lowQualScore                  :     0    0 00  0 6   00 11 11 1 00 9 0   11 0  11  0 777  0  0 22222  0  1  0   111 0    0  1   00 11 11   1   0  11111    1111 0 4444444444 00   0   00  000 0 11111 00       
lowQualScore                  :     .    . ..  . .   .. .. .. . .. . .   .. .  ..  . ...  .  . .....  .  .  .   ... .    .  .   .. .. ..   .   .  .....    .... . .......... ..   .   ..  ... . ..... ..       
lowQualScore                  :     6    5 77  5 6   77 22 22 7 77 3 5   77 5  22  5 555  5  5 99999  5  0  5   333 5    5  0   77 44 77   0   5  88888    1111 5 0000000000 77   5   77  999 5 44444 88       
consensus                     : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
Reference ( gi|13473 )        : TGTA-GTAA-T--GA-GTCTT--A--C--AGA--CGA-AGA--C-AA--TA-T--CGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13474                      : TGTA-GTAA-T--AA-GCCTT--A--C--TGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--TATTC
gi|13488                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAAA-C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GG-AAC--CAGA--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13487                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C------AA-CAC-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AA
gi|13478                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CAT-A------TCCT----C-A----------T--GT--ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13493                      : TGTA-GTAA-T--GA-AACTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-TT-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----TAAAACTCTT
gi|13498                      : TGTA-GTAA-T--GA-ACCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TC-TGT---C-AGCA-AG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTC
gi|13502                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--T-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TTTT--C-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13472                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--A------A-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AGC--C--A--AAA-CAT-GT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13499                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--AGT-TA-C-----AA-GC-AT-TGT---C-GGCT-GG-AAC--C--A--AAG-CAT-AT-----TCCT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTC
gi|13477                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCAT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AA-----TCCT----T-A----------T--GTA-ACA--TA---T-C-----T--AATT
gi|13490                      : TGTT-GTAA-A--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TAT-CA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACCTGTA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13486                      : TGCA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-G--TGT-TA-C-----AA-TC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AAT
gi|13496                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-CGT---T-GGCT-GG-ACC--C--A--AAA-CAT-AA-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13489                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--ATA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--CGT-TAAC-----AA-GCCTT-TGT---C-GGCT-GGGAAC--C--A--AAG-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13513                      : TGTA-GTAA-T--GA---CTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-CC----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--TTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13476                      : TGTA-GTAA-T--GG-ACCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GG-ATC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCC------------------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13475                      : TGTA-GTAA-T--AA-GCTTT--A--C--AGA--CAA-AGG--C-AA--TA-T--TGT-TG-C-----AA-GC-TT-TTT---C-AGAT-GA-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13506                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCTTT--A--T--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-AA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GACT-GG-AAT--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-T----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13495                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--ACA--TAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGTTGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-AAT--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13500                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--A------A-ATA--C-AA--TA-T--TGT-TA----------GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13511                      : TGTA-GTAA-C--GA-GCCTT--G--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TT-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TAT---C-GACA-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-C----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AGTTC
gi|13481                      : TGTA-GTAA-T--AA-ACCTG--A--C--AGA--CAA-ATA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AACT-GA-ACC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTC-AAC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13518                      : TGTC-ATAA-T--GA-GTCGT--A--CGCATA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TT-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-C---AT-----TCCT----C-A----------T--GCA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13523                      : TGTA-GCAA-T--AA-GACGT--A--C--ATA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TTT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-TCCT-GG-AAC--C--A--AAA-TAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13492                      : TGTG-ATAA-T--GG-GCCTT--A--C--AGA--AAA-AGA--C-AA--TA-T--TAT-TA-C-----AA-GC-TT-TGA---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AC-----TCCT----C-ATGTACAT---T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTTTT
gi|13482                      : TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CTA-AGA--C-AA--TA-T--T-T-CA-C-----AA-GC-TT-TGC---C-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13510                      : TATA-GTAACT--GA-GCCTT--A--C--AGA---AA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GGAAAC--C--A--AA---AT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----T--AATTC
gi|13483                      : TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CTA-AGA--C-AA--TA-T--TTT-CA-C-----AA-GC-TT-TGC---C-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----
gi|13480                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCAT--A--C--A------A-AGA--C-AA--TA-C--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCTCTGAC-A----------G--GTA-ACC--CA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13522                      : TGTAAGTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAAA-C-AAA-TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGG---C-TGCT-GG-AAC--C--AGGAAC-CATTAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13485                      : TGAA-ATAA-T--GA-G-CTT--A--C--AGA--CTA-AGA--C-AA--TA-T--T-T-CA-C-----AA-GC-TT-TGC---C-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13529                      : TGTA-GATA-T--GA-GCCTT--AA-C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AAAGC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-C-T-AT-----TCCT----C-A----------C--CTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13521                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGAAACAA-AAA--C-TA--TA-T---GT-TG-C-----AA-GC-TT-TGT---T-GGCT-GG-AGC--CCAA--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--GACT
gi|13525                      : TGTA-GAAT-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-TATTGT-TT-C-----AA-GT-TT-TGT---T-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ATT--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13494                      : TGTG-ATAA-T--GA-ACTTT--A--C--AAA--TAA-AGA--C-AA--TA-T--TGC-TA-C-----AA-GC-TT-TTT---C-AGCT-GG-AAA--C--A--AAA-CAA-AT-----TCCT----T-A----------T--GCA-ACT--TA---C-C-----T--AATTCT
gi|13484                      : TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CTA-AGA--C-AA--TA-T--T-T-CA-C-----AA--C-TT-TGC---C-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13505                      : TGTA-GTAT-T--GA-ACTTT--A--C--A------A-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-CGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--AT--TCC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13515                      : TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--T-A-AAA--C-AA--TATT--TGC-CA-C-----AA-GC-TT-TTT---C-GGCA-GG-AAC--C--A--AAG-CAT-AT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----G--AATTC
gi|13497                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--AAA--T---AGA--A-AA--TG-T--TGT-TA-C-----TA-GC-TT-TGT---C-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---A-C-----A--AATTCTT
