lowQualScore                  :                       4  555 0 0 111 11 22222222 22222222 1 2 0 1111 1 33 333 33 00 11 1 0 1  11 1 444 11  11 1 22222 1 0 22  2222222 111 0 0 0 11 2222 22222222222 11 77777777 000 3333 00 1111 11 33333333333333 55555555  0 11 111  1 0 0 0   
lowQualScore                  :                       .  ... . . ... .. ........ ........ . . . .... . .. ... .. .. .. . . .  .. . ... ..  .. . ..... . . ..  ....... ... . . . .. .... ........... .. ........ ... .... .. .... .. .............. ........  . .. ...  . . . .   
lowQualScore                  :                       1  000 7 7 666 55 55555555 55555555 1 1 5 1111 1 00 444 44 77 22 0 5 0  77 0 444 22  66 8 66666 1 4 11  1111111 111 4 3 7 22 4444 88888888888 55 66666666 666 9999 88 8888 22 11111111111111 11111111  4 22 333  1 4 4 4   
consensus                     :                    ACGGAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
Reference ( gi|8248 )         :                    ACGAAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8251                       :                    ACGGAC---G-G-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8254                       :                    ACGGAC-T-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--T--G-T-CCAA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-A-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8252                       :                    ACGGAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-T-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8255                       :                    ACGGAC-T-G-A-C--TG--A--------T--------T-G-A-CGGACA-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----AACCGTTGCGCAA--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8256                       :                    ACGGAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A------A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CAT-T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-GC-C----A-----------A--C----T---C---G----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8260                       :                    ACGGAT-T-G-A-C--TG--A--------C--------A-G-AAC----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-T-A--CC-----------T-C-C-G--C----A-----------AA-C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8257                       :                    ACGGACCT-G-A-C--TGCAA--------C--------TTGTA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--TCT-----ACT-A--CC-------C---T-C-C---------------------------------C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8266                       :                    ACGGAC---G-A-C--TG--A--------CGGGCACCCT-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AAT-A-ACC-A--CA--T-T-----A-T-AC-CC-------C---T-C-CAG--C----A-----------A--C----T---C--------T--T----G--C--------------GCCCT----GGTG--GT--TA-T-A-A-TAA
gi|8276                       :                    ACGGAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----
gi|8264                       :                    ACGGAC-G-GGA-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----TTG--A---C--G--G--T-C-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-A-T--CC-------CTCGT-C-C-G--C----A-----------AT-C----TGTAC---G----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-A-A-A-TAAgtgatcgagaaactgactgacagaacgggatcgagaaaacatttcccccatccgcaacctcgttgcgtgggtta
gi|8268                       :                    ACGGCC-T-G-A-C--TG--A--------C--------G-G-A-C----T-G--A---T--G--G--G-T-C--A--A-A---A--TA--A-T-----A-A-A--CC-------------C-A-G--C----A-----------A--C----TC--C---G----C--T----G--C--------------G---T----GC-G--G---TA-T-A-A-
gi|8269                       :                    ACGGAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------G-G-A-C----G-A--A---C--G--G--A-T-A-AA--A-A---T--TA--T-------A-T-A--CC-------C---C-C-A-G--C----A-----------A--C----TA--T---G----G--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8270                       :                    ACGGAC-A-G-A-C--TG--ATATAAAGAC--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-T-A--TC-------C-----C-A-G--C----A-----------A--CT---T---C---A----T--T----G--C--------------A---T----GT-G--A---TA-C-A-
gi|8272                       :                    ACGGAC-A-G-A-C---G--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-T-A--CC-------C---C-C-C-A-------A-----------A--CT---T---C---GT---T--T----G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8273                       :                    ACAGAC-G-G-A-C--GG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-T-AC-CC-------C---T-C-C-A-------A-----------A--CG---T---C---GT---T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8274                       :                    ACGGAC---G-G-C--AG--A--------C--------G-G-A-C----A-GC-A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-C---C--TA--A-T-----A-T-A--CC-------C---C-C-C----C----A-----------A--C----TT--C---G----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8275                       :                    ACAGAC-A-G-A-C--GG--A--------T--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-CCT-A--TA--TAC-----A-T-A--CC-------C---C-C-C-A-------A-----------A--C----TT--C---G----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8277                       :                    ACAGAC-G-G-A-C--AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--G--G--A---C-AG--A-G---T--GA--T-TCCTATA-T-A--CC-------C---C-C-C-C--CCCCAA-----------A--C----T---T---G----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8280                       :                     CGGAC-TTG-A-C--T------------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A---C-------C---T-C-C-G--CGCA-A-----------A--CAT--T---C---G----T--T----G--C--------------GT--T----GG-G--T---TA-T-A-A-T
gi|8281                       :                      GGAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-G-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8282                       :                      GGAC-T-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8286                       :                      GGAC-C-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--A--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---A----T--T----G--C--------------A---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8287                       :                      GGAC-T-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---TAC-C-A--CA---A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8288                       :                      GGAC-T-G-A-C--GG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T--------C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8283                       :                      GGAC-T-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--CA---T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8289                       :                      GGAC-T-G-A-C--GG--AA-------C--------T-G---C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G------T-A-A-TAA
gi|8291                       :                      GATC-T-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--CA---T---C---GT---T--T----G--A--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8293                       :                     gGGAC-TCG-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CAG-T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----AAG---------A--C----T---C---G----T--T----GTTC--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TA
gi|8295                       :                      GGAC-T-G-G-A--CG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-TTC-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-G-G--C----A-----------A-------T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TGA
gi|8297                       :                      GAAC-T-G-A-CGTCG--A--------C----------G-A-C----A-G--ATAGC--G--G--G-T-C-AA--ATA---A--CAGATAT-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A--------------C----T---C---G----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8267                       :                      GAAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------G-G-A-C------G--A---C--G--G--G-T-C-CA--A-A---A--CA--A-T-----A-T-A--CC-------------C-G-G--C----A-----------A--T----T---C---G----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--T---TA-T-A-T-TA
gi|8298                       :                   acgGAAC-T-G-A-C--AG--A--------C--------T-G-A------A-GT-A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CG--T-T-----A-T-A--TC-------C---T-G-T-G--C----A-----------A--A----C---C---A----T--T----G--A--------------G---A----GG-A--G---TT-T-A-A-T
gi|8303                       :                        AC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8249                       :                        AC-G-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-T-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8250                       :                    actgAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----A--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8258                       :                    actgAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-------A-A---A--CA--T-T-----AAT-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8259                       :                    actgAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----T-A--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-T-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-ATA-TA
gi|8300                       :                        AC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--G-T-C-AA--A-T---A--CAA-T-C-----T-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--CCAACT---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8261                       :                       gAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------TTG-A-C----A-G--A---C--G--C--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-C-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-T--A---TA-T-
gi|8301                       :                   acggtAC-T-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-GGGA---C--G--G--TCT-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-T--AC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--GT--TA-T-A-A-
gi|8262                       :                       gAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A------CA--T-TCC---A-T-A--CC-----------T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8263                       :                    actgAC-G-G-A-C--TG--A--------C--------G-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AAG-A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CCCG-----C---T-C-C-G--C----A-----------A--CG---T---C---G----T--T----T--G--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8304                       :                    actgAC-T-G-AAC--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-A-C-AA--ACA---A--CA--T-T-----A-T-AC-CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------CT-C----C---C---G----TCGT----G--C--------------G---T----TG-G--G---TA-T-A-
gi|8271                       :                        AC-G-G-A-C--TG--A-------------------G-A-C----G-A--A---CC-G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A---A---C-------C---T-C-C-G-------------------A--C----T-------G----T--T----G--C--------------T---TA---GG-G--G---TA-T-A-T-TA
gi|8253                       :                        AC-G-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C------G--A---T--G--GT-G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-------------C---T-C-CTG--C----A-----------------------------------T----G--C--------------GT--T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8305                       :                    actgAC-T-G-A-C--AG--A--------C--------A-G-A-C----G-G--A---C--A--G--G-T-C-GA--T-T---C--CA--A-T-----A-T-A--CC-------C-----C-C-G--C----A-----------A--A--------C---GAAGTT--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8302                       :                        AC-G-G-A-C--AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---CAGG--G--G-T----A--A-A---A--CA--G-T-----A-T-A--CC-------C---C-C-C-C--T-------------------C----T---C---C----T--TTGGAG--C--------------G--------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8284                       :                         g-T-G-A-C--GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--CA---T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8290                       :                     ggact-T-G-A-C--GG--A--------CC-------T-GTA-C----A-G--AA--C--GACG--T-T-C-AA--A-A---ATACA--T-T-------T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8285                       :                         gga-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----A--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8306                       :                    ggactgac-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-----------A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---CA-T-A-A-T
