lowQualScore                  :                                            1 0     0 0 11 0  0 33333333333  0 0  0 111111111 3333333333 22222222222  11  2222222 33333333333 66666666666666666666666 0 11 0 222 11111111 0 1  11  1 11111 3333 2222 444 0 3333  000 3333  2222222222 0   111 6 0      
lowQualScore                  :                                            . .     . . .. .  . ...........  . .  . ......... .......... ...........  ..  ....... ........... ....................... . .. . ... ........ . .  ..  . ..... .... .... ... . ....  ... ....  .......... .   ... . .      
lowQualScore                  :                                            8 6     5 5 33 5  5 22222222222  5 4  4 888888888 8888888888 22222222222  11  4444444 44444444444 55555555555555555555555 9 66 9 111 77777777 5 4  66  4 88888 1111 8888 444 5 9999  888 5555  1111111111 5   333 6 5      
consensus                     :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
Reference ( gi|5729 )         :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CACCGT
gi|5730                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---ATT-CACCGT
gi|5731                       :                                        TGCG-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-G---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CACCGT
gi|5732                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGT---TTT-CACCGT
gi|5733                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------TG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---C--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-CAC---GTT-CACCGT
gi|5734                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CA-A---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5737                       :                                        TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-G---------T----------G-----------CA--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5736                       :                                        TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------TG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5738                       :                                        TGCG-T-TTACC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5739                       :                                        TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TC-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCAT
gi|5740                       :                                        TGCG-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-A---------T----------G-----------CC--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5741                       :                                        TGCG-A-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CA--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--A-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5744                       :                                        TGCG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GC----------G-TGC---GTT-CCCCGT
gi|5742                       :                                        TGCA-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CT----------G-TGC---GTT-GTCCGT
gi|5745                       :                                        TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TC-A-----A----T----T---G-A----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CAC
gi|5747                       :                                        TGCA-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------TG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CC----------G-TGC---GTT-CTCC
gi|5749                       :                                        TGCA-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-A---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------C---C-A--T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GT----------G-TGT---GTT-CACCAT
gi|5750                       :                                        TGCG-T-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------G---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CC----------G-TGC---AGT-CATCGT
gi|5746                       :                                        TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---CTA--T-TC--T--------T-T-CA--AT-C-----A----T----T---G-A----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CAC
gi|5751                       :                                        TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-AT-T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A-----C----------G-TGC---GGT-CACC
gi|5753                       :                                        TGCG-G-TCACC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-G---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACTGT
gi|5752                       :                                        TGTG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------C---------T---C-A--T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5754                       :                                        TGCG-T-TCATC-G-T--G-CT-GTCACCATGACTTC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5755                       :                                        TGCG-G-TTACC-A-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------AGCGTGCGTTG---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GT----------G-TGC---GTT-CACCGT
gi|5756                       :                                        TGCG-T-TCGCC-A-T--G-CA-T-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------AA--TT-------C-----------A---------G---------C---C-A--T-T---T--------T-C-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CATCGT
gi|5757                       :                                        TGCA-G-TCACC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-GC-A---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACTGT
gi|5758                       :                                        TGCG-T-TTGCC-A-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----AC----------G-AGC---GTT-CACCGT
gi|5759                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------GC-A-CC-G---------TTCACAGTTTTG-----------CG--GT-------C-----------A---------GCGTGTTTAAT---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5760                       :                                        TGCG-G-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TA-A-CC-A---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A----T---T--------T-T-CA--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGT---GGT-TACCGT
gi|5761                       :                                        TGAG-T-TCAACCG-T--GGCG-G-----------TC-A-CT-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-T--T-T---T--------T-TTCA--TT-A-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5762                       :                                        TGCG-T-T-AGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C--A---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------C---C-G--T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCGTCGGTCAGTG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5763                       :                                        TGTG-G-TAAGC-T-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------C---C-A--T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GC----------G-T-----GTT-TATCGT
gi|5735                       :                                        TGTG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------TG--TT-------C-----------A---------G---------CGTGT-G--T-T---C--------T-C-CG--TT-CACCAAA----T----T---G-CGA--TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5764                       :                                        TGCG-T-TCACC-G-T--G-CG-C-----------TC-G-CC-G---------T----------T-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-
gi|5765                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CA--AT-------C-----------A---------G-------------C-G--TGT---G--------G-T-CA---C-C-----G----T----TC--G-T----TC---T----GC----------G-TGC---AGT-CACCGT
gi|5767                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-G---------T----------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-------G---------TTCAC-A--G-T---T--------T-TGCG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----AC----------G-TGT---GCT-CACCGT
gi|5770                       :                                        TGAG-T-TCAGT-G-TTTG-CG-G-----------TC-AACC-G---------T----------------------CGATTT-------C-----------AT--------G---------T-----A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TTTCAA----GC----------G-TGC---GGT-CACTG
gi|5748                       :                                        TGCA-TGTCAGC-G-T--G-CGCG-----------TCCA-CC-G---------T----------G------------G--TT-------T-----------A---------G---------T---CTA--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---
gi|5771                       :                                        TGTG-T-TTACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-TC-G---------T----------G-----------CT--TT-------CTGCGTGCGGTTA---------G---------T---A-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GT----------G-TAT---ATA-TACCGT
gi|5768                       :                                        TGCG-T-TCATC-G-T--G-AG-C-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-------G---------TTCAC-A--G-T---T--------T-TGCG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----AC----------G-TGC---GCT-CACCGT
gi|5772                       :                                        TGCA-T-TCTGC-G-T--G-AG-T-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TTCTCCGTGC-----------G---------G---------T---C-A--T-C---G--------T-G-CA--GT-C-----A----T----T---G-T----TC---GCTCTGC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5773                       :                                        TGCT-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------TG--TT-------C-----------ACCGCGCG--G---------T---C-A--C-C---G--------T-T-CA---C-CAA---A----T----TGC-G-T----TT---A----GC----------G-TGC---GAT-TGCCGT
gi|5769                       :                                        TGCG-T-TCAAC-G-T--G-TG-C-----------TC-A-CC-G---------TTCGTTCA---G-----------CG--TT-------C-----------A---------T---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-
gi|5766                       :                                        TGCG-T-TTTGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G-------------C-G-----------------T-G-CG--GT-C-----A----C----C---G-TGCAATC---A----GC----------G-TGT---GGT-CACCGT
gi|5774                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------
gi|5776                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C-----------------------------------CG--TT-------C-----------A-----------------------C-A--T-TGCGG--------T-C-CG--TT-C-----G----C----G---G-T----T----A----GC----------G-TGC---AGT-CACCG
gi|5777                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-CA-G---------T----------G-----------AG--TT-------C-----------A-------------------C---C-G--T-T---TAAAAACTAC-T-CA--TG-A-----A----T----TTGCG-T----TC---A----GC----------G-TGC---GCT-CACCAT
gi|5743                       :                                        TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-G---------T----------G-----------CG--TG-------T-----------G---------G---------T---A-A----A---N--------T-T-CAC-CT-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GC----------G-TGT---GGT-CACTGT
