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Reference ( gi|18526 ) : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC---A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
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gi|18588 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC---A--TGT--A-A---C----G---GCC-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-ATG--A----A-G------G--C-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18589 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC---A--A-T--A-----C----G---G-T-C-G--TA---AA--T-T--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--AT
gi|18590 : TGC-A-AAC---C-G-T--T----A-A-------AAT---C--AAC---A--AAT--A-A---C----G---G-TGC-G--TA---AA--T-T--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--ATT--C-
gi|18591 : C-A-A-C---C-G-T--G----A-A-------A-T---C--AGC---A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-CA-AC-AAA------T--G-A-GCAA----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT----CT--ATTC
gi|18593 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC---AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18592 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC---AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18595 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA---AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18594 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA---AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18597 : -A-G-C---C-A-T--A----A-A-------A-T---C--AGC---A--T-T--A-T---C----A---G-T-C-A--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----A---------T-C--AGT--C-CC--ATTCT---TA--T-GCAATT
gi|18598 : -A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC---A--T------A---T----G---G-T-C-GGCCA---AAATT-CAAAC-AAA------T----A-G--G----A-A------G--T-G-----G---------T-T--ATT----CC--A-TCT---AA--T-GCAATT
gi|18596 : -A-A-C---C-G-T--T----A-AGATCAGCA-T---C--AGC---A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--
gi|18599 : -A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC---A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--A--AAA------T--
gi|18600 : -G-T--T----A-A-------A-T---C--AGT---A--T-A--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------C--G-A-A--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-AC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18601 : -G-T--T----A-G-------A-T---C--AGC---A--T-T--A-A---T----G---A-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18602 : -G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC---A--T-T--A-A---C----A---A-T-A-A--CA---TA--T-A--AC-CAA------T--A-A-A--A----A-G------A--C-A-----T---------T-T--ATC--C-GC--ATTCT---AA--T-AGAATT
gi|18571 : -T--T----A-A-------A-T---C--AGC---A--T-T--A-A---C----G---G-T-T-G--CA---AA--
gi|18603 : -T--T----A-A-------C-T---C--AGC---C--T-T--A-T---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--T-CC--ATTC--------T-GCAATtcacaaatgagaaggtagttattcccattctaatgcaatt
gi|18604 : ----A-A-------A-T---C--GGC---A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A------------------T--T-A-----A---------T-T--TTT--C-CC--ATTAT---AA--T-GCAATT
gi|18605 : -------A-T---C--AAC---G--T-A--A-A---C----A-----T-G-G--CG-------T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCTAGAAG--T-GCAATT
gi|18606 : -T---C--AAC---A--T-T--A-A---C----A---G-T-C-T--CA---AA--T-A--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-A------A--T-A-----A---------C-C--ATT--T-CT--ATTTC---AA--T-GCAATT
gi|18607 : -T---C--AGT---A--TAT--A-A------------------A--CG---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-C------CT---AA--T-GC
gi|18608 : GC---A--T----A-A---C----G---G-C-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-G-G--A----A-G------GTAT-A-----G---------T-T--ATC--C-CC--A
gi|18609 : --A-G---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-T--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18610 : --A-G---C----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-C--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GC
gi|18611 : -G--CT---AA--T-A--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTGT---AA--T-GCAATT
gi|18612 : --CA---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-T----TTCT---
gi|18613 : ---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18614 : ---AA--T-C--AC-AAA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----GTACATGTAGT-T--ATT--C-CC--ATTCT---AC--T-GCAATT
Alignments
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lowQualScore : . . . ... . . .. .... . ....... . ... .. . .. . .. . ... .... ... . . . .. ... .. . .. . . ...... .. . . .. .... . ...... .. . ..... ......... . .. .. . .. ... .. .
