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Reference ( gi|11112 ) : AACT-C-T-T---A-TC-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA----T--T-T-T-----------T------T----G-T-G-A---A-ATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT-TAAACTCTCTCACAATATTTGTTATGAGCTGATCCACA
gi|11120 : AACA-C-T-T---A-TC-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGC-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA----A--T-T-T-----------T------T----G-T-G-A---A-ATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT-TAAACT
gi|11115 : AACT-C-G-A---A-TC-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA----T--T-T-T-----------T------T----G-T-G-A---A-ATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT-TAA
gi|11113 : AACT-C-T-T---A-TT-T--T----T----A-T-C-G--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA----T--T-T-T-----------T------T----G-T-G-A---A-ATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT-Tctaatatg
gi|11123 : AACA-C-T-T---A-TC-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA----A--A-A-T-----------T------T----G-T-G-A---A-ATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT-TAAA
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gi|11180 : ACT-C-T-T---A-TT----T----T----A-T-CTA--T----G-TGA-A-------G-T--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA-------T-T-T-----------T------T----G-T-G-A---A-ATG-T-A-ATT-T--G----C------G---T-A-T-G-TTTT-TAA
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gi|11185 : CT-C-T-T---A-TT----C----T----A-T-C-AAAT----A-GGA-A-------G-T--TC--T-C-A--AA-TT--T--T--G-AA-G--AAT-----A-G------AA------AA------------------------AAAAAAT----G-T-G-A---A-ATG-T-A-CAT-TG-G----C------G---TAA-T-G--CCT-TAA
gi|11186 : T-C-T-TTA-A-CT-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----A-G------AA------AA----A--T-A-A-----------T------T----G-T-GAA---A-ATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCT-Tttatgcatttatatacaattcttcatag
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|11114 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-A--A-T---AGG---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-G-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11115 : AACT-C-G-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----TT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT---A-AC-T-------AA-------T---ATG-
gi|11116 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--AATTT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AT----AT----T-T-----------TT--G-T-GAA---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A---G-CCCTT--AA-A
gi|11117 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--AATTT--T--T--G-GA-AGTA-T---A-G---AA--AAAC--TT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-C-T-T--G----C------G---T-A-TGG-CCCTT--AA-AT-
gi|11118 : AACC-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-CGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--acaggatacatatagctctgtaga
gi|11119 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11120 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGC-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AC-T-------
gi|11121 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T---------A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-A--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CTCTT--AA-A
gi|11122 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--atgtgtccataggacctgaatgtgaaatcactgc
gi|11123 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11124 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TA--A-G---AA--AA----TT----T-T-----------TT--G-G-G-A---A-A---------TG-T-T-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11125 : AACT-C-T-T---A-TATT-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AC----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11126 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA------------------AA--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-CC-T--------A------TT---GTG-t
gi|11127 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA------T-----------TT--G-TGG-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11128 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AATATGC-------AA------TT---A
gi|11129 : AGCT-T-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-C--CT--T-T-T--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--T-----TT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-C-------AA------
gi|11130 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-G---A-G---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11131 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----A----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--CT----TT----A-T-----------TT--T-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G-----A-T-G-CCC--------T-T-------AA------TT---GCG-ATGCTAAATCGTCTATA
gi|11132 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TTGAA-A---AA--AA----AA------------------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11133 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--AT-TT--T--T--G-GA-G--A-TTGAA-A---AA--AA----AA------------------TT--G-T-G-G---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11134 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-T-----------GT----T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11135 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GCA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--GT--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---AT--AA----AA------------------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-At
gi|11136 : AACT-C-T-T---A-T------------T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--C-T---A-G---AA--AA----AA----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AC-T-------
gi|11137 : AACT-C-T-A---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-G--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA------A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11138 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-------------AATTTTTT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CAC-----A-ATCT-------AA-------T---GTG------AA----TCTACA
gi|11139 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----CA----A-T-----------TT--G-C-C-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-Aata
gi|11140 : AACT-C-T-TTGTA-T--T-A--TGTTAT----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CTGAT-C-A--AA-TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--A------T----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-ACT-T--G----C------GT--T-A-T-G-CCCT
gi|11141 : AACT-C-T-T---A-T--T----T----A----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TA--A-G---AA--AA----AA----A-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A---G-CCCTT--AA-AT-T-------
gi|11142 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--GCGTAC------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-tgaagaatttgtaaataacc
gi|11143 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-G-------A-T--CT----C-A--A--TT--TATT--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AT----T-T-----------TT--G-T-G-A---ATA---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11144 : AACT-C-T-T---A-T--A-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA------A-----------TA--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-TAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-t
gi|11145 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------C-T--CT--TTC-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---AA--AA----AA----T-T---------------G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-ct