gi|13509                      : TGTA-ATAT-T--GA-GCCTT--A--C--AAA--CAA-TGA--C-TA--TA-T--TGT-TG-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAATTAT-ATATAACTCCT----C-A----------T--ATA-ACC---A---T-C-----T--ACTTCTT
gi|13524                      : TGCA-ATAA-T--TA-GCCTA--A--C--AAA--CGT-AGA--C-AA--CA-T--TGT-TA-C-----AA-ACATTGTGT---C---CT-GG-AAC--C--A--AAA-CCT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13504                      : TATA-ATAT-T--GA-GCCTT--T--T--A------A-AGA--C-AG--AA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CGT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-A-----T--AATTATT
gi|13526                      : TGTA-GTAT-T--GA-GCCTT--A--C--ACA--AAA-AGA--C-AA--TA-T--TCT-TG-C-----AA-GC-TT-AGT---A-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-G----------T--GTT-CCC--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13528                      : TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A--C--AAA--C---AGA--A-AA--TG-T--TGT-TA-C-----TA-G--TT-TGT---C-AGAT-GG-AAC--C--A--GAA-CAT-AT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---T-C-----A--AATTCTT
gi|13530                      : TGTG-ATAA-C--GA-GCCCT--A--C--AAA--C-A-AGA--C-AA--TG-T--TGT-TA-CC----AA-GC-TT--GT---C-GGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CAT-A------TCCT----C-A----------T--GAA-ACC--TA---T-T-----C--AATACTT
gi|13520                      : TGTG-ATAA-T--GA-GCCCT--A--C--AAA--CAT-AGG--T-GA--CA-T--GGC-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--AT-AAA-CAT-AT-----TCCT----T-G----------A--GT--ACC--TG---T-T-----T--AAATCTT
gi|13512                      : TGTA-GTAA-TTGAA-GCCTTTTA--A--AGA--CAA-AAAACC-AA--TA-T---GTATA-C-----AA-GC-TT-GGT---C-AGCT-GG-AACGTC--A--GAA-CAT-AT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TT---C-T-----T--AATTC
gi|13507                      : TGTA-ATAA-T--GT-GCCTT--A--C--AAA----ATAGA--C-AA--TG-C--TGT-TA-C-----AG-GA-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAT--C--A--AAT-CAT-AT-----TCCT----A-C----------T--GTA-ATC--TA---T-A-----T--AATT
gi|13491                      : TGTA-ACAA-T--GA-GCGTC--A--C--AAA--CAA-AGA--C-AA--TG-T--TGT-TA-C-----AA-GA-TG-TGC---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCC
gi|13503                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--CT-AAA--CAA-AGA--C-AA--TG-T--TGT-TA-C-----GA-GC-TT-TG----C-ATCT-GA-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TC
gi|13516                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--AAA--CAA-AGA--C-AA--TG-A--TGT-TA-C-----AA-GT-TT-TGT---C-GGCA-GG-AAC--T--G--TAA-CAT-CT-------GT----C-A----------T--ATA-TAC--TA---T-C-----T--AATTTTT
gi|13531                      : TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--ATT-TA-C-----AA-AC-TT-TGT---CAAACT-GG-GAT--C--A--AAA-CAT-A
gi|13508                      : TGTA--TAA-T--GAAGCCTT--A--C--AG---CAA-AAA--CCAA--TA-T--TGT-TA-C-----CA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GG-AGC--C--A--GAACCAT-AT-----TCCT------A----------T---TACATC--TT---T-C-----T--AATACTT
gi|13527                      : TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A--C--A------A-AGA--C-A--------------------------C-TT-TGT---C-AGCT-GG-GAC--G--A--AAA-CAT-AC-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TT---T-T-----T--AATTCTT
gi|13470                      : TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T--C--AAA--GAA-AGT--C-AA--TG-T--TGT-CG-C-----AA-AC-TT-TGC---C-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CAT-AT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13469                      : TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T--C--AAA--GAA-AGT--C-AA--TG-T--TGT-CG-C-----AA-AC-TT-TGC---C-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CAT-AT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13468                      : TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T--C--AAA--GAA-AGT--C-AA--TG-T--TGT-CG-C-----AA-AC-TT-TGC---C-AGCT-GG--GC--C--A--ATG-CAT-AT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13517                      : TGTA-ATAA-A--GT-GTCTC--A--T--CAA--CAT-AGA--C-AG--TG-T--TGT-TA-C-----AA-AC-TT-TGT---C-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TTC
gi|13514                      : TGTT-ATAT-T--AA-GCCTT--A--C--AAA--CAA-AGG--C-AG--TG-T--CGT-TG-T-----AA-GC-TA-TGT---C-AGCT-GG-AAC--G--A--AAA-CAT-ATA----GTCT----C-A----------T--CTA-
gi|13532                      : TGTA-GTAA-T--AA-GCCGT--A--C--AGA--TAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-AC-TT-TGT---C-GGCT-
gi|13471                      : TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T--C--AAA--GAA-AGT--C-AAGTTG-T--CG---G-C-----AA-AC-TT-TGC---C-AGCT-GG-G-C--C--A--ATG-CAT-AT-----TTC-----C-A----------TAAGTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13533                      :  GTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TC-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-AG-AAT--C--A--GAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ATA--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13534                      :  GTA-ATAC-T--GA-GCCTT-----C--AGA--AAC-AGA--C-AA--TC-T--TGT-TG-C-----AA-GC-TT-CGT---C-AGCT-GG-
gi|13538                      :   TA-GTAA-T--GA-GACTT--A--C--AGA--CAA-AAA--G-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCTT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13535                      :   TA-GTAA-T--GA-GCCTT--G--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TA-TGC---C-AGCT-GG-GAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TTAT----C-A----------T--GTA-AGC--TA---T-G-----C--AATTCTT
gi|13543                      :   TA-ATAA-T--GA-GCGTT--A--C--A------A-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GT-AT-TGT---C-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----G--AATTCTT
gi|13540                      :  aTA-GTAA-T--G--GCCTT--AAAC--AGA----A-AGG--C-AA--TA-T--TGT-T--C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AA---AT-AT-----TCCT----CAA----------T--GTA-AAC--TAATGT-C-----T--AATT
gi|13542                      :    A-GTAA-T--GA-GCCTT--A--C--AAA--TAA------C-AA--TA-T--TGT-TA----------GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CAG-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13544                      :       TAA-T--GA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13545                      :       TAA-T--GA-ACCTA--A--C--AAA--CAA-AGA--C-AA--T------GT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---T-AGCT-GG-AAC--C-----AAA-CAT-AT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---A-T-----T---ATTCT
gi|13537                      :        AA-T--GA-ACTGT--A--C--AGA--CAA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TG-C-----AA-GT-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-GT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----C--AGTTCTT
gi|13539                      :     taaAA-T--AA-GCCAT--A--C--A------A-AGA--C-AT--TA-T--TGT-TA-C-----AA-TC-TT-TGT---C-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-GT-----TCCT----C-A----------T--ATA-ACT--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13536                      :     taaAA-T--AA-CCCTT--G--C--AAA--CAT-ATA--C-AA--TT-C--TGT-TA-C-----AG-GC-TT-TGT---C-AGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13541                      :    taaaAA-T--GA-GCCGT--A--C--A------A-AGA--T-AA--TG-T--TGT-TA-CTG---AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-TAT-AT-----TCAT----C-GGTACCGTAGCT--ATA-GCC--TA---T-C-----T--AACTCTT
gi|13501                      :      taaA-T--GA-GCCTC--C--C--TGA--AAC-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------A--TTA-ACG--TA---T-C-----A--AATTCTT
gi|13479                      :   tggaatt-T--GA-GCCTT--C--C--AAA--CAA-AGA--C-AA--TG-T--TGT-TG-C-----AA-GC-TT-TGC---C-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCTT----T-G----------T--GTA-ACC--TA---TGCACATGT--AATTCTT
gi|13546                      :      tgtgaaaatA-GCCTT--A--C--AGA--CAA-AAA--C-AA--TA-T--TGT-TA-CAAAAAAA-GC-TT-TGT---C-AGCTGGG-AAC--C--AG-AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-
gi|13519                      :                               GA--TAA-AGA--A-AA--TG-T--TGT-TA-C-----AA-TC-TT-TGT---C-AGGT-TG-AAC--C--A--AAC-CAT-AT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ACtct
gi|13548                      :                      tgtaataacatacctA-AGA--C-AA--TA-T--TGT-TA-C-----AA-TA-TT-TGT---C-AGCT-GC-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTTtaatt
gi|13547                      :                                     a-AGA--A-AA--T--T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCGC----C-A----------T--GCA-GCC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13549                      :                                          --C-AT--TG-T--TGT-TA-C-----AA-GC-TT-TGT---C-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-CT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13550                      :                                                                      A-GC-TT-TGT---C-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CAT-AT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT





Alignments
lowQualScore                  :              0    0 00  0     00 0 11 0 00      11 0  0  0 00   0  1 33333    1 000 0    0    0  1   00 11 11   1  0   11111    1111 0 4444444444 00   0   00  000 0 11111 00       
lowQualScore                  :              .    . ..  .     .. . .. . ..      .. .  .  . ..   .  . .....    . ... .    .    .  .   .. .. ..   .  .   .....    .... . .......... ..   .   ..  ... . ..... ..       
lowQualScore                  :              6    5 77  5     77 5 22 9 77      66 5  5  5 77   5  0 44444    4 888 5    5    5  0   77 44 77   0  5   88888    1111 5 0000000000 77   5   77  999 5 44444 88       
consensus                     :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
Reference ( family-265 )      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13468                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG--GC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13469                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13470                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13471                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA--G-T--TGT-CGGC-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-G-C--C--A--ATG-CA-TAT-----TTC-----C-A----------TAAGTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13472                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AGC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13473                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GTCTT--A-C--AGA--CGAAGA--C-AA-TA-T--CGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13474                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCCTT--A-C--TGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--TATTC
gi|13475                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCTTT--A-C--AGA--CAAAGG--C-AA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TTTC-AGAT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13476                      :          TGTA-GTAA-T--GG-ACCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-ATC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCC------------------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13477                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCAT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAA-----TCCT----T-A----------T--GTA-ACA--TA---T-C-----T--AATT
gi|13478                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TA------TCCT----C-A----------T--GT--ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13479                      :                   -T--GA-GCCTT--C-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----T-G----------T--GTA-ACC--TA---TGCACATGT--AATTCTT
gi|13480                      : tgtgaaaatTGTA-ATAA-T--GA-GCC---------ATA--CAAAGA--C-AA-TA-C--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCTCTGAC-A----------G--GTA-ACC--CA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13481                      :          TGTA-GTAA-T--AA-ACCTG--A-C--AGA--CAAATA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AACT-GA-ACC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTC-AAC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13482                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13483                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--TTT-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----
gi|13484                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AA-C-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13485                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GC-TT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13486                      :          TGCA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-G--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AAT
gi|13487                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C------AA-CA-CAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AA
gi|13488                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAAA-C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--CAGA--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13489                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--ATA--CAAAAA--C-AA-TA-T--CGT-TAAC-----AAGCCT---T-TGTC-GGCT-GGGAAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13490                      :          TGTT-GTAA-A--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TAT-CA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACCTGTA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13491                      :          TGTA-ACAA-T--GA-GCGTC--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TA-C-----AAGA-T---G-TGCC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCC
gi|13492                      :          TGTG-ATAA-T--GG-GCCTT--A-C--AGA--AAAAGA--C-AA-TA-T--TAT-TA-C-----AAGC-T---T-TGAC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAC-----TCCT----C-ATGTACAT---T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTTTT
gi|13493                      :          TGTA-GTAA-T--GA-AACTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AATT-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----TAAAACTCTT
gi|13494                      :          TGTG-ATAA-T--GA-ACTTT--A-C--AAA--TAAAGA--C-AA-TA-T--TGC-TA-C-----AAGC-T---T-TTTC-AGCT-GG-AAA--C--A--AAA-CA-AAT-----TCCT----T-A----------T--GCA-ACT--TA---C-C-----T--AATTCT
gi|13495                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--ACA--TAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-TTTGT-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-AAT--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13496                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-CGTT-GGCT-GG-ACC--C--A--AAA-CA-TAA-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13497                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--TA--GA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----TAGC-T---T-TGTC-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---A-C-----A--AATTCTT
gi|13498                      :          TGTA-GTAA-T--GA-ACCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---C-TGTC-AGCA-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTC
gi|13499                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--AGT-TA-C-----AAGC-A---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCCT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTC
gi|13500                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--A------AATA--C-AA-TA-T--TGT-TA---------GC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13501                      :                  A-T--GA-GCCTC--C-C--TGA--AACAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------A--TTA-ACG--TA---T-C-----A--AATTCTT
gi|13502                      :   tggaattTGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--T-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGCTT---T-TTTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13503                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-CT-AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TA-C-----GAGC-T---T-TG-C-ATCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TC
gi|13504                      :          TATA-ATAT-T--GA-GCCTT--T-T--A------AAGA--C-AG-AA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CG-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-A-----T--AATTATT
gi|13505                      :          TGTA-GTAT-T--GA-ACTTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-CGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--AT--TCC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13506                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCTTT--A-T--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-AA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GACT-GG-AAT--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-T----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13507                      :          TGTA-ATAA-T--GT-GCCTT--A-C--AAA---ATAGA--C-AA-TG-C--TGT-TA-C-----AGGA-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAT-CA-TAT-----TCCT----A-C----------T--GTA-ATC--TA---T-A-----T--AATT
gi|13508                      :          TGTA--TAA-T--GAAGCCTT--A-C--AG---CAAAAA--CCAA-TA-T--TGT-TA-C-----CAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AGC--C--A--GAACCA-TAT-----TCCT------A----------T---TACATC--TT---T-C-----T--AATACTT
gi|13509                      :          TGTA-ATAT-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CAATGA--C-TA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAATTA-TATATAACTCCT----C-A----------T--ATA-ACC---A---T-C-----T--ACTTCTT
gi|13510                      :          TATA-GTAACT--GA-GCCTT--A-C--AGA---AAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GGAAAC--C--A--AA---A-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----T--AATTC
