lowQualScore                  :                                                                                                                                               1111               111111                           
lowQualScore                  :       111 1 33333 0 2222 111111 0 1 222222222222 333333 333 4444 3333333 111 0 11  3333333333333  222 11111 00  22  11 00 2222222222 0 0 2222 1111 333 7777 22 0 333333 333333 11  00 0  0   0    
lowQualScore                  :       ... . ..... . .... ...... . . ............ ...... ... .... ....... ... . ..  .............  ... ..... ..  ..  .. .. .......... . . .... .... ... .... .. . ...... ...... ..  .. .  .   .    
lowQualScore                  :       444 0 11111 5 1111 888888 5 0 444444444444 333333 666 7777 7777777 333 5 11  7777777777777  777 66666 66  66  11 66 8888888888 9 4 3333 0000 000 9999 99 4 333333 777777 11  66 5  5   9    
consensus                     : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
Reference ( gi|12550 )        : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12551                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12552                      : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12558                      : GACAGA---C-G-----G-G----T------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12554                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------A-G-A------------T------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAAT
gi|12559                      : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-ta
gi|12555                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A------T-G-------C---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12556                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActa
gi|12560                      : GACGGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---AC-T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAActta
gi|12561                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-G------------C------A---A--A-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TAC-GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAAT
gi|12557                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--TTG-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TA
gi|12562                      : GACGGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-CCC-TAATctta
gi|12564                      : GACAGA-----G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-G-C----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12565                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G----TT-------------AC---T-----A--TA--CG--G--C-A---C----C-C-GC---C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12566                      : GACGGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T-----A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG-----C-A---C----C-A-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12567                      : GACAGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------G---A--T-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GC-CGC-TAA
gi|12570                      : GAC-GA---C-G-----G-A----C------G-GGA------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GC-CCata
gi|12569                      : GACAGA---C-G-----A-AAA--C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------TT--G-A--TTT------------AC---T-----A--TACGGG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--GC-CG--G-GC-CCC-TAAT
gi|12572                      : GACGGA---C-G-----G-A----T------G-G-A------------C------T---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--CA--GGC-C--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--A-CG-CCC-TAATta
gi|12575                      : GACGGA---C-G-----C-A----C------G-G-A------------C------AT--A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-AAACC----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------ATTTT--G--CG--G-GG-CCCGTAAT
gi|12553                      : GACGGA---C-G-----G-C----C------G-G-A------------C------A---A--T---------T---G-AA-TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A----------C-G----C----A---TC---T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12571                      : GACAGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12573                      : GACAGA---T-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AA---T-----A--TAG-GG--G--C-A---C----CGC-GC---C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--C---G-GG-CGC-TAATta
gi|12574                      : GACAGA---T-G-----G-G----C------G-G-A------------C-------------T-G-------T---G-A--TT-------------AT---T-----A--TA--GG--A--C-T---C----T-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GA-CTC-TAATta
gi|12563                      : GACGGA---CAG-----G-A----C------G-GGA------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TAG-GG--G--C-A---CT---C-T-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG--CC-TAAta
gi|12576                      : GATGGA---C-G-----G-A----T------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----TGCT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12578                      : GACAGC---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------C---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12579                      : GACAGA---C-A-----G-A----C------A-A-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----CTAT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TA
gi|12580                      : GACAGATGAC-G-----A-A----C------A-G-A------------C------A---A--T---------T---G-A--TT-------------ACAA-T-----A--TAAAGGTAG--C-A---AA---C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12577                      : GACGAA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-A-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12582                      : GATAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--T-G--------C-C-A----C----A---T----TTGT-CG-----A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATcta
gi|12583                      : GACAGA---C-GAATG-G-A----T------G-G-A------------A------A---A--A-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------A------G--TG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12568                      : GACAGA---C-GTGG--A-A----C------GCG-A------------C------A---A--T-G-------T---G-AATTC-------------AC---T-----A--TA--GG--GGTC-A---T----C-C-G----C----A---T----T--C-T------G------G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12581                      : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAATcta
gi|12587                      : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C-------------T--T-CTGTCA-A---T--G--CG--G-AG-CCT-AAATta
gi|12590                      : GACAGA---C-A-----G-A----T------G-G-A------------C------A---C--A-G-------T---A-A--AT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----C---T----T-----------A---T--GGTAG--G-GG-CCC-TAA
gi|12591                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--T---GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---TC---C--T-CG-----A---T--G--C---G-GG-CCC-TCAT
gi|12586                      : GACGGA---T-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TC-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GA-CCC-TAAT
gi|12585                      : GACAAA---C-G-----G-A----C------T-G-A------------C------GT--A--T-GGAAAAGCT---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12584                      : GATGGA---T-G-----G-A----C------A-G-A------------C------A---A--T-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------A--CA--G-GA-CCC-TAATta
gi|12589                      : GACAGA---G-A-----G-A----C------G-G-AATGACAAATGCGC------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----C----AT--T----T--T-C------AT--T--G--TG--G-AA-CCA-TAATta
gi|12592                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AA---T-----A--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCA-TAATt
gi|12595                      : GACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----T-C-G----CCG--A---T----T--CAC------A---T--G--
gi|12594                      : GACGGA---C-A-----G-A----C------A-G-A------------C------A---A--A-G-------T---A-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----C-T------C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--C---G-GG-CCC-TAAT
gi|12596                      : GACGAA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----CCGATA---C----T--T------------G--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12597                      : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---GCA--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-T
gi|12598                      : GACGGA---C-G-----G-A----T------A-G-A------------C------A---GACT-GAG-----T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----T-C-AC---C----A---T----T--T------------G--G--TG--G-GG-CCC-TTAT
