lowQualScore                  :                                                                                                                            1111                                                                                                                                                  2222                   11        
lowQualScore                  :                                                         0 3 0       000 111 111111  11 0  11111111 00   111111 11111 00 1  3333 666666666666666 2222 11111 111  3333 3333 7777 0 0 111111 00 4444444444444444444444 222222 00  0   1111 55555555555555555 444   0 888  8888888 2 9999 0 00    1111111 0 66        
lowQualScore                  :                                                         . . .       ... ... ......  .. .  ........ ..   ...... ..... .. .  .... ............... .... ..... ...  .... .... .... . . ...... .. ...................... ...... ..  .   .... ................. ...   . ...  ....... . .... . ..    ....... . ..        
lowQualScore                  :                                                         6 9 5       999 999 888888  00 4  55555555 66   666666 00000 66 4  0000 111111111111111 0000 77777 333  0000 6666 9999 5 9 888888 66 0000000000000000000000 222222 66  5   0000 55555555555555555 555   5 444  6666666 1 0000 5 77    8888888 6 55        
consensus                     :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
Reference ( gi|78574 )        :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-T--A-C--CTGA-------G-CA-GTACTGTA
gi|78575                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GAACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----A--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGG-------G-CT-GTACGGTA
gi|78572                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GA-T---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AC---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-TTACTGTA
gi|78579                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------A-----C---C------A--GT-GAG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CC-ACACTGCA
gi|78573                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GA-C---------G-----C---C------G--GT-GGA----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GCACTGTA
gi|78580                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A----------------------------------C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---GC--T-C-T--A-C--CTGA-------G-TT-GTACTGT
gi|78578                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C----AA----A---------------A----A-----T---TG----C----C----C-A-C------A--G--G---------G-----C---C------A--GT--GG----C---------------------AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78576                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACGTT---T---A------AA--T-GC--------T--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----T-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GA-G---------G-----G---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-C---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------A-CT-GTACTGTA
gi|78577                      :                                               ACCATGTTCA-A-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------C--AA-C---------A-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-TC-A-C--CTGA-------G-CT-GTATTATA
gi|78581                      :                                               ACTGTGTTCA----------TT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----C---AG----C----T----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------A-CT-GTACTGTA
gi|78582                      :                                               ATTATGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A----------------------------------C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TGC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78583                      :                                               ACTGTGTACA-G-T-GAATATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A----------------------------------C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGT
gi|78588                      :                                               ACTGTGCTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----G-----T---GG----C----C----A-A-C------A--GT-G---------G-----C---A------A--GT-GGG----C-----------------A---AA--A---AA---A---T-T-TCCA-C--CTAA-------A-CT-GAACTGTA
gi|78587                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAT------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GA-C---------A-----C---C------A--GT-GGA----A-----------------A---AAT-T---AA-------T-T-T----C--TTGT-------G-CT-GTACT
gi|78585                      :                                               ACTGTGTCCA-G-T-GAATATT---T---A------AA--T-GC--------C--TGC------T-----G--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----G----A----C-T-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--TT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTATA
gi|78592                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATTAATT---A------AAA-T-TC--------C--CAC------C-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-T-C------C--AT-G---------G-----C---C------A--AT-GGG----T-----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-CA-A-C--TTCA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78584                      :                                               ACCGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----C----C----C-A----------------------------------C------A--GT-GGG----C-----------------A---TAT-T---GA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGCA
gi|78591                      :                                               ACTGTGTTTA-G-T-TTACATT---T---ATA----AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AT----A---------------A----A-----T----G----C----C----C-A-CTCTAAAA--AT-G---------G-----CCCAC------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78594                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--C-C------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C-----------------------C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-
gi|78597                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C----AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--AT-G---------G-----C---T------A------------------------------------T-T------------T-C-C--A-C--CTGA-------G-CC-GTACTGTAccaccaggagcctgt
gi|78598                      :                                               ACTGTGT-CA-G-T-GGACATT-------A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T----G----T----T----C-A-C------A--TT-G---------G-----C---C------A--GT-GGC----CA----------------A---AAT-T---AA---G---TGT-C--A-C--CT---------G-C--TTACTGTA
gi|78586                      :                                               ACTGTGGGCA-G-T-GGACATT---T---A------TA--T-GT--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------G----C-----TAGAGG----C----C----T-A-C------A--GA-C---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-ATACTCTA
gi|78590                      :                                               ACTGTGTTCC-A-T-CAACGTT---T---A------AA--T-GC--------C--TGA------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C------A--GG-C---------G-----C---C------A--GT-GGA----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-T--CTGA-------G-CT-GTAATGTA
gi|78601                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---TTTAA------AA--T-TC--------C--CAC------T-----T--T-AA----A---------------A----AA----T---GA----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------G--TT-GGG----C-----------------A---AAT-G---AA---G---
gi|78595                      :                                               ACTGTGTTCT-G-T-GGACATT---G---A------AA--T-GC--------C--CAT------T-----T--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----T----C----C-A-CC-----A--AT-G---------------T---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-T-TCCA-T--CTGA-------A-C
gi|78593                      :                                               ACTGTGTTCA-A-T-GGGCAGT---C---T------AG--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----CAA-C------A--AT-----------G-----C---C------A--TT-GGG----C-----------------A---AAT-C---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CC-ATACTtaactata
gi|78596                      :                                               ATTGTGTTCC-G-T-GAACATT---G---A------AA--T-TC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T----G----T----T----A-A-C------A--GG-C---------C-----C---C------A--GT-GCG----C-----------------A---AAT-T---AA---A---T-TCT--A-C--CTAA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78600                      :                                               ACTGTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--A-AC--------C--CAC------T-----C--A-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--AT-G
gi|78599                      :                                               ACTGTGTTCC-A-T-GGACATT---TTAAA------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T-AA----A---------------T----A-----T---AG----C------------------------------------------C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA-------T-T-T--C-CAACTGA-------G-CC-ATACGGTA
gi|78602                      :                                               ACTCTGTTCAAG-T-GGACCTA---T---A------AA--G-GC--------C---AC------T-----C--TAAA----A---------------A----A-----T---GT----T----C--------C------A--GT-G---------G-----C---A------C--GT-GGG----CCAACTTTATGTTCACTGG---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78603                      :                                               ACTGTGTTCC-A-T-GGATATT---T---G------AA--T-GT--------A--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----T----C-A-C----------------------------C---A------A--GT-GTG----C-----------------A---AAT-C---A
gi|78604                      :                                               ACTGCGTTCT-G-T-GTACATT---T---A------AAATTAGC--------TTACAC------T-----G--C-AA----A---------------G----A-----T---G------------------------------------------------C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--ACC--CTAA-------G-CGTGTAC
gi|78605                      :                                                CTGTGTTT----T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CCT------T-----C--T-AG----A---------------AT---A-----T---AG---------C----T-A-C------A--GT-C---------A-----C---C------A--G--AGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------
gi|78608                      :                                                 TGTGTTCA-G-T-GGACATT---C---C------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGA----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-TC-A-T--ATGA-------A-CT-GCACTGTA
gi|78606                      :                                                 TGTGTTAG-A-T-GGACATT---T---A------AA--C-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-A------A--GA-C---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-T-TC-A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78607                      :                                                 TATGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--TAAA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A----------------------------------C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TGC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78589                      :                                                  GTGT-CA-G-T-GTTCATT---T---A------AA--T-GC--------C--CGC------T-----C--T-AA----A---------------A----T-----A---GG----C----C----C-A-C------A--GA-G---------G-----A---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-A---AA---G---TCC-C--A-A--CTGA-------G-CT-GTACTG
gi|78612                      :                                              accacTGTTCA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-AC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-T------A--TT-G---------G-----G---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------
gi|78610                      :                                                   TGTTCA-G-T-GGACATC---T---A------AA--T-GC--------C---AC------T-----T--T-AA----T---------------A----------T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----T---C------A--GT-GGA----C-----------------A---TAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CA-ATACTGTAcctgtgtacatgta
gi|78613                      :                                                  aTGTTTA-G-T-GAACATT---G---A------AT--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----AT--------------AT---A-----T---AG----C----C----C-A-C------A--AA-T---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-C---AA---T---T-TCT--A-C--CTGA-------G-CA-GTACTGTA
gi|78614                      :                                                   TGTTCA-G-T-GGACATT---T---ACATGTAAA--T-GC--------C--CTC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-C------A--GT-G---------T-----C---C------A--AT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---TCC-C--A-C--CTG
gi|78615                      :                                                   TGTTCG-G-T-GGACAGT---T---A------TG--T-CC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AT----C----C----C-A----------------------------------C------A--AT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GT