lowQualScore : 5 1 1 000 0 5 77 6666 5 1111111 0 777 55 0 77 9 66 5 888 5555 111 9 9 9 33 222 11 3 11 4 4 222222 66 9 5 11 9999 5 333333 00 9 33333 888888888 4 44 33 5 55 999 55 8
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Reference ( family-248 ) : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
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gi|18568 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T------A-------A-T---CA-AGC-AT-T-T--A-A---C----G---G-T-CGG--CA---AA--T-C--AC-A-AAT-----T--G-A-G--A----A-T------G--T-AT----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18569 : TTTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--C-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-A------C--T-A-----G---------G-T--GTT--C-CC--AATCT---
gi|18570 : TTTGC-A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---A--AAA-A--T-T--A-A---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AT-G-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-TC--
gi|18571 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------T-G---C--TG--A--T-T-------------------T-----------AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18572 : TTTGC-A-A-T---T-G-C--T----A-A---------T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----C---G-T-C-G--CA---AA--A-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----C-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTCT---
gi|18573 : TTTGC-A-A-C---C-G-G--T----ATA-------A-CATCC--AGC-A--T-T--A-A---CTCACG---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--ATAATA-G------GC-T-A-----G---------T-TG-ATT--A-CC--ATTCTAA-AA--T-GCATTT
gi|18574 : TTTGC-A-A-C---C-G-G--T----ATA-------A-CATCC--AGC-A--T-T--A-A---CTCACG---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--ATAATA-G------GC-T-A-----G---------T-TG-ATT--A-CC--ATTCTAA-AA--T-GCATTT
gi|18575 : TTTGC-G-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---A--AGC-A--T-T--A-A---T----T---G-A-A-G--CA---AA--T-A--AG-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------A--T-T-----A---------T-T--ATT--T-CC-----CT---AA--T-AGAAT
gi|18576 : TTTGC-A-A-C---TTG-T--T----A-A-------AAT---C--AGC-A--TCT--ACAT--C----G---G-T-C-G--CC---AA--T-C--AC-A-AT------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----A---------G-A--ATT--C-CCA-ATTCT---
gi|18577 : TTTGC-ATA-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---TCAAGC-A--T-TTAA-A---C----G---GCT-C-G--CT---AA--TTC--AC-A-AAAACTCCT--G-A-T--A----A-A------G--T-ATT---G---------T-TTTATT--C-CC--ATTCT---AA--
gi|18578 : TTTGC-A-A-C---C---------------------A-T---C--AGC-A--T-C--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---A---------C-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------A--T-A-----G---------A-T--ATT--A-CC--A
gi|18579 : TTGGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-A
gi|18580 : TTAGC-C-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--C-T--A-A---C----A---G-----------------T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----T-C------T--TAA-----G---------T-T--ATT--T-CC--ATTTT---AA--
gi|18581 : TTTGC-A-A-T---T-GGC--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--A-T--C-A---T----G---A-T-C-A--CA---------------A-AA------T--G-A-G--A----A-G------GC-T-A-----G---------G-T--ATT----CC--ATTCT-------TGGCAATT
gi|18582 : TTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-T--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-TC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18583 : TTGC-A-A-C---C-G-T--TT---A-A-------A-T---C--AGC-A--T----A-A---C----G-----T-C-G--CA---AAA-T-C--AC-A-AA------T--GGA-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--AT-----CC--ATTCT---AT--T-GCAATT
gi|18584 : TTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-CGG--CA---AA--TCC--AC-A-AA------T--A-A-A--A----G-C------G--T-A-----G---------T-T--ATT--T-CC--ACTC----AATTT-GCAA
gi|18585 : TTGC-A-A-C---C-G-TGGT----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---GCT-C-GGCCA---AA--TTC--GT-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-------G---------T-T--ATTT-C-CC--ATTCT---AGC-T-GCAAT
gi|18586 : TTGCTA-A-C---CAG-T--T----A-A---------T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----T---G-TTC-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T----A-G--A----A-G---------T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCATTT
gi|18587 : TTGC-A-A-TGTGC-A-C--T----A-AT------A-T---C--AGC-A--T-C--A-A---T----G-----T-C-G--CA---AA--T-C--TC-A-AA------T--G-A-G--A----A-GC-----C--T-A-----G---------A-G--ATT--C-CC--AT
gi|18588 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--TGT--A-A---C----G---GCC-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-ATG--A----A-G------G--C-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18589 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC-A--A-T--A-----C----G---G-T-C-G--TA---AA--T-T--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--AT
gi|18590 : TGC-A-AAC---C-G-T--T----A-A-------AAT---C--AAC-A--AAT--A-A---C----G---G-TGC-G--TA---AA--T-T--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--ATT--C-