gi|5778                       :                                        TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-A---------T----------G-----------CC--GT-------C-----------ACC-------GTGTGT----T---C-A--T-C---G--------T-G-CA--GT-C-----A----C----C---G-TGGGGTC---A----GC----------G-TGC---ATT-CA
gi|5775                       :                                        TGCG-T-TCAGC-GCT--G-CA-GC----------TT-A-CC-GTGGGTCACAT----------G-----------CG--TTA------C-----------A---------G---------T---C-A----T---T--------T-T-CA--TG-C-----G---------T---G-T----TC---A----GA----------G-TGC---GAT-CAC
gi|5779                       :                                         GCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------A-------------C-A--T-T---T--------T-T-CG--TT-C-----A---------T---G-T----TC---AG---GC----------G-TGC---GGT-CACCAT
gi|5780                       :                                         GCG-G-TCACC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-TC-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACAGT
gi|5781                       :                                         GCG-A-TCA-C-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------A-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CATTTT-C-----AT---T----T---GTT----TC---A----G-----------A-TGT---G-T-CACCG
gi|5782                       :                                          CA-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-A---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A-------------------C---C-G--T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GC----------G-TGC---AGT-CACCAT
gi|5798                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------
gi|5801                       : agcgtgcgggtcaccgtgcattcagtcaattttcaattcactG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------
gi|5816                       :     cgtgcgttcaacgagcgttaagtcatttttcattcattG-T-TCAGC-G-A--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------
gi|5783                       :                        cagtcatttttcattcattG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------TG--TT-------C-----------A---------G-------------C-G--TGC---G--------G-T-CA---C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----GC----------G-TGT---GTT-CTCCGT
gi|5784                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C---------------------T---------C---C-A-----------------T-T-CG--GT-C-----A----T----C---G-T----TC---GCTCTGC----------G-TGC---GGT-CACTGT
gi|5789                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------CGTGC-G--G-T---C--------A-C-CG--TT-C-------------------G-T----TC---T----GC----------A-TAC---GGT-CACCGT
gi|5790                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------CTCC--------G---------T---------T---C-A--C-CAAAT--------T-G-CG--GT-C-----ACCGTT----C---G-T----TC---T----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5786                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-------------------------------------------------------T-C-CG--TT-C-------------------G-G----TC---A----CC----------G-TGC---GTT-CA
gi|5794                       :                                           G-T-TCAGC-G-A--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------C---------G-------------C-G-----------------T-T-CG--GT-C-----A----C----C---G-T----TC---GCTCTGC----------G-TGC---AGT-CACCGT
gi|5793                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------------C-A--------G--------T-T-CA--CA-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GC----------G-TGC---AGT-CACTGT
gi|5787                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-------------------------------T---C------C---G--------T-T-CG--GT-C-----A----CCGTGC---G-T----TC---A----AC----------T-TGC---GGT-CACCGT
gi|5785                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-A---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A-------------------C---C-G--T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GC----------A-TAC---AGT-CACCAT
gi|5792                       :                                           G-T-TCAGC-T-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-G---------T----------G-----------CA--TT-------C-----------A---------G-------------C-G--T-G---C--------GGT-CA--C--C-----A----TG---C---G-T----TC---A----GC----------G-TGT---GGT-CACCG
gi|5791                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A-------------------C---C-G--T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACTGT
gi|5788                       :                                           G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------ACC-------G---------T---T-A----------------------A--CTAA-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CAACGT
gi|5796                       :                                              -TCATC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-GC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---A-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5811                       :                                              -TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------
gi|5795                       :                 ccgtgcgttcagtcatttttcattcattg-TCAGC-G-TCGG-CC-G-----------TC-A-C--G---------TC---------G-----------TG--TT-----------------------------A---------T---C-A--T-T---T--------T-T-C---TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CC----------G-TGC---GTT-CCCC
gi|5797                       :                                                CATC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------A-TGC---GGT-CACCGT
gi|5798                       :                                                 AGC-G-T--G-CG-GG----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CA--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--A-T---T--------T-T-CAA-TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5799                       :                                                  GC-G----G-CG-G-----------TC-A-CCAG---------T----------G-----------CGG-TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------GTTGT---GGT-CACCGT
gi|5800                       :                                                  GC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GA-G---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T---CA--TG-C-----A----T----T---G-G----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5801                       :                                                   C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-G---------A----------G-----------CG--TT-------A-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5802                       :                                                   C-G-T----CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------GTTTCTGCGGTGCG--TT-------TT----------A---------G---------T---T-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5803                       :                                                   C-A-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-G---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------A---------T---C-A--T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GT----------G-TGC---TGT-CACCGT
gi|5804                       :                                                   C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-G---------T----------G-----------TT--GT-------C-----------A---------G---------T---C-AG-T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A---------T---G-C----TC--------GC----------G-TGCA--GTC-CACCGT
gi|5806                       :                                                    -G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TTT------C-----------A---------G---------T---C-ACAT-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----A----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGCTGGGGT-CACCGT
gi|5807                       :                                                    -G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-G---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T--A--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------T-TGC---GGT-TACCGT
gi|5805                       :                                                    -G-T--G-CG-G------------C-A-TC-A---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----------------------------TAC---GCT-CACC
gi|5808                       :                                                      -T--G-CG-G-----------TC-A-CC-C---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CACC
gi|5809                       :                                                                -----------TT-A-CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------T-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-------------------G-T----TC---A----GC----------G-TGT---GTT-CACCGT
gi|5811                       :                                                                               -CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT
gi|5812                       :                                                                               -CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---T-A--T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5813                       :                                                                               -CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---T-A--T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GTTGCTCCGT
gi|5810                       :                                                                               -CC-G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC------------TGC---TGT-CACCAT
gi|5814                       :                                                                               -CC-A---------T----------G-----------CG--GT-------C-----------A---------C---------TT--C-A--T-T---G--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CC----------G-TGC---GTT-CAC
gi|5815                       :                                                                                  -G---------T----------G-----------CG--TT-------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T--A--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---C----CC----------G-TGT---GGT-CACCAT
gi|5816                       :                                                                                                                          -------C-----------A---------G---------T---C-A--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC----------G-AGC---GGT-CACCGT
gi|5786                       :                                                                                                                                                                                                                     ---G-T----TC---A----GC----------G-TGC---GGT-CACCGT

lowQualScore                  :                                                 1 0     0 0 11 0  0 44444444444  0 0  0  2222222 44444444444  11  2222222 33333333333 3333333 444444444 222 0 333 0 222 11111111 0 0  11  1 11111 3333 3333 444 0 2222  000 3333   0   000   1      
lowQualScore                  :                                                 . .     . . .. .  . ...........  . .  .  ....... ...........  ..  ....... ........... ....... ......... ... . ... . ... ........ . .  ..  . ..... .... .... ... . ....  ... ....   .   ...   .      