gi|11146 : AGCT-C-A-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----G-AGA-A-------C-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--T-GA-G--A-T---AAG---AA--AA----AT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG---A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--TA-A
gi|11147 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-G-A-A-------G-TTACT--TAC-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----A-----T-T-----------TT--G-T-G-AGAAA-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11148 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----TTA--A-TTC-A--T----T-GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--T--G-G--G--A-T---A-A---AA--AA----AC----A-T-----------T---G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11149 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--A--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11150 : AACT-A-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AT----TT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CTT-A--A----G------G---T-A-T-G-
gi|11151 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-CGA--T----T-TGA-A-------G-T--CT--T-C-AT-A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----TA----T-T---------------G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-TCCTTGAAA-AT-C-------AA------TTCCAATG-A-
gi|11152 : AACA-T-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----C-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----CA----A-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11153 : AACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA---------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11154 : AACT-C-T-T---T-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--------------------------------------------------------T--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11155 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-ATTCCGTCG-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AC----AA----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----CATAATTA---T-A-T-G-CCCTT-----------------A------TT---ATA-A-GTTA
gi|11156 : AGCT-C-T-T---A-T--TTAC-T----T----A-T---A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G---AA--AA----------T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-TGA-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCATT--AA-t
gi|11157 : AATT-C-T-T---C-T--T-A--T----T----A-T-C-A--A----T-GGA-A---------T--AT--T-C-A--A--TA--T--T--G-G--G--A-T---A-G---AA--AA----CAA---G-T-----------TT--G-T-G-A---C-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTC--TA-AT-tatg
gi|11158 : AACTTC-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--TCT--T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--A-GA-G--A-T---A-GCA-AA--AA----AA-------------------T--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-CCCTT--
gi|11159 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------T-T--AT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----AA------------------AT--G-T-G-A---A-A---------TA-A-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11160 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--G----T----A-T---A--T----T-G-A-A-------G-T--CT----C-A--A--TT--TA-T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AT----TT----T-T-----------TTTGG-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T---T-GACCCT
gi|11161 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--A----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G----T---A-G---AA--GACT--TT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-
gi|11162 : AACT-C-A-T---A-T--T-A--T----C------T-C-A--T----T-G-A-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AATGAA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-C---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-CT-T-------A
gi|11163 : AACTAC-T-T---A-T--C-A--T---------A-T-C-A--TA---T-GGA-AT------G-TT-CT--T-C-A-----TT--T--T--GCGACG--A-T---A-G---AA--AC----AA----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CTCTT--AA-tt
gi|11164 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TTA-T--T--G-GA-GA-A-T---A-G---AA--AA----A-------------------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T---CAT-T--G----C------G---TAA-T-G--CCTT--AA-tt
gi|11165 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-----------T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TG--T--C--G-GA-T--A-T---A-G---AA--AA----AA----A-A-----------AA--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--t
gi|11166 : AACT-C-T-T---T-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GAA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--AT--T--G--G-GA-G--A-T---A-G---TA--TA----TT----T-TTTTAAATATAATT--T-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-T-T-G-CCCTT--AA-
gi|11167 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------A-T--CA--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TA-T-A-CAC-T--G----C------G---T-A-T-G-ACTTT--AA-ttga
gi|11168 : AACT---T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A---------T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-T--A-T---A-GA--AA--AA----GC----T-C-----------CT--G-T-A-A---AGA---------TGTT-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11169 : AACA-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---AA--AA----TT----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------t
gi|11170 : AACT-C-T-T---C-T--TTA--T----T----A-T-CCA--T----T-GGA-A-------G----CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-A--A-T---C-G---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-G-A---A-ACTTGTACAATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11171 : AACT-C-T-T---A-C--T-A--T----A----A-T-A-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A----------------T----T-T-----------TT--G-T-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----
gi|11172 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T---A--T----T-GGA-AA------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA----A-T---A-G---AA--AA----AA----A-A-----------TT--G-T-GAA---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C----------T-A-T-G-CC
gi|11173 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-A-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---G-G---AA--AA----AA----T-A-----------AT--G-C-G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11174 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---G-GAAAAA--AA----AA----G-A-----------TT--G-A-T-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-TCCTT--AA-
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11127 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------TTT-----G-TG--G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11128 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AATATGC-------AA------TT---A
gi|11129 : AGCT-T-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-C--CT--T-T-T--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------ATTT----------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-C-------AA------
gi|11130 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-G---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11131 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----A----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---CTT---T--A------T-TTT-------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G-----A-T-G-CCC--------T-T-------AA------TT---GCG-ATGCTAAATCGTCTATA
gi|11132 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TTGAA-A---A---------A---A-A---A--A---------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11133 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--AT-TT--T--T--G-GA-G--A-TTGAA-A---A---------A---A-A---A--A---------TT-----G-T---G-G---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11134 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TGT-------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11135 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GCA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--GT--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---A---------T---A-A---A--A---------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-At