gi|18591 : C-A-A-C---C-G-T--G----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-CA-AC-A-AA------T--G-A-GCAA----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT----CT--ATTC
gi|18592 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC-AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18593 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC-AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18594 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA-AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18595 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA-AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18596 : -A-A-C---C-G-T--T----A-AGATCAGCA-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--
gi|18597 : -A-G-C---C-A-T--A----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---C----A---G-T-C-A--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----A---------T-C--AGT--C-CC--ATTCT---TA--T-GCAATT
gi|18598 : -A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T------A---T----G---G-T-C-GGCCA---AAATT-CAAAC-A-AA------T----A-G--G----A-A------G--T-G-----G---------T-T--ATT----CC--A-TCT---AA--T-GCAATT
gi|18599 : -A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--A--A-AA------T--
gi|18600 : -G-T--T----A-A-------A-T---C--AGT-A--T-A--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------C--G-A-A--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-AC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18601 : -G-T--T----A-G-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---A-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18602 : -G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC-A--T-T--A-A---C----A---A-T-A-A--CA---TA--T-A--AC-C-AA------T--A-A-A--A----A-G------A--C-A-----T---------T-T--ATC--C-GC--ATTCT---AA--T-AGAATT
gi|18603 : -T--T----A-A-------C-T---C--AGC-C--T-T--A-T---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--T-CC--ATTC--------T-GCAAT
gi|18604 : ----A-A-------A-T---C--GGC-A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A------------------T--T-A-----A---------T-T--TTT--C-CC--ATTAT---AA--T-GCAATT
gi|18605 : -------A-T---C--AAC-G--T-A--A-A---C----A-----T-G-G--CG-------T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCTAGAAG--T-GCAATT
gi|18606 : -T---C--AAC-A--T-T--A-A---C----A---G-T-C-T--CA---AA--T-A--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-A------A--T-A-----A---------C-C--ATT--T-CT--ATTTC---AA--T-GCAATT
gi|18607 : -T---C--AGT-A--TAT--A-A------------------A--CG---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-C------CT---AA--T-GC
gi|18608 : GC-A--T----A-A---C----G---G-C-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-G-G--A----A-G------GTAT-A-----G---------T-T--ATC--C-CC--A
gi|18609 : --A-G---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-T--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18610 : --A-G---C----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-C--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GC
gi|18611 : -G--CT---AA--T-A--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTGT---AA--T-GCAATT
gi|18612 : --CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-T----TTCT---
gi|18613 : ---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18614 : ---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----GTACATGTAGT-T--ATT--C-CC--ATTCT---AC--T-GCAATT
Alignments
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lowQualScore : . . . ... . . .. .... . ....... . ... .. . .. . .. . ... .... ... . . . .. ... .. . .. . . ...... .. . . .. .... . ...... .. . ..... ......... . .. .. . .. ... .. .
lowQualScore : 5 1 1 000 0 5 77 6666 5 1111111 0 777 55 0 77 9 66 5 888 5555 111 9 9 9 33 222 11 3 11 4 4 222222 66 9 5 11 9999 5 333333 00 9 33333 888888888 4 44 33 5 55 999 55 8
consensus : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
Reference ( family-248 ) : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
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gi|18551 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--TT---A-A-------A-T---C--AGC-AA-T-T--A-A---C----G---GGT-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-A-------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18552 : TTTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTC--------T-GCAAT
gi|18553 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--TT---A-A-------A-T---C--AGCGA--T-T--A-A---C----GC--G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18554 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----ACA-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G-------T-G--CA---AA--T-C--AC---AA------T--GCA-G--A----A--------G--T-A-----G---------T-T--ATT--G-CC--A-TCT---AA--T-GCAATT
gi|18555 : TTTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----G-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTC--------T-GCAGTT