gi|12600                      : GACGGA---C-A-----G-A----C------A-G-A------------C------AG--A--C-G-----------G-A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12599                      : GACGGA---C-A-----G-A----C------A-G-A------------C------AG--A--C-G-----------G-A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12588                      : GACGGA---C-G-----GGA----C------G-G-A------------C------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----C----C---G----A--T-A------A---TCGG--CG--G-GGCCCC-TAAT
gi|12601                      : GACAGA---T-T-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G----A---A----C-A-G----C----ATCTT----T--T-G------A---T--G--CA--G-GA-CCC-TAATta
gi|12603                      : GACAGA---A-G-----G-A----T------G-G-A------------C------GGATA--TAG-------T---G-A--TA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----CAC-A----T----A---T----G--T-CG-----A---T--G--CG--G-GG-TCC-TA
gi|12605                      : GACAGA---C-G-----G-ATAGAC------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----C--T-C------
gi|12593                      : GACGGAA--C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-G-------T---G-A--TT-------------AC---C-----A--TT--GG--G--C-T---C----C-C-A----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CA--G-GG-CCC-TAAT
gi|12606                      : GACGGA---C-G-----G-A----C------G-G-G------------CGAA---A---A--A-GC------T---G-A--TT-------------AC---C-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-GCCGAC----A---C----T--C-G------A---------CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12604                      : GACAGA---C-G-----G-C----T------A-G-A------------CTTGACAA---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--CA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CT--G-GG-CCC-TAAT
gi|12602                      : GACGGA---T-G-----G-A----T------A-G-A------------C------AGAAA--A-GC------T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---A--T-C------A------G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12607                      :  ACAGA---CTG-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TTTT-----------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-ACC-TAAta
gi|12608                      :  ACAGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--TT-------------AC---A-----A--TA--GA--G-------------------------------T----T--T-C------A---T--G--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12609                      :  ACGGA---C-GACCGCG-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---TGATTCA--TG--TG--G--C-A---A----T-C-G----C----A---A----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CTC-TGA
gi|12610                      :  ACAGA---T-G-----G-A----T------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--AT-------------GC---T-----A--CA--GG--G--C-T---T----C-C-C----C----A---T----T--T-TCA----A---T--G--CT--G-GG-CCC-T
gi|12611                      :  ACAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------C---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--CTT---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12612                      :   CAGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--T--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12614                      :   CGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-A-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TGATta
gi|12615                      :   CAGA---C-G-----G-A----CTGACCAG-G-A------------C------A---G--A-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G---------A---TCAAAT--C-C------T---T--G--CG--G-GG-CCC-TAta
gi|12616                      :   CGGA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-C----CCG--A---TA---T--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12613                      :   CAGA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A---T-------------AC---T-----A--AA--GG--G----A---C----A-C-G----C----A--------T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CC
gi|12617                      :    AGA---C-G-----G-A----C------G-A-A-------------------A---A--T-G-------T---T-A--T--------------AC---TT----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CCG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12618                      :    AGG---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--G-C-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----CTGA-G---T----A--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12622                      :     GA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12619                      :     GA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12623                      :     GA---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12620                      :     GA---C-G-------A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12621                      :     GA---C-G-----G-AG---C------G-G-A------------C------A---A--T-G-----------G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--CG--G-GG-CCCTTAATta
gi|12624                      :     GA---C-G-------A----C------G-G-A------------CCC----A---ACCT-G-------T---C-A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--C---G-GG-CCC-TAAta
gi|12625                      :     GA---C-G-----G-A----C------G-G-A------------A------A---A--C-AGC-----T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TAA--C--T-C----------T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12626                      :     GA---C-G-----A-A----CA-----G-G-A------------C------C---A--A-G-------T---C-A--TT-------------AC---T-----ACCTA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----C---T----T--T-C------A---T--G--CG--T-GG--CT-TAATta
gi|12628                      :     GA---T-G-----G-A----C------A-G-A------------C------G---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G---------A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CTC-TAATt
gi|12627                      :     GG---C-A-----G-A----C------G-G-A------------C------A------T-G-------T---G-A--TTGCACAGGCTTATCAC---T-----A--TA--GG--A--C-A---C----C-T-G----C----C---T----G--T--------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12629                      :      A---C-G-----G-A----C------G-G-A------------C------A---A--T-G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAATca
gi|12630                      :      A---C-G-----G-A----C------G-A-A------------T------G---G--T-G-------TTGAG-A--TT-------------ACA--T-----A--TA--GG--G--C-----C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CGTAGTGG-CGC-TAATta
gi|12631                      :           -G-----G-A----C------G---A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--TT-------------AC---------A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----C----A---T----TA-T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12632                      :             -----G-A----C------G-G-A------------C------A---AA-T-G-------T---G-A--TT--------------C---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-C----C----A---T----C--A-CCAGAAAA---T--G--CC--G-GG-CCC-TTAT
gi|12633                      :                   -A----C------A-A-A------------CT-----A---A--T-G-------T---G-A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12634                      :                   -A----C------G-G-A------------C------A---A--A-G-------T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---CCGCGC-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAA
gi|12635                      :                                                                -G-------T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--C--CG--G-GG-CCC-TAATata
gi|12636                      :                                                                  -------T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-A---C----C-C-G----CCG--A---T----TAAT-C------A---------CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12637                      :                                                                                                   ---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TGATta
gi|12638                      :                                                                                                             --TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CC--G-GG-CCC-TAAta
gi|12639                      :                                                                                                                A--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--A-GG-CCC-TAATata





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                 1111               111111                           
lowQualScore                  :               0 1 22222 0 11 11 0 0 1111 333333 222 4444 22 111 0 00  3333333333333  222 11111 00  22  11 00 3333333333 0  2222 0000 333 7777 22 0 333333 333333 11  00 0  0   0    
lowQualScore                  :               . . ..... . .. .. . . .... ...... ... .... .. ... . ..  .............  ... ..... ..  ..  .. .. .......... .  .... .... ... .... .. . ...... ...... ..  .. .  .   .    