gi|8307                       :                            -G-A-C--TG--G--------C--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----G-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---A---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-A--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8294                       :                            -G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--T-T-C-AA--A-A---G--CA--T-----------A--AC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8296                       :                   ggactgatg-G-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-GG-A---C--G--G--G-T-CCAA--A-A---A--CC--A-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G-------A-----------A--T----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TATT-A-A-TAA
gi|8299                       :                    ggactgac-G-A-C--TGGGA--------C--------T-G-A-C----T-G--A---T--T--G--G-T-T-AA--A-A---AA-CA--T-T-----T-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C--------------------T----G--C--------------G---T-----G-A--G---TA-T-G-A-T
gi|8278                       :                           g-G-A-C--AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-A-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-T-G--CC-------C---C-C-C-G-------A-----------T--CT---T---C---GA---T--C----A--C--------------G--------GG-G--G---CA-T-A-A-TA
gi|8279                       :                     acagaag-G-A-C--AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-C-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-T-G---T-------C---T-C-C-C--C----A-----------A-----------C---A----T--T----G--T--------------G---G----GG-G--GAGACA-T-A-A-TAA
gi|8265                       :                    acggacgcca-A-C--GG--A--------C--------T-GCA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-T-A--CG-------C---T-C-C-G--T----AC----------A--C----T---C---GT---T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TA-TAA-A-TAA
gi|8308                       :                         acgga-A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--ATCAC--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--
gi|8276                       :                              -A-C--TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--GAT-C-GAGAA-A---A--CA--T-T-------T-C--CC-------CCA-T-C-C-G--C----A-----------A--CC---T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--T---TA-
gi|8309                       : acggactgactgactgacgtgatcgagaa-A-C--TA--A--------C--------A-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-C-AT--G-A---A--CA--T-A-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-A--C----A-----------A--C----T---T---G----T--T----G--C--------------A---TTATATG-G--G---TA-T-G-A-AAA
gi|8310                       :                                  --TG--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-C-A--CC-------G---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8311                       :                                  --TG--A--------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TACT-A-A-T
gi|8312                       :                                  --TG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA----T-----A---A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--
gi|8292                       :                                     G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-G---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8315                       :                                    gG--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--C-T-T-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---A----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8316                       :                                     G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G---C-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-T-C-G--CA---A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-GCTT---TA-T-A-A-CAA
gi|8317                       :                                     G--A--------C--------T-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-A-AA--A-A---C--CA--T-T-----A-T-A--AC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---A----T--T----G--T--------------G---T-----G-G--G---CA-T-A-A-TAA
gi|8318                       :                                     G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G------C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A---C-------C---T-C-C-G--C----A-----------A-------T---C---G----A--T----G--CG-------------G---TG---GG-G--G---TA-G-A-A-TAA
gi|8313                       :                                     G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--T-TAA---A-A-A--CC-------T---C-C-C-G--CA---A-----------A--C----T---C---C----T--T----G--C--------------A---T-----G-A--G---TA-T-A-A-
gi|8314                       :                                     G--A--------C--------T-GGA-C----G-G------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CT--T-T-----A-C-A--TG-----------T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--CG-------------G---TGG--GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8319                       :                                     G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-A-AA--A-A---A--CT--A-T-----A-T-A--AC-------C-----C-A-G--C----A-----------A--CT---T---T---G----T--T----G--C--------------A---T----GC-G--G---TA-T-A-
gi|8320                       :                                      --A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CC--T-T-----A-T-AGGCCTT-----C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---G---G----T--T----T--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8321                       :                                                  --------T-G-A-C----G-GGAA---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T----CCTTCAGTGC---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---G---G----T--T----T--C--------------GT--T----GG-G--G---TT-T-A-A-TAA
gi|8322                       :                                                           -G-A-C----ATG--A---C--G--G----T-C-AA--A-ATTCC--CA--T-T-----A-T-A--CC-----------T-C-C-G--C----AT----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8323                       :                                                             -A-C----G-G--A---C--G--CACG-T-C-AG--C-G---A--TG--C-T-----A-T-ATCCC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8324                       :                                                               -C----A-G--A---C--T--G--------AA--A-A---A--CA--T-A-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--C----G--CCCCGGGCTCATCGTG---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8325                       :                                                                                  --G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C-------------------------------------------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8326                       :                                                                                            -AA--A-A---A--CA--T-----------A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GA-G--G---AA-T-A-A-AAA
gi|8295                       :                                                                                                        --CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A-----------C---GA---T--T----G--C--------------C---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8327                       :                                                                        ggactggacgactgactgactggttcaaaaac--CA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---T---G----T--T----G--C--------------A---TG---GG-G--G---TA-T-A-A-TAAa
gi|8303                       :                                                                                                           A--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8281                       :                                                                              actgactgactgacagacgggtcaaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TC-T-A-A-T
gi|8249                       :                                                                            ggactgactgactgacagacgggtcaaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------A---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8251                       :                                                                          actgacggactgactgacagacgggtcaaaaacA--T-T-----A-C-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8254                       :                                                                           acggacggctgactgacagatgggtcaaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---T----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8252                       :                                                                         acggactgacggactgacagacgtgtccaaaaacA--T-T-----A-C-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G---TA-T-A-A-Taa
gi|8286                       :                                                                          acggacggactgactgacagatgggtcaaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-T-G--C----A-----------A--T----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8258                       :                                                                            ggaccgacggactgactgacaggtcaaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TATT-A-A-Taa
gi|8288                       :                                                                              actgactgactgactgacagacggtaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--------------------------AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8300                       :                                                                             ggactgacggacggacagacgggtcaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--CGAGTT---G---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-aa
gi|8307                       :                                                                       gactgactgactgacagaacgggtcaaatacaatctA--T-C-----A-T-A--CT-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----T---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-C-A-A-Taa
gi|8260                       :                                                                                 gactggcggactgacgggtcaaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---GT---T--T----G--C--------------G--------GA-G--G---TA-T-A-A-aa
gi|8311                       :                                                                        acggattgactgacagaacagacggtcaaaaacatA--T-T-----AGT-A--CC-------C---C-A-C-GG-C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-Taa
gi|8293                       :                                                                                     tgattgacagacgggtcaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-GAAC----A-----------A--CGAG-T---C--------T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8294                       :                                                                          ggactcgacggactgacagacgggtcaaaacagA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--T---TA-T-a
gi|8315                       :                                                                        ggactgatggactgactgacagacggttcaaaagcA--T-C-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-A--C----A-----------A--T----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8322                       :                                                                                     gactgacggacggcttgaaaacA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----TA-T----G--C--------------G--------GA-G--G---TA-T-A-A-Taa
gi|8327                       :                                                                                      gacatgacggtcaaaattcccA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-CAT-G--C----A-----------A--C----A---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-Taa
gi|8305                       :                                                                                                          cA--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------AACT----T---C---GT---T--T----G--C--------------G--------GG-G--G---TA-T-A-aa