lowQualScore                  :                                                 8 6     5 5 44 5  5 99999999999  5 5  5  7777777 00000000000  11  4444444 44444444444 8888888 555555555 111 9 222 9 111 77777777 5 5  66  4 88888 0000 3333 444 5 9999  888 6666   5   999   0      
consensus                     :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
Reference ( family-253 )      :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5729                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5730                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---ATT-CACCGT
gi|5731                       :                                             TGCG-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-G---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5732                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGT---TTT-CACCGT
gi|5733                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---C--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-CAC---GTT-CACCGT
gi|5734                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CA-AT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5735                       :                                             TGTG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G---------CGTGT-G---T-T---C--------T-C-CG--TT-CACCAAA----T----T---G-CGA--TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5736                       :                                             TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5737                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5738                       :                                             TGCG-T-TTACC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5739                       :                                             TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TC-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCAT
gi|5740                       :                                             TGCG-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CC--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5741                       :                                             TGCG-A-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---A-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5742                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CTG-TGC---GTT-GTCCGT
gi|5743                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TG-------T-----------G-------G---------T---A-A-----A---N--------T-T-CAC-CT-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-CACTGT
gi|5744                       :                                             TGCG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GCG-TGC---GTT-CCCCGT
gi|5745                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TC-A-----A----T----T---G-A----TC---A----GCG-TGC---GTT-CAC
gi|5746                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---CTA---T-TC--T--------T-T-CA--AT-C-----A----T----T---G-A----TC---A----GCG-TGC---GTT-CAC
gi|5747                       :                                             TGCA-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CTCC
gi|5748                       :                                             TGCA-TGTCAGC-G-T--G-CGCG-----------TCCA-CC-GT-------G------------G--TT-------T-----------A-------G---------T---CTA---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---
gi|5749                       :                                             TGCA-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GTG-TGT---GTT-CACCAT
gi|5750                       :                                             TGCG-T-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------G---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---AGT-CATCGT
gi|5751                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-AT--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A-----CG-TGC---GGT-CACC
gi|5752                       :                                             TGTG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------C---------T---C-A---T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5753                       :                                             TGCG-G-TCACC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5754                       :                                             TGCG-T-TCATC-G-T--G-CT-GTCACCATGACTTC-A-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5755                       :                                             TGCG-G-TTACC-A-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------GCGTGCGTTGT---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5756                       :                                             TGCG-T-TCGCC-A-T--G-CA-T-----------TC-A-CC-GT-------G-----------AA--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-C-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CATCGT
gi|5757                       :                                             TGCA-G-TCACC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-GC-AT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5758                       :                                             TGCG-T-TTGCC-A-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----ACG-AGC---GTT-CACCGT
gi|5759                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-GGCACCGT----TC-A-CA-GTTTT----G-----------CG--GT-------C-----------A-------GCGTGTTTAAT---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5760                       :                                             TGCG-G-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TA-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A-----T---T--------T-T-CA--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-TACCGT
gi|5761                       :                                             TGAG-T-TCAACCG-T--GGCG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-T---T-T---T--------T-TTCA--TT-A-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5762                       :                                             TGCG-T-T-AGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C--AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-G---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-T-C---GGT-CA
gi|5762                       :                                                G-T-TCAGC-G-T----CG-G-----------TC-A-GT-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------gtgtgcgttctccgt
gi|5763                       : tgcgttagcgtgcggtcacatgcgttcagccgtttttcatcattTGTG-G-TAAGC-T-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GCG-TGtccgt
gi|5764                       :                                             TGCG-T-TCACC-G-T--G-CG-C-----------TC-G-CC-GT-------T-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-tttatcgt
gi|5765                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--AT-------C-----------A-------G-------------C-G---TGT---G--------G-T-CA---C-C-----G----T----TC--G-T----TC---T----GCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5766                       :                                             TGCG-T-TTTGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G-------------C-G------------------T-G-CG--GT-C-----A----C----C---G-TGCAATC---A----GCG-TGT---GGT-CACCGT
gi|5767                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-GT-------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-----GT--------T---C-ACAGT-T---T--------T-G-CG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----ACG-TGT---GCT-CACCGT
gi|5768                       :                                             TGCG-T-TCATC-G-T--G-AG-C-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-----GT--------T---C-ACAGT-T---T--------T-G-CG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----ACG-TGC---GCT-CACCGT
gi|5769                       :                                             TGCG-T-TCAAC-G-T--G-TG-C-----------TC-A-CC-GTTCGTTCAG-----------CG--TT-------C-----------A-------T---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-
gi|5770                       :                                             TGAG-T-TCAGT-G-TTTG-CG-G-----------TC-AACC-GT-------------------CGATTT-------C-----------AT------G---------T-----A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TTTCAA----GCG-TGC---GGT-CACTG
gi|5771                       :                                             TGTG-T-TTACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CT--TT-------CTGCGTGCGGTTA-------G---------T---A-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-T
gi|5772                       :                                             TGCA-T-TCTGC-G-T--G-AG-T-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TTCTCCGTGC-----------G-------G---------T---C-A---T-C---G--------T-G-CA--GT-C-----A----T----T---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---GGT-CACCGTatatataccgt
gi|5773                       :                                             TGCT-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------ACCGCGCGG---------T---C-A---C-C---G--------T-T-CA---C-CAA---A----T----TGC-G-T----TT---A----GCG-TGC---GAT-TGCCGT
gi|5774                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------
