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lowQualScore                  :          .....  .. . ..........   .. ...  .   ...... . ....... .. .. .   ... .  .   ...  ..... ....   .... . . ..... .. ..  ..  ... .......... .  ....   ......  .    . ........ .  ... . ........ .... . . . ... .  . .   .   .  . .    
lowQualScore                  :          22222  88 3 2222222222   77 555  2   555555 2 3333333 66 77 3   666 1  1   888  77777 5555   1111 0 0 44444 33 33  33  777 2222222222 0  1111   111111  5    5 33333333 5  222 8 99999999 6666 5 5 0 888 5  5 5   5   5  5 5    
consensus                     :     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG-AAAG-----C-T--N----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--AT-GT----CAC-NC---TA-TTTT-T--------G-CA-N-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
Reference ( gi|73158 )        :     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG-AAAA-----C-T--G----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------C--AT-GT----CAC-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGT-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73138                      :     ATATA----ATA--T-A----A-----A-A--A---TG-AAAG-----C-T--C----A--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--AT-GT----CAC-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGT-----C--G----T-T-A-T---C-AT-C-TCC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73140                      : aaatATACAT---ATA--C-C----T-----ATA--A---TG-AAAA-----C-T--G----T--A--T-GAT---A-AA-TAG---TT-----C----AGG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C----------T-GT----CAC-AT---TA-TTTC-T--------G-TA-A-TGT-----C--G----C-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73145                      :   aaATATA-----TA--A-A----T-----ATA--AAAATG-AA------------G----TCAA--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--AT-GT----CAC-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGT-----C--GT---T-T-A-T---C-AT-C-TCC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73141                      :   aaATACAT---ATA--C-C----T-----ATA--AA--TG-AAAA-----C-T--G----T--A--T-GAT---A-AA-TAG---TT-----C----AGG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C----------T-GT----CAC-AT---TA-TTTC-T--------G-TA-A-TGT-----C--G----C-G-A-T---T-A--C-T-C-TTT-TT-G-ATGG
gi|73165                      :   aaATATA----ACA----------------TG--A---TA-AAAG-----C-T--C----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---AT-----C----AAG----A---------T--A--T----A---C------T--AT-GT----CAC-AT---T----TT-T--------G-CA-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73149                      :     ATATAT---ATT--C-A----A-----ATA--A---TG-AAAA-----C-T--G----T--A--T-CTT---A-GA-TAA---TTGTATTC----AAG----A-A-A-----T--A--CT--GA---C------T--GT-GT----GAC-AC---TT-TTTA-T--------G-CA-A-TGT-----C--A----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-
gi|73150                      :   aaATATAT---ATA--C-A----A-----ATG--A---TG-AAAG-----C-T--C----T--A--T---------AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--CT--GA---CTA----C--AT-GTATACCAC-AT---TA-TTTT-C----------CA-A-TTT-----T--A----T-G-A-T---T-AT-C-TTC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73147                      :   aaATCTA----ATATGC-A----T-----ATA--A---TGCAAAA-----T-TT-G----T--A--T-CTC---A-CA-TATACCTT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------CGAGT-GT----GAC-AT---TA-GTTT-T--------GCCA-A-TGT-----C--G----T-G-AGTGAGT-AT-C-TCC-CCT-GT-G-AT
gi|73159                      :   aaATATACACTATA--C-A----T-----ATA--A---TG-AAAG-----C-T--G----T--A--T-CTT--------------TT-----A----AAA----A-G-A-----T--T--TTTAAA---T------G--AC-AT----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TGT-----T--A----T-G-A-T---T-AT-C-TC
gi|73155                      :     ATATAT---GTA--C-A----TGTCAAATA--A---TG-AAAG-----C-T--C----C--T--T-CTTTAAA-AA-TAG---TT----------GAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--AT-AT----CAC-AT---T
gi|73137                      :    aaTATA-----TA--C-A----T-----ATA--A---TG-AAAA-----C-T--G----T--A--T-CTT---C-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--GT-GT----CAC-AT---TA-ATTT-T--------G-TA-A-TGT-----T--G----T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-C-AT
gi|73139                      :  aaatTATA-----TA--G-A----T-----ATA--A---TG-AAAA-----C-T--G----T--T--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AA---------------T--A--TT--GA---C------C--GT-GT----CAC-GT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-CT-G-ATGG
gi|73143                      : aaatcTATA-----TA--C-G----G-----ATA--A---TG-AAAG-----T-T--G----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----A----AAG----A-A-A-----T--A--TT--TA---C----------T-GT----TAC-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TA-G-ATGG
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gi|73148                      : aaatcTATA-----TA--C-A----C-----ATA--A---TA-AAAA-----C-T--G----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAA----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T---T-GT----CAA-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-
gi|73144                      : aaatcTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG-AAAA-----C-T--A----T--A--T-CAT---A-AA-TAG---GT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--GT-TT----CAC-------A-TTTT-T--------G-CG-A-TGT-----C--G----T-T-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73163                      : aaatcTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG-AAAG-----C-T--C----T--AAAT-CTT---A-AA-TAT---AT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--AA--GA---C------T--A--GT----CAC-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-ATTGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-T-C-CCT-TT-G-ATGG
gi|73162                      :      TATA----ATG---------------ATA--A---TG-AAGCT----C-T--G----A--A--T-CTC---A-AA-TAG---TT-----A----AAG----A-C-T-----T--A--TT--GA---C------CT-GT-GT----CAC-ATC--TA-TTTT-T--------G-TA-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-A--C-TCT-CCT-TT-G-ATGG
gi|73151                      :   attTATA-----TA--C-A----A-----ATA--A---TG-AAAA-----C-T--C----T--A--T-CTT---G-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---A------T--AT-GT----CAT-AT---T
gi|73164                      : aaatcTATA-----TA--C-A----------ATA--G---TG-AAAAGCTTAC-TATG----T--A--TGCTG---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--TA---T------TA-AT-GT----CAC-ATC--TA-TTTT-G--------G-CA-A-T-T-----TCAG----T-G-A-T---C-AT-CTTTC-CCTATT-G-ATG
gi|73153                      :      TATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG-AAAA--------------------------------A-CAG---TT-----C----AAG----A-A-AA----T--AGTTC--GA---C------T--GTAGT----CAC-ATCGGTA-TTTT-------------G-A-TGT-----C--G----T-C-A-T---T-AT-T-TCCACCT-TT-G-
gi|73152                      :    aaattA----ATA--C-AA---T-----ATACGA---TG-GAAAGC---C-TC-A----T--AA-T-CTT---A-AACTAG---TT-----A----AAG----A-T-A-----T--A--TT--GA---C------T--AT-GT----CAC-AT---TATTTTT-T--------G-CA-A-TGCAAAAAT--GAATTT-G-A-T---T-CTGC-ACC-ACT-TT-G-ATG
gi|73167                      :         a----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG-AAG------C-T--C----T--A--T-TTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-T-C-----T--A--TT--GA---C------T--TT-G-----CAC-AT---TA-TTTT-T--------A-CA-A-TGTC----C--A----T-G-G-T---T-AT-C-T-C-CTT-TG-G-ATGG
gi|73161                      :          ----ATA--C-A----G-----ATA--A---TA-AAAG-----C-T--C----T--G--T-CTT---A-GA-TAG---TT-----C----ACG----A-A-A-----T--A--TT--GA---A------T--AT-TT----CAC-AT---T
gi|73154                      :     tgtac----ATA--C-AAATTT-----ATA--A---TG-AAAT-----C-T--C----T--A--T-TTT---G-AA-TAG---TT-----C----ATG----A-A-A-----T--A--TT--AA---A------T--AT-GT----CAC-AT---T
gi|73168                      :         aaatctTA--C-AA---T-----ATA--A---TG-AAAG-----C-T--T----T--A--A-CGT---A-AA-TAA---TTT----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C---------A--GT----CAC-AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TGC-----T--G----C-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73156                      :               TA--C-A----T-----ACA--AAAATG-AAAG-----C-T--C----T--A--T-GTT---A-AA-TAG---CT-----C----AGG----A-A-A-----T--A--TT--AAATTG------C--AT-GT----CAC-AT---TT-TTTT-T--------
gi|73169                      :          aaatcTA--CTA----T-----ATA--A---T--AAAG-----C-T-------T-----T-CAT---ATAA-TA----TT-----C----A-GCTTTA-A-A-----T---------GA---CA-----C--GT-AC----TAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73160                      :               TA--C-A----A-----ATA--A---TG-GAAG-----C-T--C----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TA-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---
gi|73170                      :             atacatg-A----C-----ATA--A---TG-AAAA-----GAT--C----T--A--TGCTT---A-TA-TAG---TT-----T----CAG----AGA-A-----T--A--T---GG---C------T--AT-GC----CACTAT---TA-TTTT-TTACCTTTTG-CATA-TGT-----C--G----TCG-A-T---TTAT-C-TCT-CCT-TT-GAATGG
gi|73171                      :                      ----T-----ATA--A---TG-AAAG-----C-T--T----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAA----A-T-A-----T--A--TT--GG---C------T--AT-GC----CAC-AT---TA-TTTT-T--------C-CT-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-G-TCG-CCT-TT-G-ATAG
gi|73172                      :                           -----ATA--A---TG-AAAG-----C-T--C----T--A--T-CTT---A-AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A-----T--AT-TT--GA---C------T--AT-GT----CAC-GT---TA-ATTT-T--------G-CA-A-TGT-----C--G----
gi|73173                      :                                               A-----C-T--C----T--A--T-TTT---A-AA-TAG---TC-----A----AAG----A-T-A-----G--A--CT--GA---C------T---T-G-----CAC-A----TA---TT-T--------A-CA-A-TGT-----C--A----T-G-------T-A---------CT-TT-G-ATGG
