lowQualScore : 0 5 00 0 0 0 11111111 0000 0 0 000 0 0 00 11111 11 0 0 0 111111 111111 1 3 0 1111111 11 444444
lowQualScore : . . .. . . . ........ .... . . ... . . .. ..... .. . . . ...... ...... . . . ....... .. ......
lowQualScore : 4 6 66 4 4 4 55555555 9999 4 4 777 4 4 66 00000 00 4 4 4 666666 222222 2 5 4 7777777 44 888888
consensus : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAA
Reference ( gi|50313 ) : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50352 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------TC--A------
gi|50361 : TTCAT-CAGATAATCATC--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-AGAGA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50337 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAgg
gi|50374 : TTCAT-TAGAGGATCATC--AAT-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-CT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAagtca
gi|50367 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----CTG-TT-GCCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----GGCCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50320 : TTCAT-CAGACAATCATC--AAA-CCTA-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAggtca
gi|50338 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--G------AGGGTCAAaggtcaa
gi|50387 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------CA-AAG-G-------TC---------AAGGTCAagtca
gi|50401 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TT-AAGTG-------TC--A------AAGATCA
gi|50376 : TTCAT-CAGAAAATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----TTG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-ATG-G-------TC--A------AAGGTC
gi|50325 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAAACTTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-TCCC---AT-GGAAA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50340 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------ggtca
gi|50331 : TTCAT-CGTCAAATCATC--AAA-GCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATA-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------TC--A------AAGGTCAAaaa
gi|50330 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCCT-C-TAC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGT-G-------TC--A------AAGGTCAAggtca
gi|50477 : TTCAT-CAAGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-ATGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TT-AAG-G-------TC--A------AAGggtca
gi|50368 : TTCAT-TAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AC-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G---TT------T------TT-AAG-G-------TCA-A------AAGGTCAA
gi|50314 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--AACACTCAAGGTCAgtca
gi|50372 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATA-TT-GCCC---TT-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-G-A-TT------T------TCAAGG-G-------AC--A------AAGGTCAA
gi|50429 : TTCAT-CAAAGGATCATC--GGA-CCTT-C-CAA--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GAAGA-GAGG--ATA-----AACCT--TATT-G-A-TT------T------TCAAGG-G-------TC--A------AAGGTCAAggtca
gi|50357 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----CTG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------AC--A------ACGGTTAAggtca
gi|50343 : TTCAA-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GACC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAA-G-------TC--A------AAGGTCAAaggtcaa
gi|50322 : TTCAT-CGGATAATCATC--AAA-CCTT-G-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GTAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------ATGGTCAAggtca
gi|50381 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTC-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-AAGG--ATG-----AATCC--TCCT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAAggtca
gi|50412 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--C------AAGGTCA
gi|50411 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--C------AAGGTCA
gi|50332 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TAC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGT-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50329 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TAC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGT-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50394 : TTCAT-CAGAGAATCAGC--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGC-GGGG--ATT-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCGAggtca
gi|50446 : TTCAT-TAGAAAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-TGAAA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-G-T-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAggtca
gi|50375 : TTCAT-TGGAGGATCATC--AAA-CTTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC---------AAGGTCA
gi|50413 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCCT-C-TGC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GTGG--ATG-----AGCCC--TATT-T-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGATCAA
gi|50406 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-G--GA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-G-A-TT------A------TC-AAG-G-------TT--A------AAGGTCAggtca
gi|50359 : TTCAT-CAGGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCAC---AT-GGATA-GAGG--ATG-----AACCC--TATC-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--AGAGTCAAAGGTCAA
gi|50414 : TTAAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-C-CAC--------AG----AT---T-GACC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50326 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AA-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-G-A-TT------T------CC-ATG-G-------TC--A------ATGGTGAAggtca
gi|50317 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-G-A-TT------A------TC-AAG-G-------TC--AACACTCAAGGTCAaggtcaa
gi|50398 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAA
gi|50358 : TTCAT-CGCAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----CTG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATT-----GACCA--TACT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAatgtcaa
gi|50461 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AG----ATG-TT-TTCC---GT-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-T-A-TT------T------TC-AAG-A-------TC--A------AAGGTCA
gi|50403 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAT-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ACG-----AACCC--TGTT-T-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAtggtca
gi|50478 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCT---AT-GGAGA-GTGG--ATG-----AATCT--GATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCGAatgtcaa
gi|50456 : TTCAT-CAGA-AATCATC--AAA-CCTTTC-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCCTATATT-G-T-TT------T------CC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCA
gi|50333 : TTCAG-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TAC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAGA-CAGG--ACG-----AGCCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50377 : TTCAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCG---GT-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-A-------TG--A------AAGGTCggtca
gi|50384 : TTCAT-CCGCGAATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ACG-T----CC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAAtaggtca
gi|50315 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-G-A-TT------A------TC-AAG-G-------TC--AACACTCAAGGTCAgatca
gi|50353 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----GTG-TT-GCTC---AT-GGACA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC---------AAGGCCA
gi|50486 : TTCAT-CAAAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAAATGTTGAA----ATG-TT-GCCCAGGAT-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGATCAA
gi|50430 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-G-CT---AT--GAGA-GAGG--ATG-----AAACC--TATT-G-A-GT------T------TC-AAG-G-------TT--A------AAGGTCAAagatcaa
gi|50393 : TCCAT-CAGAGTATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATC-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----ATCCT--TGTT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAggtca
gi|50473 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CAG--------AA----ATA-TT-TCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATGAATTTAACCC--TATC-G-A-TT------T------CC-AGG-G-------TC--A------AAGGTTAAaagtca
gi|50442 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-G-ATTT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAggtca
gi|50426 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-T-------TC--A------AGGGTCAAatgtcaa