gi|11136 : AACT-C-T-T---A-T------------T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--C-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AC-T-------
gi|11137 : AACT-C-T-A---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-G--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11138 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----------------------------A--ATTTTTTT-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CAC-----A-ATCT-------AA-------T---GTG------AA----TCTACA
gi|11139 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---C--A------A-TTT-----G-C---C-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-Aata
gi|11140 : AACT-C-T-TTGTA-T--T-A--TGTTAT----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CTGAT-C-A--AA-TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-T-------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-ACT-T--G----C------GT--T-A-T-G-CCCT
gi|11141 : AACT-C-T-T---A-T--T----T----A----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TA--A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A---G-CCCTT--AA-AT-T-------
gi|11142 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--GCGTAC------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-tgaagaatttgtaaataacc
gi|11143 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-G-------A-T--CT----C-A--A--TT--TATT--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---ATA---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11144 : AACT-C-T-T---A-T--A-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------ATA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-TAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-t
gi|11145 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------C-T--CT--TTC-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---A---------A---A-A---A--A------T-T-------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-ct
gi|11146 : AGCT-C-A-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----G-AGA-A-------C-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--T-GA-G--A-T---AAG---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG---A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--TA-A
gi|11147 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-G-A-A-------G-TTACT--TAC-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A---------T-TTT-----G-T---G-AGAAA-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11148 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----TTA--A-TTC-A--T----T-GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--T--G-G--G--A-T---A-----A---------A---A-A---A--A------C-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11149 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--A--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11150 : AACT-A-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-T---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CTT-A--A----G------G---T-A-T-G-
gi|11151 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-CGA--T----T-TGA-A-------G-T--CT--T-C-AT-A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--A------T-T-------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-TCCTTGAAA-AT-C-------AA------TTCCAATG-A-
gi|11152 : AACA-T-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----C-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---C--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11153 : AACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA---------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11154 : AACT-C-T-T---T-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT-------------------------------------------------------------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11155 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-ATTCCGTCG-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-C---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----CATAATTA---T-A-T-G-CCCTT-----------------A------TT---ATA-A-GTTA
gi|11156 : AGCT-C-T-T---A-T--TTAC-T----T----A-T---A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G-----------------A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TGA-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCATT--AA-t
gi|11157 : AATT-C-T-T---C-T--T-A--T----T----A-T-C-A--A----T-GGA-A---------T--AT--T-C-A--A--TA--T--T--G-G--G--A-T---A-G---A---------A---A-AC--A--A------G-TTT-----G-T---G-A---C-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTC--TA-AT-tatg
gi|11158 : AACTTC-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--TCT--T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--A-GA-G--A-T---A-GCA-A---------A---A-A---A--A----------T-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-CCCTT--
gi|11159 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------T-T--AT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A---------AT-----G-T---G-A---A-A---------TA-A-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11160 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--G----T----A-T---A--T----T-G-A-A-------G-T--CT----C-A--A--TT--TA-T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A---------------T-TTTTTTTGG-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T---T-GACCCT
gi|11161 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--A----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G----T---A-G---A---------A---G-A---CTTT------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-
gi|11162 : AACT-C-A-T---A-T--T-A--T----C------T-C-A--T----T-G-A-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------ATG-A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-C---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-CT-T-------A
gi|11163 : AACTAC-T-T---A-T--C-A--T---------A-T-C-A--TA---T-GGA-AT------G-TT-CT--T-C-A-----TT--T--T--GCGACG--A-T---A-G---A---------A---A-C---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CTCTT--AA-tt
gi|11164 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TTA-T--T--G-GA-GA-A-T---A-G---A---------A---A-A---A------------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T---CAT-T--G----C------G---TAA-T-G--CCTT--AA-tt
gi|11165 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-----------T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TG--T--C--G-GA-T--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-AAA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--t
gi|11166 : AACT-C-T-T---T-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GAA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--AT--T--G--G-GA-G--A-T---A-GT--ATATTTTTTTA---A-ATATA--A------T-TT--------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-T-T-G-CCCTT--AA-
gi|11167 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------A-T--CA--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TA-T-A-CAC-T--G----C------G---T-A-T-G-ACTTT--AA-ttga
gi|11168 : AACT---T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A---------T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-T--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--GC-----T-CCT-----G-T---A-A---AGA---------TGTT-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11169 : AACA-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------t
gi|11170 : AACT-C-T-T---C-T--TTA--T----T----A-T-CCA--T----T-GGA-A-------G----CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-A--A-T---C-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-ACTTGTACAATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11171 : AACT-C-T-T---A-C--T-A--T----A----A-T-A-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-T---------------------------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----