gi|73166                      :                                                           ----T--A--T-CTTG--A-AA-TAG---TT-----C----GA-----A-G-A-----TTAA--TT--GAA--C------T--AT-GT----CAG-ACC--TA-TTTT-TT-------G-CA-T-TGT-----T--G----T-GGA-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73174                      :                                                        ataacatcaagaagatcT---A-AA-TAG---CT-----C----AAG----A-A-A-----T--A--TT--GA---C------T--GT-GT----CAC-AT---TA-TATT-T--------G-CA-A-TGC-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TAC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73175                      :                                                                              -AG-TGG---TT-----CTTGGAAG----A-A-A-----T--T--TT--AA---A------T--AC-AC----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73176                      :                                                                                 -TGG---TT-----CTT--AAG----A-A-AATTTTT--AA-TT--GA---C------------AC----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73177                      :                                                                                                ----AAG----A-A-A-----A--A--TT--GA---CTACATGC--AT-GT----CAC-AT---TA-TTTT-T--------G-TA-A---------T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73180                      :                                                                                                ----AAG----A-AGA-----T--A--TT--TA-------------AT-GA----CAC-ACCC-TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CAT-TT-G-AT
gi|73157                      :                                                                                                     AA----A-A-A-----T--A--TT--GA---C-------------------A--AT---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TAT-----C--A----T-G-A-T---T-CT-T-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73181                      :                                                                                                                           aaatttatatacatatactgT-GT----CAC-AT---TA-TTTT----------G-CA-A-TGT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT---ATGG
gi|73184                      :                                                                                                                                                tgT----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73183                      :                                                                                                                                                  T----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TAT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TG-G-ATGG
gi|73185                      :                                                                                                                                                  T----CAC-CT---TA-TTTT-T--------G-CC-A-TTT-----C--A----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-A
gi|73209                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CATA-TTT-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73189                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CT---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73182                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CT---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73188                      :                                                                                                                                            gtgtcac----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73191                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73190                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73204                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----TC-G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73193                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CT---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73195                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73194                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73179                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73178                      :                                                                                                                               aagaagattttaaatgacac----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73196                      :                                                                                                                               aagaagattttaaatgacac----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CG-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73197                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATGG
gi|73199                      :                                                                                                                                                   ----CAC-AT---TA-TCTT----------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73198                      :                                                                                                                                                   ----CAC-GC---TG-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AC-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73202                      :                                                                                                                                                   ----CAC-AC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--A----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-A-ATGG
gi|73201                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTGT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73186                      :                                                                                                                                                   ----CAC--T---TA-ATTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73203                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TTGG-ATGG
gi|73208                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73207                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73206                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73205                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73200                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73192                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73187                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-A-TTC-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCG-TT-A-ATGG
gi|73213                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-A--C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73212                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT----------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73211                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--A----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73210                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-TCT-TT-G-ATG
gi|73215                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CT---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--A----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73214                      :                                                                                                                                                   ----CAC-CT---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--A----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73217                      :                                                                                                                                                         C-AC---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----T--G----T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
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gi|73221                      :                                                                                                                                                             ---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----T--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73220                      :                                                                                                                                                             ---TA-TTTT-T--------G-CA-C-TTT-----C--G----T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73219                      :                                                                                                                                                             ---TA-TTTT-T--------G-CA-T-TTT-----C--G----T-G-A-T---C-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG





Alignments
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lowQualScore                  :                          33333  11 1 0000000000   11 555  22   2   6666666 22 11 444   444   1   111  33333 3333   2222 0 2 11 11 22  11  0 0 0000000000 0  1111   5555555  0     22222222 0  22 3333333333333 0 0 0 0 0 1 111 0  0 0   0   0  0 0    
lowQualScore                  :                          .....  .. . ..........   .. ...  ..   .   ....... .. .. ...   ...   .   ...  ..... ....   .... . . .. .. ..  ..  . . .......... .  ....   .......  .     ........ .  .. ............. . . . . . . ... .  . .   .   .  . .    
lowQualScore                  :                          99999  88 2 5555555555   66 333  88   3   9999999 66 55 222   555   0   888  66666 3333   8888 9 7 22 22 22  22  9 9 7777777777 9  8888   5555555  5     88888888 5  00 9999999999999 5 5 5 5 5 0 888 5  5 5   5   5  5 5    
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Reference ( family-260 )      :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCTN------T--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73137                      :                      TATA-----TA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACTG------T--A--T---CTT---CAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-ATTTT--------G-TAA-T-----------G-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-C-AT