lowQualScore                  :               5 0 00000 5 11 11 5 9 0000 333333 222 6666 22 333 9 66  6666666666666  777 66666 66  66  11 66 0000000000 9  3333 9999 000 8888 99 4 111111 666666 11  66 5  5   9    
consensus                     :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--N-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
Reference ( family-247 )      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12550                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12551                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12552                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12553                      :         GACGGA-C-G-----G-C--C--G-G-A----C------A---A--T----T---GAA--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A----------CG----C----A---TC---T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12554                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--A-G-A----T------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12555                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A------T-G--C---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12556                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-CG----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActa
gi|12557                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--TTG--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-CG----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActta
gi|12558                      :         GACAGA-C-G-----G-G--T--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATctta
gi|12559                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-
gi|12560                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AC-T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12561                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----C------A---A--A-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TAC-GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAAT
gi|12562                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----AT--T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12563                      :         GACGGA-CAG-----G-A--C--G-GGA----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TAG-GG--G--C-A---CT---C-TG----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG--CC-TAA
gi|12564                      :         GACAGA---G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-GC----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12565                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G----TT-------------AC---T-----A--TA--CG--G--C-A---C----C-CGC---C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12566                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T-----A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG-----C-A---C----C-AG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12567                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------G---A--T-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GC-CGC-TAA
gi|12568                      :         GACAGA-C-GTGG--A-A--C--GCG-A----C------A---A--T-G--T---G-AATTC-------------AC---T-----A--TA--GG--GGTC-A---T----C-CG----C----A---T----T--C-T------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAata
gi|12569                      :         GACAGA-C-G-----A-AAAC--G-G-A----C------A---A--T-G--TT--G-A--TTT------------AC---T-----A--TACGGG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--GC-CG--G-GC-CCC-TAATcta
gi|12570                      :         GACG-A-C-G-----G-A--C--G-GGA----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GC-CCta
gi|12571                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-CG----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12572                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------T---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--CA--GGC-C--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--A-CG-CCC-TAATta
gi|12573                      :         GACAGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AA---T-----A--TAG-GG--G--C-A---C----CGCGC---C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--C---G-GG-CGC-TAAT
gi|12574                      :         GACAGA-T-G-----G-G--C--G-G-A----C-------------T-G--T---G-A--TT-------------AT---T-----A--TA--GG--A--C-T---C----T-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GA-CTC-TAATta
gi|12575                      :         GACGGA-C-G-----C-A--C--G-G-A----C------AT--A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-AAACC----C-CG----C----AT--T----T--T-C------ATTTT--G--CG--G-GG-CCCGTAATta
gi|12576                      :         GATGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-CG----C----A---T----TGCT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12577                      :         GACGAA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-AG----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12578                      :         GACAGC-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--C---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-CG----C----A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATcta
gi|12579                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--A-A-A----C------A---A--T-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-CG----C----A---T----CTAT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TA
gi|12580                      :             GA-C-G-----A-A--C--A-G-A----C------A---A--T----T---G-A--TT-------------ACAA-T-----A--TAAAGGTAG--C-A---AA---C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12581                      :  gacagatGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12582                      :         GATAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--T-G--------C-CA----C----A---T----TTGT-CG-----A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12583                      :         GACGAA-T-G-----G-A--T--G-G-A----A------A---A--A-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------A------G--TG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12584                      :     gacaGATGGA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------A---A--T-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------A--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12585                      :         GACTGA-C-G-----T-A--T--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12586                      : gacaaacgGACGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TC-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GA-CCC-TAATta
gi|12587                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-CG----C-------------T--T-CTGTCA-A---T--G--CG--G-AG-CCT-AAATta
gi|12588                      :         GACGGA-C-G-----GGA--C--G-G-A----C------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-CG----C----C---G----A--T-A------A---TCGG--CG--G-GGCCCC-TAAT
gi|12589                      :         GACGGA-A-T-----G-A--C--A-A-ATGCGC------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CA----C----AT--T----T--T-C------AT--T--G--TG--G-AA-CCA-TAATta
gi|12590                      : gacagagaGACAGA-C-A-----G-A--T--G-G-A----C------A---C--A-G--T---A-A--AT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-TG----C----C---T----T-----------A---T--GGTAG--G-GG-CCC-TAAt
gi|12591                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--T---GG--G--C-G--------C-CG----C----A---TC---C--T-CG-----A---T--G--C---G-GG-CCC-TCAT
gi|12592                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AA---T-----A--TA--GG--G--T-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCA-TAAT
gi|12593                      :         GACGGAAC-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-G--T---G-A--TT-------------AC---C-----A--TT--GG--G--C-T---C----C-CA----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CA--G-GG-CCC-TAAT
gi|12594                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------A---A--A-G--T---A-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----C-T-----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--C---G-GG-CCC-TAATta
gi|12595                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----T-CG----CCG--A---T----T--CAC------A---T--G--
gi|12596                      :         GACGAA-C-A-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-TG----CCGATA---C----T--T------------G--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12597                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---GCA--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCA--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-T
gi|12598                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--A-G-A----C------A---GACT-GAGT---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----T-CAC---C----A---T----T--T------------G--G--TG--G-GG-CCC-TTAT
gi|12599                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--A--C-G------G-A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C--G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12600                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--A--C-G------G-A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C--G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12601                      :         GACAGA-T-T-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G----A---A----C-AG----C----ATCTT----T--T-G------A---T--G--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12602                      :         GACGGA-T-G-----G-A--T--A-G-A----C------AGAAA--A-GC-T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-T---C----C-CG----CCG--A---TA---A--T-C------A------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12603                      :         GAAGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----T------A---T--A-G--T---G-A--TA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----CACA----T----A---T----G--T-CG-----A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAta
gi|12604                      :     gacaGACAGA-C-G-----G-C--T--A-G-A----CTTGACAA---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--CA--GG--G--C-G---C----C--G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CT--G-GG-CCC-TAAT
gi|12605                      :         GACGGA-T-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-CG----C----A---T----C--T-C------ta
gi|12606                      :     gacaGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----CGAA---A---A--A-GC-T---G-A--TT-------------AC---C-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CGCCGAC----A---C----T--C-G------A---------CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12607                      :          ACAGA-CTG-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TTTT-----------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-ACC-TAA
gi|12608                      :          ACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--TT-------------AC---A-----A--TA--GA--G------------------------------T----T--T-C------A---T--G--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12609                      :          ACGGA-C-GACCGCG-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---TGATTCA--TG--TG--G--C-A---A----T-CG----C----A---A----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CTC-TGA
gi|12610                      :          ACAGA-T-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--AT-------------GC---T-----A--CA--GG--G--C-T---T----C-CC----C----A---T----T--T-TCA----A---T--G--CT--G-GG-CCC-T
gi|12611                      :          ACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--C---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--CTT---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12612                      :           CAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--T--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12613                      :           CAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A---T-------------AC---T-----A--AA--GG--G----A---C----A-CG----C----A--------T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCta
gi|12614                      :           CGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-A--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TGAT
gi|12615                      :         GACGGA-C-T-----G-A--CCAG-G-A----C------A---G--A-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-CG---------A---TCAAAT--C-C------T---T--G--CG--G-GG-CCC-TAta
gi|12616                      :         caCGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CC----CCG--A---TA---T--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12617                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-A-A-----------A---A--T-G--T---T-A--T--------------AC---TT----A--TA--GG--G--C-AC--C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12618                      :            aGG-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--G-C--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CA----CTGA-G---T----A--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12619                      :            aGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-CA----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12620                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-CA----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12621                      :             GA-C-G-----G-AG-C--G-G-A----C------A---A--T-G------G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-CA----C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--CG--G-GG-CCCTTAATta
gi|12622                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12623                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--C-A---C----C-TG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12624                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----CCC----A---ACCT-G--T---C-A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--C---G-GG-CCC-TAA
gi|12625                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---A--C-AGCT---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-CG----CCA--A---TAA--C--T-C----------T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12626                      :             GA-C-G-----A-A--CA-G-G-A----C------C---A--A-G--T---C-A--TT-------------AC---T-----ACCTA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----C---T----T--T-C------A---T--G--CG--T-GG--CT-TAATta
gi|12627                      :             GG-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A------T-G--T---G-A--TTGCACAGGCTTATCAC---T-----A--TA--GG--A--C-A---C----C-TG----C----C---T----G--T--------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12628                      :             GA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------G---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-CG---------A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CTC-TAATca
gi|12629                      :              A-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---A--T-G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12630                      :              A-C-G-----G-A--C--G-A-A----T------G---G--T-G--TTGAG-A--TT-------------ACA--T-----A--TA--GG--G--C-----C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CGTAGTGG-CGC-TAATta
gi|12631                      :                 -G-----G-A--C--G---A----C------A---A--A-G--T---G-A--TT-------------AC---------A--TA--GG--G--C-T---C----C-TG----C----A---T----TA-T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12632                      :                   -----G-A--C--G-G-A----C------A---AA-T-G--T---G-A--TT--------------C---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-CC----C----A---T----C--A-CCAGAAAA---T--G--CC--G-GG-CCC-TTAT
gi|12633                      :                         -A--C--A-A-A----CT-----A---A--T-G--T---G-A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12634                      :                         -A--C--G-G-A----C------A---A--A-G--T---G-A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---CCGCGC-CG----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAA
gi|12635                      :                                                        -G--T---G-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--C--CG--G-GG-CCC-TAATata
gi|12636                      :                                                          --T---G-A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-A---C----C-CG----CCG--A---T----TAAT-C------A---------CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12637                      :                                                                                      ---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TGATta
gi|12638                      :                                                                                                --TA--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CC--G-GG-CCC-TAAta
gi|12639                      :                                                                                                   A--GG--G--C-A---C----C-CG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--A-GG-CCC-TAATata





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                    1111               111111                           
lowQualScore                  :               0 1 22222 0 11 11 0 0 1111 333333 222 33333 11 111 11 00  3333333333333  222 11111 00  22  11 00 2222222222 0 0 2222 0000 333 7777 22 0 333333 333333 11  00 0  0   0    
lowQualScore                  :               . . ..... . .. .. . . .... ...... ... ..... .. ... .. ..  .............  ... ..... ..  ..  .. .. .......... . . .... .... ... .... .. . ...... ...... ..  .. .  .   .    
