-GAC-A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81295                      :          ttcatCAT-GA---GA---T-A--CA---CTCGA-C---A--TTG--C-C--AGA-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-GGAA-AA--A---C-T--T---T-GTC-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GAGG-G-TCAAA
gi|81296                      :               ttT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC---C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-ATA-GT-T-AAG--A-GA--A---T-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---TGG--A-CC-T-T--GA---G-TCA
gi|81297                      :          ttcatCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-T-C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A--------TC-AT--GT-T-AAG--A-TG--A---T-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---G-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81298                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-G-C---GATT-G--C-C--A-A-A-T--AT-T-A-C----C-CC-AT--GT-T-A-G--A-TA--A---C-T--T---T-A-CTA-----C----T-T---T-G--ACCC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81299                      :           ttcaCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--TT-T-A-G--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------
gi|81300                      :               tcT-GG-T-GA---T----CA---CTC-G-C---A--T-G--CAC--A-A-A-T--A--T-A-A----T-C--AT--GT---A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-TG--T-G--A--C-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81301                      :          ttcatCAT-GG-T-GA---T-A---G---CTA-A-A---T--T-G--C-C--A-A-A---------A-A----T-CC-AT--GT---A-G--A-AA--A---C-T--T-A---A-A-------C----T-T---T-A--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81302                      :             ttCAT-GG-T-GATATT-A--CA-------A-T---A--T-G--C-CA-A-A-A-T--A--T-ACA----T-CC-AC--GT-T------A-AA--A---T-G--T-A-T---C-------C----T-T---T-G--A-CC---T--GA-G-T-CCAAA
gi|81303                      :                tc-GG-T-GA---T-A--C-----TC---C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A--------CG-AG--AT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-C----T--GA-G-G-TCAAA
gi|81304                      :        ttcattcCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A------T-CC-AA--GT-T-A-C--A-A---------T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81305                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AC-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--A-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--TA-G-G-TCAA
gi|81306                      :              tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CA-AA--GT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------A----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81307                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-T---G--T-G--C-C--A-A-T-A--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-TA--A---C-T--T-A-A-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81308                      :              tCAT-GG-T-GA---A-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AA-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--G-TC---A--AA-G-G-TCAA
gi|81309                      :              tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-G--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AA--GT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---C-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81310                      :               tAT-TG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----A-CC-AA--GT-T-A-A--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81311                      :             ttCATAGG-T-GA---T-A--CA---CTC-AAC---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-ATA----T-CC-ATT-GT-T-A-G--A--A--A---C-TACT-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TA-GA-GTG-TCCAA
gi|81312                      :              tCAT-GT-T-CA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-CCCA-ACA-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-T--T-A-C-A-C-------C----T-G---T-C--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81313                      :              tCAT-GGCT-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C----A-A-T--A--T-A-A----T-CT-A---GT-T-G-G--A--A--A---C----T-G-T-A-C-------CT---T-T---T-G--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81314                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCA-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GA-T-A-G--A-AA--A---C-A--T-A-
gi|81315                      :                               t--CA---CTA-A-T------T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--------T--TAA-T-A-C-------C------T---T-G--A-CC-T-T--GT-A-G-TCAAA
gi|81316                      :    tcatgatgtaagtaagG-T-GA---T-A--CC---CAC-A-----A--T-G--C------A-C-T--A--T-A------C-CC-AT--GT-T-A-G--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A--C-T-T--GA-A-G-T
gi|81317                      :          tcaaaCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81318                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81319                      :               CAT-GG-TTGA---T-A--CA---CTC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-A----T-CC-AT---T-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-T-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81320                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-G-C--T--C-A-A----T-CC-AT--GT-C-A----A-AA--A---C-T--T-T-G-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-CCAAA
gi|81321                      :                AT-GG-T-GA---T-A--CA---CTT-AAC---A--T-G--C-C--A-A-A-T--AAAT-A-A----T-CC-AT--GT-A-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-TAA-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TG-GA-G-G-TCAAA
gi|81322                      :                AT-GG-T-GA---T-ATTCAG--CTC-A-TCTTA--TTG--C-C--A-A-A-T-----T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A--------------T-T---T-GT-A-TC-T-C--GA-G-G-TCAAA
gi|81323                      :                                                               -A-A-T--A----A-A----T-CC-AC--GT-T-A-A--A-----A---C-T--T-A-T-A-C-------A----T-T---T-G--C-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81324                      : gtgatacatactataaaacG-T-GA---T-G--CA---CTC-G-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-TC-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81325                      :                    G-T-GA---T-A--T-----TC-A-ATA-A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--GT-T-A-G--A-AAT-A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81326                      :                    G-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-TTAA--T-A-A----T-CC-AC--CCAT-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A---------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-T-G-TCAAA