gi|8274                       :                                                                            actgacagacagacggacaggtcgattccaaA--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-C-C-G--C----A-----------A--A--------CGAAG----T--T----G-----------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-T-TAaa
gi|8282                       :                                                                           acggacggcagacggacagcacagggtgaaacc--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8250                       :                                                                             ggactgacggactgacagacgggtcaaaaac--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--T----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-Taaa
gi|8285                       :                                                                           actgacggactgactgacagacgggtcaaaaac--T-T-----A-T-A--CC-------C-----A-C-G--T----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8287                       :                                                                          ggactgacgactgactgacagacgggtcaaaaac--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---GT---T--T----G--TG-------------G---T----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8289                       :                                                                             ggactgacggactgacagacgggtcaaaaac--T-T-----A-TTA--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-Taaa
gi|8292                       :                                                                            ggactgacggaactgcagacgggtcaaaaaac--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8262                       :                                                                                     ggactgactgactggtcaaagac--T-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------G--------GA-G--G---TA-T-aaa
gi|8328                       :                                                                        actgacggactgactgacagacggtcaaaacattcc--T-T-----A-T-A--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---
gi|8283                       :                                                                                                               -T-----A-T-A--CC-------C-----A-C-G--C----A-----------A--C----GA--T---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8259                       :                                                                                 ggactgacggactgacagacgggtcaaaac-T-----A-T-A--CC-------C---C-A-C-G--C----A-----------A--C----G---A---G----T--T----G--C--------------A---G----AG-G--G---TA-T-A-A-Ttaaaaa
gi|8284                       :                                                                                   acggactgactgactaacgggtcaaaac-T-----A-T-A--CC-------C-----A-C-G--C----A-----------A--C----GA--T---G----T--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-Ttata
gi|8329                       :                                                                                ggacttgacggactgacagacgggtcaaaac-T-----A-T-C--CC-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAAtaaaaa
gi|8330                       :                                                                                                                              C-------C---T-C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-ACTAA
gi|8331                       :                                                                                                                                           -C-C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8332                       :                                                                                                                                             -C-G--C----A-----------A--C----T---C---G----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                  0 1 55555 0 2222 4444 00 22222222 22222222 1 2 0 111111 33 333 22 00 11 1 0 1  11 1 444 11  22 2 33333 1  22  2222222 111 0 22222222222 0 0 3333 11 1 6666 222  3333 00 2222 11 33333333333333 222 3333  0 11 111  1 0 0 0   
lowQualScore                  :                                  . . ..... . .... .... .. ........ ........ . . . ...... .. ... .. .. .. . . .  .. . ... ..  .. . ..... .  ..  ....... ... . ........... . . .... .. . .... ...  .... .. .... .. .............. ... ....  . .. ...  . . . .   
lowQualScore                  :                                  7 4 44444 6 0000 3333 77 55555555 55555555 1 1 5 666666 00 444 88 77 22 0 5 0  77 0 333 22  22 4 55555 0  88  9999999 555 5 22222222222 9 5 2222 66 4 5555 888  4444 77 5555 66 88888888888888 333 1111  5 66 888  0 5 5 5   
consensus                     :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
Reference ( family-259 )      :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8248                       :                              ACGA-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8249                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------T-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8250                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----A--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8251                       :                              ACGG-A-C-----G-G----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8252                       :                              ACGG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---C-T-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8253                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C------G--A---T--G--GT-G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T------------C---T-C-----------CTG-C----A----------------------T----G--C--------------GT--T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8254                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--T--G-T-CCAA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-A-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8255                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------T--------T-G-A-CGGACA-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-CCGCAACCGTTGC-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8256                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A------A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CAT-T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-GCC----A--A-C----T---CG----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8257                       :                              ACGG-A-CCT---G-A----C---TGCAA--------C--------TTGTA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--TCT-----ACTA--CC-------C---T-C-----------C----------------------CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8258                       :                              ACTG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-------A-A---A--CA--T-T-----AATA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8259                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-A-A-C----------------G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------T-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-ATA-TA
gi|8260                       :                              ACGG-A-T-T---G-A----C---TG--A--------C--------A-G-AAC----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----A--AAC----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8261                       :                              ACGGTA-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------TTG-A-C----A-G--A---C--G--C--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-CA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T-------G--G---TA-T-A-
gi|8262                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A------CA--T-TCC---A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-t
gi|8263                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AAG-A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CCCG-----C---T-C-----------C-G-C----A--A-CG---T---CG----T--T----T--G--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8264                       :                              ACGG-A-C-G---GGA----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----TTG--A---C--G--G--T-C-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-AT--CC-------CTCGT-C-----------C-G-C----A--ATC----TGTACG----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-A-A-A-TAA
gi|8265                       :                              ACGG-A---------A----C---GG--A--------C--------T-GCA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-TA--CG-------C---T-C-----------C-G-T----AC-A-C----T---CGT---T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TA-TAA-A-TAA
gi|8266                       :                              ACGG-A-C-----G-A----C---TG--A--------CGGGCACCCT-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AAT-A-ACC-A--CA--T-T-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------CAG-C----A--A-C----T---C-----T--T----G--C--------------GCCCT----GGTG--GT--TA-T-A-A-TAA
gi|8267                       :                              ACGG-AAC-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C------G--A---C--G--G--G-T-C-CA--A-A---A--CA--A-T-----A-TA--CC-------------C-----------G-G-C----A--A-T----T---CG----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--T---TA-T-A-T-TA
gi|8268                       :                              ACGG-C-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----T-G--A---T--G--G--G-T-C--A--A-A---A--TA--A-T-----A-AA--CC-------------C-----------A-G-C----A--A-C----TC--CG----C--T----G--C--------------G---T----GC-G--G---TA-T-A-A-
gi|8269                       :                              ACGG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----G-A--A---C--G--G--A-T-A-AA--A-A---T--TA--T-------A-TA--CC-------C---C-C-----------A-G-C----A--A-C----TA--TG----G--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8270                       :                              ACGG-A-C-A---G-A----C---TG--ATATAAAGAC--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TA--TC-------C-----C-----------A-G-C----A--A-CT---T---CA----T--T----G--C--------------A---T----GT-G--A---TA-C-A-
gi|8271                       :                              ACGG-A-C-T---G-A---------G--A--------C--------G-A-A-C-------------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A--A---C-------C---T-C-----------C-G---------A-C----T----G----T--T----G--C--------------T---TA---GG-G--G---TA-T-A-T-TA
gi|8272                       :                              ACGG-A-C-A---G-A----C----G--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-A------A--A-CT---T---CGT---T--T----G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8273                       :                              ACAG-A-C-G---G-A----C---GG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------C-A------A--A-CG---T---CGT---T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8274                       :                              ACGG-A-C-----G-G----C---AG--A--------C--------G-G-A-C----A-GC-A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-C---C--TA--A-T-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C---C----A--A-C----TT--CG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8275                       :                              ACAG-A-C-A---G-A----C---GG--A--------T--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-CCT-A--TA--TAC-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-A------A--A-C----TT--CG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8276                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----
gi|8276                       :                                            -A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--GAT-C-GAGAA-A---A--CA--T-T-------TC--CC-------CCA-T-C-----------C-G-C----A--A-CC---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--T---TA-gtgatcgagaaactgactgacagaacgggatcgagaaaacatttcccccatccgcaacctcgttgcgtgggtta
gi|8277                       : acggactgactgactgacgtgatcgagaaACAG-A-C-G---G-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--G--G--A---C-AG--A-G---T--GA--T-TCCTATA-TA--CC-------C---C-C-----------C-C-CCCCAA--A-C----T---TG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8278                       :                              ACAG-A-A-G---G-A----C---AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-A-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TG--CC-------C---C-C-----------C-G------A--T-CT---T---CGA---T--C----A--C--------------G--------GG-G--G---CA-T-A-A-TA
gi|8279                       :                              ACGG-A-C-GCCAG-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-C-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TG---T-------C---T-C-----------C-C-C----A--A----------CA----T--T----G--T--------------G---G----GG-G--GAGACA-T-A-A-TAA