lowQualScore                  :               5 0 00000 5 11 11 5 9 0000 333333 222 44444 66 333 66 66  6666666666666  777 66666 66  66  11 66 6666666666 9 4 3333 9999 000 8888 99 4 111111 666666 11  66 5  5   9    
consensus                     :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
Reference ( family-247 )      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12550                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12551                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12552                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12553                      :         GACGGA-C-G-----G-C--C--G-G-A----C------A---AT-------T---GA-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A----------C-G----C----A---TC---T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12554                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--A-G-A----T------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12555                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A----T----G--C---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12556                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActa
gi|12557                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---ATT---G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActta
gi|12558                      :         GACAGA-C-G-----G-G--T--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATctta
gi|12559                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-
gi|12560                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---ACT---G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12561                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TAC-GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAAT
gi|12562                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12563                      :         GACGGA-CAG-----G-A--C--G-GGA----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TAG-GG--G--C-A---CT---C-T-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG--CC-TAA
gi|12564                      :         GACAGA---G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-G-C----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12565                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G-----TT-------------AC---T-----A--TA--CG--G--C-A---C----C-C-GC---C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12566                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T------A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG-----C-A---C----C-A-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12567                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------G---AT----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GC-CGC-TAA
gi|12568                      :         GACAGA-C-GTGG--A-A--C--GCG-A----C------A---AT----G--T---G--AATTC-------------AC---T-----A--TA--GG--GGTC-A---T----C-C-G----C----A---T----T--C-T------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAata
gi|12569                      :         GACAGA-C-G-----A-AAAC--G-G-A----C------A---AT----G--TT--G--A--TTT------------AC---T-----A--TACGGG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--GC-CG--G-GC-CCC-TAATcta
gi|12570                      :         GACG-A-C-G-----G-A--C--G-GGA----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GC-CCta
gi|12571                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12572                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------T---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--CA--GGC-C--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--A-CG-CCC-TAATta
gi|12573                      :         GACAGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AA---T-----A--TAG-GG--G--C-A---C----CGC-GC---C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--C---G-GG-CGC-TAAT
gi|12574                      :         GACAGA-T-G-----G-G--C--G-G-A----C-----------T----G--T---G--A--TT-------------AT---T-----A--TA--GG--A--C-T---C----T-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GA-CTC-TAATta
gi|12575                      :         GACGGA-C-G-----C-A--C--G-G-A----C------AT--AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-AAACC----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------ATTTT--G--CG--G-GG-CCCGTAATta
gi|12576                      :         GATGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----TGCT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12577                      :         GACGAA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-A-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12578                      :         GACAGC-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--C---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATcta
gi|12579                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--A-A-A----C------A---AT----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----CTAT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TA
gi|12580                      :             GA-C-G-----A-A--C--A-G-A----C------A---AT-------T---G--A--TT-------------ACAA-T-----A--TAAAGGTAG--C-A---AA---C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12581                      :  gacagatGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12582                      :         GATAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--T-G--------C-C-A----C----A---T----TTGT-CG-----A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12583                      :         GACGAA-T-G-----G-A--T--G-G-A----A------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------A------G--TG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12584                      :     gacaGATGGA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------A---AT----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------A--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12585                      :         GACTGA-C-G-----T-A--T--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12586                      : gacaaacgGACGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TC-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GA-CCC-TAATta
gi|12587                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C-------------T--T-CTGTCA-A---T--G--CG--G-AG-CCT-AAATta
gi|12588                      :         GACGGA-C-G-----GGA--C--G-G-A----C------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----C----C---G----A--T-A------A---TCGG--CG--G-GGCCCC-TAAT
gi|12589                      :         GACGGA-A-T-----G-A--C--A-A-ATGCGC------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----C----AT--T----T--T-C------AT--T--G--TG--G-AA-CCA-TAATta
gi|12590                      : gacagagaGACAGA-C-A-----G-A--T--G-G-A----C------A---CA----G--T---A--A--AT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----C---T----T-----------A---T--GGTAG--G-GG-CCC-TAAt
gi|12591                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--T---GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---TC---C--T-CG-----A---T--G--C---G-GG-CCC-TCAT
gi|12592                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AA---T-----A--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCA-TAAT
gi|12593                      :         GACGGAAC-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----G--T---G--A--TT-------------AC---C-----A--TT--GG--G--C-T---C----C-C-A----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CA--G-GG-CCC-TAAT
gi|12594                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------A---AA----G--T---A--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----C-T------C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--C---G-GG-CCC-TAATta
gi|12595                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----T-C-G----CCG--A---T----T--CAC------A---T--G--
gi|12596                      :         GACGAA-C-A-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----CCGATA---C----T--T------------G--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12597                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---GC-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-T
gi|12598                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--A-G-A----C------A---GACTGAG--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----T-C-AC---C----A---T----T--T------------G--G--TG--G-GG-CCC-TTAT
gi|12599                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--AC----G------G--A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12600                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--AC----G------G--A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12601                      :         GACAGA-T-T-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G----A---A----C-A-G----C----ATCTT----T--T-G------A---T--G--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12602                      :         GACGGA-T-G-----G-A--T--A-G-A----C------AGAAAA----GC-T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---A--T-C------A------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12603                      :         GAAGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----T------A---TA----G--T---G--A--TA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----CAC-A----T----A---T----G--T-CG-----A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAta
gi|12604                      :     gacaGACAGA-C-G-----G-C--T--A-G-A----CTTGACAA---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--CA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CT--G-GG-CCC-TAAT
gi|12605                      :         GACGGA-T-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----C--T-C------ta
gi|12606                      :     gacaGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----CGAA---A---AA----GC-T---G--A--TT-------------AC---C-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-GCCGAC----A---C----T--C-G------A---------CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12607                      :          ACAGA-CTG-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TTTT-----------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-ACC-TAA
gi|12608                      :          ACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---A-----A--TA--GA--G-------------------------------T----T--T-C------A---T--G--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12609                      :          ACGGA-C-GACCGCG-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---TGATTCA--TG--TG--G--C-A---A----T-C-G----C----A---A----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CTC-TGA
gi|12610                      :          ACAGA-T-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--AT-------------GC---T-----A--CA--GG--G--C-T---T----C-C-C----C----A---T----T--T-TCA----A---T--G--CT--G-GG-CCC-T
gi|12611                      :          ACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--C---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--CTT---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12612                      :           CAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--T--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12613                      :           CAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A---T-------------AC---T-----A--AA--GG--G----A---C----A-C-G----C----A--------T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCta
gi|12614                      :           CGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----A--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TGAT
gi|12615                      :         GACGGA-C-T-----G-A--CCAG-G-A----C------A---GA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G---------A---TCAAAT--C-C------T---T--G--CG--G-GG-CCC-TAta
gi|12616                      :         caCGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-C----CCG--A---TA---T--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12617                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-A-A-----------A---AT----G--T---T--A--T--------------AC---TT----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CCG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12618                      :            aGG-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----CTGA-G---T----A--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12619                      :            aGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12620                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12621                      :             GA-C-G-----G-AG-C--G-G-A----C------A---AT----G------G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--CG--G-GG-CCCTTAATta