gi|50390 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA-----TG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-G-C-TG------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGATCAaagtcaa
gi|50499 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CATT-C-CAC--------AACAACATG-TT-GCCC---ATTGGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TTC-----T------TC-AAG-G-------TC--A------ACGGTCAgaggtcaa
gi|50378 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTA-T-AAC--------AA----CTG-CT-GCCC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----GACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAA
gi|50476 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-G--GA-GAGG--GTA-----AACCC--TGTTGG-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCaggtcaa
gi|50475 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-C-CAC--------AG----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-A-A-TT------T------TC-A
gi|50434 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CAT--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-A-A-TT------T------TT-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAA
gi|50460 : TTCCT-CAGATGATTATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCTC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TAAT-A-G-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAaagtcaa
gi|50428 : TTCAT-CAGAGGATAACT--AAA-CCTT-C-CAC--------TA----ATG-TT-ACCT---AT-AGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------TC--A------AAAGTCAAaaatca
gi|50488 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-T-CAT--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TGTT-G-A-TT------T------TCAAGG-G-------TC--A------AAAGTCAAggtta
gi|50385 : TTCAT-AAGAGAATCGTT--AAA-CCTC-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----AATCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC---------AAGGTGAAggtca
gi|50355 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGT--TTG-----AAACC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TA--A------GAGATCAAaggtc
gi|50379 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GAA-AG------G------TA-AGG-G-------CC--A------AAGATCAAaagtcaa
gi|50459 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCAT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCA---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGT--TATT-G-A-AT------T------TC-AAG-A-------CC--A------AAGGTCAA
gi|50470 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-AAGT--ATG-----AAACC--TACT-G-A-TT------T------TT-AAG-GTCATTGATC--A------AAGGTCAAtggtcaa
gi|50447 : TTAAT-CAGAAGATCATC--AAA-CATT-C-CAT--------AA----ATG-TT-GTTC---AT-TGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--CATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAA
gi|50382 : TTCAT-CAGAGAATAATC--AAA-CTTT-T-CAC--------AA----ACG-TT-GCCC---AT-GGATA-GAG----TA-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------GAGGTCAaggttaa
gi|50356 : TTCAT-CCGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCA--TTTT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAAGTCAA
gi|50334 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GACC---AT-GGATA-GAGG--ATT-----AACCCT-TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TTCAA------AAAGTCAAggtca
gi|50397 : TTTAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CAC--------AC----ATG-TT-TCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-G-A-TTTTCAAGT------TC-AGG-GT------TC--A------AAGGTCAAggtca
gi|50316 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCT-----AC--------AA----ATA-TT-GAAC---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----AACTG--TATT-G-A-TT------T------TC-AGG-G-------TC--G------AAGGTCAA
gi|50449 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-GGTT-A-CAC--------AA----ATT-TT-GCCC---AT-GGAGA-GTGA--ATG-----AACCG--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------GAGGTCAggtca
gi|50497 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAG-CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAAA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-G-A-TT------G------CC-AAG-G-------Tgggtca
gi|50492 : TTCAT-CAGAAGATCATC--AAA-TCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GTCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TACA-G-A-TA------T------TC-AAG-G-------TT--A------AGGGTCGA
gi|50494 : TCCAT-CAAGGG-TCATC--AAA-CTGT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---GT-GGAGA-GAGG--AAG-----AACTC--TATT-G-A--T------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAAaggtaaa
gi|50507 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ATA-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGAATATG-----AACCC--AATC-G-C-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AA-GTCAAggtca
gi|50362 : TTCAT-CAGAGAATAATG--AAA-TCTT-C-CAC--------AA----ATG-TG-GCCC---AT-GGAAA-GGGG--ATG-----GACTC--TATT-A-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCttaggtca
gi|50380 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGC-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-G-A-------------------AAG-G-------TC--A------AGGGGCAAtaaagtcaa
gi|50440 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTGT-T-CAC--------A------CG-TT-CCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-ACG-G-------TT--A------AAGGTCAAagatcaa
gi|50500 : TTCAT-CACAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CAC--------TC----ATG-TT-TCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TACT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------GGGTTCAAggtca
gi|50503 : TTCAT-CATGGAAACATC--AAA-CCTT-T-TAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GTGG--GTG-----AACTC--TATT-G-A-TA------T------TC-AAG-G-------TTA-A------AAGGTGAAaggtgaa
gi|50427 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-AAC--------A------CG-CT-TCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------GGGTTCAAggtca
gi|50386 : TTCAC-CTGAGAATAATC--AAA-CCTT-T-TAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GAATA--AGG---TA-----AACCC--AATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAaggtcaa
gi|50468 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTT-G-TAT--------AC----ATG-TT-TCCC---AT-GGAAA-GAAG--ATG-----TACCC--AATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------GGGTTCAA
gi|50663 : TCAT-CAGAGAATCATC--AA--CCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC---------AAGGTCAaggtcaa
gi|50666 : TCAT-CAAAGAATCATC--AA--CCTT-T-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-G-AGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--C------AAAGTCA
gi|50673 : TCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AG----ATG-TT-TTCC---GT-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-T-A-TT------T------TC-AAG-A-------TC--A------AAGGTCA
gi|50670 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CGC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGG-AAGG--TTG-----AATCC--TATT-G-A-TT------T------TA-AGG-G-------TC--A------AAGTTCAAtggtca
gi|50665 : TCATTCAGAGAATCATTCAAAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATGGTT-GCCC---AT-GAAGAAGAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAggtca
gi|50672 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CAC--------AC----ATG-TT-TCCA---AT-GGAGA-GAGA--ATG-----TACCC--TATT-G-A-TT------TTCCAGGTC-AGG-G-------TC--A------AAGGTCAAaggtc
gi|50667 : TTAT-CAGAGA-TCATC--AA---CTT-CGCAC--------AA----ATG-TT-GCCC---A--GGAGA-GAGA--ATG-----AACTC--TATC-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGGTCAA
gi|50689 : CAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----ATC-CTCATCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-A-------TC--A------AAGGTCAAggtca
gi|50701 : AT-CAGAGAATTGTC--AAT-CCTC-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-G-A-TT------T------TC-AAT-G-------TC--A------AAGGTCAAggtca
gi|50774 : AGGATCATC--AAT-TCTT-C-CAC--------AA----ATG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAAGTCAAggtta
gi|50773 : gAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CAC--------AA----ACA-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AAGggtca
gi|50794 : gAGAATTATC--AAA-CCTT-C-CAC--------AA----TTG-TT-GCCC---AT-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCA--TATT-G-A-TT------A------TC-AAG-A-------TC--A------AAGGTCAAtaaaggtca
gi|50727 : AGGATCACT--AAA-CCTT-G-CAC--------AA----ATG-TT-ACCT---AT-GGGGA-AAGG--ATG-----AATCC--TAAT-G-A-TT------T------TC-AAG-G-------TC--A------AGGGTCAAggtca
Alignments
lowQualScore : 0 00 0 0 0 0000 0 0 11111111 000 0 0 00 11111 00 0 0 0 111111 0 1111 2222222 0 11 7777777
lowQualScore : . .. . . . .... . . ........ ... . . .. ..... .. . . . ...... . .... ....... . .. .......