gi|8280                       :                               CGG-A-C-TT--G-A----C---T------------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA---C-------C---T-C-----------C-G-CGCA-A--A-CAT--T---CG----T--T----G--C--------------GT--T----GG-G--T---TA-T-A-A-T
gi|8281                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-GA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8282                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8283                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8284                       :                                GG-A-C-TT--G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8285                       :                                GG-A-C-T---G-A----CGACTG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----A--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8286                       :                                GG-A-C-C---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--A--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--C--------------A---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8287                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---TAC-----------C-A-CA---A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8288                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-----------------C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8289                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--AA-------C--------T-G---C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G------T-A-A-TAA
gi|8290                       :                                GG-A---T---G-A----C---GG--A--------CC-------T-GTA-C----A-G--AA--C--GACG--T-T-C-AA--A-A---ATACA--T-T-------TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8291                       :                                GG-ATC-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CGT---T--T----G--A--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8292                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-G---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8293                       :                               gGG-A-C-TC--G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CAG-T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----AAGA-C----T---CG----T--T----GTTC--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TA
gi|8294                       :                                GG-A-C-T---G-ATGGAC---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--T-T-C-AA--A-A---G--CA--T----------A--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8295                       :                                GG-A-C-T---G-G----A---CG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-TTC-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------G-G-C----A--A------T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TGA
gi|8296                       :                                GG-A-C-T---G-A----CGACTG--A--------C--------T-G-A-C----A-GG-A---C--G--G--G-T-CCAA--A-A---A--CC--A-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G------A--A-T----T---CG----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TATT-A-A-TAA
gi|8297                       :                                GA-A-C-T---G-A----CGT-CG--A--------C----------G-A-C----A-G--ATAGC--G--G--G-T-C-AA--ATA---A--CAGATAT-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A----C----T---CG----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8298                       :                                GA-A-C-T---G-A----C---AG--A--------C--------T-G-A------A-GT-A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CG--T-T-----A-TA--TC-------C---T-G-----------T-G-C----A--A-A----C---CA----T--T----G--A--------------G---A----GG-A--G---TT-T-A-A-T
gi|8299                       :                                GG-A-C-T---G-G---------G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---T--T--G--G-T-T-AA--A-A---AA-CA--T-T-----T-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C-----------------T----G--C--------------G---T-----G-A--G---TA-T-G-A-T
gi|8300                       :                                 G-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--G-T-C-AA--A-T---A--CAA-T-C-----T-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CCAACT---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8301                       :                                 G-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-GGGA---C--G--G--TCT-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TT--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--GT--TA-T-A-A-
gi|8302                       :                                 G-A-C-G---G-A----C---AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---CAGG--G--G-T----A--A-A---A--CA--G-T-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-C-T---------C----T---CC----T--TTGGAG--C--------------G--------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8303                       :                                  -A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8304                       :                                  -A-C-T---G-AA---C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-A-C-AA--ACA---A--CA--T-T-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--CTC----C---CG----TCGT----G--C--------------G---T----TG-G--G---TA-T-A-
gi|8305                       :                                  -A-C-T---G-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----G-G--A---C--A--G--G-T-C-GA--T-T---C--CA--A-T-----A-TA--CC-------C-----C-----------C-G-C----A--A-A--------CGAAGTT--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8306                       :                                        ---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T----------A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---CA-T-A-A-T
gi|8307                       :                                        ---G-A----C---TG--G--------C--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----G-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---AG----T--T----G--C--------------G---T----GG-A--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8308                       :                                            -A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--ATCAC--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-
gi|8309                       :                                            -A----C---TA--A--------C--------A-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-C-AT--G-A---A--CA--T-A-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-A-C----A--A-C----T---TG----T--T----G--C--------------A---TTATATG-G--G---TA-T-G-A-AAA
gi|8310                       :                                                   ---TG--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-CA--CC-------G---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8311                       :                                                   ---TG--A--------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TACT-A-A-T
gi|8312                       :                                                   ---TG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA----T-----A--A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-
gi|8313                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--T-TAA---A-AA--CC-------T---C-C-----------C-G-CA---A--A-C----T---CC----T--T----G--C--------------A---T-----G-A--G---TA-T-A-A-
gi|8314                       :                                                       G--A--------C--------T-GGA-C----G-G------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CT--T-T-----A-CA--TG-----------T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--CG-------------G---TGG--GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8315                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--C-T-T-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8316                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G---C-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-T-----------C-G-CA---A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GCTT---TA-T-A-A-CAA
gi|8317                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-A-AA--A-A---C--CA--T-T-----A-TA--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--T--------------G---T-----G-G--G---CA-T-A-A-TAA
gi|8318                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G------C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA---C-------C---T-C-----------C-G-C----A--A------T---CG----A--T----G--CG-------------G---TG---GG-G--G---TA-G-A-A-TAA
gi|8319                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-A-AA--A-A---A--CT--A-T-----A-TA--AC-------C-----C-----------A-G-C----A--A-CT---T---TG----T--T----G--C--------------A---T----GC-G--G---TA-T-A-
gi|8320                       :                                                        --A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CC--T-T-----A-TAGGCCTT-----C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---GG----T--T----T--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8321                       :                                                                    --------T-G-A-C----G-GGAA---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T---CCTTCAGTGC---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---GG----T--T----T--C--------------GT--T----GG-G--G---TT-T-A-A-TAA
gi|8322                       :                                                                             -G-A-C----ATG--A---C--G--G----T-C-AA--A-ATTCC--CA--T-T-----A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----AT-A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8323                       :                                                                               -A-C----G-G--A---C--G--CACG-T-C-AG--C-G---A--TG--C-T-----A-TATCCC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8324                       :                                                                                 -C----A-G--A---C--T--G--------AA--A-A---A--CA--T-A-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--C----G--CCCCGGGCTCATCGTG---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8325                       :                                                                                                    --G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---C----------------------------------------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8326                       :                                                                                                              -AA--A-A---A--CA--T----------A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GA-G--G---AA-T-A-A-AAA
gi|8327                       :                                                                                                                          --CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---TG----T--T----G--C--------------A---TG---GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8328                       :                                                                                                                              --T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---
gi|8329                       :                                                                                                                                 -T-----A-TC--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8330                       :                                                                                                                                               C-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-ACTAA
gi|8331                       :                                                                                                                                                            -C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8332                       :                                                                                                                                                              -----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                  0 1 55555 0 2222 4444 00 22222222 22222222 1 2 0 111111 33 333 22 00 11 1 0 1  11 1 444 11  22 2 33333 1  22  2222222 111 0 22222222222 0 0 3333 11 1 6666 222  3333 00 2222 11 33333333333333 222 3333  0 11 111  1 0 0 0   
lowQualScore                  :                                  . . ..... . .... .... .. ........ ........ . . . ...... .. ... .. .. .. . . .  .. . ... ..  .. . ..... .  ..  ....... ... . ........... . . .... .. . .... ...  .... .. .... .. .............. ... ....  . .. ...  . . . .   