gi|11172 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T---A--T----T-GGA-AA------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA----A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---GAA---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C----------T-A-T-G-CC
gi|11173 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-A-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---G-G---A---------A---A-A---A--A------T-AAT-----G-C---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11174 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---G-GAAAA---------A---A-A---A--A------G-ATT-----G-A---T-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-TCCTT--AA-
gi|11175 : AACT-CCT-T---A-T--T---------T----A-T-T-A--CGGGGC-GGACA-------G-T--TT--G-C-A--AATTT--T--T--G-GG-G--A-----A-G---A---------A---A-A---T--G------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TCA-CAT-T--GA---C------GAT-T-A-T-G-CCCTT--AA-t
gi|11176 : AAGT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GAA-A-------G-T--AT--T-C-G--C--TG--G--T--G-GA-G--A---------------------A---A-A---A--A------T---------------G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------T---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-t
gi|11177 : ACT-C-T-T---A-T--T-AA-T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---T-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-AG--A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11178 : ACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------TAATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CATAT--G----C------G---T-A-T-G-TCCTTG-AA-AG-C-------AC------TG---AT----GCTAT----TCTA
gi|11179 : ACT-C-T-T---A-T--T-GAGT----A----A-T-C---------T-GGA-A---------T--CT--TAC-A--A--TTGTT--T--G-GA-G----T---A-----A---------G---A-A---T--A------T-TTTTTG--G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G-----------G---T-A-T-G-CCC-T--AA-AT-G-------AA-------T---ATG-ggtggatgccc
gi|11180 : ACT-C-T-T---A-T--T----T----T----A-T-CTA--T----G-TGA-A-------G-T--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G-------------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-ATT-T--G----C------G---T-A-T-G-TTTTT--AA-
gi|11181 : ACT-CAT-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGAGA-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---G-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-TCG-CCTT
gi|11182 : ACT---T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T------GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--TT-G-GA-G--A-TT--A-G---A---------A---A-A---C--A------TATTT-----G-T---G-G---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11183 : ACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----AAT-C-AA-TA---T-GGA-A---------T--CT--T-C-ATAG--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-AG--A--A------T-TTT-----GGT---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCTTT--actagaaacgttagaaactattttcatttgatatcaatgtaaatgtctgtatgatgtttaagaataattgtgtggtt
gi|11184 : CT-C-T-T---A-T--A-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-G-T-G-CCCTT--ggttatatattcaaggtcatatacgatacccaaggatcaatatcgatatct
gi|11185 : CT-C-T-T---A-T--T----C----T----A-T-C-AAAT----A-GGA-A-------G-T--TC--T-C-A--AA-TT--T--T--G-AA-G--AAT---A-G---A---------A---A-A---A--AAAAA--T---------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---TAA-T-G-CC---------T-T-------AA------TT---ATG-
gi|11186 : T-C-T-TTA-A-C--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------A-ATT-----G-T---GAA---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--catttatatacaattcttcatag
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gi|11138 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----------------------------A--ATTTTTTT-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CAC-----A-ATCT-------AA-------T---GTG------AA----TCTACA
gi|11139 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---C--A------A-TTT-----G-C---C-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-Aata
gi|11140 : AACT-C-T-TTGTA-T--T-A--TGTTAT----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CTGAT-C-A--AA-TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-T-------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-ACT-T--G----C------GT--T-A-T-G-CCCT
gi|11141 : AACT-C-T-T---A-T--T----T----A----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TA--A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A---G-CCCTT--AA-AT-T-------
gi|11142 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--GCGTAC------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-tgaagaatttgtaaataacc
gi|11143 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-G-------A-T--CT----C-A--A--TT--TATT--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---ATA---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11144 : AACT-C-T-T---A-T--A-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------ATA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-TAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-t
gi|11145 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------C-T--CT--TTC-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---A---------A---A-A---A--A------T-T-------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-ct
gi|11146 : AGCT-C-A-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----G-AGA-A-------C-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--T-GA-G--A-T---AAG---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG---A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--TA-A
gi|11147 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-G-A-A-------G-TTACT--TAC-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A---------T-TTT-----G-T---G-AGAAA-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11148 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----TTA--A-TTC-A--T----T-GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--T--G-G--G--A-T---A-----A---------A---A-A---A--A------C-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11149 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--A--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11150 : AACT-A-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-T---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CTT-A--A----G------G---T-A-T-G-
gi|11151 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-CGA--T----T-TGA-A-------G-T--CT--T-C-AT-A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--A------T-T-------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-TCCTTGAAA-AT-C-------AA------TTCCAATG-A-
gi|11152 : AACA-T-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----C-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---C--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11153 : AACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA---------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11154 : AACT-C-T-T---T-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT-------------------------------------------------------------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11155 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-ATTCCGTCG-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-C---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----CATAATTA---T-A-T-G-CCCTT-----------------A------TT---ATA-A-GTTA
gi|11156 : AGCT-C-T-T---A-T--TTAC-T----T----A-T---A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G-----------------A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TGA-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCATT--AA-t