lowQualScore : 4 66 4 4 4 9999 4 4 44444444 777 4 4 55 00000 99 4 4 4 111111 8 3333 0000000 4 44 4444444
consensus : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
Reference ( family-23 ) : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50313 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50314 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCA
gi|50315 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCA
gi|50316 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCT-----ACAA----ATA-TT-G--------AACA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACTG--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--G-------AAGGTCAA
gi|50317 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCAggtca
gi|50320 : TTCAT-CAGACAATCATC--AAA-CCTA-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50322 : TTCAT-CGGATAATCATC--AAA-CCTT-G-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GTAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------ATGGTCAAaggtcaa
gi|50325 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAAACTTT-C-CACAA----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50326 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---A-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------CCAT-G----G-------T-C--A-------ATGGTGAAggtca
gi|50329 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaggtcaa
gi|50330 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50331 : TTCAT-CGTCAAATCATC--AAA-GCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATA-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50332 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50333 : TTCAG-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-CAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50334 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CACAA----ATG-TT-G--------ACCA---T-GGATA-GAGG--ATT-----AACCCT-TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-TCAA-------AAAGTCAAggtca
gi|50337 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTCAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50338 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTCAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--G-------AGGGTCAAagtca
gi|50340 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------agtca
gi|50343 : TTCAA-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------ACCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-A----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaaa
gi|50352 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------ggtca
gi|50353 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAA-CCTT-C-CACAA----GTG-TT-G--------CTCA---T-GGACA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGCCA
gi|50355 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGT--TTG-----AAACC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-A--A-------GAGATCAA
gi|50356 : TTCAT-CCGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCA--TTTT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAAaagtcaa
gi|50357 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------A-C--A-------ACGGTTAAggtca
gi|50358 : TTCAT-CGCAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATT-----GACCA--TACT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAaggtcaa
gi|50359 : TTCAT-CAGGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CACA---T-GGATA-GAGG--ATG-----AACCC--TATC-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGAGTCA-AAGGTCAA
gi|50361 : TTCAT-CAGATAATCATC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-AGAGA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50362 : TTCAT-CAGAGAATAATG--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TG-G--------CCCA---T-GGAAA-GGGG--ATG-----GACTC--TATT-AA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCgg
gi|50367 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAtaaagtcaa
gi|50368 : TTCAT-TAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---C-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G--TT-T------TTAA-G----G-------T-CA-A-------AAGGTCAAggtca
gi|50372 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATA-TT-G--------CCCT---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------GAC--A-------AAGGTCAAgtca
gi|50374 : TTCAT-TAGAGGATCATC--AAT-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-CT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAggtca
gi|50375 : TTCAT-TGGAGGATCATC--AAA-CTTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTCA
gi|50376 : TTCAT-CAGAAAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----TTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAT-G----G-------T-C--A-------AAGGTC
gi|50377 : TTCAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCGG---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----A-------T-G--A-------AAGGTC
gi|50378 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTA-T-AACAA----CTG-CT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAtaggtca
gi|50379 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GA-------------AA-G----G-------T----A-------AGGGCCAAaggtcaa
gi|50380 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGC-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GA-------------AA-G----G-------T-C--A-------AGGGGCAAagatcaa
gi|50381 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTC-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-AAGG--ATG-----AATCC--TCCT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAagatcaa
gi|50382 : TTCAT-CAGAGAATAATC--AAA-CTTT-T-CACAA----ACG-TT-G--------CCCA---T-GGATA-GAG----TA-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GAGGTCA
gi|50384 : TTCAT-CCGCGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ACG-T------------CCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50385 : TTCAT-AAGAGAATCGTT--AAA-CCTC-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTGAAgatca
gi|50386 : TTCAC-CTGAGAATAATC--AAA-CCTT-T-TACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GAATA--AGG---TA-----AACCC--AATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAaggtc
gi|50387 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------CAAA-G----G-------T-C----------AAGGTCA
gi|50390 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA-----TG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-GC-TG-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGATCA
gi|50393 : TCCAT-CAGAGTATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATC-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----ATCCT--TGTT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAgaggtcaa
gi|50394 : TTCAT-CAGAGAATCAGC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGC-GGGG--ATT-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCGAaagtca
gi|50397 : TTTAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACAC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-GTTCAGGGT----T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50398 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50401 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TTAA-GT---G-------T-C--A-------AAGATCAatgtcaa
gi|50403 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAT-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AACCC--TGTT-TA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50406 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G--GA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAatgtcaa
gi|50411 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAGGTCA
gi|50412 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAGGTCA
gi|50413 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCCT-C-TGCAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AGCCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGATCAA
gi|50414 : TTAAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-C-CACAG----AT---T-G--------ACCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50426 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----T-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50427 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-AACA------CG-CT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGGGTTCAAAGGTCAAaagtcaa
gi|50428 : TTCAT-CAGAGGATAACT--AAA-CCTT-C-CACTA----ATG-TT-A--------CCTA---T-AGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAA
gi|50429 : TTCAT-CAAAGGATCATC--GGA-CCTT-C-CAAAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GAAGA-GAGG--ATA-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAAGG----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtta
gi|50430 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G---------CTA---T--GAGA-GAGG--ATG-----AAACC--TATT-GA-GT-T------TCAA-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50434 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-AA-TT-T------TTAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50440 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTGT-T-CACA------CG-TT-C--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TATT-GA-TT-T------TCAC-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAAaagtcaa
gi|50442 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GATTT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50446 : TTCAT-TAGAAAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-TGAAA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GT-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAatgtcaa
gi|50447 : TTAAT-CAGAAGATCATC--AAA-CATT-C-CATAA----ATG-TT-G--------TTCA---T-TGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--CATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50449 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-GGTT-A-CACAA----ATT-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGA--ATG-----AACCG--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GAGGTCAaggttaa
gi|50456 : TTCAT-CAGA-AATCATC--AAA-CCTTTC-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCCTATATT-GT-TT-T------CCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAgggtca
gi|50459 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCAT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCAA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGT--TATT-GA-AT-T------TCAA-G----A-------C-C--A-------AAGGTCAA
gi|50460 : TTCCT-CAGATGATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CTCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TAAT-AG-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAtggtcaa
gi|50461 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-T--------TCCG---T-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAaaatca
gi|50468 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTT-G-TATAC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAAA-GAAG--ATG-----TACCC--AATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGGGTTCAAAGGTCAAtggtca
gi|50470 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-AAGT--ATG-----AAACC--TACT-GA-TT-T------TTAA-G----GTCATTGAT-C--A-------AAGGTCAA
gi|50473 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CAGAA----ATA-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATGAATTTAACCC--TATC-GA-TT-T------CCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTTAA
gi|50475 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-AA-TT-T------TCAggtca
gi|50476 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G--GA-GAGG--GTA-----AACCC--TGTTGGA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTC
gi|50477 : TTCAT-CAAGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-ATGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TTAA-G----G-------T-C--A-------AAG
gi|50478 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCTA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AATCT--GATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCGA
gi|50486 : TTCAT-CAAAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-GAAATGTTGCCCAGGAT-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGATCAA
gi|50488 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-T-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TGTT-GA-TT-T------TCAAGG----G-------T-C--A-------AAAGTCAAagatcaa
gi|50492 : TTCAT-CAGAAGATCATC--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TACA-GA-TA-T------TCAA-G----G-------T-T--A-------AGGGTCGAggtca
gi|50494 : TCCAT-CA-AGGGTCATC--AAA-CTGT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCG---T-GGAGA-GAGG--AAG-----AACTC--TATT-GA--T-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaggtaaa
gi|50497 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAG-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAAA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-GA-TT-G------CCAA-G----G-------T-ggtca
gi|50499 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CATT-C-CACAACAACATG-TT-G--------CCCA---TTGGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TTCT------TCAA-G----G-------T-C--A-------ACGGTCA
gi|50500 : TTCAT-CACAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACTC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TACT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GGGTTCAA
gi|50503 : TTCAT-CATGGAAACATC--AAA-CCTT-T-TACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--GTG-----AACTC--TATT-GA-TA-T------TCAA-G----G-------T-TA-A-------AAGGTGAAaggtgaa
gi|50507 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATA-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGAATATG-----AACCC--AATC-GC-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AA-GTCAAggtca
gi|50663 : TCAT-CAGAGAATCATC--AA--CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTCAttaggtca
gi|50665 : TCATTCAGAGAATCATTCAAAA-CCTT-C-CACAA----ATGGTT-G--------CCCA---T-GAAGAAGAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50666 : TCAT-CAAAGAATCATC--AA--CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G-AGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAAGTCAaggtc
gi|50667 : TTAT-CAGAGA-TCATC--AA---CTT-CGCACAA----ATG-TT-G--------CCCA-----GGAGA-GAGA--ATG-----AACTC--TATC-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50670 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CGCAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGG-AAGG--TTG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TAAG-G----G-------T-C--A-------AAGTTCAAggtca
gi|50672 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACAC----ATG-TT-T--------CCAA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----TACCC--TATT-GA-TT-TTCCAGGTCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50673 : TCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-T--------TCCG---T-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCA
gi|50689 : CAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATC-CTCA--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAAtggtca
gi|50701 : AT-CAGAGAATTGTC--AAT-CCTC-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50727 : GAGGATCACT--AAA-CCTT-G-CACAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGGGA-AAGG--ATG-----AATCC--TAAT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtta
gi|50773 : tGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ACA-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGaaatcaa
gi|50774 : GAGGATCATC--AAT-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAAtaaaggtca
gi|50794 : AGAATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA----TTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCA--TATT-GA-TT-A------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
Alignments
lowQualScore : 0 00 0 0 0 0000 0 0 11111111 000 0 0 00 11111 00 0 0 0 111111 0 1111 2222222 0 11 7777777
lowQualScore : . .. . . . .... . . ........ ... . . .. ..... .. . . . ...... . .... ....... . .. .......