gi|81327                      :                    G-T-GA---C-A--CA---TCC-A-CCT-A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-A-A--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81328                      :                    G-T-GA---T-G--CA---C---------A----G--C-C--A-A---T--A--T-A-A------AC-AT--GT-T-A-G--A-TG--A---C-T--C-A-T-G-A-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-T
gi|81329                      :                              -A--CA---CCC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GC--A---C-T--T-A-T---C-------C----TAT---T-G--A-CC-T-T--AA-A-G-GCA
gi|81330                      :                                          -A-C---A--T-G--C-C--A-A-AAT--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-A-G--A-GA--A---T-T--T---C-A-C-------CT---T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81331                      :                                       cca-A-C---A--T-G--C-A--A-C-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT---A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-TC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81332                      :                                         a-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CCTAT--G--T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------CT---T-T---T-G--A-TC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81333                      :                                          -A-C---A--T-G--C-A--A-A-C-T--T--G-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-TTGAT-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81334                      :                                            -C---A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-AAATAT-CC-AT--GT-T-A-G--A-GG--AATTC-T--T-A-T-A-C-------CGATTT-T---T-G--A-CC-T-T--GA-GAG-TCAAA
gi|81335                      :                                            -C---A--T-GACC-C--A-G-A-T--G--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-GC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81336                      :                                                       --C-C--G-G-A-C--A--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--G---C-T--T-A-T-A-A-------T----G-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81337                      :                                                          -C--A-A-A-C--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81338                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81339                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----C-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81340                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81341                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A------------T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81342                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-TGA-G-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81343                      :                                                                           -A-A----C-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--AA--C-T--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81344                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-A--G-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81345                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81346                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AC--A---C-T--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81347                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-C--T-A---A---------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81348                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--A-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CA-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81349                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-CACTGTAAT----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81350                      :                                                                           -A-A----T-TC-ATCAGT-T-A-A--A-AA--A---C-T--T-AAT-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA


blockSeqs                     :                       T  TAT   TT  AGA     A CTT CA T AG   CC       TA AA G C AATA T     CA      A    AG AG ATT        T A T ACTGTAA GATT   TGA   GA    A   TG    T
blockSeqs                     :                       T  A     A   AT      A TA  AT T AC   A        T  T  G T .    T     A       A    CG C  CT         A G T TA      T      G     T     T   A     A
blockSeqs                     :                       .  C     .   G       . CT  .  T G    .        T  .  . . .    .     T       .    AG T  A          . . . G       T      .     .     .   G     T
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . T   .  T .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       T      .     .     .   .     A
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . C   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . C   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    T  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    T  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    T  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    T  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    T  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                       .  .     .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                .   .       . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    G  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                            . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                            . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                            . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                            . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                            . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                            . .   .  . .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                       .    .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                            .        .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                     .  .  . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    A  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .       .      .     .     .   .     .