gi|73138                      :                 aaatATATA----ATA--T-A----A-----A-A--A---TG--AAA-GCTC------A--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-T-A-T---C-AT-C-TCC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73139                      :                  aaatTATA-----TA--G-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACTG------T--T--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AA------------T--A--TT--GA-C-C---G------T-GT----CAC-G-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-CT-G-ATGG
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gi|73143                      :                 aaatcTATA-----TA--C-G----G-----ATA--A---TG--AAA-GTTG------T--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----A----AAG----A-A-A--T--A--TT--TA-C-T------------GT----TAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TA-G-ATGG
gi|73144                      :                 aaatcTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-ACTA------T--A--T---CAT---AAA-TAG---GT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-TT----CAC--------A-TTTTT--------G-CGA-T-----------G-T-C-G-T-T-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73145                      :                aaatcATATA-----TA--A-A----T-----ATA--AAAATG--AAG---TC------A--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-GTT-T-A-T---C-AT-C-TCC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73146                      :                    aaTATA-----TG--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ATTG------T--A--T---CTC---AAA-TAC---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-C---G------T-GT----GAC-A-T---TA-GTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-AGTGAGT-AT-C-TCC-CCT-GT-G-AT
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gi|73158                      : aaatttatatacatatactgATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACTG------T--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-C---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
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gi|73160                      :                               TA--C-A----A-----ATA--A---TG--GAA-GCTC------T--A--T---CTT---AAA-TAG---TA-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-
gi|73161                      :                   atacatg----ATA--C-A----G-----ATA--A---TA--AAA-GCTC------T--G--T---CTT---AGA-TAG---TT-----C----ACG----A-A-A--T--A--TT--GA-A-T---A------T-TT----CAC-A-T---T
gi|73162                      :                 tgtacTATA----ATG---------------ATA--A---TG--AA--GCTC------TGAA--T---CTC---AAA-TAG---TT-----A----AAG----A-C-T--T--A--TT--GA-CCT---G------T-GT----CAC-ATC---TA-TTTTT--------G-TAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-A--C-TCT-CCT-TT-G-ATGG
gi|73163                      :                   attTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-GCTC------T--AAAT---CTT---AAA-TAT---AT-----C----AAG----A-A-A--T--A--AA--GA-C-T---A--------GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------TGT-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-T-C-CCT-TT-G-ATGG
gi|73164                      :                      TATA-----TA--C-A----------ATA--G---TG--AAAAGCTTACTATGT--A--TG--CTG---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--TA-T-TA--A------T-GT----CACAT-C---TA-TTTTG--------G-CAA-T-----------T-T-CAG-T-G-A-T---C-AT-CTTTC-CCTATT-G-ATG
gi|73165                      :                     ATATA----ACA----------------TG--A---TA--AAA-GCTC------T--A--T---CTT---AAA-TAG---AT-----C----AAG----A------T--A--T----A-C-T---A------T-GT----CAC--------A-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73166                      :                                                              AA-GATC------T--A--T---CTTG--AAA-TAG---TT-----C----GA-----A-G-A--TTAA--TT--GAAC-T---A------T-GT----CAG-A-CC--TA-TTTTTT-------G-CAT-T-----------G-T-T-G-T-GGA-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73167                      :               ataacatcaag----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AA--GCTC------T--A--T---TTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-T-C--T--A--TT--GA-C-T---T------T-G-----CAC-A-T---TA-TTTTT--------A-CAA-TG----------T-C-C-A-T-G-G-T---T-AT-C-T-C-CTT-TG-G-ATGG
gi|73168                      :                               TA--C-AA---T-----ATA--A---TG--AAA-GCTT------T--A--A---CGT---AAA-TAA---TTT----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-----A--------GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-C-T-G-C-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73169                      :                               TA--CTA----T-----ATA--A---T---AAA-GCTT------TC-A--T---AT-----AA-TA----TT-----C----A-GCTTTA-A-A--T---------GA-C-----A------C-GTAC--TAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73170                      :                                    -A----C-----ATA--A---TG--AAAAGATC------T--A--TG--CTT---ATA-TAG---TT-----T----CAG----AGA-A--T--A--T---GG-C-T---A------T-GC----CAC-TAT---TA-TTTTTTACCTTTTG-CATAT-----------G-T-C-G-TCG-A-T---TTAT-C-TCT-CCT-TT-GAATGG
gi|73171                      :                                      ----T-----ATA--A---TG--AAA-GCTT------T--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAA----A-T-A--T--A--TT--GG-C-T---A------T-GC----CAC-A-T---TA-TTTTT--------C-CTA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-G-TCG-CCT-TT-G-ATAG
gi|73172                      :                                           -----ATA--A---TG--AAA-GCTC------T--A--T---CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--AT-TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-G-T---TA-ATTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-
gi|73173                      :                                                                  CTC------T--A--T---TTT---AAA-TAG---TC-----A----AAG----A-T-A--G--A--CT--GA-C-T----------T-G-----CAC--------A-TATTT--------A-CAA-T-----------G-T-C-A-T-G-------T-A---------CT-TT-G-ATGG
gi|73174                      :                                                                                      aT---AAA-TAG---CT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TATTT--------G-CAA-T-----------G-C-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TAC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73175                      :                                                                                            AG-TGG---TT-----CTTGGAAG----A-A-A--T--T--TT--AA-A-T---A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73176                      :                                                                                              -TGG---TT-----CTT--AAG----A-A-AATT--T--TT--AA-T-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73177                      :                                                                                                             ----AAG----A-A-A--A--A--TT--GA-C-T---ACATGCAT-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-TAA-T-----------------G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73178                      :                                                                                                             ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73179                      :                                                                                                             ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73180                      :                                                                                                             ----AAG----A-AGA--T--A--TT--TA-------A------T-GA----CAC-A-CCC-TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CAT-TT-G-AT
gi|73181                      :                                                                                                                                             -T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTT---------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT---ATGG
gi|73182                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73183                      :                                                                                                                                                     gtgtcacT----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------A-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TG-G-ATGG
gi|73184                      :                                                                                                                                                            T----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73185                      :                                                                                                                                                            T----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CCA-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-A
gi|73186                      :                                                                                                                                                             ----CAC-T-----TA-ATTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73187                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------T-C-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCG-TT-A-ATGG
gi|73188                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73189                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73190                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73191                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73192                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73193                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73194                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73195                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73196                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CGT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73197                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATGG
gi|73198                      :                                                                                                                                                             ----CAC-G-C---TG-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AC-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73199                      :                                                                                                                                                             ----CAC-A-T---TA-TCTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73200                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73201                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTGTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73202                      :                                                                                                                                                             ----CAC-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-A-ATGG
gi|73203                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TTGG-ATGG
gi|73204                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-TTC-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
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gi|73206                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73207                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73208                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
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gi|73212                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73213                      :                                                                                                                                                             ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-A--C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
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gi|73220                      :                                                                                                                                                                        ---TA-TTTTT--------G-CAC-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73221                      :                                                                                                                                                                        ---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG





Alignments
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lowQualScore                  :                          33333  11 1 0000000000   11 555  22   2   444444 5555 11 33333   444   1   111  33333 3333   2222 0 2 11 11 22  11  0 000000000000 0  1111   5555555  0     22222222 0  22 3333333333333 0 0 0 0 0 1 111 0  0 0   0   0  0 0    
lowQualScore                  :                          .....  .. . ..........   .. ...  ..   .   ...... .... .. .....   ...   .   ...  ..... ....   .... . . .. .. ..  ..  . ............ .  ....   .......  .     ........ .  .. ............. . . . . . . ... .  . .   .   .  . .    
lowQualScore                  :                          99999  88 2 5555555555   66 333  88   3   999999 0000 55 99999   555   0   888  66666 3333   8888 9 7 22 22 22  22  9 111111111111 9  8888   5555555  5     88888888 5  00 9999999999999 5 5 5 5 5 0 888 5  5 5   5   5  5 5    
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Reference ( family-260 )      :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73137                      :                      TATA-----TA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---CAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-ATTTT--------G-TAA-T-----------G-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-C-AT
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gi|73150                      :                   aaATATAT---ATA--C-A----A-----ATG--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T------------AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--CT--GA-C-T---ACA----T-GTATACCAC-A-T---TA-TTTTC----------CAA-T-----------T-T-T-A-T-G-A-T---T-AT-C-TTC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73151                      :                    aaTATA-----TA--C-A----A-----ATA--A---TG--AAA-ACT--C---T----A--T-----CTT---GAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-A-T---A------T-GT----CA--------TA-TT
gi|73152                      :                    aaatcA----ATA--C-AA---T-----ATACGA---TGG-AAA-GC---C---TCATAA--T-----CTT---AAACTAG---TT-----A----AAG----A-T-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-A-T---TATTTTTT--------G-CAA-TGCAAAAATGAAT-T-----T-G-A-T---T-CTGC-ACC-ACT-TT-G-ATG
gi|73153                      :                     aTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-------------------------------AA-CAG---TT-----C----AAGA---A-A-A--T--AGTTC--GA-C-T---G------TAGT----CAC-A-TCGGTA-TTTT------------GA-T-----------G-T-C-G-T-C-A-T---T-AT-T-TCCACCT-TT-G-
gi|73154                      :                     aaatt----ATA--C-AAATTT-----ATA--A---TG--AAA-TCT--C---T----A--T-----TTT---GAA-TAG---TT-----C----ATG----A-A-A--T--A--TT--AA-A-T---A------T-GT----CAC-A-T---T
gi|73155                      :               aaatctATATAT---GTA--C-A----TGTCAAATA--A---TG--AAA-GCT--C---C----T--T-----CTTTAAAAA-TAG---TT----------GAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-AT----CAC-A-T---T
gi|73156                      :                             aaTA--C-A----T-----ACA--AAAATG--AAA-GCT--C---T----A--T-----GTT---AAA-TAG---CT-----C----AGG----A-A-A--T--A--TT--AA-A-TTGCA------T-GT----CAC-A-T---TT-TTTTT--------
gi|73157                      :                                                                                                                aaatcAA----A-A-A--T--A--TT--GA-C-A---A------T-----------------TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------A-T-C-A-T-G-A-T---T-CT-T-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73158                      : aaatttatatacatatactgATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-C---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73159                      :                     ATATACACTATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--G---T----A--T-----CTT-------------TT-----A----AAA----A-G-A--T--T--TTTAAA-T-G---A------C-AT----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------G-T-T-A-T-G-A-T---T-AT-C-TC
gi|73160                      :                               TA--C-A----A-----ATA--A---TG--GAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TA-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-
gi|73161                      :                   atacatg----ATA--C-A----G-----ATA--A---TA--AAA-GCT--C---T----G--T-----CTT---AGA-TAG---TT-----C----ACG----A-A-A--T--A--TT--GA-A-T---A------T-TT----CAC-A-T---T
gi|73162                      :                 tgtacTATA----ATG---------------ATA--A---TG--AA--GCT--C---TGA--A--T-----CTC---AAA-TAG---TT-----A----AAG----A-C-T--T--A--TT--GA-CCT---G------T-GT----CAC-ATC---TA-TTTTT--------G-TAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-A--C-TCT-CCT-TT-G-ATGG
gi|73163                      :                   attTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-GCT--C---T----AAAT-----CTT---AAA-TAT---AT-----C----AAG----A-A-A--T--A--AA--GA-C-T---A--------GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------TGT-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-T-C-CCT-TT-G-ATGG
gi|73164                      :                      TATA-----TA--C-A----------ATA--G---TG--AAAAGCTTAC---T----A--TGTATGCTG---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--TA-T-TA--A------T-GT----CACAT-C---TA-TTTTG--------G-CAA-T-----------T-T-CAG-T-G-A-T---C-AT-CTTTC-CCTATT-G-ATG
gi|73165                      :                     ATATA----ACA----------------TG--A---TA--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---AT-----C----AAG----A------T--A--T----A-C-T---A------T-GT----CAC--------A-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73166                      :                                                              AA-GAT--C---T----A--T-----CTTG--AAA-TAG---TT-----C----GA-----A-G-A--TTAA--TT--GAAC-T---A------T-GT----CAG-A-CC--TA-TTTTTT-------G-CAT-T-----------G-T-T-G-T-GGA-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73167                      :               ataacatcaag----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AA--GCT--C---T----A--T-----TTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-T-C--T--A--TT--GA-C-T---T------T-G-----CAC-A-T---TA-TTTTT--------A-CAA-TG----------T-C-C-A-T-G-G-T---T-AT-C-T-C-CTT-TG-G-ATGG
gi|73168                      :                               TA--C-AA---T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--T---T----A--A-----CGT---AAA-TAA---TTT----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-----A--------GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-C-T-G-C-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73169                      :                               TA--CTA----T-----ATA--A---T---AAA-GCT--T---TC---A--T-----AT-----AA-TA----TT-----C----A-GCTTTA-A-A--T---------GA-C-----A------C-GTAC--TAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73170                      :                                    -A----C-----ATA--A---TG--AAAAGAT--C---T----A--TG----CTT---ATA-TAG---TT-----T----CAG----AGA-A--T--A--T---GG-C-T---A------T-GC----CAC-TAT---TA-TTTTTTACCTTTTG-CATAT-----------G-T-C-G-TCG-A-T---TTAT-C-TCT-CCT-TT-GAATGG
gi|73171                      :                                      ----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--T---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAA----A-T-A--T--A--TT--GG-C-T---A------T-GC----CAC-A-T---TA-TTTTT--------C-CTA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-G-TCG-CCT-TT-G-ATAG
gi|73172                      :                                           -----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--AT-TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-G-T---TA-ATTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-