gi|78616                      :                                                   TGTTCT-A-T-GGGCATT---A---A------AA--T-GC--------C--CAT------T-----T--T-TA----A---------------A----G-----T---AG----C----C----C-A-C------A--GA-T---------G-----C---C------A--
gi|78627                      :                                                    GCTCA-GGT-GGATACT---T---G------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T-
gi|78638                      : taaatgcccactccaaatgaccactgattccaagtggccggcccacagtggGCTCA-GGT-AGATTTT---T---G------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T--------------------------------------------C----C----C---C------A--GTGG---------G-----C---C------A--GT-tgtactgta
gi|78622                      :                           aaatgcccactgtgaattccaagtgGCTCA-GGT-GGATTTT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T-tgtactgta
gi|78645                      :  gtaaacactccaaatgcccactgtaattccaaatgacctacccacagtggGCTCA-GGT-GGATATT---T---G------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T-------------------------------------------------C----C-A-C------T--GTGG---------G-----C---C------A--Gtgccctgt
gi|78642                      :                            aatgcccactgtgattccaattggGCTCA-GGT-GGATTTC---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-------------------------------------------------C----C-A-C------T--GT-G---------GA----C---C------G--GT-tgtactgta
gi|78619                      :                            aaatgcccaccgttattccaagtgGCTCA-GGT-GGATTTT---T---G------AA--T-GC--------C--CAC------TTTCCAC--T-GA----G---------------G----G-----C---CG----T----C----C-A-C---------TT-G---------GAAT--CA--C------A--GT-GGG----C-----------------AT--AAT-tgtactgta
gi|78628                      :                                              aatggcGCTCA-GGT-GGATCTT---T---G------AA--T-GG--------C--CAC------T-----T-----A----G---------------A----A-----T-------------------C-A-C------A--GT-G---------G-----G---CATTTTGA--GT-GGA----C-----------------A---tgtactgta
gi|78578                      :                                                 taaaTTGA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----tgtactgta
gi|78597                      :                                            actgtgttcTTGA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----aaattgcccacagggccagtggcaattaagttccacctgagctgtactgta
gi|78609                      :                                            actgtgttcTTCA-G-T-GGTCATT---T---G------AA--T-AA--------C--CGT------T-----C--T-AA----A---------------A----------T---GT----C----G----T-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGG----T-----------------A---AAG-T---AA---G---T-TCT--A-T--TTGA-------G-CT-GTACTGTaaatggcccacaatggctatttccacctgagccgtactgta
gi|78618                      :                                                  tacaTCT-G-T-TGGCATT---T---T------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AG----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-ATC------A--GT-----------G-----C---C------A--GT--TG----C-----------------A---AAT-T---AT---T---T-T-TCCA-C--CTGA-------GTTA-ATACTGTA
gi|78617                      :                                                      TCA-G-T-GGACATT---T---A------AT--T-GA--------C--CAC------T-----A--T-AA----A---------------A----T-----T---GA----C----C----C-A-C------ACGGT-----------G-----C---C------A--GT-AGG----CCA---------------A---AAA-T---AAT--A---T-TCC--A-C--CTGACAAGCGTG-CT-GCACTGTA
gi|78575                      :                                                        A-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------T--CAC------T-----
gi|78572                      :                                               actgtgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ataaaaatggcccacagtggccagtgggcaaattaagttccacctgggctgtacggta
gi|78579                      :                                               actgtgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----ctaaaaatggcccacagatgccagtgggcaaattacgttccacctgagctttactgta
gi|78573                      :                                               actgtgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ttaaaaatggcccacagtgaccagtgagcaaattaagttccacctgagccacactgca
gi|78580                      :                                               actgtgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaaatggcccacagacgccggtggacaaattaatttccacctgagctgcactgta
gi|78577                      :                                               actgtgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CA-------------T--T-GA----A---------------C----A-----T---GG----ctaaaaatggcccacagtgggcaaattaagctctacctgagttgtactgt
gi|78606                      :                                                       aA-G-T-GGGCGTT---T---A------AA--T-GT--------C--CA-------T-----C--T-AA----ctaaaaatggcccaccaacaccagtgggcaaattaagtttcacctgagctgtattata
gi|78612                      :                                                    tgtgA-G-T-GGGTATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaaatggcccaaagacgccagtgggcaaattaattttcacctgagctgtactgta
gi|78582                      :                                                   tgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaaatggcccatattgggcagtgggcaaattaagttccacctgacctgtgtacatgta
gi|78588                      :                                               attatgttcA-G-T-GGACATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaaatggcctacagtgggcaaattaatttgcacctgagctgtactgta
gi|78587                      :                                               actgtgctcA-A-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaagtggccaacagtggcaagtgggcaaaaaaatttccacctaaactgaactgta
gi|78607                      :                                               actgtgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaaatggcccacagacaccagtggaaaaattaatttcttgtgctgtact
gi|78584                      :                                                 tatgttcA-G-T-GGGCATT---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----ctaaaaaatggcctacagtgggcaaattaatttgcacctgagctgtactgta
gi|78586                      :                                               accgtgttcA-G-T-GGACATA---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T------------------------------------------------G----C----C----C-A-C------A--GT-ctaaatatggcccacagtgggcatattgatttccacctgagctgtactgca
gi|78620                      :                                                        A-G-T-GGACATT---T---A------CC--T-GTGTGTTATAC--AGT------T-----C--T-AT----A---------------C----A-----C---AA----C----C----C-A-C------T--GT-G---------T-----T---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTActaaagctagaggcctacagacgccagtgggcaaattaatttccacctgagctatactcta
gi|78621                      :                                                        A-G-TAGGACATT---T---A----------T-GT--------C--CACG-----T-----C--T-CA----T---------------A----A-----T---TG----G----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------C--AT-GG-----C-----------------A---AAT-C---AG---T---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GAACTGTA
gi|78619                      :                                                        A-A-T-GG-CATT---------------A--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GGACGGC----C----C-T-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------A-----T-TCAAAA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78622                      :                                                         -G-T-AAACACT---CC--A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-AATTCCA---------------A----A-----T---GA----C----CTACCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------ATTTAA------AA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GCCCTGT
gi|78611                      :                                                             -GGACAGT-------A------AA--T-GC--------T---AC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C---C------A--AT-GA--------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AATGT---AA---
gi|78623                      :                                                        atgttaagaaACT---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--TTAA----A---------------A----A-----T---TT----C----C----C-A-C------A--GA-C---------A-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-T--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78625                      :                                                                   TT---A---A------AA--T-GC--------C--AAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C------A--CT-GGCCACAGATG-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78624                      :                                                                   TC---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----T--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTAGCC----C-A-C------A--GT-A---------------C---C------AAAGT-GGA----C-----------------A-----T-T---AA---AAAAT-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78626                      :                                                                    T---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------A-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AAT--A---T-C-C--A-C--CTG
gi|78630                      :                                                                     ---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTGGCC----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----CATTT-------------A---AA------AA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78629                      :                                                                     ---T---A------AA--T-GC--------C--CAG------T-----TATT-CC----A---------------A----G-----T---GG----CAGGCC----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG--------------------------AAT-TCTAAA---A---T-C-T--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78627                      :                                                                     ---T---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--C-AA----ATGACCACTGATTCCAA----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C----------------------AT-TC--AA---G---T-A-TCCA-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78631                      :                                                                     ---T---A------CA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----------------A-C------A--GC-C---------GCTACAC---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-C---AA---A---T-TCC--A-C--CTCC-------G-CC-ATAATGTA
gi|78628                      :                                                                     ---T---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----C-----A----A---------------A----A-----T---G-----C----C----C-A-C------T--GT-G---------A-----T---TCTA---A--GT-GGC----C-----------------A-----T-TCA-AA---GA--T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78636                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AA----C----C----C-A-C------C--GA-T---------G-----C---C------A--GT-AGG----C-----------------A---AAT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78639                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C---AC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-ATC------A--GA-T---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AA--T---AATTTG---TCT-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTATTGTA
gi|78641                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CAGCCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GAG----C-----------------A-----T-TCAAAA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78637                      :                                                                         ---A------AA--T-AC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------ATTCAA------AA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78638                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GA----ATTCC-----------A----AGTGACT---GG----C----C----C-A-C------T--GG-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------A-----T-TCAAAA---A---T-C-T--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78640                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----A-----T---GGTTGGC----T----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------T--GT-GGG----C-----------------A-----T-TCAAAA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78633                      :                                                                         ---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGGCATTC-----------------A---AA------AA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78642                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C--CACCGTTATT-----C--C-AA----GTG-------------A----C-----C---GG----T----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---G------A--GT-GGG----C----------------------AT-TTAGAA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78635                      :                                                                         ---A------AA--T-GC--------C--CTC------T-----G--T-GA----ATCCA-----------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------ATTCAA------AA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78634                      :                                                                         ---A------AA--T-GT--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GTTGGG----C-----------------A---ATT-C---AA---AATAT-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78632                      :                                                                         ---A------AT--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GC----CGG--C----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGA----C-----------------A-----T-TCA-AA---G---T-T-CC-A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78643                      :                                                                             ------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTTCA---------------A----G-----T---GGGCGGC----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGA----C----------------------AT-TCA-AA---GA--T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78645                      :                                                                             ------AA--T-GC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------ATTGGC-----T---GG----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------ATTCAAA-T---A--------T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78646                      :                                                                             ------AA--T-GA--------T--CAC------T-----C--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C------A--G-----------------------------A-----GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-A--A-G--CTG