gi|5775                       :                                             TGCG-T-TCAGC-GCT--G-CA-GC----------TT-A-CC-GT-------GGGTCACATG--CG--TTA------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TG-C-----G----T--------G-T----TC---A----GAG-TGC---GAT-CAC
gi|5776                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C-----------------------CG--TT-------C-----------A---------------------C-A---T-TGCGG--------T-C-CG--TT-C-----G----C----G---G-T----T----A----GCG-TGC---AGT-CACCG
gi|5777                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-CA-GT-------G-----------AG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---TAAAAACTAC-T-CA--TG-A-----A----T----TTGCG-T----TC---A----GCG-TGC---GCT-CACCAT
gi|5778                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------C------------C-------------------G---------T---C-A---------------------------C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----TCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5779                       :                                              GCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------A-------------C-A---T-T---T--------T-T-CG--TT-C-----A---------T---G-T----TC---AG---GCG-TGC---GGT-CACCATggggtcagcgtgcattca
gi|5780                       :                                              GCG-G-TCACC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACAGT
gi|5781                       :                                              GCG-A-TCA-C-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------A-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CATTTT-C-----AT---T----T---GTT----TC---A----G-A-TGT----GT-CACCG
gi|5782                       :                                               CA-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GCG-TGC---AGT-CACCAT
gi|5783                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G-------------C-G---TGC---G--------G-T-CA---C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----GCG-TGT---GTT-CTCCGT
gi|5784                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-------------------T---------C---C-A------------------T-T-CG--GT-C-----A----T----C---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5785                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GCA-TAC---AGT-CACCAT
gi|5786                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C------------------------------------------------------T-C-CG--TT-C-------------------G-G----TC---A----CCG-TGC---GTT-CA
gi|5787                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------------------------T---C-------C---G--------T-T-CG--GT-C-----A----CCGTGC---G-T----TC---A----ACT-TGC---GGT-CACCGT
gi|5788                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------ACC-----G---------T---T-A-----------------------A--CTAA-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CAACGT
gi|5789                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------CGTGC-G---G-T---C--------A-C-CG--TT-C-------------------G-T----TC---T----GCA-TAC---GGT-CACCGT
gi|5790                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------CTCC--------G-------T---------T---C-A---C-CAAAT--------T-G-CG--GT-C-----ACCGTT----C---G-T----TC---T----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5791                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5792                       :                                                G-T-TCAGC-T-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G-------------C-G---T-G---C--------GGT-CA--C--C-----A----TG---C---G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-CACCG
gi|5793                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A---------------------C-A---------G--------T-T-CA--CA-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---AGT-CACTGT
gi|5794                       :                                                G-T-TCAGC-G-A--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------C-------G-------------C-G------------------T-T-CG--GT-C-----A----C----C---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5795                       :                                                   -TCAGC-G-TCGG-CC-G-----------TC-A-C--GTC------G-----------TG--TT---------------------------A---------T---C-A---T-T---T--------T-T-C---TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CCCC
gi|5796                       :                                                   -TCATC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-GC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---A-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5797                       :                                                     CATC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCA-TGC---GGT-CACCGT
gi|5798                       :                                                      AGC-G-T--G-CG-GG----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---A-T---T--------T-T-CAA-TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5799                       :                                                       GC-G----G-CG-G-----------TC-A-CCAGT-------G-----------CGG-TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCGTTGT---GGT-CACCGT
gi|5800                       :                                                       GC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GA-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TG-C-----A----T----T---G-G----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5801                       :                                                        C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-GA-------G-----------CG--TT-------A-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5802                       :                                                        C-G-T----CG-G-----------TC-A-CC-GT-------GTTTCTGCGGTGCG--TT-------TT----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5803                       :                                                        C-A-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------A---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-TGC---TGT-CACCGT
gi|5804                       :                                                        C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-GT-------G-----------TT--GT-------C-----------A-------G---------T---C-AG--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A---------T---G-C----TC--------GCG-TGC---AGTCCACCGT
gi|5805                       :                                                         -G-T--G-CG-G------------C-A-TC-AT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----T
gi|5806                       :                                                         -G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TTT------C-----------A-------G---------T---C-ACA-T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----A----T---G-T----TC---A----GCG-TGCTGGGGT-CACCGTacgctcacc
gi|5807                       :                                                         -G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T--A--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCT-TGC---GGT-TACCGT
gi|5808                       :                                                           -T--G-CG-G-----------TC-A-CC-CT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACC
gi|5809                       :                                                                     -----------TT-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-------------------G-T----TC---A----GCG-TGT---GTT-CACCGT
gi|5810                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC--TGC---TGT-CACCAT
gi|5811                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5812                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5813                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTTGCTCCGT
gi|5814                       :                                                                                    -CC-AT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------C---------TT--C-A---T-T---G--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CAC
gi|5815                       :                                                                                       -GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T--A--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---C----CCG-TGT---GGT-CACCAT
gi|5816                       :                                                                                                                   -------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-AGC---GGT-CACCGT

lowQualScore                  :                                                 1 0     0 0 11 0  0 44444444444  0 0  0  2222222 44444444444  11  2222222 33333333333 3333333 444444444 222 0 333 0 222 11111111 0 0  11  1 11111 3333 3333 444 0 2222  000 3333   0   000   1      
lowQualScore                  :                                                 . .     . . .. .  . ...........  . .  .  ....... ...........  ..  ....... ........... ....... ......... ... . ... . ... ........ . .  ..  . ..... .... .... ... . ....  ... ....   .   ...   .      