gi|73173                      :                                                                  CT--C---T----A--T-----TTT---AAA-TAG---TC-----A----AAG----A-T-A--G--A--CT--GA-C-T----------T-G-----CAC--------A-TATTT--------A-CAA-T-----------G-T-C-A-T-G-------T-A---------CT-TT-G-ATGG
gi|73174                      :                                                                                         aT---AAA-TAG---CT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TATTT--------G-CAA-T-----------G-C-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TAC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73175                      :                                                                                               AG-TGG---TT-----CTTGGAAG----A-A-A--T--T--TT--AA-A-T---A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73176                      :                                                                                                 -TGG---TT-----CTT--AAG----A-A-AATT--T--TT--AA-T-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73177                      :                                                                                                                ----AAG----A-A-A--A--A--TT--GA-C-T---ACATGCAT-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-TAA-T-----------------G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73178                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73179                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73180                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--A--TT--TA-------A------T-GA----CAC-A-CCC-TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CAT-TT-G-AT
gi|73181                      :                                                                                                                                                -T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTT---------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT---ATGG
gi|73182                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73183                      :                                                                                                                                                        gtgtcacT----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------A-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TG-G-ATGG
gi|73184                      :                                                                                                                                                               T----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73185                      :                                                                                                                                                               T----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CCA-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-A
gi|73186                      :                                                                                                                                                                ----CAC-T-----TA-ATTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73187                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------T-C-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCG-TT-A-ATGG
gi|73188                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73189                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73190                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73191                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73192                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
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gi|73201                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTGTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73202                      :                                                                                                                                                                ----CAC-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-A-ATGG
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gi|73205                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73206                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73207                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73208                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73209                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CATAT-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
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gi|73212                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
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gi|73215                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73216                      :                                                                                                                                                                      C-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-GTAG
gi|73217                      :                                                                                                                                                                      C-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
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Alignments
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Reference ( family-260 )      :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73137                      :                      TATA-----TA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---CAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-ATTTT--------G-TAA-T-----------G-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-C-AT
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gi|73178                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73179                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73180                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--A--TT--TA-------A------T-GA----CAC-A-CCC-TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CAT-TT-G-AT
gi|73181                      :                                                                                                                                                -T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTT---------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT---ATGG
gi|73182                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73183                      :                                                                                                                                                        gtgtcacT----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------A-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TG-G-ATGG
gi|73184                      :                                                                                                                                                               T----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73185                      :                                                                                                                                                               T----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CCA-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-A
gi|73186                      :                                                                                                                                                                ----CAC-T-----TA-ATTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73187                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------T-C-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCG-TT-A-ATGG
gi|73188                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73189                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73190                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73191                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73192                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73193                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73194                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73195                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73196                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CGT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73197                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATGG
gi|73198                      :                                                                                                                                                                ----CAC-G-C---TG-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AC-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73199                      :                                                                                                                                                                ----CAC-A-T---TA-TCTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73200                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73201                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTGTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73202                      :                                                                                                                                                                ----CAC-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-A-ATGG
gi|73203                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TTGG-ATGG