lowQualScore                  :                                  7 4 44444 6 0000 3333 77 55555555 55555555 1 1 5 666666 00 444 88 77 22 0 5 0  77 0 333 22  22 4 55555 0  88  9999999 555 5 22222222222 9 5 2222 66 4 5555 888  4444 77 5555 66 88888888888888 333 1111  5 66 888  0 5 5 5   
consensus                     :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
Reference ( family-259 )      :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8248                       :                              ACGA-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8249                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------T-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8250                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----A--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8251                       :                              ACGG-A-C-----G-G----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8252                       :                              ACGG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---C-T-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8253                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C------G--A---T--G--GT-G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T------------C---T-C-----------CTG-C----A----------------------T----G--C--------------GT--T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8254                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--T--G-T-CCAA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-A-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8255                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------T--------T-G-A-CGGACA-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-CCGCAACCGTTGC-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8256                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A------A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CAT-T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-GCC----A--A-C----T---CG----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8257                       :                              ACGG-A-CCT---G-A----C---TGCAA--------C--------TTGTA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--TCT-----ACTA--CC-------C---T-C-----------C----------------------CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8258                       :                              ACTG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-------A-A---A--CA--T-T-----AATA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8259                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-A-A-C----------------G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------T-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-ATA-TA
gi|8260                       :                              ACGG-A-T-T---G-A----C---TG--A--------C--------A-G-AAC----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----A--AAC----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8261                       :                              ACGGTA-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------TTG-A-C----A-G--A---C--G--C--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-CA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T-------G--G---TA-T-A-
gi|8262                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A------CA--T-TCC---A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-t
gi|8263                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AAG-A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CCCG-----C---T-C-----------C-G-C----A--A-CG---T---CG----T--T----T--G--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8264                       :                              ACGG-A-C-G---GGA----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----TTG--A---C--G--G--T-C-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-AT--CC-------CTCGT-C-----------C-G-C----A--ATC----TGTACG----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-A-A-A-TAA
gi|8265                       :                              ACGG-A---------A----C---GG--A--------C--------T-GCA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-TA--CG-------C---T-C-----------C-G-T----AC-A-C----T---CGT---T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TA-TAA-A-TAA
gi|8266                       :                              ACGG-A-C-----G-A----C---TG--A--------CGGGCACCCT-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AAT-A-ACC-A--CA--T-T-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------CAG-C----A--A-C----T---C-----T--T----G--C--------------GCCCT----GGTG--GT--TA-T-A-A-TAA
gi|8267                       :                              ACGG-AAC-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C------G--A---C--G--G--G-T-C-CA--A-A---A--CA--A-T-----A-TA--CC-------------C-----------G-G-C----A--A-T----T---CG----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--T---TA-T-A-T-TA
gi|8268                       :                              ACGG-C-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----T-G--A---T--G--G--G-T-C--A--A-A---A--TA--A-T-----A-AA--CC-------------C-----------A-G-C----A--A-C----TC--CG----C--T----G--C--------------G---T----GC-G--G---TA-T-A-A-
gi|8269                       :                              ACGG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----G-A--A---C--G--G--A-T-A-AA--A-A---T--TA--T-------A-TA--CC-------C---C-C-----------A-G-C----A--A-C----TA--TG----G--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8270                       :                              ACGG-A-C-A---G-A----C---TG--ATATAAAGAC--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TA--TC-------C-----C-----------A-G-C----A--A-CT---T---CA----T--T----G--C--------------A---T----GT-G--A---TA-C-A-
gi|8271                       :                              ACGG-A-C-T---G-A---------G--A--------C--------G-A-A-C-------------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A--A---C-------C---T-C-----------C-G---------A-C----T----G----T--T----G--C--------------T---TA---GG-G--G---TA-T-A-T-TA
gi|8272                       :                              ACGG-A-C-A---G-A----C----G--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-A------A--A-CT---T---CGT---T--T----G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8273                       :                              ACAG-A-C-G---G-A----C---GG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------C-A------A--A-CG---T---CGT---T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8274                       :                              ACGG-A-C-----G-G----C---AG--A--------C--------G-G-A-C----A-GC-A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-C---C--TA--A-T-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C---C----A--A-C----TT--CG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8275                       :                              ACAG-A-C-A---G-A----C---GG--A--------T--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-CCT-A--TA--TAC-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-A------A--A-C----TT--CG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8276                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----
gi|8276                       :                                            -A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--GAT-C-GAGAA-A---A--CA--T-T-------TC--CC-------CCA-T-C-----------C-G-C----A--A-CC---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--T---TA-gtgatcgagaaactgactgacagaacgggatcgagaaaacatttcccccatccgcaacctcgttgcgtgggtta
gi|8277                       : acggactgactgactgacgtgatcgagaaACAG-A-C-G---G-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--G--G--A---C-AG--A-G---T--GA--T-TCCTATA-TA--CC-------C---C-C-----------C-C-CCCCAA--A-C----T---TG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8278                       :                              ACAG-A-A-G---G-A----C---AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-A-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TG--CC-------C---C-C-----------C-G------A--T-CT---T---CGA---T--C----A--C--------------G--------GG-G--G---CA-T-A-A-TA
gi|8279                       :                              ACGG-A-C-GCCAG-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-C-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TG---T-------C---T-C-----------C-C-C----A--A----------CA----T--T----G--T--------------G---G----GG-G--GAGACA-T-A-A-TAA
gi|8280                       :                               CGG-A-C-TT--G-A----C---T------------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA---C-------C---T-C-----------C-G-CGCA-A--A-CAT--T---CG----T--T----G--C--------------GT--T----GG-G--T---TA-T-A-A-T
gi|8281                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-GA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8282                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8283                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8284                       :                                GG-A-C-TT--G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8285                       :                                GG-A-C-T---G-A----CGACTG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----A--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8286                       :                                GG-A-C-C---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--A--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--C--------------A---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8287                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---TAC-----------C-A-CA---A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8288                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-----------------C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8289                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--AA-------C--------T-G---C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G------T-A-A-TAA
gi|8290                       :                                GG-A---T---G-A----C---GG--A--------CC-------T-GTA-C----A-G--AA--C--GACG--T-T-C-AA--A-A---ATACA--T-T-------TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8291                       :                                GG-ATC-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CGT---T--T----G--A--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8292                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-G---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8293                       :                               gGG-A-C-TC--G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CAG-T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----AAGA-C----T---CG----T--T----GTTC--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TA