lowQualScore                  :                                                 8 6     5 5 44 5  5 99999999999  5 5  5  7777777 00000000000  11  4444444 44444444444 8888888 555555555 111 9 222 9 111 77777777 5 5  66  4 88888 0000 3333 444 5 9999  888 6666   5   999   0      
consensus                     :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
Reference ( family-253 )      :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5729                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5730                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---ATT-CACCGT
gi|5731                       :                                             TGCG-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-G---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5732                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGT---TTT-CACCGT
gi|5733                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---C--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-CAC---GTT-CACCGT
gi|5734                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CA-AT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5735                       :                                             TGTG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G---------CGTGT-G---T-T---C--------T-C-CG--TT-CACCAAA----T----T---G-CGA--TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5736                       :                                             TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5737                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5738                       :                                             TGCG-T-TTACC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5739                       :                                             TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TC-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCAT
gi|5740                       :                                             TGCG-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CC--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5741                       :                                             TGCG-A-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---A-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5742                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CTG-TGC---GTT-GTCCGT
gi|5743                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TG-------T-----------G-------G---------T---A-A-----A---N--------T-T-CAC-CT-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-CACTGT
gi|5744                       :                                             TGCG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GCG-TGC---GTT-CCCCGT
gi|5745                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TC-A-----A----T----T---G-A----TC---A----GCG-TGC---GTT-CAC
gi|5746                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---CTA---T-TC--T--------T-T-CA--AT-C-----A----T----T---G-A----TC---A----GCG-TGC---GTT-CAC
gi|5747                       :                                             TGCA-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CTCC
gi|5748                       :                                             TGCA-TGTCAGC-G-T--G-CGCG-----------TCCA-CC-GT-------G------------G--TT-------T-----------A-------G---------T---CTA---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---
gi|5749                       :                                             TGCA-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GTG-TGT---GTT-CACCAT
gi|5750                       :                                             TGCG-T-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------G---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---AGT-CATCGT
gi|5751                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-AT--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A-----CG-TGC---GGT-CACC
gi|5752                       :                                             TGTG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------C---------T---C-A---T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5753                       :                                             TGCG-G-TCACC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5754                       :                                             TGCG-T-TCATC-G-T--G-CT-GTCACCATGACTTC-A-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5755                       :                                             TGCG-G-TTACC-A-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------GCGTGCGTTGT---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5756                       :                                             TGCG-T-TCGCC-A-T--G-CA-T-----------TC-A-CC-GT-------G-----------AA--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-C-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CATCGT
gi|5757                       :                                             TGCA-G-TCACC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-GC-AT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5758                       :                                             TGCG-T-TTGCC-A-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----ACG-AGC---GTT-CACCGT
gi|5759                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-GGCACCGT----TC-A-CA-GTTTT----G-----------CG--GT-------C-----------A-------GCGTGTTTAAT---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5760                       :                                             TGCG-G-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TA-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A-----T---T--------T-T-CA--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-TACCGT
gi|5761                       :                                             TGAG-T-TCAACCG-T--GGCG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-T---T-T---T--------T-TTCA--TT-A-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5762                       :                                             TGCG-T-T-AGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C--AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-G---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-T-C---GGT-CA
gi|5762                       :                                                G-T-TCAGC-G-T----CG-G-----------TC-A-GT-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------gtgtgcgttctccgt
gi|5763                       : tgcgttagcgtgcggtcacatgcgttcagccgtttttcatcattTGTG-G-TAAGC-T-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GCG-TGtccgt
gi|5764                       :                                             TGCG-T-TCACC-G-T--G-CG-C-----------TC-G-CC-GT-------T-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-tttatcgt
gi|5765                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--AT-------C-----------A-------G-------------C-G---TGT---G--------G-T-CA---C-C-----G----T----TC--G-T----TC---T----GCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5766                       :                                             TGCG-T-TTTGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G-------------C-G------------------T-G-CG--GT-C-----A----C----C---G-TGCAATC---A----GCG-TGT---GGT-CACCGT
gi|5767                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-GT-------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-----GT--------T---C-ACAGT-T---T--------T-G-CG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----ACG-TGT---GCT-CACCGT
gi|5768                       :                                             TGCG-T-TCATC-G-T--G-AG-C-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-----GT--------T---C-ACAGT-T---T--------T-G-CG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----ACG-TGC---GCT-CACCGT
gi|5769                       :                                             TGCG-T-TCAAC-G-T--G-TG-C-----------TC-A-CC-GTTCGTTCAG-----------CG--TT-------C-----------A-------T---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-
gi|5770                       :                                             TGAG-T-TCAGT-G-TTTG-CG-G-----------TC-AACC-GT-------------------CGATTT-------C-----------AT------G---------T-----A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TTTCAA----GCG-TGC---GGT-CACTG
gi|5771                       :                                             TGTG-T-TTACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CT--TT-------CTGCGTGCGGTTA-------G---------T---A-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-T
gi|5772                       :                                             TGCA-T-TCTGC-G-T--G-AG-T-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TTCTCCGTGC-----------G-------G---------T---C-A---T-C---G--------T-G-CA--GT-C-----A----T----T---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---GGT-CACCGTatatataccgt
gi|5773                       :                                             TGCT-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------ACCGCGCGG---------T---C-A---C-C---G--------T-T-CA---C-CAA---A----T----TGC-G-T----TT---A----GCG-TGC---GAT-TGCCGT
gi|5774                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------
gi|5775                       :                                             TGCG-T-TCAGC-GCT--G-CA-GC----------TT-A-CC-GT-------GGGTCACATG--CG--TTA------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TG-C-----G----T--------G-T----TC---A----GAG-TGC---GAT-CAC
gi|5776                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C-----------------------CG--TT-------C-----------A---------------------C-A---T-TGCGG--------T-C-CG--TT-C-----G----C----G---G-T----T----A----GCG-TGC---AGT-CACCG
gi|5777                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-CA-GT-------G-----------AG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---TAAAAACTAC-T-CA--TG-A-----A----T----TTGCG-T----TC---A----GCG-TGC---GCT-CACCAT
gi|5778                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------C------------C-------------------G---------T---C-A---------------------------C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----TCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5779                       :                                              GCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------A-------------C-A---T-T---T--------T-T-CG--TT-C-----A---------T---G-T----TC---AG---GCG-TGC---GGT-CACCATggggtcagcgtgcattca
gi|5780                       :                                              GCG-G-TCACC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACAGT
gi|5781                       :                                              GCG-A-TCA-C-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------A-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CATTTT-C-----AT---T----T---GTT----TC---A----G-A-TGT----GT-CACCG