gi|73204                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-TTC-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73205                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73206                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73207                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73208                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73209                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CATAT-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73210                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-TCT-TT-G-ATG
gi|73211                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73212                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73213                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-A--C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73214                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73215                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73216                      :                                                                                                                                                                      C-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-GTAG
gi|73217                      :                                                                                                                                                                      C-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73218                      :                                                                                                                                                                           ---TA-TATTG--------G-CAA-T-----------G-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73219                      :                                                                                                                                                                          t---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---C-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73220                      :                                                                                                                                                                           ---TA-TTTTT--------G-CAC-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73221                      :                                                                                                                                                                           ---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG


blockSeqs                     :                          CACTA  TG T TGTCAA       CG AAA  CA   A   GCATG  CATA AA GTATG   TAA   C   ACC  GTATT TTGG   CTTT   G AT TA GT  TA    TACATGCA        ATAC   ATCGG          TACCTTTT    TA GCAAAAATGAAT            G GAG
blockSeqs                     :                          TA     .  . AATTT        .  AAA  G    A   TAC    GA   .  G       TT    .   .    T     TT     A      G .  .  T   .     TTGCA           AC     ACCC           T           TA TG                      G GAG
blockSeqs                     :                          TA     .  . AT           .  A    .    .   C      C    .  .       G     .   .    .     .      .      G .  .  .   .     CGAG            .      ATC            T           A  GT                      . .  
blockSeqs                     :                          TA     .  . AT           .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TACA            .      ATC            .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          TA     .  . A            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     CTG             .      ACC            .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          TG     .  . T            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TAA             .      TAT            .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . T            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TGA             .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . T            .  .    .    .   A      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TGA             .      GT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . T            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TGA             .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . G            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . A            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     CG              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . T            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TG              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . T            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TG              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . T            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          A      .  . C            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     CG              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . A            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TG              .      AT             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . A            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AC             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . A            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  A                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . A            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TG              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . T            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           T  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . T            .  .    .    .   G      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . T            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     AA              .      AT             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . A            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     CA              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . G            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     GA              .      CC             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . A            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           T  G                       . .  
blockSeqs                     :                          .      .  . T            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                                 .  . T            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                                 .  . C            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           T  G                       . .  
blockSeqs                     :                                 .  . T            .  .    .    .   T      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TT              .      CC             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                                 .  . .            .  .    .    .   T      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                                    . .            .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      GT             .           A  G                       . .  
blockSeqs                     :                                      .            .  .    .    .   T      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      AT             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                   .  .    .    .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TG              .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                .   C      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TA              .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                    .      .    .  .       .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     TG              .      AT             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                           .     .   .    .     .      .      . .  .  .   .     T               .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                 .   .    .     .      .      . .  .  .   .     A               .      CC             .           T  G                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                 .   .    .     .      .      . .  .  .   .     A               .      AT             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                .      .      . .  .  .   .     T               .      CT             .           A  A                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                .      .      . .  .  .   .     A               .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                .      .      . .  .  .   .     .               .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                .      .      . .  .  .   .     .               .      CT             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                       .      . .  .  .   .     .               .      CC             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CT             .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CT             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      GC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      AT             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      AC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CT             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      CT             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      AC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      AC             .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      T              .           T  G                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      .              .           A  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      .              .           T  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .      .              .           C  T                       . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                       .              .           T  .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                       .              .                                           