gi|13511                      :          TGTA-GTAA-C--GA-GCCTT--G-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TT-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TATC-GACA-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-C----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AGTTC
gi|13512                      :          TGTA-GTAA-TTGAA-GCCTTTTA-A--AGA--CAAAAAACC-AA-TA-T---GTATA-C-----AAGC-T---T-GGTC-AGCT-GG-AACGTC--A--GAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TT---C-T-----T--AATTC
gi|13513                      :          TGTA-GTAA-T--GA---CTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CC----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--TTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13514                      :          TGTT-ATAT-T--AA-GCCTT--A-C--AAA--CAAAGG--C-AG-TG-T--CGT-TG-T-----AAGC-T---A-TGTC-AGCT-GG-AAC--G--A--AAA-CA-TATA----GTCT----C-A----------T--CTA-
gi|13515                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--TAAA-A--C-AA-TATT--TGC-CA-C-----AAGC-T---T-TTTC-GGCA-GG-AAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----G--AATTC
gi|13516                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-A--TGT-TA-C-----AAGT-T---T-TGTC-GGCA-GG-AAC--T--G--TAA-CA-TCT-------GT----C-A----------T--ATA-TAC--TA---T-C-----T--AATTTTT
gi|13517                      :          TGTA-ATAA-A--GT-GTCTC--A-T--CAA--CATAGA--C-AG-TG-T--TGT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTC-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTC
gi|13518                      :          TGTC-ATAA-T--GA-GTCGT--A-CGCATA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TT-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-C---AT-----TCCT----C-A----------T--GCA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13519                      :          TGTA-ATAA-C--AT-ACCT---------GA--TAAAGA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGGT-TG-AAC--C--A--AAC-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-AC
gi|13520                      :          TGTG-ATAA-T--GA-GCCCT--A-C--AAA--CATAGG--T-GA-CA-T--GGC-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--AT-AAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------A--GT--ACC--TG---T-T-----T--AAATCTTtaatt
gi|13521                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGAAACAAAAA--C-TA-TA-T---GT-TG-C-----AAGC-T---T-TGTT-GGCT-GG-AGC--CCAA--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--GACT
gi|13522                      :          TGTAAGTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAAA-C-AAATA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGGC-TGCT-GG-AAC--C--AGGAAC-CATTAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13523                      :          TGTA-GCAA-T--AA-GACGT--A-C--ATA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TTT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-TCCT-GG-AAC--C--A--AAA-TA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13524                      :          TGCA-ATAA-T--TA-GCCTA--A-C--AAA--CGTAGA--C-AA-CA-T--TGT-TA-C-----AAACAT---TGTGTC---CT-GG-AAC--C--A--AAA-CC-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13525                      :          TGTA-GAAT-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-TATTGT-TT-C-----AAGT-T---T-TGTT-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ATT--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13526                      :          TGTA-GTAT-T--GA-GCCTT--A-C--ACA--AAAAGA--C-AA-TA-T--TCT-TG-C-----AAGC-T---T-AGTA-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-G----------T--GTT-CCC--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13527                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT---------A--CAAAGA--C-A------------------------C-T---T-TGTC-AGCT-GG-GAC--G--A--AAA-CA-TAC-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TT---T-T-----T--AATTCTT
gi|13528                      :          TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CA--GA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----TAG--T---T-TGTC-AGAT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---T-C-----A--AATTCTT
gi|13529                      :          TGTA-GATA-T--GA-GCCTT--AAC--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CA----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-C--TAT-----TCCT----C-A----------C--CTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13530                      :          TGTG-ATAA-C--GA-GCCCT--A-C--AAA--CAA-GA--C-AA-TG-T--TGT-TA-CC----AAGC-T---T--GTC-GGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TA------TCCT----C-A----------T--GAA-ACC--TA---T-T-----C--AATACTT
gi|13531                      :          TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--ATT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTCAAACT-GG-GAT--C--A--AAA-CA-TA
gi|13532                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCCGT--A-C--AGA--TAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTC-GGCT-
gi|13533                      :           GTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TC-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-AG-AAT--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ATA--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13534                      :           GTA-ATAC-T--GA-GCCTT----C--AGA--AACAGA--C-AA-TC-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-CGTC-AGCT-GG-
gi|13535                      :            TA-GTAA-T--GA-GCCTT--G-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---A-TGCC-AGCT-GG-GAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTAT----C-A----------T--GTA-AGC--TA---T-G-----C--AATTCTT
gi|13536                      :                 AA-T--AA-CCCTT--G-C--AAA--CATATA--C-AA-TT-C--TGT-TA-C-----AGGC-T---T-TGTC-AGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13537                      :             taaaAA-T--GA-ACTGT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGT-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----C--AGTTCTT
gi|13538                      :         taaTA-GTAA-T--GA-GACTT--A-C--AGA--CAAAAA--G-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13539                      :                 AA-T--AA-GCC---------ATA--CAAAGA--C-AT-TA-T--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--ATA-ACT--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13540                      :         taaTA-GTAA-T--G--GCCTT--A-A--ACA--GAAAGG--C-AA-TA-T--TGT-T--C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AA---A-TAT-----TCCT----CAA----------T--GTA-AAC--TAATGT-C-----T--AATT
gi|13541                      :                 AA-T--GA-GCCGT--A-C--A------AAGA--T-AA-TG-T--TGT-TA-CTG---AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-TA-TAT-----TCAT----C-GGTACCGTAGCT--ATA-GCC--TA---T-C-----T--AACTCTT
gi|13542                      :          taaA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--TAA-----C-AA-TA-T--TGT-TA---------GC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CA-GAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13543                      :            TA-ATAA-T--GA-GCGTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGT-A---T-TGTC-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----G--AATTCTT
gi|13544                      :               aTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13545                      :                TAA-T--GA-ACCTA--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-T------GT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTT-AGCT-GG-AAC--C-----AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---A-T-----T---ATTCT
gi|13546                      :                        A-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CAAAAAAAGC-T---T-TGTC-AGCTGGG-AAC--C--AG-AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-
gi|13547                      :                                              AGA--A-AA-T--T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCGC----C-A----------T--GCA-GCC--TA---T-C-----T--AATTCTTtct
gi|13548                      :                                            AAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AATA-T---T-TGTC-AGCT-GC-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13549                      :                                                 --C-AT-TG-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TCT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13550                      :                                                                            AGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT





Alignments
lowQualScore                  :              0    0 00  0     00 0 11 0 00      11 0  0  0 00   0  1 33333    1 000 0    0    0  1   00 11 11   1  0   11111    1111 0 4444444444 00   0   00  000 0 11111 00       
lowQualScore                  :              .    . ..  .     .. . .. . ..      .. .  .  . ..   .  . .....    . ... .    .    .  .   .. .. ..   .  .   .....    .... . .......... ..   .   ..  ... . ..... ..       