gi|78644                      :                                                                             ------AA--T-AC--------C--CAC------T-----G--T-GATTCCA---------------A----A-----TA--GG----C----CGAACC-A-C------A--GG-G---------G-----A---A------A--GT-GGG----C-----------------ATT-AAA-A---AA---A---T-C-C--A-C--CTGA-------G-CT-GTAC-GTAta
gi|78647                      :                                                                                                    --CAC------T-----C--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----T----C----C-C-C------A--GA-T---------A-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---ACT-T---AA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTATTTTA
gi|78648                      :                                                                                                    --CAC------T-----T--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-A-C------T--GA-G---------G-----C---T------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---
gi|78649                      :                                                                                                                      --T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C----------T-G--------------------------A--GT-GTG----C-----------------A---AAT-T---CA---T---T-TCC--A-C--CTGA-------G-TC-ATAATGTA
gi|78650                      :                                                                                                                                                                G----C----C----C-G-C------A--GT-G---------G-----A---A------A--GT-GGA----C-----------------A-----T-TCA-AA---A---T-T-CC-A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGTA
gi|78651                      :                                                                                                                                                                a----C----C----C-A-C------A--GT-G---------G-----T---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AC---G---T-TCC--A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGCA
gi|78652                      :                                                                                                                                                                           ----C-A-C------A--GT-G---------G-----C---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--GTGA-------G-TT-GTGCTGTA
gi|78653                      :                                                                                                                                                                                                                 ---C------A--GT-GGG----C-----------------A---AAT-T---AA---G---T-TCC--A-C--TTGA-------G-GT-GTACTGTA
gi|78654                      :                                                                                                                                                                                                                            --GT-GGG----C-----------------A---TAT-T---AA---T---T-T-CC-A-C--CTGA-------G-CT-GTACTGCA
gi|78655                      :                                                                                                                                                                                                                                         -----------------A---AAT-T---AA---G---T-T-CC-A-C--CTGA-------A-CT-GTACTGTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                         1111                                                                                                                                                                
lowQualScore                  :                 0  0       111 333 55555555555555555  0 00  11111111 00   222222  00 1  4444 666666666666666 2222 11111 111  3333 3333 8888 0 1 0 00 222 111111 000 222222222  0    44444444444444444 333   11 88 1 4444 1    0  0   1111111 0 11 0    0    
lowQualScore                  :                 .  .       ... ... .................  . ..  ........ ..   ......  .. .  .... ............... .... ..... ...  .... .... .... . . . .. ... ...... ... .........  .    ................. ...   .. .. . .... .    .  .   ....... . .. .    .    
lowQualScore                  :                 8  8       222 111 33333333333333333  5 77  99999999 77   000000  77 5  2222 666666666666666 1111 88888 444  2222 9999 4444 5 0 5 77 222 888888 999 666666666  5    66666666666666666 222   22 44 0 2222 5    5  5   7777777 5 33 5    6    
consensus                     :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
Reference ( family-263 )      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78572                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-C---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-TTAC-TGTA
gi|78573                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAC-GC-----C---G---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GCAC-TGTA
gi|78574                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-T-TA-CC-TGA-------G-C--A-GTAC-TGTA
gi|78575                      :       ACTGTGTTCA-GT-GAACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TA--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGG-------G-C--T-GTAC-GGTA
gi|78576                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACGTT---T---A-----------------AA-T--GC--------T--CAC------TC--T-AA----A---------------A----T-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAG-GG-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA
gi|78577                      :       ACCATGTTCA-AT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-C--AAC-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TATA
gi|78578                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC----AA----A---------------A----A-----T---TG----C----C----C-A-C-A--G-G-GC-----C---A---------GT--GGC---------------------AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78579                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGGCATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-AC-----C---A---------GT-GAGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-ACAC-TGCA
gi|78580                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GC-TCTA-CC-TGA-------G-T--T-GTAC-TGT
gi|78581                      :       ACTGTGTTCA---------TT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----C---AG----C----T----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA
gi|78582                      :       ATTATGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TGCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78583                      :       ACTGTGTACA-GT-GAATATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGT
gi|78584                      :       ACCGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---TAT--T--G-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78585                      :       ACTGTGTCCA-GT-GAATATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--TGC------TG--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----G----A----C-T-C-A--GTG-GC-----C---A---------TT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TATA
gi|78586                      :       ACTGTGGGCA-GT-GGACATT---T---A-----------------TA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------G----C-----TAGAGG----C----C----T-A-C-A--GAC-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-ATAC-TCTA
gi|78587                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAC-AC-----C---A---------GT-GGAA-----------------A---AAT--T--A-A---TT-T----CT-TGT-------G-C--T-GTAC-T
gi|78588                      :       ACTGTGCTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----G-----T---GG----C----C----A-A-C-A--GTG-GC-----A---A---------GT-GGGC-----------------A---AAA--A--A-A---TT-TCCA-CC-TAA-------A-C--T-GAAC-TGTA
gi|78589                      :          GTGT-CA-GT-GTTCATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CGC------TC--T-AA----A---------------A----T-----A---GG----C----C----C-A-C-A--GAG-GA-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--A--A-A---GT-CCCA-AC-TGA-------G-C--T-GTAC-TG
gi|78590                      :  accacACTGTGTTCC-AT-CAACGTT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--TGA------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GGC-GC-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-TC-TGA-------G-C--T-GTAA-TGTA
gi|78591                      :       ACTGTGTTTA-GT-TTACATT---T---ATAAATGCCCACTCTATAAA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GT--------------------------GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78592                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATTAATT---A-----------------AAAT--TC--------C--CAC------CC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-T-C-C--ATG-GC-----C---A---------AT-GGGT-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCAA-CT-TCA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78593                      :       ACTGTGTTCA-AT-GGGCAGT---C---T-----------------AG-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----CAA-C-A--AT--GC-----C---A---------TT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-ATAC-T
gi|78594                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--C-C------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-------------------------C-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CCAGGA-------GCC--T-GT
gi|78595                      :       ACTGTGTTCT-GT-GGACATT---G---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----T----C----C-A-CCA--ATG--T-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-AT--TT-TCCA-TC-TGA-------A-C--T-A-AC-TATA
gi|78596                      :       ATTGTGTTCC-GT-GAACATT---G---A-----------------AA-T--TC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---G-----T----T----A-A-C-A--GGC-CC-----C---A---------GT-GCGC-----------------A---AAT--T--A-A---AT-TCTA-CC-TAA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78597                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC----AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--ATG-GC-----T---A----------T-----------------------------------------T-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-GTAC-TGTA
gi|78598                      :       ACTGTGT-CA-GT-GGACATT-------A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T----G----T----T----C-A-C-A--TTG-GC-----C---A---------GT-GGCCA----------------A---AAT--T--A-A---GT-GTCA-CC-T---------G-C--T--TAC-TGTA
gi|78599                      :       ACTGTGTTCC-AT-GGACATT---TTAAA-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------T----A-----T---AG----C----C----C-A-------------------------------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-AC-TGA-------G-C--C-ATAC-GGTA
gi|78600                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-A--AC--------C--CAC------TC--A-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------AT-G
gi|78601                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---TTTAA-----------------AA-T--TC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------A----AA----T---GA----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---G---------TT-GGGC-----------------A---AAT--G--A-A---G
gi|78602                      :       ACTCTGTTCAAGT-GGACCTA---T---A-----------------AA-G--GC--------C---AC------TC--TAAA----A---------------A----A-----T---GT----T----C--------C-A--GTG-GC-----A---C---------GT-GGGCCAACTTTATGTTCACTGG---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78603                      :       ACTGTGTTCC-AT-GGATATT---T---G-----------------AA-T--GT--------A--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----T----C-A-C---------C-----A---A---------GT-GTGC-----------------A---AAT--C--A-
gi|78604                      :       ACTGCGTTCT-GT-GTACATT---TA--A-----------------AA-TTAGC--------TTACAC------TG--C-AA----A---------------G----A-----T--------------------------------GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCACCC-TAA-------G-CG-T-GTAC-