blockSeqCons                  :                     
originalCons                  :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
finalCons                     :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG





Alignments
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lowQualScore                  :                          33333  11 1 0000000000   11 555  22   2   444444 5555 11 33333   444   1   111  33333 3333   2222 0 2 11 11 22  11  0 000000000000 0  1111   5555555  0     22222222 0  22 3333333333333 0 0 0 0 0 1 111 0  0 0   0   0  0 0    
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lowQualScore                  :                          99999  88 2 5555555555   66 333  88   3   999999 0000 55 99999   555   0   888  66666 3333   8888 9 7 22 22 22  22  9 111111111111 9  8888   5555555  5     88888888 5  00 9999999999999 5 5 5 5 5 0 888 5  5 5   5   5  5 5    
consensus                     :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
Reference ( family-260 )      :                     ATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-N-C---TA-TTTTT--------G-CAN-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73137                      :                      TATA-----TA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---CAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-ATTTT--------G-TAA-T-----------G-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-C-AT
gi|73138                      :                 aaatATATA----ATA--T-A----A-----A-A--A---TG--AAA-GCT--C---A----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-T-A-T---C-AT-C-TCC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73139                      :                  aaatTATA-----TA--G-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----T--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AA------------T--A--TT--GA-C-C---G------T-GT----CAC-G-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-CT-G-ATGG
gi|73140                      :                aaatcATACAT---ATA--C-C----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----GAT---AAA-TAG---TT-----C----AGG----A-A-A--T--A--TT--GA-C------------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTCT--------G-TAA-T-----------G-T-C-G-C-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73141                      :                   aaATACAT---ATA--C-C----T-----ATA--AA--TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----GAT---AAA-TAG---TT-----C----AGG----A-A-A--T--A--TT--GA-C------------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTCT--------G-TAA-T-----------G-T-C-G-C-G-A-T---T-A--C-T-C-TTT-TT-G-ATGG
gi|73142                      :                    aaTATA-----TA--C-A----T-----AAA--A---TG--AAA-ACTG-CATGT----A--T-----CTTTT-AAA-TAA---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--AA--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTTT-------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73143                      :                 aaatcTATA-----TA--C-G----G-----ATA--A---TG--AAA-GTT--G---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----A----AAG----A-A-A--T--A--TT--TA-C------------T-GT----TAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TA-G-ATGG
gi|73144                      :                 aaatcTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-ACT--A---T----A--T-----CAT---AAA-TAG---GT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-TT----CAC--------A-TTTTT--------G-CGA-T-----------G-T-C-G-T-T-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73145                      :                aaatcATATA-----TA--A-A----T-----ATA--AAAATG--AAG---T--C---A----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-GTT-T-A-T---C-AT-C-TCC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73146                      :                    aaTATA-----TG--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ATT--G---T----A--T-----CTC---AAA-TAC---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-C---G------T-GT----GAC-A-T---TA-GTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-AGTGAGT-AT-C-TCC-CCT-GT-G-AT
gi|73147                      :                aaatcATCTA----ATATGC-A----T-----ATA--A---TGCAAAA-TTT--G---T----A--T-----CTC---ACA-TATACCTT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-CGA-G------T-GT----GAC-A-T---TA-GTTTT--------GCCAA-T-----------G-T-C-G-T-G-AGTGAGT-AT-C-TCC-CCT-GT-G-AT
gi|73148                      :                    aaTATA-----TA--C-A----C-----ATA--A---TA--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAA----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T----------T-GT----CAA-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-
gi|73149                      :                aaatcATATAT---ATT--C-A----A-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---AGA-TAA---TTGTATTC----AAG----A-A-A--T--A--CT--GA-C-T---G------T-GT----GAC-A-C---TT-TTTAT--------G-CAA-T-----------G-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-
gi|73150                      :                   aaATATAT---ATA--C-A----A-----ATG--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T------------AA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--CT--GA-C-T---ACA----T-GTATACCAC-A-T---TA-TTTTC----------CAA-T-----------T-T-T-A-T-G-A-T---T-AT-C-TTC-CAT-TT-G-ATGG
gi|73151                      :                    aaTATA-----TA--C-A----A-----ATA--A---TG--AAA-ACT--C---T----A--T-----CTT---GAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-A-T---A------T-GT----CA--------TA-TT
gi|73152                      :                    aaatcA----ATA--C-AA---T-----ATACGA---TGG-AAA-GC---C---TCATAA--T-----CTT---AAACTAG---TT-----A----AAG----A-T-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-A-T---TATTTTTT--------G-CAA-TGCAAAAATGAAT-T-----T-G-A-T---T-CTGC-ACC-ACT-TT-G-ATG
gi|73153                      :                     aTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-------------------------------AA-CAG---TT-----C----AAGA---A-A-A--T--AGTTC--GA-C-T---G------TAGT----CAC-A-TCGGTA-TTTT------------GA-T-----------G-T-C-G-T-C-A-T---T-AT-T-TCCACCT-TT-G-
gi|73154                      :                     aaatt----ATA--C-AAATTT-----ATA--A---TG--AAA-TCT--C---T----A--T-----TTT---GAA-TAG---TT-----C----ATG----A-A-A--T--A--TT--AA-A-T---A------T-GT----CAC-A-T---T
gi|73155                      :               aaatctATATAT---GTA--C-A----TGTCAAATA--A---TG--AAA-GCT--C---C----T--T-----CTTTAAAAA-TAG---TT----------GAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---A------T-AT----CAC-A-T---T
gi|73156                      :                             aaTA--C-A----T-----ACA--AAAATG--AAA-GCT--C---T----A--T-----GTT---AAA-TAG---CT-----C----AGG----A-A-A--T--A--TT--AA-A-TTGCA------T-GT----CAC-A-T---TT-TTTTT--------
gi|73157                      :                                                                                                                aaatcAA----A-A-A--T--A--TT--GA-C-A---A------T-----------------TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------A-T-C-A-T-G-A-T---T-CT-T-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73158                      : aaatttatatacatatactgATATA----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-ACT--G---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-C---A------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73159                      :                     ATATACACTATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--G---T----A--T-----CTT-------------TT-----A----AAA----A-G-A--T--T--TTTAAA-T-G---A------C-AT----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------G-T-T-A-T-G-A-T---T-AT-C-TC
gi|73160                      :                               TA--C-A----A-----ATA--A---TG--GAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TA-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-
gi|73161                      :                   atacatg----ATA--C-A----G-----ATA--A---TA--AAA-GCT--C---T----G--T-----CTT---AGA-TAG---TT-----C----ACG----A-A-A--T--A--TT--GA-A-T---A------T-TT----CAC-A-T---T
gi|73162                      :                 tgtacTATA----ATG---------------ATA--A---TG--AA--GCT--C---TGA--A--T-----CTC---AAA-TAG---TT-----A----AAG----A-C-T--T--A--TT--GA-CCT---G------T-GT----CAC-ATC---TA-TTTTT--------G-TAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-A--C-TCT-CCT-TT-G-ATGG
gi|73163                      :                   attTATA-----TA--C-A----A-----TTA--A---TG--AAA-GCT--C---T----AAAT-----CTT---AAA-TAT---AT-----C----AAG----A-A-A--T--A--AA--GA-C-T---A--------GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------TGT-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-T-C-CCT-TT-G-ATGG
gi|73164                      :                      TATA-----TA--C-A----------ATA--G---TG--AAAAGCTTAC---T----A--TGTATGCTG---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--TA-T-TA--A------T-GT----CACAT-C---TA-TTTTG--------G-CAA-T-----------T-T-CAG-T-G-A-T---C-AT-CTTTC-CCTATT-G-ATG
gi|73165                      :                     ATATA----ACA----------------TG--A---TA--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---AT-----C----AAG----A------T--A--T----A-C-T---A------T-GT----CAC--------A-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73166                      :                                                              AA-GAT--C---T----A--T-----CTTG--AAA-TAG---TT-----C----GA-----A-G-A--TTAA--TT--GAAC-T---A------T-GT----CAG-A-CC--TA-TTTTTT-------G-CAT-T-----------G-T-T-G-T-GGA-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73167                      :               ataacatcaag----ATA--C-A----T-----ATA--A---TG--AA--GCT--C---T----A--T-----TTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-T-C--T--A--TT--GA-C-T---T------T-G-----CAC-A-T---TA-TTTTT--------A-CAA-TG----------T-C-C-A-T-G-G-T---T-AT-C-T-C-CTT-TG-G-ATGG