gi|5782                       :                                               CA-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GCG-TGC---AGT-CACCAT
gi|5783                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G-------------C-G---TGC---G--------G-T-CA---C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----GCG-TGT---GTT-CTCCGT
gi|5784                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-------------------T---------C---C-A------------------T-T-CG--GT-C-----A----T----C---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5785                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GCA-TAC---AGT-CACCAT
gi|5786                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C------------------------------------------------------T-C-CG--TT-C-------------------G-G----TC---A----CCG-TGC---GTT-CA
gi|5787                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------------------------T---C-------C---G--------T-T-CG--GT-C-----A----CCGTGC---G-T----TC---A----ACT-TGC---GGT-CACCGT
gi|5788                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------ACC-----G---------T---T-A-----------------------A--CTAA-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CAACGT
gi|5789                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------CGTGC-G---G-T---C--------A-C-CG--TT-C-------------------G-T----TC---T----GCA-TAC---GGT-CACCGT
gi|5790                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------CTCC--------G-------T---------T---C-A---C-CAAAT--------T-G-CG--GT-C-----ACCGTT----C---G-T----TC---T----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5791                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5792                       :                                                G-T-TCAGC-T-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G-------------C-G---T-G---C--------GGT-CA--C--C-----A----TG---C---G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-CACCG
gi|5793                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A---------------------C-A---------G--------T-T-CA--CA-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---AGT-CACTGT
gi|5794                       :                                                G-T-TCAGC-G-A--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------C-------G-------------C-G------------------T-T-CG--GT-C-----A----C----C---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5795                       :                                                   -TCAGC-G-TCGG-CC-G-----------TC-A-C--GTC------G-----------TG--TT---------------------------A---------T---C-A---T-T---T--------T-T-C---TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CCCC
gi|5796                       :                                                   -TCATC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-GC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---A-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5797                       :                                                     CATC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCA-TGC---GGT-CACCGT
gi|5798                       :                                                      AGC-G-T--G-CG-GG----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---A-T---T--------T-T-CAA-TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5799                       :                                                       GC-G----G-CG-G-----------TC-A-CCAGT-------G-----------CGG-TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCGTTGT---GGT-CACCGT
gi|5800                       :                                                       GC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GA-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TG-C-----A----T----T---G-G----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5801                       :                                                        C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-GA-------G-----------CG--TT-------A-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5802                       :                                                        C-G-T----CG-G-----------TC-A-CC-GT-------GTTTCTGCGGTGCG--TT-------TT----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5803                       :                                                        C-A-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------A---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-TGC---TGT-CACCGT
gi|5804                       :                                                        C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-GT-------G-----------TT--GT-------C-----------A-------G---------T---C-AG--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A---------T---G-C----TC--------GCG-TGC---AGTCCACCGT
gi|5805                       :                                                         -G-T--G-CG-G------------C-A-TC-AT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----T
gi|5806                       :                                                         -G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TTT------C-----------A-------G---------T---C-ACA-T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----A----T---G-T----TC---A----GCG-TGCTGGGGT-CACCGTacgctcacc
gi|5807                       :                                                         -G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T--A--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCT-TGC---GGT-TACCGT
gi|5808                       :                                                           -T--G-CG-G-----------TC-A-CC-CT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACC
gi|5809                       :                                                                     -----------TT-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-------------------G-T----TC---A----GCG-TGT---GTT-CACCGT
gi|5810                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC--TGC---TGT-CACCAT
gi|5811                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5812                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5813                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTTGCTCCGT
gi|5814                       :                                                                                    -CC-AT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------C---------TT--C-A---T-T---G--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CAC
gi|5815                       :                                                                                       -GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T--A--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---C----CCG-TGT---GGT-CACCAT
gi|5816                       :                                                                                                                   -------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-AGC---GGT-CACCGT


blockSeqs                     :                                                 G           TT      TCACCATGACT          TCGTTCA TTTCTGCGGTG  AT  CTCCGTG TGCGTGCGGTT CCGCGCG CGTGCGTTG GTG   CAG   GCG AAAAACTA      TT  G ACCAA CCGT CGTG TGC   GCAA      CTCT
blockSeqs                     :                                                 G           CG      GCACCGT              TTT     GGTCACATG    G   A       TCC         CC      CGTGTTTAA GTG   CAG   AAA .             C   G AA    GCG  G    GC    GA        CTCT
blockSeqs                     :                                                 G           .       C                    C       .            .   T       T           CC      T         T     CA    C   .             A   A .     GCG  G    GC    GG        CTCT
blockSeqs                     :                                                 .           .       G                    .       .            .   .       .           CC      T         .     T     .   .             .   . .     T    G    GC    GG        G   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           T       .         .     G     .   .             .   . .     .    G    GC    .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    G    GC    .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    C     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                 .           .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                             .       .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                                     .                    .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                                                          .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .         .   
blockSeqs                     :                                                                                          .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .             
blockSeqs                     :                                                                                          .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .     .             
blockSeqs                     :                                                                                          .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .                   
blockSeqs                     :                                                                                          .       .            .   .       .           .       .         .     .     .   .             .   . .     .    .    .                   
blockSeqs                     :                                                                                          .       .            .   .       .           .       .                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                   .       .                                                                                                     


blockSeqCons                  :                                             
originalCons                  :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
finalCons                     :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT

lowQualScore                  :                                                 1 0     0 0 11 0  0 44444444444  0 0  0  2222222 44444444444  11  2222222 33333333333 3333333 444444444 222 0 333 0 222 11111111 0 0  11  1 11111 3333 3333 444 0 2222  000 3333   0   000   1      
lowQualScore                  :                                                 . .     . . .. .  . ...........  . .  .  ....... ...........  ..  ....... ........... ....... ......... ... . ... . ... ........ . .  ..  . ..... .... .... ... . ....  ... ....   .   ...   .      