gi|78605                      :        CTGTGTTT---T-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CCT------TC--T-AG----A---------------AT---A-----T---AG---------C----T-A-C-A--GTC-AC-----C---A---------G--AGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------
gi|78606                      :         TGTGTTAG-AT-GGACATT---T---A-----------------AA-C--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-A-A--GAC-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78607                      :         TATGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--TAAA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TGCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78608                      :         TGTGTTCA-GT-GGACATT---C---C-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TTCA-TA-TGA-------A-C--T-GCAC-TGTA
gi|78609                      :             TTCA-GT-GGTCATT---T---G-----------------AA-T--AA--------C--CGT------TC--T-AA----A---------------A----------T---GT----C----G----T-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGT-----------------A---AAG--T--A-A---GT-TCTA-TT-TGA-------G-C--T-GTAC-TGT
gi|78610                      :       tacaTGTTCA-GT-GGACATC---T---A-----------------AA-T--GC--------C---AC------TT--T-AA----T---------------A----------T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GT-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---TAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--A-ATAC-TGTA
gi|78611                      :                   a-GGACAGT-------A-----------------AA-T--GC--------T---AC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C---C-A--ATGAGC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AATG-T--A-A---
gi|78612                      : atgttaagaaTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--AC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-T-A--TTG-GG-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------C-CTGT-GTACATGTA
gi|78613                      :           TGTTTA-GT-GAACATT---G---A-----------------AT-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----AT--------------AT---A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--AAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCTA-CC-TGA-------G-C--A-GTAC-TGTA
gi|78614                      :           TGTTCA-GT-GGACATT---T---ACATGTA-----------AA-T--GC--------C--CTC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-C-A--GTG-TC-----C---A---------AT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-CCCA-CC-TG
gi|78615                      :           TGTTCG-GT-GGACAGT---T---A-----------------TG-T--CC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AT----C----C----C-A-----------------C---A---------AT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GT
gi|78616                      :           TGTTCT-AT-GGGCATT---A---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TT--T-TA----A---------------A----G-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GAT-GC-----C---A---------
gi|78617                      :              TCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AT-T--GA--------C--CAC------TA--T-AA----A---------------A----T-----T---GA----C----C----C-A-C-ACGGT--GC-----C---A---------GT-AGGCCA---------------A---AAA--T--A-AT--AT-TCCA-CC-TGACAAGCGTG-C--T-GCAC-TGTA
gi|78618                      :              TCT-GT-TGGCATT---T---T-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AG----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-ATC-A--GT--GC-----C---A---------GT--TGC-----------------A---AAT--T--ATT---TT-TCCA-CC-TGA-------G-T--TAATAC-TGTA
gi|78619                      :                A-AT-GG-CATT--------------------------A-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GGACGGC----C----C-T-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78620                      :                A-GT-GGACATT---T---A-----------------CC-T--GTGTGTTATAC--AGT------TC--T-AT----A---------------C----A-----C---AA----C----C----C-A-C-T--GTG-TT-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78621                      :                A-GTAGGACATT---T---A--------------------T--GT--------C--CACG-----TC--T-CA----T---------------A----A-----T---TG----G----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---C---------AT-GG-C-----------------A---AAT--C--A-----GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GAAC-TGTA
gi|78622                      :                 -GT-AAACACT---CC--A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-AATTCCA---------------A----A-----T---GA----C----CTACCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A---TTT--A--A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GCCC-TGT
gi|78623                      :                         ACT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--TTAA----A---------------A----A-----T---TT----C----C----C-A-C-A--GAC-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-TC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78624                      :                          TC---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTAGCC----C-A-C-A--GTA--C-----C---AAA-------GT-GGAC-----------------ATT-AA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78625                      :                          TT---A---A-----------------AA-T--GC--------C--AAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--CTG-GC-----C---ACAGATGCCAGT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78626                      :                           T---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GTG-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TA-TCCA-CC-TG
gi|78627                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--C-AA----ATGACCACTGATTCCAA----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TC-A-A---GTATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78628                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC-----A----A---------------A----A-----T---G-----C----C----C-A-C-T--GTG-AT-----TCTAA---------GT-GGCC-----------------A-----T--TCAA-A---GA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78629                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAG------TTATT-CC----A---------------A----G-----T---GG----CAGGCC----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGG----------------------AATTCT--A-A---AA-TCTA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78630                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTGGCC----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTTAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78631                      :                            ---T---A-----------------CA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----------------A-C-A--GCC-GCTACACC---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---AT-TCCA-CC-TCC-------G-C--C-ATAA-TGTA
gi|78632                      :                                ---A-----------------AT-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GC----CGG--C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC-----------------A-----T--TCAA-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78633                      :                                ---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTCAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78634                      :                                ---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GTTGGGC-----------------A---A-T--TCAA-A---ATATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78635                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CTC------TG--T-GA----ATCCA-----------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78636                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AA----C----C----C-A-C-C--GAT-GC-----C---A---------GT-AGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78637                      :                                ---A-----------------AA-T--AC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78638                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GA----ATTCC-----------A----AGTGACT---GG----C----C----C-A-C-T--GGG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCTA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78639                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C---AC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-ATC-A--GAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AA---T--A-ATTTGT-CTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TGTA
gi|78640                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----A-----T---GGTTGGC----T----C-A-C-A--GTG-GA-----A---T---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78641                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CAGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GAGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78642                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CACCGTTATTC--C-AA----GTG-------------A----C-----C---GG----T----C----C-A-C-A--GTG-GA-----G---A---------GT-GGGC-----------------A---T-T--T--AGA---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78643                      :                                    -----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTTCA---------------A----G-----T---GGGCGGC----C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC----------------------AT--TCAA-A---GA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78644                      :                                    -----------------AA-T--AC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----A-----TA--GG----C----CGAACC-A-C-A--GGG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTAAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC--GTA
gi|78645                      :                                    -----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------ATTGGC-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TC-A-A---ATATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78646                      :                                    -----------------AA-T--GA--------T--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C-A--G--------------A------------GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT---------TAA-------G-C--T-GTA
gi|78647                      :                                                                      --CAC------TC--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----T----C----C-C-C-A--GAT-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---ACT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TTTA
gi|78648                      :                                                                      --CAC------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-A-C-T--GAG-GC-----T---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---
gi|78649                      :                                                                                   --T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-----TG------------A---------GT-GTGC-----------------A---AAT--T--C-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-T--C-ATAA-TGTA
gi|78650                      :                                                                                                                             G----C----C----C-G-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC-----------------A-----T--TCAA-A---AT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78651                      :                                                                                                                             a----C----C----C-A-C-A--GTG-GT-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-C---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78652                      :                                                                                                                                        ----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CG-TGA-------G-T--T-GTGC-TGTA
gi|78653                      :                                                                                                                                                           -----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CT-TGA-------G-G--T-GTAC-TGTA
gi|78654                      :                                                                                                                                                                     ---------GT-GGGC-----------------A---TAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78655                      :                                                                                                                                                                                     -----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                         1111                                                                                                                                                                
lowQualScore                  :                 0  0       111 333 55555555555555555  0 00  11111111 00   222222  00 1  4444 666666666666666 2222 11111 111  3333 3333 8888 0 1 0 00 222 111111 000 222222222  0    44444444444444444 333   11 88 1 4444 1    0  0   1111111 0 11 0    0    
lowQualScore                  :                 .  .       ... ... .................  . ..  ........ ..   ......  .. .  .... ............... .... ..... ...  .... .... .... . . . .. ... ...... ... .........  .    ................. ...   .. .. . .... .    .  .   ....... . .. .    .    