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          . . . .                                     
blockSeqs                     :                                                                           . . .    .     .       .    .  .  .          .                                           


blockSeqCons                  :               
originalCons                  :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
finalCons                     :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA





Alignments
lowQualScore                  :                  0  0 1  222 0 11  222   0 1 444 11 2 22 0 11 0 0 0 22 11 1 1 1111 1  0  11  0 0 1 00 44 11 222 0 00 0 1 1 1 2222222 2222 0 111 0 11 0  1 0 11  0 2 0     
lowQualScore                  :                  .  . .  ... . ..  ...   . . ... .. . .. . .. . . . .. .. . . .... .  .  ..  . . . .. .. .. ... . .. . . . . ....... .... . ... . .. .  . . ..  . . .     
lowQualScore                  :                  8  7 4  777 7 66  888   6 2 777 77 5 33 6 44 6 6 6 00 44 0 0 1111 0  5  77  5 5 0 77 33 77 111 5 77 5 0 0 0 8888888 6666 5 444 5 22 5  0 5 77  5 1 5     
consensus                     :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
Reference ( family-272 )      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81271                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81272                      :             tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-A--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81273                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---GTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-T--G-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81274                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-A-G-TCAGA
gi|81275                      :             ttCAT-G--T-GA---T-T--CAAT-CCC-A-C---A--T-GG-T-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TTGGA-A-G-TCAGA
gi|81276                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-C-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81277                      :            tttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81278                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CT-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---CTT--T-A-T-A---------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81279                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--AT-T-A-G--A-T---A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81280                      :             tcCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--G-T--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-G-A-G--A-GAAGA---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81281                      :             ttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---G-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-C--GA---G-TCAAA
gi|81282                      :             ttCAT-GG-T--A---T-A--CA---CTC-A-C---A--A-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--C-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81283                      :              ttAT-GG-T-G----T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A------A----T-CC-AT--GT-T-G-G--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81284                      :                 tttG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--G-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-TAA-G--A-AA--ACT-C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-GCAAA
gi|81285                      :      ttcataagtCAT-GG-T-GA-----A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-A-G--ACGA--A---C-T--T-A-T-A-A-------C----C-T---T-G--A-CC-T-C--GA-G-G-TCAA
gi|81286                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A-A----T-CT-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--AA-G-G-TCAAA
gi|81287                      :            tttCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---ACAT-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-A---GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-ATT-A-C-------C------T---T-G--A-CC-TCT--GA-GTG-TCAAA
gi|81288                      :             ttCAT-GG-A-AC---C-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--------------C-AC--GT-T-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81289                      :             tcCAT-GG-T-GA---C----CA---CTC-A-CT--A--T-T--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-CG------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-GATCAAA
gi|81290                      :             ttCAT-GG-T-GAA--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-ATC-------C----T-T---T-GGAA-CCAT-T--GA-GAG-TTAAA
gi|81291                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--A-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-GT--CT-T-A-C--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-C--GA---A-TCAAA
gi|81292                      :            ttgCAT-GG-T-GA---TCA--CAAGACT--A-T---A--T-GAGC-A--A-G-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81293                      :             ttCAT-GG-TTGAC--T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A----A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T---G--T-GA--T---G-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CCTT-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81294                      :                   tt-T-GA---T-AA-CA---CTC-A-C---A--TTG--C-C--A-A---T--A--T-A-A----T-CC-AT-----T-A-G--A-GAC-A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81295                      :          ttcatCAT-GA---GA---T-A--CA---CTCGA-C---A--TTG--C-C--AGA-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-GGAA-AA--A---C-T--T---T-GTC-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GAGG-G-TCAAA