gi|11157 : AATT-C-T-T---C-T--T-A--T----T----A-T-C-A--A----T-GGA-A---------T--AT--T-C-A--A--TA--T--T--G-G--G--A-T---A-G---A---------A---A-AC--A--A------G-TTT-----G-T---G-A---C-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTC--TA-AT-tatg
gi|11158 : AACTTC-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--TCT--T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--A-GA-G--A-T---A-GCA-A---------A---A-A---A--A----------T-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-CCCTT--
gi|11159 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------T-T--AT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A---------AT-----G-T---G-A---A-A---------TA-A-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11160 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--G----T----A-T---A--T----T-G-A-A-------G-T--CT----C-A--A--TT--TA-T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A---------------T-TTTTTTTGG-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T---T-GACCCT
gi|11161 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--A----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G----T---A-G---A---------A---G-A---CTTT------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-
gi|11162 : AACT-C-A-T---A-T--T-A--T----C------T-C-A--T----T-G-A-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------ATG-A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-C---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-CT-T-------A
gi|11163 : AACTAC-T-T---A-T--C-A--T---------A-T-C-A--TA---T-GGA-AT------G-TT-CT--T-C-A-----TT--T--T--GCGACG--A-T---A-G---A---------A---A-C---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CTCTT--AA-tt
gi|11164 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TTA-T--T--G-GA-GA-A-T---A-G---A---------A---A-A---A------------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T---CAT-T--G----C------G---TAA-T-G--CCTT--AA-tt
gi|11165 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-----------T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TG--T--C--G-GA-T--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-AAA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--t
gi|11166 : AACT-C-T-T---T-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GAA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--AT--T--G--G-GA-G--A-T---A-GT--ATATTTTTTTA---A-ATATA--A------T-TT--------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-T-T-G-CCCTT--AA-
gi|11167 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------A-T--CA--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TA-T-A-CAC-T--G----C------G---T-A-T-G-ACTTT--AA-ttga
gi|11168 : AACT---T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A---------T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-T--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--GC-----T-CCT-----G-T---A-A---AGA---------TGTT-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11169 : AACA-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------t
gi|11170 : AACT-C-T-T---C-T--TTA--T----T----A-T-CCA--T----T-GGA-A-------G----CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-A--A-T---C-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-ACTTGTACAATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11171 : AACT-C-T-T---A-C--T-A--T----A----A-T-A-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-T---------------------------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----
gi|11172 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T---A--T----T-GGA-AA------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA----A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---GAA---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C----------T-A-T-G-CC
gi|11173 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-A-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---G-G---A---------A---A-A---A--A------T-AAT-----G-C---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11174 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---G-GAAAA---------A---A-A---A--A------G-ATT-----G-A---T-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-TCCTT--AA-
gi|11175 : AACT-CCT-T---A-T--T---------T----A-T-T-A--CGGGGC-GGACA-------G-T--TT--G-C-A--AATTT--T--T--G-GG-G--A-----A-G---A---------A---A-A---T--G------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TCA-CAT-T--GA---C------GAT-T-A-T-G-CCCTT--AA-t
gi|11176 : AAGT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GAA-A-------G-T--AT--T-C-G--C--TG--G--T--G-GA-G--A---------------------A---A-A---A--A------T---------------G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------T---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-t
gi|11177 : ACT-C-T-T---A-T--T-AA-T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---T-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-AG--A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11178 : ACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------TAATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CATAT--G----C------G---T-A-T-G-TCCTTG-AA-AG-C-------AC------TG---AT----GCTAT----TCTA
gi|11179 : ACT-C-T-T---A-T--T-GAGT----A----A-T-C---------T-GGA-A---------T--CT--TAC-A--A--TTGTT--T--G-GA-G----T---A-----A---------G---A-A---T--A------T-TTTTTG--G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G-----------G---T-A-T-G-CCC-T--AA-AT-G-------AA-------T---ATG-ggtggatgccc
gi|11180 : ACT-C-T-T---A-T--T----T----T----A-T-CTA--T----G-TGA-A-------G-T--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G-------------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-ATT-T--G----C------G---T-A-T-G-TTTTT--AA-
gi|11181 : ACT-CAT-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGAGA-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---G-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-TCG-CCTT
gi|11182 : ACT---T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T------GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--TT-G-GA-G--A-TT--A-G---A---------A---A-A---C--A------TATTT-----G-T---G-G---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11183 : ACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----AAT-C-AA-TA---T-GGA-A---------T--CT--T-C-ATAG--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-AG--A--A------T-TTT-----GGT---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCTTT--actagaaacgttagaaactattttcatttgatatcaatgtaaatgtctgtatgatgtttaagaataattgtgtggtt
gi|11184 : CT-C-T-T---A-T--A-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-G-T-G-CCCTT--ggttatatattcaaggtcatatacgatacccaaggatcaatatcgatatct
gi|11185 : CT-C-T-T---A-T--T----C----T----A-T-C-AAAT----A-GGA-A-------G-T--TC--T-C-A--AA-TT--T--T--G-AA-G--AAT---A-G---A---------A---A-A---A--AAAAA--T---------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---TAA-T-G-CC---------T-T-------AA------TT---ATG-
gi|11186 : T-C-T-TTA-A-C--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------A-ATT-----G-T---GAA---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--catttatatacaattcttcatag
gi|11187 : T-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------GCT--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-C---A---------A---A-A---A--A------T-TT------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----CG-----G---G-A-T-G-CCCTT--
gi|11188 : T-T-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--TGTTAT-AGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TA--T--T--G-GA-G--A-----A-G---A---------A---A-A----------------TT-----G-TA--G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-
gi|11189 : -C-T-T---A-T--T-A--T----TTT--A-T-C-A--T----T-GGA-G-------T-C--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--C------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-ACCAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11190 : -C-T-T---AAT--C-A--T----G----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--TCC-A--A--TT--T--T--G-GA-GA-A-T---A-G-----------------A-A---A--A------T-TTT-----T-T---G-T---A-A---------CT-T-A-CAT-T--G----C------G---T-C-T-G-t