lowQualScore : 4 66 4 4 4 9999 4 4 44444444 777 4 4 55 00000 99 4 4 4 111111 8 3333 0000000 4 44 4444444
consensus : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
Reference ( family-23 ) : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50313 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50314 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCA
gi|50315 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCA
gi|50316 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCT-----ACAA----ATA-TT-G--------AACA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACTG--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--G-------AAGGTCAA
gi|50317 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCAggtca
gi|50320 : TTCAT-CAGACAATCATC--AAA-CCTA-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50322 : TTCAT-CGGATAATCATC--AAA-CCTT-G-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GTAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------ATGGTCAAaggtcaa
gi|50325 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAAACTTT-C-CACAA----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50326 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---A-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------CCAT-G----G-------T-C--A-------ATGGTGAAggtca
gi|50329 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaggtcaa
gi|50330 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50331 : TTCAT-CGTCAAATCATC--AAA-GCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATA-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50332 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50333 : TTCAG-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-CAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50334 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CACAA----ATG-TT-G--------ACCA---T-GGATA-GAGG--ATT-----AACCCT-TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-TCAA-------AAAGTCAAggtca
gi|50337 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTCAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50338 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTCAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--G-------AGGGTCAAagtca
gi|50340 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------agtca
gi|50343 : TTCAA-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------ACCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-A----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaaa
gi|50352 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------ggtca
gi|50353 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAA-CCTT-C-CACAA----GTG-TT-G--------CTCA---T-GGACA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGCCA
gi|50355 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGT--TTG-----AAACC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-A--A-------GAGATCAA
gi|50356 : TTCAT-CCGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCA--TTTT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAAaagtcaa
gi|50357 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------A-C--A-------ACGGTTAAggtca
gi|50358 : TTCAT-CGCAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATT-----GACCA--TACT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAaggtcaa
gi|50359 : TTCAT-CAGGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CACA---T-GGATA-GAGG--ATG-----AACCC--TATC-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGAGTCA-AAGGTCAA
gi|50361 : TTCAT-CAGATAATCATC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-AGAGA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50362 : TTCAT-CAGAGAATAATG--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TG-G--------CCCA---T-GGAAA-GGGG--ATG-----GACTC--TATT-AA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCgg
gi|50367 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAtaaagtcaa
gi|50368 : TTCAT-TAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---C-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G--TT-T------TTAA-G----G-------T-CA-A-------AAGGTCAAggtca
gi|50372 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATA-TT-G--------CCCT---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------GAC--A-------AAGGTCAAgtca
gi|50374 : TTCAT-TAGAGGATCATC--AAT-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-CT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAggtca
gi|50375 : TTCAT-TGGAGGATCATC--AAA-CTTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTCA
gi|50376 : TTCAT-CAGAAAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----TTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAT-G----G-------T-C--A-------AAGGTC
gi|50377 : TTCAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCGG---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----A-------T-G--A-------AAGGTC
gi|50378 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTA-T-AACAA----CTG-CT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAtaggtca
gi|50379 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GA-------------AA-G----G-------T----A-------AGGGCCAAaggtcaa
gi|50380 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGC-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GA-------------AA-G----G-------T-C--A-------AGGGGCAAagatcaa
gi|50381 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTC-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-AAGG--ATG-----AATCC--TCCT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAagatcaa
gi|50382 : TTCAT-CAGAGAATAATC--AAA-CTTT-T-CACAA----ACG-TT-G--------CCCA---T-GGATA-GAG----TA-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GAGGTCA
gi|50384 : TTCAT-CCGCGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ACG-T------------CCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50385 : TTCAT-AAGAGAATCGTT--AAA-CCTC-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTGAAgatca
gi|50386 : TTCAC-CTGAGAATAATC--AAA-CCTT-T-TACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GAATA--AGG---TA-----AACCC--AATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAaggtc
gi|50387 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------CAAA-G----G-------T-C----------AAGGTCA
gi|50390 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA-----TG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-GC-TG-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGATCA
gi|50393 : TCCAT-CAGAGTATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATC-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----ATCCT--TGTT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAgaggtcaa
gi|50394 : TTCAT-CAGAGAATCAGC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGC-GGGG--ATT-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCGAaagtca
gi|50397 : TTTAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACAC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-GTTCAGGGT----T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50398 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50401 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TTAA-GT---G-------T-C--A-------AAGATCAatgtcaa
gi|50403 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAT-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AACCC--TGTT-TA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50406 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G--GA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAatgtcaa
gi|50411 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAGGTCA
gi|50412 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAGGTCA
gi|50413 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCCT-C-TGCAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AGCCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGATCAA
gi|50414 : TTAAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-C-CACAG----AT---T-G--------ACCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50426 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----T-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50427 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-AACA------CG-CT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGGGTTCAAAGGTCAAaagtcaa