gi|73168                      :                               TA--C-AA---T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--T---T----A--A-----CGT---AAA-TAA---TTT----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-----A--------GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------G-C-T-G-C-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73169                      :                               TA--CTA----T-----ATA--A---T---AAA-GCT--T---TC---A--T-----AT-----AA-TA----TT-----C----A-GCTTTA-A-A--T---------GA-C-----A------C-GTAC--TAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73170                      :                                    -A----C-----ATA--A---TG--AAAAGAT--C---T----A--TG----CTT---ATA-TAG---TT-----T----CAG----AGA-A--T--A--T---GG-C-T---A------T-GC----CAC-TAT---TA-TTTTTTACCTTTTG-CATAT-----------G-T-C-G-TCG-A-T---TTAT-C-TCT-CCT-TT-GAATGG
gi|73171                      :                                      ----T-----ATA--A---TG--AAA-GCT--T---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAA----A-T-A--T--A--TT--GG-C-T---A------T-GC----CAC-A-T---TA-TTTTT--------C-CTA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-G-TCG-CCT-TT-G-ATAG
gi|73172                      :                                           -----ATA--A---TG--AAA-GCT--C---T----A--T-----CTT---AAA-TAG---TT-----C----AAG----A-A-A--T--AT-TT--GA-C-T---A------T-GT----CAC-G-T---TA-ATTTT--------G-CAA-T-----------G-T-C-G-
gi|73173                      :                                                                  CT--C---T----A--T-----TTT---AAA-TAG---TC-----A----AAG----A-T-A--G--A--CT--GA-C-T----------T-G-----CAC--------A-TATTT--------A-CAA-T-----------G-T-C-A-T-G-------T-A---------CT-TT-G-ATGG
gi|73174                      :                                                                                         aT---AAA-TAG---CT-----C----AAG----A-A-A--T--A--TT--GA-C-T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TATTT--------G-CAA-T-----------G-C-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TAC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73175                      :                                                                                               AG-TGG---TT-----CTTGGAAG----A-A-A--T--T--TT--AA-A-T---A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73176                      :                                                                                                 -TGG---TT-----CTT--AAG----A-A-AATT--T--TT--AA-T-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73177                      :                                                                                                                ----AAG----A-A-A--A--A--TT--GA-C-T---ACATGCAT-GT----CAC-A-T---TA-TTTTT--------G-TAA-T-----------------G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73178                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73179                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--T--TT--AA-A-TG--A------C-AC----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73180                      :                                                                                                                ----AAG----A-AGA--T--A--TT--TA-------A------T-GA----CAC-A-CCC-TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CAT-TT-G-AT
gi|73181                      :                                                                                                                                                -T---G------T-GT----CAC-A-T---TA-TTTT---------G-CAA-T-----------G-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT---ATGG
gi|73182                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73183                      :                                                                                                                                                        gtgtcacT----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------A-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TG-G-ATGG
gi|73184                      :                                                                                                                                                               T----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73185                      :                                                                                                                                                               T----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CCA-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-A
gi|73186                      :                                                                                                                                                                ----CAC-T-----TA-ATTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73187                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAA-T-----------T-C-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCG-TT-A-ATGG
gi|73188                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73189                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73190                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73191                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73192                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73193                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73194                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73195                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73196                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CGT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73197                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATGG
gi|73198                      :                                                                                                                                                                ----CAC-G-C---TG-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AC-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73199                      :                                                                                                                                                                ----CAC-A-T---TA-TCTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TC-G-ATGG
gi|73200                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AT
gi|73201                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTGTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73202                      :                                                                                                                                                                ----CAC-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-A-ATGG
gi|73203                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TTGG-ATGG
gi|73204                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-TTC-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73205                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73206                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73207                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73208                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-AAGG
gi|73209                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CATAT-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73210                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-TCT-TT-G-ATG
gi|73211                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATG
gi|73212                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTT---------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73213                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-A--C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73214                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73215                      :                                                                                                                                                                ----CAC-C-T---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CTT-TT-G-ATG
gi|73216                      :                                                                                                                                                                      C-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-GTAG
gi|73217                      :                                                                                                                                                                      C-A-C---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-A-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73218                      :                                                                                                                                                                           ---TA-TATTG--------G-CAA-T-----------G-T-C-A-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73219                      :                                                                                                                                                                          t---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---C-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73220                      :                                                                                                                                                                           ---TA-TTTTT--------G-CAC-T-----------T-T-C-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG
gi|73221                      :                                                                                                                                                                           ---TA-TTTTT--------G-CAT-T-----------T-T-T-G-T-G-A-T---T-AT-C-TCC-CCT-TT-G-ATGG