lowQualScore                  :                 8  8       222 111 33333333333333333  5 77  99999999 77   000000  77 5  2222 666666666666666 1111 88888 444  2222 9999 4444 5 0 5 77 222 888888 999 666666666  5    66666666666666666 222   22 44 0 2222 5    5  5   7777777 5 33 5    6    
consensus                     :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
Reference ( family-263 )      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78572                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-C---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-TTAC-TGTA
gi|78573                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAC-GC-----C---G---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GCAC-TGTA
gi|78574                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-T-TA-CC-TGA-------G-C--A-GTAC-TGTA
gi|78575                      :       ACTGTGTTCA-GT-GAACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TA--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGG-------G-C--T-GTAC-GGTA
gi|78576                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACGTT---T---A-----------------AA-T--GC--------T--CAC------TC--T-AA----A---------------A----T-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAG-GG-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA
gi|78577                      :       ACCATGTTCA-AT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-C--AAC-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TATA
gi|78578                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC----AA----A---------------A----A-----T---TG----C----C----C-A-C-A--G-G-GC-----C---A---------GT--GGC---------------------AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78579                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGGCATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-AC-----C---A---------GT-GAGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-ACAC-TGCA
gi|78580                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GC-TCTA-CC-TGA-------G-T--T-GTAC-TGT
gi|78581                      :       ACTGTGTTCA---------TT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----C---AG----C----T----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA
gi|78582                      :       ATTATGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TGCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78583                      :       ACTGTGTACA-GT-GAATATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGT
gi|78584                      :       ACCGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---TAT--T--G-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78585                      :       ACTGTGTCCA-GT-GAATATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--TGC------TG--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----G----A----C-T-C-A--GTG-GC-----C---A---------TT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TATA
gi|78586                      :       ACTGTGGGCA-GT-GGACATT---T---A-----------------TA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------G----C-----TAGAGG----C----C----T-A-C-A--GAC-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-ATAC-TCTA
gi|78587                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAC-AC-----C---A---------GT-GGAA-----------------A---AAT--T--A-A---TT-T----CT-TGT-------G-C--T-GTAC-T
gi|78588                      :       ACTGTGCTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----G-----T---GG----C----C----A-A-C-A--GTG-GC-----A---A---------GT-GGGC-----------------A---AAA--A--A-A---TT-TCCA-CC-TAA-------A-C--T-GAAC-TGTA
gi|78589                      :          GTGT-CA-GT-GTTCATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CGC------TC--T-AA----A---------------A----T-----A---GG----C----C----C-A-C-A--GAG-GA-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--A--A-A---GT-CCCA-AC-TGA-------G-C--T-GTAC-TG
gi|78590                      :  accacACTGTGTTCC-AT-CAACGTT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--TGA------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GGC-GC-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-TC-TGA-------G-C--T-GTAA-TGTA
gi|78591                      :       ACTGTGTTTA-GT-TTACATT---T---ATAAATGCCCACTCTATAAA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GT--------------------------GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78592                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATTAATT---A-----------------AAAT--TC--------C--CAC------CC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-T-C-C--ATG-GC-----C---A---------AT-GGGT-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCAA-CT-TCA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78593                      :       ACTGTGTTCA-AT-GGGCAGT---C---T-----------------AG-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----CAA-C-A--AT--GC-----C---A---------TT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-ATAC-T
gi|78594                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--C-C------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-------------------------C-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CCAGGA-------GCC--T-GT
gi|78595                      :       ACTGTGTTCT-GT-GGACATT---G---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----T----C----C-A-CCA--ATG--T-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-AT--TT-TCCA-TC-TGA-------A-C--T-A-AC-TATA
gi|78596                      :       ATTGTGTTCC-GT-GAACATT---G---A-----------------AA-T--TC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---G-----T----T----A-A-C-A--GGC-CC-----C---A---------GT-GCGC-----------------A---AAT--T--A-A---AT-TCTA-CC-TAA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78597                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC----AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--ATG-GC-----T---A----------T-----------------------------------------T-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-GTAC-TGTA
gi|78598                      :       ACTGTGT-CA-GT-GGACATT-------A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T----G----T----T----C-A-C-A--TTG-GC-----C---A---------GT-GGCCA----------------A---AAT--T--A-A---GT-GTCA-CC-T---------G-C--T--TAC-TGTA
gi|78599                      :       ACTGTGTTCC-AT-GGACATT---TTAAA-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------T----A-----T---AG----C----C----C-A-------------------------------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-AC-TGA-------G-C--C-ATAC-GGTA
gi|78600                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-A--AC--------C--CAC------TC--A-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------AT-G
gi|78601                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---TTTAA-----------------AA-T--TC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------A----AA----T---GA----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---G---------TT-GGGC-----------------A---AAT--G--A-A---G
gi|78602                      :       ACTCTGTTCAAGT-GGACCTA---T---A-----------------AA-G--GC--------C---AC------TC--TAAA----A---------------A----A-----T---GT----T----C--------C-A--GTG-GC-----A---C---------GT-GGGCCAACTTTATGTTCACTGG---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78603                      :       ACTGTGTTCC-AT-GGATATT---T---G-----------------AA-T--GT--------A--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----T----C-A-C---------C-----A---A---------GT-GTGC-----------------A---AAT--C--A-
gi|78604                      :       ACTGCGTTCT-GT-GTACATT---TA--A-----------------AA-TTAGC--------TTACAC------TG--C-AA----A---------------G----A-----T--------------------------------GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCACCC-TAA-------G-CG-T-GTAC-
gi|78605                      :        CTGTGTTT---T-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CCT------TC--T-AG----A---------------AT---A-----T---AG---------C----T-A-C-A--GTC-AC-----C---A---------G--AGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------
gi|78606                      :         TGTGTTAG-AT-GGACATT---T---A-----------------AA-C--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-A-A--GAC-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78607                      :         TATGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--TAAA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TGCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78608                      :         TGTGTTCA-GT-GGACATT---C---C-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TTCA-TA-TGA-------A-C--T-GCAC-TGTA
gi|78609                      :             TTCA-GT-GGTCATT---T---G-----------------AA-T--AA--------C--CGT------TC--T-AA----A---------------A----------T---GT----C----G----T-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGT-----------------A---AAG--T--A-A---GT-TCTA-TT-TGA-------G-C--T-GTAC-TGT
gi|78610                      :       tacaTGTTCA-GT-GGACATC---T---A-----------------AA-T--GC--------C---AC------TT--T-AA----T---------------A----------T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GT-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---TAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--A-ATAC-TGTA
gi|78611                      :                   a-GGACAGT-------A-----------------AA-T--GC--------T---AC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C---C-A--ATGAGC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AATG-T--A-A---
gi|78612                      : atgttaagaaTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--AC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-T-A--TTG-GG-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------C-CTGT-GTACATGTA
gi|78613                      :           TGTTTA-GT-GAACATT---G---A-----------------AT-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----AT--------------AT---A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--AAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCTA-CC-TGA-------G-C--A-GTAC-TGTA
gi|78614                      :           TGTTCA-GT-GGACATT---T---ACATGTA-----------AA-T--GC--------C--CTC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-C-A--GTG-TC-----C---A---------AT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-CCCA-CC-TG
gi|78615                      :           TGTTCG-GT-GGACAGT---T---A-----------------TG-T--CC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AT----C----C----C-A-----------------C---A---------AT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GT
gi|78616                      :           TGTTCT-AT-GGGCATT---A---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TT--T-TA----A---------------A----G-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GAT-GC-----C---A---------