gi|11191 : -T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G---------------------------------------A--A------T-TTT-----G-TTGTG-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11192 : -T-T---A-T--T-G--T----TGTGAA-T-C-A--T----T-GTAGA-------G-T--CT--T-C-AC-A--TT--T--TT-G-GA-G--A-T---A-AGA-A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CATGT--G----C------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11193 : -T---A-T--T-A--T----T--------C-A--T----T-GGA-A-------C-T--CT--T-C-A--A--TT--T--TTTG-GA-GT-A-T---A-G---A---------A---A-A---A---------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG---A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11194 : -T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--C----T-GGA-A-------G-T--CT--T-T-C--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CTCTT--
gi|11195 : ----T----A-A-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--C-------A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTTT----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---C-A-T-G-CCCTT--
gi|11196 : ----A-T-C-A--T----TTGGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--AT--T--G--T-TA-A--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--A--------TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TAA-CAT-TGAG----C------GATAT-A-T-G-CCCTT--t
gi|11197 : -GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-AT------G-T---G-A---A-A---------GG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11198 : -A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CTCTT--AA-A
gi|11199 : -------G-T--TT--T-C-T--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-TGTAA---AA------TTC--ATG-A-
gi|11200 : -A--A--TT--T--T--G-GC-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTG-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--T----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-T-------GAATT---TT---ATG-
blockSeqs : TGT AG GTGA G AA GGGG C TTCCGTC TA T TA AT GT AT TT GT TGA T AAA TATTTTTTT TTT AATTTTTTT TTTTG TGT A GAA CTTGTACAA G GA CGTA ATAATT ATA GA G CTCTCAC TATTTG CCA T T AAATCG
blockSeqs : TA C TA C A GTTA G T T A T AT A A T A TGA T CA . TG AAAAAAT TTG G A G . C G A G AT G C GTAA ATT C . . AA
blockSeqs : . A TT T . CT G A . A C AT . . T A A G GA . . AATTTT T A A . . A G . . T . . . . . . . GA
blockSeqs : . . T . . A . . . C . T . . . T A A T . . TATAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . AA
blockSeqs : . . T . . A . . . . . A . . . . T . A . . ACTTT . . . . . . . . . . . . . . . . . AT
blockSeqs : . . T . . . . . . . . A . . . . . . A . . CTTTT . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGCT . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAAT . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-T-------AA------TT---ATG-A-GCTAA----TCTATA
finalCons : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-AAAT------------TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-T-------AA------TT---ATG-A-GCTAA----TCTATA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11201 ): TAGCTCTCAATAGAATTAATGTCTGGAGGACAATAAATAGATTGAGTGTGTGACCTTTGTTGAACTTCATTCATTGCTACATAATAATGTTGCAAAGTGATATGAAATAGCGCCAATACATTGTTGAGTCATCGCATGTGCTGTGTCGGCAGTATTTAAAAAATATGATGCAT
Unaligned ( gi|11202 ): ATAGAATTATTGTCTGGAGGACAATATATATATTAGGCGTGTGACTTTTGTTCGGCGGTACGTAACAATATTGCAAAGTGACATAAAATAGGCCAATACATTGTTGCGTCATCGCATGCGCTGTGTCGG
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Reference ( family-238 ) : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-T-------AA------TT---ATG-A-GCTAA----TCTATA
gi|11107 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--AA-TT--T--T--G-GA----A-T---A-G---A---------A---A-T---T---------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--TA-AT-T-------AA------TT---ATG-A-GCTAA----TCTATA
gi|11108 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-G-A-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA----A-T---ATG---A---------A---T-T-------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--TA-AT-T-------AA------TT---ATG-A-GCTAA----TCTATAgataccttcaatagaattaatctctgcaaggacaatatatagactgagtgtggttttagccctttgttgagcttcattcggagttaacgtaacaaatttgaaataaatagcgctgaaacattgatacgtcatcgtatgcactgtggtcgcgaagcatttcaaaactcgatgcattttaaacaagacaa
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gi|11111 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA----A-T---ATG-----------------A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT---A-AT-T-------AA------TT---ATG-A-GCT-A----TCTATAgatacccttcaatagaattatctcgcaaggacaataatatagactgaagtgtgtttagccttttgttgagcttcattcgggtttacgtaacaaattgaaataaaatagcgctgaaacattgatacgtcatcgtatgcactgtggtcgcgaagcatttcaaaactcgatgcattttaacaagacaa
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gi|11113 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-G--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
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gi|11117 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--AATTT--T--T--G-GA-AGTA-T---A-G---A---------A---A-A---A--CTT----T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-C-T-T--G----C------G---T-A-TGG-CCCTT--AA-AT-
gi|11118 : AACC-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-CGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--acaggatacatatagctctgtaga
gi|11119 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11120 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGC-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AC-T-------
gi|11121 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T---------A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-A--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CTCTT--AA-A
gi|11122 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--atgtgtccataggacctgaatgtgaaatcactgc
gi|11123 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11124 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TA--A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-G---G-A---A-A---------TG-T-T-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11125 : AACT-C-T-T---A-TATT-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--C------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11126 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A---------AA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-CC-T--------A------TT---GTG-t
gi|11127 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------TTT-----G-TG--G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11128 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AATATGC-------AA------TT---A
gi|11129 : AGCT-T-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-C--CT--T-T-T--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------ATTT----------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-C-------AA------
gi|11130 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-G---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11131 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----A----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---CTT---T--A------T-TTT-------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G-----A-T-G-CCC--------T-T-------AA------TT---GCG-ATGCTAAATCGTCTATA
gi|11132 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TTGAA-A---A---------A---A-A---A--A---------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11133 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--AT-TT--T--T--G-GA-G--A-TTGAA-A---A---------A---A-A---A--A---------TT-----G-T---G-G---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11134 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TGT-------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11135 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GCA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--GT--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---A---------T---A-A---A--A---------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-At