gi|18556 : TTTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-A--CC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------A--T-A-----G---------C-T--ATT--C-CC--ATTCT---
gi|18557 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----G-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------
gi|18558 : TTCGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--G-A---C----G---A-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------A--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--CTT--C-CC--
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gi|18561 : TTTTC-A-A-C-----A-T--T----A-A-------A-T---A--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--C----AA--T-C--AC-A-AA------G--G-A-A--A----A-AC-----G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
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gi|18563 : TTTGC-A-A-C---------------------------T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18564 : TTTG--G-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGCAA--T-T--A-A---G----G---G-T---G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--TAA-----A---------T-TG-ATT--C-CCTAATTCT---AA--
gi|18565 : TTTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-C--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C---C-ACAA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18566 : TCTGA-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------C--A-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--CGCT--AATTT---AA--
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gi|18568 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T------A-------A-T---CA-AGC-AT-T-T--A-A---C----G---G-T-CGG--CA---AA--T-C--AC-A-AAT-----T--G-A-G--A----A-T------G--T-AT----G---------T-T--ATT--C-CC--
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gi|18571 : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------T-G---C--TG--A--T-T-------------------T-----------AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18572 : TTTGC-A-A-T---T-G-C--T----A-A---------T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----C---G-T-C-G--CA---AA--A-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----C-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTCT---
gi|18573 : TTTGC-A-A-C---C-G-G--T----ATA-------A-CATCC--AGC-A--T-T--A-A---CTCACG---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--ATAATA-G------GC-T-A-----G---------T-TG-ATT--A-CC--ATTCTAA-AA--T-GCATTT
gi|18574 : TTTGC-A-A-C---C-G-G--T----ATA-------A-CATCC--AGC-A--T-T--A-A---CTCACG---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--ATAATA-G------GC-T-A-----G---------T-TG-ATT--A-CC--ATTCTAA-AA--T-GCATTT
gi|18575 : TTTGC-G-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---A--AGC-A--T-T--A-A---T----T---G-A-A-G--CA---AA--T-A--AG-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------A--T-T-----A---------T-T--ATT--T-CC-----CT---AA--T-AGAAT
gi|18576 : TTTGC-A-A-C---TTG-T--T----A-A-------AAT---C--AGC-A--TCT--ACAT--C----G---G-T-C-G--CC---AA--T-C--AC-A-AT------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----A---------G-A--ATT--C-CCA-ATTCT---
gi|18577 : TTTGC-ATA-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---TCAAGC-A--T-TTAA-A---C----G---GCT-C-G--CT---AA--TTC--AC-A-AAAACTCCT--G-A-T--A----A-A------G--T-ATT---G---------T-TTTATT--C-CC--ATTCT---AA--
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gi|18580 : TTAGC-C-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--C-T--A-A---C----A---G-----------------T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----T-C------T--TAA-----G---------T-T--ATT--T-CC--ATTTT---AA--
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gi|18582 : TTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-T--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-TC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18583 : TTGC-A-A-C---C-G-T--TT---A-A-------A-T---C--AGC-A--T----A-A---C----G-----T-C-G--CA---AAA-T-C--AC-A-AA------T--GGA-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--AT-----CC--ATTCT---AT--T-GCAATT
gi|18584 : TTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-CGG--CA---AA--TCC--AC-A-AA------T--A-A-A--A----G-C------G--T-A-----G---------T-T--ATT--T-CC--ACTC----AATTT-GCAA
gi|18585 : TTGC-A-A-C---C-G-TGGT----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---GCT-C-GGCCA---AA--TTC--GT-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-------G---------T-T--ATTT-C-CC--ATTCT---AGC-T-GCAAT
gi|18586 : TTGCTA-A-C---CAG-T--T----A-A---------T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----T---G-TTC-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T----A-G--A----A-G---------T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCATTT
gi|18587 : TTGC-A-A-TGTGC-A-C--T----A-AT------A-T---C--AGC-A--T-C--A-A---T----G-----T-C-G--CA---AA--T-C--TC-A-AA------T--G-A-G--A----A-GC-----C--T-A-----G---------A-G--ATT--C-CC--AT