gi|78617                      :              TCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AT-T--GA--------C--CAC------TA--T-AA----A---------------A----T-----T---GA----C----C----C-A-C-ACGGT--GC-----C---A---------GT-AGGCCA---------------A---AAA--T--A-AT--AT-TCCA-CC-TGACAAGCGTG-C--T-GCAC-TGTA
gi|78618                      :              TCT-GT-TGGCATT---T---T-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AG----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-ATC-A--GT--GC-----C---A---------GT--TGC-----------------A---AAT--T--ATT---TT-TCCA-CC-TGA-------G-T--TAATAC-TGTA
gi|78619                      :                A-AT-GG-CATT--------------------------A-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GGACGGC----C----C-T-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78620                      :                A-GT-GGACATT---T---A-----------------CC-T--GTGTGTTATAC--AGT------TC--T-AT----A---------------C----A-----C---AA----C----C----C-A-C-T--GTG-TT-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78621                      :                A-GTAGGACATT---T---A--------------------T--GT--------C--CACG-----TC--T-CA----T---------------A----A-----T---TG----G----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---C---------AT-GG-C-----------------A---AAT--C--A-----GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GAAC-TGTA
gi|78622                      :                 -GT-AAACACT---CC--A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-AATTCCA---------------A----A-----T---GA----C----CTACCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A---TTT--A--A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GCCC-TGT
gi|78623                      :                         ACT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--TTAA----A---------------A----A-----T---TT----C----C----C-A-C-A--GAC-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-TC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78624                      :                          TC---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTAGCC----C-A-C-A--GTA--C-----C---AAA-------GT-GGAC-----------------ATT-AA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78625                      :                          TT---A---A-----------------AA-T--GC--------C--AAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--CTG-GC-----C---ACAGATGCCAGT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78626                      :                           T---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GTG-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TA-TCCA-CC-TG
gi|78627                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--C-AA----ATGACCACTGATTCCAA----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TC-A-A---GTATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78628                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC-----A----A---------------A----A-----T---G-----C----C----C-A-C-T--GTG-AT-----TCTAA---------GT-GGCC-----------------A-----T--TCAA-A---GA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78629                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAG------TTATT-CC----A---------------A----G-----T---GG----CAGGCC----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGG----------------------AATTCT--A-A---AA-TCTA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78630                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTGGCC----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTTAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78631                      :                            ---T---A-----------------CA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----------------A-C-A--GCC-GCTACACC---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---AT-TCCA-CC-TCC-------G-C--C-ATAA-TGTA
gi|78632                      :                                ---A-----------------AT-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GC----CGG--C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC-----------------A-----T--TCAA-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78633                      :                                ---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTCAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78634                      :                                ---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GTTGGGC-----------------A---A-T--TCAA-A---ATATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78635                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CTC------TG--T-GA----ATCCA-----------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78636                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AA----C----C----C-A-C-C--GAT-GC-----C---A---------GT-AGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78637                      :                                ---A-----------------AA-T--AC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78638                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GA----ATTCC-----------A----AGTGACT---GG----C----C----C-A-C-T--GGG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCTA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78639                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C---AC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-ATC-A--GAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AA---T--A-ATTTGT-CTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TGTA
gi|78640                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----A-----T---GGTTGGC----T----C-A-C-A--GTG-GA-----A---T---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78641                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CAGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GAGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78642                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CACCGTTATTC--C-AA----GTG-------------A----C-----C---GG----T----C----C-A-C-A--GTG-GA-----G---A---------GT-GGGC-----------------A---T-T--T--AGA---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78643                      :                                    -----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTTCA---------------A----G-----T---GGGCGGC----C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC----------------------AT--TCAA-A---GA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78644                      :                                    -----------------AA-T--AC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----A-----TA--GG----C----CGAACC-A-C-A--GGG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTAAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC--GTA
gi|78645                      :                                    -----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------ATTGGC-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TC-A-A---ATATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78646                      :                                    -----------------AA-T--GA--------T--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C-A--G--------------A------------GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT---------TAA-------G-C--T-GTA
gi|78647                      :                                                                      --CAC------TC--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----T----C----C-C-C-A--GAT-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---ACT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TTTA
gi|78648                      :                                                                      --CAC------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-A-C-T--GAG-GC-----T---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---
gi|78649                      :                                                                                   --T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-----TG------------A---------GT-GTGC-----------------A---AAT--T--C-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-T--C-ATAA-TGTA
gi|78650                      :                                                                                                                             G----C----C----C-G-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC-----------------A-----T--TCAA-A---AT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78651                      :                                                                                                                             a----C----C----C-A-C-A--GTG-GT-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-C---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78652                      :                                                                                                                                        ----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CG-TGA-------G-T--T-GTGC-TGTA
gi|78653                      :                                                                                                                                                           -----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CT-TGA-------G-G--T-GTAC-TGTA
gi|78654                      :                                                                                                                                                                     ---------GT-GGGC-----------------A---TAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78655                      :                                                                                                                                                                                     -----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA


blockSeqs                     :                            AAT TAA TAAATGCCCACTCTATA        GTGTTATA      CGTTAT     A  TTCC TGACCACTGATTCCA TTGG GTGAC AGA  ACGG TAGC TACC          TGA CTACAC     CAGATGCCA       CAACTTTATGTTCACTG TTT   TC CA   TTTG A           CAAGCGT   TG
blockSeqs                     :                            .   TTA CATGTA                   .             G          A  TTCC TCCA            T    A     A    TTGG AGGC GGCC          AC  C          AA              CA                TTC   G  CA   TT   A           .         G 
blockSeqs                     :                            .   A   .                        .             .          T  TTCC TTCC            T    .     .    GCGG TGGC GGCC          TG  C          .               A                 TTA   .  CA   TA   A           .         . 