lowQualScore                  :                                                 8 6     5 5 44 5  5 99999999999  5 5  5  7777777 00000000000  11  4444444 44444444444 8888888 555555555 111 9 222 9 111 77777777 5 5  66  4 88888 0000 3333 444 5 9999  888 6666   5   999   0      
consensus                     :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
Reference ( family-253 )      :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5729                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5730                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---ATT-CACCGT
gi|5731                       :                                             TGCG-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-G---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5732                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGT---TTT-CACCGT
gi|5733                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---C--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-CAC---GTT-CACCGT
gi|5734                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CA-AT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5735                       :                                             TGTG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G---------CGTGT-G---T-T---C--------T-C-CG--TT-CACCAAA----T----T---G-CGA--TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5736                       :                                             TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5737                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5738                       :                                             TGCG-T-TTACC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5739                       :                                             TGCG-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TC-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCAT
gi|5740                       :                                             TGCG-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CC--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5741                       :                                             TGCG-A-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---A-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5742                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CTG-TGC---GTT-GTCCGT
gi|5743                       :                                             TGCA-T-TCAGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TG-------T-----------G-------G---------T---A-A-----A---N--------T-T-CAC-CT-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-CACTGT
gi|5744                       :                                             TGCG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GCG-TGC---GTT-CCCCGT
gi|5745                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TC-A-----A----T----T---G-A----TC---A----GCG-TGC---GTT-CAC
gi|5746                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---CTA---T-TC--T--------T-T-CA--AT-C-----A----T----T---G-A----TC---A----GCG-TGC---GTT-CAC
gi|5747                       :                                             TGCA-G-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CTCC
gi|5748                       :                                             TGCA-TGTCAGC-G-T--G-CGCG-----------TCCA-CC-GT-------G------------G--TT-------T-----------A-------G---------T---CTA---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---
gi|5749                       :                                             TGCA-T-TCAAC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TT---A----GTG-TGT---GTT-CACCAT
gi|5750                       :                                             TGCG-T-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------G---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---AGT-CATCGT
gi|5751                       :                                             TGCGGT-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-AT--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A-----CG-TGC---GGT-CACC
gi|5752                       :                                             TGTG-T-TCTGC-A-T--G-CA-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------C---------T---C-A---T-T---T--------T-T-TA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5753                       :                                             TGCG-G-TCACC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5754                       :                                             TGCG-T-TCATC-G-T--G-CT-GTCACCATGACTTC-A-CC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5755                       :                                             TGCG-G-TTACC-A-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------GCGTGCGTTGT---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-TGC---GTT-CACCGT
gi|5756                       :                                             TGCG-T-TCGCC-A-T--G-CA-T-----------TC-A-CC-GT-------G-----------AA--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-C-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CATCGT
gi|5757                       :                                             TGCA-G-TCACC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-GC-AT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5758                       :                                             TGCG-T-TTGCC-A-T--G-TG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----ACG-AGC---GTT-CACCGT
gi|5759                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-GGCACCGT----TC-A-CA-GTTTT----G-----------CG--GT-------C-----------A-------GCGTGTTTAAT---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5760                       :                                             TGCG-G-TCACT-G-T--G-CG-G-----------TA-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A-----T---T--------T-T-CA--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-TACCGT
gi|5761                       :                                             TGAG-T-TCAACCG-T--GGCG-G-----------TC-A-CT-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-T---T-T---T--------T-TTCA--TT-A-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5762                       :                                             TGCG-T-T-AGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C--AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-G---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-T-C---GGT-CA
gi|5762                       :                                                G-T-TCAGC-G-T----CG-G-----------TC-A-GT-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------gtgtgcgttctccgt
gi|5763                       : tgcgttagcgtgcggtcacatgcgttcagccgtttttcatcattTGTG-G-TAAGC-T-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------C---C-A---T-T---T--------T-T-CA---T-C-----A----T----T---G-T----TC---T----GCG-TGtccgt
gi|5764                       :                                             TGCG-T-TCACC-G-T--G-CG-C-----------TC-G-CC-GT-------T-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-tttatcgt
gi|5765                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--AT-------C-----------A-------G-------------C-G---TGT---G--------G-T-CA---C-C-----G----T----TC--G-T----TC---T----GCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5766                       :                                             TGCG-T-TTTGC-G-T--G-TG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G-------------C-G------------------T-G-CG--GT-C-----A----C----C---G-TGCAATC---A----GCG-TGT---GGT-CACCGT
gi|5767                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-GT-------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-----GT--------T---C-ACAGT-T---T--------T-G-CG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----ACG-TGT---GCT-CACCGT
gi|5768                       :                                             TGCG-T-TCATC-G-T--G-AG-C-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--CT-------C-----------ACC-----GT--------T---C-ACAGT-T---T--------T-G-CG--TT-C-----AGCG-TG---C---G-T----TC---A----ACG-TGC---GCT-CACCGT
gi|5769                       :                                             TGCG-T-TCAAC-G-T--G-TG-C-----------TC-A-CC-GTTCGTTCAG-----------CG--TT-------C-----------A-------T---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TTGC-----A----T----T---G-
gi|5770                       :                                             TGAG-T-TCAGT-G-TTTG-CG-G-----------TC-AACC-GT-------------------CGATTT-------C-----------AT------G---------T-----A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TTTCAA----GCG-TGC---GGT-CACTG
gi|5771                       :                                             TGTG-T-TTACT-G-T--G-CG-G-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CT--TT-------CTGCGTGCGGTTA-------G---------T---A-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-T
gi|5772                       :                                             TGCA-T-TCTGC-G-T--G-AG-T-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TTCTCCGTGC-----------G-------G---------T---C-A---T-C---G--------T-G-CA--GT-C-----A----T----T---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---GGT-CACCGTatatataccgt
gi|5773                       :                                             TGCT-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------ACCGCGCGG---------T---C-A---C-C---G--------T-T-CA---C-CAA---A----T----TGC-G-T----TT---A----GCG-TGC---GAT-TGCCGT