gi|11136 : AACT-C-T-T---A-T------------T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--C-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AC-T-------
gi|11137 : AACT-C-T-A---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-G--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11138 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T-----------------------------A--ATTTTTTT-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CAC-----A-ATCT-------AA-------T---GTG------AA----TCTACA
gi|11139 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---C--A------A-TTT-----G-C---C-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-Aata
gi|11140 : AACT-C-T-TTGTA-T--T-A--TGTTAT----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CTGAT-C-A--AA-TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-T-------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-ACT-T--G----C------GT--T-A-T-G-CCCT
gi|11141 : AACT-C-T-T---A-T--T----T----A----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-TA--A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A---G-CCCTT--AA-AT-T-------
gi|11142 : AACA-C-T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--GCGTAC------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-tgaagaatttgtaaataacc
gi|11143 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-G-------A-T--CT----C-A--A--TT--TATT--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---ATA---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11144 : AACT-C-T-T---A-T--A-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A--------ATA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-TAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCTTT--AA-t
gi|11145 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------C-T--CT--TTC-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-A---A---------A---A-A---A--A------T-T-------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-ct
gi|11146 : AGCT-C-A-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----G-AGA-A-------C-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--T-GA-G--A-T---AAG---A---------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG---A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--TA-A
gi|11147 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-G-A-A-------G-TTACT--TAC-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A---------T-TTT-----G-T---G-AGAAA-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11148 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----TTA--A-TTC-A--T----T-GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--T--G-G--G--A-T---A-----A---------A---A-A---A--A------C-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11149 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--A--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11150 : AACT-A-T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-T---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CTT-A--A----G------G---T-A-T-G-
gi|11151 : AACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-CGA--T----T-TGA-A-------G-T--CT--T-C-AT-A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--A------T-T-------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-TCCTTGAAA-AT-C-------AA------TTCCAATG-A-
gi|11152 : AACA-T-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----C-GGA-A-------G-T--TT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---C--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11153 : AACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA---------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11154 : AACT-C-T-T---T-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT-------------------------------------------------------------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11155 : AACT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-ATTCCGTCG-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-C---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-C-A-CAT-T--G----CATAATTA---T-A-T-G-CCCTT-----------------A------TT---ATA-A-GTTA
gi|11156 : AGCT-C-T-T---A-T--TTAC-T----T----A-T---A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G-----------------A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TGA-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCATT--AA-t
gi|11157 : AATT-C-T-T---C-T--T-A--T----T----A-T-C-A--A----T-GGA-A---------T--AT--T-C-A--A--TA--T--T--G-G--G--A-T---A-G---A---------A---A-AC--A--A------G-TTT-----G-T---G-A---C-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTC--TA-AT-tatg
gi|11158 : AACTTC-T-T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--TCT--T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--A-GA-G--A-T---A-GCA-A---------A---A-A---A--A----------T-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-ATT-G-CCCTT--
gi|11159 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------T-T--AT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A---------AT-----G-T---G-A---A-A---------TA-A-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11160 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--G----T----A-T---A--T----T-G-A-A-------G-T--CT----C-A--A--TT--TA-T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A---------------T-TTTTTTTGG-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T---T-GACCCT
gi|11161 : AACT-C-T-T---A-T--T-G--A----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G----T---A-G---A---------A---G-A---CTTT------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-
gi|11162 : AACT-C-A-T---A-T--T-A--T----C------T-C-A--T----T-G-A-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------ATG-A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-C---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-CT-T-------A
gi|11163 : AACTAC-T-T---A-T--C-A--T---------A-T-C-A--TA---T-GGA-AT------G-TT-CT--T-C-A-----TT--T--T--GCGACG--A-T---A-G---A---------A---A-C---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CTCTT--AA-tt
gi|11164 : AACT-C-T-T---A-T--T-T--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TTA-T--T--G-GA-GA-A-T---A-G---A---------A---A-A---A------------TT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T---CAT-T--G----C------G---TAA-T-G--CCTT--AA-tt
gi|11165 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-----------T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-C--A--TG--T--C--G-GA-T--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-AAA-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--t
gi|11166 : AACT-C-T-T---T-A--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GAA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--AT--T--G--G-GA-G--A-T---A-GT--ATATTTTTTTA---A-ATATA--A------T-TT--------T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----T------G---T-T-T-G-CCCTT--AA-
gi|11167 : AACT-C-C-T---A-T--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-AGA-A-------A-T--CA--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-A---------TA-T-A-CAC-T--G----C------G---T-A-T-G-ACTTT--AA-ttga
gi|11168 : AACT---T-T---A-T--C-A--T----T----G-T-C-A--T----T-GGA-A---------T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-T--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--GC-----T-CCT-----G-T---A-A---AGA---------TGTT-A-CAT-T--G----T------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11169 : AACA-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------t