gi|12622                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12623                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12624                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----CCC----A---AC----C--T---GTCA--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--C---G-GG-CCC-TAA
gi|12625                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AC----AGCT---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TAA--C--T-C----------T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12626                      :             GA-C-G-----A-A--CA-G-G-A----C------C---AA----G--T---C--A--TT-------------AC---T-----ACCTA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----C---T----T--T-C------A---T--G--CG--T-GG--CT-TAATta
gi|12627                      :             GG-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A----T----G--T---G--A--TTGCACAGGCTTATCAC---T-----A--TA--GG--A--C-A---C----C-T-G----C----C---T----G--T--------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12628                      :             GA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------G---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G---------A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CTC-TAATca
gi|12629                      :              A-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12630                      :              A-C-G-----G-A--C--G-A-A----T------G---GT----G--TTGAG--A--TT-------------ACA--T-----A--TA--GG--G--C-----C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CGTAGTGG-CGC-TAATta
gi|12631                      :                 -G-----G-A--C--G---A----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---------A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----C----A---T----TA-T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12632                      :                   -----G-A--C--G-G-A----C------A---AAT---G--T---G--A--TT--------------C---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-C----C----A---T----C--A-CCAGAAAA---T--G--CC--G-GG-CCC-TTAT
gi|12633                      :                         -A--C--A-A-A----CT-----A---AT----G--T---G--A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12634                      :                         -A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---CCGCGC-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAA
gi|12635                      :                                                      ----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--C--CG--G-GG-CCC-TAATata
gi|12636                      :                                                           --T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-A---C----C-C-G----CCG--A---T----TAAT-C------A---------CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12637                      :                                                                                        ---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TGATta
gi|12638                      :                                                                                                  --TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CC--G-GG-CCC-TAAta
gi|12639                      :                                                                                                     A--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--A-GG-CCC-TAATata





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                    1111               111111                           
lowQualScore                  :               0 1 22222 0 11 11 0 0 1111 333333 222 33333 11 111 11 00  3333333333333  222 11111 00  22  11 00 2222222222 0 0 2222 0000 333 7777 22 0 333333 333333 11  00 0  0   0    
lowQualScore                  :               . . ..... . .. .. . . .... ...... ... ..... .. ... .. ..  .............  ... ..... ..  ..  .. .. .......... . . .... .... ... .... .. . ...... ...... ..  .. .  .   .    
lowQualScore                  :               5 0 00000 5 11 11 5 9 0000 333333 222 44444 66 333 66 66  6666666666666  777 66666 66  66  11 66 6666666666 9 4 3333 9999 000 8888 99 4 111111 666666 11  66 5  5   9    
consensus                     :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
Reference ( family-247 )      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12550                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12551                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12552                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12553                      :         GACGGA-C-G-----G-C--C--G-G-A----C------A---AT-------T---GA-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A----------C-G----C----A---TC---T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12554                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--A-G-A----T------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12555                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A----T----G--C---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12556                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActa
gi|12557                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---ATT---G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActta
gi|12558                      :         GACAGA-C-G-----G-G--T--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATctta
gi|12559                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-
gi|12560                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---ACT---G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12561                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TAC-GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAAT
gi|12562                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12563                      :         GACGGA-CAG-----G-A--C--G-GGA----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TAG-GG--G--C-A---CT---C-T-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG--CC-TAA
gi|12564                      :         GACAGA---G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-G-C----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12565                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G-----TT-------------AC---T-----A--TA--CG--G--C-A---C----C-C-GC---C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12566                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T------A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG-----C-A---C----C-A-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12567                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------G---AT----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GC-CGC-TAA
gi|12568                      :         GACAGA-C-GTGG--A-A--C--GCG-A----C------A---AT----G--T---G--AATTC-------------AC---T-----A--TA--GG--GGTC-A---T----C-C-G----C----A---T----T--C-T------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAata
gi|12569                      :         GACAGA-C-G-----A-AAAC--G-G-A----C------A---AT----G--TT--G--A--TTT------------AC---T-----A--TACGGG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--GC-CG--G-GC-CCC-TAATcta
gi|12570                      :         GACG-A-C-G-----G-A--C--G-GGA----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GC-CCta
gi|12571                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12572                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------T---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--CA--GGC-C--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--A-CG-CCC-TAATta
gi|12573                      :         GACAGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AA---T-----A--TAG-GG--G--C-A---C----CGC-GC---C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--C---G-GG-CGC-TAAT
gi|12574                      :         GACAGA-T-G-----G-G--C--G-G-A----C-----------T----G--T---G--A--TT-------------AT---T-----A--TA--GG--A--C-T---C----T-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GA-CTC-TAATta
gi|12575                      :         GACGGA-C-G-----C-A--C--G-G-A----C------AT--AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-AAACC----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------ATTTT--G--CG--G-GG-CCCGTAATta
gi|12576                      :         GATGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----TGCT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12577                      :         GACGAA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-A-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12578                      :         GACAGC-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--C---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATcta
gi|12579                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--A-A-A----C------A---AT----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----CTAT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TA
gi|12580                      :             GA-C-G-----A-A--C--A-G-A----C------A---AT-------T---G--A--TT-------------ACAA-T-----A--TAAAGGTAG--C-A---AA---C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12581                      :  gacagatGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12582                      :         GATAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--T-G--------C-C-A----C----A---T----TTGT-CG-----A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12583                      :         GACGAA-T-G-----G-A--T--G-G-A----A------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------A------G--TG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12584                      :     gacaGATGGA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------A---AT----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------A--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12585                      :         GACTGA-C-G-----T-A--T--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12586                      : gacaaacgGACGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TC-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GA-CCC-TAATta
gi|12587                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C-------------T--T-CTGTCA-A---T--G--CG--G-AG-CCT-AAATta
gi|12588                      :         GACGGA-C-G-----GGA--C--G-G-A----C------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----C----C---G----A--T-A------A---TCGG--CG--G-GGCCCC-TAAT
gi|12589                      :         GACGGA-A-T-----G-A--C--A-A-ATGCGC------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----C----AT--T----T--T-C------AT--T--G--TG--G-AA-CCA-TAATta
gi|12590                      : gacagagaGACAGA-C-A-----G-A--T--G-G-A----C------A---CA----G--T---A--A--AT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----C---T----T-----------A---T--GGTAG--G-GG-CCC-TAAt
gi|12591                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--T---GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---TC---C--T-CG-----A---T--G--C---G-GG-CCC-TCAT
gi|12592                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AA---T-----A--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCA-TAAT
gi|12593                      :         GACGGAAC-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----G--T---G--A--TT-------------AC---C-----A--TT--GG--G--C-T---C----C-C-A----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CA--G-GG-CCC-TAAT
gi|12594                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------A---AA----G--T---A--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----C-T------C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--C---G-GG-CCC-TAATta
gi|12595                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----T-C-G----CCG--A---T----T--CAC------A---T--G--
gi|12596                      :         GACGAA-C-A-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----CCGATA---C----T--T------------G--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12597                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---GC-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-T