gi|5774                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------
gi|5775                       :                                             TGCG-T-TCAGC-GCT--G-CA-GC----------TT-A-CC-GT-------GGGTCACATG--CG--TTA------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TG-C-----G----T--------G-T----TC---A----GAG-TGC---GAT-CAC
gi|5776                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-C-----------------------CG--TT-------C-----------A---------------------C-A---T-TGCGG--------T-C-CG--TT-C-----G----C----G---G-T----T----A----GCG-TGC---AGT-CACCG
gi|5777                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-CA-GT-------G-----------AG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---TAAAAACTAC-T-CA--TG-A-----A----T----TTGCG-T----TC---A----GCG-TGC---GCT-CACCAT
gi|5778                       :                                             TGCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------C------------C-------------------G---------T---C-A---------------------------C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----TCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5779                       :                                              GCG-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------A-------------C-A---T-T---T--------T-T-CG--TT-C-----A---------T---G-T----TC---AG---GCG-TGC---GGT-CACCATggggtcagcgtgcattca
gi|5780                       :                                              GCG-G-TCACC-G-T--G-TG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACAGT
gi|5781                       :                                              GCG-A-TCA-C-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------A-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CATTTT-C-----AT---T----T---GTT----TC---A----G-A-TGT----GT-CACCG
gi|5782                       :                                               CA-T-TCTGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GCG-TGC---AGT-CACCAT
gi|5783                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------TG--TT-------C-----------A-------G-------------C-G---TGC---G--------G-T-CA---C-C-----G----TG---T---G-T----TC---A----GCG-TGT---GTT-CTCCGT
gi|5784                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-------------------T---------C---C-A------------------T-T-CG--GT-C-----A----T----C---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5785                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-AT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----T---G-TGG--TC---A----GCA-TAC---AGT-CACCAT
gi|5786                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C------------------------------------------------------T-C-CG--TT-C-------------------G-G----TC---A----CCG-TGC---GTT-CA
gi|5787                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------------------------T---C-------C---G--------T-T-CG--GT-C-----A----CCGTGC---G-T----TC---A----ACT-TGC---GGT-CACCGT
gi|5788                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------ACC-----G---------T---T-A-----------------------A--CTAA-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CAACGT
gi|5789                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------CGTGC-G---G-T---C--------A-C-CG--TT-C-------------------G-T----TC---T----GCA-TAC---GGT-CACCGT
gi|5790                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------CTCC--------G-------T---------T---C-A---C-CAAAT--------T-G-CG--GT-C-----ACCGTT----C---G-T----TC---T----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5791                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-----------------C---C-G---T-T---C--------A-C-CA-----A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACTGT
gi|5792                       :                                                G-T-TCAGC-T-T--G-CG-G-----------TT-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G-------------C-G---T-G---C--------GGT-CA--C--C-----A----TG---C---G-T----TC---A----GCG-TGT---GGT-CACCG
gi|5793                       :                                                G-T-TCAGC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A---------------------C-A---------G--------T-T-CA--CA-A-----A----T----TGC-G-T----TC---A----GCG-TGC---AGT-CACTGT
gi|5794                       :                                                G-T-TCAGC-G-A--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------C-------G-------------C-G------------------T-T-CG--GT-C-----A----C----C---G-T----TC---GCTCTGCG-TGC---AGT-CACCGT
gi|5795                       :                                                   -TCAGC-G-TCGG-CC-G-----------TC-A-C--GTC------G-----------TG--TT---------------------------A---------T---C-A---T-T---T--------T-T-C---TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CCCC
gi|5796                       :                                                   -TCATC-G-T--G-CG-T-----------TC-T-GC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---A-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5797                       :                                                     CATC-G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCA-TGC---GGT-CACCGT
gi|5798                       :                                                      AGC-G-T--G-CG-GG----------TC-A-CC-GT-------G-----------CA--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---A-T---T--------T-T-CAA-TT-C-----A----C----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5799                       :                                                       GC-G----G-CG-G-----------TC-A-CCAGT-------G-----------CGG-TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCGTTGT---GGT-CACCGT
gi|5800                       :                                                       GC-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GA-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TG-C-----A----T----T---G-G----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5801                       :                                                        C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-AC-GA-------G-----------CG--TT-------A-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5802                       :                                                        C-G-T----CG-G-----------TC-A-CC-GT-------GTTTCTGCGGTGCG--TT-------TT----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5803                       :                                                        C-A-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------A---------T---C-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GTG-TGC---TGT-CACCGT
gi|5804                       :                                                        C-G-T--G-CG-T-----------TC-A-GC-GT-------G-----------TT--GT-------C-----------A-------G---------T---C-AG--T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A---------T---G-C----TC--------GCG-TGC---AGTCCACCGT
gi|5805                       :                                                         -G-T--G-CG-G------------C-A-TC-AT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----T
gi|5806                       :                                                         -G-T--G-CG-G-----------TC-A-CC-GT-------G-----------CG--TTT------C-----------A-------G---------T---C-ACA-T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----A----T---G-T----TC---A----GCG-TGCTGGGGT-CACCGTacgctcacc
gi|5807                       :                                                         -G-T--G-CG-T-----------TC-A-TC-GT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T--A--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCT-TGC---GGT-TACCGT
gi|5808                       :                                                           -T--G-CG-G-----------TC-A-CC-CT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CACC
gi|5809                       :                                                                     -----------TT-A-CC-GT-------G-----------CG--TT-------T-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-------------------G-T----TC---A----GCG-TGT---GTT-CACCGT
gi|5810                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GC--TGC---TGT-CACCAT
gi|5811                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G------TC---A----GCG-TGC---GGT-CACCGT
gi|5812                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTT-CTCCGT
gi|5813                       :                                                                                    -CC-GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---T-A---T-T---T--------T---CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-TGC---GTTGCTCCGT
gi|5814                       :                                                                                    -CC-AT-------G-----------CG--GT-------C-----------A-------C---------TT--C-A---T-T---G--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----CCG-TGC---GTT-CAC
gi|5815                       :                                                                                       -GT-------G-----------CG--TT-------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T--A--TT-T-----A----T----T---G-T----TC---C----CCG-TGT---GGT-CACCAT
gi|5816                       :                                                                                                                   -------C-----------A-------G---------T---C-A---T-T---T--------T-T-CA--TT-C-----A----T----T---G-T----TC---A----GCG-AGC---GGT-CACCGT