gi|11170 : AACT-C-T-T---C-T--TTA--T----T----A-T-CCA--T----T-GGA-A-------G----CT--T-C-A--A--TT--T-----G-GA-A--A-T---C-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-A---A-ACTTGTACAATG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--
gi|11171 : AACT-C-T-T---A-C--T-A--T----A----A-T-A-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---A-T---------------------------------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----
gi|11172 : AACT-C-T-A---A-T--C-A--T----T----A-T---A--T----T-GGA-AA------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA----A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---GAA---A-A---------TG-T-A-CA--T--G----C----------T-A-T-G-CC
gi|11173 : AACT-C-T-T---A-T--T-A--T----T----A-A-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G-GA-G--A-T---G-G---A---------A---A-A---A--A------T-AAT-----G-C---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-A--G----C------G---T-A-T-G-
gi|11174 : AACT-C-T-T---A-A--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TA--T--T--G-GA-G--A-T---G-GAAAA---------A---A-A---A--A------G-ATT-----G-A---T-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-TCCTT--AA-
gi|11175 : AACT-CCT-T---A-T--T---------T----A-T-T-A--CGGGGC-GGACA-------G-T--TT--G-C-A--AATTT--T--T--G-GG-G--A-----A-G---A---------A---A-A---T--G------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TCA-CAT-T--GA---C------GAT-T-A-T-G-CCCTT--AA-t
gi|11176 : AAGT-C-G-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GAA-A-------G-T--AT--T-C-G--C--TG--G--T--G-GA-G--A---------------------A---A-A---A--A------T---------------G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------T---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-t
gi|11177 : ACT-C-T-T---A-T--T-AA-T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-T-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---T-G---A---------A---A-A---A--A------A-ATT-----G-T---G-AG--A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-A-CCCTT--
gi|11178 : ACT-C-T-T---A-T--C-A--T----TT---A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------TAATT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CATAT--G----C------G---T-A-T-G-TCCTTG-AA-AG-C-------AC------TG---AT----GCTAT----TCTA
gi|11179 : ACT-C-T-T---A-T--T-GAGT----A----A-T-C---------T-GGA-A---------T--CT--TAC-A--A--TTGTT--T--G-GA-G----T---A-----A---------G---A-A---T--A------T-TTTTTG--G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G-----------G---T-A-T-G-CCC-T--AA-AT-G-------AA-------T---ATG-ggtggatgccc
gi|11180 : ACT-C-T-T---A-T--T----T----T----A-T-CTA--T----G-TGA-A-------G-T--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G-------------A---A-A---A--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-ATT-T--G----C------G---T-A-T-G-TTTTT--AA-
gi|11181 : ACT-CAT-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGAGA-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---G-A---------TG-T-A-CA--T--G----C------G---T-A-TCG-CCTT
gi|11182 : ACT---T-T---A-T--C-A--T----T----A-T-C-A--T------GGA-A-------A-T---T--T-C-A--A--TT--T--TT-G-GA-G--A-TT--A-G---A---------A---A-A---C--A------TATTT-----G-T---G-G---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11183 : ACT-C-TAC---A-T--C-A--T----T----AAT-C-AA-TA---T-GGA-A---------T--CT--T-C-ATAG--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-AG--A--A------T-TTT-----GGT---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------A---T-A-T-G-CCTTT--actagaaacgttagaaactattttcatttgatatcaatgtaaatgtctgtatgatgtttaagaataattgtgtggtt
gi|11184 : CT-C-T-T---A-T--A-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-GA--A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-G-T-G-CCCTT--ggttatatattcaaggtcatatacgatacccaaggatcaatatcgatatct
gi|11185 : CT-C-T-T---A-T--T----C----T----A-T-C-AAAT----A-GGA-A-------G-T--TC--T-C-A--AA-TT--T--T--G-AA-G--AAT---A-G---A---------A---A-A---A--AAAAA--T---------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-TG-G----C------G---TAA-T-G-CC---------T-T-------AA------TT---ATG-
gi|11186 : T-C-T-TTA-A-C--T-A--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--T------A-ATT-----G-T---GAA---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-TCCTT--catttatatacaattcttcatag
gi|11187 : T-C-T-T---A-T--T-T--T----T----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------GCT--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-C---A---------A---A-A---A--A------T-TT------G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----CG-----G---G-A-T-G-CCCTT--
gi|11188 : T-T-T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--TGTTAT-AGA-A-------A-T--CT--T-C-A--A--TA--T--T--G-GA-G--A-----A-G---A---------A---A-A----------------TT-----G-TA--G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-
gi|11189 : -C-T-T---A-T--T-A--T----TTT--A-T-C-A--T----T-GGA-G-------T-C--CT--T-C-A--G--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--C------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-ACCAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-
gi|11190 : -C-T-T---AAT--C-A--T----G----A-T-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--TCC-A--A--TT--T--T--G-GA-GA-A-T---A-G-----------------A-A---A--A------T-TTT-----T-T---G-T---A-A---------CT-T-A-CAT-T--G----C------G---T-C-T-G-t
gi|11191 : -T-T---A-T--T-A--T----T----A-T-T-A--T----T-GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TG--T--T--G---------------------------------------A--A------T-TTT-----G-TTGTG-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11192 : -T-T---A-T--T-G--T----TGTGAA-T-C-A--T----T-GTAGA-------G-T--CT--T-C-AC-A--TT--T--TT-G-GA-G--A-T---A-AGA-A---------A---A-A---A--A------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CATGT--G----C------G---T-A-T-G-CCCT
gi|11193 : -T---A-T--T-A--T----T--------C-A--T----T-GGA-A-------C-T--CT--T-C-A--A--TT--T--TTTG-GA-GT-A-T---A-G---A---------A---A-A---A---------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG---A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11194 : -T---A-T--T-A--T----C----A-T-C-A--C----T-GGA-A-------G-T--CT--T-T-C--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CTCTT--
gi|11195 : ----T----A-A-C-A--T----T-GGA-A-------G-T--C-------A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTTT----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---C-A-T-G-CCCTT--
gi|11196 : ----A-T-C-A--T----TTGGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--AT--T--G--T-TA-A--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--A--------TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-TAA-CAT-TGAG----C------GATAT-A-T-G-CCCTT--t
gi|11197 : -GGA-A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-AA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-AT------G-T---G-A---A-A---------GG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-A
gi|11198 : -A-------G-T--CT--T-C-A--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------A-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CTCTT--AA-A
gi|11199 : -------G-T--TT--T-C-T--A--TT--T--T--G-GA-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---T--T------T-TTT-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--G----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-TGTAA---AA------TTC--ATG-A-
gi|11200 : -A--A--TT--T--T--G-GC-G--A-T---A-G---A---------A---A-A---A--A------T-TTG-----G-T---G-A---A-A---------TG-T-A-CAT-T--T----C------G---T-A-T-G-CCCTT--AA-AT-T-------GAATT---TT---ATG-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11201 ): TAGCTCTCAATAGAATTAATGTCTGGAGGACAATAAATAGATTGAGTGTGTGACCTTTGTTGAACTTCATTCATTGCTACATAATAATGTTGCAAAGTGATATGAAATAGCGCCAATACATTGTTGAGTCATCGCATGTGCTGTGTCGGCAGTATTTAAAAAATATGATGCAT
Unaligned ( gi|11202 ): ATAGAATTATTGTCTGGAGGACAATATATATATTAGGCGTGTGACTTTTGTTCGGCGGTACGTAACAATATTGCAAAGTGACATAAAATAGGCCAATACATTGTTGCGTCATCGCATGCGCTGTGTCGG