gi|18588 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--TGT--A-A---C----G---GCC-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-ATG--A----A-G------G--C-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18589 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC-A--A-T--A-----C----G---G-T-C-G--TA---AA--T-T--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--AT
gi|18590 : TGC-A-AAC---C-G-T--T----A-A-------AAT---C--AAC-A--AAT--A-A---C----G---G-TGC-G--TA---AA--T-T--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--ATT--C-
gi|18591 : C-A-A-C---C-G-T--G----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-CA-AC-A-AA------T--G-A-GCAA----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT----CT--ATTC
gi|18592 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC-AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18593 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC-AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18594 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA-AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18595 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA-AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18596 : -A-A-C---C-G-T--T----A-AGATCAGCA-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--
gi|18597 : -A-G-C---C-A-T--A----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---C----A---G-T-C-A--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----A---------T-C--AGT--C-CC--ATTCT---TA--T-GCAATT
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gi|18603 : -T--T----A-A-------C-T---C--AGC-C--T-T--A-T---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--T-CC--ATTC--------T-GCAAT
gi|18604 : ----A-A-------A-T---C--GGC-A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A------------------T--T-A-----A---------T-T--TTT--C-CC--ATTAT---AA--T-GCAATT
gi|18605 : -------A-T---C--AAC-G--T-A--A-A---C----A-----T-G-G--CG-------T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCTAGAAG--T-GCAATT
gi|18606 : -T---C--AAC-A--T-T--A-A---C----A---G-T-C-T--CA---AA--T-A--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-A------A--T-A-----A---------C-C--ATT--T-CT--ATTTC---AA--T-GCAATT
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gi|18609 : --A-G---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-T--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18610 : --A-G---C----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-C--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GC
gi|18611 : -G--CT---AA--T-A--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTGT---AA--T-GCAATT
gi|18612 : --CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-T----TTCT---
gi|18613 : ---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18614 : ---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----GTACATGTAGT-T--ATT--C-CC--ATTCT---AC--T-GCAATT
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Reference ( family-248 ) : TTTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
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gi|18575 : TTTGC-G-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---A--AGC-A--T-T--A-A---T----T---G-A-A-G--CA---AA--T-A--AG-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------A--T-T-----A---------T-T--ATT--T-CC-----CT---AA--T-AGAAT
gi|18576 : TTTGC-A-A-C---TTG-T--T----A-A-------AAT---C--AGC-A--TCT--ACAT--C----G---G-T-C-G--CC---AA--T-C--AC-A-AT------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----A---------G-A--ATT--C-CCA-ATTCT---
gi|18577 : TTTGC-ATA-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---TCAAGC-A--T-TTAA-A---C----G---GCT-C-G--CT---AA--TTC--AC-A-AAAACTCCT--G-A-T--A----A-A------G--T-ATT---G---------T-TTTATT--C-CC--ATTCT---AA--
gi|18578 : TTTGC-A-A-C---C---------------------A-T---C--AGC-A--T-C--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---A---------C-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------A--T-A-----G---------A-T--ATT--A-CC--A
gi|18579 : TTGGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-A
gi|18580 : TTAGC-C-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--C-T--A-A---C----A---G-----------------T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----T-C------T--TAA-----G---------T-T--ATT--T-CC--ATTTT---AA--
gi|18581 : TTTGC-A-A-T---T-GGC--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--A-T--C-A---T----G---A-T-C-A--CA---------------A-AA------T--G-A-G--A----A-G------GC-T-A-----G---------G-T--ATT----CC--ATTCT-------TGGCAATT
gi|18582 : TTGC-A-A-T---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-T--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-TC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18583 : TTGC-A-A-C---C-G-T--TT---A-A-------A-T---C--AGC-A--T----A-A---C----G-----T-C-G--CA---AAA-T-C--AC-A-AA------T--GGA-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--AT-----CC--ATTCT---AT--T-GCAATT
gi|18584 : TTGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-CGG--CA---AA--TCC--AC-A-AA------T--A-A-A--A----G-C------G--T-A-----G---------T-T--ATT--T-CC--ACTC----AATTT-GCAA