gi|8294                       :                                GG-A-C-T---G-ATGGAC---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--T-T-C-AA--A-A---G--CA--T----------A--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8295                       :                                GG-A-C-T---G-G----A---CG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-TTC-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------G-G-C----A--A------T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TGA
gi|8296                       :                                GG-A-C-T---G-A----CGACTG--A--------C--------T-G-A-C----A-GG-A---C--G--G--G-T-CCAA--A-A---A--CC--A-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G------A--A-T----T---CG----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TATT-A-A-TAA
gi|8297                       :                                GA-A-C-T---G-A----CGT-CG--A--------C----------G-A-C----A-G--ATAGC--G--G--G-T-C-AA--ATA---A--CAGATAT-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A----C----T---CG----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8298                       :                                GA-A-C-T---G-A----C---AG--A--------C--------T-G-A------A-GT-A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CG--T-T-----A-TA--TC-------C---T-G-----------T-G-C----A--A-A----C---CA----T--T----G--A--------------G---A----GG-A--G---TT-T-A-A-T
gi|8299                       :                                GG-A-C-T---G-G---------G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---T--T--G--G-T-T-AA--A-A---AA-CA--T-T-----T-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C-----------------T----G--C--------------G---T-----G-A--G---TA-T-G-A-T
gi|8300                       :                                 G-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--G-T-C-AA--A-T---A--CAA-T-C-----T-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CCAACT---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8301                       :                                 G-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-GGGA---C--G--G--TCT-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TT--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--GT--TA-T-A-A-
gi|8302                       :                                 G-A-C-G---G-A----C---AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---CAGG--G--G-T----A--A-A---A--CA--G-T-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-C-T---------C----T---CC----T--TTGGAG--C--------------G--------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8303                       :                                  -A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8304                       :                                  -A-C-T---G-AA---C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-A-C-AA--ACA---A--CA--T-T-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--CTC----C---CG----TCGT----G--C--------------G---T----TG-G--G---TA-T-A-
gi|8305                       :                                  -A-C-T---G-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----G-G--A---C--A--G--G-T-C-GA--T-T---C--CA--A-T-----A-TA--CC-------C-----C-----------C-G-C----A--A-A--------CGAAGTT--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8306                       :                                        ---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T----------A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---CA-T-A-A-T
gi|8307                       :                                        ---G-A----C---TG--G--------C--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----G-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---AG----T--T----G--C--------------G---T----GG-A--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8308                       :                                            -A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--ATCAC--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-
gi|8309                       :                                            -A----C---TA--A--------C--------A-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-C-AT--G-A---A--CA--T-A-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-A-C----A--A-C----T---TG----T--T----G--C--------------A---TTATATG-G--G---TA-T-G-A-AAA
gi|8310                       :                                                   ---TG--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-CA--CC-------G---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8311                       :                                                   ---TG--A--------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TACT-A-A-T
gi|8312                       :                                                   ---TG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA----T-----A--A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-
gi|8313                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--T-TAA---A-AA--CC-------T---C-C-----------C-G-CA---A--A-C----T---CC----T--T----G--C--------------A---T-----G-A--G---TA-T-A-A-
gi|8314                       :                                                       G--A--------C--------T-GGA-C----G-G------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CT--T-T-----A-CA--TG-----------T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--CG-------------G---TGG--GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8315                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--C-T-T-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8316                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G---C-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-T-----------C-G-CA---A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GCTT---TA-T-A-A-CAA
gi|8317                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-A-AA--A-A---C--CA--T-T-----A-TA--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--T--------------G---T-----G-G--G---CA-T-A-A-TAA
gi|8318                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G------C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA---C-------C---T-C-----------C-G-C----A--A------T---CG----A--T----G--CG-------------G---TG---GG-G--G---TA-G-A-A-TAA
gi|8319                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-A-AA--A-A---A--CT--A-T-----A-TA--AC-------C-----C-----------A-G-C----A--A-CT---T---TG----T--T----G--C--------------A---T----GC-G--G---TA-T-A-
gi|8320                       :                                                        --A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CC--T-T-----A-TAGGCCTT-----C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---GG----T--T----T--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8321                       :                                                                    --------T-G-A-C----G-GGAA---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T---CCTTCAGTGC---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---GG----T--T----T--C--------------GT--T----GG-G--G---TT-T-A-A-TAA
gi|8322                       :                                                                             -G-A-C----ATG--A---C--G--G----T-C-AA--A-ATTCC--CA--T-T-----A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----AT-A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8323                       :                                                                               -A-C----G-G--A---C--G--CACG-T-C-AG--C-G---A--TG--C-T-----A-TATCCC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8324                       :                                                                                 -C----A-G--A---C--T--G--------AA--A-A---A--CA--T-A-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--C----G--CCCCGGGCTCATCGTG---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8325                       :                                                                                                    --G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---C----------------------------------------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8326                       :                                                                                                              -AA--A-A---A--CA--T----------A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GA-G--G---AA-T-A-A-AAA
gi|8327                       :                                                                                                                          --CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---TG----T--T----G--C--------------A---TG---GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8328                       :                                                                                                                              --T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---
gi|8329                       :                                                                                                                                 -T-----A-TC--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8330                       :                                                                                                                                               C-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-ACTAA
gi|8331                       :                                                                                                                                                            -C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8332                       :                                                                                                                                                              -----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA


blockSeqs                     :                                    A GCCA    TGGA GACT    TATAAAGA GGGCACCC T T   GGACA  GG TAG AG    AC A   C  GA T TTC TA  GA C CCTAT    GG  TTCAGTG TCG   CGCAACCGTTG     CCCA AG A CAAC GTA  AAGT    TGGA TT CCCGGGCTCATCGT CCC TATA    CT AGA
blockSeqs                     :                                    T CT      A    GACT    A        C        T C   TT     GA TCA A     T  C   C  G  C CC  A   T  A CC       TC  CG      CA    .               GCA  C  T AT   C    T       T    C  G              T   GG      T  T  
blockSeqs                     :                                    . TT      .    GTC     .        .        . T   AT     C  A   A     .  .   .  T  . CT  .   G  A AA       C   TT      .     .               A    T  T G    A    T       T    C  G              T   A       T  T  
blockSeqs                     :                                    . TT      .    T       .        .        . G   A      G  A   A     .  .   .  .  . C   .   A  A T        C   .       .     .               A    .  . T    T    T       T    .  .              T   G       .  .  