lowQualScore                  :              6    5 77  5     77 5 22 9 77      66 5  5  5 77   5  0 44444    4 888 5    5    5  0   77 44 77   0  5   88888    1111 5 0000000000 77   5   77  999 5 44444 88       
consensus                     :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
Reference ( family-265 )      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13468                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG--GC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13469                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13470                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13471                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA--G-T--TGT-CGGC-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-G-C--C--A--ATG-CA-TAT-----TTC-----C-A----------TAAGTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13472                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AGC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13473                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GTCTT--A-C--AGA--CGAAGA--C-AA-TA-T--CGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13474                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCCTT--A-C--TGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--TATTC
gi|13475                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCTTT--A-C--AGA--CAAAGG--C-AA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TTTC-AGAT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13476                      :          TGTA-GTAA-T--GG-ACCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-ATC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCC------------------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13477                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCAT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAA-----TCCT----T-A----------T--GTA-ACA--TA---T-C-----T--AATT
gi|13478                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TA------TCCT----C-A----------T--GT--ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13479                      :                   -T--GA-GCCTT--C-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----T-G----------T--GTA-ACC--TA---TGCACATGT--AATTCTT
gi|13480                      : tgtgaaaatTGTA-ATAA-T--GA-GCC---------ATA--CAAAGA--C-AA-TA-C--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCTCTGAC-A----------G--GTA-ACC--CA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13481                      :          TGTA-GTAA-T--AA-ACCTG--A-C--AGA--CAAATA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AACT-GA-ACC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTC-AAC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13482                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13483                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--TTT-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----
gi|13484                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AA-C-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13485                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GC-TT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13486                      :          TGCA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-G--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AAT
gi|13487                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C------AA-CA-CAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AA
gi|13488                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAAA-C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--CAGA--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13489                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--ATA--CAAAAA--C-AA-TA-T--CGT-TAAC-----AAGCCT---T-TGTC-GGCT-GGGAAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13490                      :          TGTT-GTAA-A--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TAT-CA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACCTGTA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13491                      :          TGTA-ACAA-T--GA-GCGTC--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TA-C-----AAGA-T---G-TGCC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCC
gi|13492                      :          TGTG-ATAA-T--GG-GCCTT--A-C--AGA--AAAAGA--C-AA-TA-T--TAT-TA-C-----AAGC-T---T-TGAC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAC-----TCCT----C-ATGTACAT---T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTTTT
gi|13493                      :          TGTA-GTAA-T--GA-AACTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AATT-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----TAAAACTCTT
gi|13494                      :          TGTG-ATAA-T--GA-ACTTT--A-C--AAA--TAAAGA--C-AA-TA-T--TGC-TA-C-----AAGC-T---T-TTTC-AGCT-GG-AAA--C--A--AAA-CA-AAT-----TCCT----T-A----------T--GCA-ACT--TA---C-C-----T--AATTCT
gi|13495                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--ACA--TAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-TTTGT-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-AAT--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13496                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-CGTT-GGCT-GG-ACC--C--A--AAA-CA-TAA-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13497                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--TA--GA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----TAGC-T---T-TGTC-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---A-C-----A--AATTCTT
gi|13498                      :          TGTA-GTAA-T--GA-ACCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---C-TGTC-AGCA-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTC
gi|13499                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--AGT-TA-C-----AAGC-A---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCCT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTC
gi|13500                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--A------AATA--C-AA-TA-T--TGT-TA---------GC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13501                      :                  A-T--GA-GCCTC--C-C--TGA--AACAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------A--TTA-ACG--TA---T-C-----A--AATTCTT
gi|13502                      :   tggaattTGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--T-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGCTT---T-TTTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13503                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-CT-AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TA-C-----GAGC-T---T-TG-C-ATCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TC
gi|13504                      :          TATA-ATAT-T--GA-GCCTT--T-T--A------AAGA--C-AG-AA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CG-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-A-----T--AATTATT
gi|13505                      :          TGTA-GTAT-T--GA-ACTTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-CGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--AT--TCC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13506                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCTTT--A-T--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-AA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GACT-GG-AAT--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-T----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13507                      :          TGTA-ATAA-T--GT-GCCTT--A-C--AAA---ATAGA--C-AA-TG-C--TGT-TA-C-----AGGA-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAT-CA-TAT-----TCCT----A-C----------T--GTA-ATC--TA---T-A-----T--AATT
gi|13508                      :          TGTA--TAA-T--GAAGCCTT--A-C--AG---CAAAAA--CCAA-TA-T--TGT-TA-C-----CAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AGC--C--A--GAACCA-TAT-----TCCT------A----------T---TACATC--TT---T-C-----T--AATACTT
gi|13509                      :          TGTA-ATAT-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CAATGA--C-TA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAATTA-TATATAACTCCT----C-A----------T--ATA-ACC---A---T-C-----T--ACTTCTT
gi|13510                      :          TATA-GTAACT--GA-GCCTT--A-C--AGA---AAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GGAAAC--C--A--AA---A-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----T--AATTC
gi|13511                      :          TGTA-GTAA-C--GA-GCCTT--G-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TT-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TATC-GACA-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-C----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AGTTC
gi|13512                      :          TGTA-GTAA-TTGAA-GCCTTTTA-A--AGA--CAAAAAACC-AA-TA-T---GTATA-C-----AAGC-T---T-GGTC-AGCT-GG-AACGTC--A--GAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TT---C-T-----T--AATTC
gi|13513                      :          TGTA-GTAA-T--GA---CTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CC----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--TTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13514                      :          TGTT-ATAT-T--AA-GCCTT--A-C--AAA--CAAAGG--C-AG-TG-T--CGT-TG-T-----AAGC-T---A-TGTC-AGCT-GG-AAC--G--A--AAA-CA-TATA----GTCT----C-A----------T--CTA-
gi|13515                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--TAAA-A--C-AA-TATT--TGC-CA-C-----AAGC-T---T-TTTC-GGCA-GG-AAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----G--AATTC
gi|13516                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-A--TGT-TA-C-----AAGT-T---T-TGTC-GGCA-GG-AAC--T--G--TAA-CA-TCT-------GT----C-A----------T--ATA-TAC--TA---T-C-----T--AATTTTT