gi|18585 : TTGC-A-A-C---C-G-TGGT----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---GCT-C-GGCCA---AA--TTC--GT-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-------G---------T-T--ATTT-C-CC--ATTCT---AGC-T-GCAAT
gi|18586 : TTGCTA-A-C---CAG-T--T----A-A---------T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----T---G-TTC-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T----A-G--A----A-G---------T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCATTT
gi|18587 : TTGC-A-A-TGTGC-A-C--T----A-AT------A-T---C--AGC-A--T-C--A-A---T----G-----T-C-G--CA---AA--T-C--TC-A-AA------T--G-A-G--A----A-GC-----C--T-A-----G---------A-G--ATT--C-CC--AT
gi|18588 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--TGT--A-A---C----G---GCC-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-ATG--A----A-G------G--C-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--
gi|18589 : TGC-A-A-C---C-G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC-A--A-T--A-----C----G---G-T-C-G--TA---AA--T-T--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--AT
gi|18590 : TGC-A-AAC---C-G-T--T----A-A-------AAT---C--AAC-A--AAT--A-A---C----G---G-TGC-G--TA---AA--T-T--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-C--ATT--C-
gi|18591 : C-A-A-C---C-G-T--G----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-CA-AC-A-AA------T--G-A-GCAA----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT----CT--ATTC
gi|18592 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC-AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18593 : C-A-A-C---C---T--T----A-A-------A-T---CCAGGC-AA-T-T--A-A---C----ACGCG-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--AG---A-A------G--T-A-----A---------T-TGTATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18594 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA-AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18595 : C-G-A-C---C-G-T--T----T-A-------A-T---C--AGA-AAAT-T--A-A---C----G---A---C-G--AA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-A--A----A-G------G--T-A-----G---------TAT--ATTCAC-CT--ATTTT---
gi|18596 : -A-A-C---C-G-T--T----A-AGATCAGCA-T---C--AGC-A--T-T--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--
gi|18597 : -A-G-C---C-A-T--A----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-T---C----A---G-T-C-A--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----A---------T-C--AGT--C-CC--ATTCT---TA--T-GCAATT
gi|18598 : -A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T------A---T----G---G-T-C-GGCCA---AAATT-CAAAC-A-AA------T----A-G--G----A-A------G--T-G-----G---------T-T--ATT----CC--A-TCT---AA--T-GCAATT
gi|18599 : -A-A-C---T-G-T--T----A-A-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--A--A-AA------T--
gi|18600 : -G-T--T----A-A-------A-T---C--AGT-A--T-A--A-A---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------C--G-A-A--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-AC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18601 : -G-T--T----A-G-------A-T---C--AGC-A--T-T--A-A---T----G---A-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--C-CC--ATTC--------T-GCAATT
gi|18602 : -G-T--T----A-A-------A-T---C--AAC-A--T-T--A-A---C----A---A-T-A-A--CA---TA--T-A--AC-C-AA------T--A-A-A--A----A-G------A--C-A-----T---------T-T--ATC--C-GC--ATTCT---AA--T-AGAATT
gi|18603 : -T--T----A-A-------C-T---C--AGC-C--T-T--A-T---T----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------C--T-A-----G---------G-T--ATT--T-CC--ATTC--------T-GCAAT
gi|18604 : ----A-A-------A-T---C--GGC-A--T-T--A-T---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A------------------T--T-A-----A---------T-T--TTT--C-CC--ATTAT---AA--T-GCAATT
gi|18605 : -------A-T---C--AAC-G--T-A--A-A---C----A-----T-G-G--CG-------T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCTAGAAG--T-GCAATT
gi|18606 : -T---C--AAC-A--T-T--A-A---C----A---G-T-C-T--CA---AA--T-A--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-A------A--T-A-----A---------C-C--ATT--T-CT--ATTTC---AA--T-GCAATT
gi|18607 : -T---C--AGT-A--TAT--A-A------------------A--CG---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-C------CT---AA--T-GC
gi|18608 : GC-A--T----A-A---C----G---G-C-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-G-G--A----A-G------GTAT-A-----G---------T-T--ATC--C-CC--A
gi|18609 : --A-G---C----G---G-T-C-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-T--A----G-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18610 : --A-G---C----G---G-T-T-G--CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-C--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GC
gi|18611 : -G--CT---AA--T-A--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-T------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTGT---AA--T-GCAATT
gi|18612 : --CA---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-T----TTCT---
gi|18613 : ---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----G---------T-T--ATT--C-CC--ATTCT---AA--T-GCAATT
gi|18614 : ---AA--T-C--AC-A-AA------T--G-A-G--A----A-G------G--T-A-----GTACATGTAGT-T--ATT--C-CC--ATTCT---AC--T-GCAATT