gi|12598                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--A-G-A----C------A---GACTGAG--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----T-C-AC---C----A---T----T--T------------G--G--TG--G-GG-CCC-TTAT
gi|12599                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--AC----G------G--A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12600                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--AC----G------G--A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12601                      :         GACAGA-T-T-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G----A---A----C-A-G----C----ATCTT----T--T-G------A---T--G--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12602                      :         GACGGA-T-G-----G-A--T--A-G-A----C------AGAAAA----GC-T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---A--T-C------A------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12603                      :         GAAGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----T------A---TA----G--T---G--A--TA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----CAC-A----T----A---T----G--T-CG-----A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAta
gi|12604                      :     gacaGACAGA-C-G-----G-C--T--A-G-A----CTTGACAA---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--CA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CT--G-GG-CCC-TAAT
gi|12605                      :         GACGGA-T-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----C--T-C------ta
gi|12606                      :     gacaGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----CGAA---A---AA----GC-T---G--A--TT-------------AC---C-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-GCCGAC----A---C----T--C-G------A---------CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12607                      :          ACAGA-CTG-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TTTT-----------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-ACC-TAA
gi|12608                      :          ACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---A-----A--TA--GA--G-------------------------------T----T--T-C------A---T--G--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12609                      :          ACGGA-C-GACCGCG-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---TGATTCA--TG--TG--G--C-A---A----T-C-G----C----A---A----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CTC-TGA
gi|12610                      :          ACAGA-T-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--AT-------------GC---T-----A--CA--GG--G--C-T---T----C-C-C----C----A---T----T--T-TCA----A---T--G--CT--G-GG-CCC-T
gi|12611                      :          ACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--C---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--CTT---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12612                      :           CAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--T--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12613                      :           CAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A---T-------------AC---T-----A--AA--GG--G----A---C----A-C-G----C----A--------T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCta
gi|12614                      :           CGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----A--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TGAT
gi|12615                      :         GACGGA-C-T-----G-A--CCAG-G-A----C------A---GA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G---------A---TCAAAT--C-C------T---T--G--CG--G-GG-CCC-TAta
gi|12616                      :         caCGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-C----CCG--A---TA---T--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12617                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-A-A-----------A---AT----G--T---T--A--T--------------AC---TT----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CCG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12618                      :            aGG-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----CTGA-G---T----A--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12619                      :            aGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12620                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12621                      :             GA-C-G-----G-AG-C--G-G-A----C------A---AT----G------G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--CG--G-GG-CCCTTAATta
gi|12622                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12623                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12624                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----CCC----A---AC----C--T---GTCA--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--C---G-GG-CCC-TAA
gi|12625                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AC----AGCT---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TAA--C--T-C----------T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12626                      :             GA-C-G-----A-A--CA-G-G-A----C------C---AA----G--T---C--A--TT-------------AC---T-----ACCTA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----C---T----T--T-C------A---T--G--CG--T-GG--CT-TAATta
gi|12627                      :             GG-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A----T----G--T---G--A--TTGCACAGGCTTATCAC---T-----A--TA--GG--A--C-A---C----C-T-G----C----C---T----G--T--------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12628                      :             GA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------G---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G---------A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CTC-TAATca
gi|12629                      :              A-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12630                      :              A-C-G-----G-A--C--G-A-A----T------G---GT----G--TTGAG--A--TT-------------ACA--T-----A--TA--GG--G--C-----C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CGTAGTGG-CGC-TAATta
gi|12631                      :                 -G-----G-A--C--G---A----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---------A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----C----A---T----TA-T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12632                      :                   -----G-A--C--G-G-A----C------A---AAT---G--T---G--A--TT--------------C---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-C----C----A---T----C--A-CCAGAAAA---T--G--CC--G-GG-CCC-TTAT
gi|12633                      :                         -A--C--A-A-A----CT-----A---AT----G--T---G--A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12634                      :                         -A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---CCGCGC-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAA
gi|12635                      :                                                      ----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--C--CG--G-GG-CCC-TAATata
gi|12636                      :                                                           --T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-A---C----C-C-G----CCG--A---T----TAAT-C------A---------CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12637                      :                                                                                        ---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TGATta
gi|12638                      :                                                                                                  --TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CC--G-GG-CCC-TAAta
gi|12639                      :                                                                                                     A--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--A-GG-CCC-TAATata


blockSeqs                     :                   ACCGC   AA CA          TTGACA GAA ACTGA GC TGA TC     GCACAGGCTTATC  AAA GATTC     CG  TA    GCCGCG         CCGA CGAT TCT CAAA GC   CAGAAA TTTT   GT
blockSeqs                     :                   TGG     G  A           GAA    T   TT    C  T   A      TT             AAA T         AA  C     AAACC          C    TGA  T   AA   TA   TGTCA  TCG    C 
blockSeqs                     :                   .       .  .           CC     G   CT    C  .   C      T              AA  .         C   .     ACT            C    CG   T   C    TG   TCG    TG     . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           T      G   AT    .  .   .      .              A   .         G   .     AAA            C    CG   T   A    AA   TCG    TT     . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         G   .     TTC            .    CG   T   A    A    TTG    TG     . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   T   A    .    TCG    TG     . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   A    .    TCG    T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   A    .    TCG    T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   C    .    TCG    T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AA             .    CG   .   A    .    TTG    T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AA             .    CA   .   A    .    TCG    T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    CG   .   A    .    CA     T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   A    .    A      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   A    .    G      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   A    .    G      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CA   .   A    .    G      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    CG   .   .    .    G      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    G      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    A      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     GC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      G      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      G      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     GC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     GC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     AA             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     GC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     GC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   C     .  .   .      .              .   .         .   .     AA             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   C     .  .   .      .              .   .         .   .     TT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   G     .  .   .      .              .   .         .   .     TC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AT             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      T      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   C     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   C     .  .   .      .              .   .         .   .     AC             .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     A              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     A              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                   .       .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                           .  .           .      .   T     .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                           .  .           .      .   A     .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                                                           .  .   .      .              .   .         .   .     G              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                                                           .  .   .      .              .   .         .   .     A              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                                                                                        .   .         .   .     A              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                                                                                                      .   .     C              .    .    .   .    .    .      .      . 