gi|13517                      :          TGTA-ATAA-A--GT-GTCTC--A-T--CAA--CATAGA--C-AG-TG-T--TGT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTC-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTC
gi|13518                      :          TGTC-ATAA-T--GA-GTCGT--A-CGCATA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TT-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-C---AT-----TCCT----C-A----------T--GCA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13519                      :          TGTA-ATAA-C--AT-ACCT---------GA--TAAAGA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGGT-TG-AAC--C--A--AAC-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-AC
gi|13520                      :          TGTG-ATAA-T--GA-GCCCT--A-C--AAA--CATAGG--T-GA-CA-T--GGC-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--AT-AAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------A--GT--ACC--TG---T-T-----T--AAATCTTtaatt
gi|13521                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGAAACAAAAA--C-TA-TA-T---GT-TG-C-----AAGC-T---T-TGTT-GGCT-GG-AGC--CCAA--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--GACT
gi|13522                      :          TGTAAGTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAAA-C-AAATA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGGC-TGCT-GG-AAC--C--AGGAAC-CATTAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13523                      :          TGTA-GCAA-T--AA-GACGT--A-C--ATA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TTT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-TCCT-GG-AAC--C--A--AAA-TA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13524                      :          TGCA-ATAA-T--TA-GCCTA--A-C--AAA--CGTAGA--C-AA-CA-T--TGT-TA-C-----AAACAT---TGTGTC---CT-GG-AAC--C--A--AAA-CC-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13525                      :          TGTA-GAAT-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-TATTGT-TT-C-----AAGT-T---T-TGTT-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ATT--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13526                      :          TGTA-GTAT-T--GA-GCCTT--A-C--ACA--AAAAGA--C-AA-TA-T--TCT-TG-C-----AAGC-T---T-AGTA-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-G----------T--GTT-CCC--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13527                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT---------A--CAAAGA--C-A------------------------C-T---T-TGTC-AGCT-GG-GAC--G--A--AAA-CA-TAC-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TT---T-T-----T--AATTCTT
gi|13528                      :          TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CA--GA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----TAG--T---T-TGTC-AGAT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---T-C-----A--AATTCTT
gi|13529                      :          TGTA-GATA-T--GA-GCCTT--AAC--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CA----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-C--TAT-----TCCT----C-A----------C--CTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13530                      :          TGTG-ATAA-C--GA-GCCCT--A-C--AAA--CAA-GA--C-AA-TG-T--TGT-TA-CC----AAGC-T---T--GTC-GGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TA------TCCT----C-A----------T--GAA-ACC--TA---T-T-----C--AATACTT
gi|13531                      :          TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--ATT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTCAAACT-GG-GAT--C--A--AAA-CA-TA
gi|13532                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCCGT--A-C--AGA--TAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTC-GGCT-
gi|13533                      :           GTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TC-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-AG-AAT--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ATA--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13534                      :           GTA-ATAC-T--GA-GCCTT----C--AGA--AACAGA--C-AA-TC-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-CGTC-AGCT-GG-
gi|13535                      :            TA-GTAA-T--GA-GCCTT--G-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---A-TGCC-AGCT-GG-GAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTAT----C-A----------T--GTA-AGC--TA---T-G-----C--AATTCTT
gi|13536                      :                 AA-T--AA-CCCTT--G-C--AAA--CATATA--C-AA-TT-C--TGT-TA-C-----AGGC-T---T-TGTC-AGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13537                      :             taaaAA-T--GA-ACTGT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGT-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----C--AGTTCTT
gi|13538                      :         taaTA-GTAA-T--GA-GACTT--A-C--AGA--CAAAAA--G-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13539                      :                 AA-T--AA-GCC---------ATA--CAAAGA--C-AT-TA-T--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--ATA-ACT--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13540                      :         taaTA-GTAA-T--G--GCCTT--A-A--ACA--GAAAGG--C-AA-TA-T--TGT-T--C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AA---A-TAT-----TCCT----CAA----------T--GTA-AAC--TAATGT-C-----T--AATT
gi|13541                      :                 AA-T--GA-GCCGT--A-C--A------AAGA--T-AA-TG-T--TGT-TA-CTG---AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-TA-TAT-----TCAT----C-GGTACCGTAGCT--ATA-GCC--TA---T-C-----T--AACTCTT
gi|13542                      :          taaA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--TAA-----C-AA-TA-T--TGT-TA---------GC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CA-GAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13543                      :            TA-ATAA-T--GA-GCGTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGT-A---T-TGTC-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----G--AATTCTT
gi|13544                      :               aTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13545                      :                TAA-T--GA-ACCTA--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-T------GT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTT-AGCT-GG-AAC--C-----AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---A-T-----T---ATTCT
gi|13546                      :                        A-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CAAAAAAAGC-T---T-TGTC-AGCTGGG-AAC--C--AG-AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-
gi|13547                      :                                              AGA--A-AA-T--T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCGC----C-A----------T--GCA-GCC--TA---T-C-----T--AATTCTTtct
gi|13548                      :                                            AAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AATA-T---T-TGTC-AGCT-GC-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13549                      :                                                 --C-AT-TG-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TCT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13550                      :                                                                            AGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT


blockSeqs                     :                                    GC           AC                   AAAAA    C                         AG GG          ATAAC    CTGA   GTACCGTAGC                    ACATG
blockSeqs                     :                                    T            A                    TG       T                         CA T           A        .      TGTACAT                       .    
blockSeqs                     :                                    .            A                    C        A                         .  G           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    A        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    C        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                             .    
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                                  
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                                  
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .        .      .                                  
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .                                                  
blockSeqs                     :                                    .            .                    .        .                         .  .           .                                                  
blockSeqs                     :                                                 .                    .        .                         .  .           .                                                  
blockSeqs                     :                                                 .                    .        .                         .  .                                                              
blockSeqs                     :                                                 .                    .        .                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                               .                                                                                           


blockSeqCons                  :          
originalCons                  :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
finalCons                     :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT





Alignments
lowQualScore                  :              0    0 00  0     00 0 11 0 00      11 0  0  0 00   0  1 33333    1 000 0    0    0  1   00 11 11   1  0   11111    1111 0 4444444444 00   0   00  000 0 11111 00       
lowQualScore                  :              .    . ..  .     .. . .. . ..      .. .  .  . ..   .  . .....    . ... .    .    .  .   .. .. ..   .  .   .....    .... . .......... ..   .   ..  ... . ..... ..       