gi|50428 : TTCAT-CAGAGGATAACT--AAA-CCTT-C-CACTA----ATG-TT-A--------CCTA---T-AGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAA
gi|50429 : TTCAT-CAAAGGATCATC--GGA-CCTT-C-CAAAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GAAGA-GAGG--ATA-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAAGG----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtta
gi|50430 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G---------CTA---T--GAGA-GAGG--ATG-----AAACC--TATT-GA-GT-T------TCAA-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50434 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-AA-TT-T------TTAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50440 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTGT-T-CACA------CG-TT-C--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TATT-GA-TT-T------TCAC-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAAaagtcaa
gi|50442 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GATTT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50446 : TTCAT-TAGAAAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-TGAAA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GT-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAatgtcaa
gi|50447 : TTAAT-CAGAAGATCATC--AAA-CATT-C-CATAA----ATG-TT-G--------TTCA---T-TGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--CATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50449 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-GGTT-A-CACAA----ATT-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGA--ATG-----AACCG--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GAGGTCAaggttaa
gi|50456 : TTCAT-CAGA-AATCATC--AAA-CCTTTC-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCCTATATT-GT-TT-T------CCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAgggtca
gi|50459 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCAT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCAA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGT--TATT-GA-AT-T------TCAA-G----A-------C-C--A-------AAGGTCAA
gi|50460 : TTCCT-CAGATGATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CTCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TAAT-AG-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAtggtcaa
gi|50461 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-T--------TCCG---T-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAaaatca
gi|50468 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTT-G-TATAC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAAA-GAAG--ATG-----TACCC--AATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGGGTTCAAAGGTCAAtggtca
gi|50470 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-AAGT--ATG-----AAACC--TACT-GA-TT-T------TTAA-G----GTCATTGAT-C--A-------AAGGTCAA
gi|50473 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CAGAA----ATA-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATGAATTTAACCC--TATC-GA-TT-T------CCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTTAA
gi|50475 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-AA-TT-T------TCAggtca
gi|50476 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G--GA-GAGG--GTA-----AACCC--TGTTGGA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTC
gi|50477 : TTCAT-CAAGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-ATGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TTAA-G----G-------T-C--A-------AAG
gi|50478 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCTA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AATCT--GATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCGA
gi|50486 : TTCAT-CAAAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-GAAATGTTGCCCAGGAT-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGATCAA
gi|50488 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-T-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TGTT-GA-TT-T------TCAAGG----G-------T-C--A-------AAAGTCAAagatcaa
gi|50492 : TTCAT-CAGAAGATCATC--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TACA-GA-TA-T------TCAA-G----G-------T-T--A-------AGGGTCGAggtca
gi|50494 : TCCAT-CA-AGGGTCATC--AAA-CTGT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCG---T-GGAGA-GAGG--AAG-----AACTC--TATT-GA--T-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaggtaaa
gi|50497 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAG-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAAA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-GA-TT-G------CCAA-G----G-------T-ggtca
gi|50499 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CATT-C-CACAACAACATG-TT-G--------CCCA---TTGGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TTCT------TCAA-G----G-------T-C--A-------ACGGTCA
gi|50500 : TTCAT-CACAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACTC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TACT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GGGTTCAA
gi|50503 : TTCAT-CATGGAAACATC--AAA-CCTT-T-TACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--GTG-----AACTC--TATT-GA-TA-T------TCAA-G----G-------T-TA-A-------AAGGTGAAaggtgaa
gi|50507 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATA-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGAATATG-----AACCC--AATC-GC-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AA-GTCAAggtca
gi|50663 : TCAT-CAGAGAATCATC--AA--CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTCAttaggtca
gi|50665 : TCATTCAGAGAATCATTCAAAA-CCTT-C-CACAA----ATGGTT-G--------CCCA---T-GAAGAAGAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50666 : TCAT-CAAAGAATCATC--AA--CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G-AGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAAGTCAaggtc
gi|50667 : TTAT-CAGAGA-TCATC--AA---CTT-CGCACAA----ATG-TT-G--------CCCA-----GGAGA-GAGA--ATG-----AACTC--TATC-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50670 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CGCAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGG-AAGG--TTG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TAAG-G----G-------T-C--A-------AAGTTCAAggtca
gi|50672 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACAC----ATG-TT-T--------CCAA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----TACCC--TATT-GA-TT-TTCCAGGTCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50673 : TCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-T--------TCCG---T-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCA
gi|50689 : CAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATC-CTCA--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAAtggtca
gi|50701 : AT-CAGAGAATTGTC--AAT-CCTC-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50727 : GAGGATCACT--AAA-CCTT-G-CACAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGGGA-AAGG--ATG-----AATCC--TAAT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtta
gi|50773 : tGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ACA-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGaaatcaa
gi|50774 : GAGGATCATC--AAT-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAAtaaaggtca
gi|50794 : AGAATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA----TTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCA--TATT-GA-TT-A------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
blockSeqs : AAATGTTG TCCAGG TTCA TCATTGA CA GGGTTCA
blockSeqs : . . T GGT A GGGTTCA
blockSeqs : . . . . A ACACTC
blockSeqs : . . . . . ACACTC
blockSeqs : . . . . . ACACTC
blockSeqs : . . . . . GAGTCA
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
finalCons : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
Alignments
lowQualScore : 0 00 0 0 0 0000 0 0 11111111 000 0 0 00 11111 00 0 0 0 111111 0 1111 2222222 0 11 7777777
lowQualScore : . .. . . . .... . . ........ ... . . .. ..... .. . . . ...... . .... ....... . .. .......