blockSeqs                     :                                                                                                      .   .     .              .    .    .   .    .    .               


blockSeqCons                  :         
originalCons                  :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
finalCons                     :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                    1111               111111                           
lowQualScore                  :               0 1 22222 0 11 11 0 0 1111 333333 222 33333 11 111 11 00  3333333333333  222 11111 00  22  11 00 2222222222 0 0 2222 0000 333 7777 22 0 333333 333333 11  00 0  0   0    
lowQualScore                  :               . . ..... . .. .. . . .... ...... ... ..... .. ... .. ..  .............  ... ..... ..  ..  .. .. .......... . . .... .... ... .... .. . ...... ...... ..  .. .  .   .    
lowQualScore                  :               5 0 00000 5 11 11 5 9 0000 333333 222 44444 66 333 66 66  6666666666666  777 66666 66  66  11 66 6666666666 9 4 3333 9999 000 8888 99 4 111111 666666 11  66 5  5   9    
consensus                     :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
Reference ( family-247 )      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AN----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12550                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12551                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12552                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12553                      :         GACGGA-C-G-----G-C--C--G-G-A----C------A---AT-------T---GA-A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A----------C-G----C----A---TC---T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12554                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--A-G-A----T------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12555                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A----T----G--C---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12556                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActa
gi|12557                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---ATT---G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---A----C-C-G----C----A---T----T--T-T------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TActta
gi|12558                      :         GACAGA-C-G-----G-G--T--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATctta
gi|12559                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-
gi|12560                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---ACT---G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12561                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TAC-GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAAT
gi|12562                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12563                      :         GACGGA-CAG-----G-A--C--G-GGA----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TAG-GG--G--C-A---CT---C-T-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG--CC-TAA
gi|12564                      :         GACAGA---G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-G-C----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12565                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G-----TT-------------AC---T-----A--TA--CG--G--C-A---C----C-C-GC---C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12566                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T------A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG-----C-A---C----C-A-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12567                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------G---AT----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GC-CGC-TAA
gi|12568                      :         GACAGA-C-GTGG--A-A--C--GCG-A----C------A---AT----G--T---G--AATTC-------------AC---T-----A--TA--GG--GGTC-A---T----C-C-G----C----A---T----T--C-T------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAata
gi|12569                      :         GACAGA-C-G-----A-AAAC--G-G-A----C------A---AT----G--TT--G--A--TTT------------AC---T-----A--TACGGG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--GC-CG--G-GC-CCC-TAATcta
gi|12570                      :         GACG-A-C-G-----G-A--C--G-GGA----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GC-CCta
gi|12571                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12572                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------T---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--CA--GGC-C--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--A-CG-CCC-TAATta
gi|12573                      :         GACAGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AA---T-----A--TAG-GG--G--C-A---C----CGC-GC---C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--C---G-GG-CGC-TAAT
gi|12574                      :         GACAGA-T-G-----G-G--C--G-G-A----C-----------T----G--T---G--A--TT-------------AT---T-----A--TA--GG--A--C-T---C----T-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CA--G-GA-CTC-TAATta
gi|12575                      :         GACGGA-C-G-----C-A--C--G-G-A----C------AT--AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-AAACC----C-C-G----C----AT--T----T--T-C------ATTTT--G--CG--G-GG-CCCGTAATta
gi|12576                      :         GATGGA-C-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----TGCT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12577                      :         GACGAA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-A-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12578                      :         GACAGC-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--C---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATcta
gi|12579                      :         GACAGA-C-A-----G-A--C--A-A-A----C------A---AT----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---T----CTAT-CG-----A---T--G--CG--G-GG-CCC-TA
gi|12580                      :             GA-C-G-----A-A--C--A-G-A----C------A---AT-------T---G--A--TT-------------ACAA-T-----A--TAAAGGTAG--C-A---AA---C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12581                      :  gacagatGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12582                      :         GATAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--T-G--------C-C-A----C----A---T----TTGT-CG-----A---T--G--CA--G-GG-CCC-TAATta
gi|12583                      :         GACGAA-T-G-----G-A--T--G-G-A----A------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------A------G--TG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12584                      :     gacaGATGGA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------A---AT----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------A--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12585                      :         GACTGA-C-G-----T-A--T--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12586                      : gacaaacgGACGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TC-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GA-CCC-TAATta
gi|12587                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G--------C-C-G----C-------------T--T-CTGTCA-A---T--G--CG--G-AG-CCT-AAATta
gi|12588                      :         GACGGA-C-G-----GGA--C--G-G-A----C------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--AA--GG--G--C-T---C----C-C-G----C----C---G----A--T-A------A---TCGG--CG--G-GGCCCC-TAAT
gi|12589                      :         GACGGA-A-T-----G-A--C--A-A-ATGCGC------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----C----AT--T----T--T-C------AT--T--G--TG--G-AA-CCA-TAATta
gi|12590                      : gacagagaGACAGA-C-A-----G-A--T--G-G-A----C------A---CA----G--T---A--A--AT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----C---T----T-----------A---T--GGTAG--G-GG-CCC-TAAt
gi|12591                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--T---GG--G--C-G--------C-C-G----C----A---TC---C--T-CG-----A---T--G--C---G-GG-CCC-TCAT
gi|12592                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AA---T-----A--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCA-TAAT
gi|12593                      :         GACGGAAC-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----G--T---G--A--TT-------------AC---C-----A--TT--GG--G--C-T---C----C-C-A----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CA--G-GG-CCC-TAAT
gi|12594                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------A---AA----G--T---A--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----C-T------C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--C---G-GG-CCC-TAATta