gi|81296                      :               ttT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC---C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-ATA-GT-T-AAG--A-GA--A---T-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---TGG--A-CC-T-T--GA---G-TCA
gi|81297                      :          ttcatCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-T-C---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-A--------TC-AT--GT-T-AAG--A-TG--A---T-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---G-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81298                      :              ttAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-G-C---GATT-G--C-C--A-A-A-T--AT-T-A-C----C-CC-AT--GT-T-A-G--A-TA--A---C-T--T---T-A-CTA-----C----T-T---T-G--ACCC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81299                      :           ttcaCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--TT-T-A-G--A--A--A---C-T--T-A-T-A-C-------
gi|81300                      :               tcT-GG-T-GA---T----CA---CTC-G-C---A--T-G--CAC--A-A-A-T--A--T-A-A----T-C--AT--GT---A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-TG--T-G--A--C-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81301                      :          ttcatCAT-GG-T-GA---T-A---G---CTA-A-A---T--T-G--C-C--A-A-A---------A-A----T-CC-AT--GT---A-G--A-AA--A---C-T--T-A---A-A-------C----T-T---T-A--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81302                      :             ttCAT-GG-T-GATATT-A--CA-------A-T---A--T-G--C-CA-A-A-A-T--A--T-ACA----T-CC-AC--GT-T------A-AA--A---T-G--T-A-T---C-------C----T-T---T-G--A-CC---T--GA-G-T-CCAAA
gi|81303                      :                tc-GG-T-GA---T-A--C-----TC---C---A--T-G--C----A-A-A-T-----T-A--------CG-AG--AT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-C----T--GA-G-G-TCAAA
gi|81304                      :        ttcattcCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A------T-CC-AA--GT-T-A-C--A-A---------T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81305                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AC-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--A-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--TA-G-G-TCAA
gi|81306                      :              tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CA-AA--GT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------A----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81307                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---C-C-A-T---G--T-G--C-C--A-A-T-A--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-TA--A---C-T--T-A-A-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81308                      :              tCAT-GG-T-GA---A-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-AA-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--G-TC---A--AA-G-G-TCAA
gi|81309                      :              tCAT-GG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-C---A--T-A--C-G--A-A-A-T--A--T-A-A----TTCC-AA--GT-T-A-G--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---C-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81310                      :               tAT-TG-T-GA---G-A--CA---CCC-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----A-CC-AA--GT-T-A-A--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81311                      :             ttCATAGG-T-GA---T-A--CA---CTC-AAC---A--T-G--C----A-A-A-T--A--T-ATA----T-CC-ATT-GT-T-A-G--A--A--A---C-TACT-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TA-GA-GTG-TCCAA
gi|81312                      :              tCAT-GT-T-CA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-CCCA-ACA-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-T--T-A-C-A-C-------C----T-G---T-C--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81313                      :              tCAT-GGCT-GA---T-A--CA---CCC-A-C---A--T-G--C-C----A-A-T--A--T-A-A----T-CT-A---GT-T-G-G--A--A--A---C----T-G-T-A-C-------CT---T-T---T-G--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81314                      :              tCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CCA-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GA-T-A-G--A-AA--A---C-A--T-A-
gi|81315                      :                               t--CA---CTA-A-T------T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--------T--TAA-T-A-C-------C------T---T-G--A-CC-T-T--GT-A-G-TCAAA
gi|81316                      :    tcatgatgtaagtaagG-T-GA---T-A--CC---CAC-A-----A--T-G--C------A-C-T--A--T-A------C-CC-AT--GT-T-A-G--AAGA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A--C-T-T--GA-A-G-T
gi|81317                      :          tcaaaCAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81318                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---CTC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C----T-A-T-A-C-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81319                      :               CAT-GG-TTGA---T-A--CA---CTC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-A----T-CC-AT---T-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-T-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81320                      :               CAT-GG-T-GA---T-A--CA---ACC-A-C---A--T-G--C-C--A-A-G-C--T--C-A-A----T-CC-AT--GT-C-A----A-AA--A---C-T--T-T-G-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-CCAAA
gi|81321                      :                AT-GG-T-GA---T-A--CA---CTT-AAC---A--T-G--C-C--A-A-A-T--AAAT-A-A----T-CC-AT--GT-A-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-TAA-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-TG-GA-G-G-TCAAA