blockSeqs                     :                            .   C   .                        .             .          .  TTCC TG              .    .     .    .    GG   GGCC          TG  C          .               .                 TT    .  CA   T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC T               .    .     .    .    .    GGCC          AG  G          .               .                 .     .  CA   G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    GGCC          AC  C          .               .                 .     .  CA   G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    AGCC          TG  C          .               .                 .     .  CA   T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    GAAC          TG  C          .               .                 .     .  CA   G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  CA   G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    .             AC  C          .               .                 .     .  CA   G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTTC .               .    .     .    .    .    .             AC  C          .               .                 .     .  CA   G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  C    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  TTCC .               .    .     .    .    .    .             AG  C          .               .                 .     .  C    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             GC  A          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             GC  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  T          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TC  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AC  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AT  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AT  T          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  G          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AC  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TA  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  T          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             CC  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  T          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AT  A          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             GG  A          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AT  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             GG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                            .   .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  C          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AT  A          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             AG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             TG  A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             G   C          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             T   C          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             T   A          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             T   T          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                                .   .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             T   C          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                                    .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    T    .           .         . 
blockSeqs                     :                                    .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    A    .           .         . 
blockSeqs                     :                                    .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                                    .                        .             .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    G    .           .         . 
blockSeqs                     :                                                                           .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    G    .           .           
blockSeqs                     :                                                                           .          .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    T    .                       
blockSeqs                     :                                                                                      .  .    .               .    .     .    .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    G    .                       
blockSeqs                     :                                                                                                                              .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .    .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                              .    .    .             .   .          .               .                 .     .  .                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                        .             .   .          .               .                 .     .  .                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .               .                 .     .  .                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .                                                                            


blockSeqCons                  :       
originalCons                  :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
finalCons                     :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                         1111                                                                                                                                                                
lowQualScore                  :                 0  0       111 333 55555555555555555  0 00  11111111 00   222222  00 1  4444 666666666666666 2222 11111 111  3333 3333 8888 0 1 0 00 222 111111 000 222222222  0    44444444444444444 333   11 88 1 4444 1    0  0   1111111 0 11 0    0    
lowQualScore                  :                 .  .       ... ... .................  . ..  ........ ..   ......  .. .  .... ............... .... ..... ...  .... .... .... . . . .. ... ...... ... .........  .    ................. ...   .. .. . .... .    .  .   ....... . .. .    .    
lowQualScore                  :                 8  8       222 111 33333333333333333  5 77  99999999 77   000000  77 5  2222 666666666666666 1111 88888 444  2222 9999 4444 5 0 5 77 222 888888 999 666666666  5    66666666666666666 222   22 44 0 2222 5    5  5   7777777 5 33 5    6    
consensus                     :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
Reference ( family-263 )      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78572                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-C---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-TTAC-TGTA
gi|78573                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAC-GC-----C---G---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GCAC-TGTA
gi|78574                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-T-TA-CC-TGA-------G-C--A-GTAC-TGTA
gi|78575                      :       ACTGTGTTCA-GT-GAACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TA--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGG-------G-C--T-GTAC-GGTA
gi|78576                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACGTT---T---A-----------------AA-T--GC--------T--CAC------TC--T-AA----A---------------A----T-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAG-GG-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA
gi|78577                      :       ACCATGTTCA-AT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-C--AAC-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TATA
gi|78578                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC----AA----A---------------A----A-----T---TG----C----C----C-A-C-A--G-G-GC-----C---A---------GT--GGC---------------------AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78579                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGGCATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-AC-----C---A---------GT-GAGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-ACAC-TGCA
gi|78580                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GC-TCTA-CC-TGA-------G-T--T-GTAC-TGT
gi|78581                      :       ACTGTGTTCA---------TT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----C---AG----C----T----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA
gi|78582                      :       ATTATGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TGCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78583                      :       ACTGTGTACA-GT-GAATATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGT
gi|78584                      :       ACCGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----C----C----C-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---TAT--T--G-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78585                      :       ACTGTGTCCA-GT-GAATATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--TGC------TG--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----G----A----C-T-C-A--GTG-GC-----C---A---------TT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TATA
gi|78586                      :       ACTGTGGGCA-GT-GGACATT---T---A-----------------TA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------G----C-----TAGAGG----C----C----T-A-C-A--GAC-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-ATAC-TCTA
gi|78587                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GAC-AC-----C---A---------GT-GGAA-----------------A---AAT--T--A-A---TT-T----CT-TGT-------G-C--T-GTAC-T
gi|78588                      :       ACTGTGCTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----G-----T---GG----C----C----A-A-C-A--GTG-GC-----A---A---------GT-GGGC-----------------A---AAA--A--A-A---TT-TCCA-CC-TAA-------A-C--T-GAAC-TGTA
gi|78589                      :          GTGT-CA-GT-GTTCATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CGC------TC--T-AA----A---------------A----T-----A---GG----C----C----C-A-C-A--GAG-GA-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--A--A-A---GT-CCCA-AC-TGA-------G-C--T-GTAC-TG
gi|78590                      :  accacACTGTGTTCC-AT-CAACGTT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--TGA------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GGC-GC-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-TC-TGA-------G-C--T-GTAA-TGTA
gi|78591                      :       ACTGTGTTTA-GT-TTACATT---T---ATAAATGCCCACTCTATAAA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GT--------------------------GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78592                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATTAATT---A-----------------AAAT--TC--------C--CAC------CC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-T-C-C--ATG-GC-----C---A---------AT-GGGT-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCAA-CT-TCA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78593                      :       ACTGTGTTCA-AT-GGGCAGT---C---T-----------------AG-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----CAA-C-A--AT--GC-----C---A---------TT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-ATAC-T
gi|78594                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--C-C------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-------------------------C-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CCAGGA-------GCC--T-GT
gi|78595                      :       ACTGTGTTCT-GT-GGACATT---G---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----T----C----C-A-CCA--ATG--T-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-AT--TT-TCCA-TC-TGA-------A-C--T-A-AC-TATA
gi|78596                      :       ATTGTGTTCC-GT-GAACATT---G---A-----------------AA-T--TC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---G-----T----T----A-A-C-A--GGC-CC-----C---A---------GT-GCGC-----------------A---AAT--T--A-A---AT-TCTA-CC-TAA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78597                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC----AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--ATG-GC-----T---A----------T-----------------------------------------T-TCCA-CC-TGA-------G-C--C-GTAC-TGTA
gi|78598                      :       ACTGTGT-CA-GT-GGACATT-------A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T----G----T----T----C-A-C-A--TTG-GC-----C---A---------GT-GGCCA----------------A---AAT--T--A-A---GT-GTCA-CC-T---------G-C--T--TAC-TGTA
gi|78599                      :       ACTGTGTTCC-AT-GGACATT---TTAAA-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------T----A-----T---AG----C----C----C-A-------------------------------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-AC-TGA-------G-C--C-ATAC-GGTA
gi|78600                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-A--AC--------C--CAC------TC--A-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------AT-G
gi|78601                      :       ACTGTGTTCA-GT-GGACATT---TTTAA-----------------AA-T--TC--------C--CAC------TT--T-AA----A---------------A----AA----T---GA----C----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---G---------TT-GGGC-----------------A---AAT--G--A-A---G
gi|78602                      :       ACTCTGTTCAAGT-GGACCTA---T---A-----------------AA-G--GC--------C---AC------TC--TAAA----A---------------A----A-----T---GT----T----C--------C-A--GTG-GC-----A---C---------GT-GGGCCAACTTTATGTTCACTGG---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78603                      :       ACTGTGTTCC-AT-GGATATT---T---G-----------------AA-T--GT--------A--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----T----C-A-C---------C-----A---A---------GT-GTGC-----------------A---AAT--C--A-