gi|12595                      :         GACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----T-C-G----CCG--A---T----T--CAC------A---T--G--
gi|12596                      :         GACGAA-C-A-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----CCGATA---C----T--T------------G--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12597                      :         GACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---GC-A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-T
gi|12598                      :         GACGGA-C-G-----G-A--T--A-G-A----C------A---GACTGAG--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----T-C-AC---C----A---T----T--T------------G--G--TG--G-GG-CCC-TTAT
gi|12599                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--AC----G------G--A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12600                      :         GACGGA-C-A-----G-A--C--A-G-A----C------AG--AC----G------G--A--T--------------ACAAAT-----A--TA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12601                      :         GACAGA-T-T-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G----A---A----C-A-G----C----ATCTT----T--T-G------A---T--G--CA--G-GA-CCC-TAAT
gi|12602                      :         GACGGA-T-G-----G-A--T--A-G-A----C------AGAAAA----GC-T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---A--T-C------A------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12603                      :         GAAGGA-T-G-----G-A--C--G-G-A----T------A---TA----G--T---G--A--TA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---C----CAC-A----T----A---T----G--T-CG-----A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAta
gi|12604                      :     gacaGACAGA-C-G-----G-C--T--A-G-A----CTTGACAA---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--CA--GG--G--C-G---C----C---G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CT--G-GG-CCC-TAAT
gi|12605                      :         GACGGA-T-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G----C----A---T----C--T-C------ta
gi|12606                      :     gacaGACGGA-C-G-----G-A--C--G-G-G----CGAA---A---AA----GC-T---G--A--TT-------------AC---C-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-GCCGAC----A---C----T--C-G------A---------CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12607                      :          ACAGA-CTG-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TTTT-----------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T-----CG--G-GG-ACC-TAA
gi|12608                      :          ACAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---A-----A--TA--GA--G-------------------------------T----T--T-C------A---T--G--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12609                      :          ACGGA-C-GACCGCG-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---TGATTCA--TG--TG--G--C-A---A----T-C-G----C----A---A----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CTC-TGA
gi|12610                      :          ACAGA-T-G-----G-A--T--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--AT-------------GC---T-----A--CA--GG--G--C-T---T----C-C-C----C----A---T----T--T-TCA----A---T--G--CT--G-GG-CCC-T
gi|12611                      :          ACAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--C---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--CTT---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12612                      :           CAGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--T--CG--G-AG-CCC-TAAT
gi|12613                      :           CAGA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A---T-------------AC---T-----A--AA--GG--G----A---C----A-C-G----C----A--------T--T-C------A---TG-G--CG--G-GG-CCta
gi|12614                      :           CGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----A--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCG--A---TA---C--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TGAT
gi|12615                      :         GACGGA-C-T-----G-A--CCAG-G-A----C------A---GA----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G---------A---TCAAAT--C-C------T---T--G--CG--G-GG-CCC-TAta
gi|12616                      :         caCGGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-C----CCG--A---TA---T--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12617                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-A-A-----------A---AT----G--T---T--A--T--------------AC---TT----A--TA--GG--G--C-A---C----C-CCG----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12618                      :            aGG-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AG----C--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-A----CTGA-G---T----A--T-C------G------G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12619                      :            aGA-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12620                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12621                      :             GA-C-G-----G-AG-C--G-G-A----C------A---AT----G------G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-A----C----A---T----T--T-CA-----A---T--G--CG--G-GG-CCCTTAATta
gi|12622                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATta
gi|12623                      :             GA-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--C-A---C----C-T-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12624                      :             GA-C-G-------A--C--G-G-A----CCC----A---AC----C--T---GTCA--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--C---G-GG-CCC-TAA
gi|12625                      :             GA-C-G-----G-A--C--G-G-A----A------A---AC----AGCT---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-T---C----C-C-G----CCA--A---TAA--C--T-C----------T--G--CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12626                      :             GA-C-G-----A-A--CA-G-G-A----C------C---AA----G--T---C--A--TT-------------AC---T-----ACCTA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----C---T----T--T-C------A---T--G--CG--T-GG--CT-TAATta
gi|12627                      :             GG-C-A-----G-A--C--G-G-A----C------A----T----G--T---G--A--TTGCACAGGCTTATCAC---T-----A--TA--GG--A--C-A---C----C-T-G----C----C---T----G--T--------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAATt
gi|12628                      :             GA-T-G-----G-A--C--A-G-A----C------G---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A--------C-C-G---------A---T----C--T-CTTG---A---T--G--CG--G-GG-CTC-TAATca
gi|12629                      :              A-C-G-----G-A--C--G-G-A----C------A---AT----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-TCC-TAAT
gi|12630                      :              A-C-G-----G-A--C--G-A-A----T------G---GT----G--TTGAG--A--TT-------------ACA--T-----A--TA--GG--G--C-----C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---TG-G--CGTAGTGG-CGC-TAATta
gi|12631                      :                 -G-----G-A--C--G---A----C------A---AA----G--T---G--A--TT-------------AC---------A--TA--GG--G--C-T---C----C-T-G----C----A---T----TA-T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAA
gi|12632                      :                   -----G-A--C--G-G-A----C------A---AAT---G--T---G--A--TT--------------C---T-----A--TA--GG--G--C-A---T----C-C-C----C----A---T----C--A-CCAGAAAA---T--G--CC--G-GG-CCC-TTAT
gi|12633                      :                         -A--C--A-A-A----CT-----A---AT----G--T---G--A--T--------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TAAta
gi|12634                      :                         -A--C--G-G-A----C------A---AA----G--T---G--A--AA-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-G---CCGCGC-C-G----C----A---T----C--T-CTCG---A---T--G--CG--G-GG-CCT-TAA
gi|12635                      :                                                      ----G--T---G--A--TT-------------AC---T-----A--TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--C--CG--G-GG-CCC-TAATata
gi|12636                      :                                                           --T---G--A--TT-------------AC---T-----G--TA--GG--G--T-A---C----C-C-G----CCG--A---T----TAAT-C------A---------CG--G-GG-CCC-TAAT
gi|12637                      :                                                                                        ---T-----A--TA--AG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--G-GG-CCC-TGATta
gi|12638                      :                                                                                                  --TA--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CC--G-GG-CCC-TAAta
gi|12639                      :                                                                                                     A--GG--G--C-A---C----C-C-G----C----A---T----T--T-C------A---T--G--CG--A-GG-CCC-TAATata