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gi|106235 : -G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GT--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-A
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Reference ( family-242 ) : AGG-AGTTG-C-G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----N---A--G--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-AGGA
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gi|106145 : aAGT-AGTTG-C-A-CTTA--AC-A-AG------T--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--GTT----T---T--G--GC--AAA--T-T-C-CAA-G-T---T-C-AA-AGGA
gi|106146 : aAGC-AGATG-C-A-CT-T--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--GTT----T---T--G--GC--AAA-AC-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-AGGA
gi|106147 : aAGG-AGTTG-C-G-CT-G--AC-A-AA----G-T--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---C--G--G--------------TAA-G-T---T-C-AA-AGG
gi|106148 : aAGG-AATTG-C-G-CT-T--AC-A-AG----G-A--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--TTT----C---T--G--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-CGAA-AGG
gi|106149 : aAGT-AGTTG-C-A-CT-T--AA-A-AG----G-TACG-----TA-T--T-T---ACATGTATG-A-G-G-A--GTT----T---T--G--GC--AAA-AT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-AGG
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gi|106157 : aTTG-C-G-CT-T--AG-C-AG----G-TCACATGG-TA-T--T-T---T------TG-A-G-G-A--GTT----T------G--GC--AAA-AAAT-C-TAA-G-T---T-C-AA-AGGA
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gi|106159 : aggtagttttgtgAGGTAGTTG-C-A-CTTA--AT-A-AG----G-T--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-A-A--GTT----T---T--G--GC--AAA-
gi|106160 : AGG-AGTTT-C-G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GC--AAA------C-TAA-G-T---T-C-AA-AG
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gi|106207 : AGG-AGATG-C-A-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-TATT-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-ACGAcaaagg
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gi|106233 : TG-C-A-CT-A--AC-A-AG----G-T--------TA-C--T-T---A------TG-T-G-G-AG-TTT----T---A-----GC--AAA-AT-T-A-TAC-G-T---T-C-AA-A
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gi|106222 : -AGTTG-C-G-CT-G--AC-A-AG----G-C--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--AC--AAA-TT-T-T-AAA-G-T---T-C-AA-A
gi|106223 : GTTG-C-G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-ATGA
gi|106224 : GTTG-T-G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-GAG-A--TTT----A---A--G--GT--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-A
gi|106225 : GTTG-C-G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TT-T--T-CG--A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-A
gi|106226 : GTTG-T-G-CT-T--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--TT------------------------------TAA-G-T---T-C-AA-AGGA
gi|106227 : TTG-C-G-CT-T--AC-ACAG----G-TCTCACATGTA-C--T-TTGTA------TG-A-G-G-AG-TTT----T---------GC--AAA-T----C-TAA-G-T---TTC-AA-AGGA
gi|106228 : TTG-C-A-CT-G--AC-A--G----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----C---A--G--GC--AAA-TT-T-CTTAA-G-T---T-C-AA-A
gi|106229 : TTG-CCG-CT-G--AC-A-AG----T-T--------TA-T--C-T---A------TA-A-G-A-A--TTT----A---C--A--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-AGG
gi|106230 : TG-C-A-CT-G--AC-A-AG------T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-
gi|106231 : TG-C-G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-TA--A------AG-A-G-G-A--TTT----C---A--GGCGC--AAA--T-C-C-TAA-G-T---T-C-AA-GG
gi|106232 : TG-C-A-CT-G--AC-A-AG----GAT--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--TTT----C---T--G--AC--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-
gi|106233 : TG-C-A-CT-A--AC-A-AG----G-T--------TA-C--T-T---A------TG-T-G-G-AG-TTT----T---A-----GC--AAA-AT-T-A-TAC-G-T---T-C-AA-A
gi|106234 : TG-C-G-TT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-T---A------TG-A-G-G-A--TTT----C---A--G--GC--ATA-AT-T-C-AAA-G-T---T-C-GA-AGG
gi|106235 : -G-CT-G--AC-A-AG----G-T--------TA-T--T-C---A------TG-A-G-G-A--TTT----A---A--G--GT--AAA-TT-T-C-TAA-G-T---T-C-AA-A
gi|106236 : --T-T---A------TG-A-G-G-A--GTT----T---T--G--GC--AAA-AT-T-C-TAA-GTT---T-C-AA-A
gi|106237 : G-A-G-G-A--GTT----T---T--G--AC--AAA-AT-T-T-TAA-G-T---T-C-AA-AGGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|106214 ): GTAGTTGCGCATATGATGTCCCATGTATTTATCTGGAGTTTTGGCCAAAAAAAAAGTCTAAGTTCAAAGGA