gi|78604                      :       ACTGCGTTCT-GT-GTACATT---TA--A-----------------AA-TTAGC--------TTACAC------TG--C-AA----A---------------G----A-----T--------------------------------GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCACCC-TAA-------G-CG-T-GTAC-
gi|78605                      :        CTGTGTTT---T-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CCT------TC--T-AG----A---------------AT---A-----T---AG---------C----T-A-C-A--GTC-AC-----C---A---------G--AGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------
gi|78606                      :         TGTGTTAG-AT-GGACATT---T---A-----------------AA-C--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-A-A--GAC-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78607                      :         TATGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--TAAA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----T-A-----------------C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TGCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78608                      :         TGTGTTCA-GT-GGACATT---C---C-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TTCA-TA-TGA-------A-C--T-GCAC-TGTA
gi|78609                      :             TTCA-GT-GGTCATT---T---G-----------------AA-T--AA--------C--CGT------TC--T-AA----A---------------A----------T---GT----C----G----T-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGT-----------------A---AAG--T--A-A---GT-TCTA-TT-TGA-------G-C--T-GTAC-TGT
gi|78610                      :       tacaTGTTCA-GT-GGACATC---T---A-----------------AA-T--GC--------C---AC------TT--T-AA----T---------------A----------T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GT-----C---A---------GT-GGAC-----------------A---TAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--A-ATAC-TGTA
gi|78611                      :                   a-GGACAGT-------A-----------------AA-T--GC--------T---AC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C---C-A--ATGAGC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AATG-T--A-A---
gi|78612                      : atgttaagaaTGTTCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AA-T--AC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-T-A--TTG-GG-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------C-CTGT-GTACATGTA
gi|78613                      :           TGTTTA-GT-GAACATT---G---A-----------------AT-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----AT--------------AT---A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--AAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---TT-TCTA-CC-TGA-------G-C--A-GTAC-TGTA
gi|78614                      :           TGTTCA-GT-GGACATT---T---ACATGTA-----------AA-T--GC--------C--CTC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GA----C----C----C-A-C-A--GTG-TC-----C---A---------AT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-CCCA-CC-TG
gi|78615                      :           TGTTCG-GT-GGACAGT---T---A-----------------TG-T--CC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AT----C----C----C-A-----------------C---A---------AT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GT
gi|78616                      :           TGTTCT-AT-GGGCATT---A---A-----------------AA-T--GC--------C--CAT------TT--T-TA----A---------------A----G-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GAT-GC-----C---A---------
gi|78617                      :              TCA-GT-GGACATT---T---A-----------------AT-T--GA--------C--CAC------TA--T-AA----A---------------A----T-----T---GA----C----C----C-A-C-ACGGT--GC-----C---A---------GT-AGGCCA---------------A---AAA--T--A-AT--AT-TCCA-CC-TGACAAGCGTG-C--T-GCAC-TGTA
gi|78618                      :              TCT-GT-TGGCATT---T---T-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AG----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-ATC-A--GT--GC-----C---A---------GT--TGC-----------------A---AAT--T--ATT---TT-TCCA-CC-TGA-------G-T--TAATAC-TGTA
gi|78619                      :                A-AT-GG-CATT--------------------------A-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GGACGGC----C----C-T-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78620                      :                A-GT-GGACATT---T---A-----------------CC-T--GTGTGTTATAC--AGT------TC--T-AT----A---------------C----A-----C---AA----C----C----C-A-C-T--GTG-TT-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78621                      :                A-GTAGGACATT---T---A--------------------T--GT--------C--CACG-----TC--T-CA----T---------------A----A-----T---TG----G----C----C-A-C-A--GTG-GC-----C---C---------AT-GG-C-----------------A---AAT--C--A-----GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GAAC-TGTA
gi|78622                      :                 -GT-AAACACT---CC--A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-AATTCCA---------------A----A-----T---GA----C----CTACCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A---TTT--A--A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GCCC-TGT
gi|78623                      :                         ACT---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--TTAA----A---------------A----A-----T---TT----C----C----C-A-C-A--GAC-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-TC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78624                      :                          TC---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TT--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTAGCC----C-A-C-A--GTA--C-----C---AAA-------GT-GGAC-----------------ATT-AA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78625                      :                          TT---A---A-----------------AA-T--GC--------C--AAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----C----C----C-A-C-A--CTG-GC-----C---ACAGATGCCAGT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78626                      :                           T---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-A--GTG-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TA-TCCA-CC-TG
gi|78627                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--C-AA----ATGACCACTGATTCCAA----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TC-A-A---GTATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78628                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TC-----A----A---------------A----A-----T---G-----C----C----C-A-C-T--GTG-AT-----TCTAA---------GT-GGCC-----------------A-----T--TCAA-A---GA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78629                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAG------TTATT-CC----A---------------A----G-----T---GG----CAGGCC----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGG----------------------AATTCT--A-A---AA-TCTA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78630                      :                            ---T---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----CTGGCC----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTTAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78631                      :                            ---T---A-----------------CA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----------------A-C-A--GCC-GCTACACC---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--C--A-A---AT-TCCA-CC-TCC-------G-C--C-ATAA-TGTA
gi|78632                      :                                ---A-----------------AT-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GC----CGG--C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC-----------------A-----T--TCAA-A---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78633                      :                                ---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTCAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78634                      :                                ---A-----------------AA-T--GT--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GTTGGGC-----------------A---A-T--TCAA-A---ATATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78635                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CTC------TG--T-GA----ATCCA-----------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78636                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AA----C----C----C-A-C-C--GAT-GC-----C---A---------GT-AGGC-----------------A---AAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78637                      :                                ---A-----------------AA-T--AC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CGGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78638                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GA----ATTCC-----------A----AGTGACT---GG----C----C----C-A-C-T--GGG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCTA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78639                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C---AC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-ATC-A--GAT-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AA---T--A-ATTTGT-CTCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TGTA
gi|78640                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----A-----T---GGTTGGC----T----C-A-C-A--GTG-GA-----A---T---------GT-GGGC-----------------A-----T--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78641                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----G-----T---GG----C----CAGCCC-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GAGC----------------------AT--TCAA-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78642                      :                                ---A-----------------AA-T--GC--------C--CACCGTTATTC--C-AA----GTG-------------A----C-----C---GG----T----C----C-A-C-A--GTG-GA-----G---A---------GT-GGGC-----------------A---T-T--T--AGA---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78643                      :                                    -----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTTCA---------------A----G-----T---GGGCGGC----C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC----------------------AT--TCAA-A---GA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78644                      :                                    -----------------AA-T--AC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------A----A-----TA--GG----C----CGAACC-A-C-A--GGG-GA-----A---A---------GT-GGGC-----------------ATTAAA------A-A---AA-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC--GTA
gi|78645                      :                                    -----------------AA-T--GC--------C--CAC------TG--T-GATTCCA---------------ATTGGC-----T---GG----C----C----C-A-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGGC----------------------AT--TC-A-A---ATATCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78646                      :                                    -----------------AA-T--GA--------T--CAC------TC--T-AA----A---------------A----A-----T---GG----T----C----C-A-C-A--G--------------A------------GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT---------TAA-------G-C--T-GTA
gi|78647                      :                                                                      --CAC------TC--T-AA----A---------------T----A-----T---GG----T----C----C-C-C-A--GAT-AC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---ACT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAT-TTTA
gi|78648                      :                                                                      --CAC------TT--T-AA----A---------------A----A-----T---AG----A----C----C-A-C-T--GAG-GC-----T---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---
gi|78649                      :                                                                                   --T-AA----A---------------A----A-----T---AG----C----C----C-A-C-----TG------------A---------GT-GTGC-----------------A---AAT--T--C-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-T--C-ATAA-TGTA
gi|78650                      :                                                                                                                             G----C----C----C-G-C-A--GTG-GA-----A---A---------GT-GGAC-----------------A-----T--TCAA-A---AT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGTA
gi|78651                      :                                                                                                                             a----C----C----C-A-C-A--GTG-GT-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-C---GT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78652                      :                                                                                                                                        ----C-A-C-A--GTG-GC-----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CG-TGA-------G-T--T-GTGC-TGTA
gi|78653                      :                                                                                                                                                           -----C---A---------GT-GGGC-----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CT-TGA-------G-G--T-GTAC-TGTA
gi|78654                      :                                                                                                                                                                     ---------GT-GGGC-----------------A---TAT--T--A-A---TT-TCCA-CC-TGA-------G-C--T-GTAC-TGCA
gi|78655                      :                                                                                                                                                                                     -----------------A---AAT--T--A-A---GT-TCCA-CC-TGA-------A-C--T-GTAC-TGTA