gi|81322                      :                AT-GG-T-GA---T-ATTCAG--CTC-A-TCTTA--TTG--C-C--A-A-A-T-----T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A--------------T-T---T-GT-A-TC-T-C--GA-G-G-TCAAA
gi|81323                      :                                                               -A-A-T--A----A-A----T-CC-AC--GT-T-A-A--A-----A---C-T--T-A-T-A-C-------A----T-T---T-G--C-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81324                      : gtgatacatactataaaacG-T-GA---T-G--CA---CTC-G-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-TC-AA--GT-T-A-G--A-AA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-C-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81325                      :                    G-T-GA---T-A--T-----TC-A-ATA-A--T-A--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AC--GT-T-A-G--A-AAT-A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA---G-TCAAA
gi|81326                      :                    G-T-GA---T-A--CA---CTA-A-T---A--T-G--C-C--A-A-A-TTAA--T-A-A----T-CC-AC--CCAT-A-G--A-AA--A---C-T--T-A-T-A---------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-T-G-TCAAA
gi|81327                      :                    G-T-GA---C-A--CA---TCC-A-CCT-A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-A-A--A-GA--A-----T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81328                      :                    G-T-GA---T-G--CA---C---------A----G--C-C--A-A---T--A--T-A-A------AC-AT--GT-T-A-G--A-TG--A---C-T--C-A-T-G-A-------C----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-T
gi|81329                      :                              -A--CA---CCC-A-CC--A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GC--A---C-T--T-A-T---C-------C----TAT---T-G--A-CC-T-T--AA-A-G-GCA
gi|81330                      :                                          -A-C---A--T-G--C-C--A-A-AAT--A--T-A-A----T-CC-AA--GT-T-A-G--A-GA--A---T-T--T---C-A-C-------CT---T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81331                      :                                       cca-A-C---A--T-G--C-A--A-C-A-T--A----A-A----T-CC-AT--GT---A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-T---T-G--A-TC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81332                      :                                         a-A-C---A--T-G--C-C--A-A-A-T--A--T-A-A----T-CCTAT--G--T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------CT---T-T---T-G--A-TC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81333                      :                                          -A-C---A--T-G--C-A--A-A-C-T--T--G-A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-GA--A---C-T--T-A-T-A-C-------C----T-TTGAT-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81334                      :                                            -C---A--T-G--C-C--A-A-A-TT-A--T-A-AAATAT-CC-AT--GT-T-A-G--A-GG--AATTC-T--T-A-T-A-C-------CGATTT-T---T-G--A-CC-T-T--GA-GAG-TCAAA
gi|81335                      :                                            -C---A--T-GACC-C--A-G-A-T--G--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-GC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81336                      :                                                       --C-C--G-G-A-C--A--TGA-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--G---C-T--T-A-T-A-A-------T----G-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81337                      :                                                          -C--A-A-A-C--A----A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81338                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81339                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----C-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81340                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81341                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-A------------T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81342                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-C--T-A-TGA-G-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81343                      :                                                                           -A-A----C-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--AA--C-T--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81344                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-A--G-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81345                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-A--A--A--A---C-C--T-A-T-A-A-------G----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-A-TCAA
gi|81346                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AC--A---C-T--T-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAA
gi|81347                      :                                                                           -A-A----T-CC-AT--GT-T-A-G--A-AA--A---C-C--T-A---A---------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCA
gi|81348                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--A-A-T-A-A-------T----T-T---T-G--A-CA-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81349                      :                                                                           -A-A----T-TC-AT--GT-T-A-A--A-AA--A---C-T--G-A-T-A-CACTGTAAT----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA
gi|81350                      :                                                                           -A-A----T-TC-ATCAGT-T-A-A--A-AA--A---C-T--T-AAT-A-A-------T----T-T---T-G--A-CC-T-T--GA-G-G-TCAAA