blockSeqs                     :                                    . TC      .    T       .        .        . .   A      T  A   A     .  .   .  .  . A   .   .  A T        C   .       .     .               A    .  . T    T    A       .    .  .              .   G       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . A   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . G    .    T       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . C   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . C    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . T    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . A    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . A    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . A    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . T    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    G       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . A       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . A       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . A       .    A       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    A       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    A       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    A       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . C       .    T       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    G       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    C       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    A       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . G       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    A       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . T       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . .       .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . .       .    A       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . .       .    T       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                    . .       .    T       .        .        . .   T      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                              .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                              .    T       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                              .    T       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                              .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                              .    T       .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                   .       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                   .       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                   .       .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   G      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   A      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                           .        .        . .   .      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                    .        . .   .      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                             . .   .      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                               .   .      .  .   .     .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                       .  .   .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                              .  .  . .   .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                          .   .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                              .  . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                 . .        .   .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .       .     .               .    .  . .    .    .       .    .  .              .   .       .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              .               .    .  .                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              .               .    .  .                                                            


blockSeqCons                  :                              
originalCons                  :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
finalCons                     :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                  0 1 55555 0 2222 4444 00 22222222 22222222 1 2 0 111111 33 333 22 00 11 1 0 1  11 1 444 11  22 2 33333 1  22  2222222 111 0 22222222222 0 0 3333 11 1 6666 222  3333 00 2222 11 33333333333333 222 3333  0 11 111  1 0 0 0   
lowQualScore                  :                                  . . ..... . .... .... .. ........ ........ . . . ...... .. ... .. .. .. . . .  .. . ... ..  .. . ..... .  ..  ....... ... . ........... . . .... .. . .... ...  .... .. .... .. .............. ... ....  . .. ...  . . . .   
lowQualScore                  :                                  7 4 44444 6 0000 3333 77 55555555 55555555 1 1 5 666666 00 444 88 77 22 0 5 0  77 0 333 22  22 4 55555 0  88  9999999 555 5 22222222222 9 5 2222 66 4 5555 888  4444 77 5555 66 88888888888888 333 1111  5 66 888  0 5 5 5   
consensus                     :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
Reference ( family-259 )      :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8248                       :                              ACGA-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8249                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------T-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8250                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----A--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8251                       :                              ACGG-A-C-----G-G----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8252                       :                              ACGG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---C-T-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8253                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C------G--A---T--G--GT-G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T------------C---T-C-----------CTG-C----A----------------------T----G--C--------------GT--T----GG-G--G---TG-T-A-A-T
gi|8254                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--T--G-T-CCAA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-A-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8255                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------T--------T-G-A-CGGACA-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-CCGCAACCGTTGC-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8256                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A------A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CAT-T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-GCC----A--A-C----T---CG----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8257                       :                              ACGG-A-CCT---G-A----C---TGCAA--------C--------TTGTA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--TCT-----ACTA--CC-------C---T-C-----------C----------------------CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8258                       :                              ACTG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-------A-A---A--CA--T-T-----AATA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8259                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-A-A-C----------------G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------T-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-ATA-TA
gi|8260                       :                              ACGG-A-T-T---G-A----C---TG--A--------C--------A-G-AAC----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----A--AAC----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8261                       :                              ACGGTA-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------TTG-A-C----A-G--A---C--G--C--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-TT----A-CA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T-------G--G---TA-T-A-
gi|8262                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G----T-C-AA--A-A------CA--T-TCC---A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-t
gi|8263                       :                              ACTG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AAG-A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CCCG-----C---T-C-----------C-G-C----A--A-CG---T---CG----T--T----T--G--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-
gi|8264                       :                              ACGG-A-C-G---GGA----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----TTG--A---C--G--G--T-C-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-AT--CC-------CTCGT-C-----------C-G-C----A--ATC----TGTACG----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-A-A-A-TAA
gi|8265                       :                              ACGG-A---------A----C---GG--A--------C--------T-GCA-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-TA--CG-------C---T-C-----------C-G-T----AC-A-C----T---CGT---T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TA-TAA-A-TAA
gi|8266                       :                              ACGG-A-C-----G-A----C---TG--A--------CGGGCACCCT-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AAT-A-ACC-A--CA--T-T-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------CAG-C----A--A-C----T---C-----T--T----G--C--------------GCCCT----GGTG--GT--TA-T-A-A-TAA
gi|8267                       :                              ACGG-AAC-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C------G--A---C--G--G--G-T-C-CA--A-A---A--CA--A-T-----A-TA--CC-------------C-----------G-G-C----A--A-T----T---CG----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--T---TA-T-A-T-TA
gi|8268                       :                              ACGG-C-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----T-G--A---T--G--G--G-T-C--A--A-A---A--TA--A-T-----A-AA--CC-------------C-----------A-G-C----A--A-C----TC--CG----C--T----G--C--------------G---T----GC-G--G---TA-T-A-A-
gi|8269                       :                              ACGG-A-C-G---G-A----C---TG--A--------C--------G-G-A-C----G-A--A---C--G--G--A-T-A-AA--A-A---T--TA--T-------A-TA--CC-------C---C-C-----------A-G-C----A--A-C----TA--TG----G--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8270                       :                              ACGG-A-C-A---G-A----C---TG--ATATAAAGAC--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TA--TC-------C-----C-----------A-G-C----A--A-CT---T---CA----T--T----G--C--------------A---T----GT-G--A---TA-C-A-
gi|8271                       :                              ACGG-A-C-T---G-A---------G--A--------C--------G-A-A-C-------------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A--A---C-------C---T-C-----------C-G---------A-C----T----G----T--T----G--C--------------T---TA---GG-G--G---TA-T-A-T-TA
gi|8272                       :                              ACGG-A-C-A---G-A----C----G--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-A------A--A-CT---T---CGT---T--T----G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8273                       :                              ACAG-A-C-G---G-A----C---GG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T----G--A-A---A--CC--TAT-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------C-A------A--A-CG---T---CGT---T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8274                       :                              ACGG-A-C-----G-G----C---AG--A--------C--------G-G-A-C----A-GC-A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-C---C--TA--A-T-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C---C----A--A-C----TT--CG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8275                       :                              ACAG-A-C-A---G-A----C---GG--A--------T--------A-G-A-C----A-G--A---CA-G--G--G-T-G-AA--A-CCT-A--TA--TAC-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-A------A--A-C----TT--CG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8276                       :                              ACGG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----
gi|8276                       :                                            -A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--GAT-C-GAGAA-A---A--CA--T-T-------TC--CC-------CCA-T-C-----------C-G-C----A--A-CC---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--T---TA-gtgatcgagaaactgactgacagaacgggatcgagaaaacatttcccccatccgcaacctcgttgcgtgggtta
gi|8277                       : acggactgactgactgacgtgatcgagaaACAG-A-C-G---G-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--G--G--A---C-AG--A-G---T--GA--T-TCCTATA-TA--CC-------C---C-C-----------C-C-CCCCAA--A-C----T---TG----T--TT---G--C--------------G---G----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8278                       :                              ACAG-A-A-G---G-A----C---AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-A-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TG--CC-------C---C-C-----------C-G------A--T-CT---T---CGA---T--C----A--C--------------G--------GG-G--G---CA-T-A-A-TA