lowQualScore                  :              6    5 77  5     77 5 22 9 77      66 5  5  5 77   5  0 44444    4 888 5    5    5  0   77 44 77   0  5   88888    1111 5 0000000000 77   5   77  999 5 44444 88       
consensus                     :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
Reference ( family-265 )      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13468                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG--GC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13469                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13470                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA-TG-T--TGT-CG-C-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-GCC--C--A--ATG-CA-TAT-----TCCA----T-A----------A--GTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13471                      :          TGTA-ATAA-T--AA-GCCTT--T-C--AAA--GAAAGT--C-AA--G-T--TGT-CGGC-----AAAC-T---T-TGCC-AGCT-GG-G-C--C--A--ATG-CA-TAT-----TTC-----C-A----------TAAGTC-ATC--TA---C-C-----T--AATTCTT
gi|13472                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AGC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13473                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GTCTT--A-C--AGA--CGAAGA--C-AA-TA-T--CGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13474                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCCTT--A-C--TGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--TATTC
gi|13475                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCTTT--A-C--AGA--CAAAGG--C-AA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TTTC-AGAT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13476                      :          TGTA-GTAA-T--GG-ACCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-ATC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCC------------------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13477                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCAT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAA-----TCCT----T-A----------T--GTA-ACA--TA---T-C-----T--AATT
gi|13478                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TA------TCCT----C-A----------T--GT--ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13479                      :                   -T--GA-GCCTT--C-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----T-G----------T--GTA-ACC--TA---TGCACATGT--AATTCTT
gi|13480                      : tgtgaaaatTGTA-ATAA-T--GA-GCC---------ATA--CAAAGA--C-AA-TA-C--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCTCTGAC-A----------G--GTA-ACC--CA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13481                      :          TGTA-GTAA-T--AA-ACCTG--A-C--AGA--CAAATA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AACT-GA-ACC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTC-AAC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13482                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13483                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--TTT-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----
gi|13484                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AA-C-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13485                      :          TGAA-ATAA-T--GA-GC-TT--A-C--AGA--CTAAGA--C-AA-TA-T--T-T-CA-C-----AAGC-T---T-TGCC-AGCT-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------A--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTTTT
gi|13486                      :          TGCA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-G--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AAT
gi|13487                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C------AA-CA-CAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AA
gi|13488                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAAA-C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--CAGA--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13489                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--ATA--CAAAAA--C-AA-TA-T--CGT-TAAC-----AAGCCT---T-TGTC-GGCT-GGGAAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13490                      :          TGTT-GTAA-A--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TAT-CA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACCTGTA---T-C-----T--TATTCTT
gi|13491                      :          TGTA-ACAA-T--GA-GCGTC--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TA-C-----AAGA-T---G-TGCC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCC
gi|13492                      :          TGTG-ATAA-T--GG-GCCTT--A-C--AGA--AAAAGA--C-AA-TA-T--TAT-TA-C-----AAGC-T---T-TGAC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAC-----TCCT----C-ATGTACAT---T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTTTT
gi|13493                      :          TGTA-GTAA-T--GA-AACTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AATT-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----TAAAACTCTT
gi|13494                      :          TGTG-ATAA-T--GA-ACTTT--A-C--AAA--TAAAGA--C-AA-TA-T--TGC-TA-C-----AAGC-T---T-TTTC-AGCT-GG-AAA--C--A--AAA-CA-AAT-----TCCT----T-A----------T--GCA-ACT--TA---C-C-----T--AATTCT
gi|13495                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--ACA--TAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-TTTGT-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-AAT--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13496                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-CGTT-GGCT-GG-ACC--C--A--AAA-CA-TAA-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TG---T-C-----T--AATTC
gi|13497                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--TA--GA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----TAGC-T---T-TGTC-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---A-C-----A--AATTCTT
gi|13498                      :          TGTA-GTAA-T--GA-ACCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---C-TGTC-AGCA-AG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTC
gi|13499                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--AGT-TA-C-----AAGC-A---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCCT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----G--AATTC
gi|13500                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--A------AATA--C-AA-TA-T--TGT-TA---------GC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13501                      :                  A-T--GA-GCCTC--C-C--TGA--AACAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------A--TTA-ACG--TA---T-C-----A--AATTCTT
gi|13502                      :   tggaattTGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--T-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGCTT---T-TTTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13503                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-CT-AAA--CAAAGA--C-AA-TG-T--TGT-TA-C-----GAGC-T---T-TG-C-ATCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TC
gi|13504                      :          TATA-ATAT-T--GA-GCCTT--T-T--A------AAGA--C-AG-AA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAA-CG-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-A-----T--AATTATT
gi|13505                      :          TGTA-GTAT-T--GA-ACTTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-CGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--AT--TCC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13506                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCTTT--A-T--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-AA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GACT-GG-AAT--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-T----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13507                      :          TGTA-ATAA-T--GT-GCCTT--A-C--AAA---ATAGA--C-AA-TG-C--TGT-TA-C-----AGGA-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAT--C--A--AAT-CA-TAT-----TCCT----A-C----------T--GTA-ATC--TA---T-A-----T--AATT
gi|13508                      :          TGTA--TAA-T--GAAGCCTT--A-C--AG---CAAAAA--CCAA-TA-T--TGT-TA-C-----CAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AGC--C--A--GAACCA-TAT-----TCCT------A----------T---TACATC--TT---T-C-----T--AATACTT
gi|13509                      :          TGTA-ATAT-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CAATGA--C-TA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAATTA-TATATAACTCCT----C-A----------T--ATA-ACC---A---T-C-----T--ACTTCTT
gi|13510                      :          TATA-GTAACT--GA-GCCTT--A-C--AGA---AAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GGAAAC--C--A--AA---A-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----T--AATTC