lowQualScore : 4 66 4 4 4 9999 4 4 44444444 777 4 4 55 00000 99 4 4 4 111111 8 3333 0000000 4 44 4444444
consensus : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
Reference ( family-23 ) : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50313 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50314 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCA
gi|50315 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCA
gi|50316 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCT-----ACAA----ATA-TT-G--------AACA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACTG--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--G-------AAGGTCAA
gi|50317 : TTCAT-CAAAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GCGA--ATG-----AACCC--TAAT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-C--AACACTC-AAGGTCAggtca
gi|50320 : TTCAT-CAGACAATCATC--AAA-CCTA-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50322 : TTCAT-CGGATAATCATC--AAA-CCTT-G-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GTAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------ATGGTCAAaggtcaa
gi|50325 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAAACTTT-C-CACAA----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50326 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---A-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------CCAT-G----G-------T-C--A-------ATGGTGAAggtca
gi|50329 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaggtcaa
gi|50330 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50331 : TTCAT-CGTCAAATCATC--AAA-GCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATA-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50332 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50333 : TTCAG-CAGAGAATTATC--AAA-CTCT-C-TACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-CAGG--ACG-----AGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50334 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CACAA----ATG-TT-G--------ACCA---T-GGATA-GAGG--ATT-----AACCCT-TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-TCAA-------AAAGTCAAggtca
gi|50337 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTCAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50338 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CTCAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAAA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--G-------AGGGTCAAagtca
gi|50340 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------agtca
gi|50343 : TTCAA-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------ACCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-A----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaaa
gi|50352 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------ggtca
gi|50353 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAA-CCTT-C-CACAA----GTG-TT-G--------CTCA---T-GGACA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGCCA
gi|50355 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGT--TTG-----AAACC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-A--A-------GAGATCAA
gi|50356 : TTCAT-CCGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCA--TTTT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAAaagtcaa
gi|50357 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------A-C--A-------ACGGTTAAggtca
gi|50358 : TTCAT-CGCAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATT-----GACCA--TACT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAaggtcaa
gi|50359 : TTCAT-CAGGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CACA---T-GGATA-GAGG--ATG-----AACCC--TATC-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGAGTCA-AAGGTCAA
gi|50361 : TTCAT-CAGATAATCATC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-AGAGA-GAGG--ATG-----AACTC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50362 : TTCAT-CAGAGAATAATG--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TG-G--------CCCA---T-GGAAA-GGGG--ATG-----GACTC--TATT-AA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCgg
gi|50367 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----CTG-TT-G--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GGCCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAtaaagtcaa
gi|50368 : TTCAT-TAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---C-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-G--TT-T------TTAA-G----G-------T-CA-A-------AAGGTCAAggtca
gi|50372 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATA-TT-G--------CCCT---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------GAC--A-------AAGGTCAAgtca
gi|50374 : TTCAT-TAGAGGATCATC--AAT-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-CT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAggtca
gi|50375 : TTCAT-TGGAGGATCATC--AAA-CTTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTCA
gi|50376 : TTCAT-CAGAAAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----TTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAT-G----G-------T-C--A-------AAGGTC
gi|50377 : TTCAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCGG---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----A-------T-G--A-------AAGGTC
gi|50378 : TTCAT-CACAGAATCATC--AAA-CCTA-T-AACAA----CTG-CT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----GACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAtaggtca
gi|50379 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GA-------------AA-G----G-------T----A-------AGGGCCAAaggtcaa
gi|50380 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGC-GAGG--ATG-----CACTC--TATT-GA-------------AA-G----G-------T-C--A-------AGGGGCAAagatcaa
gi|50381 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTC-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-AAGG--ATG-----AATCC--TCCT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAagatcaa
gi|50382 : TTCAT-CAGAGAATAATC--AAA-CTTT-T-CACAA----ACG-TT-G--------CCCA---T-GGATA-GAG----TA-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GAGGTCA
gi|50384 : TTCAT-CCGCGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ACG-T------------CCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50385 : TTCAT-AAGAGAATCGTT--AAA-CCTC-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTGAAgatca
gi|50386 : TTCAC-CTGAGAATAATC--AAA-CCTT-T-TACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GAATA--AGG---TA-----AACCC--AATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAaggtc
gi|50387 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------CAAA-G----G-------T-C----------AAGGTCA
gi|50390 : TTCAT-CAGAGAATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA-----TG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AACCC--TATT-GC-TG-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGATCA
gi|50393 : TCCAT-CAGAGTATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATC-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----ATCCT--TGTT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAgaggtcaa
gi|50394 : TTCAT-CAGAGAATCAGC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGC-GGGG--ATT-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCGAaagtca
gi|50397 : TTTAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACAC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-GTTCAGGGT----T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50398 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50401 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TTAA-GT---G-------T-C--A-------AAGATCAatgtcaa
gi|50403 : TTCAT-CAGAGAATCATA--AAT-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ACG-----AACCC--TGTT-TA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50406 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G--GA-GAGG--ATA-----AACCC--TATT-GA-TT-A------TCAA-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAatgtcaa
gi|50411 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAGGTCA
gi|50412 : TCCAT-CAGAAAACCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAGGTCA
gi|50413 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCCT-C-TGCAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AGCCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGATCAA
gi|50414 : TTAAT-CAGAGAATCATT--AAA-CCTT-C-CACAG----AT---T-G--------ACCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50426 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----T-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50427 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-AACA------CG-CT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----CACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGGGTTCAAAGGTCAAaagtcaa
gi|50428 : TTCAT-CAGAGGATAACT--AAA-CCTT-C-CACTA----ATG-TT-A--------CCTA---T-AGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GA-TT-T------TCAG-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAA
gi|50429 : TTCAT-CAAAGGATCATC--GGA-CCTT-C-CAAAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GAAGA-GAGG--ATA-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAAGG----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtta
gi|50430 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G---------CTA---T--GAGA-GAGG--ATG-----AAACC--TATT-GA-GT-T------TCAA-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50434 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-AA-TT-T------TTAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50440 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTGT-T-CACA------CG-TT-C--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TATT-GA-TT-T------TCAC-G----G-------T-T--A-------AAGGTCAAaagtcaa
gi|50442 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-C-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TATT-GATTT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtca
gi|50446 : TTCAT-TAGAAAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-TGAAA-GAGA--ATG-----AACCC--TATT-GT-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAatgtcaa
gi|50447 : TTAAT-CAGAAGATCATC--AAA-CATT-C-CATAA----ATG-TT-G--------TTCA---T-TGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--CATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50449 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-GGTT-A-CACAA----ATT-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGA--ATG-----AACCG--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GAGGTCAaggttaa
gi|50456 : TTCAT-CAGA-AATCATC--AAA-CCTTTC-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCCTATATT-GT-TT-T------CCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAgggtca
gi|50459 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCAT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCAA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGT--TATT-GA-AT-T------TCAA-G----A-------C-C--A-------AAGGTCAA
gi|50460 : TTCCT-CAGATGATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CTCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TAAT-AG-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAtggtcaa
gi|50461 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-T--------TCCG---T-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAaaatca
gi|50468 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CTTT-G-TATAC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAAA-GAAG--ATG-----TACCC--AATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--AGGGTTCAAAGGTCAAtggtca
gi|50470 : TCCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-AAGT--ATG-----AAACC--TACT-GA-TT-T------TTAA-G----GTCATTGAT-C--A-------AAGGTCAA
gi|50473 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-TCTT-C-CAGAA----ATA-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATGAATTTAACCC--TATC-GA-TT-T------CCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTTAA
gi|50475 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-AA-TT-T------TCAggtca
gi|50476 : TTCAT-CAGAGAATCGTC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G--GA-GAGG--GTA-----AACCC--TGTTGGA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTC
gi|50477 : TTCAT-CAAGGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-ATGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TTAA-G----G-------T-C--A-------AAG
gi|50478 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCAT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCTA---T-GGAGA-GTGG--ATG-----AATCT--GATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCGA
gi|50486 : TTCAT-CAAAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATG-TT-GAAATGTTGCCCAGGAT-GGAGA-GAGG--ATG-----AAGCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGATCAA
gi|50488 : TTCAT-CAGAGGATCACT--AAA-CCTT-T-CATAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCA--TGTT-GA-TT-T------TCAAGG----G-------T-C--A-------AAAGTCAAagatcaa
gi|50492 : TTCAT-CAGAAGATCATC--AAA-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TACA-GA-TA-T------TCAA-G----G-------T-T--A-------AGGGTCGAggtca
gi|50494 : TCCAT-CA-AGGGTCATC--AAA-CTGT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCG---T-GGAGA-GAGG--AAG-----AACTC--TATT-GA--T-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAaggtaaa
gi|50497 : TTCAT-CAGAGAATCATC--AAG-CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAAA-GAGG--GTG-----AACCC--TATT-GA-TT-G------CCAA-G----G-------T-ggtca
gi|50499 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CATT-C-CACAACAACATG-TT-G--------CCCA---TTGGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TTCT------TCAA-G----G-------T-C--A-------ACGGTCA
gi|50500 : TTCAT-CACAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACTC----ATG-TT-T--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----TACCC--TACT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------GGGTTCAA
gi|50503 : TTCAT-CATGGAAACATC--AAA-CCTT-T-TACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GTGG--GTG-----AACTC--TATT-GA-TA-T------TCAA-G----G-------T-TA-A-------AAGGTGAAaggtgaa
gi|50507 : TTCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ATA-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGAATATG-----AACCC--AATC-GC-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AA-GTCAAggtca
gi|50663 : TCAT-CAGAGAATCATC--AA--CCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACGC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C----------AAGGTCAttaggtca
gi|50665 : TCATTCAGAGAATCATTCAAAA-CCTT-C-CACAA----ATGGTT-G--------CCCA---T-GAAGAAGAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAA
gi|50666 : TCAT-CAAAGAATCATC--AA--CCTT-T-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-G-AGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--C-------AAAGTCAaggtc
gi|50667 : TTAT-CAGAGA-TCATC--AA---CTT-CGCACAA----ATG-TT-G--------CCCA-----GGAGA-GAGA--ATG-----AACTC--TATC-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAA
gi|50670 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-C-CGCAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGG-AAGG--TTG-----AATCC--TATT-GA-TT-T------TAAG-G----G-------T-C--A-------AAGTTCAAggtca
gi|50672 : TCAT-CAGAGGATCATC--AAA-CCTT-G-CACAC----ATG-TT-T--------CCAA---T-GGAGA-GAGA--ATG-----TACCC--TATT-GA-TT-TTCCAGGTCAG-G----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50673 : TCAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAG----ATG-TT-T--------TCCG---T-GGAGA-GAAG--ATG-----AACCC--TATT-TA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCA
gi|50689 : CAT-CAGAGAATCATC--AAA-CCTT-C-CACAA----ATC-CTCA--------TCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAAtggtca
gi|50701 : AT-CAGAGAATTGTC--AAT-CCTC-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCT--TATT-GA-TT-T------TCAA-T----G-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca
gi|50727 : GAGGATCACT--AAA-CCTT-G-CACAA----ATG-TT-A--------CCTA---T-GGGGA-AAGG--ATG-----AATCC--TAAT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AGGGTCAAggtta
gi|50773 : tGAGAATCATC--AAA-CCTT-T-CACAA----ACA-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAGaaatcaa
gi|50774 : GAGGATCATC--AAT-TCTT-C-CACAA----ATG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----AACCC--TATT-GA-TT-T------TCAA-G----G-------T-C--A-------AAAGTCAAtaaaggtca
gi|50794 : AGAATTATC--AAA-CCTT-C-CACAA----TTG-TT-G--------CCCA---T-GGAGA-GAGG--ATG-----GACCA--TATT-GA-TT-A------TCAA-G----A-------T-C--A-------AAGGTCAAggtca