gi|8279                       :                              ACGG-A-C-GCCAG-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----A-G--A---C--A--G--G-C-C-AA--A-A---A--CA--A-T-----A-TG---T-------C---T-C-----------C-C-C----A--A----------CA----T--T----G--T--------------G---G----GG-G--GAGACA-T-A-A-TAA
gi|8280                       :                               CGG-A-C-TT--G-A----C---T------------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA---C-------C---T-C-----------C-G-CGCA-A--A-CAT--T---CG----T--T----G--C--------------GT--T----GG-G--T---TA-T-A-A-T
gi|8281                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-GA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8282                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8283                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8284                       :                                GG-A-C-TT--G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GT-A---TA-T-A-A-AAA
gi|8285                       :                                GG-A-C-T---G-A----CGACTG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----A--C--------------G---T-----G-G--G---TA-T-A-A-
gi|8286                       :                                GG-A-C-C---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--A--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--C--------------A---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8287                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---TAC-----------C-A-CA---A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8288                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-----------------C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8289                       :                                GG-A-C-T---G-A----C---GG--AA-------C--------T-G---C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AA--A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G------T-A-A-TAA
gi|8290                       :                                GG-A---T---G-A----C---GG--A--------CC-------T-GTA-C----A-G--AA--C--GACG--T-T-C-AA--A-A---ATACA--T-T-------TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C------------------T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8291                       :                                GG-ATC-T---G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CA---T---CGT---T--T----G--A--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8292                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-T-C-AA--A-G---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8293                       :                               gGG-A-C-TC--G-A----C---GG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C--A--A-A---A--CAG-T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----AAGA-C----T---CG----T--T----GTTC--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TA
gi|8294                       :                                GG-A-C-T---G-ATGGAC---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--T-T-C-AA--A-A---G--CA--T----------A--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8295                       :                                GG-A-C-T---G-G----A---CG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--T--G--G-TTC-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------G-G-C----A--A------T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TGA
gi|8296                       :                                GG-A-C-T---G-A----CGACTG--A--------C--------T-G-A-C----A-GG-A---C--G--G--G-T-CCAA--A-A---A--CC--A-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G------A--A-T----T---CG----T--T----G--C--------------G---T-----G-G--G---TATT-A-A-TAA
gi|8297                       :                                GA-A-C-T---G-A----CGT-CG--A--------C----------G-A-C----A-G--ATAGC--G--G--G-T-C-AA--ATA---A--CAGATAT-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A----C----T---CG----T--T-------C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-CAA
gi|8298                       :                                GA-A-C-T---G-A----C---AG--A--------C--------T-G-A------A-GT-A---T--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CG--T-T-----A-TA--TC-------C---T-G-----------T-G-C----A--A-A----C---CA----T--T----G--A--------------G---A----GG-A--G---TT-T-A-A-T
gi|8299                       :                                GG-A-C-T---G-G---------G--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---T--T--G--G-T-T-AA--A-A---AA-CA--T-T-----T-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C-----------------T----G--C--------------G---T-----G-A--G---TA-T-G-A-T
gi|8300                       :                                 G-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--AA--C--G--G--G-T-C-AA--A-T---A--CAA-T-C-----T-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-CCAACT---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8301                       :                                 G-A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-GGGA---C--G--G--TCT-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TT--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--GT--TA-T-A-A-
gi|8302                       :                                 G-A-C-G---G-A----C---AG--A--------A--------T-G-A-C----A-G--A---CAGG--G--G-T----A--A-A---A--CA--G-T-----A-TA--CC-------C---C-C-----------C-C-T---------C----T---CC----T--TTGGAG--C--------------G--------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8303                       :                                  -A-C-T---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-T
gi|8304                       :                                  -A-C-T---G-AA---C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-A-C-AA--ACA---A--CA--T-T-----A-TAC-CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--CTC----C---CG----TCGT----G--C--------------G---T----TG-G--G---TA-T-A-
gi|8305                       :                                  -A-C-T---G-A----C---AG--A--------C--------A-G-A-C----G-G--A---C--A--G--G-T-C-GA--T-T---C--CA--A-T-----A-TA--CC-------C-----C-----------C-G-C----A--A-A--------CGAAGTT--T----G--C--------------G---G----AG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8306                       :                                        ---G-A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T----------A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---CA-T-A-A-T
gi|8307                       :                                        ---G-A----C---TG--G--------C--------G-G-A-C----T-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----G-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---AG----T--T----G--C--------------G---T----GG-A--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8308                       :                                            -A----C---TG--A--------C--------T-G-A-C----A-G--ATCAC--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-
gi|8309                       :                                            -A----C---TA--A--------C--------A-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-C-AT--G-A---A--CA--T-A-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-A-C----A--A-C----T---TG----T--T----G--C--------------A---TTATATG-G--G---TA-T-G-A-AAA
gi|8310                       :                                                   ---TG--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-CA--CC-------G---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8311                       :                                                   ---TG--A--------T--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A------CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----GC-C--------------G---T----GG-G--G---TACT-A-A-T
gi|8312                       :                                                   ---TG--A--------C--------G-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CA----T-----A--A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-
gi|8313                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-AC--A--CA--T-TAA---A-AA--CC-------T---C-C-----------C-G-CA---A--A-C----T---CC----T--T----G--C--------------A---T-----G-A--G---TA-T-A-A-
gi|8314                       :                                                       G--A--------C--------T-GGA-C----G-G------C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CT--T-T-----A-CA--TG-----------T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--CG-------------G---TGG--GG-G--G---TA-T-A-A-AAA
gi|8315                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--C-T-T-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--T--------------G---T----GG-G--G---TA-T-G-A-TAA
gi|8316                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G---C-GA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-T-----------C-G-CA---A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-GCTT---TA-T-A-A-CAA
gi|8317                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-T----G-G--A---T--G--G--G-T-A-AA--A-A---C--CA--T-T-----A-TA--AC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CA----T--T----G--T--------------G---T-----G-G--G---CA-T-A-A-TAA
gi|8318                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G------C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA---C-------C---T-C-----------C-G-C----A--A------T---CG----A--T----G--CG-------------G---TG---GG-G--G---TA-G-A-A-TAA
gi|8319                       :                                                       G--A--------C--------T-G-A-C----A-G--A---C--G--G--G-T-A-AA--A-A---A--CT--A-T-----A-TA--AC-------C-----C-----------A-G-C----A--A-CT---T---TG----T--T----G--C--------------A---T----GC-G--G---TA-T-A-
gi|8320                       :                                                        --A--------C--------T-G-A-C----G-G--A---C--G--G--G-T-C-AA--A-A---A--CC--T-T-----A-TAGGCCTT-----C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---GG----T--T----T--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8321                       :                                                                    --------T-G-A-C----G-GGAA---C--G--G----T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-T---CCTTCAGTGC---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---GG----T--T----T--C--------------GT--T----GG-G--G---TT-T-A-A-TAA
gi|8322                       :                                                                             -G-A-C----ATG--A---C--G--G----T-C-AA--A-ATTCC--CA--T-T-----A-TA--CC-----------T-C-----------C-G-C----AT-A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8323                       :                                                                               -A-C----G-G--A---C--G--CACG-T-C-AG--C-G---A--TG--C-T-----A-TATCCC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8324                       :                                                                                 -C----A-G--A---C--T--G--------AA--A-A---A--CA--T-A-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--C----G--CCCCGGGCTCATCGTG---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8325                       :                                                                                                    --G--G-T-C-AA--A-A---A--CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---C----------------------------------------GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8326                       :                                                                                                              -AA--A-A---A--CA--T----------A--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GA-G--G---AA-T-A-A-AAA
gi|8327                       :                                                                                                                          --CA--T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---TG----T--T----G--C--------------A---TG---GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8328                       :                                                                                                                              --T-T-----A-TA--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---
gi|8329                       :                                                                                                                                 -T-----A-TC--CC-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---A----GG-G--G----A-T-A-A-TAA
gi|8330                       :                                                                                                                                               C-------C---T-C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-ACTAA
gi|8331                       :                                                                                                                                                            -C-----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA
gi|8332                       :                                                                                                                                                              -----------C-G-C----A--A-C----T---CG----T--T----G--C--------------G---T----GG-G--G---TA-T-A-A-TAA