gi|13511                      :          TGTA-GTAA-C--GA-GCCTT--G-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TT-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TATC-GACA-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-C----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AGTTC
gi|13512                      :          TGTA-GTAA-TTGAA-GCCTTTTA-A--AGA--CAAAAAACC-AA-TA-T---GTATA-C-----AAGC-T---T-GGTC-AGCT-GG-AACGTC--A--GAA-CA-TAT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TT---C-T-----T--AATTC
gi|13513                      :          TGTA-GTAA-T--GA---CTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CC----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--TTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13514                      :          TGTT-ATAT-T--AA-GCCTT--A-C--AAA--CAAAGG--C-AG-TG-T--CGT-TG-T-----AAGC-T---A-TGTC-AGCT-GG-AAC--G--A--AAA-CA-TATA----GTCT----C-A----------T--CTA-
gi|13515                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--TAAA-A--C-AA-TATT--TGC-CA-C-----AAGC-T---T-TTTC-GGCA-GG-AAC--C--A--AAG-CA-TAT-----TCTT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-G-----G--AATTC
gi|13516                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-TG-A--TGT-TA-C-----AAGT-T---T-TGTC-GGCA-GG-AAC--T--G--TAA-CA-TCT-------GT----C-A----------T--ATA-TAC--TA---T-C-----T--AATTTTT
gi|13517                      :          TGTA-ATAA-A--GT-GTCTC--A-T--CAA--CATAGA--C-AG-TG-T--TGT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTC-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTC
gi|13518                      :          TGTC-ATAA-T--GA-GTCGT--A-CGCATA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TT-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-C---AT-----TCCT----C-A----------T--GCA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13519                      :          TGTA-ATAA-C--AT-ACCT---------GA--TAAAGA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGGT-TG-AAC--C--A--AAC-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-AC
gi|13520                      :          TGTG-ATAA-T--GA-GCCCT--A-C--AAA--CATAGG--T-GA-CA-T--GGC-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--AT-AAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------A--GT--ACC--TG---T-T-----T--AAATCTTtaatt
gi|13521                      :          TGTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGAAACAAAAA--C-TA-TA-T---GT-TG-C-----AAGC-T---T-TGTT-GGCT-GG-AGC--CCAA--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--GACT
gi|13522                      :          TGTAAGTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAAA-C-AAATA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGGC-TGCT-GG-AAC--C--AGGAAC-CATTAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13523                      :          TGTA-GCAA-T--AA-GACGT--A-C--ATA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TTT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-TCCT-GG-AAC--C--A--AAA-TA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13524                      :          TGCA-ATAA-T--TA-GCCTA--A-C--AAA--CGTAGA--C-AA-CA-T--TGT-TA-C-----AAACAT---TGTGTC---CT-GG-AAC--C--A--AAA-CC-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--CA---T-C-----T--AATTCT
gi|13525                      :          TGTA-GAAT-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-TATTGT-TT-C-----AAGT-T---T-TGTT-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTG-ATT--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13526                      :          TGTA-GTAT-T--GA-GCCTT--A-C--ACA--AAAAGA--C-AA-TA-T--TCT-TG-C-----AAGC-T---T-AGTA-AGAT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-G----------T--GTT-CCC--TA---T-A-----T--AATTC
gi|13527                      :          TGTA-ATAA-T--GA-GCCTT---------A--CAAAGA--C-A------------------------C-T---T-TGTC-AGCT-GG-GAC--G--A--AAA-CA-TAC-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TT---T-T-----T--AATTCTT
gi|13528                      :          TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--CA--GA--A-AA-TG-T--TGT-TA-C-----TAG--T---T-TGTC-AGAT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----T-G----------T--GTA-ACC--TT---T-C-----A--AATTCTT
gi|13529                      :          TGTA-GATA-T--GA-GCCTT--AAC--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CA----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--GAA-C--TAT-----TCCT----C-A----------C--CTA-ACT--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13530                      :          TGTG-ATAA-C--GA-GCCCT--A-C--AAA--CAA-GA--C-AA-TG-T--TGT-TA-CC----AAGC-T---T--GTC-GGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TA------TCCT----C-A----------T--GAA-ACC--TA---T-T-----C--AATACTT
gi|13531                      :          TGTA-ATTA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--ATT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTCAAACT-GG-GAT--C--A--AAA-CA-TA
gi|13532                      :          TGTA-GTAA-T--AA-GCCGT--A-C--AGA--TAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAAC-T---T-TGTC-GGCT-
gi|13533                      :           GTA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TC-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-AG-AAT--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ATA--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13534                      :           GTA-ATAC-T--GA-GCCTT----C--AGA--AACAGA--C-AA-TC-T--TGT-TG-C-----AAGC-T---T-CGTC-AGCT-GG-
gi|13535                      :            TA-GTAA-T--GA-GCCTT--G-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---A-TGCC-AGCT-GG-GAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTAT----C-A----------T--GTA-AGC--TA---T-G-----C--AATTCTT
gi|13536                      :                 AA-T--AA-CCCTT--G-C--AAA--CATATA--C-AA-TT-C--TGT-TA-C-----AGGC-T---T-TGTC-AGCT-GA-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13537                      :             taaaAA-T--GA-ACTGT--A-C--AGA--CAAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TG-C-----AAGT-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----C--AGTTCTT
gi|13538                      :         taaTA-GTAA-T--GA-GACTT--A-C--AGA--CAAAAA--G-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCTT----C-G----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATT
gi|13539                      :                 AA-T--AA-GCC---------ATA--CAAAGA--C-AT-TA-T--TGT-TA-C-----AATC-T---T-TGTC-AGCC-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TGT-----TCCT----C-A----------T--ATA-ACT--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13540                      :         taaTA-GTAA-T--G--GCCTT--A-A--ACA--GAAAGG--C-AA-TA-T--TGT-T--C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AA---A-TAT-----TCCT----CAA----------T--GTA-AAC--TAATGT-C-----T--AATT
gi|13541                      :                 AA-T--GA-GCCGT--A-C--A------AAGA--T-AA-TG-T--TGT-TA-CTG---AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-TA-TAT-----TCAT----C-GGTACCGTAGCT--ATA-GCC--TA---T-C-----T--AACTCTT
gi|13542                      :          taaA-GTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AAA--TAA-----C-AA-TA-T--TGT-TA---------GC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--TAA-CA-GAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13543                      :            TA-ATAA-T--GA-GCGTT--A-C--A------AAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGT-A---T-TGTC-AACT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----G--AATTCTT
gi|13544                      :               aTAA-T--GA-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-GGCT-GG-AAC--C--A--GAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTC
gi|13545                      :                TAA-T--GA-ACCTA--A-C--AAA--CAAAGA--C-AA-T------GT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTT-AGCT-GG-AAC--C-----AAA-CA-TAT-----TCCT----A-A----------T--GTA-ATC--TA---A-T-----T---ATTCT
gi|13546                      :                        A-GCCTT--A-C--AGA--CAAAAA--C-AA-TA-T--TGT-TA-CAAAAAAAGC-T---T-TGTC-AGCTGGG-AAC--C--AG-AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-
gi|13547                      :                                              AGA--A-AA-T--T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCGC----C-A----------T--GCA-GCC--TA---T-C-----T--AATTCTTtct
gi|13548                      :                                            AAAGA--C-AA-TA-T--TGT-TA-C-----AATA-T---T-TGTC-AGCT-GC-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TTCT----C-A----------T--GTA-ATC--TA---T-C-----T--AATTCTT
gi|13549                      :                                                 --C-AT-TG-T--TGT-TA-C-----AAGC-T---T-TGTC-AGTT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TCT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-T-----T--AATTCTT
gi|13550                      :                                                                            AGC-T---T-TGTC-AGCT-GG-AAC--C--A--AAA-CA-TAT-----TCCT----C-A----------T--GTA-ACC--TA---T-C-----T--AATTCTT